Аутор Тема: Древна ДНК - научни радови  (Прочитано 129962 пута)

Ван мреже Be like Bill

  • Познавалац
  • ******
  • Поруке: 777
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #760 послато: Децембар 26, 2021, 04:30:29 поподне »
Сви остаци који су у директном контакту са кожом, пљувачком или неким другим ДНК материјалом истраживача имају велику шансу да буду контаминирани, нарочито јер је у питању стара ДНК, подложна брзом пропадању. Као што написах, археолози на овим просторима нису томе придавали никакав значај те су слободно руковали тим остацима, без коришћења рукавица и друге опреме.

Slažem se, ali prema opisu postupka za dobijanje drevne DNK mislim da je mala verovatnoća da humani ostaci koji će biti podvrgnuti DNK analizi dođu u dodir sa DNK materijalom istraživača, pošto, koliko sam shvatio, taj materijal se uzima iz unutrašnjosti koštanog materijala a sam postupak uzimanja je tehnički dosta dobro zaštićen da ne dođe do zagađenja

Цитат
Extracting this DNA starts by finding the right kinds of bones, like teeth or the small, dense bones of the inner ear (petrous bone), that preserve enough DNA inside. Researchers then grind a section or drill into the bone and prepare the resulting powder for DNA extraction and sequencing. It’s a delicate, carefully-controlled process: Raghavan’s new lab is located in the sub-basement of the Gordon Center for Integrative Science, purposefully separated from other genetic labs to avoid contaminating the samples with modern DNA.

https://www.uchicagomedicine.org/forefront/biological-sciences-articles/ancient-dna-tools-help-scientists-study-human-evolution-directly-from-the-source


Ван мреже Be like Bill

  • Познавалац
  • ******
  • Поруке: 777
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #761 послато: Децембар 26, 2021, 04:36:17 поподне »
Замолио бих да ми објасните, како се митохондријални ДНК не уклапа у хипотезу да је скелет пропадао особи која је живела у двадесетом веку, кад припада хаплогрупи која је стара само 800 година. Налаз мени делује пре свега контра-аргумент датирању узорка из рада.

Ja smatram da sam upravo to i rekao :) Ne verujem da ispitivani DNK pripada osobi starijoj od 500-800 godina. Kako je došla u taj kraj Like mi je zagonetka, pogotovo što je i po Y-DNK i po autosomalnim rezultatima vezana za prostor Balkana, tačnije srpskih prostora na Balkanu dok po mtDNK vuče na severnija područja

На мрежи Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5117
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #762 послато: Децембар 26, 2021, 04:49:00 поподне »
Koliko znam, DNK ekstrakciju obično vrše iz zuba ili kosti gde je mala šansa da je moglo doći do zagađenja. Ovde bih pre posumnjao da se radi o ostacima nekog Srbina iz Drugog svetskog rata, ali me buni mitohondrijalni DNK svojom starošću

Управо мтДНК, уз аутосомалну, показује да је реч о модерном узорку.  Када кажемо модеран, он може бити и из касног средњег века, али и из 20. века. Суштина је да није из бронзаног доба, ни из антике.

На мрежи Vladimir_J

  • Члан Друштва
  • Почетник
  • *****
  • Поруке: 42
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #763 послато: Децембар 26, 2021, 05:02:09 поподне »
Ja smatram da sam upravo to i rekao :) Ne verujem da ispitivani DNK pripada osobi starijoj od 500-800 godina. Kako je došla u taj kraj Like mi je zagonetka, pogotovo što je i po Y-DNK i po autosomalnim rezultatima vezana za prostor Balkana, tačnije srpskih prostora na Balkanu dok po mtDNK vuče na severnija područja

Извињавам се, погрешно сам Вас разумео :) То што је митохондријална ДНК северњачка, може бити лако прихватљиво. Довољно је да је покојник имао прабабу из Немачке ;)

На мрежи Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2025
  • I2-BY55783>BY79593
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #764 послато: Децембар 26, 2021, 05:05:36 поподне »
Истина је да се скелетни остаци могу лако контаминирати, али се исто тако лако и та контаминација открива NGS секвенцирањем генома, поготово ако је у питању мушки узорак. Овај узорак дефинитивно није контаминиран, у супротном би био обележен као такав од стране аутора, а контаминација би била видљива и у неконзистентним SNP-овима на Y-хромозому, а таквих у овом случају нема. Код овог узорка и аутосомални профил и Y-хаплогрупа, па можда чак и mt-хаплогрупа, указују да се ради о остацима из много каснијег периода, а верујем да би све недоумице биле решене директним датирањем овог скелета. Ускоро би требао изаћи још један рад (Lazaridis et al.), у коме ће између осталих бити и око 30 додатних узорака из ове исте пећине, па ће се и поређењем аутосомалног профила са њима моћи релативно лако утврдити да ли је у питању "уљез" из каснијег периода.

