10
« Последња порука Драган Обреновић послато Септембар 09, 2024, 10:10:18 пре подне »
Не, нисте добро схватили. WGS тест је теоретски гледано у сваком могућем погледу бољи и напреднији тест од Big Y-700.
Big Y-700 тест покрива само део укупне дужине Y хромозома, али се фокусира на поуздане регионе који имају доказан филогенетски значај за истраживање и при томе их "појачава" да би се добио јако велики просечан број очитавања по позицији. FTDNA захтева минимум 10 поузданих очитавања да би сматрао неки SNP поузданим (а просек очитавања по позицији је код Big Y-700 теста најчешће преко 40x).
Типичан WGS 30x тест са друге стране очитава (теоретски) комплетан геном - 23 пара хромозома, укључујући и X и Y, с тим што је дубина очитавања самог Y хромозома типично у околини 15x, што је за потребе генетичке генеалогије сасвим довољно. Другим речима, са оба теста ћете добити исти резултат, али ће "резолуција" (број детаља) бити већа код исправно урађеног WGS теста.
Е сад, где је квака 22... На основу преко 20 тестова које сам радио код различитих фирми (FTDNA, Dante Labs, YSEQ, Nebula Genomics) фирма FamilyTreeDNA је без икаквог премца најпрофесионалнија са 100% квалитетно урађеним тестовима. Уз тест добијате и доживотни приступ њиховим услугама, бићете увршћени и на њихово филогенетско стабло (мени је то рецимо јако битно, некима можда није).
Са другим фирмама које продају "direct to consumer" WGS тестове није баш тако сјајна ситуација:
1) Dante Labs - можете добити добро очитан резултат, али има примера да су људи добили резултат без Y хромозома (женски), добили туђи резултат, гомилу шума (смећа), узорак очитан просечном дубином 3x, да чекају резултат више од 2 године (мој случај) итд.
2) Nebula Genomics - углавном су добри, али ја сам уместо резултата мог сина, добио сам резултат непознате особе (помешани узорци у лабораторији), по свему судећи неког Пољака. Срећом имао сам од пре тога и исправан Dante Labs резултат па сам имао аргументацију да се жалим и на крају успео (једва су признали своју грешку). Послали су ми заменски кит, који сам поново послао из Немачке, на праћењу пошиљке стоји да је уручен, а они тврде да им никада није стигао. Моја реч против њихове - дигао сам руке, а хтео сам да урадим тест јер ми се свиђају њихови здравствени извештаји.
3) YSEQ - озбиљна компанија, углавном добро раде, али наши уредници Српског ДНК пројекта уочили су да се из њиховог WGS теста просечно (софтверски) може очитати мање STR маркера него из других WGS тестова. Свакако, за некога ко је урадио WGS тест заправо STR маркери немају неку посебну вредност, али могу помоћи за "регрутовање" потенцијалних кандидата за дубинско тестирање, међу људима који су урадили тест само на STR маркере.
Све у свему, ја за своја истраживања увек идем на FTDNA (Big Y-700) јер знам шта ћу добити и што је још важније, мени лично много значи да имам резултате на оба стабла. Међутим тест је објективно јако скуп обзиром да технолошки већ заостаје за WGS тестовима.
Скорашње поруке
Свако је наравно слободан да води и одржава своје породично стабло како му је најзгодније и најлепше, и то је сасвим у реду.
