Форум - Порекло

ДНК порекло => Aрхеологија и археогенетика => Тему започео: Црна Гуја Јануар 20, 2017, 12:50:52 пре подне

Наслов: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Јануар 20, 2017, 12:50:52 пре подне
На овој теми биће објављивани радови везани за древну ДНК, са линковима ка оригиналним текстовима и додатним информацијама. Постављам прво неколико најбитнијих радова из претходних пет година, а постепено ћу додавати и остале, као и оне објављене пре 2012. Наравно, свако је слободан предложити радове за које мисли да су битни а нису већ постављени.


2012:


Keller et al.: New insights into the Tyrolean Iceman's origin and phenotype as inferred by whole-genome sequencing

http://www.nature.com/articles/ncomms1701 (http://www.nature.com/articles/ncomms1701)

http://www.nature.com/article-assets/npg/ncomms/journal/v3/n2/extref/ncomms1701-s1.pdf (http://www.nature.com/article-assets/npg/ncomms/journal/v3/n2/extref/ncomms1701-s1.pdf)


Fu et al.: DNA analysis of an early modern human from Tianyuan Cave, China

http://www.pnas.org/content/110/6/2223.full.pdf (http://www.pnas.org/content/110/6/2223.full.pdf)

http://www.pnas.org/content/110/6/2223.full.pdf?with-ds=yes (http://www.pnas.org/content/110/6/2223.full.pdf?with-ds=yes)


2013:


Lazaridis et al.: Ancient human genomes suggest three ancestral populations for present-day Europeans

http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2013/12/23/001552.full.pdf (http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2013/12/23/001552.full.pdf)

http://biorxiv.org/content/biorxiv/suppl/2014/04/05/001552.DC4/001552-1.pdf (http://biorxiv.org/content/biorxiv/suppl/2014/04/05/001552.DC4/001552-1.pdf)


Raghavan et al.: Upper Palaeolithic Siberian genome reveals dual ancestry of Native Americans

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4105016/pdf/nihms583477.pdf (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4105016/pdf/nihms583477.pdf)

http://www.nature.com/nature/journal/v505/n7481/extref/nature12736-s1.pdf (http://www.nature.com/nature/journal/v505/n7481/extref/nature12736-s1.pdf)


2014:


Gamba et al.: Genome flux and stasis in a five millennium transect of European prehistory

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4218962/pdf/ncomms6257.pdf (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4218962/pdf/ncomms6257.pdf)

http://www.nature.com/article-assets/npg/ncomms/2014/141021/ncomms6257/extref/ncomms6257-s1.pdf (http://www.nature.com/article-assets/npg/ncomms/2014/141021/ncomms6257/extref/ncomms6257-s1.pdf)


Skoglund et al.: Genomic Diversity and Admixture Differs for Stone-Age Scandinavian Foragers and Farmers

http://biology-web.nmsu.edu/~houde/Genomic%20Diversity%20and%20Admixture%20Differs%20for%20Stone-Age%20Scandinavian%20Foragers%20and%20Farmers.pdf (http://biology-web.nmsu.edu/~houde/Genomic%20Diversity%20and%20Admixture%20Differs%20for%20Stone-Age%20Scandinavian%20Foragers%20and%20Farmers.pdf)


Rasmussen et al.: The genome of a Late Pleistocene human from a Clovis burial site in western Montana

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4878442/pdf/nihms786416.pdf (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4878442/pdf/nihms786416.pdf)

http://www.nature.com/nature/journal/v506/n7487/extref/nature13025-s1.pdf (http://www.nature.com/nature/journal/v506/n7487/extref/nature13025-s1.pdf)


Fu et al.: Genome sequence of a 45,000-year-old modern human from western Siberia

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4753769/pdf/nihms756266.pdf (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4753769/pdf/nihms756266.pdf)

http://www.nature.com/nature/journal/v514/n7523/extref/nature13810-s1.pdf (http://www.nature.com/nature/journal/v514/n7523/extref/nature13810-s1.pdf)


Seguin-Orlando et al.: Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years

http://science.sciencemag.org/content/346/6213/1113.full (http://science.sciencemag.org/content/346/6213/1113.full)

https://www.repository.cam.ac.uk/bitstream/handle/1810/246496/Seguin-Orlando-et-al-Science-Genomic-Structure-in-Europeans-dating-back-at-least-36-200-years.pdf;sequence=1 (https://www.repository.cam.ac.uk/bitstream/handle/1810/246496/Seguin-Orlando-et-al-Science-Genomic-Structure-in-Europeans-dating-back-at-least-36-200-years.pdf;sequence=1)


Olalde et al.: Derived immune and ancestral pigmentation alleles in a 7,000-year-old Mesolithic European

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4269527/pdf/nihms643758.pdf (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4269527/pdf/nihms643758.pdf)

http://www.nature.com/nature/journal/v507/n7491/extref/nature12960-s1.pdf (http://www.nature.com/nature/journal/v507/n7491/extref/nature12960-s1.pdf)


Szécsényi-Nagy et al.: Tracing the genetic origin of Europe's first farmers reveals insights into their social organization

http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2014/09/03/008664.full.pdf (http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2014/09/03/008664.full.pdf)

http://biorxiv.org/content/biorxiv/suppl/2014/09/03/008664.DC1/008664-1.pdf (http://biorxiv.org/content/biorxiv/suppl/2014/09/03/008664.DC1/008664-1.pdf)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Јануар 20, 2017, 12:51:22 пре подне
2015:


Haak et al.: Massive migration from the steppe was a source for Indo-European languages in Europe

http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2015/02/10/013433.full.pdf (http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2015/02/10/013433.full.pdf)

http://www.nature.com/nature/journal/v522/n7555/extref/nature14317-s1.pdf (http://www.nature.com/nature/journal/v522/n7555/extref/nature14317-s1.pdf)


Mathieson et al.: Genome-wide patterns of selection in 230 ancient Eurasians

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4918750/pdf/nihms734926.pdf (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4918750/pdf/nihms734926.pdf)

http://www.nature.com/nature/journal/v528/n7583/extref/nature16152-s1.pdf (http://www.nature.com/nature/journal/v528/n7583/extref/nature16152-s1.pdf)


Allentoft et al.: Population genomics of Bronze Age Eurasia

http://www.nature.com/nature/journal/v522/n7555/full/nature14507.html (http://www.nature.com/nature/journal/v522/n7555/full/nature14507.html)

http://www.nature.com/nature/journal/v522/n7555/extref/nature14507-s1.pdf (http://www.nature.com/nature/journal/v522/n7555/extref/nature14507-s1.pdf)


Jones et al.: Upper Palaeolithic genomes reveal deep roots of modern Eurasians

http://www.nature.com/articles/ncomms9912 (http://www.nature.com/articles/ncomms9912)

http://www.nature.com/article-assets/npg/ncomms/2015/151116/ncomms9912/extref/ncomms9912-s1.pdf (http://www.nature.com/article-assets/npg/ncomms/2015/151116/ncomms9912/extref/ncomms9912-s1.pdf)


Cassidy et al.: Neolithic and Bronze Age migration to Ireland and establishment of the insular Atlantic genome

http://www.pnas.org/content/113/2/368.full.pdf (http://www.pnas.org/content/113/2/368.full.pdf)

http://www.pnas.org/content/suppl/2015/12/23/1518445113.DCSupplemental/pnas.1518445113.sapp.pdf (http://www.pnas.org/content/suppl/2015/12/23/1518445113.DCSupplemental/pnas.1518445113.sapp.pdf)


Günther et al.: Ancient genomes link early farmers from Atapuerca in Spain to modern-day Basques

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4586848/ (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4586848/)

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4586848/pdf/pnas.201509851.pdf (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4586848/pdf/pnas.201509851.pdf)


Hofmanova et al.: Early farmers from across Europe directly descended from Neolithic Aegeans

http://www.pnas.org/content/113/25/6886.full.pdf (http://www.pnas.org/content/113/25/6886.full.pdf)

http://www.pnas.org/content/suppl/2016/06/02/1523951113.DCSupplemental/pnas.1523951113.sapp.pdf (http://www.pnas.org/content/suppl/2016/06/02/1523951113.DCSupplemental/pnas.1523951113.sapp.pdf)


Rasmussen et al.: The ancestry and affiliations of Kennewick Man

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4878456/pdf/nihms-786414.pdf (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4878456/pdf/nihms-786414.pdf)

http://www.nature.com/nature/journal/v523/n7561/extref/nature14625-s1.pdf (http://www.nature.com/nature/journal/v523/n7561/extref/nature14625-s1.pdf)


Fu et al.: An early modern human from Romania with a recent Neanderthal ancestor

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4537386/pdf/nihms688129.pdf (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4537386/pdf/nihms688129.pdf)

http://www.nature.com/nature/journal/v524/n7564/extref/nature14558-s1.pdf (http://www.nature.com/nature/journal/v524/n7564/extref/nature14558-s1.pdf)


2016:


Fu et al.: The genetic history of Ice Age Europe

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4943878/pdf/nihms777742.pdf (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4943878/pdf/nihms777742.pdf)

http://www.nature.com/nature/journal/v534/n7606/extref/nature17993-s1.pdf (http://www.nature.com/nature/journal/v534/n7606/extref/nature17993-s1.pdf)


Lazaridis et al.: The genetic structure of the world’s first farmers

http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2016/06/16/059311.full.pdf (http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2016/06/16/059311.full.pdf)

http://biorxiv.org/content/biorxiv/suppl/2016/06/16/059311.DC1/059311-1.pdf (http://biorxiv.org/content/biorxiv/suppl/2016/06/16/059311.DC1/059311-1.pdf)


Broushaki et al.: Early Neolithic genomes from the eastern Fertile Crescent

http://science.sciencemag.org/content/353/6298/499.full (http://science.sciencemag.org/content/353/6298/499.full)

http://science.sciencemag.org/content/sci/suppl/2016/07/13/science.aaf7943.DC1/Broushaki.SM.pdf (http://science.sciencemag.org/content/sci/suppl/2016/07/13/science.aaf7943.DC1/Broushaki.SM.pdf)


Martiniano et al.: Genomic signals of migration and continuity in Britain before the Anglo-Saxons

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4735653/pdf/ncomms10326.pdf (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4735653/pdf/ncomms10326.pdf)

http://www.nature.com/article-assets/npg/ncomms/2016/160119/ncomms10326/extref/ncomms10326-s1.pdf (http://www.nature.com/article-assets/npg/ncomms/2016/160119/ncomms10326/extref/ncomms10326-s1.pdf)


Schiffels et al.: Iron Age and Anglo-Saxon genomes from East England reveal British migration history

http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2015/07/17/022723.full.pdf (http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2015/07/17/022723.full.pdf)

http://biorxiv.org/content/biorxiv/suppl/2015/07/17/022723.DC1/022723-1.pdf (http://biorxiv.org/content/biorxiv/suppl/2015/07/17/022723.DC1/022723-1.pdf)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Јануар 20, 2017, 12:51:45 пре подне
Резервисано.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Јануар 20, 2017, 12:52:07 пре подне
Резервисано.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Јануар 20, 2017, 01:10:12 поподне
Ево још пар радова. Ова година ће бити ''родна'' што се тиче древне ДНК  :)
2013:

High resolution mapping of Y haplogroup G in Tyrol (Austria) 2013.

http://www.blutspendezurich.ch/Media/File/Publikationen%202013/High%20resolution%20mapping%20of%20Y%20haplogroup%20G(2).pdf (http://www.blutspendezurich.ch/Media/File/Publikationen%202013/High%20resolution%20mapping%20of%20Y%20haplogroup%20G(2).pdf)

2016:

Paleogenetic analyses on Mesolithic to Early Bronze Age individuals from the Iberian Peninsula

https://publications.ub.uni-mainz.de/theses/volltexte/2016/100000815/pdf/100000815.pdf (https://publications.ub.uni-mainz.de/theses/volltexte/2016/100000815/pdf/100000815.pdf)

Y-chromosomal DNA analyzed for four prehistoric cemeteries from Cis-Baikal, Siberia

http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352409X16306927 (http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352409X16306927)

И најновији рад Кљосова.
2017:


Excavated DNA from Two Khazar Burials

http://file.scirp.org/pdf/AA_2017011815275855.pdf (http://file.scirp.org/pdf/AA_2017011815275855.pdf)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Јануар 20, 2017, 10:35:36 поподне
Најновије: Jan. 18, 2017

Modern human origins: multiregional evolution of autosomes and East Asia origin of Y and mtDNA

http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2017/01/18/101410.full.pdf (http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2017/01/18/101410.full.pdf)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Јануар 24, 2017, 06:17:29 поподне
Први резултати древне ДНК из средњег века ове године, рани средњи век, јужна Немачка.  :)

Нажалост за приступ целом раду се мора платити.

The paper's about kinship and social structure, and not geared for ancient population genetics. But the Y-chromosome haplogroups include R1b (7), I1 (2), I2b1 (2), and I2b, and the mitochondrial haplogroups include T2f (6), H2a2 (3), H1b, HV0*, U3a and U5a. Keep in mind that many of these samples are close relatives.
http://eurogenes.blogspot.rs/2017/01/ancient-dna-evidence-of-emerging-noble.html?m=1 (http://eurogenes.blogspot.rs/2017/01/ancient-dna-evidence-of-emerging-noble.html?m=1)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Јануар 24, 2017, 06:26:16 поподне
Први резултати древне ДНК из средњег века ове године, рани средњи век, јужна Немачка.  :)

Нажалост за приступ целом раду се мора платити.

The paper's about kinship and social structure, and not geared for ancient population genetics. But the Y-chromosome haplogroups include R1b (7), I1 (2), I2b1 (2), and I2b, and the mitochondrial haplogroups include T2f (6), H2a2 (3), H1b, HV0*, U3a and U5a. Keep in mind that many of these samples are close relatives.
http://eurogenes.blogspot.rs/2017/01/ancient-dna-evidence-of-emerging-noble.html?m=1 (http://eurogenes.blogspot.rs/2017/01/ancient-dna-evidence-of-emerging-noble.html?m=1)

I2b1 и I2b су, претпостављам, I2a2-М223 по новијој номенклатури?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Јануар 24, 2017, 06:30:37 поподне
Колико сам схватио тако је, не бавим се толико гранама И2 па нисам сигуран.
Видећемо шта ће Црна Гуја рећи.  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Јануар 24, 2017, 09:12:19 поподне
Нисам још стигао да погледам о чему се ради, али НиколаВук је у праву, ако су написали I2b1 у питању је I2a2a-M223. Не знам из ког разлога користе номенклатуру од пре скоро 10 година.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Јануар 25, 2017, 02:44:41 поподне
Нажалост нема Y-ДНК.

Цитат
The Jomon period of the Japanese Archipelago, characterized by cord-marked ‘jomon’ potteries, has yielded abundant human skeletal remains. However, the genetic origins of the Jomon people and their relationships with modern populations have not been clarified. We determined a total of 115 million base pair nuclear genome sequences from two Jomon individuals (male and female each) from the Sanganji Shell Mound (dated 3000 years before present) with the Jomon-characteristic mitochondrial DNA haplogroup N9b, and compared these nuclear genome sequences with those of worldwide populations. We found that the Jomon population lineage is best considered to have diverged before diversification of present-day East Eurasian populations, with no evidence of gene flow events between the Jomon and other continental populations. This suggests that the Sanganji Jomon people descended from an early phase of population dispersals in East Asia. We also estimated that the modern mainland Japanese inherited <20% of Jomon peoples’ genomes. Our findings, based on the first analysis of Jomon nuclear genome sequence data, firmly demonstrate that the modern mainland Japanese resulted from genetic admixture of the indigenous Jomon people and later migrants.

http://www.nature.com/jhg/journal/v62/n2/pdf/jhg2016110a.pdf (http://www.nature.com/jhg/journal/v62/n2/pdf/jhg2016110a.pdf)

http://www.nature.com/jhg/journal/v62/n2/suppinfo/jhg2016110s1.html?url=/jhg/journal/v62/n2/abs/jhg2016110a.html (http://www.nature.com/jhg/journal/v62/n2/suppinfo/jhg2016110s1.html?url=/jhg/journal/v62/n2/abs/jhg2016110a.html)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Јануар 28, 2017, 12:28:06 поподне
Ево маркера из рада о Баварији.  :)
(http://i.imgur.com/86h1OOw.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: шкрњо Фебруар 02, 2017, 08:12:02 поподне
February 02, 2017

The Neolithic Transition in the Baltic Was Not Driven by Admixture with Early European Farmers
http://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(16)31542-1 (http://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(16)31542-1)

•A degree of genetic continuity from the Mesolithic to the Neolithic in the Baltic
•Steppe-related genetic influences found in the Baltic during the Neolithic
•No Anatolian farmer-related genetic admixture in Neolithic Baltic samples
•Steppe ancestry in Latvia at the time of the emergence of Balto-Slavic languages


И најзанимљивији део.

Further, the Y chromosomes of two of four Latvian Mesolithic samples were assigned to haplogroup R1b (the maximum-likelihood sub-haplogroup is R1b1b), which is the most common haplogroup found in modern Western Europeans.

Та мезолитска R1b свакако није старосједилачка на том простору, јер су носиоци Нарва културе на тај простор дошли из Самаре (Русија), гдје већ имамо древну R1b1* из отприлике истог периода. Археолошки налази такође подупиру тезу да су становници Нарва културе дошли у касном мезолиту.
Around Lake Baikal in Siberia the favoured form of pot combined the pointed-base shape with an everted rim. The pots were mainly built up from clay coils, pinched together, and often left undecorated. This type of pottery reached the Samara region in the middle Volga River valley by 7000 BC... It was the first pottery in Europe. From there pottery of the same type had spread to the Baltic and Scandinavia by about 5500 BC, before any sign of contact with farming.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: шкрњо Фебруар 02, 2017, 08:30:47 поподне
^Успут, узорци из Литваније су I2, док су ови из Летоније R1b.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Март 03, 2017, 03:32:48 поподне
Ancestry and demography and descendants of Iron Age nomads of the Eurasian Steppe

http://www.nature.com/articles/ncomms14615 (http://www.nature.com/articles/ncomms14615)

Између осталог, прoнађен је и један R1b-Z2103 међу Сарматима.


Extensive farming in Estonia started through a sex-biased migration from the Steppe

http://www.biorxiv.org/content/early/2017/03/02/112714?%3Fcollection= (http://www.biorxiv.org/content/early/2017/03/02/112714?%3Fcollection=)

У три узорка из Corded Ware културе потврђена је R1a-Z645, а један од њих је и Z283+. Узорак из Comb Ceramic културе је R1a-YP1272.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Март 03, 2017, 10:35:13 поподне
Не знам шта се ово дешава данас, али сам много срећан. ;D

Mittnik et al.: The Genetic History of Northern Europe

http://biorxiv.org/content/early/2017/03/03/113241 (http://biorxiv.org/content/early/2017/03/03/113241)

24 нова узорка из мезолита и неолита са територија Литваније, Летоније, Естоније, Русије и Шведске.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Март 03, 2017, 11:38:35 поподне
Не знам шта се ово дешава данас, али сам много срећан. ;D

Mittnik et al.: The Genetic History of Northern Europe

http://biorxiv.org/content/early/2017/03/03/113241 (http://biorxiv.org/content/early/2017/03/03/113241)

24 нова узорка из мезолита и неолита са територија Литваније, Летоније, Естоније, Русије и Шведске.

Већина скелета поменутих у овом раду припада хаплогрупи R1a осим два који припадају хг I2, и то Spiginas1 I2a1a L1286>L233 и Kretuonas2 I2a1b M423. Чини ми се да је ово до сада најисточнији налаз древне I2a1?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Март 03, 2017, 11:41:32 поподне
Не знам шта се ово дешава данас, али сам много срећан. ;D

Mittnik et al.: The Genetic History of Northern Europe

http://biorxiv.org/content/early/2017/03/03/113241 (http://biorxiv.org/content/early/2017/03/03/113241)

24 нова узорка из мезолита и неолита са територија Литваније, Летоније, Естоније, Русије и Шведске.
Ево битних табела и графикона из рада.

(http://i.imgur.com/K6CwOzK.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Синиша Јерковић Март 04, 2017, 08:34:08 пре подне
Не знам шта се ово дешава данас, али сам много срећан. ;D

Mittnik et al.: The Genetic History of Northern Europe

http://biorxiv.org/content/early/2017/03/03/113241 (http://biorxiv.org/content/early/2017/03/03/113241)

24 нова узорка из мезолита и неолита са територија Литваније, Летоније, Естоније, Русије и Шведске.

Значајни резултати. Погледах само површно, али овај М423 у Нарва култури мислимда задаје јак ударац бастарнској теорији. Помјера старост М423 у источној Европи много даље у прошлост.

Мислим да ће овим налазом посебно задовољан бити Вадим Веренич. Он је још у самим почецима генетичких истраживања, развијао тезу о поријеклу М423 из старих палеолитских култура источне Европе: Свидеријске, Кунда и Нарва.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: шкрњо Март 04, 2017, 11:53:31 пре подне
Значајни резултати. Погледах само површно, али овај М423 у Нарва култури мислимда задаје јак ударац бастарнској теорији. Помјера старост М423 у источној Европи много даље у прошлост.

Мислим да ће овим налазом посебно задовољан бити Вадим Веренич. Он је још у самим почецима генетичких истраживања, развијао тезу о поријеклу М423 из старих палеолитских култура источне Европе: Свидеријске, Кунда и Нарва.
Мислим да ово ништа не мијења што се поријекла М423 тиче, јер древна М423 је налажена чак и у Шпанији (Haak et al. 2015). И даље остаје чињеница да се старије гране М423 (Ислес, Дислес) налазе претежно на сјеверозападу Европе, као и да је Динарик директан огранак Дислеса.
П.С. Мотала12 узорак је био позитиван на СНП који дефинише динарик (Л147.2 колико се сјећам), но није сигурно да ли је заправо динарик или не.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Синиша Јерковић Март 04, 2017, 05:22:32 поподне
Мислим да ово ништа не мијења што се поријекла М423 тиче, јер древна М423 је налажена чак и у Шпанији (Haak et al. 2015). И даље остаје чињеница да се старије гране М423 (Ислес, Дислес) налазе претежно на сјеверозападу Европе, као и да је Динарик директан огранак Дислеса.
П.С. Мотала12 узорак је био позитиван на СНП који дефинише динарик (Л147.2 колико се сјећам), но није сигурно да ли је заправо динарик или не.

Зато и написах "задаје јак ударац". Не написах да је сасвим побија.

Не знамо којој подграни припада овај налаз из Естоније (ваљда ће га неко већ претрести). Али чисто географски гледано он стоји доста источно, па га морамо узети у обзир код разматрања појаве Динарик или I2-CTS10228 у источној Европи.

Ево шта у раду кажу за оваја налаз:

"Kretuonas2 has a derived allele at I2a1b1:C→T, however only with coverage of 1x.
Due to missing significance at that position we are not confident in this assignment.
We were however able to find multiple upstream mutations assigning this individual
to I2a1b (CTS176, CTS1293, CTS1802, CTS5375, CTS7218, and S2702). We are
confident that the placement of this sample in Y chromosomal haplogroup I2a1b is
correct."

Ако користе ИСОГГ номинацију ( а пише да користе), овај налаз би лако могао бити Ислес. Али о том потом. И за Ислес је чудна овакава источна позиција.

Интересантни су наводи и о аутосомалној генетици ова два узорка која припадају I2a1 хаплогрупи:

An eastern Baltic refugium of European hunter-gatherers
The results for the Kunda individual are mirrored in the four later eastern Baltic
Neolithic hunter-gatherers of the Narva culture (Fig. 2) and further supported by the
lack of significantly positive results for the D-statistic D(Narva, Kunda; X, Mbuti)
(Supplementary Information Table S2) demonstrating population continuity at the
transition from Mesolithic to Neolithic
, which in the eastern Baltic region is signified
by a change in networks of contacts and the use of pottery rather than a stark shift in
economy as seen in Central and Southern Europe15. That Narva individuals derive
directly from Kunda without additional admixture cannot be rejected (p=0.12),
however it can also be accounted for by admixture of Kunda with either EHG, SHG
or WHG (Supplementary Information Table S4). Specifically we see a greater
proportion of possible admixture into the two samples excavated at the more eastern
site Kretuonas (13±3% EHG or 33±7% SHG) than into the two Narva individuals
from the more western sites (3±3% EHG or 7±6% SHG) (Supplementary Information
Table S5). This substructure within the eastern Baltic foragers might have been
present already in the Mesolithic, and evades our detection as we only have one
sample from this time period.

Данашње балтичке државе са Естонијом посједују веома мало хаплогрупе I2a1, међутим то је подручје у Европи са најбоље очуваном аутосомалном генетиком оригиналних европских ловаца сакупљача.

Ова два I2a1 појединца најближа су аутосомално западноевропским ловцима сакупљачима(WHG) са значајном примјесом скандинавских ловаца сакупљача (SHG) и прилично слабом примјесом источноевропских ловаца сакупљача (EHG).

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Синиша Јерковић Март 04, 2017, 05:59:14 поподне
Треба додати да је и овај други налаз I2a1a2a1a tj. L233 још чуднији за источну Европу. Док се за М423 још и могу наћи неке паралеле са источном Европом, за L233 веома тешко. Ова грана је због своје јаке присутности на британским острвима и западној Европи носила и назив Western. У I2a Пројекту нисма успио видјети ниједног појединца источније од Њемачке да јој припада, мада еупедија спомиње да има појединаца у Пољској и Скандинавији да јој припадају.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Србин Март 09, 2017, 12:41:26 пре подне
Parallel ancient genomic transects reveal complex population history of early European farmers

http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2017/03/06/114488.full.pdf (http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2017/03/06/114488.full.pdf)

Велика студија са укупно 177 древних узорака од чега је чак 127 нових.

Bla16 Blätterhöhle Blätterhöhle Cave 51.4 7.6 3958–3344 M U5b2a2 R1b1 0.80 39.9±2.0 15±5.8
Bla28 Blätterhöhle Blätterhöhle Cave 51.4 7.6 3337–3024 M J1c1b1 R1 0.10 52.5±2.7 11±4.5
Bla5 Blätterhöhle Blätterhöhle Cave 51.4 7.6 3704–3117 F H5 .. 5.07 41.6±1.9 24±4.7
Bla8 Blätterhöhle Blätterhöhle Cave 51.4 7.6 4038–3532 M U5b2b2 I2a1 4.58 73.4±2.0 12±2.9

(http://s5.ifotos.pl/img/neol3png_asrpsaw.png)

^^^Blätterhöhle узорци се аутосомално налазе имеђу западних ловаца-сакупљача (WHG) и Иберијске популације бакарног доба/енеолит/халколит (Iberia_CA/Iberia_Copper Age).

Осим тога имамо и ово:

Цитат
We successfully sequenced a total of 16
Bl¨atterh¨ohle MN samples, many of them with distinct individual labels from ref. [18],
although surprisingly, the genome-wide data indicated that these corresponded to only
four unique individuals, for which we merged libraries to increase coverage: Bla28; Bla5
(same as Bla7, Bal13, Bla26(o), Bla30, and Bla54); Bla16 (same as Bla27 and Bla59); and
Bla8 (same as Bla9, Bla11, Bla24, Bla26(x), and Bla45). Based on stable isotopes, the
first three of these were classified as farmers, while Bla8 had signatures associated with a
hunter-gatherer-fisher lifestyle [18]. In accordance with previous results [18], we find that
the group of MN farmers experienced admixture with hunter-gatherers, which we now
estimate to have been at least 40%. We additionally observe admixture in the individual
Bla8, with ∼25% ancestry derived from farmers. Our results thus provide evidence
of asymmetric gene flow between farmers and hunter-gatherers at Bl¨atterh¨ohle centered
around the relatively late date of 4100 ± 120 BCE (ALDER dates of 10–25 generations).

^^^Прва три (2 R1(b) мушкарца и једна H5 мтДНК жена) су наводно земљорадници док је I2a1 ловац-сакупљач. Приметан је асиметричан ток гена, конкретно у овом случају ловци-сакупљачи са ∼25% аутосомалне компоненте првих Европских земљорадника (FEF/First Europen Farmers), односно земљорадници са најмање 40% компоненте западних ловаца-сакупљача (WHG/Western Hunter-Gatherer).

Цитирам најзанимљивије коментаре са Еупедије и Јуроджинса:

http://www.eupedia.com/forum/threads/33700-More-Neolithic-Y-DNA-and-mtDNA-from-Hungary-Germany-and-Spain-(Lipson-et-al-2017) (http://www.eupedia.com/forum/threads/33700-More-Neolithic-Y-DNA-and-mtDNA-from-Hungary-Germany-and-Spain-(Lipson-et-al-2017))

Цитат
I wonder then if the R1b is the "WHG" part of "EHG" if that makes any sense? Could there be a reservoir of them in some as yet unsampled corner of the Balkans or the Carpathians? Or did they move down from the far north into both Central Europe and the steppes?

The autosomal admixtures of these Blatterhole samples from a burial cave are very interesting. (These are the samples which Bollingino et al sampled.) The whole set up is rather odd. There was admixture going both ways, contrary to the speculation in that paper, i.e. the "farmers", so delineated through analysis of what they consumed in terms of food, are about 40-50% WHG, and one (?) of the fisher/foragers is 25% EEF, and yet despite using the same burial cave the two groups led very separate and distinct lives.

^^^Да, лупише и остадоше живи.

http://eurogenes.blogspot.rs/2017/03/neolithic-europe-its-complicated-lipson.html (http://eurogenes.blogspot.rs/2017/03/neolithic-europe-its-complicated-lipson.html)

Цитат
On Balterhohle R1b1..
"R1b1a1a2 showed
both derived and ancestral alleles of characteristic SNPs."

He's probably a relative of R1b1a1a2 M269.

Balterhohle is interesting. The data indicates the people buried there were the fusion of a hunter gatherer tribe and farmer tribe. Some lived as hunter gatherers, some as farmer-hunters, but all were heavily admixed between both tribes.

Farmer mtDNA on the site; H1c3, H11a, H5*, J1c1b1
Hunter gatherer mtDNA on the site; U5b2a2, U5b2b2, other U5b
Hunter gatherer Y DNA on the site; I2a1, R1b1a1a2

^^^На оба места се претпоставља да су ловци-сакупљачи и једни и други (I2a1+R1b) баш као и у Нарви при чему се вероватно мисли на старије узорке Bla16 и Bla8. Можда није Балкан у питању већ Балтик као место са којег су R1b отишли у степу. Међутим зашто да само R1b оде у степу без I2a1 кад су као ловци-сакупљачи већ хиљадама година живели заједно (већ на два места имамо ту комбинацију)? Ископаше у Васиљевки мезолитске I2a2+R1a али нема ни трага ни гласа од I2a1+R1b. Можда нам је нешто промакло тј. чека да буде откривено?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Синиша Јерковић Март 09, 2017, 08:36:12 пре подне
Прије некидан смо прокоментарисали овај рад, додуше не превише детаљно, па нисмо ни споменули ову R1b нађену у Њемачкој
http://www.poreklo.rs/forum/index.php?topic=679.msg42748#msg42748

Не треба заборавити ни прилично рано присуство R1b у неолитској Шпанији Els Trocs [I0410 / Troc 3] 5295-5066 calBCE Међутим ова R1b је судећи по неким накнадним анализама или V88 (афричка) или блиска истој. Ово пишем прије свега због аутосомалне генетике узорка из Блатерхола који га приближава узорцима из неолитске Иберије.

И мени је лично источно или сјевероисточно поријекло ове R1b логичније, међутим не бих искључио постојање још неке старије R1b у Европи, блиске афричкој V88, која је у општем метежу бронзаног доба, као и безброј других грана или изумрла или преживјела у занемарљивом броју.

Не знам да ли данас међу тестираним Европљанима има присутне неке гране L388-

Погледаћу.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Синиша Јерковић Март 09, 2017, 08:49:58 пре подне
Сад видим да постоји једна прилично стара грана R1b у Европи.
R1b-M343, M278 > PH155 > M335

На пројекту само тројица тестираних, сва тројица из Њемачке.

Иначе и гране V88 има у Европи, мада више на Блиском Истоку. У Европи је широко заступљена код ашкенаских јевреја.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Март 09, 2017, 11:36:51 пре подне
Прије некидан смо прокоментарисали овај рад, додуше не превише детаљно, па нисмо ни споменули ову R1b нађену у Њемачкој
http://www.poreklo.rs/forum/index.php?topic=679.msg42748#msg42748

Не треба заборавити ни прилично рано присуство R1b у неолитској Шпанији Els Trocs [I0410 / Troc 3] 5295-5066 calBCE Међутим ова R1b је судећи по неким накнадним анализама или V88 (афричка) или блиска истој. Ово пишем прије свега због аутосомалне генетике узорка из Блатерхола који га приближава узорцима из неолитске Иберије.

И мени је лично источно или сјевероисточно поријекло ове R1b логичније, међутим не бих искључио постојање још неке старије R1b у Европи, блиске афричкој V88, која је у општем метежу бронзаног доба, као и безброј других грана или изумрла или преживјела у занемарљивом броју.

Не знам да ли данас међу тестираним Европљанима има присутне неке гране L388-

Погледаћу.
Та R1b V88 из неолита Шпаније је на те просторе могла доћи само једним путем - преласком Гибралтара/морем. Зато сматрам да је то најреалнија теорија и за Е-V13, која се после ширила на исток и остале делове Европе.
Цитат
R1b-V88 surely spread from the Near East too, although through a different route, with cattle herders via North Africa, then crossing over to Iberia
Једна од ретких реалних теорија са Еупедије, на крају ће се испоставити да су били у праву и за ширење Е-V13 са Индоевропљанима, пошто је буквално непостојећа у најновијем раду као и у претходним радовима везаних за неолитску днк (осим оног преиндоевропског/неолитског узорка из Каталоније).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Март 09, 2017, 11:48:54 пре подне
Та R1b V88 из неолита Шпаније је на те просторе могла доћи само једним путем - преласком Гибралтара/морем. Зато сматрам да је то најреалнија теорија и за Е-V13, која се после ширила на исток и остале делове Европе. Једна од ретких реалних теорија са Еупедије, на крају ће се испоставити да су били у праву и за ширење Е-V13 са Индоевропљанима, пошто је буквално непостојећа у најновијем раду као и у претходним радовима везаних за неолитску днк (осим оног преиндоевропског/неолитског узорка из Каталоније).

Ипак постоји и на неолитским налазиштима. Каква је беше ситуација у Анадолији. Ако се не варам, било је неких резултата старе днк одатле, а колико се сећам, доминира G2a такође.

Ако је нека Е дошла са Индоевропљанима, онда би је морало бити и међу оним узорцима са "Јамна" налазишта. Тамо је присутна углавном R1, уз можда нешто I групе и старе J2, која географски није далеко.

Можда су ИЕ "покупили" E-V13 негде успут?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Март 09, 2017, 11:59:46 пре подне
Ипак постоји и на неолитским налазиштима. Каква је беше ситуација у Анадолији. Ако се не варам, било је неких резултата старе днк одатле, а колико се сећам, доминира G2a такође.

Ево са Еупедије део текста око G2a и осталих неолитских узорака.
Ипак, значајне мањине других хаплогрупа пронађене су на различитим неолитским локалитетима поред G2a већине, укључујући C1a2, H2, I*, I2a1, I2c, и J2a у Анадолији, C1a2, E-M78, H2, I*, I1, I2a, I2a1, J2 и T1a у културама југоисточне и централне Европе (Старчево, Сопот, култури Линеарнотракасте керамике), као и E-V13, H2, I2a1, I2a2a1 и R1b-V88 у западној Европи (Импресо култура, Мегалитске културе). H2 и T1a су пронађене у прекерамичком неолиту Леванта, и оне су такође повезане са раним развојем пољопривреде. Као што је већ речено, С1а2 је пронађена у мезолитској Шпанији (Olalde et al. 2014) Она је данас непостојећа хаплогрупа повезана са првим палеолитским Европљанима, и могла би бити пронађена у неким будућим узорцима древне днк широм Европе и Анадолије пре неолита. Е1b1b је такође пронађена у прекерамичком неолиту Леванта, али у овом случају њене гране вероватно нису E-M78 или E-V13 већ E1b1b1* или E-M123. R1b-V88 је такође сигурно започела своје ширење са Блиског Истока, иако другачијом рутом, са сточарима и пастирима кроз северну Африку и потом преласком на Иберијско полуострво. Остатак узорака вероватно представља асимиловане ловце-сакупљаче потеклих од мезолитских становника западне Анадолије (I*, I2c, J2) и Европе (I*, I1, I2a, I2a1, I2a2). Занимљиво је рећи да доста ових хаплогрупа, попут C1a2, H2 и I* данас практично не постоје, а неколико осталих су данас врло ретке у Европи (I2c, R1b-V88).

Цитат
Ако је нека Е дошла са Индоевропљанима, онда би је морало бити и међу оним узорцима са "Јамна" налазишта. Тамо је присутна углавном R1, уз можда нешто I групе и старе J2, која географски није далеко.

Можда су ИЕ "покупили" E-V13 негде успут?

Па пази, мени је она Банетова теорија о Трипољској култури и E-V13 као каснонеолитској на Балкану сасвим реална. Чињеница је да се Трипољска култура граничила са украјинским степама и Јамном, то може бити показатељ неког могућег мешања и тадашњег ширења на Балкан кроз неке прото-трачке/илирске заједнице. (иако ми је за Илире реалнија оно источнохалштатска прича о R1b U152 G2a L497)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Март 09, 2017, 01:00:51 поподне
Ево са Еупедије део текста око G2a и осталих неолитских узорака.
Ипак, значајне мањине других хаплогрупа пронађене су на различитим неолитским локалитетима поред G2a већине, укључујући C1a2, H2, I*, I2a1, I2c, и J2a у Анадолији, C1a2, E-M78, H2, I*, I1, I2a, I2a1, J2 и T1a у културама југоисточне и централне Европе (Старчево, Сопот, култури Линеарнотракасте керамике), као и E-V13, H2, I2a1, I2a2a1 и R1b-V88 у западној Европи (Импресо култура, Мегалитске културе). H2 и T1a су пронађене у прекерамичком неолиту Леванта, и оне су такође повезане са раним развојем пољопривреде. Као што је већ речено, С1а2 је пронађена у мезолитској Шпанији (Olalde et al. 2014) Она је данас непостојећа хаплогрупа повезана са првим палеолитским Европљанима, и могла би бити пронађена у неким будућим узорцима древне днк широм Европе и Анадолије пре неолита. Е1b1b је такође пронађена у прекерамичком неолиту Леванта, али у овом случају њене гране вероватно нису E-M78 или E-V13 већ E1b1b1* или E-M123. R1b-V88 је такође сигурно започела своје ширење са Блиског Истока, иако другачијом рутом, са сточарима и пастирима кроз северну Африку и потом преласком на Иберијско полуострво. Остатак узорака вероватно представља асимиловане ловце-сакупљаче потеклих од мезолитских становника западне Анадолије (I*, I2c, J2) и Европе (I*, I1, I2a, I2a1, I2a2). Занимљиво је рећи да доста ових хаплогрупа, попут C1a2, H2 и I* данас практично не постоје, а неколико осталих су данас врло ретке у Европи (I2c, R1b-V88).

Па пази, мени је она Банетова теорија о Трипољској култури и E-V13 као каснонеолитској на Балкану сасвим реална. Чињеница је да се Трипољска култура граничила са украјинским степама и Јамном, то може бити показатељ неког могућег мешања и тадашњег ширења на Балкан кроз неке прото-трачке/илирске заједнице. (иако ми је за Илире реалнија оно источнохалштатска прича о R1b U152 G2a L497)

Мислим да је велика грешка археогенетичара и археолога уопште што се у узимању узорака фокусирају на средњу и нарочито северну Европу, а потпуно заобилазе Балкан. По мом мишљењу, Балкан је кључ за целу Европу што се тиче неолитских и каснијих енеолитских и бронзанодопских миграција. Преко њега су прешли сви они који су накнадно "подарили" неолит централној, западној и северној Европи, а по свему судећи је Балкан био и једна од главних "неуралгичних" тачака индоевропске експанзије. Што се тиче E-V13, мислим да је неолитска бутмирска култура, раширена на простору БиХ, ЦГ и Хрватске, била један од главних "резервоара" ове хаплогрупе, али да су њени припадници остали на неки начин изоловани од главних неолитских миграторних токова (хаплогрупе G2a, H2 и остале); накнадна нагла експанзија E-V13 је вероватно последица асимилације њених носилаца са ИЕ. Тако да, сада када уопштено знамо генетску слику "неолићана" на подручју Паноније и централне Европе, требало би се позабавити унутрашњошћу ЈИ Европе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Синиша Јерковић Март 09, 2017, 01:36:00 поподне
Мислим да је велика грешка археогенетичара и археолога уопште што се у узимању узорака фокусирају на средњу и нарочито северну Европу, а потпуно заобилазе Балкан. По мом мишљењу, Балкан је кључ за целу Европу што се тиче неолитских и каснијих енеолитских и бронзанодопских миграција. Преко њега су прешли сви они који су накнадно "подарили" неолит централној, западној и северној Европи, а по свему судећи је Балкан био и једна од главних "неуралгичних" тачака индоевропске експанзије. Што се тиче E-V13, мислим да је неолитска бутмирска култура, раширена на простору БиХ, ЦГ и Хрватске, била један од главних "резервоара" ове хаплогрупе, али да су њени припадници остали на неки начин изоловани од главних неолитских миграторних токова (хаплогрупе G2a, H2 и остале); накнадна нагла експанзија E-V13 је вероватно последица асимилације њених носилаца са ИЕ. Тако да, сада када уопштено знамо генетску слику "неолићана" на подручју Паноније и централне Европе, требало би се позабавити унутрашњошћу ЈИ Европе.

Слажем се. Досадашњи налази су показали присуство E-V13 у култури Пресоване керамике. Нажалост, та култура је веома слабо покривена налазима. Поред нешто шпанских налазишта ( и то веома мало Y-днк), главне локације ове културе на западном Балкану уз јадранско-јонску обалу нису испитане, а нити подручја ове културе на Апенинском полуострву, Сицилији, Сардини и Корзици.

Искрено, не вјерујем  у касни индоевропски долазак E-V13, јер досад имамо солидан узорак индоевропских култура из Бронзаног доба, и нигдје тамо није пронађен E-V13.

Сем тога, E-V13 је већ евидентитан у неолитској Европи и само непокривеност одређених налазишта је узрок што није више присутна у досадашњој старој днк.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Синиша Јерковић Март 09, 2017, 01:40:32 поподне
Пошто је Никола споменуо Бутмирску културу која је добрим дијелом проистекла из културе Пресоване керамике, постављам линк на занимљив сајт посвећен Бутмирској култури.

http://dmc.ssst.edu.ba/ButmirNeolithicCulture/

Било би добро да имамо анализирану стару днк ове културе, јер је она другачијег поријекла од старчевачко-винчанске.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ... Март 09, 2017, 05:41:32 поподне

Па пази, мени је она Банетова теорија о Трипољској култури и E-V13 као каснонеолитској на Балкану сасвим реална. Чињеница је да се Трипољска култура граничила са украјинским степама и Јамном, то може бити показатељ неког могућег мешања и тадашњег ширења на Балкан кроз неке прото-трачке/илирске заједнице. (иако ми је за Илире реалнија оно источнохалштатска прича о R1b U152 G2a L497)

Ако бих требао бирати на основу досадашњих истраживања део Балкана где бих тражио древну E-V13, то би био доњи ток Дунава (између Старе планине и Карпата) и исток Балканског полуострва.
У Јужној Румунији ова хаплогрупа је готово стандардна на 20%, у Северној Бугарској се креће од 20% до скоро 40% у Разграду, Хасково 29%.
Како се креће ка Украјини и према областима Трипољске културе тај проценат опада, наравно постоји могућност да су у неко доба припадници те културе кренули уз Дунав. 
Када би се изоставили проценти хаплогрупа као што су R1a, I2a din, I1, R1b западна; а које су могле доста касније доћи на то подручје, удео E-V13 би постао доста већи. Такође број мушких носилаца ове хаплогрупе у овој области превазилази број носилаца код Албанаца.
Код Албанаца је просек неких 35% ако укључимо Тоске, са тим што морамо узети у обзир да се демографска експанзија код овог народа наставила и током друге половине ХХ века, када су сви остали народи у окружењу стагнирали. Такође нагла експанзија албанског народа задњих векова је пропрађена исељавањем других народа са истог подручја што утиче на проценте и бројчаност одређених хаплогрупа.

Број тестираних из области око доњег тока Дунава је мали, такође скоро ништа не знамо о разновсности и подгранама E-V13 у тој области. Постоји могућност да то нису исте подгране као код нас. Треба узети у обзир теорију са Еупедије о могућем доласку носилаца E-V13 из више праваца на Балкан, и да овде имамо збирни ефекат.
Углавном, без обзира одакле год дошла, које тачно време, које подгране и сл., мислим да је ово значајна област за ширење E-V13.




Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Србин Март 09, 2017, 05:48:16 поподне
Сад видим да постоји једна прилично стара грана R1b у Европи.
R1b-M343, M278 > PH155 > M335

На пројекту само тројица тестираних, сва тројица из Њемачке.

Иначе и гране V88 има у Европи, мада више на Блиском Истоку. У Европи је широко заступљена код ашкенаских јевреја.

https://en.wikipedia.org/wiki/Haplogroup_R1b (https://en.wikipedia.org/wiki/Haplogroup_R1b)

По основном R1b стаблу ISOGG 2017 Звејниеки (или нека оближња популација) може имати неке везе са M73 и M269 тј. да је прва кренула на исток а друга на запад. За R-P297* се каже да је изгледа изумрла док је P297/PF6398 предачка R-P297*, M73 и M269. Тако да мени се лично више чини да Блатехоле можда има везе са том М335. Са друге стране као што рекох Звејниеки може имати везе са Источном Еврпом па самим тим и ширењем М269 на запад у гвозденом добу.

https://www.yfull.com/tree/R-L278/ (https://www.yfull.com/tree/R-L278/)

M335 се одвојила пре V88 па је сасвим могуће да је M335 ушла у Европу директно преко Анатолије или степе а V88 преко Африке и Гибралтара. Таквој теорији иде у прилог и неолитски V88 у Шпанији. V88 је вероватно стигао у Европу после M335.

Ипак постоји и на неолитским налазиштима. Каква је беше ситуација у Анадолији. Ако се не варам, било је неких резултата старе днк одатле, а колико се сећам, доминира G2a такође.

Ако је нека Е дошла са Индоевропљанима, онда би је морало бити и међу оним узорцима са "Јамна" налазишта. Тамо је присутна углавном R1, уз можда нешто I групе и старе J2, која географски није далеко.

Можда су ИЕ "покупили" E-V13 негде успут?

Није искључено да на основу изузетка (мали број обрађених локалитета) закључују да се ради о правилу односно да  очигледно погрешно претпостављају да нека хаплогрупа није ни била заступљена у посматраној популацији.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Март 09, 2017, 06:46:50 поподне
Мислим да је велика грешка археогенетичара и археолога уопште што се у узимању узорака фокусирају на средњу и нарочито северну Европу, а потпуно заобилазе Балкан. По мом мишљењу, Балкан је кључ за целу Европу што се тиче неолитских и каснијих енеолитских и бронзанодопских миграција. Преко њега су прешли сви они који су накнадно "подарили" неолит централној, западној и северној Европи, а по свему судећи је Балкан био и једна од главних "неуралгичних" тачака индоевропске експанзије. Што се тиче E-V13, мислим да је неолитска бутмирска култура, раширена на простору БиХ, ЦГ и Хрватске, била један од главних "резервоара" ове хаплогрупе, али да су њени припадници остали на неки начин изоловани од главних неолитских миграторних токова (хаплогрупе G2a, H2 и остале); накнадна нагла експанзија E-V13 је вероватно последица асимилације њених носилаца са ИЕ. Тако да, сада када уопштено знамо генетску слику "неолићана" на подручју Паноније и централне Европе, требало би се позабавити унутрашњошћу ЈИ Европе.
Слажем се са овим, кад тад ће се открити ''Hotspot'' E-V13 у Европи. Да ли је то Трипољска култура, Импресо, или нека трећа, откриће време. За сада делује најреалније да су се из те њихове ''оазе'' почели нагло ширити доласком неке индоевропске заједнице, право питање је које. Након тога, у антици, кроз Римљане, Грке, војску Александра Великог, то је мање споран део. :)
Цитат: Владица Цонић
Ако бих требао бирати на основу досадашњих истраживања део Балкана где бих тражио древну E-V13, то би био доњи ток Дунава (између Старе планине и Карпата) и исток Балканског полуострва.
У Јужној Румунији ова хаплогрупа је готово стандардна на 20%, у Северној Бугарској се креће од 20% до скоро 40% у Разграду, Хасково 29%.
Како се креће ка Украјини и према областима Трипољске културе тај проценат опада, наравно постоји могућност да су у неко доба припадници те културе кренули уз Дунав. 
Када би се изоставили проценти хаплогрупа као што су R1a, I2a din, I1, R1b западна; а које су могле доста касније доћи на то подручје, удео E-V13 би постао доста већи. Такође број мушких носилаца ове хаплогрупе у овој области превазилази број носилаца код Албанаца.
Код Албанаца је просек неких 35% ако укључимо Тоске, са тим што морамо узети у обзир да се демографска експанзија код овог народа наставила и током друге половине ХХ века, када су сви остали народи у окружењу стагнирали. Такође нагла експанзија албанског народа задњих векова је пропрађена исељавањем других народа са истог подручја што утиче на проценте и бројчаност одређених хаплогрупа.


Број тестираних из области око доњег тока Дунава је мали, такође скоро ништа не знамо о разновсности и подгранама E-V13 у тој области. Постоји могућност да то нису исте подгране као код нас. Треба узети у обзир теорију са Еупедије о могућем доласку носилаца E-V13 из више праваца на Балкан, и да овде имамо збирни ефекат.
Углавном, без обзира одакле год дошла, које тачно време, које подгране и сл., мислим да је ово значајна област за ширење E-V13.
Ово ми подсетило на тему коју је недавно отворио НиколаВук, Касноантички археолошки хоризонт трачког племена Беси (http://www.poreklo.rs/forum/index.php?topic=1882.0 (http://www.poreklo.rs/forum/index.php?topic=1882.0)), то је отприлике тај географски простор,  мада опет то је антика, и питање је шта би се код њихових скелета могло наћи (R1b BY6111/J2b2 M241 делују реално).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Март 09, 2017, 08:06:51 поподне
Ако бих требао бирати на основу досадашњих истраживања део Балкана где бих тражио древну E-V13, то би био доњи ток Дунава (између Старе планине и Карпата) и исток Балканског полуострва.
У Јужној Румунији ова хаплогрупа је готово стандардна на 20%, у Северној Бугарској се креће од 20% до скоро 40% у Разграду, Хасково 29%.
Како се креће ка Украјини и према областима Трипољске културе тај проценат опада, наравно постоји могућност да су у неко доба припадници те културе кренули уз Дунав. 
Када би се изоставили проценти хаплогрупа као што су R1a, I2a din, I1, R1b западна; а које су могле доста касније доћи на то подручје, удео E-V13 би постао доста већи. Такође број мушких носилаца ове хаплогрупе у овој области превазилази број носилаца код Албанаца.
Код Албанаца је просек неких 35% ако укључимо Тоске, са тим што морамо узети у обзир да се демографска експанзија код овог народа наставила и током друге половине ХХ века, када су сви остали народи у окружењу стагнирали. Такође нагла експанзија албанског народа задњих векова је пропрађена исељавањем других народа са истог подручја што утиче на проценте и бројчаност одређених хаплогрупа.

Број тестираних из области око доњег тока Дунава је мали, такође скоро ништа не знамо о разновсности и подгранама E-V13 у тој области. Постоји могућност да то нису исте подгране као код нас. Треба узети у обзир теорију са Еупедије о могућем доласку носилаца E-V13 из више праваца на Балкан, и да овде имамо збирни ефекат.
Углавном, без обзира одакле год дошла, које тачно време, које подгране и сл., мислим да је ово значајна област за ширење E-V13.

Доњи ток Дунава, са неолитским културама Караново-Гумелница и Кукутени-Трипоље североисточније је припадао истом културном ареалу (балканско-анадолском) као и Старчево и Винча, па претпостављам да је и генетски састав неолитског становништва те области био сличан старчевачко-винчанском, дакле доминација G2a, H2 и евентуално неке варијанте I2a. Као што рече Синиша, бутмирска култура није део тог ареала већ је везана за Медитеран и Кардијум-Импресо културу која јој је претходила; северноафричка провенијенција хг E-V13 ми више нагиње ка њеној миграцији из Африке преко мора у Европу, а не преко Анадолије из области Плодног Полумесеца као G2a и H2. Друга ствар, још једном се показало да данашњи распоред и нарочито процентуална заступљеност хаплогрупа има врло мало значаја за стање какво је било у неолиту, нпр. У оном новом раду са 127 или колико већ нових резултата показује се доминација G2a и H2 групе, од којих је ова друга данас готово непостојећа, а ни прва се не одликује богзна каквом бројношћу. По мени, већи индикатор о старости неке хаплогрупе на одређеном подручју је разноврсност хаплотипова и грана него процентуална заступљеност. Мислим да ту разноврсност када је у питању E-V13 имамо на подручју југозападног Балкана, јужне Италије, Сицилије, због тога ми се чини да су те области биле жаришта ове хаплогрупе у време неолита. Када буду објавили неке археогенетске резултате из унутрашњости Балкана, онда ћемо знати засигурно.  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ... Март 09, 2017, 08:42:19 поподне
Доњи ток Дунава, са неолитским културама Караново-Гумелница и Кукутени-Трипоље североисточније је припадао истом културном ареалу (балканско-анадолском) као и Старчево и Винча, па претпостављам да је и генетски састав неолитског становништва те области био сличан старчевачко-винчанском, дакле доминација G2a, H2 и евентуално неке варијанте I2a. Као што рече Синиша, бутмирска култура није део тог ареала већ је везана за Медитеран и Кардијум-Импресо културу која јој је претходила; северноафричка провенијенција хг E-V13 ми више нагиње ка њеној миграцији из Африке преко мора у Европу, а не преко Анадолије из области Плодног Полумесеца као G2a и H2. Друга ствар, још једном се показало да данашњи распоред и нарочито процентуална заступљеност хаплогрупа има врло мало значаја за стање какво је било у неолиту, нпр. У оном новом раду са 127 или колико већ нових резултата показује се доминација G2a и H2 групе, од којих је ова друга данас готово непостојећа, а ни прва се не одликује богзна каквом бројношћу. По мени, већи индикатор о старости неке хаплогрупе на одређеном подручју је разноврсност хаплотипова и грана него процентуална заступљеност. Мислим да ту разноврсност када је у питању E-V13 имамо на подручју југозападног Балкана, јужне Италије, Сицилије, због тога ми се чини да су те области биле жаришта ове хаплогрупе у време неолита. Када буду објавили неке археогенетске резултате из унутрашњости Балкана, онда ћемо знати засигурно.  :)

Зато сам и ставио на крају  "без обзира одакле год дошла, које тачно време, које подгране и сл., мислим да је ово значајна област за ширење E-V13."

За сада је логичније повезивати Караново-Гумелница и Кукутени-Трипоље са неким другим хаплогрупама као што је G2a, а не са E-V13. Видећемо шта ће резултати неких будућих истраживања рећи. У неком периоду се десила смена становништва у тој области када је E-V13  преовладао.
Разноврсност E-V13 имамо већу на западу, али такође и далеко већи број тестираних. Источни и Северни Балкан је још увек непознаница, не само за погране Е1б.

Културу пресоване керамике такође многи повезују као доминантну G2a.
За Е1б остаје Сицилија/Балкан као место почетне експанзије, или чак можда нешто треће, нпр. што се пише о доласку са више страна.



Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Србин Март 09, 2017, 09:56:02 поподне
http://forum.molgen.org/index.php/topic,70.1125.html (http://forum.molgen.org/index.php/topic,70.1125.html)

Са Молгена:

Цитат
I1593/Bla16+Bla27+Bla59: R1b1
This Blatterhole_MN individual was derived for six SNPs within the P clade (L781, L741, P226, P237, P239, M45), one SNP characteristic for haplogroup R (P227), one for R1 (P238), and the sole representing SNP for R1b (M343). Subclade R1b1 was defined by L278. R1b1a1a2 showed both  derived  and  ancestral  alleles  of  characteristic  SNPs.  Thus,  he  could  only  be  assigned  to haplogroup R1b1.

На уровне M269 позитивные и негативные снипы. Это вымершая линия, близкая к R-M269.

Bla16 на нивоу М269 има и позитивне и негативне снипове што значи да је у питању рођачка грана М269.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Март 09, 2017, 11:32:49 поподне
Не треба заборавити ни прилично рано присуство R1b у неолитској Шпанији Els Trocs [I0410 / Troc 3] 5295-5066 calBCE Међутим ова R1b је судећи по неким накнадним анализама или V88 (афричка) или блиска истој. Ово пишем прије свега због аутосомалне генетике узорка из Блатерхола који га приближава узорцима из неолитске Иберије.

И мени је лично источно или сјевероисточно поријекло ове R1b логичније, међутим не бих искључио постојање још неке старије R1b у Европи, блиске афричкој V88, која је у општем метежу бронзаног доба, као и безброј других грана или изумрла или преживјела у занемарљивом броју.

Та R1b V88 из неолита Шпаније је на те просторе могла доћи само једним путем - преласком Гибралтара/морем. Зато сматрам да је то најреалнија теорија и за Е-V13, која се после ширила на исток и остале делове Европе.

Troc 3 је дефинитивно V88, али мислим да је мало вероватно да је у Иберију прешао из Северне Африке, пре ће бити да је обратно, јер се све старије гране налазе у Европи, висока фреквенција међу појединим афричким народима је последица founder effecta у задњих 4000-5000 година. Древни узорци пронађени до сада упућују да је Р1б1 по свој прилици у позном палеолиту и мезолиту боравила негде на простору Источне Европе, вероватно у степама северно од Црног Мора (тада језера), и врло могуће на Балкану. Оваквим положајем Р1б1 би се по мом мишљењу најбоље објаснили Вилабруна L754 и Els Trosc V88 који су кренули ка западу, док су M73 и M269 вероватно обитавали нешто источније где за сада имамо (пре)М73 међу летонским ловцима сакупљачима и врло вероватно код ловца-сакупљача из Самаре.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Март 09, 2017, 11:48:11 поподне
Ово ми подсетило на тему коју је недавно отворио НиколаВук, Касноантички археолошки хоризонт трачког племена Беси (http://www.poreklo.rs/forum/index.php?topic=1882.0 (http://www.poreklo.rs/forum/index.php?topic=1882.0)), то је отприлике тај географски простор,  мада опет то је антика, и питање је шта би се код њихових скелета могло наћи (R1b BY6111/J2b2 M241 делују реално).

Нажалост, у питању су остаци спаљених покојника, тако да не знам да ли би и колико уопште могли да извуку генетског материјала из карбонизованих костију; нисам оптимиста, гледајући да "кубуре" и са извлачењем материјала из костију скелетно сахрањених појединаца.  :) :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Март 10, 2017, 12:09:49 пре подне
Нажалост, у питању су остаци спаљених покојника, тако да не знам да ли би и колико уопште могли да извуку генетског материјала из карбонизованих костију; нисам оптимиста, гледајући да "кубуре" и са извлачењем материјала из костију скелетно сахрањених појединаца.  :) :)
Штета :P :D
Ништа, чекамо онда то фамозно истраживање неолита Бугарске и БЈРМ које ће надам се бити објављено ускоро.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Март 10, 2017, 12:19:48 пре подне
Што се тиче E-V13, мислим да је неолитска бутмирска култура, раширена на простору БиХ, ЦГ и Хрватске, била један од главних "резервоара" ове хаплогрупе, али да су њени припадници остали на неки начин изоловани од главних неолитских миграторних токова (хаплогрупе G2a, H2 и остале); накнадна нагла експанзија E-V13 је вероватно последица асимилације њених носилаца са ИЕ. Тако да, сада када уопштено знамо генетску слику "неолићана" на подручју Паноније и централне Европе, требало би се позабавити унутрашњошћу ЈИ Европе.

Доњи ток Дунава, са неолитским културама Караново-Гумелница и Кукутени-Трипоље североисточније је припадао истом културном ареалу (балканско-анадолском) као и Старчево и Винча, па претпостављам да је и генетски састав неолитског становништва те области био сличан старчевачко-винчанском, дакле доминација G2a, H2 и евентуално неке варијанте I2a. Као што рече Синиша, бутмирска култура није део тог ареала већ је везана за Медитеран и Кардијум-Импресо културу која јој је претходила; северноафричка провенијенција хг E-V13 ми више нагиње ка њеној миграцији из Африке преко мора у Европу, а не преко Анадолије из области Плодног Полумесеца као G2a и H2.

И овај најновији рад је потврдио да Е-V13 скоро сигурно није била део оригиналних неолитских фармера са Блиског Истока, и слажем се са Николом да је најбољи кандидат за "извориште" ове хаплогрупе бутмирска култура. У новом раду је пронађен узорак из периода Ленђелске културе који је припадао грани предачкој V13: VEJ4a/I1900, 4796-4685 BC, E1b1b1a1b1-L618. Ево шта аутори рада кажу о овој и претходној Сопотској култури:

Цитат
The further cultural development of the eastern and western parts of the Carpathian Basin remained mostly distinct in the local Late Neolithic (ca. 5000-4500 BCE), with the transition of the Szakálhát and late ALPc to the Tisza culture in the East; and the spread of the Sopot culture of southern origin, followed by the Lengyel cultural orbit, surviving until 4300 BCE to the western part of today’s Hungary.

Дакле, Сопотска и наредна Ленђелска култура нису "природне" наследнице најранијих неолитских култура, већ им је порекло са југа, а то је управо подручје Бутмирске културе, и овај L618 узорак савршено иде у прилог пореклу L618/V13 из бутмирске културе.

Слажем се и по питању Трипољске културе, она је последица досељавања неолитских фармера из Старчево-Крис-Корош комплекса, па и ту треба без сумње очекивати пре свега хаплогрупе G2a2 и H2, мада је могуће и да је један део претходне Бушко-Дњестарске популације апсорбован, па нас не треба изненадити ако се у будућности међу Трипољцима открију и неке друге хаплогрупе, као што су R1a, R1b и I2a.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Март 10, 2017, 12:31:58 поподне
Штета :P :D
Ништа, чекамо онда то фамозно истраживање неолита Бугарске и БЈРМ које ће надам се бити објављено ускоро.

Исправка, постоји нешто мало скелета ископаних са две некрополе касноантичког беског хоризонта, колико се сећам, са локалитета Поповјане код Самокова у Бугарској (у подножју Витоше) и Стојкове њиве код Доње Љубате (Босилеград) у Србији. Они потичу из најкаснијег периода овог хоризонта, друге половине 4. века, када је христијанизација почела да буде видљива на основу промене гробног ритуса (инхумација уместо инцинерације). Додуше, када би узели генетски узорак са тих скелета, то би било равно светском чуду.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Србин Март 14, 2017, 05:46:59 поподне
Навалише, нема шта.

https://link.springer.com/article/10.1007/s00439-017-1770-2 (https://link.springer.com/article/10.1007/s00439-017-1770-2)

^^^Балановски ет. ал."Genetic differentiation between upland and lowland populations shapes the Y-chromosomal landscape of West Asia".

Цитат
The ancient Yamnaya samples are located on the “eastern” R-GG400 branch of haplogroup R1b-L23, showing that the paternal descendants of the Yamnaya still live in the Pontic steppe and that the ancient Yamnaya population was not an important source of paternal lineages in present-day West Europeans.

Откривен је нови "источни" огранак GG400 "источне" R1b-L23. Стога аутори сматрају да потомци Јамнајаца по мушкој линији још увек живе у Понтијској степи као и да древна популација Јамна културе није била важан извор мушких линија код данашњих западних Европљана.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Март 14, 2017, 08:03:57 поподне
Навалише, нема шта.

https://link.springer.com/article/10.1007/s00439-017-1770-2 (https://link.springer.com/article/10.1007/s00439-017-1770-2)

^^^Балановски ет. ал."Genetic differentiation between upland and lowland populations shapes the Y-chromosomal landscape of West Asia".

Откривен је нови "источни" огранак GG400 "источне" R1b-L23. Стога аутори сматрају да потомци Јамнајаца по мушкој линији још увек живе у Понтијској степи као и да древна популација Јамна културе није била важан извор мушких линија код данашњих западних Европљана.

Овај рад није о древној ДНК већ о модерним популацијама, а мислим да сам и раније помињао да ова GG400 не представља никакву нову грану источне R1b, већ је у питању добро нам позната Z2103. Ништа ново нисмо сазнали, одавно је познато да је Z2103 и данас заступљена код неких степских народа, пре свега код Башкира, док је прилично ретка у Западној Европи. Заиста неозбиљно од Балановског, не знам шта бих више рекао.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Србин Март 14, 2017, 08:52:19 поподне
Овај рад није о древној ДНК већ о модерним популацијама, а мислим да сам и раније помињао да ова GG400 не представља никакву нову грану источне R1b, већ је у питању добро нам позната Z2103. Ништа ново нисмо сазнали, одавно је познато да је Z2103 и данас заступљена код неких степских народа, пре свега код Башкира, док је прилично ретка у Западној Европи. Заиста неозбиљно од Балановског, не знам шта бих више рекао.

У контексту је древне Јамна популације али можда је боље пребацити у неку другу прикладнију тему.  ;)

На Eurogenes-у је прокоментарисано као "epic fail".

Још мало па ће завршити као Кљосов.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Март 14, 2017, 09:00:43 поподне
У контексту је древне Јамна популације али можда је боље пребацити у неку другу прикладнију тему.  ;)

На Eurogenes-у је прокоментарисано као "epic fail".

Још мало па ће завршити као Кљосов.

Видео сам да се помињу узорци Јамне културе, али то су стари узорци објављени пре две године, који су већ изанализирани до детаља, и сад се појави Колумбо Балановски који "открије" наводно нову грану, и "открије" да носиоци те гране нису населили Западну Европу. Није само на Еурогенесу. ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Србин Март 15, 2017, 12:28:00 пре подне
Видео сам да се помињу узорци Јамне културе, али то су стари узорци објављени пре две године, који су већ изанализирани до детаља, и сад се појави Колумбо Балановски који "открије" наводно нову грану, и "открије" да носиоци те гране нису населили Западну Европу. Није само на Еурогенесу. ;)

Haak et. al. 2015.?

У септембру 2016 је избацио за GG400 и то је искористио за ово сад али то је оно што ми је и промакло. Што је најгоре ја ко коза и поверовах да је стварно у питању нова грана.  ;D Чак би и са том хипотетичком новом граном било глупо да без нових узорака дДНК са тог подручја искључи L51 из приче тек тако.

Значи GG400=Z2103 (на неком месту у у тексту је чак погрешно укуцано Z2130) тако да пошто из старе студије имамо Z2103 а не L51 онда је закључио да Јамнајци тј. Курганци нису преци L51. Сјајно, нема шта.  ::)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Март 15, 2017, 01:06:45 пре подне
Haak et. al. 2015.?

У септембру 2016 је избацио за GG400 и то је искористио за ово сад али то је оно што ми је и промакло. Што је најгоре ја ко коза и поверовах да је стварно у питању нова грана.  ;D Чак би и са том хипотетичком новом граном било глупо да без нових узорака дДНК са тог подручја искључи L51 из приче тек тако.

Значи GG400=Z2103 (на неком месту у у тексту је чак погрешно укуцано Z2130) тако да пошто из старе студије имамо Z2103 а не L51 онда је закључио да Јамнајци тј. Курганци нису преци L51. Сјајно, нема шта.  ::)

Да, Haak, али Mathieson и Allentoft, исто из 2015. Проблем је што покушава одавно познате ствари да представи новим "открићима", и што порекло хаплогрупе R1b без икаквих доказа (и насупрот тренутно доступним) гура на Блиски Исток. Тврдње које се тичу L51 и нису толико спорне, сасвим је могуће да L51 не потиче директно из Јамне културе, чији се почетак датује око 3300. п.н.е, али је у сваком случају дошла из степа у неком периоду (можда са ранијим Суворово-Новоданиловка, Чернавода или Коцофени културама), што се јасно види по високом уделу "степске" компоненте у аутосомалној генетици свих до сада откривених Бел Бикер узорака из Немачке и Чешке. Што се тиче западног дела Јамне културе у црноморским степама, могуће да је у њему доминирала грана Z2103>>Z2110 која није до сада пронађена у источном делу Јамне културе, а управо та грана је данас заступљена на Балкану и у осталим деловима Европе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Мај 10, 2017, 02:12:25 поподне
Један нови рад о "молекуларној археологији", како је у чланку називају, и њеној корелацији са индоевропском лингвистиком:

https://www.academia.edu/32927784/Molecular_archaeology_and_Indo-European_linguistics_Impressions_from_new_data
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Sergio Јул 06, 2017, 01:14:48 пре подне
Линк:
The analysis of DNA from the hardened tooth plaque of five Neanderthals (http://www.nature.com/news/neanderthal-tooth-plaque-hints-at-meals-and-kisses-1.21593)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Јул 19, 2017, 03:25:16 поподне
Не сјећам се да смо постављали сљедећи рад:

Extensive Farming in Estonia Started through a Sex-Biased Migration from the Steppe

Има неколико пронађених R1a

http://www.biorxiv.org/content/early/2017/03/02/112714

http://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2017/03/02/112714.full.pdf
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Јул 19, 2017, 03:54:36 поподне
Не сјећам се да смо постављали сљедећи рад:

Extensive Farming in Estonia Started through a Sex-Biased Migration from the Steppe

Има неколико пронађених R1a

http://www.biorxiv.org/content/early/2017/03/02/112714

http://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2017/03/02/112714.full.pdf

Има неких занимљивих детаља. Од Y-днк успјели су извући један из Комб Керамик културе и припада крајње ријеткој грани хаплогрупе R1a-YP1272, којој засад припадају један египатски Копт, један Тунижанин, Рус, Бјелорус и Чех. Аутосомално је утврђено да су тестирани из Комб Керамик културе повезани са Источним ловцима сакупљачима из Карелије и да се разликују од литванско-летонских скоро тестираних ловаца сакупљача који су ближи Западним ловцима сакупљачима (WHG)

Осталих 5 тестираних узорака су из Corded Ware културе и сви су R1a-Z645, при чему је код једног пронађена и R1a-Z283 што само потврђује да је главнина европске R1a па и практично сва словенска, проистекла из ове културе. Они су донијели  и нову неолитску културу као и нешто јужније степске генетике.

Занимљиво да 2500 г пне у Естонији још увијек нема N1c.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Јануар 10, 2018, 08:10:19 пре подне
Добра вест што се тиче старе ДНК:

http://www.hurriyetdailynews.com/turkish-scientists-to-crack-neolithic-era-dna-code-european-funding-awarded-125398

У плану је тестирање 1500 узорака из Анадолије, период 10 до 8000 година пре н. е (неолит). Пројекат ће се звати: "Neogen".

"The European Research Council (ERC) has awarded Turkish scientists a €2.5 million ($2.9 million) grant to analyze the DNA of 1,500 people who used to live in the Anatolian region – the Asian part of present-day Turkey – during the Neolithic period."
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Јануар 10, 2018, 10:32:21 пре подне
http://journals.plos.org/plosbiology/article?id=10.1371/journal.pbio.2003703
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Јануар 10, 2018, 10:48:24 пре подне
http://journals.plos.org/plosbiology/article?id=10.1371/journal.pbio.2003703

Хвала на линку, Милоше. Што се тиче Y-днк донекле очекивани резултати, од 4 мушка хаплотипа, двојица I2, један I2-M423 и један неутврђен. Ништа необично за скандинавски мезолит.

Ако сам добро упратио причу аутосомалној днк, говори се о одређеном мијешању западних и источних ловаца сакупљача на простору Скандинавије, гдје су источни дошли накнадно из сјевероисточног правца и спуштали се обалом Норвешке. Не знам да ли би овај утицај источних ловаца сакупљача могао бити извор за скандинавске гране R1a, које додуше још нису нађене у старој днк на простору Скандинавије (уколико нешто нисам пропустио).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Јануар 10, 2018, 11:04:23 пре подне
Овај дио из студије везан за физички изглед мезолитских Скандинаваца је интересантан:

"The genomic data further allowed us to study the physical appearance of SHGs ; for instance, they show a combination of eye color varying from blue to light brown and light skin pigmentation. This is strikingly different from the WHGs—who have been suggested to have the specific combination of blue eyes and dark skin  and EHGs—who have been suggested to be brown-eyed and light-skinned."
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Сремац Јануар 10, 2018, 11:58:41 пре подне
Овај дио из студије везан за физички изглед мезолитских Скандинаваца је интересантан:

"The genomic data further allowed us to study the physical appearance of SHGs ; for instance, they show a combination of eye color varying from blue to light brown and light skin pigmentation. This is strikingly different from the WHGs—who have been suggested to have the specific combination of blue eyes and dark skin  and EHGs—who have been suggested to be brown-eyed and light-skinned."

Занимљиво је такође да су варијанте гена одговорне за депигментацију постале учесталије у популацији SHG у односу на предачке популације због прилагођавање животним условима Скандинавије:

In addition to performing this genome-wide scan, we studied the allele frequencies in three
pigmentation genes (SLC24A5, SLC45A2, which have a strong effect on skin pigmentation,
and OCA2/HERC2,which has a strong effect on eye pigmentation) in which the derived alleles
are virtually fixed in northern Europeans today...
All of the depigmentation variants at these three genes are in
high frequency in SHGs in contrast to both WHGs and EHGs
(Fig 4B)...
Therefore, the unique configuration of the SHGs is not fully explained by the fact that SHGs are a
mixture of EHGs and WHGs, but could rather be explained by a continued increase of the
allele frequencies after the admixture event, likely caused by adaptation to high-latitude environments

[50,52].
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Јануар 10, 2018, 12:06:41 поподне
Занимљиво је такође да су варијанте гена одговорне за депигментацију постале учесталије у популацији SHG у односу на предачке популације због прилагођавање животним условима Скандинавије:

In addition to performing this genome-wide scan, we studied the allele frequencies in three
pigmentation genes (SLC24A5, SLC45A2, which have a strong effect on skin pigmentation,
and OCA2/HERC2,which has a strong effect on eye pigmentation) in which the derived alleles
are virtually fixed in northern Europeans today...
All of the depigmentation variants at these three genes are in
high frequency in SHGs in contrast to both WHGs and EHGs
(Fig 4B)...
Therefore, the unique configuration of the SHGs is not fully explained by the fact that SHGs are a
mixture of EHGs and WHGs, but could rather be explained by a continued increase of the
allele frequencies after the admixture event, likely caused by adaptation to high-latitude environments

[50,52].

