Аутор Тема: Древна ДНК  (Прочитано 97619 пута)

Ван мреже Петровић Мађер

  • Помоћник
  • ****
  • Поруке: 109
  • I2-PH908
Одг: Древна ДНК
« Одговор #560 послато: јун 25, 2019, 08:13:51 пре подне »

Ван мреже НиколаВук

  • Помоћник уредника
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 4824
  • I2-PH908>FT14506>Y52621, род Никшића
Одг: Древна ДНК
« Одговор #561 послато: јул 08, 2019, 01:49:08 поподне »
Археогенетски налаз једне од основних подграна E-V22, V3262, у пећини у Танзанији, датован од 8. до 5. века п.н.е:

"Ted Kandell је са корисником Ashraf Taqatqa и још 9 особа.
Визуелни приповедач · 6. јул у 21:29
For all you E-V22 and E-M78 people out there, here is the analysis of I13980 from the Prendergast (2019) Ancient East African Herders study, dated to 740-490 BCE from Gishimangeda Cave in Tanzania,:
He's E-V3262, a basal clade directly under E-V22. His mtDNA is HV1b1 which is modal among Yemeni Jews. HV1b1a and HV1b1b however are found in both Somalia and Yemen.
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1kOVrrUKNmidekjxqhXK557aZ_DG836e9lICUzuZ-MkM/edit?usp=sharing

https://yfull.com/tree/E-V3262/
"
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже НиколаВук

  • Помоћник уредника
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 4824
  • I2-PH908>FT14506>Y52621, род Никшића
Одг: Древна ДНК
« Одговор #562 послато: јул 21, 2019, 08:13:53 пре подне »
Први случај успешног изоловања Y-ДНК хаплогрупе из неандерталских узорака:

"Ted Kandell је поделио везу у групи: Ancient DNA.
6 ч. ·
A Neanderthal Y!
(The correct branch for each SNP is listed, not the haplogroup designation as of right now.)
This is what I get for derived (positive) basal Y SNPs:
The following SNPs are derived (positive) in both Neanderthals and modern humans, but ancestral (negative) in bonobos, chimpanzees, and gorillas.
They define an earlier "Homo sapiens super-haplogroup":
A21544 (NEANDERTHAL + AMH)                           
A8834   (NEANDERTHAL + AMH)                              
These SNPs "flip" from being A0-T and A00 SNPs to the other branch. (The correct branch is listed here):
A0-T YP3663;FGC27793         
A0-T FGC25825                        
A0-T YP3204;FGC26862         
A0-T FGC26773;V6456                  
A0-T FGC26585;YP3043;V5900   
A0-T FGC27434;YP3520;V7628   
A0-T? Z9140
A00 FGC26961;YP2043         
A00 YP2254                             
A00 YP2077;FGC27094
These SNPs are the "Neanderthal-only" haplogroup, which is a sister clade to entire modern human Y tree:                          
A21642 (NEANDERTHAL)           
A21601 (NEANDERTHAL)         
A21586 (NEANDERTHAL)         
A21678 (NEANDERTHAL)   
A21639 (NEANDERTHAL)
This is what I get for ancestral (negative) basal Y SNPs. Again, the correct haplogroup is listed:
A00 YP2518;FGC25438                  
A00 YP2708;V2243;FGC25755   
A00 YP2781;FGC25876                  
A00 FGC25898;YP2790                  
A00 FGC26401                        
A00 V2858;YP2962;A2764          
A00 YP2968;FGC26450;V2888   
A00 FGC26763;YP3141                  
A00 A4985;YP3292                  
A00 YP3334;FGC27109;V3453   
A00 FGC27166;YP3368;V3699   
A00 V3736;L1139                          
A00 FGC27213;V3874                  
A00 A2939;YP3604                  
A00 A2956;YP3649                  
A00 FGC27906;YP3728                  
A00 FGC25380                          
A00 FGC25594                          
A00 FGC25618;V1567;YP2614   
A00 YP2765;FGC25847                  
A00 YP2910;V2548;FGC26335
A00 FGC26481;YP2990
A00 FGC26599
A00 YP3220;FGC26890
A00 L1148
A00 FGC27751;YP3642
A00 V1523;YP2604;FGC25592
A00 FGC25930;YP2803
A00 FGC26404;YP2949
A00 FGC26747;YP3125
A00 A2828
A00 V3481;YP3336;FGC27114
A00 FGC27176
A00 FGC27195;YP3386
A00 YP3510;FGC27422
A00 A2948;YP3615
A00 FGC27833;YP3688
A00 A3647
A00 FGC25404;YP2496
A00 FGC25466;YP2530
A00 ZS2646
A00 FGC26367;YP2930;V2627
A00 FGC26376
A00 FGC26468;YP2983;V29560
A00 FGC26512;YP3006
A00 FGC26622
A00 FGC26693;YP3098
A00 YP3294;FGC27028
A00 FGC27418;YP3506
A00 FGC27708
A00 FGC27867;YP3708
A00 Y12947;Z7152
A00 Z21469;YP2975;FGC26459;V2922
A00 Z8062;S16565
A00 A3886
A00 A3646
A00 A3780
A00 FGC26975;V6928 
A00 FGC27430;YP3517;V7622
A00 FGC25928
A00 L1115
A00 A2684
A00 FGC26673;YP3087;V6114
A00 FGC26750;YP3128;V6352
A00 YP3229;FGC26915;V6798
A00 FGC26008;V5185   
A00 YP2834;FGC26191;V5346
A00 FGC26922;YP3232;V6814
A00 FGC27008;YP3278;V7039
A00 YP3303;FGC27052;V7147
A00 A3885   
A00 FGC27584;V7830   
A0-T YP1829                                  
A0-T FGC25754;YP1834                  
A0-T YP2146;FGC27375                  
A0-T PF547                                  
A0-T FGC25471;YP1762                  
A0-T YP1798;FGC25596                  
A0-T FGC25943;YP1872                  
A0-T FGC26476;YP1939                  
A0-T YP2196;A2943                  
A0-T FGC28120                           
A Neanderthal sub-haplogroup only found in one sample but not others:
A21365   (MEZMAISKAYA 2 NEANDERTHAL)
A21432   (MEZMAISKAYA 2 NEANDERTHAL)
A21383   (MEZMAISKAYA 2 NEANDERTHAL)
A21473   (MEZMAISKAYA 2 NEANDERTHAL)
A21616   (MEZMAISKAYA 2 NEANDERTHAL)
http://cdna.eva.mpg.de/neandertal/Hohlenstein-Stadel/BAM/hg19/
"
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 3893
  • I2-PH908>FT14506>Y56203>Y134578 Тарски Никшићи
Одг: Древна ДНК
« Одговор #563 послато: јул 21, 2019, 10:49:32 поподне »
Први случај успешног изоловања Y-ДНК хаплогрупе из неандерталских узорака:

