Аутор Тема: Нови мт-ДНК тестирани на Српском ДНК Пројекту  (Прочитано 8239 пута)

Ван мреже Sergio

  • Памтиша
  • ********
  • Поруке: 1749
  • I2-PH908>Y81557 | mtDNA: K1a-C150T
Одг: Нови мт-ДНК тестирани на Српском ДНК Пројекту
« Одговор #20 послато: март 02, 2019, 03:30:13 поподне »
Не знам да ли је могуће да моји (било чији) резултати не могу да се сврстају ни у једну постојећу грану (сви који су се појавили на поклапањима имају само ознаку Х хаплогрупе). Друга варијанта је да сам наручила и платила Full sequence очекујући да добијем детаљну грану, а да је то било неоправдано очекивање. Сертификат који сам добила има само ознаку Х хаплогрупе.

Па јесте мало необично, посебно што је у питању Full sequence.

Мени пише да припадам хаплогрупи К1а-C150Т. Исто је било док сам имао само основни тест (HVR+HVR2, без Coding regions). Очекивао сам да ће ме сврстати у неку дубљу подграну испод К1a-C150T (нпр. K1a11, K1a24, K1a30 и K1a31), али после урађеног Full sequence теста сам и даље остао К1а-C150Т. Значи да подграна којој припадам још увек није откривена.
Иначе на списку поклапања имам само петоро људи, а од њих су четвро на основном нивоу HVR1. На нивоу пуног поклапања (HVR1+HVR2+Coding Regions) имам само једну женску особу хрватске националности из Херцеговине. Али чак и ту пише да смо "Genetic Distance 2", тако да у суштини ни то није најближе поклапање. Наши простори су слабо покривени овом врстом теста. Мало је расположивих резултата за међусобно поређење. Предложио бих Вам да приложите свој резултат у PhyloTree базу, а на тај начин ћете у будућности допринети проналажењу нових подграна.

PhyloTree: http://www.phylotree.org/tree/index.htm
Upload: http://www.ianlogan.co.uk/checker/submission_maker.htm
« Последња измена: март 02, 2019, 03:36:18 поподне Sergio »

Ван мреже marigold

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 246
  • mtDNA: H
Одг: Нови мт-ДНК тестирани на Српском ДНК Пројекту
« Одговор #21 послато: март 02, 2019, 05:03:15 поподне »
Па јесте мало необично, посебно што је у питању Full sequence.

Мени пише да припадам хаплогрупи К1а-C150Т. Исто је било док сам имао само основни тест (HVR+HVR2, без Coding regions). Очекивао сам да ће ме сврстати у неку дубљу подграну испод К1a-C150T (нпр. K1a11, K1a24, K1a30 и K1a31), али после урађеног Full sequence теста сам и даље остао К1а-C150Т. Значи да подграна којој припадам још увек није откривена.
Иначе на списку поклапања имам само петоро људи, а од њих су четвро на основном нивоу HVR1. На нивоу пуног поклапања (HVR1+HVR2+Coding Regions) имам само једну женску особу хрватске националности из Херцеговине. Али чак и ту пише да смо "Genetic Distance 2", тако да у суштини ни то није најближе поклапање. Наши простори су слабо покривени овом врстом теста. Мало је расположивих резултата за међусобно поређење. Предложио бих Вам да приложите свој резултат у PhyloTree базу, а на тај начин ћете у будућности допринети проналажењу нових подграна.

PhyloTree: http://www.phylotree.org/tree/index.htm
Upload: http://www.ianlogan.co.uk/checker/submission_maker.htm

Мени је испало на HVR1, HVR2, CODING REGIONS - 14 MATCHES, од тога 7 са Genetic Distance 0 (један има српско име и презиме, али не знам одакле је), 3 са Genetic Distance 1 (изгледа да су двојица Румуни и 1 "Македонац", презиме на ски, али женски предак има српско име), и по двоје са дистанцом 2 и 3 (Србин, Грк, Румун и Рус). Збуњује ме што се у мапи поклапања на Full sequence приказује само Грк , али пише 2 Step Match, односно то поклапање је са дистанцом 2, па испада да и није неко поклапање.
С друге стране, на Matches Maps на HVR1 Matches се појављује 97 особа, на HVR2 - 13 особа, а на Full Sequence Matches једна особа - Грк (2 Step Match), за кога сам и поставила слику.
Није ми јасно зашто се разликују подаци у Matches и на Matches Maps и шта је веродостојније.
Хвала на линковима, урадићу то, али треба ми времена да проучим, да не погрешим.

