Древна ДНК - научни радови

[Exiled]

Сумњам да је до новца и да га надлежни који раде на испитивању у БиХ имају више од колега у Србији. Мислим да је на делу незаинтересованост и незнање  о генетици у 2023 години ма колико то чудно звучало.

Нема то везе са новцем, то ти је више везано за "гусле"😊

[Кековац]

Прегледна мапа са узорцима старе ДНК који се могу повезати са Словенима (углавном период 9. до 15. века)

https://www.google.com/maps/d/u/0/viewer?mid=1hZ28c61g0tNMYLfrvoo3a2Y0chPeGTlH&ll=49.84842526832148%2C18.501412059844867&z=5

Подсетих се и овог J2b-Y22075 узорка из Белорусије (10-12 век). Интересантно би било видети која је дубља подграна, низводно је и кричка J-Y22059.

Откуд овај узорак са локалитета Гомолава? Пише у опису да је из рада Cosmopolitanism at the Roman Danubian Frontier, Slavic Migrations, and the Genomic Formation of Modern Balkan Peoples али тамо не видим да постоји узорак са овог локалитета већ само из Виминацијума, Књажевца и Ниша.

[drajver]

Јуче објављен препринт рада са прилично храбрим насловом Ancient DNA reveals the origins of the Albanians

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.06.05.543790v1

[drajver]

Пребацићу ову дискусију на тему о Албанцима.

[drajver]

Видим да су ових дана објављени сирови резултати из рада Early contact between late farming and pastoralist societies in southeastern Europe

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB62503

Гуја је неке од ових већ детаљније прегледао, надам се да ће нешто од тога објавити и овдје.

[drajver]

Ово је неки списак узорака са прелиминарно одређеним хаплогрупама.

