Пре два дана сам послао мејл YFull-у са питањем о узорку ИР1... Управо сам добио одговор од YFull-a:
”We checked all SNPs directly in the BAM file. This gives the greatest accuracy of the determination.
I can confirm that the sample IR1 is:
L665-
also
N-Y6503: Y30760+ FGC28493/Y6564+ FGC28486/Y6561+ FGC28474/Y6557+ FGC28445/Y6543+ FGC28441/Y6541+ FGC28398/Y6518+ FGC28400/Y6515+ FGC28404/Y6521+ FGC28406/Y6523+ FGC28408/Y6525+ FGC28414/Y6470+ FGC28420/Y6537+ FGC28428/Y6534x FGC28430/Y6536+ Y6587/FGC28392+ FGC28444/Y6542+ FGC28447/Y6482+ Y6544/FGC28450+ Y6546+ FGC28459/Y6548+ FGC28461/Y6549+ Y6553+ FGC28479/Y6559+ FGC28484/Y6560+ FGC28390/Y6589+ FGC28490/Y6562+ FGC28492/Y6566+ FGC28501/Y6494+ Y6569+ FGC28505/Y6570+ FGC28506/Y6571+ FGC28507/Y6572+ FGC28514/Y7882+ FGC28518/Y6576+ FGC28522/Y6577+
FGC28528/Y6503+ FGC28533/Y6511+ Y7872+ Y30759+
N-P189.2: Y7880/FGC28487- FGC28473/Y6556- Y6481- FGC28438/Y7892- FGC28433/Y6466- FGC28425/Y6512- P189/P189.2/P189.1- FGC28396/Y6514- BY739/Y7893- Y7881- FGC28403/Y6468- FGC28405/Y6522- FGC28412/Y6528- FGC28415/Y6471- FGC28418/Y6505- FGC28421/Y6473- Y6476- FGC28426/Y6533- Y6478- Y6539- FGC28440/Y6540- FGC28452/Y6550- FGC28453/Y6551- Y6486/FGC28455- FGC28462/Y6488- FGC28469/Y6504- FGC28476/Y6558- FGC28491/Y6565- FGC28500/Y6508- FGC28508/Y6498- FGC28511/Y6573- Y7883- FGC28516/Y6509- Y6580/FGC28526- FGC28531/Y6581- ZS6704/FGC28534/Y6583- Y7887-
N-Y7310: FGC28530/Y7871- FGC28529/Y7870- FGC28520/Y7888- FGC28465/Y7876- FGC28446/Y7874- FGC28424/Y7310- FGC28439/Y7873- FGC28442/Y7311- FGC28468/Y7314- FGC28477/Y7878- Y7879/FGC28478- FGC28481/Y7315- FGC28488/Y7886- FGC28503/Y7317-
N-FGC28483: FGC28483-”
Дакле,
IR1 је позитиван на Y6503 и негативан на L665. Тај L665 је заправо „крив“ за збрку јер је у објављеним сировим подацима за IR1 означен као позитиван. Па када још у тим истим објављеним подацима нисам нашао Y6503, постао сам сумњичав...
Извињавам се на изазваној збрци, али увек се држим оне старе „три пута мери – једном сеци“... Или у овом случају – два, три пута провери...