Аутор Тема: Питање везано за разлику у маркерима  (Прочитано 3391 пута)

Ван мреже Bojan

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 203
  • ПХ908>А20333>FT14649
Одг: Питање везано за разлику у маркерима
« Одговор #20 послато: новембар 29, 2019, 06:23:22 поподне »
У принципу сви ови последњи постови су тачни.Ја бих само додао да постоје брзо и споро мутирајуќи маркери и на основу управо њих стручњаци дају процене могуќе повезаности меѓу тестираним кандидатима.Али на крају увјек пресуди СНИП...

Ван мреже Ojler

  • Одбор за хералдику
  • Етнолог
  • ******
  • Поруке: 2591
  • Y-DNK: I2-Y3120 Z17855>PH3414 Мириловићи
Одг: Питање везано за разлику у маркерима
« Одговор #21 послато: новембар 29, 2019, 08:33:32 поподне »
У принципу сви ови последњи постови су тачни.Ја бих само додао да постоје брзо и споро мутирајуќи маркери и на основу управо њих стручњаци дају процене могуќе повезаности меѓу тестираним кандидатима.Али на крају увјек пресуди СНИП...

И то у вези брзине промене маркера, који је брзо а који споро мутирајући, је опет емпиријски закључак. Нећеш наћи два истраживања која дају исте вероватноће мутације маркера, а налазио сам примере где су разлике добијених вероватноћа промене истог маркера и преко 50%. Мој мишљење је да је давање било какве процене TMRC само на основу разлика на STR маркерима неутемељено и безвредно.
Kамене рабъ и госодинъ

Ван мреже Radul

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 934
  • J2a-Z38463>SK1357+ Башино Село, Цетиње
Одг: Питање везано за разлику у маркерима
« Одговор #22 послато: новембар 29, 2019, 08:59:11 поподне »
И то у вези брзине промене маркера, који је брзо а који споро мутирајући, је опет емпиријски закључак. Нећеш наћи два истраживања која дају исте вероватноће мутације маркера, а налазио сам примере где су разлике добијених вероватноћа промене истог маркера и преко 50%. Мој мишљење је да је давање било какве процене TMRC само на основу разлика на STR маркерима неутемељено и безвредно.

Па није баш то тако, упрошћаваш.  Елем, већина истраживања популационе генетике рађена су са прорачунима НЗП само на основу разлика на STR маркерима, групно. Шта више показала су се итекако тачна, тако да се користе и у новим радовима.

Ван мреже Radul

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 934
  • J2a-Z38463>SK1357+ Башино Село, Цетиње
Одг: Питање везано за разлику у маркерима
« Одговор #23 послато: новембар 29, 2019, 09:10:47 поподне »
Ако сам добро разумео:
If two individuals exactly match at all loci in a 21 marker test, there is a 50% probability of a MRCA within the last 8 generations


Не може се на основу 23 маркера тврдити то (there is a 50% probability of a MRCA within the last 8 generations). Не може се радити појединачни прорачун. Што због мањег броја маркера, што због могуће конвергенције, елем не мутирају сви маркери истом брзином. Са 23 маркера можеш имати само тезу о ближе и даље повезаним унутар рода. Мада и то може бити релативно. Са друге стране, за већи род могуће је утврдити групну оквирну старост и на стандарду од Y23.





 
« Последња измена: новембар 29, 2019, 09:19:17 поподне Radul »

Ван мреже Ojler

  • Одбор за хералдику
  • Етнолог
  • ******
  • Поруке: 2591
  • Y-DNK: I2-Y3120 Z17855>PH3414 Мириловићи
Одг: Питање везано за разлику у маркерима
« Одговор #24 послато: новембар 29, 2019, 11:25:03 поподне »
Па није баш то тако, упрошћаваш.  Елем, већина истраживања популационе генетике рађена су са прорачунима НЗП само на основу разлика на STR маркерима, групно. Шта више показала су се итекако тачна, тако да се користе и у новим радовима.

Погледај ову упоредну табелу резултата 14 различитих истраживања стопе мутације STR маркера. Неке стопе се за исти маркер разликују и по 400%. Како се онда може тврдити да су процене на бази оваквих параметара поуздане?

