Форум - Порекло
ДНК порекло => Аутосомална ДНК => Тему започео: dons Новембар 06, 2021, 08:35:31 поподне
-
Posto nisam jos odradio y-dna ,Uplaodovao sam autozomalnu genetiku sa MyHeritage na https://cladefinder.yseq.net/ i dobio ovo predvidjanje:
Most specific position on the YFull YTree is R-M458 Link to R-M458 on YFull View heatmap on Y Heatmap View theoretical migration on PhyloGeographer
R-M458 M458/PF6241+ PF6202/Z2909/S4555($) PF6219/Z2911/S4549(?) Y2911/FGC2634/M12425(?)
┣━R-A11460 A11460($) FT65132(?) Y36839(?) YP6496/A11452(?)
┃ ┗━R-BY202471 BY202471($) BY202644(?) BY202870(?) BY202982(?) BY203482(?) BY203963(?) BY204568(?) FGC58770($) FT205930/Y183718(?) ZS2990(?)
┗━R-PF7521 +2 PF7521/Z2908/S4567(?)
Available Panels
YSEQ recommends the R1a-M458 Panel Predicted R-M458 is the panel root. This panel is applicable and will definitely provide higher resolution.
Next best prediction (scored 327 compared to 327) R-Z2125
Je li neko radio ovo i da li ovo ima nekog smisla i tacnosti, i sta sam to ustvari dobio?
-
Posto nisam jos odradio y-dna ,Uplaodovao sam autozomalnu genetiku sa MyHeritage na https://cladefinder.yseq.net/ i dobio ovo predvidjanje:
Most specific position on the YFull YTree is R-M458 Link to R-M458 on YFull View heatmap on Y Heatmap View theoretical migration on PhyloGeographer
R-M458 M458/PF6241+ PF6202/Z2909/S4555($) PF6219/Z2911/S4549(?) Y2911/FGC2634/M12425(?)
┣━R-A11460 A11460($) FT65132(?) Y36839(?) YP6496/A11452(?)
┃ ┗━R-BY202471 BY202471($) BY202644(?) BY202870(?) BY202982(?) BY203482(?) BY203963(?) BY204568(?) FGC58770($) FT205930/Y183718(?) ZS2990(?)
┗━R-PF7521 +2 PF7521/Z2908/S4567(?)
Available Panels
YSEQ recommends the R1a-M458 Panel Predicted R-M458 is the panel root. This panel is applicable and will definitely provide higher resolution.
Next best prediction (scored 327 compared to 327) R-Z2125
Je li neko radio ovo i da li ovo ima nekog smisla i tacnosti, i sta sam to ustvari dobio?
Предиктор ти каже да највероватније припадаш хаплогрупи R-M458, која се сматра доминантно словенском хаплогрупом.
-
Dobar dan,
Do sada mi uopste nija pala ideja o mogucnosti da mogu preko autosomalnog fajla da saznam nesto vise. Znala sam za Y hr.i predvidjanje HG.Moje pitanje ako neko moze da mi da odgv.ako postavim svoje autosomalne rezultate kao zensko da li cu dobiti rezultat mislim na mitohondrijalni dnk?ili je nemoguce?
Hvala
-
Dobar dan,
Do sada mi uopste nija pala ideja o mogucnosti da mogu preko autosomalnog fajla da saznam nesto vise. Znala sam za Y hr.i predvidjanje HG.Moje pitanje ako neko moze da mi da odgv.ako postavim svoje autosomalne rezultate kao zensko da li cu dobiti rezultat mislim na mitohondrijalni dnk?ili je nemoguce?
Hvala
Познате су ми само апликације које извлаче информацију о Y-ДНК хаплогрупи. Претраживао сам да ли постоји нешто слично за мтДНК, али нисам на то наишао. Уз то, питање је да ли је тако нешто уопште могуће, јер су у аутозомном фајлу садржани резултати анализе хромозома, а не митохондрије.
-
Познате су ми само апликације које извлаче информацију о Y-ДНК хаплогрупи. Претраживао сам да ли постоји нешто слично за мтДНК, али нисам на то наишао. Уз то, питање је да ли је тако нешто уопште могуће, јер су у аутозомном фајлу садржани резултати анализе хромозома, а не митохондрије.
