Форум - Порекло

ДНК порекло => Дискусије о хаплогрупама => Тему започео: Rigel Јун 18, 2017, 11:19:12 поподне

Наслов: Општа филогенетскa стаблa Y хромозома и мтДНК: односи међу хаплогрупама
Порука од: Rigel Јун 18, 2017, 11:19:12 поподне
Нисам био сигуран на коју постојећу тему бих могао ово додати, па сам одлучио да отворим нову.

Углавном се на форуму усредсређујемо на гранања унутар појединих хаплогрупа, па сам приметио да многи нису упознати са широм сликом, тј. са даљим филогенетским везама између главних хаплогрупа. Стога мислим да је корисно да се представе општа стабла Y хромозома и мтДНК. Ово су најбољи и најдетаљнији прикази стабала које сам за сада нашао.


Опште филогенетско стабло Y хромозома

Овај приказ филогенетског стаблa Y хромозома је из 2015., па су неки називи грана стари, неке мање подгране изостају и постоје извесна одступања у погледу времена гранања у односу на тренутну хронологију на yfull-у. Стабло је израђено на основу комплетног секвенцира Y хромозома из 456 узорака, па је разумљиво зашто неке мање подгране недостају. Ипак, покривеност укупне људске популације је доста добра за овакав општи приказ, а одступања у односу на актуелне податке са yfull-а нису толико значајна.

(рад из кога је илустрација преузета се може наћи овде: http://genome.cshlp.org/content/25/4/459.long (http://genome.cshlp.org/content/25/4/459.long))

(http://i.imgur.com/nVRLhZx.png)


Иста илустрација у другачијој оријентацији, са нешто мање детаља и више боја:


(http://i.imgur.com/2WvV46B.png)

Наслов: Одг: Општа филогенетскa стаблa Y хромозома и мтДНК: односи међу хаплогрупама
Порука од: Rigel Јун 18, 2017, 11:22:42 поподне
Опште филогенетско стабло мтДНК


Овај приказ је преузет из рада (http://www.cell.com/ajhg/fulltext/S0002-9297(09)00163-3 (http://www.cell.com/ajhg/fulltext/S0002-9297(09)00163-3)) из 2009., али даје добру општу слику.


(http://i.imgur.com/vzctsXK.png)