Аутор Тема: Древна ДНК - научни радови  (Прочитано 43448 пута)

На мрежи Милош

  • Уредник СДНКП
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 3781
  • I2-PH908>Y56203>Y134578 Тарски Никшићи
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #240 послато: мај 08, 2019, 05:29:31 поподне »
Један рад о масовној гробници из периода 2880-2776 п.н.е. (Globular Amphora Culture), код села Кошице у јужној Пољској. Занимљиво да је хаплогрупа пронађена код 8 мушкараца, уједно и једина, I2a-M223>L801 (https://www.yfull.com/tree/I-L801/).

https://www.pnas.org/content/early/2019/04/30/1820210116







Ако је рачуница на Yfull-у: TMRCA CI 95% 4900<->3300 ybp, онда је ово матично подручје целе I2a-L801.
« Последња измена: мај 08, 2019, 06:06:46 поподне Милош »

Ван мреже Иван Вукићевић

  • Помоћник уредника
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1693
  • Васојевић
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #241 послато: мај 08, 2019, 07:19:29 поподне »
Један рад о масовној гробници из периода 2880-2776 п.н.е. (Globular Amphora Culture), код села Кошице у јужној Пољској. Занимљиво да је хаплогрупа пронађена код 8 мушкараца, уједно и једина, I2a-M223>L801 (https://www.yfull.com/tree/I-L801/).

Постоји могућност да су само тестирали до сада познате гране (попут YSEQ панела). Могуће је да су L801* тј. да припадају подграни која још увек није именована.

На мрежи Милош

  • Уредник СДНКП
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 3781
  • I2-PH908>Y56203>Y134578 Тарски Никшићи
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #242 послато: мај 08, 2019, 07:41:13 поподне »
Постоји могућност да су само тестирали до сада познате гране (попут YSEQ панела). Могуће је да су L801* тј. да припадају подграни која још увек није именована.

Ако узмемо процену Yfull-а као тачну, онда је ово сам почетак овог СНП-а, што значи да је за то време, последњи у низу и да нема низводних грана.

Иначе овде се види да је реч о једној породици: мајци старој око 60 година и четворица синова, старих од 40 до 20 година. Тројица су сигурно ожењени и двојица старијих имају по двоје деце (6,14,16 и 17 година), млађи једно дете, старо 2 године, а најмлађи изгледа није био жењен. Штрче једна жена стара око 35 година и мушко дете, старо око 2 године, исте хаплогрупе као остали мушкарци, али митахондријске днк која није нађена у групи.

Ван мреже Милан Петровић

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 549
  • I2-PH908>DYS561=15
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #243 послато: мај 08, 2019, 07:48:04 поподне »
Шта их је убило, некаква епидемија?
Догодине у Холштајну!

На мрежи Милош

  • Уредник СДНКП
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 3781
  • I2-PH908>Y56203>Y134578 Тарски Никшићи
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #244 послато: мај 08, 2019, 07:50:45 поподне »
Шта их је убило, некаква епидемија?

Пише у тексту. Убијени су ударцима у главу. Не може се поуздано рећи да ли су убијени од стране степских придошлица или у неком међусобном сукобу.

Ван мреже Иван Вукићевић

  • Помоћник уредника
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1693
  • Васојевић
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #245 послато: мај 08, 2019, 08:00:06 поподне »
Ако узмемо процену Yfull-а као тачну, онда је ово сам почетак овог СНП-а, што значи да је за то време, последњи у низу и да нема низводних грана.

У тексту се не спомиње да нису успели да издвоје баш ниједну подграну за ову породицу нити да су се тиме уопште бавили.

Ван мреже НиколаВук

  • Помоћник уредника
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 4711
  • I2-PH908>FT14506>Y52621, род Никшића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #246 послато: мај 23, 2019, 02:00:04 поподне »
Нови рад са археогенетским узорцима из бронзаног и гвозденог доба Естоније и Ингрије (околина Санкт Петербурга, Русија). Занимљив је због прве појаве N1-M178 хаплогрупе (бивши N1c) у оквиру гвозденог доба, која је представљена својим подгранама L392/L1026 и још низводнијом L550; аутори претпостављају да припадници N1 хаплогрупе на те просторе долазе током гвозденог доба као говорници уралских језика (од којих су настали естонски, фински и њима сродни језици). Примећује се изразита доминација R1a хаплогрупе (Балтословени), извучене су и неке ниже подгране које су учествовале у каснијој словенској етногенези - YP340 и Y2902 (обе испод Z280>CTS1211); такође је приметно потпуно одсуство хаплогрупе I.

https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(19)30424-5?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0960982219304245%3Fshowall%3Dtrue#secsectitle1180
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже НиколаВук