Да, у ствари они су имали у "понуди" плаве очи са WHG стране и свијетлу кожу са EHG стране, али је тек утицај средине након мијешања допринио да управо до изражаја дођу ову особине и да се даље генерацијски утврђују. Иначе, да је то само посљедица мијешања могло је доћи и до комбинације тамне очи-тамна кожа што је такође постојало у WHG/EHG "понуди".
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Јануар 10, 2018, 12:12:14 поподне
Да, у ствари они су имали у "понуди" плаве очи са WHG стране и свијетлу кожу са EHG стране, али је тек утицај средине након мијешања допринио да управо до изражаја дођу ову особине и да се даље генерацијски утврђују. Иначе, да је то само посљедица мијешања могло је доћи и до комбинације тамне очи-тамна кожа што је такође постојало у WHG/EHG "понуди".

A мoждa и oвaкo

(https://i2.wp.com/www.ancient-origins.net/sites/default/files/styles/large/public/impression-of-a-blue-eyed-hunter-gatherer.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Сремац Јануар 10, 2018, 12:17:06 поподне
Да, у ствари они су имали у "понуди" плаве очи са WHG стране и свијетлу кожу са EHG стране, али је тек утицај средине након мијешања допринио да управо до изражаја дођу ову особине и да се даље генерацијски утврђују. Иначе, да је то само посљедица мијешања могло је доћи и до комбинације тамне очи-тамна кожа што је такође постојало у WHG/EHG "понуди".

Да, управо то чини SHG "јединственом конфигурацијом", тј. одређене особине(светле очи и кожа) наслеђене из различитих извора су се фиксирале баш у тој популацији, док су, што се прилагодљивости тиче, мање пожељне комбинације ишчезле...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Сремац Јануар 10, 2018, 12:19:38 поподне
A мoждa и oвaкo

(https://i2.wp.com/www.ancient-origins.net/sites/default/files/styles/large/public/impression-of-a-blue-eyed-hunter-gatherer.jpg)

Ово је мислим "Ла Брана" или ћемо га звати једноставно Брана :). Типичан WHG.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Јануар 10, 2018, 12:24:51 поподне
Ово је мислим "Ла Брана" или ћемо га звати једноставно Брана :). Типичан WHG.

Taкo je!
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Бакс Јануар 10, 2018, 02:43:47 поподне
A мoждa и oвaкo

(https://i2.wp.com/www.ancient-origins.net/sites/default/files/styles/large/public/impression-of-a-blue-eyed-hunter-gatherer.jpg)

Помало је такијех јунака, као што је Страхињићу Бане.

Исти Франко Неро!
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Jelic Јануар 10, 2018, 02:45:39 поподне
Помало је такијех јунака, као што је Страхињићу Бане.

Исти Франко Неро!

Баш личе. :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Јануар 10, 2018, 02:53:47 поподне
Помало је такијех јунака, као што је Страхињићу Бане.

Исти Франко Неро!

Блaнкo вapиjaнтa

(https://s10.postimg.org/sv0nxz1k9/hi-hunter-gatherer-740-1.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Јануар 10, 2018, 03:11:47 поподне
Блaнкo вapиjaнтa

(https://s10.postimg.org/sv0nxz1k9/hi-hunter-gatherer-740-1.jpg)

Сад је као Шабан Шаулић.  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Јануар 10, 2018, 04:48:37 поподне
Ако сам добро упратио причу аутосомалној днк, говори се о одређеном мијешању западних и источних ловаца сакупљача на простору Скандинавије, гдје су источни дошли накнадно из сјевероисточног правца и спуштали се обалом Норвешке. Не знам да ли би овај утицај источних ловаца сакупљача могао бити извор за скандинавске гране R1a, које додуше још нису нађене у старој днк на простору Скандинавије (уколико нешто нисам пропустио).

Синиша, ако мислиш на грану Z284, она се, као вероватно и све остале гране испод М417, готово сигурно ширила са Corded Ware културом, уосталом и њена старост не допушта неки много ранији период. Пронађен је један узорак у Данској који припада овој грани:

RISE61, 2851-2492 BC, Kyndelöse, Denmark, Corded_Ware_Scandinavia, R1a1a1b1-Z283>Y2395>Z284

А још један узорак који припада предачкој грани је пронађен у Естонији:

Kunila 2, 2575-2350 BC, Kunila, Estonia, Corded_Ware_Baltic, R1a1a1b1-Z283>Y2395


Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Јануар 10, 2018, 05:05:49 поподне
Синиша, ако мислиш на грану Z284, она се, као вероватно и све остале гране испод М417, готово сигурно ширила са Corded Ware културом, уосталом и њена старост не допушта неки много ранији период. Пронађен је један узорак у Данској који припада овој грани:

RISE61, 2851-2492 BC, Kyndelöse, Denmark, Corded_Ware_Scandinavia, R1a1a1b1-Z283>Y2395>Z284

А још један узорак који припада предачкој грани је пронађен у Естонији:

Kunila 2, 2575-2350 BC, Kunila, Estonia, Corded_Ware_Baltic, R1a1a1b1-Z283>Y2395

Мислио сам уопштено на сјеверозападну, несловенску R1a, па међу њом и на Z284. Међутим, из овог што си поставио, сасвим је извјесно да је Z284 дио Corded Ware експанзије.

Моја логика је била сљедећа: у раду кажу да су се у Скандинавији сусреле популације WHG и EHG и измјешале. Претпоставка је да је R1a представљала добар дио мушких линија EHG, баш као што је I за WHG. С обзиром да је EHG мјешавина присутнија у старој днк у Норвешкој,него у Шведској, закључак је рада да се EHG популација спуштала са сјевера Норвешке, обалом до југа. И данас је R1a од свих нордијаких земаља најзаступљенији у Норвешкој. Један дио свакако отпада на Z284. Међутим има и других старијих грана, највише мислим на R1a-L664, које су могле бити дио ове мезолитске сеобе.

Та EHG популација је морала донијети неке своје Y днк линије. Уколико није R1a, питање је које? Шта ти мислиш о томе?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: шкрњо Јануар 10, 2018, 05:18:07 поподне
Не видим уопште неку сврху ове студије, малтене је иста као она коју љетос објавише, обрађени У-ДНК узорци су исти, глупи закључци око "климатске адаптације" су исти, све је исто, само мало другачије срочено.

Што се наводних климатских адаптација тиче, прво треба напоменути да боја косе и очију (за разлику од коже) нема апсолутно никакву улогу. Коса је сачињена од мртвих ћелија, а оно што је битно за добар вид при мрачнијим условима је повећан број штапићастих ћелија и присуство тапетум луцидум слоја (који људи немају), што је уочљиво код свих ноктурналних животиња, а не безначајна површна пигментација.
Даље, клима у мезолитској Скандинавији је била чак и мало топлија него данашња, па све и да су то наводно "климатске адаптације", не би било великог подстицаја за њима. Горњепалеолитски Кромањонци сви редом бјеху тамнокоси и тамнооки, а живјели су често под оштрим, глацијалним условима. Гдје њима бјеше тај "подстицај"? Или Ескимима?

Што се тиче наводних пигментационих особина источних и западних ловаца, и ту су се испромашивали за све паре.
Западни ловци нису били искључиво плавооки, што доказују узорци попут Бишона из Швајцарске. И они за које се сматра да су били свјетлооки су најчешће имали једва нешто преко 50% предвиђене вјероватноће за то (попут Лошбура).
Првобитне особине источних ловаца су биле и свијетла коса и свијетле очи (примјер: Самара узорак из Русије). Ови који су отишли западније су вјероватно покупили пар гена за тамне очи управо од Кромањонаца.
Што се свијетле косе тиче, она несумњиво долази са истока (Афонтова Гора 3, горњепалеолитски ловац из Сибира).

Тај закључак да су источни ловци били тамне косе и очију долази од првих узорака тестираних из Карелије, који осим што су били помијешани са западним Кромањонцима очигледно бијаху помијешани и са још нечим, јер је један од њих носио Ј1 хаплогрупу. Источнији, чистији ЕХГ попут Самаре су били свијетлих очију и плаве косе (иако је и међу њима несумњиво било варијација).

Кад је свијетла кожа у питању, мишљења сам (још недоказаног) да су западни ловци имали свој одвојен ген за свијетлу кожу, али да није још откривен због њиховог изузетно малог доприноса просјечном данашњем Европљанину у поређењу са степским досељеницима или неолитским фармерима, што се најбоље види у фенотипима. И раније сам напомињао као примјер да више од 15 посто Оркадијаца нема један од данашњих гена за свијетлу кожу, што је проценат већи од било којег европског народа и од већине сјеверноафричких, иако су они уз Ирце убједљиво најсвјетлији што се коже тиче. Исти феномен је присутан у Азији, гдје народима попут Јакута или Амур Манчуа фале азијски гени за свијетлу кожу, иако су свијетли за њихове стандарде.
Углавном, све и да ово што предлажем није тачно, кожа им је вјероватно била прелазна, нешто попут сјеверноамеричких Индијанаца Великих равница, не сасвим тамна.
Да резимирам: источни ловци (ИЕ преци)- свијетла коса, најчешће свијетле очи; западни Кромањонци- тамна коса, тамне очи у палеолиту, са додатком свијетлих у мезолиту.



Занимљиво је да истраживачи акценат стављају на најбаналније и често прилично бескорисне ставке фенотипа. Да мало обрате више пажње на морфологију, видјели би да су источни ловци били десет пута ближи неолитским фармерима него западним Кромањонцима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: шкрњо Јануар 10, 2018, 05:18:31 поподне
Мислио сам уопштено на сјеверозападну, несловенску R1a, па међу њом и на Z284. Међутим, из овог што си поставио, сасвим је извјесно да је Z284 дио Corded Ware експанзије.

Моја логика је била сљедећа: у раду кажу да су се у Скандинавији сусреле популације WHG и EHG и измјешале. Претпоставка је да је R1a представљала добар дио мушких линија EHG, баш као што је I за WHG. С обзиром да је EHG мјешавина присутнија у старој днк у Норвешкој,него у Шведској, закључак је рада да се EHG популација спуштала са сјевера Норвешке, обалом до југа. И данас је R1a од свих нордијаких земаља најзаступљенији у Норвешкој. Један дио свакако отпада на Z284. Међутим има и других старијих грана, највише мислим на R1a-L664, које су могле бити дио ове мезолитске сеобе.

Та EHG популација је морала донијети неке своје Y днк линије. Уколико није R1a, питање је које? Шта ти мислиш о томе?
Те линије су, као што се види, једва оставиле трага у мезолиту (надјачане од стране западних), а камоли у каснијим периодима. ЕХГ из Самаре у Русији и они из Естоније су имали неке архаичне R1b гране које су данас у потпуности ишчезле, а ови из Естоније су успут покупили и понеку I2a2.
Сумњам да је L664 дио мезолитске сеобе, јер је и она M417 подграна. Те R1 гране које су у мезолиту кренуле ка западу су касније готово потпуно почишћене пред најездом њихових ИЕ рођака са истока.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Јануар 10, 2018, 05:57:57 поподне
Те линије су, као што се види, једва оставиле трага у мезолиту (надјачане од стране западних), а камоли у каснијим периодима. ЕХГ из Самаре у Русији и они из Естоније су имали неке архаичне R1b гране које су данас у потпуности ишчезле, а ови из Естоније су успут покупили и понеку I2a2.
Сумњам да је L664 дио мезолитске сеобе, јер је и она M417 подграна. Те R1 гране које су у мезолиту кренуле ка западу су касније готово потпуно почишћене пред најездом њихових ИЕ рођака са истока.

Ово што си писао за фенотип и гене не могу коментарисати, јер сам о томе само површно читао.

Што се тиче R1a и EHG, поменућу само да су у раду као референтан EHG узорак користили управо онај који је тестиран као R1a1 M459+ Yuzhnyy Oleni Ostrov [I0061 / UzOO 74; Karelia in Fu 2016]

Дакле, уопште није спорно да је популација која је носила R1a у мезолиту ушла у Скандинавију. Ја сам се само питао која би то савремена R1a могла бити и да ли је повећана учесталост R1a у Норвешкој бар једним дијелом повезана са повећаним удјелом EHG у мезолитским узорцима из Норвешке.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Јануар 10, 2018, 10:29:58 поподне
Genetiker: Y-SNP calls from Mesolithic Scandinavia (https://genetiker.wordpress.com/2018/01/10/y-snp-calls-from-mesolithic-scandinavia/)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: шкрњо Јануар 10, 2018, 11:59:33 поподне
Ово што си писао за фенотип и гене не могу коментарисати, јер сам о томе само површно читао.

Што се тиче R1a и EHG, поменућу само да су у раду као референтан EHG узорак користили управо онај који је тестиран као R1a1 M459+ Yuzhnyy Oleni Ostrov [I0061 / UzOO 74; Karelia in Fu 2016]

Дакле, уопште није спорно да је популација која је носила R1a у мезолиту ушла у Скандинавију. Ја сам се само питао која би то савремена R1a могла бити и да ли је повећана учесталост R1a у Норвешкој бар једним дијелом повезана са повећаним удјелом EHG у мезолитским узорцима из Норвешке.
Позната ми је чињеница да су користили (помијешане) источне ловце из Карелије као репер, што наведох у дијелу о пигментационим карактеристикама.

Међутим, тај узорак који ти наведе није М417 (која се везује за индоевропски продор), којој припада малтене сва норвешка и европска R1a. Као што видимо из истраживања, те гране раног продора на запад су се слабо снашле и у мезолиту, а за даље да не говоримо. И R1b гране које су претходиле масовној индоевропској инвазији, попут оних из Самаре и Естоније, су изузетна ријеткост данас.

Осим тога, да је тај мезолитски продор заслужан за дио R1a у Скандинавији, уз њу би добро преживјеле и друге многобројније I2 гране, што није случај.

Genetiker: Y-SNP calls from Mesolithic Scandinavia (https://genetiker.wordpress.com/2018/01/10/y-snp-calls-from-mesolithic-scandinavia/)
Узорак Stora Förvar 11 су одавно у студијама обрадили и Скоглунд и Гинтер, али ни један није поменуо да је I1.
То Генетикер највјероватније гура неку своју празну причу, као што је до скора упорно тврдио да је граветијанска култура палеолитске Европе била доминантно R1b, све док му истраживање граветијанских остатака није оборило теорију.
Најранија I1 је нађена у неолитској Мађарској, гдје је највјероватније и доживјела бум након уског грла и проширила се на сјевер. Ако је вјеровати yfull-u, такође је и премлада за Stora Förvar 11.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Јануар 11, 2018, 12:24:48 пре подне
Узорак Stora Förvar 11 су одавно у студијама обрадили и Скоглунд и Гинтер, али ни један није поменуо да је I1. То Генетикер највјероватније гура неку своју празну причу, као што је до скора упорно тврдио да је граветијанска култура палеолитске Европе била доминантно R1b, све док му истраживање граветијанских остатака није оборило теорију. Најранија I1 је нађена у неолитској Мађарској, гдје је највјероватније и доживјела бум након уског грла и проширила се на сјевер. Ако је вјеровати yfull-u, такође је и премлада за Stora Förvar 11.

Технички гледано да би неко био I1 мора да буде позитиван на свих 305 мутација на том нивоу, односно на M253 која је међу последњим (најскоријим) мутацијама у том низу. Тако да овај Stora Förvar 11 није I1, али је позитиван на бар 7 од тих 305 мутација, тако да је нека врста пре-I1, тј. нека изумрла рођачка грана. Слажем се да је већа вероватноћа да је I1 доживела демографску експлозију међу неком неолитском популацијом која се ширила на север.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Јануар 11, 2018, 01:13:57 пре подне
Мислио сам уопштено на сјеверозападну, несловенску R1a, па међу њом и на Z284. Међутим, из овог што си поставио, сасвим је извјесно да је Z284 дио Corded Ware експанзије.

Моја логика је била сљедећа: у раду кажу да су се у Скандинавији сусреле популације WHG и EHG и измјешале. Претпоставка је да је R1a представљала добар дио мушких линија EHG, баш као што је I за WHG. С обзиром да је EHG мјешавина присутнија у старој днк у Норвешкој,него у Шведској, закључак је рада да се EHG популација спуштала са сјевера Норвешке, обалом до југа. И данас је R1a од свих нордијаких земаља најзаступљенији у Норвешкој. Један дио свакако отпада на Z284. Међутим има и других старијих грана, највише мислим на R1a-L664, које су могле бити дио ове мезолитске сеобе.

Та EHG популација је морала донијети неке своје Y днк линије. Уколико није R1a, питање је које? Шта ти мислиш о томе?

Као што рече шкрњо L664 је такође испод М417, и такође је пронађена у Corded Ware култури у Немачкој (тачније предвиђена је на основу STR маркера њена предачка грана CTS4385). Слажем се да је врло вероватно да је R1а била значајно заступљена међу источним ловцима-сакупљачима на широком простору од Балтика (вероватно и Скандинавије) до Бајкала, али се ту ради о узводним и ретким гранама, М420*, М459* и пре свега М198* (настала пре 14100, TMRCA 8500 година) и YP1272 (TMRCA 7500 година). М198 је по свој прилици била јако раширена на простору северне Евроазије, али је као и код свих ловачко-сакупљачких хаплогрупа већина грана изумрла, па су и испод М198 до данас опстале само две гране, М417 и YP1051. YP1272 је пронађена у узорку старом 3800-5900 година из Pit-Comb Ware културе, која се простирала од Балтика до Алтаја. Ово су за сада најстарији (мезолитски и неолитски) узорци R1а:

I1819, 8825-8561 BC, Vasil'evka 3, Ukraine, Ukraine_Mesolithic, R1a-M420

I0061, 6773-5886 BC, Yuzhnyy Oleni Ostrov, Karelia, Russia, Karelia_HG, R1a1-M459* (xM198)

LOK_1980.006, 6125-4885 BC, Lokomotiv, Irkutsk, Russia, Kitoi culture, R1a1a-M198

LOK_1981.024.01, 6125-4885 BC, Lokomotiv, Irkutsk, Russia, Kitoi culture, R1a1a-M198

S5876.E1.L1, 5500-4800 BC, Dereivka, Ukraine, Dnieper-Donets I, R1a-M420

I0433, 5200-4000 BC, Khvalynsk, Volga River, Samara, Russia, Samara_Eneolithic, R1a1-M459* (xM198)

Ukraine_N1, 4452-4350 BC, Vovnigi 2, Ukraine, Dnieper-Donets I, R1a1-M459* (xM198)

I6561, 5000-3500 BCE, Alexandria, Ukraine, Sredny Stog II, R1a1a1-M417

A3, 4000 BC, Serteya VIII, Smolenskaya Oblast, Russia, Comb_Ceramic, R1a1-M459

Kudrukula 3, 3900-1800 BC, Kudruküla, Ida-Viru , Estonia, Comb_Ceramic, R1a1b-YP1272



Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Јануар 11, 2018, 06:36:51 пре подне
Погледао сам детаљније те старе гране гране R1a и видим да сте у праву. Виши проценат EHG у мезолитским узорцима Норвешке и данашња виша присутност R1a у Норвешкој је коинциденција, не може се наћи веза.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Јануар 31, 2018, 03:44:43 поподне
Изгледа да је објављен још један рад старе ДНК са сјевера Европе

https://phys.org/news/2018-01-northern-european-population-history-revealed.html#jCp

Генетикер је дао своју СНП листу налаза:

https://genetiker.wordpress.com/2018/01/31/y-snp-calls-from-ancient-northern-europe/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Јануар 31, 2018, 03:54:44 поподне
Изгледа да је објављен још један рад старе ДНК са сјевера Европе

https://phys.org/news/2018-01-northern-european-population-history-revealed.html#jCp

Генетикер је дао своју СНП листу налаза:

https://genetiker.wordpress.com/2018/01/31/y-snp-calls-from-ancient-northern-europe/

Овдје су комплетнији резултати и текст

https://www.nature.com/articles/s41467-018-02825-9/tables/1

https://www.nature.com/articles/s41467-018-02825-9
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Јануар 31, 2018, 05:33:34 поподне
Изгледа да је објављен још један рад старе ДНК са сјевера Европе

https://phys.org/news/2018-01-northern-european-population-history-revealed.html#jCp

Генетикер је дао своју СНП листу налаза:

https://genetiker.wordpress.com/2018/01/31/y-snp-calls-from-ancient-northern-europe/

Kretuonas 5 је наведен као I2a1b~Y3104(xI2a1b2), то би значило да није позитиван на L621 или?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Фебруар 14, 2018, 05:52:39 пре подне
Тестирани су остаци угарског краља Беле III, и утврђено је да је припадао хаплогрупи R1a, што би значило да је ово хаплогрупа династије Арпадовића. Нажалост тестирани су само STR маркери, па се не може са сигурношћу утврдити дубља подграна, али судећи по Невгену у питању је грана ирано-скитског порекла Z93>Z2125>Z2123>Y934>YP451 (https://www.yfull.com/tree/R-YP451/).

DNA profiling of Hungarian King Béla III and other skeletal remains
originating from the Royal Basilica of Székesfehérvár
(https://link.springer.com/content/pdf/10.1007%2Fs12520-018-0609-7.pdf)

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Фебруар 14, 2018, 08:45:02 пре подне
Тестирани су остаци угарског краља Беле III, и утврђено је да је припадао хаплогрупи R1a, што би значило да је ово хаплогрупа династије Арпадовића. Нажалост тестирани су само STR маркери, па се не може са сигурношћу утврдити дубља подграна, али судећи по Невгену у питању је грана ирано-скитског порекла Z93>Z2125>Z2123>Y934>YP451 (https://www.yfull.com/tree/R-YP451/).

DNA profiling of Hungarian King Béla III and other skeletal remains
originating from the Royal Basilica of Székesfehérvár
(https://link.springer.com/content/pdf/10.1007%2Fs12520-018-0609-7.pdf)

Изгледа да најближи рођаци Арпадовића живе у Србији. Е, сад да ли су Срби или Мађари...

Цитат из рада:

"The closest haplotype to that of King Béla was found as B1-Step-Neighbour in the YHRD. This had 32 repeats compared to the King’s 33 in marker DYS389II. This haplotype was discovered in the population living in Northern Serbia (Zgonjanin et al. 2017)."

Иначе, иако Невген даје најјачу процјену за Z93 (не посве јаку), најближих хаплотипова има и међу разним гранама Z280>CTS34002, ако не узимамо у обзир и неке блиске Z284. Z93 би свакако, с обзиром на азијско поријекло Мађара, имао највише логике.

Поред Беле у гробници је тестиран још један склелет са идентичним хаплотипом, али се не ради о белином ни оцу ни сину, могуће само рођаку по мушкој линији.

Трећи R1a скелет из краљевске гробнице  припада хаплогрупи R1a-Y2613, највјероватније Y2608, и има велики број поклапања са савременим популацијама, од којих и пуна поклапања са неким Хрватима.

Тестирани Ј1 из гробнице припада по свему судећи хаплогрупи
J1- Z1828> Z1842> Z18436> CTS1460> CTS7188
Најближа поклапања су на Кавказу (поготово Чеченији)

Иако није близак хаплотип, грана Z1842 је предиктована за Шекуларце Радмужевиће.

Провјерићу још два R1b и један E-V13 хаплотип.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Фебруар 14, 2018, 09:08:36 пре подне
Двојица R1b немају блиских поклапања на нашим просторима, Невген и блиска поклапања дају највише шансе код једног за R1b-L21 ,а код другог за R1b-U106.

Е1b је највјероватније нека E-V13>Z5018 грана, од наших му је најближи Кузмановић из Осипаонице, који наводи раније влашко поријекло.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Фебруар 14, 2018, 09:23:23 пре подне

Тестирани Ј1 из гробнице припада по свему судећи хаплогрупи
J1- Z1828> Z1842> Z18436> CTS1460> CTS7188
Најближа поклапања су на Кавказу (поготово Чеченији)

Иако није близак хаплотип, грана Z1842 је предиктована за Шекуларце Радмужевиће.

Сад видим да ове хаплогрупе, блиског хаплотипа, има и по Хрватској (анонимне базе). Дакле, ради се ипак о некој популацији, не о случајном појединцу.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Фебруар 14, 2018, 09:47:01 пре подне
 Бела изгледа као Y934>YP451>YP449 (R-YP450-). За CTS34002 проблем прави његов dys385, као и височији GATAH4. За неке ближе Z284 је проблем њихов модал dys448=19, који их може се рећи избацује из круга. Бела има јако чудну високу вриједност на dys389ii, али обзиром да је тако чудна рекао бих да је вјероватно једноставно необична вишеструка мутација.

 за J1 сигурно је CTS1460, али доста чудних dys392=13 га чини могуће најближим једном турском хаплотипу из турско-јерменско-казахске групе S12993>FGC37470. (J-Y22035 Yfull)

 За E-V13, сложио бих се са симом да показује афинитет са Кузмановићем. И највјероватнија опција за обоје јесте грана FGC11450>CTS11286 (Швицарац), генерално имају као и скоро сви FGC11450 GATAH4=10 (са одузимањем), и наравно dys390=23 који их чини ближим Шпару. Имају још двије гране, један други Z5108, и један S-7461, који би можда били у оптицају, али ипак додајући и Кузмановићеве маркере они имају мале шансе, посебно други.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Сол Фебруар 14, 2018, 12:51:45 поподне
Јел негде објављен (завршен?) рад Д. Марјановића из 2012.?

DNA Analysis of Skeletal Remains of Bosnian Medieval Royal Family

https://www.bib.irb.hr/883579
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: crni Фебруар 14, 2018, 01:20:27 поподне
Јел негде објављен (завршен?) рад Д. Марјановића из 2012.?

DNA Analysis of Skeletal Remains of Bosnian Medieval Royal Family

https://www.bib.irb.hr/883579

Изгледа да је сажетак објављен у Зборнику European Forensic DNA Working Group Meeting 2012. (http://bib.irb.hr/prikazi-rad?rad=883579), а биографија, истраживање, радови и публикације, као и контакти Проф. Др. Дамира Марјановића могу се наћи на линку (https://people.ibu.edu.ba/dmarjanovic/).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: filipi Фебруар 14, 2018, 02:18:29 поподне
Изгледа да је сажетак објављен у Зборнику European Forensic DNA Working Group Meeting 2012. (http://bib.irb.hr/prikazi-rad?rad=883579), а биографија, истраживање, радови и публикације, као и контакти Проф. Др. Дамира Марјановића могу се наћи на линку (https://people.ibu.edu.ba/dmarjanovic/).
Neki Bosnjacki portlali i stranice na drusrvenim mrezama su objavili da se radi o I2a Hg ali kao Marjanovic nece da to objavi.Urnebesno je sto urednici tih portala jos su u 2003 godini sto se tice haplogrupa,pa navode da je I2a staroilirska Hg i predslovenska koju nose Bosnjaci uglavnom :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Фебруар 14, 2018, 02:27:13 поподне
Eтo дa иcкopиcтим пpилику, пa дa питaм, дoклe ce cтиглo oкo пpичe у вeзи тecтиpaњa Нeмaњићa?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Фебруар 14, 2018, 08:30:32 поподне
Eтo дa иcкopиcтим пpилику, пa дa питaм, дoклe ce cтиглo oкo пpичe у вeзи тecтиpaњa Нeмaњићa?

Мрка капа, још увек.  ;)

Што се тиче Котроманића, на повезници коју је приложио Сол пише да је то "необјављени рад". Велика је штета ако заиста није објављен из политичких разлога (због "нежељене" хаплогрупе).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Фебруар 17, 2018, 04:47:10 поподне
http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371%2Fjournal.pone.0190169
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Свевлад Фебруар 17, 2018, 05:20:53 поподне
Мрка капа, још увек.  ;)

Што се тиче Котроманића, на повезници коју је приложио Сол пише да је то "необјављени рад". Велика је штета ако заиста није објављен из политичких разлога (због "нежељене" хаплогрупе).

Да су сачувани остаци неког од Котроманића?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Фебруар 17, 2018, 06:01:41 поподне
Да су сачувани остаци неког од Котроманића?

Сачувани јесу, пошто су се сахрањивали у Бобовцу, босанском краљевском утврђењу код Вареша.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Скардус Фебруар 17, 2018, 06:46:56 поподне
Предложио бих отварање ''Фонда'' у којем би се сакупљала средства за ДНК анализе остатака средњевековних српских владара и осталог племства за које се тачно зна локација где су сахрањени. ''Фонд'' би сакупљао и радио анализе ДНК и за остале старе људске остатке које се пронађу на територији Србије, укључујући и предантички и антички период.
Руководство ''Фонда'' би имало и задатак да од цркве добије одговарајуће дозволе, јер како изгледа, проблем су баш те дозволе???
Такође, ''Фонд'' би се старао за проналажење најстручнијих ДНК центара у свету за анализе које се не могу вршити у Србији, како се не би десио случај као код анализе ДНК Немањића.




Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Фебруар 17, 2018, 08:21:18 поподне
Предложио бих отварање ''Фонда'' у којем би се сакупљала средства за ДНК анализе остатака средњевековних српских владара и осталог племства за које се тачно зна локација где су сахрањени. ''Фонд'' би сакупљао и радио анализе ДНК и за остале старе људске остатке које се пронађу на територији Србије, укључујући и предантички и антички период.
Руководство ''Фонда'' би имало и задатак да од цркве добије одговарајуће дозволе, јер како изгледа, проблем су баш те дозволе???
Такође, ''Фонд'' би се старао за проналажење најстручнијих ДНК центара у свету за анализе које се не могу вршити у Србији, како се не би десио случај као код анализе ДНК Немањића.

За тај фонд би требала позамашна средства чини ми се, много већа од оних која су потребна за тестирање живих појединаца.

Није ми јасно какав се то "случај" десио код Немањића, с обзиром да није извршена никаква анализа њихове ДНК до сада?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Скардус Фебруар 18, 2018, 12:04:43 пре подне
Никола Вук је у праву. У питању су Лазаревићи, као једина породица од српског племства којима су идентификовани земни остаци, али којима није било могуће узети ДНК.
То сам прочитао у неком чланку а у коментарима је неко посумњао да је да се подаци из неког разлога прикривају јер је, како кажу, нелогично да се узима ДНК са костију старих стотине хиљада година а да се не може узети ДНК са остацима старим 600 година.
По мом мишљењу неодговорно је понашање државе према нашим славним прецима, исто као и понашање цркве која мошти наших владара - светаца сматра својим власништвом.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Фебруар 18, 2018, 01:55:21 поподне
Никола Вук је у праву. У питању су Лазаревићи, као једина породица од српског племства којима су идентификовани земни остаци, али којима није било могуће узети ДНК.
То сам прочитао у неком чланку а у коментарима је неко посумњао да је да се подаци из неког разлога прикривају јер је, како кажу, нелогично да се узима ДНК са костију старих стотине хиљада година а да се не може узети ДНК са остацима старим 600 година.
По мом мишљењу неодговорно је понашање државе према нашим славним прецима, исто као и понашање цркве која мошти наших владара - светаца сматра својим власништвом.

Узет је ДНК и из Лазаревих и из Стефанових моштију како би се потврдило да је у Манасији, а не у Копорину сахрањен Лазарев син, Стефан Лазаревић. Додуше циљ им је био само да покажу везу отац-син, зато му ваљда нису ни одредили хаплогрупу.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Фебруар 21, 2018, 12:42:27 пре подне
Тестирани скелети са некропола у Мађарској и Италији које се приписују Лангобардима:

Understanding 6th-Century Barbarian Social Organization and Migration through Paleogenomics (https://www.biorxiv.org/content/early/2018/02/20/268250)

(https://s13.postimg.org/mmyssiiyv/image.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Фебруар 21, 2018, 01:00:45 пре подне
Тестирани скелети са некропола у Мађарској и Италији које се приписују Лангобардима:

Understanding 6th-Century Barbarian Social Organization and Migration through Paleogenomics (https://www.biorxiv.org/content/early/2018/02/20/268250)

Занимљиво. Колико видим у Мађарској некрополи је солидна заступљеност I-M223 и R-U106 што се врло добро уклапа у већ познато германско порекло овог племена.
Са друге стране у италијанској некрополи доминира R-P312.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Фебруар 21, 2018, 01:08:42 пре подне
Занимљиво. Колико видим у Мађарској некрополи је солидна заступљеност I-M223 и R-U106 што се врло добро уклапа у већ познато германско порекло овог племена.
Са друге стране у италијанској некрополи доминира R-P312.

Meни je зaнимљивa cкopo нeвидљивa I1... И oвa пocтojeћa je P109 aкo ce нe вapaм.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Фебруар 21, 2018, 09:18:26 пре подне
Колико видим аутори студије су извели закључак:
"Finally, our data was consistent with the proposed long-distance migration from Pannonia to Northern Italy."

Немам увид у цјелокупан рад, па не знам на основу чега су потврдили сеобу Лангобарда. Y-днк коју су представили чини ми се да не пружа сасвим сигурне доказе да се сеоба десила, мада оставља могућност да јесте. Можда су се у овом закључку више ослањали на аутосомалну днк, на коју нисам претјерано обратио пажњу. Оно што је евидентно јесте да и налазиште у Мађарској и у Италији садржи јак германски уплив. Питање је само да ли су то исти Германи.

Рад је добар, јер су за неке узорке дати прилично дубоки СНП-ови. Са друге стране, има доста грешака у представљању резултата, нарочито код означавања. Покушао сам на основу датих СНП-ова, дати јаснији преглед хаплогрупа тестираних.

Италија

CL38       E-V13
CL31   G2a1-Z6553
CL63   I2a2-M223>CTS616>Z161>L801>S2364>L1198>Z79
CL23   T1a-M70>L131>L446
CL110   R1-M173
CL53   R1b-M173>M269
CL57   R1b-M173>M269>L23>L51>L151
CL93   R1b-M173>M269>L23>L51>L151
CL145   R1b-M173>M269>L23>L51>L151
CL146   R1b-M173>M269>L23>L51>L151
CL92   R1b-M173>M269>L23>L51>L151
CL84   R1b-M173>M269>L23>L51>L151>U106>Z381
CL30   R1b-M173>M269>L23>L51>L151>P312
CL49   R1b-M173>M269>L23>L51>L151>P312>U152>L2>Z367
CL94   R1b-M173>M269>L23>L51>L151>P312>S11987
CL121   R1b-M173>M269>L23>Z2103

Мађарска

SZ18   E-V22
SZ45   I1-M253>L22
SZ12   I2a2-M223>CTS616
SZ14   I2a2-M223>CTS616
SZ24   I2a2-M223>CTS616
SZ43   I2a2-M223>CTS616>L1229>S391
SZ3   I2a2-M223>CTS616>Z161>L801
SZ13   I2a2-M223>CTS616>Z161>L801>S2364>S8112
SZ22   I2a2-M223>CTS616>Z161>L801>S2364>S8112
SZ7   I2a2-M223>CTS616>Z161>L801>S2364>S8112
SZ36   T1a-M70>L208
SZ15   R1a-M417>Z282>Z284>S200
SZ4   R1b-M173>M269>L23>L51>L151>U106>Z16
SZ16   R1b-M173>M269>L23>L51>L151>U106>Z381
SZ23   R1b-M173>M269>L23>L51>L151>U106>Z381
SZ2   R1b-M173>M269>L23>L51>L151>P312>L21>DF13>DF21>Z16924>L130
SZ11   R1b-M173>M269>L23>L51>L151>U106>Z381>L48>Z9>Z30>Z8
SZ27B   R1b-M173>M269>L23>L51>L151>P312
SZ37   R1b-M173>M269>L23>L51>L151>P312
SZ42   R1b-M173>M269>L23>L51>L151>P312
SZ5   R1b-M173>M269>L23>L51>L151>P312>U152>Z36>CTS5531

Мађарска(бронзано доба)

SZ1   R1a-M417>Z93>Z94>Z2123
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Фебруар 21, 2018, 09:32:33 пре подне
Чисто технички гледано лангобардска налазишта у Мађарској и Италији повезују двије хаплогрупе, које се могу повезати са германским пиопулацијама: R1b-U106 и I2-M223.

Међутим, кад се спустимо до нивоа најнижих грана, везу можемо уочити на нивоу R1b-U106>Z381. Италијански узорци нису даље СНп одређени, док у мђарском узорку имамо и специфичнију грану R1b-U106>Z381>L48>Z9>Z30>Z8. Можемо само нагађати да ли је и италијански узорак Z8.

Што се I2-M223 тиче, постоји само један I2-M223 у италијанском узорку, одређен као I2a2-M223>CTS616>Z161>L801>S2364>L1198>Z79 ( по еупедији ово је хаплогрупа Чака Нориса). Иначе овај узорак је у раду погрешно означен као I1. Узорци у мађарском налазишту припадају грани I2a2-M223>CTS616>Z161>L801>S2364>S8112. Ту дакле можемо уочити везу на нивоу I2a2-M223>CTS616>Z161>L801>S2364. Постоји још један мађарски узорак који је L801, па може припадати или грани S8112 или Z79.

На германски уплив указује и присуство R1a-M417>Z282>Z284>S200 и  I1-M253>L22 у мађарском узорку.

Укратко би могли закључити да су једине сигурно потврђене везуе између два налазишта, што се тиче германске генетике:

R1b-M173>M269>L23>L51>L151>U106>Z381
I2a2-M223>CTS616>Z161>L801>S2364

па би у складу са тим и Лангобарди могли бити носиоци једне од ове двије хаплогрупе, или можда и обе.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Фебруар 21, 2018, 09:47:38 пре подне
Што се тиче романске генетике на налазишту, ту већ имамо свега и свачега.

У Италији имамо:
E-V13 без дубљих подграна.
T1a-M70>L131>L446
R1b-M173>M269>L23>Z2103
Више западне R1b која није СНП дубље одређена па би могла бити и U106 и P312.
R1b-M173>M269>L23>L51>L151>P312 која је заступљена са подграном U152>L2>Z367 и S11987.

У Мађарској имамо:

Е-V22, прилично необично.
T1a-M70>L208, друга грана у односу на италијанску.
R1b-M173>M269>L23>L51>L151>P312>L21>DF13>DF21>Z16924>L130, ова подграна је типична за британска острва.
R1b-M173>M269>L23>L51>L151>P312>U152>Z36>CTS5531
и више R1b-M173>M269>L23>L51>L151>P312 без дубљих подграна.

Видимо да на нивоу романске генетике, још мање могу да се успоставе директне везе. Једино можда на ниво R1b-M173>M269>L23>L51>L151>P312, али то је прилично стара грана. Ово иде у прилог томе да се ту ради о различитим романским популацијама у Мађарској и Италији.

Остаје још хаплогрупа G2a1-Z6553 у италијанском узорку. Она би требала бити кавкаског поријекла. Нисма гелдао детаљније, знам да су неку G2a1 повезивали са Аланима, можд аби требало испитати ту тезу.

На налазишти је тестиран и једна узорак из Бронзаног доба са тла Мађарске и припада хаплогрупи:
R1a-M417>Z93>Z94>Z2123

Примјетно је одсуство словенских хаплогрупа у оба налазишта, што је и очекивано с обзриом да Словена у панонији у то вријеме још није било, или су тек почели да продиру.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Фебруар 21, 2018, 03:29:33 поподне
Мени је занимљиво што се јављају две потпуно различите подгране од T хаплогрупе на истраженим налазиштима, а занимљива је и дихотомија E-V22 (Мађарска) - E-V13 (Италија). У Мађарској се јавља и један усамљени I1 L22; заиста је занимљиво оволико одсуство I1 хаплогрупе, да додам још да за поменути узорак не можемо да знамо да ли је у питању P109 или нека од других многобројних подграна од L22.

Прелистао сам мало рад, нарочито део који се тиче археолошког контекста, и у оба случаја (и мађарском и италијанском) се ради о родовским некрополама (Солад је из прве трећине 6. века, док је Колењо с краја 6. и почетка 7. века), са конструкцијом гробова и налазима типичним за Лангобарде; јављају се у мањем броју и гробови другачије конструкције и сиромашнији налазима, који се изгледа могу везати за локално (романско) становништво. То се лепо види и по структури хаплогрупа, доминирају S2364 и Z381, по свему судећи доминантне код Лангобарда. Нагласио бих да се налазиште Солад у Мађарској налази јужно од језера Балатон, тј. малтене на његовој обали, а у балатонској области је још раније дефинисана кестхељска група, која представља романизоване староседеоце Паноније и потомке римских колониста под влашћу разних варварских племена током 5. и 6. века, отуд и прилична хетерогентост "не-лангобардске" Y-ДНК генетике на некрополи у Соладу, а слично се може рећи и за налазиште Колењо у близини Торина.

По аутозомалној генетици су изоловали CEU-GBR (Central Europe-Great Britain), која доминира код свих лангобардских гробова, док се у староседелачким гробовима јавља TSI (Tuscans from Italy) у већем броју и у мањем IBS (Iberians from Spain). Занимљиви су следећи закључци:

 By crudely assigning individuals into five colour-coded groups based on relative ancestry                          
components, a clear correspondence can be observed between our ADMIXTURE and PCA analysis.                          
Analysis of Y chromosomes in males generally reveals a highly concordant pattern to the autosomes,                              
with haplogroups that are most predominant in modern central/northern Europeans along with a                          
smaller set of southern European-associated haplogroups in both cemeteries.

We also examined our ancient samples within the context of the prehistoric groups that were                              
the major contributors to modern European genetic variation: Paleolithic hunter-gatherers (WHG),                      
Neolithic farmers (EEF) and Bronze Age Steppe herders (SA). Both PCA (Figures S7.4-7) and                            
supervised ADMIXTURE analysis (Figures S8.16-18) essentially reiterate the same structure amongst                    
our ancient samples, with greatest EEF ancestry in those individuals demonstrating similarities to                          
modern southern Europeans and greater WHG+SA ancestry in those that resembled modern                        
northern Europeans (with WHG being predominant in Northwest Europe and SA in Northeast                          
Europe).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: sbk Фебруар 23, 2018, 12:21:45 пре подне
Видео сам вест (http://www.rtv.rs/sr_lat/zivot/nauka-i-tehnologija/arheolozi-iz-srbije-donose-nova-svetska-otkrica_895511.html (http://www.rtv.rs/sr_lat/zivot/nauka-i-tehnologija/arheolozi-iz-srbije-donose-nova-svetska-otkrica_895511.html), https://www.b92.net/zivot/nauka.php?yyyy=2018&mm=02&dd=22&nav_id=1361800 (https://www.b92.net/zivot/nauka.php?yyyy=2018&mm=02&dd=22&nav_id=1361800)) да су српски археолози Андреј Старовић, Душан Борић и Драгана Антоновић дошли до занимљивих отркрића о ДНК древног становништва југоисточног дела Европе, али чланак не доноси ниједан конкретан податак...

У ствари, вест се односи на рад који је објављен на Nature https://www.nature.com/articles/nature25778 (https://www.nature.com/articles/nature25778),  (само за претплатнике).

Мени је најзанимљивије деловала реченица  "Резултати студије доносе сасвим нове, а понегде и изненађујуће закључке о пореклу европског становништва, а подаци са локалитета Лепенски Вир, Власац, Ајмана кључни су за разумевање механизама најстаријих генетских мешања између ловачко - сакупљачких староседелаца и новопридошлих фармера."


Зна ли можда неко нешто више?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Фебруар 23, 2018, 01:26:12 пре подне
Видео сам вест (http://www.rtv.rs/sr_lat/zivot/nauka-i-tehnologija/arheolozi-iz-srbije-donose-nova-svetska-otkrica_895511.html (http://www.rtv.rs/sr_lat/zivot/nauka-i-tehnologija/arheolozi-iz-srbije-donose-nova-svetska-otkrica_895511.html), https://www.b92.net/zivot/nauka.php?yyyy=2018&mm=02&dd=22&nav_id=1361800 (https://www.b92.net/zivot/nauka.php?yyyy=2018&mm=02&dd=22&nav_id=1361800)) да су српски археолози Андреј Старовић, Душан Борић и Драгана Антоновић дошли до занимљивих отркрића о ДНК древног становништва југоисточног дела Европе, али чланак не доноси ниједан конкретан податак...

У ствари, вест се односи на рад који је објављен на Nature https://www.nature.com/articles/nature25778 (https://www.nature.com/articles/nature25778),  (само за претплатнике).

Мени је најзанимљивије деловала реченица  "Резултати студије доносе сасвим нове, а понегде и изненађујуће закључке о пореклу европског становништва, а подаци са локалитета Лепенски Вир, Власац, Ајмана кључни су за разумевање механизама најстаријих генетских мешања између ловачко - сакупљачких староседелаца и новопридошлих фармера."


Зна ли можда неко нешто више?

http://sci-hub.tw/10.1038/nature25778 (http://sci-hub.tw/10.1038/nature25778)

https://dnk.poreklo.rs/genetska-slika-lepenskog-vira-vince/ (https://dnk.poreklo.rs/genetska-slika-lepenskog-vira-vince/)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Фебруар 28, 2018, 09:57:40 поподне
Да ли је доступан BAM фајл за онај налаз Z2103 из вучедолске културе којим случајем, и да ли су за њега успели да извуку ниже подгране?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Фебруар 28, 2018, 10:33:32 поподне
Да ли је доступан BAM фајл за онај налаз Z2103 из вучедолске културе којим случајем, и да ли су за њега успели да извуку ниже подгране?

 Гледајући остале узорке, изгледа да ће га ускоро урадити, ако је могуће. Мој кандидат за дубљу подграну јесте Z2108>KMS67.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Фебруар 28, 2018, 10:40:06 поподне
Да ли је доступан BAM фајл за онај налаз Z2103 из вучедолске културе којим случајем, и да ли су за њега успели да извуку ниже подгране?

Колико ја разумем то су ови резултати: Y-SNP calls for I3499 (https://genetiker.wordpress.com/y-snp-calls-for-i3499/)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Фебруар 28, 2018, 10:57:14 поподне
Колико ја разумем то су ови резултати: Y-SNP calls for I3499 (https://genetiker.wordpress.com/y-snp-calls-for-i3499/)

R1b-M343-L754-L388-P297-M269-L23-L51-FGC796-S1194-CTS4528-S14328-PF2642-PF2642

Да ли ово значи да је узорак ипак L51+ Z2103-, или ја нисам нешто добро разумео?  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Фебруар 28, 2018, 11:09:08 поподне
R1b-M343-L754-L388-P297-M269-L23-L51-FGC796-S1194-CTS4528-S14328-PF2642-PF2642

Да ли ово значи да је узорак ипак L51+ Z2103-, или ја нисам нешто добро разумео?  :)

Стоји и
 R1b-M343-L754-L388-P297-M269-L23-CTS7340.1-GG536-CTS1843-CTS7822-CTS7556-GG649-BY20202-PF2642-PF2642  (ово имплицира да је Z2103+, L51-)

 Чини ми се да је овдје кључан СНП PF2642. Знам за неки резултат који је позитиван на PF2642 а налази се између Z2110 и CTS9219 (негативан на CTS9219).
https://www.worldfamilies.net/node/35820
 Генерално не очекујем CTS9219 у Вучедолу, између осталог и због недовољне старости CTS9219. Оно са чим би CTS9219 морао имати везе јесте Кослођени, Вербичоара итд..
 
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ... Фебруар 28, 2018, 11:16:26 поподне

Стоји и
 R1b-M343-L754-L388-P297-M269-L23-CTS7340.1-GG536-CTS1843-CTS7822-CTS7556-GG649-BY20202-PF2642-PF2642  (ово имплицира да је Z2103+, L51-)

 Чини ми се да је овдје кључан СНП PF2642. Знам за неки резултат који је позитиван на PF2642 а налази се између Z2110 и CTS9219 (негативан на CTS9219).
https://www.worldfamilies.net/node/35820
 Генерално не очекујем CTS9219 у Вучедолу, између осталог и због недовољне старости CTS9219. Оно са чим би CTS9219 морао имати везе јесте Кослођени, Вербичоара итд..

Не разумем се много у Р1б СНП-ове али ми се чини да се PF2642 јавља на више места, тј у оквиру више грана.
BY20202 би требао бити изнад CTS9219, а испод Y5592/GG649
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Фебруар 28, 2018, 11:28:03 поподне
R1b-M343-L754-L388-P297-M269-L23-L51-FGC796-S1194-CTS4528-S14328-PF2642-PF2642

Да ли ово значи да је узорак ипак L51+ Z2103-, или ја нисам нешто добро разумео?  :)

Опет ћу да почнем са ”колико ја разумем” такав појединачан позитиван резултат за SNP се сматра ”неправилним одзивом” (false call) или случајном мутацијом. Наиме тај болдовани резултат не значи да је добио ”одзив” за L51 већ само за PF2642.
Тј, да би се резултат сматрао позитвним на неку подграну потребно је да буде позитиван на очекивани филогенетски низ SNP-ева који су на нивоу изнад те подгране. То у случају PF2642 немамо.

Нисам сигуран како је genetiker на крају добио R1b1a1a2a2~Z2103, али је на почетку то навео као резултат за овај узорак што се слаже и са податком из студије.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Фебруар 28, 2018, 11:33:36 поподне
Опет ћу да почнем са ”колико ја разумем” такав појединачан позитиван резултат за SNP се сматра ”неправилним одзивом” (false call) или случајном мутацијом. Наиме тај болдовани резултат не значи да је добио ”одзив” за L51 већ само за PF2642.
Тј, да би се резултат сматрао позитвним на неку подграну потребно је да буде позитиван на очекивани филогенетски низ SNP-ева који су на нивоу изнад те подгране. То у случају PF2642 немамо.


Taкo je... Ta мутaциja ce jaвљa нa иcтoм мecту и кoд нeкe дpугe xaплoгpупe, дoк je у oвoм cлучajу oчиглeднo нeзaвиcнa, a штo ce филoгeнeтcкoг cтaблa тичe нeбитнa.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Фебруар 28, 2018, 11:44:31 поподне
Не разумем се много у Р1б СНП-ове али ми се чини да се PF2642 јавља на више места, тј у оквиру више грана.
BY20202 би требао бити изнад CTS9219, а испод Y5592/GG649

 Да, ради се о "међуграни" BY20202 и то је одлично, наиме ја сам већ више хаплотипова из анонимних студија Грчке класификовао као вјероватне Y5592*.:)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ... Фебруар 28, 2018, 11:50:44 поподне
Да, ради се о "међуграни" BY20202 и то је одлично, наиме ја сам већ више хаплотипова из анонимних студија Грчке класификовао као вјероватне Y5592*.:)

Сачекаћемо да неко од администратора Р1б пројеката протумачи ове СНП-ове, пошто је овај филогенетски низ одозго нелогичан и код неких других болдованих СНП-ова.
Мислим да је Y5592* само једна од могућности за PF2642.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: sbk Фебруар 28, 2018, 11:59:40 поподне
http://sci-hub.tw/10.1038/nature25778 (http://sci-hub.tw/10.1038/nature25778)

https://dnk.poreklo.rs/genetska-slika-lepenskog-vira-vince/ (https://dnk.poreklo.rs/genetska-slika-lepenskog-vira-vince/)

Хвала пуно!
Познат ми је овај други линк са "Порекла",  кад сам видео чланак помислио сам да има још неких вести... Добро, разумем да у научном свету неки рад од пре неколико месеци такође је "свежа" вест.

Хвала још једном.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Свевлад Март 02, 2018, 01:26:07 поподне
Анализирани узорци из Британије из римског периода.

(http://4.bp.blogspot.com/-uuWEsp0LNmU/Vp63QyalGzI/AAAAAAAAD6U/Bnd5tJRmTXQ/s1164/Martiniano_etal_Table_1.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Март 02, 2018, 02:07:22 поподне
Анализирани узорци из Британије из римског периода.

(http://4.bp.blogspot.com/-uuWEsp0LNmU/Vp63QyalGzI/AAAAAAAAD6U/Bnd5tJRmTXQ/s1164/Martiniano_etal_Table_1.png)

3DRIF-16: R1b-U106

3DRIF-26: J2b1-M205

6DRIF-18: R1b-L151

6DRIF-21: R1b-P312>L21>DF63>CTS6919

6DRIF-22: R1b-P312>U152>L2>FGC22501

6DRIF-23: R1b-P312>DF19>DF88>Y3096>Y6234>S4268>Y6237 (xL644)

6DRIF-3: R1b-U106
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Март 02, 2018, 03:09:12 поподне

3DRIF-26: J2b1-M205


Je л' тo тaj глaдиjaтop? :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ДушанВучко Март 02, 2018, 03:35:26 поподне
У једном чланку под називом "The Black face of Roman Britain", се наводи истраживање са универзитета у Редингу,где кажу да је чак 20% популације римске Британије било небританског порекла...
Dr Hella Eckardt who is a senior lecturer in Roman Archaeology at the University of Reading said:

Our analysis of excavated skeletal remains of people living in Roman Britain such as the 'Ivory Bangle Lady' and others like her show that multicultural Britain is not just a phenomenon of more modern times."

As part of the research, archaeologists analysed the facial features of skeletons, skull measurements, the chemical signature of food and drink and burial goods- which told them about the conditions and quality of life of African migrants.

Dr Debbie Weeks-Bernard who heads the 'Roman Revealed' project said:

The University of Reading research results showed that people came to Britain from many different parts of the Roman Empire, including North Africa. In some of the larger towns like York and Winchester, up to 20 per cent of the Roman Britain population may be classed as 'non-local' or 'incomers'. "
(http://www.romansrevealed.com/uploads/images/landingPageImages/julia.jpg)
http://www.obv.org.uk/news-blogs/black-face-roman-britain


A million British men may be directly descended from the Roman legions which came, saw and conquered England and Wales almost two thousand years ago, a DNA study suggests.

The Romans departed abruptly in the early 5th Century AD, leaving behind relics of their rule including Hadrian's Wall along with a host of towns, roads and encampments.

The painting above is entitled "The Last Roman Leaves Britain" by John Everett Millais.
(https://4.bp.blogspot.com/-IGj4KVJbfQc/WP36ekVtOMI/AAAAAAAAJpE/SajCKFYD2X8G-SKLjodLaCM-tw9YmlrswCLcB/s1600/roman-lastromanleavesbritain-John%2BEverett%2BMillais.jpg)
But, according to a report in THE TELEGRAPH, perhaps the most enduring sign of their legacy is in British genes, with an estimated million British men descending from the invading forces.

A genetic study of 5,000 people found that up to four million men in England and Wales carry distinctive genetic signatures which are most commonly found, and likely have their origin, in Italy, the newspaper report said.
 The DNA markers are much rarer in Ireland, where there was no Roman invasion, and Scotland where the armies' presence was limited to a brief occupation of some southern regions.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Свевлад Март 02, 2018, 03:48:13 поподне
Je л' тo тaj глaдиjaтop? :)

Јесте.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Грк Март 02, 2018, 06:00:52 поподне
Претходно истраживање ме подјети на овај текст о поријеклу фамилије Грахам из Британије:

https://www.scribd.com/document/363327972/Graham-Origins-Arms-and-the-Man
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: нцп Март 02, 2018, 09:08:24 поподне
Претходно истраживање ме подјети на овај текст о поријеклу фамилије Грахам из Британије:

https://www.scribd.com/document/363327972/Graham-Origins-Arms-and-the-Man

Одлично!
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Март 13, 2018, 03:54:40 пре подне
У новом раду тестирано је 36 раносредњовековних узорака из Баварске (5-6. век), један ранији узорак (~300 н.е.) са истог подручја (римски војник), затим два узорка која се везују за Сармате, један са Крима који се везује за Остроготе, и један из Србије који се везује за Гепиде (~550 н.е, налазиште Виминацијум). Нажалост, у раду нису тестиране ипсилон хаплогрупе, али сазнаће се и то када буду објављени сирови подаци. Оно што је најзанимљивије код овог узорка је да има прилично велики удео источноазијске генетике, у К=8 анализи скоро 25%, а од модерних популација најбоље се уклапа у кавкаске Ногаје, што би можда могло указивати да је био део неке хунске популације која се утопила у Гепиде, или нека рана аварска придошлица. С обзиром да су Гепиди дуго времена били под хунском влашћу вероватније ми делује прва опција.

Population genomic analysis of elongated skulls
reveals extensive female-biased immigration in Early Medieval Bavaria
(http://www.pnas.org/content/pnas/early/2018/03/06/1719880115.full.pdf)

Додатни материјал (http://www.pnas.org/content/pnas/suppl/2018/03/06/1719880115.DCSupplemental/pnas.1719880115.sapp.pdf)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Март 13, 2018, 09:25:54 пре подне
У новом раду тестирано је 36 раносредњовековних узорака из Баварске (5-6. век), један ранији узорак (~300 н.е.) са истог подручја (римски војник), затим два узорка која се везују за Сармате, један са Крима који се везује за Остроготе, и један из Србије који се везује за Гепиде (~550 н.е, налазиште Виминацијум). Нажалост, у раду нису тестиране ипсилон хаплогрупе, али сазнаће се и то када буду објављени сирови подаци. Оно што је најзанимљивије код овог узорка је да има прилично велики удео источноазијске генетике, у К=8 анализи скоро 25%, а од модерних популација најбоље се уклапа у кавкаске Ногаје, што би можда могло указивати да је био део неке хунске популације која се утопила у Гепиде, или нека рана аварска придошлица. С обзиром да су Гепиди дуго времена били под хунском влашћу вероватније ми делује прва опција.

Population genomic analysis of elongated skulls
reveals extensive female-biased immigration in Early Medieval Bavaria
(http://www.pnas.org/content/pnas/early/2018/03/06/1719880115.full.pdf)

Додатни материјал (http://www.pnas.org/content/pnas/suppl/2018/03/06/1719880115.DCSupplemental/pnas.1719880115.sapp.pdf)

Ако су у питању аутозомални резултати, а сва је прилика да јесу, велики проценат источне Азије код Гепида није неуобичајен. Њихово племство је од Хуна преузело обичај вештачког деформисања лобања, па је сасвим могућно и да су са хунским племством ступали у брачне везе; ако индивидуа од које је узет узорак поседује вештачки деформисану лобању, онда је ствар врло јасна. Осим Хуна, Гепиди су били у блиском додиру и са Аланима, па је то још један могући "извор" источноазијске генетике код наведене индивидуе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Март 13, 2018, 11:42:47 пре подне
Нисам успио схватити да ли су гепидски и остроготски узорак, из Србије и Крима, мушки или женски узорци? У сваком случају гепидски узорак, поред још једног из баварске серије, има највећи удио East Asian неевропске компоненте од свих досад тестираних савремених и древних Европљана. По тој логици, тај утицај не би требао бити од неког народа са ове стране Урала. Од свих азијских народа који су прокрстарили нашим подручјима мислим да Хуни имају најисточније азијско поријекло (бар њихов горњи слој). Тако се бар писало. У том случају они би били најбољи кандидати за ову East Asian компоненту у гепидском узорку из Виминацијума.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Март 13, 2018, 02:47:46 поподне
Ако су у питању аутозомални резултати, а сва је прилика да јесу, велики проценат источне Азије код Гепида није неуобичајен. Њихово племство је од Хуна преузело обичај вештачког деформисања лобања, па је сасвим могућно и да су са хунским племством ступали у брачне везе; ако индивидуа од које је узет узорак поседује вештачки деформисану лобању, онда је ствар врло јасна. Осим Хуна, Гепиди су били у блиском додиру и са Аланима, па је то још један могући "извор" источноазијске генетике код наведене индивидуе.

Да, у питању су аутозомални резултати (плус mt-DNA), а гепидски скелет који је тестиран има вештачки деформисану лобању. Али колико схватих, у закључку аутори кажу да се не може доказати ексклузивно хунско/источњачко порекло овог обичаја, јер су скелети са вештачки деформисаним лобањама пронађени у ранијем периоду (2. век) у Румунији. Такође, остроготски скелет са Крима који је бар стотинак година старији од гепидског такође има вештачки деформисану лобању, а нема скоро ни трага источноазијске генетике. Код њега доминира медитеранска генетика јужне/југоисточне Европе и Блиског Истока, уз мали проценат Јужне Азије, а од модерних популација најбоље се уклапа у Турке. Ови резултати говоре да иако је нађен у остроготском контексту вероватно представља популацију грчке колоније Пантикапеја (https://en.wikipedia.org/wiki/Panticapaeum) на Криму.

Нисам успио схватити да ли су гепидски и остроготски узорак, из Србије и Крима, мушки или женски узорци? У сваком случају гепидски узорак, поред још једног из баварске серије, има највећи удио East Asian неевропске компоненте од свих досад тестираних савремених и древних Европљана. По тој логици, тај утицај не би требао бити од неког народа са ове стране Урала. Од свих азијских народа који су прокрстарили нашим подручјима мислим да Хуни имају најисточније азијско поријекло (бар њихов горњи слој). Тако се бар писало. У том случају они би били најбољи кандидати за ову East Asian компоненту у гепидском узорку из Виминацијума.

И гепидски и остроготски су мушки. И римски војник и два сарматска узорка такође. Иначе, ова два сарматска узорка се од данашњих популација најбоље уклапају у Таџике, што свакако има смисла. Мислим да су сирови подаци већ доступни па нећемо дуго чекати и на ипсилон хаплогрупе. Када је у питању митохондријална, остроготски узорак KER_1 је HV9a, а гепидски VIM_2 је H7.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Nebo Март 13, 2018, 03:27:06 поподне
Пригодан кратки осврт на вештачку деформацију лобање:

https://sveoarheologiji.weebly.com/arheologija-i-antropologija/vestacka-deformacija-lobanje
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Март 13, 2018, 05:31:01 поподне
Нисам успио схватити да ли су гепидски и остроготски узорак, из Србије и Крима, мушки или женски узорци? У сваком случају гепидски узорак, поред још једног из баварске серије, има највећи удио East Asian неевропске компоненте од свих досад тестираних савремених и древних Европљана. По тој логици, тај утицај не би требао бити од неког народа са ове стране Урала. Од свих азијских народа који су прокрстарили нашим подручјима мислим да Хуни имају најисточније азијско поријекло (бар њихов горњи слој). Тако се бар писало. У том случају они би били најбољи кандидати за ову East Asian компоненту у гепидском узорку из Виминацијума.

Алани су први народ који је покорен од стране Хуна након њихове "провале" кроз врата народа, врло рано су ушли у њихов племенски савез и са њима се орођавали. Због тога сам напоменуо да је ту могућ и алански утицај, јер су и они у 5-6. веку сигурно имали приличан удео источноазијске генетике због тих међусобних веза; крајње порекло тог "генетског удела" је свакако хунско.

Да, у питању су аутозомални резултати (плус mt-DNA), а гепидски скелет који је тестиран има вештачки деформисану лобању. Али колико схватих, у закључку аутори кажу да се не може доказати ексклузивно хунско/источњачко порекло овог обичаја, јер су скелети са вештачки деформисаним лобањама пронађени у ранијем периоду (2. век) у Румунији. Такође, остроготски скелет са Крима који је бар стотинак година старији од гепидског такође има вештачки деформисану лобању, а нема скоро ни трага источноазијске генетике. Код њега доминира медитеранска генетика јужне/југоисточне Европе и Блиског Истока, уз мали проценат Јужне Азије, а од модерних популација најбоље се уклапа у Турке. Ови резултати говоре да иако је нађен у остроготском контексту вероватно представља популацију грчке колоније Пантикапеја (https://en.wikipedia.org/wiki/Panticapaeum) на Криму.

Постоји претпоставка да нису Алани и остали народи тај обичај усвојили од Хуна, већ Хуни од Алана. Изгледа да је та претпоставка, услед ових старијих налаза, ближа истини и да је то првобитно био обичај индоиранских номада пре него туркијских као што су Хуни. С друге стране, није неопходно да неко ко има вештачки деформисану лобању има и удео источноазијске генетике; та пракса је прихватање обичаја, која може, али и не мора нужно водити склапању брачних веза и самим тим, упливом источноазијске генетике. Ако је Острогот из половине 5. века, онда је живео у време када је хунска држава под Атилом била на врхунцу моћи, отуд ни не чуди појава вештачки деформисане лобање; у другој половини 5. и почетком 6. века, након пропасти Атилине државе, ова пракса знатно јењава, нарочито код германских народа који су је практиковали. Мислим да су је током 6. века практиковали само Гепиди, мада и код њих показује с временом тенденцију опадања.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Март 13, 2018, 11:21:18 поподне
Занимљив чланак о појави вештачке деформације лобања током Сеобе народа:

http://www.ancient-origins.net/news-evolution-human-origins/new-study-reveal-origins-elongated-skulls-carpathian-basin-001530

"The Hun population came into contact with Alan-Turkish people who were in the habit of performing cranial deformation,” the study authors wrote. “Thus the Huns can only be considered to be the transmitters and not the developers of this tradition."

"The authors maintain that the custom spread from east to west in 6 phases, originating up to 4,000 years ago. Beginning in Central Asia, in the territory west of the Tien-Shan, the custom spread through the Caucasus and Kalymykia Steppe, through to the Danube Basin (present day Romania, Serbia, Croatia, Slovenia, Austria, Slovakia, Hungary, and Czech Republic), then split into three distinct regions – the Middle Germanic Group, in which curiously the elongated skulls were all female; South and Southwest Germanic group, known from burial sites in Bavarian and Rhenish territories; and the Rhone Group – located in the southwest of Switzerland, the east of France, and the north of Italy."
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Март 15, 2018, 10:45:05 поподне
Pleistocene North African genomes link Near Eastern and sub-Saharan African human populations (http://science.sciencemag.org/content/early/2018/03/14/science.aar8380)

Цитат
genomic data from seven 15,000-year-old modern humans from Morocco, attributed to the Iberomaurusian culture

Sample   mtDNA   Y-DNA
TAF009   U6a6b   E1b1b1a1b1
TAF010   U6a7b   E1b1b1a1
TAF011   U6a7      E1b1b1a1
TAF012   U6a7
TAF013   U6a7b   E1b1b1a1
TAF014   M1b      E1b1b1a1
TAF015   U6a1b   E1b1b

TAF009 би по ISOGG требало да буде E-L618.
Ово је локација Тафоралт, Мароко (https://www.google.com/maps/place/Tafoughalt,+Morocco/@36.3799901,-4.960695,5z/data=!4m5!3m4!1s0xd781f0fced7318f:0x9d2c6171ee5bb8d2!8m2!3d34.806871!4d-2.4122257!5m1!1e4).

Занимљиво је да из ових резултата следи да је YFull потценио старост L618 за бар 25%.
Поред тога, рекао бих да Гибралтар постаје јак кандидат за место уласка E-L618 тј претка E-V13 у Европу.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Март 15, 2018, 11:25:36 поподне
Поред тога, рекао бих да Гибралтар постаје јак кандидат за место уласка E-L618 тј претка E-V13 у Европу.

 Не бих рекао, као што сам спомињао E-V13 је вјероватно посљедица Импресо експанзије, а древна ДНК сва три тестирана Импресо деривата засад показује присуство E-L618, а нити једна друга хг није присутна код више од једног, дакле то имплицира да је најмањи заједнички садржалац односно прото елеменат Импреса E-L618. Но ови резултати и јасно упућују да се Капсијска култура развила из Иберо-мавританске, те да су E-L618 потомци Капсијаца који су из данашњег Туниса прешли у Европу. Мада вара овај назив "Иберо" јер је то углавном напуштено стајалиште о јаким преко-Гибралтарским везама ове културе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Март 16, 2018, 08:23:28 пре подне
древна ДНК сва три тестирана Импресо деривата засад показује присуство E-L618

Ко је трећи? Ја знам за оног из Хрватске и из Шпаније.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Март 19, 2018, 03:00:35 пре подне
Ко је трећи? Ја знам за оног из Хрватске и из Шпаније.

 Онај из Сопота, а наравно Сопот има генетске везе са јадранским Импресом преко Бутмира а мислим и неке директне везе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Март 19, 2018, 07:46:53 поподне
Видим да се на антрогеници води расправа око објављене археогентичке студије http://science.sciencemag.org/content/early/2018/03/14/science.aar8380. Немам времена да гледам детаљније, погледах само површно. Чини ми се да би могло бити E-L618. Да ли је неко можда детаљније гледао резултате?

Ради се о налазима из Марока који су припадали култури https://en.wikipedia.org/wiki/Iberomaurusian

Налази би могли бити интересантни у вези поријекла E-V13 хаплогрупе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Март 19, 2018, 08:20:56 поподне
Да ли је неко можда детаљније гледао резултате?

Steve Fix је урадио анализу BAM фајлова. Испоставило се да је TAF009 за ког се на основу података из студије претпостављало да је L618+ ипак негативан на L618.
Тј свих 7 резултата су M78+ при чему нису позитвни на све SNP-еве који се иначе сматрају еквивалентним M78. Однос позитивних и негативних M78 еквивалената је у просеку 85%:15%. Неколико њих је овај податак сматрало корисним за израчунавање старости M78 али по мени то нема баш много смисла јер се врло могуће ради о грани из које нису произашли L618 и V13.

Све у свему најинтересантније је што је пре овога устаљено мишљење било да ”колевку” M78 треба тражити на североистоку Африке а ови најновији налази старе ДНК су са северозапада Африке па се водила нека дискусија и у том смислу.

Што се мене тиче не видим да ови резултати дају некакав битно другачији поглед на M78 од оног какав је био раније. Да је TAF009 испао L618+ то би било доста занимљивије. Иначе верујем да има и пуно материјала за дискусију из угла аутосомалних резултата али то није моја област интересовања па не могу ни да дам некакав добар коментар везано за то.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Март 19, 2018, 08:34:22 поподне
Steve Fix је урадио анализу BAM фајлова. Испоставило се да је TAF009 за ког се на основу података из студије претпостављало да је L618+ ипак негативан на L618.
Тј свих 7 резултата су M78+ при чему нису позитвни на све SNP-еве који се иначе сматрају еквивалентним M78. Однос позитивних и негативних M78 еквивалената је у просеку 85%:15%. Неколико њих је овај податак сматрало корисним за израчунавање старости M78 али по мени то нема баш много смисла јер се врло могуће ради о грани из које нису произашли L618 и V13.

Све у свему најинтересантније је што је пре овога устаљено мишљење било да ”колевку” M78 треба тражити на североистоку Африке а ови најновији налази старе ДНК су са северозапада Африке па се водила нека дискусија и у том смислу.

Што се мене тиче не видим да ови резултати дају некакав битно другачији поглед на M78 од оног какав је био раније. Да је TAF009 испао L618+ то би било доста занимљивије. Иначе верујем да има и пуно материјала за дискусију из угла аутосомалних резултата али то није моја област интересовања па не могу ни да дам некакав добар коментар везано за то.

Да, сад сам видио да је и Генетикер свих шест узорака одредио као E-M78.

Што се аутосомалне днк тиче, видим да је расправа око Натуфијске  и западноафричке мјешавине. Нисам се удубљивао. Једино из пратећег материјала читам "Taforalt fall on an intermediate position between present-day North Africans and sub-Saharan (East) Africans."

А најближа данашња аутосомална популација Taforalt јесте кушитски Афар народ из Џибутија, Еритреје и Етиопије. Ту се отприлике поклапају Y-днк и аутосомални резултати с обзиром да је источна субсахарска Африка доминантно E-M78.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Март 21, 2018, 04:50:46 поподне
Гепидски узорак Vim_2 из Виминацијума припада хаплогрупи R1b1b-PH155.

https://anthrogenica.com/showthread.php?13793-Y-DNA-of-Roman-Soldier-FN2-buried-in-Germany&p=367827&viewfull=1#post367827 (https://anthrogenica.com/showthread.php?13793-Y-DNA-of-Roman-Soldier-FN2-buried-in-Germany&p=367827&viewfull=1#post367827)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Март 21, 2018, 09:38:21 поподне
Гепидски узорак Vim_2 из Виминацијума припада хаплогрупи R1b1b-PH155.

https://anthrogenica.com/showthread.php?13793-Y-DNA-of-Roman-Soldier-FN2-buried-in-Germany&p=367827&viewfull=1#post367827 (https://anthrogenica.com/showthread.php?13793-Y-DNA-of-Roman-Soldier-FN2-buried-in-Germany&p=367827&viewfull=1#post367827)

Потпуно неочекивана хаплогрупа, морам рећи, ова грана се налази узводно од M335, малоазијске R1b која се прва одвојила од "главног" стабла. Уз висок проценат источноазијске аутозомалне генетике, можда је овај "Гепид" ипак делимично или потпуно хунског порекла. Видим да је и Веренич сличног мишљења:

The guy's DNA is indicative of full Hunnic ancestry (assuming there was not a contamination in biological material)

Сетио сам се и Симовог коментара око одређених хрватских родова из западне (кајкавске) Славоније, који су испали управо R1b-M335, можда они представљају наследнике Гепида или Хуна?

Да ли су утврдили хаплогрупу Острогота са Крима, са "вишком" медитеранске аутозомалне генетике?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Март 21, 2018, 10:08:18 поподне
Сетио сам се и Симовог коментара око одређених хрватских родова из западне (кајкавске) Славоније, који су испали управо R1b-M335, можда они представљају наследнике Гепида или Хуна?

Да ли су утврдили хаплогрупу Острогота са Крима, са "вишком" медитеранске аутозомалне генетике?

И мени се чини да би овај "Гепид" уствари могао бити "прави" Хун, чини ми се да је ова грана прилично распрострањена у Централној и Источној Азији, додуше не у неком значајнијем проценту.

