YHRD

[Be like Bill]

Ne znam da li negde postoji posebna tema o YHRD bazi podataka. Ako postoji, poruku slobodno prebacite na drugo mesto.

Na YHRD-u su pre sat vremena izvršili novu dopunu baze podataka i ugradili zanimljivu mogućnost analize najbrojnijih haplotipova koji se nalaze u pojedinim nacionalnim bazama podataka bez obzira na rad iz koga potiču. Tako možete npr uporediti najčešće hrvatske i srpske haplotipove

https://yhrd.org/tools/national_database/Croatia

https://yhrd.org/tools/national_database/Serbia

(spustite se malo ispod karte. Na žalost zasad daju samo 10 najčešćih haplotipova po projektu ali nadam se da će i dalje napredovati sa tom idejom)

[CosicZ]

Ново издање https://yhrd.org/pages/resources/release_history

Release 64 - 2021/May/10

Contribution YA003787 (Bosnia and Herzegovina [Bosnian]): append 100 => 580
Contribution YA004313 (Chubut, Argentina [Admixed]): append 204 => 264
Contribution YA004314 (Rio Negro, Argentina [Admixed]): append 6 => 36
Contribution YA004694 (Sichuan, China [Han]): new 0 => 176
Contribution YA004695 (Sichuan, China [Tibetan]): new 0 => 186
Contribution YA004696 (Sichuan, China [Yi]): new 0 => 165
Contribution YA004697 (Luoyang, China [Han]): new 0 => 2314
Contribution YA004699 (Trelew, Argentina [Admixed]): new 0 => 66
Contribution YA004700 (Tonghua, China [Korean]): new 0 => 539
Contribution YA004701 (Majorca, Spain [Chueta]): new 0 => 100
Contribution YA004702 (Majorca, Spain [Majorcan]): new 0 => 46
Contribution YA004703 (Puno, Peru [Aymara]): new 0 => 89
Contribution YA004704 (Shuozhou, China [Han]): new 0 => 1374
Contribution YA004705 (Baoding, China [Han]): new 0 => 1405
Contribution YA004706 (Odisha, India [Indian]): new 0 => 202
Contribution YA004707 (Guangdong, China [Hakka Han]): new 0 => 260
Contribution YA004708 (Guangdong, China [She]): new 0 => 215
Contribution YA004709 (Guangdong, China [Han]): new 0 => 601
Contribution YA004710 (Zhejiang, China [Han]): new 0 => 340
Contribution YA004711 (Fujian, China [Han]): new 0 => 80
Contribution YA004712 (Russian Federation [Russian]): new 0 => 691
Contribution YA004713 (Yunnan, China [Han]): new 0 => 3448
Contribution YA004714 (North Kazakhstan, Kazakhstan [Kazakh]): new 0 => 382
Contribution YA004715 (Malta [Maltese]): new 0 => 292
Contribution YA004716 (Sichuan, China [Qiang]): new 0 => 564
Contribution YA004717 (Cyprus [Armenian Cypriot]): new 0 => 56
Contribution YA004718 (Cyprus [Maronite Cypriot]): new 0 => 57
Contribution YA004719 (Uttar Pradesh, India [Gujjar]): new 0 => 202
Contribution YA004720 (Maoming, China [Han]): new 0 => 431
Contribution YA004721 (Nayagarh-Odisha, India [Indian]): new 0 => 236
Contribution YA004722 (Madhya Pradesh, India [Indian]): new 0 => 511
Contribution YA004723 (Puebla, México [Mestizo]): new 0 => 380
Former database sizes: minimal=321472, y12=280844, yfiler=261123, y23=89578, yfilerplus=89554, ymax=38089, ysnp=25835
New database sizes: minimal=337450, y12=296792, yfiler=277005, y23=93999, yfilerplus=97087, ymax=40201, ysnp=29429

https://yhrd.org/pages/resources/national_databases
https://yhrd.org/pages/resources/composition
https://yhrd.org/tools/national_database/Bosnia%20and%20Herzegovina
https://yhrd.org/YA003787

[Be like Bill]