"Ted Kandell је поделио везу у групи: Ancient DNA.
6 ч. ·
A Neanderthal Y!
(The correct branch for each SNP is listed, not the haplogroup designation as of right now.)
This is what I get for derived (positive) basal Y SNPs:
The following SNPs are derived (positive) in both Neanderthals and modern humans, but ancestral (negative) in bonobos, chimpanzees, and gorillas.
They define an earlier "Homo sapiens super-haplogroup":
A21544 (NEANDERTHAL + AMH)                           
A8834   (NEANDERTHAL + AMH)                              

На ISOGG Browser који уређује Томас Кран, оба ова СНП-а су старије гране. Видим да је Тед зато променио пост.

http://ybrowse.org/gb2/gbrowse/chrY/?name=chrY%3A6919653..6919653

https://www.google.com/url?sa=t&source=web&rct=j&url=https://isogg.org/tree/2019HaplogroupA.xlsx&ved=2ahUKEwjM2uyn7MbjAhVqpYsKHYtUCfMQFjABegQIBxAG&usg=AOvVaw2rN4q-SyCsfcCpk-lLdF6L

А8834 је вероватно СНП Денисоваца, док је нејасна ситуација што се тиче Неандерталца+анатомски модерног човека.

A21544 је СНП "раног" Неандерталца из Мезмајскаја 2 и SPY 94A, али не и "касног" Неандерталца из Хохленштајна, који се и аутосомално разликују.

