Аутор Тема: Древна ДНК - научни радови  (Прочитано 233758 пута)

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5160
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #420 послато: Мај 27, 2020, 08:00:20 поподне »
3x E-M78 и 2x E-M215
Резултати можда не указују на неке нове сценарије али су у принципу важни за E-V13.

Видио сам збирни дијаграм на којем је приказана Е хаплогрупа као присутна у овом раду, али нисам видио табелу са информацијама о узорцима за Е.

Знаш ли можда који су називи (шифре) ових узорака који су Е?

Ван мреже Bane

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 977
  • E-Z16988+BY99620+
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #421 послато: Мај 27, 2020, 08:09:08 поподне »
Знаш ли можда који су називи (шифре) ових узорака који су Е?

BERG79
BERG157-3
BERG157-4
BERG157-9
CLR11

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5160
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #422 послато: Мај 27, 2020, 08:22:44 поподне »
BERG79
BERG157-3
BERG157-4
BERG157-9
CLR11

Хвала ти. Претпостављам да је неко већ прегледао бамове? Уколико стигнем, погледаћу мало, да видим докле се може ићи низводно.

Ван мреже Bane

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 977
  • E-Z16988+BY99620+
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #423 послато: Мај 27, 2020, 08:34:55 поподне »
Хвала ти. Претпостављам да је неко већ прегледао бамове? Уколико стигнем, погледаћу мало, да видим докле се може ићи низводно.

Није ми познато да се неко бавио бам фајловима. Вероватно су фајлови тек од скора доступни (ако уопште јесу доступни).

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5160
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #424 послато: Мај 27, 2020, 08:44:17 поподне »
Није ми познато да се неко бавио бам фајловима. Вероватно су фајлови тек од скора доступни (ако уопште јесу доступни).

Покушавам сад на претрази да нађем ове Е бам фајлове, али не иде. Могуће да за неке узорке нису радили секвенцирање или бам фајлови нису доступни.

Доступни су иначе бам фајлови за неке друге узорке из овог рада.
« Последња измена: Мај 27, 2020, 08:48:43 поподне drajver »

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5160
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #425 послато: Мај 27, 2020, 08:53:42 поподне »
Покушавам сад на претрази да нађем ове Е бам фајлове, али не иде. Могуће да за неке узорке нису радили секвенцирање или бам фајлови нису доступни.

Доступни су иначе бам фајлови за неке друге узорке из овог рада.

Рекао бих да су за неке узорке радили само СНП тестирање,а међу њима су изгледа и сви из Е хаплогрупе. Тако да ништа од бамова.

Ван мреже filipi

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1141
  • I-CTS10228_Y4882_A1328*
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #426 послато: Мај 28, 2020, 09:56:44 поподне »
https://www.cell.com/cell/pdf/S0092-8674(20)30509-2.pdf?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0092867420305092%3Fshowall%3Dtrue

Genome-wide analysis of 110 ancient individuals from the Near East

Gene pools of Anatolia and Caucasus were biologically connected ∼6500 BCE

Gene flow from neighboring populations in Northern Levant during 3 rd millennium BCE

One individual of likely Central Asian origin in 2 nd millennium BCE Northern Levant

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5160
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #427 послато: Мај 29, 2020, 08:24:18 пре подне »
https://www.cell.com/cell/pdf/S0092-8674(20)30509-2.pdf?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0092867420305092%3Fshowall%3Dtrue

Genome-wide analysis of 110 ancient individuals from the Near East

Gene pools of Anatolia and Caucasus were biologically connected ∼6500 BCE

Gene flow from neighboring populations in Northern Levant during 3 rd millennium BCE

One individual of likely Central Asian origin in 2 nd millennium BCE Northern Levant

Ако сам добро видио, углавном: Ј1, Ј2а, G2a-M406, E-M123, понека L, T, H2. Има и један R1b-L754.

Такође, има неколико J2b. За наше М205 свакако најзначајнији је резултат J2b-M205 из налазишта Алалах близу Антакије на турско-сиријској граници. Узорак се датира у 1600-1700 година пне. То налазиште требало би припадати Аморићанима.

https://sr.wikipedia.org/wiki/%D0%90%D0%BC%D0%BE%D1%80%D0%B8%D1%82%D0%B8

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5160
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #428 послато: Мај 29, 2020, 09:02:58 пре подне »
На налазишту Алалах је присутна још један узорак J2b, али није М205 већ припада грани https://www.yfull.com/tree/J-Z2453/

Трећи J2b коме није одређене дубља подграна је из налазишта Titriş Höyük и нешто је старији , око 2300 г. пне

http://www3.uakron.edu/titris/overview.html

Дакле сва три налаза J2b су са турско-сиријске границе, период од 2300-1600 пне.


Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13161
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #429 послато: Мај 29, 2020, 09:08:09 пре подне »
Ако сам добро видио, углавном: Ј1, Ј2а, G2a-M406, E-M123, понека L, T, H2. Има и један R1b-L754.

