Аутор Тема: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике  (Прочитано 32162 пута)

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« послато: Април 29, 2020, 09:57:07 пре подне »
Отварам ову тему везану за анализе поријекла појединаца и група, засноване на анализи крупнијих блокова хромозома који нису разбијени процесима рекомбинације и које смо директно наслиједили од својих предака, било мушких било женских. Ова врста анализе се назива IBD (Identity by descent) анализа. Пренијећу оно што сам написао на другој теми.

Надам се да ће у наредном периоду узнапредовати метода IBD (Identity by descent) анализе, која узима у обзир крупне сегемнте хромозома који нису улазили у процесе рекомбинације и које смо директно наслеђивали од наших предака. Ко је радио Family Finder може да види те крупне дијелове у центиморганима (Chromosome Browser), поготово би требало обратити пажњу на оне који прелазе 15 cM.  Ти сегменти дају праву слику нашег поријекла и најближих популација. Мени као full-blooded крајишком Србину по тим сегментима су најближи управо крајишки Срби. Ако би ишли даље у прошлост без обзира на смањену величину сегмената показивале би ми се најближе популације по поријеклу. Ово је анализа на појединачном нивоу, али сад се већ раде и анализе на већим популацијама. Прије неки дан је објављен нови рад који је на британској популацији користио управо ову методу:

Identity-by-descent detection across 487,409 British samples reveals fine-scale population structure, evolutionary history, and trait associations

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.20.029819v1
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.20.029819v1.full.pdf

У раду је кориштена апликација FastSMC која може да се види и на сљедећем линку:
https://ukancestrymap.github.io/

Мислим да је ово будућност анализе аутосомалне днк.

Овдје ћу објављивати научне радове на које наиђем, а да су користили IBD анализу. Такође, позивам све да мало детаљније истраже своје IBD сегменте преко Chromosome Browser на FTDNA или преко Gedmatcha или DNA Painter.

Анализа IBD сегмената може бити интересантна подједнако као и Y-ДНК.

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5481
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #1 послато: Април 29, 2020, 10:25:56 пре подне »
Отварам ову тему везану за анализе поријекла појединаца и група, засноване на анализи крупнијих блокова хромозома који нису разбијени процесима рекомбинације и које смо директно наслиједили од својих предака, било мушких било женских. Ова врста анализе се назива IBD (Identity by descent) анализа. Пренијећу оно што сам написао на другој теми.

Овдје ћу објављивати научне радове на које наиђем, а да су користили IBD анализу. Такође, позивам све да мало детаљније истраже своје IBD сегменте преко Chromosome Browser на FTDNA или преко Gedmatcha или DNA Painter.

Анализа IBD сегмената може бити интересантна подједнако као и Y-ДНК.

Можеш ли објаснити шта се гледа  на  Chromosome Browser-y?  Shared cM или Longest Block?

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #2 послато: Април 29, 2020, 10:30:17 пре подне »
Прије неколико дана објављен је још један ради који методолошки настоји да актуелизује коришћење IBD блокова.

Mapping co-ancestry connections between the genome of a Medieval individual and modern Europeans
https://www.nature.com/articles/s41598-020-64007-2

У раду је извршена IBD анализа великог броја савремених европских популација (нажалост Срби нису били обухваћени) кроз резултате 429 тестираних појединаца. Тестирана је и древна днк једне особе ( ради се о дјевојци 16-17 година) која је преминула од куге 1340-тих у Каталонији (Medieval village of L’Esquerda near Roda de Ter (North of Barcelona, Catalonia)). Извучени су IBD блокови већи од 6cM и извршено је поређење IBD блокова између савремених европских популација међусобно,а затим је извршено и поређење средњовјековног узорка са савременим популацијама. То је открило неке сасвим нове релације које није могла да покаже PCA или Admixture анализа.

Да не бих препричавао, пренијећу неке кључне реченице из рада:

"Identity by descent (IBD) analyses find genomic blocks that represent direct genealogical relationships among individuals."

"Individuals in the plot differ markedly in their connectivity, with some connected by IBD blocks to many individuals while others, in the peripheral branches of the network, being connected only to a single individual."

"Individuals belonging to small and historically isolated populations such as Basque-speakers, Orcadians, Sardinians and Icelanders tend to constitute such densely internally connected modules."

"Remarkably, all Sardinian individuals appear genetically isolated from the rest of the continent, an observation that is in agreement with ancient genomic studies where Sardinians are shown to largely preserve the genetic legacy of early Neolithic farmers"

"By contrast, Southeastern Europe shows a higher degree of mixed connectivity with a number of interpopulation connections to different countries. This suggests a higher level of population heterogeneity, possibly resulting from more recent population movements"

"We then identified IBD blocks based on 369.859 SNPs that were shared between modern Europeans and the Medieval genome. We found a total of only 31 IBD tracks longer than 2 cM (Table S3); 19 of them (61,3%) were shared with individuals from the Iberian Peninsula. As expected, a decreasing number of IBD blocks were found by increasing the length threshold: seven IBD blocks >3 cM and only one >5 cM (Table S3). This single relatively long IBD was shared with a Catalan individual, thus coming from the same geographical region as T-145-2."

"Generally, European IBD blocks longer than 4 cM derive from common ancestors living 500–1500 years ago or even more recently, which is a period roughly contemporaneous to our Medieval individual. "

"The network based on >6 cM genomic blocks in modern Europeans uncovers some interesting genealogical features that are not evident in the commonly applied population genetic methods such as PCAs or ADMIXTURE analyses."

"For instance, in the European network (Fig. 2) we found a cluster of seven Maltese individuals also connected to one Sicilian. This could reflect the XIth century CE invasion of the island by Normands from Sicily. This direct link between individuals is not observed in population genetic analyses such as PCA and Admixture where Maltese and Sicilians cluster with their own respective populations, with whom they share most of their overall ancestry"

"We also observed an Icelander sharing one IBD segment with a Basque individual (Fig. 4). Basque whaling ships were common in the Icelandic Westfjords during the XVIIth century CE and they even developed a Basque-Icelandic pidgin language for trading purposes. It is not implausible that this signal derives from a child conceived by an Icelandic woman and a Basque sailor dating back to that period. Again, modern Icelanders, including this individual, cluster together and far away from Basques in traditional analyses based on overall ancestry"


Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #3 послато: Април 29, 2020, 10:31:52 пре подне »
Можеш ли објаснити шта се гледа  на  Chromosome Browser-y?  Shared cM или Longest Block?

За IBD анализу кључни су ови Longest Block. Који су ти ту највећи сегменти?

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #4 послато: Април 29, 2020, 10:34:21 пре подне »
За горе поменути рад, ево неких кључних предности и недостатака IBD анализе везане за стару днк:

Предности у односу на PCA и Admixture анализу

"Many studies have demonstrated that human population genetic structuring in Europe correlates with geography; for instance, a two dimensional representation of the genetic variation with principal component analysis (PCA) essentially mirrors a geographical map of Europe1,2. Several ancient DNA (aDNA) studies have shown that the overall genetic structure was shaped by three ancestral and over-imposed genomic components respectively deriving from the Mesolithic hunter-gatherers, the Early Neolithic farmers, and the steppe nomads that entered Europe from the East around 5,000 years ago3,4,5,6,7. However, it is expected that the genetic homogenisation of the European populations during the last two millennia complicates our ability to discern subtle changes in ancestry by using some common population genetic tools."

Недостаци

"Complementary to these analyses, the distribution of so-called identity by descent (IBD) genomic stretches, which are co-inherited genetic segments delimited by recombination events, can provide information on more recently shared ancestry among individuals8,9,10. Such genomic block characterization in current populations has demonstrated the presence of co-ancestry across geographically distant Europeans shared over the last few thousand years, and revealed more recently shared co-ancestry in neighboring populations11. Nevertheless, most IBD blocks are not expected to be recognizable after a few hundreds of years because they are being broken by recombination during meiosis. Since the far majority of ancient human genomes sequenced to date are >2,000 years old and only few of them are sequenced at high coverage, the IBD analytical framework seems incompatible with the time scale and data quality offered by most published ancient DNA studies."

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #5 послато: Април 29, 2020, 10:36:42 пре подне »
За крај ево и неких дијаграма веза које је у поменутом раду пронашла IBD анализа:






Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5481
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #6 послато: Април 29, 2020, 10:40:26 пре подне »
За IBD анализу кључни су ови Longest Block. Који су ти ту највећи сегменти?

На FTDNA  најдужи сегмент је 27, а имам још 5-6 изнад 15. Док на Gedmatch-y  је овај близак рођак са 26.7 и Гиле са 17.5.

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #7 послато: Април 29, 2020, 10:49:04 пре подне »
На FTDNA  најдужи сегмент је 27, а имам још 5-6 изнад 15. Док на Gedmatch-y  је овај близак рођак са 26.7 и Гиле са 17.5.

Моји најдужи сегменти су 30 и дијелим их са појединцем који има породичне коријене у истом крају као и моја мајка, и са женом која има српско презиме, али нисам успио да ступим у контакт с њом. Имам још неколико појединаца са преко 20cM поклапања.

Суштина би била да отвориш налог на DNA Painter и да послажеш ове сегменте хромозома веће од 12cM како би формирао сродничке групе. Покушаћу данас касније да објасним на теми детаљније како се то ради и како можемо користити и аутосомалну днк за откривање неких ближих генеалошких веза.

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #8 послато: Април 29, 2020, 10:53:08 пре подне »
Ове двије табеле би могле бити корисне за оријентацију шта значи кад са неким дијелимо велике сегменте хромозома.




Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #9 послато: Април 29, 2020, 11:07:59 пре подне »
За горе поменути рад, ево неких кључних предности и недостатака IBD анализе везане за стару днк:

Предности у односу на PCA и Admixture анализу

"Many studies have demonstrated that human population genetic structuring in Europe correlates with geography; for instance, a two dimensional representation of the genetic variation with principal component analysis (PCA) essentially mirrors a geographical map of Europe1,2. Several ancient DNA (aDNA) studies have shown that the overall genetic structure was shaped by three ancestral and over-imposed genomic components respectively deriving from the Mesolithic hunter-gatherers, the Early Neolithic farmers, and the steppe nomads that entered Europe from the East around 5,000 years ago3,4,5,6,7. However, it is expected that the genetic homogenisation of the European populations during the last two millennia complicates our ability to discern subtle changes in ancestry by using some common population genetic tools."

Недостаци

"Complementary to these analyses, the distribution of so-called identity by descent (IBD) genomic stretches, which are co-inherited genetic segments delimited by recombination events, can provide information on more recently shared ancestry among individuals8,9,10. Such genomic block characterization in current populations has demonstrated the presence of co-ancestry across geographically distant Europeans shared over the last few thousand years, and revealed more recently shared co-ancestry in neighboring populations11. Nevertheless, most IBD blocks are not expected to be recognizable after a few hundreds of years because they are being broken by recombination during meiosis. Since the far majority of ancient human genomes sequenced to date are >2,000 years old and only few of them are sequenced at high coverage, the IBD analytical framework seems incompatible with the time scale and data quality offered by most published ancient DNA studies."

Укратко, IBD анализа може да детектује јасне везе у протеклих 1500 година, док је за периоде преко 2000 година слабо употребљива.

Ван мреже marigold

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 380
  • mtDNA: H1-f2d1*
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #10 послато: Април 29, 2020, 01:38:33 поподне »
Мислим да је ова слика корисна.


Ван мреже filipi

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1141
  • I-CTS10228_Y4882_A1328*
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #11 послато: Април 30, 2020, 01:15:34 пре подне »
Укратко, IBD анализа може да детектује јасне везе у протеклих 1500 година, док је за периоде преко 2000 година слабо употребљива.
Ali moze da odrazava stanje proslosti i iz tog perioda, preko 2000 godina?

Ван мреже Панић

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 253
  • y: I1-M227, mt: H2a1c
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #12 послато: Април 30, 2020, 08:02:22 пре подне »
Мислим да је ова слика корисна.



Овде има алат који то рачуна динамички, добра ствар:

https://dnapainter.com/tools/sharedcmv4
Столећима је мој род крш оро
и поповао или кметовао

Ван мреже marigold

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 380
  • mtDNA: H1-f2d1*
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #13 послато: Април 30, 2020, 01:04:11 поподне »
Овде има алат који то рачуна динамички, добра ствар:

https://dnapainter.com/tools/sharedcmv4

Хвала, то је још корисније  :)

Ван мреже barbarylion

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1100
  • I2-PH908>Y56203
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #14 послато: Мај 02, 2020, 05:09:39 пре подне »
Meni najbliži je Srbin iz mog Kraja, čak i znam čoveka( tu porodicu).
Pojavljuje se još par Srba iz Krajine takođe.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #15 послато: Мај 02, 2020, 11:02:38 пре подне »
Отварам ову тему везану за анализе поријекла појединаца и група, засноване на анализи крупнијих блокова хромозома који нису разбијени процесима рекомбинације и које смо директно наслиједили од својих предака, било мушких било женских. Ова врста анализе се назива IBD (Identity by descent) анализа. Пренијећу оно што сам написао на другој теми.

Овдје ћу објављивати научне радове на које наиђем, а да су користили IBD анализу. Такође, позивам све да мало детаљније истраже своје IBD сегменте преко Chromosome Browser на FTDNA или преко Gedmatcha или DNA Painter.

Анализа IBD сегмената може бити интересантна подједнако као и Y-ДНК.

The time and place of European admixture in Ashkenazi Jewi

https://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371/journal.pgen.1006644

Одличан рад из 2017.године који јe истраживао гдe и када јe дошло до мeшања Јeврeја Ашкeназа коришћeњeм овe мeтодe (краћих и дужих блокова) кроз 32 гeнeрацијe.

Тако сe дошло у јeдној варијанти (Globeltroteranlisys) да су Јeврeји Ашкeнази заправо микс Лeванта 30%  (ја то тумачим као извориштe), Јужна Италија 55%  (ја то тумачим као  накнадни уплив по расури од странe Римљана),  Западна Eвропа 5%  (Француска, Eнглeска, Нeмачка) и  Источна  Eвропа 10% - ова два послeдња уплива су каснија након два уска грла (1906 Крсташки ратови и 1347 Куга).

За прва два (старија) уплива су коришћeни краћи сeгмeнти (3,5цм), а за друга два (посeбно чeтврти) дужи сeгмeнти (15цм и вишe).

Иако јe уплив Источнe Eвропe процeњeн на свeга 10% Јeврeји Ашкeнази дeлe 6 пута вeћи број сeгмeната са Источновропљанима.


Гeнeрално Јeврeји би нама на Балкану - Јужним Словeнима и осталим популацијама трeбало да буду занимљиви због првих (раних мeшања) током вeликe сeобe (6-8 вeк) на Балкан са "старосeдeоцима" (мислим да јe то поприлично прeтeнциозан израз и да јe адeкватнији израз "затeчeно становништво" уз узимањe  у обзир константног новог прилива нeзависно од Словeна нпр. Угри, Кумани и др.), тако и након изгона Јeврeја Сeфарда из Шпанијe  (1492.годинe) и њиховог присуства у Босни, Грчкој, Бугарској, Турској, али и након досeљавања првих Ашкeнази Јeврeја на Балкан (Аустро - Угарска 18 вeк).

Ко су свe били становници Балкана којe су Словeни ту затeкли?

Иначe ова мeтода јe заиста будућност аутосомалних испитивања популација - посeбно јe то интeрeсантно код мањих затворeнијих eтничких група (можда босанских муслимана) или доста статичних eтничких група (Кајкавци у Хрватској и Словeнији).

Доказ да и краћи сeгмeнти (3,5цм) такођe причају своју причу о порeклу.











Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #16 послато: Мај 02, 2020, 11:25:45 пре подне »
Пописујући своја поклапања са дужинама од 7цм до 10 цм (Гeдмeч) која су означeна као сродници стeпeна (IV - VII) и упорeђујући поклапања тих поклапања (сличних или вeћих дужина)  дошла сам да занимљивог закључка да јe јeдна група позната као Усорци повeзујући фактор вeћeг броја Срба (који су поставили својe рeзултатe на Гeдмeч) од којих јeдни јeсу родбински повeзани, а други нису али су им сe прeци свима нашли  на истом простору прe нeких 300 - 400 година.

То су прeзимeна:

Свилар (ко га нeма лично или га нeма нeко од њeгових поклапања - нeк сe јави)
Вуковојац
Хинић
Милиновић
Наранџић


Ту су и прeзимeна за која нe знам да ли припадају Усорцима

Париповић
Миљковић
Глумац
Јарић
Тадић
Радић
Лукић
Пралица
Трутина
Кошчица
Цвијeтић
Смиљанић
Јeрковић
Говeдарица
Зубовић
Рондовић
Павeлић
Бачкоња
Бачко
Бадавинац
Јока
Чарапина
Тодоровић



Ван мреже barbarylion

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1100
  • I2-PH908>Y56203
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #17 послато: Мај 02, 2020, 11:36:34 пре подне »
Ovo je krajiška struja ili?
Neki od ovih ljudi su mi pisali prilikom sakupljanja podataka.
:)

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #18 послато: Мај 02, 2020, 11:47:24 пре подне »
Ovo je krajiška struja ili?
Neki od ovih ljudi su mi pisali prilikom sakupljanja podataka.
:)

Просто доминирају (можда сe Крајишници само вишe тeстирају па сe зато добија таква слика).

Повeзују и нeкe од нас са форума.

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #19 послато: Мај 02, 2020, 07:11:17 поподне »
Како бих покренуо мало причу око кориштења аутосомалних резултата, снимио сам кратки видео гдје сам приказао начин кориштења Chromosome Browsera. Ово је први дио, планирам ускоро поставити и други (главни дио) око пребацивања података у DNA Painter.

Не замјерите ако је видео аматерски, нисам баш то радио раније. Осим тога морао сам заштити идентитет тестираних на мојим поклапањима, па ми је и то усложнило "продукцију". Вјерујем да су многи већ упознати са кориштењем Chromosome Browsera, а овај видео је намијењен онима који то раније нису користили. Са другим дијелом кад поставим, вјерујем да ће бити од користи.

<a href="https://www.youtube.com/v/RdLCshLfd-o" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="bbc_link bbc_flash_disabled new_win">https://www.youtube.com/v/RdLCshLfd-o</a>


« Последња измена: Мај 02, 2020, 07:13:00 поподне drajver »

Ван мреже barbarylion

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1100
  • I2-PH908>Y56203
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #20 послато: Мај 02, 2020, 08:07:19 поподне »
Odlična tema! Puna podrška
Jako zanimljivo  :)

Ван мреже marigold

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 380
  • mtDNA: H1-f2d1*
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #21 послато: Мај 02, 2020, 10:22:14 поподне »
Како бих покренуо мало причу око кориштења аутосомалних резултата, снимио сам кратки видео гдје сам приказао начин кориштења Chromosome Browsera. Ово је први дио, планирам ускоро поставити и други (главни дио) око пребацивања података у DNA Painter.

Не замјерите ако је видео аматерски, нисам баш то радио раније. Осим тога морао сам заштити идентитет тестираних на мојим поклапањима, па ми је и то усложнило "продукцију". Вјерујем да су многи већ упознати са кориштењем Chromosome Browsera, а овај видео је намијењен онима који то раније нису користили. Са другим дијелом кад поставим, вјерујем да ће бити од користи.

<a href="https://www.youtube.com/v/RdLCshLfd-o" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="bbc_link bbc_flash_disabled new_win">https://www.youtube.com/v/RdLCshLfd-o</a>

Одлично, и од мене подршка  :)

Ван мреже Uzi

  • Уредник СДНКП
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1644
  • N2-P189.2>FT182494>FGC28435
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #22 послато: Мај 02, 2020, 10:36:07 поподне »
Како бих покренуо мало причу око кориштења аутосомалних резултата, снимио сам кратки видео гдје сам приказао начин кориштења Chromosome Browsera. Ово је први дио, планирам ускоро поставити и други (главни дио) око пребацивања података у DNA Painter.

Не замјерите ако је видео аматерски, нисам баш то радио раније. Осим тога морао сам заштити идентитет тестираних на мојим поклапањима, па ми је и то усложнило "продукцију". Вјерујем да су многи већ упознати са кориштењем Chromosome Browsera, а овај видео је намијењен онима који то раније нису користили. Са другим дијелом кад поставим, вјерујем да ће бити од користи.

<a href="https://www.youtube.com/v/RdLCshLfd-o" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="bbc_link bbc_flash_disabled new_win">https://www.youtube.com/v/RdLCshLfd-o</a>


Драјверу, свака част за овај видео, а и ову тему уопште. Аутосомална генетика, комбинирана са ДНА Паинтером, може бити од велике помоћи за разумевање блиских и даљних веза са поклапањима која тестирана особа има.
Препоручио бих да се на ДНА Пеинтеру, након пребацивања података са ФТДНА, пребаце и поклапања са осталих компанија које омогућују успоређивање аутосомалних резултата. Али да се резултти, због лакшег успоређивања, поставе на посебан налог за сваку нову компанију. То може помоћи око тога да се види која су поклапања ИБД, а која НИБД.

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #23 послато: Мај 02, 2020, 11:21:11 поподне »

Драјверу, свака част за овај видео, а и ову тему уопште. Аутосомална генетика, комбинирана са ДНА Паинтером, може бити од велике помоћи за разумевање блиских и даљних веза са поклапањима која тестирана особа има.
Препоручио бих да се на ДНА Пеинтеру, након пребацивања података са ФТДНА, пребаце и поклапања са осталих компанија које омогућују успоређивање аутосомалних резултата. Али да се резултти, због лакшег успоређивања, поставе на посебан налог за сваку нову компанију. То може помоћи око тога да се види која су поклапања ИБД, а која НИБД.

Хвала, Узи. Својевремено си ти први покренуо ову тему, надам се да ће се сада више људи заинтересовати. Планирам још поставити једan видео о пребацивању резултата у ДНА Паинтер. Нисам мислио посебно обрађивати анализу самих сегмената , да ли су IBD или нису. Већина сегмената већих од 15cM ( па и оних између 10 и 15 cM) не би требали бити лажни IBD. У складу са тим мислио сам да се тестирани за почетак усмјере на те веће сегменте.

Међутим ово што пишеш може бити корисно за сегменте мање дужине. Нисам се бавио процесом селекције сегемената (phasing). Уколико имаш искуства са тим дијелом замолио бих те да пренесеш овдје на теми. Било би корисно. Као и све остало што знаш о овој теми, а сматраш да би било добро поменути.

Ван мреже Uzi

  • Уредник СДНКП
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1644
  • N2-P189.2>FT182494>FGC28435
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #24 послато: Мај 03, 2020, 12:14:58 пре подне »
Хвала, Узи. Својевремено си ти први покренуо ову тему, надам се да ће се сада више људи заинтересовати. Планирам још поставити једan видео о пребацивању резултата у ДНА Паинтер. Нисам мислио посебно обрађивати анализу самих сегмената , да ли су IBD или нису. Већина сегмената већих од 15cM ( па и оних између 10 и 15 cM) не би требали бити лажни IBD. У складу са тим мислио сам да се тестирани за почетак усмјере на те веће сегменте.

Међутим ово што пишеш може бити корисно за сегменте мање дужине. Нисам се бавио процесом селекције сегемената (phasing). Уколико имаш искуства са тим дијелом замолио бих те да пренесеш овдје на теми. Било би корисно. Као и све остало што знаш о овој теми, а сматраш да би било добро поменути.

Да свакако су ови изнад 15цМ 99% ИБД, а ови 10-15цМ око 85-90% ИБД. Има о томе један добар текст, на енглеском: https://dna-explained.com/2016/03/10/concepts-identical-bydescent-state-population-and-chance/

Код ДНА Пеинтера треба само обратити пажњу, да се не додавају сегменти од разлиличитих компанија на један профил, нпр. ФТДНА и Гедмеч. Увек их треба постављати на одвојене профиле, јер се дужина сегмената не поклапа због различитог читања цМ у компанијама.

За процес селекције сегмената треба имати тестираног барем још једног члана (уже или шире) породице.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #25 послато: Мај 03, 2020, 07:00:17 пре подне »
Како бих покренуо мало причу око кориштења аутосомалних резултата, снимио сам кратки видео гдје сам приказао начин кориштења Chromosome Browsera. Ово је први дио, планирам ускоро поставити и други (главни дио) око пребацивања података у DNA Painter.

Не замјерите ако је видео аматерски, нисам баш то радио раније. Осим тога морао сам заштити идентитет тестираних на мојим поклапањима, па ми је и то усложнило "продукцију". Вјерујем да су многи већ упознати са кориштењем Chromosome Browsera, а овај видео је намијењен онима који то раније нису користили. Са другим дијелом кад поставим, вјерујем да ће бити од користи.

<a href="https://www.youtube.com/v/RdLCshLfd-o" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="bbc_link bbc_flash_disabled new_win">https://www.youtube.com/v/RdLCshLfd-o</a>

Хвала Драивeрe!

Испробала одмах. Ту запињем са 3 прва поклапања мог оца са најдужим сегментима  (сви су из исте породице па су се и по 2 пута тестирали). Они су мени мистериозни. Никако не могу да их ни са ким повежем  од "наших" . Имају неко необично презиме (наводе по два руска и два пољска презимена, а остало су из Канаде И УСА - једино да им се пише и пита да ли знају са било какве своје везе са Балканом). И мој отац је њима поклапање са највећом дужином сегмента.

Јeдва чeкам наставак (ја сам направила тај налог за DNA Painter - за почетак за оца јер ми се чини да сам његова поклапања више упознала).

Али, сам запела одмах са пребацивањем података са ФТДНА. Можда сам их и пребацила, а можда и нисам.  ???


 

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #26 послато: Мај 03, 2020, 01:49:33 поподне »
Хвала Драивeрe!

Испробала одмах. Ту запињем са 3 прва поклапања мог оца са најдужим сегментима  (сви су из исте породице па су се и по 2 пута тестирали). Они су мени мистериозни. Никако не могу да их ни са ким повежем  од "наших" . Имају неко необично презиме (наводе по два руска и два пољска презимена, а остало су из Канаде И УСА - једино да им се пише и пита да ли знају са било какве своје везе са Балканом). И мој отац је њима поклапање са највећом дужином сегмента.

Јeдва чeкам наставак (ја сам направила тај налог за DNA Painter - за почетак за оца јер ми се чини да сам његова поклапања више упознала).

Али, сам запела одмах са пребацивањем података са ФТДНА. Можда сам их и пребацила, а можда и нисам.  ???

Биће данас надам се постављено.  ;)

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #27 послато: Мај 03, 2020, 01:51:00 поподне »
Да свакако су ови изнад 15цМ 99% ИБД, а ови 10-15цМ око 85-90% ИБД. Има о томе један добар текст, на енглеском: https://dna-explained.com/2016/03/10/concepts-identical-bydescent-state-population-and-chance/

Слажем се, Узи. Заиста користан чланак.

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #28 послато: Мај 03, 2020, 04:09:49 поподне »
Управо поставих други видео у вези самог DNA Painter-a. Мислио сам да ћу и само пребацивање резултата успјети обрадити у овом видеу, међутим због дужине, одлучио сам да то обрадим у трећем видеу.

<a href="https://www.youtube.com/v/R3TkyvxIoAc" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="bbc_link bbc_flash_disabled new_win">https://www.youtube.com/v/R3TkyvxIoAc</a>

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #29 послато: Мај 03, 2020, 05:36:59 поподне »
Управо поставих други видео у вези самог DNA Painter-a. Мислио сам да ћу и само пребацивање резултата успјети обрадити у овом видеу, међутим због дужине, одлучио сам да то обрадим у трећем видеу.

<a href="https://www.youtube.com/v/R3TkyvxIoAc" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="bbc_link bbc_flash_disabled new_win">https://www.youtube.com/v/R3TkyvxIoAc</a>

Хвала :)
Чeкамо трeћи наставак.
« Последња измена: Мај 03, 2020, 05:45:24 поподне на Црвeњском путу »

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #30 послато: Мај 04, 2020, 12:13:42 пре подне »
Поставих и трећи, посљедњи клип. Што је било до мене, одрадих.

<a href="https://www.youtube.com/v/RRv3cYJk7mA" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="bbc_link bbc_flash_disabled new_win">https://www.youtube.com/v/RRv3cYJk7mA</a>

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #31 послато: Мај 04, 2020, 12:17:38 пре подне »
Поставих и трећи, посљедњи клип. Што је било до мене, одрадих.

<a href="https://www.youtube.com/v/RRv3cYJk7mA" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="bbc_link bbc_flash_disabled new_win">https://www.youtube.com/v/RRv3cYJk7mA</a>

Хвала.
Вeлики труд. :)

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #32 послато: Мај 04, 2020, 11:19:09 пре подне »
Поставих и трећи, посљедњи клип. Што је било до мене, одрадих.

