Аутор Тема: Пољаци  (Прочитано 5160 пута)

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 4825
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: Пољаци
« Одговор #20 послато: октобар 23, 2020, 10:42:00 пре подне »
По броју узорака (2075) значајан рад, по свему осталом приличан промашај. Не могу да схватим да у 2020. години нису били у стању да тестирају ниже гране I2a групе ни R1a, код Пољака најприсутнијих хаплогрупа.

Ураде анализу по регионима и оставе хаплогрупу I као јединствену хаплогрупу, као да су I1 и I2a-YP196 имале исту генетичку историју. Онда дају неку мршаву подјелу на ниже гране, али за читаву узорак Пољака, а не по регионима.

Може се претпоставити да је I2a-YP196 међу Пољацима на око 8-9%. Оно што ме је зачудило јесте присуство само два тестирана E-V13, што је мање од 0,1%. То ми не дјелује превише реално. Примјетио сам и један М205.

У наслову и уводу као да је акценат стављен на варијабилност хаплогрупа. У делу текста се може видети да су и целу R хаплогрупу сврстали као једну, па показују проценте у одређеним областима, где достижу негде и до 80%. Процентуално присуство и варијабилност немају везе једно са другим, па ми није јасна поента. 

Технологија која је коришћена је iScan, Illumina. Постоји NGS датабаза, али приступ подацима је ограничен. Могуће да је ипак рађена дубља анализа.

https://ega-archive.org/studies/EGAS00001004111

Ван мреже drajver

  • Уредник СДНКП
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1880
Одг: Пољаци
« Одговор #21 послато: октобар 23, 2020, 11:26:00 пре подне »
У наслову и уводу као да је акценат стављен на варијабилност хаплогрупа. У делу текста се може видети да су и целу R хаплогрупу сврстали као једну, па показују проценте у одређеним областима, где достижу негде и до 80%. Процентуално присуство и варијабилност немају везе једно са другим, па ми није јасна поента. 

Технологија која је коришћена је iScan, Illumina. Постоји NGS датабаза, али приступ подацима је ограничен. Могуће да је ипак рађена дубља анализа.

https://ega-archive.org/studies/EGAS00001004111

Видио сам да за приступ подацима потребно одобрење. Нисам схватио да је рађен NGS, већ само SNP тестирање, нешто слично оном што ради 23andme.


Ван мреже Bane

  • Познавалац
  • ******
  • Поруке: 792
  • E-Z16988+BY99620+
Одг: Пољаци
« Одговор #22 послато: октобар 23, 2020, 11:40:17 пре подне »
Има у supplementary material табела 6 (последња табела) прогноза мало нижих грана.
« Последња измена: октобар 23, 2020, 11:41:55 пре подне Bane »

Ван мреже drajver

  • Уредник СДНКП
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1880
Одг: Пољаци
« Одговор #23 послато: октобар 23, 2020, 12:07:40 поподне »
Има у supplementary material табела 6 (последња табела) прогноза мало нижих грана.

Табела 3 је најинформативнија, јер даје конкретне СНП-ове, али је проблем што нема подјеле по регионима да би се неки закључци могли изводити. Има само распоред нижих грана ( а и то донекле) за цијелу Пољску.

Ван мреже drajver

  • Уредник СДНКП
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1880
Одг: Пољаци
« Одговор #24 послато: октобар 23, 2020, 03:14:57 поподне »
Карта распореда хаплогрупе I у Пољској из горе постављеног рада није баш информативна. Важнију информацију доносе зоне са ниским присуством, него оне са високим, јер не знамо који проценат отпада на I1, I2, и које гране I2 (пошто је поред Динарика присутна и L38 и M223 и M26). Међутим претпостављам да зоне високог присуства I хаплогрупе у источној Пољској, посебно крај око  Бјалистока који се наслања на Полесје (зона 25), источни дио Лублинске области (зона 33) и област Бескида(зона 12) ипак треба приписати Динарику.



По овој карти, хаплогрупа I, а самим тим и Динарик је слабо присутна на подручју Централне Пољске, Мазурије и неких сјеверозападних региона.

