Пребацивање података са FTDNA на Yfull

[Spajic1]

Сигуран сам да је ово већ неко питао, али ја нисам могао наћи на форуму. Пролетос су ми стигли резултати BigY700 теста на FTDNA . Ја могу да их преузмем у облику CSF  и VCF . Међутим ове облике не могу да убацим на Yfull или на MyHeritage  . Има ли ико неку идеју? Волео бих да моји подаци буду на Yfull и на MyHerigate као и на другим локацијама где се истражују породична стабла јер сам мало запео са истраживањем свог порекла, а што буде више упоређивања и тестирања резултати ће брже стићи.
Знам за опцију да доплатим 100 USD на FTDNA и онда могу прузети Big Y Raw Data али ни онда нисам сигуран да их могу убацити на ове локације.
Свако искуство и предлог је непроцењив.

[НикПав]

На MH можете да пребаците само фајл који добијете ако сте радили аутосомални тест на FTDNA. Он је бесплатан, али потпуно неповезан са BAM и тестирањем Y хромозома.
Што се тиче YFULL, најбоља опција је BAM који се плаћа $100, VCF је доста лошија.

[Милош]

Yfull прихвата и VCF фајл са FTDNA...

[Драган Обреновић]

Као што је већ написано, на МyHeritage се може послати фајл са резултатима FamilyFinder теста (из ваше поруке није јасно да ли сте и њега радили поред Big Y-700?)

YFULL иначе прихвата VCF фајл као резултат Big Y-700, мада је свакако боље послати BAM који као што знате кошта.

Можете и за почетак послати VCF, а касније му бесплатно придружити и BAM када и ако се одлучите да ”откупите своје сопствене податке” од FTDNA - што је њихова пословна пракса која и мене изузетно иритра, али тако је како је.

[Spajic1]

Хвала свима.
Нисам радио ниједан додатни тест осим BIG700   . Пробаћу да постави VCF филе на Yfull, а што се тиче  FamilyFinder морам да сачекам поновни попуст, јер је сада 79 USD а 100 USD је пребацивање BAM филе. Боље да ово друго платим, јер покрива све.
Поздрав

[dons]

Ako sam radio Family Finder na FTDNA da li je moguce doplatiti njima oa da na istok uzorku urade y haplogrupu,ili mora ponovo da se salje?

[Platin]

Ako sam radio Family Finder na FTDNA da li je moguce doplatiti njima oa da na istok uzorku urade y haplogrupu,ili mora ponovo da se salje?

Не треба поново да се шаље.
Само се плати следеће тестирање по жељи.

[Васић.РС]

Овдје можете послати свој аутозомални фајл и добићете Y хаплогрупу https://cladefinder.yseq.net/index.php
Наравно, само мушкарци имају ову привилегију .  Резултат се добије у овом облику:

Most specific position on the YFull YTree is I-M423 Link to I-M423 on YFull View heatmap on Y Heatmap View theoretical migration on PhyloGeographer

I-M423    CTS1293/Z2577/S2632+ CTS137/Z2574/S2620($) CTS176/Z2575/S2621/V1063+ CTS2365/S2646($) CTS3293/Z2590/S2659(?) CTS5985/Z2592/S2687(?) CTS7218/Z2596/S2702($) CTS8239/Z2598/S2715($) FGC20462(?) FGC7055(?) FGC7060(?) FGC7070(?) FGC7081(?) FGC8125(?) M423(?) S2654/FGC7071(?) S2657/FGC8110(?) S9008/FGC8108(?) V5116/S7711/FGC7068/SK1239(?) V6976/Z2599/FGC8124(?) V7450/Z2602/S22471/FGC7074(?) Y3114($) Y3117/FGC7078(?) Y3119/FGC8122(?) Y3999/FGC7079(?) YP201/FGC7073($) YP207/S2663/FGC8111(?) YP208/S2666/FGC7072(?) YP209/FGC8106($) YP211/FGC7085($) YP213/FGC7075(?) YP214/FGC7056(?) YP215/FGC8128(?) Z2580/FGC7065/V1939($) Z2581/FGC8118/V2043(?) Z2582/S11619/FGC7084/SK1238/V2221($) Z2583/S11650(?) Z2584/S11840/V2478(?) Z2593/S2688/FGC8109(?) Z2594(?) Z2595/S2691(?) Z2601($) Z2604/S2749/FGC8120($) Z2605/S2750($) Z2607/S2770(?) L178/S328/L178.1/L178.2(?) M10436/Z2579/S10435/V1297.1/V1297(?)
┣━I-FGC41353 +2   FGC41353(?) Y7286/FGC8126(?)
┗━I-V6473    FT366591(?) FT366592(?) FT366593(?) FT366594(?) V6473(?) V6750(?)

Available Panels
YSEQ recommends the I2a-M423 Panel Predicted I-M423 is the panel root. This panel is applicable and will definitely provide higher resolution.

[TwT]

Поздрав свима, новајлија сам по питању генетичке генеалогије.

Недавно сам се тестирао преко FTDNA (на 37 маркера) и испала ми је хаплогрупа I-M253.