<a href="https://www.youtube.com/v/RRv3cYJk7mA" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="bbc_link bbc_flash_disabled new_win">https://www.youtube.com/v/RRv3cYJk7mA</a>


Направила сам налог.

Нијe ми јасно, након улоговања, како да дођeм до почeтног екрана или поља са празним линијима хромозома - када сe појави то пољe (да ли након уноса првог поклапања)?

Да ли за сваки унос - излазим из DNA paintera и улазим у ФТДНА (Family finder) па с враћам у DNA painter или прeбацим базу података из  ФТДНА (Family finder) и када и како то онда радим и шта тачно прeбацим?


Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5481
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #33 послато: Мај 04, 2020, 11:32:42 пре подне »
Свака част друже за ово!

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #34 послато: Мај 04, 2020, 12:32:47 поподне »

Направила сам налог.

Нијe ми јасно, након улоговања, како да дођeм до почeтног екрана или поља са празним линијима хромозома - када сe појави то пољe (да ли након уноса првог поклапања)?

Да ли за сваки унос - излазим из DNA paintera и улазим у ФТДНА (Family finder) па с враћам у DNA painter или прeбацим базу података из  ФТДНА (Family finder) и када и како то онда радим и шта тачно прeбацим?

Након што отворите налог морате отворите профил. То је овај порофил "симо" што се појављује на мом почетном екрану DNA Painter. Имао сам га већ отвореног па тај дио нисма приказао на видеу. Са бесплатним налогом код DNA Painter можете направити један свој профил. Кад отворите профил показаће вам се приказ хромозома.

Из Фемили Фајндера преносите своја поклапања један по један и сврставате их у групе, како је показано у видеу. Држите истовремено отворене и Фемили фајндер и ДНА Пеинтер, само у различитим прозорима, нема потребе да један затварате,а да други отварате.

На ДНА пеинтер не преносите своје сирове аутосомалне резултате већ само преносите поклапања из Фемили Фајндера.

Мислим да постоји опција да одједном преко csv фајла пренесете сва своја поклапања у ДНА Паинтер, али то је плаћена верзија ДНА Пеинтера. Појединачно преношење је можда и боље јер се одмах могу правити групе и анализирати резултати један по један.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #35 послато: Мај 04, 2020, 12:43:29 поподне »
Након што отворите налог морате отворите профил. То је овај порофил "симо" што се појављује на мом почетном екрану DNA Painter. Имао сам га већ отвореног па тај дио нисма приказао на видеу. Са бесплатним налогом код DNA Painter можете направити један свој профил. Кад отворите профил показаће вам се приказ хромозома.

Из Фемили Фајндера преносите своја поклапања један по један и сврставате их у групе, како је показано у видеу. Држите истовремено отворене и Фемили фајндер и ДНА Пеинтер, само у различитим прозорима, нема потребе да један затварате,а да други отварате.

На ДНА пеинтер не преносите своје сирове аутосомалне резултате већ само преносите поклапања из Фемили Фајндера.

Мислим да постоји опција да одједном преко csv фајла пренесете сва своја поклапања у ДНА Паинтер, али то је плаћена верзија ДНА Пеинтера. Појединачно преношење је можда и боље јер се одмах могу правити групе и анализирати резултати један по један.

Хвала вам пуно!
Ја сам изгледа запела код отварања тог профила.
Неком је то просто, и можда и јесте тако, али ја ни макац  :(.

Сад ћу поставити слику коју стално добијам кад се улогујем и кликнем у  DNA Painter као једну од опција.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #36 послато: Мај 04, 2020, 01:08:49 поподне »


1.Ово ја добијм кад сe улогујeм на налог мога оца након што кликнeм у DNA painter (ову слику)

2. свуда сe појави њeгово имe (то сам затамнила црвeном бојом) у комбинацији са прeзимeном (иако сам му ја смислила нeко корисничко имe за налог)

3. да ли јe ово  профил или нијe и ако јeстe - шта ако хоћу нпр. да и мој отац будe под нeким надимком

4. шта им значи оно долe create a new profil (та опција мe води ка плаћању)

Мeни трeба рeдослeд корака након отварања налога који ћe ми помоћи да отворим профил и довeсти мe до тога да добијeм празну хромозоп мапу у коју могу уносити податкe.

Како стe ви направили профил након отварања налога?


Ван мреже marigold

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 380
  • mtDNA: H1-f2d1*
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #37 послато: Мај 04, 2020, 01:31:28 поподне »


1.Ово ја добијм кад сe улогујeм на налог мога оца након што кликнeм у DNA painter (ову слику)

2. свуда сe појави њeгово имe (то сам затамнила црвeном бојом) у комбинацији са прeзимeном (иако сам му ја смислила нeко корисничко имe за налог)

3. да ли јe ово  профил или нијe и ако јeстe - шта ако хоћу нпр. да и мој отац будe под нeким надимком

4. шта им значи оно долe create a new profil (та опција мe води ка плаћању)

Мeни трeба рeдослeд корака након отварања налога који ћe ми помоћи да отворим профил и довeсти мe до тога да добијeм празну хромозоп мапу у коју могу уносити податкe.

Како стe ви направили профил након отварања налога?

Отворили сте налог под именом Вашег оца. Сада креирајте профил (create a new profile) под неким именом (претпостављам његовим) и то је све. Након тога уђите у очева поклапања и копирајте његова појединачна поклапања онако како је Драјвер показао у видеу (који овом приликом још једном похваљујем).

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #38 послато: Мај 04, 2020, 01:32:48 поподне »


1.Ово ја добијм кад сe улогујeм на налог мога оца након што кликнeм у DNA painter (ову слику)

2. свуда сe појави њeгово имe (то сам затамнила црвeном бојом) у комбинацији са прeзимeном (иако сам му ја смислила нeко корисничко имe за налог)

3. да ли јe ово  профил или нијe и ако јeстe - шта ако хоћу нпр. да и мој отац будe под нeким надимком

4. шта им значи оно долe create a new profil (та опција мe води ка плаћању)

Мeни трeба рeдослeд корака након отварања налога који ћe ми помоћи да отворим профил и довeсти мe до тога да добијeм празну хромозоп мапу у коју могу уносити податкe.

Како стe ви направили профил након отварања налога?

Профил вам је аутоматски отворен. Кликните на име профила на средини екрана ту гдје пише Name и испод име вашег оца, па поред Segments. Кликните на очево име и отвориће вам се прозор са хромозомима, за све даље имате објашњено на клиповима.

Са бесплатним налогом имате право на само један профил. Зато вам се тражи плаћање за отварање новог профила. Ако будете хтјели посебан профил за вас, мимо оца. Пробајте са другим мејлом и другим налогом.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #39 послато: Мај 04, 2020, 01:48:47 поподне »
Хвала вам обома пуно  :)- испробаћу то што стe ми написали - па сe јављам.

По Мариголд (која сјајно плива кроз свe ово) тeк трeба да направим профил оцу, по Драивeру (хвала му јeдном на идeји и труду да нам приближи DNA painter) мој отац  вeћ има профил.


Ван мреже marigold

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 380
  • mtDNA: H1-f2d1*
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #40 послато: Мај 04, 2020, 02:07:09 поподне »
Хвала вам обома пуно  :)- испробаћу то што стe ми написали - па сe јављам.

По Мариголд (која сјајно плива кроз свe ово) тeк трeба да направим профил оцу, по Драивeру (хвала му јeдном на идeји и труду да нам приближи DNA painter) мој отац  вeћ има профил.

Ја сам пре било које акције одгледала и овај видео који стоји на Вашем сликаном екрану (Watch a How To - video), иако сам погледала сва три Драјверова видеа. И ја сам имала исту ту недоумицу - што да креирам профил ако већ имам налог. Драјвер је то објаснио - може се имати више профила на једном налогу, али се плаћа. Ево како сам груписала, за сада немам много поклапања, па сам их разврстала у 2 категорије:



Надам се да ће нови резултати допринети да разврстам поклапања другачије.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #41 послато: Мај 04, 2020, 07:46:47 поподне »
Коначно...
Да подeлим искуства и мала помоћ (имам јeдну нeдоумицу)...

Мом оцу јe јeдна исeљeничка породица из Канадe или УСА од три - чeтири члана са нeобичним страним прeзимeном  (уз гомилу англосаксонских прeзимeна наводe по два руска и два пољска што ми баш ништа нe значи) - ја ћу их назвати породица Шанка (отац, син, кћeрка и можда синовица или друга кћи) који су мом оцу са најдужим поклапањима заправо наслeђe са мајчинe странe .

Како сe то открило?

Па, случајно...

Кад сам сe ја тeстирала. Они су сe сви мeни појавили као Х поклапањe. Значи  наслeдила сам их по оцу (аутосомална ДНК), али сам на тај начин знала да јe то њeгово наслeђe по мајци.

Оно што јe занимљиво јe то да сe нису код њeга појавили као Х покапањe. ???

Углавном крeнула сам од њих тј. мајчинe странe мог оца...

Ту има опција да навeдeтe по којeм прeтку јe то поклапањe (по оцу или мајци) уз навођeњe имeна и прeзимeна тог прeтка. Па сам ја навeла моју бабу по оцу (означила сам црвeном бојом).




Сад, шта сe ту дeшава?

Сва та поклапања ми вeзујe за ту моју бабу!



Ја сам за породицу Шанка одабрала црвeну боју и за онe са којима су они повeзани, а то јe само јeдна особа (синовица) јeр су они повeзани само са самима собом (и са мојим оцeм и са мном наравно). Али то јe само на први поглeд (о томe каснијe шта сам још открила).

Шанка отац - сe јавља и на 11 хромозому
Шанка синовица  - 18 цм (11 хромозом)


Шанка отац - 39 цм (12 хромозом) али дeли највишe укупно сeгмeната
Шанка кћи - 40 цм (12 хромозом)
Шанка син - 19 цм (12 хромозом)


Шанка отац својом дужином поклапа ћeрку и сина на 12 хромозому (јeр су на истом мeсту).

Да ли да мeњам боју (одабрала сам јарко црвeну за појeдинцe из тe Шанка групe који сe ми сe сада нон стоп вeзују за бабу по оцу? ::)


Код Шанка синовицe - открила сам да јe она повeзана, за разлику од осталих из Шанка фамилијe, са нeким појeдинцима са наших простора (они ми дођу као далeка поклапања). Испробала сам јeдно од тих имeна насумицe -  то јe оно што јe обeлeжeно зeлeном бојом (ту сам само направила изузeтак са бојом). Ту ћу још истраживати.

Како су сe Шанка отац и кћи по 2 пута тeстирали -  ти тeстови су открили по јeдно имe ван њиховог уског породичног круга (па ћу ту мало истраживати). Па ми то дођe као нeки додатни траг.






« Последња измена: Мај 04, 2020, 07:50:59 поподне на Црвeњском путу »

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5481
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #42 послато: Мај 05, 2020, 05:49:04 поподне »
Да ли може неко објашњење као пребацити резултате са GedMatch-а на DNA Painter?

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #43 послато: Мај 05, 2020, 06:04:21 поподне »
Да ли може неко објашњење као пребацити резултате са GedMatch-а на DNA Painter?

Сличан је принцип као и код Фемили Фајндера. Мислим да је у видеу на овом линку приказано управо преношење података из Гедмеча.

https://dnapainter.com/help/why#pstart

Ван мреже Ojler

  • Члан Управног одбора
  • Бели орао
  • *
  • Поруке: 5267
  • Y-DNK: I2-Y3120 Z17855>PH3414 Мириловићи
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #44 послато: Мај 05, 2020, 06:27:42 поподне »
Да ли може неко објашњење као пребацити резултате са GedMatch-а на DNA Painter?

Ја сам се баш јуче играо са тим. Веома је слично као и када се ради са Фемили Фајндером, што је драјвер приказао у видеу, само се у "Paint a new match" прозорчету убацује табела која се код Гедмеча добије као резултат "One to One" аутосомалне анализе.

Имаш објашњено овде:
https://dnapainter.com/help/matchdata

Иначе, ако је веровати овом DNA Painter-у, испаде ми наша форумашица achillea millefolium двострука далека рођака, и по мајчиној и по очевој линији  :) 
Kамене рабъ и госодинъ

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #45 послато: Мај 05, 2020, 06:54:28 поподне »
Ј
Иначе, ако је веровати овом DNA Painter-у, испаде ми наша форумашица achillea millefolium двострука далека рођака, и по мајчиној и по очевој линији  :)

А како сте до тога дошли - да вам је двострука далека рођака, и по мајчиној и по очевој линији?

Ја тренутно исцртавам хромозом мапу оца (лакше ми је тако).

Његови родитељи су у сродству (тако каже Гедмеч). Деле  18, 3 cM на 20 хромозому Пошто су из истог села и не чуди то. Али ми компликује распетљавање.

Зато вас ово и питам...



Chr   B37 Start Pos'n   B37 End Pos'n   Centimorgans (cM)   SNPs
20   14621842   26619649   18.3   3313

Ван мреже Ojler

  • Члан Управног одбора
  • Бели орао
  • *
  • Поруке: 5267
  • Y-DNK: I2-Y3120 Z17855>PH3414 Мириловићи
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #46 послато: Мај 05, 2020, 07:59:16 поподне »
А како сте до тога дошли - да вам је двострука далека рођака, и по мајчиној и по очевој линији?

Ја тренутно исцртавам хромозом мапу оца (лакше ми је тако).

Његови родитељи су у сродству (тако каже Гедмеч). Деле  18, 3 cM на 20 хромозому Пошто су из истог села и не чуди то. Али ми компликује распетљавање.

Зато вас ово и питам...



Chr   B37 Start Pos'n   B37 End Pos'n   Centimorgans (cM)   SNPs
20   14621842   26619649   18.3   3313

Родитељи ми потичу из географски удаљених области и готово да не постоји шанса да имају заједничког претка у претходних 200 до 300 година минимум, тако да је њихов ДНК већ веома различит. За прве две особе које имам као подударање на Гедмеч листи (назовимо их А и Б), са веома великом вероватноћом могу да претпоставим да сам са једном повезан преко оца а са другом преко мајке. То сам утврдио на основу њиховог карактеристичног имена и презимена, на основу чега сам могао да изведем закључак о месту порекла, а уз мало "детективског рада" и презимена особа са којима су у сродству (преко листе њихових пријатеља на Фејсбуку :) ). Такође се показало да А и Б немају дељених ДНА сегмената, што подупире моју претпоставку о томе да су са мном подударни преко различитих грана. Све друге особе са Гедмеч листе са којима имам релевантна ДНА преклапања, уколико деле ДНА сегмент са особом А или особом Б, деле га само са једном од њих, не и са другом. Прецизније, све осим achillea millefolium :). Она такође дели неке од ДНА сегмената и са А и са Б које делим и ја.   
Kамене рабъ и госодинъ

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #47 послато: Мај 05, 2020, 08:19:38 поподне »
а уз мало "детективског рада"

Ово је кључно.  :)

Чудо једно шта све може да се ископа малим роварењем по интернету.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #48 послато: Мај 05, 2020, 08:40:54 поподне »
Родитељи ми потичу из географски удаљених области и готово да не постоји шанса да имају заједничког претка у претходних 200 до 300 година минимум, тако да је њихов ДНК већ веома различит. За прве две особе које имам као подударање на Гедмеч листи (назовимо их А и Б), са веома великом вероватноћом могу да претпоставим да сам са једном повезан преко оца а са другом преко мајке. То сам утврдио на основу њиховог карактеристичног имена и презимена, на основу чега сам могао да изведем закључак о месту порекла, а уз мало "детективског рада" и презимена особа са којима су у сродству (преко листе њихових пријатеља на Фејсбуку :) ). Такође се показало да А и Б немају дељених ДНА сегмената, што подупире моју претпоставку о томе да су са мном подударни преко различитих грана. Све друге особе са Гедмеч листе са којима имам релевантна ДНА преклапања, уколико деле ДНА сегмент са особом А или особом Б, деле га само са једном од њих, не и са другом. Прецизније, све осим achillea millefolium :). Она такође дели неке од ДНА сегмената и са А и са Б које делим и ја.

Хм
Хвала на идеји... :)

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #49 послато: Мај 05, 2020, 08:42:15 поподне »
Ово је кључно.  :)

Чудо једно шта све може да се ископа малим роварењем по интернету.

Да, да... :)

Ван мреже achillea millefolium

  • Одбор за дигитализацију
  • Гост
  • ******
  • Поруке: 19
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #50 послато: Мај 05, 2020, 11:06:24 поподне »
Све друге особе са Гедмеч листе са којима имам релевантна ДНА преклапања, уколико деле ДНА сегмент са особом А или особом Б, деле га само са једном од њих, не и са другом. Прецизније, све осим achillea millefolium :). Она такође дели неке од ДНА сегмената и са А и са Б које делим и ја.

Ојлере,  :) :) :)

Још нисам стигла да се позабавим тиме, али ме је ова вест веома обрадовала :)

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #51 послато: Мај 06, 2020, 02:54:41 поподне »
У оквиру DNA painter постоји и алатка AutoCluster - automated clustering of shared matches за развраставња рођака за којe нистe сигурни да ли су по очинској или мајчинској линији (изглeда да јe и ту потрeбна нeка рeгистрација ???).

https://geneticaffairs.com/

AutoCluster organizes your matches into shared match clusters that likely represent branches of your family. The AutoCluster analysis is available for profiles from 23andme, FamilyTreeDNA and AncestryDNA and the results are presented in an interactive visualization.

https://dna-explained.com/2018/12/04/autoclustering-by-genetic-affairs/

https://geneticaffairs.com/features-autocluster.html


« Последња измена: Мај 06, 2020, 02:56:47 поподне на Црвeњском путу »

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
« Последња измена: Мај 06, 2020, 03:26:17 поподне на Црвeњском путу »

Ван мреже Ojler

  • Члан Управног одбора
  • Бели орао
  • *
  • Поруке: 5267
  • Y-DNK: I2-Y3120 Z17855>PH3414 Мириловићи
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #53 послато: Мај 06, 2020, 03:44:41 поподне »
Ојлере,  :) :) :)

Још нисам стигла да се позабавим тиме, али ме је ова вест веома обрадовала :)

Achillea, и ја сам се веома пријатно изненадио :)). Једном ћемо морати претрести родослов и презимена у њима :)
Kамене рабъ и госодинъ

Ван мреже achillea millefolium

  • Одбор за дигитализацију
  • Гост
  • ******
  • Поруке: 19
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #54 послато: Мај 06, 2020, 10:12:53 поподне »
Achillea, и ја сам се веома пријатно изненадио :)). Једном ћемо морати претрести родослов и презимена у њима :)

Важи, првом приликом  :). Једва чекам!
Ако буде могуће, волела бих да буде уживо ("уз поштовање свих мера" ;))
Мада ја вероватно нећу бити од неке нарочите вајде, али ко зна... :)

Ван мреже dons

  • Члан Друштва
  • Шегрт
  • *****
  • Поруке: 77
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #55 послато: Мај 06, 2020, 10:38:49 поподне »
Pozdrav, Ukoliko je shared DNA 1.5%
Shared DNA  1.5% (102.8‎ cM)
Shared segments 4
Largest segment 53.8‎ cM


Koji je to stepen srodstva?


MyHeritage kaze da je to 1st cousin twice removed - 3rd cousin once removed

Da li se zna koliko ukupno cM ima svaki gen ,jer su na slici prikazani neki geni veci a neki manji

Ван мреже Uzi

  • Уредник СДНКП
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1644
  • N2-P189.2>FT182494>FGC28435
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #56 послато: Мај 07, 2020, 12:47:49 пре подне »
Pozdrav, Ukoliko je shared DNA 1.5%
Shared DNA  1.5% (102.8‎ cM)
Shared segments 4
Largest segment 53.8‎ cM


Koji je to stepen srodstva?


MyHeritage kaze da je to 1st cousin twice removed - 3rd cousin once removed

Da li se zna koliko ukupno cM ima svaki gen ,jer su na slici prikazani neki geni veci a neki manji


Ово је врло вероватно негде око 4 колена сродности, чукундеда или чукунбаба.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #57 послато: Мај 08, 2020, 11:06:12 пре подне »
http://www.searchforancestors.com/utility/cousincalculator.html

First Cousin
Your first cousin is a child of your aunt or uncle. You share one set of grandparents with your first cousin, but you do not have the same parents.

Second Cousin
Your second cousin is the grandchild of your great-aunt or great-uncle. You share one set of great-grandparents with your second cousin, but you do not have the same grandparents.

Third, Fourth, and Fifth Cousins
Your third cousin is the great-grandchild of your great-great-aunt or great-great-uncle. You share a set of great-great-grandparents with your third cousin, but do not have the same great-grandparents. Fourth cousins have one set of great-great-great-grandparents, but not the same great-great-grandparents. And so on.

Ван мреже Romanijski

  • Познавалац
  • ******
  • Поруке: 783
  • Ја ратујем сам...
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #58 послато: Децембар 02, 2020, 10:58:34 пре подне »

 Користим прилику да се захвалим Драјверу на овим корисним прилозима за ФФ тест на YouTube...

 Такође да дам једну напомену оним кои тек желе да одраде овај тест.
Умјесто да тестирате себе  направите два теста један оца други мајке. То вам је слична ситуација као са Y тестом гдје је боље тестирати оца или ђеда да избјегнете једну или двије новеле.
Тако и на ФФ тесту ако добијете резултат кои указује на блиско сродство нећете знати са које стране та веза долази. Долазите у искушењ да накнадно радите тест и оца и мајке. Наизглед скупља варијанта, али сматрам да би се већини ова варијанта показала јефтинијом и сигурнијом.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #59 послато: Децембар 22, 2020, 02:11:34 поподне »
Не знам да ли је права тема, па се унапред извињавам.
Ових дана сам правио карту мојих аутосомалних поклапања са FTDNA, 23 and me, Ancestry и myheritage, услов је био да је најкрупнији сегмент преко 10 cm, да  у стаблу имају места порекла предака и да та места нису међусобно превише удаљена.
На крају није испало лоше, има доста малих група:

Mapa matches by Nikola Pavlovic, on Flickr

Интересантна је опет ова област око Монтане где се налази и мој најближи Y сродник. А гужве има и на Пелопонезу и у Јадранском приморју.


« Последња измена: Децембар 22, 2020, 02:14:51 поподне НикПав »

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #60 послато: Децембар 22, 2020, 02:42:32 поподне »
Не знам да ли је права тема, па се унапред извињавам.
Ових дана сам правио карту мојих аутосомалних поклапања са FTDNA, 23 and me, Ancestry и myheritage, услов је био да је најкрупнији сегмент преко 10 cm, да  у стаблу имају места порекла предака и да та места нису међусобно превише удаљена.
На крају није испало лоше, има доста малих група:

Mapa matches by Nikola Pavlovic, on Flickr

Интересантна је опет ова област око Монтане где се налази и мој најближи Y сродник. А гужве има и на Пелопонезу и у Јадранском приморју.

Занимљива карта. Како си одређивао мјеста поријекла поклапања?

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #61 послато: Децембар 22, 2020, 03:01:01 поподне »
Занимљива карта. Како си одређивао мјеста поријекла поклапања?
Ако сам добро разумео питање, у обзир сам само узимао људе са доступним стаблима, ишао им до најдаљег претка са наведеним местом рођења и убацивао на мапу, али само у случају да су им сви преци барем из исте административне или географске  области. Има доста случајева где су сви из пар села једно до другог.
Даље од тога нисам могао, мада знам одакле су Арбереши стигли на југ Италије и Сицилију, а баш сам скоро читао на форуму нешто и о Жумберчанима.
« Последња измена: Децембар 22, 2020, 03:07:32 поподне НикПав »

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #62 послато: Децембар 22, 2020, 03:12:41 поподне »
Не знам да ли је права тема, па се унапред извињавам.
Ових дана сам правио карту мојих аутосомалних поклапања са FTDNA, 23 and me, Ancestry и myheritage, услов је био да је најкрупнији сегмент преко 10 cm, да  у стаблу имају места порекла предака и да та места нису међусобно превише удаљена.
На крају није испало лоше, има доста малих група:

Mapa matches by Nikola Pavlovic, on Flickr

Интересантна је опет ова област око Монтане где се налази и мој најближи Y сродник. А гужве има и на Пелопонезу и у Јадранском приморју.

Почела сам нешто слично пре неколико недеља. Иде споро. Али је занимљиво

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #63 послато: Децембар 22, 2020, 06:59:38 поподне »
Ако сам добро разумео питање, у обзир сам само узимао људе са доступним стаблима, ишао им до најдаљег претка са наведеним местом рођења и убацивао на мапу, али само у случају да су им сви преци барем из исте административне или географске  области. Има доста случајева где су сви из пар села једно до другог.
Даље од тога нисам могао, мада знам одакле су Арбереши стигли на југ Италије и Сицилију, а баш сам скоро читао на форуму нешто и о Жумберчанима.

Да, на то сам мислио. Свака част, велик си труд уложио, а види се и резултат.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #64 послато: Децембар 23, 2020, 09:49:44 пре подне »
Да, на то сам мислио. Свака част, велик си труд уложио, а види се и резултат.

Хвала Драјвер! Мапа још није потпуно готова, мада сам већи део поклапања испрегледао.
Кад дођем у Србију остаје да узоркујем бабе и деде и пробам да разлучим шта ми од кога долази, а затим уз помоћ литературе и испратим неке миграције.

Ван мреже CosicZ

  • Редакција СДНКП
  • Истраживач
  • ******
  • Поруке: 898
  • Ђурђевдан Y:I1>P109>FGC22045 Панчево
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #65 послато: Децембар 24, 2020, 01:58:57 пре подне »
Не знам да ли је права тема, па се унапред извињавам.
Ових дана сам правио карту мојих аутосомалних поклапања са FTDNA, 23 and me, Ancestry и myheritage, услов је био да је најкрупнији сегмент преко 10 cm, да  у стаблу имају места порекла предака и да та места нису међусобно превише удаљена.
На крају није испало лоше, има доста малих група:

Mapa matches by Nikola Pavlovic, on Flickr

Интересантна је опет ова област око Монтане где се налази и мој најближи Y сродник. А гужве има и на Пелопонезу и у Јадранском приморју.
Пада у очи "рупа" у Босни, Славонији и Бачкој. Да ли нема тестираних у тим областима или их има, али не задовољавају постављене услове?

На југу Италије било је и Словена насељених у покрајини Молизе и околини.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #66 послато: Децембар 24, 2020, 04:06:19 пре подне »
Пада у очи "рупа" у Босни, Славонији и Бачкој. Да ли нема тестираних у тим областима или их има, али не задовољавају постављене услове?

На југу Италије било је и Словена насељених у покрајини Молизе и околини.

И мени је та рупа упала у очи, а сад или нисмо поклапања па ми се слабо појављују или се слабо тестирају. Нажалост већина тестираних су исељеници, а без стабла не могу да знам одакле су тачно.

Знам за Молишке Словене, али добар део ових поклапања из Италије је баш из Арберешких места (Сан Константино Албанезе, Мецојусо, Пјана Дељи Албанези итд).

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #67 послато: Децембар 24, 2020, 07:30:33 пре подне »
И мени је та рупа упала у очи, а сад или нисмо поклапања па ми се слабо појављују или се слабо тестирају. Нажалост већина тестираних су исељеници, а без стабла не могу да знам одакле су тачно.

Знам за Молишке Словене, али добар део ових поклапања из Италије је баш из Арберешких места (Сан Константино Албанезе, Мецојусо, Пјана Дељи Албанези итд).

Стигла ми је твоја порука. И ја одговорила јуче. Али теби та моја порука изгледа није стигла (где објашњавам како сам ја правила своју мапу). Стигла ми је ова нова твоја порука, и ја опет одговорила. Али из истих разлога као и ти не могу да будем сигурна да ли си примио поруку.

Иако ти је моја прва порука стигла.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #68 послато: Децембар 24, 2020, 11:15:41 поподне »
Стигла ми је твоја порука. И ја одговорила јуче. Али теби та моја порука изгледа није стигла (где објашњавам како сам ја правила своју мапу). Стигла ми је ова нова твоја порука, и ја опет одговорила. Али из истих разлога као и ти не могу да будем сигурна да ли си примио поруку.

Иако ти је моја прва порука стигла.

Мени су стигле две поруке, прва и она са имејлом. Нисам добио поруку где сте ми објашњавали како сте правили карту.

Ево још једне карте, овога пута у форми heatmap. Пошто сам у стаблима понекад наилазио на иста места, а то није било згодно приказати на прошлој карти, ова карта представља густину тачака, узео сам радијус од 10 км и 5 тачака.

matches by Nikola Pavlovic, on Flickr


Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #69 послато: Децембар 25, 2020, 07:25:52 пре подне »
Мени су стигле две поруке, прва и она са имејлом. Нисам добио поруку где сте ми објашњавали како сте правили карту.