Ван мреже Sergio

  • Памтиша
  • ********
  • Поруке: 1749
  • I2-PH908>Y81557 | mtDNA: K1a-C150T
Одг: Нови мт-ДНК тестирани на Српском ДНК Пројекту
« Одговор #22 послато: март 02, 2019, 05:53:00 поподне »
Мени је испало на HVR1, HVR2, CODING REGIONS - 14 MATCHES, од тога 7 са Genetic Distance 0 (један има српско име и презиме, али не знам одакле је), 3 са Genetic Distance 1 (изгледа да су двојица Румуни и 1 "Македонац", презиме на ски, али женски предак има српско име), и по двоје са дистанцом 2 и 3 (Србин, Грк, Румун и Рус).

То није тако лоше. Сва моје малобројна поклапања су углавном везана за особе из Словеније, Хрватске и Херцеговине (плус један недефинисани странац).

Збуњује ме што се у мапи поклапања на Full sequence приказује само Грк , али пише 2 Step Match, односно то поклапање је са дистанцом 2, па испада да и није неко поклапање.
С друге стране, на Matches Maps на HVR1 Matches се појављује 97 особа, на HVR2 - 13 особа, а на Full Sequence Matches једна особа - Грк (2 Step Match), за кога сам и поставила слику.
Није ми јасно зашто се разликују подаци у Matches и на Matches Maps и шта је веродостојније.

Ма ни мени то није баш најјасније.

Хвала на линковима, урадићу то, али треба ми времена да проучим, да не погрешим.

Стиче се дојам да прихватају само FTDNA Full sequence резултате, мада ја сам без проблема поставио резултат свог оца, који је радио Full sequence преко YSEQ лабораторије.
Инструкције делују компликовано, али ипак нису ако се пажљиво чита текст и прате кораци.
FTDNA не скрива да се ослања на Phylotree.org, што се тиче тумачења резлтата.
Ово је линк за самосталну анализу raw data фајла:
https://dna.jameslick.com/mthap/
« Последња измена: март 02, 2019, 05:55:03 поподне Sergio »

Ван мреже Atlantische

  • Уредник СДНКП
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 1281
  • G2a-L42>YSC33
Одг: Нови мт-ДНК тестирани на Српском ДНК Пројекту
« Одговор #23 послато: март 02, 2019, 07:05:26 поподне »
Није ми јасно зашто се разликују подаци у Matches и на Matches Maps и шта је веродостојније.
Разлог за то што вам се нека поклапања која се приказују у matches не појављују у matches map јесте што особе често не наведу своје ancestral locations најдаљих познатих Y-ДНК и мтДНК предака. 
''Заведени светским чудима, заборависмо на себе и на своје порекло." - М. Капор

Ван мреже сɣнце

  • Познавалац
  • ******
  • Поруке: 701
  • I-S17250>Y4882>A1328
Одг: Нови мт-ДНК тестирани на Српском ДНК Пројекту
« Одговор #24 послато: март 03, 2019, 07:32:34 поподне »
Моја хаплоскупина мтднк је H* (латинично Х)
Не знам, је ли уобичајно, да се добије искона H.
Мати потиче из сјевернога Подриња.

Ван мреже marigold

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 246
  • mtDNA: H
Одг: Нови мт-ДНК тестирани на Српском ДНК Пројекту
« Одговор #25 послато: март 03, 2019, 08:26:08 поподне »
Моја хаплоскупина мтднк је H* (латинично Х)
Не знам, је ли уобичајно, да се добије искона H.
Мати потиче из сјевернога Подриња.

Ето и ја сам то добила, не мимоилазе ме ретке и неистражене гране. Моја баба је из Јабланичког округа (срез Пусторечки), али не знам више, јер је рано остала без мајке (прабаба), а ја без те бабе.

Ван мреже Црна Гуја

  • Уредник
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1632
  • Z3660>Y34637-
Одг: Нови мт-ДНК тестирани на Српском ДНК Пројекту
« Одговор #26 послато: март 17, 2019, 07:48:36 поподне »
На Yfull-у од пре неки дан постоји и стабло са митохондријалним хаплогрупама:

https://www.yfull.com/mtree/

Ван мреже filipi

  • Познавалац
  • ******
  • Поруке: 751
  • I-CTS10228_Y4882_A1328*
Одг: Нови мт-ДНК тестирани на Српском ДНК Пројекту
« Одговор #27 послато: април 15, 2019, 05:17:28 поподне »


Ako se neko razumije, moze li objasnjenje? U pitanju je osoba sa Ozrena.