Ван мреже Ojler

  • Члан Друштва
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 4211
  • Y-DNK: I2-Y3120 Z17855>PH3414 Мириловићи
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #765 послато: Децембар 26, 2021, 05:49:30 поподне »
Ја сам већ писао детаљно Yfull-у зашто да буду опрезни око овог узорка. До сада су на моје поруке одговарали прилично брзо. Ова громогласна тишина са њихове стране овог пута ми је сумњива. :)

Не би било лоше указати и ауторима рада на контрадикторност датирања са аутозомалним и mtDNA налазима.
Kамене рабъ и госодинъ

Ван мреже CosicZ

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 445
  • Ђурђевдан Y:I1>P109>FGC22045 Панчево
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #766 послато: Децембар 26, 2021, 11:49:01 поподне »
Изгледа да је драјвер био у праву када је посумњао у исправно датирање id:I18719 на Y стаблу, јер ако се погледају бочне линије HV0a1a на mtDNA стаблу: https://www.yfull.com/mtree/HV0a1/, тамо у једној од њих се налази и резултат једног скелетног узорка из Норвешке: https://www.yfull.com/mtree/HV0a1c/ id:VK524NOR [NO-18] age 1000 ybp.
Потражио сам Y хаплогрупу овог узорка и ево је овде (датација се савршено слаже):
https://www.yfull.com/tree/I-Y3000/ id:VK524NOR [NO-18] age 1000 ybp.

Аха, кад би се зезали. ;)
Један проблем је да су процене старости за mtDNA хаплогрупе мање поуздане него за хаплогрупе Y хромозома. Yfull је израчунао да је вероватноћа 95% да је HV0a1a1 настала пре између 1700 и 325 година, а да има TMRCA 1250 до 175 година. Притом I18719 вероватно није уврштен у процену засновану на три савремена узорка.

Археогенетски налази су обично слабије покривени од савремених, па је тешко рећи где се тачно налазе у односу на њих. Тако је и за I18719 тешко рећи да ли је I2-CTS10228* или I2-Y3120* (Y3116) или нека њена подгрупа. На пример, овде https://www.yfull.com/branch-info/J-YP157/#t4-tab су два древна 1X и два савремена 3X узорка, па TMRCA није ни израчуната. Али јесте овде https://www.yfull.com/branch-info/I-Y141086/#t4-tab где је древни 1X и савремени 39X узорак.

Шарић и њему слични су популарнији код публике која има мањак знања надокнађен вишком патриотизма. Но ствари стоје овако: од Лепенског Вира до Римског Царства преовлађују неке друге хаплогрупе. Остаје да се испита да ли су се I2-Y3120 или њени непосредни преци можда крили у неком кутку Балкана ( ала Астериксово село). Теоретски, ако се не би мешали са околним популацијама, њихова аутосомална генетика се не би много мењала, једино би прошла кроз врло уско грло. Али то баш звучи сумануто. А на основу хаплогрупа види се да су се Срби итекако мешали и са околним и са удаљеним популацијама.

У суштини сви Европљани су мешавина палеолитских домородачких ловаца-сакупљача, неолитских блискоисточних пољопривредника и степских Индоевропљана. Ако је I18719 стварно из бронзаног доба, а има аутосомалну генетику као данашњи Срби, највероватније објашњење би било да је то зато што се налазе на месту где је то мешање било најинтезивније, а не на југу, северозападу или североистоку Европе где претежу поједине прапопулације.

Да ли је којим случајем познато да ли су у ту јаму/пећину бацани убијени Срби за време НДХ? Тренутно ми контаминација или "залутали" скелет неког убијеног Србина од усташке руке делују као најлогичније решење ове загонетке.
Мени је пао на памет онај несретни домаћин што је угостио Људевита. Ако би се мало растегла старост HV0a1a1 таман довољно за "прабабу" из Бојке.