Ево још једне карте, овога пута у форми heatmap. Пошто сам у стаблима понекад наилазио на иста места, а то није било згодно приказати на прошлој карти, ова карта представља густину тачака, узео сам радијус од 10 км и 5 тачака.

matches by Nikola Pavlovic, on Flickr

Па значи није стигла главна порука. Објаснићу овде. Радим за оца.

Нашла сам неку карту која је мени била за сада одговарајућа: на њој је СФРЈ, суседне земље (Балкан) и Апенинско полуоострво. Уцртана су  сва битна места.

Мана јој је што нема остале земље Европе.

Карту сам сачувала на компјутеру међу сликама. Ту имам опцију увећања када трагам за неким местом и када га нађем (претходно га нађем на google) користим опцију "писање, цртање", изаберем боју, дебљину ,"оловке" и ставим тачку одређене боје код тог места које сам лоцирала као битно) (некад је у питању село у том округу, а место је средиште округа).

Ово су моји почеци. А жеље су ми веће од могућности (техничког знања).

Имам само ФТДНА као извор.
Ако је неко навео само своје презиме трагам по интернету за пореклом (ако га још има на my heritage свашта се ту нађе) и тако сам нашла порекло презимена Бакош из Мађарске (концентрисани су у једној области на граници Мађарске и Словачке) и тај Бакош вуче рођаке из Словачке.

Или Гламузина - али нашла сам их на my heritage. Неко место близу Плоча.

Имам разне идеје. Ако узмемо нпр. Бугарску - идентификовала сам неких 5 ближих рођака које ФТДНА третира као рођаке 2-3 реда (све је то старије од 200 година) и означила сам их јарко наранџастом бојом али ја бих волела да на карти прикажем и повезујуће људе, а они су ми нпр. у Хрватској за коју сам одредила жуту боју и онда ми ти наранџасти "штрче" међу жутима (али су мом оцу заправо даљи рођаци од тих жутих и оних наранџастих Бугара). Али види се ВЕЗА.

Е сад има група "рођака" Бугара који су му даља прича, IV и V рођаци (значи то је старије од 300 година) и који бацају на Лику и невезани су од прве групе Бугара. Јавља се недоумица како их обележити. Па једино ми остаје да их обележим истом бојом али тамнијом нијансом.

Али кад погледам карту јасно знам да су јарко наранџасти блискији (јасно се назире Шоплук), а тамније наранџасти даљи рођаци и сви су у Бугарској.

Сви рођаци Грци, Руси, Украјинци, Пољаци.су му даљи рођаци.

« Последња измена: Децембар 25, 2020, 07:30:58 пре подне на Црвeњском путу »

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #70 послато: Децембар 26, 2020, 08:57:22 поподне »
Па значи није стигла главна порука. Објаснићу овде. Радим за оца.

Нашла сам неку карту која је мени била за сада одговарајућа: на њој је СФРЈ, суседне земље (Балкан) и Апенинско полуоострво. Уцртана су  сва битна места.

Мана јој је што нема остале земље Европе.

Карту сам сачувала на компјутеру међу сликама. Ту имам опцију увећања када трагам за неким местом и када га нађем (претходно га нађем на google) користим опцију "писање, цртање", изаберем боју, дебљину ,"оловке" и ставим тачку одређене боје код тог места које сам лоцирала као битно) (некад је у питању село у том округу, а место је средиште округа).

Ово су моји почеци. А жеље су ми веће од могућности (техничког знања).

Имам само ФТДНА као извор.
Ако је неко навео само своје презиме трагам по интернету за пореклом (ако га још има на my heritage свашта се ту нађе) и тако сам нашла порекло презимена Бакош из Мађарске (концентрисани су у једној области на граници Мађарске и Словачке) и тај Бакош вуче рођаке из Словачке.

Или Гламузина - али нашла сам их на my heritage. Неко место близу Плоча.

Имам разне идеје. Ако узмемо нпр. Бугарску - идентификовала сам неких 5 ближих рођака које ФТДНА третира као рођаке 2-3 реда (све је то старије од 200 година) и означила сам их јарко наранџастом бојом али ја бих волела да на карти прикажем и повезујуће људе, а они су ми нпр. у Хрватској за коју сам одредила жуту боју и онда ми ти наранџасти "штрче" међу жутима (али су мом оцу заправо даљи рођаци од тих жутих и оних наранџастих Бугара). Али види се ВЕЗА.

Е сад има група "рођака" Бугара који су му даља прича, IV и V рођаци (значи то је старије од 300 година) и који бацају на Лику и невезани су од прве групе Бугара. Јавља се недоумица како их обележити. Па једино ми остаје да их обележим истом бојом али тамнијом нијансом.

Али кад погледам карту јасно знам да су јарко наранџасти блискији (јасно се назире Шоплук), а тамније наранџасти даљи рођаци и сви су у Бугарској.

Сви рођаци Грци, Руси, Украјинци, Пољаци.су му даљи рођаци.

Препоручио бих Вам My Google maps, ту уз сваку тачку можете да додате и неке напомене. Изузетно је лако и једноставно, не треба Вам неко техничко предзнање. 
Одлучио сам се прво да убацим све људе на мапу, па онда истражим њихова могућа порекла, мада као што сам већ написао, о неким групама сам читао раније. Највише ме је заинтересовао грозд око Монтане, због мог BigY пајтоса, нашао сам на интернету извод из књиге о Чипровском устанку 1688. (Петър Чолов, Чипровското въстание 1688 г.) и чини ми се да би се и он и још нека аутосомална поклапања могла довести у везу са овим догађајем. Кад на то додам и Банатске Бугаре у поклапањима има још више логике.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #71 послато: Децембар 26, 2020, 09:22:59 поподне »
Препоручио бих Вам My Google maps, ту уз сваку тачку можете да додате и неке напомене. Изузетно је лако и једноставно, не треба Вам неко техничко предзнање. 
Одлучио сам се прво да убацим све људе на мапу, па онда истражим њихова могућа порекла, мада као што сам већ написао, о неким групама сам читао раније. Највише ме је заинтересовао грозд око Монтане, због мог BigY пајтоса, нашао сам на интернету извод из књиге о Чипровском устанку 1688. (Петър Чолов, Чипровското въстание 1688 г.) и чини ми се да би се и он и још нека аутосомална поклапања могла довести у везу са овим догађајем. Кад на то додам и Банатске Бугаре у поклапањима има још више логике.
Пробала ....али како се црта по тој мапи?
Да ли мапу скинем, па је пребацим у фотографије и цртам по њој или ?

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #72 послато: Децембар 26, 2020, 09:35:25 поподне »
Пробала ....али како се црта по тој мапи?
Да ли мапу скинем, па је пребацим у фотографије и цртам по њој или ?

Све радите онлајн. У претраживач укуцате место које тражите и програм аутоматски додаје маркер на то место на карти.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #73 послато: Децембар 26, 2020, 09:46:58 поподне »
Све радите онлајн. У претраживач укуцате место које тражите и програм аутоматски додаје маркер на то место на карти.

Хм
Пробаћу.
И аутоматски чува?
Хвала пуно.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #74 послато: Децембар 26, 2020, 09:58:00 поподне »
Хм
Пробаћу.
И аутоматски чува?
Хвала пуно.

Послао сам Вам мало упутство у ПП.

Ван мреже marigold

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 380
  • mtDNA: H1-f2d1*
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #75 послато: Децембар 26, 2020, 10:32:14 поподне »
Послао сам Вам мало упутство у ПП.

Ако није проблем, поставите то упутство на форум.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #76 послато: Децембар 27, 2020, 02:46:05 пре подне »
Ако није проблем, поставите то упутство на форум.

Чим устанем (трчим по чикашком времену).

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #77 послато: Децембар 27, 2020, 07:24:15 пре подне »
Послао сам Вам мало упутство у ПП.

Ништа ми се не отвара у поруци.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #78 послато: Децембар 27, 2020, 08:15:59 пре подне »
Ако није проблем, поставите то упутство на форум.

Покушаћу ја (нешто се назире), а Никола нек исправи.

1.откуца се  google maps
2. кликне се у то
3.отвори вам се мапа
4.са леве стране појави се прозор на коме пише кућа/посао - подесите локацију (ту ништа не дирати)
5. Изнад тога има прозорчић на коме су са леве стране "три болдиране хоризонталне црте", а са десне стране "лупа"
6.кликнете у те три црте
7.отвори се садржај са више опција

8.изаберете опцију "ваша места" (код мене је све преведено на српски)
9.отвори вам се поље кућа/посао (ту ништа не дирати)
10.изнад тога имате 4 опције - кликнете у ону која је означена као "мапе"

11.ту вам се отвори: прикажи све моје мапе, а доле на дну "направи мапу" (плаве боје) - кликнете у то

12.отворе се са леве стране "веће прозорче" које носи назив "ненасловљене мапе" (ту ћете касније унети назив своје мапе под којом ћете је запамтити и скинути) + ""мање прозорче" на средини са 7 квадратића (1.стрелица лево, 2.стрелица десно, 3.шака, 4."болдирани знак који личи на неку обрнуту сузу" (помоћу њега обележавате поклапања пошто идентификујете на карти место поклапања).

13. Увеличате мапу кад год хоћете да нађете неко мање место
14. На крају имате ону опцију да све то и сачувате (оно веће прозорче)







« Последња измена: Децембар 27, 2020, 08:25:40 пре подне на Црвeњском путу »

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #79 послато: Децембар 27, 2020, 08:23:59 пре подне »
Никола хвала вам што сте били упорни. Ја сам мислила да је то све као да треба да цртам по свемиру. :)

Питање: како мењам боје обележивача?
Код мене је само плава боја међу опцијама.

На мрежи Драган Обреновић

  • Члан Управног одбора
  • Истраживач
  • *
  • Поруке: 955
  • R1b-U152>FTA27217
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #80 послато: Децембар 27, 2020, 08:48:13 пре подне »
Само да додам да постоји и пречица да се дође до својих ”custom” мапа, а то је да се укуца адреса:

mymaps.google.com

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #81 послато: Децембар 27, 2020, 08:49:58 пре подне »
Никола хвала вам што сте били упорни. Ја сам мислила да је то све као да треба да цртам по свемиру. :)

Питање: како мењам боје обележивача?
Код мене је само плава боја међу опцијама.

Смислила сам како да мењам боје.
Кад завршим мапу сачуваћу је. Онда ћу је пребацити у опцију "слике" и ту имам онај програмчић "цртање, писање" са могућношћу коришћења разних боја.

Мени је то важно када хоћу да правим разлику између ближих и даљих поклапања у оквиру једне исте области или земље (нпр. Бугарска у којој сва поклапања означим нпр.зеленом бојом/ближа јарко зеленом/даља светлије зеленом) + повезујући сродници од којих су неки у сасвим другом земљама (нпр.Хрватска за коју сам нпр.резервисала жуту боју) и да их вежем (обојим) за боју већинских поклапања (грозда).
Тако кад год погледам карту - врло лако идентификујем повезујуће људе (па и могуће правце миграција).

Онај што се зелени међу жутима - значи тај је веза са Бугарима.
« Последња измена: Децембар 27, 2020, 08:55:28 пре подне на Црвeњском путу »

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #82 послато: Децембар 27, 2020, 08:52:28 пре подне »
Само да додам да постоји и пречица да се дође до својих ”custom” мапа, а то је да се укуца адреса:

mymaps.google.com
Хвала Драгане!
 :)

Мени увек треба детаљно упутство.
Пошла сам од себе - и тако написала Мариголд (и другима које би то можда занимало).

Мени је Сергио увек детаљно објашњавао корак по корак.
« Последња измена: Децембар 27, 2020, 08:54:40 пре подне на Црвeњском путу »

На мрежи Драган Обреновић

  • Члан Управног одбора
  • Истраживач
  • *
  • Поруке: 955
  • R1b-U152>FTA27217
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #83 послато: Децембар 27, 2020, 09:02:39 пре подне »
Смислила сам како да мењам боје.
Кад завршим мапу сачуваћу је. Онда ћу је пребацити у опцију "слике" и ту имам онај програмчић "цртање, писање" са могућношћу коришћења разних боја.

Нема потребе, све то може да се уради на самој Google мапи. Након што додате локацију, кликните на пин (чиоду), а онда на "кантицу". Ту можете да промените и боју и облик ознаке локације:




Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #84 послато: Децембар 27, 2020, 09:31:17 пре подне »
Нема потребе, све то може да се уради на самој Google мапи. Након што додате локацију, кликните на пин (чиоду), а онда на "кантицу". Ту можете да промените и боју и облик ознаке локације:



Сјајно!
Ово је оно што мени треба.
Хвала најлепше!
 :)

Ван мреже marigold

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 380
  • mtDNA: H1-f2d1*
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #85 послато: Децембар 27, 2020, 11:16:50 пре подне »
Покушаћу ја (нешто се назире), а Никола нек исправи.

1.откуца се  google maps
2. кликне се у то
3.отвори вам се мапа
4.са леве стране појави се прозор на коме пише кућа/посао - подесите локацију (ту ништа не дирати)
5. Изнад тога има прозорчић на коме су са леве стране "три болдиране хоризонталне црте", а са десне стране "лупа"
6.кликнете у те три црте
7.отвори се садржај са више опција

8.изаберете опцију "ваша места" (код мене је све преведено на српски)
9.отвори вам се поље кућа/посао (ту ништа не дирати)
10.изнад тога имате 4 опције - кликнете у ону која је означена као "мапе"

11.ту вам се отвори: прикажи све моје мапе, а доле на дну "направи мапу" (плаве боје) - кликнете у то

12.отворе се са леве стране "веће прозорче" које носи назив "ненасловљене мапе" (ту ћете касније унети назив своје мапе под којом ћете је запамтити и скинути) + ""мање прозорче" на средини са 7 квадратића (1.стрелица лево, 2.стрелица десно, 3.шака, 4."болдирани знак који личи на неку обрнуту сузу" (помоћу њега обележавате поклапања пошто идентификујете на карти место поклапања).

13. Увеличате мапу кад год хоћете да нађете неко мање место
14. На крају имате ону опцију да све то и сачувате (оно веће прозорче)

Хвала, успела сам  :)

Ван мреже wiola

  • Шегрт
  • ***
  • Поруке: 75
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #86 послато: Децембар 27, 2020, 12:38:26 поподне »
Препоручио бих Вам My Google maps, ту уз сваку тачку можете да додате и неке напомене. Изузетно је лако и једноставно, не треба Вам неко техничко предзнање. 

Ја сам исто одушевље са "Google maps", за моје Зељковиће то изгледа овако https://www.google.com/maps/d/edit?mid=1RQeu6ZheDpwfehjbEv_d0PzxWEAnezuJ&usp=sharing, додуше ја сам уносио само помен презимена, и обележавање у бојама ми је било по старости помена, и по националној припадности.

Оно што сам хтео да питам је да ли имате искуства у "извожењу" и " увожењу" података. Због лакшег чувања и обраде.
Видео сам да се може добити приказ података у табели, али њу саму, могу само простим копирањем да копирам у "ексел", нисам успео да је извезем.
Могуће је извожење у формату *.kml i *.kmz , али за сад не видим неку употребљивост, па чак и када се конвертују нпр преко https://mygeodata.cloud/converter/ .
Хвала .

Ван мреже wiola

  • Шегрт
  • ***
  • Поруке: 75
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #87 послато: Децембар 27, 2020, 12:54:05 поподне »
па чак и када се конвертују нпр преко https://mygeodata.cloud/converter/ .
Хвала .

Преко овог линка је ипак само 3 бесплатна конверотања месечно, ипак сам успео да *.kml, prevedem u "MS Office Open XML spreadsheet(.xlsx)", уважио ми је и наше карактере, као и ћирилицу.
Успео сам да пронађем и начин увоза података, не пренесе ми се само информација о боји, упутство је на https://webapps.stackexchange.com/questions/12475/how-do-i-plot-a-bunch-of-points-on-google-maps , дакле код креирања нове мапе даје могућност увожења подата, ја сам искористи *.xlsx фајл, и није ми пренео само информације о боји, координате, називе и описе, јесте.

Остаје питање могућности "увоза" података у већ активну мапу.
« Последња измена: Децембар 27, 2020, 01:08:10 поподне wiola »

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #88 послато: Децембар 27, 2020, 02:17:55 поподне »
Хвала, успела сам  :)

Драго ми је.
И ви сте мени помогли пролетос.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #89 послато: Децембар 29, 2020, 05:55:36 пре подне »
Ја сам исто одушевље са "Google maps", за моје Зељковиће то изгледа овако https://www.google.com/maps/d/edit?mid=1RQeu6ZheDpwfehjbEv_d0PzxWEAnezuJ&usp=sharing, додуше ја сам уносио само помен презимена, и обележавање у бојама ми је било по старости помена, и по националној припадности.

Оно што сам хтео да питам је да ли имате искуства у "извожењу" и " увожењу" података. Због лакшег чувања и обраде.
Видео сам да се може добити приказ података у табели, али њу саму, могу само простим копирањем да копирам у "ексел", нисам успео да је извезем.
Могуће је извожење у формату *.kml i *.kmz , али за сад не видим неку употребљивост, па чак и када се конвертују нпр преко https://mygeodata.cloud/converter/ .
Хвала .

Извињавам се на изостанку мог упутства, запио сам поштено у ових пар слободних камионџијских дана.

Што се извоза тиче, веома је користан уколико сте упознати са неким од бесплатних ГИС програма (као рецимо QGis). Користим један ГИС који се плаћа али је врло једноставан, за разлику од ових бесплатних који су ми деловали доста компликовано када сам пробао, тако да ту не могу помоћи. ГИС су згодни за креирање heatmaps и можда теоретских векторских праваца миграција.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #90 послато: Децембар 30, 2020, 10:49:10 поподне »
Ево још једне, мало бесмислене анализе, хаплогрупа мојих поклапања са 23 and me, а урађена је, јер колико сам схватио није могуће видети хаплогрупе на том сајту уколико вам ти људи нису поклапања, а постоји тема о ХГ са тог сајта на форуму. Па, ако неко уочи нешто занимљиво нека каже, радо ћу проверити да ли је реч о нашим људима.

23andme by Nikola Pavlovic, on Flickr

Ван мреже Uzi

  • Уредник СДНКП
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1644
  • N2-P189.2>FT182494>FGC28435
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #91 послато: Децембар 30, 2020, 11:54:30 поподне »
Занимљива анализа.

Ако сам добро схватио E-V13=11% I-S17250=9% R-CTS3402=5% R-P311=3% I-M423=3% R-U152=3% R-M417=2% итд..

     

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #92 послато: Децембар 30, 2020, 11:56:33 поподне »
Занимљива анализа.

Ако сам добро схватио E-V13=11% I-S17250=9% R-CTS3402=5% R-P311=3% I-M423=3% R-U152=3% R-M417=2% итд..

     

Тачно Узи, али сам је превасходно урадио због чињенице да податке са 23 and me могу да виде само поклапања. Можда сам и лоше разумео  :) Моје најближе поклапање је Милтеновић (70 cm дељених), који по претрази није пописан, G-L42, а пошто не одговара, а Милтеновића има доле на југу близу базе мајчиних предака, верујем да је одатле.
« Последња измена: Децембар 31, 2020, 12:03:34 пре подне НикПав »

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #93 послато: Јануар 02, 2021, 07:23:17 пре подне »
После пажљиве ревизије података, Жумберчани ми постају све занимљивији. Целим мојим Жумберачким аутосомалним гроздом доминира само једно презиме: Бадовинац (са преко 10 различитих Бадовинаца по стаблима, са дељеним ДНК сегментима до 20 цм) , са славом Никољдан, по и даље активном сајту Жумберачког викаријата.

badovinac by Nikola Pavlovic, on Flickr

Не знам да ли су се тестирали, али ако нису позивам их (иако ми је Никољдан слава по више линија које су са мушке стране и само са мушке стране).
« Последња измена: Јануар 02, 2021, 07:28:52 пре подне НикПав »

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #94 послато: Јануар 02, 2021, 07:50:18 пре подне »
После пажљиве ревизије података, Жумберчани ми постају све занимљивији. Целим мојим Жумберачким аутосомалним гроздом доминира само једно презиме: Бадовинац (са преко 10 различитих Бадовинаца по стаблима, са дељеним ДНК сегментима до 20 цм) , са славом Никољдан, по и даље активном сајту Жумберачког викаријата.

badovinac by Nikola Pavlovic, on Flickr

Не знам да ли су се тестирали, али ако нису позивам их (иако ми је Никољдан слава по више линија које су са мушке стране и само са мушке стране).

Бадовинцима су поклапање и мом оцу, а нисам знала где да их сврстам.

Постоји село Бадовинци код Шапца. Али не могу за то да се ухватим.




« Последња измена: Јануар 02, 2021, 07:52:36 пре подне на Црвeњском путу »

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #95 послато: Јануар 02, 2021, 07:53:24 пре подне »
Овим  си веома помогао и мени кад је реч о Бадовинцима који су поклапање мом оцу, а нисам знала где да их сврстам.

Постоји село Бадовинци код Шапца. Али не могу за то да се ухватим.

Знам да постоје Бадовинци код Шапца (стара љубав била пореклом оданде), али ови људи су сви из Бадовинаца код Озља (можда да пишемо латиницом па нас разумеју)  ;D Још кад сретнете стару емиграцију, то више није само презиме Бадовинац из Бадовинаца, него и Badovinatz, Badowinatz i Badovinacs  :D

Ван мреже Atlantische

  • Уредник СДНКП
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1938
  • G2a-FT221531
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #96 послато: Јануар 02, 2021, 08:01:03 пре подне »
Жумберачки Бадовинци су тестирани преко 23andMe, припадају хаплогрупи G2a-L42 (извесно подграни Y128028).
''Заведени светским чудима, заборависмо на себе и на своје порекло." - М. Капор

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #97 послато: Јануар 02, 2021, 08:02:44 пре подне »
Жумберачки Бадовинци су тестирани преко 23andMe, припадају хаплогрупи G2a-L42 (извесно подграни Y128028).

Имам G2a-L42  међу веома блиским поклапањима на 23 and me (Милтеновић 70 цм сегмент, други на листи, ћерка трећа), али пошто не одговарају не знам одакле су. Са Павловића стране, дефинитивно није. Али, мени и прабаба и чукунбаба по прабаби  по оцу (Радивојевићи и Симеуновићи славе Никољдан, у литератури нема подата о пореклу).
« Последња измена: Јануар 02, 2021, 08:06:35 пре подне НикПав »

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #98 послато: Јануар 02, 2021, 08:04:06 пре подне »
Знам да постоје Бадовинци код Шапца (стара љубав била пореклом оданде), али ови људи су сви из Бадовинаца код Озља (можда да пишемо латиницом па нас разумеју)  ;D Још кад сретнете стару емиграцију, то више није само презиме Бадовинац из Бадовинаца, него и Badovinatz, Badowinatz i Badovinacs  :D

Ник баш ти хвала. Ја сам се са њима вртела у круг. И ништа. Сад ћу мало да проверим.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #99 послато: Јануар 02, 2021, 08:05:36 пре подне »
Жумберачки Бадовинци су тестирани преко 23andMe, припадају хаплогрупи G2a-L42 (извесно подграни Y128028).

Хм. Ви и ја смо иначе род преко мог оца. Сродство је старије од 200 година

Ван мреже Atlantische

  • Уредник СДНКП
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1938
  • G2a-FT221531
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #100 послато: Јануар 02, 2021, 08:07:04 пре подне »
Имам G2a-L42  међу веома блиским поклапањима на 23 and me (Милтеновић 70 цм сегмент, други на листи, ћерка трећа), али пошто не одговарају не знам одакле су. Са Павловића стране, дефинитивно није.
Милтеновићи су сигурно јужњаци. А ове гране (велика већина отпада на L42>Y128028) има у свим српским крајевима, разуме се са обласним разликама у процентима.
''Заведени светским чудима, заборависмо на себе и на своје порекло." - М. Капор

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #101 послато: Јануар 02, 2021, 08:10:13 пре подне »
Милтеновићи су сигурно јужњаци. А ове гране (велика већина отпада на L42>Y128028) има у свим српским крајевима, разуме се са обласним разликама у процентима.

Тако се и мени чини, има их доле јако близу нама. Али, пошто сам мало изменио тј додао у прошлом посту, поновићу овде:  мени и прабаба и чукунбаба по прабаби  по оцу (Радивојевићи и Симеуновићи из Крушевице) славе Никољдан, (у литератури нема подата о пореклу, али зато су им први запамћени преци записани под невероватним именима, као Ерос(им)  ;D). Петар Ж. Петровић им наводи порекло (Бајина Башта), али у нашој монографији мислим да се не наводи.
Не знам одакле бих вукао толико Бадовинаца. Имам и пар Маћешића G-M201.
« Последња измена: Јануар 02, 2021, 08:20:39 пре подне НикПав »

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #102 послато: Јануар 02, 2021, 08:28:48 пре подне »
Те Маћешиће имамо и ми.

Али сад од два профила не могу да уђем ни у један.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #103 послато: Јануар 02, 2021, 08:40:45 пре подне »
Те Маћешиће имамо и ми.

Али сад од два профила не могу да уђем ни у један.

Да немате можда и мене, зовем се Никола Павловић?

Иначе, не знам шта бих вам рекао о аутосомалном лавиринту. Ја добих три фамилије из села са бабине стране, са којима не бисмо требали да смо род, али дељени сегменти су јако мали и кад се упореди литература, све те фамилије су дошле из Суводола са Карађорђем, убих се објашњавајући мом породичном родословцу, да ми није Кљосов рекао да смо род него егзактни тест и да иако, наравно увек постоји шанса за сеоско шврљање, пре ће бити да сродство вучемо из старог села и да постоји разлог зашто, па скоро ни дан данас се у селу мештани не узимају међусобно.  :D
Мало мука аутосомалног истраживања, ако је офтопик бришите.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #104 послато: Јануар 02, 2021, 09:49:04 пре подне »
Да немате можда и мене, зовем се Никола Павловић?

Иначе, не знам шта бих вам рекао о аутосомалном лавиринту. Ја добих три фамилије из села са бабине стране, са којима не бисмо требали да смо род, али дељени сегменти су јако мали и кад се упореди литература, све те фамилије су дошле из Суводола са Карађорђем, убих се објашњавајући мом породичном родословцу, да ми није Кљосов рекао да смо род него егзактни тест и да иако, наравно увек постоји шанса за сеоско шврљање, пре ће бити да сродство вучемо из старог села и да постоји разлог зашто, па скоро ни дан данас се у селу мештани не узимају међусобно.  :D
Мало мука аутосомалног истраживања, ако је офтопик бришите.

Проверићу за Павловиће. То презиме ми се урезало по основу једне друге приче (праћење Y хромозома) и скоро на једном од два профила појави се неки Павловић.

Али мени се сад мешају у глави и презимена које неко наведе у свом родослову.

Најинтересантније за мене ових дана је нешто што две године нисам уочила међу поклапањима мог оца (списак се стално шири)!

Пратећи неко презиме Тулга које ми је личило на финско, а остављена су имена на родословном стаблу, открих да се ради о једној породици хришћана из Албаније (могуће грчко- цинцарско - српској) исељеника у УСА на почетку 20 века, они ме одведоше до неких Руса и ја не видим другу везу до Срба исељених у Русију после Велике Сеобе преко њихових кћерки.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #105 послато: Јануар 02, 2021, 10:04:58 пре подне »
Проверићу за Павловиће. То презиме ми се урезало по основу једне друге приче (праћење Y хромозома) и скоро на једном од два профила појави се неки Павловић.

Али мени се сад мешају у глави и презимена које неко наведе у свом родослову.

Најинтересантније за мене ових дана је нешто што две године нисам уочила међу поклапањима мог оца (списак се стално шири)!

Пратећи неко презиме Тулга које ми је личило на финско, а остављена су имена на родословном стаблу, открих да се ради о једној породици хришћана из Албаније (могуће грчко- цинцарско - српској) исељеника у УСА на почетку 20 века, они ме одведоше до неких Руса и ја не видим другу везу до Срба исељених у Русију после Велике Сеобе преко њихових кћерки.

TULGA

Vasil Kristov, Korce, Berat, Albania
Vasilika Bessie Soter
Archilles Buti Soter, Corca, Albania
Limathia Olympia Kotsi
Krisula Jorgi (George) Drenova, Korca, Albania

Шта ме наводи да је породица грчко- цинцарско- српског (словенског)  порекла? Презиме Наум код најстаријег од горе поменутих (Васил Кристов).

Имена су врло лепа и мени занимљива.