Danas je izašla nova dopuna YHRD-ove baze podataka. PF7263 nije loše prošao. Dobili smo dva nova rođaka, jedan u Veneciji a drugi, verovali ili ne, na Tibetu. Što se tiče PF7257* i dalje nema ništa što bi moglo biti povezano sa njim. Novi haplotipovi su uglavnom poreklom iz Kine.

https://yhrd.org/pages/resources/release_history

Release 65 - 2021/Aug/05

Contribution YA004123 (Ordos, China [Mongolian]): append 258 => 471
Contribution YA004223 (Liangshan, China [Yi]): append 939 => 1043
Contribution YA004613 (Qinghai, China [Tibetan]): append 45 => 103
Contribution YA004724 (Veneto, Italy [Italian]): new 0 => 115
Contribution YA004725 (Emilia-Romagna, Italy [Italian]): new 0 => 248
Contribution YA004726 (Chengdu, China [Tibetan]): new 0 => 95
Contribution YA004727 (Hohhot, China [Mongolian]): new 0 => 240
Contribution YA004728 (Hulun Buir, China [Mongolian]): new 0 => 226
Contribution YA004729 (Liangshan, China [Tibetan]): new 0 => 101
Contribution YA004730 (Shigatse, China [Sherpa]): new 0 => 161
Contribution YA004731 (Nagaland, India [Naga]): new 0 => 203
Contribution YA004732 (Zimbabwe [Zimbabwean]): new 0 => 480
Contribution YA004733 (Yunnan, China [Lisu]): new 0 => 423
Contribution YA004734 (Punjab, Pakistan [Jat]): new 0 => 143
Contribution YA004735 (Punjab, India [Ramgarhia]): new 0 => 170
Contribution YA004736 (Yunnan, China [Va]): new 0 => 368
Contribution YA004737 (Yunnan, China [Yi]): new 0 => 397
Contribution YA004738 (Yunnan, China [Hui]): new 0 => 297
Contribution YA004739 (Yunnan, China [Bai]): new 0 => 142
Contribution YA004740 (Yunnan, China [Han]): new 0 => 933

[CosicZ]

И овим Италијанима су тестирани SNP маркери, видим да их има са E-V13, J2a-M92, J2b, R1a:
https://yhrd.org/pages/resources/composition#ysnps
https://yhrd.org/YA004724
https://yhrd.org/YA004725

На пример, овај I1 са PowerPlex Y23 хаплотипом:
16 12 20 28 14 10 25 12 11 10 16 21 21 23 12 11 12 13 16 13,14 14 12

[Be like Bill]

Izašla je nova dopuna na YHRD-u, prilično zanimljiva što se tiče naših krajeva. Pojavili su se srpski haplotipovi sa Kosova u čijem sakupljanju su pomogli i ljudi sa Porekla. Na žalost, ne kao rezultat u okviru Republike Srbije nego kao rezultat u okviru Republike Kosovo čim je i Kosovo došlo u rang država koje su prihvaćene kao deo YHRD zajednice.

Nešto bolja vest je da su Damir Marjanović i Dragan Primorac priložili novu grupu haplotipova iz Pule, Splita, Hvara, Osijeka i Varaždina (al' su tu padale dnevnice ) tako da bi bilo dobro ponovo provući stare haplotipove kroz YHRD pretraživač ne bi li se pojavilo što novo.

J1 PF7263 je "razbio" kod Sorani Kurda što i nije neka novost, više potvrda onog što sam ranije znao.

Na žalost, uklonili su rezultate Roma i Afganistanaca u Nemačkoj, što sam i očekivao nakon nedavog ulaska Woke kulture u genetičku geneologiju