ДНК из савремених узорака је обично лако разликовати од древних, јер се ДНК временом распада на све мање делове, а брзина распада зависи од услова у којима се налази. Ако се не варам, мислим да је био неки налаз из Немачке за који се мислило да је бронзанодобни, а показало се да је раносредњовековни.

Ван мреже Владимир Бојановић

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 772
  • I2>PH908>Y52621>FT190799, род Никшића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #767 послато: Децембар 27, 2021, 01:39:20 пре подне »
Један проблем је да су процене старости за mtDNA хаплогрупе мање поуздане него за хаплогрупе Y хромозома. Yfull је израчунао да је вероватноћа 95% да је HV0a1a1 настала пре између 1700 и 325 година, а да има TMRCA 1250 до 175 година. Притом I18719 вероватно није уврштен у процену засновану на три савремена узорка.
Можда је рачуница за HV0a1a1 несигурна, међутим ако погледамо осталe подгранe испод https://www.yfull.com/mtree/HV0a1/, којој је TMRCA 2100 година, видљив је солидан број узорака (међу којима је и један археогенетски резултат, због чега сам окачио HV0a1c , ради поређења) који су учествовали у прорачунима и иста процена времена настанка свакој од њих: formed 2100 ybp. Ако је на MTree већ утврђено толико генетски сродних женских линија I18719, испод HV0a1, где су са друге стране мушкарци? Ово је довољно да се тренутна позиција I18719 на Y стаблу I2-CTS10228* прогласи као крајње непоузданом.

Археогенетски налази су обично слабије покривени од савремених, па је тешко рећи где се тачно налазе у односу на њих. Тако је и за I18719 тешко рећи да ли је I2-CTS10228* или I2-Y3120* (Y3116) или нека њена подгрупа. На пример, овде https://www.yfull.com/branch-info/J-YP157/#t4-tab су два древна 1X и два савремена 3X узорка, па TMRCA није ни израчуната. Али јесте овде https://www.yfull.com/branch-info/I-Y141086/#t4-tab где је древни 1X и савремени 39X узорак.
Рекао бих за J-YP157 да су сва четири узорка древна, не само два, управо због малих дубина очитавања локуса, па отуд можда није израчуната TMRCA за ову подграну.
« Последња измена: Децембар 27, 2021, 01:50:47 пре подне Владимир Бојановић »

На мрежи Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5117
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #768 послато: Децембар 27, 2021, 11:02:17 пре подне »
Ја сам већ писао детаљно Yfull-у зашто да буду опрезни око овог узорка. До сада су на моје поруке одговарали прилично брзо. Ова громогласна тишина са њихове стране овог пута ми је сумњива. :)

Оно што су ми одговорили из Yfull-а се може свести на то да су и они свесни да је врло могуће у питању модеран узорак, али да су га пренели из рада, па све док се не одради додатна радиокарбонска анализа, остаће тако. По њиховим речима овај узорк има веома слабу покривеност и очитан му је једино Y3116, који је на нивоу Y3120. Као пример сахрањивања у истој хумци у различитим епохама, дали су ми пример Sungir узорака. Тако да они признају да је можда у питању "модеран" човек, али без додатне радиокарбонске анализе то не могу да тврде.
« Последња измена: Децембар 27, 2021, 11:16:47 пре подне Милош »

На мрежи Vladimir_J

  • Члан Друштва
  • Почетник
  • *****
  • Поруке: 42
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #769 послато: Децембар 29, 2021, 11:17:53 поподне »
Чини ми се да има још неколико занимљивих узорака из овог рада који нису овде поменути. На пример:

I25524 IAP066; inv. 12967   Szécsényi-Nagy, Anna   This study   Context: Archaeological - Period   2175   130   450-1 BCE   Hungary_IA_LaTene_o3   Komárom–Esztergom county, Tokod-Altáró   Hungary   47,726454   18,665632   1240K   1   2,6   800538   M   n/a (no relatives detected)   R-PF6155

који је изгледа већ додат на YFull кao https://www.yfull.com/tree/R-M458/. Има из Мађарске и Чешке још узорака са Словенима блиских подграна хаплогрупе R1a, aли се уз то појављују и узорци хаплогрупе E-Z1057 (I16272 400-200 BCE Czech_IA_LaTene и два потенцијално контаминирана I18527 и I18832). Можда су R1a узорци назнака потенцијалне зоне мешања са популацијом која је учествовала у етногенези Словена, а присуство хаплогрупе E-Z1057 (коју имамо и код нас на ДНК пројекту) можда може да указује на то да је делимично на Балкан дошла и са Словенима у 6. и 7. веку.