Све се више питам ко су заиста били Цинцари. Да ли су се неки издавали за Цинцаре (а у ствари били Грци) у средини где се могуће није позитивно гледало на Грке.

Неки облици мимикрије.


Ван мреже НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #106 послато: Јануар 02, 2021, 10:34:56 пре подне »
TULGA

Vasil Kristov, Korce, Berat, Albania
Vasilika Bessie Soter
Archilles Buti Soter, Corca, Albania
Limathia Olympia Kotsi
Krisula Jorgi (George) Drenova, Korca, Albania

Шта ме наводи да је породица грчко- цинцарско- српског (словенског)  порекла? Презиме Наум код најстаријег од горе поменутих (Васил Кристов).

Имена су врло лепа и мени занимљива.

Све се више питам ко су заиста били Цинцари. Да ли су се неки издавали за Цинцаре (а у ствари били Грци) у средини где се могуће није позитивно гледало на Грке.

Неки облици мимикрије.

Село Дреново, које се овде помиње, је све до 60-их година прошлог века имало словенојезичну већину, а након тога настаје асимилација и исељавање, тако да је последњи говорник локалног словенског дијалекта умро негде током 2000-их. Цинцари су се у село изгледа доселили тек у другој половини 20. века, тако да ће пре бити да су ово поклапања те словенске оазе у околини Корче.

https://en.wikipedia.org/wiki/Drenov%C3%AB

Иначе, мимикрија никад није ишла у смеру од Грка ка Цинцарима, већ супротно, тј. Цинцари су били изузетно подложни асимилацији међу Грке. Тај тренд стапања са грчким језиком и културом је и даље присутан код Цинцара који су остали на Пинду.
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #107 послато: Јануар 02, 2021, 11:46:35 пре подне »
Село Дреново, које се овде помиње, је све до 60-их година прошлог века имало словенојезичну већину, а након тога настаје асимилација и исељавање, тако да је последњи говорник локалног словенског дијалекта умро негде током 2000-их. Цинцари су се у село изгледа доселили тек у другој половини 20. века, тако да ће пре бити да су ово поклапања те словенске оазе у околини Корче.

https://en.wikipedia.org/wiki/Drenov%C3%AB

Иначе, мимикрија никад није ишла у смеру од Грка ка Цинцарима, већ супротно, тј. Цинцари су били изузетно подложни асимилацији међу Грке. Тај тренд стапања са грчким језиком и културом је и даље присутан код Цинцара који су остали на Пинду.

Нешто нисам сигурна.

Цинцари у Албанији су као неке оазе или клинови између грчког и арбанашког дела Епира. Остаци романизованих становника Балканa. Двојезични сигурно. Словенски живаљ и словенски језик им није био непознаница.

По доласку у Србију многи од њих (можда због недостатака својих цркава) говоре грчким језиком и вероватно иду у цркве где је служба вршена на грчком језику.

Ван мреже НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #108 послато: Јануар 02, 2021, 01:08:58 поподне »
Нешто нисам сигурна.

Цинцари у Албанији су као неке оазе или клинови између грчког и арбанашког дела Епира. Остаци романизованих становника Балканa. Двојезични сигурно. Словенски живаљ и словенски језик им није био непознаница.

По доласку у Србију многи од њих (можда због недостатака својих цркава) говоре грчким језиком и вероватно иду у цркве где је служба вршена на грчком језику.

У шта нисте сигурни, у словенство становника Дренова код Корче (средњовековне Горице) или у смер асимилације између Грка и Цинцара?  :) Све су то лако проверљиве чињенице, нема ту места некаквој мистификацији.
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #109 послато: Јануар 02, 2021, 01:33:13 поподне »
У шта нисте сигурни, у словенство становника Дренова код Корче (средњовековне Горице) или у смер асимилације између Грка и Цинцара?  :) Све су то лако проверљиве чињенице, нема ту места некаквој мистификацији.

Цинцари - Грци.
Мислим да је ту било некаквих преливања од једних до других нарочито онда када би се неко нашао усамљен у већинском окружењу.

Зато кад наиђем на нека поклапања често нисам сигурна ко су ти људи били заиста у прошлости.

 

Ван мреже НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #110 послато: Јануар 02, 2021, 02:49:19 поподне »
Цинцари - Грци.
Мислим да је ту било некаквих преливања од једних до других нарочито онда када би се неко нашао усамљен у већинском окружењу.

Зато кад наиђем на нека поклапања често нисам сигурна ко су ти људи били заиста у прошлости.

Тренд код Цинцара је увек био да опонашају грчку културу, јер су њу сматрали супериорном. То се види и по томе што је њихов највећи урбани центар, Москопоље, био један од расадника грчких штампаних књига и културе уопште, као и по великом броју позајмљеница из грчког у цинцарски језик. Управо због тога су често људи, који са њима нису били ближе упознати, за њих мислили да су Грци. Такође су, за разлику од Словена, они били врло привржени Цариградској патријаршији у доба турске владавине, али и касније.
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #111 послато: Јануар 02, 2021, 08:05:50 поподне »

Зато кад наиђем на нека поклапања често нисам сигурна ко су ти људи били заиста у прошлости.

Без неких историјских извора или можда презимена, ово је тешко рећи за гомилу поклапања  :D

Кума ми је била Цинцарка из Метсова, мислим да осим чињенице да је Цинцарка, није знала чак ни језик.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #112 послато: Јануар 02, 2021, 08:57:03 поподне »
Без неких историјских извора или можда презимена, ово је тешко рећи за гомилу поклапања  :D

Кума ми је била Цинцарка из Метсова, мислим да осим чињенице да је Цинцарка, није знала чак ни језик.
У праву си.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #113 послато: Јануар 02, 2021, 09:16:03 поподне »
TULGA

Vasil Kristov, Korce, Berat, Albania
Vasilika Bessie Soter
Archilles Buti Soter, Corca, Albania
Limathia Olympia Kotsi
Krisula Jorgi (George) Drenova, Korca, Albania

Шта ме наводи да је породица грчко- цинцарско- српског (словенског)  порекла? Презиме Наум код најстаријег од горе поменутих (Васил Кристов).

Имена су врло лепа и мени занимљива.

Све се више питам ко су заиста били Цинцари. Да ли су се неки издавали за Цинцаре (а у ствари били Грци) у средини где се могуће није позитивно гледало на Грке.

Неки облици мимикрије.

Кристо Наум из Корче.

Он се наводи у родослову.

https://www.ancestry.com/genealogy/records/kristo-naum-24-d090jc

Видим да се неки потомак распитивао 2012 за презиме Наум.

https://www.genealogy.com/forum/regional/countries/topics/albania/874/

Али чини ми се да погрешно наводи места рођења предака јер ја не налазим та места.

Николас/Коли Петер из Коблара (мада ставља знак питања)
Не знам које му је то место.

Фросина Наум из Трибеске.
Мени ово друго место пре личи на место Требиње у близини Поградеца.

Али са Карађорђем је убијен његов секретар Наум Крнар (од њега Наумовићи) родом из Москопоља. Цинцарин који је себе сматрао Грком.

https://sr.m.wikipedia.org/sr-ec/%D0%9D%D0%B0%D1%83%D0%BC%D0%BE%D0%B2%D0%B8%D1%9B%D0%B8

Мој отац је из Шумадије (Рача којој општини припада и Вишевац) и Тулге (Науми) су његово АС поклапање.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #114 послато: Јануар 02, 2021, 09:35:00 поподне »
Ипак има неко место/село  ? Кобларe на граници Ђирокастре и Корче.

https://mapcarta.com/13911282

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #115 послато: Јануар 03, 2021, 09:30:58 поподне »
Кристо Наум из Корче.

Он се наводи у родослову.

https://www.ancestry.com/genealogy/records/kristo-naum-24-d090jc

Видим да се неки потомак распитивао 2012 за презиме Наум.

https://www.genealogy.com/forum/regional/countries/topics/albania/874/

Али чини ми се да погрешно наводи места рођења предака јер ја не налазим та места.

Николас/Коли Петер из Коблара (мада ставља знак питања)
Не знам које му је то место.

Фросина Наум из Трибеске.
Мени ово друго место пре личи на место Требиње у близини Поградеца.

Али са Карађорђем је убијен његов секретар Наум Крнар (од њега Наумовићи) родом из Москопоља. Цинцарин који је себе сматрао Грком.

https://sr.m.wikipedia.org/sr-ec/%D0%9D%D0%B0%D1%83%D0%BC%D0%BE%D0%B2%D0%B8%D1%9B%D0%B8

Мој отац је из Шумадије (Рача којој општини припада и Вишевац) и Тулге (Науми) су његово АС поклапање.

Колики је највећи сегмент на коме се Ваш отац поклапа са Корчанима?

Уколико је сајт forebears поуздан, то презиме се у Албанији највише јавља око Корче, а има га у још неким околним државама, док је презиме Тулга данас веома ретко.


Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #116 послато: Јануар 03, 2021, 09:55:06 поподне »
Колики је највећи сегмент на коме се Ваш отац поклапа са Корчанима?

Уколико је сајт forebears поуздан, то презиме се у Албанији највише јавља око Корче, а има га у још неким околним државама, док је презиме Тулга данас веома ретко.

10цм

Тулга су они изгледа додали пошто су се иселили у УСА .

Обратила сам пажњу на то презиме истражујући једно  поклапање из Литваније (Кричена) и нека из Русије.

А задржала се због тога што је жена навела имена својих предака па у "мору" оних поклапања разбија монотонију.


Од "наших" са Балкана повезница су само Тутић (14цм)  за које сам нашла да су из Доброг Дуба, Тутин, и Даку, Гњилане (13).

То су вероватно неке везе преко женских линија.

Једна линија мог оца за коју знам је досељена од Сјенице у Чумић (мајчина линија његове мајке).
« Последња измена: Јануар 03, 2021, 09:57:20 поподне на Црвeњском путу »

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #117 послато: Јануар 03, 2021, 10:01:24 поподне »
10цм

Тулга су они изгледа додали пошто су се иселили у УСА .

Обратила сам пажњу на то презиме истражујући једно  поклапање из Литваније (Кричена) и нека из Русије.

А задржала се због тога што је жена навела имена својих предака па у "мору" оних поклапања разбија монотонију.


Од "наших" са Балкана повезница су само Тутић (14цм)  за које сам нашла да су из Доброг Дуба, Тутин, и Даку, Гњилане (13).

То су вероватно неке везе преко женских линија.

Иако не наслеђујемо подједнако са свих страна, рекао бих да су у питању веома старе везе.  Већ на нивоу од 20 цм имам неке чудне људе које је немогуће испратити.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #118 послато: Јануар 03, 2021, 10:12:46 поподне »
Иако не наслеђујемо подједнако са свих страна, рекао бих да су у питању веома старе везе.  Већ на нивоу од 20 цм имам неке чудне људе које је немогуће испратити.

Па код мог оца су сва поклапања врло стара.

Најближи су му неки из УСА (од 39-41цм). Њих петоро се тестирали из исте породице. И наводе нека три руска и пољска презимена.

Ни са ким немају повезницу до мог оца.

Жао ми људи. Пребацили су податке и на Гедмеч.

Али мислим да сам нашла одакле им је то једно руско презиме (место Петров, Белгород)

А повезница могу да буду неки исељени Срби у Русију пре 250-300 година.

У сваком случају знам да долазе мом оцу преко његове мајке јер су мени они на X хромозому који сам добила од њега.

Веома ми помаже цртање карте.

« Последња измена: Јануар 03, 2021, 10:14:26 поподне на Црвeњском путу »

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #119 послато: Јануар 03, 2021, 10:23:51 поподне »
Па код мог оца су сва поклапања врло стара.

Најближи су му неки из УСА (од 39-41цм). Њих петоро се тестирали из исте породице. И наводе нека три руска и пољска презимена.

Ни са ким немају повезницу до мог оца.

Жао ми људи. Пребацили су податке и на Гедмеч.

Али мислим да сам нашла одакле им је то једно руско презиме (место Петров, Белгород)

А повезница могу да буду неки исељени Срби у Русију пре 250-300 година.

У сваком случају знам да долазе мом оцу преко његове мајке јер су мени они на X хромозому који сам добила од њега.

Веома ми помаже цртање карте.

Мени најближе поклапање 114 цм дељени сегмент и опет не знам одакле ми иако сумњам због места боравка (по чукунбаби).

Мислим да је мапирање за сада најбоље што се АС тиче уколико немате блиска поклапања, барем можете добити представу о пореклу, на нивоу данашњих нација. А ако мало зачачкате неке давне миграције и ту можете разлучити ко су и шта су.
« Последња измена: Јануар 03, 2021, 10:25:42 поподне НикПав »

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #120 послато: Јануар 03, 2021, 10:51:32 поподне »
Мени најближе поклапање 114 цм дељени сегмент и опет не знам одакле ми иако сумњам због места боравка (по чукунбаби).

Мислим да је мапирање за сада најбоље што се АС тиче уколико немате блиска поклапања, барем можете добити представу о пореклу, на нивоу данашњих нација. А ако мало зачачкате неке давне миграције и ту можете разлучити ко су и шта су.
Искрено - пошто смо остварили значајни напредак што се тиче порекла по Y хромозому 2020 (веза је од пре 600-800 година) и пошто даљих помака није било и скоро да им се више и не надам, АС поклапања су ми бескрајно занимљива.

И сад још кад сам кренула са овим картама и разноразним бојама све се некако уклапа.

Највише ми сметају они са иницијалима или који ништа не напишу о себи.

Иначе ја имам једно поклапање од 70 цм (преко моје мајке).

Очева фамилија је у једном месту 200-250 година и мени и требају те неке старе везе тј. старије од тренутка њиховог насељавања тог места.

Доста се лепо назире Шоплук (Видин).

Али с друге стране и залеђе Дубровника.


Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #121 послато: Јануар 04, 2021, 04:34:17 пре подне »
Искрено - пошто смо остварили значајни напредак што се тиче порекла по Y хромозому 2020 (веза је од пре 600-800 година) и пошто даљих помака није било и скоро да им се више и не надам, АС поклапања су ми бескрајно занимљива.

И сад још кад сам кренула са овим картама и разноразним бојама све се некако уклапа.

Највише ми сметају они са иницијалима или који ништа не напишу о себи.

Иначе ја имам једно поклапање од 70 цм (преко моје мајке).

Очева фамилија је у једном месту 200-250 година и мени и требају те неке старе везе тј. старије од тренутка њиховог насељавања тог места.

Доста се лепо назире Шоплук (Видин).

Али с друге стране и залеђе Дубровника.

Тако и код мене, ко је засигурно 20805 тестиран је, више кандидата нема, па сам се окренуо АС.

Има много таквих који остављају или иницијале или немају стабло (поготово међу Албанцима којих имам поприлично).

Мени доста тога упућује на околину Книна, Гацког ка Плужинама и Маљесију са тенденцијом ширења ка Љешу и Шијку и Драчу (али не остављају податке) и један грозд око Гњилана ка Прешеву са припадницима оба народа која су доле живела и међу којима имам људе и са сегментима по 30 цм (ту су мајчини под лупом, деда је по предању са Скопске Црне Горе).

Остатак је врло стар и може се везати за миграције из XV века, па и раније.
« Последња измена: Јануар 04, 2021, 04:44:54 пре подне НикПав »

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #122 послато: Јануар 04, 2021, 07:59:04 пре подне »
Тако и код мене, ко је засигурно 20805 тестиран је, више кандидата нема, па сам се окренуо АС.

Има много таквих који остављају или иницијале или немају стабло (поготово међу Албанцима којих имам поприлично).

Мени доста тога упућује на околину Книна, Гацког ка Плужинама и Маљесију са тенденцијом ширења ка Љешу и Шијку и Драчу (али не остављају податке) и један грозд око Гњилана ка Прешеву са припадницима оба народа која су доле живела и међу којима имам људе и са сегментима по 30 цм (ту су мајчини под лупом, деда је по предању са Скопске Црне Горе).

Остатак је врло стар и може се везати за миграције из XV века, па и раније.

Хм

Можемо да се "испомогнемо" за неке од Албанаца.

Има их мој отац у оквиру различитих гроздова.

Лика (као јако стара веза) са многим АС поклапањима ме врло изненадила, Далмација још и више (посебно острва).

Неки Албанци (за похвалу) тестирају порекло и по оцу и по мајци. И напишу то. Што ја поштујем.

Чак сам почела да правим карту мтр порекла тестираних.


Теби саветујем (мада си ти очигледно много напреднији од мене) да тестираш своју мајку (ако си у могућности) или њену мајку (баку) или мајчину  сестру (тетку) или своју сестру. Ту ће се видети поклапања на Х хромозому (која се код тебе не виде)  и добићеш одговоре на многа питања. Примера ради: код мог оца свега њих  4 на Х хромозому од 900 АС поклапања, а код мене 100 од његових АС поклапања. Јасно ми је било да му је то "наслеђе од мајке". То су она залеђа Дубровника и Далмација.

Али тек ћу цртати карту : очеви - мајчини.




Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #123 послато: Јануар 04, 2021, 10:12:26 пре подне »
На MY Heritage дијелим неочекивано крупан сегмент од 41cМ са једним Американцем. Он је оставио детаљно стабло својих предка до почетка 20. вијека и ту нема наших људи, већ само Американци и то из држава гдје наши људи нису пуно ни исељавали (Сјеверна Каролина и Алабама). Видим да има још дијељних сегемената са појединцима са наших простора, тако да нема сумње да му је неко од скорашњих предака са Балкана. Сумњам да се ради о non-paternal event (кад напишем овако на енглеском некако ми блаже звучи  :) )

Мој прадеда јесте почетком 20. вијека боравио у Америци, е сад  да ли је навраћао до Алабаме и Сјеверне Каролине, не знам.  :)
« Последња измена: Јануар 04, 2021, 10:14:44 пре подне drajver »

Ван мреже Romanijski

  • Познавалац
  • ******
  • Поруке: 783
  • Ја ратујем сам...
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #124 послато: Јануар 04, 2021, 11:31:19 пре подне »
 Боље да си питао имали још неко у мечевима тог па би неки закључак извео...  :)

Ван мреже Uzi

  • Уредник СДНКП
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1644
  • N2-P189.2>FT182494>FGC28435
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #125 послато: Јануар 04, 2021, 01:00:21 поподне »
На MY Heritage дијелим неочекивано крупан сегмент од 41cМ са једним Американцем. Он је оставио детаљно стабло својих предка до почетка 20. вијека и ту нема наших људи, већ само Американци и то из држава гдје наши људи нису пуно ни исељавали (Сјеверна Каролина и Алабама). Видим да има још дијељних сегемената са појединцима са наших простора, тако да нема сумње да му је неко од скорашњих предака са Балкана. Сумњам да се ради о non-paternal event (кад напишем овако на енглеском некако ми блаже звучи  :) )

Мој прадеда јесте почетком 20. вијека боравио у Америци, е сад  да ли је навраћао до Алабаме и Сјеверне Каролине, не знам.  :)

Колико свеукупно делиш цМ са њим?

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #126 послато: Јануар 04, 2021, 01:09:15 поподне »
Колико свеукупно делиш цМ са њим?

47,1 cM

Означен ми је као Трећи до Пети рођак. По њиховој таблици постоји могућност да имамо заједничког прадеду или прабабу, а распон се протеже до пет генерација уназад.

Примјетио сам да овај исти сегмент, али са мањим бројем cM дијелим са бар још двоје тестираних са наших подручја. Крајишка су презимена у питању. Послао сам му поруку, ваљда ће одговорити.

У родослову има звучна презимена Hendrix, Bryant.  :) Још ће испасти црнац.
« Последња измена: Јануар 04, 2021, 01:12:35 поподне drajver »

Ван мреже Uzi

  • Уредник СДНКП
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1644
  • N2-P189.2>FT182494>FGC28435
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #127 послато: Јануар 04, 2021, 01:28:19 поподне »
47,1 cM

Означен ми је као Трећи до Пети рођак. По њиховој таблици постоји могућност да имамо заједничког прадеду или прабабу, а распон се протеже до пет генерација уназад.

Примјетио сам да овај исти сегмент, али са мањим бројем cM дијелим са бар још двоје тестираних са наших подручја. Крајишка су презимена у питању. Послао сам му поруку, ваљда ће одговорити.

У родослову има звучна презимена Hendrix, Bryant.  :) Још ће испасти црнац.

Да ли се види колико тестирани човек оквирно има година?

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #128 послато: Јануар 04, 2021, 01:43:30 поподне »
Да ли се види колико тестирани човек оквирно има година?

По овоме што видим на стаблу требао би бити негдје 1950-1960. годиште. Дао је имена баба и деда са обе стране који су рођени у првој деценији 20. вијека. И сви су Американци.

Ван мреже Uzi

  • Уредник СДНКП
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1644
  • N2-P189.2>FT182494>FGC28435
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #129 послато: Јануар 04, 2021, 02:02:05 поподне »
По овоме што видим на стаблу требао би бити негдје 1950-1960. годиште. Дао је имена баба и деда са обе стране који су рођени у првој деценији 20. вијека. И сви су Американци.

Изгледа да сте онда и генерацијско поједнако удаљени од заједничког претка.

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #130 послато: Јануар 04, 2021, 02:27:03 поподне »
Изгледа да сте онда и генерацијско поједнако удаљени од заједничког претка.

Не знам, волио бих да се човјек јави. Уколико има и најмању назнаку о балканским коријенима неког од својих предака био би то користан траг.

Иначе, на MYHeritage поред овог Американца имам само још два појединца са којима дијелим сегменте преко 40 cМ. Један је по оцу Србин, поријеклом из околине Приједора, а други је са обе стране српског поријекла из Босне и Херцеговине, рекао бих такође крајишког поријекла. Ова двојица су ми сасвим јасна, иако не знам преко кога смо директно повезани, а овај Американац ми је баш непознаница.

На мрежи Драган Обреновић

  • Члан Управног одбора
  • Истраживач
  • *
  • Поруке: 955
  • R1b-U152>FTA27217
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #131 послато: Јануар 04, 2021, 08:27:19 поподне »
Не знам, волио бих да се човјек јави. Уколико има и најмању назнаку о балканским коријенима неког од својих предака био би то користан траг.

Иначе, на MYHeritage поред овог Американца имам само још два појединца са којима дијелим сегменте преко 40 cМ. Један је по оцу Србин, поријеклом из околине Приједора, а други је са обе стране српског поријекла из Босне и Херцеговине, рекао бих такође крајишког поријекла. Ова двојица су ми сасвим јасна, иако не знам преко кога смо директно повезани, а овај Американац ми је баш непознаница.

На FTDNA ми је комплетиран Family Finder тест и најдужи сегмент који са неким делим је 22 центиморгана, али поклапања која имам су ми статистички разбацана по скоро свим хромозомима. Контактирао сам скоро све најближе генетске сроднике, понеки су већ одговорили али углавном ништа паметно нисам сазнао. Углавном не знају родослов даље од 3-4 генерације уназад, а до тог нивоа не препознајемо ни једног заједничког претка (презиме и сл.)

Међутим, када сам уплоадовао аутосомални фајл на MyHeritage, тамо су откривена много конкретнија поклапања - имам чак седам особа са којима делим сегмент дужи од 40 центиморгана (41.3, 41.9, 42.5, 42.5, 43.3, 43.4, 44.6 cM), а што је још интересантније, са свима се поклапам на хромозому 15:



Сродство са свима њима је процењено на "3rd - 5th cousin". Такође планирам да их све контактирам како бих проверио да ли можда знају за неког свог претка који потиче са Балкана (у питању су особе са страним презименима, углавном из Америке и Британије).

Иначе, послао сам у MyHeritage узорке за оца, мајку, тетку (очеву рођену сестру) и ујака (мајчиног рођеног брата), тако да ће по њиховим резултатима бити доста јасније који хромозом сам наследио од очеве фамилије а који од мајчине.
« Последња измена: Јануар 04, 2021, 08:30:36 поподне Драган Обреновић »

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #132 послато: Јануар 04, 2021, 08:27:39 поподне »
Хм

Можемо да се "испомогнемо" за неке од Албанаца.

Има их мој отац у оквиру различитих гроздова.

Лика (као јако стара веза) са многим АС поклапањима ме врло изненадила, Далмација још и више (посебно острва).

Неки Албанци (за похвалу) тестирају порекло и по оцу и по мајци. И напишу то. Што ја поштујем.

Чак сам почела да правим карту мтр порекла тестираних.


Теби саветујем (мада си ти очигледно много напреднији од мене) да тестираш своју мајку (ако си у могућности) или њену мајку (баку) или мајчину  сестру (тетку) или своју сестру. Ту ће се видети поклапања на Х хромозому (која се код тебе не виде)  и добићеш одговоре на многа питања. Примера ради: код мог оца свега њих  4 на Х хромозому од 900 АС поклапања, а код мене 100 од његових АС поклапања. Јасно ми је било да му је то "наслеђе од мајке". То су она залеђа Дубровника и Далмација.

Али тек ћу цртати карту : очеви - мајчини.

Ови са КиМ слабо пишу одакле су, а највише имам Гашија, Бериша и Краснића и Мухаџира са презименима по селима баш око мог (Реткоцер, Лапаштица, Стубла).

Рано сам остао без родитеља, али планирам да тестирам бабе и деде кад дођем у Србију, ваљда поживе до тада.

На MY Heritage дијелим неочекивано крупан сегмент од 41cМ са једним Американцем. Он је оставио детаљно стабло својих предка до почетка 20. вијека и ту нема наших људи, већ само Американци и то из држава гдје наши људи нису пуно ни исељавали (Сјеверна Каролина и Алабама). Видим да има још дијељних сегемената са појединцима са наших простора, тако да нема сумње да му је неко од скорашњих предака са Балкана. Сумњам да се ради о non-paternal event (кад напишем овако на енглеском некако ми блаже звучи  :) )

Мој прадеда јесте почетком 20. вијека боравио у Америци, е сад  да ли је навраћао до Алабаме и Сјеверне Каролине, не знам.  :)

Мени се чини да MyHeritage уме мало да побрљави на неким сегментима, тако да треба бити опрезан. Мени даје најближа поклапања са Шпанцем, Грком, Немцем и Квебечанком и то са свима на почетку 15. хромозома, одмах иза зоне где нема очитавања, од по 40+ цм и мислим да је у питању нека грешка. И само на том месту на почетку 15. хромозома имам чудне људе са дугачким дељеним сегментом, који нису ни међусобно повезани, нити имају у аутосомалним резултатима зоне као и ја.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #133 послато: Јануар 04, 2021, 08:33:19 поподне »
Да немате можда и мене, зовем се Никола Павловић?

 Ја (лично) имам двојицу Павловића који изгледа нису родбински повезани (дођу ми по мајци).

Један је I1 (Србија).

А други је R1a (Црна Гора).




Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #134 послато: Јануар 04, 2021, 08:36:37 поподне »
Ови са КиМ слабо пишу одакле су, а највише имам Гашија, Бериша и Краснића и Мухаџира са презименима по селима баш око мог (Реткоцер, Лапаштица, Стубла).

Рано сам остао без родитеља, али планирам да тестирам бабе и деде кад дођем у Србију, ваљда поживе до тада.

Мени се чини да MyHeritage уме мало да побрљави на неким сегментима, тако да треба бити опрезан. Мени даје најближа поклапања са Шпанцем, Грком, Немцем и Квебечанком и то са свима на почетку 15. хромозома, одмах иза зоне где нема очитавања, од по 40+ цм и мислим да је у питању нека грешка. И само на том месту на почетку 15. хромозома имам чудне људе са дугачким дељеним сегментом, који нису ни међусобно повезани, нити имају у аутосомалним резултатима зоне као и ја.



Хм.

Где (код кога) видех те Краснићије данас?

Навијам за твоје бабе и деде!  :)

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #135 послато: Јануар 04, 2021, 08:41:46 поподне »
Мени се чини да MyHeritage уме мало да побрљави на неким сегментима, тако да треба бити опрезан. Мени даје најближа поклапања са Шпанцем, Грком, Немцем и Квебечанком и то са свима на почетку 15. хромозома, одмах иза зоне где нема очитавања, од по 40+ цм и мислим да је у питању нека грешка. И само на том месту на почетку 15. хромозома имам чудне људе са дугачким дељеним сегментом, који нису ни међусобно повезани, нити имају у аутосомалним резултатима зоне као и ја.

У праву си, изгледа да се заиста ради о грешци јер је и моје поклапање са Американцем на истој позицији 15 хромозома. А колико видим исти је случај и код Драгана са његовим поклапањима. Мене је збунило што сам са Американцем дијелио још један мањи сегмент, а он је имао још неких поклапања са наших простора.