"Острогот" са Крима је по Вереничу Ј2а1-L26, а један форумаш са Молгена тврди да припада грани Y6240* (https://www.yfull.com/tree/J-Y6240*/).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Сремац Март 22, 2018, 03:24:19 поподне
Нисам сигуран да је гепидски узорак потпуно хунског порекла, провукао сам узорак кроз Global 25 Давидског, није превише близак ни једном древном ни савременом становништву. Резултат указује на мешавину средњеазијског становништва попут Скита (можда баш Хуни), Германа и евентуално неког балканског становништва:

[1] "distance%=2.0205"

         Gepid_Serbia_ACD:VIM_2

Scythian_ZevakinoChilikta,38
Nordic_IA,19
Vinca_MN,18.4
Germany_Medieval_outlier,9.6
Germany_Medieval,7.2
Karasuk_outlier,4.2
Ust_Ishim,3
Iberia_BA,0.6

Изгледа као да је један родитељ средњеазијског, а други мешаног германско-балканског порекла...
Иначе, један од ближих узорака овом гепидском је IR1 из Мађарске.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Март 22, 2018, 03:32:23 поподне
Изгледа као да је један родитељ средњеазијског, а други мешаног германско-балканског порекла...
Иначе, један од ближих узорака овом гепидском је IR1 из Мађарске.

Та поклапања са IR1 су због азијске генетике, или нечег другог?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Сремац Март 22, 2018, 03:48:48 поподне
Па сигурно да је због сличне мешавине, која укључује степску и азијску генетику, е сад је питање да ли се IR1 може довести у везу са гепидским узорком у смислу да је IR1 предачки у односу на гепидски узорак. Мени не личи на тако нешто...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Март 31, 2018, 09:36:38 поподне
Данас је изашао рад о старој ДНК са простора јужне и централне Азије. Број обрађених старих узорака = 362

The Genomic Formation of South and Central Asia

https://www.biorxiv.org/content/early/2018/03/31/292581
https://www.biorxiv.org/content/early/2018/03/31/292581.figures-only
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/suppl/2018/03/31/292581.DC1/292581-1.pdf

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Март 31, 2018, 10:07:11 поподне
Могли би наши стручњаци за стару ДНК да виде има ли шта интересантно. Видех да има доста R1a, R1b (Y-DNA). Ту су и двојица J2b (xM241) из Ирана (око 6000 пре н. е.). Од раније имамо онај узорак J2b* са Загроса.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Април 01, 2018, 10:02:03 пре подне
Могли би наши стручњаци за стару ДНК да виде има ли шта интересантно. Видех да има доста R1a, R1b (Y-DNA). Ту су и двојица J2b (xM241) из Ирана (око 6000 пре н. е.). Од раније имамо онај узорак J2b* са Загроса.

Ови узорци J2b пронађени су заједно са R1b1a1a2a2-M269 (Z2103?), 6000-5700 пре н. е (Hajji Firuz). Нема детаљнијих информација за сада.

Невезано за стару ДНК, на FTDNA се недавно појавио један J2b-M12+/M102-.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Април 06, 2018, 09:07:32 поподне
Ови узорци J2b пронађени су заједно са R1b1a1a2a2-M269 (Z2103?), 6000-5700 пре н. е (Hajji Firuz). Нема детаљнијих информација за сада.

Невезано за стару ДНК, на FTDNA се недавно појавио један J2b-M12+/M102-.

Мислим да су потврдили да је R1b из Хаџи Фируза заиста Z2103. Као и са оним радом о геномској историји Европе, и овде је старост узорка премашила прогнозе Yfull-a о настанку СНП-а (по Yfull-у горња граница настанка Z2103 је 4800. п.н.е.). Сад, питање је да ли могу да установе нешто низводније од Z2103? Било би занимљиво ако би могла и нижа подграна да се извуче.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Полић Април 19, 2018, 09:28:12 пре подне
 Ево један линк археогенетике евроазијске степе
https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB20658
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Мај 09, 2018, 10:04:47 поподне
Данас су изашла два велика рада, са преко 200 нових древних узорака:

137 ancient human genomes from across the Eurasian steppes (https://www.nature.com/articles/s41586-018-0094-2)

The first horse herders and the impact of early Bronze Age steppe expansions into Asia (http://science.sciencemag.org/content/early/2018/05/08/science.aar7711)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Мај 10, 2018, 09:23:00 поподне
Данас су изашла два велика рада, са преко 200 нових древних узорака:

The first horse herders and the impact of early Bronze Age steppe expansions into Asia (http://science.sciencemag.org/content/early/2018/05/08/science.aar7711)

Што се тиче J групе из овог рада:

Namazga_CA DA379 J-L134 J-M304 J
Namazga_CA DA381 J-L26 J-L26 J2a1
Anatolia_EBA MA2212 J-L559 J-M410 J2a
Anatolia_MLBA MA2200 J-L26 J-L26 J2a1
Anatolia_MLBA MA2205 J-L27 J-L26 J2a1


Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Мај 17, 2018, 09:17:46 пре подне
The genetic prehistory of the Greater Caucasus

https://www.biorxiv.org/content/early/2018/05/16/322347.figures-only

Има прилично R1b, а детектоване су изгледа Q1a и L. Од J су ту:

I2055 Unakozovskaya 6533.0 Eneolithic Caucasus R1a J
 I2056 Unakozovskaya 6477.5 Eneolithic Caucasus R1a J2a
 OSS001.A0101 Nogir 3 5570.0 Maykop J2a1
 I6268 Klady 5564.0 Maykop Novosvobodnaya R1a J2a1
 I6266 Klady 5200.0 Maykop Novosvobodnaya X2f J2a1
 I2051 Marchenkova Gora, D13 3260.0 Dolmen LBA H6a1a2a J
 KDC001.A0101 Kudachurt 3823.5 MBA North Caucasus X2i J2b
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Мај 17, 2018, 12:15:18 поподне
The genetic prehistory of the Greater Caucasus

https://www.biorxiv.org/content/early/2018/05/16/322347.figures-only

Има прилично R1b, а детектоване су изгледа Q1a и L. Од J су ту:

I2055 Unakozovskaya 6533.0 Eneolithic Caucasus R1a J
 I2056 Unakozovskaya 6477.5 Eneolithic Caucasus R1a J2a
 OSS001.A0101 Nogir 3 5570.0 Maykop J2a1
 I6268 Klady 5564.0 Maykop Novosvobodnaya R1a J2a1
 I6266 Klady 5200.0 Maykop Novosvobodnaya X2f J2a1
 I2051 Marchenkova Gora, D13 3260.0 Dolmen LBA H6a1a2a J
 KDC001.A0101 Kudachurt 3823.5 MBA North Caucasus X2i J2b

Занимљиво је да се хаплогрупа L јавља искључиво у оквиру касне мајкопске културе. Иначе, суседи мајкопске културе (3700-3000. п.н.е.) су Јамна на северу и Кура-Араксес на југу.

https://en.wikipedia.org/wiki/Maykop_culture
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Мај 22, 2018, 10:58:32 пре подне
Мислио сам да сајт Jean Manco неће више моћи да се нађе на мрежи, али изгледа да постоје опције као што су web.archive.org
Задњи уноси на сајту су били крајем 2017. године. Ово је списак научних радова који су третирали древну днк,а које је Jean Manco користила као извор. Мислим да је корисно имати овакав списак на једном мјесту. Списак је закључно са септембром 2017. године.

Adler, C.J. (2012), Ancient DNA Studies of Human Evolution. PhD dissertation, Australian Centre for Ancient DNA, University of Adelaide, January 2012.
Afanasiev, G.E., M. V. Dobrovolskaya et al. (2015), M. V. Dobrovolskaya, New archaeological, anthropological and genetic aspects in the study of the Alans from the Don region = Афанасьев Г.Е., Добровольская М.В., Коробов Д.С., Решетова И.К. Новые археологические, антропологические и генетические аспекты в изучении донских алан // КСИА. Выпуск 237. М. 2015. С. 64-79.
Afanasiev, G.E., S. Wen et al. (2015), Хазарские конфедераты в бассейне Дона (археологические, антропологические и генетические аспекты) = Khazar's confederates in the Don basin (archaeological, anthropological and genetic aspects), Тезисы докладов на Всероссийской научной конференции "Естественнонаучные методы исследования и парадигма современной археологии". М.: ИА РАН.
Afonso, C.A.P. (2010), Contribuiçăo do ADN antigo para o estudo das populaçőes do Neolítico final/Calcolítico portuguesas. Thesis, Universidade de Coimbra.
Allentoft, M. et al. (2015), Population genomics of Bronze Age Eurasia, Nature, 522, 167?172 (11 June 2015).
Alexeeva, T.I et al. (2000), Homo Sungirensis, Upper Palaeolithic man: ecological and evolutionary aspects of the investigation and see Ovchinnikov and Goodwin 2003 for critique.
Alt, K. W. et al (2014), Lombards on the Move ? An Integrative Study of the Migration Period Cemetery at Szolad, Hungary, PLoS ONE 9(11): e110793.
Alt, K. W. et al (2016), A Community in Life and Death: The Late Neolithic Megalithic Tomb at Alto de Reinoso (Burgos, Spain), PLoS ONE, 11(1): e0146176.
Altinisik, E (2015), Insan iskeletlerinde mitokondriyal genomanalizi ve haplogrup tayini, PhD thesis, University of Istanbul.
Alzualde, A. et al. (2005), Temporal Mitochondrial DNA Variation in the Basque Country: Influence of Post-Neolithic Events, Annals of Human Genetics, vol. 69, no. 6, pp. 665-79.
Alzualde, A. (2006), Insights into the 'Isolation' of the Basques: MtDNA Lineages from the Historical Site of Aldaieta (6th-7th Centuries AD), American Journal of Physical Anthropology, vol. 130, no. 3 (July 2006), pp. 394-404.
Alzualde, A. (2007), Influences of the European Kingdoms of Late Antiquity on the Basque Country: an ancient-DNA study, Current Anthropology, vol. 48, no. 1.
Arroyo Pardo, E., E. Fernández Domínguez and A. O. Foix (2006), La Problematica del origen de los Iberos segun la secuencia genetica de los restos humanos [pdf], Lucentum, vol. 25 (2006), pp. 13-22.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Мај 22, 2018, 10:59:20 пре подне
Bandelt (2005), Hans-Jürgen, Mosaics of ancient mitochondrial DNA: positive indicators of nonauthenticity, European Journal of Human Genetics, vol. 13, pp. 1106?1112.
Banffy, E. et al. (2012), 'Early Neolithic' graves are in fact 6000 years younger - appeal for real interdisciplinarity between archaeology and ancient DNA research, Journal of Human Genetics, 2012 Jul, vol. 57, no. 7, pp. 467-9.
Benazzi, S. et al. (2015), The makers of the Protoaurignacian and implications for Neandertal extinction, Science, published online April 23 2015.
Bennett, C.C. and F.A. Kaestle (2010), Investigation of Ancient DNA from Western Siberia and the Sargat Culture, Human Biology, vol. 82, no. 2 (April 2010), pp. 143-156.
Boaventura, R. et al. (2014), Funerary practices and anthropology during Middle-Late Neolithic (4th and 3rd Millennia BCE) in Portugal: old bones, new insights, Anthropologie, vol. 52, no. 2, 183-205.
Bogácsi-Szabó, E. (2005), Mitochondrial DNA of ancient Cumanians: culturally Asian steppe nomadic immigrants with substantially more western Eurasian mitochondrial DNA lineages, Human Biology, vol.77, no. 5 (October 2005), pp. 639-62.
Bogdanowicz, W. et al. (2009), Genetic identification of putative remains of the famous astronomer Nicolaus Copernicus, Proceedings of the National Acadamy of Sciences of the USA (Published online before print July 7, 2009).
Bollongino, R. et al. (2013), 2000 years of parallel societies in Stone Age Central Europe, Science, Online October 10 2013.
Bouakaze, C., et al. (2007), First successful assay of Y-SNP typing by SNaPshot minisequencing on ancient DNA, International Journal of Legal Medicine, vol. 121, no. 6, pp. 493-9.
Bouakaze, C., et al. (2009), Pigment phenotype and biogeographical ancestry from ancient skeletal remains: inferences from multiplexed autosomal SNP analysis, International Journal of Legal Medicine, vol. 123, no. 4 .
Bouwman, A. S. (2008), Kinship between burials from Grave Circle B at Mycenae revealed by ancient DNA typing, Journal of Archaeological Science, vol. 35, no. 9 (Sep 2008), pp. 2580-2584.
Bramanti, B. (2008), Ancient DNA: Genetic analysis of aDNA from sixteen skeletons of the Vedrovice, Anthropologie (Journal of the Moravske Zemske Muzeum), vol. 46, nos. 2-3, pp. 153-160.
Bramanti, B. et al. (2009), Genetic Discontinuity Between Local Hunter-Gatherers and Central Europe?s First Farmers, Science, vol. 326. no. 5949 (October 2009), pp. 137-140.
Brandt, G. et al. (2013), Ancient DNA Reveals Key Stages in the Formation of Central European Mitochondrial Genetic Diversity, Science, vol. 342, no. 6155 (2013), pp. 257-261.
Brotherton, P. (2013), Neolithic mitochondrial haplogroup H genomes and the genetic origins of Europeans, Nature Communications, 4, Article number: 1764.
Broushaki, F. et al. (2016), Early Neolithic genomes from the eastern Fertile Crescent, Science, first release 14 July 2016.
Burger, J. et al. (2007), Absence of the lactase-persistence-associated allele in early Neolithic Europeans, Proceedings of the National Academy of Sciences USA, vol. 104, no. 10, pp. 3736-3741.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Мај 22, 2018, 11:00:03 пре подне
Caramelli, D. et al. (2003), Evidence for a genetic discontinuity between Neandertals and 24,000-year-old anatomically modern Europeans, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 100, no. 11, pp. 6593-6597; but see Bandelt 2005.
Caramelli, D. et al. (2007), Genetic analysis of the skeletal remains attributed to Francesco Petrarca, Forensic Science International, vol. 173, no. 1, pp. 36-40.
Caramelli, D. et al. (2007), Genetic variation in prehistoric Sardinia, Human Genetics, vol.122, nos. 3-4 (Nov 2007), pp. 327-336.
Caramelli, D. et al. (2008), A 28,000 Years Old Cro-Magnon mtDNA Sequence Differs from All Potentially Contaminating Modern Sequences, PloS ONE, vol. 3, no. 3 .
Cardos, G. et al. (2004), Paleo-mtDNA analysis and population genetic aspects of old Thracian populations from South-East of Romania, Romanian Journal of Legal Medicine, vol. 12, no. 4, pp. 239-246.
Carpenter, M. L. et al. (2013), Pulling out the 1%: whole-genome capture for the targeted enrichment of ancient DNA sequencing libraries, The American Journal of Human Genetics, vol. 93, pp. 852?864.
Casas, M.J., et al. (2006), Human Mitochondrial DNA Diversity in an Archaeological Site in al-Andalus: Genetic Impact of Migrations from North Africa in Medieval Spain, American Journal of Physical Anthropology, vol. 131, pp. 539-551.
Cassidy, L. M. et al. (2015), Neolithic and Bronze Age migration to Ireland and establishment of the insular Atlantic genome, PNAS, Published online before print December 28, 2015.
Chandler, H., Sykes, B. and Zilhăo, J. (2005), Using ancient DNA to examine genetic continuity at the Mesolithic-Neolithic transition in Portugal, in P. Arias, R. Ontanon and C. Garcia-Monco (eds.), Actas del III Congreso del Neolitico en la Peninsula Iberica, pp. 781-86.
Charlier, P. et al. (2012), Genetic comparison of the head of Henri IV and the presumptive blood from Louis XVI (both Kings of France), Forensic Science International, online ahead of print 30 December 2012, but see Larmuseau 2013.
Chekunova E. M. et al. (2014), The first results of genetic typing of local population and ancient humans in Upper Dvina region, in A. Mazurkevich, M. Polkovnikova and E. Dolbunova (eds.), Archaeology of lake settlement IV-II mill. BC, pp. 290-294.
Chikisheva, T.A. et al. (2007), A paleogenetic study of the prehistoric populations of the Altai, Archaeology, Ethnology and Anthropology of Eurasia, vol. 4, no. 32, pp. 130-142.
Chilvers, E.R. (2008), Ancient DNA in human bones from Neolithic and Bronze Age sites in Greece and Crete, Journal of Archaeological Science, vol. 35 , pp. 2707?2714.  Describes the attempt to retrieve aDNA. The actual aDNA results are reported in Bouwman 2008.
Clisson, I. et al. (2002), Genetic analysis of human remains from a double inhumation in a frozen kurgan in Kazakhstan (Berel site, Early 3rd Century BC), International Journal of Legal Medicine, vol. 116, no. 5 (Oct 2002).
Coble MD, et al. (2009), Mystery Solved: The Identification of the Two Missing Romanov Children Using DNA Analysis, PLoS ONE, vol. 4, no. 3: e4838.
Csányi, B. et al. (2008), Y-Chromosome Analysis of Ancient Hungarian and Two Modern Hungarian-Speaking Populations from the Carpathian Basin, Annals of Human Genetics, vol. 72, no. 4, pp. 519 - 534.
Csősz, A. et al (2016), Maternal genetic ancestry and legacy of 10th century AD Hungarians, bioRxiv preprint first posted online 2 June 2016.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Мај 22, 2018, 11:00:34 пре подне
Daskalaki, E., (2014), Archaeological Genetics - Approaching Human History through DNA Analysis, Dissertation at Uppsala University 21 March 2014.
Deguilloux, M-F. et al. (2010), News from the west: Ancient DNA from a French megalithic burial chamber, American Journal of Physical Anthropology (online ahead of print August 2010).
Delsate, D. et al. (2009), De l'ocre sur le crâne mésolithique (haplogroupe U5a) de Reuland-Loschbour (Grand-Duché de Luxembourg), Bulletin de la Société Préhistorique Luxembourgeoise, vol. 31, pp. 7-30.
Der Sarkissian, C. (2011), Mitochondrial DNA in ancient human populations of Europe. Thesis (Ph.D.), University of Adelaide, School of Earth and Environmental Sciences.
Der Sarkissian, C. et al. (2013), Ancient DNA reveals prehistoric gene-flow from Siberia in the complex human population history of north east Europe, PloS Genetics, vol. 9. no. 2, e1003296.
Der Sarkissian, C. et al. (2014), Mitochondrial Genome Sequencing in Mesolithic North East Europe Unearths a New Sub-Clade within the Broadly Distributed Human Haplogroup C1, PLoS ONE, vol. 9, no. 2: e87612.
Devault, A. M. et al. (2017), A molecular portrait of maternal sepsis from Byzantine Troy, eLife 2017;6:e20983
Di Benedetto et al. (2000), Mitochondrial DNA sequences in prehistoric human remains from the Alps, European Journal of Human Genetics, vol. 8, pp. 669?677.
Di Bernardo, G. et al. (2009), Ancient DNA and Family Relationships in a Pompeian House, Annals of Human Genetics, vol. 73, no. 4 , pp. 429-437.
Dissing, J. (2007), The last Viking King: a royal maternity case solved by ancient DNA analysis, Forensic Science International vol. 166, no. 1 (Feb 2007), pp. 21-7.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Мај 22, 2018, 11:00:59 пре подне
Eaton, K. et al (2015), Museum of London Report on the DNA Analyses of Four Roman Individuals.
Endicott, P. et al. (2009), Genotyping human ancient mtDNA control and coding region polymorphisms with a multiplexed Single-Base-Extension assay: the singular maternal history of the Tyrolean Iceman, BMC Genetics.
Ermini, L. et al. (2008), Complete Mitochondrial Genome Sequence of the Tyrolean Iceman, Current Biology, (3 Oct 2008).
Fernández Domínguez, E. (2005), Polimorfismos de DNA mitocondrial en poblaciones antiguas de la cuenca mediterránea. (Doctoral thesis).
Fernández, E. et al. (2006), MtDNA analysis of ancient samples from Castellón (Spain): Diachronic variation and genetic relationships, International Congress Series, vol. 1288 (April 2006), pp. 127-129.
Fernández, E. et al. (2008), Mitochondrial DNA genetic relationships at the ancient Neolithic site of Tell Halula, Forensic Science International: Genetics Supplement Series, vol.1, no. 1, pp. 271?273.
Fernández, E. et al. (2014), Ancient DNA analysis of 8000 B.C. Near Eastern farmers supports an Early Neolithic pioneer maritime colonization of mainland Europe through Cyprus and the Aegean Islands, PLoS Genetics 10(6): e1004401.
Fernández, E. and Arroyo-Pardo, E. (2014), Palaeogenetic study of the human remains, In António Faustino Carvalho (ed.) Bom Santo Cave (Lisbon) and the Middle Neolithic Societies of Southern Portugal, pp. 133-142.
Francalacci, P. (1995), DNA analysis of ancient desiccated corpses from Xinjiang, Journal of Indoeuropean Studies, vol. 23, pp. 385?389.
Freder, J. (2010), Die mittelalterlichen Skelette von Usedom: The mediaeval skeletons of Usedom (Dissertation Free University Berlin 2010).
Fregel, R. et al. (2009), Demographic history of Canary Islands male gene-pool: replacement of native lineages by European, BMC Evolutionary Biology, vol. 9, article no.181 (3 Aug 2009).
Fu, Q. et al. (2013), A revised timescale for human evolution based on ancient mitochondrial genomes, Current Biology, 21 March 2013.
Fu, Q. et al. (2014), Genome sequence of a 45,000-year-old modern human from western Siberia, Nature 514, 445-449.
Fu, Q. et al. (2015), An early modern human from Romania with a recent Neanderthal ancestor, Nature, published online 22 June 2015.
Fu. Q. et al. (2016), The genetic history of Ice Age Europe, Nature, published online 2 May 2016.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Мај 22, 2018, 11:01:29 пре подне
Gallego-Llorente, M. et al. (2016), The genetics of an early Neolithic pastoralist from the Zagros, Iran, bioRxiv pre-print 18 June 2016.
Gamba, C., Fernández, E. et al. (2008), Population genetics and DNA preservation in ancient human remains from Eastern Spain, Forensic Science International: Genetics Supplement Series, vol. 1, no. 1, (August 2008), pp. 462-464.
Gamba, C. et al. (2012), Ancient DNA from an Early Neolithic Iberian population supports a pioneer colonization by first farmers, Molecular Ecology, vol. 21, no. 1 (January 2012), pp. 45-56.
Gamba, C. et al. (2014), Genome flux and stasis in a five millennium transect of European prehistory, Nature Communications, vol. 5, Article number: 5257.
Gao, S. et al. (2008), Mitochondrial DNA analysis of human remains from the Yuansha site in Xinjiang, Science in China Series C: Life Sciences, vol. 51, no. 3, pp. 205-213.
Ghirotto, et al. (2010), Inferring Genealogical Processes from Patterns of Bronze-Age and Modern DNA Variation in Sardinia, Molecular Biology and Evolution, vol. 27 no. 4 (1 April 2010), pp. 875-886.
Gleize, Y. et al. (2016), Early Medieval Muslim Graves in France: First Archaeological, Anthropological and Palaeogenomic Evidence, PLoS ONE 11(2): e0148583.
Gómez-Sánchez, D. et al. (2014), Mitochondrial DNA from El Mirador Cave (Atapuerca, Spain) Reveals the Heterogeneity of Chalcolithic Populations, PLoS ONE 9(8): e105105.
Gonçalves, D. et al (2014), All different, all equal: Evidence of aheterogeneous Neolithic population at the BomSanto Cave necropolis (Portugal), HOMO - Journal of Comparative Human Biology, online 14 March 2016 ahead of print.
Gonzalez Fortes, G. et al. (2017), Genetic Analysis of the Individual of Chan do Lindeiro: Characterization of her Mitogenome and Situation of the Sample in the European Paleogenic Context, Cadernos do Laboratorio Xeolóxico de Laxe, no. 39, pp. 111 - 128.
González-Fortes et al. (2017b), Paleogenomic Evidence for Multi-generational Mixing between Neolithic Farmers and Mesolithic Hunter-Gatherers in the Lower Danube Basin, Current Biology, Published Online: May 25, 2017.
Gonzalez-Ruiz, M. et al. (2012), Tracing the origin of the east-west population admixture in the Altai Region (Central Asia), PLoS ONE, vol. 7, no. 11 (November 2012), e48904.
Gounder Palnichamy, M. et al. (2010), Mitochondrial haplogroup N1a phylogeography, with implication to the origin of European farmers, BMC Evolutionary Biology, vol. 10, no. 304.
Guba, S. et al. (2011), HVS-I polymorphism screening of ancient human mitochondrial DNA provides evidence for N9a discontinuity and East Asian haplogroups in the Neolithic Hungary, Journal of Human Genetics, (online 15 September 2011), but see Banffy 2012 and response Zeke and Guba 2012.
Günther, T. et al. (2015), Ancient genomes link early farmers from Atapuerca in Spain to modern-day Basques, PNAS, published online September 8, 2015 before print.
Günther, T. et al. (2017), Genomics of Mesolithic Scandinavia reveal colonization routes and high-latitude adaptation, bioRxiv preprint first posted online Jul. 17, 2017.
Gworys, B. et al. (2013), Assessment of late Neolithic pastoralist's life conditions from the Wroclaw-Jagodno site (SW Poland) on the basis of physiological stress markers, Journal of Archaeological Science, online 13 February 2013 ahead of print.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Мај 22, 2018, 11:02:04 пре подне
Haak, W. et al. (2005), Ancient DNA from the First European Farmers in 7500-Year-Old Neolithic Sites, Science, vol. 310, no. 5750, pp. 1016-1018.
Haak, W. et al. (2008), Ancient DNA, Strontium isotopes, and osteological analyses shed light on social and kinship organization of the Later Stone Age, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 105, no. 47 (2008), pp. 18226-18231.
Haak, W. et al. (2010), Ancient DNA from European Early Neolithic Farmers Reveals Their Near Eastern Affinities, PloS Biology, vol. 8, no.11 (November 2010): e1000536.
Haak, W. et al. (2015), Massive migration from the steppe is a source for Indo-European languages in Europe, bioRxiv preprint.
Haas, C. et al. (2013), Y-chromosomal analysis identifies the skeletal remains of Swiss national hero Jorg Jenatsch (1596-1639), Forensic Science International Genetics (2013).
Haber, M. et al. (2017), Continuity and admixture in the last five millennia of Levantine history from ancient Canaanite and present-day Lebanese genome sequences, AJHG Online: July 27, 2017
Hanna, J. et al. (2012), Ancient DNA typing shows that a bronze age mummy is a composite of different skeletons, Journal of Archaeological Science, Available online 21 April 2012.
Hawass, Z. et al. (2012), Revisiting the harem conspiracy and death of Ramesses III: anthropological, forensic, radiological, and genetic study, BMJ 345, e8268.
Hedenstierna-Jonson, C. et al (2017), A female Viking warrior confirmed by genomics, Am J Phys Anthropol.2017;1–8.
Helgason, A. (2009), Sequences From First Settlers Reveal Rapid Evolution in Icelandic mtDNA Pool, PLoS Genetics, vol. 5, no. 1 (January 2009).
Hervella, M. et al. (2009), Enterramientos en fosa en el Neolítico Antiguo en Navarra: evaluación de las evidencias arqueológicas mediante el estudio antropológico y molecular, Revista Espańola de Antropología Física, vol. 30, pp. 31-38.
Hervella, M. et al (2012), Ancient DNA from hunter-gatherer and farmer groups from Northern Spain supports a random dispersion model for the Neolithic expansion into Europe, PLoS ONE, vol. 7, no. 4: e34417.
Hervella, M. et al (2014), Early Neolithic funerary diversity and mitochondrial variability of two Iberian sites, Archaeological and Anthropological Sciences, online 29 November 2014 ahead of print.
Hervella, M. et al (2015), Ancient DNA from South-East Europe Reveals Different Events during Early and Middle Neolithic Influencing the European Genetic Heritage, PloS ONE, 10(6): e0128810. Haplogroups not entered into the table of DNA from the European Neolithic, as they are insufficiently resolved to add anything to the data from previous papers.
Hervella, M. et al (2016), The mitogenome of a 35,000-year-old Homo sapiens from Europe supports a Palaeolithic back migration to Africa, Scientific Reports, 6:25501.
Hofmanová, Z. et al. (2015), Early farmers from across Europe directly descended from Neolithic Aegeans, bioRxiv preprint first posted online November 25, 2015; pubished in PNAS early edition, 6 June 2016.
Holck, P. (2006), The Oseberg Ship Burial, Norway: New Thoughts On the Skeletons From the Grave Mound, European Journal of Archaeology, vol. 9, no. 2-3, pp. 185-210.
Hollard, C. et al. (2014), Strong genetic admixture in the Altai at the Middle Bronze Age revealed by uniparental and ancestry informative markers, Forensic Science International: Genetics, Available online 2 June.
Hughey, J. et al. (2013), A European population in Minoan Bronze Age Crete, Nature Communications, vol. 4, Article number 1861.
Hummel, S. et al. (2005), Detection of the CCR5-D32 HIV resistance gene in Bronze Age skeletons, Genes and Immunity, vol. 6, no. 4, pp. 371-374.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Мај 22, 2018, 11:02:29 пре подне
Izagirre, N. and de la Rúa, C. (1999), Absence of mtDNA haplogroup V in ancient Basques, American Journal of Human Genetics, vol. 65, pp. 199-207.
Izagirre, N. and de la Rúa, C. (2002), Ancient mtDNA haplogroups: a new insight into the genetic history of European populations, International Journal of Anthropology, vol. 17, no. 1 (Jan 2002), pp. 27-40.
Jones, E. R. et al. (2015), Upper Palaeolithic genomes reveal deep roots of modern Eurasians, Nature Communications, 6, article 8912.
Jones, E. R. et al. (2017), The Neolithic Transition in the Baltic Was Not Driven by Admixture with Early European Farmers, Current Biology 27, 1-7.
Juras, A. (2012), Ethnogenesis of the Slavs in the light of ancient DNA analyses, thesis.
Juras, A. et al. (2017), Investigating kinship of Neolithic post-LBK human remains from Krusza Zamkowa, Poland using ancient DNA, Forensic Science International: Genetics, vol. 26 (January 2017), pp. 30–39.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Мај 22, 2018, 11:03:08 пре подне
Kefi, R. et al. (2005), Diversité mitochondriale de la population de Taforalt (12.000 ans BP - Maroc): une approche génétique a l'étude du peuplement de l'afrique du nord [pdf], Anthropologie, vol. 43/1, pp. 1-11.
Kefi, R. et al. (2016), On the origin of Iberomaurusians: new data based on ancient mitochondrial DNA and phylogenetic analysis of Afalou and Taforalt populations, Mitochondrial DNA Part A. Published online: 30 Dec 2016
Keller, A. et al (2012), New insights into the Tyrolean Iceman's origin and phenotype as inferred by whole-genome sequencing, Nature Communications, vol. 3, Article number 698 (Published 28 February 2012).
Keller, M. et al. (2015), United in Death—Related by Blood? Genetic and Archeometric Analyses of Skeletal Remains from the Neolithic Earthwork Bruchsal-Aue, American Journal of Physical Anthropology, 157:458–471.
Keyser-Tracqui, C. et al. (2003), Nuclear and mitochondrial DNA analysis of a 2,000-year-old necropolis in the Egyin Gol Valley of Mongolia, American Journal of Human Genetics, vol. 73, (August 2003), pp. 247-260.
Keyser-Tracqui, C. et al. (2006), Population origins in Mongolia: genetic structure analysis of ancient and modern DNA, American Journal of Physical Anthropology, vol. 131, no. 2 (October 2006), pp. 272-81.
Keyser, C. et al. (2008), Tracing back ancient south Siberian population history using mitochondrial and Y-chromosome SNPs, Forensic Science International Genetic Supplement Series, vol. 1, pp. 343?345.
Keyser C. et al. (2009), Ancient DNA provides new insights into the history of south Siberian Kurgan people, Human Genetics, vol. 126, no. 3 (September 2009), pp. 395-410.
Khairat Ibrahim Abd Elhay, R. (2013), Next generation sequencing of DNA extracted from mummified tissue, PhD dissertation, University of Tübingen.
Kiesslich, J. et al. (2005), DNA Analysis on Biological Remains from Archaeological Findings - Sex Identification and Kinship Analysis on Skeletons from Mitterkirchen, Upper Austria. In: Interpretierte Eisenzeiten. Fallstudien, Methoden, Theorie. Tagungsbeiträge der 1. Linzer Gespräche zur interpretativen Eisenzeitarchäologie, eds. Raimund Karl - Jutta Leskovar (Studien zur Kulturgeschichte von Oberösterreich 18).
Kılınç, G. M. et al (2016), The Demographic Development of the First Farmers in Anatolia, Current Biology 26, 1–8.
Kim, K. et al. (2010), A Western Eurasian Male Is Found in 2000-Year-Old Elite Xiongnu Cemetery in Northeast Mongolia, American Journal of Physical Anthropology, vol. 142, no. 3 (July 2010), pp. 429-440.
King, T. et al. (2014), Identification of the remains of King Richard III, Nature Communications, 5, Article number: 5631.
Knipper, C. et al. (2014), Social differentiation and land use at an Early Iron Age princely seat: bioarchaeological investigations at the Glauberg (Germany), Journal of Archaeological Science, vol. 41 (2014), pp. 818-835.
Kozlowski, T. et al. (2014), Osteological, chemical and genetic analyses of the human skeleton from a Neolithic site representing the Globular Amphora Culture (Kowal, Kuyavia region, Poland), Anthropologie, vol. 52, no. 1, pp. 91-111.
Krause, J. et al. (2010), A Complete mtDNA Genome of an Early Modern Human from Kostenki, Russia, Current Biology (online 31 December 2009).
Kruttli, A. et al. (2014), European Lactase Persistence Allele (T-13910) in Medieval Central Europe, PLoS ONE, 9(1): e86251.
Krzewiska, M. et al. (2015), Mitochondrial DNA variation in the Viking Age population of Norway, Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biology, 370.
Kubálek, P. et al. (2008), (A near eastern haplotype in the burial of a young man with a fissure in the skull from the early medieval cemetery at Tetín), Archeologie Ve Stedních echách, vol. 12 (2008), pp. 645-650.
Kulikov, E.E. (2004), Molecular Genetic Characteristics of Medieval Populations of the Russian North, Russian Journal of Genetics, vol. 40, no. (January, 2004), pp. 1-9.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Мај 22, 2018, 11:03:42 пре подне
Lacan, M. et al. (2011), Ancient DNA reveals male diffusion through the Neolithic Mediterranean route, Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA, online before print May 31, 2011.
Lacan, M. et al. (2011), Ancient DNA suggests the leading role played by men in the Neolithic dissemination, Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA, online before print October 31, 2011.
Lacan, M. (2011), La Néolithisation du bassin méditerranéen : Apports de l'ADN ancien, thesis Université Toulouse III Paul Sabatier, presented 12 December 2011.
Lalueza-Fox, C. et al. (2004), Unravelling migrations in the steppe: mitochondrial DNA sequences from ancient central Asians, Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, vol. 271, no. 1542, pp.941-947.
Lalueza-Fox, C. et al. (2010), Genetic analysis of the presumptive blood from Louis XVI, king of France, FSI Genetics (online 12 October 2010 ahead of print), but see Larmuseau 2013 and Olalde 2014.
Larmuseau, M. H. D. et al (2013), Genetic genealogy reveals true Y haplogroup of House of Bourbon contradicting recent identification of the presumed remains of two French Kings, European Journal of Human Genetics, advance online publication 9 October 2013.
Lazaridis, I. et al. (2013), Ancient human genomes suggest three ancestral populations for Europeans, pre-print online 23 December 2013.
Lazaridis, I. et al. (2016), Genomic insights into the origin of farming in the ancient Near East, Nature, online 25 July 2016.
Lazaridis, I. et al. (2017), Genetic origins of the Minoans and Mycenaeans, Nature, Published online 2 August 2017.
Lee, E. et al. (2012), Emerging genetic patterns of the European neolithic: Perspectives from a late neolithic bell beaker burial site in Germany, American Journal of Physical Anthropology, vol. 148, no. 4, pp. 571-579.
Lee, E. et al. (2012), Collective burials among agro-pastoral societies in later Neolithic Germany: Perspectives from ancient DNA, Journal of Archaeological Science, Available online 6 September 2012.
Lee, E. et al. (2014), Ancient DNA insights from the Middle Neolithic in Germany, Archaeological and Anthropological Sciences, vol. 6, no. 2, pp. 199-204.
Li, C. et al. (2010), Evidence that a West-East admixed population lived in the Tarim Basin as early as the early Bronze Age, BMC Biology, vol. 8, no. 15.
Li, C. et al. (2015), Analysis of ancient human mitochondrial DNA from the Xiaohe cemetery: insights into prehistoric population movements in the Tarim Basin, China, BMC Genetics (2015) 16:78
Liden, K. et al. (2006), Pushing it back. Dating the CCR5?32 bp deletion to the Mesolithic in Sweden and its implications for the Meso\Neo transition, Documenta Praehistorica, vol. 33, pp. 29-37.
Lillie, M. C. et al. (2012), Prehistoric populations of Ukraine: Migration at the later Mesolithic to Neolithic transition, in E. Kaiser, J. Burger and W. Schier (eds.), Population Dynamics in Prehistory and Early History (2012), pp. 77-92.
Lipson, M. et al. (2017), Parallel ancient genomic transects reveal complex population history of early European farmers, bioRxiv, 6 March 2017.
Lorkiewicz, W. et al. (2015), Between the Baltic and Danubian Worlds: The Genetic Affinities of a Middle Neolithic Population from Central Poland, PLoS ONE 10(2): e0118316.
Lucotte, G et al. (2011), Haplogroup of the Y Chromosome of Napoléon the First, Journal of Molecular Biology Research, vol. 1, no. 1 (December 2011), pp. 12-19.
Lucotte, G et al. (2013), Reconstruction of the lineage Y chromosome haplotype of Napoléon the First, International Journal of Sciences, vol. 2, no. 9 (September 2013), pp. 127-139.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Мај 22, 2018, 11:04:11 пре подне
Maca-Meyer, N. et al. (2004), Ancient mtDNA analysis and the origin of the Guanches, European Journal of Human Genetics, vol. 12, pp. 155-162.
Malmstrom, H. (2007), Ancient DNA as a Means to Investigate the European Neolithic. Thesis Uppsala University.
Malmstrom, H. et al. (2009), Ancient DNA Reveals Lack of Continuity between Neolithic Hunter-Gatherers and Contemporary Scandinavians, Current Biology, vol. 19 (Nov 2009), pp. 1?5.
Malmström, H. et al. (2010), High frequency of lactose intolerance in a prehistoric hunter-gatherer population in northern Europe, BMC Evolutionary Biology, vol. 10, no. 89.
Malmström, H. et al. (2011), Finding the founder of Stockholm: a kinship study based on Y-chromosomal, autosomal and mitochondrial DNA, Annals of Anatomy - Anatomischer Anzeiger, online 5 April 2011 ahead of print.
Malmström, H. et al. (2015), Ancient mitochondrial DNA from the northern fringe of the Neolithic farming expansion in Europe sheds light on the dispersion process, Phil. Trans. R. Soc. B, vol. 370, no. 1660, 20130373.
Mannino, M.A. et al. (2012), Origin and diet of the prehistoric hunter-gatherers on the Mediterranean island of Favignana (Čgadi Islands, Sicily), PLoS ONE, vol. 7, no. 11 (November 2012), e49802.
Martiniano, R. et al (2016), Genomic signals of migration and continuity in Britain before the Anglo-Saxons, Nature Communications, 7: 10326.
Martiniano, R. et al (2017), The population genomics of archaeological transition in west Iberia: Investigation of ancient substructure using imputation and haplotype-based methods, PLoS Genetics, 13(7): e1006852.
Matheson, C.D. et al. (2009), Molecular Exploration of the First-Century Tomb of the Shroud in Akeldama, Jerusalem, PLoS One, vol. 4, no 12: e8319.
Mathieson, I. et al. (2015), Eight thousand years of natural selection in Europe, bioRxiv preprint March 14, 2015; update 10 October 2015.
Mathieson, I. et al. (2017), The Genomic History of Southeastern Europe, bioRxiv preprint May 9, 2017, updated May 20, 2017.
Matisoo-Smith, E. A. et al. (2016), A European Mitochondrial Haplotype Identified in Ancient Phoenician Remains from Carthage, North Africa. PLoS ONE 11(5): e0155046.
Matney, T. et al. (2010), Understanding Early Bronze Age social structure through mortuary remains: A pilot aDNA study from Titris Höyük, southeastern Turkey, International Journal of Osteoarchaeology, (online before print 27 October 2010).
Melchior, L. et al. (2008), Rare mtDNA haplogroups and genetic differences in rich and poor Danish Iron-Age villages, American Journal of Physical Anthropology, vol. 135, pp. 206-215.
Melchior, L. et al. (2008), Evidence of Authentic DNA from Danish Viking Age Skeletons Untouched by Humans for 1,000 Years, PLoS ONE, vol. 3, no. 5.
Melchior L, et al. (2010), Genetic Diversity among Ancient Nordic Populations, PLoS ONE, vol. 5, no. 7, e11898.
Meyer, C. et al. (2008), Die Menchlichen Skelettfunde aus der neolithischen Totenhütte von Benzingerode: Anthropologische Untersuchungen an den Bestatturgen eines Kollektivgrabes der Bernburger Kultur, Archäologie in Sachsen-Anhalt, Sonderband 7 (2008), pp. 107-143.
Mittnik, A. et al. (2017), The Genetic History of Northern Europe, bioRxiv preprint first posted online Mar. 3, 2017.
Modi, A. et al. (2017), Complete mitochondrial sequences from Mesolithic Sardinia, Scientific Reports, 7:4286.
Molodin, V. I. et al. (2012), Human migrations in the southern region of the West Siberian Plain during the Bronze Age: Archaeological, palaeogenetic and anthropological data, in E. Kaiser, J. Burger and W. Schier (eds.), Population Dynamics in Prehistory and Early History (2012), pp. 93-111.
Mooder K. et al. (2006), Population Affinities of Neolithic Siberians: A Snapshot From Prehistoric Lake Baikal, American Journal of Physical Anthropology, vol. 129, no. 3 (March 2006), pp. 323-481.
Moussa, N. et al. (2016), Y-chromosomal DNA analyzed for four prehistoric cemeteries from Cis-Baikal, Siberia, Journal of Archaeological Science: Reports, Available online 15 November 2016.
Mustafin, Kh.Kh. et al. (2017), The first results of Y-DNA haplogroup testing for a Medieval Russian burial of the 16th – 17th centuries in Radonezh (Moscow area), Rusin, 1(47), 107-110.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Мај 22, 2018, 11:04:46 пре подне
Nagy, D. et al. (2011), Comparison of Lactase Persistence Polymorphism in Ancient and Present-Day Hungarian Populations, American Journal of Physical Anthropology (online 1 March 2011 ahead of print).
Naumann, E. et al. (2013), Slaves as burial gifts in Viking Age Norway? Evidence from stable isotope and ancient DNA analyses, Journal of Archaeological Science, Available online 13 September 2013.
Nedoluzhko, A. V. et al. (2014), Analysis of the Mitochondrial Genome of a Novosvobodnaya Culture Representative using Next-Generation Sequencing and Its Relation to the Funnel Beaker Culture, Acta Naturae, vol. 6, no. 2, pp. 31-35.
Nedoluzhko, A. V. et al. (2015), Исследование археологических культур северного кавказа современными методами генетики = Untersuchungen archäologischer kulturen des Nordkaukasus mit aktuellen methoden der genetik, Кавказ как связующее звено между Восточной Европой и Передним Востоком: диалог культур, культура диалога (к 140-летию Александра А. Миллера), pp. 162-166.
Neparáczki, E. et al (2016), Genetic structure of the early Hungarian conquerors inferred from mtDNA haplotypes and chromosome haplogroups in a small cemetery, Molecular Genetics and Genomics.
Neparáczki, E. et al (2016), Revising mtDNA haplotypes of the ancient Hungarian conquerors with next generation sequencing, bioRxiv, preprint first posted online Dec. 7, 2016.
Nesheva, D. V. et al. (2015), Mitochondrial DNA Suggests a Western Eurasian origin for Ancient (Proto-) Bulgarians, Human Biology Open Access Pre-Prints 69.
Newton, J. (2011), Ancient Mitochondrial DNA From Pre-historic Southeastern Europe: The Presence of East Eurasian Haplogroups Provides Evidence of Interactions with South Siberians Across the Central Asian Steppe Belt. Masters Theses, Grand Valley State University, Paper 5.
Nikitin, A. et al. (2010), Comprehensive site chronology and Ancient Mitochondrial DNA analysis from Verteba Cave - a Trypillian Culture site of Eneolithic Ukraine, Interdisciplinaria archaeologica: Natural Sciences in Archaeology, vol. 1, nos.1-2, pp. 9-18.
Nikitin, A. et al. (2011), Bioarchaeological Analysis of Bronze Age Human Remains from the Podillya Region of Ukraine, Interdisciplinaria archaeologica: Natural Sciences in Archaeology, vol. 2, no.1 (2011), pp. 9-14.
Nikitin, A. (2012), Mitochondrial haplogroup C in ancient mitochondrial DNA from Ukraine extends the presence of East Eurasian genetic lineages in Neolithic Central and Eastern Europe, Journal of Human Genetics, online 7 June 2012 ahead of print.
Nikitin, A. G. et al. (2017). Subdivisions of haplogroups U and C encompass mitochondrial DNA lineages of Eneolithic–Early Bronze Age Kurgan populations of western North Pontic steppe, Journal of Human Genetics (2 February 2017).
Nikitin, A. G. et al. (2017), Mitochondrial DNA analysis of eneolithic trypillians from Ukraine reveals neolithic farming genetic roots, PLoS ONE, 12(2): e0172952.
Ning, C. et al. (2016), Ancient mitochondrial genome reveals trace of prehistoric migration in the east Pamir by pastoralists, Journal of Human Genetics, Journal of Human Genetics (2016) 61, 103–108.
Núnez, C., et al. (2011), Genetic analysis of 7 medieval skeletons from the Aragonese Pyrenees, Croatian Medical Journal, vol. 52, no. 3 (15 Jun 15 2011), pp. 336-43.
Núnez, C., et al. (2016), Mitochondrial DNA Reveals the Trace of the Ancient Settlers of a Violently Devastated Late Bronze and Iron Ages Village, PLoS ONE 11(5): e0155342. Data not added to the tables on this website, as it is not given in a compatible format (i.e. the samples are not individually dated and labelled in the paper.)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Мај 22, 2018, 11:05:36 пре подне
O'Connor, S. et al. (2011), Exceptional preservation of a prehistoric human brain from Heslington, Yorkshire, UK, Journal of Archaeological Science, vol. 38, no. 7, (July 2011), pp. 1641-1654.
Olalde, I. et al. (2014), Derived immune and ancestral pigmentation alleles in a 7,000-year-old Mesolithic European, Nature, Published online 26 January 2014.
Olalde, I. et al. (2014), Genomic analysis of the blood attributed to Louis XVI (1754?1793), king of France, Scientific Reports 4, Article number: 4666.
Olalde, I. et al. (2015), A common genetic origin for early farmers from Mediterranean Cardial and Central European LBK cultures,  Molecular Biology and Evolution, online 2 September 2015.
Olalde, I. et al. (2017), The Beaker phenomenon and the genomic transformation of Northwest Europe, bioRvix preprint 9 May 2017.
Olaria, C. (2011), L'inhumation collective Mesolithic-Neolithic de Cingle del Mas Nou (Ares del Maestre, Castellon) / The Mesolithic-Neolithic collective burial of Cingle del Mas Nou (Ares del Maestre, Castellon), in Transitions in the Mediterranean; how hunters became farmers, International Colloquium 14 and 15 April 2011 at the Museum of Toulouse. Abstract only.
Oliver Foix, A.; Arroyo Pardo, E.; Fernández Domínguez, E. (2008), Secuencias genéticas matrilineales de los restos óseos humanos de la Costa Lloguera (Castellón), Verdolay: Revista del Museo de Murcia, vol. 11, pp. 37-48.
Omrak, A. et al. (2015), Genomic Evidence Establishes Anatolia as the Source of the European Neolithic Gene Pool, Current Biology 26, 1–6.
Ottoni, C. et al (2016), Comparing maternal genetic variation across two millennia reveals the demographic history of an ancient human population in southwest Turkey, Royal Society open science, 3: 150250.
Ovchinnikov, I. V. and Goodwin, W. (2003), Ancient human DNA from Sungir?, Journal of Human Evolution, vol. 44 (2003), pp. 389-392.
Özbal, R., (2010), The emergrence of Ubaid styles at Tell Kurdu: a local perspective, in R.A. Carter and G. Philip (eds.), Beyond the Ubaid, Studies in Ancient Oriental Civilization no. 63 (Oriental Institute of the University of Chicago 2010), pp. 293-310, citing N. Mekel-Bobrov and B. Lahn, Ancient DNA Analysis of Human Remains from Tell Kur-du, in R. Özbal et al, Tell Kurdu Excavations 2001, Anatolica, vol. 30 (2004), pp. 72-73.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Мај 22, 2018, 11:06:03 пре подне
Petkovski, E. et al. (2006), MALDI-TOF MS analysis of Y-SNPs in ancient samples, International Congress Series, vol. 1288, (April 2006), pp. 25-27.
Pilipenko, A. S. et al. (2010), Mitochondrial DNA studies of the Pazyryk people (4th to 3rd centuries BC) from northwestern Mongolia, Archaeological and Anthropological Sciences, vol. 2, no. 4 (December 2010), pp. 231-236.
Pilipenko, A. S. et al. (2011), Mitochondrial DNA of a Late Neolithic woman from Kaminnaya Cave (Gorny Altai), Vavilov Journal of Genetics and Breeding, vol. 15, no. 4, pp. 633-43.
Pilipenko, A. S. et al. (2015), MtDNA Haplogroup A10 Lineages in Bronze Age Samples Suggest That Ancient Autochthonous Human Groups Contributed to the Specificity of the Indigenous West Siberian Population, PloS ONE, 10(5): e0127182.
Pilipenko, A. S. et al. (2015), A paleogenetic study of Pazyryk people buried at Ak-Alakha-1, The Altai Mountains (in Russian.)
Pilipenko, A. S. et al. (2016), A Genetic Analysis of Human Remains from the Bronze Age (2nd Millennium BC) Cemetery Bertek-56 in the Altai Mountains, Archaeology, Ethnology & Anthropology of Eurasia, vol. 44, no. 4, pp. 141-149.
Pitulko, V. V. et al (2015), Ancient anthropological finds of the high latitude Arctic (Zhohov site, New Siberian Islands), Ural Historical Journal, no. 24 (47), 2015, pp. 61-72.
Plantinga, T. S. et al (2012), Low prevalence of lactase persistence in Neolithic South-West Europe, European Journal of Human Genetics, advance online publication 11 January 2012.
Płoszaj, T. et al (2016), Analysis of medieval mtDNA from Napole cemetery provides new insights into the early history of Polish state, Annals of Human Biology, posted online: 08 Feb 2016.
Posth, C. et al. (2016), Pleistocene mitochondrial genomes suggest a single major dispersal of non-Africans and a Late Glacial population turnover in Europe, Current Biology, published online February 4, 2016.
Posnik, G. D. et al. (2016), Punctuated bursts in human male demography inferred from 1,244 worldwide Y-chromosome sequences, Nature Genetics, 48, 593–599.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Мај 22, 2018, 11:07:38 пре подне
Raghavan, M. et al. (2013), Upper Palaeolithic Siberian genome reveals dual ancestry of Native Americans, Nature, published online 20 November 2013.
Rai, N. (2013), Relic excavated in western India is probably of Georgian Queen Ketevan, Mitochondrion, online 16 December 2013.
Ricaut, F.X, et al. (2004), Genetic analysis of a Scytho-Siberian skeleton and its implications for ancient Central Asian migrations, Human Biology, vol. 76, no. 1 (Feb 2004), pp.109-25.
Ricaut, F.X, et al. (2004), Genetic analysis of human remains found in two eighteenth century Yakut graves at At-Dabaan, International Journal of Legal Medicine, vol. 118, no. 1 (Feb 2004), pp. 24-31.
Ricaut, F.X, et al. (2004), Genetic analysis and ethnic affinities from two Scytho-Siberian skeletons, American Journal of Physical Anthropology, vol. 123, no. 4 (Apr 2004), pp. 351-60.
Ricaut, F.X, et al. (2010), Comparison between morphological and genetic data to estimate biological relationship: The case of the Egyin Gol necropolis (Mongolia), American Journal of Physical Anthropology, vol. 143, no. 3 (November 2010).
Rivollat, M. et al. (2015), When the Waves of European Neolithization Met: First Paleogenetic Evidence from Early Farmers in the Southern Paris Basin, PLoS ONE 10(4): e0125521.
Rivollat, M. et al. (2016), Ancient mitochondrial DNA from the middle neolithic necropolis of Obernai extends the genetic influence of the LBK to west of the Rhine, American Journal of Physical Anthropology.
Rollo, F., et al. (2006), Fine Characterization of the Iceman?s mtDNA Haplogroup, American Journal of Physical Anthropology, vol. 130, no. (2006), pp. 557- 564.
Rogaev, (2009), Genomic identification in the historical case of the Nicholas II royal family, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 106, no 13 (March 2009), pp. 5258?5263.
Rudbeck, L., et al. (2005), mtDNA analysis of human remains from an early Danish Christian cemetery, American Journal of Physical Anthropology, vol. 128, pp. 424-429.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Мај 22, 2018, 11:08:11 пре подне
Saag, L. et al. (2017), Extensive farming in Estonia started through a sex-biased migration from the Steppe, bioRxiv preprint first posted online March 2, 2017.
Salamon, M. et al. (2010), Ancient mtDNA sequences and radiocarbon dating of human bones from the Chalcolithic caves of Wadi El Makkukh, Mediterranean Archaeology and Archaeometry, vol. 10, no. 2, pp. 1?14.
Sampietro, M. L. et al. (2005), The genetics of the pre-Roman Iberian Peninsula: a mtDNA study of ancient Iberians, Annals of Human Genetics, vol. 69, pt. 5 (Sep 2005), pp. 535-48.
Sampietro, M. et al. (2007), Palaeogenetic evidence supports a dual model of Neolithic spreading into Europe, Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, vol. 274, pp. 2161-2167.
Sánchez-Quinto, F. et al. (2012), Genomic affinities of two 7,000-year-old Iberian hunter-gatherers, Current Biology, Available online 28 June 2012.
Schiffels, S. et al (2016), Iron Age and Anglo-Saxon genomes from East England reveal British migration history, Nature Communications, 7: 10408.
Schilz, F. (2006), Molekulargenetische Verwandtschaftsanalysen am prähistorischen Skelettkollektiv der Lichtensteinhöhle, Dissertation, Göttingen. Summarised in English, with Y-DNA haplogroups assigned: D. Schweitzer, Lichtenstein Cave Data Analysis (2008).
Schuenemann, V.J. et al. (2011), Targeted enrichment of ancient pathogens yielding the pPCP1 plasmid of Yersinia pestis from victims of the Black Death, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, online August 29, 2011 ahead of print.
Schuenemann, V.J. et al. (2017), Ancient Egyptian mummy genomes suggest an increase of Sub-Saharan African ancestry in post-Roman periods, Nature Communications, 8:15694.
Seguin-Orlando, A. et al. 2014, Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years, Science, 6 November 2014.
Simón, M. et al. (2011), The presence of nuclear families in prehistoric collective burials revisited: the Bronze Age burial of Montanissell Cave (Spain) in the light of aDNA, American Journal of Physical Anthropology, online 30 September 2011, ahead of print.
Skoglund, P. et al. (2012), Origins and genetic legacy of Neolithic farmers and hunter-gatherers in Europe, Science, vol. 336, no. 6080 (April 2012), pp. 466-469.
Skoglund, P. (2013), Reconstructing the Human Past using Ancient and Modern Genomes, Dissertation Uppsala University.
Skoglund, P. et al. (2014), Genomic diversity and admixture differs for Stone-Age Scandinavian foragers and farmers, Science, Published Online April 24 2014.
Sofeso, C. et al. (2012), Verifying archaeological hypotheses: Investigations on origin and genealogical lineages of a privileged society in Upper Bavaria from Imperial Roman times (Erding, Kletthamer Feld), Population Dynamics in Prehistory and Early History, eds. Elke Kaiser, Joachim Burger and Wolfram Schier (ebook July 2012), pp. 113-130.
Stanaszek, L. and Mankowska-Pliszka, H. (2013), Nowe spojrzenie na ?cz?owieka z Janis?awic?. Analiza antropologiczna-kliniczna szkieletu, Prehistoryczny owca. Wystawa o czowieku z Janis?awic, 17-26.
Sverrisdóttir, O. Ó. et al., Direct estimates of natural selection in Iberia indicate calcium absorption was not the only driver of lactase persistence in Europe, Molecular Biology and Evolution, First published online: January 21, 2014.
Sykes, B.C. (2000), Report on DNA recovered from the Red Lady of Paviland. In: Aldhouse-Green, S. (ed.), Paviland Cave and the Red Lady: A Definitive Report, pp. 75?77.
Szécsényi-Nagy et al. (2015), Tracing the genetic origin of Europe's first farmers reveals insights into their social organization, Proceedings of the Royal Society B, vol. 282, no. 1805, 20150339. (Previously published online 2014 elsewhere before print).
Szécsényi-Nagy (2015), Molecular genetic investigation of the Neolithic population history in the western Carpathian Basin, PhD thesis Johannes Gutenberg-Universität in Mainz.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Мај 22, 2018, 11:08:51 пре подне
Terberger, T. et al. (2015), Standing upright to all eternity –The Mesolithic burial site at Groß Fredenwalde, Brandenburg (NE Germany), Quartär 6, pp. 133-153.
Tomczyk, J. et al. (2010), Anthropological Analysis of the Osteological Material from an Ancient Tomb (Early Bronze Age) from the Middle Euphrates Valley, Terqa (Syria), International Journal of Osteoarchaeology, published online ahead of print.
Tömöry, G. et al. (2007), Comparison of maternal lineage and biogeographic analyses of ancient and modern Hungarian populations, American Journal of Physical Anthropology, vol. 34, no. 3, pp. 354-68.
Töpf, A.L. et al. (2006), Tracing the phylogeography of human populations in Britain based on 4th?11th century mtDNA genotypes, Molecular Biology and Evolution, vol. 23, no. 1, pp. 152-161.
Töpf, A.L. et al. (2007), Ancient human mtDNA genotypes from England reveal lost variation over the last millennium, Biology Letters, vol. 3, no. 5, pp. 550-553.
Unterländer, M. et al. (2017), Ancestry and demography and descendants of Iron Age nomads of the Eurasian Steppe, Nature Communications 8, Article number: 14615.
Vai, S. et al. (2015), Genealogical Relationships between Early Medieval and Modern Inhabitants of Piedmont, PLoS ONE 10(1): e0116801.
Vanek, D. et al. (2009), Kinship and Y-chromosome analysis of 7th century human remains: novel DNA extraction and typing procedure for ancient material, Croatian Medical Journal, vol. 50, pp. 286-95.
Vanek D. et al. (2015), Complex analysis of 700-year-old skeletal remains found in an unusual grave–case report, Anthropology, 2: 138.
Vernesi, C. et al. (2001), Genetic characterization of the body attributed to the evangelist Luke, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 98, no. 23 (Nov 2001), pp. 13460-13463. See Bandelt 2005 for query on authenticity.
Vernesi, C. (2004), The Etruscans: A Population-Genetic Study, American Journal of Human Genetics, vol. 74, pp. 694-704. Data not included in the table, because of difficulty assigning haplogroups, and technical criticisms - see Bandelt 2005.
Wang, H. et al. (2012), Genetic characteristics of an ancient nomadic group in Northern China, Human Biology, vol. 84, no. 4, article 3.
Warnberg, O. and Alt, K.W. (2012), Molekulargenetische Analysen an den Bestattungen aus dem endneolithischen Kollektivgrab von Spreitenbach / Analyses en génétique moléculaire des inhumations de la sépulture collective de Spreitenbach, In T. Doppler (éd.), Spreitenbach-Moosweg (Argovie, Suisse): une sépulture collective vers 2500 av. J.-C. / Spreitenbach-Moosweg (Aargau, Schweiz): ein Kollektivgrab um 2500 v.Chr., pp. 158-169.
Wilde, S. et al. (2014), Direct evidence for positive selection of skin, hair, and eye pigmentation in Europeans during the last 5,000 y, PNAS, vol. 111, no. 13, pp. 4832?4837.
Witas, H. W. et al (2013), mtDNA from the Early Bronze Age to the Roman Period Suggests a Genetic Link between the Indian Subcontinent and Mesopotamian Cradle of Civilization, PLoS ONE, 8 (9), e73682.
Witas, H. W. et al (2015), Hunting for the LCT-13910T Allele between the Middle Neolithic and the Middle Ages suggests its absence in dairying LBK people entering the Kuyavia region in the 8th millennium BP, PLoS ONE, 10(4): e0122384.
Wong, E. et al (2017), Reconstructing genetic history of Siberian and Northeastern European populations, Genome Research, 27: 1-14.
Xie, C.Z., et al. (2007), Evidence of ancient DNA reveals the first European lineage in Iron Age Central China, Proceedings of the Royal Society: Biological Sciences, vol. 274, no. 1618 (Jul 2007), pp. 1597-601.
Xie, C.Z., et al. (2007), Mitochondrial DNA analysis of ancient Sampula population in Xinjiang, Progress in Natural Science, vol. 17, no. 8 (Aug 2007), pp. 927-933(7).
Zawicki, P. and Witas, H. W. (2008), HIV-1 protecting CCR5-?32 allele in medieval Poland, Infection, Genetics and Evolution, vol. 8, no. 2, (March 2008), pp. 146-151.
Zeke, T. and Guba, Z. (2012), Response to Data on Hungarian Early Neolithic graves by Banffy et al., Journal of Human Genetics, (advance online publication, 7 June 2012).
Zhang, F. et al. (2010), Prehistorical East?West Admixture of Maternal Lineages in a 2,500-Year-Old Population in Xinjiang, American Journal of Physical Anthropology early online.
Zvelebil, M. and Pettitt, P. (2012), Biosocial archaeology of the Early Neolithic: Synthetic analyses of a human skeletal population from the LBK cemetery of Vedrovice, Czech Republic, Journal of Anthropological Archaeology, available online 5 March 2012 ahead of print.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Мај 22, 2018, 11:11:14 пре подне
Извињавам се администрацији и члановима форума на већем броју постова, али мислим да је корисно имати овај списак литературе на једном мјесту, поготово што неће више бити доступан на мрежи. Може бити користан и приликом писања радова као референтна листа.

Било би га добро допунити на крају године и за 2018. годину.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Сол Мај 27, 2018, 09:47:05 поподне
Можда овај рад Еве Клоновске (2012.) садржи нека занимљивих открића.

Anthropological examination of skeletal remains from Bobovac. Completing and Refitting Skeletal Remains. A report

According to written historical sources the town Bobovac built in the first half of 14th century by the Governor Stjepan II Kotromanić was probably used as a residence by several Bosnian kings until 1463 when Bosnia became occupied by the Ottoman Empire. Hypothetically four kings and one queen could be buried in the royal chapel in Bobovac – Ostoja, Stjepan Ostojić, Tvrtko II and his wife Doroteja Gorjanska and Tomaš (Stjepan Tomaš). Under Turkish occupation Bobovac was reduced to rubbles and the royal chapel demolished. Later, the place became a goal of thefts and amateur archaeologists who looted and plundered graves. During the first systematic archaeological excavations in 1963, conducted under auspices of the National Museum in Sarajevo, nine graves within and outside the royal chapel were opened and excavated. In compliance with original records from the excavation incomplete skeletal remains of 14 individuals (13 adults and one child) were found. Majority of found skeletal remains were badly preserved and many bones were missing. The remains from Bobovac housed in the National Museum were examined in 2007 by the author, who is a forensic anthropologist. The remains represent 13 individuals.

https://www.ceeol.com/search/article-detail?id=257135
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: crni Мај 28, 2018, 01:08:46 пре подне
Можда овај рад Еве Клоновске (2012.) садржи нека занимљивих открића.

Anthropological examination of skeletal remains from Bobovac. Completing and Refitting Skeletal Remains. A report

According to written historical sources the town Bobovac built in the first half of 14th century by the Governor Stjepan II Kotromanić was probably used as a residence by several Bosnian kings until 1463 when Bosnia became occupied by the Ottoman Empire. Hypothetically four kings and one queen could be buried in the royal chapel in Bobovac – Ostoja, Stjepan Ostojić, Tvrtko II and his wife Doroteja Gorjanska and Tomaš (Stjepan Tomaš). Under Turkish occupation Bobovac was reduced to rubbles and the royal chapel demolished. Later, the place became a goal of thefts and amateur archaeologists who looted and plundered graves. During the first systematic archaeological excavations in 1963, conducted under auspices of the National Museum in Sarajevo, nine graves within and outside the royal chapel were opened and excavated. In compliance with original records from the excavation incomplete skeletal remains of 14 individuals (13 adults and one child) were found. Majority of found skeletal remains were badly preserved and many bones were missing. The remains from Bobovac housed in the National Museum were examined in 2007 by the author, who is a forensic anthropologist. The remains represent 13 individuals.

https://www.ceeol.com/search/article-detail?id=257135

Поменути рад Клоновске може се прочитати у Glasniku Zemaljskog muzeja BiH u Sarajevu, Arheologija, Sveska 53, 2012 (https://www.scribd.com/document/189141400/Glasnik-Zemaljskog-muzeja-BiH-u-Sarajevu-sveska-53-nova-serija-djelimi%C4%8Dna-2012), од странице 293-315, обилује илустрацијама и описом скелетних налаза ископаних 1963. године из 9 гробова краљевске гробнице у Бобовцу.

На самом крају овог прегледа Ева Елвира Клоновска (антрополог форензичар) даје препоруку за анализу коштаних остатака на ДНА и листу препоручених европских лабораторија за ту врсту научно-истраживачког рада ..

Нешто више о археологији Бобовца и краљевским гробовима може се наћи у раду Мирсада Сијарића Nadgrobne ploče tri bosanska kralja, 2006 (https://hrcak.srce.hr/file/18469).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: crni Мај 28, 2018, 09:04:42 поподне
Нисам сигуран да је гепидски узорак потпуно хунског порекла, провукао сам узорак кроз Global 25 Давидског, није превише близак ни једном древном ни савременом становништву. Резултат указује на мешавину средњеазијског становништва попут Скита (можда баш Хуни), Германа и евентуално неког балканског становништва:

[1] "distance%=2.0205"

         Gepid_Serbia_ACD:VIM_2

Scythian_ZevakinoChilikta,38
Nordic_IA,19
Vinca_MN,18.4
Germany_Medieval_outlier,9.6
Germany_Medieval,7.2
Karasuk_outlier,4.2
Ust_Ishim,3
Iberia_BA,0.6

Изгледа као да је један родитељ средњеазијског, а други мешаног германско-балканског порекла...
Иначе, један од ближих узорака овом гепидском је IR1 из Мађарске.

...
Fu, Q. et al. (2013), A revised timescale for human evolution based on ancient mitochondrial genomes, Current Biology, 21 March 2013.
Fu, Q. et al. (2014), Genome sequence of a 45,000-year-old modern human from western Siberia, Nature 514, 445-449.
Fu, Q. et al. (2015), An early modern human from Romania with a recent Neanderthal ancestor, Nature, published online 22 June 2015.
Fu. Q. et al. (2016), The genetic history of Ice Age Europe, Nature, published online 2 May 2016.

Узорак српског Гепида близак са IR1 и зрнцем Ust_Ishim у "мјешавини"  :)

Ust Ishim 45.000 година, досада најстарији забиљежен људски геном, утврђене хаплогрупе K2a*(K-M2308xM2313,F549,M2335) , условно речено, предачке хаплогрупе NO>N-M231>N2-Y6503 код IR1, можда згодна прилика за подсјетник и увид у Fu, Q. et al. (2014), Genome sequence of a 45,000-year-old modern human from western Siberia, Nature 514 (https://www.nature.com/articles/nature13810.epdf?referrer_access_token=nSLCppvHQs8abvkHHXRghtRgN0jAjWel9jnR3ZoTv0P9G67KCArMtzNWdAZhEz_rfEjZHnhtHvZX3rLhiOqApI2MrA_pENBsIYT1MGOWUqTiPR2pwKxvVLU9dCX2kUs75MFPmuQqGaCAFYLjislqG0vWjoDps49DEiGu3E4S_EP5VaUo6MgpxOcAs_j48OFCx1rHvbiun4D2hLdzgIg3l1C-_nJZDNF5mFFfNLiNyR_R_Xhcudtjb3oav6excdih&tracking_referrer=www.scientificamerican.com), 445-449. , као и погледати новинарски чланак у Scientific American о овом, својевремено, значајном открићу ка освјетљавање савремених људских миграција из прадавне афричке постојбине, 45,000-Year-Old Man's Genome Sequenced (https://www.scientificamerican.com/article/45-000-year-old-mans-genome-sequenced/).

Надам се да ће ова занимљива примједба г. Сремца послужити у откривању даље и ближе прошлости мистериозне гране N2 и српског N-P189.2  ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Сремац Мај 28, 2018, 10:21:35 поподне


Узорак српског Гепида близак са IR1 и зрнцем Ust_Ishim у "мјешавини"  :)

Ust Ishim 45.000 година, досада најстарији забиљежен људски геном, утврђене хаплогрупе K2a*(K-M2308xM2313,F549,M2335) , условно речено, предачке хаплогрупе NO>N-M231>N2-Y6503 код IR1, можда згодна прилика за подсјетник и увид у Fu, Q. et al. (2014), Genome sequence of a 45,000-year-old modern human from western Siberia, Nature 514 (https://www.nature.com/articles/nature13810.epdf?referrer_access_token=nSLCppvHQs8abvkHHXRghtRgN0jAjWel9jnR3ZoTv0P9G67KCArMtzNWdAZhEz_rfEjZHnhtHvZX3rLhiOqApI2MrA_pENBsIYT1MGOWUqTiPR2pwKxvVLU9dCX2kUs75MFPmuQqGaCAFYLjislqG0vWjoDps49DEiGu3E4S_EP5VaUo6MgpxOcAs_j48OFCx1rHvbiun4D2hLdzgIg3l1C-_nJZDNF5mFFfNLiNyR_R_Xhcudtjb3oav6excdih&tracking_referrer=www.scientificamerican.com), 445-449. , као и погледати новинарски чланак у Scientific American о овом, својевремено, значајном открићу ка освјетљавање савремених људских миграција из прадавне афричке постојбине, 45,000-Year-Old Man's Genome Sequenced (https://www.scientificamerican.com/article/45-000-year-old-mans-genome-sequenced/).

Надам се да ће ова занимљива примједба г. Сремца послужити у откривању даље и ближе прошлости мистериозне гране N2 и српског N-P189.2  ;)

Хм, горњи модел није баш добар (пре свега због временске удаљености узорака), већ је само илустративне природе, јер показује да Гепид није чисто хунског порекла како се спекулисало.
Свакако, Гепид показује јак утицај Источне Азије, што га издваја од осталих узорака из рада и  вероватно да је постотак Ust_Ishim-а управо због склоности Гепида ка "егзотици" - Источној Азији, Сибиру, можда и Јужној Азији.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Јун 09, 2018, 12:31:33 поподне
https://indo-european.eu/2018/06/oldest-bubonic-plague-genome-decoded-in-srubna-ca-3800-ybp/

http://www.shh.mpg.de/979007/oldest-bubonic-plaque
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Сол Септембар 07, 2018, 11:15:33 поподне
Mitogenomic data indicate admixture components of Asian Hun and Srubnaya origin in the Hungarian Conquerors

I-P37.2 међу мађарском елитом 10. столећа.

Archaeologist presume that the rich 10th century cemeteries of Karos and Kenézlő comprise the Conqueror military elite, raising the question as to what extent can our findings be generalized to he entire Conqueror population---
...... The only exceptions are the two chiefs in Karos2 and 3, who had identical X2f maternal haplotypes and I2a1 Y chromosomal haplotypes (data not shown), so were probably brothers. This indicates that these neighboring communities did not intermarry probably because of different group-identity.

при крају рада има и занимљив осврт на порекло мађарског језика,

The large genetic diversity of the Conquerors which seemingly assembled from multiple  ethnic sources and their relative low proportion, having no lasting effect on Hungarian ethnogenesis, raises doubts about the Conqueror origin of the Hungarian language......

Above data infer that preconquest presence of the language in the Carpathian Basin, is an equally grounded hypothesis, as had been
proposed by several scientists (a summary in English is given in [105]), which is also hinted by a recently detected genomic admixture between Mansis and a Middle Neolithic (5000 BCE) individual from the Carpathian Basin [90].

https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2018/01/19/250688.full.pdf
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Новембар 06, 2018, 10:53:52 пре подне
http://www.pnas.org/content/early/2018/10/31/1813608115?fbclid=IwAR10POTudUyWywhTHS5qJkbpeEyJJCwePUSDcXYDLG-L9H3TF-ARkC-DL2Q

https://www.nature.com/articles/s41588-018-0250-5?fbclid=IwAR0J-dxzF77OQT3Dt2SMjdLija9lAcjL_MledBGm9m8Gqox-sxlAllum8Lg
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Децембар 06, 2018, 11:43:50 пре подне
Древна ДНК из неолита у Кини

https://www.biorxiv.org/content/early/2018/12/05/487918?fbclid=IwAR0nNEDDrhU_FD3kZKDGi0M5y__IO8baCjItFwMyXqrKBfRL9XUtqlGvgOo
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Сол Децембар 30, 2018, 09:15:56 поподне
Ancient genomes for which Y-chromosome data are available (analysed as of June 2017).

https://umap.openstreetmap.fr/en/map/ancient-human-dna_41837#6.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милан Петровић Децембар 30, 2018, 09:25:01 поподне
Ancient genomes for which Y-chromosome data are available (analysed as of June 2017).

https://umap.openstreetmap.fr/en/map/ancient-human-dna_41837#6.