Ништа не тврдим, али ето, да напоменем овде. Можда је још неко овде размишљао у том правцу.

Ван мреже CosicZ

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 445
  • Ђурђевдан Y:I1>P109>FGC22045 Панчево
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #770 послато: Децембар 30, 2021, 06:08:16 пре подне »
Поменути су:

https://www.yfull.com/live/tree/R-M458/ id:I25524
 I25524   Hungary_IA_LaTene_o3   2175   R-PF6155   R1a1a1   K1a+195
 I25524   R1a1a1b1a1a~   R-PF6202*(xFGC32020,BY32070,CTS11962.1,A11452)
 I25524:Result ( 91.7% 55 -0 +5): K1-a4

https://www.yfull.com/live/tree/R-L1029/ id:I13780 CZE [CZ-ST] 2250 ybp     најстарији R1a-L1029
 I13780   Czech_IA_LaTene   2250   R-YP5267   R1a1a1b1a1a1c1a3a~   K1a26
 I13780   R1a1a1b1a1a1c1a3a~   R-YP5269
 I13780:Result ( 93.3% 56 -0 +4): K1a26

https://www.yfull.com/live/tree/R-Z280/
 id:I14193 CZE [CZ-ST] 3850 ybp
 I14193   Czech_EBA_Unetice   3850   R-Z280   R1a1a1   T2e
 I14193   R1a1a1b1a2b3a1c2~   R-YP587*(xY10895,Y35753,A7020)
 I14193:Result ( 96.8% 61 -0 +2): T2e4

 id:I13795 CZE [CZ-US] 3000 ybp
 I13795   Czech_LBA_Knoviz   3000   R-Z280   R1a1a1   J1c8a
 I13795   R1a1a1b1a2   R-S204*(xS205,CTS1211)
 I13795:Result ( 91.4% 55 -1 +3): J1c8

 id:I11158
 I11158   Czech_EBA_son.I14193_son.I7198   4025   R-Z280   R1a1a1   U5b2c
 I11158   R1a1a1b1a2   R-S204*(xYP569,Y1401,YP4370,FGC46006,CTS1211)
 I11158:Result ( 96.7% 58 -0 +2): U5b2c3a

R1a
https://www.yfull.com/tree/R-M458/ id:I25524 HUN [HU-TB]  2176 ybp
    https://www.yfull.com/tree/R-L1029/ id:I13780 CZE [CZ-ST]  2250 ybp
https://www.yfull.com/tree/R-Z280/ id:I13795 CZE [CZ-US]  3000 ybp
    https://www.yfull.com/tree/R-FT6375/
    https://www.yfull.com/live/tree/R-FT6375/ id:I14193 CZE [CZ-ST]  3850 ybp
    https://www.yfull.com/tree/R-S24902/
    https://www.yfull.com/live/tree/R-YP563/ id:I11158 CZE [CZ-PR]  4025 ybp

R1b
https://www.yfull.com/tree/R-U106/ id:I23978 SVN [SI-142]  2521 ybp
https://www.yfull.com/tree/R-U152/ id:I7286 CZE [CZ-US]  4251 ybp
    https://www.yfull.com/tree/R-L2/
    id:I5696 SVN [SI-009]  2255 ybp
    id:I5690 SVN [SI-054]  2544 ybp
    id:I24342 HRV [HR-13]  3411 ybp
    id:I21402 FRA [FR-51]  2200 ybp
    id:I11701 AUT [AT-3]  2300 ybp
     https://www.yfull.com/tree/R-FGC59581/ id:I18492 HUN [HU-GS]  2240 ybp
     https://www.yfull.com/tree/R-S18462/ id:I25504 HUN [HU-VA]  2850 ybp
     https://www.yfull.com/tree/R-BY96884/ id:I5695 SVN [SI-009]  3086 ybp

Или је централна Европа била место где су се мешали источноевропски и западноевропски Индоевропљани или су Индоевропљани већ од самог почетка били мешавина R1a и R1b ( и E-V13 и других хаплогрупа), па је генетским дрифтом настала данашња ситуација - R1a претежно на истоку, R1b на западу, E-V13 на југу.