Сасвим је јасно да то поклапање на 15 хромозому треба занемарити.
« Последња измена: Јануар 04, 2021, 08:43:17 поподне drajver »

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #136 послато: Јануар 04, 2021, 08:42:03 поподне »
На FTDNA ми је комплетиран Family Finder тест и најдужи сегмент који са неким делим је 22 центиморгана, али поклапања која имам су ми статистички разбацана по скоро свим хромозомима. Контактирао сам скоро све најближе генетске сроднике, понеки су већ одговорили али углавном ништа паметно нисам сазнао. Углавном не знају родослов даље од 3-4 генерације уназад, а до тог нивоа не препознајемо ни једног заједничког претка (презиме и сл.)

Међутим, када сам уплоадовао аутосомални фајл на MyHeritage, тамо су откривена много конкретнија поклапања - имам чак седам особа са којима делим сегмент дужи од 40 центиморгана (41.3, 41.9, 42.5, 42.5, 43.3, 43.4, 44.6 cM), а што је још интересантније, са свима се поклапам на хромозому 15:



Сродство са свима њима је процењено на "3rd - 5th cousin". Такође планирам да их све контактирам како бих проверио да ли можда знају за неког свог претка који потиче са Балкана (у питању су особе са страним презименима, углавном из Америке и Британије).

Иначе, послао сам у MyHeritage узорке за оца, мајку, тетку (очеву рођену сестру) и ујака (мајчиног рођеног брата), тако да ће по њиховим резултатима бити доста јасније који хромозом сам наследио од очеве фамилије а који од мајчине.

Здраво живо рођаче!  :)Не делимо неки велики сегмент али ипак делимо неки. Дођеш ми по мајци (рекла бих)!

А данас на некој руској групи која се бави ГГ на ФБ неко је баш питао за поклапања на том 15 хромозому и као ту је један од њих нешто објашњавао "стручно" у чему је проблем са тим баш хромозомом, помињао нека наслеђа у оквиру мањих етничких заједница код којих се наслеђују ти неки исти сегменти (као код Јевреја) и да се ту нешто сусреће на том хромозому. Очигледно да нисам баш најбоље разумела.

На мрежи Драган Обреновић

  • Члан Управног одбора
  • Истраживач
  • *
  • Поруке: 955
  • R1b-U152>FTA27217
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #137 послато: Јануар 04, 2021, 08:43:48 поподне »
Мени се чини да MyHeritage уме мало да побрљави на неким сегментима, тако да треба бити опрезан. Мени даје најближа поклапања са Шпанцем, Грком, Немцем и Квебечанком и то са свима на почетку 15. хромозома, одмах иза зоне где нема очитавања, од по 40+ цм и мислим да је у питању нека грешка. И само на том месту на почетку 15. хромозома имам чудне људе са дугачким дељеним сегментом, који нису ни међусобно повезани, нити имају у аутосомалним резултатима зоне као и ја.

Хмм, ово је врло драгоцена информација, јер малопре сам баш написао како имам поклапања од 40+ cM управо на почетку хромозома 15. Дефинитивно онда делује да је у питању неки баг, контактираћу их да пријавим.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #138 послато: Јануар 04, 2021, 09:01:04 поподне »
Хмм, ово је врло драгоцена информација, јер малопре сам баш написао како имам поклапања од 40+ cM управо на почетку хромозома 15. Дефинитивно онда делује да је у питању неки баг, контактираћу их да пријавим.

Тако је, опрез са почетком 15. хромозома, мада ми се чини да MyHeritage може мало да учини ту.

Ево текста на енглеском о том хромозому и разлозима чудних поклапања: https://whoareyoumadeof.com/blog/dna-matches-on-chromosome-15/ Изгледа да није цео хромозом проблематичан, већ само његов део.

Хм.

Где (код кога) видех те Краснићије данас?

Навијам за твоје бабе и деде!  :)

Хвала!

Иначе, не би ме чудило да је део тих поклапања са КиМ резултат арнаућења.
« Последња измена: Јануар 04, 2021, 09:04:12 поподне НикПав »

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #139 послато: Јануар 05, 2021, 10:06:34 поподне »
Упозорио бих и на хромозом 16, где су исто могућа лажна поклапања са којекаквим странцима, а одликује га необично велики број заједничких поклапања (по 500,600 па и више), која сва имају поред и иконицу да делите сви исти сегмент.
Изгледа да MyHeritage алгоритам не препознаје добро те тзв "pileup" делове на појединим хромозомима.
« Последња измена: Јануар 05, 2021, 10:08:30 поподне НикПав »

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #140 послато: Јануар 13, 2021, 01:21:37 поподне »
Цитат
Управо тај део приче ми је најзанимљивији.

Ја не могу да тврдим 100%, али долазим до закључка да се неком рекомбинацијом преносе "мањи сегменти" кроз векове и да један исти мањи сегменти на истом месту истог хромозома има више људи на различитим местима како унутар истог народа, тако и унутар различитих народа (због разних миграција).

На Црвењском путу, одговорићу овде пошто је више у теми.

Радим мали експеримент са DNA Painter и приметио сам исту ствар као и Ви. Узимам поклапања са сегментима дужим од 6 cm и за сада има пар сегмената где се гомилају припадници одређених народа. Објавићу кад све завршим.
« Последња измена: Јануар 13, 2021, 01:26:27 поподне НикПав »

На мрежи Драган Обреновић

  • Члан Управног одбора
  • Истраживач
  • *
  • Поруке: 955
  • R1b-U152>FTA27217
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #141 послато: Јануар 13, 2021, 01:46:31 поподне »
Jel opet hromozom 15 u pitanju ili neki drugi? Taj hromozom 15 je izgleda zaista specifičan:

https://dna-explained.com/2014/02/19/generational-inheritance/

This phenomenon is shown clearly in the Vannoy project where 5 cousins who descend from Elijah Vannoy born in 1786 share a very significant portion of chromosome 15.  These people are all 5 generations or more distantly related from the common ancestor, (approximate 4th cousins) and should share less than 1% of their DNA in total, and certainly no large, unbroken segments.   As you can see, below, that’s not the case.  We don’t know why or how some DNA clumps together like this and is transmitted in complete (or nearly complete) segments, but they obviously are.  We often call these “sticky segments” for lack of a better term.


Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #142 послато: Јануар 13, 2021, 02:00:33 поподне »
Jel opet hromozom 15 u pitanju ili neki drugi? Taj hromozom 15 je izgleda zaista specifičan:

https://dna-explained.com/2014/02/19/generational-inheritance/

This phenomenon is shown clearly in the Vannoy project where 5 cousins who descend from Elijah Vannoy born in 1786 share a very significant portion of chromosome 15.  These people are all 5 generations or more distantly related from the common ancestor, (approximate 4th cousins) and should share less than 1% of their DNA in total, and certainly no large, unbroken segments.   As you can see, below, that’s not the case.  We don’t know why or how some DNA clumps together like this and is transmitted in complete (or nearly complete) segments, but they obviously are.  We often call these “sticky segments” for lack of a better term.

Није у питању 15, пошто ми се на њему гомилају баш разни народи (чак и једна Инуит жена) без икаквог смисла, те људе ни не рачунам. Слично важи и за део 16. хромозома
У питању је хромозом број 2.

Ван мреже Bane

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 977
  • E-Z16988+BY99620+
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #143 послато: Јануар 13, 2021, 02:02:23 поподне »
На Црвењском путу, одговорићу овде пошто је више у теми.

Радим мали експеримент са DNA Painter и приметио сам исту ствар као и Ви. Узимам поклапања са сегментима дужим од 6 cm и за сада има пар сегмената где се гомилају припадници одређених народа. Објавићу кад све завршим.


Можда буде од помоћи: The Geography of Recent Genetic Ancestry across Europe

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #144 послато: Јануар 13, 2021, 02:04:50 поподне »
На Црвењском путу, одговорићу овде пошто је више у теми.

Радим мали експеримент са DNA Painter и приметио сам исту ствар као и Ви. Узимам поклапања са сегментима дужим од 6 cm и за сада има пар сегмената где се гомилају припадници одређених народа. Објавићу кад све завршим.

Ја сам радила исто што и ви.

У једној варијанти сам пратила Х хромозом, у другој су била да кажем "обична" поклапања. Пропутовах читавим светом. Од Северне Европе, преко Русије, Балкана, до Турске (чак), а имам и примера да вучем грозд АС поклапања из ко зна којих дубина прошлости, а да немам повезницу међу тестиранима са Балкана, а врло често и имам (мада није правило).

Нађох 9 "дама" (оне су ми нешто биле посебно занимљиве) са којима имам поклапање на истом хромозому једног сегмента од 7-9 cm које су разбацане по различитим етносима.

Ради провере - није ме мрзело - поред највећег сегмента ма колико он био мали (ту мислим на оне од 7 cm) убацивала сам на DNA painter и оне мање "сегментиће" (па и од 1cm)  јер сам хтела да стекнем слику на којим хромозомима се јављају. Јесте споро - али ко воли да се игра са бојама и детаљима, а знатижељан је, и није тако страшно. :)


Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #145 послато: Јануар 13, 2021, 02:14:27 поподне »
47,1 cM

Означен ми је као Трећи до Пети рођак. По њиховој таблици постоји могућност да имамо заједничког прадеду или прабабу, а распон се протеже до пет генерација уназад.

Примјетио сам да овај исти сегмент, али са мањим бројем cM дијелим са бар још двоје тестираних са наших подручја. Крајишка су презимена у питању. Послао сам му поруку, ваљда ће одговорити.

У родослову има звучна презимена Hendrix, Bryant.  :) Још ће испасти црнац.

Е сад, није у вези са овим конкретно што сте написали. Али јесте са нечим другим.

Ту на my heritage ви и мој отац сте повезани. Скромним генетским везама. Али ипак повезани. Што мени потврђује део предања да су први досељеници села у којем је рођен из Босне.

Чини ми се да.сте добили и исте генетске групе (онај крајишки кластер).

Погледах вашу и његову процену етничке припадности. Доста се пратите (добро њему је већа јужна Европа и Грчка од вас,  а нешто мањи Балтик од вашег).
Он има и ту неку Немачку и Скандинавију.


Али јако се добро сећам да сте ви и он имали оног Zerbia који је избрисао после свој профил на Гедмечу.

Мада сам ја негде била сачувала његова поклапања
« Последња измена: Јануар 13, 2021, 02:16:47 поподне на Црвeњском путу »

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #146 послато: Јануар 14, 2021, 05:12:15 пре подне »

Можда буде од помоћи: The Geography of Recent Genetic Ancestry across Europe

Хвала Бане!

Ја сам радила исто што и ви.

У једној варијанти сам пратила Х хромозом, у другој су била да кажем "обична" поклапања. Пропутовах читавим светом. Од Северне Европе, преко Русије, Балкана, до Турске (чак), а имам и примера да вучем грозд АС поклапања из ко зна којих дубина прошлости, а да немам повезницу међу тестиранима са Балкана, а врло често и имам (мада није правило).

Нађох 9 "дама" (оне су ми нешто биле посебно занимљиве) са којима имам поклапање на истом хромозому једног сегмента од 7-9 cm које су разбацане по различитим етносима.

Ради провере - није ме мрзело - поред највећег сегмента ма колико он био мали (ту мислим на оне од 7 cm) убацивала сам на DNA painter и оне мање "сегментиће" (па и од 1cm)  јер сам хтела да стекнем слику на којим хромозомима се јављају. Јесте споро - али ко воли да се игра са бојама и детаљима, а знатижељан је, и није тако страшно. :)



 Код мене за сада све по старом, углавном се гомилају Балканци и јужна Италија уз нешто мало Украјинаца из околине Кривог Рога и Тернопила, Пољака и Латвијаца.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #147 послато: Јануар 30, 2021, 05:42:41 пре подне »
Ево како стоје ствари за сада на узорку од 1759 поклапања

Screenshot_20210129-122659 by Nikola Pavlovic, on Flickr

Највеће изненађење је појава Подунавских Шваба и Чеха са пореклом из Војводине. Уколико нису у питању лажна поклапања једино што ми пада на памет је да је нека фамилија из Крушевице са којом сам повезан (а за неке се наводи да су дошле из правца Војводине) покупила нешто док је била горе или су они покупили нешто од нашег живља. Ердељановић наводи да су и Павловићи провели неко време у Срему, највероватније у време Кочине крајине.
Занимљиво је да ми је и једна од група на myheritage управо Пољска и Немачка, додуше у категорији low confidence.
Већ су се искристалисали и неки карактеристични сегменти, али о томе нећу док не обрадим сва поклапања.
« Последња измена: Јануар 30, 2021, 05:52:54 пре подне НикПав »

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #148 послато: Јануар 30, 2021, 07:44:48 пре подне »
Ево како стоје ствари за сада на узорку од 1759 поклапања

Screenshot_20210129-122659 by Nikola Pavlovic, on Flickr

Највеће изненађење је појава Подунавских Шваба и Чеха са пореклом из Војводине. Уколико нису у питању лажна поклапања једино што ми пада на памет је да је нека фамилија из Крушевице са којом сам повезан (а за неке се наводи да су дошле из правца Војводине) покупила нешто док је била горе или су они покупили нешто од нашег живља. Ердељановић наводи да су и Павловићи провели неко време у Срему, највероватније у време Кочине крајине.
Занимљиво је да ми је и једна од група на myheritage управо Пољска и Немачка, додуше у категорији low confidence.
Већ су се искристалисали и неки карактеристични сегменти, али о томе нећу док не обрадим сва поклапања.

Ово си сам правио (разврставање и остало)?

Како одредиш ко припада ком етносу?

Управо на my heritage имам појединце разврстане у више етноса. Не знам шта је критеријум? Неке ставе у Англосаксонце само зато што живе у Великој Британији!


Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #149 послато: Јануар 30, 2021, 08:41:56 пре подне »
Не знам да ли је још неко пробао опцију аутокластеровања на MYHeritage. Ова опција заправо аутоматски одради оно што се ручно ради код DNA Painter. Резултате аутокластеровања вам пошаљу на мејл и бесплатно је.

Ево како изгледа код мене тај извјештај:



Сваки од ових кластера је једна сродничка група повезана заједничким претком (мушким или женским) од којег су наслеђени IBD сегменти.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #150 послато: Јануар 30, 2021, 08:44:07 пре подне »
Не знам да ли је још неко пробао опцију аутокластеровања на MYHeritage. Ова опција заправо аутоматски одради оно што се ручно ради код DNA Painter. Резултате аутокластеровања вам пошаљу на мејл и бесплатно је.

Ево како изгледа код мене тај извјештај:



Сваки од ових кластера је једна сродничка група повезана заједничким претком (мушким или женским) од којег су наслеђени IBD сегменти.

Нисам. Сад ћу пробати.

Хвала
 :)

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #151 послато: Јануар 30, 2021, 09:30:12 пре подне »
Нисам. Сад ћу пробати.

Хвала
 :)

Сад сам провјерио неки од ових њихових "кластера" али то изгледа уопште није оно што сам ја мислио. ови кластери нису груписани по заједничким IBD сегментима, већ по неком другом принципу. Могуће по међусобним везама.

Самим тим не видим пуно користи од ове опције аутокластеровања.

И даље груписање по IBD сегментима остаје да се ради ручно. (у DNA Painteru)

С тим да MY Heritage ипак има једну корисну алатку,а то је да кад вам излиста списак појединаца са којима дијелите генетику ви и изабрани појединац, посебно означи оне на том списку са којим обојица дијелите заједничке IBD сегменте. И на овај начин се прилично брзо могу формирати IBD групе.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #152 послато: Јануар 30, 2021, 10:25:09 пре подне »
Сад сам провјерио неки од ових њихових "кластера" али то изгледа уопште није оно што сам ја мислио. ови кластери нису груписани по заједничким IBD сегментима, већ по неком другом принципу. Могуће по међусобним везама.

Самим тим не видим пуно користи од ове опције аутокластеровања.

И даље груписање по IBD сегментима остаје да се ради ручно. (у DNA Painteru)

С тим да MY Heritage ипак има једну корисну алатку,а то је да кад вам излиста списак појединаца са којима дијелите генетику ви и изабрани појединац, посебно означи оне на том списку са којим обојица дијелите заједничке IBD сегменте. И на овај начин се прилично брзо могу формирати IBD групе.

А ха! Хвала.

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #153 послато: Јануар 30, 2021, 12:30:04 поподне »
Приликом анализе сегмената треба узети у обзир на којој позицији хромозома је дошло до "ломљења" сегмента. С обзиром да је ово ломљење једносмјеран процес, спознаја редослиједа ломљења је заправо и спознаја редослиједа предака, тј. породичног стабла. Покушаћу то илустровати на једној својој сродничкој IBD групи. Користим базу MYHeritage и њихов хромозомални прегледач.

На 13 хромозому дијелим један прилично велик сегмент од 42,3cm са Србином из БиХ (претпостављам по презименима да би могао бити из Крајине). Величина овог IBD сегмента указује да са њим дијелим најдаље чукун-чукун деду или чукун-чукун бабу. Преко MYHeritage списка подударности, веома лако сам дошао до информације с ким још од мојих поклапања дијелим сегмент на истој позицији хромозома. Поред горе наведеног, то је још седам појединаца. Са њим су ти дијељени сегменти значајно мањи. Приказани су на сљедећој слици.



Појединци су означени јединственим бојама, да не бих постављао презимена у јавни простор. Ово је оно што сам успио закључити из података које су оставили:

тамно плава- Србин из БиХ, вјероватно Крајина
наранџаста- Српкиња, крајишко поријекло
жуто- Српкиња, нема података
зелено- Србин, по мушкој линији околина Пожаревца, непознато одакле су друге линије
свијетло плаво- Хрватица непознатог поријекла
љубичасто- Хрватица, средња Босна
црвено- српско презиме

На прегледачу се може видјети да су сегменти различитих дужина. Међутим, оно што је овдје битно јесу лијева и десна граница сегмената, она нам показује гдје је дошло до ломљења IBD сегмената. Мој сегменат није приказан али је он једнак овом тамно плавом. Крећемо од најдужег сегмента и гледамо му границе. Тамно плави и зелени сегмент имају идентичну десну границу, и то је најстарије ломљење. Након тога посматрамо другу лијеву границу зеленог сегмента и видимо да се она поклапа са више сегмената (жутим, наранџастим), и ту је друго ломљење. Треће ломљење је на десној граници жутог и наранџастог сегмента, које се поклапа са црвеним и свијетло плавим сегментом. И на крају четврто ломљење је на лијевој граници лијевог и љубичастог сегмента.

На овај начин, идентификујући редослијед ломљења формирао сам мало родословно стабло за овај IBD сегмент. На њему је указано и на којој позицији 13 хромозома је дошло до ломљења IBD сегемнта.



Када се покушава реконструисати редослијед ломљења треба увијек посматрати укупну слику, и схватити да се ломљења дешавају и са лијеве и са десне стране сегмента, па су нека претходна ломљења изгубљена у каснијим генерацијама код појединаца. Друга ствар је и величина самих сегмената. Већи сегмент свакако значи већу блискост, али неки појединци који имају и мање сегменте не морају нужно бити даљи, само се сегмент уситнио и пренио на такав начин.

Да би овај метод реконструкције помоћу тачке "ломљења" сегмената могао бити поуздан показује и чињеница да двије Хрватице које имају овај IBD сегмент (свјетло плава и љубичаста) имају цијепање на истом мјесту, тј. дијеле заједничког претка у односу на остале.

Мало сам одужио, надам се да сам успио појаснити.

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #154 послато: Јануар 30, 2021, 12:36:15 поподне »
Наравно, из горе постављеног стабла је јасно да једино са тамно плавим узорком у мом случају има смисла тражити заједничке претке.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #155 послато: Јануар 30, 2021, 05:32:55 поподне »
Ово си сам правио (разврставање и остало)?

Како одредиш ко припада ком етносу?

Управо на my heritage имам појединце разврстане у више етноса. Не знам шта је критеријум? Неке ставе у Англосаксонце само зато што живе у Великој Британији!

Сам сам правио, а породична стабла су први извор како сам одређивао припадност.
Ако нема стабла име и презиме може доста рећи, уз myheritage процену етничке припадности.
Уколико видим нешто сумњиво (као Швеђанина из Шведске са шведским именом и презименом, а без стабла са 25% Грчка и Јужна Италија) таква поклапања нисам убацивао у DNA Painter, као и људе, махом из САД, који немају стабла, са класичним америчким именима.
Уколико је у питању мешанац од народа које већ имам у painter, убацим сегмент и видим кога још има ту и сврстам га у народ који се најчешће јавља на том сегменту.

Не знам да ли је још неко пробао опцију аутокластеровања на MYHeritage. Ова опција заправо аутоматски одради оно што се ручно ради код DNA Painter. Резултате аутокластеровања вам пошаљу на мејл и бесплатно је.

Ево како изгледа код мене тај извјештај:



Сваки од ових кластера је једна сродничка група повезана заједничким претком (мушким или женским) од којег су наслеђени IBD сегменти.

Користио сам аутокластер, али за овај попис по националностима није згодан.
Мислим да ће аутокластер бити пун погодак кад тестирам бабе и деде, џаба ми овако кад не знам ко ми са чије стране долази  :)

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #156 послато: Фебруар 24, 2021, 02:34:07 пре подне »
Захваљујући помоћи моје 20805 братије успео сам да лоцирам неке људе и једна од интересантних зона са доста поклапања је зона Плав - Гусиње.
За сада из овог краја на нивоу од 19цм до 11цм у комаду су:
Ђонбаљаји - четири особе
Хасанђекаји - две особе
Хоти из Хота код Гусиња - две особе
Коленовићи - две особе
Вутаји - једна особа
Гутић - једна особа

Надам се да ће се ова заврзлама коначно решити ускоро  ::) . Интензивно трагамо за потенцијалним 20805, рађени су неки панели на YSEQ.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #157 послато: Март 12, 2021, 01:59:08 пре подне »
Освежио сам мапу поклапања, додао локације других 20805 и правце миграција по мушким линијама фамилија баба и деда (потkрепљених предањима или литературом) и ово је резултат:

За пуну резолуцију десни клик, view image

matches by Nikola Pavlovic, on Flickr
« Последња измена: Март 12, 2021, 02:02:23 пре подне НикПав »

Ван мреже Romanijski

  • Познавалац
  • ******
  • Поруке: 783
  • Ја ратујем сам...
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #158 послато: Јун 18, 2021, 02:48:13 пре подне »
Мало лијепих објашњења , можда неком буде корисно. За сваку генерацију дате вриједности цМ (центи моргана).

https://support.livingdna.com/hc/en-us/articles/360013536560-What-does-my-relationship-prediction-mean-

На мрежи Драган Обреновић

  • Члан Управног одбора
  • Истраживач
  • *
  • Поруке: 955
  • R1b-U152>FTA27217
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #159 послато: Јун 18, 2021, 07:14:45 пре подне »
Мало лијепих објашњења , можда неком буде корисно. За сваку генерацију дате вриједности цМ (центи моргана).

https://support.livingdna.com/hc/en-us/articles/360013536560-What-does-my-relationship-prediction-mean-

Исто то, у мало другачијој форми:

https://dnapainter.com/tools/sharedcmv4

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #160 послато: Јун 21, 2021, 02:41:08 поподне »
Мало играња у ГИС програму:

Густина аутосомалних поклапања, са Цвијићевом мапом миграција као подлогом

srbija by Nikola Pavlovic, on Flickr

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #161 послато: Јун 21, 2021, 03:08:57 поподне »
Мало играња у ГИС програму:

Густина аутосомалних поклапања, са Цвијићевом мапом миграција као подлогом

srbija by Nikola Pavlovic, on Flickr

Свиђа ми се.

Баш је занимљиво.

И право освежење на форуму.


На мрежи Amicus

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 9508
  • I1 P109 FGC22045
    • Порекло.рс
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #162 послато: Јун 21, 2021, 03:24:07 поподне »
Браво за идеју, Никола. :)



Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #163 послато: Јун 22, 2021, 01:21:23 пре подне »
Хвала! Кад будем имао мало више времена планирам да дигитализујем све правце миграција са Цвијићеве карте, онда ће бити згодно да се ради у векторским програмима са њима или ГИС, пошто ће бити геореференцирани.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #164 послато: Јун 22, 2021, 06:34:57 пре подне »
Хвала! Кад будем имао мало више времена планирам да дигитализујем све правце миграција са Цвијићеве карте, онда ће бити згодно да се ради у векторским програмима са њима или ГИС, пошто ће бити геореференцирани.

Никпав већ сада не можемо да те пратимо.

Можемо само да гледамо (неки).

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #165 послато: Јун 26, 2021, 03:27:43 пре подне »
На сав хаос код мене, деда (мајчин отац) ми је повезан аутосомално и са лажним дреничким Кучима. Наручио сам му BigY па да видимо да није по мушкој линији, за сада се зна да је E-V13.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #166 послато: Јун 28, 2021, 08:45:10 пре подне »
Ево још мапа са Цвијићевом као подлогом.

Изгледа да се у Плаву и Гусињу није знало ко пије ко плаћа, свако мало се неко нови појави као поклапање  :D Нит мањег простора, нит више поклапања. Скадарска Крајина и Улцињ прате тај тренд.

mapa by Nikola Pavlovic, on Flickr

Македонија полупразна

makedonija by Nikola Pavlovic, on Flickr

Хрватска, махом све јужно од Саве

hrvatska by Nikola Pavlovic, on Flickr

Грчка, овде већ не знам које би могле бити везе, сем традиционалних насеобина Словена и Цинцара

gtcka by Nikola Pavlovic, on Flickr

Бугарска.
Деда и баба имају доста поклапања по западној и југозападној Бугарској, што и није изненађење. Баба има доста поклапања по централној Бугарској (Плевен, Ловеч, Тројан, Севлиево па све до Варне), али северозападна Бугарска није по мајчиној линији.

bugarska by Nikola Pavlovic, on Flickr

Босна

bosna by Nikola Pavlovic, on Flickr

Албанија

albanija by Nikola Pavlovic, on Flickr

Пошто са Y поклапањима иде слабо, решавање аутосомалних поклапања је постало главна занимација.
« Последња измена: Јун 28, 2021, 08:47:52 пре подне НикПав »

Ван мреже НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #167 послато: Јун 28, 2021, 10:55:32 пре подне »
У Грчкој се највише Спарта "црвени".  :)
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #168 послато: Август 03, 2021, 10:28:28 поподне »
У Грчкој се највише Спарта "црвени".  :)

Имам доста Грка са Пелопонеза из неког разлога.

Интересантно је да у свим регијама одакле су припадници E-Y20805 имам солидан број поклапања, осим у Шведској. Нови Италијан се таман лепо угнездио међу аутосомална поклапања.

Ван мреже barbarylion

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1100
  • I2-PH908>Y56203
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #169 послато: Септембар 03, 2021, 05:12:06 поподне »
Сад сам провјерио неки од ових њихових "кластера" али то изгледа уопште није оно што сам ја мислио. ови кластери нису груписани по заједничким IBD сегментима, већ по неком другом принципу. Могуће по међусобним везама.

Самим тим не видим пуно користи од ове опције аутокластеровања.

И даље груписање по IBD сегментима остаје да се ради ручно. (у DNA Painteru)

С тим да MY Heritage ипак има једну корисну алатку,а то је да кад вам излиста списак појединаца са којима дијелите генетику ви и изабрани појединац, посебно означи оне на том списку са којим обојица дијелите заједничке IBD сегменте. И на овај начин се прилично брзо могу формирати IBD групе.

Već dugo razmišljam ali nikako da dođem do odgovora na ovo pitanje, pa da priupitam, koji je rezlog pojavljivanja Albanaca ( uglavnom maksimum 2-3 osobe/poklapanja) kod zapadnih jugoslovena( Srba,Hrvata,Slovenaca), primetio sam da se to nalazi i kod kajkavskih Hrvata, to me malo zbunjuje, postoji li tu zaista neka veza ili je stvar sa sa nacinom racunanja, nekim sistemom koji to grupise?

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #170 послато: Септембар 22, 2021, 10:25:16 пре подне »
Прије неколико дана сам на MYHeritage примјетио да имам своје прво аутосомално поклапање које је означено као:

Прва рођакиња у другом кољену-друга рођакиња у првом кољену

Пошто сам видио да у породичном стаблу има презиме Качар које се појављује и у мом стаблу , ступио сам у контакт са тестираном, тачније њеним сином који јој води налог и испоставило се да јесмо рођаци и то не тако далеко повезани. Наиме, ја и тестирана дијелимо истог чукунбабу и чукундједу, њен прадеда и моја прабаба су рођени брат и сестра. Ради се о породици Качар из Рисовца Бос. Петровац. Брачни пар Качар од ког смо потекли живио је у Рисовцу у другој половини 19. вијека. Захваљујући овом поклапању знам које сам IBD сегменте сасвим сигурно наслиједио од прабабе Качар. Сад знам да ми је поуздана линија насљеђивања отац-његова мајка- њезина мајка.