Release 66 - 2021/Dec/07

Contribution YA003315 (United States [Hispanic American]): replace 236 => 236
Contribution YA004399 (Uttar Pradesh, India [Indian]): append 132 => 518
Contribution YA004437 (Maryland, United States [European American]): replace 345 => 359
Contribution YA004438 (Maryland, United States [African American]): replace 330 => 341
Contribution YA004439 (Maryland, United States [Asian American]): replace 96 => 96
Contribution YA004694 (Sichuan, China [Han]): append 176 => 358
Contribution YA004741 (Sichuan, China [Hakka Han]): new 0 => 171
Contribution YA004742 (Hvar, Croatia [Croatian]): new 0 => 104
Contribution YA004743 (Osijek, Croatia [Croatian]): new 0 => 109
Contribution YA004744 (Pula, Croatia [Croatian]): new 0 => 94
Contribution YA004745 (Split, Croatia [Croatian]): new 0 => 102
Contribution YA004746 (Varazdin, Croatia [Croatian]): new 0 => 98
Contribution YA004747 (England [English]): new 0 => 461
Contribution YA004748 (Ireland [Irish]): new 0 => 191
Contribution YA004751 (Gansu, China [Yugur]): new 0 => 98
Contribution YA004752 (Inner Mongolia, China [Han]): new 0 => 159
Contribution YA004754 (Rétköz, Hungary [Hungarian]): new 0 => 101
Contribution YA004755 (Vág Valley, Slovakia [Hungarian]): new 0 => 48
Contribution YA004756 (Sikkim, India [Nepali, Bhutia, Lepcha]): new 0 => 35
Contribution YA004757 (Rajasthan, India [Indian]): new 0 => 281
Contribution YA004758 (Amazonas, Peru [Awajun]): new 0 => 18
Contribution YA004759 (Kosovo [Serbian]): new 0 => 400
Contribution YA004760 (Iraq [Sorani Kurdish]): new 0 => 157
Contribution YA004290 (Germany [Romanian]) removed => -42
Contribution YA004291 (Germany [Afghan]) removed => -32

https://yhrd.org/pages/resources/release_history

[Небојша]

Nešto bolja vest je da su Damir Marjanović i Dragan Primorac priložili novu grupu haplotipova iz Pule, Splita, Hvara, Osijeka i Varaždina (al' su tu padale dnevnice ) tako da bi bilo dobro ponovo provući stare haplotipove kroz YHRD pretraživač ne bi li se pojavilo što novo.

Знаш ли можда које је тачно истраживање у питању, или је реч о спајању резузлтата из неколико претходних студија?

[Селаковић]

Izašla je nova dopuna na YHRD-u, prilično zanimljiva što se tiče naših krajeva. Pojavili su se srpski haplotipovi sa Kosova u čijem sakupljanju su pomogli i ljudi sa Porekla.

https://yhrd.org/pages/resources/release_history

Како на линку који сте окачили пише, хаплотипове су приложили:

"Miljana Kecmanović, Milica Mihajlović, Vanja Tanasić, Verica Radojičić, Feđa Puač, Milica Keckarević Marković, Dušan Keckarević". 

[Atlantische]

Срамотна подршка афирмацији терористичке-нарко државе од стране београдских научника.

[Be like Bill]

Знаш ли можда које је тачно истраживање у питању, или је реч о спајању резузлтата из неколико претходних студија?

Ne znam. Pretpostavljam da je nešto novo. Marjanović i Primorac su pomenuti kao prilagači bez navođenja rada.

[Be like Bill]

Како на линку који сте окачили пише, хаплотипове су приложили:

"Miljana Kecmanović, Milica Mihajlović, Vanja Tanasić, Verica Radojičić, Feđa Puač, Milica Keckarević Marković, Dušan Keckarević".

Tako piše, ali kao zemlja na koju se vode rezultati ispitivanja piše Kosovo. Hvala Bogu, bar su istakli da se radi o Srbima umesto da su ih sve strpali u kategoriju "Kosovari".

https://drive.google.com/file/d/1hH__Wla5ktKHL4Lz23ofHgkepr1pi7YG/view?usp=sharing

[Atlantische]

Tako piše, ali kao zemlja na koju se vode rezultati ispitivanja piše Kosovo. Hvala Bogu, bar su istakli da se radi o Srbima umesto da su ih sve strpali u kategoriju "Kosovari".

https://drive.google.com/file/d/1hH__Wla5ktKHL4Lz23ofHgkepr1pi7YG/view?usp=sharing

Јединих 400 хаплотипова који представљају ту квази државу чине хаплотипови оних чији су најмилији убијани у име борбе за настанак те творевине. Питам се, шта би рекли тестирани на овакав срамотан потез оних који су им секвенцирали узорке?