Ово је генијално! Хвала!
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Март 14, 2019, 10:13:29 поподне
После вишемесечне суше, коначно нови радови о древној ДНК:

Survival of Late Pleistocene Hunter-Gatherer
Ancestry in the Iberian Peninsula
(https://www.cell.com/current-biology/pdfExtended/S0960-9822(19)30145-9)

The genomic history of the Iberian
Peninsula over the past 8000 years
(https://reich.hms.harvard.edu/sites/reich.hms.harvard.edu/files/inline-files/2019_Olalde_Science_IberiaTransect_0.pdf)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Март 15, 2019, 11:14:47 пре подне
После вишемесечне суше, коначно нови радови о древној ДНК:

Survival of Late Pleistocene Hunter-Gatherer
Ancestry in the Iberian Peninsula
(https://www.cell.com/current-biology/pdfExtended/S0960-9822(19)30145-9)

The genomic history of the Iberian
Peninsula over the past 8000 years
(https://reich.hms.harvard.edu/sites/reich.hms.harvard.edu/files/inline-files/2019_Olalde_Science_IberiaTransect_0.pdf)

https://www.cell.com/cms/10.1016/j.cub.2019.02.006/attachment/547b706c-4868-4e2a-ab78-98ad49e17591/mmc4.mp4

(https://i.postimg.cc/P5g1kL1L/FB-IMG-1552643148200.jpg)

(https://i.postimg.cc/MZnRXbtc/FB-IMG-1552643157146.jpg)

Чини ми се да је на овом локалитету пронађена најстарија до сад I1 хаплогрупа. Или предачка од I1. Могуће грана која је изумрла, а не предачка данашњим носиоцима I1 хаплогрупе. Али свакако показује где је извориште I1.

(https://i.postimg.cc/Z5C9XmRD/FB-IMG-1552646341762.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Март 15, 2019, 12:20:52 поподне
J узорци:

Y-chromosome calls for the Iberian males   

ID   Pop name   Haplogroup
I8205   NE_Iberia_Hel (Empúries2)   J
I8208   NE_Iberia_Hel (Empúries2)   J
I8216   NE_Iberia_RomP (Empúries2)   J
I12162   NE_Iberia_c.6CE_PL   J2a
I4054   SE_Iberia_c.3-4CE   J
I3983   SE_Iberia_c.3-4CE   J2a1a2a2
I3584   SE_Iberia_c.5-8CE   J
I8145   SE_Iberia_c.10-16CE   J
I12514   SE_Iberia_c.10-16CE   J2a
I12515   SE_Iberia_c.10-16CE   J2a
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Скардус Март 18, 2019, 10:24:57 поподне
J узорци:

Y-chromosome calls for the Iberian males   

ID   Pop name   Haplogroup
I8205   NE_Iberia_Hel (Empúries2)   J
I8208   NE_Iberia_Hel (Empúries2)   J
I8216   NE_Iberia_RomP (Empúries2)   J
I12162   NE_Iberia_c.6CE_PL   J2a
I4054   SE_Iberia_c.3-4CE   J
I3983   SE_Iberia_c.3-4CE   J2a1a2a2
I3584   SE_Iberia_c.5-8CE   J
I8145   SE_Iberia_c.10-16CE   J
I12514   SE_Iberia_c.10-16CE   J2a
I12515   SE_Iberia_c.10-16CE   J2a
И тако све теорије падоше у воду...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Март 18, 2019, 10:31:15 поподне
И тако све теорије падоше у воду...

Које теорије конкретно?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Скардус Март 19, 2019, 09:45:57 пре подне
Које теорије конкретно?
Цитирам:''Чини ми се да је на овом локалитету пронађена најстарија до сад I1 хаплогрупа. Или предачка од I1. Могуће грана која је изумрла, а не предачка данашњим носиоцима I1 хаплогрупе. Али свакако показује где је извориште I1''.
Па зар нисмо рекли да је Скандинавија извориште И1 нпр?

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Март 19, 2019, 10:18:11 пре подне
Цитирам:''Чини ми се да је на овом локалитету пронађена најстарија до сад I1 хаплогрупа. Или предачка од I1. Могуће грана која је изумрла, а не предачка данашњим носиоцима I1 хаплогрупе. Али свакако показује где је извориште I1''.
Па зар нисмо рекли да је Скандинавија извориште И1 нпр?

Као што се може видети из табеле, реч је о узорку старом више од 10000 година. Дакле период касног палеолита, када је Скандинавија била под ледом.

(http://www.dandebat.dk/dk-images/127p.jpg)

Самим тим није Скандинавија могла бити извориште. Извориште хаплогрупе I, дакле и I1 и I2 је свакако западна граветијанска и каснија солутренска култура. Одатле су се шириле на север. Следи магдаленијанска па азилијанска култура, којој и припада тестирани појединац I1.

(https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/7/72/Homo_Sapiens_in_Europe_-_solutrean_distribution_map-en.svg)

 За I1 је карактеристично тзв. уско грло од 23000 година. Што значи да су били на ивици нестанка и да се пре 4500 година десило чудо и демографски бум код њих, тако да их данас прилично има.

https://www.yfull.com/tree/i1/

Ова I1 нађена на Пиринејима је једна од многих изумрлих подграна.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Март 19, 2019, 02:01:31 поподне
Мислим да ће се показати исправном хипотеза да је I1 у Скандинавију пристигао током неолита где је потом доживео демографски бум и у великој мери истиснуо носиоце I2-M423 као и могуће остале I2 који су до тад били доминантни.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ДушанВучко Март 19, 2019, 02:07:05 поподне
Мислим да ће се показати исправном хипотеза да је I1 у Скандинавију пристигао током неолита где је потом доживео демографски бум и у великој мери истиснуо носиоце I2-M423 као и могуће остале I2 који су до тад били доминантни.
Онда је могуће да су I1 пре доласка у Скандинавију већ постали земљорадници и потисли староседеоце ловце сакупљаче I2-M423 ? То би значило да су I2-M423 међу последњим ловцима сакупљачима
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Март 21, 2019, 06:54:58 поподне
The Arrival of Steppe and Iranian Related Ancestry in the Islands of the Western Mediterranean
 (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/584714v1.article-metrics)
Supplemental_Materials, Online_Tables
 (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/584714v1.supplementary-material)
Most Sardinians buried in a Nuragic Bronze Age context possessed uniparental haplogroups found in European hunter-gatherers and early farmers, including Y-haplogroup R1b1a[xR1b1a1a] which is different from the characteristic R1b1a1a2a1a2 spread in association with the Bell Beaker complex4 An exception is individual I10553 (1226-1056 calBCE) who carried Y-haplogroup J2b2a (Online Table 1), previously observed in a Croatian Middle Bronze Age individual bearing Steppe ancestry44, suggesting the possibility of genetic input from groups that arrived from the east after the spread of first farmers. This is consistent with the evidence of material culture exchange between Sardinians and mainland Mediterranean groups15 , although genome-wide analyses find no significant evidence of Steppe ancestry so the quantitative demographic impact was minimal.

The presence of Steppe ancestry in Early Bronze Age Sicily is also evident in Y chromosome analysis, which reveals that 4 of the 5 Early Bronze Age males had Steppe-associated Y-haplogroup R1b1a1a2a1a2. (Online Table 1). Two of these were Y haplogroup R1b1a1a2a1a2a1 (Z195) which today is largely restricted to Iberia and has been hypothesized to have originated there 2500-2000 BCE57.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Иван Вукићевић Март 21, 2019, 07:43:23 поподне
The presence of Steppe ancestry in Early Bronze Age Sicily is also evident in Y chromosome analysis, which reveals that 4 of the 5 Early Bronze Age males had Steppe-associated Y-haplogroup R1b1a1a2a1a2. (Online Table 1).

Тешко је схватити да се у појединим радовима и даље користе ознаке попут R1b1a1a2a1a2. Већ пар година се те ознаке константно мењају, тако да они који их користе у радовима очигледно нису свесни да сами себи чине медвеђу услугу са њиховим коришћењем јер ризикују да свега пар месеци након објављивања радова те ознаке представљају неке друге гране, а не оне о којима су писали.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Март 21, 2019, 10:01:56 поподне
The Arrival of Steppe and Iranian Related Ancestry in the Islands of the Western Mediterranean
 (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/584714v1.article-metrics)
Supplemental_Materials, Online_Tables
 (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/584714v1.supplementary-material)
Most Sardinians buried in a Nuragic Bronze Age context possessed uniparental haplogroups found in European hunter-gatherers and early farmers, including Y-haplogroup R1b1a[xR1b1a1a] which is different from the characteristic R1b1a1a2a1a2 spread in association with the Bell Beaker complex4 An exception is individual I10553 (1226-1056 calBCE) who carried Y-haplogroup J2b2a (Online Table 1), previously observed in a Croatian Middle Bronze Age individual bearing Steppe ancestry44, suggesting the possibility of genetic input from groups that arrived from the east after the spread of first farmers. This is consistent with the evidence of material culture exchange between Sardinians and mainland Mediterranean groups15 , although genome-wide analyses find no significant evidence of Steppe ancestry so the quantitative demographic impact was minimal.

The presence of Steppe ancestry in Early Bronze Age Sicily is also evident in Y chromosome analysis, which reveals that 4 of the 5 Early Bronze Age males had Steppe-associated Y-haplogroup R1b1a1a2a1a2. (Online Table 1). Two of these were Y haplogroup R1b1a1a2a1a2a1 (Z195) which today is largely restricted to Iberia and has been hypothesized to have originated there 2500-2000 BCE57.

Занимљиво да не нађоше I2a-M26 на Сардинији, мада укупан број Y-днк и није превелик.

Иако у тексту наводе: "These results falsify the view that the people of Sardinia are isolated descendants of Europe's first farmers. Instead, our results show that the island's admixture history since the Bronze Age is as complex as that in many other parts of Europe." Упркос томе, мислим да управо налази овог рада показују да је простор у Европи гдје се у највећој мјери очувала генетика неолитских анадолских земљорадника управо подручје  Сицилије, Сардиније и осталих острва Западног Mедитерана.

Колико сам успио да видим, становништво Сардиније и Сицилије већ се од краја Бронзаног доба почело аутосомално приближавати Микењанима, тј. као да се становништво источног и западног Медитерана полако уједначава. Без обзира на удјеле иранског неолитика и степске компоненте, и даље и код једних и других убједљиво доминира генетика анадолских неолитских земљорадника. WHG је у повлачењу.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Март 22, 2019, 11:51:20 поподне
Занимљиво да не нађоше I2a-M26 на Сардинији, мада укупан број Y-днк и није превелик.
Милан ми је скренуо пажњу да је исти дан објављено и истраживање које се бави искључиво Сардинијом, ту је пронађен M26, али свега један узорак.

Population history from the Neolithic to present on the Mediterranean island of Sardinia: An ancient DNA perspective
 (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/583104v1.article-info)
Our genome-wide data allowed us to assign Y haplogroups for 25 ancient Sardinian individ170 uals. More than half of them consist of R1b-V88 (n “ 10) or I2-M223 (n “ 7) (Sup. Fig. 3,Supp. Mat. 1B). In our reference data set, these two Y-haplogroups appear first in Balkan hunter-gatherer and Balkan Neolithic individuals, and also in more recent western Neolithic populations. Francalacci et al. (2013) identified three major Sardinia-specific founder clades based on present-day variation within the haplogroups I2-M26, G2-L91 and R1b-V88, and here we found each of those broader haplogroups in at least one ancient Sardinian individual.

Занимљиво, чак седам M223.

Такође је ово занимљиво, не знам када ће бити објављено.

DNA TEST TRACES DIRECT DESCENDANTS OF GREAT MORAVIAN NOBLEMEN
 (https://www.radio.cz/en/section/in-focus/dna-test-traces-direct-descendants-of-great-moravian-noblemen)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Март 23, 2019, 12:04:56 пре подне
Занимљиво да овај J2b2 са Сардиније нема степску компоненту у аутозомалној, или му је врло слаба. То би био још један ексер у ковчегу хипотезе о степском ИЕ пореклу ове хаплогрупе коју нарочито форсирају на Фољеји?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Бећар Март 24, 2019, 03:39:28 пре подне
Мислим да ће се показати исправном хипотеза да је I1 у Скандинавију пристигао током неолита где је потом доживео демографски бум и у великој мери истиснуо носиоце I2-M423 као и могуће остале I2 који су до тад били доминантни.
Па свакако могуће НиколаВук, али би то онда било на самом крају Неолита. Ја видим да ви имате врло солидну фундацију знања, из ваших ранијих коментара, па ћу само кратко коментарисати што мислим да вам је већ познато. Северна Група, посебно L22, 4000 године млађа грана од CTS6364, је изгледа тамо експлодирала.  Ова грана доминира по броју целу И1 па се тако некако и често гледа као И1. Али основна грана од које полази, нађена је раније у данашњој Немачкој, Пољској, мада и негде у Скандинавији.

Јужна Група И1 (Z58 и Z63) је подједнако стара и не може се лако објаснити некаквим Шведска-Норвешка-Финска пореклом. Данска је у игри по теорији, али не по нађеној древној ДНК, а уствари потпуно ван игре на основу модерног ДНК тестирања Данаца. Најстарји древни примерак Z63 ДНК (теоретски 4600 година стара грана) је ипак за сада нађен само у Kowalenko, Poljska. Мали део Z63 има у Финској али то је нај вероватније каснија Готска прича.

Истискивање I2-M423 је врло интересантна тема. Каве су теорије за предности тих Северних Група И1?  Зашто су они успели да истисну I2-M423?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Март 24, 2019, 08:12:25 пре подне
Истискивање I2-M423 је врло интересантна тема. Каве су теорије за предности тих Северних Група И1?  Зашто су они успели да истисну I2-M423?

Из сличних разлога из којих су мезолитско-неолитске староседелачке Y-ДНК хаплогрупе у доброј мери истиснуте са простора западне Европе - долазак новог становништва (поглавито R1b-L51) које је имало бољу технологију, већу популацију и већу отпорност на заразне болести која долази услед дужег боравка у близини домаћих животиња. Додуше R1b Индоевропљани баш и нису најбољи пример због тога што они смењују становништво које је у највећој мери већ неолитско, самим тим има доместификоване животиње (осим коња који су индоевропски "специјалитет"), код њих је узрок углавном употреба коња и двоколица у ратне сврхе и боља опремљеност (ИЕ оружја од метала у односу на неолитска од камена, кости, јелењег рога, опсидијана). Судар неолитског са мезолитским становништвом је нарочито неповољан за потоње, услед горе реченог; мезолићани по природи свог привређивања (лов и сакупљање) живе у малим заједницама (30-40 људи), распршеним на ширем простору, за разлику од неолићана који живе сконцентрисани у већим насељима (неколико стотина, можда и хиљада људи), што им омогућава привреда заснована на производњи хране (земљорадња и сточарство), имају савршенију технологију глачаног камена у односу на мезолитску окресану индустрију камена и имају већу отпорност на заразне болести потекле од домаћих животиња. Ако претпоставимо да су I1 били део неолитског таласа који је напослетку допро и до Скандинавије, није необично што су они доживели демографски бум док су мезолитски староседеоци (I2a-M423) у доброј мери нестали; један део се вероватно иселио док је други део асимилован од стране неолићана.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Бећар Март 24, 2019, 05:59:09 поподне
Врло добро речено НиколаВук. Продирање бољом технологијом али уништавање болестима које придошлице носе а имају донекле отпорност. То је показано и у боље документованој историји Америчких индијанаца а и острва као Хаваји и Хаити. Вероватно је тако било и на Сардинији.

Интернет је пун прокламација да је I1 Викиншка (800-1100 АД) или тако нека северно нацинална групација новијег датума. Сама бронза се појављује у Скандинавији тек у време експлозије I1-M253-L22 тј. негде одмах после  теоретског зачећа те под-гране, пре неких 3900 година. А оружје и алатке које су вероватно давале велику предност у то време су морале бити од бронзе.  Значи бронзано оружије прављено у јужнијим или централним деловима Европе.  Талас простирања технологије бронзе је добро документовано у Европи и Азији, а Балкан је пионир те ере.

https://en.wikipedia.org/wiki/Bronze_Age

Проналазак бакарне секире 4650 BC (пре 6670 година) и објеката легуре као бронза у југо-источној Србији, постављају Винча Културу много раније на хронолошкој линију Бронзаног Доба. Чак је врло необичан опис фуруна које су користили за топљење бакрних легура оцртава више напредну технологију виђену тек доста касније у Бронзаном Добу.

То је и негде време када налазимо први примерак I-M253 (из периода од пре 7500-6500 година), значи саму основу групе I1. Налазиште је било нешто даље западно од Винча Културе на територији данашње Мађарске. А културе после Винче су се и померале западним правцем.  А то је исто релативно близу Динарске области где се вероватно развила и друга грана тог истог античког дрвета (I-М170),  грана I-M438.  То је наравно грана-основа групе I2. Мени то говори да порекло сестри I1 и I2 треба тражити ближе кућног прага, а не у далекој Скандинавији.  Има добрих разлога зашто се не селити у област где је аграрна сезона врло кратка а зима врло хладна, мрачна и дуга.  Они који тамо успеју, брзо направе концетрацију људи сличних себи.

За сада још нема ништа што подржава некаквим доказом ову хипотезу. Ја разумем да су ово зато шпекулације на основу мало информација које данас имамо.

Балакaн је одувек био раскрница инвазија, миграција и тираније. Са тиме су долазиле болести и масовно уништавање мушких хаплогрупа.  Ми већ знамо на основу студија из Лајпцига и Харварда да је древна ДНК била много више разноврсна и често тотално уништавана.  Зашто онда гледати данашње концетрације мушке Y-DNK као меродавну оцену древне прошлости? Генетичари са та два универзитета, у сарадњи са археолозима, више не гледају само древну Y-DNK као меродавну оцену миграција и прошлости.  Дрвена митохондриал ДНК је повезала више миграција кој они сада студирају. 
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Бећар Март 25, 2019, 02:15:00 поподне

Чини ми се да је на овом локалитету пронађена најстарија до сад I1 хаплогрупа. Или предачка од I1. Могуће грана која је изумрла, а не предачка данашњим носиоцима I1 хаплогрупе. Али свакако показује где је извориште I1.

Колико ја разумем из Max Planck Inst извештаја, тај нај старији примерак I хаплогрупе који они називају "може бити I1" је само око 5600 године стар. Било је више "може бити I1" примерака који су само били 4000-4500 година староссти. То је ипак од вредности, поготово ако је некао од изгубљених I1 грана, па можда зато и није лако идентификовати. Ја сам исто био збуњен начином како пишу њихове узроке али се касније у чланку и графикону види да је узорак новијег датума.

Како су они причали о узорцима могуће је да су G2, а можда I1 и I2 покупљени негде успут док су Степски Људи пратили Дунав, Саву и свратили на пазарење у Трст пре него што су ухватили стазу Француске ривијере.  БАр је то мени најлогичнији пут коњима или пешке. Мени интересантно је да је један од наших људи, пореклом мало јужније од  Копаоника, близу горе споменутог Плоче бакарног налазишта, већ тестиран I1 Big Y на FTDNA. Ја сам са њим пре комуницирао а верујем и неки од вас, тако да је он већ јавно писао да му један од ближих "Y-DNA рођака" са Иберије. 

Како било, миграције ове врсте нису биле хомогенизована Y-DNA племена једне хаплогупе чак ни тако давно.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Март 30, 2019, 12:06:30 поподне
Тестирани су Скитски узорци из Јужног Сибира помоћу STR и SNP маркера, а коришћен је и НевГен:

Genetic kinship and admixture in Iron Age Scytho-Siberians (https://link.springer.com/article/10.1007/s00439-019-02002-y)

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: симо Март 30, 2019, 01:48:45 поподне
Тестирани су Скитски узорци из Јужног Сибира помоћу STR и SNP маркера, а коришћен је и НевГен:

Genetic kinship and admixture in Iron Age Scytho-Siberians (https://link.springer.com/article/10.1007/s00439-019-02002-y)

Рекао бих очекивани Y-днк резултати (R1a-Z93 и Q-L330). Гледао сам ову једну N и нисам јој успио пронаћи неке блиске појединце. (понадао сам се да није P189.2)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: crni Април 01, 2019, 01:05:36 пре подне
Рекао бих очекивани Y-днк резултати (R1a-Z93 и Q-L330). Гледао сам ову једну N и нисам јој успио пронаћи неке блиске појединце. (понадао сам се да није P189.2)

Петоро аутора (Zvénigorosky, Kovalev, Crubézy, Ludes, Keyser) из Genetic kinship and admixture in Iron Age Scytho-Siberians (https://link.springer.com/article/10.1007/s00439-019-02002-y) и прошле године били су заједно у истом тиму који је објавио New genetic evidence of affinities and discontinuities between bronze age Siberian populations (https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/ajpa.23607#accessDenialLayout). Овдје сам примјетио тројицу N (NO-M214) са 17 маркера, дакле "старијих" од овог једног N (N-M231)? Да нису случајно ова тројица P189.2?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Април 01, 2019, 09:24:40 пре подне
Петоро аутора (Zvénigorosky, Kovalev, Crubézy, Ludes, Keyser) из Genetic kinship and admixture in Iron Age Scytho-Siberians (https://link.springer.com/article/10.1007/s00439-019-02002-y) и прошле године били су заједно у истом тиму који је објавио New genetic evidence of affinities and discontinuities between bronze age Siberian populations (https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/ajpa.23607#accessDenialLayout). Овдје сам примјетио тројицу N (NO-M214) са 17 маркера, дакле "старијих" од овог једног N (N-M231)? Да нису случајно ова тројица P189.2?

Не би требало с обзиром да су сви N2-Y6503 испод M231, тј. M231+.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Април 04, 2019, 10:45:48 пре подне
Навали народе. ;)

Y-chromosome haplogroups from Hun, Avar and conquering Hungarian period nomadic people of the Carpathian Basin
 (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/597997v1)

The west Eurasian R1a1a1b1a2b-CTS1211 subclade of R1a is most frequent in Eastern Europe especially among Slavic people. This Hg was detected just in the Conqueror group (K2/18, K2/41 and K1/10). Though CTS1211 was not covered in K2/36 but it may also belong to this sub-branch of Z283.

Hg I2a1a2b-L621 was present in 5 Conqueror samples, and a 6th sample form Magyarhomorog (MH/9) most likely also belongs here, as MH/9 is a likely kin of MH/16 (see below). This Hg of European origin is most prominent in the Balkans and Eastern Europe, especially among Slavic speaking groups. It might have been a major lineage of the Cucuteni-Trypillian culture and it was present in the Baden culture of the Calcholitic Carpathian Basin 25.

I1- M253, identified from one Conqueror sample is a northern European Hg found mostly in Scandinavia and Finland and might have originated from this region during the Mesolithic. It has somewhat similar distribution to R1b-U106 associated with Germanic speaking populations.

Three out of 4 samples in the small Karos3 cemetery belonged to Hg R1b1a1b1a1a1-U106 setting apart this cemetery from all other groups, except for the Hun/2 sample which is the only other one with this Hg. Hg U106 is considered a “Germanic” branch as it is most significant today in Germany, Scandinavia, and Britain, and rare in Eastern Europe (Supplementary Table S4). Its ancestral branch Hg R1b1a1b-M262 is assumed to have emerged in the Pontic-Caspian Steppe and arrived to Europe with Bronze Age migrations 26. Its presence in Hun and Conqueror samples may derive from Goths, Gepids or other German allies of the Huns.

We detected R1b1a1b1a1a2b-U152 in one sample from the Sárrétudvari Conqueror cemetery, which represent rather commoners than the elite. U152 is the Italo-Celtic R1b branch, concentrated around the Alps, and which was present in the Carpathian Basin before the conquer, so did not necessarily arrived with the Conquerors.

The mediterranean haplogroup E1b1b1a1b1a-V13 was detected in an Avar (SzK/239) and a Conqueror (K2/6) sample, while this marker was not covered in another sample (K1/13, E1b1b- M215). This Hg originated in the Middle East and migrated to the Balkans and Western Asia during the Bronze Age.

The PSZ/1 Avar leader belongs to Hg G2a-P15, while K2/33 to the G2a2b-L30 subbranch. Hg G2a is originated from Anatolia/Iran, now it is most common in the Caucasus region and its is arrival to Europe isassociated with the spread of Neolithic farmers 27.

One Conqueror sample belongs to Hg J1-M267 and another to J2a1a-L26. Both J1 and J2 lineages aremost frequent around the Middle East-Caucasus and probably originated from this region 28, then expanded with pastorists prior to the Neolithic.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Април 04, 2019, 11:41:12 пре подне
Навали народе. ;)

Y-chromosome haplogroups from Hun, Avar and conquering Hungarian period nomadic people of the Carpathian Basin
 (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/597997v1)


(https://i.postimg.cc/Fsb3QGtX/20190404-112621.jpg)

(https://i.postimg.cc/Y2Ym18CL/20190404-112542.jpg)

Било би добро ако се обради БAM фајл. Што се тиче I2a-L621, он је врло могуће "динарик", али видимо да је S17250-. Али значајан резултат свакако. Археогенетски резултати из овог периода нама највише и требају.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ДушанВучко Април 04, 2019, 11:56:40 пре подне
Овај conqueror period може у већини да буде и пресек панонског дела Велике Моравске, тј. стање које су Мађари затекли кад су дошли, непосредно после пада Велике Моравске
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ДушанВучко Април 04, 2019, 12:20:52 поподне
Овај conqueror period може у већини да буде и пресек панонског дела Велике Моравске, тј. стање које су Мађари затекли кад су дошли, непосредно после пада Велике Моравске
Мада се ради о неколико локалитета у источној Мађарској...Али на 29 узорака, могуће да је око 30% словенске генетике, што није много мање у односу на данашњи проценат код Мађара. Али је видно "шареније" у односу на аварски период
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Април 04, 2019, 04:48:26 поподне
Резултати овог рада бацају светло на многе занимљивости, нарочито што се тиче N хаплогрупе. Изгледа да је једна од главних хаплогрупа Авара била N1-Y16323 (https://yfull.com/tree/N-Y16323/) (СНП-ови B197 и Z35291 у раду), која се данас углавном везује за Бурјате и Чукче у Сибиру а има је и у централној Азији. Мислим да ова подграна још увек није пронађена код садашњих балканских популација, нека ме неко исправи ако грешим. Такође су код Авара присутни и неки N1 који нису ближе дефинисани. Упадљива разлика у односу на хунску Q1-M25 (мислим на однос Q1-N1) која је такође присутна у раду а има је и код данашњих популација на Балкану. У време мађарског доласка имамо потпуно другачије N1 хаплотипове - N1-Z1936 (https://yfull.com/tree/N-Z1936/) који се везује управо за угријске народе (нпр. западносибирске Ханте и Мансе, најближе језичке рођаке Мађара) али што је још занимљивије и N1-M2019 (https://yfull.com/tree/N-M2019/) (СНП M2004 у раду) којој припада један тестирани Хрват из задарског краја. До сада смо мислили да је N1-M2019 дошла са Аварима у Панонију и на Балкан а изгледа да су ипак раносредњовековни Мађари ту главни "кривци", мада не бих потпуно искључио могућност да буде пронађена и у ранијем, аварском контексту, с обзиром на извесну разноврсност N1 хаплотипова код њих. Иначе се ова грана углавном везује за Јакуте у источном Сибиру.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Александар Невски Април 04, 2019, 09:08:15 поподне
Нађох гдѣ йе Карос, мѣсто и гробље с трома Л621. То йе на сѣвероистоку Мађарске, на самой граници са Словачком, а ни украйинска граница нѣйе далеко.
Мађархоморог с йош тройцом йе йужнийе, од прилике на срѣдини Мађарске по висини, али опет на истоку, близу румунске границе.

Врло занимљив рад.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Сол Април 05, 2019, 07:16:41 поподне
(https://i.postimg.cc/Fsb3QGtX/20190404-112621.jpg)

(https://i.postimg.cc/Y2Ym18CL/20190404-112542.jpg)

Било би добро ако се обради БAM фајл. Што се тиче I2a-L621, он је врло могуће "динарик", али видимо да је S17250-. Али значајан резултат свакако. Археогенетски резултати из овог периода нама највише и требају.

Налази из -Conqueror доба, као да пресликавају хетерогену скупину мађарске освајачке екипе сачињену од пребеглих елтебера Хазарског каганата - Печењеза, Огуза, кримских Хуна & Гота, волшких Бугара, Башкира, Древљана -I-Y4460 ? или пак хазаро-ашкеназ -Y18331?  и R1a -CTS1211 Вјатића?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Април 05, 2019, 07:50:54 поподне
Упадљива разлика у односу на хунску Q1-M25 (мислим на однос Q1-N1) која је такође присутна у раду а има је и код данашњих популација на Балкану.

У раду ”Y chromosomal heritage of Croatian population and its island isolates” из 2003. године је по свему судећи забележена хаплогрупа Q са фреквенцијом од 14% на Хвару и 6% на Корчули. Сећам се да се још пре неколико година спекулисало о могућности Хунског (или Аварског) порекла ове хаплогрупе. У то време ми се чинило да то има смисла.
Временом сам постао скептик кад су такве спекулације у питању и да ме је пре неки дан неко питао да ли је могуће хунско порекло хаплогрупе Q на западном Балкану, вероватно бих рекао - јако тешко.

Фасцинанто је да се након ових резултата хунско порекло хаплогрупе Q може сматрати скоро потврђеним.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Април 05, 2019, 08:02:18 поподне
У раду ”Y chromosomal heritage of Croatian population and its island isolates” из 2003. године је по свему судећи забележена хаплогрупа Q са фреквенцијом од 14% на Хвару и 6% на Корчули. Сећам се да се још пре неколико година спекулисало о могућности Хунског (или Аварског) порекла ове хаплогрупе. У то време ми се чинило да то има смисла.
Временом сам постао скептик кад су такве спекулације у питању и да ме је пре неки дан неко питао да ли је могуће хунско порекло хаплогрупе Q на западном Балкану, вероватно бих рекао - јако тешко.

Фасцинанто је да се након ових резултата хунско порекло хаплогрупе Q може сматрати скоро потврђеним.

Видим на стаблу Q-M25 један нови узорак id:HGDP00896.

https://www.yfull.com/tree/Q-M25/

Ради се о грани Q-YP789, где имамо већ једног Мађара. Да ли је можда ово узорак из овог рада?

https://www.yfull.com/tree/Q-YP789/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Април 05, 2019, 08:22:40 поподне
Видим на стаблу Q-M25 један нови узорак id:HGDP00896.

https://www.yfull.com/tree/Q-M25/

Ради се о грани Q-YP789, где имамо већ једног Мађара. Да ли је можда ово узорак из овог рада?

https://www.yfull.com/tree/Q-YP789/
Мислим да није. Бам фајлови из рада још увек нису доступни за преузимање.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Април 05, 2019, 08:26:46 поподне
Мислим да није. Бам фајлови из рада још увек нису доступни за преузимање.

Таман сам се обрадовао. Зна ли се кад ће бити доступни?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Април 05, 2019, 08:27:46 поподне
У раду ”Y chromosomal heritage of Croatian population and its island isolates” из 2003. године је по свему судећи забележена хаплогрупа Q са фреквенцијом од 14% на Хвару и 6% на Корчули. Сећам се да се још пре неколико година спекулисало о могућности Хунског (или Аварског) порекла ове хаплогрупе. У то време ми се чинило да то има смисла.
Временом сам постао скептик кад су такве спекулације у питању и да ме је пре неки дан неко питао да ли је могуће хунско порекло хаплогрупе Q на западном Балкану, вероватно бих рекао - јако тешко.

Фасцинанто је да се након ових резултата хунско порекло хаплогрупе Q може сматрати скоро потврђеним.

 Ако се на отоцима хрватским ради о Q-L245 а мислим да се ради према резултату који знам са Корчуле, ту нема говора о хунској вези. На оном узорку од 1100 већином су се јављали Q-L245, само један мислим Q-L715..
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Април 05, 2019, 08:47:06 поподне
Видим на стаблу Q-M25 један нови узорак id:HGDP00896.

https://www.yfull.com/tree/Q-M25/

Ради се о грани Q-YP789, где имамо већ једног Мађара. Да ли је можда ово узорак из овог рада?

https://www.yfull.com/tree/Q-YP789/


HGDP00896 је одавде Table S1: https://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371/journal.pgen.1003666#s5
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Април 05, 2019, 08:48:57 поподне
Ако се на отоцима хрватским ради о Q-L245 а мислим да се ради према резултату који знам са Корчуле, ту нема говора о хунској вези. На оном узорку од 1100 већином су се јављали Q-L245, само један мислим Q-L715..

Нисам се бавио детаљима, признајем. Слажем се да то треба разјаснити.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Април 05, 2019, 08:49:06 поподне

HGDP00896 је одавде Table S1: https://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371/journal.pgen.1003666#s5

Хвала Бане...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Април 05, 2019, 10:51:27 поподне
Таман сам се обрадовао. Зна ли се кад ће бити доступни?
Обично буду кроз пар дана, ваљда ће тако бити и са овим радом.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: filipi Април 05, 2019, 11:49:40 поподне
Da li se dobro sjecam da ima Horvath Hg Q iz Madjarske?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: crni Април 06, 2019, 01:02:09 поподне
Заиста, врло занимљив, и садржајем и концепцијом, рад (https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2019/04/03/597997.full.pdf)

Сва петорица N из Conqueror периода нађени су на сјевероистоку Мађарске, на тромеђи са Словачком и Украјином, на подручју Bodrogköz регије, тројица на локалитету у мјесту Karos, а двојица N у мјесту Kenézlő. Од петорице, двојица су одређена N1-M2019, а тројица N1-Z1936.

Bane је поставио студију (https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=62.msg48308#msg48308), а Atlantische графиконе (https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=62.msg48651#msg48651) са истраживања Bodrogköz регије из 2017. године из којих можемо примјетити такође неуобичајено високо учешће хг N за мађарске прилике (9/147, 6,1%), гдје је утврђено 1 N1c-L1034, 1 N1c-L708*, 6 N1c-VL29, 1 N1c-Z1936. (https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00438-017-1319-z).

Готово да се може утврдити континуитет становништва Bodrogköz регије са позиције хаплогрупе N conqueror периода, док би ова шесторица N1c-VL29 могла тражити своје поријекло од кагана (KB/300, Kunbábony/300 (khagan), 630–650/660, M178 (xZ35159), (VL29, Z1936, L1034), N1a1a) из early Avar периода? Kunbábony се налази 20-ак км јужно од Будимпеште.

О одсуству хг N у мађарској генетици кратко је реферисао 2017. Michael St. Clair: " ... the genetic history of Hungarians reflects that population expansion is not a prerequisite for language expansion. Such a scenario for the Hungarians agrees with the historical record in that a large population shifted to the language of a relatively small population from Central Asia, the Huns, who invaded Europe in the fourth century.", што је постало већ опште мјесто у проучавању мађарске историје и етногенезе, а као занимљивост овдје је понуђен модел ширења хг N Евроазијом по T шеми под утицајем лова и припитомљавања ирваса (Rangifer tarandus) као и развоја металургије на том огромном подручју.

(https://www.genlinginterface.com/wp-content/uploads/2017/05/Hg-N-Update-2.pdf)

На крају, на неки начин морам изразити своје разочарење "непроналаском" N2 међу тим археогенетским мађарским узорцима .. заиста би било више него интересантно имати једну такву квалитетну научну интерпретацију.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Април 06, 2019, 03:07:13 поподне
Готово да се може утврдити континуитет становништва Bodrogköz регије са позиције хаплогрупе N conqueror периода, док би ова шесторица N1c-VL29 могла тражити своје поријекло од кагана (KB/300, Kunbábony/300 (khagan), 630–650/660, M178 (xZ35159), (VL29, Z1936, L1034), N1a1a) из early Avar периода? Kunbábony се налази 20-ак км јужно од Будимпеште.

Мислим да ниједан од N1 аварских узорака се неће испоставити као позитиван на VL29 с обзиром да је то прибалтичка грана карактеристична за Финце, Естонце, скандинавске и балтске народе. Ако буду успели да прецизирају СНП од ових неодређених N1-M178 извесније ми је да ће то бити неке подгране из "утробе Азије", као што је Y16323 која је изгледа основна аварска грана.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Србин Април 06, 2019, 11:21:00 поподне
Интересантан нови рад. Издвојио бих следеће:

- из неког разлога приметно одсуство R-CTS1211 и L621 xS17250 у доба Аварског Каганата

- у доба освајања L621 xS17250 има више од R-CTS1211

- 50% елитних гробова L621 xS17250, један вођа, 50% L621 xS17250 у елитним гробовима

- 25% R-CTS1211 у елитним гробовима

- 75% R-CTS1211 толерантни на лактозу при чему чине 50% толерантних читавог узорка из доба освајања

- 0% R-U106 и I-M253 толерантно на лактозу

- 0% R-U106 и I-M253 плавооких или плавокосих

- 0% R-CTS1211 плавооких или плавокосих

- 83% L621 xS17250 нетолерантно на лактозу (потпуно супротно од R-CTS1211)

- L621 xS17250 ако су елитни онда су браон очију, тамне косе и тена, ако нису 1/3 имају комбинацију плаве очи, коса и светла кожа, 2/3 неелитних плави

- E-V13 плавоок риђокос (Балкан Шпрахбунд?)

- нема R-М458 али има J1, J2a, R-L23, сви браон очију, косе

А ко би рекао, бар ја нисам ово очекивао. Негативна корелација R-CTS1211 и L621 xS17250 - све контра од заступљености преко аутозомалних особина, мтднк до статуса. Са друге стране поменуто није уочљиво код германских R-U106 и I-M253. Самим тим на основу приложених резултата може се закључити да су дотични узорци R-CTS1211 и L621 xS17250 припадали различитим етногрупама које су ушле у састав освајача.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Србин Април 07, 2019, 12:50:35 пре подне
Грешка, не може да се исправи.

50% елитних L621 xS17250 је плаво, сви грађани црни.

Заправо побркао сам К3/12 са МХ/9. Овај горе близу елитних из Кароса, Мађархоморог издвојени доле.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Сол Април 07, 2019, 11:33:11 пре подне
присуство R1a- Z94 > Z2124 у сва три периода (Хун-Авар-Conqueror), као и налаз ХГ краља Беле III. (Арпадовића) Z2123 > YP451+ > YP449- указује на карачајско-балкарски предео, као место порекла елитног дела освајача.

апропо, далматинска острва; последљи сакрални краљ/кенде, освајачке мађарске дуалне монархије (ђула= ратни вожд & кенде=сакрални вожд) зваше се Курсан Kurszán  Kusál, Cussan, dux Chussal Chussol, Chusdal, Cusa. Презиме Кусановић (R-CTS1211 >CTS3402 , Брач) је можда настало управо од тог необичног имена.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Србин Април 07, 2019, 03:03:17 поподне
https://www.eupedia.com/forum/threads/38193-Huns-Avars-and-Hungars/page2?s=e5405d6b627cb8146f7739b47c708c17 (https://www.eupedia.com/forum/threads/38193-Huns-Avars-and-Hungars/page2?s=e5405d6b627cb8146f7739b47c708c17)

Дибран рече на Еупедији да у додацима изгледа има један М458, само не зна да ли је елита или не.

Једва чекам резултате анализе БАМ фајлова.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Дервента Април 07, 2019, 11:49:06 поподне
Интересантан чланак је објављен у New Scientist  о миграцији носилаца Јамнаја културе у Европу. До сада се углавном могло читати о некој мирној коегзистенцији, али сада по први пут видим да се користи ријеч геноцид када се описује замјена до тада доминанних И и Г у Западној Европи са овим новопридошлим носиоцима хаплогрупе Р.

https://www.newscientist.com/article/mg24132230-200-story-of-most-murderous-people-of-all-time-revealed-in-ancient-dna/ (https://www.newscientist.com/article/mg24132230-200-story-of-most-murderous-people-of-all-time-revealed-in-ancient-dna/)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Април 08, 2019, 12:31:29 поподне
Обично буду кроз пар дана, ваљда ће тако бити и са овим радом.

Да ли су ово BAM file-ови?

https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB31764
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Србин Април 08, 2019, 01:17:05 поподне
Требало би да јесу, има тачно 49 узорака (46 мушкараца и три жене) а сви БАМ фајлови имају у називу префикс ХУН тј. из тог су рада.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Април 08, 2019, 01:29:58 поподне
Требало би да јесу, има тачно 49 узорака (46 мушкараца и три жене) а сви БАМ фајлови имају у називу префикс ХУН тј. из тог су рада.

Да, дефинитивно су из овог рада.

Издвојио сам једног I2a. Па ако неко жели нека покуша да отпакује фајл. Ако сазнамо грану једног, вероватно су и остали иста грана.

https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/ERS3324704
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Србин Април 08, 2019, 01:37:55 поподне
Тачно, Валдемар на Антрогеници већ окачио тај линк.

https://anthrogenica.com/showthread.php?8066-DISCUSSION-THREAD-FOR-quot-Genetic-Genealogy-and-Ancient-DNA-in-the-News-quot/page229&s=f529d31e4ebd677269a7642de9f3963a (https://anthrogenica.com/showthread.php?8066-DISCUSSION-THREAD-FOR-quot-Genetic-Genealogy-and-Ancient-DNA-in-the-News-quot/page229&s=f529d31e4ebd677269a7642de9f3963a)

Можда је неко из иностранства већ почео.

Иначе чудно да на Антрогеници још није отворена посебна тема. Бар је ја не видим. На Еупедији јесте.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Април 08, 2019, 01:42:44 поподне
Тачно, Валдемар на Антрогеници већ окачио тај линк.

https://anthrogenica.com/showthread.php?8066-DISCUSSION-THREAD-FOR-quot-Genetic-Genealogy-and-Ancient-DNA-in-the-News-quot/page229&s=f529d31e4ebd677269a7642de9f3963a (https://anthrogenica.com/showthread.php?8066-DISCUSSION-THREAD-FOR-quot-Genetic-Genealogy-and-Ancient-DNA-in-the-News-quot/page229&s=f529d31e4ebd677269a7642de9f3963a)

Можда је неко из иностранства већ почео.

Иначе чудно да на Антрогеници још није отворена посебна тема. Бар је ја не видим. На Еупедији јесте.

Одлично! Брзо се шири прича...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Дервента Април 15, 2019, 09:24:22 поподне
Рад објављен данас у часопису Nature који се бави доласком носиоца пољопривредних култура у данашњу Британију:

https://www.nature.com/articles/s41559-019-0871-9 (https://www.nature.com/articles/s41559-019-0871-9)       
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Април 18, 2019, 11:12:20 поподне
A Transient Pulse of Genetic Admixture from the Crusaders in the Near East Identified from Ancient Genome Sequences (https://www.cell.com/ajhg/fulltext/S0002-9297(19)30111-9)

During the medieval period, hundreds of thousands of Europeans migrated to the Near East to take part in the Crusades, and many of them settled in the newly established Christian states along the Eastern Mediterranean coast. Here, we present a genetic snapshot of these events and their aftermath by sequencing the whole genomes of 13 individuals who lived in what is today known as Lebanon between the 3rd and 13th centuries CE. These include nine individuals from the “Crusaders’ pit” in Sidon, a mass burial in South Lebanon identified from the archaeology as the grave of Crusaders killed during a battle in the 13th century CE. We show that all of the Crusaders’ pit individuals were males; some were Western Europeans from diverse origins, some were locals (genetically indistinguishable from present-day Lebanese), and two individuals were a mixture of European and Near Eastern ancestries, providing direct evidence that the Crusaders admixed with the local population. However, these mixtures appear to have had limited genetic consequences since signals of admixture with Europeans are not significant in any Lebanese group today—in particular, Lebanese Christians are today genetically similar to local people who lived during the Roman period which preceded the Crusades by more than four centuries.

(https://i.imgur.com/fC9yLJQ.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: filipi Април 25, 2019, 04:00:00 поподне
Megalitske grobnice u zapadnoj i sjevernoj neolitskoj Evropi.
I2a2 i I2a1b

https://www.pnas.org/content/early/2019/04/09/1818037116/tab-figures-data
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милан Петровић Април 25, 2019, 04:15:14 поподне
Megalitske grobnice u zapadnoj i sjevernoj neolitskoj Evropi.
I2a2 i I2a1b

https://www.pnas.org/content/early/2019/04/09/1818037116/tab-figures-data

Ови I2a1b су наши преци?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: filipi Април 25, 2019, 04:29:53 поподне
Ови I2a1b су наши преци?
Da, samo malo dalji :)

https://www.yfull.com/arch-3.07/tree/I2a1b/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милан Петровић Април 25, 2019, 04:35:39 поподне
Da, samo malo dalji :)

https://www.yfull.com/arch-3.07/tree/I2a1b/


То је сјајно. :)
Заиста су живели у ширем подручју Догерленда.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: filipi Април 25, 2019, 04:44:14 поподне

То је сјајно. :)
Заиста су живели у ширем подручју Догерленда.
To je stablo M423 TMRCA oko 13900 godina. Ne samo to, vec i nas mladji predak u tom stablu L621, TMRCA oko 6500 godina, tj njegovi potomci, su zivjeli i na Britanskim ostrvima i sirom centralne i zapadne Evrope, pa do Bjelorusije.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ДушанВучко Април 26, 2019, 02:25:42 пре подне

То је сјајно. :)
Заиста су живели у ширем подручју Догерленда.
(https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d5/Doggerland3er.png/1280px-Doggerland3er.png)
https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=23.msg17773#msg17773
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милан Петровић Април 26, 2019, 02:39:49 пре подне
(https://scontent.fbeg9-1.fna.fbcdn.net/v/t1.0-9/fr/cp0/e15/q65/51739608_2143523339034500_9177125323660066816_o.jpg?_nc_cat=103&efg=eyJpIjoidCJ9&_nc_ht=scontent.fbeg9-1.fna&oh=103ed5d0ae65bcde6a8b059c41d4affd&oe=5D37A754)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Мај 08, 2019, 05:29:31 поподне
Један рад о масовној гробници из периода 2880-2776 п.н.е. (Globular Amphora Culture), код села Кошице у јужној Пољској. Занимљиво да је хаплогрупа пронађена код 8 мушкараца, уједно и једина, I2a-M223>L801 (https://www.yfull.com/tree/I-L801/).

https://www.pnas.org/content/early/2019/04/30/1820210116

(https://4.bp.blogspot.com/-Q7sYVzsPWsE/XNFK_nmpdEI/AAAAAAAAH0c/XlGVsjTfwmgYJ--55p-JLIrWWhWJfxvpwCLcBGAs/s1600/Late_Neolithic_mass_grave_Fig_3.jpg)

(https://i.postimg.cc/63FLhhYx/20190508-180343.jpg)

(https://i.postimg.cc/pXfYDzj3/20190508-180410.jpg)

Ако је рачуница на Yfull-у: TMRCA CI 95% 4900<->3300 ybp, онда је ово матично подручје целе I2a-L801.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Иван Вукићевић Мај 08, 2019, 07:19:29 поподне
Један рад о масовној гробници из периода 2880-2776 п.н.е. (Globular Amphora Culture), код села Кошице у јужној Пољској. Занимљиво да је хаплогрупа пронађена код 8 мушкараца, уједно и једина, I2a-M223>L801 (https://www.yfull.com/tree/I-L801/).

Постоји могућност да су само тестирали до сада познате гране (попут YSEQ панела). Могуће је да су L801* тј. да припадају подграни која још увек није именована.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Мај 08, 2019, 07:41:13 поподне
Постоји могућност да су само тестирали до сада познате гране (попут YSEQ панела). Могуће је да су L801* тј. да припадају подграни која још увек није именована.

Ако узмемо процену Yfull-а као тачну, онда је ово сам почетак овог СНП-а, што значи да је за то време, последњи у низу и да нема низводних грана.

Иначе овде се види да је реч о једној породици: мајци старој око 60 година и четворица синова, старих од 40 до 20 година. Тројица су сигурно ожењени и двојица старијих имају по двоје деце (6,14,16 и 17 година), млађи једно дете, старо 2 године, а најмлађи изгледа није био жењен. Штрче једна жена стара око 35 година и мушко дете, старо око 2 године, исте хаплогрупе као остали мушкарци, али митахондријске днк која није нађена у групи.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милан Петровић Мај 08, 2019, 07:48:04 поподне
Шта их је убило, некаква епидемија?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Мај 08, 2019, 07:50:45 поподне
Шта их је убило, некаква епидемија?

Пише у тексту. Убијени су ударцима у главу. Не може се поуздано рећи да ли су убијени од стране степских придошлица или у неком међусобном сукобу.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Иван Вукићевић Мај 08, 2019, 08:00:06 поподне
Ако узмемо процену Yfull-а као тачну, онда је ово сам почетак овог СНП-а, што значи да је за то време, последњи у низу и да нема низводних грана.

У тексту се не спомиње да нису успели да издвоје баш ниједну подграну за ову породицу нити да су се тиме уопште бавили.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Мај 23, 2019, 02:00:04 поподне
Нови рад са археогенетским узорцима из бронзаног и гвозденог доба Естоније и Ингрије (околина Санкт Петербурга, Русија). Занимљив је због прве појаве N1-M178 хаплогрупе (бивши N1c) у оквиру гвозденог доба, која је представљена својим подгранама L392/L1026 и још низводнијом L550; аутори претпостављају да припадници N1 хаплогрупе на те просторе долазе током гвозденог доба као говорници уралских језика (од којих су настали естонски, фински и њима сродни језици). Примећује се изразита доминација R1a хаплогрупе (Балтословени), извучене су и неке ниже подгране које су учествовале у каснијој словенској етногенези - YP340 и Y2902 (обе испод Z280>CTS1211); такође је приметно потпуно одсуство хаплогрупе I.

https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(19)30424-5?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0960982219304245%3Fshowall%3Dtrue#secsectitle1180
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Јун 21, 2019, 10:42:48 поподне
Нови рад о критској аутозомалној генетици:

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/ahg.12328

Занимљиво је присуство потенцијалне аутозомалне ДНК која би могла да се повеже са Словенима:

"(3) evidence of a genetic relationship among the Cretans and Central, Northern, and Eastern Europeans, which could be explained by the settlement in the island of northern origin tribes during the medieval period

"The results of the ALDER analysis suggest that settlers from the North reached Crete between the third and the 13th centuries C.E. This time frame is compatible with either the Goths reaching Crete in the fourth to sixth centuries or the Slavs in the seventh century or with Byzantines resettling populations on the island the 10th century C.E.
"
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Србин Јун 30, 2019, 12:19:16 пре подне
Објављен препринт предстојећег рада Bennet et al. "The origin of the Gravettians: genomic evidence from a 36,000-year-old Eastern 2 European" на bioRxiv-у.

Link: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/685404v1 (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/685404v1)

Рад се бави испитивањем порекла становништва везаног за млађепалеолитску културу Граветијена. У питању је локалитет Буран Каја III на Криму.

Buran Kaya 3A старости 35775calBP припада мтДНК хаплогрупи N1, односно Y хаплогрупи BT, највероватније CT или C.

Што се тиче аутозомалне анализе интересантна су ова два пасуса.

Цитат
Discussion

The results of the genome-wide analysis of BuranKaya3A offer important evidence linking the
previously established genetic signature of the manufacturers of the Gravettian in Central Europe
to a much earlier appearance of the Gravettian in Eastern Europe. The absence of the “Common
West Eurasian” ancestry, as represented by Villabruna, in BuranKaya3A marks a key genetic
distinction between the Gravettian inhabitants of Buran-Kaya III, possibly including the broader
populations of EUP Eastern Europe as well, and the UP populations of Western and Central
Europe, which is characterized by a West-to-East reduction in “Common West Eurasian” ancestry
(seen in Extended Data Figure 10). The association we show here of this eastern genetic character
with the cultural material of the Gravettian of Buran-Kaya III, which has been compared to nearby
contemporaneous Early Upper Palaeolithic assemblages from the Caucasus indicated in Figure
3, collectively support an eastern advance of AMHs during the EUP into Europe through the
Caucasus as has been previously proposed based on archaeological evidence alone. Such a
population would have had to have split from the settlers of Central Europe and the Mediterranean
prior to their acquisition of the Common West Eurasian component as represented by Villabruna.
In this scenario, the technical adaptations required for the challenging environment of the open
Eastern European plains, a dryer landscape with little natural shelter, as well as possible cultural
exchanges with local populations, may have played a role in the development of the Early
Gravettian industry. The individuals recently characterized genetically from layer C of
Dzudzuana cave in the Caucasus (data not yet available), who were found to contain ancestry (both
Basal Eurasian and Common West Eurasian) that was absent ca. 9,000 years earlier in Crimea,
may represent more recent immigration into Eastern Europe. A higher resolution of these
movements awaits genetic analysis of more EUP and MUP sites from this region.

Цитат
Low Common West Eurasian ancestry in UP Eastern Europe

Ancestry from a population which split from all non-Africans prior to their separation from each
other, termed Basal Eurasian, had not been known in Europe until after the Last Glacial Maximum
(LGM). However, two 24,000-27,000-year-old (cal BP) individuals from layer C at Dzudzuana
Cave in the southern Caucasus have recently been reported to share ~70% common ancestry with
Villabruna and ~30% ancestry deriving from this Basal-Eurasian source. Additionally, varying
layers of Villabruna ancestry, which did not enter Europe in an unmixed form prior to ca. 14,000
years ago (cal BP), have been found in members of the Gravettian Vestonice cluster as well as
the Magdalenian El Miron cluster, indicating a degree of shared ancestry in these groups with a
“Common West Eurasian” population. We calculated the relative level of Basal Eurasian
ancestry using D-statistic D(EUP East Asian, UP, Ust-Ishim, Mbuti), where a positive value
indicates Basal Eurasian ancestry as allele sharing between the UP individual and Africans. This
analysis showed BuranKaya3A, like other pre-LGM UP Europeans, to be lacking Basal Eurasian
ancestry (Extended Data Figure 9). Similar tests examine the relative affinities of Palaeolithic and
Mesolithic populations to Villabruna as opposed to either modern East Asians, D(x, Han;
Villabruna, Mbuti), or BuranKaya3A, D(x, BuranKaya3A; Villabruna, Mbuti) (Extended Data
Figures 10 and 11, respectively). These results show levels of Villabruna ancestry in Eastern
European EUP individuals (Sunghir3, Kostenki12, Kostenki14, and BuranKaya3A) below that of
later UP Central and Western Europeans from Gravettian contexts (the Vestonice cluster).
Intriguingly, this includes a proportion of shared ancestry with Villabruna in BuranKaya3A similar
to that found in Ust-Ishim and both ancient and modern East Asians (Extended Data Figures 10
and 11), which should be insignificant based on previous admixturegraph analysis.

Буран Каја А3 не поседује ни BE (Basal Eurasian/Базални Евроазијат) ни CWE (Common West Eurasian/Општи Западни Евроазијат) компоненту у свом аутозомалном саставу што сугерише да се ради о популацијама које су се одвојиле раније од оних са уделом CWE компоненте (централноевропски Граветијен Вестонице и западноевропски Магдаленијен Ел Мирон) а што подржава стабло из Лазаридисовог препринта рада о Дзудзуани (CWE и Сунгир3/Костенки14 се одвојили од WE).

Највише CWE имају Лошбур и Бишон, са друге стране та компонента је најмање заступљена код БуранКајаА3, Уст-Ишим те код древних и савремених Источних Азијата.

Од запада ка истоку постоји градација смањења удела CWE што одговара већој заступљености архаичних популација старијег слоја у Источној Европи за време горњег Палеолита. Поменуто би требало да наведе на претпоставку да се миграција популација везаних за CWE са истока на запад десила релативно брзо јер у супротном имали би много већи удео старијих компоненти и на западу.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Јун 30, 2019, 06:59:23 поподне
Нови рад о Неандерталцима, Денисовцима, архаичним и модерним људима...

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/674986v1
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Јул 03, 2019, 11:46:37 поподне
Рад о археогенетским резултатима становника древног филистејског града Ашкелона (касно бронзано-рано гвоздено доба); аутозомалним анализама је доказано да Филистејци заиста потичу из Европе, односно да су досељеници из времена касног бронзаног доба на тло Палестине. Рађене су и мтДНК и Y-ДНК анализе, мада што се тиче ових последњих нажалост нису успели да издвоје неке смисленије и ниже подгране (издвојене су само код 4 индивидуе - Ј, R1, BT и L).

https://advances.sciencemag.org/content/5/7/eaax0061

https://www.sciencemag.org/news/2019/07/biblical-philistines-archenemies-ancient-israelites-hailed-europe-dna-reveals
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Јул 04, 2019, 12:11:18 поподне
Рад о археогенетским резултатима становника древног филистејског града Ашкелона (касно бронзано-рано гвоздено доба); аутозомалним анализама је доказано да Филистејци заиста потичу из Европе, односно да су досељеници из времена касног бронзаног доба на тло Палестине. Рађене су и мтДНК и Y-ДНК анализе, мада што се тиче ових последњих нажалост нису успели да издвоје неке смисленије и ниже подгране (издвојене су само код 4 индивидуе - Ј, R1, BT и L).

https://advances.sciencemag.org/content/5/7/eaax0061

https://www.sciencemag.org/news/2019/07/biblical-philistines-archenemies-ancient-israelites-hailed-europe-dna-reveals

Допуна за Филистејце:

Ted Kandell је поделио везу у групи: Ancient DNA.
1 сат · Ashqelon, Израел ·
Corrected Y-DNA for the Philistines:
ASH008 ASH066 J-Z2331
ASH067 R1b-M269
ASH087 L-M20


https://docs.google.com/spreadsheets/d/1A1j-n_jDGYYN7tUHGFBkj6x4ohzYr987spqa_SILPJo/edit?#gid=894106243
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Јул 04, 2019, 02:10:37 поподне
Допуна за Филистејце:

Ted Kandell је поделио везу у групи: Ancient DNA.
1 сат · Ashqelon, Израел ·
Corrected Y-DNA for the Philistines:
ASH008 ASH066 J-Z2331
ASH067 R1b-M269
ASH087 L-M20


https://docs.google.com/spreadsheets/d/1A1j-n_jDGYYN7tUHGFBkj6x4ohzYr987spqa_SILPJo/edit?#gid=894106243

Хвала Ниџа, ово је право моћно! 8)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Јул 12, 2019, 01:07:55 пре подне
Нови рад о Скитима, од бронзаног преко гвозденог доба па све до черњаховске културе (3-4. век н.е.). Тестирано је пет временски и територијално различитих популација Скита:

https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(19)30712-2

Што се тиче Y-ДНК, издвојене су следеће хаплогрупе:

https://www.cell.com/cms/10.1016/j.cub.2019.06.019/attachment/d57f7395-4faf-4f6c-8d38-7d30448193d8/mmc1

Занимљиво је присуство скандинавске R1a-Z284>S4458>S5301 (у раду означена као R1a1e-CTS1123) међу јужноуралским Скитима. R1a (више грана, међу којима и Z93) је свакако најбројнија, јавља се и Q1-L332, E1b-M84, J1-P58 и J2a.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Јул 12, 2019, 05:33:58 поподне
Нови рад о Скитима, од бронзаног преко гвозденог доба па све до черњаховске културе (3-4. век н.е.). Тестирано је пет временски и територијално различитих популација Скита:

https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(19)30712-2

Што се тиче Y-ДНК, издвојене су следеће хаплогрупе:

https://www.cell.com/cms/10.1016/j.cub.2019.06.019/attachment/d57f7395-4faf-4f6c-8d38-7d30448193d8/mmc1

Занимљиво је присуство скандинавске R1a-Z284>S4458>S5301 (у раду означена као R1a1e-CTS1123) међу јужноуралским Скитима. R1a (више грана, међу којима и Z93) је свакако најбројнија, јавља се и Q1-L332, E1b-M84, J1-P58 и J2a.

Исправка Теда Кандела у вези с овим радом и занимљива вест за све који се занимају за J1 хаплогрупу:

"MJ-52, a Scythian from Kazakhstan, from the 8th–5th century BCE Tasmola culture, is J1-L620*, not J1-P58 as stated in the Jarve et al. (2019) study.
In spite of being derived for (J1-P58 equivalent) PF4693;Z2357;YSC0000168;AM01307+,
he's ancestral for (J1-P58 equivalent)
CTS4823;PF4841;AM01315-
He's derived down to J-L620, but ancestral for:
J-L136 equivalents:
AM01332;Z2369;PF4821-
AM01308;CTS3101-
J-FGC6065 equivalents:
Y19466-
J-FGC6031 equivalents:
FGC6126-
FGC6068-
FGC6167-
The J SNP calls are here:
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1fgYZWBXjs91U_ecd2jWm9m4rJ9MRhb2ZWKFNJQebHyA/edit?usp=sharing
https://yfull.com/tree/J-L620/
The study:
https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(19)30712-2
He's mtDNA A23, which is today found only in Iran and Siberia.
"
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ДушанВучко Јул 13, 2019, 05:47:12 поподне


Занимљиво је присуство скандинавске R1a-Z284>S4458>S5301 (у раду означена као R1a1e-CTS1123) међу јужноуралским Скитима. R1a (више грана, међу којима и Z93) је свакако најбројнија, јавља се и Q1-L332, E1b-M84, J1-P58 и J2a.
Јел би могло присуство ове скандинавксе гране међу јужноуралским Скитима да име везе са овим?:
"This study confirms that Europe is important, but also that a parallel influence from the east and towards northern Scandinavia exists,” says Prescott, who was not involved in the new study. He is an archaeologist and an expert in The new stone age and The bronze age.

The results confirm that northern countries were not an Arctic dead end, but could have been a melting pot of people from continental Europe and the Urals, who brought new technologies like ceramics from as far away as China.

The results confirm that northern countries were not an Arctic dead end, but could have been a melting pot of people from continental Europe and the Urals, who brought new technologies like ceramics from as far away as China."

Ако је било контаката Скандинаваца са људима са Урала у бронзаном добу, можда је неки ген отишао назад, за Урал?
http://sciencenordic.com/first-scandinavians-came-north-and-south
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Јул 14, 2019, 12:30:53 пре подне
Ако је било контаката Скандинаваца са људима са Урала у бронзаном добу, можда је неки ген отишао назад, за Урал?
http://sciencenordic.com/first-scandinavians-came-north-and-south

Могуће, мада није искључено да су погрешили у одређивању, као за онај J1-L620*, за који су написали да је J1-P58.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Сол Октобар 14, 2019, 07:35:41 поподне
да ли су негде објављени резултати ...The analysis revealed that the skulls belonged to three malnourished males, between the ages of 14 and 16, who had lived between 415 and 560 A.D. There were no signs of violent death.

DNA testing revealed the flat-topped skull hailed from somewhere in the Middle East, northern Africa or southeastern Europe. The egg-shaped skull belonged to someone from East Asia. The unaltered skull likely came from a person of west Eurasian ancestry. Their genes were relatively unmixed, suggesting they had moved from these places or their parents had....?

Cranial deformation and genetic diversity in three adolescent male individuals from the Great Migration Period from Osijek, eastern Croatia
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Be like Bill Октобар 14, 2019, 08:39:48 поподне
да ли су негде објављени резултати ...The analysis revealed that the skulls belonged to three malnourished males, between the ages of 14 and 16, who had lived between 415 and 560 A.D. There were no signs of violent death.

DNA testing revealed the flat-topped skull hailed from somewhere in the Middle East, northern Africa or southeastern Europe. The egg-shaped skull belonged to someone from East Asia. The unaltered skull likely came from a person of west Eurasian ancestry. Their genes were relatively unmixed, suggesting they had moved from these places or their parents had....?

Cranial deformation and genetic diversity in three adolescent male individuals from the Great Migration Period from Osijek, eastern Croatia

Jesu, nešto sam ja pisao o tome, ali nisu izvučeni Y-DNK profili, samo autosomalni

https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=3.msg122174#msg122174
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Сол Октобар 14, 2019, 08:53:07 поподне
Jesu, nešto sam ja pisao o tome, ali nisu izvučeni Y-DNK profili, samo autosomalni

https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=3.msg122174#msg122174

Хвала radon-е!  :)

Да ли можда знаш из ког је рада налаз ратника Ј1 (такође из миграционог времена у Славонији) ?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Be like Bill Октобар 14, 2019, 08:54:51 поподне
Хвала radon-е!  :)

Да ли можда знаш из ког је рада налаз ратника Ј1 (такође из миграционог времена у Славонији) ?

Da budem iskren ne znam za nekog J1 ratnika iz Slavonije. Moguće da sam propustio nešto. Jedino što mi pada na pamet jeste J1 sahranjen sa mađarskim kraljevima, verovatno CTS1460
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Be like Bill Октобар 14, 2019, 09:01:40 поподне
Postoji jedan rad za koji se ne sećam da smo ga pominjali. U pitanju su ostaci sa franačkog groblja u Holandiji. Iz nekih razloga, između ostalih i zbog konjske opreme sahranjene sa njima pretpostavljaju da bi se moglo raditi o Avarima, iako su po svemu sudeći duže vreme živeli na prostoru gde su sahranjeni. U pitanju su dva J2a i jedan J2b. Ni jedna od tih grupa nije baš nešto česta u današnjoj Holandiji pa su rezultati zato još zanimljiviji. Rad je inače star četiri godine, iz 2015 godine.

https://j2-m172.info/2015/04/three-j2-found-at-merovingian-buriel-site-roman-frankish-transitional-period/

Цитат
When they talk about Avar like equipment its just that: Avar like, not directly Avar but like it. What comes to mind to me is Sarmatian and/or Thracian horsemen for instance in Roman service. The paper does show the dispersal of these type of equipment along the Rhine Danube frontier. It is known that in the Maastricht area Roman cavalry was stationed. There is no Dutch history telling us of any Avar invasions and in this research which is done with great precision there isn’t a single clue regarding any forceful occupation of any faction or battle or anything to suggest an Avar invasion. Frankish Avar wars occur much later in the Karolingian era. In the Netherlands there are sites that show massive damage that occurred from Germanic assaults on Roman villas and/or castras. Stuff like that is not the case here. They buried among locals, their wifes are locals, their children are locals. The graves were also repeatedly in use so other generations were added to it. Everything is consistent with late Roman early Middle Ages transitional period. Locals wouldn’t have their attackers among them in their graves, this isn’t logical. The reason the researchers put forth this theory instead of an Avar invasion/occupation/replacement is simply because no Avar ‘invasion’ evidence exists. This research covered basically everything there is to research about the grave-site, some type of occupation/replacement would certainly have showed up. What is documented in Dutch history however is the presence of Roman horsemen/legionnaires/farmers from many different J2 rich areas. To me this papers makes a lot of sense as it jives with pretty much everything I’ve been saying for a while now. From the J2b2 indirect descendants of Charlemagne, to the Trojan Frankish origin myth, the descriptions of Tacitus of Asciburgium, Romans Christianity, Equitates, etc. The authors are political/smart enough to not make a definite claim regarding their origins but like I said they do say that the positioning of the burial field right on the main building of the Roman complex is meaningful. It sure does sound logical to me.
Regarding ethnic connections: There is this well known pre-Merovingian figure from the same area: Saint Servatius. He was born in Armenia and died prob. 384 AD in Maastricht

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Новембар 07, 2019, 09:16:20 поподне

Ancient Rome: A genetic crossroads of Europe and the Mediterranean (https://sci-hub.tw/10.1126/science.aay6826)

Цитат
Ancient Rome was the capital of an empire of ~70 million inhabitants, but little is known about the
genetics of ancient Romans. Here we present 127 genomes from 29 archaeological sites in and around
Rome, spanning the past 12,000 years.
We observe two major prehistoric ancestry transitions: one with
the introduction of farming and another prior to the Iron Age. By the founding of Rome, the genetic
composition of the region approximated that of modern Mediterranean populations. During the Imperial
period, Rome’s population received net immigration from the Near East, followed by an increase in
genetic contributions from Europe. These ancestry shifts mirrored the geopolitical affiliations of Rome
and were accompanied by marked interindividual diversity, reflecting gene flow from across the
Mediterranean, Europe, and North Africa.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Новембар 07, 2019, 09:59:51 поподне
Ancient Rome: A genetic crossroads of Europe and the Mediterranean (https://sci-hub.tw/10.1126/science.aay6826)

 Код латинских племена очекивано доминира R1b, но занимљиво једини етрурски Y-днк је J-M12 (J-L283 вјероватно ?), E-V13 нема чак ни у доба Принципата на солидном узорку, тек у позној антици један. J-L26 у неолиту..
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Новембар 08, 2019, 09:00:58 пре подне
Ексел табела са древним узорцима из овог рада:

https://docs.google.com/spreadsheets/d/1hH1c-vKI6kdkXRrPKiYmD3ICkDpMjaO_fixBA0iGAxo/edit
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Новембар 08, 2019, 10:55:59 пре подне
Ексел табела са древним узорцима из овог рада:

https://docs.google.com/spreadsheets/d/1hH1c-vKI6kdkXRrPKiYmD3ICkDpMjaO_fixBA0iGAxo/edit

Велики број J узорака. Очекивано присуство J-L70, за коју се и верује да се највише ширила у доба Рима и током грчке колонизације. Штета што ови J-M12 немају дубљу одредницу. С обзиром да видим једног J2b-M241>Z631 (дакле познат дубљи СНП), надаћу се да ова двојица J2b-M12 могу бити и M205. :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Be like Bill Новембар 08, 2019, 11:43:31 пре подне
Велики број J узорака. Очекивано присуство J-L70, за коју се и верује да се највише ширила у доба Рима и током грчке колонизације. Штета што ови J-M12 немају дубљу одредницу. С обзиром да видим једног J2b-M241>Z631 (дакле познат дубљи СНП), надаћу се да ова двојица J2b-M12 могу бити и M205. :)

Koliko vidim, izgleda da ima jedan Y134194. Čestitamo! :)

https://anthrogenica.com/showthread.php?18871-Ancient-Rome-A-genetic-crossroads-of-Europe-and-the-Mediterranean&p=617967&viewfull=1#post617967
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Новембар 08, 2019, 11:49:17 пре подне
Koliko vidim, izgleda da ima jedan Y134194. Čestitamo! :)

https://anthrogenica.com/showthread.php?18871-Ancient-Rome-A-genetic-crossroads-of-Europe-and-the-Mediterranean&p=617967&viewfull=1#post617967

Сад тек видим! Значајна ствар за M205, хвала радоне! Уз ове друге M12 и M241, значајно присуство хаплогрупе J2b. Ови M12 могу бити M12*, има их на ширем медитеранском подручју. Мада, верујем да су нека дубља пдограна.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Новембар 08, 2019, 11:50:27 пре подне
Велики број J узорака. Очекивано присуство J-L70, за коју се и верује да се највише ширила у доба Рима и током грчке колонизације. Штета што ови J-M12 немају дубљу одредницу. С обзиром да видим једног J2b-M241>Z631 (дакле познат дубљи СНП), надаћу се да ова двојица J2b-M12 могу бити и M205. :)

Зор је на теми J2b-M241 написао да је дубља грана од узорка R474 (Етрурац) - J2b2-CTS6190.

https://www.yfull.com/tree/J-CTS6190/

https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=1981.msg124620#msg124620
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Новембар 08, 2019, 12:26:29 поподне
Не знам да ли је неко помињао, али је TMRCA за M205 скочио за 3000 год. Био је око 5000 година, сада је 8300. Не знам да ли се и код других подграна на Yfull десио у задње време овакав скок.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Новембар 08, 2019, 12:48:29 поподне
Не знам да ли је неко помињао, али је TMRCA за M205 скочио за 3000 год. Био је око 5000 година, сада је 8300. Не знам да ли се и код других подграна на Yfull десио у задње време овакав скок.

Како BigY има бољу покривеност, очитао је вероватно већи број СНП-ова, а самим тим и новеле. Изгледа да су Саудијци који су означени као нови на стаблу, заслужни за ово. Прекомпоновање нпр. PH908 стабла TMRCA је пао са 1850 на 1700. Када се погледа у info, види се да је рачуница 1635. Са новим резултатима TMRCA ће расти, али како је у питању млада грана, 1800 ybp је максимум.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Новембар 08, 2019, 12:55:25 поподне
Занимљиво одсуство L43> грана које данас чине највећи део L497 хаплотипова у Италији. Иако су у питању свега три резултата који су L497+, сви су са различитих локација и периода и припадају грани Z726 (https://www.yfull.com/tree/G-Z726/), а два још низводнијој CYS4803 која за разлику од L43> грана има практично одсуство у јужнијим крајевима (Апенини, Балкан) и добрим делом има своје ''чисте'' келтске и германске огранке, присутне у већем броју и у Британији.

Late Antiquity: Z726 (Crypta Balbi)
Late Medieval: Z726>CTS4803>Z6150 (https://www.yfull.com/tree/G-Z6150/)>Z30771 (Villa Magna)
Renaissance:   Z726>CTS4803>S2808>S23438 (https://www.yfull.com/tree/G-S23438/)(Cancelleria)

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 08, 2019, 02:21:43 поподне
Како BigY има бољу покривеност, очитао је вероватно већи број СНП-ова, а самим тим и новеле. Изгледа да су Саудијци који су означени као нови на стаблу, заслужни за ово. Прекомпоновање нпр. PH908 стабла TMRCA је пао са 1850 на 1700. Када се погледа у info, види се да је рачуница 1635. Са новим резултатима TMRCA ће расти, али како је у питању млада грана, 1800 ybp је максимум.

Већа покривеност не би требала да утиче, јер би то све требало бити укалкулисано у формули. Уколико тест са већом или квалитетнијом покривеношћу даје већи број СНП-ова, онда и број СНП-ова по години би требало да се усклади са тим. BigY700 би требао да да 50% више СНП-ова у односу на BigY500. Уколико се за BigY500 рачунало око 150 година по СНП-у, онда би за BigY700 требало рачунати 80 година по СНП-у. И тако за сваки други тест у складу са његовом покривеношћу (Данте Лабс и остали)

У овом конкретном случају, мислим да се ради о таквом неусклађивању, јер су године подигли новоубачени Саудијац и Палестинац (YF17356 и YF13211). Њих двојица имају ненормално много новела у односу на све остале. То једино ако су они нека стара грана,а сви остали млађи на нивоу 5000 година. Треба сачекати сљедеће сређивање стабла.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Новембар 08, 2019, 02:24:35 поподне
Зор је на теми J2b-M241 написао да је дубља грана од узорка R474 (Етрурац) - J2b2-CTS6190.

https://www.yfull.com/tree/J-CTS6190/

 Нашао је Фљор да дијели R474 три SNP-а са Американцем YF03795. Чини се да је J-CTS6190 сасвим етрурска грана (Италија, Португалци).