Kамене рабъ и госодинъ

Ван мреже Bojan

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 203
  • ПХ908>А20333>FT14649
Одг: Питање везано за разлику у маркерима
« Одговор #25 послато: новембар 30, 2019, 12:07:20 пре подне »
И то у вези брзине промене маркера, који је брзо а који споро мутирајући, је опет емпиријски закључак. Нећеш наћи два истраживања која дају исте вероватноће мутације маркера, а налазио сам примере где су разлике добијених вероватноћа промене истог маркера и преко 50%. Мој мишљење је да је давање било какве процене TMRC само на основу разлика на STR маркерима неутемељено и безвредно.
ја управо то и рекох у последњој реченици мог поста,снип је кадија.Можемо ми просипати памет,а радо бих се другачије изразио,али снип суди и опак је и не ферма ни маркере ни живу силу...

Ван мреже Radul

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 934
  • J2a-Z38463>SK1357+ Башино Село, Цетиње
Одг: Питање везано за разлику у маркерима
« Одговор #26 послато: новембар 30, 2019, 01:02:27 пре подне »
Погледај ову упоредну табелу резултата 14 различитих истраживања стопе мутације STR маркера. Неке стопе се за исти маркер разликују и по 400%. Како се онда може тврдити да су процене на бази оваквих параметара поуздане?


Знам за то, постављао сам давно ову табелу. Постоје разлике тачно, као што постоје и за СНП рачунање. Адекватнија је она студија која има већу базу података и која је новија.
Стопе мутације по алелима:

ја управо то и рекох у последњој реченици мог поста,снип је кадија.Можемо ми просипати памет,а радо бих се другачије изразио,али снип суди и опак је и не ферма ни маркере ни живу силу...
Бојане нико не спори да је снип најбољи за одређивање НЗП-а, овде је било ријечи шта се може са 23 маркера. У чему се сви слажемо.

Ван мреже Ojler

  • Одбор за хералдику
  • Етнолог
  • ******
  • Поруке: 2591
  • Y-DNK: I2-Y3120 Z17855>PH3414 Мириловићи
Одг: Питање везано за разлику у маркерима
« Одговор #27 послато: новембар 30, 2019, 01:30:55 пре подне »
Знам за то, постављао сам давно ову табелу. Постоје разлике тачно, као што постоје и за СНП рачунање. Адекватнија је она студија која има већу базу података и која је новија.

Шта знам... Ја ту не видим неку зависност ни од броја узорака ни од старости истраживања. Код неких маркера су након тесет година истраживања поново добијене вредности које су била добијане на почетку, а да су узорци били приближно исти, с тим да су у свим оним истраживањима током тих 10 година вредности значајно осциловале. Али то нам је што нам је. Кад је реч о STR мутацијама боље процене немамо...
Kамене рабъ и госодинъ

Ван мреже Александар Невски

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 1004
  • Борац за педерско-некрофилско-људождерска права.
Одг: Питање везано за разлику у маркерима
« Одговор #28 послато: новембар 30, 2019, 07:46:51 пре подне »
Погледај ову упоредну табелу резултата 14 различитих истраживања стопе мутације STR маркера. Неке стопе се за исти маркер разликују и по 400%. Како се онда може тврдити да су процене на бази оваквих параметара поуздане?


Молим да се овоме скупу процѣн брзина промѣне на ознаках дода и моя: (Невски 2015):

https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=739.msg14353#msg14353
Србски пѣсник Лаза Костић: "у млазових прочитам сричући" "по уздасих тако први' у јунака реч поврви"

Ван мреже Ojler

  • Одбор за хералдику
  • Етнолог
  • ******
  • Поруке: 2591
  • Y-DNK: I2-Y3120 Z17855>PH3414 Мириловићи
Одг: Питање везано за разлику у маркерима
« Одговор #29 послато: новембар 30, 2019, 11:18:51 пре подне »
Молим да се овоме скупу процѣн брзина промѣне на ознаках дода и моя: (Невски 2015):

https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=739.msg14353#msg14353

Хвала Невски! Јеси ли можда у међувремену урадио нове процене стопа мутације?
Kамене рабъ и госодинъ

Ван мреже Александар Невски

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 1004
  • Борац за педерско-некрофилско-људождерска права.
Одг: Питање везано за разлику у маркерима
« Одговор #30 послато: новембар 30, 2019, 04:52:11 поподне »
Хвала Невски! Јеси ли можда у међувремену урадио нове процене стопа мутације?

Не, иако више пута размишљах о том. Йедноставно не постизавам од других работа.
Србски пѣсник Лаза Костић: "у млазових прочитам сричући" "по уздасих тако први' у јунака реч поврви"