Ван мреже CosicZ

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 445
  • Ђурђевдан Y:I1>P109>FGC22045 Панчево
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #771 послато: Децембар 31, 2021, 07:43:28 пре подне »
Можда је рачуница за HV0a1a1 несигурна, међутим ако погледамо осталe подгранe испод https://www.yfull.com/mtree/HV0a1/, којој је TMRCA 2100 година, видљив је солидан број узорака (међу којима је и један археогенетски резултат, због чега сам окачио HV0a1c , ради поређења) који су учествовали у прорачунима и иста процена времена настанка свакој од њих: formed 2100 ybp. Ако је на MTree већ утврђено толико генетски сродних женских линија I18719, испод HV0a1, где су са друге стране мушкарци? Ово је довољно да се тренутна позиција I18719 на Y стаблу I2-CTS10228* прогласи као крајње непоузданом.
Рекао бих за J-YP157 да су сва четири узорка древна, не само два, управо због малих дубина очитавања локуса, па отуд можда није израчуната TMRCA за ову подграну.
Проблем није HV0a1a1 или HV0a1, већ mtDNA генерално. Мутација на mtDNA се може десити у следећој генерацији или у двадесетој. На дуге стазе, а то значи хиљаде и хиљаде година, број мутација у некој грани ће бити у оквиру просека, али гране са малим бројем мутација као што су ове могу значајно одударати од просека. Неколико екстремних примера:
https://www.yfull.com/mtree/H6a1b/ formed 3900 ybp, TMRCA 2900 ybp
https://www.yfull.com/mtree/H6a1b2/ formed 2900 ybp, TMRCA 1850 ybp
 id:I23207 SRB [RS-VO] age 3900 ybp
 id:NLKG218_M61 CHN [CN-XJ] age 2213 ybp
 id:BLT_M19 CHN [CN-XJ] age 4632

https://www.yfull.com/mtree/H6a1a/ formed 3900 ybp, TMRCA 2500 ybp
https://www.yfull.com/mtree/H6a1a4b1/ formed 950 ybp, TMRCA 550 ybp
 id:Hetian_M16A CHN [CN-XJ] age 1709 ybp
https://www.yfull.com/mtree/H6a1a26/ formed 2500 ybp, TMRCA 700 ybp
 id:AKB001 KAZ [KZ-KAR] age 2638 ybp

https://www.yfull.com/mtree/H4a-a/ formed 6600 ybp, TMRCA 5200 ybp
https://www.yfull.com/mtree/H4a1/ formed 5200 ybp, TMRCA 4000 ybp
 d:I2510 BGR [BG-04] age 4756 ybp
https://www.yfull.com/mtree/H4a1a1/ formed 2900 ybp, TMRCA 1500 ybp
 id:PB768 IRL [IE-CE] age 3811 ybp
https://www.yfull.com/mtree/H4a1a1a/ formed 1500 ybp, TMRCA 850 ybp ???
 id:CTH217 TUR [TR-42] age 8278 ybp !!!
https://www.yfull.com/mtree/H4a1a1a1a1/ formed 500 ybp, TMRCA 200 ybp
 id:VK203 GBR [GB-ORK] age 1600 ybp
https://www.yfull.com/mtree/H4a1a1a3/ formed 850 ybp, TMRCA 550 ybp
 id:PLEper327 HUN [HU-HB] age 1000 ybp
https://www.yfull.com/mtree/H4a1a1a6/ formed 850 ybp, TMRCA 600 ybp
 id:MHper15 HUN [HU-HB] age 1000 ybp
 id:MF498663.1 DEU [DE-BY] age 3811 ybp
https://www.yfull.com/mtree/H4a1c1a/ formed 1800 ybp, TMRCA 850 ybp
 id:I5696 SVN [SI-009] age 2255 ybp

https://www.yfull.com/mtree/U5b3a1/ formed 6800 ybp, TMRCA 5500 ybp
 id:R19 ITA [IT-AN] age 7290 ybp

https://www.yfull.com/mtree/U5b2c3/ formed 6600 ybp, TMRCA 3000 ybp
 id:MA969 EST [EE-37] age 4688 ybp
https://www.yfull.com/mtree/U5b2c3a/ formed 3000 ybp, TMRCA 1550 ybp
 id:I11158 CZE [CZ-PR] age 4025 ybp
 id:I7198 CZE [CZ-PR] age 4036 ybp

Наравно бројнији су примери где је старост налаза мања од старости хаплогрупе. Али мислим да ово показује да у целој заврзлами, прорачуни старости mtDNA су најмање поуздани. Надајмо се да ће неко утврдити колико је тачно стар I18719.