Даћу статистику дијељен днк да би се видјело како се веза ове удаљености манифестује кроз аутосомалну днк.

Иначе за одређивање блискости два појединца, три су елемента на основу којих одређујемо блискост, сваки утиче на свој начин:

- проценат укупне заједничке днк: са тестираном у овом случају имам 2,2% дијељене днк. Први сљедећи на листи мојих поклапања је са 1% дијељене днк. Са сином тестиране већ имам 0,7% дијељен днк, што показује како се већ у једној генерацији проценат дијељене днк нагло смањује.
- број заједничких IBD сегемената: са тестираном дијелим 9 заједничких IBD сегмената. Са сљедећим поклапањем на листи је то 6 сегмената. Са сином тестиране дијелим 3 сегмента што показује да је рекомбинацијом у само једној генерацији нестало 6  IBD сегмената.
-величина највећег IBD сегмента: са тестираном дијелим највећи IBD сегмент 31,3‎ cM, што није највећи сегмент који дијелим са неким. Има чак осам појединаца прије тестиране са којима дијелим веће сегменте. Са сином тестиране највећи сегмент је 20,2‎ cM.

На основу овог примјера може се закључити да су сва три елемента важна, али чини ми се да је проценат укупне днк и број дијељених IBD сегмената нешто важнији за суштинску блискост од дужине највећег сегмента. Мада и то може варирати од случаја до случаја, тако да ипак треба сва три елемента узети у обзир.

На MYHeritage су дали шему блискости за категорију Прва рођакиња у другом кољену-друга рођакиња у првом кољену. Она да је распон могућих веза. На овом мом примјеру видим да је била поуздана. Означио сам стрелицом у какавом смо родословном односу тестирана рођакиња и ја.




Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #171 послато: Септембар 25, 2021, 03:25:21 пре подне »
Пошто се најстарији Павловић шлогирао, нисам желео да га малтретирам са чачкањем по устима, па је као следећи најстарији Павловић избор пао на моју рођену тетку.

Док мој узорак броји 1200 поклапања са свих доступних комерцијалних тестова, теткина поклапања су ограничена на MH и FTDNA, а до сада сам обрадио њих 100. Иако делимо тек четвртину гена, неке тенденције су уочљиве:

Тетка, Петњица, Плав и Груде, од 100 обрађених, четвртина је из ових крајева.



Ја




Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #172 послато: Септембар 25, 2021, 05:27:47 пре подне »
Управо су стигли резултати моје баке и ствари су поприлично јасне, Петњичани, Плављани и Груде које тетка и ја делимо нису преко ње. Можда је ипак прича мог прадеде била тачна.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #173 послато: Октобар 02, 2021, 01:51:25 пре подне »
Ево једног примера са Gedmatch и колико phasing помаже у елиминисању лажних поклапања.

Теткин MH kit, без phasing преко 40000 поклапања. Теткин MH kit после phasing са MH kit њене мајке, раздвојен на два kits за хромозоме по мајци и по оцу: по оцу 922 поклапања, по мајци 3043.

А ово је статистика са MH:

Никола 3876 поклапања, од тога са тетком заједничких 310, са бабом по оцу заједничких 455, са бабом по мајци заједничких 182 и са дедом по мајци 161. Наравно, немогуће је да су сви остали са стране деде по оцу, што наводи на закључак да је преко 50% поклапања лажно. Да ствар буде још компликованија имам доста поклапања од по 9 cm, са којима моје бабе и деда деле много више, тако да и она прича о 15 cm као сигурном знаку да је поклапање право, не стоји.
« Последња измена: Октобар 02, 2021, 01:56:14 пре подне НикПав »

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #174 послато: Март 06, 2022, 04:36:55 пре подне »
Немамо много активних чланова са југа, а још мање оних који су пробали да анализирају своја аутосомална поклапања и пробају да одгонетну одакле су се људи досељавали у ове крајеве.

Бабиних 135 најближих поклапања. Њени су дошли из Црне Траве, из Мелну и са Риле (род Ћурчишци, предак се бавио прерадом коже и свирао гајде). Риста Николић је записао у својој књизи Власина и Крајиште, да неколико родова из Црне Траве тврди да су дошли негде из околине Копаоника, а фамилија бабине мајке (Вукашиновићи) тврди (мимо Ристе) да су дошли чак из Херцеговине. Да ли су бабина поклапања потврда тако нечега, не знам, али је груписање интересантно.
Још једна занимљива ствар до које сам дошао у разговору са једним од админа групе Балканджии, чија је жена исто из Мелну, је да се становништво две Мелне (Горне и Долне) селило у два правца (за Србију и ка Бургасу, жена му је Мелничанка, потомак струје која је населила Бургас). Оно што још нисам нашао у литератури је шта је определило ове људе да ли да крену на исток или на запад.



Деда је по оцу источна струја (Вучи Дел на Руј планини), по мајци косовска струја (околина Гњилана и Косовске Каменице). Интересантно је ово црвенило од Габрова ка Трјавни, где се и налази његово најближе Y поклапање, али остаје отворено питање како су се те миграције одвијале.
Дедина мајчина страна ми је потпуно непозната и осим чињенице да су његова поклапања са те стране мешовита и да неки Албанци са којима сам причао кажу да имају српско порекло (Кадриу из Прилепнице), немам других информација.

Дедин узорак је 127 најближих поклапања. Није дочекао да проћаскамо о његовим резултатима.


Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #175 послато: Март 06, 2022, 05:44:40 пре подне »
Многе Мирдите нису завршиле на дединој мапи, јер нису међу најближим поклапањима, али причајући са њима, јасно ми је зашто је некада постојала Република Мирдита и шта их је понукало (мимо подршке наше Краљевине). И дан данас веома отворени за разговоре о пореклу, о продору ислама међу Албанце, веома пријатни и предусретљиви. Са њима је најлакше причати. Поздрав за Мирдите, са MH и YT!
« Последња измена: Март 06, 2022, 05:50:40 пре подне НикПав »

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1601
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #176 послато: Март 06, 2022, 09:06:05 пре подне »
Немамо много активних чланова са југа, а још мање оних који су пробали да анализирају своја аутосомална поклапања и пробају да одгонетну одакле су се људи досељавали у ове крајеве.

Бабиних 135 најближих поклапања. Њени су дошли из Црне Траве, из Мелну и са Риле (род Ћурчишци, предак се бавио прерадом коже и свирао гајде). Риста Николић је записао у својој књизи Власина и Крајиште, да неколико родова из Црне Траве тврди да су дошли негде из околине Копаоника, а фамилија бабине мајке (Вукашиновићи) тврди (мимо Ристе) да су дошли чак из Херцеговине. Да ли су бабина поклапања потврда тако нечега, не знам, али је груписање интересантно.
Још једна занимљива ствар до које сам дошао у разговору са једним од админа групе Балканджии, чија је жена исто из Мелну, је да се становништво две Мелне (Горне и Долне) селило у два правца (за Србију и ка Бургасу, жена му је Мелничанка, потомак струје која је населила Бургас). Оно што још нисам нашао у литератури је шта је определило ове људе да ли да крену на исток или на запад.



Деда је по оцу источна струја (Вучи Дел на Руј планини), по мајци косовска струја (околина Гњилана и Косовске Каменице). Интересантно је ово црвенило од Габрова ка Трјавни, где се и налази његово најближе Y поклапање, али остаје отворено питање како су се те миграције одвијале.
Дедина мајчина страна ми је потпуно непозната и осим чињенице да су његова поклапања са те стране мешовита и да неки Албанци са којима сам причао кажу да имају српско порекло (Кадриу из Прилепнице), немам других информација.

Дедин узорак је 127 најближих поклапања. Није дочекао да проћаскамо о његовим резултатима.



Па ја покушавах прошле године за оца. Велики је то посао.

Некадашњи Видински пашалук и историјска дешавања у унутар њега би био највероватнији одговор на твоје питање.

Иначе сам размишљала о покретању теме Видински пашалук.




Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #177 послато: Март 08, 2022, 02:47:27 пре подне »
Па ја покушавах прошле године за оца. Велики је то посао.

Некадашњи Видински пашалук и историјска дешавања у унутар њега би био највероватнији одговор на твоје питање.

Иначе сам размишљала о покретању теме Видински пашалук.

И мени се чини да су овде Власи (поготово они ишчезли са КиМ одиграли значајну улогу), НЦП, мислим да сте упрскали 23andme регистрацију, добио сам поруку о непознатом узорку, регистровао сам га опет и постоји могућност да вам пребацим резултате на основу email. Али сачекајмо резултате , па Вам пишем. Нисам забележио све kit numbers, па не знам о коме се ради  :) Обавестио сам администрацију форума о донацијама 23andme китова, али очигледно нико ко није у директном контакту са мном није имао шансу.
Не уједам иако сам E-V13 по обе линије и иако чекам да ми се деда по мајци дода у базу већ пет месеци, само је обежен као Бугарин (да мученик није умро чекајући резултате имао би нервни напад).
« Последња измена: Март 08, 2022, 02:58:18 пре подне НикПав »

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #178 послато: Април 27, 2022, 09:57:40 поподне »
Мапа поклапања тетке по мајци, 23andme и Ancestry. Стрелицама означено одакле су нам преци дошли, само чињенице, предања нисам стављао на мапу.




Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #179 послато: Април 27, 2022, 10:59:25 поподне »
Мапа тетке по оцу је још у изради, али чисто за поређење стављам и њу и своју завршену мапу. Свима нам је највећа концентрација поклапања у Гусињу и око Подгорице (углавном источно од града).




Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #180 послато: Мај 22, 2022, 02:42:24 пре подне »
Тетка по оцу, 95% завршена

rayman wallpaper

Ван мреже ivanc79

  • Члан Друштва
  • Помоћник
  • *****
  • Поруке: 199
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #181 послато: Мај 22, 2022, 09:29:06 пре подне »
Где могу учитати своје резултате анализе аутозомалне генетике са Family finder (FTDNA) ради упоређивања? Gedmatch већ пробао. Има ли још нешто?

На мрежи Драган Обреновић

  • Члан Управног одбора
  • Истраживач
  • *
  • Поруке: 955
  • R1b-U152>FTA27217
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #182 послато: Мај 22, 2022, 10:10:22 пре подне »
Где могу учитати своје резултате анализе аутозомалне генетике са Family finder (FTDNA) ради упоређивања? Gedmatch већ пробао. Има ли још нешто?

MyHeritage (https://www.myheritage.com/dna/upload)

GeneaNet (https://en.geneanet.org/dna/#bloc-upload)

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #183 послато: Јун 23, 2022, 03:49:20 поподне »
Аутосомални профили тројице Авара који су E-Y20805




Ван мреже Exiled

  • Члан Друштва
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2394
  • ПХ908>А20333>FT14649>FT175994
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #184 послато: Јун 24, 2022, 10:58:50 пре подне »
Мени је зона сумрака или боље речено луд,збуњен ситуацуја суђена овим мојим трагањима. Најближи ми меч на аутосомалу и то најдужи блок од 65 цм нека странкиња. Писо сам јој мејл, видећемо има ли какво рационално објашњење...

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #185 послато: Јун 24, 2022, 11:08:05 пре подне »
Мени је зона сумрака или боље речено луд,збуњен ситуацуја суђена овим мојим трагањима. Најближи ми меч на аутосомалу и то најдужи блок од 65 цм нека странкиња. Писо сам јој мејл, видећемо има ли какво рационално објашњење...

Рационално је објашњење да има бар једног претка са наших простора. Често је то случај у тим поклапањима, код особа са страним именима и презименима. Ако на профилу имају приложено стабло то се може видјети и одмах. Да је нпр. Catherine а баба Танкосава и сл.

Ван мреже Romanijski

  • Познавалац
  • ******
  • Поруке: 783
  • Ја ратујем сам...
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #186 послато: Јун 24, 2022, 11:23:28 пре подне »
Мени је зона сумрака или боље речено луд,збуњен ситуацуја суђена овим мојим трагањима. Најближи ми меч на аутосомалу и то најдужи блок од 65 цм нека странкиња. Писо сам јој мејл, видећемо има ли какво рационално објашњење...
Да би ти била јаснија слика тестирај још оца и мајку  ако нису живи долазе у обзир као адекватна замјена њихова браћа или сестре. На МyHeritage постој одлична функција триангулације.
Тек кад имаш низ од двоје блиских тада си у могућности да раздвојиш ко ти је са које стране од непознатих. Ако урадиш и прве рођаке очеве и (или) мајчине  тада имаш могућност да спајаш покидане сегменте услед рекомбинације при стварању нове јединке (за ово мораш да будеш ИТ стручан или замолиш неког). Тако да са аутосомалним будеш у могућности да завириш доста дубље од оног што на први поглед нуди.
Ако при томе имаш и дубински Y ,,онда си на коњу".
Aко си радио преко ФТДНА у њиховој табели имаш човјечуљка то је низ за тебе и ту особу. Што је само дио ове претходне приче.
Што се тиче богатства база ту је МyHeritage неприкосновен, а нај слабији Livingdna.
Тако свима кои су радили аутосомални тест препоручујем да пребаце на МyHeritage.
Они кои имају претке кои су имали потомство из два брака су у још поволјнијој ситуацији да распетљају генетске правце...
« Последња измена: Јун 24, 2022, 11:28:57 пре подне Romanijski »

Ван мреже Exiled

  • Члан Друштва
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2394
  • ПХ908>А20333>FT14649>FT175994
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #187 послато: Јун 24, 2022, 11:25:26 пре подне »
Рационално је објашњење да има бар једног претка са наших простора. Често је то случај у тим поклапањима, код особа са страним именима и презименима. Ако на профилу имају приложено стабло то се може видјети и одмах. Да је нпр. Catherine а баба Танкосава и сл.
Само има мејладреса и то је то...знам да је стрико љети ишо у Матарушку бању ако није то незнам шта би друго било😉 Надам се да ће се јавити тек сам синоћ посло мејл..

Ван мреже Exiled

  • Члан Друштва
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2394
  • ПХ908>А20333>FT14649>FT175994
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #188 послато: Јун 24, 2022, 12:24:10 поподне »
Да би ти била јаснија слика тестирај још оца и мајку  ако нису живи долазе у обзир као адекватна замјена њихова браћа или сестре. На МyHeritage постој одлична функција триангулације.
Тек кад имаш низ од двоје блиских тада си у могућности да раздвојиш ко ти је са које стране од непознатих. Ако урадиш и прве рођаке очеве и (или) мајчине  тада имаш могућност да спајаш покидане сегменте услед рекомбинације при стварању нове јединке (за ово мораш да будеш ИТ стручан или замолиш неког). Тако да са аутосомалним будеш у могућности да завириш доста дубље од оног што на први поглед нуди.
Ако при томе имаш и дубински Y ,,онда си на коњу".
Aко си радио преко ФТДНА у њиховој табели имаш човјечуљка то је низ за тебе и ту особу. Што је само дио ове претходне приче.
Што се тиче богатства база ту је МyHeritage неприкосновен, а нај слабији Livingdna.
Тако свима кои су радили аутосомални тест препоручујем да пребаце на МyHeritage.
Они кои имају претке кои су имали потомство из два брака су у још поволјнијој ситуацији да распетљају генетске правце...
Хвала Романијски, тренутно ми звучи мало компликовано али заиста незнам ништа о аутосомалу. Требаће ми неко време да уђем у причу,гледаћу да пребацим податке и у друге базе...

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #189 послато: Јун 25, 2022, 12:07:50 пре подне »
Од свих сервиса Myheritage је можда и најсклонији лажим поклапањима, претеривању у дељеним сегментима и pileups зонама, тако да опрез.
Постоји разлог зашто други сервиси попут 23andme и Ancestry не допуштају постављање сирових податкака других сервиса, једноставно нису компатибилни по тестираним СНПс, а Myheritage то решава тако што сам дода (импутира) недостајуће СНП вредности, за које сматра да су највероватније. 
Леп пример је моја тетка, од 2090 поклапања, само 800 дели са родитељима својим.


Ван мреже Romanijski

  • Познавалац
  • ******
  • Поруке: 783
  • Ја ратујем сам...
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #190 послато: Јун 25, 2022, 07:12:25 пре подне »
Од свих сервиса Myheritage је можда и најсклонији лажим поклапањима, претеривању у дељеним сегментима и pileups зонама, тако да опрез.
Постоји разлог зашто други сервиси попут 23andme и Ancestry не допуштају постављање сирових податкака других сервиса, једноставно нису компатибилни по тестираним СНПс, а  то решава тако што сам дода (импутира) недостајуће СНП вредности, за које сматра да су највероватније. 
Леп пример је моја тетка, од 2090 поклапања, само 800 дели са родитељима својим.
Нећу се сложити са твојим објашњењем, из више разлога. Например вриједности су мање него у ФТДНА. Самим тим ја не видим ту додавање него одузимање. Други моменат испушташ из вида рекомбинацију. Од родитеља наслеђује се 50%, али коих то се никад не зна. Тако и два рођена брата могу да буду теоретски један другом не видљива јер их програм не препознаје. Али је зато чинјеница да они имају највећу базу корисника. Ја немам намјеру да заступам било који сервис. Само износим свој поглед кои је резултат 6 тестова пренесених са ФТДНА на Myheritage. Имам и ја меч са човјеком 123,7цМ али нас двојица немамо ни једну триангулацију што је онако баш чудно. Али то није аргумент да бих могао да кажем да дојау на резултате....

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #191 послато: Јул 03, 2022, 01:23:43 пре подне »
Интересантне коинциденције са мајчине стране. Повећан број поклапања са мајчине стране на острву Хиосу су поткрепљене BigY тестовима двојице Грка са Хиоса који су R1B-BY611 и имају истоветна поклапања (он Y ми аутосомална) као и тетка у региону Ресена (села Крани и Арвати) и Дибре.
« Последња измена: Јул 03, 2022, 01:25:34 пре подне НикПав »

Ван мреже Exiled

  • Члан Друштва
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2394
  • ПХ908>А20333>FT14649>FT175994
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #192 послато: Јул 17, 2022, 08:25:39 поподне »
Анализа аутосомала ме доведе у везу са Коњокрадом,како је он старином из Пошћења ђе су били и моји Савовићи па и није изненађење. Сад треба утврдити чија се нана заљубила😀.  Оно што је занимљиво је да кажу финско поријекло 8%, да су рекли шведско у реду, приписо би то P109 али ово ме мало избацило из калупа...

Ван мреже Exiled

  • Члан Друштва
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2394
  • ПХ908>А20333>FT14649>FT175994
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #193 послато: Јул 20, 2022, 07:40:00 поподне »
Анализа аутосомала ме доведе у везу са Коњокрадом,како је он старином из Пошћења ђе су били и моји Савовићи па и није изненађење. Сад треба утврдити чија се нана заљубила😀.  Оно што је занимљиво је да кажу финско поријекло 8%, да су рекли шведско у реду, приписо би то P109 али ово ме мало избацило из калупа...
Од 63 меча колко их имам међу Мађарима скоро половина има везе са презименом Хорват, а друго презиме које је знаковито је Фаркаш који би требали бити од Војнића по неким изворима. Нису ваљда свима који су долазили са хрватске стране давали презиме Хорват или Хроват,додуше ређе.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #194 послато: Јул 24, 2022, 12:15:58 поподне »
На основу аутосомалних поклапања тетака, баба, деде и мене са свих могућих сервиса, до сада сам утврдио да је велика вероватноћа да

-међу прецима имам Дробњаке (мислим да би то могли бити Зарићи из Вукасоваца) и
-род који слави Алимпија R1a-M458>A11460 (чукунбабини Кузмановићи из Бистрице славе ту славу, тетки се поклапања баш јављају у неким селима око Уба и на запад преко Осечине, где је овај род присутан).
Оно што остаје нејасно, али је очигледно је
-веза са Карађорђевићима,
-релативно ближа поклапања из Казанаца и Чарађа (најчешће презиме Говедарица), то је веза преко бабе опет нека
-присуство свих родова из Сукурућа и Вуксанлекића међу поклапањима (долазе преко Павловића, баба њих нема) и
-огроман број поклапања из Плава и Гусиња.

Мајчина страна је толко запетљана по свему судећи, да ни не покушавам да нађем неку законитост.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #195 послато: Јул 24, 2022, 09:41:34 поподне »
Трагом разноразних гроздова које моја аутосомална поклапања  формирају, наишао сам на интересантан чланак који би могао објаснити грозд око Бузауа и Трговишта.



https://movafaq.wordpress.com/2017/01/13/bulgari-gradinari-romania-s/

У српским изворима нисам нашао ништа о Србима из области Бузау, нигде се не спомињу.
По бугарским изворима, то су заправо Бугари.




Ван мреже Милан Петровић

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1076
  • I2-PH908 FT277965>Y93865>Y95760 Род Зорића
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #196 послато: Август 02, 2022, 10:54:58 поподне »
Да ли постоји сервис или сајт преко кога може да се анализира аутосомална днк уз помоћ vcf фајла?
Догодине у Холштајну!

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #197 послато: Август 05, 2022, 04:39:54 поподне »
Да ли постоји сервис или сајт преко кога може да се анализира аутосомална днк уз помоћ vcf фајла?

Gedmatch је раније прихватао VCF фајлове, нисам сигуран да ли их и даље прихвата.
Једно од решења би била конверзија у raw формат, знам да је могуће пребацити VCF у 23andme raw формат.

Ван мреже Милан Петровић

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1076
  • I2-PH908 FT277965>Y93865>Y95760 Род Зорића
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #198 послато: Август 05, 2022, 05:20:13 поподне »
Хвала Ник!
Догодине у Холштајну!

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #199 послато: Октобар 14, 2022, 08:16:44 поподне »
IBD резултати балканских народа

Срби из Србије


резултати из БиХ. овај с Русијом и Словенијом је Србин или Хрват из Сарајева


резултати из Хрватске: Срби


резултати из Хрватске: Хрвати
овај у доњем десном углу који добива само Словенију и Хрватску је из кајкавског подручја. Остали су из Далмације


Румуни


горњи ред: Албанац, Грк, Бугарин, Грк, Мађар
доњи ред: Македонац, Егејски Македонац, три резултата из ЦГ (Албанац, Муслиман, Србин из приморја)

Ван мреже Exiled

  • Члан Друштва
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2394
  • ПХ908>А20333>FT14649>FT175994
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #200 послато: Октобар 14, 2022, 08:31:22 поподне »
Има једна ствар која ме мало баца у недоумицу мада није толико ни круцијална но да је поменем,можда неко има слично искуство. Наиме, код једне компаније имам 10.5 цМ са Војнић Пурчарем а код друге компаније имам 12.5 цМ са Војнич Хајдуком. Питање је да ли ових 2.5 цМ можемо приписати компанијским мерилима или ово може бти разлика у евентуално једном снипу? Да напоменем да генерално са Војнићима сам на око 900 година, по Yfull процени.

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #201 послато: Октобар 14, 2022, 09:07:04 поподне »
Србин, отац Херцеговина, мајка Црна Гора


Србин, отац Дувно, мајка Куршумлија


Српкиња, Бања Лука


Србин, отац околина Прњавора, мајка Сарајевска регија


Србин, Котор Варош


Србин из Лике


Српкиња из Црне Горе (Црмница)


Српкиња из југоисточне Србије (јабланички и топлички округ)



Код Срба који имају прекодринске корене, често се срећу јача аутосомална поклапања на простору Западне Србије. И даље је доста интересантно да се и поред солидне покривености, Србима на мапи појављују пре Румунија и Грчка, него Албанија и Македонија. Ту углавном постоји једна аутосомална рупа. Вероватно јесте до узорка, пошто видим да се и Албанцима те области слабо јављају.

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #202 послато: Октобар 14, 2022, 09:09:56 поподне »
Има једна ствар која ме мало баца у недоумицу мада није толико ни круцијална но да је поменем,можда неко има слично искуство. Наиме, код једне компаније имам 10.5 цМ са Војнић Пурчарем а код друге компаније имам 12.5 цМ са Војнич Хајдуком. Питање је да ли ових 2.5 цМ можемо приписати компанијским мерилима или ово може бти разлика у евентуално једном снипу? Да напоменем да генерално са Војнићима сам на око 900 година, по Yfull процени.

аутосомална ДНК је јако нестабилна. веза родитељ-дијете може бити било која вриједност између 3330 и 3720 центиморгана:

https://www.yourdnaguide.com/scp

10-12 може стварно бити свашта. у овој конкретној ситуацији највјеровтаније сегмент заједничког претка тебе и ова два војнића који је остао очуван код све тројице.

да ли се поклапање с обојицом налази на истој позицији и хромозому?

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #203 послато: Октобар 14, 2022, 09:28:10 поподне »
Код Срба који имају прекодринске корене, често се срећу јача аутосомална поклапања на простору Западне Србије. И даље је доста интересантно да се и поред солидне покривености, Србима на мапи појављују пре Румунија и Грчка, него Албанија и Македонија. Ту углавном постоји једна аутосомална рупа. Вероватно јесте до узорка, пошто видим да се и Албанцима те области слабо јављају.

Мислим да је комбинација малог узорка, и тога што су подијелили Албанију, Македонију и ЦГ на премалене регије, поготово Македонију.

Поставићу касније резултате са MyHeritage , гдје 99% Срба добива везу са ЦГ, а са Бугарском и Румунијом готово нико.

Чини се 23andme да детектира неке везе из средњег вијека (Румунија, Пелопонез), а пропушта неке скорије (Црна Гора)

Ван мреже Exiled

  • Члан Друштва
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2394
  • ПХ908>А20333>FT14649>FT175994
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #204 послато: Октобар 14, 2022, 09:34:14 поподне »
аутосомална ДНК је јако нестабилна. веза родитељ-дијете може бити било која вриједност између 3330 и 3720 центиморгана:

https://www.yourdnaguide.com/scp

10-12 може стварно бити свашта. у овој конкретној ситуацији највјеровтаније сегмент заједничког претка тебе и ова два војнића који је остао очуван код све тројице.

да ли се поклапање с обојицом налази на истој позицији и хромозому?
То нисам  покушавао да проверим него сам узео као готову ствар по мушкој линији јер је то предањска ствар код Војнића,ради се само о шпиц надимку. У принципу сам и то мислио да нема велике важности. Можда би се могла извући нека математика пошто са стричевом унуком, од нјегове ћерке, делим 46 цМ и онда покушавам да направим слику од пре 900 година до данашњих дана. Да се разумемо, добро знам да је АС главобоља али се некако надам да може да искрсне нешто.

Ван мреже Exiled

  • Члан Друштва
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2394
  • ПХ908>А20333>FT14649>FT175994
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #205 послато: Октобар 14, 2022, 09:40:16 поподне »
Мислим да је комбинација малог узорка, и тога што су подијелили Албанију, Македонију и ЦГ на премалене регије, поготово Македонију.

Поставићу касније резултате са MyHeritage , гдје 99% Срба добива везу са ЦГ, а са Бугарском и Румунијом готово нико.

Чини се 23andme да детектира неке везе из средњег вијека (Румунија, Пелопонез), а пропушта неке скорије (Црна Гора)
А про по постотака, добијам више аутосомала у Хрватској него у Србији,Цг,и БиХ, заједно. Имота ме закла али немам прођу у комуникацији, игнор тотални. Додуше и прађедовска линија по баби  и по деди ми је блиска бунјевачким родовима и ту ми се стварају шумови...јако тешко за распетљати.

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #206 послато: Октобар 15, 2022, 11:37:18 пре подне »
На MyHeritage постоје 3 IBD кластера које добива 90% тестираних Срба:

општи јужнословенски:


Херцеговина, Црна гора, Западна Србија и Источна Босна, тј. Цвијићева динарска миграциона струја:


крајишки (добивају га и Срби из подручја далеко од Крајине)


ови су нешто рјеђи:

Црногорски кластер, поклапа се са Зетско-Рашким дијалектом, добивају га сви Црногорци, али и Срби из централне и западне Србије.


кластер муслимана Санџаклија, добивају га и неки Срби из тог подручја:


кластер Срба из Средње Босне. добивају га и Срби из Западне Србије, Срема, Славоније:

Ван мреже Ивица Јовановић

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 882
  • J-L70 > J-Z40772* mdDNA:HV-b15a
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #207 послато: Октобар 15, 2022, 11:44:39 пре подне »
Није лоше. Само овај општи јужнословенски кластер има неку јаку тачку тамо у Румунији где на једном широком простору живи 75% Мађара.
Милутин Бранковић, 4. ескадрон Коњичке дивизије. Крф 26.04.1916.
Сава Питић, 13. Пук. Острво Видo 24.01.1916.
Сима Мијуцић, 9. пешадијски пук. Браунау 1917.