Ствари са географским распоредом хаплогрупа у Пољској додатно компликује и чињеница да је у Пољској послије Другог свјетског рата дошло до масовних пресељавања становништва, тако да се нека повезница са ранијим раздобљима на основу овакавих мапа тешко може успоставити.
« Последња измена: октобар 23, 2020, 03:33:23 поподне drajver »

Ван мреже Акса

  • Косовци
  • Познавалац
  • *
  • Поруке: 618
Одг: Пољаци
« Одговор #25 послато: новембар 15, 2020, 10:13:39 поподне »
Покушао сам да проучим ово велико пољско истраживање. Оваква врста СНП-тестирања није од никакве помоћи, паметније би им било да су користили предвиђаче. Све похвале за узорак и за тестирање које су спровели по свим војводствима.


C-M216   C-M130 =5 C1: 0.18
                     
E-M34 =2
E-M96 =3
E-V13 =2
E-M5389   E-M96 =97 E1: 3.84
Низводно од E-M5389  E-M96 су у великом броју припадници E1b-V13. Друге варијанте Е хаплогрупе су малобројне Е-М123, V22 и др., и претпостављам да су они E-M34 =2, E-M96 =3. Има их нешто можда и низводно од E-M5389  E-M96.
                 
G-L13 =5
G-L14 =2
G-L30 =1
G-L42 =1
G-P15 =22  G2a: 1.22
Хаплогрупа G2a према пољском ФТДНА пројекту је заступљена са L497 и ретким U1, M406 и другим гранама.

G-M342 =1  G1: 00.4

G-M377 =1  G2b: 00.4  
                                   
H-M282   H-P96 =1  H1: 00.4   

I-M170 =6  I: 0.22
Овде се ради можда о припадницима I2c-L596 или о неким веома ретким гранама I2a.
                                       
I-L22 =13
I-P109 =7
I-M253 =7
I-M72 =4
I-M307.2   I-M253 =6
I-L80   I-M253 =120  I1: 5.80

I-M26 =2
I-L38 =5   
I-M223 =20                                   
I-L460 =235  I2: 9.69
Низводно од I-L460 су у великом броју припадници I2-CTS10228. Како је СНП L460 предачки за све гране I2a, можда има низводно од L460 још припадника I2-M223 као и ретких грана: I2-L38, I2-M26, I2-L233 и др. 
                           
J-L24 =4
J-L70 =1
J-M67 =1
J-L27   J-L26 =9
J-M92 =13  J2a: 1.03
                                 
J-M172 =35  J2: 1.30
Овде се у великом броју ради о припадницима J2b-M241. Пошто је СНП M172 предачки и за J2a, можда има нешто сврстаних Ј2а хаплотипа под овим СНП-ом
                                       
J-M205 =1  J2b1: 00.4  
                                     
J-P58 =1                                     
J-M267 =22  J1: 0.85

NO-P193   NO-M214 =2  N: 00.8    
Нека веома ретка грана.
                                 
N-M178 =114  N1c: 4.21    
                           
O-P201 =1  O2a: 00.4   
                                   
Q-L214   Q-M378 =3  Q1b: 0.11 
                                   
Q-M25 =4    Q1a: 0.15 
                                   
R-M459 =1
R-P278.2 =1
R-M417 =1538  R1a: 56.93
Од чак 1540 хаплотипа, само су један успели да тестирају баш низводно, а то је P278.2. Овај СНП M459 би могао бити нека стара R1a. Гледајући пољске и друге пројекте у којима су учлањени Пољаци и националне мањине из Пољске, могу да се нађу и они који не припадају низводним гранама Z280 и M458, веома су ретки и рекао би да сви скупа чине 1 до 2%, а то су;  R-Z284, L664, Z283, Z282, PF6155, Z93, ови последњи су нешто мало више заступљенији, углавном пореклом Јевреји што се види из њихових имена и презимена.
                       
R-L20 =6
R-L21 =13
R-L48 =3
R-M269 =3
R-Z278 =2
R-P297 =1
R-U152 =4
R-L23 =119
R-P311 =230  R1b: 14.09   
Хаплогрупа R1b као што је познато највише је заступљена у Пољској са U106, U152, има Y14300 и друге гране.
           
T-L131 =2
T-M70 =3  T1a: 0.18