Иначе,
 R50 , Centocelle, 135-244CE (Imperial Rome) J-M205>Y134194

 J-M205 је већ раније нађен у "римском" контексту (онај гладијатор..).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Be like Bill Новембар 08, 2019, 03:16:40 поподне
Koliko vidim prema autosomalnoj DNK, ovog J2b Y134194 baca između južne Italije, Grčke i Kipra, bliže južnoj Italiji. Možda je testirani već neko vreme bio na tom području pa je treća ili četvrta generacija. Moguće i da je u pitanju neka feničanska DNK koja je samo otišla malo severnije.

https://anthrogenica.com/showthread.php?18871-Ancient-Rome-A-genetic-crossroads-of-Europe-and-the-Mediterranean&p=618080&viewfull=1#post618080

Kad sam vidio onoliko J1 uzoraka, pogotovo CTS5368 pomislio sam da bi tu mogao biti i neki PF7263 ali sad, gledajući mesta koja zauzimaju na grafici, sumnjam u to.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Новембар 08, 2019, 03:22:54 поподне
R437 Latin, Prenestini Tribe, 400 - 200 BCE  R-U152>L2>ZZ48>FGC10543>FGC10530>FGC10536>PR5365 (FTDNA, на YFull-у је само присутна грана R-Y84137 која је испод ZZ48)
R435 Latin, Prenestini Tribe, 600 - 200 BCE, R-Z145
R851 Latin, 800 - 500 BCE,  R-DF90
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Новембар 08, 2019, 03:34:30 поподне
Већа покривеност не би требала да утиче, јер би то све требало бити укалкулисано у формули. Уколико тест са већом или квалитетнијом покривеношћу даје већи број СНП-ова, онда и број СНП-ова по години би требало да се усклади са тим. BigY700 би требао да да 50% више СНП-ова у односу на BigY500. Уколико се за BigY500 рачунало око 150 година по СНП-у, онда би за BigY700 требало рачунати 80 година по СНП-у. И тако за сваки други тест у складу са његовом покривеношћу (Данте Лабс и остали)

У овом конкретном случају, мислим да се ради о таквом неусклађивању, јер су године подигли новоубачени Саудијац и Палестинац (YF17356 и YF13211). Њих двојица имају ненормално много новела у односу на све остале. То једино ако су они нека стара грана,а сви остали млађи на нивоу 5000 година. Треба сачекати сљедеће сређивање стабла.

Да, то је главни проблем, што њих двојица имај по преко 100 СНП-ова, а формула је остала иста.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: сɣнце Новембар 08, 2019, 06:23:03 поподне
Нашао је Фљор да дијели R474 три SNP-а са Американцем YF03795. Чини се да је J-CTS6190 сасвим етрурска грана (Италија, Португалци).

Иначе,
 R50 , Centocelle, 135-244CE (Imperial Rome) J-M205>Y134194

 J-M205 је већ раније нађен у "римском" контексту (онај гладијатор..).

Етрусци су осим Тоскане насељавали и Ретију. У латинским историјским изворима (могу по потреби истражити којим) спомиње се, да су Етрусци избегли у Горе Ретије када су у долине провалили Гали.
Осим тога етрушчански језик веома је сродан с језиком острва Лемнос и с њим твори тзв. тирренску језичну породицу.
Извори говоре о легендама о досељењу Етруска из Грчке, али је и други пут могућ. Генетика може одгонетнути то питање.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Новембар 08, 2019, 07:42:43 поподне
Етрусци су осим Тоскане насељавали и Ретију. У латинским историјским изворима (могу по потреби истражити којим) спомиње се, да су Етрусци избегли у Горе Ретије када су у долине провалили Гали.
Осим тога етрушчански језик веома је сродан с језиком острва Лемнос и с њим твори тзв. тирренску језичну породицу.
Извори говоре о легендама о досељењу Етруска из Грчке, али је и други пут могућ. Генетика може одгонетнути то питање.

 Мислим да се лемнијски језик води као генетски ближи етрурском него и један од њих ретском.

 Албанци углавном тврде да је овај Етрурац није "прави" већ да је "илирског/месапског/дарданског поријекла" (смијешно за Дарданце, изворни Дарданци нису били Илири већ Мези) да би се одбранила теза о доласку J-L283 из степа. Међутим кад се крену истраживати популације, обично чешће хаплогрупе излазе прво, дакле не бих рекао да ће на 50 Етрураца ово остати једини J-L283. Налаз J-L283 код Етрушчана уз налазе J-L283 код Нурагијских Сардињана праве проблем степској теорији. Прво код Сардињана никакве степске R1b (осим R-V88) у то доба нису регистроване.

 Ова грана је опет 3800 г. удаљена од балканских, такођер има један на Сардинији код којег нема позиције за ниже гране. Но и све старије гране J-L283 су разноврсне на Сардинији. Могла би ово бити грана која је остала у Италији ако се иде мојом тезом о доласку J-L283 на Балкан са Бел-Бикер популацијом.

 Што се тиче ретског, занимљив је налаз G-Y8903 на отоку Лемносу, овај Грк мислим није близак никоме. Очекивати је да би за очување тиренске групе језика могла "стајати" нека хаплогрупа/грана. Од неолитске хг. G2a, L497 која је јака у ретским подручјима, а има је и у Италији би могла бити таква, наравно гране L497 су касније учествовале и у келтским миграцијама. Занимљиво јавља се на Лемносу и G-L91 (невген 67 маркера). Дакле неке необичне G2a гране баш на Лемносу. Трећи је неки I1.

 Ако би ишли по доласку Етрураца са истока онда би западни Балкан говорио тиренским дијалектом у то доба, но вјерујем да би се нашле такве паралеле у ономастици Делмата и осталих група да је то случај.
 Опет подсјећам да је онај J-L283 далматски узорак од прије 3600 г. био аутозомално најближи сјеверним Талијанима, па Каталонцима, слично као и узорак прије 3200 г. на мислим јаподском подручју.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Новембар 08, 2019, 10:15:01 поподне
Мислим да се лемнијски језик води као генетски ближи етрурском него и један од њих ретском.

 Албанци углавном тврде да је овај Етрурац није "прави" већ да је "илирског/месапског/дарданског поријекла" (смијешно за Дарданце, изворни Дарданци нису били Илири већ Мези) да би се одбранила теза о доласку J-L283 из степа. Међутим кад се крену истраживати популације, обично чешће хаплогрупе излазе прво, дакле не бих рекао да ће на 50 Етрураца ово остати једини J-L283. Налаз J-L283 код Етрушчана уз налазе J-L283 код Нурагијских Сардињана праве проблем степској теорији. Прво код Сардињана никакве степске R1b (осим R-V88) у то доба нису регистроване.

 Ова грана је опет 3800 г. удаљена од балканских, такођер има један на Сардинији код којег нема позиције за ниже гране. Но и све старије гране J-L283 су разноврсне на Сардинији. Могла би ово бити грана која је остала у Италији ако се иде мојом тезом о доласку J-L283 на Балкан са Бел-Бикер популацијом.

 Што се тиче ретског, занимљив је налаз G-Y8903 на отоку Лемносу, овај Грк мислим није близак никоме. Очекивати је да би за очување тиренске групе језика могла "стајати" нека хаплогрупа/грана. Од неолитске хг. G2a, L497 која је јака у ретским подручјима, а има је и у Италији би могла бити таква, наравно гране L497 су касније учествовале и у келтским миграцијама. Занимљиво јавља се на Лемносу и G-L91 (невген 67 маркера). Дакле неке необичне G2a гране баш на Лемносу. Трећи је неки I1.

 Ако би ишли по доласку Етрураца са истока онда би западни Балкан говорио тиренским дијалектом у то доба, но вјерујем да би се нашле такве паралеле у ономастици Делмата и осталих група да је то случај.
 Опет подсјећам да је онај J-L283 далматски узорак од прије 3600 г. био аутозомално најближи сјеверним Талијанима, па Каталонцима, слично као и узорак прије 3200 г. на мислим јаподском подручју.

Мала дигресија, али је добро питање да ли су "Мези" и Прото-Дарданци били ближи Дачанима и Трачанима или говорницима грчког, фригијског (и његовог наследника - јерменског) и можда пеонског. Самим тим и питање дарданског супстрата остаје отворено; адстрат који је у Дарданију продро са запада је свакако илирски, али је он дефинитивно каснији, из периода касног халштата.

Што се тиче Етрураца, мислим да је јасно да је L283 на простору северне Италије старија од бронзаног доба па се и за етрурски може претпоставити да представља прави староседелачки језик Италије. Везе са лемнијским вероватно датирају још из времена пре доласка индоевропских говорника који су "исекли" групације преиндоевропских језика на подручју Медитерана, не верујем да су последица неког једнократног доласка у време касног бронзаног/раног гвозденог доба, јер ни у археолошком запису нису посведочени трагови такве миграције. Можда је мит о доласку Етрураца са истока (са Лемноса), који се јавља у списима старогрчких аутора, последица неке етрурске легенде о доласку њихових предака на тло Италије морским путем са подручја Егеја, али се та сеоба, ако се догодила, сигурно није збила при крају касног бронзаног доба већ раније. Мислим да би се L283 могла лепо уклопити у миграцију морским путем неке преиндоевропске популације са подручја Егеја и/или западне Анадолије, најкасније током раног бронзаног доба.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Новембар 08, 2019, 10:55:32 поподне
Одсуство, тј занемарљива заступљеност E-V13 међу тестираним узорцима је по мени добар указатељ о начину тј путевима доласка E-V13 у Италију.
Моја претпоставка је да је E-V13 дошао са истока и то преко два главна правца, на северу преко Венецијске низије док је на југу пут водио преко мора грчком и илирском колонизацијом. Када је у питању јужна рута може се јасније говорити и о временским оквирима миграција јер су грчка колонизација и Magna Grecia историјски добро описани.

Кад се ради о северној рути, ту је ситуација мало сложенија али имам итисак да је значајан део E-V13 овом рутом мигрирао након пада Римског царства под притиском Германа и Словена. Наравно верујем да је E-V13 био присутан на северу Италије и пре тога али је тешко проценити удео тог старијег присуства у односу на удео миграција након пада римског царства.

У склопу ове дискусије интересантно је и присуство моје гране E-Z16988>A11837 на Сардинији при чему TMRCA за A11837 не би смео да буде старији од 2800 година а могао би да буде и доста млађи, нпр 2000 година (то није било могуће израчунати на основу расположивих података).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: сɣнце Новембар 09, 2019, 06:39:08 поподне
Мала приповест о језику етруска / туска

https://www.youtube.com/v/wtzg5uEpiOI

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: filipi Новембар 12, 2019, 03:40:00 поподне
https://www.nature.com/articles/s41598-019-53105-5


Published: 12 November 2019
Y-chromosome haplogroups from Hun, Avar and conquering Hungarian period nomadic people of the Carpathian Basin
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Новембар 12, 2019, 04:38:50 поподне
https://www.nature.com/articles/s41598-019-53105-5


Published: 12 November 2019
Y-chromosome haplogroups from Hun, Avar and conquering Hungarian period nomadic people of the Carpathian Basin

Рад је објављен још априла ове године. Било је доста дискусије. Ја сам очекивао да ће брзо одрадити и неке ниже гране. Пре свега ме је занимала ова I2a-L621 међу мађарском елитом.


Y-chromosome haplogroups from Hun, Avar and conquering Hungarian period nomadic people of the Carpathian Basin
 (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/597997v1)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: сɣнце Новембар 12, 2019, 05:32:34 поподне
https://www.nature.com/articles/s41598-019-53105-5


Published: 12 November 2019
Y-chromosome haplogroups from Hun, Avar and conquering Hungarian period nomadic people of the Carpathian Basin

Цитат
Hg I2a1a2b-L621 was present in 5 Conqueror samples, and a 6th sample form Magyarhomorog (MH/9) most likely also belongs here
.

Колико разумијем свих шест узорака са истока Мађарске бијаху S17250. Ја сам очекивао више Z17855.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Новембар 12, 2019, 05:41:41 поподне
.

Колико разумијем свих шест узорака са истока Мађарске бијаху S17250. Ја сам очекивао више Z17855.

Мислим да су сви негативни на S17250.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: сɣнце Новембар 12, 2019, 06:04:33 поподне
Мислим да су сви негативни на S17250.

Хвала, Милоше. Не бијах разумио, да L-621 (xS17250) значи исто што и " S17250 – ".
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ДушанВучко Новембар 12, 2019, 11:29:08 поподне
То су вероватно већ асимиловани Словени од стране Мађара са претходног станишта , пре доласка у Панонију, Етелкез (иза Карпата, где су боравили од 850. до 895.)...што може да укаже на брзину асимилације од стране Мађара (када су ови налази мађарских освајача I2a, пре можда само пола века били Словени)
(https://hungaryforyou.files.wordpress.com/2013/05/osmagyar_vandorlas1.jpg?w=300&h=214)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ДушанВучко Новембар 12, 2019, 11:39:00 поподне
Constantine Porphyrogenitus identified Etelköz with the lands where the rivers "Barouch", "Koubou", "Troullos", "Broutos", and "Seretos" run. The identification of the last three rivers with the Dniester, the Prut, and the Siret is without debate, but the traditional identification of the Barouch with the Dnieper and the Koubou with the Southern Bug is refuted by Spinei.
https://en.wikipedia.org/wiki/Hungarian_prehistory#Etelköz
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ДушанВучко Новембар 13, 2019, 12:06:31 пре подне
Рад је објављен још априла ове године. Било је доста дискусије. Ја сам очекивао да ће брзо одрадити и неке ниже гране. Пре свега ме је занимала ова I2a-L621 међу мађарском елитом.
Први познати мађарски војвода је био Леведи (по коме је и област добила име Левадија, станиште пре "Етелкеза").
Levedi, or Levedias, Lebedias, and Lebedi[citation needed] was the first known voivode of the Hungarians. Levedi's wife was a Khazar princess, and he was close to the Khazar ruling dynasty. He may himself have been part Khazar. According to Constantine VII Porphyrogenitus' De administrando imperio, the Khazars sought to make Levedi the paramount ruler of all the Hungarian tribes, but he refused, possibly because he was childless or because his close ties to the Khazar government were resented by other Magyar leaders. Instead, Levedi proposed Álmos and his son Árpád as leaders of the Magyars.
 Porphyrogenitus's narration suggests that Levedi was born between around 800 and 815, because he seems to have been older than Álmos who was born in the 820s. Levedi bore the title "voivode", which is of Slavic origin. When using that title, Porphyrogenitus always referred to the heads of the seven Magyar tribes.
https://en.wikipedia.org/wiki/Levedi
Занимљиво је што су по овоме, Мађари још од периода пре доласка у Панонију усвојили словенски појам "војвода" ...Ако су усвојили сам појам, морали су да буду у контакту са словенском елитом која је користила тај назив, па су преузели појам, а можда и неко од словенске елите је постао део мађарске елите?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ДушанВучко Новембар 13, 2019, 01:09:28 пре подне
Ако су усвојили сам појам, морали су да буду у контакту са словенском елитом која је користила тај назив, па су преузели појам, а можда и неко од словенске елите је постао део мађарске елите?
Назив титуле се не преузима без носиоца саме титуле...Занимљиво је да се код Леведија не наводи стриктно етничко порекло , него само то да је био близак хазарским властима, да је био ожењен Хазарком и да су га Хазари поставили као вођу Мађара (а да је он сам препустио вођство Алмошу)...па је моја претпоставка да би Леведи могао бити неко од словеских војвода, тј, представник ловенске елите који је ушао у хазарску владајућу елиту женидбом за хазарску принцезу и који би био постављен од стране Хазара, за владара над Мађарима у време њиховог боравка под Хазарима
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ДушанВучко Новембар 13, 2019, 01:25:39 пре подне
Оно што сам из овога могао да закључим је: 1. Леведи, који је рођен почетком деветог века, се помиње да је био ожењен хазарском принцезом, близак хазарским властима, али његова етничка припадност се не помиње...2. Леведи је био први мађарски војвода...3. Хазари су га поставили за вођу Мађара и имао је титулу војводе...4. Војвода је словенски појам...4. Имамо словенску хаплогрупу међу мађарским освајачима (мађарском елитом) на истоку Мађарске на крају деветог века
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Новембар 15, 2019, 10:25:56 пре подне
Ancient Rome: A genetic crossroads of Europe and the Mediterranean (https://sci-hub.tw/10.1126/science.aay6826)

Ево табеле са обрађеним BAM фајловима, где се могу видети ниже гране.

https://docs.google.com/spreadsheets/d/1O9jAuIMfvYThj97rHFE5-T3sVI6LW5mNdb4ww6RW0J4/htmlview
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Новембар 15, 2019, 02:55:21 поподне
Ево табеле са обрађеним BAM фајловима, где се могу видети ниже гране.

https://docs.google.com/spreadsheets/d/1O9jAuIMfvYThj97rHFE5-T3sVI6LW5mNdb4ww6RW0J4/htmlview

Везано за резултат Етрурца. Зор је нешто већ писао о њему на основу сирових података и хаплогрупе J2a-M241>L283.

Дубља грана је J2a-M241>L283.>Z38240>CTS6190

https://www.yfull.com/tree/J-CTS6190/
https://www.yfull.com/tree/J-Z38240/

Јесте у питању један резултат, али је битан. То је "братска" грана од PH1602, која се јавља на западу Балкана. Ако имамо у виду и археогенетски резултат из Далмације из раног бронзаног доба (1700-1500) J2a-M241>L283, који смо повезали са прото-Илирима, да ли се може рећи да су Етрурци и Илири "два братска народа"?

Мислим да је оно што је писао Зор најближи истини:


 Албанци углавном тврде да је овај Етрурац није "прави" већ да је "илирског/месапског/дарданског поријекла" (смијешно за Дарданце, изворни Дарданци нису били Илири већ Мези) да би се одбранила теза о доласку J-L283 из степа. Међутим кад се крену истраживати популације, обично чешће хаплогрупе излазе прво, дакле не бих рекао да ће на 50 Етрураца ово остати једини J-L283. Налаз J-L283 код Етрушчана уз налазе J-L283 код Нурагијских Сардињана праве проблем степској теорији. Прво код Сардињана никакве степске R1b (осим R-V88) у то доба нису регистроване.

 Ова грана је опет 3800 г. удаљена од балканских, такођер има један на Сардинији код којег нема позиције за ниже гране. Но и све старије гране J-L283 су разноврсне на Сардинији. Могла би ово бити грана која је остала у Италији ако се иде мојом тезом о доласку J-L283 на Балкан са Бел-Бикер популацијом.

 Ако би ишли по доласку Етрураца са истока онда би западни Балкан говорио тиренским дијалектом у то доба, но вјерујем да би се нашле такве паралеле у ономастици Делмата и осталих група да је то случај.
 Опет подсјећам да је онај J-L283 далматски узорак од прије 3600 г. био аутозомално најближи сјеверним Талијанима, па Каталонцима, слично као и узорак прије 3200 г. на мислим јаподском подручју.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Новембар 15, 2019, 03:31:59 поподне

Јесте у питању један резултат, али је битан. То је "братска" грана од PH1602, која се јавља на западу Балкана. Ако имамо у виду и археогенетски резултат из Далмације из раног бронзаног доба (1700-1500) J2a-M241>L283, који смо повезали са прото-Илирима, да ли се може рећи да су Етрурци и Илири "два братска народа"?

Генетски да, али та веза вероватно претходи периоду јаче инфилтрације индоевропских елемената на Балкан и у Италију, током бронзаног доба. Језички нису "браћа", јер је етрурски преиндоевропски изолат док су језици или дијалекти народа који се називају Илирима и Панонцима несумњиво били индоевропски.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Децембар 17, 2019, 03:54:38 поподне
Нови рад о археогенетској слици средњовековних Хазара:

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2019.12.15.876912v1?fbclid=IwAR3loSqMfbL8iY6fHriFAtnoz97IkmFRr_xBBz2BR8tzagqzdORGD4FatCM

Рађене су све врсте анализа, аутосомална, мтДНК и Y-ДНК, у питању су скелети осморице мушкараца и једне жене, сахрањени у курганима, из 8. и 9. века. Што се тиче Y-ДНК, из 4 скелета су успели да извуку довољно материјала за анализу, колико сам приметио, рађене су и SNP и STR анализе (на 17 маркера). На основу STR анализе, одредили су да један скелет припада хаплогрупи Q, један је C3 док су два R1a. SNP анализом су успели само да потврде R1a код двојице наведених индивидуа. Нисам видео да ли су у раду постављени STR маркери, било би добро када би могли некако да дођемо до тих података.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Децембар 17, 2019, 04:52:23 поподне
Нови рад о археогенетској слици средњовековних Хазара:

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2019.12.15.876912v1?fbclid=IwAR3loSqMfbL8iY6fHriFAtnoz97IkmFRr_xBBz2BR8tzagqzdORGD4FatCM

Рађене су све врсте анализа, аутосомална, мтДНК и Y-ДНК, у питању су скелети осморице мушкараца и једне жене, сахрањени у курганима, из 8. и 9. века. Што се тиче Y-ДНК, из 4 скелета су успели да извуку довољно материјала за анализу, колико сам приметио, рађене су и SNP и STR анализе (на 17 маркера). На основу STR анализе, одредили су да један скелет припада хаплогрупи Q, један је C3 док су два R1a. SNP анализом су успели само да потврде R1a код двојице наведених индивидуа. Нисам видео да ли су у раду постављени STR маркери, било би добро када би могли некако да дођемо до тих података.

 Да занимљиво, не видим STR вриједности нигдје а ту бих сигурно имао шта рећи. У старој студији Кљосова и Фалајеве гдје су објављени STR два хазарска узорка. На 17 маркера се могу опредијелити као 1) сигурно R-F2935, вјероватно R-F1019, 2) R-Y57, вјероватно R-Y52.

 Дакле тад је код Хазара нађена само R-Z93. Било би занимљиво видјети јесу ли опет ове гране или нешто треће код R1a, а и која је Q грана. Види се аутозомално јак азијски елемент, у ранијој студији није било аутозомалне ДНК.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: сɣнце Децембар 17, 2019, 05:58:09 поподне
Нови рад о археогенетској слици средњовековних Хазара:

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2019.12.15.876912v1?fbclid=IwAR3loSqMfbL8iY6fHriFAtnoz97IkmFRr_xBBz2BR8tzagqzdORGD4FatCM

Рађене су све врсте анализа, аутосомална, мтДНК и Y-ДНК, у питању су скелети осморице мушкараца и једне жене, сахрањени у курганима, из 8. и 9. века. Што се тиче Y-ДНК, из 4 скелета су успели да извуку довољно материјала за анализу, колико сам приметио, рађене су и SNP и STR анализе (на 17 маркера). На основу STR анализе, одредили су да један скелет припада хаплогрупи Q, један је C3 док су два R1a. SNP анализом су успели само да потврде R1a код двојице наведених индивидуа. Нисам видео да ли су у раду постављени STR маркери, било би добро када би могли некако да дођемо до тих података.

Очекивано. Вјеројатно је ријеч о R1a-Z93.
Q се јавља као честа у Туркмена, но с овом комбинацијом грубо бих предпоставио, да су ови турачки родови поријеклом право са сјеверних дијелова Алтаја и горњега тога Иртиша.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Децембар 17, 2019, 06:37:18 поподне
Да занимљиво, не видим STR вриједности нигдје а ту бих сигурно имао шта рећи. У старој студији Кљосова и Фалајеве гдје су објављени STR два хазарска узорка. На 17 маркера се могу опредијелити као 1) сигурно R-F2935, вјероватно R-F1019, 2) R-Y57, вјероватно R-Y52.

 Дакле тад је код Хазара нађена само R-Z93. Било би занимљиво видјети јесу ли опет ове гране или нешто треће код R1a, а и која је Q грана. Види се аутозомално јак азијски елемент, у ранијој студији није било аутозомалне ДНК.

Такође се јавља и некаква "C3", вероватно је у питању C-L1373 која је раширена код степских номада.

https://yfull.com/tree/C-L1373/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: filipi Јануар 09, 2020, 09:50:33 пре подне

PREDICTION OF Y HAPLOGROUP IN ANALYSIS OF HUMAN SKELETAL REMAINS FROM ARCHAEOLOGICAL SITES IN BOSNIA AND HERZEGOVINA

https://www.researchgate.net/publication/336313137_PREDICTION_OF_Y_HAPLOGROUP_IN_ANALYSIS_OF_HUMAN_SKELETAL_REMAINS_FROM_ARCHAEOLOGICAL_SITES_IN_BOSNIA_AND_HERZEGOVINA

Upravo sam saznao od autora studije, da se radi o DYS448-19, kod svih testiranih I2a.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 09, 2020, 09:59:51 пре подне
PREDICTION OF Y HAPLOGROUP IN ANALYSIS OF HUMAN SKELETAL REMAINS FROM ARCHAEOLOGICAL SITES IN BOSNIA AND HERZEGOVINA

https://www.researchgate.net/publication/336313137_PREDICTION_OF_Y_HAPLOGROUP_IN_ANALYSIS_OF_HUMAN_SKELETAL_REMAINS_FROM_ARCHAEOLOGICAL_SITES_IN_BOSNIA_AND_HERZEGOVINA

Upravo sam saznao od autora studije, da se radi o DYS448-19, kod svih testiranih I2a.

Претпостављам да би ови у Дивичанима требали бити исти остаци из овог прилога од 2015. године.

https://www.youtube.com/v/L_9y7i35KIE
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Јануар 09, 2020, 10:13:11 пре подне
Сјајан налаз. Значи раносредњовековно становништво Босне доминантно I2-PH908, што је и било за очекивати.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Јануар 09, 2020, 10:18:22 пре подне
PREDICTION OF Y HAPLOGROUP IN ANALYSIS OF HUMAN SKELETAL REMAINS FROM ARCHAEOLOGICAL SITES IN BOSNIA AND HERZEGOVINA

https://www.researchgate.net/publication/336313137_PREDICTION_OF_Y_HAPLOGROUP_IN_ANALYSIS_OF_HUMAN_SKELETAL_REMAINS_FROM_ARCHAEOLOGICAL_SITES_IN_BOSNIA_AND_HERZEGOVINA

Upravo sam saznao od autora studije, da se radi o DYS448-19, kod svih testiranih I2a.

"Prediction results from both online software’s used in this study were in concordance, however predictor NEVGEN calculates subgroups of haplogroup I2a. These preliminary results indicate that genetic structure of male population in medieval B&H is similar to the recent one. Our results also showed that both of these software’s can be used for predicting haplogroups, however HAPEST is the recommended one."

Очигледна пристрасност показана према Невгену, с обзиром да је овај Hapest последњи пут ажуриран, по свему судећи, 2013. године.  ::) Али ништа чудно када су у питању комшије.  ;)

Сјајан налаз. Значи раносредњовековно становништво Босне доминантно I2-PH908, што је и било за очекивати.

У Копошићима код Илијаша и Дивичанима код Јајца су истражене некрополе стећака, тако да је ипак у питању касносредњовековно становништво.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 09, 2020, 10:22:01 пре подне
Друго налазиште у Копошићима би требало бити ово

https://www.rtvbn.com/cirilica/3814967/Srednjovjekovni-grad-Dubrovnik-jos-ima-tajni

Ако је тачно ово што Филипи преноси, велики кнез Батић би требао бити I2-PH908

https://bs.wikipedia.org/wiki/Bati%C4%87_Mirkovi%C4%87#cite_note-5

https://www.zemaljskimuzej.ba/en/archaeology/middle-ages/remains-knez-mirko-radojevi%C4%87%E2%80%99s-funerary-shroud

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Јануар 15, 2020, 12:46:59 поподне
Genetic analysis of male Hungarian Conquerors: European and Asian paternal lineages of the conquering Hungarian tribes (https://link.springer.com/article/10.1007/s12520-019-00996-0)
CTS10228 и наравно Невген. ;)
(https://media.springernature.com/full/springer-static/image/art%3A10.1007%2Fs12520-019-00996-0/MediaObjects/12520_2019_996_Fig3_HTML.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Јануар 15, 2020, 01:24:45 поподне
Genetic analysis of male Hungarian Conquerors: European and Asian paternal lineages of the conquering Hungarian tribes (https://link.springer.com/article/10.1007/s12520-019-00996-0)
CTS10228 и наравно Невген. ;)


Ако добро схватам, они претпостављају да је у питању грана  A815 (https://www.yfull.com/tree/I-A815/). Филогенетски низ је
CTS10228>S17250>Y5596>Z16971>Y5595>A815.

Грана је паралелна са A16681, којој припада археогенетски резултат Sungir 6.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Јануар 15, 2020, 01:50:22 поподне
Genetic analysis of male Hungarian Conquerors: European and Asian paternal lineages of the conquering Hungarian tribes (https://link.springer.com/article/10.1007/s12520-019-00996-0)
CTS10228 и наравно Невген. ;)
(https://media.springernature.com/full/springer-static/image/art%3A10.1007%2Fs12520-019-00996-0/MediaObjects/12520_2019_996_Fig3_HTML.png)

Чланак је написан врло квалитетно, колико сам приметио. Анализирана је свака грана понаособ, врло прецизно, са упућивањем на савремене тестиране појединце који припадају дотичним гранама и њихова места порекла, уз осврт на историју, археологију и лингвистику. Овако би један чланак из генетичке генеалогије, науке у развоју, требало да изгледа.

Код I2a-CTS10228 су утврдили да се ради о грани А815, која се налази испод S17250>Y5596>Y16971:

https://www.yfull.com/tree/I-A815/

Тројица тестираних припадника ове гране, који су били у блиским родбинским односима, су изгледа припадали племенској аристократији, односно били главари племена. Улазак у мађарски етнос се десио вероватно на простору Левадије (доњи ток Дона и приобаље Азовског мора), а они су сврстани у "понтску" компоненту (постоје још и "уралска" и "алтајска" компонента). Свакако занимљив развој догађаја.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 15, 2020, 01:57:33 поподне
Genetic analysis of male Hungarian Conquerors: European and Asian paternal lineages of the conquering Hungarian tribes (https://link.springer.com/article/10.1007/s12520-019-00996-0)

Јесмо ли негдје раније овај рад коментарисали у препринту? Нешто су ми ове карте познате.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Јануар 15, 2020, 02:00:22 поподне
Јесмо ли негдје раније овај рад коментарисали у препринту? Нешто су ми ове карте познате.

Требало би да је у питању овај рад:

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/597997v1

Коментарисан овде:

https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=1791.msg112390#msg112390
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Јануар 15, 2020, 02:12:26 поподне
Ови проценти такође показују колико драстично може да се разликује генетска слика једног народа из ранијег (рани Мађари, непосредно након доласка у Панонску низију) и каснијег периода (савремени Мађари).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Одисеј Јануар 15, 2020, 06:19:55 поподне
Ови проценти такође показују колико драстично може да се разликује генетска слика једног народа из ранијег (рани Мађари, непосредно након доласка у Панонску низију) и каснијег периода (савремени Мађари).

Мени је још већа загонетка распоред хаплогрупа међу монголоидима (преци Финаца и Мађара су то дефинитивно били у антрополошком смислу). У источној и југоисточној Азији доминира хаплогрупа О, док исте међу Монголима и Казасима има јако мало (а и то су сигурно монголизирани Хани), код њих доминира Ц хаплогрупа. Сибирски старосједиоци су углавном Q и N, О је скоро непостојећа међу њима. Исто важи и за америчке Индијанце, они су углавном Q.
Ваљда би хаплогрупа О за њих требало да буде нешто слично ономе што је хаплогрупа И или Р1 за нас, нека "општеазијатска" хаплогрупа, с обзиром на њене огромне фреквенције у Јапану, Кини, Кореји, Вијетнаму, Тајланду, Лаосу, Филипинима, Индонезији итд. Међутим, уопште није тако.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Јануар 15, 2020, 11:23:41 поподне
Ови проценти такође показују колико драстично може да се разликује генетска слика једног народа из ранијег (рани Мађари, непосредно након доласка у Панонску низију) и каснијег периода (савремени Мађари).

Мени је овде веома занимљив резултат N3a2-M2118 > PH1612 > PH1896. На Yfull-у постоји тестирани Мађар који припада овој грани. Са једним Турчином из области Хатај дели ову грану. Њихов TMRCA je 1100 година. Иначе Мађар је из области Борсод-Абауј-Земплен, која одговара области где су се археогенетска истраживања вршила. Управо овај узорак је из Tuzsér-Boszorkányhegy/grave 6, која је веома близу области одакле је тестирани Мађар PH1896. Како TMRCA одговара периоду доласка Мађара, овај Мађар би могао бити и директан потомак узорка TBo/6.

https://www.yfull.com/tree/N-PH1896/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ДушанВучко Јануар 16, 2020, 12:10:30 пре подне
Чланак је написан врло квалитетно, колико сам приметио. Анализирана је свака грана понаособ, врло прецизно, са упућивањем на савремене тестиране појединце који припадају дотичним гранама и њихова места порекла, уз осврт на историју, археологију и лингвистику. Овако би један чланак из генетичке генеалогије, науке у развоју, требало да изгледа.

Код I2a-CTS10228 су утврдили да се ради о грани А815, која се налази испод S17250>Y5596>Y16971:

https://www.yfull.com/tree/I-A815/

Тројица тестираних припадника ове гране, који су били у блиским родбинским односима, су изгледа припадали племенској аристократији, односно били главари племена. Улазак у мађарски етнос се десио вероватно на простору Левадије (доњи ток Дона и приобаље Азовског мора), а они су сврстани у "понтску" компоненту (постоје још и "уралска" и "алтајска" компонента). Свакако занимљив развој догађаја.
Meни је занимљиво код словенских хаплогрупа одсуство R1a, a имамо зато I2a...Па се опет враћам на првог мађарског војводу Леведија (који по Порфирогенету и није био мађарског порекла):
Porphyrogenitus's narration suggests that Levedi was born between around 800 and 815, because he seems to have been older than Álmos who was born in the 820s.[7] Levedi bore the title "voivode", which is of Slavic origin.
https://en.wikipedia.org/wiki/Levedi
Војводу Леведија , који је био поглавар мађарских племена је наследио Алмош (са којим није био у сродству, а од Алмоша потиче прва мађарска династија Арпада)

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ДушанВучко Јануар 16, 2020, 12:31:05 пре подне
Леведи можда и није био Словен, али сама титула војводе, говори о некој интеракцији , не толико у смислу самог мешања становништва, него и у смислу титуларног појма "војводе",што значи да је и одређена словенска елита ушла међу Мађаре и пренела и њима тај појам још пре досељавања у Панонију. Па можда и не чуди појављивање ових узорака међу  мађарском елитом код ових налаза, а да су словенског порекла
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Јануар 16, 2020, 01:22:21 пре подне
Ако добро схватам, они претпостављају да је у питању грана  A815 (https://www.yfull.com/tree/I-A815/). Филогенетски низ је
CTS10228>S17250>Y5596>Z16971>Y5595>A815.

Грана је паралелна са A16681, којој припада археогенетски резултат Sungir 6.

Код I2a-CTS10228 су утврдили да се ради о грани А815, која се налази испод S17250>Y5596>Y16971:

https://www.yfull.com/tree/I-A815/

Тројица тестираних припадника ове гране, који су били у блиским родбинским односима, су изгледа припадали племенској аристократији, односно били главари племена. Улазак у мађарски етнос се десио вероватно на простору Левадије (доњи ток Дона и приобаље Азовског мора), а они су сврстани у "понтску" компоненту (постоје још и "уралска" и "алтајска" компонента). Свакако занимљив развој догађаја.

Три од четири скелета мађарских освајача који имају идентичне хаплотипове на доступним маркерима су SNP тестирана, и негативни су на S17250, тако да никако не могу припадати грани А815 која је низводно од S17250. Аутори су у тексту само навели да се један од живућих Мађара који је А815+ разликује на 2 маркера од хаплотипа освајача, што у случају динарика не мора ништа да значи. Невген највећу вероватноћу даје грани Z17855, а збирни хаплотип освајача најближе поклапање у нашој табели има са Ђурицом из Зечева код Кистања (Z17855, род Ђ), од ког се разликује на 2 од 22 упоредива маркера (нисам узимао у обзир оне који имају мање од 23 тестирана маркера).

Међутим, када се у обзир узме распрострањеност гране Z17855, односно њено скоро потпуно одсуство у Мађарској и Централној Европи, чини се да би вероватнија опција била грана Y4460, за коју Невген даје мању вероватноћу али скоро исто високо уклапање као за Z17855. Ова грана се најчешће јавља управо на простору Централне Европе, а на Yfull стаблу има и пет Мађара припадника ове гране.

(https://i.postimg.cc/5tSddhNc/osv.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Јануар 16, 2020, 08:27:01 пре подне
Три од четири скелета мађарских освајача који имају идентичне хаплотипове на доступним маркерима су SNP тестирана, и негативни су на S17250, тако да никако не могу припадати грани А815 која је низводно од S17250. Аутори су у тексту само навели да се један од живућих Мађара који је А815+ разликује на 2 маркера од хаплотипа освајача, што у случају динарика не мора ништа да значи. Невген највећу вероватноћу даје грани Z17855, а збирни хаплотип освајача најближе поклапање у нашој табели има са Ђурицом из Зечева код Кистања (Z17855, род Ђ), од ког се разликује на 2 од 22 упоредива маркера (нисам узимао у обзир оне који имају мање од 23 тестирана маркера).

Међутим, када се у обзир узме распрострањеност гране Z17855, односно њено скоро потпуно одсуство у Мађарској и Централној Европи, чини се да би вероватнија опција била грана Y4460, за коју Невген даје мању вероватноћу али скоро исто високо уклапање као за Z17855. Ова грана се најчешће јавља управо на простору Централне Европе, а на Yfull стаблу има и пет Мађара припадника ове гране.

(https://i.postimg.cc/5tSddhNc/osv.png)

Да, у праву си. У оном прелиминарном тексту је стајало хS17250, дакле негативно. И тада смо као могућу грану спомињали Y4460. Из тог разлога ми се учинило да износе претпоставку, јер и у табели у овом новом раду, најдубља грана која је наведена је CTS10228.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Јануар 16, 2020, 03:35:12 поподне
 K2/16, K2/52, K3/11, K3/12 су по STR вриједностима врло вјероватно негативни на неке гране које се јављају код Мађара:
I-Y4460>Y3106>A6105,  dys19=17 је стара вриједност код ове гране а маркер је спор, +481=29
I-Y4460>SK1241, dys391=10, dys458=18.., има 481=30 али није довољно да индицира неку везу.

 Јавља се још других грана Y4460 у Мађарској, па могуће да постоји веза с њима, али са овима тешко.

 K2/17 из старије студије личи на једног секељског I-Y4882, с њим дијели ријетку комбинацију dys19=15 + dys390=23, ако то нису новије мутације код Секеља онда би могао лако бити I-Y4882.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Voljen od Boga Јануар 16, 2020, 09:09:54 поподне
Ови СТР маркери би могли бити од Y4460 без обзира на многа непоклапања.
Како доћи до снипова ових узорака?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: сɣнце Јануар 17, 2020, 04:42:27 поподне
Чисто ради упоредбе наводим неке историјске упомене о Угрима.

"Народ турков в старину имел жительство вблизи Хазарии, в местности, называемой Леведией по имени первого воеводы их... Они жили три года вместе с хазарами, помогая им во всех войнах... а другая часть (венгров) вместе со своим воеводою и предводителем Леведием поселилась в западной стороне, в местах, называемых Ателькузу, где ныне живет народ печенежский» (Порфирогенит,  гл. 38).

У гл. 40 свога дјела Константин опет говори о области Ателкузу:

«Местность же, где турки жили раньше, называется по имени протекающей там реки Этель и Кузу: ныне там живут печенеги, а турки, прогнанные печенегами, пришли и поселились в той земле, где живут ныне»

Этель, то јест,  Итил је турско назвање Волге.
Послије другога нападења печенега они преходе из Етелкуза у Паноннију 895 — 896.
Нам је важно замјетити, да су се находили у тијесном додиру с источним Словијенима током скоро цијелога IX в.

Сказ Анонима о досељењу Мадјара у Паноннију,  гл.7:
«Глава 7. О выходе венгерских племен с их прародины. В 884 году от рождества Христова, как говорится об этом в хрониках с погодным изложением событий (in аnnalibus... cronicis) семь лиц, имевших княжеское достоинство (principales persone) и называемых [по-венгерски] hetumoger [семь мадьяр], выступили из земли Скифии,  по направлению на запад. В их числе вышел из этой области вождь Альмош, сын Юдьека, из рода короля Магога, муж, оставивший по себе добрую память, бывший их (князей)  господином и советником. Вышел он со своей женой и сыном своим Арпадом, а также с двумя сыновьями своего дяди Хюлека, Совардом и Кадочей, и огромной неисчислимой массой союзных народов.
Много дней шли они через пустынные края, переправились через реку Этиль сидя на бурдюках, как это принято у язычников (super tulbou sedentes ritu paganismo)  и нигде не встретился им путь, который бы вел к городу или человеческому жилью. И не питались они плодами трудов человеческих, как было у (них обычно принято, а утоляли голод мясом и рыбой, пока не вошли в землю Руси (in Rusciam), которую называют Суздаль (Susudal). И юноши их почти каждый день проводили на охоте. Поэтому с тех дней до настоящего времени венгры — лучшие охотники среди других народов. Двигаясь таким образом, вождь Альмош со всеми своими вступил в землю Руси, называемую Суздаль."


Када су дошли до Кијева и хтјели га напасти, дошло је до сражења.  Кијевски владар скупа с Куманима против Угра.  Наводно су их Угри поразили али по милости Алмоша постигли примирје,  након чега им је русски владар нахвалио Паноннију богатством вода и рибе и народа Булгарскога,  Словенскога и Влашкога; Видјевши силу и милост Алмоша њима су се придружили и Кумани. С Алмошем су такође пошли синови кијевскога владара као залог, да их неће напасти, као и мног народ Кијева. 

"Тогда упомянутые выше вожди половцев [следуют имена семи половецких вождей], увидев милость вождя Альмоша, проявленную им по отношению к Русам, упали к его ногам и добровольно подчинились ему, сказав: «С сегодняшнего дня тебя избираем своим господином и повелителем до самого последнего нашего потомства. И куда бы ни повела тебя твоя судьба, всюду мы последуем за тобой». И то, что они сказали на словах вождю Альмошу, они скрепили присягой, поклявшись по языческому обычаю. Вождь Альмош и его вельможи таким же образом связали себя по отношению к ним клятвой и присягой. Тогда эти семь половецких вождей согласились идти в Паннонию вместе со своими женами и детьми, а также с огромной массой [своего народа]. Подобным образом многие из Русов присоединились к вождю Альмошу и пришли с ним в Паннонию. Их потомство до сегодняшнего дня проживает в различных местах Венгрии. "

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Voljen od Boga Јануар 17, 2020, 08:45:23 поподне
.....Conquerors remained between Central Asians and eastern Europeans, with smallest weighted Euclidean distances from Bashkirs (BSH), Hungarians (HUN), Tajiks (TJK), Estonians (EST), Kazakhs (KAZ), Uzbeks (UZB) and Slovaks (SVK).....

....The Avars map to the top right corner, close to eastern Siberian Chukchis (CHK), Yukaghirs (YUK), Eskimos (ESK) and Transbaikalian Buryats (BUR). The Conquerors (CONQ) map to the middle of the graph, very close to eastern European Belorusians (BLR), Ukrainians (UKR), Russians (RUS) and Polish (POL), not far from Volga-Uralic region Bashkirs (BSH), Volga Tatars (TAT), ....

Eurasian paternal lineages is 69 % compared to 58,8% for mtDNA; while proportion of lineages with northwestern European and Caucasus-Middle East origin are nearly the same affirming that both males and females of similar origin migrated together. Both MDS analysis of the entire Conqueror Y chromosome pool and PCA of their N1a lineages indicates that their admixture sources are found among Central Asians and eastern European Pontic Steppe groups, a finding comparable to what had been described for maternal lineages 11. Composition of the Conqueror paternal lineages is very similar to that of Baskhirs, while their maternal composition was found most similar to Volga Tatars 11. These modern populations are located next to each other, have similar prehistory 33 and genetic structure derived from the same admixture sources detected in the Conquerors. Moreover it must be noted that Bashkirs were not represented in the mitogenome database while Volga Tatars are missing from our Ychromosome database due to lack of data, but their N1a distribution is quite similar (Fig. 4), thus mtDNA results are in accord with Y-chromosomal ones.

The Conqueror-Bashkir relations are also supported by historical sources, as early Hungarians of the Carpathian Basin were reported to be identical to Baskhirs by Arabic historians like al-Masudi, al-Qazwini, alBalhi, al-Istahri and Abu Hamid al-Garnati 34, latter visited both groups at the same time around 1150 AD and used the term Bashgird to refer to the Hungarians in the Carpathian Basin. In addition parallels were found between several Conqueror and Bashkir tribe names and Bashkiria has been identified with Magna Hungaria, the motherland of Conquerors 35.

...Population genetic data rather position the Conqueror elite among Turkic groups, Bashkirs and Volga Tatars, in agreement with contemporary historical accounts which denominated the Conquerors as “Turks”38. This does not exclude the possibility that the Hungarian language could also have been present in the obviously very heterogeneous, probably multiethnic Conqueror tribal alliance.
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/597997v1.full.pdf

https://www.youtube.com/v/prxAxTlkOF0

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Јануар 17, 2020, 11:27:16 поподне
Чисто ради упоредбе наводим неке историјске упомене о Угрима.

"Народ турков в старину имел жительство вблизи Хазарии, в местности, называемой Леведией по имени первого воеводы их... Они жили три года вместе с хазарами, помогая им во всех войнах... а другая часть (венгров) вместе со своим воеводою и предводителем Леведием поселилась в западной стороне, в местах, называемых Ателькузу, где ныне живет народ печенежский» (Порфирогенит,  гл. 38).

У гл. 40 свога дјела Константин опет говори о области Ателкузу:

«Местность же, где турки жили раньше, называется по имени протекающей там реки Этель и Кузу: ныне там живут печенеги, а турки, прогнанные печенегами, пришли и поселились в той земле, где живут ныне»

Этель, то јест,  Итил је турско назвање Волге.
Послије другога нападења печенега они преходе из Етелкуза у Паноннију 895 — 896.
Нам је важно замјетити, да су се находили у тијесном додиру с источним Словијенима током скоро цијелога IX в.

Етелкез се налазио западно од Леведије, која је била у доњем току Дона, односно у питању је поречје Дњестра, Прута и Сирета. Свакако не би било ни логично да су се Мађари вратили на исток (до Волге), па онда одатле отишли у Панонију. Сеоба је била постепена али увек ка југозападу, од Магна Хунгарије (подручје данашњег Башкортостана, одакле су их вероватно истиснули преци данашњих Башкира) до Леведије и потом Етелкез и Панонска низија. У Етелкезу су изгледа дошли у сукоб са словенским племеном Тивераца.

https://en.wikipedia.org/wiki/Tivertsi
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 18, 2020, 08:35:38 пре подне
Чини се да је и N-M2019 присутна код једног Хрвата из Задра и Србина из околине Гњилана, ипак дошла са Мађарима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Јануар 22, 2020, 05:48:12 поподне
Genetic insights into the social organisation of the Avar period elite in the 7th century AD Carpathian Basin (https://www.nature.com/articles/s41598-019-57378-8)

Цитат: Abstract
After 568 AD the Avars settled in the Carpathian Basin and founded the Avar Qaganate that was an important power in Central Europe until the 9th century. Part of the Avar society was probably of Asian origin; however, the localisation of their homeland is hampered by the scarcity of historical and archaeological data. Here, we study mitogenome and Y chromosomal variability of twenty-six individuals, a number of them representing a well-characterised elite group buried at the centre of the Carpathian Basin more than a century after the Avar conquest. The studied group has maternal and paternal genetic affinities to several ancient and modern East-Central Asian populations. The majority of the mitochondrial DNA variability represents Asian haplogroups (C, D, F, M, R, Y and Z). The Y-STR variability of the analysed elite males belongs only to five lineages, three N-Tat with mostly Asian parallels and two Q haplotypes. The homogeneity of the Y chromosomes reveals paternal kinship as a cohesive force in the organisation of the Avar elite strata on both social and territorial level. Our results indicate that the Avar elite arrived in the Carpathian Basin as a group of families, and remained mostly endogamous for several generations after the conquest.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Јануар 22, 2020, 06:22:16 поподне
Genetic insights into the social organisation of the Avar period elite in the 7th century AD Carpathian Basin (https://www.nature.com/articles/s41598-019-57378-8)

Изгледа да је ово посебан чланак о аварским скелетима из Мађарске о којима је већ било речи. Колико сам запазио, од 18 тестираних мушких скелета, 16 припада грани N1-TAT>Y16323>F4205, која се јавља и код Бурјата, док два скелета припадају хаплогрупи Q1 и то двема различитим гранама, L713>YP789 и L330. Обе ове гране су присутне и код Срба док аварска N-F4205 засад не бележи присуство. У студији помињу да се ова грана од N1 јавља код Секеља у Ердељу као и код Мађара у Хајду-Бихар жупанији.

https://yfull.com/tree/N-F4205/
https://yfull.com/tree/Q-YP789/
https://yfull.com/tree/Q-L330/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Фебруар 16, 2020, 01:23:59 пре подне
Medieval mummies of Zeleny Yar burial ground in the Arctic Zone of Western Siberia (https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0210718)

Нађене мтдна хаплогрупе:
U5a (#34), H3ao (#53), D (#67–1), U4b1b1 (#67–2), and D4j8 (#68)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Фебруар 25, 2020, 09:00:59 пре подне
The spread of steppe and Iranian-related ancestry in the islands of the western Mediterranean (https://www.nature.com/articles/s41559-020-1102-0)

Steppe-pastoralist-related ancestry reached Central Europe by at least 2500 bc, whereas Iranian farmer-related ancestry was present in Aegean Europe by at least 1900 bc. However, the spread of these ancestries into the western Mediterranean, where they have contributed to many populations that live today, remains poorly understood. Here, we generated genome-wide ancient-DNA data from the Balearic Islands, Sicily and Sardinia, increasing the number of individuals with reported data from 5 to 66. The oldest individual from the Balearic Islands (~2400 bc) carried ancestry from steppe pastoralists that probably derived from west-to-east migration from Iberia, although two later Balearic individuals had less ancestry from steppe pastoralists. In Sicily, steppe pastoralist ancestry arrived by ~2200 bc, in part from Iberia; Iranian-related ancestry arrived by the midsecond millennium bc, contemporary to its previously documented spread to the Aegean; and there was large-scale population replacement after the Bronze Age. In Sardinia, nearly all ancestry derived from the island’s early farmers until the first millennium bc, with the exception of an outlier from the third millennium bc, who had primarily North African ancestry and who—along with an approximately contemporary Iberian—documents widespread Africa-to-Europe gene flow in the Chalcolithic. Major immigration into Sardinia began in the first millennium bc and, at present, no more than 56–62% of Sardinian ancestry is from its first farmers. This value is lower than previous estimates, highlighting that Sardinia, similar to every other region in Europe, has been a stage for major movement and mixtures of people.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Фебруар 25, 2020, 11:56:38 пре подне
The spread of steppe and Iranian-related ancestry in the islands of the western Mediterranean (https://www.nature.com/articles/s41559-020-1102-0)

Steppe-pastoralist-related ancestry reached Central Europe by at least 2500 bc, whereas Iranian farmer-related ancestry was present in Aegean Europe by at least 1900 bc. However, the spread of these ancestries into the western Mediterranean, where they have contributed to many populations that live today, remains poorly understood. Here, we generated genome-wide ancient-DNA data from the Balearic Islands, Sicily and Sardinia, increasing the number of individuals with reported data from 5 to 66. The oldest individual from the Balearic Islands (~2400 bc) carried ancestry from steppe pastoralists that probably derived from west-to-east migration from Iberia, although two later Balearic individuals had less ancestry from steppe pastoralists. In Sicily, steppe pastoralist ancestry arrived by ~2200 bc, in part from Iberia; Iranian-related ancestry arrived by the midsecond millennium bc, contemporary to its previously documented spread to the Aegean; and there was large-scale population replacement after the Bronze Age. In Sardinia, nearly all ancestry derived from the island’s early farmers until the first millennium bc, with the exception of an outlier from the third millennium bc, who had primarily North African ancestry and who—along with an approximately contemporary Iberian—documents widespread Africa-to-Europe gene flow in the Chalcolithic. Major immigration into Sardinia began in the first millennium bc and, at present, no more than 56–62% of Sardinian ancestry is from its first farmers. This value is lower than previous estimates, highlighting that Sardinia, similar to every other region in Europe, has been a stage for major movement and mixtures of people.

Скоро је баш објављен детаљан рад за савремене популације Сардиније и Корзике. Мислим да је западни Медитеран тренутно једно од генетички боље обрађених подручја.

На овом нивоу не видим неке директне везе са нашим просторима. Лазаревић из Рагодеша, Пирот има даље "рођаке" међу бронзанодобским Сардињанима, у оквиру гране G2a-PF3378 https://www.yfull.com/tree/G-PF3378/

Много су значајнији закључци у оквиру аутосомалне днк.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Фебруар 25, 2020, 02:28:46 поподне
Краћи преглед пронађених Y-днк грана из горе постављеног рада, укупно 31 узорак, могуће да ће ентузијасти пронаћи још неке ниже гране, ово  је углавном оно што је званично у самом раду.

I3315   Menorca_LBA   R1b1a1a2a1a2(xR1b1a1a2a1a2c) P312(xZ290) https://www.yfull.com/tree/R-P312/
I3642   Sardinia_Nuragic_BA   G2a2b2b1a1 PF3378 https://www.yfull.com/tree/G-PF3378/
I10364   Sardinia_Nuragic_BA   G2a2b2b1a1 PF3378 https://www.yfull.com/tree/G-PF3378/
I15946   Sardinia_Neolithic   I2a2a M223 https://www.yfull.com/tree/I-M223/
I15947   Sardinia_Neolithic_contam   G2a2b2b PF3359 https://www.yfull.com/tree/G-PF3359/
I15940   Sardinia_Bell_Beaker15940   E1b1b1a M35>L539 https://www.yfull.com/tree/E-L539/
I15941   Sardinia_Bell_Beaker   H2 P96 https://www.yfull.com/tree/H-P96/
I15942   Sardinia_Bell_Beaker   G2a2a1a2a1 L91>PF3239 https://www.yfull.com/tree/G-PF3239/
I16170   Sardinia_Nuragic_BA   I2 M438 https://www.yfull.com/tree/I2/
I16168   Sardinia_Nuragic_BA   H2 H2 P96 https://www.yfull.com/tree/H-P96/
I10553   Sardinia_Nuragic_BA   J2b2a M241>L283 https://yfull.com/tree/J-L283/
I16164   Sardinia_Chalcolithic   G2a2b2b1a1 PF3378 https://www.yfull.com/tree/G-PF3378/
I16166   Sardinia_Chalcolithic   I M170 https://www.yfull.com/tree/I/
I12220   Sardinia_LateAntiquity J M304 https://yfull.com/tree/J/
I12221   Sardinia_EarlyMedieval   E1b1b1b2 Z830 https://www.yfull.com/tree/E-Z830/
I14675   Sardinia_Bell_Beaker   I2a2a2a M223>L1228 https://www.yfull.com/tree/I-PF692/
I14676   Sardinia_Bell_Beaker   I2a2a2a M223>L1228 https://www.yfull.com/tree/I-PF692/
I14677   Sardinia_Bell_Beaker   G2a2a1a2a1 L91>PF3239 https://www.yfull.com/tree/G-PF3239/
I14678   Sardinia_Bell_Beaker   G2a2a1a2a1 L91>PF3239 https://www.yfull.com/tree/G-PF3239/
I3743   Sardinia_Nuragic_BA   R1b1a(xR1b1a1a) L754 (xP297) https://www.yfull.com/tree/R-L754/
I10365   Sardinia_Nuragic_BA10365   G2a2a1a2a1 L91>PF3239 https://www.yfull.com/tree/G-PF3239/
I3123   Sicily_EBA3123   R1b1a1a2a1a2a1  DF27>Z195  https://www.yfull.com/tree/R-Z195/
I11443   Sicily_EBA11443   R1b1a1a2a1a2 (xR1b1a1a2a1a2c) P312(xZ290) https://www.yfull.com/tree/R-P312/
I3124   Sicily_EBA3124   R1b1a1a2a1a2 (xR1b1a1a2a1a2c) P312(xZ290) https://www.yfull.com/tree/R-P312/
I3125   Sicily_MBA3125   G2a2b2a1a1c1a  Z1903 https://www.yfull.com/tree/G-Z1903/
I11442   Sicily_EBA   R1b1a1a2a1a2 (xR1b1a1a2a1a2c) P312(xZ290) https://www.yfull.com/tree/R-P312/
I7796   Sicily_EBA   J M304 https://yfull.com/tree/J/
I4064   Sicily_MN   C1a2 V20 https://www.yfull.com/tree/C-V20/
I8561   Sicily_EBA8561   R1b1a1a2a1a2a1 R1b1a1a2a1a2a1  DF27>Z195  https://www.yfull.com/tree/R-Z195/
I3876   Sicily_LBA   G2a2b2a1a1c1a Z1903 https://www.yfull.com/tree/G-Z1903/
I10373   Sicily_LBA_son.I3878_10373   G2a2b2a1a1c1a Z1903 https://www.yfull.com/tree/G-Z1903/


Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Март 03, 2020, 10:24:48 поподне
Прије пар сати изашао је нови рад о древној ДНК који говори о социокултурном увиду путем дрвене ДНК. Иначе сам рад не доноси нове узорке, већ обрађује тему тако што проучава и сумира раније објављене радове. На брзину сам прелетео/прочитао рад и могу рећи да конкретно нема ништа ново (неолитске и друге миграције, замјене и сеобе становништва и слично).

Beyond broad strokes: sociocultural insights from the study of ancient genomes (https://www.nature.com/articles/s41576-020-0218-z)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Март 03, 2020, 10:39:54 поподне
Прије пар сати изашао је нови рад о древној ДНК који говори о социокултурном увиду путем дрвене ДНК. Иначе сам рад не доноси нове узорке, већ обрађује тему тако што проучава и сумира раније објављене радове. На брзину сам прелетео/прочитао рад и могу рећи да конкретно нема ништа ново (неолитске и друге миграције, замјене и сеобе становништва и слично).

Beyond broad strokes: sociocultural insights from the study of ancient genomes (https://www.nature.com/articles/s41576-020-0218-z)

(https://i.imgur.com/FCbEaUd.png)
ширење пољопривреде Европом
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Март 05, 2020, 11:14:59 поподне
Dzhansugurova, L. B., Dzhantaeva, K. B., Nurzhibek, G. S., Kuzovleva, E. B., Musralina, L. Z., Evinger, S., ... & Khussainova, E. М. (2017). ISOLATION AND ANALYSIS OF ANCIENT DNA FROM HUMAN BONES OF THE HUN PERIOD. БИОЛОГИЯ ЖƏНЕ МЕДИЦИНА СЕРИЯСЫ, 39. (http://nauka-nanrk.kz/ru/assets/assets/журнал%202017%204/Биология_04_2017__Готов.pdf)

Да поменемо овај занимљиви археогенетски рад о хунском племићу који је L-M20 и мтДНА D4j12 хаплогрупе.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Март 14, 2020, 12:39:44 пре подне
Нови рад, тема мезолит и неолит на Сицилији. Само су из 4 узорка извукли Y-ДНК: UZZ40 - I; UZZ81 - I2a2; UZZ33 - H; UZZ61 - C1a2.  Елем линк:

Genomic and dietary transitions during the Mesolithic and Early Neolithic in Sicily (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.11.986158v1.full.pdf)

Supplementary Text Genomic and dietary transitions during the Mesolithic and Early Neolithic in Sicily (https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2020/03/12/2020.03.11.986158/DC1/embed/media-1.pdf?)

Southern Italy is a key region for understanding the agricultural transition in the Mediterranean due to its central position. We present a genomic transect for 19 prehistoric Sicilians that covers the Early Mesolithic to Early Neolithic period. We find that the Early Mesolithic hunter-gatherers (HGs) are a highly drifted sister lineage to Early Holocene western European HGs, whereas a quarter of the Late Mesolithic HGs ancestry is related to HGs from eastern Europe and the Near East. This indicates substantial gene flow from (south-)eastern Europe between the Early and Late Mesolithic. The Early Neolithic farmers are genetically most similar to those from the Balkan and Greece, and carry only a maximum of ~7% ancestry from Sicilian Mesolithic HGs. Ancestry changes match changes in dietary profile and material culture, except for two individuals who may provide tentative initial evidence that HGs adopted elements of farming in Sicily.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Март 26, 2020, 05:29:51 поподне
Нисам проверавао детаље али како стоје ствари у овом раду https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.25.004606v1 је објављен 5100 година стари R1b-L151 из Монголије.
Као што је познато R1b-L151 данас доминира у Западној Европи.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Април 03, 2020, 01:57:54 пре подне
Резултати овог рада бацају светло на многе занимљивости, нарочито што се тиче N хаплогрупе. Изгледа да је једна од главних хаплогрупа Авара била N1-Y16323 (https://yfull.com/tree/N-Y16323/) (СНП-ови B197 и Z35291 у раду), која се данас углавном везује за Бурјате и Чукче у Сибиру а има је и у централној Азији. Мислим да ова подграна још увек није пронађена код садашњих балканских популација, нека ме неко исправи ако грешим. Такође су код Авара присутни и неки N1 који нису ближе дефинисани. Упадљива разлика у односу на хунску Q1-M25 (мислим на однос Q1-N1) која је такође присутна у раду а има је и код данашњих популација на Балкану.

 Чини се да их има ипак, не на Балкану додуше:
1) већ сам помињао један прилично сигурни хаплотип N-Y16323 односно боље речено N-Y16220 (јер се ту десила мутација 391=10<-11) се јавља код Румуна из Констанце (студија о Аромунима).

2)  прото-Аварска грана Q-L330 узорак AC7, по STR вриједностима не може се радити о грани Q-BZ3944 присутној код Мађара. Оно што аутори нису уочили је сличност са два румунска хаплотипа те се може рећи да тај аварски узорак највјероватније припада грани Q-Y12448. Један је из округа Орадеа, други непознато, могуће исто Трансилванија. Невјероватно да нема потомака Авара код Мађара досад (барем не ових који су поуздани) а чини се има их код Румуна. :) Њихово задње велико упориште јесте била Трансилванија тј. ту су се по археолошким доказима у позније аварско временима почели помицати Авари са запада. И овај Румун из Констанце се преко присуства mtdna D у Констанци и у Трансилванији код Румуна могуће може даље повезати са Трансилванијом.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Април 03, 2020, 03:10:34 пре подне
Још један древни N2 узорак, додуше Р189.2-, из рада Sirak et al. 2020 (https://genome.cshlp.org/content/early/2020/03/12/gr.260141.119.abstract):

I14462/I14463; 1000-0 BC; Maanit uul, Ulziit sum, Bayankhongor aimag, Mongolia; Mongolia Bronze Age; N2-Y6503 (xP189.2)

Могуће је да припада грани Y147565 (паралелној са Р189.2), којој припадају и неолитски узорак DA247 са Бајкала, пре-Скитски/Кимерски узорак IR1 из Мађарске и модерни Алтајац ERS2478500 са YFull стабла.
         
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Април 03, 2020, 09:52:18 пре подне
Још један древни N2 узорак, додуше Р189.2-, из рада Sirak et al. 2020 (https://genome.cshlp.org/content/early/2020/03/12/gr.260141.119.abstract):

I14462/I14463; 1000-0 BC; Maanit uul, Ulziit sum, Bayankhongor aimag, Mongolia; Mongolia Bronze Age; N2-Y6503 (xP189.2)

Могуће је да припада грани Y147565 (паралелној са Р189.2), којој припадају и неолитски узорак DA247 са Бајкала, пре-Скитски/Кимерски узорак IR1 из Мађарске и модерни Алтајац ERS2478500 са YFull стабла.

Зна ли се нешто више о околностима налаза, којој археолошкој култури припада узорак и слично?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Април 03, 2020, 11:32:12 пре подне
Зна ли се нешто више о околностима налаза, којој археолошкој култури припада узорак и слично?

У додатним материјалима нема нажалост никаквих детаља о археолошком контексту тестираних скелета, а није рађена чак ни радиокарбонска анализа старости, па су опсези јако велики. Покушао сам пронаћи тај локалитет у помоћним табелама друга два рада о Монголији, али изгледа да у њима нема ниједног тестираног скелета са тог локалитета.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: crni Април 04, 2020, 08:30:48 поподне
Још један древни N2 узорак, додуше Р189.2-, из рада Sirak et al. 2020 (https://genome.cshlp.org/content/early/2020/03/12/gr.260141.119.abstract):

I14462/I14463; 1000-0 BC; Maanit uul, Ulziit sum, Bayankhongor aimag, Mongolia; Mongolia Bronze Age; N2-Y6503 (xP189.2)

Могуће је да припада грани Y147565 (паралелној са Р189.2), којој припадају и неолитски узорак DA247 са Бајкала, пре-Скитски/Кимерски узорак IR1 из Мађарске и модерни Алтајац ERS2478500 са YFull стабла.

mtDNA Haplogroup D4j1 древног монголског N2, према Supplemental Material из овог рада.
https://genome.cshlp.org/content/suppl/2020/03/12/gr.260141.119.DC1/Supplemental_Tables.xlsx
Прве утиске о бронзанодобној археологији покрајине Бајанхонгор (Bayankhongor aimag) као и округа Улзит (Ulziit sum) можемо стећи кроз преглед Чарлз Ронкоса из 2017. године
https://digitalcollections.sit.edu/cgi/viewcontent.cgi?article=3593&context=isp_collection

Упркос уоченој карактеристичној појави повећане мобилности становништва ове археолошке епохе (~2500-400 BCE), изразито степског дијела Монголије, примјећен је и констатован снажан замах градње монументалних и масивних погребних конструкција тога подручја.
Јеленски камен (Deer stone), мегалитско надгробно обиљежје, које се ту појављује оставља некако најснажнији утисак обзиром на нека разматрања о поријеклу ових споменика и унутар кимерске археолошке културе?
https://en.wikipedia.org/wiki/Deer_stone
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Април 10, 2020, 01:53:03 поподне
Пронађен је до сада најстарији скелет који припада хаплогрупи R1a-M458 (https://www.yfull.com/tree/R-M458/). Доступни су генетички резултати, али конкретни подаци о налазу (археолошки локалитет и временски период) нису још увек познати. По неким још увек непровереним информацијама, скелет MX265 потиче из гробнице у јужној Немачкој (дистрикт Констанц на самом југу покрајине Баден-Виртемберг, на граници са Швајцарском), и датира се у период Културе звонастих пехара (Bell Beaker), оквирно око 2500-2000 п.н.е. Колико видим, позитиван је на следеће SNP-ове:

ниво PF6155: AM01874+, AM01875+, PF6161+

ниво PF6155>M458: PF6202+

С обзиром на старост скелета, не изненађује то што је негативан на све остале очитане SNP-ове испод M458, укључујући и оне који дефинишу гране CTS11962, CTS11962>L1029, L260>YP256 и L260>YP1337.

Научни рад би требао бити објављен у скоријој будућности:

https://boris.unibe.ch/133227/ (https://boris.unibe.ch/133227/)

Цитат
Genetic transition in the Swiss Late Neolithic and Early Bronze Age

Major genetic changes in European populations occurred at the beginning as well as final stages of the Neolithic period as shown by recent genetic studies. The transition from hunter-gatherers to agriculturalists and farmers in the 6th millennium BCE coincided with a human migration from the Near East. A second migration into Central Europe occurred originating from the Pontic steppe in the 3rd millennium BCE and was linked to the spread of the Corded Ware Culture which ranged as far southwest as modern-day Western Switzerland. These genetic processes are well studied, for example for the Middle-Elbe-Saale region in Germany, however, little is known from the regions that connect Central and Southern Europe. In this study, we investigate genome-wide data from 97 individuals from the Swiss Plateau, Southern Germany and the Alsace Region in France that span the transition from the Neolithic to the Bronze Age (4500 to 2000 BCE). Our results show a similar genetic process as reported for the Middle-Elbe-Saale region suggesting that the migration from the Pontic steppe reached all the way into the Swiss Plateau. However, our evidence suggests that the onset of that transition may have started even earlier in Switzerland compared to the Middle-Elbe-Saale region. The existence of core families within multiple burials and the determination, quantification and the estimated dates of arrival of different ancestry components in this region were analysed. Our data represent the first comprehensive genome wide dataset from Neolithic individuals from the Swiss Plateau and provide the first insights into the genetic history of this region.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Април 10, 2020, 04:18:21 поподне
Пронађен је до сада најстарији скелет који припада хаплогрупи R1a-M458 (https://www.yfull.com/tree/R-M458/). Доступни су генетички резултати, али конкретни подаци о налазу (археолошки локалитет и временски период) нису још увек познати. По неким још увек непровереним информацијама, скелет MX265 потиче из гробнице у јужној Немачкој (дистрикт Констанц на самом југу покрајине Баден-Виртемберг, на граници са Швајцарском), и датира се у период Културе звонастих пехара (Bell Beaker), оквирно око 2500-2000 п.н.е. Колико видим, позитиван је на следеће SNP-ове:

ниво PF6155: AM01874+, AM01875+, PF6161+

ниво PF6155>M458: PF6202+

С обзиром на старост скелета, не изненађује то што је негативан на све остале очитане SNP-ове испод M458, укључујући и оне који дефинишу гране CTS11962, CTS11962>L1029, L260>YP256 и L260>YP1337.

Научни рад би требао бити објављен у скоријој будућности:

https://boris.unibe.ch/133227/ (https://boris.unibe.ch/133227/)

Како се може објаснити ово? Сувише западно, по неком мом мишљењу.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Đorđo Април 10, 2020, 04:51:28 поподне
шта ми знамо шта је било пре 4000 година
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 10, 2020, 06:04:53 поподне
Како се може објаснити ово? Сувише западно, по неком мом мишљењу.

Не мислим да је превише чудно. То је зона преклапања Bell Beaker и Corded Ware. Нека R1a је већ налажена раније на подручју централне Њемачке у том периоду ( додуше у оквиру Corded Ware), али као што се у оквиру може наћи R1b и у оквиру Bell Beaker ће бити R1a.  Поготово ако се ради о некој давно изолованој грани М458.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Април 11, 2020, 07:42:47 поподне
Како се може објаснити ово? Сувише западно, по неком мом мишљењу.

Изгледа да је господин MX265 могао долутати однекле са истока, судећи по занимљивом аутосомалном саставу. Најбоље се моделује као мешавина средњенеолитског земљорадника из Мађарске, Corded Ware узорка из Немачке и узорка из бронзаног доба са подручја Балтика:

Цитат
MX265 is tough. Best fit I can get is Baltic_EST_BA+Hungary_MN+CWC_DEU.
@0.027066
Baltic_EST_BA: 25%
CWC_Germany: 32%
Farmer: 43.2% (31% of it is from Hungary_MN)

His farmer ancestry is mostly from Hungary Farmers. It's not from Western European farmers, like the two Swiss farmers you posted.

He has a big dose of Central/East European Hunter Gatherer. He gets that hunter gatherer ancestry from a Baltic_BA or WelzinBA like population. Inclusion of either of them improves his fit a lot. Baltic_BA improves his fit the most, signifcantly more than Welzin_BA does.

Не чуди да су овом узорку најближи модерни узорци Срби и остали јужнословенски народи, који су настали мешањем популација сличних горенаведеним, у грубо говорећи сличним пропорцијама:

Цитат
His overall makeup is similar to modern South Slavs.....Arza already pointed this out earlier.

Which is more evidence his farmer ancestry is Southeast European. If it were from Western European farmers he'd be most similar to French, Spanish.

MX265_scaled
MX265_scaled 0

Serbian 0.039691695
Slovenian 0.040226854
Croatian_maincluster 0.041287611
Bosnian 0.042506465
Hungarianavg 0.042859144
Montenegrin1 0.044271857
French_East 0.044653894

http://eurogenes.blogspot.com/2020/04/business-almost-as-usual.html?commentPage=2 (http://eurogenes.blogspot.com/2020/04/business-almost-as-usual.html?commentPage=2)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Полић Април 11, 2020, 08:05:33 поподне
Изгледа да је господин MX265 могао долутати однекле са истока, судећи по занимљивом аутосомалном саставу. Најбоље се моделује као мешавина средњенеолитског земљорадника из Мађарске, Corded Ware узорка из Немачке и узорка из бронзаног доба са подручја Балтика:

Не чуди да су овом узорку најближи модерни узорци Срби и остали јужнословенски народи, који су настали мешањем популација сличних горенаведеним, у грубо говорећи сличним пропорцијама:

http://eurogenes.blogspot.com/2020/04/business-almost-as-usual.html?commentPage=2 (http://eurogenes.blogspot.com/2020/04/business-almost-as-usual.html?commentPage=2)
i tada smo odlazili za Njemačku
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Април 12, 2020, 01:42:21 пре подне
(https://i.imgur.com/z6gniUz.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 12, 2020, 11:00:37 пре подне
(https://i.imgur.com/z6gniUz.png)

Логична је ова блискост са савременим Србима. Убацио сам у PCA узорке савремених Срба које имам (скалиране) и упоредио их са Bell Beaker узорцима широм Европе, а убацио сам још и Corded Ware узорке. Позиција савремених Срба у таквој шеми је да су аутосомално најближи Bell Beaker узорцима из Баварске, Чешке, Пољске, Мађарске. По тој аналогији и МХ265 би требао бити аутосомално близак Бел Бикеровцима из те зоне. Односно жутој групи са доње слике:

(https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/22/Beaker_culture_diffusion.svg/1024px-Beaker_culture_diffusion.svg.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 12, 2020, 11:34:12 пре подне
Гледам сад баш те односе Стара Европа-Индоевропљани у Европи и смјени становништва која се десила у Бронзаном добу. Баш је драстична смјена која се десила у Британији, као да је цјелокупно становништво замијењено (истребљено?). То се види и по аутосомалној и по Y-днк. Доминантно I2 неолитско становништво Британије смијенило је доминантно R1b становништво Бронзаног доба. Ово рецимо није случај у Иберији и Италији гдје се аутосомална генетика Старе Европе солидно очувала, иако су  Y-днк линије прилично замијењене . И Централна Европа представља некакву прелазну варијанту. Британски случај може да указује да тамо од старијег становништва нису преживјеле ни жене ни дјеца.