[Лука]

Ех, на шта су све људи спремни због каријере.

[Be like Bill]

Јединих 400 хаплотипова који представљају ту квази државу чине хаплотипови оних чији су најмилији убијани у име борбе за настанак те творевине. Питам се, шта би рекли тестирани на овакав срамотан потез оних који су им секвенцирали узорке?

Znam da im sigurno neće biti lako, ali situacija je takva kakva je. YHRD drže Nemci, pa su oni verovatno i kumovali pod kojim će se imenom pojaviti haplotipovi. Naši bi teoretski mogli povući rezultate, ali onda bi se opet Srbi opet povlačili u tamu a Kosovo će se sasvim sigurno ponovo pojaviti na spisku YHRD kontributora. Kako god okreneš, nema dobrog rešenja

[Atlantische]

Znam da im sigurno neće biti lako, ali situacija je takva kakva je. YHRD drže Nemci, pa su oni verovatno i kumovali pod kojim će se imenom pojaviti haplotipovi. Naši bi teoretski mogli povući rezultate, ali onda bi se opet Srbi opet povlačili u tamu a Kosovo će se sasvim sigurno ponovo pojaviti na spisku YHRD kontributora. Kako god okreneš, nema dobrog rešenja

Не видим какво је то "повлачење у таму". Уосталом, та тама је била досадашње непостојање тзв. Косова на YHRD, тако да подржавам највећу могућу таму у том случају. Ако се и кад-тад тамо појави та нарко творевина, зашто пре тога и зашто уопште српска научна заједница мора давати ветар у леђа томе? Дакле, сами Арнаути су у својој приштинској касаби неспособни за било какве STR анализе, али је зато ту неко из Београда да их уврсти на YHRD. Генијално, као фамозних бриселских 5:0. Хаплотипи су се могли подвести под нпр. централну Србију, ако је већ донета одлука да се поставе на YHRD.

[Platin]

Мени није јасно ништа више од тога да су неки наши научници радили над неким узорцима.

Да ли су им наши сами послали резултате или су их ови навели као литературу... немам појма.

[Be like Bill]

Не видим какво је то "повлачење у таму". Уосталом, та тама је била досадашње непостојање тзв. Косова на YHRD, тако да подржавам највећу могућу таму у том случају. Ако се и кад-тад тамо појави та нарко творевина, зашто пре тога и зашто уопште српска научна заједница мора давати ветар у леђа томе? Дакле, сами Арнаути су у својој приштинској касаби неспособни за било какве STR анализе, али је зато ту неко из Београда да их уврсти на YHRD. Генијално, као фамозних бриселских 5:0. Хаплотипи су се могли подвести под нпр. централну Србију, ако је већ донета одлука да се поставе на YHRD.

Priznajem da izraz "povlačenje u tamu" nije najbolje izabran, a i slažem se da su haplotipovi mogli biti podvedeni pod centralnu Srbiju ili Srbiju bez navođenja lokacije s tim što bi se informacija o lokaciji (južna srpska pokrajina ili sl) mogla obezbediti u samom radu za koji pretpostavljam da će da usledi kao i razlog zašto nije navedena kod pristupa YHRD-u, da ne bi bila zloupotrebljena radi davanja legitimnosti nepostojećoj državi.

No za to bi trebalo razgovarati sa licima koja su prijavila rad Lucu Roveru i Saši Vilvajtu. Mislim da oni jedini mogu nešto preduzeti povodom toga.

[Be like Bill]

Мени није јасно ништа више од тога да су неки наши научници радили над неким узорцима.

Да ли су им наши сами послали резултате или су их ови навели као литературу... немам појма.

Jeste, autori koji žele da njihovi rezultati budu deo baze podataka sami ih prijavljuju. To ima veze sa citiranjima i kliktajima što doprinosi boljem statusu u naučnoj zajednici. Naučnici su kompleksaši isto kao i mi forumaši

https://yhrd.org/pages/help/contribute

[CosicZ]

https://yhrd.org/posts

Beta Version of upcoming YHRD version availabe
We will be updating YHRD on February 7th, 2022. To get a sneak preview, please visit https://beta.yhrd.org and see the news section there for detailed information. If you have any feedback or want to report a bug/error, please contact us.