Мене буни што нпр. мени на Yfull-у, иако се не користе ови снпови у анализи, показују да сам позитиван на оба ова снпа.
« Последња измена: јул 22, 2019, 12:17:31 пре подне Милош »

Ван мреже ДушанВучко

  • Члан Друштва
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 3626
  • I2-PH908>FT14506>Y52621, род Никшића
Одг: Древна ДНК
« Одговор #564 послато: јул 21, 2019, 11:30:02 поподне »
Мене буни што нпр. мени на Yfull-у, иако се не користе ови снпови у анализи, показују да сам позитиван на оба ова снпа.
Колика је старост тих СНПова? То би значило да су сви I2 позитивни на те СНПове? Ако је по времену боравка хаплогрупе I у Европи и времену изумирања неандерталаца, период заједничког боравка у Европи неколико хиљада година, али буни што је један СНП од неандерталца, а други од денисовца)
« Последња измена: јул 21, 2019, 11:36:51 поподне ДушанВучко »

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 3893
  • I2-PH908>FT14506>Y56203>Y134578 Тарски Никшићи
Одг: Древна ДНК
« Одговор #565 послато: јул 21, 2019, 11:48:27 поподне »
Колика је старост тих СНПова? То би значило да су сви I2 позитивни на те СНПове? Ако је по времену боравка хаплогрупе I у Европи и времену изумирања неандерталаца, период заједничког боравка у Европи неколико хиљада година, али буни што је један СНП од неандерталца, а други од денисовца)

Тед ми није објасни зашто мисли да нисмо позитвни на ова два снпа, али тврди да ипак нисмо.

Ван мреже НиколаВук

  • Помоћник уредника
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 4824
  • I2-PH908>FT14506>Y52621, род Никшића
Одг: Древна ДНК
« Одговор #566 послато: јул 29, 2019, 01:37:17 поподне »
Коментари на нови рад о генетици Тохараца (говорника изоловане индо-европске гране, тзв. тохарске, који су живели на подручју данашње Ујгурије-Синкјанга):

R1b1a1a2-M269 Tocharians?
No, R1b2-PH155 Huns!
The complete set of aligned Y SNP calls from the Tianshan individuals:
https://docs.google.com/spreadsheets/d/15ecXQf2gRYNfMELt4H5lYuN5G9NXXIWTAhscqvfOPR0/edit?usp=sharing
• M15-2: R-PH200
https://yfull.com/tree/R-PH200/
• MO12: R-PH155
 https://yfull.com/tree/R-PH155/
• M15-1: Q-M120
https://yfull.com/tree/Q-M120/
• X3:       Q-F5400
https://yfull.com/tree/Q-F5400/
R-PH200 under R-PH155 was found in a supposed "Gepid" (VIM_2, ERS2374341 on the YFull tree) from Serbia from the 6th century CE with an artificially deformed skull who was autosomally at least 20% East Asian, and therefore likely a Hun or with a Hun father, and also a Tian Shan Hun from Uzbekistan from about the year 260 CE. Both Q-M120 and Q-F5400 are East Asian.
Autosomally, these 4 individuals from China are substantially East Asian.
https://eurogenes.blogspot.com/2019/07/they-mixed-up-tocharians-with-huns.html
This raises some interesting questions about the origins of this earliest branch of R1b, which doesn't appear to have migrated westward from the R* homeland until historic period. The first westward movement of R1b appears to have taken place after the LGM, not before 17,100 ybp, and likely later after the Bolling Interstadial ("the End of the Ice Age") at 14,700 ybp.
https://yfull.com/tree/R1b/

Изгледа да се овде ипак ради о "Прото-Хунима", а не о Тохарцима.
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже НиколаВук

  • Помоћник уредника
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 4824
  • I2-PH908>FT14506>Y52621, род Никшића
Одг: Древна ДНК
« Одговор #567 послато: јул 31, 2019, 04:17:49 поподне »
Преци савремених људи су се, поред неандерталаца и денисованаца, мешали и са две још увек неидентификоване врсте хоминина (провизорно назване Extinct Hominin 1 - EH1 и Extinct Hominin 2 - EH2); прва врста је живела негде на подручју јужне Азије а друга на острву Флорес у Индонезији. Иако су познати остаци Homo floresiensis-a (тзв. "хобита", надимка који је добио због минијатурног раста) са острва Флорес, није разјашњено да ли генетски траг EH2 потиче од ове или неке друге врсте хоминина са тог острва.

Humans Interbred with Four Extinct Hominin Species, Research Finds
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Србин

  • Помоћник
  • ****
  • Поруке: 124
  • Y-DNA: I2a-Z17855>BY190177
Одг: Древна ДНК
« Одговор #568 послато: август 05, 2019, 08:49:49 поподне »
Новости са Антрогенике.

У питању је резултат БАМ фајла једног од узорака из необјављене студије са узорцима из околине Рима.

