Г25 средњи век

[kocovic]

Тестирам Г25 калкулатор па ми требају добровољци.

Код: [Изабери]

Early_Ottoman_Turk,0.0902997,0.0411289,-0.0112822,-0.0306042,-0.0228246,-0.0120388,0.0052875,-0.0008077,-0.0149132,-0.0000607,-0.0027334,0.0033345,-0.0041253,-0.0009978,-0.0015042,-0.0033588,-0.0009996,0.0009713,0.0014246,-0.0011776,-0.0042528,0.0004534,0.0001027,-0.003404,-0.0009979
Albania_Ottoman,0.1220184,0.1486734,0.014934,-0.0221578,0.0270204,-0.0087572,0.002491,0.0023998,0.0008998,0.0174582,0.0027282,0.0060248,-0.0076114,0.006936,-0.0207924,0.0010872,0.0178106,0.00038,0.0054804,-0.0047522,-0.0116046,0.0032892,0.0015038,0.0046272,-0.0064664
Albania_Medieval,0.1206525,0.1543605,0.0143305,-0.03553,0.024312,-0.007251,-0.002115,-0.001269,0.003068,0.019864,0.0020295,0.005545,-0.013082,0.0008255,-0.0192725,-0.012596,0.010561,-0.002154,0.008296,-0.0155075,-0.009421,0.0030295,0.0003695,-0.0013855,0.0
Serbia_Ottoman,0.1255847,0.1296493,0.0560653,0.0424207,0.0414437,0.0085523,0.010184,0.006923,-0.0002727,-0.0060137,-0.0040597,-0.0058947,0.006095,0.0158267,-0.0137983,0.0005743,0.005172,0.0009713,0.005489,0.0064197,-0.0017467,-0.005111,-0.0002053,-0.0006027,0.0010377
Bulgaria_Medieval,0.12236,0.133542,0.0130105,-0.0040375,0.0116945,0.0043225,-0.0003525,0.0016155,-0.0052155,0.0025515,0.0005685,0.0028475,0.0060955,0.0063995,-0.007736,0.004972,0.0075625,0.0002535,0.0015715,-0.0026265,-0.00549,-0.001051,0.0069015,0.0018075,-0.0035925
Bulgaria_Medieval_Bulgar,0.10927,0.072103,0.042992,0.010982,0.008001,-0.000837,0.00705,0.003692,-0.000205,0.002187,-0.001137,0.005245,0.001635,0.004404,-0.004614,-0.013524,-0.014603,0.003927,0.003645,0.006003,-0.012353,0.000866,-0.000986,-0.001687,0.001317

Мислим да је углавном погоднији за централни и источни Балкан, али ајде да видим какве резултате овде добијате

[Ивица Јовановић]

Evo sa tvojim kalkulatorom:

Distance to:   IvicaJovanovic_scaled
0.04195380   Bulgaria_Medieval
0.04859734   Serbia_Ottoman
0.04874359   Albania_Ottoman
0.06294453   Albania_Medieval
0.08462407   Bulgaria_Medieval_Bulgar
0.13909094   Early_Ottoman_Turk



A evo sa jednim starim kalkulatorom koji sam napravio, isto srednji vek:

Distance to:   IvicaJovanovic_scaled
0.03638264   Macedonia_Medieval
0.04195380   Bulgaria_Medieval
0.04716852   Croatia_Medieval_o
0.04859734   Serbia_Sirmium_Ottoman.SG
0.05247681   Hungary_Medieval.SG
0.06294453   Albania_Medieval
0.06428767   Croatia_Medieval
0.07095790   BosniaHerzegovina_Medieval
0.15657371   Turkey_Medieval
0.34352624   Romania_Medieval

Vlaškoj populaciji istoka Srbije je bliža srednjevekovna Makedonija od Srbije, Bugarske ili Rumunije. Svi koje sam provukao su dobili Macedonia_Medieval na prvom mestu, dok je ono ispod variralo.