(posted 8 days ago)

https://beta.yhrd.org/posts

Implementational change to YHRD search
As of YHRD release R67, we have changed the way searches are performed. We are glad to introduce a new search option at YHRD: a selectable “Kit”. Please read about the new search here.

(posted 9 days ago)

 
Convenient collection of Population Studies
At each National Database or Metapopulation summary, all population studies being used to assemble the collection are listed for your convenience.

(posted 9 days ago)

 
Removal of YHRD uncommonly used search features
In order to further reduce the complexity of YHRD (and thus make it easier to maintain), we have decided to remove some uncommonly used features of the YHRD search: ancestry information (minimal), ancestry information (Yfiler) and ancestry information (1-step neighbors).

(posted 9 days ago)

 
Moved from Google Maps to OpenStreetMap
As Google Maps does not comply with our understanding of privacy protection, we have moved from Google Maps to leaflet.js using OpenStreetMap map data. Please make yourself familiar with those new maps e.g. at Western-European Metapopulation or Y-SNP M231 defining Haplogroup N.

(posted 9 days ago)

 
AMOVA removed
Due to the decreasing use and the increasing maintenance work, we decided to remove the tool AMOVA from the public area of YHRD. If you need to use AMOVA, please contact us or use other software for population genetic data analysis (e.g. ARLEQUIN).

(posted 9 days ago)

Упутство за претраживање.
https://beta.yhrd.org/downloads/YHRD_Search_R67.pdf

[CosicZ]

https://yhrd.org/posts

We are pleased to announce the latest release of the YHRD: Release R68. More than 6500 haplotypes were added to the database. Please see our Release History for further information on particular submissions. To allow validation or testing, we have moved the former database version R67 to a special archive available at https://archive.yhrd.org.

https://yhrd.org/pages/resources/release_history

Release 68 - 2022/Oct/29

New contributions: YA004761, YA004763, YA004764, YA004765, YA006003, YA006004, YA006005, YA006006, YA006007, YA006008, YA006009, YA006010, YA006011
Updated contributions: YA003031, YA003484, YA004006, YA004634, YA004737, YA004738, YA005569
Removed contributions: YA005300, YA005003, YA004749, YA006000
Added 894 haplotypes to Metapopulation Admixed
Added 435 haplotypes to Metapopulation African - Sub-Saharan African
Added 145 haplotypes to Metapopulation East Asian - Dravidian
Added 1121 haplotypes to Metapopulation East Asian - Korean
Added 1322 haplotypes to Metapopulation East Asian - Sino-Tibetan - Chinese (Han)
Added 497 haplotypes to Metapopulation East Asian - Sino-Tibetan - Tibeto-Burman
Added 975 haplotypes to Metapopulation East Asian - Tai-Kadai
Added 710 haplotypes to Metapopulation Eurasian - Altaic
Added 755 haplotypes to Metapopulation Eurasian - European - Western European
Added 152 haplotypes to Metapopulation Eurasian - Indian
Added 87 haplotypes to Metapopulation Native American
Added 894 haplotypes to National Database Argentina
Added 435 haplotypes to National Database Benin
Added 2794 haplotypes to National Database China
Added 513 haplotypes to National Database Germany
Added 297 haplotypes to National Database India
Added 651 haplotypes to National Database Kazakhstan
Added 87 haplotypes to National Database Peru
Added 1121 haplotypes to National Database South Korea
Added 6 haplotypes to National Database Spain
Added 236 haplotypes to National Database United Kingdom
Added 59 haplotypes to National Database Uzbekistan
To allow validation or testing, we have moved the former database version R67 to a special archive available at https://archive.yhrd.org.

Пример минимални хаплотип 16 13 31 24 11 11 13 14,15
https://yhrd.org/search/search Found 675 matches in 350,500 Haplotypes.
https://archive.yhrd.org/search/search Found 673 matches in 343,932 Haplotypes.