Чудно ми је и за Y хаплогрупу да је могуће. По дефиницији Y хромозом није аутозомни и не би требао да се садржи у резултату аутозомне анализе.
-
Чудно ми је и за Y хаплогрупу да је могуће. По дефиницији Y хромозом није аутозомни и не би требао да се садржи у резултату аутозомне анализе.
Svi komercijalni čipovi koje se koriste za takozvani array typing detektiraju i određen broj mutacija na y-kromozomu. My heritage naprimjer koristi ovaj čip i u opisu vidiš da uključuje 1423 markera na y-kromozomu:
https://jp.illumina.com/content/dam/illumina/gcs/assembled-assets/marketing-literature/infinium-omni-express-24-beadchip-data-sheet-m-gl-00950/infinium-omniexpress-24-beadchip-data-sheet-m-gl-00950.pdf
-
Hvala na odgovoru.Bas mi je zao eto htela sam da saznam odprilike da smestim sve te zenske predke u jednu definiciju.(sve te Kuce,Drobanjake,Bjelopavlice,Klimente,Niksice..)
Odgovor za Ojlera ,moguce je pre nego sto sto je uradjen Y hr.mog bratanca preko autosomalnog fajla sam saznala da je njegova HG I2a.sto se kasnije potvrdilo.
Thenx 👌
-
Чудно ми је и за Y хаплогрупу да је могуће. По дефиницији Y хромозом није аутозомни и не би требао да се садржи у резултату аутозомне анализе.
Ствар конфигурације microarray чипа, очигледно... Знамо да FTDNA одувек узоркује X хромозом, који такође није аутозом. А знамо и да 23andMe узоркује неке SNP локације на Y хромозому, тј. одређује барем кровне Y хаплогрупе за тестиране мушкарце. Небојша већ годинама прати и евидентира те резултате са 23andMe.
А ово ми је новост за MyHeritage, што је послао Имоћанин. Њима обраду узорака ради лабораторија GeneByGene у Хјустону (иста која ради и за FTDNA) али могуће да за MyHeritage користе другачије microarray чипове у односу на FTDNA FamilyFinder тестове.
-
Ствар конфигурације microarray чипа, очигледно... Знамо да FTDNA одувек узоркује X хромозом, који такође није аутозом. А знамо и да 23andMe узоркује неке SNP локације на Y хромозому, тј. одређује барем кровне Y хаплогрупе за тестиране мушкарце. Небојша већ годинама прати и евидентира те резултате са 23andMe.
А ово ми је новост за MyHeritage, што је послао Имоћанин. Њима обраду узорака ради лабораторија GeneByGene у Хјустону (иста која ради и за FTDNA) али могуће да за MyHeritage користе другачије microarray чипове у односу на FTDNA FamilyFinder тестове.
Evo nešto o tome na njihovoj stranici. U 2019 je bila priča o tome da su naručili novu verziju čipa ali neznam dokle je to stiglo.
https://blog.myheritage.com/2019/04/update-regarding-dna-test-processing-times/
-
Evo nešto o tome na njihovoj stranici. U 2019 je bila priča o tome da su naručili novu verziju čipa ali neznam dokle je to stiglo.
https://blog.myheritage.com/2019/04/update-regarding-dna-test-processing-times/
23andme je već ranije preša na tu novu verziju koja uključuje više markera za ne-europske populacije:
“ In 2017, 23andMe migrated from the Illumina OmniExpress chip that was used across multiple ancestry DNA companies. The current 23andme v5 chip, the Global Screening Array (GSA) is a next-generation genotyping array for population-scale genetics, variant screening, pharmacogenomics studies, and precision medicine research. This version of the chip has around 650,000 SNPs suitable for both ancestry and health testing.”
-
Постоји овај предиктор: https://dna.jameslick.com/mthap/
Али питање је да ли компанија код које сте се тестирали тестира MT ДНК маркере.
Ако не, онда ни овај предиктор неће моћи ништа да вам предвиди.