Yfull обично археогенетске узорке означава ружичастом бојом. Друга двојица су из рада "Low-pass DNA sequencing of 1200 Sardinians reconstructs European Y-chromosome phylogeny" где је квантитет имао предност над квалитетом.
https://yfull.com/sardinians/
https://www.yfull.com/samples-from-paper/2/?page=2
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23908240

Ван мреже CosicZ

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 445
  • Ђурђевдан Y:I1>P109>FGC22045 Панчево
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #772 послато: Јануар 03, 2022, 07:36:18 поподне »
Стиже нови рад:

Reconstructing genetic histories and social organisation in Neolithic and Bronze Age Croatia

https://www.nature.com/articles/s41598-021-94932-9/tables/1


Од 13 мушких скелета, 7 је G2a.

Без већих изненађења. Опет одсуство E-V13.

Занимљив је овај R1a-Z93 из римског периода. Најниже је одређен као https://www.yfull.com/tree/R-F1345/ Можда открију нешто још ниже. Аутосомално има прилично велик удио степске генетике.

Било би такође интересантно ако би се могло специфичније одредити POP04 (J хаплогрупа).
https://www.nature.com/articles/s41598-021-94932-9/tables/1
Цитат
POP23   Beli Manastir-Popova zemlja Roman Period   260–402 calCE   Croatia_Pop_RomanP   M   962,966   T2f2   R1a1a1b2a2b1
https://www.yfull.com/tree/R-F1019/ formed 3100 ybp, TMRCA 2500 ybp
https://www.yfull.com/mtree/T2f2c/ formed 5100 ybp, TMRCA 2400 ybp
id:POP23 HRV [HR-14] age 258 ybp ( надам се да је грешка до Yfull-а, а да нису ископали попа)?

https://www.nature.com/articles/s41598-021-94932-9
https://www.nature.com/articles/s41598-021-94932-9/figures/1

https://www.nature.com/articles/s41598-021-94932-9/figures/2

https://www.nature.com/articles/s41598-021-94932-9/figures/3

Цитат
To further characterise differential genetic affinities of the Jagodnjak group to the Dalmatian Bronze Age and other genomes, we visualised genetic substructures among post-Neolithic genomes from the region with increased resolution using UMAP and default parameters (Fig. 3c, Methods). While UMAP does not reflect genetic distances in a linear way, clearly defined clusters become apparent, in which Croatia_Pop_CA and Croatia_Dal_BA cluster with ancient genomes from Bulgaria, Montenegro, Romania and some Hungarians together with predominantly present-day Italian_North genomes, pointing to a genetic profile consistent with southern Europe. Testing with qpWave confirmed that Croatia_Pop_CA provides a feasible single source of ancestry for the Dalmatian Bronze Age (Supplementary Table S4). Croatia_Jag_MBA contrastingly falls to the left of present-day genomes from Hungary, Germany, Czech Republic and Croatia, indicating a Central European genetic signature. Other ancient genomes in this cloud also include individuals from the Carpathian Basin belonging to Makó EBA, Vatya MBA, and an LBA individual.

