Древна ДНК - научни радови

[Кековац]

Ово је типична генетика становништва словенског порекла које су асимиловали Авари, па онда Мађари. Свакако нису пореклом Мађари. Имамо и старије узорке из околине Беча са сличном генетиком. Хаплогрупе овог становништва су типичне за Јужне Словене, нарочито Хрвате и Словенце,  мада има и хаплогрупа које се срећу код Словака и Чеха. Ипак основу изгледа да чине Словени са доњег Дунава. Код узорака из околине Беча је видљив и палеобалканско уплив.

[Милан Петровић]

Na lajvu stoji da su modifikovane grane FT277965 i I-Y93865.
Da li to ima veze sa ovim uzorkom AHP221 ?

[Кековац]

Na lajvu stoji da su modifikovane grane FT277965 i I-Y93865.
Da li to ima veze sa ovim uzorkom AHP221 ?

Не верујем. Гране су модификоване пре додавања овог узорка.

[Милан Петровић]

Не верујем. Гране су модификоване пре додавања овог узорка.

Штета. 
Значи да тај узорак неће добити нижу подграну?

[kocovic]

Слична прича и за "live" грану на I-Z17855:


AHP15 је неки мађарски узорак из IX-X века нове ере. Међутим није ми јасно како је доспео на врх те гране ако је позитиван на СНП Y230195, требало би да буде у овој великој бугарско-албанској грани.

[Слобо]

Слична прича и за "live" грану на I-Z17855:


AHP15 је неки мађарски узорак из IX-X века нове ере. Међутим није ми јасно како је доспео на врх те гране ако је позитиван на СНП Y230195, требало би да буде у овој великој бугарско-албанској грани.

Потпуно исто и за АХП29. Стављен је као паралелна грана са У30507 и ФГЦ21780 иако изгледа позтиван на ФГЦ21780?

[Imoćanin]

Слична прича и за "live" грану на I-Z17855:


AHP15 је неки мађарски узорак из IX-X века нове ере. Међутим није ми јасно како је доспео на врх те гране ако је позитиван на СНП Y230195, требало би да буде у овој великој бугарско-албанској грани.

Po ćemu sudiš? AHP15 je datiran u drugu polovinu 9. stoljeća (Zalavar I) i opis groba je ovaj:

AHP15 Grave 25/00- The design of the burial pit follows the previous Avar period rite: narrow trenches at the head and foot ends beneath the coffin. The coffin was held together by 10 large iron pins, next to the dead was a small iron knife and a so-called Moravian-type fire-brake (typical in the second half of the 9th century CE, especially in the Moravian Basin). Grave 19/00 cuts into this grave, which contained an ornate gold dangling. This is one of the most precious of the Zalavár jewels, its decoration has parallels on the so-called Arnulf ciborium and on the cover of the Codex Aureus, which was made around 870 CE at the court of Charles the Bald in St. Denis and given by Arnulf to the monastery of St. Emmeram in Regensburg in 893 CE. Hence, the individual in grave 19/00 probably belonged to the entourage of King Arnulf, who was a frequent visitor to Mosaburg between 880 and 890 CE. Consequently, grave 25/00 probably is from between 860-870 CE. Anthropological and genetic sex: Male; 40-50 years old.

[kocovic]

Po ćemu sudiš? AHP15 je datiran u drugu polovinu 9. stoljeća (Zalavar I) i opis groba je ovaj:

AHP15 Grave 25/00- The design of the burial pit follows the previous Avar period rite: narrow trenches at the head and foot ends beneath the coffin. The coffin was held together by 10 large iron pins, next to the dead was a small iron knife and a so-called Moravian-type fire-brake (typical in the second half of the 9th century CE, especially in the Moravian Basin). Grave 19/00 cuts into this grave, which contained an ornate gold dangling. This is one of the most precious of the Zalavár jewels, its decoration has parallels on the so-called Arnulf ciborium and on the cover of the Codex Aureus, which was made around 870 CE at the court of Charles the Bald in St. Denis and given by Arnulf to the monastery of St. Emmeram in Regensburg in 893 CE. Hence, the individual in grave 19/00 probably belonged to the entourage of King Arnulf, who was a frequent visitor to Mosaburg between 880 and 890 CE. Consequently, grave 25/00 probably is from between 860-870 CE. Anthropological and genetic sex: Male; 40-50 years old.