-
23andme je već ranije preša na tu novu verziju koja uključuje više markera za ne-europske populacije:
“ In 2017, 23andMe migrated from the Illumina OmniExpress chip that was used across multiple ancestry DNA companies. The current 23andme v5 chip, the Global Screening Array (GSA) is a next-generation genotyping array for population-scale genetics, variant screening, pharmacogenomics studies, and precision medicine research. This version of the chip has around 650,000 SNPs suitable for both ancestry and health testing.”
Evo, našao sam lijep pregled čipova:
https://www.nature.com/articles/s41431-021-00917-7/tables/1
Vidi se da ovaj Illumina OmniExpress čip ne testira mitrohondrijski dnk, a ovaj novi Illumina GSA samo 134 markera (MT).
Zanimljivo je da su na novoj verziji 3 GSA čipa povečali pokrivenost na y-kromozomu na preko 4000 markera.
-
Necu se zahvaljivati vise podrazumeva se.👌 Testirala sam se Na My heritage odavno -autosomalni.Kliknula mi je ta ideja da li je moguce da saznam i to?Da priznam ne snalazim se najbolje ali ucim i svakako mi treba malo vise vremena da raskrinkam kako sve to funkcionise.Znaci u pitanju je MyH kako da to saznam? Bilo moguce ili ne necije inskrukcije su mi potrebne.
-
Necu se zahvaljivati vise podrazumeva se.👌 Testirala sam se Na My heritage odavno -autosomalni.Kliknula mi je ta ideja da li je moguce da saznam i to?Da priznam ne snalazim se najbolje ali ucim i svakako mi treba malo vise vremena da raskrinkam kako sve to funkcionise.Znaci u pitanju je MyH kako da to saznam? Bilo moguce ili ne necije inskrukcije su mi potrebne.
Nažalost, neće biti moguće. MyHeritage je koristio ovaj Illumina OmniExpress čip i taj ne pokriva ništa na mitrohondrijima.
-
Nažalost, neće biti moguće. MyHeritage je koristio ovaj Illumina OmniExpress čip i taj ne pokriva ništa na mitrohondrijima.
Зависи када се тестирала, од 2019 FTDNA и MyHeritage исто користе нови чип (GSA)
-
Зависи када се тестирала, од 2019 FTDNA и MyHeritage исто користе нови чип (GSA)
Evo šta im trenutačno piše na stranici:
In accordance with the industry standard, MyHeritage uses the Illumina OmniExpress-24 chip, with hundreds of thousands of strategically selected probes to capture the greatest amount of genetic variation, and facilitate research.
-
Nije tako davno bas sam pogledala 2019 ali sam dobila rzl. 2020. E sada sta dalje ?
-
Nije tako davno bas sam pogledala 2019 ali sam dobila rzl. 2020. E sada sta dalje ?
И још једном извините, ништа лично, живели!
-
Samo opusteno cl.Gorance naravno da se ne ljutim a nije mi ni u prirodi.🙂 i ne postoji razlog .Usmeni govor mi vise lezi nego pisani pa da ne ostane nejasno malo oduzim 😉Nego ovde sa Mhdnk sam zadala sebi jedan zadatak pa videcemo ako bude moguce da saznam i to uz pomoc ljudi koji znaju vise.
Vas mali post za galaxiju 👌prekjuce sam merila 28 hiljada svetlosnih godina (zanimala me jedna planeta)koliko je udaljena pa su cifre nemerljive ako svetlost putuje 300hiljada u sekundi pa puta ...autostoperski malo tesko😀😀😀😀
Sve najbolje i vama zelim
-
Da shvatim samo da nije moguce .Nema veze mozda u buducnosti izadje nesto novo .Nikakva zurba.
Hvala svima.
300 00km u 1sek ......pa koliko dalje xxxxxx🙃😄🙃😄🙃
-
Evo, našao sam lijep pregled čipova:
https://www.nature.com/articles/s41431-021-00917-7/tables/1
Vidi se da ovaj Illumina OmniExpress čip ne testira mitrohondrijski dnk, a ovaj novi Illumina GSA samo 134 markera (MT).