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #208 послато: Октобар 15, 2022, 12:02:39 поподне »
Није лоше. Само овај општи јужнословенски кластер има неку јаку тачку тамо у Румунији где на једном широком простору живи 75% Мађара.

нема ту чврстих граница, имају и ови остали кластери неке насумичне концентрације по Европи, али је јасно која је главна скупина на коју се односе.

Иначе са Секељима и имамо неких веза, рецимо преко хаплогрупе N, па и неких грана I2 и R1а.

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #209 послато: Октобар 15, 2022, 12:30:06 поподне »
Покушао сам међу својим поклапањима пронаћи неке Србе који добивају Румунски, Бугарски или Грчки кластер, као што је случај за већину тестираних Срба на 23andme.

На MyHeritage је изгледа то доста рјеђи случај.

Румунију сам нашао да добивају, нпр. један Влах из источне Србије, Пироћанка, Војвођани из Баната и Срема.

Грчку добивају углавном они Срби који имају неку везу с Македонијом, обично заједно с Македонским кластером.

Бугарску нема скоро па нико међу мојим поклапањима.

Албанске кластере добивају Срби из зетско-рашке зоне, али и Војвођани.

Примијетио сам и неке западноевропске кластере (Италија, Аустрија, Њемачка), чега нема код 23andme. Опет најчешће код Војвођана, али зна се појавити и код тестираних из Шумадије или Босне.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #210 послато: Октобар 26, 2022, 01:45:22 поподне »
Покушао сам међу својим поклапањима пронаћи неке Србе који добивају Румунски, Бугарски или Грчки кластер, као што је случај за већину тестираних Срба на 23andme.

На MyHeritage је изгледа то доста рјеђи случај.

Код мене сви (сем бабе по оцу) имамо Румунију,
Грчку су добиле обе бабе и тетка по оцу, Бугарску само тетка по мајци а њени родитељи јок, а баба по мајци је добила Фландрију и западну Украјину, Молдавију и СИ Румунију, што су две групе које никад нисам срео код наших и Бугара.

Ван мреже Gorance

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 692
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #211 послато: Октобар 27, 2022, 01:05:50 поподне »
Код мене сви (сем бабе по оцу) имамо Румунију,
Грчку су добиле обе бабе и тетка по оцу, Бугарску само тетка по мајци а њени родитељи јок, а баба по мајци је добила Фландрију и западну Украјину, Молдавију и СИ Румунију, што су две групе које никад нисам срео код наших и Бугара.
Какав Oktoberfest. Шалим се,наравно. И мене чека Autosomal i mtdk, кад дође време.

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #212 послато: Октобар 28, 2022, 09:56:19 поподне »
Код мене сви (сем бабе по оцу) имамо Румунију,
Грчку су добиле обе бабе и тетка по оцу, Бугарску само тетка по мајци а њени родитељи јок, а баба по мајци је добила Фландрију и западну Украјину, Молдавију и СИ Румунију, што су две групе које никад нисам срео код наших и Бугара.

Они су сви из јужне Србије?
Видим Молдавију и Румунију код неких својих поклапања. Мислим да је та повезница преко Влаха/Румуна, евентуално српских исељеника у Новорусију.


Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #213 послато: Октобар 29, 2022, 02:03:48 пре подне »
Они су сви из јужне Србије?
Видим Молдавију и Румунију код неких својих поклапања. Мислим да је та повезница преко Влаха/Румуна, евентуално српских исељеника у Новорусију.

Нису сви, само ми је мајчина страна одоздо, очева је из Шумадије.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #214 послато: Октобар 30, 2022, 01:57:09 пре подне »
Какав Oktoberfest. Шалим се,наравно. И мене чека Autosomal i mtdk, кад дође време.

Имајући у виду моју подграну и подграну мајчиног оца, ништа ме не изненађује, али ме јако нервира што не могу да докучим шта је тачно у питању и што морам да сарађујем са више балканских ДНК пројеката, а то расплињавање на разне стране ме јако замара  :) Верујем да кад бих тестирао и фамилије мојих баба, прабаба и чукунбаба тек би била луда кућа.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #215 послато: Новембар 12, 2022, 05:44:59 пре подне »
Гледајући већину калкулатора базираних на Г25 координатама, сваки купи неко наслеђе са Блиског истока или Јемена и Саудијске Арабије.

Главни и један насумично изабран:




Target: nikola_scaled
Distance: 3.3390% / 0.03338988
47.0 Southern_European
45.6 Eastern_European
7.4 Arab_Egyptian_Levantine

Код мене та аутосомална поклапања заиста постоје. Са Блиског Истока и даље на исток.
А риђији сам (где је било риђе по бради, а имао сам наранџасте делове браде, сада је седо), остало се држи и светлији сам од већине овде, вероватно, са све овим очима  ;D
« Последња измена: Новембар 12, 2022, 05:55:12 пре подне НикПав »

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #216 послато: Децембар 15, 2022, 05:43:37 поподне »
Број мојих поклапања по држави (непотпуна листа), скалиран с бројем становника, бројем дијаспоре (јер се више тестирају), и ГДП-ом сваке државе:

Croatia3.05093644574076
BosniaHerzegovina2.84937339025858
Serbia2.28564894273697
Montenegro1.07428815016343
Macedonia0.965881050650002
Albania0.957147511998648
Romania0.822891470749909
Austria0.777032420247396
Bulgaria0.765300313229185
Greece0.756937718175148
Hungary0.693903742541354
Slovenia0.635093848752547
Ukraine0.584002646546144
Czechia0.572618340666156
Italy0.52395144328516
Poland0.433598938443894
Turkey0.360303760634958
Russia0.2236575390897
Germany0.216861491366398

Аустрија је на високој позицији због великог броја Срба или Хрвата који су као предачку локацију поставили Аустријско Царство или Аустроугарску. Све остало има смисла.

« Последња измена: Децембар 15, 2022, 05:46:24 поподне Никац »

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #217 послато: Децембар 15, 2022, 10:13:38 поподне »


ево сликовитог приказа, направљен помоћу https://www.mapchart.net/europe.html

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #218 послато: Децембар 15, 2022, 10:29:59 поподне »
Ево како до података о поријеклу за ваша поклапања на MyHeritage-у.

- под стабло>моје стабло, направите "лажно" породично стабло, и сваком претку ставите као мјесто рођења другу државу. ја сам то урадио само за државе источне и централне Европе и Балкана, јер ме оне занимају.

-сајт неће одмах учитати податке, треба му неколико дана.

-након тих неколико дана изаберите опцију: днк>подударања>филтери>има заједничко мјесто

-овако ћете добити информацију испод сваког поклапања, као на примјер:
 Места предака заједничка за вас и -- укључују Србија и Босна и Херцеговина.

-можете на дну странице поставити "Резултати по страници 50", копирати читаву страницу у неки текст едитор, и разврставати их.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #219 послато: Децембар 17, 2022, 04:18:08 пре подне »
Комбинована heatmap поклапања мојих тетака и мене. Сигурно је да има дупликата (дељених поклапања), укупно је обрађено преко 4500 поклапања. Гусиње и Подгорица према Тузима убедљиво доминирају. У питању су поклапања са Myheritage, Ancestry и 23andme.

« Последња измена: Децембар 17, 2022, 04:19:57 пре подне НикПав »

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #220 послато: Децембар 17, 2022, 10:19:42 поподне »
Одвојио сам чисто због лакше прегледности:

Искрено, не видим неку превелику разлику између ове две мапе. Док се Душан, Никац и ја међусобно ипак доста разликујемо. Можда Никац може да објасни како ово да посматрамо.

То су "локације" твојих аутосомалних поклпања.

Заправо, мјеста рођења њиховог најстаријег познатог претка по директној очевој и мајчиној линији. Исте оне које се користе у FTDNA-овим y-днк и мт-днк пројектима.

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #221 послато: Децембар 17, 2022, 10:41:28 поподне »
То су "локације" твојих аутосомалних поклпања.

Заправо, мјеста рођења њиховог најстаријег познатог претка по директној очевој и мајчиној линији. Исте оне које се користе у FTDNA-овим y-днк и мт-днк пројектима.

Дакле ове аутосомалне мапе са FTDNA, MH, итд. су заправо креиране на основу локација наших савремених аутосомалних рођака (локација њихових предака). Не показују нешто од чега смо ми саткани кроз дубљу историју. У пренесеном то негде дође на исто, али ипак се гледа из савремене визуре.

На основу овога могу да закључим да, када су аутосомалне мапе у питању, најреални приказ даје 23andMe. Тамо 90% Срба добија компоненту Balkan & Greece преко 95%. То једино има логике ако узмемо у обзир да највећи број Срба и има највише поклапања уназад 300 година управо на овим просторима.

Каква су ово FTDNA аутосомална поклапања Срба у Скандинавији, Великој Британији, итд. 

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #222 послато: Децембар 17, 2022, 10:48:46 поподне »
Треба имати у виду да већина ових наших поклапања на западу Европу потиче од појединаца који имају неког у породици са наших простора. То нпр. може бити само баба са мајчине стране па да се то већ региструје као аутосомално поклапање.

Са друге стране, поклапања на простору словенских земаља, гдје није било миграције наших људи у значајном броју у посљедњих педесетак година, могу бити индикативна.


Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #223 послато: Децембар 17, 2022, 10:52:44 поподне »
Треба имати у виду да већина ових наших поклапања на западу Европу потиче од појединаца који имају неког у породици са наших простора. То нпр. може бити само баба са мајчине стране па да се то већ региструје као аутосомално поклапање.

Са друге стране, поклапања на простору словенских земаља, гдје није било миграције наших људи у значајном броју у посљедњих педесетак година, могу бити индикативна.

Да, јасно ми је то. Зато кажем да су ове мапе заправо слика наших поклапања у виду западне дијаспоре (најчешће), а не некакав предачки аутосомални микс.

Са друге стране, чуди ме да 23andMe, као западна компанија, не даје сличне мапе, већ Балканци имају углавном балканска поклапања. Једино објашњење ми је да тамо има много више тестираних људи одавде, него на FTDNA. 

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #224 послато: Децембар 17, 2022, 11:07:42 поподне »
Дакле ове аутосомалне мапе са FTDNA, MH, итд. су заправо креиране на основу локација наших савремених аутосомалних рођака (локација њихових предака). Не показују нешто од чега смо ми саткани кроз дубљу историју. У пренесеном то негде дође на исто, али ипак се гледа из савремене визуре.

На основу овога могу да закључим да, када су аутосомалне мапе у питању, најреални приказ даје 23andMe. Тамо 90% Срба добија компоненту Balkan & Greece преко 95%. То једино има логике ако узмемо у обзир да највећи број Срба и има највише поклапања уназад 300 година управо на овим просторима.

Каква су ово FTDNA аутосомална поклапања Срба у Скандинавији, Великој Британији, итд.

Оно са 90% Балкана је admixture анализа, то је друго, нема везе са поклапањима.
најједноставније речено, 90% Балкана на 23andme значи да је 90% твоје днк словенско-старобалканска мјешавина (небитно у којем омјеру, зато га и Албанци и Срби могу имати 90-100%).

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #225 послато: Децембар 17, 2022, 11:16:12 поподне »
Оно са 90% Балкана је admixture анализа, то је друго, нема везе са поклапањима.

Зар мапе са FTDNA и MH нису исто то?

најједноставније речено, 90% Балкана на 23andme значи да је 90% твоје днк словенско-старобалканска мјешавина (небитно у којем омјеру, зато га и Албанци и Срби могу имати 90-100%).

Упоређујући конкретна поклапања на 23andMe са аутосомалном мапом, чини ми се да долазимо до сличног алгоритма(?). Или не користе исте методе FTDNA и 23andMe, остали.

Приметих да су Грци, Албанци, Македонци и Срби на 23andMe махом B&G +90%. С тим да се код Срба неретко у мањем проценту јавља и Источна Европе. Дакле и она је код Срба део неке те опште словенско-старобалканске мешавине. 

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #226 послато: Децембар 17, 2022, 11:22:54 поподне »
Што се тиче самих поклапања (мислим на људе с којима имамо поклапања) , 23andme дефинитивно има строжи алгоритам за филтрирање од осталих компанија. Филтрирају се лажна поклапања, али с њима и већина оних с којима имамо средњовјековне и старије везе (нпр. протословенске). На FTDNA и MyHeritage та старија поклапања за сада још увијек можемо видјети.

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #227 послато: Децембар 17, 2022, 11:49:36 поподне »
Зар мапе са FTDNA и MH нису исто то?

Упоређујући конкретна поклапања на 23andMe са аутосомалном мапом, чини ми се да долазимо до сличног алгоритма(?). Или не користе исте методе FTDNA и 23andMe, остали.

Приметих да су Грци, Албанци, Македонци и Срби на 23andMe махом B&G +90%. С тим да се код Срба неретко у мањем проценту јавља и Источна Европе. Дакле и она је код Срба део неке те опште словенско-старобалканске мешавине.

Двије су главне методе које сви користе: admixture и IBD.

admixture анализа је свака која садржи неке проценте у себи, тако је можеш препознати.
Ради се тако да се узме 100 Балканаца, 100 Скандинаваца, итд. , они се дефинишу као "популације". Затим се твој узорак убаци у алгоритам који одређује јеси ли чисти припадник неке од ових популација (онда добијеш 100%), или си мјешавина више њих.

IBD анализа је свака која се темељи на твојем сродству (заједничким центиморганима) с конкретним појединцима. Па их покушава некако филтрирати или "извући неки закључак" из њих. Она не може бити изражена у процентима.

сврха им је иста, одредити гдје су ти живјели преци.

Ево примјера с MyHeritage и 23andme . Заокружио сам оно што је IBD анализа, а не admixture.



Дакле, ова прецизнија регионална мјеста поријекла су одређена на темељу дијељења центиморгана с конкретним поклапањима, "рођацима", то је IBD.

Остатак анализе, ови проценти, су admixture анализа. То двоје нема везе једно с другим, може се вршити потпуно одвојено.
Некада су обије компаније имале само admixture анализу, без IBD. На FTDNA је још увијек тако.

Ова мапа с FTDNA није никаква анализа, то је само листа свих поклапања, без икаквог филтрирања, приказана на мапи.
« Последња измена: Децембар 17, 2022, 11:53:14 поподне Никац »

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #228 послато: Децембар 17, 2022, 11:54:53 поподне »
Дакле, ова прецизнија регионална мјеста поријекла су одређена на темељу дијељења центиморгана с конкретним поклапањима, "рођацима", то је IBD.

Остатак анализе, ови проценти, су admixture анализа. То двоје нема везе једно с другим, може се вршити потпуно одвојено.
Некада су обије компаније имале само admixture анализу, без IBD. На FTDNA је још увијек тако.

Ова мапа с FTDNA није никаква анализа, то је само листа свих поклапања, без икаквог филтрирања, приказана на мапи.

Како нема везе. На основу овога што си поделио, IBD је само детаљнији део admixture. Не могу се гледати одвојено заправо. 

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #229 послато: Децембар 18, 2022, 12:06:23 пре подне »
Како нема везе. На основу овога што си поделио, IBD је само детаљнији део admixture. Не могу се гледати одвојено заправо.

Па свакако има највише смисла кад се комбинују и једна и друга.
Само што је IBD алгоритам напреднији и "млађи", релативно скоро се почео користити у односу на admixture.

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #230 послато: Децембар 18, 2022, 12:45:35 пре подне »
ова студија сибирских народа, ако неког занима, извлачи максимум из IBD-а, показује шта се све може сазнати помоћу њега

https://www.researchgate.net/publication/322110176_Between_Lake_Baikal_and_the_Baltic_Sea_Genomic_history_of_the_gateway_to_Europe

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #231 послато: Децембар 18, 2022, 10:44:14 пре подне »
Па свакако има највише смисла кад се комбинују и једна и друга.
Само што је IBD алгоритам напреднији и "млађи", релативно скоро се почео користити у односу на admixture.

Сад сам нпр. проверио MyHeritage. Admixture мапа је заправо у уској вези са конкретним поклапањима. То се може проверити тако што се оде на DNA matches, па кроз опцију Filters проверити која поклапања ти долазе преко које компоненте. Проценат конкретних поклапња одговара ооном са мапе.

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #232 послато: Децембар 18, 2022, 11:13:13 пре подне »
Сад сам нпр. проверио MyHeritage. Admixture мапа је заправо у уској вези са конкретним поклапањима. То се може проверити тако што се оде на DNA matches, па кроз опцију Filters проверити која поклапања ти долазе преко које компоненте. Проценат конкретних поклапња одговара ооном са мапе.
То је филтрирање поклапања по компонентама које они добивају у својим резултатима. У том филтеру Нпр. Можеш видјети сва поклапања која имају бар мало Ашкенази компоненте, иако је ти сам немаш.

Проценти се рачунају на темељу 5000 референтних узорака:

MyHeritage calculates Ethnicity Estimates by comparing your DNA to that of the 5000 participants in the Founder Populations project, whose family trees show consistent ancestry from the same region or ethnicity going back many generations.

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #233 послато: Децембар 18, 2022, 11:19:53 пре подне »
То је филтрирање поклапања по компонентама које они добивају у својим резултатима. У том филтеру Нпр. Можеш видјети сва поклапања која имају бар мало Ашкенази компоненте, иако је ти сам немаш.

Проценти се рачунају на темељу 5000 референтних узорака:

MyHeritage calculates Ethnicity Estimates by comparing your DNA to that of the 5000 participants in the Founder Populations project, whose family trees show consistent ancestry from the same region or ethnicity going back many generations.

Али чини ми се да се проценат тих поклапања поклапа са оним на мапи. То написах због оне констатације да admixture мапа нема везе са конкретним поклапањима. У случају 23andMe и MyHeritage се чини да ипак има.

Имају та поклапања везе и са мапом на MyOrigins, што смо могли видети јуче, само се темеље на нешто другачијој ввези, колико сам схватио.

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #234 послато: Децембар 18, 2022, 11:29:48 пре подне »
Детаљније моје две најјаче компоненте

Southern Europe (Italian Peninsula 35% + Greece & Balkans 11%)


Eastern Europe (West Slavic 50%)



Ван мреже ZO

  • Члан Друштва
  • Помоћник
  • *****
  • Поруке: 161
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #235 послато: Децембар 18, 2022, 02:04:32 поподне »
Моја шира слика поклапања.



зумирано



Занима ме ова Шпанија.

« Последња измена: Децембар 18, 2022, 02:12:22 поподне ZO »

Ван мреже ZO

  • Члан Друштва
  • Помоћник
  • *****
  • Поруке: 161
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #236 послато: Децембар 18, 2022, 02:17:58 поподне »
Са овима немам никакве повезнице преко Балкана. Мушке линије су Е и нека Р1б.


Ван мреже Ивица Јовановић

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 882
  • J-L70 > J-Z40772* mdDNA:HV-b15a
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #237 послато: Децембар 18, 2022, 04:02:12 поподне »




Malo po bivšoj Jugi. Interesantno je da ovo što imam poklapanja po Srbiji i Bosni muškarci su u 80% slučajeva J2.
Милутин Бранковић, 4. ескадрон Коњичке дивизије. Крф 26.04.1916.
Сава Питић, 13. Пук. Острво Видo 24.01.1916.
Сима Мијуцић, 9. пешадијски пук. Браунау 1917.

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #238 послато: Децембар 18, 2022, 04:53:07 поподне »
Детаљније моје две најјаче компоненте

Southern Europe (Italian Peninsula 35% + Greece & Balkans 11%)

Eastern Europe (West Slavic 50%)


Ту се управо види да нема везе. Поклапања су ти најјача на западном Балкану, а њихова admixture анализа те моделира највећим дијелом као микс Италијана и Пољака, нигдје везе.

У Италији имаш само неколико поклапања с Молижанима и сродним групама. Ја их имам још и много више од тебе, а имам 0% италијанске компоненте.

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #239 послато: Децембар 18, 2022, 05:36:00 поподне »
Не измишљам ја ово, то су ствари које сам прочитао на на њиховим FAQ страницама.

с 23andme сајта:

How we calculate your ancestral breakdown (admixture анализа)
To determine your ancestral breakdown, we use an algorithm that individually looks at short pieces of DNA across your genome. We compare each piece to DNA from reference populations from around the world

ово су ти референтни узорци, и детаљнији приказ за Европу. има их укупно 14,812



How we match you to genetic groups (IBD анализа)
...To determine these results, we identify groups of people with known and shared ancestry, based on their DNA and reported ancestor information. These individuals act as a reference who represent specific ethnic and ethnolinguistic groups. With over 400,000 reference individuals, we can identify over 2000 different regions and genetic groups around the world. Then, to match you to a genetic group, we look for identical pieces of DNA that you have in common with the reference individuals. As our customer database expands, the number of reference individuals and genetic groups will continue to grow, enabling new ancestry insights for all customers.

ово су други узорци (има их 400,000) и други начин рачунања.

То су заправо њихове муштерије (customer database), које можеш видјети и у својим поклапањима.

Када се тестираш код њих, ако су ти оба дједа и бабе рођена у истој административној јединици, и ако даш пристанак за то, твој узорак се користи за IBD анализу осталих тестираних.
Можеш донирати свој узорак и за admixture анализу. Само што је то учинило много мање људи.

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #240 послато: Децембар 18, 2022, 06:05:27 поподне »
Ту се управо види да нема везе. Поклапања су ти најјача на западном Балкану, а њихова admixture анализа те моделира највећим дијелом као микс Италијана и Пољака, нигдје везе.

У Италији имаш само неколико поклапања с Молижанима и сродним групама. Ја их имам још и много више од тебе, а имам 0% италијанске компоненте.

Мислио сам више на то да се и ови са FTDNA такође труде да оном мапом уоквире већи део ових конкретних поклапања. Иако је систем сличнији оном са GEDmatch калкулатора и има за циљ да прикаже оквирно какав смо ми аутосомални микс. С тим да су и сама поклапања чини се знатно шира, па иду и далеко ван Балкана.

Судећи по овим објашњењима, MH и 23andMe такође не би требало да имају аутосомалне мапе сличне поклапањима, мада се чини да је то више случај него код FTDNA. Посебно код 23andMe, док MH подсећа на неки микс ова два калкулатора.

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #241 послато: Децембар 18, 2022, 08:04:32 поподне »
Мислио сам више на то да се и ови са FTDNA такође труде да оном мапом уоквире већи део ових конкретних поклапања. Иако је систем сличнији оном са GEDmatch калкулатора и има за циљ да прикаже оквирно какав смо ми аутосомални микс. С тим да су и сама поклапања чини се знатно шира, па иду и далеко ван Балкана.

Судећи по овим објашњењима, MH и 23andMe такође не би требало да имају аутосомалне мапе сличне поклапањима, мада се чини да је то више случај него код FTDNA. Посебно код 23andMe, док MH подсећа на неки микс ова два калкулатора.

23andme и MyHeritage имају сјеверне Балканце, односно Србе међу референтним популацијама, па њихови admixture резултати имају више смисла за нас. ФТДНА нема, имају само Грке и Бугаре.

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #242 послато: Децембар 18, 2022, 08:14:55 поподне »
MyHeritage calculates Ethnicity Estimates by comparing your DNA to that of the 5000 participants in the Founder Populations project, whose family trees show consistent ancestry from the same region or ethnicity going back many generations.

И на MH Србима може да се појави Велика Британија на мапи, али и та веза претпостављам иде преко наше дијаспоре, тј. не верујем да су од свих популација нашли Ирце или Енглезе као блиске Србима.

Ван мреже Душан

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 312
  • I2a1b-PH908
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #243 послато: Децембар 18, 2022, 09:13:37 поподне »
Admixture мапа нема никакве везе са тим поклапањима у FTDNA. 

Питање је јесу ли сва та поклапања реална.

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #244 послато: Децембар 18, 2022, 09:17:35 поподне »
Admixture мапа нема никакве везе са тим поклапањима у FTDNA. 

Питање је јесу ли сва та поклапања реална.

На FTDNA онда нису реални ни мапа ни поклапања. :D

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #245 послато: Децембар 18, 2022, 09:18:58 поподне »
И на MH Србима може да се појави Велика Британија на мапи, али и та веза претпостављам иде преко наше дијаспоре, тј. не верујем да су од свих популација нашли Ирце или Енглезе као блиске Србима.

тешко да међу само 5000 референтних узорака има већи број Британаца српског поријекла

Та Британија је неко старије насљеђе, то добивају они који и на G25 или гедмечу имају јачи западноевропски утицај.

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #246 послато: Децембар 18, 2022, 09:24:07 поподне »
Admixture мапа нема никакве везе са тим поклапањима у FTDNA. 

Питање је јесу ли сва та поклапања реална.

Према ономе што је Никац написао, admixture не би требало да има везе ни са поклапањима и на 23andMe/MH, само што се тамо поклапања са мапом кудикамо више "прате".

Мени додуше још увек није јасно како немају везе (морају имати), пошто нам та поклапања заправо и говоре одакле имамо највише уплива.
« Последња измена: Децембар 18, 2022, 09:59:00 поподне Небојша »

Ван мреже Душан

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 312
  • I2a1b-PH908
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #247 послато: Децембар 18, 2022, 09:26:58 поподне »
На FTDNA онда нису реални ни мапа ни поклапања. :D

Мапа можда донекле јесте само као модел, показује како наша аутосомална слика може да разложи на мање целине.

Тако рецимо мој резултат може да се моделује као 45% Бугарин/Тракијски Грк, 6% Италијан, 23% Пољак, 16% Рус и 11% Мађар.



Те популације су у оптицају и на Гедмеч калкулаторима.


А ова поклапања по Британији и Скандинавији су научна фантастика.


Ван мреже Exiled

  • Члан Друштва
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2394
  • ПХ908>А20333>FT14649>FT175994
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #248 послато: Децембар 18, 2022, 09:28:40 поподне »
тешко да међу само 5000 референтних узорака има већи број Британаца српског поријекла

Та Британија је неко старије насљеђе, то добивају они који и на G25 или гедмечу имају јачи западноевропски утицај.
Па и није баш тако што се тиче Британије, ево моја митохондрија H17 све сами Скандинавци и Брити...мој случај није правило али само кажем да ситуација није баш проста за објаснити.

Ван мреже Душан

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 312
  • I2a1b-PH908
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #249 послато: Децембар 18, 2022, 09:32:17 поподне »
Иначе мапе FTDNA 2.0 су имале више смисла од ових.

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #250 послато: Децембар 18, 2022, 09:33:26 поподне »
Па и није баш тако што се тиче Британије, ево моја митохондрија H17 све сами Скандинавци и Брити...мој случај није правило али само кажем да ситуација није баш проста за објаснити.

Имао сам исту дилему када сам сазнао mtDNA V1a и приметио да ми се по калкулаторима у неком проценту 2-5% јављају Скандинавија и Финска. Ова митохондијална је најчашћа управо на том простору. Али нисам сигуран да аутосомални пресеци иду тако далеко у прошлост.

Ван мреже Exiled

  • Члан Друштва
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2394
  • ПХ908>А20333>FT14649>FT175994
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #251 послато: Децембар 18, 2022, 09:38:57 поподне »
Имао сам исту дилему када сам сазнао mtDNA V1a и приметио да ми се по калкулаторима у неком проценту 2-5% јављају Скандинавија и Финска. Ова митохондијална је најчашћа управо на том простору. Али нисам сигуран да аутосомални пресеци иду тако далеко у прошлост.
То јесте и највећа цака која нас баца у лутање што нисмо сигурни колко АС дубоко иде и одакле прикупља шумове. Моје уверење је да је АС чиста комерцијала и зато се превише и не трудим да проникнем у "тајне". Испратим нове мечеве направим неку своју пројекцију могуће везе и то је то. Може да се изроди неко фино откриће али треба чини ми се и среће имати.

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #252 послато: Децембар 18, 2022, 09:50:23 поподне »
Према ономе што је Никац написао, admixture не би требало да има везе ни са поклапањима и на 23andMe/MH, само што се тамо поклапања са мапом кудикамо више "прате".

Мени додуше још увек није јасно како немају везе (морају имати), пошто нам та поклапања заправо и говоре одакле имамо највише уплива.

поклапања се одређују на темељу IBD сегмената. То је дугачки одсјечак ДНК који је идентичан код два човјека, па је онда вјероватно наслијеђен од заједничког претка.

admixture је другачији. ту се гледају фреквенције алела. Нпр. на узроку од 600 "Балканца", 75.23% их носи алел G на позицији 23454. Ти рецимо такође имаш G на тој позицији, дакле, ту имаш добро поклапање.
и тако за неколико стотина хиљада алела, наравно уз неке компликованије формуле.
« Последња измена: Децембар 18, 2022, 09:58:50 поподне Небојша »

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #253 послато: Децембар 18, 2022, 10:05:04 поподне »
поклапања се одређују на темељу IBD сегмената. То је дугачки одсјечак ДНК који је идентичан код два човјека, па је онда вјероватно наслијеђен од заједничког претка.

admixture је другачији. ту се гледају фреквенције алела. Нпр. на узроку од 600 "Балканца", 75.23% их носи алел G на позицији 23454. Ти рецимо такође имаш G на тој позицији, дакле, ту имаш добро поклапање.
и тако за неколико стотина хиљада алела, наравно уз неке компликованије формуле.