[Небојша]

[НикПав]

Distance to:   Nikola_scaled
0.05342711   Serbia_Ottoman
0.05516450   Bulgaria_Medieval
0.06218714   Albania_Ottoman
0.07011574   Albania_Medieval
0.08434254   Bulgaria_Medieval_Bulgar
0.14422931   Early_Ottoman_Turk


Target: Nikola_scaled
Distance: 3.0197% / 0.03019655
57.6   Serbia_Ottoman
40.4   Albania_Medieval
2.0   Bulgaria_Medieval_Bulgar

[ДушанВучко]

У овом калкулатору има свега сем "Serbian medieval"... добар неки калкулатор, има "albanian medieval ", a нема "serbian medieval"...По калкулатору, ми смо егал са Албанцима у османском периоду, а у средњем веку, њих има, а нас не..."лепо" су то сачинили...

[ДушанВучко]

У овом калкулатору има свега сем "Serbian medieval"... добар неки калкулатор, има "albanian medieval ", a нема "serbian medieval"...По калкулатору, ми смо егал са Албанцима у османском периоду, а у средњем веку, њих има, а нас не..."лепо" су то сачинили...

Не само везано за њих, него свих отприлике има у категорији "medieval", сем нас ... значи, ми имамо "црну рупу" у средњем веку у овом калкулатору, за разлику од других 
"Serbian medieval don't exist in this calculator"
Срећа па је само калкулатор

[ДушанВучко]

Ово је калкулатор где се шаље порука: "брале, ти си "случајни Србин " (само добијеш два, три Арбанаса, Бугарина, Румуна", "medieval " и шарено, шареније од онога што си мислио, а то шта си мислио, тога "нема"... јер, ако нисам "serbian medieval", а јесам"albanian, romanian, bulgarian...", онда сам све друго више, него оно што сам
Само избриши српски средњи век из могућности у калкулатору, и добијеш било шта друго сем тога

[ДушанВучко]

Evo sa tvojim kalkulatorom:

Distance to:   IvicaJovanovic_scaled
0.04195380   Bulgaria_Medieval
0.04859734   Serbia_Ottoman
0.04874359   Albania_Ottoman
0.06294453   Albania_Medieval
0.08462407   Bulgaria_Medieval_Bulgar
0.13909094   Early_Ottoman_Turk



A evo sa jednim starim kalkulatorom koji sam napravio, isto srednji vek:

Distance to:   IvicaJovanovic_scaled
0.03638264   Macedonia_Medieval
0.04195380   Bulgaria_Medieval
0.04716852   Croatia_Medieval_o
0.04859734   Serbia_Sirmium_Ottoman.SG
0.05247681   Hungary_Medieval.SG
0.06294453   Albania_Medieval
0.06428767   Croatia_Medieval
0.07095790   BosniaHerzegovina_Medieval
0.15657371   Turkey_Medieval
0.34352624   Romania_Medieval

Vlaškoj populaciji istoka Srbije je bliža srednjevekovna Makedonija od Srbije, Bugarske ili Rumunije. Svi koje sam provukao su dobili Macedonia_Medieval na prvom mestu, dok je ono ispod variralo.

Овде има "medieval" свих около, сем нас...таква случајност није без намере, а видео сам и код других , то ми је упало у очи. Али да кажемо да и претерујем, хипотетички, у машти, да су све те територије имале своје државе у "medieval"  периоду, али некако наша је изостала из калкулатора

[Ивица Јовановић]

Ово је калкулатор где се шаље порука: "брале, ти си "случајни Србин " (само добијеш два, три Арбанаса, Бугарина, Румуна", "medieval " и шарено, шареније од онога што си мислио, а то шта си мислио, тога "нема"... јер, ако нисам "serbian medieval", а јесам"albanian, romanian, bulgarian...", онда сам све друго више, него оно што сам
Само избриши српски средњи век из могућности у калкулатору, и добијеш било шта друго сем тога

