Аутор Тема: Древна ДНК  (Прочитано 141027 пута)

Ван мреже Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1810
  • Z3660>Y34637-
Одг: Древна ДНК
« Одговор #440 послато: Новембар 16, 2017, 04:08:59 поподне »
Извини Гујо, "моша". Видех после да је само допуна у питању.

 ;)

Нешто сам се ја пребацио, мислио сам да су оба узорка са подручја Мађарске J2a1.

Да се исправим/допуним, имају два Ј2а1, I1902 из овог рада (Ленђелска култура, Мађарска), и онај кога малопре поменух, I5078 (Сопотска култура, Хрватска), али је он из другог рада (Mathieson et al. 2017).

Ван мреже Atlantische

  • Уредник СДНКП
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1579
  • G2a-BY195513
Одг: Древна ДНК
« Одговор #441 послато: Децембар 29, 2017, 12:57:23 поподне »
Занимљив чланак са Генетикера.

Pigmentation of Neolithic Europeans
''Заведени светским чудима, заборависмо на себе и на своје порекло." - М. Капор


Ван мреже Radul

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 1254
  • J-Y230579 Башино Село, Цетиње > Кривошије
Одг: Древна ДНК
« Одговор #442 послато: Јануар 17, 2018, 03:17:16 поподне »
Може ли се на основу овога извући закључак да је I9041 J2a L26>M67?>М92?
https://genetiker.wordpress.com/y-snp-calls-for-i9041/

Y-SNP calls for I9041
Below are Y-SNP calls for I9041, a Mycenaean sample from Greece. Positive calls are in bold, and negative calls are in non-bold.

The calls show that I9041 belonged to Y haplogroup J2a1-L26(xabcdeghi).

Издојени позитивни:

J2-M410-L559/PF4986
J2-M410-M410/PF4941
J2-M410-CTS5482/PF4968
J2-M410-PF4985
J2-M410-CTS6586/PF4970
J2-M410-CTS9781/PF4978
J2-M410-Z7740
J2-M410-L379
J2-M410-L375
J2-M410-L373
J2-M410-PF5008-L581-Z37823-PF5000-PF4993-Z37822
J2-M410-PF4610-CTS7683/PF5100/P354
J2-M410-PF4610-L26-L27/PF5111/F4326/S396
J2-M410-PF4610-L26-L26/PAGE55/S57/PF5110/PAGES00055

J2-M410-PF4610-L26-Z6064-Z6055-Z6057-Z6057
J2-M410-PF4610-L26-PF5087-PF5116-PF5119-L558-M67-Y4036-Z467-S11842-Y15913-FGC21366
J2-M410-PF4610-L26-PF5087-PF5116-PF5119-L558-M67-Z500-M92-PF7412-Z515-Z517
« Последња измена: Јануар 17, 2018, 03:21:43 поподне Radul »
Ако се бојите, немојте то чинити; ако то радите, не бојте се! - Темуџин

Ван мреже НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 6264
  • I2-PH908>Y52621>Y189944, род Никшића
Одг: Древна ДНК
« Одговор #443 послато: Фебруар 20, 2018, 11:55:34 поподне »
Генетикерови резултати за неке древне узорке из бакарног и бронзаног доба Европе (нарочито из оквира Културе звонастих пехара - Bell Beaker):

https://genetiker.wordpress.com/2018/02/19/y-snp-calls-for-bell-beaker-genomes/

Sample   Country   Culture   Date BC   Haplogroup
I0457   Spain   Copper Age   2920–2340   I2~M438
I0261   Spain   Bell Beaker   2850–2250   R1b1a2~V88
I0257   Spain   Bell Beaker   2571–2350   R1b1a2~V88
I2416   England   Bell Beaker   2460–2200   R1b1a1a2a1a~L151
I2575   France   Bell Beaker   2476–2211   R1b1a1a2~M269
I4248   Germany   Bell Beaker   2500–2000   R~M207
E09568   Germany   Bell Beaker   2461–2210   pre-R1b1a1a2a1a-L151
I3604   Germany   Bell Beaker   2300   R1b1a1a2~M269
I3607   Germany   Bell Beaker   2300   R1b1a1a~P297
I3596   Germany   Bell Beaker   2300–2150   R1b1a1a2~M269
I4178   Hungary   Bell Beaker   2500–2200   R1b1a1a2a1~L51
I2787   Hungary   Bell Beaker   2458–2202   R1b1a1a2a2-Z2103
I4251   Poland   Bell Beaker   2837–2672   R1b1a1a2~M269
I4253   Poland   Bell Beaker   2571–2208   R1b1a1a2a2-Z2103
I4252   Poland   Bell Beaker   2463–2142   R1b1a1a2a1a~L151
I2598   England   Early Bronze Age   2140–1940   R1b1a1a2a1a~L151
I2464   England   Early Bronze Age   1750–1610   R1b1a1a2a1-L51
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 6264
  • I2-PH908>Y52621>Y189944, род Никшића
Одг: Древна ДНК
« Одговор #444 послато: Март 04, 2018, 03:19:10 поподне »
Ко зна руски, не би било лоше да погледа ово. Колико сам разумео, у вези је са средњовековним налазом I2a-YP196 у владимирској области:

http://xn--c1acc6aafa1c.xn--p1ai/?page_id=29377
Чињеницама против самоувереног незнања.

симо

  • Гост
Одг: Древна ДНК
« Одговор #445 послато: Март 04, 2018, 03:43:44 поподне »
Ко зна руски, не би било лоше да погледа ово. Колико сам разумео, у вези је са средњовековним налазом I2a-YP196 у владимирској области:

http://xn--c1acc6aafa1c.xn--p1ai/?page_id=29377

Аутор је на крају дошао до тезе, анализирајући аутосомалну днк Сунгирца, да су једино I2-YP196 исконски Словени,а сви остали, укључујући и разне гране R1a, заправо словенизовани. У једну руку, у праву је што се тиче тврдње да I2-YP196 учествује у самом коријену словенске етногенезе, али прецјењује  њен значај. Чини ми се да изједначава аутосомалну компоненту "неолитских земљорадника" коју назива "јужноевропском" са Y-днк I2-YP196, иако знамо да је "неолитска" компонента присутна у практично свим европским популацијама, па је у одређеном проценту свакако морала бити присутна и међу разним припадницима R1a у источној Европи и прије доласка I2-YP196.

У сваком случају, анализа је рекао бих сасвим једнодимензионална, ослања се само на генетичке резултате. У неким дијеловим је коректна, у неким мислим да не гађа суштину.

Занимљиве су карте блискости Сунгирца са саврменим популацијама, са Србијом као великим поклапањем.




На мрежи Сремац

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 532
  • Y-DNK: I2-PH908>Y81557* / mtDNK: H11a5
Одг: Древна ДНК
« Одговор #446 послато: Март 04, 2018, 04:05:58 поподне »
IBD (Једнакост по пореклу) анализа најближих народа:

Ukrainian-West-and-Center 95,77

Belarusian 95,5

Polish 90,57

Balt 90,4

Montenegrian 88,66

Russian-West 87,97

Serbian 87,8

Estonian 87,17

Slovenian 86,42

Russian-South 86,29

Занимљиво да смо у врху народа који деле највише заједничких сегмената са Сунгирцем. Присуство јужнословенских народа у првих десет најсроднијих народа, аутор, ако сам га добро схватио, објашњава релативном блискошћу Сунгирца са временом словенског ширења:

Отдельно стоит отметить присутствие в первой десятке трех славянских выборок с Балкан — черногорцев, сербов и словенцев. К сожалению, на карте их «пятнышки» плохо видны из-за небольшого размера. Думаю, объяснять их наличие следует в первую очередь тем, что время жизни «сунгирца» гораздо ближе к эпохе экспансии славян, чем наши дни, поэтому в его геноме сохранилось большее число относительно длинных IBD-сегментов, связанных именно с этим событием.

Али додаје да за поткрепљење ове анализе треба више узорака одличног квалитета (Сунгирац није баш најбољег квалитета јер је контаминиран):

По моему опыту, для твердой уверенности в итогах IBD-анализа следует сформировать выборку из 4-5 геномов отличного качества прочтения. Пока же у нас в наличии один геном среднего качества прочтения, поэтому к результатам следует относиться, как к предварительным.