Резултат је I-CTS8799, еквивалентан М436.

Ради се о централноапенинском локалитету Grotta Continenza недалеко од места Trasacco, L'Aquila источно од Рима.

Остаци су из доба Мeзолита, датирани на 10100-9816 calBCE.

Ван мреже Сол

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1114
Одг: Древна ДНК
« Одговор #569 послато: август 08, 2019, 11:08:40 поподне »
зна ли неко нешто подробније о налазу I2a-M26 у граду Владимиру? (Known Y-DNA haplogroups from different Old Slavic burials ; Vladimir (1100–1220) I2a-M26 (Sikora, 2017))
 
HAPLOGROUP ANALYSIS FOR A MEDIEVAL RUSSIAN BURIAL OF 16TH–17TH CENTURES IN RADONEZH (MOSCOW AREA)
https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/15445/1/09-Mustafin.pdf
СОКО БАIО СА ТРИЕС ЗМАIEВАХ МРѢЕТ НЕЋЕ ДОК СВѢЕТА ТРАIЕ

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 3893
  • I2-PH908>FT14506>Y56203>Y134578 Тарски Никшићи
Одг: Древна ДНК
« Одговор #570 послато: август 08, 2019, 11:29:12 поподне »
зна ли неко нешто подробније о налазу I2a-M26 у граду Владимиру? (Known Y-DNA haplogroups from different Old Slavic burials ; Vladimir (1100–1220) I2a-M26 (Sikora, 2017))
 
HAPLOGROUP ANALYSIS FOR A MEDIEVAL RUSSIAN BURIAL OF 16TH–17TH CENTURES IN RADONEZH (MOSCOW AREA)
https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/15445/1/09-Mustafin.pdf

Искрено први пут видим овај рад. Веома занимљиво откриће, уколико није било контаминације. :)

Ван мреже НиколаВук

  • Помоћник уредника
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 4824
  • I2-PH908>FT14506>Y52621, род Никшића
Одг: Древна ДНК
« Одговор #571 послато: септембар 20, 2019, 12:20:35 поподне »
Нови метод анализе гена преко кога је могуће предвидети изглед одређене индивидуе је употребљен ради реконструкције изгледа денисованске девојчице из епонимне пећине Денисове. Судећи по њеном изгледу, денисованци су се разликовали и од неандерталаца и од модерних људи, најзначајније разлике су шира вилица и лице:

https://www.sciencemag.org/news/2019/09/ancient-dna-puts-face-mysterious-denisovans-extinct-cousins-neanderthals?fbclid=IwAR1oxVqiklDutOF-FOdPy-QB__lAYsMtxcomhZmpXdk4Mi4qFrnitnLXfNQ

Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 3893
  • I2-PH908>FT14506>Y56203>Y134578 Тарски Никшићи
Одг: Древна ДНК
« Одговор #572 послато: септембар 20, 2019, 12:31:49 поподне »
Нови метод анализе гена преко кога је могуће предвидети изглед одређене индивидуе је употребљен ради реконструкције изгледа денисованске девојчице из епонимне пећине Денисове. Судећи по њеном изгледу, денисованци су се разликовали и од неандерталаца и од модерних људи, најзначајније разлике су шира вилица и лице:

https://www.sciencemag.org/news/2019/09/ancient-dna-puts-face-mysterious-denisovans-extinct-cousins-neanderthals?fbclid=IwAR1oxVqiklDutOF-FOdPy-QB__lAYsMtxcomhZmpXdk4Mi4qFrnitnLXfNQ



А косе очи? :)

Ван мреже НиколаВук

  • Помоћник уредника
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 4824
  • I2-PH908>FT14506>Y52621, род Никшића
Одг: Древна ДНК
« Одговор #573 послато: септембар 20, 2019, 01:24:39 поподне »
А косе очи? :)

То и ја помислих, али ни речи о томе.  ;)
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Зрно

  • Помоћник уредника
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 1259
  • R1b>BY611>YZ2705>BY200954
Одг: Древна ДНК
« Одговор #574 послато: септембар 20, 2019, 02:00:39 поподне »
Нешто као Индијанци по изгледу.