Такође, има неколико J2b. За наше М205 свакако најзначајнији је резултат J2b-M205 из налазишта Алалах близу Антакије на турско-сиријској граници. Узорак се датира у 1600-1700 година пне. То налазиште требало би припадати Аморићанима.

https://sr.wikipedia.org/wiki/%D0%90%D0%BC%D0%BE%D1%80%D0%B8%D1%82%D0%B8

На истом налазишту где је пронађена M205 постоји и J2b-CTS6812/Z2454. То је мислим предачка грана M241. Недалеко одатле (TItrişHöyük), пронађена је и једна J2b-M12. Ако буде БАМ фајлова, може бити интересантно за порекло саме J2b.

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5160
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #430 послато: Мај 29, 2020, 09:22:03 пре подне »
На истом налазишту где је пронађена M205 постоји и J2b-CTS6812/Z2454. То је мислим предачка грана M241. Недалеко одатле (TItrişHöyük), пронађена је и једна J2b-M12. Ако буде БАМ фајлова, може бити интересантно за порекло саме J2b.

Грана J2b-CTS6812 није предачка за M241, могло би се рећи да јој сестринска. Видим да је доста присутна у арапском свијету, али је има и по Европи (можда преко Јевреја?). Нисам се детаљније бавио, па не знам. Ово видим само из YFull стабла.

Ван мреже filipi

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1141
  • I-CTS10228_Y4882_A1328*
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #431 послато: Јун 05, 2020, 03:20:38 поподне »
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/ajpa.24079
I2a1a and I2a1b samples along with low coverage I2a-L460 and I2-M438 samples. Battle Axe samples had half WHG ancestry, while the other half was a near equal mix of EEF and WSH ancestry. Pitted Ware samples had mostly WHG ancestry with some EEF ancestry. Funnelbeaker samples had nearly equal amounts of WHG and EEF ancestry. The migrations associated with these cultures occur very close to the Times to Most Recent Common Ancestors of I1-M253 and I2a-L38.


Ван мреже ДушанВучко

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 7260
  • I2-Y250780, род Никшића, U5a2b мт-ДНК
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #432 послато: Јун 27, 2020, 07:16:20 поподне »
Далеки "рођа" из Шведске :)  (I2-L460>P37.2>M423>L621>CTS10228>(S17250,Y4460,Z17855)
Motala reconstruction. Haplogroup I2-L460, mtDna U2e1.
5000 BC from Ostergotland, southern Sweden.

https://api.nationalgeographic.com/distribution/public/amp/history/2020/06/exclusive-skull-ritual-site-motala-reconstructed?fbclid=IwAR3UvUHWzT9UNEeeq8DoxVBRnUPad786pA21HQRTx81CTIuS-63rvtm5_No
« Последња измена: Јун 27, 2020, 07:23:41 поподне ДушанВучко »

Ван мреже НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8513
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #433 послато: Јун 27, 2020, 08:01:58 поподне »
Далеки "рођа" из Шведске :)  (I2-L460>P37.2>M423>L621>CTS10228>(S17250,Y4460,Z17855)
Motala reconstruction. Haplogroup I2-L460, mtDna U2e1.
5000 BC from Ostergotland, southern Sweden.

https://api.nationalgeographic.com/distribution/public/amp/history/2020/06/exclusive-skull-ritual-site-motala-reconstructed?fbclid=IwAR3UvUHWzT9UNEeeq8DoxVBRnUPad786pA21HQRTx81CTIuS-63rvtm5_No

Мислим да је само један скелет из Мотале идентификован као I2-M423*. Овај чију су реконструкцију дали би требало да је још узводнија I2-L460*.

https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/suppl/2017/07/17/164400.DC1/164400-2.pdf

Стр. 29
« Последња измена: Јун 27, 2020, 08:13:39 поподне НиколаВук »
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Милан Петровић

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1076
  • I2-PH908 FT277965>Y93865>Y95760 Род Зорића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #434 послато: Јун 27, 2020, 08:13:58 поподне »
Мало да поткреше браду, да обуче кошуљу и панталоне, па пролази као Драгутин из Требиња.
« Последња измена: Јун 27, 2020, 08:23:05 поподне Милан Петровић »
Догодине у Холштајну!

Ван мреже Concom

  • Почетник
  • **
  • Поруке: 27
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #435 послато: Јул 09, 2020, 10:29:43 поподне »
Мало да поткреше браду, да обуче кошуљу и панталоне, па пролази као Драгутин из Требиња.


Meni više liči na askurđela pokojnog glumca Mande, onakvog kakav je izgledao u "Selo gori, a baba se češlja".

