ДНК порекло > Основе генетичке генеалогије

Број јединствених СНП-ова

(1/6) > >>

Селаковић:
Пореклаши који сте урадили "Велики ипсилон" или очитавање целокупног ипсилон хромозома код FullGenomes исл: Колико сте имали јединствених (нових) СНП-ова? Колико је стара најнизводнија званична СНП-грана којој припадате (дакле онај СНП који делите са бар још једним човеком)?


Један од радова о различитим вероватноћама СНП мутација:

https://academic.oup.com/gbe/article/doi/10.1093/gbe/evr044/583477/Mutation-Rate-Distribution-Inferred-from

mladjo:

--- Цитат: Селаковић  фебруар 27, 2017, 03:15:18 поподне ---Пореклаши који сте урадили "Велики ипсилон" или очитавање целокупног ипсилон хромозома код FullGenomes исл: Колико сте имали јединствених (нових) СНП-ова? Колико је стара најнизводнија званична СНП-грана којој припадате (дакле онај СНП који делите са бар још једним човеком)?


Један од радова о различитим вероватноћама СНП мутација:

https://academic.oup.com/gbe/article/doi/10.1093/gbe/evr044/583477/Mutation-Rate-Distribution-Inferred-from

--- Крај цитата ---


R1a L1280 YP3992 "рођен" прије 1200 година, а TMRCA 950 година са другим тестираним.

Синиша Јерковић:

--- Цитат: Селаковић  фебруар 27, 2017, 03:15:18 поподне ---Пореклаши који сте урадили "Велики ипсилон" или очитавање целокупног ипсилон хромозома код FullGenomes исл: Колико сте имали јединствених (нових) СНП-ова? Колико је стара најнизводнија званична СНП-грана којој припадате (дакле онај СНП који делите са бар још једним човеком)?


Један од радова о различитим вероватноћама СНП мутација:

https://academic.oup.com/gbe/article/doi/10.1093/gbe/evr044/583477/Mutation-Rate-Distribution-Inferred-from

--- Крај цитата ---

Даћу податак са YFull странице.

11 СНП-ова најбољег квалитета
4 СНП-ова прихватљивог квалитета
29 СНП-ова непоузданог квалитета

Посљедњи СНП у филогенетском стаблу је S17250, са процијењеном старошћу од 1850 година. За процјену старости су кориштени само СНП-ови најбољег квалитета.

Међутим, Y Full тј. Биг Ипсилон код мене није могао да препозна PH908, који се налази у филогенетском стаблу испод S17250 и процјењена старост (на основу других тестираних) му је такође 1850 година.

Ако добро разумијем рачуницу, за 1800 година догодило се неких 11 промјена. То му дође око 150-160 година за једну промјену.

Селаковић:

--- Цитат: млађо  фебруар 27, 2017, 03:29:19 поподне ---
R1a L1280 YP3992 "рођен" прије 1200 година, а TRMCA 950 година са другим тестираним.

--- Крај цитата ---

Хвала, Млађо! А јединствених СНП-ова имаш ли?

Селаковић:

--- Цитат: Синиша Јерковић  фебруар 27, 2017, 03:30:55 поподне ---
Ако добро разумијем рачуницу, за 1800 година догодило се неких 11 промјена. То му дође око 150-160 година за једну промјену.

--- Крај цитата ---

Хвала, Синиша! Баш ме тај податак интересовао.

Има ли неког објашњења о овим "мање" и "више" поузданим СНП-овима?

Навигација

[0] Индекс порука

[#] Следећа страна

Иди на пуну верзију