Ван мреже marigold

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 246
  • mtDNA: H
Одг: Нови мт-ДНК тестирани на Српском ДНК Пројекту
« Одговор #28 послато: јул 22, 2019, 05:38:27 поподне »
Ово је линк за самосталну анализу raw data фајла:
https://dna.jameslick.com/mthap/

Тек данас сам урадила самосталну анализу и ево почетка упоређења мојих резултата са постојећим у бази:

Markers found (shown as differences to rCRS):

HVR2: 263G (315.1C)
CR: 750G 1438G 4769G 4919T 6285A 8860G 12732C 15326G
HVR1: 16311C


Best mtDNA Haplogroup Matches:

1) H
Defining Markers for haplogroup H:
HVR2: 263G
CR: 750G 1438G 4769G 8860G 15326G
HVR1:

Marker path from rCRS to haplogroup H (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS)263GH2a2a 8860G 15326GH2a2 750GH2a4769GH2 1438GH(315.1C) 4919T 6285A 12732C 16311C
Good Match! Your results also had extra markers for this haplogroup:
Matches(6): 263G 750G 1438G 4769G 8860G 15326G
Extras(4): (315.1C) 4919T 6285A 12732C 16311C

1) H76
Defining Markers for haplogroup H76:
HVR2:
263G
CR: 750G 1438G 4769G 8572A 8860G 15326G
HVR1: 16311C

Marker path from rCRS to haplogroup H76 (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS)
263GH2a2a8860G 15326GH2a2 750GH2a 4769GH21438GH8572A 16311C H76(315.1C) 4919T 6285A 12732C

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(7): 263G 750G 1438G 4769G 8860G 15326G 16311C
Mismatches(1): 8572G
Extras(3): (315.1C) 4919T 6285A 12732C


1) H1(T16311C)
Defining Markers for haplogroup H1(T16311C):
HVR2:
263G
CR: 750G 1438G 3010A 4769G 8860G 15326G
HVR1: 16311C

Marker path from rCRS to haplogroup H1(T16311C) (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS)
263GH2a2a8860G 15326GH2a2750GH2a 4769GH21438G H3010AH116311CH1(T16311C)(315.1C) 4919T 6285A 12732C

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(7): 263G 750G 1438G 4769G 8860G 15326G 16311C
Mismatches(1): 3010G
Extras(3): (315.1C) 4919T 6285A 12732C


1) H3(T16311C)
Defining Markers for haplogroup H3(T16311C):
HVR2:
263G
CR: 750G 1438G 4769G 6776C 8860G 15326G
HVR1: 16311C

Marker path from rCRS to haplogroup H3(T16311C) (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS)
263GH2a2a8860G 15326GH2a2750GH2a4769GH21438GH 6776CH316311C H3(T16311C)(315.1C) 4919T 6285A 12732C

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(7): 263G 750G 1438G 4769G 8860G 15326G 16311C
Mismatches(1): 6776T
Extras(3): (315.1C) 4919T 6285A 12732C


1) H80
Defining Markers for haplogroup H80:[/b]
HVR2: 263G
CR: 750G 1438G 2361A 4769G 8860G 15326G
HVR1: 16311C

Marker path from rCRS to haplogroup H80 (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS)
263GH2a2a 8860G 15326GH2a2750GH2a4769GH2 1438G H2361A 16311CH80(315.1C) 4919T 6285A 12732C

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(7): 263G 750G 1438G 4769G 8860G 15326G 16311C
Mismatches(1): 2361G
Extras(3): (315.1C) 4919T 6285A 12732C

Колико разумем, црвеним је означено зашто нистам добила дубљу грану хаплогрупе Х. Овде сам навела неслагања које су означили бројем 1, а у анализи су наведена и под бројевима 2 и 3, али је ту више неслагања.

Ван мреже сɣнце

  • Познавалац
  • ******
  • Поруке: 701
  • I-S17250>Y4882>A1328
Одг: Нови мт-ДНК тестирани на Српском ДНК Пројекту
« Одговор #29 послато: јул 22, 2019, 07:20:16 поподне »
Тек данас сам урадила самосталну анализу и ево почетка упоређења мојих резултата са постојећим у бази:

Markers found (shown as differences to rCRS):

HVR2: 263G (315.1C)
CR: 750G 1438G 4769G 4919T 6285A 8860G 12732C 15326G
HVR1: 16311C


Best mtDNA Haplogroup Matches:

1) H
Defining Markers for haplogroup H:
HVR2: 263G
CR: 750G 1438G 4769G 8860G 15326G
HVR1:

Marker path from rCRS to haplogroup H (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS)263GH2a2a 8860G 15326GH2a2 750GH2a4769GH2 1438GH(315.1C) 4919T 6285A 12732C 16311C
Good Match! Your results also had extra markers for this haplogroup:
Matches(6): 263G 750G 1438G 4769G 8860G 15326G
Extras(4): (315.1C) 4919T 6285A 12732C 16311C

 (315.1C) 4919T 6285A 12732C



Ти си бар имала једам "good match". Ја немах ни то.

У мене
Best mtDNA Haplogroup Matches:

1) H(G13708A)
2) H
2) H18
3) H39
3) H(G16129A)
3) H83
3) H20
3) H(C16291T)
3) H82
3) H24

но за све стоји
Your results contained differences with this haplogroup.