BOY001.merge_Y.bam: Total SNPs: 19141 Result (56.4% 317 -7 +208): R-Z2103
BOY008.merge_Y.bam: Total SNPs: 9801 Result (59.9% 157 -0 +105): R-Y14420
BOY008.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 1475 Result (96.0% 24 -0 +1): R-M269 
BOY009.merge_Y.bam: Total SNPs: 14394 Result (57.6% 257 -4 +168): R-Z2103
BOY009.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 17435 Result (70.0% 242 -2 +95): R-Z2108
BOY014.merged_Y.bam: Total SNPs: 2574 Result (82.1% 26 -1 +2): J-M205 
BOY019.merge_Y.bam: Total SNPs: 4403 Result (55.6% 65 -0 +52): R-Z2108
BOY019.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 8496 Result (69.3% 88 -0 +39): R-Z2108
KTL001.merge_Y.bam: Total SNPs: 25466 Result (82.7% 383 -2 +73): I-S12195
KTL001.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 17841 Result (74.9% 182 -0 +61): I-S12195
KTL002.merge_Y.bam: Total SNPs: 130 Result (100.0% 2 -0 +0): F       
KTL003.merge_Y.bam: Total SNPs: 173 Result (100.0% 2 -0 +0): R-CTS3065
KTL004.merge_Y.bam: Total SNPs: 299 Result (50.0% 2 -0 +2): A0-T   
KTL005.merge_Y.bam: Total SNPs: 26336 Result (82.8% 378 -1 +75): R-V1636
KTL005.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 14024 Result (74.4% 128 -0 +44): R-V1636
KTL006.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 57662 Result (84.8% 698 -2 +118): I-L699 
KTL006.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 117582 Result (85.8% 1012 -0 +168): I-L699 
KTL007.merge_Y.bam: Total SNPs: 170
KTL008.merge_Y.bam: Total SNPs: 142 Result (-50.0% 2 -1 +0): A-L602 
MAJ002.B0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 281 Result (-33.3% 2 -1 +1): F       
MAJ003.merge_Y.bam: Total SNPs: 44628 Result (92.1% 780 -1 +64): G-P303 
MAJ003.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 42195 Result (88.2% 463 -0 +62): G-Z39332
MAJ004.merge_Y.bam: Total SNPs: 405 Result (75.0% 3 -0 +1): P-P337 
MAJ008.merge_Y.bam: Total SNPs: 58 Result (100.0% 1 -0 +0): T-L206 
MAJ009.merge_Y.bam: Total SNPs: 10962 Result (87.0% 181 -0 +27): R-L754 
MAJ009.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 5016 Result (80.3% 61 -0 +15): R-L754 
MAJ017.merge_Y.bam: Total SNPs: 46666 Result (88.7% 673 -0 +86): R-M12149
MAJ017.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 68881 Result (82.2% 666 -1 +141): R-Z2103
MAJ019.merge_Y.bam: Total SNPs: 106 Result (100.0% 2 -0 +0): CT     
MAJ020.merge_Y.bam: Total SNPs: 335 Result (63.6% 7 -0 +4): G-Y292455
MAJ023.merge_Y.bam: Total SNPs: 163 Result (100.0% 2 -0 +0): R-P297 
PIE003.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 41 Result (100.0% 1 -0 +0): R-BY161172
PIE004.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 29668 Result (84.4% 379 -0 +70): R-PF6287
PIE004.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 143502 Result (80.2% 1097 -2 +264): R-PF6287
PIE005.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 21476 Result (85.2% 288 -2 +43): C-Y83490
PIE006.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 59
PIE008.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 62 Result (100.0% 1 -0 +0): E-CTS12954
PIE009.A.merge_trim2_Y.bam: Total SNPs: 841 Result (80.0% 8 -0 +2): J-M410 
PIE010.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 11
PIE012.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 37
PIE013.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 11252 Result (86.2% 172 -1 +24): R-Y7777
PIE014.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 47 Result (100.0% 3 -0 +0): R-BY161172
PIE015.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 22789 Result (85.3% 366 -2 +56): G-FGC12126
PIE015.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 140276 Result (83.6% 1193 -3 +224): G-FGC12126
PIE017.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 26587 Result (79.5% 348 -2 +82): R-PF6287
PIE018.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 29
PIE019.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 12997 Result (90.7% 198 -1 +17): R-PF6287
PIE022.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 2789 Result (87.9% 51 -0 +7): G-PF3147
PIE023.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 30831 Result (87.6% 407 -1 +54): R-Y7777
PIE023.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 153887 Result (84.6% 1175 -2 +207): R-PF6287
PIE025.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 7310 Result (81.4% 105 -0 +24): T-M70   
PIE025.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 49068 Result (77.4% 405 -0 +118): T-Y14629
PIE026.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 3068 Result (81.7% 49 -0 +11): R-L754 
PIE028.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 22644 Result (83.1% 305 -0 +62): J-Z6050
PIE028.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 116237 Result (79.4% 883 -1 +225): J-Z6050
PIE029.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 9445 Result (83.3% 169 -0 +34): G-PH488
PIE030.A.merge_trim2_Y.bam: Total SNPs: 11Result (100.0% 2 -0 +0): R-BY161172
PIE032.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 2201 Result (92.5% 49 -0 +4): G-P15   
PIE033.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 28606 Result (87.1% 457 -1 +64): G-Z6484
PIE033.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 138233 Result (81.8% 1186 -2 +256): G-Z6128
PIE034.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 98 Result (50.0% 1 -0 +1): J-Y947 
PIE035.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 13

[drajver]

