Аутор Тема: Древна ДНК - научни радови  (Прочитано 237516 пута)

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5170
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #1320 послато: Фебруар 20, 2024, 09:38:21 поподне »
Нисам успио пронаћи Y-DNA резултате у горе постављеном раду, иако наводе да су их дали у прилозима. Прилози ми се чине као да су непотпуни.

Сирови резултати такође још нису постављени на ENA.

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB68333?show=xrefs

Ван мреже Кековац

  • Уредник СДНКП
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 516
  • I2-S25733>PH2670>Y200040
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #1321 послато: Фебруар 20, 2024, 09:58:48 поподне »
Нисам успио пронаћи Y-DNA резултате у горе постављеном раду, иако наводе да су их дали у прилозима. Прилози ми се чине као да су непотпуни.

Сирови резултати такође још нису постављени на ENA.

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB68333?show=xrefs

Има терминалних SNP у прилогу 2, први Excel sheet. Све саме Corded Ware хаплогрупе: R1b-U106, R1b-U152, R1a-Z280 и један I2a2-L596

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5170
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #1322 послато: Фебруар 20, 2024, 10:20:10 поподне »
Има терминалних SNP у прилогу 2, први Excel sheet. Све саме Corded Ware хаплогрупе: R1b-U106, R1b-U152, R1a-Z280 и један I2a2-L596

Сад видим, нисам изгледа био нешто добро отворио.

На мрежи Ивица Јовановић

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 909
  • J-L70 > J-Z40772* mdDNA:HV-b15a
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #1323 послато: Фебруар 25, 2024, 08:50:06 поподне »
Видим да се данас махнито прича о раду "Ancient DNA connects large-scale migration with the spread of Slavic-associated culture" али не могу нигде да га нађем. Ни цео рад нити фајлове.
Милутин Бранковић, 4. ескадрон Коњичке дивизије. Крф 26.04.1916.
Сава Питић, 13. Пук. Острво Видo 24.01.1916.
Сима Мијуцић, 9. пешадијски пук. Браунау 1917.

На мрежи Ивица Јовановић

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 909
  • J-L70 > J-Z40772* mdDNA:HV-b15a
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #1324 послато: Фебруар 25, 2024, 08:54:12 поподне »
Милутин Бранковић, 4. ескадрон Коњичке дивизије. Крф 26.04.1916.
Сава Питић, 13. Пук. Острво Видo 24.01.1916.
Сима Мијуцић, 9. пешадијски пук. Браунау 1917.

Ван мреже Radul

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1691
  • J-Y230853 Башино Село, Цетиње > Кривошије
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #1325 послато: Фебруар 25, 2024, 09:28:39 поподне »
Ако се бојите, немојте то чинити; ако то радите, не бојте се! - Темуџин

Ван мреже Бећар

  • Члан Друштва
  • Помоћник
  • *****
  • Поруке: 169

Ван мреже Radul

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1691
  • J-Y230853 Башино Село, Цетиње > Кривошије
Ако се бојите, немојте то чинити; ако то радите, не бојте се! - Темуџин

Ван мреже Небо_Сав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 630
  • I-Y3120>I-PH908>I-BY93199
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #1328 послато: Март 07, 2024, 10:34:10 поподне »
https://www.pnas.org/doi/full/10.1073/pnas.2310545121#abstract

Genomic ancestry and social dynamics of the last hunter-gatherers of Atlantic France
I2a1 (I-L460), интересантан је процењени фенотип, са тамном кожом и плавим очима

Превод: гугл
Значај
Још од раног холоцена, западну и централну Европу насељавала је генетски различита група ловаца-сакупљача. Генерисали смо различите типове биомолекуларних података, укључујући секвенцирање комплетних генома велике покривености, из људских скелетних остатака сахрањених на иконичним локацијама Тевијек и Хоедик у Бретањи, који представљају неке од последњих ловаца-сакупљача западне Европе. Подаци показују да су ови последњи сакупљачи били део мреже људи који су одржавали егзогамне праксе. Ове социјално-културне динамике допринеле су избегавању инбридинга. Неки од појединаца сакупљача временски се поклапају са доласком неолитских фармера у суседне регионе. Међутим, нисмо нашли никакво наслеђе везано за фармере у анализираним ловцима-сакупљачима и мреже за размену партнера чине се искључивим за групу сакупљача.