Иначе то је овај AHS15 у твојој аутосомалној анализи:

Zaista fascinantno koliko je to izmiješana populacija u Panoniji. Usporedio sam uzorke koji su dosad postavljeni ispod E-V13 i I2a-Y3120 da vidim da li je haplogrupa indikator balto-slavenske autosomalne genetike ali izgleda da tu ne postoji velika korelacija:

[Imoćanin]

Pa to ti kažem, čovjek jednom ćetvrtinom pripada "Avar cluster" a rođen je u prvoj polovini 9. stoljeća. Nije ti on doša sa Mađarima.

[kocovic]

Pa to ti kažem, čovjek jednom ćetvrtinom pripada "Avar cluster" a rođen je u prvoj polovini 9. stoljeća. Nije ti on doša sa Mađarima.

А добро, ти си мислио буквално. Ја сам рекао "мађарски" јер је пронађен у Мађарској, а да ли је био Мађар, Авар, Бугар, Турчин итд остављам другима да погађају.

[Imoćanin]

А добро, ти си мислио буквално. Ја сам рекао "мађарски" јер је пронађен у Мађарској, а да ли је био Мађар, Авар, Бугар, Турчин итд остављам другима да погађају.

Ok. onda nesporazum, sorry ;-) Nego, tko ga je pregledao na niže SNP-ove koje spominješ?

[kocovic]

Ok. onda nesporazum, sorry ;-) Nego, tko ga je pregledao na niže SNP-ove koje spominješ?

Не знам, али ово што сам написао буквално стоји на yfull сајту. Иди на "live" и стави стрелицу миша преко "i' и видећеш његове СНП-ове.

[drajver]

Погледао сам сирови резултат овог AHP15. Јесте позитиван на Y230195, додуше има само једно позитивно читање. Y230196 му није покривен. Објективно могли су га спустити до испод Y230195.

[Imoćanin]

Не знам, али ово што сам написао буквално стоји на yfull сајту. Иди на "live" и стави стрелицу миша преко "i' и видећеш његове СНП-ове.

Pod "i" vidiš SNP-ove na koje je potencijalno pozitivan ali po YFull-u rezultat je nepouzdan ili nema očitanja na toj poziciji.

[drajver]

Провјерио сам AHP15 и на грану која није присутна на YFull стаблу, већ само на BIGY FTDNA стаблу, а која је именована SNP-ом FTB838. На том нивоу се налазe још неких четири SNP-a. AHP15 je на нека од њих негативан, неки му нису покривени, а на један од њих, MF55622, је позитиван (iма једно позитивно читање на овој позицији). Ако су ова очитавања валидна AHP15 би требао поцијепати ниво I-FTB838 на FTDNA стаблу, тј. његова филогенетска позиција би требала бити I2-Z17855>Y230195>MF55622

[Слобо]

Провјерио сам AHP15 и на грану која није присутна на YFull стаблу, већ само на BIGY FTDNA стаблу, а која је именована SNP-ом FTB838. На том нивоу се налазe још неких четири SNP-a. AHP15 je на нека од њих негативан, неки му нису покривени, а на један од њих, MF55622, је позитиван (iма једно позитивно читање на овој позицији). Ако су ова очитавања валидна AHP15 би требао поцијепати ниво I-FTB838 на FTDNA стаблу, тј. његова филогенетска позиција би требала бити I2-Z17855>Y230195>MF55622

Да ли видиш шта слично за АХП29 који мене посебно интересује?