PIE037.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 21733 Result (85.9% 274 -0 +45): H-Y19962
PIE037.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 121907 Result (82.2% 934 -3 +191): H-FTC500
PIE038.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 42 Result (-50.0% 2 -1 +0): J-Y947 
PIE039.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 24
PIE041.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 122 Result (100.0% 1 -0 +0): R-YP555
PIE042.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 1361 Result (82.4% 28 -0 +6): R-V88   
PIE043.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 128 Result (100.0% 1 -0 +0): G-FTA27302
PIE044.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 2209 Result (74.4% 32 -1 +7): J-PF4610
PIE048.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 15
PIE050.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 38169 Result (88.1% 461 -1 +59): C-Y83490
PIE050.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 154524 Result (86.1% 1270 -6 +184): C-FT59486
PIE053.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 73 Result (100.0% 1 -0 +0): J-Y947 
PIE054.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 28635 Result (86.7% 448 -1 +65): G-P303 
PIE054.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 141697 Result (85.4% 1226 -4 +195): G-PF3345
PIE057.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 43294 Result (85.3% 556 -6 +75): C-BY36620
PIE057.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 173177 Result (86.1% 1469 -13 +192): C-BY36620
PIE058.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 24856 Result (85.7% 381 -1 +60): G-L140 
PIE06061.merge_trim2_Y.bam: Total SNPs: 35813 Result (85.1% 472 -1 +79): I-L701 
PIE061.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 113088 Result (79.9% 893 -4 +209): I-Y5606
PIE062.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 3838 Result (91.9% 57 -0 +5): G-P15   
PIE063.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 20168 Result (85.3% 290 -2 +43): C-Y83490
PIE064.C0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 2355 Result (97.3% 36 -0 +1): R-M269 
PIE064.D0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 19
PIE065.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 55 Result (100.0% 1 -0 +0): E-CTS12954
PIE069.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 87
PIE071631.merge.trim2_trim2_Y.bam: Total SNPs: 18829 Result (80.3% 284 -5 +51): J-Y15913
PIE074.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 34
PIE075.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 23
PIE076.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 26699 Result (86.4% 327 -1 +48): C-Y83490
PIE076.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 97323 Result (81.8% 798 -3 +166): C-Y83490
PIE077.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 72 Result (100.0% 1 -0 +0): E-CTS12954
PIE078.G0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 8364 Result (88.0% 117 -0 +16): I-L621 
PTK001.A0101.TF1.1_trim10_Y.bam: Total SNPs: 16618 Result (59.8% 202 -1 +131): IJK     
PTK003.merged_trim10_Y.bam: Total SNPs: 2179 Result (62.5% 20 -0 +12): R-PF6287
PTK004.A0101.TF1.1_trim10_Y.bam: Total SNPs: 6055 Result (65.9% 87 -0 +45): I-Y344225
PTK005.A0101.TF1.1_trim10_Y.bam: Total SNPs: 20056 Result (73.1% 357 -3 +119): G-CTS342
UBK003.merge_Y.bam: Total SNPs: 238 Result (100.0% 3 -0 +0): G       
UBK006.merge_Y.bam: Total SNPs: 17345 Result (80.5% 265 -0 +64): I-BY33169
UBK006.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 12527 Result (74.1% 109 -0 +38): I-M838 
USV004.merge_Y.bam: Total SNPs: 234 Result (100.0% 2 -0 +0): I       
USV005.merge_Y.bam: Total SNPs: 486 Result (71.4% 5 -0 +2): I-CTS10228
VAR002.B0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 17 Result (100.0% 1 -0 +0): G-P15   
VAR003.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 48 Result (100.0% 1 -0 +0): R-BY161172
VAR004.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 16465 Result (87.2% 258 -0 +38): G-PH488
VAR006.A0101.TF1.2_trim2_Y.bam: Total SNPs: 11627 Result (82.0% 143 -2 +24): I-L596 
VAR008.B0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 8322 Result (87.7% 131 -1 +15): R-PF6287
VAR009.A0101.TF1.2_trim2_Y.bam: Total SNPs: 31674 Result (88.4% 506 -1 +63): E-L618 
VAR010.B0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 32855 Result (91.0% 496 -1 +46): T-Y6033
VAR011.A0101.TF1.2_trim2_Y.bam: Total SNPs: 32621 Result (83.9% 489 -3 +83): G-PF3148
VAR012.B0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 100 Result (100.0% 1 -0 +0): H-Z34873
VAR016.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 13935 Result (84.7% 211 -0 +38): T-L162 
VAR017.B0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 75 Result (25.0% 1 -0 +3): E-CTS12954
VAR018.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 23163 Result (85.2% 369 -2 +57): E-L618 
VAR019.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 21811 Result (89.2% 346 -0 +42): R-PF6287
VAR020.A0101.TF1.2_trim2_Y.bam: Total SNPs: 15683 Result (86.5% 212 -0 +33): R-Y7777
VAR021.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 44 Result (100.0% 2 -0 +0): R-BY161172
VAR022.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 44237 Result (88.4% 607 -0 +80): T-Y6033
VAR023_ANI160.merge_trim2_Y.bam: Total SNPs: 13441 Result (89.1% 229 -0 +28): G-PH488
VAR026.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 2761 Result (86.2% 50 -0 +8): R-PF6287
VAR027.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 52 Result (100.0% 1 -0 +0): J-Y947 
VAR030.B0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 15395 Result (83.8% 223 -2 +36): I-L699 
VAR032.B0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 28790 Result (85.9% 396 -2 +58): T-Y6033