Ово звучи логично.

Међутим, тек онда поклапања са FTDNA (Ирска, Шкотска), немају смисла, пошто са њима сигурно не делимо претке уназад 300 година (колико је релевантно за просечан аутосомал). Могу да схватим једино ако сама база нагиње више западу, а нема довољно Балканаца, па је то неки ехо наших даљих поклапања.
« Последња измена: Децембар 18, 2022, 10:18:49 поподне Небојша »

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #254 послато: Децембар 19, 2022, 10:15:57 пре подне »
Ово звучи логично.

Међутим, тек онда поклапања са FTDNA (Ирска, Шкотска), немају смисла, пошто са њима сигурно не делимо претке уназад 300 година (колико је релевантно за просечан аутосомал). Могу да схватим једино ако сама база нагиње више западу, а нема довољно Балканаца, па је то неки ехо наших даљих поклапања.

Постоје те "pile up" регије на хромозомима које се не би смјеле користити за одређивање поклапања, а FTDNA и MyHeritage их користе, већ је било говора о томе. Само 23andme их филтрира.

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #255 послато: Децембар 20, 2022, 11:10:31 пре подне »
Ово су сва моја поклапања са 18 ЦМ или више.
узео сам 18 као границу, зато што на 17 већ имам неке који су повезани с миграцијама Балканаца у јужну Италију, које су се десиле у 15/16 вијеку.





« Последња измена: Децембар 20, 2022, 11:16:19 пре подне Никац »

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #256 послато: Децембар 20, 2022, 01:01:53 поподне »
ево и heatmape:



израђена помоћу сајта: http://www.heatmapper.ca/geocoordinate/

Ван мреже Ивица Јовановић

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 882
  • J-L70 > J-Z40772* mdDNA:HV-b15a
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #257 послато: Децембар 20, 2022, 01:33:24 поподне »
Никац, шта си то аплоадовао (Select Data File) да би добио ову последњу топлотну мапу?
Милутин Бранковић, 4. ескадрон Коњичке дивизије. Крф 26.04.1916.
Сава Питић, 13. Пук. Острво Видo 24.01.1916.
Сима Мијуцић, 9. пешадијски пук. Браунау 1917.

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #258 послато: Децембар 20, 2022, 01:47:28 поподне »
Никац, шта си то аплоадовао (Select Data File) да би добио ову последњу топлотну мапу?

prvo moraš pomoću ovog alata manuelno staviti poklapanja na mapu, jedno po jedno : https://www.google.com/maps/d/

zatim klikni na ove tri tačkice pokraj sloja/layer 1, i izvezi/export podatke u CSV formatu.

CSV format izgleda ovako:

WKT,naziv,opis
"POINT (18.3816407 43.8402114)",Tačka 1,
"POINT (15.8509498 43.9530637)",Tačka 4,

trebaš ga preoblikovati u ovo, pomoću text editora i excela:

Longitude   Latitude   Value
18.3816407   43.8402114   1
15.8509498   43.9530637   1

prvi red mora biti  "Longitude   Latitude   Value", u zadnjoj koloni "1" za sve tačke, vrijednosti razdvojene tab-om
i takav fajl možeš uploadovati na heatmapper.

Ван мреже Ивица Јовановић

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 882
  • J-L70 > J-Z40772* mdDNA:HV-b15a
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #259 послато: Децембар 20, 2022, 02:40:41 поподне »
Neka, što bi rekli u mom kraju neka ću trpim  ;D
Милутин Бранковић, 4. ескадрон Коњичке дивизије. Крф 26.04.1916.
Сава Питић, 13. Пук. Острво Видo 24.01.1916.
Сима Мијуцић, 9. пешадијски пук. Браунау 1917.

Ван мреже Ивица Јовановић

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 882
  • J-L70 > J-Z40772* mdDNA:HV-b15a
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #260 послато: Децембар 20, 2022, 04:34:50 поподне »
Не знам да ли има неке везе, али на фтДНА Compare Origins нема ни једне друге групе до Ј и Р1а. Имам двојицу О, по једног I-Z2338 и I-M253. Чак и ова екипа горе по балтику и остарвима је или Ј или Р1а.
Милутин Бранковић, 4. ескадрон Коњичке дивизије. Крф 26.04.1916.
Сава Питић, 13. Пук. Острво Видo 24.01.1916.
Сима Мијуцић, 9. пешадијски пук. Браунау 1917.

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #261 послато: Децембар 20, 2022, 05:37:46 поподне »
Neka, što bi rekli u mom kraju neka ću trpim  ;D

Možeš ti samo ponabadati ove lokacije na gugl mapi, zbilja nije komplikovano, a ja da ti uradim ovo ostalo, minuta posla

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #262 послато: Децембар 20, 2022, 06:43:48 поподне »
Никац, да ли си узимао као границу 18цм укупно или највећи комад да је 18цм?

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #263 послато: Децембар 20, 2022, 07:37:58 поподне »
Никац, да ли си узимао као границу 18цм укупно или највећи комад да је 18цм?
Ukupno

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #264 послато: Децембар 20, 2022, 09:11:48 поподне »
Одлучио сам се да мапирам само поклапања са 23andme и Ancestry до 18цм, да бих показао колико је мало ових чудних небалканских поклапања. То је дефинитивно нека бољка МХ и ФТДНА алгоритма. Туфна у Буџаку у Украјини су Бугари.




Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #265 послато: Децембар 20, 2022, 09:26:38 поподне »
Како сте одређивали рођаке на мапи ако је поставио 4 локације различите код предака (све линије), нпр на 23andMe? Или имате тестиране и родитеље, па на основу тога можете да закључите са које тачно стране долази која линија?

Нпр. ако имаш са неким поклапање на 23andMe (али и осталим сајтовима), он има 4 основне предачке линије. Нпр. деда по оцу Лика, баба по оцу Шумадија, деда по мајци Срем, итд. Не можеш уносити све 4 тачке, пошто си вероватно повезан преко једне линије са њим.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #266 послато: Децембар 20, 2022, 09:47:18 поподне »
Како сте одређивали рођаке на мапи ако је поставио 4 локације различите код предака (све линије), нпр на 23andMe? Или имате тестиране и родитеље, па на основу тога можете да закључите са које тачно стране долази која линија?

Нпр. ако имаш са неким поклапање на 23andMe (али и осталим сајтовима), он има 4 основне предачке линије. Нпр. деда по оцу Лика, баба по оцу Шумадија, деда по мајци Срем, итд. Не можеш уносити све 4 тачке, пошто си вероватно повезан преко једне линије са њим.

Ако су из крајева одакле су моји то увек прво уписујем, ако су из крајева где немам никог или прескочим или, уколико имам грозд поклапања у тој зони, ставим то.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #267 послато: Децембар 20, 2022, 11:18:00 поподне »
Тетка по мајци, опет само 23andme и Ancestry.

Скромније, али тачније од овог мислим да није могло. Деда и она на МХ добијају Црну Гору, о томе још нисам успео ништа да сазнам.





Тетка по оцу ће већ бити проблем, јер има више поклапања од нас.

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #268 послато: Децембар 21, 2022, 12:22:56 пре подне »
Како сте одређивали рођаке на мапи ако је поставио 4 локације различите код предака (све линије), нпр на 23andMe? Или имате тестиране и родитеље, па на основу тога можете да закључите са које тачно стране долази која линија?

Нпр. ако имаш са неким поклапање на 23andMe (али и осталим сајтовима), он има 4 основне предачке линије. Нпр. деда по оцу Лика, баба по оцу Шумадија, деда по мајци Срем, итд. Не можеш уносити све 4 тачке, пошто си вероватно повезан преко једне линије са њим.
По мом искуству и нема много таквих случајева. Али тамо гдје је тешко одредити, као у тој ситуацији с Ликом, Сремом, и Шумадијом, можеш га или не унијети, или унијети све 4 локације. Па онда нпр. у Лици нађеш још 10 поклапања које ће створити хотспот заједно с овим, а ова локација у Срему ће остати усамљена, па неће кварити општу слику.

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #269 послато: Децембар 21, 2022, 12:53:41 пре подне »
Одлучио сам се да мапирам само поклапања са 23andme и Ancestry до 18цм, да бих показао колико је мало ових чудних небалканских поклапања. То је дефинитивно нека бољка МХ и ФТДНА алгоритма. Туфна у Буџаку у Украјини су Бугари.

Видим да ти имаш ове јужне италијане и на 18 cm, па ми теорија донекле пада у воду.
Али по овим по овим твојим мапама, поготово за тетку, ипак се чини да је баш негдје око 18 cm граница за "recent ancestry" (око 400 година?)

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #270 послато: Децембар 21, 2022, 12:59:15 пре подне »
Видим да ти имаш ове јужне италијане и на 18 cm, па ми теорија донекле пада у воду.
Али по овим по овим твојим мапама, поготово за тетку, ипак се чини да је баш негдје око 18 cm граница за "recent ancestry" (око 400 година?)

Не знам шта бих рекао Никац, можда је изолованост и међусобни бракови донекле допринело циркулацији истих гена код њих, а можда је и 18цм та нека граница.

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #271 послато: Децембар 21, 2022, 01:52:31 поподне »
Мапа најближих днк рођака са 23andMe (од 23cM на горе).

плаво: Срби
црвено: Хрвати
црно: Немци/Аустријанци
жуто: Бугари
зелено: Бошњаци
браон: Албанци
наранџасто: Мађари




Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #272 послато: Децембар 21, 2022, 02:08:03 поподне »
Мапа најближих днк рођака са 23andMe (од 23cM на горе).

плаво: Срби
црвено: Хрвати
црно: Немци/Аустријанци
жуто: Бугари
зелено: Бошњаци
браон: Албанци
наранџасто: Мађари





Иако admixture мапа не би требало да има везе са ДНК поклапањима, мени се чини да се на 23andMe (бар код мене) то доста поклапа. Посебно када се оде на детаљније регије у Хрватској (Далмација, Лика).

То је вероватно добро, с обзиром да се, колико сам схватио, за admixture користи потпуно независан узорак.

Ancestry Composition


Ван мреже Ивица Јовановић

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 882
  • J-L70 > J-Z40772* mdDNA:HV-b15a
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #273 послато: Децембар 21, 2022, 02:43:00 поподне »
Ovo je kod tebe izgleda ispravno, ako ne gresim ti i jesi poreklom iz tog grozda tu oko bosanske krajine i rsk. Moram da probam 23andme, cuo sam od jednog dobrog coveka da tamo ima mnogo nasih ljudi.
Милутин Бранковић, 4. ескадрон Коњичке дивизије. Крф 26.04.1916.
Сава Питић, 13. Пук. Острво Видo 24.01.1916.
Сима Мијуцић, 9. пешадијски пук. Браунау 1917.

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #274 послато: Децембар 21, 2022, 02:59:39 поподне »
Иако admixture мапа не би требало да има везе са ДНК поклапањима, мени се чини да се на 23andMe (бар код мене) то доста поклапа. Посебно када се оде на детаљније регије у Хрватској (Далмација, Лика).

То је вероватно добро, с обзиром да се, колико сам схватио, за admixture користи потпуно независан узорак.

Ancestry Composition



Ove mape s 23andme i jesu IBD, tj. gdje su ti koncentrisani bliski rođaci u onoj bazi od 400,000 ljudi

Admixture ima uglavnom nadnacionalne "komponente" (Balkan, istočna Evropa) i računa se uvijek u procentima

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #275 послато: Децембар 21, 2022, 03:12:48 поподне »
Ovo je kod tebe izgleda ispravno, ako ne gresim ti i jesi poreklom iz tog grozda tu oko bosanske krajine i rsk. Moram da probam 23andme, cuo sam od jednog dobrog coveka da tamo ima mnogo nasih ljudi.

Имам и Баната (Нецми) и Горње Пчиње, што се такође види на овој мапи. Добар је 23andMe, али сам ја само ближе генетичке рођаке издвајао. Било би занимљиво направити ово са свим рођацима. Добила би се шира, али вероватно и не тако прецизна слика.

Оно што је велики проблем, је то што и међу ближим днк рођацима има доста странаца који су оставили само своју локацију у Америци, или Немачкој. Има међу ближима и доста Срба који су оставили само име и презиме што, уз аутосомални пресек, није довољно да се открије одакле тачно долази ваша веза.

Питање је да ли би се слика променила са више тестираних (слабије генетичке везе), вероватно не превише.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #276 послато: Децембар 22, 2022, 07:41:26 пре подне »
Тетка по оцу. Има нечега у нашој причици, време ће, надам се, показати шта се ту тачно десило. За сада се чини да би се прича о Узуновићима који су примили Ислам па се вратили, могла применити и на нас, пошто сви славимо другачије славе:



« Последња измена: Децембар 22, 2022, 07:45:37 пре подне НикПав »

Ван мреже Ивица Јовановић

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 882
  • J-L70 > J-Z40772* mdDNA:HV-b15a
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #277 послато: Децембар 23, 2022, 10:44:49 пре подне »


U odnosu na vas ostale malo Balkana. Ovo sto imamo je taj grozd juzno od Vidina (gde ima dosta vlaha prim. aut.), onda ovo oko Krajove. Ono sto je cudno je veliki broj poklapanja u severnoj Rumuniji (i severnije od toga sto nije prikazano na ovoj mapi). Na zapadnom Balkanu imam samo izolovane slucajeve (prezimena Krič, Kričković, Lakić itd. i 90% njih je j-M205). Probacu sa mapom sa MyHeritage, mislim da cemo zbog broja testiranih sa Balkana dobiti jasniju sliku. Mada, evo gledam upravo, realno to je tu negde samo ima vise testiranih pojedinaca u tim epicentrima.
Милутин Бранковић, 4. ескадрон Коњичке дивизије. Крф 26.04.1916.
Сава Питић, 13. Пук. Острво Видo 24.01.1916.
Сима Мијуцић, 9. пешадијски пук. Браунау 1917.

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #278 послато: Децембар 23, 2022, 02:42:24 поподне »


U odnosu na vas ostale malo Balkana. Ovo sto imamo je taj grozd juzno od Vidina (gde ima dosta vlaha prim. aut.), onda ovo oko Krajove. Ono sto je cudno je veliki broj poklapanja u severnoj Rumuniji (i severnije od toga sto nije prikazano na ovoj mapi). Na zapadnom Balkanu imam samo izolovane slucajeve (prezimena Krič, Kričković, Lakić itd. i 90% njih je j-M205). Probacu sa mapom sa MyHeritage, mislim da cemo zbog broja testiranih sa Balkana dobiti jasniju sliku. Mada, evo gledam upravo, realno to je tu negde samo ima vise testiranih pojedinaca u tim epicentrima.

Да ли ти је ово са FTDNA, или укупно FTDNA + MyHeritage. Искрено, мислим да то које су ти конкретно Y хаплогрупе аутосомална поклапања у овом случају нема превише везе.  :D


Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #279 послато: Децембар 23, 2022, 03:00:08 поподне »
Мапа најближих днк рођака са 23andMe (од 23cM на горе).

плаво: Срби
црвено: Хрвати
црно: Немци/Аустријанци
жуто: Бугари
зелено: Бошњаци
браон: Албанци
наранџасто: Мађари





Издвојио сам и најближе аутосомалне рођаке са MH, како би упоредио са 23andMe. Чини се најпре да на MH има више оних блиских и релативно блиских поклапања. На FTDNA има најмање блиских рођака, самим тим и више простора за лажна поклапања. Она сигурно постоје и на MH/23andMe, али их пре свега треба тражити међу удаљенијим рођацима.

Згодно је што MH има нешто детаљнију admixture мапу за сваког појединца, па је то некад добар траг у откривању порекла тестираног из поклапања. Такође, често су ту породична стабла, породична презимена, локације.

плаво: Срби
црвено: Хрвати
црно: Немци и Аустријанци
жуто: Бугари
зелено: Бошњаци
браон: Албанци
наранџасто: Мађари
сиво: Македонци
светлобраон: Пољаци и Словаци



У конкретно мом случају, резултати се доста поклапају. Мапа се поклапа и са оним што MyHeritage одређује преко тзв. крајишког кластера.



Код 23andMe најближи днк рођаци јављају се на простору Подгрмеча и Поткозарја, док су на MyHeritage најближа поклапња на простору Лике (околина Зрмање), околине Книна, Унца и такође Подгрмеча. Треба узети у обзир да се Крајишници знатно чешће тестирају у односу на остале Србе, али резултати свакако имају смисла.

Ван мреже Ивица Јовановић

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 882
  • J-L70 > J-Z40772* mdDNA:HV-b15a
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #280 послато: Децембар 23, 2022, 03:23:33 поподне »
Samo ftDNA. Znam da nema veze nego mi je bilo zanimljivo da su ti zapadno od Drine ljudi sa tom grupom. Napravio sam csv sa poklapanjima sa myheritage, ima ih mnogo vise. Poslao sam Nikcu, pa kada uradi uradi.
Милутин Бранковић, 4. ескадрон Коњичке дивизије. Крф 26.04.1916.
Сава Питић, 13. Пук. Острво Видo 24.01.1916.
Сима Мијуцић, 9. пешадијски пук. Браунау 1917.

Ван мреже Ивица Јовановић

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 882
  • J-L70 > J-Z40772* mdDNA:HV-b15a
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #281 послато: Децембар 24, 2022, 12:25:15 пре подне »


Ovo su poklapanja ftDNA+MyHeritage
Милутин Бранковић, 4. ескадрон Коњичке дивизије. Крф 26.04.1916.
Сава Питић, 13. Пук. Острво Видo 24.01.1916.
Сима Мијуцић, 9. пешадијски пук. Браунау 1917.

Ван мреже Exiled

  • Члан Друштва
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2394
  • ПХ908>А20333>FT14649>FT175994
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #282 послато: Јануар 01, 2023, 08:32:40 поподне »
Молим вас да ми наведете број ваших подударања у Мађарској. Ја их имам 69 и то све Мађари, један има који није него је само по пребивалишту. Баш ме занима како наши људи стоје са Мађарима.

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #283 послато: Јануар 01, 2023, 09:30:26 поподне »
Молим вас да ми наведете број ваших подударања у Мађарској. Ја их имам 69 и то све Мађари, један има који није него је само по пребивалишту. Баш ме занима како наши људи стоје са Мађарима.

слично, 56

међу ближима које сам мапирао сви су из сјеверне половине Мађарске

Ван мреже Ивица Јовановић

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 882
  • J-L70 > J-Z40772* mdDNA:HV-b15a
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #284 послато: Јануар 01, 2023, 10:20:14 поподне »
Iznenadjujuce malo. Na gedmatch ni jedan u prvih 100, ali zato imam jednog belgijanca i dvoje brazilaca u prvih 10 sto je strejndz. Na myheritage u prvih 50 imam troje, to jest tri zene. Jedna se preziva Konrad, druga Arbel a treca Radoi i mislim da ni jedna nije Madjarica. Neuporedivo vise imam Poljaka i Ukrajinaca od severnih (pored Srba, Rumuna i Grka koji su mi najbrojniji). Uradicu ove godine i 23andme i ancestry testove pa cu videti kakva je situacija tamo. Na ftDNA je slicno, 1 u prvih 100 (i taj Madjar zivi u Hrvatskoj).
Милутин Бранковић, 4. ескадрон Коњичке дивизије. Крф 26.04.1916.
Сава Питић, 13. Пук. Острво Видo 24.01.1916.
Сима Мијуцић, 9. пешадијски пук. Браунау 1917.

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #285 послато: Јануар 02, 2023, 07:30:39 пре подне »
Молим вас да ми наведете број ваших подударања у Мађарској. Ја их имам 69 и то све Мађари, један има који није него је само по пребивалишту. Баш ме занима како наши људи стоје са Мађарима.

Где ти се јављају Мађари? Проверио сам MyHeritage, имам око 40-ак њих из Мађарске, од тога преко 30 са мађарским презименима, могуће да се заломио и који Словак.

Ово јесте интересантно, ако се узме у обзир да са територије Хрватске постоји сличан број поклапања. Али наши људи на MH често уписују локацују где тренутно бораве (већина је USA, Germany, итд). Mогуће да је популаран овај сајт код Мађара. У сваком случају, од тих 40, чак 38 има компоненту Балкан, која се јавља код 82% Мађара са MyHeritage.

Ван мреже Exiled

  • Члан Друштва
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2394
  • ПХ908>А20333>FT14649>FT175994
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #286 послато: Јануар 02, 2023, 10:47:58 пре подне »
Где ти се јављају Мађари? Проверио сам MyHeritage, имам око 40-ак њих из Мађарске, од тога преко 30 са мађарским презименима, могуће да се заломио и који Словак.

Ово јесте интересантно, ако се узме у обзир да са територије Хрватске постоји сличан број поклапања. Али наши људи на MH често уписују локацују где тренутно бораве (већина је USA, Germany, итд). Mогуће да је популаран овај сајт код Мађара. У сваком случају, од тих 40, чак 38 има компоненту Балкан, која се јавља код 82% Мађара са MyHeritage.
Видовић,мој најближи рођак са пројекта их има 86. Нисам провераво по регијама али су ко што рекох све Мађари и претпостављам наши који су мађаризовани у последњих 300/400 година.Доста их је везано са презименом Хорват што је јасан знак. Убаци ми Драган буву да би моја веза са Војнићима на АС могла бити не по очинској линији,како сам раније капиро ту везу,већ другачије и овај број и мојих и Видовићевих подударања тамо нам нешто сугерише.

Ван мреже Exiled

  • Члан Друштва
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2394
  • ПХ908>А20333>FT14649>FT175994
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #287 послато: Јануар 09, 2023, 05:56:31 поподне »
Пратим мало БДП од како су се вратили у живот и има једна ствар која ми се јако свиђа а нисам знао да је могућа. Наиме они људима који су радили аутосомал предлажу слање података њима и они им на основу истих проналазе хаплогрупу. Можда би могли украсти ову идеју. Стручњаци вероватно знају како извући те податке из аутосомала.

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #288 послато: Јануар 09, 2023, 06:03:26 поподне »
Пратим мало БДП од како су се вратили у живот и има једна ствар која ми се јако свиђа а нисам знао да је могућа. Наиме они људима који су радили аутосомал предлажу слање података њима и они им на основу истих проналазе хаплогрупу. Можда би могли украсти ову идеју. Стручњаци вероватно знају како извући те податке из аутосомала.

Може се на основу RAW фајла са MyHeritage (могуће и Ancestry) одредити нека основна подграна попут I-M438, R-M198 и слично. Програм је MorleyDNA.

https://ytree.morleydna.com/

Требаш дакле вући за рукав људе који су радили тамо тест, да ти пошаљу RAW, или сами убаце и добију неку основну подграну. Када су подгране у питању, 23andMe је YFull у односу на ово, али важан је сваки податак.

Недавно сам баш добио информацију да је један Боговац (Св. Јован), Запужане/Бенковац, са MyHeritage, испао I-M438 на MorleyDNA.

Ван мреже Exiled

  • Члан Друштва
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2394
  • ПХ908>А20333>FT14649>FT175994
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #289 послато: Јануар 09, 2023, 06:32:35 поподне »
Може се на основу RAW фајла са MyHeritage (могуће и Ancestry) одредити нека основна подграна попут I-M438, R-M198 и слично. Програм је MorleyDNA.

https://ytree.morleydna.com/

Требаш дакле вући за рукав људе који су радили тамо тест, да ти пошаљу RAW, или сами убаце и добију неку основну подграну. Када су подгране у питању, 23andMe је YFull у односу на ово, али важан је сваки податак.

Недавно сам баш добио информацију да је један Боговац (Св. Јован), Запужане/Бенковац, са MyHeritage, испао I-M438 на MorleyDNA.
Добро, значи знате како се то ради. Рукав јесте и биће увек проблем. Можда као и они објавити ту могућност  па ако се људи јаве,јаве се...Они то раде на ФБ. Какви су максимуми овог предлога незнам али осетих потребу да предложим.

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #290 послато: Јануар 09, 2023, 07:11:52 поподне »
Добро, значи знате како се то ради. Рукав јесте и биће увек проблем. Можда као и они објавити ту могућност  па ако се људи јаве,јаве се...Они то раде на ФБ. Какви су максимуми овог предлога незнам али осетих потребу да предложим.

Свакако не би било лоше да се отвори посебна тема. Мислим да је на форуму више пута било речи о том предвиђачу MorleyDNA.

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #291 послато: Јануар 09, 2023, 07:14:13 поподне »
Издвојио сам и најближе аутосомалне рођаке са MH, како би упоредио са 23andMe. Чини се најпре да на MH има више оних блиских и релативно блиских поклапања. На FTDNA има најмање блиских рођака, самим тим и више простора за лажна поклапања. Она сигурно постоје и на MH/23andMe, али их пре свега треба тражити међу удаљенијим рођацима.

Згодно је што MH има нешто детаљнију admixture мапу за сваког појединца, па је то некад добар траг у откривању порекла тестираног из поклапања. Такође, често су ту породична стабла, породична презимена, локације.

плаво: Срби
црвено: Хрвати
црно: Немци и Аустријанци
жуто: Бугари
зелено: Бошњаци
браон: Албанци
наранџасто: Мађари
сиво: Македонци
светлобраон: Пољаци и Словаци



У конкретно мом случају, резултати се доста поклапају. Мапа се поклапа и са оним што MyHeritage одређује преко тзв. крајишког кластера.



Код 23andMe најближи днк рођаци јављају се на простору Подгрмеча и Поткозарја, док су на MyHeritage најближа поклапња на простору Лике (околина Зрмање), околине Книна, Унца и такође Подгрмеча. Треба узети у обзир да се Крајишници знатно чешће тестирају у односу на остале Србе, али резултати свакако имају смисла.


Heat мапа на основу ближих поклапања са MyHeritage. Hotspot - Зрмања Врело!  8)


Ван мреже Exiled

  • Члан Друштва
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2394
  • ПХ908>А20333>FT14649>FT175994
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #292 послато: Јануар 09, 2023, 07:29:23 поподне »
Свакако не би било лоше да се отвори посебна тема. Мислим да је на форуму више пута било речи о том предвиђачу MorleyDNA.
Ево како ја то видим, људи ураде АС и незнајући шта раде. Кад добију резултате виде да су им сви живи рођаци и онда одустају од даљњих трагања. Е сад кад би ту ускочили и рекли људи није крај имамо опцију која ће вам помоћи да сазнате нешто више...итд.итд.

Ван мреже НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #293 послато: Јануар 10, 2023, 09:00:04 пре подне »
Може се на основу RAW фајла са MyHeritage (могуће и Ancestry) одредити нека основна подграна попут I-M438, R-M198 и слично. Програм је MorleyDNA.

https://ytree.morleydna.com/

Требаш дакле вући за рукав људе који су радили тамо тест, да ти пошаљу RAW, или сами убаце и добију неку основну подграну. Када су подгране у питању, 23andMe је YFull у односу на ово, али важан је сваки податак.

Недавно сам баш добио информацију да је један Боговац (Св. Јован), Запужане/Бенковац, са MyHeritage, испао I-M438 на MorleyDNA.

Постоји и YSEQ Cladefinder од Хантера Провина, за који ми се чини да је за нијансу бољи од Морлија што се тиче проналаска нижих подграна:

https://cladefinder.yseq.net/
Чињеницама против самоувереног незнања.

На мрежи Драган Обреновић

  • Члан Управног одбора
  • Истраживач
  • *
  • Поруке: 955
  • R1b-U152>FTA27217
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #294 послато: Јануар 10, 2023, 09:20:50 пре подне »
Постоји и YSEQ Cladefinder од Хантера Провина, за који ми се чини да је за нијансу бољи од Морлија што се тиче проналаска нижих подграна:

https://cladefinder.yseq.net/

Да, Cladefinder се редовно синхронизује са стањем YFull стабла.

Нарочито је згодан у комбинацији са програмом WGS Extract - експортује се VCF фајл само за Y хромозом и пошаље на Cladefinder - добије се инстант позиција на YFull стаблу.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 511
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Одг: IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике
« Одговор #295 послато: Фебруар 03, 2023, 03:32:02 пре подне »
Иако далека, интересантна су ова поклапања са Сицилије на Ancestry. Код тетке по мајци доминира презиме Cucci, Cuchi и друге варијанте, код тетке по оцу су убедљиво најбројније Матранге. Нажалост, нико ми није одговорио на понуде за тестирање.