[drajver]

Да ли видиш шта слично за АХП29 који мене посебно интересује?

Могу погледати.

[Драган Обреновић]

Pod "i" vidiš SNP-ove na koje je potencijalno pozitivan ali po YFull-u rezultat je nepouzdan ili nema očitanja na toj poziciji.

Управо тако - подгране наведене под "i" означавају да се не може искључити могућност да тестирана особа припада некој од наведених подграна. Разлог за несигурност може бити рецимо:

1) Врста теста коју је особа радила не очитава уопште ту позицију снипа (нпр. стари Big Y-500 тест)

2) Ради се о T2T снипу, а резултат је поравнат према Hg19 или Hg38 референтном геному који нема мапирану ту позицију (ако би се сирова очитавања поново поравнала, по T2T реф. геному, можда би се могло поуздано утврдити да ли је позитиван или није)

3) Тестирани просто "није имао среће" и позиција му није уопште очитана или је плитко или непоуздано очитана

Пример ситуације 3) је рецимо Димитријевић који је остао на нивоу PH908* и поред тога што има Т2Т поравнати WGS тест:



Ако се уради провера снипа Y503090 код њега, види се да га YFull води као "Controversial (X)", јер има 9 позитивних очитавања и 5 негативних (у овом случају ипак делује да је позитиван, али YFull има "оштре судијске критеријуме"):

[drajver]

Да ли видиш шта слично за АХП29 који мене посебно интересује?

AHP29 би требало да припада нивоу https://www.yfull.com/live/tree/I-FGC21780/ иако по свему судећи цијепа тај ниво.

Нису му покривени FGC21780, FGC21782, FGC21783.
Има два позитивна читања на FGC21785 C>2A, два негативна читања на FT171850 A>2A и три позитивна читања на FT255191 C>3G (при чему овдје има и негативних читања). Међутим на FTDNA стаблу се и FT171850 и FT255191 налазе на нивоу BY198747 који је испод нивоа I-FGC21780 на YFull стаблу односно испод нивоа I-FGC21782 на FTDNA стаблу.

Када се сравне подаци за оба стабла, добија се сљедећи филогенетски низ за AHP29: I1-FGC21792>FGC21785>FT255191 тј. AHP29 цијепа ниво I-FGC21780 на YFull стаблу и ниво I-BY198747 на FTDNA стаблу. При чему треба имати у виду да AHP29 има три негативна читања на BY198747 C>3C, а нису му покривени FT172014 и BY207558.

Укратко, није ближе повезан са нашим припадницима гране I-FGC21792.

[Слобо]

AHP29 би требало да припада нивоу https://www.yfull.com/live/tree/I-FGC21780/ иако по свему судећи цијепа тај ниво.

Нису му покривени FGC21780, FGC21782, FGC21783.
Има два позитивна читања на FGC21785 C>2A, два негативна читања на FT171850 A>2A и три позитивна читања на FT255191 C>3G (при чему овдје има и негативних читања). Међутим на FTDNA стаблу се и FT171850 и FT255191 налазе на нивоу BY198747 који је испод нивоа I-FGC21780 на YFull стаблу односно испод нивоа I-FGC21782 на FTDNA стаблу.

Када се сравне подаци за оба стабла, добија се сљедећи филогенетски низ за AHP29: I1-FGC21792>FGC21785>FT255191 тј. AHP29 цијепа ниво I-FGC21780 на YFull стаблу и ниво I-BY198747 на FTDNA стаблу. При чему треба имати у виду да AHP29 има три негативна читања на BY198747 C>3C, а нису му покривени FT172014 и BY207558.

Укратко, није ближе повезан са нашим припадницима гране I-FGC21792.

Географски је тако близу нама, а испоставља се да су сви данашњи носиоци те генетике Англо-Саксонци плус један Норвежанин...
Хвала на објашњењу