[drajver]

VAR033.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 62 Result (66.7% 2 -0 +1): R-FGC52936
VAR034.A0101.TF1.2_trim2_Y.bam: Total SNPs: 28
YUN001.merge_Y.bam: Total SNPs: 56 Result (100.0% 1 -0 +0): R-Y111961
YUN003_049.merge_Y.bam: Total SNPs: 112 Result (50.0% 1 -0 +1): R-Y62620
YUN005.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 50 Result (50.0% 1 -0 +1): F       
YUN006_031.merge_Y.bam: Total SNPs: 188 Result (33.3% 2 -0 +4): E-CTS12954
YUN007.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 33166 Result (88.6% 453 -1 +55): J-Y13128
YUN007.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 140533 Result (84.2% 1112 -4 +195): J-Z36834
YUN009.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 27227 Result (88.9% 420 -1 +49): G-FGC82036
YUN009.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 133898 Result (85.7% 1171 -4 +181): G-FGC82036
YUN012.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 75 Result (33.3% 1 -0 +2): E-CTS12954
YUN013.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 20254 Result (79.6% 266 -3 +57): C-F15182
YUN013.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 109129 Result (74.4% 908 -6 +289): C-F16270
YUN014.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 50
YUN015.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 6266 Result (90.6% 96 -0 +10): G-L30   
YUN019.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 78
YUN021.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 107 Result (33.3% 1 -0 +2): E-CTS447
YUN025.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 77 Result (100.0% 1 -0 +0): J       
YUN026.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 19851 Result (82.1% 238 -0 +52): J-Y13128
YUN026.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 64945 Result (71.2% 504 -3 +191): J-Y13128
YUN027_I0781.merge_trim2_Y.bam: Total SNPs: 422 Result (37.5% 3 -0 +5): R-BY34758
YUN028.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 42
YUN033.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 26 Result (100.0% 1 -0 +0): B-L1388
YUN034.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 7
YUN035.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 47
YUN036.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 14 Result (100.0% 1 -0 +0): E-CTS12954
YUN037.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 17132 Result (82.6% 239 -2 +43): I-L621 
YUN038.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 26912 Result (85.2% 363 -2 +56): I-S19848
YUN038.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 105625 Result (80.2% 846 -5 +190): I-S19848
YUN039.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 34
YUN041.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 77 Result (100.0% 1 -0 +0): J-Y947 
YUN042.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 59 Result (100.0% 1 -0 +0): J-Y947 
YUN043.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 95 Result (100.0% 1 -0 +0): J-Y947 
YUN044.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 20
YUN045.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 29 Result (100.0% 1 -0 +0): O-Y141174
YUN048.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 10848 Result (79.4% 142 -1 +33): H-Y19966
YUN048.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 40816 Result (76.1% 330 -2 +96): H-Y19966

[Небојша]

Ово је неки списак узорака са прелиминарно одређеним хаплогрупама.
BOY001.merge_Y.bam: Total SNPs: 19141 Result (56.4% 317 -7 +208): R-Z2103
BOY008.merge_Y.bam: Total SNPs: 9801 Result (59.9% 157 -0 +105): R-Y14420
BOY008.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 1475 Result (96.0% 24 -0 +1): R-M269 
BOY009.merge_Y.bam: Total SNPs: 14394 Result (57.6% 257 -4 +168): R-Z2103
BOY009.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 17435 Result (70.0% 242 -2 +95): R-Z2108
BOY014.merged_Y.bam: Total SNPs: 2574 Result (82.1% 26 -1 +2): J-M205 
BOY019.merge_Y.bam: Total SNPs: 4403 Result (55.6% 65 -0 +52): R-Z2108
BOY019.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 8496 Result (69.3% 88 -0 +39): R-Z2108

