Аутор Тема: Обавештења о изменама и допунама у табели Српског ДНК пројекта  (Прочитано 174774 пута)

Ван мреже НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 7228
  • I2-PH908>Y189944>Y250780, род Никшића
Одг: Обавештења о изменама и допунама у табели Српског ДНК пројекта
« Одговор #720 послато: Април 14, 2022, 03:09:58 поподне »
За Миљешковића (I2-PH908, род Озринића, слава Ивањдан) је у табели прецизирано место порекла, па уместо Кртоли/Тиват сада стоји Миловићи/Тиват.
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Панић

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 241
  • y: I1-M227, mt: H2a1c
Одг: Обавештења о изменама и допунама у табели Српског ДНК пројекта
« Одговор #721 послато: Април 15, 2022, 11:54:04 пре подне »
Јелић, Лазарева Субота, Бања Врућица, Теслић - I1-A11380

Дошли су резултати WGS теста код YSEQ за Јелића. Припада подграни I1-BY169301*, па је од сада у табели заведен под тим снипом. На Yfull му је завршена и анализа STR маркера, али прилично "мршаво", успели су да издвоје само 63 вредности од референтних 111. Све нове вредности маркера су унете у табелу СДНКП.

Може ли само објашњење да ли ти мршави резултати, како рекосте, значе да се ништа више ни не може сазнати? Јер, радио је WGS, ја сам мислио да више од тога ни не може да се ради, зар не?
Столећима је мој род крш оро
и поповао или кметовао

Ван мреже НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 7228
  • I2-PH908>Y189944>Y250780, род Никшића
Одг: Обавештења о изменама и допунама у табели Српског ДНК пројекта
« Одговор #722 послато: Април 15, 2022, 11:56:03 пре подне »
Може ли само објашњење да ли ти мршави резултати, како рекосте, значе да се ништа више ни не може сазнати? Јер, радио је WGS, ја сам мислио да више од тога ни не може да се ради, зар не?

Што се тиче STR маркера, више од тога не може, а SNP позиција би требало да је ок.
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Драган Обреновић

  • Редакција СДНКП
  • Познавалац
  • ******
  • Поруке: 514
  • R1b-U152>FTA42008
Одг: Обавештења о изменама и допунама у табели Српског ДНК пројекта
« Одговор #723 послато: Април 15, 2022, 12:40:41 поподне »
Може ли само објашњење да ли ти мршави резултати, како рекосте, значе да се ништа више ни не може сазнати? Јер, радио је WGS, ја сам мислио да више од тога ни не може да се ради, зар не?

Циљано STR тестирање (нпр. FTDNA Y-STR 111 тест) се генерално ради другачијом методом (користе се прајмери, као за PCR тест за COVID, а сумњиви резултати се проверавају скупим Сангер тестовима). На тај начин се поуздано очитавају вредности STR маркера, али се уопште не добијају SNP мутације.

Код WGS теста се са друге стране поуздано откривају SNP мутације које тестирани појединац носи у свом геному (односно за наше потребе Y хромозому), а вредности STR маркера се као споредни ефекат, софтверски препознају из сирових резултата.

Међутим, пошто се секвенцирање целог генома ради у парчићима од 150 базних парова који се поравнавају са референтним геномом да би се одредило шта је заправо очитано, дешава се да почетак или крај STR секвенце не упадне у прочитаних 150 базних парова ("преломи се"), нарочито код дужих STR секвенци и у том случају је тешко софтверски одредити колико пута се нека секвенца понавља.

Због тога број софтверски очитаних STR вредности код WGS тестова често зависи од фактора среће, односно како се појединцу "заломило".

У сваком случају, након што урадиш BigY/WGS тест, вредности STR маркера ти и нису више претерано битне, јер STR маркери ионако само служе за "регрутацију" потенцијалних кандидата за она права, дубља SNP тестирања, на основу блискости STR хаплотипа.

Ван мреже Панић

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 241
  • y: I1-M227, mt: H2a1c
Одг: Обавештења о изменама и допунама у табели Српског ДНК пројекта
« Одговор #724 послато: Април 15, 2022, 03:26:39 поподне »
Никола и Драгане, хвала на објашњењу.
Столећима је мој род крш оро
и поповао или кметовао

Ван мреже Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2077
  • I2-BY55783>BY79593
Одг: Обавештења о изменама и допунама у табели Српског ДНК пројекта
« Одговор #725 послато: Април 26, 2022, 05:10:31 поподне »
На основу прелиминарне обраде резултата WGS теста, у табели су допуњени STR маркери за следеће тестиране:

Ђоковића из Југовића код Никшића, хаплогрупа I2-Y189944* (са 23 на 95)

Такође, с обзиром да су формирали нову грану Y263686, Ђоковић и Вујачић из Струга код Шавника су пребачени у нови род Y189944* A.


Драчу из Доњих Биљана код Бенковца, хаплогрупа I1-BY169301* (са 23 на 98)

Сви припадници гране A11380 пребачени су у низводну грану BY169301, a родови у којима су тестирани који су радили дубинске тестове су пребачени у одговарајуће гране испод BY169301.

« Последња измена: Мај 09, 2022, 04:18:01 поподне Црна Гуја »

Ван мреже Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2077
  • I2-BY55783>BY79593
Одг: Обавештења о изменама и допунама у табели Српског ДНК пројекта
« Одговор #726 послато: Мај 09, 2022, 04:11:20 поподне »
На основу прелиминарне обраде резултата WGS теста, у табели су допуњени STR маркери за Радовића из Доње Бијење код Невесиња (Никољдан), са 23 на 96. Такође, с обзиром да ће поцепати постојећи ниво J2a-Y230579, односно да је негативан на цуцки и пјешивачки SNP, сврстан је у посебан род Y230579* A.
« Последња измена: Мај 09, 2022, 04:18:27 поподне Црна Гуја »

Ван мреже Uzi

  • Уредник СДНКП
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 1363
  • N2-P189.2>FT182494>FGC28435
Одг: Обавештења о изменама и допунама у табели Српског ДНК пројекта
« Одговор #727 послато: Мај 10, 2022, 12:02:04 поподне »
Радановићу завршен дубински тест (WGS). Остаје на нивоју FT182494*.

Радановић потврђено негативан на FGC28435 и премештен у грану FT182494*.

Ван мреже Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2077
  • I2-BY55783>BY79593
Одг: Обавештења о изменама и допунама у табели Српског ДНК пројекта
« Одговор #728 послато: Мај 12, 2022, 12:55:00 поподне »
У табелу је убачен резултат Радосављевића из Доњег Крњина код Лепосавића, слава Лучиндан. Радосављевићу су стигли резултати WGS теста и прослеђени су на YFull, где ће формирати нову грану A29945 са Никетићем из Крћевца код Тополе:

https://www.yfull.com/tree/I-Y134582/


Такође, допуњени су STR  маркери са 23 на 93 за Грковића из Липика у Славонији, слава Ђурђевдан. И њему су пристигли резултати WGS теста, и поделио је грану Y134578 (8 позитивних и 5 негативних SNP-ова):

https://www.yfull.com/tree/I-Y134578/

Ван мреже marigold

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 371
  • mtDNA: H1-f2d1*
Одг: Обавештења о изменама и допунама у табели Српског ДНК пројекта
« Одговор #729 послато: Мај 15, 2022, 02:24:09 поподне »
Јовановић, Митровдан, Драгово, Рековац, T1a2-L131-CTS933, на основу прелиминарне обраде резултата WGS теста на YFull-у сврстан у T-Y206597 - https://www.yfull.com/tree/T-CTS933/