  • Помоћник уредника
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 4711
  • I2-PH908>FT14506>Y52621, род Никшића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #247 послато: јун 21, 2019, 10:42:48 поподне »
Нови рад о критској аутозомалној генетици:

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/ahg.12328

Занимљиво је присуство потенцијалне аутозомалне ДНК која би могла да се повеже са Словенима:

"(3) evidence of a genetic relationship among the Cretans and Central, Northern, and Eastern Europeans, which could be explained by the settlement in the island of northern origin tribes during the medieval period

"The results of the ALDER analysis suggest that settlers from the North reached Crete between the third and the 13th centuries C.E. This time frame is compatible with either the Goths reaching Crete in the fourth to sixth centuries or the Slavs in the seventh century or with Byzantines resettling populations on the island the 10th century C.E.
"
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Србин

  • Помоћник
  • ****
  • Поруке: 121
  • Y-DNA: I2a-Z17855*
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #248 послато: јун 30, 2019, 12:19:16 пре подне »
Објављен препринт предстојећег рада Bennet et al. "The origin of the Gravettians: genomic evidence from a 36,000-year-old Eastern 2 European" на bioRxiv-у.

Link: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/685404v1

Рад се бави испитивањем порекла становништва везаног за млађепалеолитску културу Граветијена. У питању је локалитет Буран Каја III на Криму.

Buran Kaya 3A старости 35775calBP припада мтДНК хаплогрупи N1, односно Y хаплогрупи BT, највероватније CT или C.

Што се тиче аутозомалне анализе интересантна су ова два пасуса.

Цитат
Discussion

The results of the genome-wide analysis of BuranKaya3A offer important evidence linking the
previously established genetic signature of the manufacturers of the Gravettian in Central Europe
to a much earlier appearance of the Gravettian in Eastern Europe. The absence of the “Common
West Eurasian” ancestry, as represented by Villabruna, in BuranKaya3A marks a key genetic
distinction between the Gravettian inhabitants of Buran-Kaya III, possibly including the broader
populations of EUP Eastern Europe as well, and the UP populations of Western and Central
Europe, which is characterized by a West-to-East reduction in “Common West Eurasian” ancestry
(seen in Extended Data Figure 10). The association we show here of this eastern genetic character
with the cultural material of the Gravettian of Buran-Kaya III, which has been compared to nearby
contemporaneous Early Upper Palaeolithic assemblages from the Caucasus indicated in Figure
3, collectively support an eastern advance of AMHs during the EUP into Europe through the
Caucasus as has been previously proposed based on archaeological evidence alone. Such a
population would have had to have split from the settlers of Central Europe and the Mediterranean
prior to their acquisition of the Common West Eurasian component as represented by Villabruna.
In this scenario, the technical adaptations required for the challenging environment of the open
Eastern European plains, a dryer landscape with little natural shelter, as well as possible cultural
exchanges with local populations, may have played a role in the development of the Early
Gravettian industry. The individuals recently characterized genetically from layer C of
Dzudzuana cave in the Caucasus (data not yet available), who were found to contain ancestry (both
Basal Eurasian and Common West Eurasian) that was absent ca. 9,000 years earlier in Crimea,
may represent more recent immigration into Eastern Europe. A higher resolution of these
movements awaits genetic analysis of more EUP and MUP sites from this region.

Цитат
Low Common West Eurasian ancestry in UP Eastern Europe

Ancestry from a population which split from all non-Africans prior to their separation from each
other, termed Basal Eurasian, had not been known in Europe until after the Last Glacial Maximum
(LGM). However, two 24,000-27,000-year-old (cal BP) individuals from layer C at Dzudzuana
Cave in the southern Caucasus have recently been reported to share ~70% common ancestry with
Villabruna and ~30% ancestry deriving from this Basal-Eurasian source. Additionally, varying
layers of Villabruna ancestry, which did not enter Europe in an unmixed form prior to ca. 14,000
years ago (cal BP), have been found in members of the Gravettian Vestonice cluster as well as
the Magdalenian El Miron cluster, indicating a degree of shared ancestry in these groups with a
“Common West Eurasian” population. We calculated the relative level of Basal Eurasian
ancestry using D-statistic D(EUP East Asian, UP, Ust-Ishim, Mbuti), where a positive value
indicates Basal Eurasian ancestry as allele sharing between the UP individual and Africans. This
analysis showed BuranKaya3A, like other pre-LGM UP Europeans, to be lacking Basal Eurasian
ancestry (Extended Data Figure 9). Similar tests examine the relative affinities of Palaeolithic and
Mesolithic populations to Villabruna as opposed to either modern East Asians, D(x, Han;
Villabruna, Mbuti), or BuranKaya3A, D(x, BuranKaya3A; Villabruna, Mbuti) (Extended Data
Figures 10 and 11, respectively). These results show levels of Villabruna ancestry in Eastern
European EUP individuals (Sunghir3, Kostenki12, Kostenki14, and BuranKaya3A) below that of
later UP Central and Western Europeans from Gravettian contexts (the Vestonice cluster).
Intriguingly, this includes a proportion of shared ancestry with Villabruna in BuranKaya3A similar
to that found in Ust-Ishim and both ancient and modern East Asians (Extended Data Figures 10
and 11), which should be insignificant based on previous admixturegraph analysis.