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5160
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #436 послато: Јул 10, 2020, 02:28:23 поподне »
Наишао сам данас на нови археогенетички рад (објављен 7. јула 2020) ,а који се односи на генетичко поријекло мађарске династије Арпадоваца. Знам да су подаци о Бели III и раније објављивани. Иако још нисма детаљније прочитао рад, мислим да су радили неке SNP профилације и да повезују Арпадовце са данашњом башкирском популацијом.

https://www.nature.com/articles/s41431-020-0683-z

We set out to identify the origins of the Árpád Dynasty based on genome sequencing of DNA derived from the skeletal remains of Hungarian King Béla III (1172–1196) and eight additional individuals (six males, two females) originally interred at the Royal Basilica of Székesfehérvár. Y-chromosome analysis established that two individuals, Béla III and HU52 assign to haplogroups R-Z2125 whose distribution centres near South Central Asia with subsidiary expansions in the regions of modern Iran, the Volga Ural region and the Caucasus. Out of a cohort of 4340 individuals from these geographic areas, we acquired whole-genome data from 208 individuals derived for the R-Z2123 haplogroup. From these data we have established that the closest living kin of the Árpád Dynasty are R-SUR51 derived modern day Bashkirs predominantly from the Burzyansky and Abzelilovsky districts of Bashkortostan in the Russian Federation. Our analysis also reveals the existence of SNPs defining a novel Árpád Dynasty specific haplogroup R-ARP. Framed within the context of a high resolution R-Z2123 phylogeny, the ancestry of the first Hungarian royal dynasty traces to the region centering near Northern Afghanistan about 4500 years ago and identifies the Bashkirs as their closest kin, with a separation date between the two populations at the beginning of the first millennium CE.

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5160
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #437 послато: Јул 10, 2020, 02:59:02 поподне »
Ово је табела са старом ДНК из овог рада. Поред Беле III само је још један Арпадовић који припада хаплогрупи https://www.yfull.com/tree/R-Y2633/ тј. нижој подграни ове хаплогрупе означене као SUR51.  https://haplogroup.org/ystory/r-sur51/

Остали припадају разним хаплогрупама:
https://www.yfull.com/tree/J-ZS7640/
https://www.yfull.com/arch-3.09/tree/R-PF6658/
https://www.yfull.com/tree/E-Y58870/
https://www.yfull.com/tree/R-YP1626/
https://haplogroup.org/ystory/r-by41605/

https://www.nature.com/articles/s41431-020-0683-z/tables/2


Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5160
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #438 послато: Јул 10, 2020, 03:20:41 поподне »
Судећи по овом раду, чини се да у Новом Саду живи потомак Арпадовића или бар рођак (сад да ли је Србин или Мађар, не знам). Не знам ни да ли је из јавне или анонимне базе. Ево шта пише:

"and SUR51 present in the 48 Bashkirs, the individual from modern day Serbia and the two Árpád Dynasty members, Béla III (HU3B) and HU52. The R-SUR51 haplogroup bifurcates further after 17 shared SNPs (Table S7). The Bashkirs have the additional six SNPs associated with R-SUR51, while the individual from modern day Serbia and the two Árpád Dynasty members lack these, but are derived for a novel haplogroup, R-ARP, defined by nine shared SNPs. The individual from modern day Serbia has nine additional private SNPs, absent from the ancient samples, that define a novel haplogroup R-UVD (Ujvidék; the Hungarian name of modern day Novi Sad). 38 Bashkirs are further derived for R-SUR2 and its subhaplogroups R-SUR72 and R-SUR3/SUR95 while 7 have not been derived past R-SUR51*."

Да неко случајно није наишао на податак о тестираном из Новог Сада који припада овој хаплогрупи?

Ван мреже Zor

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1386
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #439 послато: Јул 10, 2020, 03:24:53 поподне »
Наишао сам данас на нови археогенетички рад (објављен 7. јула 2020) ,а који се односи на генетичко поријекло мађарске династије Арпадоваца. Знам да су подаци о Бели III и раније објављивани. Иако још нисма детаљније прочитао рад, мислим да су радили неке SNP профилације и да повезују Арпадовце са данашњом башкирском популацијом.

 Занимљиво, то су они исти узорци од раније. Изгледа да сам погодио неке. 8) За Z93 Белу бар Z2123. Ово директно повезивање са Башкирима не изгледа нешто реално, осим ако се иде преко старог снипа Z2123. Код Башкира је заступљена највише R-Y5977. Грана Беле III је најчешћа на Блиском истоку, иако има и номадских налаза са Тјаншана. Мада има једна друга грана код Мађара данас која би требало да има ближе везе са Башкирима.

Бела изгледа као Y934>YP451>YP449 (R-YP450-). За CTS34002 проблем прави његов dys385, као и височији GATAH4. За неке ближе Z284 је проблем њихов модал dys448=19, који их може се рећи избацује из круга. Бела има јако чудну високу вриједност на dys389ii, али обзиром да је тако чудна рекао бих да је вјероватно једноставно необична вишеструка мутација.

 за J1 сигурно је CTS1460, али доста чудних dys392=13 га чини могуће најближим једном турском хаплотипу из турско-јерменско-казахске групе S12993>FGC37470. (J-Y22035 Yfull)

 За E-V13, сложио бих се са симом да показује афинитет са Кузмановићем. И највјероватнија опција за обоје јесте грана FGC11450>CTS11286 (Швицарац), генерално имају као и скоро сви FGC11450 GATAH4=10 (са одузимањем), и наравно dys390=23 који их чини ближим Шпару. Имају још двије гране, један други Z5108, и један S-7461, који би можда били у оптицају, али ипак додајући и Кузмановићеве маркере они имају мале шансе, посебно други.