На 750 немам ни А ни G, на 15326 немам ни А ни G.
Markers found (shown as differences to rCRS):

HVR2: 263G
CR: 1438G 4769G 8860G 13708A


Ван мреже marigold

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 246
  • mtDNA: H
Одг: Нови мт-ДНК тестирани на Српском ДНК Пројекту
« Одговор #30 послато: јул 22, 2019, 10:17:14 поподне »
Мало је расположивих резултата за међусобно поређење. Предложио бих Вам да приложите свој резултат у PhyloTree базу, а на тај начин ћете у будућности допринети проналажењу нових подграна.

PhyloTree: http://www.phylotree.org/tree/index.htm
Upload: http://www.ianlogan.co.uk/checker/submission_maker.htm

Сунце, урадила сам ноћас и ово, што и теби препоручујем, мора се од нечег почети.

Ван мреже Sergio

  • Памтиша
  • ********
  • Поруке: 1749
  • I2-PH908>Y81557 | mtDNA: K1a-C150T
Одг: Нови мт-ДНК тестирани на Српском ДНК Пројекту
« Одговор #31 послато: јул 23, 2019, 04:17:54 поподне »
Сунце, урадила сам ноћас и ово, што и теби препоручујем, мора се од нечег почети.

Ја препоручујем upload на yfull/mtree. Кошта 25 долара, али је већа шанса да они временом развију детаљније и разгранатије стабло него phylotree. На phylotree.org нема помака још од 2016. године.
Линк:
https://www.yfull.com/mtree/
« Последња измена: јул 23, 2019, 04:19:28 поподне Sergio »

Ван мреже marigold

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 246
  • mtDNA: H
Одг: Нови мт-ДНК тестирани на Српском ДНК Пројекту
« Одговор #32 послато: јул 23, 2019, 05:05:40 поподне »

Ја препоручујем upload на yfull/mtree. Кошта 25 долара, али је већа шанса да они временом развију детаљније и разгранатије стабло него phylotree. На phylotree.org нема помака још од 2016. године.
Линк:
https://www.yfull.com/mtree/

Каква је процедура? Да ли сте то радили, пошто сте у марту препоручили PhyloTree базу, али нисам стигла да се тиме тада бавим?

Ван мреже Прерад

  • Члан Друштва
  • Шегрт
  • *****
  • Поруке: 56
Одг: Нови мт-ДНК тестирани на Српском ДНК Пројекту
« Одговор #33 послато: јул 23, 2019, 07:22:25 поподне »
Каква је процедура? Да ли сте то радили, пошто сте у марту препоручили PhyloTree базу, али нисам стигла да се тиме тада бавим?

Процедура је једноставна. Под секцијом "mtDNA Interpretation" клкнеш на "Order Now!". Затим попуниш податке за емаијл и корисничко име, одабереш да се ради о фаста фајлу и гдје је био урађен тест, затим пребациш свој фаста фајл (или ставиш УРЛ) те сачекаш обраду. Када се обрада заврши, добијеш проуку на емајл и захтјев за уплату.

Ван мреже Sergio

  • Памтиша
  • ********
  • Поруке: 1749
  • I2-PH908>Y81557 | mtDNA: K1a-C150T
Одг: Нови мт-ДНК тестирани на Српском ДНК Пројекту
« Одговор #34 послато: јул 23, 2019, 07:51:33 поподне »
Каква је процедура? Да ли сте то радили, пошто сте у марту препоручили PhyloTree базу, али нисам стигла да се тиме тада бавим?

Phylotree je bila referentna mtdna baza dugi niz godina. U poslenje vreme posustaju. Ili mi se bar tako čini...Yfull je pre par meseci pokrenuo svoju mtdna bazu i mislim da imaju dosta potencijala. U početku su dozvoljavali postavljanje podataka samo onima koji su prethodno radili Big-Y, ali sada to više nije uslov. Sad može svako da postavi svoj mtFull Sequence rezultat rađen preko FTDNA ili YSEQ. Naravno, traže da se plati nadoknada od 25$ preko PayPal-a, ali ja mislim da vredi. U tom slučaju kasnije daju popust za naknadno postavljanje BigY rezultata. Ja sam postavio svoje rezultate za mtDNA haplogrupu K1a-C150T (FTDNA). Na Yfull-u za sada nosi oznaku K1a-a1a*. Takođe sam stavio i očeve rezultate. On je mtDNA haplogrupa H1t. Na yfull-u je za sada ista oznaka. Oznake će se vremenom menjati kad se budu otkrivale nove grane. Jedino ostaje pitanje univerzalne standardizacije tih oznaka.

Ван мреже marigold

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 246
  • mtDNA: H
Одг: Нови мт-ДНК тестирани на Српском ДНК Пројекту
« Одговор #35 послато: јул 23, 2019, 08:42:01 поподне »
Хвала Прераде и Sergio на информацијама  :)