Мене занима сад ако бих хтио да пребацим резултат на YFull, да ли ћу поново морати плаћати накнаду, када будем дорадио BIG-Y?

Хвала!

[Драган Обреновић]

Поздрав свима, новајлија сам по питању генетичке генеалогије.

Недавно сам се тестирао преко FTDNA (на 37 маркера) и испала ми је хаплогрупа I-M253.

Мене занима сад ако бих хтио да пребацим резултат на YFull, да ли ћу поново морати плаћати накнаду, када будем дорадио BIG-Y?

Хвала!

На YFull шаљете резултат Big Y-700 теста, када га будете урадили, не можете послати само STR маркере.

Компанија YFull наплаћује 45 EUR анализу вашег резултата и сврставање на YTree филогенетско стабло људског рода. Уплата је једнократна и њоме се добија трајни (доживотни) налог и приступ резултату и алатима за анализу. Обавезно се придружите и Српском ДНК пројекту на YFull.

Сам резултат Big Y-700 можете послати на два начина - као VCF фајл (Variant Call Format) или као BAM фајл (Binary Alignment Map). VCF се може бесплатно преузети, а BAM захтева да га "откупите" од FTDNA за 100 USD, што је доста иритантна пракса компаније FTDNA, али тако је како је.

Разлика између слања  фајлова са FTDNA на YFull је суштински у нивоу детаља које сваки од ових формата садржи. VCF фајл садржи "просејане" информације о разликама вашег Y хромозома у односу на Y хромозом Hg38 референтног људског генома, као што су SNP мутације (Single Nucleotide Polymorphisms), делеције и уметања нуклеотида.

Слање VCF фајла је само преношење резултата анализе FTDNA на YFull, и у том случају YFull "верује на реч" колегама из FTDNA и ваш резултат се смешта на стабло, сходно документованим мутацијама у VCF фајлу.

У случају слања "сировог" BAM фајла, компанија YFull ради своју, независну анализу мутација на вашем Y хромозому, у складу са сопственим критеријумима, који се понекад незнатно разликују од FTDNA, где имају мало оштрије критеријуме колико пута нека позиција на Y хромозому мора бити очитана да би се сматрала поузданом. Међутим, дешава се нешто ређе и обрнута ситуација (да SNP-ови које FTDNA прихвата, YFull не уважава јер се налазе у регионима које они сматрају непоузданима за филогенетску анализу).

Оно што је добра околност - ви можете прво бесплатно преузети са FTDNA свој VCF фајл и послати компанији YFull, уз наравно уплату 45 EUR. Када вам потврде да је резултат на стаблу, можете у будућности у било ком тренутку бесплатно надоградити анализу накнадним слањем BAM фајла, када и ако се одлучите да га откупите од FTDNA за 100 USD.

[Malesevic]

Да ли ово са  VCF фајлом важи и за Данте Лабс? Пошто изгледа да не  планирају да ми доставе БАМ фајл

[Ojler]

Да ли ово са  VCF фајлом важи и за Данте Лабс? Пошто изгледа да не  планирају да ми доставе БАМ фајл

Њихов VCF је раније био практично неупотребљив. Не сећам се објашњења, али су га нешто филтрирали па је садржао веома мало корисних информација за даљу анализу. Не знам како сада раде (ако уопште раде).

[Драган Обреновић]

Да ли ово са  VCF фајлом важи и за Данте Лабс? Пошто изгледа да не  планирају да ми доставе БАМ фајл

Нисам чуо до сада да неко није добио BAM фајл, а да су му завршили анализу. Претпоставим да се овде ради о ситуацији да BAM фајл није преузет у року од 30 дана и да су га онда "архивирали".

[Ojler]

Нисам чуо до сада да неко није добио BAM фајл, а да су му завршили анализу. Претпоставим да се овде ради о ситуацији да BAM фајл није преузет у року од 30 дана и да су га онда "архивирали".

Мени су прво били доставили VCF, а BAM и FASTQ после шест месеци.

[Драган Обреновић]

ОК, то им је онда нека нова пракса, до сада сам испратио преко 20 (можда и 30) резултата тестова код Dante Labs и обично када кажу да је анализа комплетна, сви фајлови су доступни исти дан или сутрадан.

[Ojler]

ОК, то им је онда нека нова пракса, до сада сам испратио преко 20 (можда и 30) резултата тестова код Dante Labs и обично када кажу да је анализа комплетна, сви фајлови су доступни исти дан или сутрадан.

Није нова пракса, ја сам се овде међу првима тестирао. Износим само да су таква била моја искуства, а како је сада немам појма.

[Malesevic]

Нисам чуо до сада да неко није добио BAM фајл, а да су му завршили анализу. Претпоставим да се овде ради о ситуацији да BAM фајл није преузет у року од 30 дана и да су га онда "архивирали".

Вероватно је тако. Јер као што је познато, чекао сам доста дуго на резултат, писао неке жалбе, итд. И онда су ми одједном 30-ог маја доставили резултат тј. убацили у онај панел али је обавештење отишло у спем, па сам ја те резултате видео тек негде почетком јула. Писао сам им од тада два мејла али...