Апстракт
Још од раног холоцена, западну и централну Европу насељавала је генетски различита група западних ловаца-сакупљача (WHGs). Ова група је на крају замењена и асимилована од стране долазећих неолитских фармера. Западни атлантски фасад био је дом неким од последњих мезолитских локалитета континенталне Европе, представљених иконичним отвореним локалитетима у Хоедику и Тевијеку у јужној Бретањи, Француска. Ови локалитети су познати по необично добро очуваним и богатим гробљима. Геномске студије мезолитских европских ловаца-сакупљача биле су ограничене на појединачне или неколико појединаца по локацији и наше разумевање социјалне динамике последњих мезолитских ловаца-сакупљача у Европи и њихових интеракција са долазећим фармерима је ограничено. Секвенцирали смо и анализирали комплетне геноме 10 појединаца са мезолитских локалитета Хоедик, Тевијек и Шампињи у Француској, четири од којих су секвенцирани са 23 до 8 пута већим покривањем генома. Анализа геномских, хронолошких и исхранских података открила је да су популације касног мезолита у Бретањи одржавале различите социјалне јединице у мрежи која размењује партнере. Ово је резултирало ниским биолошким сродством унутар групе које је спречавало консангвинично спаривање, упркос малој величини популације касног мезолита. У анализираним ловцима-сакупљачима нисмо пронашли генетско наслеђе од неолитских фармера, иако су неки од њих можда постојали у исто време са првим пољопривредним групама у суседним регионима. Стога, за разлику од претходних закључака базираних на стабилним изотопским подацима са истих локалитета, заједница касних мезолитских сакупљача била је ограничена на размену партнера са суседним групама ловаца-сакупљача, на искључење неолитских фармера.




https://i.imgur.com/ErSDEqQ.png



« Последња измена: Март 07, 2024, 10:39:53 поподне Небо_Сав »

Ван мреже Кековац

  • Уредник СДНКП
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 516
  • I2-S25733>PH2670>Y200040
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #1329 послато: Март 07, 2024, 11:06:23 поподне »
https://www.pnas.org/doi/full/10.1073/pnas.2310545121#abstract

Genomic ancestry and social dynamics of the last hunter-gatherers of Atlantic France
I2a1 (I-L460), интересантан је процењени фенотип, са тамном кожом и плавим очима

Превод: гугл
Значај
Још од раног холоцена, западну и централну Европу насељавала је генетски различита група ловаца-сакупљача. Генерисали смо различите типове биомолекуларних података, укључујући секвенцирање комплетних генома велике покривености, из људских скелетних остатака сахрањених на иконичним локацијама Тевијек и Хоедик у Бретањи, који представљају неке од последњих ловаца-сакупљача западне Европе. Подаци показују да су ови последњи сакупљачи били део мреже људи који су одржавали егзогамне праксе. Ове социјално-културне динамике допринеле су избегавању инбридинга. Неки од појединаца сакупљача временски се поклапају са доласком неолитских фармера у суседне регионе. Међутим, нисмо нашли никакво наслеђе везано за фармере у анализираним ловцима-сакупљачима и мреже за размену партнера чине се искључивим за групу сакупљача.

Апстракт
Још од раног холоцена, западну и централну Европу насељавала је генетски различита група западних ловаца-сакупљача (WHGs). Ова група је на крају замењена и асимилована од стране долазећих неолитских фармера. Западни атлантски фасад био је дом неким од последњих мезолитских локалитета континенталне Европе, представљених иконичним отвореним локалитетима у Хоедику и Тевијеку у јужној Бретањи, Француска. Ови локалитети су познати по необично добро очуваним и богатим гробљима. Геномске студије мезолитских европских ловаца-сакупљача биле су ограничене на појединачне или неколико појединаца по локацији и наше разумевање социјалне динамике последњих мезолитских ловаца-сакупљача у Европи и њихових интеракција са долазећим фармерима је ограничено. Секвенцирали смо и анализирали комплетне геноме 10 појединаца са мезолитских локалитета Хоедик, Тевијек и Шампињи у Француској, четири од којих су секвенцирани са 23 до 8 пута већим покривањем генома. Анализа геномских, хронолошких и исхранских података открила је да су популације касног мезолита у Бретањи одржавале различите социјалне јединице у мрежи која размењује партнере. Ово је резултирало ниским биолошким сродством унутар групе које је спречавало консангвинично спаривање, упркос малој величини популације касног мезолита. У анализираним ловцима-сакупљачима нисмо пронашли генетско наслеђе од неолитских фармера, иако су неки од њих можда постојали у исто време са првим пољопривредним групама у суседним регионима. Стога, за разлику од претходних закључака базираних на стабилним изотопским подацима са истих локалитета, заједница касних мезолитских сакупљача била је ограничена на размену партнера са суседним групама ловаца-сакупљача, на искључење неолитских фармера.




https://i.imgur.com/ErSDEqQ.png



Што се фенотипа тиче, то је типичан фенотип западних ловаца-сакупљача, од којих нам је остала хаплогрупа I2. Међутим неки од анализираних узорака имају другачији фенотип:

Цитат
We observe that while most individuals carry the dark skin and blue eyes characteristic of WHGs, D(4)-hoe003 and J(11)-hoe005 likely had pale to intermediate skin pigmentation.

Ово су они узорци који су поцепали грану I2a-L161. Иако су на PCA заузели сам шпиц WHG и магдаленског клина, изгледа су ипак имали и источњачке генетике, можда неку EHG примесу. О овим узорцима је већ било речи на теми https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=6835.msg195349#msg195349.