Буран Каја А3 не поседује ни BE (Basal Eurasian/Базални Евроазијат) ни CWE (Common West Eurasian/Општи Западни Евроазијат) компоненту у свом аутозомалном саставу што сугерише да се ради о популацијама које су се одвојиле раније од оних са уделом CWE компоненте (централноевропски Граветијен Вестонице и западноевропски Магдаленијен Ел Мирон) а што подржава стабло из Лазаридисовог препринта рада о Дзудзуани (CWE и Сунгир3/Костенки14 се одвојили од WE).

Највише CWE имају Лошбур и Бишон, са друге стране та компонента је најмање заступљена код БуранКајаА3, Уст-Ишим те код древних и савремених Источних Азијата.

Од запада ка истоку постоји градација смањења удела CWE што одговара већој заступљености архаичних популација старијег слоја у Источној Европи за време горњег Палеолита. Поменуто би требало да наведе на претпоставку да се миграција популација везаних за CWE са истока на запад десила релативно брзо јер у супротном имали би много већи удео старијих компоненти и на западу.

На мрежи Милош

  • Уредник СДНКП
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 3781
  • I2-PH908>Y56203>Y134578 Тарски Никшићи
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #249 послато: јун 30, 2019, 06:59:23 поподне »
Нови рад о Неандерталцима, Денисовцима, архаичним и модерним људима...

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/674986v1

Ван мреже НиколаВук

  • Помоћник уредника
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 4711
  • I2-PH908>FT14506>Y52621, род Никшића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #250 послато: јул 03, 2019, 11:46:37 поподне »
Рад о археогенетским резултатима становника древног филистејског града Ашкелона (касно бронзано-рано гвоздено доба); аутозомалним анализама је доказано да Филистејци заиста потичу из Европе, односно да су досељеници из времена касног бронзаног доба на тло Палестине. Рађене су и мтДНК и Y-ДНК анализе, мада што се тиче ових последњих нажалост нису успели да издвоје неке смисленије и ниже подгране (издвојене су само код 4 индивидуе - Ј, R1, BT и L).

https://advances.sciencemag.org/content/5/7/eaax0061

https://www.sciencemag.org/news/2019/07/biblical-philistines-archenemies-ancient-israelites-hailed-europe-dna-reveals
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже НиколаВук

  • Помоћник уредника
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 4711
  • I2-PH908>FT14506>Y52621, род Никшића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #251 послато: јул 04, 2019, 12:11:18 поподне »
Рад о археогенетским резултатима становника древног филистејског града Ашкелона (касно бронзано-рано гвоздено доба); аутозомалним анализама је доказано да Филистејци заиста потичу из Европе, односно да су досељеници из времена касног бронзаног доба на тло Палестине. Рађене су и мтДНК и Y-ДНК анализе, мада што се тиче ових последњих нажалост нису успели да издвоје неке смисленије и ниже подгране (издвојене су само код 4 индивидуе - Ј, R1, BT и L).

https://advances.sciencemag.org/content/5/7/eaax0061

https://www.sciencemag.org/news/2019/07/biblical-philistines-archenemies-ancient-israelites-hailed-europe-dna-reveals

Допуна за Филистејце:

Ted Kandell је поделио везу у групи: Ancient DNA.
1 сат · Ashqelon, Израел ·
Corrected Y-DNA for the Philistines:
ASH008 ASH066 J-Z2331
ASH067 R1b-M269
ASH087 L-M20


https://docs.google.com/spreadsheets/d/1A1j-n_jDGYYN7tUHGFBkj6x4ohzYr987spqa_SILPJo/edit?#gid=894106243
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Radul

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 896
  • J2a-Z38463>SK1357+
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #252 послато: јул 04, 2019, 02:10:37 поподне »
Допуна за Филистејце:

Ted Kandell је поделио везу у групи: Ancient DNA.
1 сат · Ashqelon, Израел ·
Corrected Y-DNA for the Philistines:
ASH008 ASH066 J-Z2331
ASH067 R1b-M269
ASH087 L-M20


https://docs.google.com/spreadsheets/d/1A1j-n_jDGYYN7tUHGFBkj6x4ohzYr987spqa_SILPJo/edit?#gid=894106243

Хвала Ниџа, ово је право моћно! 8)