Genetic transformation following the Bronze Age
Neither the Jagodnjak nor the Dalmatian Bronze Age groups approximate present-day populations from the region in PCA space, indicating that further significant population changes have since occurred. Our single individual from Popova zemlja, Croatia_Pop_RomanP, provides rare genomic data for Croatia after the Bronze Age33. (Table 1, Fig. 4a, Supplementary Table S1). We find this individual clustering with present-day populations of Croatia, Bulgaria and Romania in PCA and UMAP space (Figs. 2, 3c).We investigated this clustering with f4-statistics and could confirm cladality of this individual with present-day Croatians compared to other ancient and present-day populations in Europe (Supplementary Table S7). We then tested population continuity with qpWave, and found Croatia_RomanP was consistent with forming a genetic clade with present-day Croatians, as well as Bulgarians or Hungarians (p = 0.78 respectively) (Supplementary Table S4). Although based on a single individual who may or may not be representative for the wider population in that time period, this data point indicates that a broadly present-day genetic signature had already formed by Roman times, and any further population turnovers were not as significant as previous ones.
https://www.nature.com/articles/s41598-021-94932-9/figures/4

Ван мреже Radul

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 1453
  • J-Y230853 Башино Село, Цетиње > Кривошије
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #773 послато: Јануар 12, 2022, 10:26:49 поподне »
Ево једног право занимљивог археогенетичког рада.

Determining Y-DNA and mtDNA haplogroups for the Twelveth-Century Medieval Slavic Burial near Zagoryansky Settlement on the Upper Klyazma (Moscow Region). Part II

Анализирана су четири средњовјековна мушка склелета из околине Москве. Два припадају Е1b1b а друга два J2a1. Оно што је занимљиво јесте што узорке повезују са Србима. Помињу и неке резултате из Србије из непубликованих радова:

"Поскольку по результатам определения Y-гаплогруппы первого образца было сделано предположение о наличии связей с Балкано-Дунайским регионом, в анализ включены также группы с территории Центральной Сербии (могильники Омолица и Дупляя, расположенные в 20 км к юго-востоку от Белграда, XI–XII вв., неопубликованные данные Н.Н. Гончаровой)".
Ако се бојите, немојте то чинити; ако то радите, не бојте се! - Темуџин

На мрежи НУки ⚔🦅⚔

  • Члан Друштва
  • Гост
  • *****
  • Поруке: 2
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #774 послато: Јануар 12, 2022, 11:44:52 поподне »
Da li znaš na osnovu čega ih povezuju sa teritorijom Srbije i u koje vreme je datirana ta povezanost? Ne ide mi prevođenje sa ruskog baš najbolje😅

Ван мреже Zor

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1144
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #775 послато: Јануар 13, 2022, 12:32:03 пре подне »
Da li znaš na osnovu čega ih povezuju sa teritorijom Srbije i u koje vreme je datirana ta povezanost? Ne ide mi prevođenje sa ruskog baš najbolje😅

 Вјероватно површног дилетантизма на првом мјесту типичног за многе публикације (типа I2a мезолитски Балканци). Помињу се проценти те хг на Балкану те то као правац недавне миграције. Спомињу и антрополошке налазе о блискостима са западним и јужним Словенима.

 По ограниченим STR вриједностима први E1b најприје припада грани E-CTS10880. А први Ј2а (прилично) могуће припада грани J-Z6046 у ком случају и не изгледају те везе нешто балканско-дунавски. Логично би се ту јавио и неки I-Y3120.
« Последња измена: Јануар 13, 2022, 12:36:20 пре подне Zor »

Ван мреже сɣнце

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1267
  • I-A1328
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #776 послато: Јануар 13, 2022, 05:04:07 поподне »
Da li znaš na osnovu čega ih povezuju sa teritorijom Srbije i u koje vreme je datirana ta povezanost? Ne ide mi prevođenje sa ruskog baš najbolje😅

На мјесту ископаних узорака по податцима из археологије живјели су некада фински Вијеси ( самоназвање Вепси ). Находи женских украшења из гробнице указују на племе Кривића које се је у тај крај насељавало у оно вријеме. По краниологијским поређењима може се приближно казати кому племену припадају остатци. Обзор лобања двају мужских узорака дао је вриједности које се приближавају вриједностима Поморјана и јужних Словијена.  То је побудило помисао, да сви узорци могу ( али не морају ) имати везу  са средњим Балканом и јоште даље, да је једно из овдашњих племена учествовало у етногенези тога дијела Кривића. Да би се та теорија провјерила или оповргла, као поредбена грађа узети су у рассматрање необјављени краниологички податци находа који потичу из 11./12. вијека са простора средишње Србије.

Заиста низводно добивенога снп J-PF5087 постоји један огранак https://www.yfull.com/tree/J-FGC4975/ који указује на поријекло са простора Солуна, но постоје и други огранци који су присутни у Татара и Мордве.
Мислимо да владамо нашим речима, но уистину речи, попут татарскога лука, дејствују на ум, те моћно мрсе и сукају мисао; зато у свим споровима и беседама ваља најпрво установити међе речима и изразима, да би други знали, како их ми видимо.