Која ли је ово M205 у мору R1b-Z2103. Божаново, Бугарска. Знамо ли тачно из код периода датирају сви ови узорци? Видим да се међу резултатима јавља и J-Y13128, низводно је она J2a-Y14439 присутна данас код динарских Срба, Бугара и Италијана.

[CosicZ]

https://anthrogenica.com/showthread.php?28491-Early-contact-between-late-farming-and-pastoralist-societies-in-southeastern-Europe

YUN037.A0101.TF1.1_trim2_Y   I-L621*(xI-Y44940,I-Y81696,I-Y39505,I-Y85905,I-Y5596,I-Y140266,I-Y32084,I-FT138628,I-Y39942,I-BY31905)   S10302   14054   1340
YUN038.A0101.TF1.1_trim2_Y   I-S19848*(xI-Y85772,I-Y81696,I-Y225862,I-Y140266,I-Y188845,I-PH3310,I-Y56203,I-Y251275,I-Y265455,I-Y62880,I-BY89974)   S19848   20164   2443
YUN038.Ymerged_Y   I-S19848*(xI-Y85772,I-Y44940,I-CTS10228,I-FGC20473,I-BY31905)   S19848   225924   20951

[drajver]

Која ли је ово M205 у мору R1b-Z2103. Божаново, Бугарска. Знамо ли тачно из код периода датирају сви ови узорци? Видим да се међу резултатима јавља и J-Y13128, низводно је она J2a-Y14439 присутна данас код динарских Срба, Бугара и Италијана.

Текстуални дио рада још увијек није објављен, тако да треба сачекати са тачнијим временским позиционирањем.

Оно што наводе у апстракту даје грубу слику из ког периода су узорци: "However, what happened between the demise of the Copper Age settlements ~4250 BCE and the expansion of pastoralists remains poorly understood. To address this question, we analysed genome-wide data from 135 ancient individuals from the contact zone between southeastern Europe and the northwestern Black Sea region spanning this critical time period."

[drajver]

https://anthrogenica.com/showthread.php?28491-Early-contact-between-late-farming-and-pastoralist-societies-in-southeastern-Europe

Прегледао је Гуја оба ова узорка, има објављено на теми на антхрогеници, оба су негативна на CTS4002. Нису ближе повезани са I-Y3120.

[Глигорија]

11627 Result (82.0% 143 -2 +24): I-L596
А овај узорак? Колко је стар и колико је далеко од I-Y16418?

[Кековац]

Прегледао је Гуја оба ова узорка, има објављено на теми на антхрогеници, оба су негативна на CTS4002. Нису ближе повезани са I-Y3120.

А овај узорак USV005.merge_Y.bam: Total SNPs: 486 Result (71.4% 5 -0 +2): I-CTS10228 ?

[drajver]

А овај узорак USV005.merge_Y.bam: Total SNPs: 486 Result (71.4% 5 -0 +2): I-CTS10228 ?

То су програмски избачене предикције хаплогрупа. Прилично непоуздане и са могућим лажним очитавањима. Ништа без ручне провјере.

[Црна Гуја]

Прегледао је Гуја оба ова узорка, има објављено на теми на антхрогеници, оба су негативна на CTS4002. Нису ближе повезани са I-Y3120.