Ван мреже НиколаВук

  • Помоћник уредника
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 4711
  • I2-PH908>FT14506>Y52621, род Никшића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #253 послато: јул 12, 2019, 01:07:55 пре подне »
Нови рад о Скитима, од бронзаног преко гвозденог доба па све до черњаховске културе (3-4. век н.е.). Тестирано је пет временски и територијално различитих популација Скита:

https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(19)30712-2

Што се тиче Y-ДНК, издвојене су следеће хаплогрупе:

https://www.cell.com/cms/10.1016/j.cub.2019.06.019/attachment/d57f7395-4faf-4f6c-8d38-7d30448193d8/mmc1

Занимљиво је присуство скандинавске R1a-Z284>S4458>S5301 (у раду означена као R1a1e-CTS1123) међу јужноуралским Скитима. R1a (више грана, међу којима и Z93) је свакако најбројнија, јавља се и Q1-L332, E1b-M84, J1-P58 и J2a.
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже НиколаВук

  • Помоћник уредника
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 4711
  • I2-PH908>FT14506>Y52621, род Никшића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #254 послато: јул 12, 2019, 05:33:58 поподне »
Нови рад о Скитима, од бронзаног преко гвозденог доба па све до черњаховске културе (3-4. век н.е.). Тестирано је пет временски и територијално различитих популација Скита:

https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(19)30712-2

Што се тиче Y-ДНК, издвојене су следеће хаплогрупе:

https://www.cell.com/cms/10.1016/j.cub.2019.06.019/attachment/d57f7395-4faf-4f6c-8d38-7d30448193d8/mmc1

Занимљиво је присуство скандинавске R1a-Z284>S4458>S5301 (у раду означена као R1a1e-CTS1123) међу јужноуралским Скитима. R1a (више грана, међу којима и Z93) је свакако најбројнија, јавља се и Q1-L332, E1b-M84, J1-P58 и J2a.

Исправка Теда Кандела у вези с овим радом и занимљива вест за све који се занимају за J1 хаплогрупу:

"MJ-52, a Scythian from Kazakhstan, from the 8th–5th century BCE Tasmola culture, is J1-L620*, not J1-P58 as stated in the Jarve et al. (2019) study.
In spite of being derived for (J1-P58 equivalent) PF4693;Z2357;YSC0000168;AM01307+,
he's ancestral for (J1-P58 equivalent)
CTS4823;PF4841;AM01315-
He's derived down to J-L620, but ancestral for:
J-L136 equivalents:
AM01332;Z2369;PF4821-
AM01308;CTS3101-
J-FGC6065 equivalents:
Y19466-
J-FGC6031 equivalents:
FGC6126-
FGC6068-
FGC6167-
The J SNP calls are here:
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1fgYZWBXjs91U_ecd2jWm9m4rJ9MRhb2ZWKFNJQebHyA/edit?usp=sharing
https://yfull.com/tree/J-L620/
The study:
https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(19)30712-2
He's mtDNA A23, which is today found only in Iran and Siberia.
"
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже ДушанВучко

  • Члан Друштва
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 3474
  • I2-PH908>FT14506>Y52621, род Никшића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #255 послато: јул 13, 2019, 05:47:12 поподне »


Занимљиво је присуство скандинавске R1a-Z284>S4458>S5301 (у раду означена као R1a1e-CTS1123) међу јужноуралским Скитима. R1a (више грана, међу којима и Z93) је свакако најбројнија, јавља се и Q1-L332, E1b-M84, J1-P58 и J2a.
Јел би могло присуство ове скандинавксе гране међу јужноуралским Скитима да име везе са овим?:
"This study confirms that Europe is important, but also that a parallel influence from the east and towards northern Scandinavia exists,” says Prescott, who was not involved in the new study. He is an archaeologist and an expert in The new stone age and The bronze age.

The results confirm that northern countries were not an Arctic dead end, but could have been a melting pot of people from continental Europe and the Urals, who brought new technologies like ceramics from as far away as China.

The results confirm that northern countries were not an Arctic dead end, but could have been a melting pot of people from continental Europe and the Urals, who brought new technologies like ceramics from as far away as China."

Ако је било контаката Скандинаваца са људима са Урала у бронзаном добу, можда је неки ген отишао назад, за Урал?
http://sciencenordic.com/first-scandinavians-came-north-and-south

Ван мреже НиколаВук

  • Помоћник уредника
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 4711
  • I2-PH908>FT14506>Y52621, род Никшића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #256 послато: јул 14, 2019, 12:30:53 пре подне »
Ако је било контаката Скандинаваца са људима са Урала у бронзаном добу, можда је неки ген отишао назад, за Урал?
http://sciencenordic.com/first-scandinavians-came-north-and-south

Могуће, мада није искључено да су погрешили у одређивању, као за онај J1-L620*, за који су написали да је J1-P58.
Чињеницама против самоувереног незнања.