Ван мреже Владимир Бојановић

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 772
  • I2>PH908>Y52621>FT190799, род Никшића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #777 послато: Јануар 13, 2022, 06:09:55 поподне »
Заиста низводно добивенога снп J-PF5087 постоји један огранак https://www.yfull.com/tree/J-FGC4975/ који указује на поријекло са простора Солуна, но постоје и други огранци који су присутни у Татара и Мордве.
Можда су и ови Турци из Једрена потомци тог племена? Свакако им се подграна J-Y237396 налази испод J-FGC30508 гране којој припада поменути Грк из Солуна.

Ван мреже Zor

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1144
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #778 послато: Јануар 13, 2022, 06:49:37 поподне »
Можда су и ови Турци из Једрена потомци тог племена? Свакако им се подграна J-Y237396 налази испод J-FGC30508 гране којој припада поменути Грк из Солуна.

Заиста низводно добивенога снп J-PF5087 постоји један огранак https://www.yfull.com/tree/J-FGC4975/ који указује на поријекло са простора Солуна, но постоје и други огранци који су присутни у Татара и Мордве.

 Ако је Грк онда је јеврејског поријекла. Тај "Турчин" је Сефард из Турске. Та цијела грана је јеврејска. Ако видите да нека блискоисточна грана има огроман број припадника на YFull-у из Украјине, Литве, Румуније, Мађарске итд. а грана је bottleneck по правилу се ради о јеврејској грани (јер су јако добро покривени дубљим тестовима).

 Нису рађени SNP тестови за Y-DNA и стоји да су користили Невген предиктор. Један J2a има 437=16 што само мислим има J-Z6046 од свих или скоро свих грана, а то је доста спор маркер па је до добра индикација за ту грану. Други има доста чешћи модалнији 15 и само 3 маркера па се не може предвиђати баш шта је.
« Последња измена: Јануар 13, 2022, 06:58:22 поподне Zor »

Ван мреже CosicZ

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 445
  • Ђурђевдан Y:I1>P109>FGC22045 Панчево
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #779 послато: Јануар 20, 2022, 06:10:50 пре подне »
За муштулук.
Цитат
I18719   P3779; BzV 10a   Pinhasi, Ron   This study   Context: Archaeological - Period   3200   144   1500-1000 BCE   Croatia_MBA_LBA   Bezdanjača Cave   Croatia   44.8520052   15.4199444   1240K   2   3.747999   825868   M   n/a (no relatives detected)   I-Y3120
Шта год да је, остаје забележено. Неће сад нико моћи жив остати од аутохтонаша...
Штуцавица је почела http://www.genealogywise.com/profiles/blogs/haplogroup-i2a1-l621-cts10228-y3120 .
Цитат
According to data collected from an extensive research that has been conducted in the last dozen years, and thousands of ancient and modern DNA test results from different European countries, it seems that the haplogroup I2a-L621 appeared somewhere along the Lower Danube about 12.000 YBP. There is also archeogenetic evidence that some I2a-L621 people lived in the middle of today’s Bulgaria 5000 years ago.[3] However, the carriers of its oldest lineages have managed to survive until today in central-western Europe. (https://www.yfull.com/tree/I-L621/) No one can tell (yet) how or when they arrived in the area, and, besides, it has been impossible to determine if the subclade Y3120 (formed 3400 YBP) “was born” there or not.

 Fortunately, the recent publication of the paper "Large-Scale Migration into Southern Britain during the Middle to Late Bronze Age"[4]  shed some light on the problem. The study includes genome-wide data from 793 individuals, all from the Middle to Late Bronze Age and the Iron Age, and, as it happens, one of these individuals (“I18719”) was I-CTS10228>Y3120 male who lived in (today’s) Croatia between 1200 and 1000 BCE and had south European autosomal background.

[At present, it should also be pointed out that the “Y3120* men”, negative for downstream branches, live in the Balkans (9 different surnames from Serbia, Bosnia and Herzegovina, Croatia https://dnk. poreklo.rs/DNK-projekat/ ). And, there are some Montenegrins who are yet to be verified.]