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 3893
  • I2-PH908>FT14506>Y56203>Y134578 Тарски Никшићи
Одг: Древна ДНК
« Одговор #575 послато: септембар 20, 2019, 08:33:18 поподне »
« Последња измена: септембар 20, 2019, 08:34:58 поподне Милош »

Ван мреже Полић

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 485
  • I2-Y56203
Одг: Древна ДНК
« Одговор #576 послато: септембар 21, 2019, 03:01:38 поподне »
Овде је мало боље... и очи су косе.



https://www.nationalgeographic.rs/vesti/14255-naucnici-rekonstruisali-skelet-praistorijskog-coveka-denisovana.html

Очи јесу косо постављене, али је питање како је изгледао горњи очни капак код њих, и да ли су савремени Азијати ту особину спуштеног горњег капка наследили од Денисоваца. Ген је вероватно идентификован код савремених популација који доводи до формирања тог карактеристичног набора горњег очног капка, али да ли је и код Денисоваца тако?

На мрежи сɣнце

  • Познавалац
  • ******
  • Поруке: 573
  • I-S17250>Y4882>A1328
Одг: Древна ДНК
« Одговор #577 послато: септембар 21, 2019, 04:19:31 поподне »
Очи јесу косо постављене, али је питање како је изгледао горњи очни капак код њих, и да ли су савремени Азијати ту особину спуштеног горњег капка наследили од Денисоваца. Ген је вероватно идентификован код савремених популација који доводи до формирања тог карактеристичног набора горњег очног капка, али да ли је и код Денисоваца тако?

Највиши одстотак, чак до 5% денисовскога генома налази се у Тибећана, исконих становника Аустралије и Полинежана, а не Хан или Монгола.

На мрежи filipi

  • Познавалац
  • ******
  • Поруке: 713
  • I-CTS10228_Y4882_A1328*
Одг: Древна ДНК
« Одговор #578 послато: септембар 22, 2019, 12:00:36 пре подне »
Nas rodjak is Loschboura. Lundiak u posjeti luksemburskom muzeju.

https://lundiak.wordpress.com/2019/09/13/how-i-met-loschbour-man-my-8000-y-o-ydna-cousin/

Ван мреже НиколаВук

  • Помоћник уредника
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 4824
  • I2-PH908>FT14506>Y52621, род Никшића
Одг: Древна ДНК
« Одговор #579 послато: октобар 13, 2019, 09:06:29 пре подне »
Ново занимљиво откриће - издвојене су Y-ДНК и мтДНК Египћанина који је живео у временском распону 1991-1802. п.н.е. У питању је Y-ДНК хаплогрупа H2-P96, прецизније H2-Y21618*. H2-P96, која је данас врло ретка, је била прилично присутна међу неолитским земљорадницима Блиског истока, Анадолије и Европе.

"‎Ted Kandell‎ за YFull.com
7 ч. ·
Everyone, meet Nakht-Ankh from Shashotep, Egypt. He lived sometime between 1991 BCE – 1802 BCE. He was the son of the Lady Khnum-Aa, and the older brother of Khnum-Nakht.
He's Y-DNA H-Y21618* and mtDNA M1a1* + G8251A, G16145A.
He's the earliest person who we can name in all of human history whose Y and mtDNA haplogroups we can identify.
Nakht-Ankh was a contemporary of the Bell Beakers in Britain, the Minoans, and the Indus Valley Civilization in South Asia. He lived 100 years before Hammurabi of Babylon.
I reanalyzed his Y SNPs using the YFull haplogroups and he's derived for 2 F* SNPs, Z19004 and Z18865 in H-P96, and BY44412 in H-Y21618. He's ancestral for G*, IJ* and K* SNPs and for Z19117 in H-Y19962 which is the immediate subgroup of H-Y21618.
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1YDssYjnyLl-e6KrPIYnQAOQpxUTmemePj3_U134h1uc/edit?pli=1#gid=0
Haplogroup H2-P96 may be a very surprising result for Egypt. It's never been seen among Egyptians today. H2 is closely associated with the Northwest Anatolian and European Neolithic. However, H2 was also found in a Pre-Pottery Neolithic C Levantine individual from about 9000 ybp. It seems like some Levantine Neolithic and Chalcolithic people made it to Egypt at the start of Egyptian civilization. Since he's ancestral for H-Y19962, he's not in the European subclade of H-P96.
The study wasn't able to identify his or his brother Khnum-Nakht's Y haplogroups, but they were able to get their mtDNA haplotype, proving that they were at least half-brothers.
http://xn--c1acc6aafa1c.xn--p1ai/wp-content/uploads/Drosou-ea-18-DNA-of-Egyptian-mummy.pdf
"
Чињеницама против самоувереног незнања.