Можда, мада мислим да је то суштински немогуће. С обзиром на огромну територију, тешко је очекивати да би се могао утврдити просек који би одговарао свим тадашњим регионима а који би могли да назовемо 'serbian_medieval_average'. Чак и да је могуће, до 12. века би се могло очекивати нешто што би се налазило на пола пута између BosniaHerzegovina_Medieval и Montenegro_Doclea_Roman, уз одређене варијације од жупе до жупе рекао бих. Након 12. века била би потребна једна велика промена односно додатак (Македонија и источније). О периоду касног средњег века у областима северно од Саве и Дунава да и не говоримо. Дакле, један просек за средњовековне Србе једноставно не би био утемељен у реалности, мора их бити више.

Добро сте приметили, нема много serbian_medieval узорака. Тај период је у сенци Рима, Винче а ускоро и палеолита на просторима које насељавају Срби. Али проће и то и биће узорака. Искрен да будем ово BosniaHerzegovina_Medieval и Montenegro_Doclea_Roman, али и још пар њих, без проблема могу проћи као serbian_medieval.

[kocovic]

Albania_Medieval су у суштини Римљани. Данас најсличнији са грчким власима - Арванитима, само што је пронађен у јужној Албанији па сам га тако завео.
Albania_Ottoman су узорци из Албаније из турког периода.
Serbia_Ottoman су узорци из Срема у доба Турака. Други историјски узорак из Србије не постоји.
Bulgaria_Medieval су узорци из Бугарске у касније средњем веку. Овде за разлику од Србије не постоји узорак из Турског доба.
Bulgaria_Medieval_Bulgar и Early_Ottoman_Turk су баш то што пише, један је прави азијски Бугар, док су други рани Турци Османлије.

Такође ово су све просеци, осим за Bulgaria_Medieval_Bulgar где је у питању само један узорак. И још једном понављам ово је тест. Хоћу да видим колико су реални резултати ових узорака које званично стоје на Вахадуу, у односу на тренутну популацију Балкана (не само Србије) јер не може да буде да баш нико није близак овим узорцима из Срема.

[kocovic]

Distance to:   kocovic_scaled
0.02692333   Albania_Ottoman
0.03357732   Bulgaria_Medieval
0.04060962   Albania_Medieval
0.07118642   Serbia_Ottoman
0.08560962   Bulgaria_Medieval_Bulgar
0.12928213   Early_Ottoman_Turk

Target: kocovic_scaled
Distance: 1.1298% / 0.01129755
33.2   Albania_Ottoman
31.2   Albania_Medieval
23.0   Serbia_Ottoman
7.8   Bulgaria_Medieval
4.8   Bulgaria_Medieval_Bulgar

[Ивица Јовановић]

Што се средњег века тиче нисмо само ми у Србији оштећени, немају ни Грци такав неки узорак на Вахадуо. Немају ни Румуни јер је њихов узорак у ствари Монгол. Нама недостају узорци, можда би у некој перспективи најкорисније тестирати узорке из Малог Зворника и оне узорке са границе Србије и Црне Горе. Мислим на оне који су пронађени код саме границе и датирани у неки 11. или 12. век ја мислим. Било је у новинама пре пар година, велика некропола, камени саркофази.

[НиколаВук]

Што се средњег века тиче нисмо само ми у Србији оштећени, немају ни Грци такав неки узорак на Вахадуо. Немају ни Румуни јер је њихов узорак у ствари Монгол. Нама недостају узорци, можда би у некој перспективи најкорисније тестирати узорке из Малог Зворника и оне узорке са границе Србије и Црне Горе. Мислим на оне који су пронађени код саме границе и датирани у неки 11. или 12. век ја мислим. Било је у новинама пре пар година, велика некропола, камени саркофази.