Ван мреже Vidak

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 292
Одг: Древна ДНК
« Одговор #447 послато: Март 04, 2018, 09:04:09 поподне »
IBD (Једнакост по пореклу) анализа најближих народа:

Ukrainian-West-and-Center 95,77

Belarusian 95,5

Polish 90,57

Balt 90,4

Montenegrian 88,66

Russian-West 87,97

Serbian 87,8

Estonian 87,17

Slovenian 86,42

Russian-South 86,29

Занимљиво да смо у врху народа који деле највише заједничких сегмената са Сунгирцем. Присуство јужнословенских народа у првих десет најсроднијих народа, аутор, ако сам га добро схватио, објашњава релативном блискошћу Сунгирца са временом словенског ширења:

Отдельно стоит отметить присутствие в первой десятке трех славянских выборок с Балкан — черногорцев, сербов и словенцев. К сожалению, на карте их «пятнышки» плохо видны из-за небольшого размера. Думаю, объяснять их наличие следует в первую очередь тем, что время жизни «сунгирца» гораздо ближе к эпохе экспансии славян, чем наши дни, поэтому в его геноме сохранилось большее число относительно длинных IBD-сегментов, связанных именно с этим событием.

Али додаје да за поткрепљење ове анализе треба више узорака одличног квалитета (Сунгирац није баш најбољег квалитета јер је контаминиран):

По моему опыту, для твердой уверенности в итогах IBD-анализа следует сформировать выборку из 4-5 геномов отличного качества прочтения. Пока же у нас в наличии один геном среднего качества прочтения, поэтому к результатам следует относиться, как к предварительным.

Da li po ovim procentima bliskosti ispada da je u crnoj Gori veci procenat Slovenske genetike nego u Srbiji? Po haplogrupama bi trebalo biti obratno.

На мрежи Сремац

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 532
  • Y-DNK: I2-PH908>Y81557* / mtDNK: H11a5
Одг: Древна ДНК
« Одговор #448 послато: Март 04, 2018, 09:50:17 поподне »
Испада да је коришћени узорак црногорског становништва аутосомално мало сроднији Сунгирцу но узорак становништва Србије.
Хаплогрупе и нису толико битне...Овде је реч о идентичним деловима ДНК. То би значило да Сунгирац дели више заједничких предака са становништвом Црне Горе, него са становништвом Србије...Уопште, као што и аутор примећује, присуство три јужнословенска народа међу првих десет изгледа необично...

Ван мреже Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1810
  • Z3660>Y34637-
Одг: Древна ДНК
« Одговор #449 послато: Март 20, 2018, 05:37:00 поподне »
Интервју са Дејвидом Рајхом, шефом Харвардске лабораторије која је до сада у радовима обрадила преко 900 древних узорака, а још преко 3000 узорака је "ускладиштено" и чека на анализу:

David Reich Unearths Human History Etched in Bone

Ван мреже НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 6264
  • I2-PH908>Y52621>Y189944, род Никшића
Одг: Древна ДНК
« Одговор #450 послато: Март 20, 2018, 11:51:57 поподне »
Интервју са Дејвидом Рајхом, шефом Харвардске лабораторије која је до сада у радовима обрадила преко 900 древних узорака, а још преко 3000 узорака је "ускладиштено" и чека на анализу:

David Reich Unearths Human History Etched in Bone

Одличан чланак. На ову техничку ствар се, изгледа, мора приликом обраде узорка највише обратити пажња:

Dr. Reich oversees a team with many different skills, from genetics to mathematics. But the “clean lab” is where the raw material for all their work — ancient DNA — is recovered. The head-to-toe suits that the researchers don in an airlock each morning ensure that no stray flake of skin or bead of sweat contaminates the bones with modern DNA. Each night the entire lab is bathed in gene-destroying ultraviolet light.

Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 4830
  • Y134591 Тарски Никшићи

Ван мреже Свевлад

  • Памтиша
  • ********
  • Поруке: 1737
  • Аутошовинизам је тешка болест!
Одг: Древна ДНК
« Одговор #452 послато: Април 03, 2018, 03:05:30 пре подне »
Пигментација људи који су живели у југоисточној Европи од пре око 12 000 до пре 2500 година.

https://genetiker.wordpress.com/2018/02/24/pigmentation-of-ancient-southeastern-europeans/
« Последња измена: Април 03, 2018, 03:08:55 пре подне Свевлад »

Ван мреже filipi

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 969
  • I-CTS10228_Y4882_A1328*
Одг: Древна ДНК
« Одговор #453 послато: Април 16, 2018, 08:38:34 пре подне »
95 Y хромозома из древне Евроазијске Степе!
55 хаплогрупа

https://docs.google.com/spreadsheets/d/1Rja6ZyjQrz3UK7_HTagkzczoOFjwcXOGdNOm9FC3Rik/edit#gid=0

Ван мреже Зрно

  • Помоћник уредника
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1668
  • R1b>BY611>YZ2705>BY200954
Одг: Древна ДНК
« Одговор #454 послато: Април 16, 2018, 09:31:04 пре подне »
95 Y хромозома из древне Евроазијске Степе!
55 хаплогрупа

https://docs.google.com/spreadsheets/d/1Rja6ZyjQrz3UK7_HTagkzczoOFjwcXOGdNOm9FC3Rik/edit#gid=0

Од 55 примерака, нема ниједан R1b источни, само 2-3 западна.