Најинтересантније је што се ова инвазија Бел Бикероваца на Британију сматра "мирољубивом, коегзистирајућом". Није ми јасно како су "коегзистирајући" успјели тако брзо да промијене комплетну генетичку слику острва.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Април 12, 2020, 12:22:22 поподне
Гледам сад баш те односе Стара Европа-Индоевропљани у Европи и смјени становништва која се десила у Бронзаном добу. Баш је драстична смјена која се десила у Британији, као да је цјелокупно становништво замијењено (истребљено?). То се види и по аутосомалној и по Y-днк. Доминантно I2 неолитско становништво Британије смијенило је доминантно R1b становништво Бронзаног доба. Ово рецимо није случај у Иберији и Италији гдје се аутосомална генетика Старе Европе солидно очувала, иако су  Y-днк линије прилично замијењене . И Централна Европа представља некакву прелазну варијанту. Британски случај може да указује да тамо од старијег становништва нису преживјеле ни жене ни дјеца.

Најинтересантније је што се ова инвазија Бел Бикероваца на Британију сматра "мирољубивом, коегзистирајућом". Није ми јасно како су "коегзистирајући" успјели тако брзо да промијене комплетну генетичку слику острва.

Биће да Британија није била насељена као Европа, и како је по природи ствари изолованије мјесто, са доласком Бел Бикероваца доспјели су и нови вируси који су утицали на пређашњу популацију, поред могућих насилних догађаја.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 12, 2020, 12:43:33 поподне
Биће да Британија није била насељена као Европа, и како је по природи ствари изолованије мјесто, са доласком Бел Бикероваца доспјели су и нови вируси који су утицали на пређашњу популацију, поред могућих насилних догађаја.

Могуће је да је и ово што пишеш разлог: малобројност и болести. А вјероватно је као што обично бива спој више фактора. Оно што је видљиво из резултата јесте да није било генетичког мијешања дошљака и старосједилаца. Да ли су се старосједиоци очували изоловани у неким џеповима и били осуђени на изумирање, можемо само претпостављати.

Иако данашњи распоред неких Y-днк грана нема пуно везе са распоредом из прошлости, можда је занимљиво видјети гдје су у Британији и Ирској зоне са највишом присутношћу I2-Isles, за коју бисмо могли претпоставити да је бар једним дијелом наслеђе преиндоевропске Британије. нађох ову малу карту, не знам колико је релевантна.

(https://i.pinimg.com/236x/83/d6/26/83d6265c898a8448030208435b62247a--genealogy.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: нцп Април 13, 2020, 04:22:56 пре подне
Могуће је да је и ово што пишеш разлог: малобројност и болести. А вјероватно је као што обично бива спој више фактора. Оно што је видљиво из резултата јесте да није било генетичког мијешања дошљака и старосједилаца. Да ли су се старосједиоци очували изоловани у неким џеповима и били осуђени на изумирање, можемо само претпостављати.

Иако данашњи распоред неких Y-днк грана нема пуно везе са распоредом из прошлости, можда је занимљиво видјети гдје су у Британији и Ирској зоне са највишом присутношћу I2-Isles, за коју бисмо могли претпоставити да је бар једним дијелом наслеђе преиндоевропске Британије. нађох ову малу карту, не знам колико је релевантна.

(https://i.pinimg.com/236x/83/d6/26/83d6265c898a8448030208435b62247a--genealogy.jpg)

I2 хаплогрупа, као најстарија у Eвропи, јe прeдмeт разноразног испитивања (како јe прeживeла, шта су јој слабости и др.) ::)

The Y chromosome: a blueprint for men’s health?(2017)

https://www.nature.com/articles/ejhg2017128

Haplogroup I was also associated with a higher risk of malignancy, including the highly specific AIDS-defining malignancy Kaposi’s sarcoma. Moreover, individuals with haplogroup I were more resistant to highly active antiretroviral therapy, taking longer to achieve viral load suppression.


Recombination hotspots in an extended human pseudoautosomal domain predicted from double-strand break maps and characterized by sperm-based crossover analysis (2018)

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6193736/

Ово јe нeки порeмeћај вeзан за јeтру...

Мушкарци који носе ePAR имају две копије пуне дужине наизглед клинички небитног гена крвне групе КСГ , као и две копије GYG2 gene, који кодирају претечу гликоген синтазе посебно важног за јетру. Занимљиво је да оба ова гена беже од инактивације код жена. У Менсах ет ал. студија, ePAR је примећен у 15 независних белгијских и француских породица: сви белгијски ePAR Y хромозоми припадали су једној суб-хаплогрупи, I2а (I-P37.2), док су они из два релативна француска носача првог степена припадали суб -групи у оквиру рода R1b, повезаног на даљину, наиме R-P312. Ово указује да је стварање ePARе понављано и да се десило најмање два пута на основу глобалне Y-хромозомске филогеније.


Па су испитивали припадникe I-P37.2 нe само на сeвeру, вeћ и и на Балкану (Панонија).

Our study suggests that the haplogroup I2a-associated ePAR is likely to have a more geographically restricted distribution than originally proposed . In the course of identifying carriers we established by junction PCR that the ePAR was present within the two sister I2a sub-lineages I-L1286 and I-L1294, both of which occur predominantly within Northwestern Europe, but was absent from two Hungarian males within the I-M423 sub-haplogroup as determined by resequencing of 3.7 Mb of Y-specific DNA (see S3B Fig). The majority of I-P37.2 men belong to the sub-lineage I-M423, which is predominantly found within Southeastern Europe, and rarely encountered in Northwestern Europe, hence its probable absence from the dataset tested by Mensah et al. So, whilst we would expect to find haplogroup-I2a ePAR carriers at a frequency of approximately 1% among Northwest European men as originally reported, we would expect only a minority of I2a men in Southwest Europe to be carriers of the ePAR.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 13, 2020, 07:20:36 поподне
Зна ли неко нешто о овоме? Данас је објављено у медијима.

INGEB: Genetički dokazi daju novu sliku o prahistoriji

http://www.federalna.ba/bhs/vijest/313953/otkrice-bh-naucnika
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Април 13, 2020, 07:39:35 поподне
Зна ли неко нешто о овоме? Данас је објављено у медијима.

INGEB: Genetički dokazi daju novu sliku o prahistoriji

http://www.federalna.ba/bhs/vijest/313953/otkrice-bh-naucnika

Видим да је претпоставка да су у питању припадници илирског/панонског племена Десидијата. Одлична ствар је што ће вршити анализу хаплогрупа. Кад се то одради, биће то први анализирани узорци припадника неког илирског/панонског племена. У чланку пише да су из заједничке гробнице са мноштвом скелета за анализу издвојени остаци три индивидуе, два мушкарца и једне жене. Бацио сам поглед и у Праисторији југославенских земаља том 5 (Жељезно доба), где постоји опис гробнице у Вратници код Високог. Одређени елементи (лобање поређане дуж зидова, полагање копаља уз лобање) ме подсећају на колективне гробнице из истог периода (млађе гвоздено доба - латен) у Крајчиновићима код Прибоја и Махревићима код Чајнича, с тим што су релативно сличне гробнице пронађене и у Виру код Посушја и Горици код Љубушког. Ове гробнице су нешто касније датоване у односу на вратничку (отприлике у 2. век п.н.е. док је вратничка датована у крај 4. века п.н.е.), али није искључено да постоји некаква веза. Иначе, колективна гробница у Крајчиновићима се по начину сахрањивања као и неким материјалним налазима доводи у везу са Келтима (конкретно са Скордисцима), по мишљењу Михаила Зотовића, археолога који ју је истраживао.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 13, 2020, 07:40:48 поподне
Зна ли неко нешто о овоме? Данас је објављено у медијима.

INGEB: Genetički dokazi daju novu sliku o prahistoriji

http://www.federalna.ba/bhs/vijest/313953/otkrice-bh-naucnika

Не знам за сирове резултате,али са тог института излазе и овакви радови:

https://www.researchgate.net/publication/338157820_An_ethnic_genetics_-_case_study_of_BH_facts_fallacies_and_myths

Човјек тобоже напада псеудонауку,а онда напише псеудоначни рад. По оној народној: Држте лопова!
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небо_Сав Април 13, 2020, 08:52:48 поподне
Не знам за сирове резултате,али са тог института излазе и овакви радови:

https://www.researchgate.net/publication/338157820_An_ethnic_genetics_-_case_study_of_BH_facts_fallacies_and_myths

Човјек тобоже напада псеудонауку,а онда напише псеудоначни рад.

Шта рећи...и наука је постала део масовне културе (као и књижевност, позориште, и све остало што се раније сматрало "високом културом"). Хиперинфлација у образовању -  умножавање Универзитета, факултета, струковних школа, броја студената,  помама за звањима, индексом цитираности... а у овом случају и примитивна  политичка свест - довела је до деградације научних радова. 

Оно што пре тридесет година није могло бити названо и обичним "стручним радом" сада се именује као "оригинални научни рад".  Данас је довољно поставити неку хипотезу, тобож прикупити податке  (или тенденциозно изабрати  податке  из информатичког универзума), применити елементарну статистику, направити пар дијаграма,  цитирати понеко име, направити (псеудо)закључак, послати то у псеудо-научне часописе који наплаћују објављивање оваквих радова  - и ето (псеудо)науке, ето индекса цитираности, ето избора у звање професора, доцента, асистента,  сарадника... 
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 14, 2020, 09:44:57 поподне
Већ сам помињао на другим темама о аутосомалној днк да је српским узорцима аутосомално прилично близак тестирани Визигот под шифром I12031 из гробља Pla de l'Horta (Sarrià de Ter, Girona, Catalonia, Spain) које се датира у 6-7. вијек. Без обзира да ли је његова аутосомална блискост са Србима посљедица сличне комбинације мјешавине, мислим да је прилично симптоматично што нам је он ближи нпр. од раних Словена из истог тог периода.

У раду је за овај налаз написано сљедеће:

"Immediately to the north of this area, a necropolis associated with the villa has been found, with a funerary building and a series of tombs. This site clearly belongs to the villa, which would subsequently be extended in the Visigoth period. The samples that have been analyzed correspond to this Visigothic phase. Several types of burials can be seen, from a simple grave to a cist. Thе number of burials identified (58), as well as the results of the analysis, demonstrate the persistence and importance of the habitat, even though it has not yet been identified archaeologically. The grave goods and the typology of the tombs point to a Visigothic origin of the individuals."

Аутосомални резултати једног дијела тестираних из овог гробља показују афинитет ка Балкану и Панонији, што се види и из доње шеме:

(https://i.postimg.cc/qq6y1Fqp/F1-large.jpg)

Y-днк хаплогрупа Визигота I12031  је у раду означена као E-V13. Не знам да ли су негдје на мрежи већ детаљно прегледали његове bam фајлове, али покушао сам данас да их прегледам, не бих ли нашао припадност некој специфичнијој подграни хаплогрупе E-V13. И на крају сам, без обзира на шкрта очитања појединих позиција, успио да дођем до специфичне хаплогрупе овог узорка и она је: E-V13>Z16663>Y93395
https://www.yfull.com/tree/E-Y93395/

Ова грана је стара око 2900 година. Има још неколико подграна, могуће да је I12031 позитиван на неку до њих, али за већину позиција испод Y93395 није имао очитања. Једино што сам успио да очитам је негативан резултат за неке СНП-ове испод Y93395: CTS11037, BY52783. Што се тиче очитаних позиција изнад Y93395, очитао сам позитивно сљедећи низ SNP-ова: V13>CTS5856>Z16662>Y36784/BY3331>Y93395.

У грани Y93395 се налазе: Мађари, Чеси, Словаци, Аустријанци, Италијани, Енглези, Малтежани. Рекао бих да је највећа разноврсност на подручју западне Паноније, па у складу са аутосомалним резултатима, могли би претпоставити да је ова грана настала негдје на подручју западне Паноније у Жељезном добу. Можда међу неком илирско-панонском популацијом. Узводна грана Z16663 је показала већ значајну разноврсност на подручју Балкана. Спомињао сам раније https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=19.msg106607#msg106607

На гробљу у Каталонији, дакле могао би бити сахрањен неки наш далеки рођак Панон/Илир који се придружио Визиготима, прошавшим кроз Панонију, на свом путу ка Иберији.

Да још једном нагласим да је I12031 од свих досад тестираних узорака старе днк, мени лично аутосомално најближи. Зато сам се мало детаљније и позабавио његовом генетиком.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Април 14, 2020, 10:33:03 поподне
У грани Y93395 се налазе: Мађари, Чеси, Словаци, Аустријанци, Италијани, Енглези, Малтежани. Рекао бих да је највећа разноврсност на подручју западне Паноније, па у складу са аутосомалним резултатима, могли би претпоставити да је ова грана настала негдје на подручју западне Паноније у Жељезном добу. Можда међу неком илирско-панонском популацијом. Узводна грана Z16663 је показала већ значајну разноврсност на подручју Балкана. Спомињао сам раније https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=19.msg106607#msg106607

На гробљу у Каталонији, дакле могао би бити сахрањен неки наш далеки рођак Панон/Илир који се придружио Визиготима, прошавшим кроз Панонију, на свом путу ка Иберији.

Да још једном нагласим да је I12031 од свих досад тестираних узорака старе днк, мени лично аутосомално најближи. Зато сам се мало детаљније и позабавио његовом генетиком.

 Занимљив налаз, то јесте највјероватнија опција, да је потомак Панона који је пришао Визиготима јер знам да је имао доста аутозомалне балканске компоненте, као и визиготске па због тога вјероватно испада ближи Ј.Словенима Генерално Z16663 је ријетка на Балкану. Најчешћа је E-Y193398 тј. кластер Понтских грка. Има Хрват од друге паралелне гране која није честа, но изнад њега на стаблу има и Пољак.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Април 14, 2020, 10:54:08 поподне
Најчешћа је E-Y193398 тј. кластер Понтских грка. Има Хрват од друге паралелне гране која није честа, но изнад њега на стаблу има и Пољак.

 Недавно се појавио Јермен E-Z21371, нема још BigY али изгледа да је у некој даљој вези са овим Понтским Грцима. Иако је E-V13 обзиром да Понтски Грци имају врло различиту генетику од Грка, могуће да ова група и није изворно грчког поријекла већ да је као и неке друге гране V13 дошла с прото-Јерменима са Балкана. :D
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 17, 2020, 09:04:04 поподне
Нови рад, древна ДНК са подручја југоисточне Пољске, период око 2500 г пне. (углавном Corded Ware уз нешто мало Bell Beaker)

Y-днк изолована код 11 узорака. Доминација R1b хаплогрупе. Код два узорка најдубље дошли до https://www.yfull.com/tree/R-L52/ ( мада су у раду написали ниво L11 који је једну степеницу ниже)

https://www.nature.com/articles/s41598-020-63138-w

Недавно смо имали R1a код Bell Beaker у Швици, а ево сад R1b код Corded Ware. То се зове културна размјена.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Април 18, 2020, 11:07:08 поподне
Mitochondrial and Y-chromosome diversity of the prehistoric Koban culture of the North Caucasus (https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352409X20301486)

(https://i.imgur.com/ptSMGJn.png)
1 – KlinYar-3, and 2 – Zayukovo-3.
Sample ID; Burial site; mt-haplogroup (Sanger); mt-haplogroup (Illumina); Y-haplogroup (Illumina)

1; Klin-Yar-3; H20a; –; –
2; Klin-Yar-3; J1c; J1b1; E1a2a1b1b
6; Zayukovo-3; N; –; –
7; Zayukovo-3; U5a1a1h; U5a1a2; G2a1a1a2
8; Zayukovo-3; HV1; HV1a1a; D1a2a1
9; Zayukovo-3; T1a; T1a1; G2a1a
10; Zayukovo-3; H1e; –; –
11; Zayukovo-3; W5a; N; R1b1a1b
12; Zayukovo-3; R6/H1e; –; –
13; Zayukovo-3; –; –; R1a
14; Zayukovo-3; R6; –; –
15; Zayukovo-3; I1; – –
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: filipi Април 20, 2020, 04:40:18 поподне
https://www.nature.com/articles/s41467-020-15560-x

Ancient genomes reveal social and genetic structure of Late Neolithic Switzerland

(https://i.postimg.cc/s2rVpvWh/FB-IMG-1587392618569.jpg)

(https://i.postimg.cc/Y26qCNmw/FB-IMG-1587392643655.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Април 20, 2020, 04:42:53 поподне
Велико разочарање за мене, нити један једини G2a-L497.  ::)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 20, 2020, 05:54:24 поподне
Велико разочарање за мене, нити један једини G2a-L497.  ::)

Али има доста I2-M423, вјероватно Лошбурових рођака. Видим и један Ислес L161 прилично стар. Ваљало би свакако проћи кроз сирове резултате, видим да су доступни на ENA. Можда се открије и који предачки за наше М423.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Април 20, 2020, 06:15:14 поподне
Узорак MX265 који је једини R1a-М458 узорак у овом раду, уједно је и најмлађи датирани узорак (763-431 BC), дакле потиче из периода Халштатске културе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 20, 2020, 06:44:30 поподне
Могуће је да су сви I2-M423 из овог рада L161+. Насумице сам погледао сирове резултате од MX188 који је означен као M423, и он има једно позитивно читање на L161 (Isles-по ранијој терминологији) .
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Nenad M Април 20, 2020, 06:44:46 поподне
Узорак MX265 који је једини R1a-М458 узорак у овом раду, уједно је и најмлађи датирани узорак (763-431 BC), дакле потиче из периода Халштатске културе.

Једно питање, да бих иоле могао да пратим причу: отворио сам YFull.com, кликнуо на R1a и тражио преко ctrl-F све оне ознаке које су наведене у табели код тог узорка и - ништа. Како знате да је то М458? Да ли је у питању неко старије означавање? Што се тиче М458, то сам нашао, али оно што стоји у табели - L146, M420, PF6229, тога нема. Претпостављам да је разлог моје танко предзнање, али можда још има наде за мене  :) Или баш груб превид, али у то сумњам.
Хвала.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 20, 2020, 08:55:10 поподне
Могуће је да су сви I2-M423 из овог рада L161+. Насумице сам погледао сирове резултате од MX188 који је означен као M423, и он има једно позитивно читање на L161 (Isles-по ранијој терминологији) .

Детаљније сам прошао узорак МХ188 из Spreitenbach (Швица). Изгледа да овај резултат дијели постојећи I2-M423>L161 ниво, јер је МХ188 позитиван на L161 (додуше једно позитивно читање, али без негативних),а истовремено негативан на S2660, S2727, S2680 који се тренутно налазе на нивоу L161.

Очитања за ове позиције су сљедећа:
S2660 (12 негативних)
S2727 (2 негативна)
S2680 (1 негативан)

Остале позиције на нивоу L161 су без одазива.

Прије него што сам схватио ситуацију на L161 нивоу очитао сам негативно и неке позиције испод L161:

Y1339 (1-)
Y13577 (1-)
S2703 (7-)
BY11027 (2-)
Y12993 (1-)
Y12064 (1-)

Такође постоје негативна очитања за друге подгране испод М423:

ниво L621- S13737 (13-)
ниво Y24694- A20191 (5-)

Укратко, узорак МХ188 је I2-M423>L161* и није оставио живих потомака (бар да их досад знамо). Инвазија Индоевропљана Азијата слистила је ову стару европску грану што мачем, што биолошким оружјем, нико није претекао. Једино наши преци што се склонише у шуме десно од Keiserslauterna.  ::)

Не знам да ли су и остали узорци из Spreitenbach такође на овом нивоу. С обзиром на још једног очитаног L161 из Lingolsheima из 4600 г пне. сасвим могуће. Изгледа да је L161 била раније много присутнија у овом дијелу Европе, него што је то данас случај.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 20, 2020, 09:53:13 поподне
Узорак SX33 из Lingolsheima у Алзасу који се датира у 4600 пне означен је у раду као I2-M423>L161. Иако му позиција L161 није очитана, може се претпоставити да је L161+ јер је позитиван на S2660 и S2727, који се налазе на нивоу L161, а на које је негативно очитан MX188 из Spreitenbach. Ово би значило да је SX33:

I2-M423>L161>S2660/S2727

Нисам га провјеравао на остале позиције на нивоу L161, као ни на низводне гране.

Како год, ово показује већ значајну разноврсност гране на поменутом подручју: сјевер Швајцарске/Алзас.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 21, 2020, 01:11:17 пре подне
Занимљиви су и аутосомални резултати и закључци из овог рада.

Из прегледа тестираних појединаца и учешћа степске генетике у њиховим резултатима, може се претпоставити кад су до подручја Швајцарске и Рајне стигли први "степски" дошљаци. То се десило око 2700 године пне, а први талас је свакако био повезан са Corded Ware који је долазио из правца Њемачке.

На овим тестрианим I2-M423>L161 се управо види тај прелаз. Старији узорак SX33 из Алзаса (Lingolsheim) нема степску аутосомалну компоненту, док је имају узорци из  Spreitenbach Швјацарска (датирани око 2500 г пне). Што ће рећи да је први додир Corded Ware и Old Europe ипак био такав да је дошло до генетичког мијешања, при чему се очувала мушка линија Old Europe. Ипак у неком каснијем периоду ове линије L161 су изумрле.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: filipi Април 22, 2020, 11:24:00 пре подне

Ancient Y-DNA from Corded
War

https://drive.google.com/file/d/1rrfL3ZXEeFyGNggiM9hck7NiQEG4sP2e/view
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: filipi Април 24, 2020, 06:49:49 пре подне
https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB36529

Ancient genomes from present-day France unveil 7,000 years of its demographic history.

PER3123 Mesolithic I2a1b2
BERG157-7 Neolithic I2a1a2
BLP10 Neolithic I2~
BUCH2 Neolithic H2a
Es97-1 Neolithic I2a1a2
MDV248 Neolithic H2~
ROS102 Neolithic I2a1a2a
ROS45 Neolithic I2a1a2
ROS78 Neolithic I2a1a2a
Sch72-15 Neolithic C1
WET370 Neolithic H2~
PEI2 BellBeaker G2a2b2b1a1a
CBV95 BellBeaker R1b1a1b
BIS130 Bronze age R1b1a1b
EUG11 Bronze Age R1b1a1b
OBE3626-1 Bronze age R1b1a1b1a1
PIR3037AB Bronze age R1b1a1b
PIR3116B Bronze age R1b1a1b1a1a
PSS4170 Bronze age R1b1a1b1a1
QUIN58 Bronze age R1b1a1b
RIX15 Bronze age R1b1a1b1a1
RIX2 Bronze age R1b1a1b1a1a2
PECH5 Iron age R1b1a1b1a1
PECH8 Iron age R1b1a1b1a1
PEY163 Iron age R1b1a1b
BES1248 Iron Age I1



Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милан Петровић Април 24, 2020, 09:58:40 пре подне
Да ли се зна у ком делу Француске је пронађен PER3123? То је L621?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Сол Април 24, 2020, 11:36:38 пре подне
до сада једини археогенетски налаз који се повезује са Галаћанима /Galatian Celts - Anatolia_IA_MA2197

http://eurogenes.blogspot.com/2018/10/a-closer-look-at-couple-of-ancients.html
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 20, 2020, 06:44:18 пре подне
Објављен је препринт рада који обрађује стару днк бронзаног доба са подручја Баната. Колико видим на овом што су објавили на Anthrogenici има разних грана I2a хаплогрупе, R1b и занимљиво и један J2b. Нисам детаљније гледао, не знам које су се номенкалтуре држали.

Уколико буду било објављених сирових резултата, покушаћу провјерити гране.

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.18.101337v1

Ово су објавили на Anthrogenici


Burial   Genetic Sex   Age   X-fold genomic depth   mt haplogr.   Y haplogr.   
122E   XY      6-9   1.09         U5a2b1a      I2a1b
122S   XX      35-50   0.78         H32      *
161   XX      9-11   1.20         H80      *
163   XY      45-55   1.21         U4a2      J2b
181   XX      >18   0.62         U4a2      *
186   XX      8-11   0.33         H1aj      *
211   XY      50-55   0.79         U5a2b1a      I2a1b
220   XY      15-25   0.64         T2b11      R1b1a2a2c1
223   XX      7-10   0.39         U3a1      *
224   XX      25-40   0.77         T2b      *
225   XY      25-35   0.82         J1b1a1      R1b1a2a2c1
228   XX      35-50   0.95         J1c      *
237   XX      15-20   0.89         T2b      *
243   XY      20-35   1.12         H      BT
246   XX      45-50   0.98         H80      *
247   XX      10-12   0.90         H1      *
257 A   XX      40-60   0.60         H      *
257 B   XY      inf.I   0.61         K1a4      R1b1a2a2c1a1
260   XY      15-18   0.92         J1c      I2a2a1a2a2
282   XY      15-20   1.41         H2b      BT
287   XX      20-35   0.81         U5b2a2c      *
288   XX      60+   0.81         HV0e      *
295   XY      15-20   0.82         H80      I2a1a
302   XX      20-35   0.89         J1c      *

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 20, 2020, 06:51:09 пре подне
Још један рад старе ДНК објављен везан за мезолит и неолит на подручју Француске и Њемачке. 101 узорак.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/629712
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 20, 2020, 07:15:58 пре подне
Објављен је препринт рада који обрађује стару днк бронзаног доба са подручја Баната. Колико видим на овом што су објавили на Anthrogenici има разних грана I2a хаплогрупе, R1b и занимљиво и један J2b. Нисам детаљније гледао, не знам које су се номенкалтуре држали.

Уколико буду било објављених сирових резултата, покушаћу провјерити гране.

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.18.101337v1

Ово су објавили на Anthrogenici


Burial   Genetic Sex   Age   X-fold genomic depth   mt haplogr.   Y haplogr.   
122E   XY      6-9   1.09         U5a2b1a      I2a1b
122S   XX      35-50   0.78         H32      *
161   XX      9-11   1.20         H80      *
163   XY      45-55   1.21         U4a2      J2b
181   XX      >18   0.62         U4a2      *
186   XX      8-11   0.33         H1aj      *
211   XY      50-55   0.79         U5a2b1a      I2a1b
220   XY      15-25   0.64         T2b11      R1b1a2a2c1
223   XX      7-10   0.39         U3a1      *
224   XX      25-40   0.77         T2b      *
225   XY      25-35   0.82         J1b1a1      R1b1a2a2c1
228   XX      35-50   0.95         J1c      *
237   XX      15-20   0.89         T2b      *
243   XY      20-35   1.12         H      BT
246   XX      45-50   0.98         H80      *
247   XX      10-12   0.90         H1      *
257 A   XX      40-60   0.60         H      *
257 B   XY      inf.I   0.61         K1a4      R1b1a2a2c1a1
260   XY      15-18   0.92         J1c      I2a2a1a2a2
282   XY      15-20   1.41         H2b      BT
287   XX      20-35   0.81         U5b2a2c      *
288   XX      60+   0.81         HV0e      *
295   XY      15-20   0.82         H80      I2a1a
302   XX      20-35   0.89         J1c      *

Колико видим, ово је рад иза ког стоји Лабораторија за биоархеологију Филозофског факултета у Београду. Зна ли се нешто више о овој лабораторији?

http://bioarchlab.org/projects/344-kinship-status-and-social-inequality-in-the-early-bronze-age-of-southeastern-europe-the-case-of-mokrin-necropolis

Поготово што видим да је у току неколико археогентичких пројеката из којих стоји и Министарство науке,али и неке иностране фондације

http://bioarchlab.org/projects
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Мај 20, 2020, 07:53:43 пре подне
Објављен је препринт рада који обрађује стару днк бронзаног доба са подручја Баната. Колико видим на овом што су објавили на Anthrogenici има разних грана I2a хаплогрупе, R1b и занимљиво и један J2b. Нисам детаљније гледао, не знам које су се номенкалтуре држали.

Уколико буду било објављених сирових резултата, покушаћу провјерити гране.

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.18.101337v1


Опет без E-V13.  ::)
Ситуација са древном E-V13 постаје помало бизарна. Нигде је нема.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Мај 20, 2020, 08:31:52 пре подне
Колико видим, ово је рад иза ког стоји Лабораторија за биоархеологију Филозофског факултета у Београду. Зна ли се нешто више о овој лабораторији?

http://bioarchlab.org/projects/344-kinship-status-and-social-inequality-in-the-early-bronze-age-of-southeastern-europe-the-case-of-mokrin-necropolis

Поготово што видим да је у току неколико археогентичких пројеката из којих стоји и Министарство науке,али и неке иностране фондације

http://bioarchlab.org/projects

Било је о томе више речи на овој теми:

https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=679.msg129382#msg129382

На скупу Српског археолошког друштва који је 2019. године одржан у Неготину, од 30. маја до 01. јуна, је горепоменута Жегарац заједно са археологом Маријом Кречковић имала следеће излагање: "ДРЕВНА ДНК АНАЛИЗА ИНДИВИДУА САХРАЊЕНИХ НА РАНОБРОНЗАНОДОПСКОЈ НЕКРОПОЛИ У МОКРИНУ (2100–1800. ГОДИНА ПРЕ НОВЕ ЕРЕ)". Било би добро некако доћи до резултата ових истраживања и видети које врсте испитивања су рађене (аутосомална, Y-ДНК, мтДНК).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Мај 20, 2020, 08:38:19 пре подне
Нисам детаљније гледао, не знам које су се номенкалтуре држали.

Рекао бих да је у питању најновија ISOGG номенклатура из 2019. године, где би I2a1b означавао СНП М436 (тј. некадашњи I2a2), док I2a1a означава P37.2 (тј. некадашњи I2a1).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 20, 2020, 09:23:21 пре подне
Рекао бих да је у питању најновија ISOGG номенклатура из 2019. године, где би I2a1b означавао СНП М436 (тј. некадашњи I2a2), док I2a1a означава P37.2 (тј. некадашњи I2a1).

Могуће, међутим номенклатура за R1b им је прилично стара, из 2015. године, грана R1b1a2a2c1 би требала бити Z2109. У стаблу из 2019. године ове ознаке нема.

Једино ако су користили номенклатуре из различитих година за различите хаплогрупе, што би за један научни рад било прилично глупо.

Друга опција би била да су и ове ознаке I хаплогрупе из 2015. године, али онда би у I2a1b могли препознати М423.

Ускоро ће неко већ објавити комплетније податке, па ће се разјаснити.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bulajić Мај 20, 2020, 11:58:50 пре подне

Опет без E-V13.  ::)
Ситуација са древном E-V13 постаје помало бизарна. Нигде је нема.

У бронзаном добу E-V13 још није долазио толико на север.

(http://www.abroadintheyard.com/wp-content/uploads/Europe-c-7000-BC-2k-jpg.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bulajić Мај 20, 2020, 12:01:26 поподне
Пре 4000 година се појављује Ев-13 на врло занимљивом месту  ;)

(http://www.abroadintheyard.com/wp-content/uploads/Europe-c-2000-BC-2k-jpg.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Мај 20, 2020, 12:31:07 поподне
У бронзаном добу E-V13 још није долазио толико на север.

Пре 4000 година се појављује Ев-13 на врло занимљивом месту  ;)


Карте које си приложио су производ нечије изражене креативности и у истој мери изражене непрецизности. Тј нису ни тачне ни релевантне. Постојање Y-ДНК који представља предачке хаплогрупе у односу на E-V13 је утврђено северно од Балкана прилично ”рано”:

Сопотска култура, старост 6900 г. - E-M78
Ленгјел култура, старост 6700 г. - E-L618
Трипољска култура, старост 5800 г. - E-M78

Најстарија до сада пронађена E-V13 је стара 7000 година и са подручја је Шпаније.
Проблем је у томе што следећи најстарији потврђени E-V13 потиче из наше/нове ере.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 20, 2020, 01:36:27 поподне
Могуће, међутим номенклатура за R1b им је прилично стара, из 2015. године, грана R1b1a2a2c1 би требала бити Z2109. У стаблу из 2019. године ове ознаке нема.

Једино ако су користили номенклатуре из различитих година за различите хаплогрупе, што би за један научни рад било прилично глупо.

Друга опција би била да су и ове ознаке I хаплогрупе из 2015. године, али онда би у I2a1b могли препознати М423.

Ускоро ће неко већ објавити комплетније податке, па ће се разјаснити.

За предикцију Y-днк грана је коришћен yhaplo софтвер,а он директно користи ISOGG номенклатуру.
https://github.com/23andMe/yhaplo

Негдје пронађох да се ослања на 2016 ISOGG стабло, али не знам да ли се може пребацивати и на остале варијанте стабла. Штета што нису дали преглед СНП-ова. Видим да се препринт позива на неке табеле које недостају, па ће вјероватно бити доступно касније.

Ово ме највише интересује због могућег М423 међу овим узорцима. Све зависи од године означавања.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 20, 2020, 01:41:16 поподне
Још један рад старе ДНК објављен везан за мезолит и неолит на подручју Француске и Њемачке. 101 узорак.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/629712

Ово су били објављени сирови резултати. Јутрос су били доступни на ENA.

У међувремену су их аутори повукли. (has been suppressed at the submitter's request)

Кад се рад објави ово ће бити солидна количина података за европски неолит. И ту очекујем можда неке помаке за I2-M423.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Мај 20, 2020, 04:32:16 поподне
За предикцију Y-днк грана је коришћен yhaplo софтвер,а он директно користи ISOGG номенклатуру.
https://github.com/23andMe/yhaplo

Негдје пронађох да се ослања на 2016 ISOGG стабло, али не знам да ли се може пребацивати и на остале варијанте стабла. Штета што нису дали преглед СНП-ова. Видим да се препринт позива на неке табеле које недостају, па ће вјероватно бити доступно касније.

Ово ме највише интересује због могућег М423 међу овим узорцима. Све зависи од године означавања.

Ако је заиста присутан М423, мислим да би добар кандидат била подграна M423>L161>Y13331, која се јавља у Бугарској.

https://yfull.com/tree/I-Y13331/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 20, 2020, 06:58:56 поподне
Ако је заиста присутан М423, мислим да би добар кандидат била подграна M423>L161>Y13331, која се јавља у Бугарској.

https://yfull.com/tree/I-Y13331/

И мени је на памет пала та подграна. Бојим се да ће се морати сачекати објављивање сирових резултата да би се то провјерило.

Иначе, мислим да је прилично извјесно да се овдје заоста ради о два М423 узорка. Провјеравао сам Yhaplo и у њега је заиста уграђено 2015 ISOGG стабло. То би било и у складу са означеном граном за R1b која се по тој номенклатури посљедњи пут јавља управо на тој верзији стабла. Један од узорака је R1b-CTS7556 очинска грана од R1b-CTS9219.

Сад жив нећеш остати од аутохтониста.  :)

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Мај 20, 2020, 09:24:26 поподне
И мени је на памет пала та подграна. Бојим се да ће се морати сачекати објављивање сирових резултата да би се то провјерило.

Иначе, мислим да је прилично извјесно да се овдје заоста ради о два М423 узорка. Провјеравао сам Yhaplo и у њега је заиста уграђено 2015 ISOGG стабло. То би било и у складу са означеном граном за R1b која се по тој номенклатури посљедњи пут јавља управо на тој верзији стабла. Један од узорака је R1b-CTS7556 очинска грана од R1b-CTS9219.

Сад жив нећеш остати од аутохтониста.  :)

Да, биће гори од ајкула кад намиришу крв.  ;) Једино што им се у рачуницу не уклапа тај предак од R1b-Z2705.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 21, 2020, 09:45:41 пре подне
Објављен је препринт рада који обрађује стару днк бронзаног доба са подручја Баната. Колико видим на овом што су објавили на Anthrogenici има разних грана I2a хаплогрупе, R1b и занимљиво и један J2b. Нисам детаљније гледао, не знам које су се номенкалтуре држали.

Уколико буду било објављених сирових резултата, покушаћу провјерити гране.

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.18.101337v1

Ово су објавили на Anthrogenici


Burial   Genetic Sex   Age   X-fold genomic depth   mt haplogr.   Y haplogr.   
122E   XY      6-9   1.09         U5a2b1a      I2a1b
122S   XX      35-50   0.78         H32      *
161   XX      9-11   1.20         H80      *
163   XY      45-55   1.21         U4a2      J2b
181   XX      >18   0.62         U4a2      *
186   XX      8-11   0.33         H1aj      *
211   XY      50-55   0.79         U5a2b1a      I2a1b
220   XY      15-25   0.64         T2b11      R1b1a2a2c1
223   XX      7-10   0.39         U3a1      *
224   XX      25-40   0.77         T2b      *
225   XY      25-35   0.82         J1b1a1      R1b1a2a2c1
228   XX      35-50   0.95         J1c      *
237   XX      15-20   0.89         T2b      *
243   XY      20-35   1.12         H      BT
246   XX      45-50   0.98         H80      *
247   XX      10-12   0.90         H1      *
257 A   XX      40-60   0.60         H      *
257 B   XY      inf.I   0.61         K1a4      R1b1a2a2c1a1
260   XY      15-18   0.92         J1c      I2a2a1a2a2
282   XY      15-20   1.41         H2b      BT
287   XX      20-35   0.81         U5b2a2c      *
288   XX      60+   0.81         HV0e      *
295   XY      15-20   0.82         H80      I2a1a
302   XX      20-35   0.89         J1c      *

Узимајући у обзир ISOGG стабло из 2015, гране Y-днк хаплогрупa би требале бити ове:

122E   I2a1b М423
163   J2b M12
211   I2a1b М423
220   R1b1a2a2c1 Z2109
225   R1b1a2a2c1 Z2109
243   BT
257   R1b1a2a2c1a1 Z2109>CTS7556
260   I2a2a1a2a2 М223>S18331
282   BT
295   I2a1a P37.2>CTS595

Прилична разноврсност грана I2 хаплогрупе. Грана CTS595 је предачка за М26.

Такође је и присуство "источне" R1b Z2103 у складу са ранијим налазима из Вучедолске културе гдје је ова грана такође нађена. Изгледа да је тај рани продор Индоевропљана у Подунавље и на Балкан био повезан  са овом граном.

Иначе у самом раду тежиште и није на генетичким резултатима, већ су они једно од средстава да се докажу одређене претпоставке о социјалним односима у друштву ове ранобронзанодопске културе. Колико сам видио говори се о некој женској егзогамији,а закључци се изводе на основу генетички уочених веза мајка-дјеца. Не знам колико то све пије воду.

Везано за ове културе раног бронзаног доба у Подунављу, пронађох на мрежи jeдан прилично прегледан рад Haskel J Greenfield The Maros culture: a regional subtradition during the Early Bronze Age of Central Europe који може у пдф да се нађе на следећем линку https://www.academia.edu/2100199/2001d_The_Maros_culture_a_regional_subtradition_during_the_Early_Bronze_Age_of_Central_Europe

Мокринско налазиште судећи по овом раду улази у тзв.централну групу.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Мај 21, 2020, 10:15:30 пре подне
122E   I2a1b М423
163   J2b M12
211   I2a1b М423
220   R1b1a2a2c1 Z2109
225   R1b1a2a2c1 Z2109
243   BT
257   R1b1a2a2c1a1 Z2109>CTS7556
260   I2a2a1a2a2 М223>S18331
282   BT
295   I2a1a P37.2>CTS595


Јел има података о старости узорака?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Владимир Бојановић Мај 21, 2020, 10:56:31 пре подне
Иначе у самом раду тежиште и није на генетичким резултатима, већ су они једно од средстава да се докажу одређене претпоставке о социјалним односима у друштву ове ранобронзанодопске културе. Колико сам видио говори се о некој женској егзогамији,а закључци се изводе на основу генетички уочених веза мајка-дјеца. Не знам колико то све пије воду.
Још пар сличних, феминистичких истраживања и ваше теорије о неприсутности I2 на Балкану у бронзаном добу одоше "низ Дунав".   :D ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 21, 2020, 11:11:07 пре подне

Јел има података о старости узорака?

У раду је речено:
Radiocarbon dating indicates that the Mokrin necropolis was used for 300 years, from around 2100-1800 cal BC
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 21, 2020, 11:12:05 пре подне
Још пар сличних, феминистичких истраживања и ваше теорије о неприсутности I2 на Балкану у бронзаном добу одоше "низ Дунав".   :D ;)

Да, ако нам аутохтонисти не дођу главе, феминисти хоће сигурно.  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милан Петровић Мај 21, 2020, 11:14:22 пре подне
Још пар сличних, феминистичких истраживања и ваше теорије о неприсутности I2 на Балкану у бронзаном добу одоше "низ Дунав".   :D ;)
Банат није на Балкану.  ;D
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bulajić Мај 21, 2020, 12:18:25 поподне

Карте које си приложио су производ нечије изражене креативности и у истој мери изражене непрецизности. Тј нису ни тачне ни релевантне. Постојање Y-ДНК који представља предачке хаплогрупе у односу на E-V13 је утврђено северно од Балкана прилично ”рано”:

Сопотска култура, старост 6900 г. - E-M78
Ленгјел култура, старост 6700 г. - E-L618
Трипољска култура, старост 5800 г. - E-M78

Најстарија до сада пронађена E-V13 је стара 7000 година и са подручја је Шпаније.
Проблем је у томе што следећи најстарији потврђени E-V13 потиче из наше/нове ере.

На сајту где су објављене мапе је на почетку текста наведено:

First, a disclaimer.  Human genetic history is complicated, particular in Europe, therefore the territorial lines associated with major Y-DNA haplogroups in these maps should be seen as best guesses based on current knowledge of genetics, archaeology, and history (sources below).

Е сад, додатни питање је кад је и објављен пост, пошто датум није наведен, тако да не знамо да ли је мапа објављена пре 9 година или скоро, када свакако има више информација.

Хвала за информације о Сопотској, Трипољској и Ленђел култури.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ojler Мај 21, 2020, 07:28:00 поподне
Ако је заиста присутан М423, мислим да би добар кандидат била подграна M423>L161>Y13331, која се јавља у Бугарској.

https://yfull.com/tree/I-Y13331/

Колико сам разумео, извесно је само да се ради о I2а-М423 а претпоставка о свакој дубљој подграни је једнако валидна у овом моменту?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Скардус Мај 21, 2020, 10:22:39 поподне
Логично. Биће кроз време ископано још пуно костију скоро свих хаплогрупа које постоје на Балкану данас.
Оно што се променило у последњих 7-8 хиљада година није битније променило генетску слику Балкана и Европе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Мај 21, 2020, 10:26:14 поподне
Колико сам разумео, извесно је само да се ради о I2а-М423 а претпоставка о свакој дубљој подграни је једнако валидна у овом моменту?

Да, док не дођу БАМ фајлови, све испод М423 је отворено. Ипак, делује ми да би могла бити она горе постављена грана због њене изолованости у Родопима (ако се добро сећам, носилац је Помак), што би се уклапало са претпоставком о изолованој грани која је у једној прилично затвореној планинској "тврђави" као што су Родопи успела да се очува до данашњих дана. Њена предачка грана L161 је пронађена и на Балтику, па претпостављам да је можда допирала и до Паноније и Балкана током неолита, енеолита и раног бронзаног доба.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Мај 21, 2020, 10:28:29 поподне
Оно што се променило у последњих 7-8 хиљада година није битније променило генетску слику Балкана и Европе.

Ово је потпуно нетачно. А и руши вам "снешка" због присуства R1b-Z2109, која је предачка за R1b-BY611>Z2705, врло распрострањену код Албанаца.  ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ojler Мај 21, 2020, 10:37:25 поподне
Да, док не дођу БАМ фајлови, све испод М423 је отворено. Ипак, делује ми да би могла бити она горе постављена грана због њене изолованости у Родопима (ако се добро сећам, носилац је Помак), што би се уклапало са претпоставком о изолованој грани која је у једној прилично затвореној планинској "тврђави" као што су Родопи успела да се очува до данашњих дана. Њена предачка грана L161 је пронађена и на Балтику, па претпостављам да је можда допирала и до Паноније и Балкана током неолита, енеолита и раног бронзаног доба.

Ја бих пре очекивао да ће бити нека "звездица", односно да се опет ради о "слепом цреву".
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Мај 21, 2020, 10:40:27 поподне
Ја бих пре очекивао да ће бити нека "звездица", односно да се опет ради о "слепом цреву".

Није немогуће, мада је овде већ у питању рано бронзано доба (2100-1800. п.н.е.). Мислим да су "звездице" више везане за неолит и енеолит, али је то само мој лични утисак.  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Мај 21, 2020, 11:17:47 поподне
Везано за ове културе раног бронзаног доба у Подунављу, пронађох на мрежи jeдан прилично прегледан рад Haskel J Greenfield The Maros culture: a regional subtradition during the Early Bronze Age of Central Europe који може у пдф да се нађе на следећем линку https://www.academia.edu/2100199/2001d_The_Maros_culture_a_regional_subtradition_during_the_Early_Bronze_Age_of_Central_Europe

Мокринско налазиште судећи по овом раду улази у тзв.централну групу.

У питању је тзв. моришка култура, која има више алтернативних назива: мокринска група, Перјамош култура (Periamos), Пећика култура (Pecica), зависно од тога да ли о њој пишу српски, мађарски или румунски археолози. Централна територија на којој се распростирала је био доњи ток реке Мориш.

https://sr.wikipedia.org/wiki/%D0%9C%D0%BE%D1%80%D0%B8%D1%88%D0%BA%D0%BE-%D0%BC%D0%BE%D0%BA%D1%80%D0%B8%D0%BD%D1%81%D0%BA%D0%B0_%D0%B3%D1%80%D1%83%D0%BF%D0%B0
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Мај 22, 2020, 12:12:39 пре подне

Опет без E-V13.  ::)
Ситуација са древном E-V13 постаје помало бизарна. Нигде је нема.

 Од Моришке културе су већ била два налаза само без Y-DNA. Ово није култура гдје сам ја очекивао E-V13. Како се чини нема везе са Панонијом у БД, што је очекивано.

 Но начуо сам да има необјављених "важних" E-V13 налаза на карпатском подручју. Онда је то источно подручје вјероватно. Источно се налази култура која је имала велике везе са Цетинском културом, гдје је и локални неолитски елемент учествовао значајно у генези. Нема тренутно никаквих налаза објављених са подручја Румуније у БД.

 И постоји и прије нове ере један скитски E-V13 налаз: scy197 E-FGC44169* Глиное, Молдавија. 300 г. пне. Аутозомално јасно се ради о скитизованим Гетима не само код тог већ и код још 3 налаза.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Мај 22, 2020, 07:31:17 пре подне
Но начуо сам да има необјављених "важних" E-V13 налаза на карпатском подручју.

То би било супер интересантно. А јел познато колико треба да чекамо до објаве тих налаза?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Мај 22, 2020, 12:08:13 поподне
То би било супер интересантно. А јел познато колико треба да чекамо до објаве тих налаза?

 Не, но има прилично радова изгледа који чекају објављивање. Не бих рекао да ће ово изаћи ове године но можда идуће.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Скардус Мај 23, 2020, 12:32:01 поподне
Ово је потпуно нетачно. А и руши вам "снешка" због присуства R1b-Z2109, која је предачка за R1b-BY611>Z2705, врло распрострањену код Албанаца.  ;)
Хехе. Треба имати стрпљења. Видећемо, надам се за коју годину најдуже, шта ће рећи наука. Можда нађемо пра-албанце у Тунису...
Био сам уверен да сам 100% Српске или Словенске генетике а оно испадох Баск или Каталонац.
Тако ће и у твом случају испасти са пра-албанцима.
Једноставно, гледам их сваког дана и видим да у добром проценту немају изглед Европљана. И даље тврдим да је Албански језик наметнут огромној већини (као код Мађара) и да пра-албанце треба тражити међу некој од варијанти хаплогрупе "Ј". Верујем да је она малобројна.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ojler Мај 23, 2020, 12:42:18 поподне
...
Једноставно, гледам их сваког дана и видим да у добром проценту немају изглед Европљана.
...

Шта си ти у стању да напишеш, то је чудо једно...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Грк Мај 23, 2020, 01:47:35 поподне
Шта си ти у стању да напишеш, то је чудо једно...

Право збориш, али није примитивизам највећи човјеков непријатељ, већ људска глупост.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Скардус Мај 23, 2020, 08:19:37 поподне
Шта си ти у стању да напишеш, то је чудо једно...
Одлично знате када се први пут помињу Албанци а говорите о пра-албанцима?  Нонсенс.
Ма битно је да сам вас насмејао.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ojler Мај 23, 2020, 09:56:21 поподне
Одлично знате када се први пут помињу Албанци а говорите о пра-албанцима?  Нонсенс.
Ма битно је да сам вас насмејао.

Шта сам ја говорио о пра-албанцима, шта причаш?

Него објасни ти мени којим то тачно метром мериш како изгледају Европљани па да и ја нешто научим. Јесу ли Албанци црнци па не изгледају као Европљани или у чему је њихов проблем? Није ми јасно какав је то "европски" изглед који си ти замислио да један народ треба да испуњава да би се квалификовао да носи епитет Европљанин. Јесу ли ниски коврџави Грци квргавог носа, који су ударили темеље европске цивилизације типични Европљани или и њима нешто фали? Или риђокоси пегави Ирци и Шкоти, да ли су се својим изгледом дисквалификовали? Или можда црномањасти латино Италијани и Шпанци, да ли превише личе на Цигане? Или косооки Лапонци, јесу ли превише налик Монголима? Да можда ипак право на титулу Европљанина оставимо великим плавокосим Скандинавцима и Русима, које су по лепоти претекли једино Срби? 
Најпре ће бити да по теби сви поменути имају право да личе на Европљане, само Албанци немају. Но то више говори о теби него о Албанцима...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: filipi Мај 24, 2020, 12:11:14 поподне
Srednjovjekovna Saksonija. Pronadjeni i uzorci slovenskog porijekla.

1. R1a-CTS11962, 3. R1a-L1029 4. I1- CTS7362 (?) 5. E-V13 8. I2-Y3210 9. R1a-L1029, 10

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.20.106971v1
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 24, 2020, 01:09:44 поподне
Srednjovjekovna Saksonija. Pronadjeni i uzorci slovenskog porijekla.

1. R1a-CTS11962, 3. R1a-L1029 4. I1- CTS7362 (?) 5. E-V13 8. I2-Y3210 9. R1a-L1029, 10

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.20.106971v1

Колико видим, тежиште рада је на дефинисању најповољнијих дијелова скелета за узимање и анализу древен днк. Дакле, у самом раду нема података о локацијама, старости, хаплогрупама.

Не видим на ENA да су објављени сирови резултати. У самом раду пише да ће бити приложени по објављивању рада (ово је препринт). Било би корисно прегледати ове словенске гране.

Иначе протеклих дана је била права поплава радова древне днк. I2-M423 је детектована у раду о нелоиту Француске и Њемачке (скоро сам постављао линк на тај рад),а колико видим присутна је и у неолиту Ирске (грана Ислес чини ми се). Ако томе додамо и скорашњу откривену у Мокрину, древан географија I2-M423 је овим радовима значајно употпуњена.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 24, 2020, 05:13:41 поподне
Још један рад старе ДНК објављен везан за мезолит и неолит на подручју Француске и Њемачке. 101 узорак.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/629712

На Anthrogenica форуму извучена је Y-днк из овог рада.

Sample_name   Accession   Hg   Hg_marker   Total_reads   Valid_markers
BDB001   ERS4238849   NA   NA   827   32
BOT004   ERS4238850   NA   NA   573   317
BOT005   ERS4238851   NA   NA   26   5
FLR001   ERS4238852   H2a1~   H-Z18920/etc*(xZ19055)   17336   7567
FLR002   ERS4238853   H2a1~   H-Z18902/etc*(xZ19055)   19813   8358
FLR013   ERS4238859   NA   NA   344   75
GRG003   ERS4238861   G2a2b2a1a1b1a1a1a1   G-Y10621*(xF1300.2,CTS7357.1,BY96420,Z45840,Y79321,Z45512,Z45929,BY71145,YSC0000033,Z45256,Z41181,Z45507,Z45525,FT104662,Y92137,BY181691)   54735   14681
GRG015   ERS4238863   NA   NA   547   12
GRG021   ERS4238867   G2a2b2a1   G-PF3337/etc*(xZ2024,AM01781.1,Z39805,SK1158,FT121947,FGC470,CTS342,Z30712,PF5145,Y48033,Z31268)   40571   13197
GRG023   ERS4238869   G2a2b2a1a1c1a1a2c2~   G-FT57729   11621   5547
GRG025   ERS4238870   NA   NA   525   25
GRG027   ERS4238871   G2a2b2a1a1b1a1a1a1b4   G-Z44675*(xZ45862,Y138649,FT126463)   53435   15028
GRG035   ERS4238874   G2a2b2a   G-PF3329/etc*(xU1,FT122042,Z3390,CTS342,S1415,Z30712,Y57846,Z31268,M7809,Z39357,Z6371,Y175851,Z30509,L288.2)   26695   9952
GRG041   ERS4238875   H2a1~   H-Z18920/etc*(xZ19047)   28177   9705
GRG043   ERS4238876   G2a2b2a1   G-Y287/etc*(xZ2024,S10678,Z39803,SK1156,FT121254,Z1822,Y368,Z16696,FGC37700,FGC65117,S1415,Z30712,Y48686,Z31250)   44620   13011
GRG047   ERS4238877   G2a2b2a1   G-PF3337*(xFGC7575,S10678,Z39805,SK1158,FT121357,Z736,CTS342,S1415,Y50523,Z31245)   16710   7382
GRG049   ERS4238878   NA   NA   179   69
GRG050   ERS4238879   NA   NA   154   12
GRG052   ERS4238880   G2a2b2a1a   G-PF3346*(xFGC954,AM01781.1,Z39805,SK1156,YFS4607980.2,S26003,Z723,FGC12138,FGC37761,FGC65117,S1415,Z30712,Z40368,Y46004)   27622   10358
GRG056   ERS4238881   NA   NA   215   9
HBS002   ERS4238883   G2a2b   G-CTS10449/etc*(xM3382,FGC946,Y142068,Z44150,Y18379,FT121672,Z730,Z3423,FGC12126,FGC37703,BY75083,Z40489,Z6894,Y175964,L288.2,PF3417)   2193   734
HBS004   ERS4238884   G2a2b2a1a1a1b1a2b1b~   G-FT48389   3873   1342
HBS006   ERS4238886   G2a2b2a1a1c1a   G-CTS11388*(xZ3388,FT12724)   9760   3318
LBR001   ERS4238890   I2a1b1a2a1b2~   I-Y15408   44089   13326
LBR002   ERS4238891   I2a1b1b2   I-Y6099   32739   11533
LBR005   ERS4238894   I2a1b   I-P217/etc*(xP220,S2577)   39470   14990
OBN001   ERS4238895   NA   NA   131   10
OBN003   ERS4238897   NA   NA   485   12
OBN004   ERS4238898   I2a1a2~   I-AM01261/etc*(xFGC7100,S20061)   19604   8139
OBN005   ERS4238899   I2a1a2~   I-AM01260/etc*(xAMM088,YP220)   16702   7205
OBN006   ERS4238900   C1a2b   C-Z44511/etc*(xZ44530)   21707   8859
OBN008   ERS4238902   NA   NA   819   27
OBN010   ERS4238904   NA   NA   321   24
OBN011   ERS4238905   I2a1a2~   I-Z2587/etc*(xFGC7100,S20646)   21641   8179
PEN001_real1   ERS4238906   J2b2a~   J-AM01377*(xL283,Z8334,Y965,Z8386)   2584   702
PEN001_real2   ERS4238907   NA   NA   4596   1805
PEN003   ERS4238908   I2a1a2~   I-AM01283/etc*(xAMM077,CTS7175)   36557   12595
SCH004   ERS4238913   NA   NA   749   190
SCH007   ERS4238914   NA   NA   1733   175
SCH009   ERS4238915   NA   NA   998   123
SCH010   ERS4238916   NA   NA   1872   183
SCH014   ERS4238918   NA   NA   1900   212
SCH015   ERS4238919   NA   NA   197   27
SCH016   ERS4238920   C1a2b   C-Z44471   20231   4034
SMH004   ERS4238922   R1b1a1b1a1a2b3   R-PF6601   9816   756
TGM008   ERS4238923   NA   NA   285   127
TGM009   ERS4238924   I2a2a1b   I-S6596*(xBY16362,FGC18098,BY47568)   30355   11240
XN164   ERS4238925   H2a1~   H-Z19016/etc*(xZ19050)   22132   4838
XN165   ERS4238926   H2a1~   H-Z18858*(xZ19055)   30448   6443
XN166   ERS4238927   NA   NA   4491   411
XN168   ERS4238929   H2a1~   H-Z18952*(xZ19050)   11957   3187
XN169   ERS4238930   NA   NA   1817   215
XN170   ERS4238931   H2~   H-SK1189/etc*(xZ19098,Y21591)   16358   4303
XN171   ERS4238932   H2a1~   H-Z19016/etc*(xZ19038)   22143   6529
XN172   ERS4238933   NA   NA   1865   229
XN174   ERS4238935   NA   NA   8234   2882
XN175   ERS4238936   NA   NA   948   105
XN178   ERS4238937   NA   NA   265   30
XN180   ERS4238938   H2a1~   H-Z18988*(xZ19055)   7681   2292
XN182   ERS4238939   NA   NA   913   141
XN183   ERS4238940   NA   NA   569   124
XN188   ERS4238941   NA   NA   1007   204
XN211   ERS4238946   NA   NA   837   77
XN215   ERS4238947   NA   NA   1144   351
XN224   ERS4238948   NA   NA   231   20
XN225   ERS4238949   H2   H-Z18849/etc*(xY21591)   3978   1482

Доступни су и сирови резултати, погледао сма површно ова 4 која су I2-M423: OBN004, OBN005, OBN011, PEN003. Имају негативних очитања на нивоима L161 и L621 (не директно ових SNP-ова који именују гране), такође неки имају и негативна очитања за баскијску подграну М-423.

Бар двојица имају позитивна очитања на Y3104. У суштини позиције се врте око М423* и Y3104*.

Мислим да сам примјетио и неке G2a-L42 али нисам детаљније прегледао.

Опет нема Е хаплогрупе у узорку неолитске Француске и Њемачке. Доминирају G2a, I2a и H2a. R1b још не бјеше пристигла.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Скардус Мај 24, 2020, 08:58:03 поподне
Шта сам ја говорио о пра-албанцима, шта причаш?

Него објасни ти мени којим то тачно метром мериш како изгледају Европљани па да и ја нешто научим.
Добро. Извињавам се. Погрешно сам се изразио, мада остајем при ставу да ментални склоп Албанаца није европски. Мала Азија и Блиски Исток су им ближи.
Мој однос према Албанцима је сасвим коректан а имам на десетине пријатеља. У глобалу, волим их исто онолико колико они воле Србе.
Проблем је што на овом форуму примећујем надљудски напор да се наметне теза да су Албанци Илири а ако то не прође онда Трачани или Дарданци. Та теза је злонамерна јер иде уз длаку званичној Албанској политици, која за Илире каже да су пра-албанци.
Иде се дотле да се од две-три "познате" Илирске речи некако нађе веза са Албанским речима.
На другој страни, оно много изгледније, које има утемељење у многим званичним документима - да су Срби и Хрвати Илирског порекла, узима се са подсмехом и гађењем.
Нисам сигуран да знате рејтинг овог форума међу Србима? Жалосно је низак а ја сам вам управо написао због чега.
Хвала.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ojler Мај 24, 2020, 09:56:30 поподне
Добро. Извињавам се. Погрешно сам се изразио, мада остајем при ставу да ментални склоп Албанаца није европски. Мала Азија и Блиски Исток су им ближи.
Мој однос према Албанцима је сасвим коректан а имам на десетине пријатеља. У глобалу, волим их исто онолико колико они воле Србе.
Проблем је што на овом форуму примећујем надљудски напор да се наметне теза да су Албанци Илири а ако то не прође онда Трачани или Дарданци. Та теза је злонамерна јер иде уз длаку званичној Албанској политици, која за Илире каже да су пра-албанци.
Иде се дотле да се од две-три "познате" Илирске речи некако нађе веза са Албанским речима.
На другој страни, оно много изгледније, које има утемељење у многим званичним документима - да су Срби и Хрвати Илирског порекла, узима се са подсмехом и гађењем.
Нисам сигуран да знате рејтинг овог форума међу Србима? Жалосно је низак а ја сам вам управо написао због чега.
Хвала.

Јасно је да постоји менталитет Албанаца на Косову као што га имају и било који други народи, то уопште није спорно. Ни Срби немају свуда исти менталитет и вероватно се Србин из Суботице и Србин из Штрпца у много чему више разликују него Србин и Хрват из Суботице.
Из угла неког Немца вероватно и Србин из руралних крајева Србије или Црне Горе својим менталитетом више личи на "источњака" него на Европљанина. Та ствар је у великој мери у оку посматрача.

А што се тиче овог Форума, он нема своје мишљење, већ га имају појединци који га посећују. Свега пар људи се овде озбиљније уопште и бави пореклом Албанаца а колико ће њихов став бити уважаван зависи од репутације коју су стекли међу посетиоцима. Ја рецимо никад нисам изучавао порекло Албанаца па о томе могу да судим само на основу поверења које сам стекао у ставове људи који о томе причају. Ако имаш добрих аргумента и жеље да опонираш њиховим ставовима, слободно изволи. Дај изворе, податке, мишљења других признатих истраживача који подупиру твој став (какав год да је), па да се укрсте тезе. Тако се стиче репутација и кредит да ти сутра неко поверује кад нешто напишеш.

Када је у питању рејтинг Форума Порекла међу Србима, нисам испратио то истраживање па не знам резултате. Знам само да је међу Србима са којима се ја дружим веома цењен. А фала богу оних других форума, са високим рејтингом у Срба, не мањка. Зато нека остане овај један онима који више воле да мисле својом главом него да их неко воли.

Не бих више затрпавао тему нашом дискусијом којој овде није место...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Златан Мај 24, 2020, 10:42:32 поподне
Добро. Извињавам се. Погрешно сам се изразио, мада остајем при ставу да ментални склоп Албанаца није европски. Мала Азија и Блиски Исток су им ближи.
Мој однос према Албанцима је сасвим коректан а имам на десетине пријатеља. У глобалу, волим их исто онолико колико они воле Србе.
Проблем је што на овом форуму примећујем надљудски напор да се наметне теза да су Албанци Илири а ако то не прође онда Трачани или Дарданци. Та теза је злонамерна јер иде уз длаку званичној Албанској политици, која за Илире каже да су пра-албанци.
Иде се дотле да се од две-три "познате" Илирске речи некако нађе веза са Албанским речима.
На другој страни, оно много изгледније, које има утемељење у многим званичним документима - да су Срби и Хрвати Илирског порекла, узима се са подсмехом и гађењем.
Нисам сигуран да знате рејтинг овог форума међу Србима? Жалосно је низак а ја сам вам управо написао због чега.
Хвала.

Албанци као аутохтон народ на овим просторима сигурно имају одређен илирски удео у свом генетском коду, али исто тако га имају и данашњи Срби, Хрвати, Бугари и други. О томе да су Албанци директни наследници Илира по мени не може бити говора, јер не постоји континуитет који би историјски испратио такав процес. Илири силазе са европске позорнице (ако не грешим) негде у 4. или 5. веку, а Албанци се као народ под овим именом помињу тек много векова касније. Свако њихово помињање у контексту директних и искључивих наследника Илира је у најмањеу руку неозбиљно.

Сада, наравно да су данашњи Срби наследници илирског генетског материјала. То није спорно, али овде је ипак реч о чињеници да наше I2A Y3120 не можемо назвати наследницима илирског генетског материјала, а они су ти који су (заједно са R1a гранама) осталим старобалканским припадницима дали језик и име.

А ово последње у вези колико је форум популаран је крајње неозбиљно с твоје стране. Јел' си одрадио неку анкету? Или су то мишљења људи који посећују аутохтонистичке форуме а-ла Шарић итд? А и генерално, када би човек радио само да би се неком свидео, неби ишта успео у животу. Другим речима, колико се човек неком свиђа или не у овој области - то је небитно. Нисмо на естради и то би требао да разумеш.



Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 25, 2020, 09:10:08 пре подне
Srednjovjekovna Saksonija. Pronadjeni i uzorci slovenskog porijekla.

1. R1a-CTS11962, 3. R1a-L1029 4. I1- CTS7362 (?) 5. E-V13 8. I2-Y3210 9. R1a-L1029, 10

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.20.106971v1

Колико видим, тежиште рада је на дефинисању најповољнијих дијелова скелета за узимање и анализу древен днк. Дакле, у самом раду нема података о локацијама, старости, хаплогрупама.

Не видим на ENA да су објављени сирови резултати. У самом раду пише да ће бити приложени по објављивању рада (ово је препринт). Било би корисно прегледати ове словенске гране.

Иначе протеклих дана је била права поплава радова древне днк. I2-M423 је детектована у раду о нелоиту Француске и Њемачке (скоро сам постављао линк на тај рад),а колико видим присутна је и у неолиту Ирске (грана Ислес чини ми се). Ако томе додамо и скорашњу откривену у Мокрину, древан географија I2-M423 је овим радовима значајно употпуњена.

Не погледах рад детаљније, па нисам примјетио да је дата локација узорака Krakau near Peissen. То је подручје близу ушћа Сале у Лабу. Насеље су основали Словени у 9. вијеку,а у 14. вијеку насеље је већ било напуштено.

Словенска племена у овом дијелу улазила су у српски племенски савез. Конкретно на овој локацији помиње се племе Жирмунти.

https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%96%D0%B8%D1%80%D0%BC%D1%83%D0%BD%D1%82%D1%8B

Једва чекам да објаве сирове резултате, не би ли се могло нешто више извући од подграна L1029 и Y3120, али и J2b-M241 и E-V13.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: filipi Мај 25, 2020, 10:10:29 пре подне
Не погледах рад детаљније, па нисам примјетио да је дата локација узорака Krakau near Peissen. То је подручје близу ушћа Сале у Лабу. Насеље су основали Словени у 9. вијеку,а у 14. вијеку насеље је већ било напуштено.

Словенска племена у овом дијелу улазила су у српски племенски савез. Конкретно на овој локацији помиње се племе Жирмунти.

https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%96%D0%B8%D1%80%D0%BC%D1%83%D0%BD%D1%82%D1%8B

Једва чекам да објаве сирове резултате, не би ли се могло нешто више извући од подграна L1029 и Y3120, али и J2b-M241 и E-V13.
Ovo?
https://www.google.com/amp/s/www.medieval.eu/medieval-truck-stop-excavated/amp/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 25, 2020, 10:54:06 пре подне
Ovo?
https://www.google.com/amp/s/www.medieval.eu/medieval-truck-stop-excavated/amp/

Да, то би требало бити то налазиште.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 27, 2020, 09:54:41 пре подне
Објављен је и рад о генетичкој историји Француске са већим бројем узорака од мезолита до жељезног доба. Доста резултата очекивано. Разне гране I2a у мезолиту и неолиту, појава R1b заједно са степском Јамнаја аутосомалном генетиком у Бел Бикер периоду. Има и један I1 из Жељезног доба.
https://www.pnas.org/content/early/2020/05/20/1918034117

Сирови резултати су већ неко вријеме доступни, па је било и детаљнијих анализа грана по страним форумима. Што се I2-M423 тиче присутно је 5 узорака из периода од 4800-4000 г пне, четири узорка су из области Алзаса, док је један из околине Калеа. Углавном се ради о M423>Y3104* и М423>Y3104>L161.

Доста древне I2-M423 изоловано је ове године и то на прилично широком простору од Ирске преко рајнско-алпског подручја до Паноније. И ова хаплогрупа би се могла сврстати у оне гране које су биле значајно присутније у прошлости него данас.  Чини се да је та хаплогрупа била прилично заступљена међу мезолитским и неолитским становницима централне и западне Европе.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Мај 27, 2020, 06:27:09 поподне
Објављен је и рад о генетичкој историји Француске са већим бројем узорака од мезолита до жељезног доба. Доста резултата очекивано. Разне гране I2a у мезолиту и неолиту, појава R1b заједно са степском Јамнаја аутосомалном генетиком у Бел Бикер периоду. Има и један I1 из Жељезног доба.
https://www.pnas.org/content/early/2020/05/20/1918034117

3x E-M78 и 2x E-M215
Резултати можда не указују на неке нове сценарије али су у принципу важни за E-V13.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 27, 2020, 08:00:20 поподне
3x E-M78 и 2x E-M215
Резултати можда не указују на неке нове сценарије али су у принципу важни за E-V13.

Видио сам збирни дијаграм на којем је приказана Е хаплогрупа као присутна у овом раду, али нисам видио табелу са информацијама о узорцима за Е.

Знаш ли можда који су називи (шифре) ових узорака који су Е?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Мај 27, 2020, 08:09:08 поподне
Знаш ли можда који су називи (шифре) ових узорака који су Е?

BERG79
BERG157-3
BERG157-4
BERG157-9
CLR11
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 27, 2020, 08:22:44 поподне
BERG79
BERG157-3
BERG157-4
BERG157-9
CLR11

Хвала ти. Претпостављам да је неко већ прегледао бамове? Уколико стигнем, погледаћу мало, да видим докле се може ићи низводно.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Мај 27, 2020, 08:34:55 поподне
Хвала ти. Претпостављам да је неко већ прегледао бамове? Уколико стигнем, погледаћу мало, да видим докле се може ићи низводно.

Није ми познато да се неко бавио бам фајловима. Вероватно су фајлови тек од скора доступни (ако уопште јесу доступни).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 27, 2020, 08:44:17 поподне
Није ми познато да се неко бавио бам фајловима. Вероватно су фајлови тек од скора доступни (ако уопште јесу доступни).

Покушавам сад на претрази да нађем ове Е бам фајлове, али не иде. Могуће да за неке узорке нису радили секвенцирање или бам фајлови нису доступни.

Доступни су иначе бам фајлови за неке друге узорке из овог рада.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 27, 2020, 08:53:42 поподне
Покушавам сад на претрази да нађем ове Е бам фајлове, али не иде. Могуће да за неке узорке нису радили секвенцирање или бам фајлови нису доступни.

Доступни су иначе бам фајлови за неке друге узорке из овог рада.

Рекао бих да су за неке узорке радили само СНП тестирање,а међу њима су изгледа и сви из Е хаплогрупе. Тако да ништа од бамова.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: filipi Мај 28, 2020, 09:56:44 поподне
https://www.cell.com/cell/pdf/S0092-8674(20)30509-2.pdf?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0092867420305092%3Fshowall%3Dtrue

Genome-wide analysis of 110 ancient individuals from the Near East

Gene pools of Anatolia and Caucasus were biologically connected ∼6500 BCE

Gene flow from neighboring populations in Northern Levant during 3 rd millennium BCE

One individual of likely Central Asian origin in 2 nd millennium BCE Northern Levant
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 29, 2020, 08:24:18 пре подне
https://www.cell.com/cell/pdf/S0092-8674(20)30509-2.pdf?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0092867420305092%3Fshowall%3Dtrue

Genome-wide analysis of 110 ancient individuals from the Near East

Gene pools of Anatolia and Caucasus were biologically connected ∼6500 BCE

Gene flow from neighboring populations in Northern Levant during 3 rd millennium BCE

One individual of likely Central Asian origin in 2 nd millennium BCE Northern Levant

Ако сам добро видио, углавном: Ј1, Ј2а, G2a-M406, E-M123, понека L, T, H2. Има и један R1b-L754.

Такође, има неколико J2b. За наше М205 свакако најзначајнији је резултат J2b-M205 из налазишта Алалах близу Антакије на турско-сиријској граници. Узорак се датира у 1600-1700 година пне. То налазиште требало би припадати Аморићанима.

https://sr.wikipedia.org/wiki/%D0%90%D0%BC%D0%BE%D1%80%D0%B8%D1%82%D0%B8
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 29, 2020, 09:02:58 пре подне
На налазишту Алалах је присутна још један узорак J2b, али није М205 већ припада грани https://www.yfull.com/tree/J-Z2453/

Трећи J2b коме није одређене дубља подграна је из налазишта Titriş Höyük и нешто је старији , око 2300 г. пне

http://www3.uakron.edu/titris/overview.html

Дакле сва три налаза J2b су са турско-сиријске границе, период од 2300-1600 пне.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Мај 29, 2020, 09:08:09 пре подне
Ако сам добро видио, углавном: Ј1, Ј2а, G2a-M406, E-M123, понека L, T, H2. Има и један R1b-L754.

Такође, има неколико J2b. За наше М205 свакако најзначајнији је резултат J2b-M205 из налазишта Алалах близу Антакије на турско-сиријској граници. Узорак се датира у 1600-1700 година пне. То налазиште требало би припадати Аморићанима.

https://sr.wikipedia.org/wiki/%D0%90%D0%BC%D0%BE%D1%80%D0%B8%D1%82%D0%B8

На истом налазишту где је пронађена M205 постоји и J2b-CTS6812/Z2454. То је мислим предачка грана M241. Недалеко одатле (TItrişHöyük), пронађена је и једна J2b-M12. Ако буде БАМ фајлова, може бити интересантно за порекло саме J2b.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 29, 2020, 09:22:03 пре подне
На истом налазишту где је пронађена M205 постоји и J2b-CTS6812/Z2454. То је мислим предачка грана M241. Недалеко одатле (TItrişHöyük), пронађена је и једна J2b-M12. Ако буде БАМ фајлова, може бити интересантно за порекло саме J2b.

Грана J2b-CTS6812 није предачка за M241, могло би се рећи да јој сестринска. Видим да је доста присутна у арапском свијету, али је има и по Европи (можда преко Јевреја?). Нисам се детаљније бавио, па не знам. Ово видим само из YFull стабла.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: filipi Јун 05, 2020, 03:20:38 поподне
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/ajpa.24079
I2a1a and I2a1b samples along with low coverage I2a-L460 and I2-M438 samples. Battle Axe samples had half WHG ancestry, while the other half was a near equal mix of EEF and WSH ancestry. Pitted Ware samples had mostly WHG ancestry with some EEF ancestry. Funnelbeaker samples had nearly equal amounts of WHG and EEF ancestry. The migrations associated with these cultures occur very close to the Times to Most Recent Common Ancestors of I1-M253 and I2a-L38.