Прегледао сам синоћ тек пар узорака, оних нама најзанимљивијих:


YUN037; ~4600-4300 BC; Yunatsite, Pazardzhik, Bulgaria; KGK_VI_CA; I2-L621 (xY45825,CTS4002,Y85772)

L621 level: 8 derived SNPs

L621>Y45825 level: 6 ancestral SNPs

L621>CTS10936 level: *no calls*

L621>CTS10936>S19848 level: DEL

L621>CTS10936>S19848>CTS4002 level: CTS4002- C>A (1C); S23503/SK1240/YP198- G>A (1G)

L621>CTS10936>S19848>Y85772 level: Y101018- C>T (1C); Y94278- G>A (1G)


YUN038; ~4600-4300 BC; Yunatsite, Pazardzhik, Bulgaria; KGK_VI_CA; I2-L621>CTS10936>S19848* (xCTS4002,Y85772)

L621 level: 26 derived SNPs, 1 ambiguous SNP, 1 ancestral SNP

L621>CTS10936 level: CTS11768+ C>A (2A); FGC12092/YP224+ G>A (2A)

L621>CTS10936>S19848 level: S19848+  T>A (4A)

L621>CTS10936>S19848>CTS4002 level: CTS4002- C>A (2C)

L621>CTS10936>S19848>Y85772 level: 11 ancestral SNPs


Занимљиво је да два узорка из Варне (VAR009 и VAR018) припадају прилично реткој грани, паралелној са E-V13:

https://www.yfull.com/tree/E-Y182141/

[НиколаВук]

Локалитет Јунаците је велики тел, на тој локацији се са повременим прекидима живело од раног неолита па до краја праисторије. Узорци које је Гуја прегледао потичу из халколитске (енеолитске, бакарнодобне) фазе која се везује за културу Караново VI (једног од основних стубова археолошког комплекса Коџадермен-Гумелница-Караново VI); та фаза је имала насилан крај, приликом чега је дошло до спаљивања насеља и погибије његових становника (за које су написали да су се у тренутку напада углавном састојали од жена, деце и старих људи); у спаљеним остацима станишта су налажени и скелетни остаци погинулих, често са јасним знацима насилне смрти. Било би добро проверити да ли узорци YUN037 и YUN038 припадају некима од тих насилно страдалих или су укопани на стандардан начин, односно да су пронађени унутар некрополе. Цео археолошки комплекс коме је припадала култура Караново VI се наслањао и био у блиским односима са североисточнијом Кукутени-Трипоље културом, са којом се прожимао на простору Влашке низије (такође култура Варне припада овом комплексу и прилично је блиска са Караново VI културом). Ако се добро сећам, још неки I2-L621 узорци су нађени и у Румунији, нисам сигуран да ли се исто датују као и Караново VI (друга половина 5. миленијума п.н.е.), у сваком случају мени делује да се I2-L621 најпре може везати уз Кукутени-Трипоље, иако на тамошњим налазиштима није још увек нађена (можда је била присутна јужније, односно само на простору Румуније?). Занимљив је и проналазак гране паралелне E-V13 на некрополи у Варни, то њене почетке чини ми се чвршће повезује са ареалом Црног мора (и то можда баш западне обале Црног мора).

https://bg.wikipedia.org/wiki/%D0%A1%D0%B5%D0%BB%D0%B8%D1%89%D0%BD%D0%B0_%D0%BC%D0%BE%D0%B3%D0%B8%D0%BB%D0%B0_%E2%80%9E%D0%AE%D0%BD%D0%B0%D1%86%D0%B8%D1%82%D0%B5%E2%80%9C
https://bg.wikipedia.org/wiki/%D0%9A%D0%B0%D1%80%D0%B0%D0%BD%D0%BE%D0%B2%D0%BE_VI
https://bg.wikipedia.org/wiki/%D0%9A%D0%BE%D0%B4%D0%B6%D0%B0%D0%B4%D0%B5%D1%80%D0%BC%D0%B5%D0%BD_%E2%80%93_%D0%93%D1%83%D0%BC%D0%B5%D0%BB%D0%BD%D0%B8%D1%86%D0%B0_%E2%80%93_%D0%9A%D0%B0%D1%80%D0%B0%D0%BD%D0%BE%D0%B2%D0%BE_VI

https://en.wikipedia.org/wiki/Tell_Yunatsite
https://en.wikipedia.org/wiki/Gumelni%C8%9Ba_culture
https://en.wikipedia.org/wiki/Gumelni%C8%9Ba%E2%80%93Kod%C5%BEadermen-Karanovo_VI_complex

[Кековац]