Ван мреже Небо_Сав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 630
  • I-Y3120>I-PH908>I-BY93199
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #1330 послато: Март 07, 2024, 11:36:37 поподне »
Што се фенотипа тиче, то је типичан фенотип западних ловаца-сакупљача, од којих нам је остала хаплогрупа I2. Међутим неки од анализираних узорака имају другачији фенотип:

Ово су они узорци који су поцепали грану I2a-L161. Иако су на PCA заузели сам шпиц WHG и магдаленског клина, изгледа су ипак имали и источњачке генетике, можда неку EHG примесу. О овим узорцима је већ било речи на теми https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=6835.msg195349#msg195349.
Хвала, Кековче, извињавам се,  вероватно сам превидео сам ову тему, тако да нисам  био отворио линк и прочитао чланак. 
Тако је то кад у постовима нема табела, дијаграма, слика..  :). Зато сам их ја стављам у поруке, изгледа ми прегледније, и потребно је мање времена при читању  да се види о чему се ради. Па ако је интересантно, може да се иде на линк, односно чланак. Хвала, у сваком случају.

На мрежи Јовица Кртинић

  • Члан Друштва
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 4197
  • Нема ни могућег ако не желимо немогуће!
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #1331 послато: Март 17, 2024, 03:19:46 поподне »
Интересантна емисија емитована на РТС у којој се говори и о археогенетичким налазима у истраживању порекла Словена (од 7:20):

<a href="https://www.youtube.com/v/HdF0oasqSdQ" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="bbc_link bbc_flash_disabled new_win">https://www.youtube.com/v/HdF0oasqSdQ</a>


« Последња измена: Март 17, 2024, 03:22:25 поподне Јовица Кртинић »

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5170
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #1332 послато: Март 18, 2024, 09:18:38 пре подне »
Нова студија древне ДНК о етногенези германских народа, преко 700 нових секвенцираних узорака. Ради се о препринту.

Steppe Ancestry in western Eurasia and the spread of the Germanic Languages

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.13.584607v1

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.13.584607v1.supplementary-material

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5170
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #1333 послато: Март 18, 2024, 09:30:14 пре подне »
Колико видим, два I2-Y3120 су нађена у Данској, али у викиншком периоду, вјероватно као генетички уплив сјеверних Словена.

У Данској су пронађена и два I2-M423 (видјећемо послије да ли ће бити и нешто ниже), један из раног неолита, други из гвозденог доба.

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5170
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #1334 послато: Март 18, 2024, 09:42:24 пре подне »
Што се тиче E-V13, пронађено је неколико узорака, већина из историјског периода. Најстарија два су из гвозденог доба са подручја Крима, један би требао бити https://www.yfull.com/tree/E-BY5022/ а други https://www.yfull.com/tree/E-A2192/

Доминантно словенске гране хаплогрупе R1a, R1a-Z280 и R1a-M458, пронађене само код три узорка. Хаплогрупа R1a-Z280 пронађена код једног узорка из гвозденог доба на тлу Француксе (латенска култура) и код једног узорка из Данске (антика). Хаплогрупа R1a-M458, тачније узводнија R1a-PF6155, нађена код једног узорка из Данске из периода антике.
« Последња измена: Март 18, 2024, 09:54:08 пре подне drajver »

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5170
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #1335 послато: Март 18, 2024, 10:10:40 пре подне »
Занимљиво је да је грана https://www.yfull.com/tree/I-Y7627/ која је иначе приутна на нашим просторима пронађена у овом истраживању у узорку из гвозденог доба на подручју Данске (Јитланда).

На мрежи Ивица Јовановић

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 909
  • J-L70 > J-Z40772* mdDNA:HV-b15a
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #1336 послато: Март 18, 2024, 11:01:49 пре подне »
Na koji način vršite pretragu po uzorcima?
Милутин Бранковић, 4. ескадрон Коњичке дивизије. Крф 26.04.1916.
Сава Питић, 13. Пук. Острво Видo 24.01.1916.
Сима Мијуцић, 9. пешадијски пук. Браунау 1917.

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5170
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #1337 послато: Март 18, 2024, 11:07:38 пре подне »
Na koji način vršite pretragu po uzorcima?

У Supplementary Material постоји ексцел табела са подацима о узорцима.
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2024/03/14/2024.03.13.584607/DC4/embed/media-4.xlsx?download=true

Ван мреже Кековац

  • Уредник СДНКП
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 516
  • I2-S25733>PH2670>Y200040
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #1338 послато: Март 18, 2024, 12:14:34 поподне »
Занимљиво је да је грана https://www.yfull.com/tree/I-Y7627/ која је иначе приутна на нашим просторима пронађена у овом истраживању у узорку из гвозденог доба на подручју Данске (Јитланда).

Потврђена је припадност овој грани код два рода из књиге о Херцеговцима: Љубибратићи и Миљанићи и Росандићи. Занимљив резултат.

На мрежи Ивица Јовановић

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 909
  • J-L70 > J-Z40772* mdDNA:HV-b15a
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #1339 послато: Март 18, 2024, 12:52:53 поподне »
Нађох једног J-Z423, Римљани у Холандији. мтДНА K1a4.
Милутин Бранковић, 4. ескадрон Коњичке дивизије. Крф 26.04.1916.
Сава Питић, 13. Пук. Острво Видo 24.01.1916.
Сима Мијуцић, 9. пешадијски пук. Браунау 1917.