Zanimljivo je da su na novoj verziji 3 GSA čipa povečali pokrivenost na y-kromozomu na preko 4000 markera.
Да ли је овај чип већ у комерцијалној употреби код неке компаније? Можда 23andMe?
-
Да ли је овај чип већ у комерцијалној употреби код неке компаније? Можда 23andMe?
Sumjam da će u naredno vrijeme nešto promijeniti. Oni taj GSA čip prve generacije kod sebe zovu V5. Ti čipovi pružaju mogućnost customizacije = do 50.000 SNP-ova po želji naručitelja. Mislim da su dosta visoke ulazne investicije i da će ovaj čip trošiti do felge ;-)
-
Evo šta im trenutačno piše na stranici:
In accordance with the industry standard, MyHeritage uses the Illumina OmniExpress-24 chip, with hundreds of thousands of strategically selected probes to capture the greatest amount of genetic variation, and facilitate research.
https://forums.familytreedna.com/forum/family-tree-dna-communications/announcements-and-new-features/323620-gsa-chip
https://blog.myheritage.com/2019/04/update-regarding-dna-test-processing-times/
FDTNA и MyHeritage (мислим да је то у суштини иста компанија) су негдје 2018./2019. имали промјену чипа, и тренутно дају сирове податке који имају добро преклапање с новим 23andme, а слабије са старим 23andme, као и старим FDTNA и MyHeritage .
Нови чип би требало да је GSA, а стари Omni.
Чини се да још то нису ажурирали на својим страницама, које су и иначе доста дисфункционалне.
-
Како видим почели су излазити подаци о Y-DNK гранама на основу FamilyFinder тестова. Међу обрађенима су већ неки тестирани из 2021 и касније.
Да ли се зна како FTDNA долази до тих резултата, да ли путем новог тестирања узорака или резултате извлаче из већ постојећих тестова за које нам тада нису дали све податке (без Y-DNK СНПова)?
После обраде добија се нови фајл за преузимање са називом Y-SNP Raw Data (GZIP, CSV).
-
kdoliko je ovaj cladefinder pouzdan?
Most specific position on the YFull YTree is R-Z2125
Link to R-Z2125 on YFull View maps, migrations and statistics on HRAS View theoretical migration on PhyloGeographer +1 +2 +3 ↺
R-Z2125 Y471768(?) Y600163(?) Z2125+
┣━R-FTA9450 FTA21743(?) FTA9450(?) FTC84106(?)
┣━R-S23592 +3 FGC81322(?) S23592($) Y504520(?) YP1558(?) YP349($)
┣━R-Y208716 +2 CTS12670(?) FT287305(?) FT416707(?) MF175459/FT287461(?) MF175463(?) Y208716(?)
┣━R-YP413 +3 Y490409(?) Y550089(?) Y553740(?) YP413/M12301($)
┗━R-Z2123 +4 Y481849(?) Y612680(?) Z2123($)
Available Panels
YSEQ recommends the R1a-Z93 Panel Predicted R-Z2125 is downstream of the panel root. This panel may be applicable if it tests subclades below R-Z2125. Please verify and check with YSEQ customer support.
Next best prediction (scored 326 compared to 327) R-Z645
-
kdoliko je ovaj cladefinder pouzdan?
Most specific position on the YFull YTree is R-Z2125
Link to R-Z2125 on YFull View maps, migrations and statistics on HRAS View theoretical migration on PhyloGeographer +1 +2 +3 ↺
R-Z2125 Y471768(?) Y600163(?) Z2125+
┣━R-FTA9450 FTA21743(?) FTA9450(?) FTC84106(?)
┣━R-S23592 +3 FGC81322(?) S23592($) Y504520(?) YP1558(?) YP349($)
┣━R-Y208716 +2 CTS12670(?) FT287305(?) FT416707(?) MF175459/FT287461(?) MF175463(?) Y208716(?)