(https://i.postimg.cc/BZx2MDNY/FB-IMG-1591363196006.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ДушанВучко Јун 27, 2020, 07:16:20 поподне
Далеки "рођа" из Шведске :)  (I2-L460>P37.2>M423>L621>CTS10228>(S17250,Y4460,Z17855)
Motala reconstruction. Haplogroup I2-L460, mtDna U2e1.
5000 BC from Ostergotland, southern Sweden.
(https://www.nationalgeographic.com/content/dam/archaeologyandhistory/2020/06/ludvig-facial-reconstruction/01-facial-reconstruction-mystery-skull.adapt.1190.1.jpg)
https://api.nationalgeographic.com/distribution/public/amp/history/2020/06/exclusive-skull-ritual-site-motala-reconstructed?fbclid=IwAR3UvUHWzT9UNEeeq8DoxVBRnUPad786pA21HQRTx81CTIuS-63rvtm5_No
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Јун 27, 2020, 08:01:58 поподне
Далеки "рођа" из Шведске :)  (I2-L460>P37.2>M423>L621>CTS10228>(S17250,Y4460,Z17855)
Motala reconstruction. Haplogroup I2-L460, mtDna U2e1.
5000 BC from Ostergotland, southern Sweden.
(https://www.nationalgeographic.com/content/dam/archaeologyandhistory/2020/06/ludvig-facial-reconstruction/01-facial-reconstruction-mystery-skull.adapt.1190.1.jpg)
https://api.nationalgeographic.com/distribution/public/amp/history/2020/06/exclusive-skull-ritual-site-motala-reconstructed?fbclid=IwAR3UvUHWzT9UNEeeq8DoxVBRnUPad786pA21HQRTx81CTIuS-63rvtm5_No

Мислим да је само један скелет из Мотале идентификован као I2-M423*. Овај чију су реконструкцију дали би требало да је још узводнија I2-L460*.

https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/suppl/2017/07/17/164400.DC1/164400-2.pdf

Стр. 29
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милан Петровић Јун 27, 2020, 08:13:58 поподне
Мало да поткреше браду, да обуче кошуљу и панталоне, па пролази као Драгутин из Требиња.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Concom Јул 09, 2020, 10:29:43 поподне
Мало да поткреше браду, да обуче кошуљу и панталоне, па пролази као Драгутин из Требиња.


Meni više liči na askurđela pokojnog glumca Mande, onakvog kakav je izgledao u "Selo gori, a baba se češlja".
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јул 10, 2020, 02:28:23 поподне
Наишао сам данас на нови археогенетички рад (објављен 7. јула 2020) ,а који се односи на генетичко поријекло мађарске династије Арпадоваца. Знам да су подаци о Бели III и раније објављивани. Иако још нисма детаљније прочитао рад, мислим да су радили неке SNP профилације и да повезују Арпадовце са данашњом башкирском популацијом.

https://www.nature.com/articles/s41431-020-0683-z

We set out to identify the origins of the Árpád Dynasty based on genome sequencing of DNA derived from the skeletal remains of Hungarian King Béla III (1172–1196) and eight additional individuals (six males, two females) originally interred at the Royal Basilica of Székesfehérvár. Y-chromosome analysis established that two individuals, Béla III and HU52 assign to haplogroups R-Z2125 whose distribution centres near South Central Asia with subsidiary expansions in the regions of modern Iran, the Volga Ural region and the Caucasus. Out of a cohort of 4340 individuals from these geographic areas, we acquired whole-genome data from 208 individuals derived for the R-Z2123 haplogroup. From these data we have established that the closest living kin of the Árpád Dynasty are R-SUR51 derived modern day Bashkirs predominantly from the Burzyansky and Abzelilovsky districts of Bashkortostan in the Russian Federation. Our analysis also reveals the existence of SNPs defining a novel Árpád Dynasty specific haplogroup R-ARP. Framed within the context of a high resolution R-Z2123 phylogeny, the ancestry of the first Hungarian royal dynasty traces to the region centering near Northern Afghanistan about 4500 years ago and identifies the Bashkirs as their closest kin, with a separation date between the two populations at the beginning of the first millennium CE.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јул 10, 2020, 02:59:02 поподне
Ово је табела са старом ДНК из овог рада. Поред Беле III само је још један Арпадовић који припада хаплогрупи https://www.yfull.com/tree/R-Y2633/ тј. нижој подграни ове хаплогрупе означене као SUR51.  https://haplogroup.org/ystory/r-sur51/

Остали припадају разним хаплогрупама:
https://www.yfull.com/tree/J-ZS7640/
https://www.yfull.com/arch-3.09/tree/R-PF6658/
https://www.yfull.com/tree/E-Y58870/
https://www.yfull.com/tree/R-YP1626/
https://haplogroup.org/ystory/r-by41605/

https://www.nature.com/articles/s41431-020-0683-z/tables/2

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јул 10, 2020, 03:20:41 поподне
Судећи по овом раду, чини се да у Новом Саду живи потомак Арпадовића или бар рођак (сад да ли је Србин или Мађар, не знам). Не знам ни да ли је из јавне или анонимне базе. Ево шта пише:

"and SUR51 present in the 48 Bashkirs, the individual from modern day Serbia and the two Árpád Dynasty members, Béla III (HU3B) and HU52. The R-SUR51 haplogroup bifurcates further after 17 shared SNPs (Table S7). The Bashkirs have the additional six SNPs associated with R-SUR51, while the individual from modern day Serbia and the two Árpád Dynasty members lack these, but are derived for a novel haplogroup, R-ARP, defined by nine shared SNPs. The individual from modern day Serbia has nine additional private SNPs, absent from the ancient samples, that define a novel haplogroup R-UVD (Ujvidék; the Hungarian name of modern day Novi Sad). 38 Bashkirs are further derived for R-SUR2 and its subhaplogroups R-SUR72 and R-SUR3/SUR95 while 7 have not been derived past R-SUR51*."

Да неко случајно није наишао на податак о тестираном из Новог Сада који припада овој хаплогрупи?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Јул 10, 2020, 03:24:53 поподне
Наишао сам данас на нови археогенетички рад (објављен 7. јула 2020) ,а који се односи на генетичко поријекло мађарске династије Арпадоваца. Знам да су подаци о Бели III и раније објављивани. Иако још нисма детаљније прочитао рад, мислим да су радили неке SNP профилације и да повезују Арпадовце са данашњом башкирском популацијом.

 Занимљиво, то су они исти узорци од раније. Изгледа да сам погодио неке. 8) За Z93 Белу бар Z2123. Ово директно повезивање са Башкирима не изгледа нешто реално, осим ако се иде преко старог снипа Z2123. Код Башкира је заступљена највише R-Y5977. Грана Беле III је најчешћа на Блиском истоку, иако има и номадских налаза са Тјаншана. Мада има једна друга грана код Мађара данас која би требало да има ближе везе са Башкирима.

Бела изгледа као Y934>YP451>YP449 (R-YP450-). За CTS34002 проблем прави његов dys385, као и височији GATAH4. За неке ближе Z284 је проблем њихов модал dys448=19, који их може се рећи избацује из круга. Бела има јако чудну високу вриједност на dys389ii, али обзиром да је тако чудна рекао бих да је вјероватно једноставно необична вишеструка мутација.

 за J1 сигурно је CTS1460, али доста чудних dys392=13 га чини могуће најближим једном турском хаплотипу из турско-јерменско-казахске групе S12993>FGC37470. (J-Y22035 Yfull)

 За E-V13, сложио бих се са симом да показује афинитет са Кузмановићем. И највјероватнија опција за обоје јесте грана FGC11450>CTS11286 (Швицарац), генерално имају као и скоро сви FGC11450 GATAH4=10 (са одузимањем), и наравно dys390=23 који их чини ближим Шпару. Имају још двије гране, један други Z5108, и један S-7461, који би можда били у оптицају, али ипак додајући и Кузмановићеве маркере они имају мале шансе, посебно други.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јул 10, 2020, 03:25:26 поподне
Закључак из рада везан за миграцију и долазак Мађара. Поклапају се периоди издвајања посебних линија за R1a-Z93 и N1c хаплогрупу древних Мађара:

"This would suggest that a group of people consisting of a Turkic (R-SUR51) component and a Finno-Ugric (N-B539) component left the Volga Ural region about 2000 years ago and started a migration that eventually culminated in settlement in the Carpathian Basin."
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јул 10, 2020, 03:26:19 поподне
Занимљиво, то су они исти узорци од раније. Изгледа да сам погодио неке. 8) За Z93 Белу бар Z2123. Ово директно повезивање са Башкирима не изгледа нешто реално, осим ако се иде преко старог снипа Z2123. Код Башкира је заступљена највише R-Y5977. Грана Беле III је најчешћа на Блиском истоку, иако има и номадских налаза са Тјаншана. Мада има једна друга грана код Мађара данас која би требало да има ближе везе са Башкирима.

Зор, прочитај детаљније рад, рађени су NGS тестови и веза са Башкирима је несумњива.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Јул 10, 2020, 04:01:57 поподне
Зор, прочитај детаљније рад, рађени су NGS тестови и веза са Башкирима је несумњива.

 Да, сад гледам башкирске резултате неке то је група Башкира из клана Кипсак, који су R-Y2632 али нико није уплоадовао на YFull још увијек за разлику од споменуте гране. На неким STR вриједностима се види афинитет са Белом.

 Што се тиче овог узорка из Србије. Успио сам га наћи по STR вриједностима. То је студија Згоњанин и других што се наводи у овој студији. Узорак је из Војводине.
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28789900/

ID147SerPop    Serbia [Serbian] North

 На 17 маркера има само једна разлика са Белом, и то је овај повећан 389ii (код оба). Јесу то радили NGS у студији Згоњанин? То ми је занимљиво јер у тој студији имам два ближа рођака. Или су аутори раније студије о Бели видјели поклапање са њим па је само рађен за њега NGS? Углавном као да је могуће доћи до NGS неких резултата из студија ако постоји интерес колега..

 Врло могуће да је Мађар мада нисам видио досад код њих таквих хаплотипова, мада и није превише Мађара још увијек тестирано.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ДушанВучко Јул 11, 2020, 02:18:53 пре подне
Морам мало ликовима да се позабавим, знам да не мора да има везе, али једна слика старог Башкира и бисте Арпада и Краља Стефана, првог мађарског краља :) :
(https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/8a/Bashkir_elder.jpg/220px-Bashkir_elder.jpg)
https://en.wikipedia.org/wiki/Bashkirs
(https://c8.alamy.com/comp/GKTD3H/prince-arpad-statue-by-hungarian-sculptor-gyorgy-zala-on-the-millennium-GKTD3H.jpg)
(https://www.traditioninaction.org/SOD/SODimages5/249_Bust.jpg)
https://tlm-md.blogspot.com/2013/09/st-stephen-of-hungary-king-confessor-s.html
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Јул 11, 2020, 03:39:35 пре подне
Судећи по овом раду, чини се да у Новом Саду живи потомак Арпадовића или бар рођак (сад да ли је Србин или Мађар, не знам). Не знам ни да ли је из јавне или анонимне базе. Ево шта пише:

"and SUR51 present in the 48 Bashkirs, the individual from modern day Serbia and the two Árpád Dynasty members, Béla III (HU3B) and HU52. The R-SUR51 haplogroup bifurcates further after 17 shared SNPs (Table S7). The Bashkirs have the additional six SNPs associated with R-SUR51, while the individual from modern day Serbia and the two Árpád Dynasty members lack these, but are derived for a novel haplogroup, R-ARP, defined by nine shared SNPs. The individual from modern day Serbia has nine additional private SNPs, absent from the ancient samples, that define a novel haplogroup R-UVD (Ujvidék; the Hungarian name of modern day Novi Sad). 38 Bashkirs are further derived for R-SUR2 and its subhaplogroups R-SUR72 and R-SUR3/SUR95 while 7 have not been derived past R-SUR51*."

Да неко случајно није наишао на податак о тестираном из Новог Сада који припада овој хаплогрупи?
Овде https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/R;name=R-SUR51 су издвојени R-ARP5 и R-FT351000 без "заставица", па је тешко рећи да ли је реч о Новосађанину.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јул 11, 2020, 07:10:11 пре подне
Овде https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/R;name=R-SUR51 су издвојени R-ARP5 и R-FT351000 без "заставица", па је тешко рећи да ли је реч о Новосађанину.

Колико сам успио схватити из рада, они су овог Новосађанина нашли у некој од анонимних радова који су тестирали STR маркере, па су га на основу блискости маркера тестирали прво на неку од подграна Z93 и тек кад су видјели да је близак Арпадовићима, урадили су и NGS тестове који су потврдили да је Новосађанин и по SNP-овима најближи Арпадовићима. Тако, да га вјероватно нема у ФТДНА бази. Могуће да је узет из рада који је Зор поменуо.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јул 11, 2020, 07:22:01 пре подне
Морам мало ликовима да се позабавим, знам да не мора да има везе, али једна слика старог Башкира и бисте Арпада и Краља Стефана, првог мађарског краља :) :
(https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/8a/Bashkir_elder.jpg/220px-Bashkir_elder.jpg)
https://en.wikipedia.org/wiki/Bashkirs
(https://c8.alamy.com/comp/GKTD3H/prince-arpad-statue-by-hungarian-sculptor-gyorgy-zala-on-the-millennium-GKTD3H.jpg)
(https://www.traditioninaction.org/SOD/SODimages5/249_Bust.jpg)
https://tlm-md.blogspot.com/2013/09/st-stephen-of-hungary-king-confessor-s.html

Не мора  значити да су Арпадовићи били монголоидног типа. Башкири представљају прелаз између двије расе: европске и монгoлоидне, при чему је европоидна компонента међу Башкирима прилично стара.

Изгледа да је присуство Башкира у мађарској конфедерацији племена познато и из историјских извора. ово се може прочитати на руској Википедији:

"В IX веке вместе с древними мадьярами предгорья Урала покинули родовые подразделения нескольких древнебашкирских родов, таких как Юрматы, Еней, Кесе и ряда других. Они вошли в состав древневенгерской конфедерации племён, которая располагалась в стране Леведии, в междуречье Дона и Днепра. В начале X века венгры вместе с башкирами под предводительством князя Арпада перешли через Карпатские горы и завоевали территорию Паннонии, основав Венгерское королевство.

В X веке первые письменные сведения о башкирах Венгрии встречаются в книге арабского учёного Аль-Масуди «Мурудж аз-захаб». Он называет и венгров, и башкир башгирдами или баджгирдами. По мнению известного тюрколога Ахмад-Заки Валиди, численное доминирование башкир в венгерской армии и переход политической власти в Венгрии в руки верхушки башкирских племён Юрматы и Еней в XII в. привели к тому, что этноним башгирд (башкир) в средневековых арабских источниках стал служить для обозначения всего населения Венгерского королевства."

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Јул 14, 2020, 02:49:58 пре подне
 Ево их на YFull-у:
https://yfull.com/tree/E-Y58870/
https://www.yfull.com/tree/R-Y2632/
https://www.yfull.com/tree/J-ZS7640/

 Ово мора да су Бела III и његов син (мислим да је и он тестиран), ови остали су можда Башкири.

 Надам се као што су овдје поновили студију са Арпадом, и радили NGS, да ће исто урадити с оном студијом Авара и мађарских Освајача гдје има још више узорака.

 R1a у кластеру са Хрватима Чакавцима.
 https://www.yfull.com/tree/R-M12335/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bars Јул 14, 2020, 10:12:27 поподне
Hello!
I don't know Serbian
language. I write in Russian and English. Sorry ...

I am a Bashkir by nationality. In this 2020th year, we are holding a Kurultai of our
clan - R1a-Y2632 on the paternal side.
Kurultai will be held in Bashkiria.

Our clan is scattered all over the world, as we are descendants of the Saka-Dinling steppe people. Recently we learned that representatives of our clan are also among the Serbs in Vojvodina. These Serbs are descendants of king Arpad.

Our line is R1a-SUR51. The same line also for the Arpads and this Serb. We would like to find this Serb from Vojvodina and invite him to our Kurultai in Bashkiria.

Do you have any contacts of this Serbs from the R1a-SUR51 line?
LET him write to me at [email protected]

On Kurultai we will get acquainted and communicate with each other. There will also be traditions of our ancestors in Kurultai - we will shoot arrows, drink kumys, live in yurts, ride horses.

Good day.

Здравствуйте!
Я не знаю сербский
язык. Пишу на русском и на английском языках.

По национальности я башкир. В этом 2020м году мы проводим курултай нашего
клана - R1a-Y2632 по отцовской линии.
Курултай будет проходить в Башкирии.

Клан у нас разбросан по всему миру, так как мы - потомки степняков саков-динлин. Недавно мы узнали что представители нашего клана есть и среди сербов в Воеводине. Они потомки короля Арпада.

Наша линия R1a-SUR51. Такая же линия у Арпадов и у этого серба. Мы хотели бы найти этого серба с Воеводины и пригласить его на наш курултай в Башкирию.

Есть ли у вас контакты этого серба с линией R1a-SUR51?
ПУСТЬ он напишет мне на [email protected]

На курултае мы будем знакомится и общаться друг с другом. Будут и традиции наших предклв на курултае - мы будеи стрелять из лука, пить кумыс, жить в юртах, ездить на лошадях.

Доброго дня.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bars Јул 14, 2020, 10:19:41 поподне
Цитат: ДушанВучко
Морам мало ликовима да се позабавим, знам да не мора да има везе, али једна слика старог Башкира и бисте Арпада и Краља Стефана, првог мађарског краља :)

No bro.
These are the phenotypes of Bashkirs from
R1a-SUR51.

(http://suyun.info/userfiles/bulletin/images/kuns.png)
My father in this photo - on the left. R1a-SUR51.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Concom Јул 14, 2020, 10:30:15 поподне
No bro.
These are the phenotypes of Bashkirs from
R1a-SUR51.

(http://suyun.info/userfiles/bulletin/images/kuns.png)
My father in this photo - on the left. R1a-SUR51.

If your father is this Сура-телевский guy, he is the most handsome of the three.

I am a little surprised with deep blue eyes of the guy in the middle, because it must come from both maternal and paternal side (recessive gene).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јул 14, 2020, 10:30:48 поподне
Hello!
I don't know Serbian
language. I write in Russian and English. Sorry ...

I am a Bashkir by nationality. In this 2020th year, we are holding a Kurultai of our
clan - R1a-Y2632 on the paternal side.
Kurultai will be held in Bashkiria.

Our clan is scattered all over the world, as we are descendants of the Saka-Dinling steppe people. Recently we learned that representatives of our clan are also among the Serbs in Vojvodina. These Serbs are descendants of king Arpad.

Our line is R1a-SUR51. The same line also for the Arpads and this Serb. We would like to find this Serb from Vojvodina and invite him to our Kurultai in Bashkiria.

Do you have any contacts of this Serbs from the R1a-SUR51 line?
LET him write to me at [email protected]

On Kurultai we will get acquainted and communicate with each other. There will also be traditions of our ancestors in Kurultai - we will shoot arrows, drink kumys, live in yurts, ride horses.

Good day.

Здравствуйте!
Я не знаю сербский
язык. Пишу на русском и на английском языках.

По национальности я башкир. В этом 2020м году мы проводим курултай нашего
клана - R1a-Y2632 по отцовской линии.
Курултай будет проходить в Башкирии.

Клан у нас разбросан по всему миру, так как мы - потомки степняков саков-динлин. Недавно мы узнали что представители нашего клана есть и среди сербов в Воеводине. Они потомки короля Арпада.

Наша линия R1a-SUR51. Такая же линия у Арпадов и у этого серба. Мы хотели бы найти этого серба с Воеводины и пригласить его на наш курултай в Башкирию.

Есть ли у вас контакты этого серба с линией R1a-SUR51?
ПУСТЬ он напишет мне на [email protected]

На курултае мы будем знакомится и общаться друг с другом. Будут и традиции наших предклв на курултае - мы будеи стрелять из лука, пить кумыс, жить в юртах, ездить на лошадях.

Доброго дня.

This Serb R1a-SUR51 is not from public databases. He was probably testеd in the study mentioned by Zor

 
Да, сад гледам башкирске резултате неке то је група Башкира из клана Кипсак, који су R-Y2632 али нико није уплоадовао на YFull још увијек за разлику од споменуте гране. На неким STR вриједностима се види афинитет са Белом.

 Што се тиче овог узорка из Србије. Успио сам га наћи по STR вриједностима. То је студија Згоњанин и других што се наводи у овој студији. Узорак је из Војводине.
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28789900/

ID147SerPop    Serbia [Serbian] North

 На 17 маркера има само једна разлика са Белом, и то је овај повећан 389ii (код оба). Јесу то радили NGS у студији Згоњанин? То ми је занимљиво јер у тој студији имам два ближа рођака. Или су аутори раније студије о Бели видјели поклапање са њим па је само рађен за њега NGS? Углавном као да је могуће доћи до NGS неких резултата из студија ако постоји интерес колега..

 Врло могуће да је Мађар мада нисам видио досад код њих таквих хаплотипова, мада и није превише Мађара још увијек тестирано.


So you can try to get his contact from the paper authors.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bars Јул 14, 2020, 10:58:21 поподне
Цитат: drajver link=topic=1791
This Serb R1a-SUR51 is not from public databases. He was probably testеd in the study mentioned by Zor

 
So you can try to get his contact from the paper authors.
Thanks bro!👍
I wonder if the open sites have his email address?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bars Јул 14, 2020, 11:01:37 поподне
If your father is this Сура-телевский guy, he is the most handsome of the three.
Thank you.
Yes, my father is Сура-телевский башкир.
My clan have name - Sura-Teleu.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Јул 15, 2020, 03:00:42 пре подне
Можда не би било лоше, да ако неком и од других родова недостаје сродника за BigY или неки сличан тест, да га потражи међу анонимним резултатима, па ако га нађе по STR резултатима, да га контактира преко аутора студија.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Be like Bill Јул 15, 2020, 06:15:08 пре подне
Ova nova situacija sa Arpadom bi bila dobar trenutak da organizujemo DNK dan za Mađare. Ne znam koliko bi njihove kulturne institucije u Srbiji to bile spremne da podrže :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јул 15, 2020, 07:54:09 пре подне
Занимљиво је да се српска владарска кућа (Вукановићи из којих си се касније издвојили Немањићи) веома рано ородила са Арпадовићима. Мађарска краљица Јелена, ћерка рашког великог жупана Уроша I, је баба тестираном Бели III. Чак и за Уроша I се претпоставља да је по мајци Мађар, највише због посрбљене варијанте мађарског Ur (господин) што је дало Урош, име које се касније усталило међу Вукановићима и Немањићима као владарско.

У сваком случају, то је период можда најинтензивнијих српско-мађарских веза, када Јелена практично управља Мађарском, у чему јој помаже брат Белош, оновремени бан Хрватске. Чак и легендарни предак Немањића, Бела Урош, има име са мађарским коријеном.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Concom Јул 15, 2020, 02:17:08 поподне
Занимљиво је да се српска владарска кућа (Вукановићи из којих си се касније издвојили Немањићи) веома рано ородила са Арпадовићима. Мађарска краљица Јелена, ћерка рашког великог жупана Уроша I, је баба тестираном Бели III. Чак и за Уроша I се претпоставља да је по мајци Мађар, највише због посрбљене варијанте мађарског Ur (господин) што је дало Урош, име које се касније усталило међу Вукановићима и Немањићима као владарско.

У сваком случају, то је период можда најинтензивнијих српско-мађарских веза, када Јелена практично управља Мађарском, у чему јој помаже брат Белош, оновремени бан Хрватске. Чак и легендарни предак Немањића, Бела Урош, има име са мађарским коријеном.

"Ott Ruška úrhölgy voltam, noha valódi nevem Piroska, az övék szerint Rumenka."

http://www.hid.rs/hidkor.php?link_id=2825&&page_id=rizsanyi_attila
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bars Јул 19, 2020, 11:58:06 поподне
LIFE's TIME OF A COMMON ANCESTOR BY THE PATERNAL LINE BETWEEN THE ARPAD DYNASTY AND BASHKIRS R1a-SUR51
https://www.academia.edu/43664336/LIFES_TIME_OF_A_COMMON_ANCESTOR_BY_THE_PATERNAL_LINE_BETWEEN_THE_ARPAD_DYNASTY_AND_BASHKIRS_R1a-SUR51

In July 2020, the results of the complete Y-DNA sequencing of the king of the Hungarian Arpad Dynasty — Bela III were published in Nature .
The result turned out to be somewhat unexpected for our project — the Arpads from subclade R1a-SUR51. The authors of the study of the paleo-DNA of the Arpad Dynasty indicate in the article that the Bashkirs R1a-SUR51 are the closest approximates relatives to the Arpad Dynasty, and the lifetime of the common ancestor of the Arpad Dynasty and Bashkirs R1a-SUR51 — beginning of our era. .
The paleo-DNA data of the Arpads allow a slightly different assumption about the ethnogenesis of the Bashkirs R1a-SUR51.
If we take into account the calculation of the authors of the study about the separation from the common ancestor of the Arpad Dynasty from the Bashkirs R1a-SUR51 by 2 thousand years ago, — then these are Sarmatian times. Then the ancestors of the Bashkirs R1a-SUR51 and the ancestors of the Arpad dynasty were part of the Sarmatian union of tribes called the Aorsi (Aorsen).
Later, as history has shown, the ancestors of the Arpads became part of the ancient Magyar-Hungarians of the Urals, and the ancestors of the Bashkirs became part of the Kipchak-Kuns.
The traditional Hungarian genealogy of the Arpads — brings their clan from the descendants of the ruler of the Huns — Attila , it is also indicated that the Arpads are relatives of the Bulgarian Dynasty Dulo of which such Bulgarian khans as Kubrat, Batbayan, Asparuh and others are known .
R. R. Suyunov suggests in this regard that the Bashkirs R1a-SUR51, like the Arpads, are probably descendants of the Hunnic Khan Attila , and that Attila was the ancestor of Ashina. To test this version, paleo-DNA data from Attila's descendants are required. R. R. Suyunov also considers that the common ancestor of the Bashkirs R1a-SUR51 and the Arpad Dynasty is a ruler from the clan of Attila who lived in the 7th century AD. Perhaps he is the mythical Oguz Khan, where his eldest son Kun (Gunesh) is the ancestor of the Bashkir R1a-SUR51.
B. A. Muratov put forward in connection with the data's paleo-DNA of the Arpad Dynasty - another version that perhaps the Arpads are descendants of the western house of Ashina (descendants of Istemi-Kagan) , either from Khan Turksanf or from Kutlug Sibir-khan Bagatur.
Kutlug Sibir-khan Bagatur Uraklan Ashina is a more likely contender for the role of the ancestor of the house of Arpads, since his title indicates that he is the khan of the Savirs, and the Savirs (Savart-Asfal) is the previously original name of the ancient Hungarians . Already the ethnonym Savart-Asfal itself indicates that the ancient Hungarians were an alliance of the Ugric (Savirs) and Turanian (Asfal) clans, where Asfal (Asjoloi) means ‘Hephthalites’.
On 17 markers, the Bela III haplotype diverges from the Bashkir R1a-SUR51 by 4 teps, which, according to the SKRZHAMM's formula, determines the lifetime of a common ancestor between the Arpad Dynasty and the Bashkirs R1a-SUR51 - in the 7th century, or to be more precise, at 628-th year of our era. The analysis of our project suggests that the divergence of the Arpads with the Bashkirs R1a-SUR51 falls on the era of the Western Turkic Kaganate.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јул 22, 2020, 08:34:51 поподне
Видим на сајту Давидског да је почетком јула објављен препринт рада Saag et al.

Genetic ancestry changes in Stone to Bronze Age transition in the East European plain

Ово је апстракт

"Transition from the Stone to the Bronze Age in Central and Western Europe was a period of major population movements originating from the Ponto-Caspian Steppe. Here, we report new genome-wide sequence data from 28 individuals from the territory north of this source area – from the under-studied Western part of present-day Russia, including Stone Age hunter-gatherers (10,800–4,250 cal BC) and Bronze Age farmers from the Corded Ware complex called Fatyanovo Culture (2,900–2,050 cal BC). We show that Eastern hunter-gatherer ancestry was present in Northwestern Russia already from around 10,000 BC. Furthermore, we see a clear change in ancestry with the arrival of farming – the Fatyanovo Culture individuals were genetically similar to other Corded Ware cultures, carrying a mixture of Steppe and European early farmer ancestry and thus likely originating from a fast migration towards the northeast from somewhere in the vicinity of modern-day Ukraine, which is the closest area where these ancestries coexisted from around 3,000 BC."

Ово су линкови за пратећи материјал.

https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2020/07/03/2020.07.02.184507/DC1/embed/media-1.pdf?download=true
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2020/07/03/2020.07.02.184507/DC2/embed/media-2.zip?download=true
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2020/07/03/2020.07.02.184507/DC3/embed/media-3.xlsx?download=true

Што се тиче Y-днк углавном се ради о R1a, R1a-Z645, R1a-Z93. Давидски пише да је узорак PES001 из око 10.000 г. пне досад најстарији пронађени узорак R1a (на југу архангелске области). Судећи по табели из рада требао би припадати једној прилично ријеткој пдограни хаплогрупе R1a https://www.yfull.com/tree/R-YP1272/

Немам времена да детаљно ишчитавам, али можда неком буде интересантно.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: filipi Јул 31, 2020, 09:47:24 поподне
https://link.springer.com/article/10.1007/s00439-020-02209-4

Genetic evidence suggests a sense of family, parity and conquest in the Xiongnu Iron Age nomads of Mongolia

(https://i.postimg.cc/26n35qCL/FB-IMG-1596224793056.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Август 11, 2020, 10:38:15 поподне
Чак је и Усаме Зукорлић писао да Е хаплогрупа указује на то да је твој први предак био супсахарски Африканац, тј. црнац. То логике нема. Европски и други неафрички народи са повишеним процентом ове хаплогрупе скоро никад не добијају ни 1% супсахарске генетике на аутосомалним тестирањима. Да је висок проценат хаплогрупе Е у корелацији са супсахарском генетиком, код косовских Албанаца и континенталних Грка би се неком логиком очекивало барем 5% црначке генетике. А ње заправо има само у незнатним траговима.

 На бошњачком пројекту је Е "староафричка". ;D

 Но био је Шум Лака папир, и он је јасно рекао шта је и како је што се тиче субсахарске генетике. Чуди ме да се није о томе више говорило и другдје, све стоји у тој студији. Ова студија руши и глупости о хг Е..

 Бантуиди нису никакав примјер изворне аутозомалне генетике хг E. Доминантна генетика потиче од хаплогрупе E али генетика коју су они у западној Африци абсорбовали никакве везе нема не са хг E, већ ни са A, B.

 Прво, Пигмеји су генетски доминантно потомци прото-Шум Лаке (Шум Лака има Банту јак утицај). Потичу доминантно од генетике хаплогрупе A00. Која се од људи одвојила прије 236 000 г. Уз Банту и тек мали утицај хаплогрупе B. Пигмеји доминатно нису хомо сапиенс. Носиоци хаплогрупе E1b1a, Банту народи, носе од 11-20 , по неким процјенама и преко 30 % доминантно овог елемента. 10-20 % од овог елемента је за посебну причу. A00 су се вјероватно прије 200000 г. у З.Африци мијешали са пред-Неандерталским хоминином. Хаплогрупе A00000 , на мапи из студије је њихова удаљеност трећина пута од Неандерталца до чимпанзе. Могао би бити неки Хомо-еректус којих је било по Африци. Да се Скандинавац помијешао са овим елементом отишла би му аутозомална свјетлосним годинама од модерних људи.

 Дакле субсахарску генетику дефинше примјеса аутозомалне генетике хаплгорупа A00 и још неоткривене "A00000" (можда буде и још која нула). Никакве везе хаплогрупа E нема с тим. Хотентоти, Бушмани као носиоци A фенотипски не одударају од неких базалних Евроазијаца толико. Чак и код Пигмеја не искоче неки архаизми као код Бантуа, сад видимо зашто. A00 је удаљен 236000 г, док с друге стране овај "A00000" мора бити бар 600000, прије ће бити милион година удаљен, по удаљености из студије он би могао бити и два милиона година удаљен.. И Бантуи носе 3 % тога. :) 3 % од милион значи да то одмах удаљава 30000 г.

 Шта је наспрам тога разлика између DE и CF који су се одвојили прије 68000 г. Па C од F прије 66 000. Изворни DE нису могли бити предалеко од базалних Евроазијаца, по папиру ту негдје..
 
 Зато на K13 калкулатору Неандерталац из Хрватске је доминантно субсахарац, 90 %. ;D Очито да је у великом дијелу субсахарска генетика повезана са генетиком A00 и A00000.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Одисеј Август 11, 2020, 11:49:24 поподне
Чекај сад, збунио си ме. :D

1. Хоћеш да кажеш да постоје људи који нису хомо сапиенс, а да су Пигмеји заправо дио те екипе?
Зар нису Бушмани и Хотентоти аутосомално најудаљенији од остатка човјечанства, а не Пигмеји?

2. Хоћеш да кажеш да је црначки фенотип заправо посљедица уплива неког архаичног хоминида који није хомо сапиенс?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Август 12, 2020, 12:51:59 пре подне
1. Хоћеш да кажеш да постоје људи који нису хомо сапиенс, а да су Пигмеји заправо дио те екипе?
Зар нису Бушмани и Хотентоти аутосомално најудаљенији од остатка човјечанства, а не Пигмеји?

 Мбути Пигмеји носе
1. 56.4 % генетику од A00 (236000 г.)
2. 26.6 % генетоку од познијег Банту уплива (који сам има A00 од друге стране)
3. 17 % генетике која извире од хаплогрупе B

 Ака Пигмеји су
1. 41 % A00
2. 59 % Банту

 Хотентоти и Бушмени су хг A1b1 која је удаљена по YFull-у 130700 г. Банту и код Мбутија B примјеса њих наравно приближава. Кад се то све "прерачуна" могу испасти и Хотентоти даљи. Хотентоти су сасвим засебна група.

 Оно што је мени занимљиво, по овим резултатима испада да су носиоци пигмејске групе језика у ствари A00, док би B можда били повезани са нило-сахарском групом.

 Ова прото-Шум Лака генетика је рођак сапиенса, јесу ли сад они сапиенс, у сваком случају нису модерни људи према неком ранијем схватању, или су "на граници". Углавном дупло су даљи од Хотентона/Бушмана. И Пигмеји имају доста те генетике. Наравно, одвојеним упливом (са још архаичнијим хоминидом) имају и Бантуи.

 Пигмеји наравно имају Банту примјесе јер су их ови потиснули, доминирали над њима..

2. Хоћеш да кажеш да је црначки фенотип заправо посљедица уплива неког архаичног хоминида који није хомо сапиенс?

 Нису сви "црначки" фенотипи исти, али ако се ради о Банту, 3 % овог јако архаичног хоминида свакако је морало имати неког уплива уз овог нешто ближег.

 У суштини ова генетика која се одвојила прије 236 000 година се кретала по Африци и изгледа да је одвојено улазила у друге популације. Нпр. Мота гдје је нађена E-M329 (https://www.yfull.com/tree/E-M329/) грана E1b1b је имала 29 % овог A00 елемента. Прије те примјесе Мота је био аутозомално брат базалних Евроазијаца.

 Један дио ове A00 (https://www.yfull.com/tree/A00/) генетике се помјешао са пред-неандерталским хоминином и онда су их покупили носиоци E1b1a. То је свакако значајно удаљило E1b1a аутозомално од њихове изворне генетике.

 У студији је и анализа са Тафоралтом (гдје су сви били E-M78) и ту је "ANA" (ancestral North African) генетика била без ових примјеса, Тафоралт је имао и Евроазијсу примјесу. У сваком случају оно што су говорили да је Тафоралт дијелом субсахарски није тачно, да би био "субсахарски" мора имати ове ултра архаичне примјесе..
 То је оно што њих у ствари удаљује од Евроазијаца највише.. Хотентоти опет су по страни..

 Студија
 https://www.nature.com/articles/s41586-020-1929-1
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Август 12, 2020, 01:14:41 пре подне
 Менде Бантуи имају нешто више ове архаичне примјесе од Јоруба и Лемандеа. Обзиром да су Менде базални на Нигер-Конго језичком стаблу (врло рано одвојени) изгледа да би тај архаични елемент могао бити са Менде подручја.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Одисеј Август 12, 2020, 01:25:19 пре подне
Знам да "црнци" нису кластер у генетском смислу као што су то базални Евроазијци или монголоиди, јер су неким "црнцима" генетски ближи Евроазијци него други "црнци". Нпр. велика је аутосомална разлика између народа којем припада мушка лоза Барака Обаме (Луо народ) и Зулуа рецимо. Генетске разлике унутар Африке знају бити далеко веће него разлике између било које двије неподсахарске популације.

Занимљиво. Значи Пигмеји су аутосомално најудаљенији од остатка човјечанства, а тај архаични хоминид (А00) чија генетика доминира међу Пигмејима заправо је и сам претрпио уплив неког још архаичнијег хоминида са још пар "нула".
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Август 12, 2020, 02:32:54 пре подне
Занимљиво. Значи Пигмеји су аутосомално најудаљенији од остатка човјечанства, а тај архаични хоминид (А00) чија генетика доминира међу Пигмејима заправо је и сам претрпио уплив неког још архаичнијег хоминида са још пар "нула".

 С тим да Пигмеји изворно нису имали генетике тог још архаичнијег хоминида, то су само посредно добили од Бантуа. Дакле Бантуи имају више те генетике (око 3 %) од Пигмеја. Јер је архаични А00 очито се сам раздвојио још прије 200000 г., и само један њихов огранак је срео овог "A00000". И баш то су Бантуи покупили.

 Кад си већ питао око фенотипа, као да је мало код Пета Јуинга испливао 3 % "A00000". ;D Џордан с друге стране супротан спектар.
(https://www.nydailynews.com/resizer/Wq4mV7uu546uj_RIg3oN1h7ZOFg=/1400x0/top/arc-anglerfish-arc2-prod-tronc.s3.amazonaws.com/public/QWOCYC6KIJGUJJZLZPMUKXBMF4.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Uzi Август 12, 2020, 02:43:04 поподне
Знам да "црнци" нису кластер у генетском смислу као што су то базални Евроазијци или монголоиди, јер су неким "црнцима" генетски ближи Евроазијци него други "црнци". Нпр. велика је аутосомална разлика између народа којем припада мушка лоза Барака Обаме (Луо народ) и Зулуа рецимо. Генетске разлике унутар Африке знају бити далеко веће него разлике између било које двије неподсахарске популације.

Занимљиво. Значи Пигмеји су аутосомално најудаљенији од остатка човјечанства, а тај архаични хоминид (А00) чија генетика доминира међу Пигмејима заправо је и сам претрпио уплив неког још архаичнијег хоминида са још пар "нула".

Извињавам се што излазим из теме, али да ли би се могла објаснити разлика између горе наведених и означених људи? То јест, разлика између евроазијца и такозваних монголоида.  https://sr.wikipedia.org/wiki/%D0%95%D0%B2%D1%80%D0%BE%D0%B0%D0%B7%D0%B8%D1%98%D0%B0 (https://sr.wikipedia.org/wiki/%D0%95%D0%B2%D1%80%D0%BE%D0%B0%D0%B7%D0%B8%D1%98%D0%B0)

Такође кад укуцам реченицу монголоид, по свим данашњим стндардима та реченица се више не употребљава и увредљива је, слично је са реченицом нигер, па ме чуди да и њу не употребљавате да означите "црнце".

(https://i.postimg.cc/sXSWrJs6/Capture.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Зрно Август 12, 2020, 03:32:46 поподне
Узи, ипак претерујеш са тим ставом, још од раније. Како другачије назвати монголоидну расу? Тако је званичан назив у уџбеницима географије и биологије код нас. Добила је назив по Монголима, а не по људима који имају Даунов синдром. То што су они касније усвојили назив је друга ствар. Има опција да се о њима говори као "жутој раси" или "косооким". Неку чеврту верзију не видим, јер рећи "азијат" је потпуно непрецизно, пошто у то не спада читава јужна и југозападна Азија.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Србин Август 12, 2020, 03:53:34 поподне
На biorxiv.org постављен препринт рада научног тима Bortolini et. al 2020 под називом Early Alpine occupation backdates westward human migration in Late Glacial Europe (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.08.10.241430v1).

Извод:

Цитат
The end of the Last Glacial Maximum (LGM) in Europe (~16.5 ka ago) set in motion major changes in human culture and population structure1. In Southern Europe, Early Epigravettian material culture was replaced by Late Epigravettian art and technology about 18-17 ka ago at the beginning of southern Alpine deglaciation, although available genetic evidence from individuals who lived ~14 ka ago2–5 opened up questions on the impact of migrations on this cultural transition only after that date. Here we generate new genomic data from a human mandible uncovered at the Late Epigravettian site of Riparo Tagliente (Veneto, Italy), that we directly dated to 16,980-16,510 cal BP (2σ). This individual, affected by a low-prevalence dental pathology named focal osseous dysplasia, attests that the very emergence of Late Epigravettian material culture in Italy was already associated with migration and genetic replacement of the Gravettian-related ancestry. In doing so, we push back by at least 3,000 years the date of the diffusion in Southern Europe of a genetic component linked to Balkan/Anatolian refugia, previously believed to have spread during the later Bølling/Allerød warming event (~14 ka ago4,6). Our results suggest that demic diffusion from a genetically diverse population may have substantially contributed to cultural changes in LGM and post-LGM Southern Europe, independently from abrupt shifts to warmer and more favourable conditions.

Фајл у .pdf формату (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.08.10.241430v1.full.pdf) нуди више информација.

Цитат
The mtDNA haplogroup is a basal U4'9, consistent with a European Palaeolithic individual (Fig. 2A). X/Autosome coverage ratio in the order of 0.56 confirmed the individual was male, and the chromosome Y haplogroup estimated to be I2, which captures the majority of the post-Villabruna diversity in Europe (Fig. 2B). From a population perspective, we performed a MDS analysis based on outgroup f3 distances (Fig. 3A) and found the sample to fall within the broader European Western Hunter Gatherer (WHG) genetic variation, pointing to an affinity to the (which was not certified by peer review) is the author/funder. It is made available under a CC-BY-ND 4.0 International license. bioRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.08.10.241430. this version posted August 10, 2020. The copyright holder for this preprint previously described Villabruna Cluster4, known to have largely replaced previous European Hunter Gatherer populations at least ~14 ky ago.

Узорак Таљиенте 2 стар око 17000 година припада NRY хаплогрупи I2, односно базалној мтДНК хаплогрупи U4'9.

Интересантна расправа:

Цитат
Tagliente2 seems to be basal to all samples that are more recent than Villabruna based on both autosomic DNA and Y chromosome. From an autosome perspective, this may result from an admixture between Villabruna and survivors of the Věstonice or Goyet clusters between 17 and 14 ka ago. Nevertheless, the symmetrical relationship of Tagliente2 and other post 14kya European hunter-gatherers with Věstonice, Ostuni, Goyet or Kostenki (Fig. 3B) does not seem to support this scenario in spite of the promising qpGraph (Extended Data Fig.4).

Аутори претпостављају да се из угла аутозомалне генетике ради о томе да су WHG (Западни Ловци-Сакупљачи) потомци ове групе, те да самим тим не представљају млађи слој настао накнадним мешањем са затеченим Палеоевропљанима.

Можете погледати и коментаре на страници Давидовог блога под називом "Villabruna people existed in Europe at least 17,000 years ago (Bortolini et al. 2020 preprint)" (https://eurogenes.blogspot.com/2020/08/villabruna-people-existed-in-europe-at.html).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Uzi Август 12, 2020, 04:47:56 поподне
Узи, ипак претерујеш са тим ставом, још од раније. Како другачије назвати монголоидну расу? Тако је званичан назив у уџбеницима географије и биологије код нас. Добила је назив по Монголима, а не по људима који имају Даунов синдром. То што су они касније усвојили назив је друга ствар. Има опција да се о њима говори као "жутој раси" или "косооким". Неку чеврту верзију не видим, јер рећи "азијат" је потпуно непрецизно, пошто у то не спада читава јужна и југозападна Азија.

Зрно, тужно је то што се та реч користи у уџбеницима географије и биологије. Вероватно ће треба проћи још неко време да се та рећ избаци из употребе у Срба, надам се што пре. На српској википедији нема ни речи о томе да се та реч сматра увредљивом.

https://sr.wikipedia.org/wiki/%D0%9C%D0%BE%D0%BD%D0%B3%D0%BE%D0%BB%D0%BE%D0%B8%D0%B4%D0%BD%D0%B0_%D1%80%D0%B0%D1%81%D0%B0 (https://sr.wikipedia.org/wiki/%D0%9C%D0%BE%D0%BD%D0%B3%D0%BE%D0%BB%D0%BE%D0%B8%D0%B4%D0%BD%D0%B0_%D1%80%D0%B0%D1%81%D0%B0)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Одисеј Август 12, 2020, 05:16:16 поподне
Добро, како би ти описао људе који заиста чине један јасно истакнут генетски кластер, који се уз то одликује и специфичном физиономијом? Како назвати цјелину којој припадају Јапанци, Кмери, Ескими, Монголи и Апачи?
Косооки, жута раса? То је прилично увредљив термин.
Азијати? Е ово је најидиотскији назив за те људе, јер нити сви живе у Азији (Индијанци живе у Америкама), нити у Азији живе само припадници тог антрополошког типа, нити је јасно по којој то логици Јапанци припадају Азији, а Турци, Иранци и Саудијци не.

Источни Евроазијати је адекватнији термин, али и ту је проблем што у ту категорију спадају бројни народи који јесу ближи "жутој" него "бијелој" раси, али који не личе на њих. Нпр. Аину, Негритоси, Андаманци, Папуанци, највјероватније и Абориџини.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Зрно Август 12, 2020, 05:29:13 поподне
Сасвим је довољно да се људи са Дауновим синдром не називају монголоидима и да се с тим заврши свака прича о погрдности. Монголе су Европљани прве упознали, што се тиче те физиономије, па је зато раса названа по њима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Одисеј Август 12, 2020, 05:32:32 поподне
Антрополошки типови постоје, свиђало се то нама или не. И то насљеђујеш, свиђало нам се то или не. Не постоје "расе", али постоје очигледни "кластери". Не могу двоје Бушмана добити сина који личи на Николаса Кејџа, нити ја могу с Аном Курњиковом добити сина који изгледа као Мајкл Џордан.
Кластери нису "друштвени конструкт", јер да јесу, физички изглед људи не би зависио од физичког изгледа родитеља и дједова.

Оно што је важно јесте да се не дозволи да се људи међусобно масакрирају због тога. Али рећи да је антрополошка разлика између Путина, Мугабеа и Шинза Абеа "друштвени конструкт" једнака је глупост као и ово што говоре аутохтонисти, типа династија Оштривојевић.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Миодраг Август 13, 2020, 01:22:35 пре подне
S Anom Kurnjikovom?  :o I odmah sina a ne ćerku? :o

Skromnost je zaista vrlina.  ::) A sirota Naomi Cambell čekala, čekala... i izvisila. ;D

Не могу двоје Бушмана добити сина који личи на Николаса Кејџа, нити ја могу с Аном Курњиковом добити сина који изгледа као Мајкл Џордан.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Uzi Август 13, 2020, 10:44:10 пре подне
Ствар је врло једноставна, израз монголоид је увредљив и то је то, и жао ми је што више људи то не види. Окачио сам раније слику где је то јасно написано и по дефиницији. Ја у свом окружењу не могу ту реч употребљавати, прво због тога што би сви мислили да сам необразован, а друо зато што би увредио своје пријатеље који би условно речено у ту категорију потпали, проверено.

Незнам која би била најбоља реч у српском језику да надомести ту увредљиву реч, али сам сигуран да има људи који су доста стручнији по том питању и могли би дати одговор.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Exiled Август 13, 2020, 01:10:33 поподне
Ствар је врло једноставна, израз монголоид је увредљив и то је то, и жао ми је што више људи то не види. Окачио сам раније слику где је то јасно написано и по дефиницији. Ја у свом окружењу не могу ту реч употребљавати, прво због тога што би сви мислили да сам необразован, а друо зато што би увредио своје пријатеље који би условно речено у ту категорију потпали, проверено.

Незнам која би била најбоља реч у српском језику да надомести ту увредљиву реч, али сам сигуран да има људи који су доста стручнији по том питању и могли би дати одговор.
Можда би реч везана управо за синдром могла бити добра замена.Као напр.Дауновац,свакако нисам стручњак али ето паде ми на памет...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Скардус Август 13, 2020, 01:57:51 поподне
Настави Одисеју.
Веома лепо објашњавао и не наседају на морално-етичке упаде.
С за Курњикову - честитам. Добар избор.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: сɣнце Август 14, 2020, 04:10:58 поподне
Постоји андрос - човек и постоји андроид - човеколики.
Постоји Монгол и постоји монголоид - монгололики.

Што је ту побогу увредљиво?
Али ако кому јест, нека себи скује најпогоднији израз с помоћу аналогије.

европљанинолики
нижесахарјанинолики
источноазијањинолики
америколики

Принцип онога -ид или -лики је, да неко ко је налик на некога не мора нужно бити из тога места.
Стога ни монголоид није по себи неморално рећи, али било би исто као називати европиде англидима или слично. Технички исправно али није најпрецизнија могућност.

Једино што је неисправно је особе са синдромом Дауна називати монгололикима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Vidak Август 16, 2020, 09:02:09 пре подне
https://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371%2Fjournal.pgen.1008895
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Август 21, 2020, 10:26:02 поподне
 Уз доста старијих узорака из подручја Тракије, коначно идуће године је ту и узорак првог Булгара са прелаза 8. и 9. в. из Бугарске који je Q-L53 (https://www.yfull.com/tree/Q-L53/) (садашњи ISOGG).

 Такођер има источноазијски аутозомални утицај, као и друге, очекивано. Иако сам очековао прије неки хунски Q-L712. Коначно да се и ту нешто покрене по питању Прабугара. :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Август 21, 2020, 11:06:40 поподне
Уз доста старијих узорака из подручја Тракије, коначно идуће године је ту и узорак првог Булгара са прелаза 8. и 9. в. из Бугарске који je Q-L53 (https://www.yfull.com/tree/Q-L53/) (садашњи ISOGG).

 Такођер има источноазијски аутозомални утицај, као и друге, очекивано. Иако сам очековао прије неки хунски Q-L712. Коначно да се и ту нешто покрене по питању Прабугара. :)

Претпостављам да ће бити или L330 или YP4004. Занимљиво у сваком случају.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Exiled Август 21, 2020, 11:18:21 поподне
Уз доста старијих узорака из подручја Тракије, коначно идуће године је ту и узорак првог Булгара са прелаза 8. и 9. в. из Бугарске који je Q-L53 (https://www.yfull.com/tree/Q-L53/) (садашњи ISOGG).

 Такођер има источноазијски аутозомални утицај, као и друге, очекивано. Иако сам очековао прије неки хунски Q-L712. Коначно да се и ту нешто покрене по питању Прабугара. :)
Може ли се наћи каква веза са овом нашом братоношком групом?Слабо сам то пратио,па незнам баш много...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Август 21, 2020, 11:54:43 поподне
Претпостављам да ће бити или L330 или YP4004. Занимљиво у сваком случају.

 У овом
гостовању (https://sedemosmi.tv/production/%d1%81%d1%82%d1%83%d0%b4%d0%b8%d0%be-%d1%85%d1%8a-%d1%81%d0%b2%d0%b5%d1%82%d0%be%d1%81%d0%bb%d0%b0%d0%b2-%d1%81%d1%82%d0%b0%d0%bc%d0%be%d0%b2-18-%d0%b0%d0%b2%d0%b3%d1%83%d1%81%d1%82-2020-%d0%b3/) у бугарској емисији Стаматов, који ради на студији је изнио неке детаље, при томе са табелом иза њега, (која је у "огледало" верзији ради ауторских права), ја сам похватао доста података како се он помјерао преко скриншотова.;D Он каже да има и кавказоидног централноазијског елемента (гедрозија) као и јак кавкаски елемент. Уколико се ту ипак ради о грани YP4004, онда вјероватно и Q-YP4055. Дотична није туркијска већ је аланска и нађена је већ код Алана позне антике, а центар јој је код Чечена. Могуће да тај јачи кавкаски елемент наговјештава прије YP4055 него L330.
 У сваком случају у студији су као и обично радили само рудименталне SNP-ове, у поређењу с неким ранијим, и ово је добра дубина. BAM фајлови ће рећи више.

 Он је углавном о томе и причао, тј. Прабугари иранског поријекла, свакако јесу имали и такав утицај обзиром на нека имена код њих, но јасно је да нису били "аланофони".

Може ли се наћи каква веза са овом нашом братоношком групом?Слабо сам то пратио,па незнам баш много...

 Братоношка грана нема везе са овом. Генерално се ради о блискоисточној групи, и вјероватно се ради о некој старијој миграцији на Балкан са БИ, могуће у римско доба али и прије. Јавља се и на Корчули, и сигурно је управо овај кластер био иза раних помпозних тврдњи о потомцима Авара са Корчуле. ;D Колико сам видио Братоножићи су у ствари Букумири.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Exiled Август 22, 2020, 10:32:33 пре подне
У овом
гостовању (https://sedemosmi.tv/production/%d1%81%d1%82%d1%83%d0%b4%d0%b8%d0%be-%d1%85%d1%8a-%d1%81%d0%b2%d0%b5%d1%82%d0%be%d1%81%d0%bb%d0%b0%d0%b2-%d1%81%d1%82%d0%b0%d0%bc%d0%be%d0%b2-18-%d0%b0%d0%b2%d0%b3%d1%83%d1%81%d1%82-2020-%d0%b3/) у бугарској емисији Стаматов, који ради на студији је изнио неке детаље, при томе са табелом иза њега, (која је у "огледало" верзији ради ауторских права), ја сам похватао доста података како се он помјерао преко скриншотова.;D Он каже да има и кавказоидног централноазијског елемента (гедрозија) као и јак кавкаски елемент. Уколико се ту ипак ради о грани YP4004, онда вјероватно и Q-YP4055. Дотична није туркијска већ је аланска и нађена је већ код Алана позне антике, а центар јој је код Чечена. Могуће да тај јачи кавкаски елемент наговјештава прије YP4055 него L330.
 У сваком случају у студији су као и обично радили само рудименталне SNP-ове, у поређењу с неким ранијим, и ово је добра дубина. BAM фајлови ће рећи више.

 Он је углавном о томе и причао, тј. Прабугари иранског поријекла, свакако јесу имали и такав утицај обзиром на нека имена код њих, но јасно је да нису били "аланофони".

 Братоношка грана нема везе са овом. Генерално се ради о блискоисточној групи, и вјероватно се ради о некој старијој миграцији на Балкан са БИ, могуће у римско доба али и прије. Јавља се и на Корчули, и сигурно је управо овај кластер био иза раних помпозних тврдњи о потомцима Авара са Корчуле. ;D Колико сам видио Братоножићи су у ствари Букумири.
Хвала🙂
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Август 24, 2020, 06:50:55 пре подне
На eurogenes блогу су објавили неке најаве древне днк са подручја Бугарске, из рада о којем се већ причало, а које се односе на R1a-Z93 у раном Бронзаном добу на подручју Бугарске.

https://eurogenes.blogspot.com/2020/08/fascinating-stuff.html

"But we have results from the Ezero culture, from Southeastern Bulgaria, which is from the early Bronze Age and which seems to connect the people of this culture with the future Hittites and Trojans. This has been confirmed by archeology many times and has been known for at least half a century. But now we see the genetic parallels between the two. Some of these ancient groups from the Bronze Age in one way or another have survived to this day in our country Bulgarians, as we also carry a certain amount of blood and genes from these same people, perhaps in the range of between 5 and 10%, which connects us with the Hittites, ancient Anatolia and the Trojans. There is a huge processing of the results before they are published, but among them there are huge curiosities from now on. One of them is from the necropolis in Merichleri from the Early Bronze Age and in another necropolis in Tsaribrod (the older of the two), these are mound necropolises from the Yamna culture in the Caucasus, of people who migrated here in Bulgaria and connected between you are. They came from the haplogroup R1a, namely Z93, which is the haplogroup again of the Scythian, but more of the Indo-Aryan tribes, the future Indo-Aryans, who later conquered India. But one of the tribes of the Yamna culture seems to have strayed and arrived in the Balkans instead of going to India. And so by chance, because archaeologists and geneticists have chosen between 260 burial mounds from this period, they have chosen only 3-4 and have come across exactly this extremely ancient group, which is from the time before the Indo-European group was divided into Iranians, Indians and Slavs, they were still one people at the time with the same genomes. And yes, one of these groups is among what we call Thracian tribes, but these are not Thracians. We have results from both the Early Iron Age and the Late Bronze Age, which are possibly Thracian, but I will keep them a secret at this stage, as I do not want to provoke speculation."
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 04, 2020, 11:20:50 поподне
Узимајући у обзир ISOGG стабло из 2015, гране Y-днк хаплогрупa би требале бити ове:

122E   I2a1b М423
163   J2b M12
211   I2a1b М423
220   R1b1a2a2c1 Z2109
225   R1b1a2a2c1 Z2109
243   BT
257   R1b1a2a2c1a1 Z2109>CTS7556
260   I2a2a1a2a2 М223>S18331
282   BT
295   I2a1a P37.2>CTS595

Прилична разноврсност грана I2 хаплогрупе. Грана CTS595 је предачка за М26.

Такође је и присуство "источне" R1b Z2103 у складу са ранијим налазима из Вучедолске културе гдје је ова грана такође нађена. Изгледа да је тај рани продор Индоевропљана у Подунавље и на Балкан био повезан  са овом граном.

Иначе у самом раду тежиште и није на генетичким резултатима, већ су они једно од средстава да се докажу одређене претпоставке о социјалним односима у друштву ове ранобронзанодопске културе. Колико сам видио говори се о некој женској егзогамији,а закључци се изводе на основу генетички уочених веза мајка-дјеца. Не знам колико то све пије воду.

Везано за ове културе раног бронзаног доба у Подунављу, пронађох на мрежи jeдан прилично прегледан рад Haskel J Greenfield The Maros culture: a regional subtradition during the Early Bronze Age of Central Europe који може у пдф да се нађе на следећем линку https://www.academia.edu/2100199/2001d_The_Maros_culture_a_regional_subtradition_during_the_Early_Bronze_Age_of_Central_Europe

Мокринско налазиште судећи по овом раду улази у тзв.централну групу.

Cирови резултати налазишта у Мокрину доступни су на ENA. Нажалост, шифре узорака нису исте као оне у препринту и практично се немогуће снаћи. Док се рад не објави, а претпостављам да би то могло бити веома скоро, може се само по некој аналогији редослиједа претпоставити о ком се узорку раду. Претпоставио сам да је узорак MОK12 један од ова два код којих је нађена хаплогрупа M423 и могло би се рећи да сам имао среће.

МОК12 изгледа заиста припада хаплогрупи М423>L161. Поред неколико потврђених позиција на нивоу I-M170, уочио сам и сљедеће промјене:

V2043 A>G 1G (ниво M423)+
S2620 C>T 2T (ниво М423)+
Y3726 C>T 1T (ниво L161)+
V2610 T>T 1T (ниво L621)-

Ово је крајње површно читање на насумичним позицијама. Нисам провјеравaо низводне гране L161. Како год, чини се да је M423>L161 била присутна у Панонији у Бронзаном добу, а рекао бих да је ова грана у неолиту била далеко присутнија на европском континенту него што је то данас случај. Било би добро провјерити и ону изоловану грану M423>L161 у Бугарској, да ли можда има какве везе са овим мокринским узорцима.

Волио бих детаљније проћи ове мокринске узорке, али тешко да ћу имати времена.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 04, 2020, 11:43:12 поподне
Било би добро провјерити и ону изоловану грану M423>L161 у Бугарској, да ли можда има какве везе са овим мокринским узорцима.

Сасвим сам случајно ово споменуо. Рекох, ајде да провјерим на брзину неколико СНП-ова ове подгране код МОК12 , кад оно испаде да има позитивна читања и то на:

Y13336 G>C 1C
Y13335 G>A 1A (na nivou Y13331)

Ови резултати донекле имају логике јер ову ријетку грану Islesa налазимо у Балкану, у Бугарској. Увијек сам се питао како је та грана ту доспјела и када. Чини се да се назире одговор. Покушаћу завршити овај узорак до краја.

Ово су засад лоше вијести за наше аутохтонисте. Изгледа да се Динарик неће ископати ни у овом покушају. А није да није било близу.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 05, 2020, 12:23:20 пре подне
Испод гране Y13331 постоји још грана Y13339. Преконтролисао сам све позиције на том нивоу, нема ниједне позитивне, има неких 5 негативних, остале нису покривене. Може се закључити да узорак МОК12 не припада грани Y13339 и да му је тренутна позиција на стаблу на нивоу Y13331*

https://www.yfull.com/tree/I-Y13331*/

На том нивоу се тренутно налазе и једна група бугарских помака (који узгред на ФТДНА Пројекту пишу да су Трачани/Беси, не знам шта је конкретно основ за ту тврдњу). Само је један од ових Бугара Помака урадио BIGY и не видим његове новеле, није искључено да неки од новела дијели са МОК12.

Иначе грана Y13331 је по YFullu стара 4600-4100 година, узорци из Мокрина су стари око 4000 година, тако да је то ту негдје приближно.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Септембар 05, 2020, 04:02:33 поподне
Испод гране Y13331 постоји још грана Y13339. Преконтролисао сам све позиције на том нивоу, нема ниједне позитивне, има неких 5 негативних, остале нису покривене. Може се закључити да узорак МОК12 не припада грани Y13339 и да му је тренутна позиција на стаблу на нивоу Y13331*

https://www.yfull.com/tree/I-Y13331*/

На том нивоу се тренутно налазе и једна група бугарских помака (који узгред на ФТДНА Пројекту пишу да су Трачани/Беси, не знам шта је конкретно основ за ту тврдњу). Само је један од ових Бугара Помака урадио BIGY и не видим његове новеле, није искључено да неки од новела дијели са МОК12.

Иначе грана Y13331 је по YFullu стара 4600-4100 година, узорци из Мокрина су стари око 4000 година, тако да је то ту негдје приближно.

Погодих у прогнози.  ;)

Ако је заиста присутан М423, мислим да би добар кандидат била подграна M423>L161>Y13331, која се јавља у Бугарској.

https://yfull.com/tree/I-Y13331/

Да ли знаш како стоје ствари са R1b из Мокрина?

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 05, 2020, 05:39:40 поподне
Погодих у прогнози.  ;)

Да ли знаш како стоје ствари са R1b из Мокрина?

Да, сад видим да си то помињао раније.

Нисам стигао погледати остале узорке. Сад куцам са телефона, кад се вратим са села, могао бих погледати још који. Проблем је што не знам који се узорак крије под којом шифром. Рад још званично није објављен, а у препринту нису назначене шифре.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Слатинац Септембар 07, 2020, 12:14:18 поподне
На форуму anthrogenetica су већ анализирали узорке који припадају хаплогрупи R1b-Z2103. Послао сам овима тиму YFull-а шифре ових узорака, тако да ће ускоро да се појаве на стабло па ћемо видети њихову коначну позицију.

Цитат
Sample MOK27 is R1b-M269>Z2103>Z2108>CTS7556+, and possibly R-CTS7556*.

MOK27 calls, positives in green, negatives in red:

->CTS7556: C > T, 1 read
--Y18960: C > T, 1 read
--FGC29295: no reads
--FGC29296: C > T, 1 read

---->Y20612: G, 1 read
-----FGC29330: no reads
-----FT31210: no reads
-----FT31546: C, 1 read
-----Y204783: no reads
-----Y20604: no reads

---->FT40347: A, 2 reads

---->Y5592: no reads

------>CTS9219: no reads
-------Y5594: no reads
-------Y5593: no reads
-------Y5591: no reads
-------Y5590: G, 1 read
-------Y5589: no reads
-------CTS1450: no reads

Цитат
MOK19A; 2100-1800 BC; Mokrin necropolis, Kikinda, Banat; Serbia, Maros_EBA; R1b-Z2103>Z2106>Z2108>Y14415>Y14420* (xY14512) (https://yfull.com/tree/R-Y14420/)


Z2106 level: Y12538/Z8131+ G>T (1T)

Z2108 level: CTS1843/Z2109+ T>C (2C)

Z2108>Z2110 level: S12460- A>G (1A); Z2110/CTS7822- A>T (1A); S17864- T>G (2T)

Z2108>Y14415 level: Y14416+ C>T (1T)

Z2108>Y14415>Y14420 level: Y14420+ G>A (2A)

Z2108>Y14415>Y14420>Y14512 level: Y14512- C>G (1C); Y14514- T>C (1T)

Цитат
MOK22; 2100-1800 BC; Mokrin necropolis, Kikinda, Banat; Serbia; Maros_EBA; R1b1a2a2c1-Z2103>Z2106>Z2108 (xZ2110) (https://yfull.com/tree/R-Z2108/)


Z2108 level: Z2109/CTS1843+ T>C (1C)

Z2108>Z2110 level: Z2110/CTS7822- A>T (1A); S17864- T>G (2T)

Z2108>Y14415 level: *no calls*

Z2108>Y14415>Y14420 level: *no calls*

Z2108>KMS67 level: *no calls*




MOK24A; 2100-1800 BC; Mokrin necropolis, Kikinda, Banat; Serbia; Maros_EBA; R1b1a2a2c1-Z2103>Z2106>Z2108>Z2110>CTS7556?[/b (https://yfull.com/tree/R-CTS7556/)] (xCTS1450)


Z2110 level: S17864+ T>G (1G)

Z2110>CTS7556 level: CTS7556+ C>T (1T); Y18960- C>T (2C)

Z2110>CTS7556>CTS1450 level: CTS1450- T>G (1T); Y5591/V3089- A>G (1A); Y5593- T>G (2T)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Зрно Септембар 07, 2020, 12:45:14 поподне
По свему судећи, ниже гране R1b тад нису ни постојале - она које нас интересују.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Септембар 07, 2020, 02:12:35 поподне
Највећа разноврсност је код хаплогрупе R1b-Z2103>Z2108. Сада барем имамо идеју којим правцем и у ком периоду су преци наших BY611 и осталих који се налазе испод CTS1450 највероватније дошли. Такође онај I2-Y13331 налаз пружа добру индицију где се након Баната ово становништво спустило, с обзиром на везе са Помацима у Родопима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Слатинац Септембар 07, 2020, 11:17:20 поподне
Одговорио ми је Владимир из YFull тима. Нажалост, због лошег квалитета узорке из Мокрина не могу додати на своје стабло.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Слатинац Септембар 08, 2020, 12:49:52 пре подне
На gjenetika.com (http://www.gjenetika.com/adn-antike-nga-kultura-maros-serbi-veriore/?fbclid=IwAR0w3aNp3Q2bj-8oIYCLoAdzhpebIvA8waKkbVGXpV3RAfERmGLGIZQkdGg) објављен је чланак везан за ове резултате из Мокрина.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Септембар 17, 2020, 02:53:44 поподне
Изашао је нови рад, Population genomics of the Viking world:

https://www.nature.com/articles/s41586-020-2688-8?fbclid=IwAR2Ll0I9NJ0RkJ7JTx_AKYSYRb8IDtPtdQZqR6Yt4NhTY7JwPz4Wt3YYGQU#Sec35

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/703405v1.full?fbclid=IwAR1HzKnTrUWW7-U-vFqxR4IryiOAYHtKWCZwM0WHkoKrwSW5pF54j3Vyf7I

Само сам на брзину погледао, разноврсне су мушке линије, највише је наравно R1b и I1. На овом линку би требало да се налазе BAM фајлови, па кога интересује, нека погледа:

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB37976?fbclid=IwAR1VYXES4aB1pSIcvyIkoJXfLXsY8ERf0YnU9pvtBzGGhjA6wmNuZt2x4_M
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 17, 2020, 03:26:39 поподне
Изашао је нови рад, Population genomics of the Viking world:

https://www.nature.com/articles/s41586-020-2688-8?fbclid=IwAR2Ll0I9NJ0RkJ7JTx_AKYSYRb8IDtPtdQZqR6Yt4NhTY7JwPz4Wt3YYGQU#Sec35

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/703405v1.full?fbclid=IwAR1HzKnTrUWW7-U-vFqxR4IryiOAYHtKWCZwM0WHkoKrwSW5pF54j3Vyf7I

Само сам на брзину погледао, разноврсне су мушке линије, највише је наравно R1b и I1. На овом линку би требало да се налазе BAM фајлови, па кога интересује, нека погледа:

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB37976?fbclid=IwAR1VYXES4aB1pSIcvyIkoJXfLXsY8ERf0YnU9pvtBzGGhjA6wmNuZt2x4_M

Овдје би ми најинтересантнија била I1. На жалост, немам времена да прегледавам бамове, а не видим да су на другим форумима објавили штогод о I1 узорцима. Било би добро кад би се нашло нешто од  I1 присутне међу Србима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 18, 2020, 01:43:51 поподне
Колико сам видио, у овом раду о Викинзима један I2a Динарик, међутим у налазу из украјинског Чернигова, па је све јасно.

Исто би се могло рећи и за налаз R1a-M458>L1029>YP417 из Русије и R1a-M458>L1029 из украјинског Луцка. Све су то словенски утицаји. И други L1029 пронађен у Данској могао би потицати од попапских Словена, код којих је ова грана доста присутна.

С друге стране, неколико оних викиншких налаза који су CTS1211, CTS3402 и Z92 би могли потицати и од балтичких народа, поготово из раних викиншких налаза (нпр. налаз у Естонији из 8. вијека)

Нисам видио да су претресли ове "словенске" хаплогрупе на Антхрогеници. Ако их нико не обради у међувремену, обрадићу их ја идуће седмице.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Септембар 18, 2020, 02:16:13 поподне
Колико сам видио, у овом раду о Викинзима један I2a Динарик, међутим у налазу из украјинског Чернигова, па је све јасно.

Исто би се могло рећи и за налаз R1a-M458>L1029>YP417 из Русије и R1a-M458>L1029 из украјинског Луцка. Све су то словенски утицаји. И други L1029 пронађен у Данској могао би потицати од попапских Словена, код којих је ова грана доста присутна.

С друге стране, неколико оних викиншких налаза који су CTS1211, CTS3402 и Z92 би могли потицати и од балтичких народа, поготово из раних викиншких налаза (нпр. налаз у Естонији из 8. вијека)

Нисам видио да су претресли ове "словенске" хаплогрупе на Антхрогеници. Ако их нико не обради у међувремену, обрадићу их ја идуће седмице.

Да ли си можда успео да прегледаш I1 хаплотипове, да ли се неки подудара са нашим родовима?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 18, 2020, 02:22:20 поподне
Да ли си можда успео да прегледаш I1 хаплотипове, да ли се неки подудара са нашим родовима?

Нисам прегледао ништа од сирових резултата, већ сам само пратио њихове десигнације докле су они најдаље дошли. Сад не могу да одвојим вријее да то испрегледам. Од  I1 сам видио да има нека М227, погледаћу на брзину шта се још може видјети на нивоу стабла.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 18, 2020, 02:40:04 поподне
Што се М227 тиче, има један узорак 10. вијек, Готланд. Ништа ниже од М227 нису назначили. Овај узорак би због наших хаплотипова ваљало проћи. Ради се о узорку VK50

Што се P109 тиче, има неких 6 узорака, из разних периода (неки и прилично рановикиншки) и са разних локација, од Естоније до Исланда. Међутим нису ишли ниже од нивоа P109, требало би прегледати и ове узорке. Ради се о сљедећим: VK70,VK110, VK176, VK281, VK296 ,VK511.

Има још доста других грана L22+, за нас не толико битних.

Прегледаћу још и друге гране I1.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 18, 2020, 02:57:51 поподне
Од осталих грана I1 присутнa je само Z58 и један узорак који припада грани Z17943. I1-Z63 потпуно одсуствује у викиншким узорцима.

Од I1-Z58 грана приутна је и гранаI-Z2041 и I-Z2041>Z2040 која је даља предачка за ону нашу малу Z58 грану којој припада Цветковић I1-М253>Z58>Z59>Y3560>A480>FGC66544. Међутим то је баш давна предачка грана, па не знам колико је релевантна. У сваком случају, могли би се прегледати и ти узорци VK445, VK446, VK496, VK521.

То је отприлике то што се тиче I1.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 18, 2020, 03:32:21 поподне
Видим да су ове викиншке узорке почели убацивати на YFull стабло, тако да ће се веома брзо знати све терминалне позиције.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 18, 2020, 03:37:20 поподне
Динарик VK542 већ постављен у грани Y4460

https://www.yfull.com/tree/I-SK1241/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 18, 2020, 03:39:29 поподне
Видим и овај М227 није повезан са нашим

https://www.yfull.com/tree/I-Y22923*/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 18, 2020, 03:42:59 поподне
Први верификовани Викинг код нас, Дејановић из околине Врања (Clavdivs ми је некидан на њега скренуо пажњу). Чак два викиншка узорка у оквиру гране I1-P109>Y5621 којој припада Дејановић.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Uzi Септембар 18, 2020, 05:16:56 поподне
Први верификовани Викинг код нас, Дејановић из околине Врања (Clavdivs ми је некидан на њега скренуо пажњу). Чак два викиншка узорка у оквиру гране I1-P109>Y5621 којој припада Дејановић.

Свака част. :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 21, 2020, 09:07:14 пре подне
Први верификовани Викинг код нас, Дејановић из околине Врања (Clavdivs ми је некидан на њега скренуо пажњу). Чак два викиншка узорка у оквиру гране I1-P109>Y5621 којој припада Дејановић.

Можда сам ипак  претјерано рекао да се ради о потврђеном Викингу, јер старост гране Y5621 предатира викиншки период, а сам Дејановић је тестиран као Y5621* док су два викиншка узорка у гранама на које је Дејановић негативан. Међутим, ни та два викиншка узорка који припадају Y5621 не припадају истим подгранама, па бих рекао да је ова грана Y5621 свакако коријенска за викиншку популацију.

Што се дробњачке гране тиче и она нема викиншке узорке који су јој најближе повезани, али проистиче из старије гране I1-P109>S14887 у оквиру које је , у различитим подгранама регистровано доста викиншких узорака (VK473, VK511, VK553, VK509, VK176, VK320, VK165) тако да би се и ова грана S14887 могла назвати коријенском викиншком.

Под овим коријенска викиншка, мислим на оне хаплогрупе које су иницијално учествовале у етногенези Викинга.

Међутим, треба рећи да су везе Дробњака и Дејановића са викиншким узорцима из овог рада старе око 2800 година, тј. да се могу смјестити у Нордијско Бронзано доба. Најближе везе Дробњака су са Швеђанима и старе су око 2300 година. И даље имамо временску рупу од 3. в. пне до 12. в. не, кад су се могли десити различити сценарија доласка, али ми се и даље чини да је нормански сценарио највјероватнији.


Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 21, 2020, 10:31:37 пре подне
I1-Z63 потпуно одсуствује у викиншким узорцима.