???

Ван мреже НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 6264
  • I2-PH908>Y52621>Y189944, род Никшића
Одг: Древна ДНК
« Одговор #455 послато: Април 16, 2018, 03:16:54 поподне »
Од 55 примерака, нема ниједан R1b источни, само 2-3 западна.

???

Осим P312 (DA111) и U106 (DA119), има и мало "егзотичнијих" R1b - Y14051 (подграна од типично монголске M478/M73) у два узорка, Y20750 (такође подграна од M478/M73) у једном узорку и PH200 (подграна од PH155, која је нађена код оног "Гепида", уствари највероватније Хуна из Виминацијума) у једном узорку.

https://yfull.com/tree/R-Y14051/
https://yfull.com/tree/R-Y20750/
https://yfull.com/tree/R-PH200/

На брзину сам прегледао снипове, чини ми се као мешавина централно- и источно-азијатских и блискоисточних/европских. Недостаје контекст за ове узорке, да ли су сви они били Scythians, Xiongnu, Huns, Turks and Mongols као што пише на табели, тј. да ли су се сви сахрањивали на начин уобичајен за ове степске номаде или неки узорци можда представљају и заробљенике/робове? Потврдило се, међутим, да је PH155 била присутна међу средњовековним степским номадима (највероватније Хунима, с обзиром на виминацијумски налаз). Занимљиво је код N халогрупе присуство две давно раздвојене гране - L1025 (која се углавном везује за европске народе) и Y16220 (присутна код Бурјата и Турака); можда се у једном случају ради о заробљенику/робу, а у другом случају о припаднику номадског племена?

https://yfull.com/tree/N-L1025/
https://yfull.com/tree/N-Y16220/

Све у свему, ни трага од N2 Y6503, што сам и очекивао.  ;)
« Последња измена: Април 16, 2018, 10:51:14 поподне НиколаВук »
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже МучаСR1bин

  • Члан Друштва
  • Шегрт
  • *****
  • Поруке: 78
  • R1b - U152
Одг: Древна ДНК
« Одговор #456 послато: Април 18, 2018, 12:08:15 поподне »
www.rts.rs/page/magazine/ci/story/2520/nauka/3107035/srednjovekovne-neveste-sa-vanzemaljskim-glavama.html
вест која се тиче везе наших простора и Баварске у раном средњем веку
„Ако видите човека који се жали, тај сигурно није Србин!“

Ван мреже НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 6264
  • I2-PH908>Y52621>Y189944, род Никшића
Одг: Древна ДНК
« Одговор #457 послато: Април 18, 2018, 12:38:47 поподне »
www.rts.rs/page/magazine/ci/story/2520/nauka/3107035/srednjovekovne-neveste-sa-vanzemaljskim-glavama.html
вест која се тиче везе наших простора и Баварске у раном средњем веку

Врло занимљиво. Бајуварско-гепидско-хунска веза.  ;)
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 6264
  • I2-PH908>Y52621>Y189944, род Никшића
Одг: Древна ДНК
« Одговор #458 послато: Мај 01, 2018, 10:37:47 поподне »
Табела са резултатима древне ДНК из евроазијске степе (Scythians, Xiongnu, Huns, Turks and Mongols):

http://open-genomes.org/analysis/Eurasian_Steppe_Y-DNA_mtDNA_Gedmatch.html

Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Гмитар

  • Помоћник
  • ****
  • Поруке: 114
  • R1a>YP343>YP371>YP971>Y57718+
Одг: Древна ДНК
« Одговор #459 послато: Јун 02, 2018, 03:59:55 поподне »
Извињавам се ако је неко ово већ поделио раније, налетео сам на веома занимљив сајт где се могу пронаћи разни узорци из различитих историјских временских периода.


https://web.archive.org/web/20171028022010/http://www.ancestraljourneys.org:80/ancientdna.shtml