┣━R-YP413 +3 Y490409(?) Y550089(?) Y553740(?) YP413/M12301($)
┗━R-Z2123 +4 Y481849(?) Y612680(?) Z2123($)
Available Panels
YSEQ recommends the R1a-Z93 Panel Predicted R-Z2125 is downstream of the panel root. This panel may be applicable if it tests subclades below R-Z2125. Please verify and check with YSEQ customer support.
Next best prediction (scored 326 compared to 327) R-Z645
Поприлично прецизан, али то све зависи од "сирових података" (енг. "raw data") које сте добили од компаније код које је урађен тест.
-
MyHeritage autozomalni test je u pitanju
-
MyHeritage autozomalni test je u pitanju
Они дају мање података о ипсилон ДНК хаплогрупи али њихов тест није непрецизан, тако да највероватније нећете да останете на нивоу R-Z2125, већ вероватно можете да добијете још неку подграну уколико се одлучите за цео ипсилон ДНК тест (било путем неког од WGS тестова или нешто типа FamilyTreeDNA Big Y-700). Мало јефтинија варијанта је да урадите 23andMe или Ancestry аутосомални тест јер ми се чини да они комплетније резултате али свакако у том случају опет нећете добити финални лист/подграну.
-
Hvala..nije moj test :)
U pitanju su neki anonimni rezultati iz Like, jedan autozomalni i 2 y dna (sve isto prezime)
Za ove y dna na 23 markera nevgen daje unsupported subclade sto valjda znaci da moze biti bilo sta?
(https://i.ibb.co/ZXt8R6V/unsupported.png) (https://ibb.co/H41zLDV)
-
Hvala..nije moj test :)
U pitanju su neki anonimni rezultati iz Like, jedan autozomalni i 2 y dna (sve isto prezime)
Za ove y dna na 23 markera nevgen daje unsupported subclade sto valjda znaci da moze biti bilo sta?
(https://i.ibb.co/ZXt8R6V/unsupported.png) (https://ibb.co/H41zLDV)
Не знам по којем принципу ради Невген. Можда неко други може да каже више о томе
-
Hvala..nije moj test :)
U pitanju su neki anonimni rezultati iz Like, jedan autozomalni i 2 y dna (sve isto prezime)
Za ove y dna na 23 markera nevgen daje unsupported subclade sto valjda znaci da moze biti bilo sta?
(https://i.ibb.co/ZXt8R6V/unsupported.png) (https://ibb.co/H41zLDV)
Ја сам провлачио кроз Cladefinder аутозомни тест једног човека (My Heritage) који је касније урадио тест и са STR маркерима. Исто му је показивао ову подграну од R1a-Z93, али се на тесту показало да је ипак у питању једна од подграна од R1a-Z280. Тако да за неке гране изгледа ипак није 100% прецизан.
-
Da li MyHeritage ima neku opciju da se na uzorku koji je radjen autozomalno uradi neki specificni SNP test?
-
Da li MyHeritage ima neku opciju da se na uzorku koji je radjen autozomalno uradi neki specificni SNP test?
MH нема такву опцију. Само ако сте радили тест код ФТДНА, можете да искористите исти узорак за Y тест.
-
Da li MyHeritage ima neku opciju da se na uzorku koji je radjen autozomalno uradi neki specificni SNP test?
Требало би да постоји опција да се на основу RAW фајла са MyHeritage извуче основна хаплогрупа. Подаци се убаце у MorleyDNA предвиђач и он одреди неки од основних SNP-ова.
https://ytree.morleydna.com/
Данас видим да многи директно раде аутосомални трансфер са MH на FTDNA и на тај начин добију основну подграну.
(https://i.postimg.cc/K8XNdTNH/p.png)
-
Требало би да постоји опција да се на основу RAW фајла са MyHeritage извуче основна хаплогрупа. Подаци се убаце у MorleyDNA предвиђач и он одреди неки од основних SNP-ова.
https://ytree.morleydna.com/
Данас видим да многи директно раде аутосомални трансфер са MH на FTDNA и на тај начин добију основну подграну.
(https://i.postimg.cc/K8XNdTNH/p.png)
YSEQ Cladefinder је за те сврхе унеколико прецизнији од Морлија:
https://cladefinder.yseq.net/