Локалитет Јунаците је велики тел, на тој локацији се са повременим прекидима живело од раног неолита па до краја праисторије. Узорци које је Гуја прегледао потичу из халколитске (енеолитске, бакарнодобне) фазе која се везује за културу Караново VI (једног од основних стубова археолошког комплекса Коџадермен-Гумелница-Караново VI); та фаза је имала насилан крај, приликом чега је дошло до спаљивања насеља и погибије његових становника (за које су написали да су се у тренутку напада углавном састојали од жена, деце и старих људи); у спаљеним остацима станишта су налажени и скелетни остаци погинулих, често са јасним знацима насилне смрти. Било би добро проверити да ли узорци YUN037 и YUN038 припадају некима од тих насилно страдалих или су укопани на стандардан начин, односно да су пронађени унутар некрополе. Цео археолошки комплекс коме је припадала култура Караново VI се наслањао и био у блиским односима са североисточнијом Кукутени-Трипоље културом, са којом се прожимао на простору Влашке низије (такође култура Варне припада овом комплексу и прилично је блиска са Караново VI културом). Ако се добро сећам, још неки I2-L621 узорци су нађени и у Румунији, нисам сигуран да ли се исто датују као и Караново VI (друга половина 5. миленијума п.н.е.), у сваком случају мени делује да се I2-L621 најпре може везати уз Кукутени-Трипоље, иако на тамошњим налазиштима није још увек нађена (можда је била присутна јужније, односно само на простору Румуније?). Занимљив је и проналазак гране паралелне E-V13 на некрополи у Варни, то њене почетке чини ми се чвршће повезује са ареалом Црног мора (и то можда баш западне обале Црног мора).

https://bg.wikipedia.org/wiki/%D0%A1%D0%B5%D0%BB%D0%B8%D1%89%D0%BD%D0%B0_%D0%BC%D0%BE%D0%B3%D0%B8%D0%BB%D0%B0_%E2%80%9E%D0%AE%D0%BD%D0%B0%D1%86%D0%B8%D1%82%D0%B5%E2%80%9C
https://bg.wikipedia.org/wiki/%D0%9A%D0%B0%D1%80%D0%B0%D0%BD%D0%BE%D0%B2%D0%BE_VI
https://bg.wikipedia.org/wiki/%D0%9A%D0%BE%D0%B4%D0%B6%D0%B0%D0%B4%D0%B5%D1%80%D0%BC%D0%B5%D0%BD_%E2%80%93_%D0%93%D1%83%D0%BC%D0%B5%D0%BB%D0%BD%D0%B8%D1%86%D0%B0_%E2%80%93_%D0%9A%D0%B0%D1%80%D0%B0%D0%BD%D0%BE%D0%B2%D0%BE_VI

https://en.wikipedia.org/wiki/Tell_Yunatsite
https://en.wikipedia.org/wiki/Gumelni%C8%9Ba_culture
https://en.wikipedia.org/wiki/Gumelni%C8%9Ba%E2%80%93Kod%C5%BEadermen-Karanovo_VI_complex

Узорци из Румуније су били из бакарног (I7137 Bodrogkeresztur I-L621) и бронзаног доба (I10479 Carlomanesti Arman I-L621>CTS4002).

Био је још један из Бугарске I19454 из раног бронзаног доба који је ако се не варам I-L621* са локалитета TellKran.

Мислим да имамо тренутно два хотспота хаплогрупе L621 у бронзаном добу, једну у данашњој Румунији око Карпата, а другу јужно од планине Балкан на северозападу Тракије. Можда су обронци Карпатско-балканског планинског венца служили дуго као рефугијум за мезолитску генетику, кроз цео неолит и халколит.

[CosicZ]

https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-S10302/tree
https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-S10302/ancient

Колико видим I-L621 је и PIE078.

[Кековац]

Оно што је још занимљиво је старост узорка 7137 из Румуније, а то је око 6000 година, што је веома близу TMRCA гране L621 који је 6500 година. Мада, узорак је додат на FTDNA стабло и изгледа да цепа овај ниво тако што формира грану S10302.