Ако под Малим Зворником мислиш на Орловине, та истраживања нису још ни публикована, иако је прва кампања била сада већ далеке 2013. године. Због тога сумњам да ће тамо пронађене скелете да узимају у обзир за археогенетску анализу, макар док не буду објављени. Друга ствар је што, колико је мени познато (био сам у саставу тима који је ископавао на прве две кампање), ти пронађени скелети не припадају раносредњовековном већ рановизантијском раздобљу (6. век). Свакако би било занимљиво видети шта би анализа показала, јер нисам сигуран да ли је и један скелет са рановизантијских висинских утврђења и градова у Србији прошао кроз такву анализу.

[drajver]

Што се средњег века тиче нисмо само ми у Србији оштећени, немају ни Грци такав неки узорак на Вахадуо. Немају ни Румуни јер је њихов узорак у ствари Монгол. Нама недостају узорци, можда би у некој перспективи најкорисније тестирати узорке из Малог Зворника и оне узорке са границе Србије и Црне Горе. Мислим на оне који су пронађени код саме границе и датирани у неки 11. или 12. век ја мислим. Било је у новинама пре пар година, велика некропола, камени саркофази.

Имаш неколико српских средњовјековних узорака из налазишта Doclea код Подгорице из раног средег вијека (8-12 в.). Аутосомално словенско-старобалканска мјешавина. Један од мушких узорака је https://www.yfull.com/tree/J-CTS6190/ хаплогрупа које има и код данашњих Срба.

[Ивица Јовановић]

gde mogu da nadjem koordinate tih uzoraka?

[drajver]

gde mogu da nadjem koordinate tih uzoraka?

Имаш их код eurogenes у оним његовим координатама узорака. Потражи под Doclea.

[kocovic]

Што се средњег века тиче нисмо само ми у Србији оштећени, немају ни Грци такав неки узорак на Вахадуо. Немају ни Румуни јер је њихов узорак у ствари Монгол. Нама недостају узорци, можда би у некој перспективи најкорисније тестирати узорке из Малог Зворника и оне узорке са границе Србије и Црне Горе. Мислим на оне који су пронађени код саме границе и датирани у неки 11. или 12. век ја мислим. Било је у новинама пре пар година, велика некропола, камени саркофази.

Интересује ме углавном 14-16 век, евентуално 17. век. Ово претходно ми је заиста небитно. Људи су се превише селили да би могао нешто да утврдиш.

[drajver]

Интересује ме углавном 14-16 век, евентуално 17. век. Ово претходно ми је заиста небитно. Људи су се превише селили да би могао нешто да утврдиш.

Онда поготово не можеш ништа да добијеш из аутосомалних PCA калкулација. Оне су генерално безвриједне за сав период уназад 2000 година. Немају ту врсту прецизности да могу показати било какве битне информације везане за поријекло. Највише што се може добити јесте општи однос словенско-несловенско у аутосомалној мјешавини.

Зато предлажем да се пребациш на IBD анализу.

[kocovic]

Онда поготово не можеш ништа да добијеш из аутосомалних PCA калкулација. Оне су генерално безвриједне за сав период уназад 2000 година. Немају ту врсту прецизности да могу показати било какве битне информације везане за поријекло. Највише што се може добити јесте општи однос словенско-несловенско у аутосомалној мјешавини.

Зато предлажем да се пребациш на IBD анализу.

За сада је ИБД анализа поприлично недоступна.
Колико сам видео сви користе исте алате: qpdAdm и plink2. Први да тестирају хипотезе, други за конверзију 23andMe или VCF фајла у shotgun (SG) формат. Са друге стране неке верзије plink2 су ми правиле проблем при конверзији, па сам ту сам стао.

[drajver]

За сада је ИБД анализа поприлично недоступна.
Колико сам видео сви користе исте алате: qpdAdm и plink2. Први да тестирају хипотезе, други за конверзију 23andMe или VCF фајла у shotgun (SG) формат. Са друге стране неке верзије plink2 су ми правиле проблем при конверзији, па сам ту сам стао.

Да, нема засад неког погодног и лако употребљивог софтвера за IBD, а није ми познато ни да постоји нека онлајн база гдје би се старим узорцима могли упоређивати савремени узорци. Што је штета, јер мислим да би то помјерило ставри доста напријед.