Сад сам видио да су анализом на YFullu успјели да изолују један Z63 узорак, VK146 из Оксфорда, Енглеска 10. вијек. У самом раду су га терминално означили на нивоу I1-Z58>S247. Претпостављам да је YFull анализа тачнија и да се ради заиста о Z63. Означен је као позитиван на FGC81364*, мада је анализа још у току и требало би због различитих читања сачекати коначну анализу.

Како год, мислим да се може рећи да I1-Z63 није карактеристична за Викинге, а рекао бих ни за скандинавске популације.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Октобар 12, 2020, 04:52:26 пре подне
https://dna-explained.com/2020/09/18/442-ancient-viking-skeletons-hold-dna-surprises-does-your-y-or-mitochondrial-dna-match-daily-updates-here/
Цитат
Sample: VK379 / Oland_1077
Location: Oland, Sweden
Age: Early Viking 700 CE
Y-DNA: I-FGC22048
mtDNA: U3b1b
https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/I;name=I-FGC22048
https://haplotree.info/i1/?node=VK379
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Октобар 12, 2020, 06:08:48 пре подне
https://dna-explained.com/2020/09/18/442-ancient-viking-skeletons-hold-dna-surprises-does-your-y-or-mitochondrial-dna-match-daily-updates-here/https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/I;name=I-FGC22048
https://haplotree.info/i1/?node=VK379

Ето ближег дробњачког рођака и својеврсна потврда за викиншко поријекло. Резултат је у складу са присуством гране I-FGC22048 у Шведској.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Октобар 12, 2020, 10:37:15 поподне
Управо сам прошао све снипове од Викинга 379 (I-FGC22046) :)

(https://i.imgur.com/a78DcMY.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Октобар 18, 2020, 07:48:57 пре подне
И ови викинзи имају релативно блиске сроднике у таблици Порекла.
https://dna-explained.com/2020/09/18/442-ancient-viking-skeletons-hold-dna-surprises-does-your-y-or-mitochondrial-dna-match-daily-updates-here/
Цитат
Sample: VK355 / Oland_1046
Location: Oland, Sweden
Age: Viking 847 ± 65 CE
Y-DNA: L-L595
FTDNA Comment: Joins 2 other ancients on this rare branch. ASH087 and I2923
mtDNA: U5b1b1a
https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/L;name=L-L595
https://www.yfull.com/tree/L-L595/

Цитат
Sample: VK274 / Denmark_Kaargarden 391
Location: Kaagården, Langeland, Denmark
Age: Viking 10th century CE
Y-DNA: R-PH3519
mtDNA: T2b-T152C!
https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/R;name=R-PH3519
https://www.yfull.com/tree/R-PH3519/
https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=4571.msg119708#msg119708

Цитат
Sample: VK326 / Denmark_Ribe 5
Location: Ribe, Jutland, Denmark
Age: Viking 9-11th centuries CE
Y-DNA: R-Y52895
mtDNA: U5b1-T16189C!-T16192C!
https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/R;name=R-Y52895
https://www.yfull.com/tree/R-Y58552/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Октобар 21, 2020, 06:11:01 пре подне
Управо сам прошао све снипове од Викинга 379 (I-FGC22046) :)

(https://i.imgur.com/a78DcMY.png)
Да ли сте проверавали да ли је позитиван или негативан на снипове Швеђана I1-FGC22048* и I1-Y83335 са FTDNA https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/I;name=I-FGC22048 ?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Октобар 21, 2020, 01:41:53 поподне
Да ли сте проверавали да ли је позитиван или негативан на снипове Швеђана I1-FGC22048* и I1-Y83335 са FTDNA https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/I;name=I-FGC22048 ?

Ниједан од 17 снипова I-Y83335 није покривен анализом, а новели Швеђана I1-FGC22048* нису ми доступни. 
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Октобар 28, 2020, 01:36:06 поподне
Не знам да ли је овај рад помињан раније:

A dynamic 6,000-year genetic history of Eurasia’s Eastern Steppe (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.25.008078v1)

Својеврсни преглед и критика овог рада су доступни на следећем линку:

https://indo-european.eu/2020/03/r1b-rich-proto-indo-europeans-show-genetic-continuity-in-asia/

Занимљивост представља присуство R1b-Z2103 код три староујгурска узорка (из периода 744-840. године н.е.). Z2103 је у ове централноазијске пределе продрла вероватно као последица ширења индоевропских група са запада током касног енеолита и раног бронзаног доба (3000-2500. године п.н.е.), група које су формирале Афанасјево и Чемурчек културу, а које претходе Јамна култури. У оквиру ових култура је пронађен и најисточнији археогенетички налаз "западног" R1b-L51 до сада, I6222, на подручју централне Монголије.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Октобар 28, 2020, 02:31:31 поподне
У вези са поменутим радом, баш малопре објавих на Антрогеници, пронађен је још један далеки рођак наших Бањана-Пивљана:

Цитат
FNO001; 5000-3000 BC*; Fofonovo, Buryatia; Russia; Fofonovo_LN; N2-pre-Y6503


Y6503 level: 20 derived, 5 ancestral SNPs

Y6503>P189.2 level: 15 ancestral SNPs, one derived: BY29068+ G>A (5A)

Y6503>Y147565 level: Y147658- A>G (5A)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Uzi Октобар 28, 2020, 02:59:24 поподне
У вези са поменутим радом, баш малопре објавих на Антрогеници, пронађен је још један далеки рођак наших Бањана-Пивљана:

Свакак част Гујо, баш сам се питао да ли би се могао наћи неки нови N2 у том раду.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: crni Октобар 28, 2020, 10:52:12 поподне
У вези са поменутим радом, баш малопре објавих на Антрогеници, пронађен је још један далеки рођак наших Бањана-Пивљана:

Свака част Црна Гујо, FNO001, Pre-Bronze периода, не класификоване културне припадности (Фофонова ?), MT haplogroup C4, биће, чини се, до сада најдаљи рођак наших Бањана-Пивљана?

Више детаља у допунској табели из овога рада (даунлодује се).

https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2020/03/25/2020.03.25.008078/DC2/embed/media-2.xlsx?download=true
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Октобар 30, 2020, 08:41:06 пре подне
Објављен је рад који је раније био доступан у препинту и о којем је било ријечи у сљедећем посту. Ради се о средњовјековним словенским налазима из Саксоније (Krakauberg Peissen)
https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=1791.msg136177#msg136177

https://www.nature.com/articles/s41598-020-75163-w#Sec14

Један од узорака је свакако I2a Dinaric. Видим да су радили секвенцирање узорка KRA001, он се већ налази на YFull стаблу под R1a-M458>L1029. За ове остале нисам сигуран да ли су радили само SNP тестирање.

(https://i.postimg.cc/bwVp0z6L/kalibracija.png)
(https://i.postimg.cc/Hx4N2zYH/haplotyping.png)

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Октобар 30, 2020, 08:54:41 пре подне
Табела преведена на SNP-ове:

KRA001 https://www.yfull.com/tree/R-L1029/   
KRA003 https://www.yfull.com/tree/R-L1029/
KRA004 https://www.yfull.com/tree/I-CTS7362/
KRA005 https://www.yfull.com/tree/e-v13/
KRA008 https://www.yfull.com/tree/I-Y3120/
KRA009 https://www.yfull.com/tree/R-L1029/
KRA010 https://www.yfull.com/tree/J-Z631/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Бакс Октобар 30, 2020, 04:20:06 поподне
Занимљиво, има и Е-V13 и Ј2b
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Новембар 05, 2020, 08:45:45 поподне
Early medieval genetic data from Ural region evaluated in the light of archaeological evidence of ancient Hungarians
 (https://www.nature.com/articles/s41598-020-75910-z)

Цитат
In contrast to the mitochondrial lineages, the Y-chromosomal gene pool based on STR and/or SNP data show homogenous composition in our dataset: 83.3% is N-M46, 5.5% G2a (G-L1266), 5.5% J2 and 5.5% is R1b of the typed male individuals (Supplementary Table S2). 13 male samples out of 19 from Uyelgi cemetery carry Y-haplogroup N with various DNA preservation-dependent subhaplogroup classifications, while in the Cis-Ural we detected three N-M46 Y-haplogroups (samples from Brody, Bartym and Bayanovo cemeteries).

The Y-haplogroup were assigned based on Y-STR data using nevgen.org, as well as based on Y-SNP capture and shallow shotgun sequencing data by Y-leaf v1 and v247. Terminal Y-SNPs were verified on the Y tree of ISOGG version 15.34 (https://isogg.org/tree/).

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Новембар 07, 2020, 12:34:49 пре подне
Свих седам мушких узорака уз Кракауберга сада су на YFull стаблу. Већина очекивано припада западнословенским гранама хаплогрупа R1a, I2 и E, један припада релативно младој германској грани хаплогрупе I1, док последњи припада грани J2b2a старости око 2700 година која је распрострањена широм Европе.


KRA001: R1a-M458>L1029>YP263>Y126915 (https://www.yfull.com/live/tree/R-Y126915/)

KRA003: R1a-M458>L1029>YP263>Y126915 (https://www.yfull.com/live/tree/R-Y126915/)

KRA009: R1a-M458>L1029>YP593>BY195372 (https://www.yfull.com/live/tree/R-BY195372/)

KRA008: I2-Y3120>S17250>Y4882>Y16473* (https://www.yfull.com/tree/I-Y16473/)

KRA005: E-V13>Z1057>CTS1273>L540 (https://www.yfull.com/tree/E-L540/)

KRA004: I1-Z58>Z60>FGC8666>L573>Y4870 (https://www.yfull.com/tree/I-Y4870/)

KRA010: J2b2a-L283>Z638>Z631>Z1043 (https://www.yfull.com/tree/J-Z1043/)

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: vid.knezevic Новембар 11, 2020, 10:37:26 пре подне
Занимљиво откриће. Такође ми је фасцинантно да су успели да извуку генетички материјал у тако старом узорку. Подсећа ме на причу око упоређивања узорка Лазаревића (Стефана или Вука ,око чега се води битка) и кнеза Лазара, ако се добро сећам било је приче да је било тешко/немогуће детљније анализирати ДНК материјал због старости узорка. Исправите ме ако грешим.
https://www.nature.com/articles/s42003-020-01372-8?fbclid=IwAR1Qy0vtXcE_3lS5VFanmzS4ydDZhdY2go4dI7FoPegp0Mr_YAceemnu9IA
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Новембар 11, 2020, 10:42:53 пре подне
Занимљиво откриће. Такође ми је фасцинантно да су успели да извуку генетички материјал у тако старом узорку. Подсећа ме на причу око упоређивања узорка Лазаревића (Стефана или Вука ,око чега се води битка) и кнеза Лазара, ако се добро сећам било је приче да је било тешко/немогуће детљније анализирати ДНК материјал због старости узорка. Исправите ме ако грешим.
https://www.nature.com/articles/s42003-020-01372-8?fbclid=IwAR1Qy0vtXcE_3lS5VFanmzS4ydDZhdY2go4dI7FoPegp0Mr_YAceemnu9IA

Могуће да је тада технологија била мање развијена, с обзиром да се са деспотовим моштима радило 2000-их година. Чини ми се, ипак, да код црквених великодостојника просто није постојала жеља за неким дубљим испитивањима, њих је занимало само да се једнократно утврди да ли постоји веза отац-син.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 11, 2020, 10:45:39 пре подне
Занимљиво откриће. Такође ми је фасцинантно да су успели да извуку генетички материјал у тако старом узорку. Подсећа ме на причу око упоређивања узорка Лазаревића (Стефана или Вука ,око чега се води битка) и кнеза Лазара, ако се добро сећам било је приче да је било тешко/немогуће детљније анализирати ДНК материјал због старости узорка. Исправите ме ако грешим.
https://www.nature.com/articles/s42003-020-01372-8?fbclid=IwAR1Qy0vtXcE_3lS5VFanmzS4ydDZhdY2go4dI7FoPegp0Mr_YAceemnu9IA

Био је са овог налазишта у Кремсу још један узорак чини ми се прије пар година обрађен. Ово су сад први једнојајачани близанци археогенетички обрађени. И овај ранији узорак из Кремса и ови нови, ако се не варам сви су хаплогрупе I.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 17, 2020, 11:45:52 пре подне
Објављен је рад Kinship and social organization in Copper Age Europe. A cross-disciplinary analysis of archaeology, DNA, isotopes, and anthropology from two Bell Beaker cemeteries
https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0241278#sec015

Ради се о археогенетичкој обради два Бел Бикер гробља из Баварске из периода око 2200 г. пне. Овај рад је и раније био објављен у препринту (2019) па су и резултати днк из њега углавном познати. Све мушке линије су R1b-M269, код неких се дошло до R1b-P312, док је митохондријална днк прилично разноврсна. Аутосомално су узорци негдје између степске и европске неолитске популације, дакле свакако је било мијешања. Тежиште рада није толико било на поријеклу и миграцијама, колико на схватању социјалне организације ових раних Индоевропљана у контексту њихових генетичких резултата. Аутори су обрадом резултата потврдили неке своје почетне тезе да се радило о патрилокалној и егзогамној заједници која се груписала у моногамне породице, гдје се фаворизовала и везивала уз себе мушка дјеца, док су женска дјеца углавном служила за социјална повезивања са осталим групама. На тај начин је вјероватно и дошло једним дијелом до доминације Y-днк степских досељеника у односу на Y-днк домицилног неолитског становништво, а патрилокална група је фаворизовала језик њених мушких носилаца, дакле индоевропски.

Отприлике је најбитније дато у апстракту:

"We present a high-resolution cross-disciplinary analysis of kinship structure and social institutions in two Late Copper Age Bell Beaker culture cemeteries of South Germany containing 24 and 18 burials, of which 34 provided genetic information. By combining archaeological, anthropological, genetic and isotopic evidence we are able to document the internal kinship and residency structure of the cemeteries and the socially organizing principles of these local communities. The buried individuals represent four to six generations of two family groups, one nuclear family at the Alburg cemetery, and one seemingly more extended at Irlbach. While likely monogamous, they practiced exogamy, as six out of eight non-locals are women. Maternal genetic diversity is high with 23 different mitochondrial haplotypes from 34 individuals, whereas all males belong to one single Y-chromosome haplogroup without any detectable contribution from Y-chromosomes typical of the farmers who had been the sole inhabitants of the region hundreds of years before. This provides evidence for the society being patrilocal, perhaps as a way of protecting property among the male line, while in-marriage from many different places secured social and political networks and prevented inbreeding. We also find evidence that the communities practiced selection for which of their children (aged 0–14 years) received a proper burial, as buried juveniles were in all but one case boys, suggesting the priority of young males in the cemeteries. This is plausibly linked to the exchange of foster children as part of an expansionist kinship system which is well attested from later Indo-European-speaking cultural groups."

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Драган Обреновић Новембар 17, 2020, 05:52:59 поподне
Ради се о археогенетичкој обради два Бел Бикер гробља из Баварске из периода око 2200 г. пне.
...

Та култура има назив на српском - зове се "култура звонастих пехара", тако да нема потребе да се пише ћирилична транскрипција енглеског назива.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 17, 2020, 06:52:53 поподне
Та култура има назив на српском - зове се "култура звонастих пехара", тако да нема потребе да се пише ћирилична транскрипција енглеског назива.

Хвала на напомени, Драгане, познат ми је тај назив, али ја бих ипак да пишем онако како мени паше.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Новембар 24, 2020, 07:07:35 поподне
Данас је објављена прелиминарна верзија рада у коме се међу 15 секвенцираних древних генома налази и њих шест са подручја Србије, и то два мезолитска са Власца (култура Лепенског Вира), и четири ранонеолитска (Старчевачка култура) - два из ранонеолитске фазе налазишта Лепенски Вир, и по један из епонимних налазишта Старчева и Винче. Одлична вест је да су секвенцирани целокупни геноми (shotgun), и да су изузетно високог квалитета (просечна покривеност/depth of coverage је од 11 до 16), што је фантастично за овако старе скелете. Може се очекивати да ће се сви мушки узорци наћи на YFull стаблу када BAM фајлови буду објављени. Ево и основних информација о тестираним скелетима:


VLASA32; 7791-7518 п.н.е.; Власац; мушко, R1b1-L754 (xL389,xV88) (https://www.yfull.com/tree/R-V2219/); mtDNA: U5a2a

VLASA7; 6814-6390 п.н.е.; Власац, мушко, I2-pre-M438 (xPF3798,BY32225) (https://www.yfull.com/tree/I2/); mtDNA: U5a2a

LEPE48; 6062-5917 п.н.е.; Лепенски Вир; мушко, C1a2b-F16270*(xZ44576,F15182) (https://www.yfull.com/tree/C-F16270/); mtDNA: K1a1

LEPE52; 5981-5743 п.н.е.; Лепенски Вир; мушко; G2a2b2a1a1c-CTS342*(xFGC12126,Z724,PF4202,Y36001) (https://www.yfull.com/tree/G-CTS342/); mtDNA: H3

VC3-2; 5719-5374 п.н.е.; Винча-Бело Брдо; мушко; G2a2a1a3-FGC34725*(xFGC34623) (https://www.yfull.com/tree/G-FGC34725/); mtDNA: HV-16311

STAR1; 5639-5526 п.н.е.; Старчево; женско; mtDNA: T2e2

Линк ка раду (pdf): https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.11.23.394502v1.full.pdf (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.11.23.394502v1.full.pdf)

Линк ка додатним материјалима (pdf, excell): https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.11.23.394502v1.supplementary-material (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.11.23.394502v1.supplementary-material)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Грк Новембар 24, 2020, 08:38:08 поподне
Зна ли неко кад се могу очекивати резултата из истраживања некропола Милавићи и Хатељи?

https://www.opstinaberkovici.com/berkovii/drutvo/2424-arheolozi-sa-svih-strana-svijeta-oduevljeni-bogatom-istorijom-hercegovine.html
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Новембар 24, 2020, 11:45:57 поподне
Данас је објављена прелиминарна верзија рада у коме се међу 15 секвенцираних древних генома налази и њих шест са подручја Србије, и то два мезолитска са Власца (култура Лепенског Вира), и четири ранонеолитска (Старчевачка култура) - два из ранонеолитске фазе налазишта Лепенски Вир, и по један из епонимних налазишта Старчева и Винче.[/url]
Ово ће обрадовати оне који сматрају да је Балкан колевка европске цивилизације:
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.11.23.394502v1.full.pdf
Figure 3 - Demographic scenario inferred from the sampled genomes and underlying genetic data.
Figure 4 - Possible scenario of the population history of SW-Asia and Europe between the Last Glacial Maximum (LGM) and the Early Neolithic period, i.e. approximately 26,000 to 7,000 years ago.
По овом сценарију земљорадњу је из Мале Азије у Европу донела популација настала мешањем централних ( балканских?) и блискоисточних ловаца-сакупљача.
Цитат
The LGM shaped Holocene genetic diversity in SW Asia and Europe 211
We find that Holocene human genetic structure in SW Asia and Europe emerged briefly before 212
or during the LGM with the initial separation 32-21 kya of a western-central European and an 213
eastern group of HGs. Right after this initial split, the western-central European branch 214
experienced a very strong bottleneck (equivalent to a single human couple for one generation) 215
that decreased the diversity of all descending populations. Then, these HGs further divided 216
23.3-20.0 kya, leaving us with three genetically distinct groups in western-central Europe that 217
potentially differentiated in separate LGM refuge areas (Fig. 4a). The ancestors of Loschbour 218
and Bichon could have resided in separate refugia in South Western Europe, and the ancestors 219
of the Mesolithic Vlasac population could have lived in a geographically distinct central 220
refugium likely located around the Balkans and the Aegean. Broadly speaking, these refugial 221
populations coincide later on with what archaeologists have identified as the areas of 222
distribution of Magdalenian and Epigravettian traditions in Europe35,36. In contrast, the eastern 223
group of HGs, which does not show any sign of a strong bottleneck and was potentially 224
genetically more diverse, diverged further into at least three groups of Near Eastern HGs during 225
the LGM: one that later massively admixed with central HGs to become the ancestors of later 226
Anatolian and Aegean farmers, one leading to the ancestors of Iranian Neolithic farmers, and 227
one to Neolithic populations in the southern Levant (respectively east1, east2 and east3 on 228
Fig 4a). After the LGM, these HG populations re-expanded from their southern refugia 229
probably due to improving climatic conditions37, allowing previously separated central and 230
east1 refugial populations to overlap and admix 19 kya (Fig. 4b), and then to become a distinct 231
population from which Northwestern, Central Anatolian and European farmers would later 232
descend. 233
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Децембар 02, 2020, 02:09:08 поподне
(https://proizhod.nauka.bg/wp-content/uploads/2020/10/res1.png)


https://proizhod.nauka.bg/2020/10/28/%d0%ba%d1%8a%d1%81%d0%b5%d0%bd-%d0%bd%d0%b5%d0%be%d0%bb%d0%b8%d1%82-%d1%80%d0%b5%d0%b7%d1%83%d0%bb%d1%82%d0%b0%d1%82%d0%b8/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Децембар 14, 2020, 07:38:52 поподне
Динарик VK542 већ постављен у грани Y4460

https://www.yfull.com/tree/I-SK1241/

Видим да је на Yfull live-у VK542 пребачен на грану Y4460> Y3106>Y91535 (https://www.yfull.com/live/tree/I-Y91535/), што и има смисла, с обзиром да млађу грану Y90289 чине Швеђани, чији је "Викинг542" предак, очигледно словенског порекла.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Децембар 14, 2020, 08:24:32 поподне
Видим да је на Yfull live-у VK542 пребачен на грану Y4460> Y3106>Y91535 (https://www.yfull.com/live/tree/I-Y91535/), што и има смисла, с обзиром да млађу грану Y90289 чине Швеђани, чији је "Викинг542" предак, очигледно словенског порекла.

VK542 има и једно позитивно очитање на SK1241, зато сам и мислио да припада овој грани, јер даље нисам ни провјеравао. На SNP-u Y91535 има два позитивна очитања и то у оба смјера, тако да претпостављам да је то поузданије. Додуше ниједна друга позиција на том нивоу му није покривена.

А због овог Швеђанина, слажем се, има више логике.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Децембар 25, 2020, 07:34:21 пре подне
Прије два дана објављена је студија о древној ДНК Кариба. Из студије се виде два одвојена правца досељавања људи на ову групу острва. Први људи су дошли на Карибе, Кубу прије 6.000 година и то су вјероватно људи из централне Америке јер са њима дјеле заједничког биолошког и културног (артефакати) материјала. Други талас насељавања био је из правца сјевероистока јужне Америке прије 2.500-3.000 година. Оно што је занимљиво јесте да су ти људи из првог таласа исчезли (осим у малој групи на западу Кубе) и није евидентирано да су се ове двије заједнице међусобно мјешале јер је такав случај забиљежен само код три индивидуе.

https://www.nature.com/articles/s41586-020-03053-2
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 14, 2021, 09:41:56 пре подне
Објављен је рад о ДНК неолита и Бронзаног доба Француске.

Heterogeneous Hunter-Gatherer and Steppe-Related Ancestries in Late Neolithic and Bell Beaker Genomes from Present-Day France

https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(20)31835-2?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0960982220318352%3Fshowall%3Dtrue#back-bib102

(https://marlin-prod.literatumonline.com/cms/attachment/2c5f83a5-9abf-4862-a3e5-12eba35d220d/gr1.jpg)

Oво би требале бити хаплогрупе, ако сам их правилно дешифровао. Претпоставио сам да су користили ISOGG стабло 2019 (преко алатке YLeaf). Нисам успио наћи сирове резултате.

1H07   I2a1b1b1   I2-M223>S23680
1H13   I2a1b1b1      I2-M223>S23680
2H07   H2a1a   H2-P96>Y21592
2H10   I2a1b1b1      I2-M223>S23680
2H11   I2a1a1b1      I2-M223>S23680
2H17   I2a1b1b1      I2-M223>S23680
2HxC5x196x1131   I2a1b1b1     I2-M223>S23680
GBVPK   R1b1a1b1a1a2a1      R1b-P312>DF27>Z195
ROUQCC      I2a1b1b      I2-M223>S23680
ROUQFF      I2a1a2      I2-М423
ROUQHH      I2a1b1b1      I2-M223>S23680
ROUQW      I2a1b1b1      I2-M223>S23680
TORTD      I2a1b1b1      I2-M223>S23680

Занимљива је доминација мезолитских ловачко-сакупљачких линија у неолитској Француској, без обзира на аутосомална мијешања са неолитским земљорадницима.

Из апстракта:

"This reveals Late Neolithic populations that are genetically diverse and include individuals with dark skin, hair, and eyes. We detect heterogeneous hunter-gatherer ancestries within Late Neolithic communities, reaching up to ∼63.3% in some individuals, and variable genetic contributions of steppe herders in Bell Beaker populations. We provide an estimate as late as ∼3,800 years BCE for the admixture between Neolithic and Mesolithic populations and as early as ∼2,650 years BCE for the arrival of steppe-related ancestry."

У касном неолиту, радило се дакле о фенотипски тамнијој популацији, са доста добро очуваном палеолитском генетиком (и аутосомалном и Y-днк).

Неолитски земљорадници долазе до данашње Француске у периоду око 3800 г. пне, а  сточари са истока око 2650 године пне.


Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 15, 2021, 07:34:01 пре подне
Још један рад старе ДНК објављен ових дана. Извучена је ДНК са три узорка (једна женски и два мушка) са некрополе на сјверу Данске који припадају тзв. Култури појединачних гробова (Single Grave culture SGC) из Бронзаног доба. Узорци су датирани у периоду од 2600-2200 BC. Аутосомално блиски осталим групама степских сточара (Corded Ware). Што се Y-ДНК тиче, успјели су извући са само једног узорка и он припада прилично ријеткој варијанти хаплогрупе R1b, R-V1636.
https://www.yfull.com/tree/R-V1636/

https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0244872
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Јануар 15, 2021, 10:43:12 пре подне
Још један рад старе ДНК објављен ових дана. Извучена је ДНК са три узорка (једна женски и два мушка) са некрополе на сјверу Данске који припадају тзв. Култури појединачних гробова (Single Grave culture SGC) из Бронзаног доба. Узорци су датирани у периоду од 2600-2200 BC. Аутосомално блиски осталим групама степских сточара (Corded Ware). Што се Y-ДНК тиче, успјели су извући са само једног узорка и он припада прилично ријеткој варијанти хаплогрупе R1b, R-V1636.
https://www.yfull.com/tree/R-V1636/

https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0244872

Занимљив распоред има ова V1636, прилично "разбацан". Зна ли се нешто више о тој грани?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 15, 2021, 11:26:45 пре подне
Занимљив распоред има ова V1636, прилично "разбацан". Зна ли се нешто више о тој грани?

Искрено, ја сам је тек сад уочио, тако да не знам, а видим да по распореду више нагиње Азији него Европи.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 15, 2021, 11:30:45 пре подне
Примјетио сам да су ових дана објављени сирови резултати из рада

 The genomic history of the Aegean palatial civilizations


The Cycladic, the Minoan, and the Helladic (Mycenaean) cultures define the Bronze Age (BA) of Greece. Urbanism, complex social structures, craft and agricultural specialization, and the earliest forms of writing, characterize this iconic period. We sequenced six early to middle BA whole genomes, along with 11 mtDNA genomes, sampled from the three BA cultures of the Aegean Sea. The Early BA (EBA) genomes are homogeneous and derive most of their ancestry from Neolithic Aegeans, contrary to earlier hypotheses that the Neolithic-EBA cultural transition was due to massive population turn-over. EBA Aegeans were shaped by relatively small-scale migration from East of the Aegean, as evidenced by the Caucasus-related ancestry also detected in Anatolians. In contrast, Middle BA (MBA) individuals of northern Greece differ from EBA populations in showing ~50% Pontic-Caspian Steppe-related ancestry, dated at ca. 2,600-2,000 BCE. Such gene flow events during the MBA contributed towards shaping present-day Greek genomes.

Колико видим рад са сличним насловом био је присутан на некој конференцији из 2015. године
https://meeting.physanth.org/program/2015/session18/papageorgopoulou-2015-the-origins-of-the-aegean-palatial-civilizations-from-a-population-genetic-perspective.html

Не могу сад да се сјетим да ли је стара днк из овог рада већ обрађивана раније? Има ли неко информацију?

Ако није, добро би било прегледати ове сирове резултате.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Јануар 15, 2021, 12:53:16 поподне
Примјетио сам да су ових дана објављени сирови резултати из рада

 The genomic history of the Aegean palatial civilizations

Ни ја не налазим да се неко бавио том студијом.
А како може да се дође објављених сирових резултата?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 15, 2021, 01:37:22 поподне
Ни ја не налазим да се неко бавио том студијом.
А како може да се дође објављених сирових резултата?

Изгледа да студија још није објављена. Сирови резултати су доступни на сајту NCBI.

Узео сам да прегледам бар један од тих узорака под ознаком Pta08

Подаци о узорку су сљедећи:
Minoan-Petras-EBA
2849-2621 calBCE

Цијепа постојећу грану https://www.yfull.com/live/tree/G-L140/ јер је негативан на L140, али је позитиван на PF337 (могуће и на Z3268), који се тренутно налазе на нивоу L140.

Ради се дакле о минојском узорку.

Уколико успијем уклопити са временом, могао бих прегледати и остале узорке. А вјероватно ће их обрадити и на другим форумима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 15, 2021, 01:54:52 поподне
Заборавих да окачим линк на сирове резултате. Има 6 WGS-ова.

https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/?study=ERP121113

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 15, 2021, 02:13:50 поподне
Ово је списак тих шест узорака са подацима који су о њима тренутно доступни:

Pta08 Minoan-Petras-EBA 2849-2621 calBCE G2a-P15>L1259>L30>CTS574>CTS2488G>P303>CTS796>PF3337
Mik15 Helladic-Manika-EBA 2890-2764 calBCE (по свему судећи жена)
Log04 Helladic-Logkas-MBA 2007-1915 calBCE (жена)
Log02 Helladic-Logkas-MBA 1924-1831 calBCE (жена)
Kou03 Cycladic-Koufonisi-EBA 2832-2578 calBCE (жена)
Kou01 Cycladic-Koufonisi-EBA 2464-2349 calBCE J2a-M410>PF4610>L26>Z6064>Z6055>Z6057>Y7013>Y7010>Y13128>Z36834

Изгледа да су само Pta08 и Kou01 мушкарци.

Прегледао сам и Kou01 и додао терминални СНП.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Јануар 15, 2021, 07:07:16 поподне
Ово је списак тих шест узорака са подацима који су о њима тренутно доступни:

Хвала!
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Јануар 16, 2021, 03:14:30 пре подне
Узео сам да прегледам бар један од тих узорака под ознаком Pta08

Подаци о узорку су сљедећи:
Minoan-Petras-EBA
2849-2621 calBCE

Цијепа постојећу грану https://www.yfull.com/live/tree/G-L140/ јер је негативан на L140, али је позитиван на PF337 (могуће и на Z3268), који се тренутно налазе на нивоу L140.

Ради се дакле о минојском узорку.

Ја не видим L140 међу очитаним SNP-овима код Pta08. Све које видим на нивоу L140 су позитивни:

Y324/Z3351+ A>T (2T); PF3347/CTS12891+ A>G (1G); CTS12570+ C>T (2T); PF3337/Z764+ G>T (1T); Z767+ G>A (1A); CTS796+ T>G (2G); Y307/Z3268+ A>G (2G-1A)

Такође има позитивне SNP-ове и на низводним нивоима PF3346 (Z3065+ A>T (2T)) и PF3345 (PF3345+ G>T (4T)). Сви SNP-ови на нивоима испод PF3345 (Z6779, CTS342 и L497) су негативни, па се Pta08 придружује Македонцу, Грку и Норвежанину испод L140>PF3346>PF3345* (https://www.yfull.com/tree/G-PF3345/).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 16, 2021, 07:37:15 пре подне
Ја не видим L140 међу очитаним SNP-овима код Pta08. Све које видим на нивоу L140 су позитивни:

Y324/Z3351+ A>T (2T); PF3347/CTS12891+ A>G (1G); CTS12570+ C>T (2T); PF3337/Z764+ G>T (1T); Z767+ G>A (1A); CTS796+ T>G (2G); Y307/Z3268+ A>G (2G-1A)

Такође има позитивне SNP-ове и на низводним нивоима PF3346 (Z3065+ A>T (2T)) и PF3345 (PF3345+ G>T (4T)). Сви SNP-ови на нивоима испод PF3345 (Z6779, CTS342 и L497) су негативни, па се Pta08 придружује Македонцу, Грку и Норвежанину испод L140>PF3346>PF3345* (https://www.yfull.com/tree/G-PF3345/).

Посматрао сам live стабло YFulla, а на live стаблу на нивоу L140 нема ових СНП-ова на нивоу L140 које си набројао, осим Z3268 и PF3337, које сам видио да су позитивни. Што се тиче самог L140 видио сам да има једно негативно читање, па нисам даље провјеравао нивое испод L140.

У праву си, Pta08 спушта се до нивоа PF3345, сад видим да има четири позитвна читања. И на YFullu су већ поставили овај узорак на тој позицији.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 23, 2021, 07:41:47 пре подне
Занимљив распоред има ова V1636, прилично "разбацан". Зна ли се нешто више о тој грани?

Погледао сам bam фајл овог узорка из Single Grave културе у Данској под ознаком Gjerrild5. Рекао бих да се налази на нивоу V1636*. Негативан је на подграну V1274, а по свему судећи и на подграну Y106006 (нисам прегледао све СНП-ове на овом нивоу али оно што јесам било је негативно).

Старост гране V1636 је око 6000 година. Занимљиво је да су обе подгране (које су раздвојене још пре око 6500 година) присутне код Dungan Кинеза, што је индикативно и говори можда о и о старијем присуству ове гране у том дијелу свијета. А присутан је и један узорак  Jinyu Кинеза.

Дунган Кинези су иначе муслиманска кинеска група, присутна у западној Кини и централној Азији.

Рекао бих да је ова грана доживјела својеврсно ширење и гранање у периоду енеолита и бронзаног доба на широком азијском пространству, а да су очигледно још тада неке гране дошле и до Европе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 23, 2021, 08:12:04 пре подне
Некако ми ова приказ миграција на овој карти најбоље одговора уз тренутни распоред гране R1b-V1636.

(https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e9/Yamnaya-related_migrations.jpg/1920px-Yamnaya-related_migrations.jpg)

Можда су ови кинески узорци V1636 потомци носилаца Афанасјевске културе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: NenadI Јануар 23, 2021, 08:02:40 поподне
Видим да се то просто не може означавати само као Р1а и Р1б, али ме интересује од упућених, да ли је се разријешила мистерија генезе ИЕ народа? У неким древним узорцима су нађени искључиво Р1б, а у неким Р1а. Како се у то уклапа тзв CWC култура? Коме би она била ближа? Гдје би били у центри Р1а а ггдје Р1б пред стварање ИЕ популације?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Јануар 24, 2021, 06:04:33 поподне
Видим да се то просто не може означавати само као Р1а и Р1б, али ме интересује од упућених, да ли је се разријешила мистерија генезе ИЕ народа? У неким древним узорцима су нађени искључиво Р1б, а у неким Р1а. Како се у то уклапа тзв CWC култура? Коме би она била ближа? Гдје би били у центри Р1а а ггдје Р1б пред стварање ИЕ популације?

На овој теми је о томе било говора:

https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=1971.0
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Србин Јануар 28, 2021, 06:32:36 поподне
Новости са Антрогенике: https://www.eupedia.com/forum/threads/40865-High-levels-of-HG-in-LN-German-settlement?p=618462#post618462

У питању је Имел ет ал. студија под називом Genome-wide study of a Neolithic Wartberg grave community reveals distinct HLA variation and hunter-gatherer ancestry (https://www.nature.com/articles/s42003-020-01627-4)

Узорци са немачког неолитског локалитета Вартберг указују на већу отпорност западних ловаца-сакупљача на вирусе од савремених популација, али не и на бактеријске инфекције. Узорци, међу којим они мушког пола сви припадају хаплогрупи I2 (I2a1, I2a2, I2c1) датирани су на 3300-3200 п.н.е (калибрисано), непосредно пре миграције сточара са истока. мтДНК хаплогрупе су разноврсне. Удео WHG компоненте достиже чак 34-58%. Временом су ти алели могли изгубити предност мутирањем патогена, а дошло је до селекције оних везаних за отпорност на бактерије, попут Јерсиније Пестис која изазива Кугу (након доласка сточара).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 28, 2021, 07:39:21 поподне
Новости са Антрогенике: https://www.eupedia.com/forum/threads/40865-High-levels-of-HG-in-LN-German-settlement?p=618462#post618462

У питању је Имел ет ал. студија под називом Genome-wide study of a Neolithic Wartberg grave community reveals distinct HLA variation and hunter-gatherer ancestry (https://www.nature.com/articles/s42003-020-01627-4)

Узорци са немачког неолитског локалитета Вартберг указују на већу отпорност западних ловаца-сакупљача на вирусе од савремених популација, али не и на бактеријске инфекције. Узорци, међу којим они мушког пола сви припадају хаплогрупи I2 (I2a1, I2a2, I2c1) датирани су на 3300-3200 п.н.е (калибрисано), непосредно пре миграције сточара са истока. мтДНК хаплогрупе су разноврсне. Удео WHG компоненте достиже чак 34-58%. Временом су ти алели могли изгубити предност мутирањем патогена, а дошло је до селекције оних везаних за отпорност на бактерије, попут Јерсиније Пестис која изазива Кугу (након доласка сточара).

Уз сву разноврсност I2 на тако малом простору (L596, M223, M26, Y4213) чуди да нема М423.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Фебруар 02, 2021, 02:51:34 пре подне
Видим на сајту Давидског да је почетком јула објављен препринт рада Saag et al.

Genetic ancestry changes in Stone to Bronze Age transition in the East European plain

Ово је апстракт

"Transition from the Stone to the Bronze Age in Central and Western Europe was a period of major population movements originating from the Ponto-Caspian Steppe. Here, we report new genome-wide sequence data from 28 individuals from the territory north of this source area – from the under-studied Western part of present-day Russia, including Stone Age hunter-gatherers (10,800–4,250 cal BC) and Bronze Age farmers from the Corded Ware complex called Fatyanovo Culture (2,900–2,050 cal BC). We show that Eastern hunter-gatherer ancestry was present in Northwestern Russia already from around 10,000 BC. Furthermore, we see a clear change in ancestry with the arrival of farming – the Fatyanovo Culture individuals were genetically similar to other Corded Ware cultures, carrying a mixture of Steppe and European early farmer ancestry and thus likely originating from a fast migration towards the northeast from somewhere in the vicinity of modern-day Ukraine, which is the closest area where these ancestries coexisted from around 3,000 BC."

Ово су линкови за пратећи материјал.

https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2020/07/03/2020.07.02.184507/DC1/embed/media-1.pdf?download=true
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2020/07/03/2020.07.02.184507/DC2/embed/media-2.zip?download=true
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2020/07/03/2020.07.02.184507/DC3/embed/media-3.xlsx?download=true

Што се тиче Y-днк углавном се ради о R1a, R1a-Z645, R1a-Z93. Давидски пише да је узорак PES001 из око 10.000 г. пне досад најстарији пронађени узорак R1a (на југу архангелске области). Судећи по табели из рада требао би припадати једној прилично ријеткој пдограни хаплогрупе R1a https://www.yfull.com/tree/R-YP1272/

Немам времена да детаљно ишчитавам, али можда неком буде интересантно.
Фатјаново као прапостојбина Балто-Словена или Индо-Иранаца?
https://eurogenes.blogspot.com/2020/11/fatyanovo-as-part-of-wider-corded-ware.html
(https://1.bp.blogspot.com/-1rgM3Ia8t5E/X68skad65uI/AAAAAAAAJbE/-3WJJetcWgMEFThXeR0mLscHUoa4klaDQCLcBGAsYHQ/s948/Fatyanovo_Figure_11.jpg)
https://www.cambridge.org/core/journals/proceedings-of-the-prehistoric-society/article/forgotten-child-of-the-wider-corded-ware-family-russian-fatyanovo-culture-in-context/6309A60F638130BF6F7FD96135AA1B37
Цитат
The Fatyanovo Culture, together with its eastern twin, the Balanovo Culture, forms part of the pan-European Corded Ware Complex. Within that complex, it represents its eastern expansion to the catchment of the Upper and Middle Volga River in the European part of Russia. Its immediate roots are to be found in the southern Baltic States, Belarus, and northern Ukraine (the Baltic and Middle-Dnepr Corded Ware Cultures), from where moving people spread the culture further east along the river valleys of the forested flatlands. By doing so, they introduced animal husbandry to these regions. Fatyanovo Culture is predominately recognised through its material culture imbedded in its mortuary practices. Most aspects of every-day life remain unknown. The lack of an adequate absolute chronological framework has thus far prevented the verification of its internal cultural dynamics while overall interaction proposed also on typo-stratigraphical grounds suggests a contemporaneity with other representations of the Corded Ware Complex in Europe. Fatyanovo Culture is formed by the reverse movement to the (north-)east of the Corded Ware Complex, itself established in the aftermath of the westbound spread of Yamnaya populations from the steppes. It thus represents an important link between west and east, pastoralists and last hunter-gatherers, and the 3rd and the 2nd millennia bc. Through its descendants (including Abashevo, Sintashta, and Andronovo Cultures) it becomes a key component in the development of the wider cultural landscape of Bronze Age Eurasia.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Фебруар 08, 2021, 11:52:49 поподне
Више него занимљива хаплогрупа палеолитског скелета из комшилука, старог преко 40.000 година:

F6-620; 42260-40860 п.н.е.; Бачо Киро пећина, општина Дријаново, Бугарска; pre-F-Y27277 (https://www.yfull.com/tree/F-Y27277/)


ниво Y27277: Y27277+ C>T (2T); Y27279+ G>A (1A); Y27293+ G>T (6T); Y27286+ T>A (1A); Y27291+ T>G (1G); F19004+ C>T (2T); FT90012+ G>A (1A); FT278667- T>A (1T); FT90068- A>G (1A)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Селаковић Фебруар 09, 2021, 09:51:33 пре подне
Видех на нету:

(https://i.postimg.cc/tCs46fGC/wk1lxyvul9g61.png) (https://postimg.cc/crNWyFJV)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Зрно Фебруар 09, 2021, 09:58:49 пре подне
Видех на нету:

(https://i.postimg.cc/tCs46fGC/wk1lxyvul9g61.png) (https://postimg.cc/crNWyFJV)

Ваљда нешто што је ближе тј. сличније треба да буде топлијих боја, а не обрнуто.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Мића Фебруар 09, 2021, 10:14:45 пре подне
Ваљда нешто што је ближе тј. сличније треба да буде топлијих боја, а не обрнуто.

Користили су семафор боје.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Фебруар 10, 2021, 07:39:12 пре подне
Дакле, Истра је колонија археоЛала на Јадрану.

Највише сличности има на западу Балкана, Подунављу, Карпатима, у горњем сливу Елбе и Рајне. Подручје кроз које су у протеклих 4000 година мигрирале R1b-Z2103, J2-L283, E-V13, I2-Y3120 и друге хаплогрупе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Србин Фебруар 10, 2021, 11:01:53 поподне
Уз сву разноврсност I2 на тако малом простору (L596, M223, M26, Y4213) чуди да нема М423.

Интересантно да их раније налазимо у Алзасу и то комплет са U5b: https://umap.openstreetmap.fr/en/map/ancient-human-dna_41837#9/48.4228/7.7124

BERG02-2, BERG157-2, BERG157-7, BORS-Michelsberg, 4315-3803 BC

https://www.pnas.org/content/early/2020/05/20/1918034117
https://doi.org/10.1073/pnas.1918034117

BERG02-2
mtDNA: W5b

BERG157-2
mtDNA: J1c1b

BERG157-7
mtDNA: U5b1c
Y-DNA: I2a1b

Студија је користила ISOGG19/20, дакле I2a1a2. С Антрогенике: https://anthrogenica.com/showthread.php?20136-Ancient-genomes-from-present-day-France-unveil-7-000-years-of-its-demographic-history/page6

BERG157-7: I2a1-M423>Y3104 (>pre-L161?)


Више него занимљива хаплогрупа палеолитског скелета из комшилука, старог преко 40.000 година:

F6-620; 42260-40860 п.н.е.; Бачо Киро пећина, општина Дријаново, Бугарска; pre-F-Y27277 (https://www.yfull.com/tree/F-Y27277/)


ниво Y27277: Y27277+ C>T (2T); Y27279+ G>A (1A); Y27293+ G>T (6T); Y27286+ T>A (1A); Y27291+ T>G (1G); F19004+ C>T (2T); FT90012+ G>A (1A); FT278667- T>A (1T); FT90068- A>G (1A)

Остали резултати објављени на Антрогеници: https://anthrogenica.com/showthread.php?20265-Initial-Upper-Palaeolithic-Homo-sapiens-from-Bacho-Kiro-Cave-Bulgaria/page21&s=0e69522fa950b215c50b3d39c04898a0

CC7-335  44840-42880BC IUP Y-DNA: pre-C-M130 mtDNA: N
BB7-240  44180-42450BC IUP Y-DNA: pre-C-M130 mtDNA: N
AA7-738  42260-40860BC IUP Y-DNA: F-M89 mtDNA: M
F6-620  42260-40860BC IUP Y-DNA: pre-F-Y27277 mtDNA: M
BK-1653  32870-32260BC MUP Y-DNA: pre-P-P226 or pre-R mtDNA: U8

CC7-2289 44580-43720BC IUP mtDNA: R (жена)

https://www.yfull.com/tree/F-Y27277/
https://www.yfull.com/tree/C/
https://www.yfull.com/tree/P/

Аутозомалнa удаљеност, састав (при крају): https://eurogenes.blogspot.com/2021/01/the-great-shift.html?commentPage=2
PCA: https://i.ibb.co/SmRNGXS/Bacho-Kiro-PCA.png
Давид објавио коодринате, али није унео у базу (при крају стране): https://eurogenes.blogspot.com/2021/01/a-tantalizing-link.html?commentPage=2

Најмлађи узорак је практично Граветијен по мушкој линији сродан Јани (ANS/Древни Северни Сибирци - претеча ANE/Древних Северних Евроазијата). Очито је P заузимала степе Северне Евроазије од Балкана до Берингије, такорећи "праисторијски R/Q". Данас P има и на Филипинима - Негритоси.

Бачокировцима/Bachokirian (старијим узорцима) су аутозомално најближи AASI (Негритоси). Млађи узорци, почев од белгијског Орињацијена Goyet Q116-1 већ имају хаплогрупу C. На Антрогеници су поменути узорак уношењем целе базе моделирали као Континенца+Панија+"цео свет" што значи да је Вахадуо аутоматски предвидео AASI у Панији и без одабира релевантних узорака: https://i.imgur.com/u3qXLb6.png

Значи P1 доноси источноевроазијску аутозомалну компоненту у Сибир, а митохаплогрупа U западноевроазијску (Јана P+U, 25% ENA+75% WE). C и F заједно с митохаплогрупама N и M исто доносе источноевроазијску. Једино Буран-Каја прави проблем јер је CT/C+N, при чему је аутозомлно посебно удаљена од Вилабруне, "безбазална" и то 100% западноевроазијска претеча Граветијена C+U.

Од IJK и IJ ни трага ни гласа. Мислим да смо тек загребали испод површине. Недостаје нам много више старих узорака.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Србин Фебруар 10, 2021, 11:20:38 поподне
Извињавам се што пишем двапут, али у међувремену је Прибислав проверио BAM фајлове: https://anthrogenica.com/showthread.php?20265-Initial-Upper-Palaeolithic-Homo-sapiens-from-Bacho-Kiro-Cave-Bulgaria&s=b08cec18a9e25887a25479b3592bb25a&p=746662&viewfull=1#post746662

Дакле BB7-240 није само pre-C већ је и pre-C1!
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Фебруар 23, 2021, 09:01:37 поподне
Древна ДНК Нубије из хришћанског периода:
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.02.17.431423v1

Master ID (Lab)   Skeletal Code   Y haplogroup in terminal mutation notation    Y haplogroup in ISOGG v15.73 notation   Likely Geographic Origin/Primary Distribution of Haplogroup
I6138*   R101*   E-GG24   E1b1b1b2b3a   Africa
I19140   R123   LT   LT   West Eurasia
I6139   R124   E-V22   E1b1b1a1b2   Africa
I19014   R15   E-V32   E1b1b1a1a1b   Africa
I19143   R150   E-Z1919   E1b1b1a1   Africa
I6340   R169   T-Y31477   T1a1a1a1   West Eurasia
I6252   R181   E-Y125054   E1b1b1a1a1c   Africa
I6327   R196   E-BY7923   E1b1b1a1a1b1a1   Africa
I6328   R201   T-L208   T1a1a   West Eurasia
I19015   R21   E-Y161115   E1b1b1a1a1c   Africa
I19132   R57   E-L1250   E1b1b1a1b2   Africa
I6250   R59   E-BY7923   E1b1b1a1a1b1a1   Africa
I6331*   R93*   E-GG24   E1b1b1b2b3a   Africa
I19138   R96   E-Y125054   E1b1b1a1a1c   Africa
I18508   S115   E-FGC14382   E1b1b1a1a1b1a1   Africa
I17475   S144   J-M92   J2a1a1a2b2a1a   West Eurasia
I6332   S159   E-M41   E2a   Africa
I18612^   S16^   E-Y125054   E1b1b1a1a1c   Africa
I18514   S182   E-Y6730   E1b1b1a1a1c   Africa
I6334   S198   G-L140   G2a2b2a1   West Eurasia
I18520   S217   J-YSC0000234   J1a2a1a2d2b2b2   West Eurasia
I6336   S27   E-Y161113   E1b1b1a1a1c   Africa
I18610^   S29^   E-Y125054   E1b1b1a1a1c   Africa
I6254   S33   R-L295   R2a2b1b2b   West Eurasia
I17481   S45   E-CTS2294   E1b1b1a1a1b1a   Africa
I6255   S50   J-M92   J2a1a1a2b2a1a   West Eurasia
I6325   S73   J-M92   J2a1a1a2b2a1a   West Eurasia
I6337   S79   G-L140   G2a2b2a1   West Eurasia
I6257   S81   J-BY94   J1a2b2b   West Eurasia
I17482   S94b   G-P15   G2a   West Eurasia
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Март 08, 2021, 10:50:56 пре подне
Недавно је изашао рад у руском часопису "Генетика" који се бави археогенетском анализом скелета са подручја Хазарског каганата, односно из 8-9. века са територије ростовске области. У питању је 57. том, бр. 4 тог часописа, који је изашао ове године и до чијег апстракта се може доћи преко следећег линка:

http://vigg.ru/genetika/

Име чланка је "Y-ГАПЛОГРУППЫ КОСТНЫХ ОСТАНКОВ ИЗ КУРГАННЫХ ПОГРЕБЕНИЙ ХАЗАРСКОГО ВРЕМЕНИ НА ТЕРРИТОРИИ ЮГА РОССИИ". О саставу хаплогрупа се из апстракта може сазнати следеће - три скелета су носиоци R1a хаплогрупе, два су C2b, и по један скелет припада G2a, N1a, Q и R1b хаплогрупи. Рађено је само SNP тестирање, не и NGS тест, а помињу се и маркери.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: сɣнце Март 08, 2021, 01:07:13 поподне
Недавно је изашао рад у руском часопису "Генетика" који се бави археогенетском анализом скелета са подручја Хазарског каганата, односно из 8-9. века са територије ростовске области. У питању је 57. том, бр. 4 тог часописа, који је изашао ове године и до чијег апстракта се може доћи преко следећег линка:

http://vigg.ru/genetika/

Име чланка је "Y-ГАПЛОГРУППЫ КОСТНЫХ ОСТАНКОВ ИЗ КУРГАННЫХ ПОГРЕБЕНИЙ ХАЗАРСКОГО ВРЕМЕНИ НА ТЕРРИТОРИИ ЮГА РОССИИ". О саставу хаплогрупа се из апстракта може сазнати следеће - три скелета су носиоци R1a хаплогрупе, два су C2b, и по један скелет припада G2a, N1a, Q и R1b хаплогрупи. Рађено је само SNP тестирање, не и NGS тест, а помињу се и маркери.

Најдох у журналу "Генетика" још ове занимљиве чланке:

ГЕНОФОНД НОВГОРОДЦЕВ: МЕЖДУ СЕВЕРОМ И ЮГОМ
Том: 53Номер: 11 Год: 2017 Страницы: 1338-1348
https://www.elibrary.ru/item.asp?id=30561616 (https://www.elibrary.ru/item.asp?id=30561616)
Цитат
генофонд новгородцев оказался и не северным, и не южным, а представителем выявленной в работе буферной зоны, охватившей популяции от Псковщины на западе до костромских краев на востоке. Все четыре популяции новгородцев в целом сходны. Различия между ними могут отражать особенности расселения древних славян (вдоль рек), сохранившиеся в генофонде вопреки бурным демографическим событиям более поздних времен. Пятую часть генофонда новгородцев составляют варианты гаплогруппы N3, причем оба основных европейских варианта - условно “финский” N3a4 и условно “прибалтийский” N3a3 - представлены примерно равными частотами. Анализ филогенетической сети N3a3 впервые выявил особый “балто-славянский” кластер STR-гаплотипов (характерный для балтоязычных литовцев, но нехарактерный для финноязычных эстонцев), в который новгородцы не вошли. Это указывает на то, что N3a3, как и N3a4, унаследована новгородцами от финноязычного населения, которое, в свою очередь, впитало мезолитический генофонд Северо-Восточной Европы.

СОХРАНИЛИСЬ ЛИ СЛЕДЫ ФИННО-УГОРСКОГО ВЛИЯНИЯ В ГЕНОФОНДЕ РУССКОГО НАСЕЛЕНИЯ ЯРОСЛАВСКОЙ ОБЛАСТИ? СВИДЕТЕЛЬСТВА Y-ХРОМОСОМЫ
Том: 53Номер: 3 Год: 2017 Страницы: 378-389
https://www.elibrary.ru/item.asp?id=28917701 (https://www.elibrary.ru/item.asp?id=28917701)
Цитат
Верхнее Поволжье в VIII–X вв. являлось зоной контактов населения, говорившего на финно-угорских, славянских и скандинавских языках. Однако неизвестен вклад этих групп населения в генофонд современной русской популяции Верхнего Поволжья. Для ответа на этот вопрос по широкой панели STR и SNP маркеров Y-хромосомы изучены четыре популяции Ярославской области (N = 132 человека). Две из них оказались генетически схожи: в сборной выборке коренного русского населения Ярославской области и этнографической группе кацкарей мажорной гаплогруппой выступает R-M198(хМ458). Более половины генофонда третьей популяции – этнографической группы сицкарей – составляет гаплогруппа R-M458. В генофонде четвертой популяции – потомков населения г. Молога – мажорной гаплогруппой является N-M178. Субтипирование N-M178 выявило различные пути проникновения этой гаплогруппы в генофонды популяций Ярославского Поволжья: в большинстве русских популяций преобладает субвариант N3a3-CTS10760, в сборной выборке Ярославской области в равной степени представлены субварианты N3a3-CTS10760 и N3a4-Z1936, а в генофонде мологжан доминирует субвариант N3a4-Z1936, характерный для населения севера Восточной Европы и Волго-Уральского региона. Совокупность полученных результатов может указывать на сохранение финно-угорского пласта в генофонде мологжан, на значительный вклад славянской колонизации в формирование генофонда населения Ярославского Поволжья и позволяет выдвинуть гипотезу о большем генетическом вкладе низовой (Ростово-Суздальской), а не верховой (Новгородской) волны славянской экспансии.


ГЕНОФОНД ЮГО-ЗАПАДНЫХ БАШКИР ПО МАРКЕРАМ Y-ХРОМОСОМЫ: ОПЫТ МЕЖДИСЦИПЛИНАРНОГО АНАЛИЗА
Том: 54Номер: 13 Год: 2018 Страницы: 95-98
https://www.elibrary.ru/item.asp?id=36465090 (https://www.elibrary.ru/item.asp?id=36465090)
Цитат
Междисциплинарное исследование связи родовой структуры и полиморфизма Y-хромосомы юго-западных башкир, проведенное по 64 SNP-маркерам, выявило в генофонде кланового объединения мин (N = 68) 14 Y-гаплогрупп. Наиболее частыми оказались субварианты “североевразийской” гаплогруппы N3a, охватившие треть генофонда минцев (34%). На втором по частоте месте – “паневразийские” гаплогруппы R1a и R1b (26%), распространенные у северной части минцев. “Центральноазиатская” гаплогруппа С2* обнаружена с той же невысокой частотой (16%), что и “переднеазиатские” варианты гаплогрупп J, G, E. Впервые сделан вывод, что генофонд юго-западных башкир (минцев) сформировался на преобладающей основе коренного дотюркского населения региона. “Центральноазиатский” пласт генофонда минцев оказался минорным, но именно его носители могли играть структурообразующую роль в клановом объединении мин.

ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ПОПУЛЯЦИЙ ВОЛГО-УРАЛЬСКОГО РЕГИОНА ПО ДАННЫМ ОБ ИЗМЕНЧИВОСТИ Y-ХРОМОСОМЫ
Том: 51Номер: 1 Год: 2015 Страницы: 120
https://www.elibrary.ru/item.asp?id=22681776
 (https://www.elibrary.ru/item.asp?id=22681776)
Цитат
Проведен анализ генетического разнообразия девяти этнических групп Волго-Уральского региона с использованием 15 диаллельных локусов нерекомбинирующей области Y-хромосомы. Мажорными гаплогруппами Y-хромосомы в регионе являются R1a-M198, R1b-M269 и N-M231. Было установлено, что наиболее сильно от других популяций Волго-Уральского региона отличаются башкиры как по данным Fst, так и по данным анализа главных компонент. Кроме того, был проведен анализ распределения частот гаплогрупп Y-хромосомы в ранее не изученной по мужской линии популяции бесермян, по результатам которого было выявлено преобладание гаплогруппы N-M231 (54.7%), что может свидетельствовать о превалировании финно-угорского компонента в формировании патрилинейной составляющей генофонда бесермянского этноса.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Март 30, 2021, 10:14:19 поподне
Рад о генетици Скита:
https://advances.sciencemag.org/content/7/13/eabe4414 .
Чекајући .бам фајлове ово је преглед хаплогрупа, 72 узорка:

AIG005.A0101   R1(R-P234,R-M173)
ALN001.A0101   Q1a1a1(Q-M265,Q-M120)
ALN002.A0101   R1a(R-L62,R-M420)
ALN003.A0101   Q1a2a1c(Q-L330)
ALN005.A0101   R1a1a1b2a(R-Z94)
ALN008.A0101   E1b1b1b2a(E-M123)
ALN004.A0101   R1b1a2(R-PF6475,R-M269)
BGD004.A0101   NO(NO-M2313)
BIY006.A0101   CT(CT-M5812,CT-M168)
BIY011.A0101   R1(R-P225,R-M173)
BSB004.A0101   CT(CT-M5715,CT-M168)
CHK004.A0101   J2a(J-L212,J-M410)
HUN001.merged   R1a1a1b (R-Z645)
KRY001.A0101   R1a1a1b2a  (R-Z94)
KKB001.A0101   J2a (J-L212; J-M410)
KKB002.A0101   R1a1a1b2 (R-Z93)
KLK002.A0101   C2b1c(C-F1918)
KNT004.A0101   D1b2a  (D-Z17175;  D-CTS220)
KNT005.A0101   L1a2  (L-M357)
KOK001.A0101   Q1b1b1(Q-FGC4872,Q-Y2990)
KNT001.A0101   E1b1b1a1b1a  (E-V13)
KNT003.A0101   J2a1h2  (J-L25)
KBO001.A0101   Q1a2a1(Q-L54)
BDY003.B0101   R1a1a(R-L449,R-M512)
KSH003.A0101   R1a1a1b2 (R-Z93)
MMR001.A0101   J(J-CTS852,J-M304)
BRE005.A0101   Q1a2a1c  (Q-L334; Q-L330)
BRE002.A0101   Q1a2a1c  (Q-L330)
CSP001.A0101   Q1a(Q-M1088,Q-L472)
KEN001.A0101   J2a(J-L212,J-M410)
KEN003.A0101   R1a1a1b(R-Z647,R-Z645)
CSP003.A0101   L(L-PF5747,L-M20)
CSP004.A0101   R1a1a(R-M512)
BGD002.A0101   R1a(R-L62,R-M420)
BIY001.A0101   NO(NO-F549,NO-M2313)
BIY002.A0101   Q1a2a(Q-L475,Q-L53)
BIY003.A0101   N1c1(N-L395,N-M46)
BIY005.A0101   F(F-P14,F-M89)
BIY007.A0101   G(G-M3509.1,G-M201)
BIY008.A0101   N1c1a1a(N-L392)
BIY009.A0101   N1c1a1a2(N-CTS10082,N-Z1936)
BIY010.A0101   Q1a(Q-M1155,Q-L472)
BIY012.A0101   CT(CT-M5603,CT-M168)
KOK002.A0101   CF(CF-M3690,CF-P143)
SHD001.A0101   Q1a2a(Q-L53)
SMV001.A0101   N1c1a(N-P298,N-M178)
SMV002.A0101   G(G-M3544,G-M201)
AIG001.A0101   P1(P-P243,P-M45)
AIG002.A0101   R1(R-P238,R-M173)
AIG006.A0101   R1a(R-L63,R-M420)
BSB001.A0101   R1a1a(R-M198,R-M512)
CLK001.A0101   R1a1a1(R-Page7,R-M417)
KBU003.A0101   R1a1a1(R-M417)
SHD002.A0101   BT(BT-M9267,BT-M42)
TAL003.A0101   R1a1a1b2  (R-Z93)
TAL005.A0101   C2b  (C-L1373)
AKB001.A0101   R1a1a1b (R-Z645)
BKT001.A0101   R1a1a1b2a (R-Z94)
ESZ001.A0101   R1a1a1  (R-M417)
KKM001.A0101   R1a1a1b (R-Z645)
KSH001.A0101   R1a1a1b2 (R-Z93)
KSH004.A0101   R1a1a1b (R-Z647; R-Z645)
KYZ001.A0101   R1a1a1b2a (R-Z94)
NUR002.A0101   R1a1a1b (R-Z647; R-Z645)
TAL004.A0101   R1a1a1b  (R-Z645)
WAR001.A0101   Q1a2a (Q-L475; Q-L53)
BIR010.A0101   Q1a1(Q-F1215,Q-F1096)
VOR003.A0101   BT(BT-Z12003,BT-M42)
BRE011.A0101   Q1a1b1a  (Q-L713)
BRE004.A0101   Q1a1b1a  (Q-L715; Q-L713)
BRE013.A0101   Q1a2a1c  (Q-L330)
BRE014.A0101   R1a1a1b  (R-Z645)


Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Април 06, 2021, 01:54:08 пре подне
Рад о генетици Скита:
https://advances.sciencemag.org/content/7/13/eabe4414 .
Чекајући .бам фајлове ово је преглед хаплогрупа, 72 узорка:

AIG005.A0101   R1(R-P234,R-M173)
ALN001.A0101   Q1a1a1(Q-M265,Q-M120)
ALN002.A0101   R1a(R-L62,R-M420)
ALN003.A0101   Q1a2a1c(Q-L330)
ALN005.A0101   R1a1a1b2a(R-Z94)
ALN008.A0101   E1b1b1b2a(E-M123)
ALN004.A0101   R1b1a2(R-PF6475,R-M269)
BGD004.A0101   NO(NO-M2313)
BIY006.A0101   CT(CT-M5812,CT-M168)
BIY011.A0101   R1(R-P225,R-M173)
BSB004.A0101   CT(CT-M5715,CT-M168)
CHK004.A0101   J2a(J-L212,J-M410)
HUN001.merged   R1a1a1b (R-Z645)
KRY001.A0101   R1a1a1b2a  (R-Z94)
KKB001.A0101   J2a (J-L212; J-M410)
KKB002.A0101   R1a1a1b2 (R-Z93)
KLK002.A0101   C2b1c(C-F1918)
KNT004.A0101   D1b2a  (D-Z17175;  D-CTS220)
KNT005.A0101   L1a2  (L-M357)
KOK001.A0101   Q1b1b1(Q-FGC4872,Q-Y2990)
KNT001.A0101   E1b1b1a1b1a  (E-V13)
KNT003.A0101   J2a1h2  (J-L25)
KBO001.A0101   Q1a2a1(Q-L54)
BDY003.B0101   R1a1a(R-L449,R-M512)
KSH003.A0101   R1a1a1b2 (R-Z93)
MMR001.A0101   J(J-CTS852,J-M304)
BRE005.A0101   Q1a2a1c  (Q-L334; Q-L330)
BRE002.A0101   Q1a2a1c  (Q-L330)
CSP001.A0101   Q1a(Q-M1088,Q-L472)
KEN001.A0101   J2a(J-L212,J-M410)
KEN003.A0101   R1a1a1b(R-Z647,R-Z645)
CSP003.A0101   L(L-PF5747,L-M20)
CSP004.A0101   R1a1a(R-M512)
BGD002.A0101   R1a(R-L62,R-M420)
BIY001.A0101   NO(NO-F549,NO-M2313)
BIY002.A0101   Q1a2a(Q-L475,Q-L53)
BIY003.A0101   N1c1(N-L395,N-M46)
BIY005.A0101   F(F-P14,F-M89)
BIY007.A0101   G(G-M3509.1,G-M201)
BIY008.A0101   N1c1a1a(N-L392)
BIY009.A0101   N1c1a1a2(N-CTS10082,N-Z1936)
BIY010.A0101   Q1a(Q-M1155,Q-L472)
BIY012.A0101   CT(CT-M5603,CT-M168)
KOK002.A0101   CF(CF-M3690,CF-P143)
SHD001.A0101   Q1a2a(Q-L53)
SMV001.A0101   N1c1a(N-P298,N-M178)
SMV002.A0101   G(G-M3544,G-M201)
AIG001.A0101   P1(P-P243,P-M45)
AIG002.A0101   R1(R-P238,R-M173)
AIG006.A0101   R1a(R-L63,R-M420)
BSB001.A0101   R1a1a(R-M198,R-M512)
CLK001.A0101   R1a1a1(R-Page7,R-M417)
KBU003.A0101   R1a1a1(R-M417)
SHD002.A0101   BT(BT-M9267,BT-M42)
TAL003.A0101   R1a1a1b2  (R-Z93)
TAL005.A0101   C2b  (C-L1373)
AKB001.A0101   R1a1a1b (R-Z645)
BKT001.A0101   R1a1a1b2a (R-Z94)
ESZ001.A0101   R1a1a1  (R-M417)
KKM001.A0101   R1a1a1b (R-Z645)
KSH001.A0101   R1a1a1b2 (R-Z93)
KSH004.A0101   R1a1a1b (R-Z647; R-Z645)
KYZ001.A0101   R1a1a1b2a (R-Z94)
NUR002.A0101   R1a1a1b (R-Z647; R-Z645)
TAL004.A0101   R1a1a1b  (R-Z645)
WAR001.A0101   Q1a2a (Q-L475; Q-L53)
BIR010.A0101   Q1a1(Q-F1215,Q-F1096)
VOR003.A0101   BT(BT-Z12003,BT-M42)
BRE011.A0101   Q1a1b1a  (Q-L713)
BRE004.A0101   Q1a1b1a  (Q-L715; Q-L713)
BRE013.A0101   Q1a2a1c  (Q-L330)
BRE014.A0101   R1a1a1b  (R-Z645)

Започео сам анализу сирових података за J узорке. Како су у fasta формату требаће ми доста времена док их испребацујем у .bam фајлове.
Узорак којег сам почео првог обрађивати је KKB001.A0101, за сада сам утврдио да је J2a-L26 (xL24, xL25, xPF5116).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Србин Април 08, 2021, 07:51:40 поподне
Ако већ нисте видели, Давид је објавио интересантан део текста везан за већ познате узорке из бугарске пећине Бачо Киро, у питању је нови рад: https://eurogenes.blogspot.com/2021/04/the-bacho-kiro-surprise-hajdinjak-et-al.html

Хајдињак сад тврди да GoyetQ116-1 није мешавина Тианјуана већ нечег што је допринело и једном и другом. Такође помиње да су узорци из Монголије резултат миграције тих раних Европљана у Азију, али да је поменута генетика ишчезла у западној Евроазији судећи по каснијим европским узорцима који су били ближи савременим Европљанима него савременим азијским популацијама.

Такође је објављен рад Прифера ет ал. о занимљивом узорку старом преко 45000 година са чешког локалитета у склопу пећинског система Koněprusy (Коњепруси): https://www.nature.com/articles/s41559-021-01443-x

Узорак је назван Zlatý kůň (Злати Куњ=Златни Коњ) по брду изнад пећина. У питању су остаци особе женског пола па је осим аутозомалног обављен још само мтДНК тест. Аутозомално је базална у односу на Уст-Ишим, што значи да се одвојила пре поделе Крунских Евроазијата на Западне и Источне. Припадала је мтДНК хаплогрупи N.

Уст ишим је ближи осталим Евроазијатима него Oase1, међутим због лошег узорка претходно поменутог није било могуће утврдити везу између популација поменутог чешког и румунског локалитета.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Србин Април 08, 2021, 08:51:24 поподне
Истекло време за исправку.

https://www.nature.com/articles/s41586-021-03335-3

Цитат
On the basis of the numbers of putatively deaminated fragments aligning to the X chromosome and the autosomes21 (Supplementary Information 4), we conclude that specimens F6-620, AA7-738, BB7-240 and CC7-335 belonged to males, whereas BK1653 and CC7-2289 belonged to females, although the low amount of data makes this conclusion tentative for CC7-2289 (Extended Data Fig. 2a).

У Хајдињаковом раду је наведено да је узорак BK1653 женског пола.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 22, 2021, 08:34:10 пре подне
Нови рад древне ДНК. Тестирани су остаци из крипте манастирске цркве у граду Riesa( раније словенско Riezowe) недалеко од Дрездена, из период 17-19. вијека.

Циљ рада је било идентификација и откривање генетичких родбинских веза између сахрањених појединаца. Y хромозомално су профилисане три племићке породице из тог подручја:
Hanisch/von Odeleben
von Welck
Felgenhauer

Занимљиво је да су Hanisch/von Odeleben и von Welck словенског поријекла. Hanisch припадају хаплогрупи R1a-Y2613, а von Welck хаплогрупи R1a-Y2902>Y3219. Фелгенхауере нисам детаљније провјеравао, чини ми се да су R1b. Цијело то подручје и у топонимији и у антропонимији обилује словенским ријечима, па ови резултати и не чуде.

Ово су STR профили тестираних:

(https://marlin-prod.literatumonline.com/cms/attachment/fff42144-9f1a-4f10-8cf2-f88fb6c93de3/fx3.jpg)

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33872864/

За Hanischa нисам пронашао неких ближих поклапања код нас, иако је на 23 маркера незахвално говорити о везама. von Welck-овима је од наших најближи један необјављени Херцеговац.

Детаљније о von Welck-овима
https://de.zxc.wiki/wiki/Welck_(Adelsgeschlecht)

Тестирани су конкретно остаци овог појединца
https://de.zxc.wiki/wiki/Curt_Robert_von_Welck

(https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/f/f4/Curt_Robert_von_Welck.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Христифор Април 29, 2021, 12:50:57 поподне
Уочљив је мањак материјала везаних за Србију почевши од раног до касног средњег века. Чак и у Босни раде днк анализе скелета испод стећака.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Владимир Бојановић Мај 03, 2021, 09:22:26 поподне
Данас сам приметио доста велики број археогенетских резултата у I2-L161(сестринска хг нашој L621)>L1498: https://www.yfull.com/tree/I-L1498/. Најновије обраде се тичу Y12993 подгране: https://www.yfull.com/tree/I-Y12993/ , тј. неких налаза на Оркнијским острвима: https://sr.wikipedia.org/sr-ec/%D0%9E%D1%80%D0%BA%D0%BD%D0%B8%D1%98%D1%81%D0%BA%D0%B0_%D0%BE%D1%81%D1%82%D1%80%D0%B2%D0%B0

Интересантан је њихов TMRCA од 6500 година (који се иначе поклапа са проценом за L621). Да ли је неко упућен о којим неолитским налазиштима је реч, укључујући и оне у Ирској, где су обрађени узорци из нешто старијих подграна?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 03, 2021, 09:35:38 поподне
Данас сам приметио доста велики број археогенетских резултата у I2-L161(сестринска хг нашој L621)>L1498: https://www.yfull.com/tree/I-L1498/. Најновије обраде се тичу Y12993 подгране: https://www.yfull.com/tree/I-Y12993/ , тј. неких налаза на Оркнијским острвима: https://sr.wikipedia.org/sr-ec/%D0%9E%D1%80%D0%BA%D0%BD%D0%B8%D1%98%D1%81%D0%BA%D0%B0_%D0%BE%D1%81%D1%82%D1%80%D0%B2%D0%B0

Интересантан је њихов TMRCA од 6500 година (који се иначе поклапа са проценом за L621). Да ли је неко упућен о којим неолитским налазиштима је реч, укључујући и оне у Ирској, где су обрађени узорци из нешто старијих подграна?

Требали би бити одавде https://reich.hms.harvard.edu/ancient-genome-diversity-project
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 13, 2021, 08:53:37 пре подне
Објављено је геномско истраживање Бронзаног доба на тлу Италије. Не знам да ли су се ови узорци раније помињали у препринту, али колико видим обрађено је неких 22 генома од чега 13 мушких, а и од тих успјели су извући Y-днк за 11, углавном G2a, R1b, J2a, I2-M223 и I2-M26

https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(21)00535-2?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0960982221005352%3Fshowall%3Dtrue
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Јун 05, 2021, 03:39:46 пре подне
Нови рад о Скитима, од бронзаног преко гвозденог доба па све до черњаховске културе (3-4. век н.е.). Тестирано је пет временски и територијално различитих популација Скита:

https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(19)30712-2

Што се тиче Y-ДНК, издвојене су следеће хаплогрупе:

https://www.cell.com/cms/10.1016/j.cub.2019.06.019/attachment/d57f7395-4faf-4f6c-8d38-7d30448193d8/mmc1

Занимљиво је присуство скандинавске R1a-Z284>S4458>S5301 (у раду означена као R1a1e-CTS1123) међу јужноуралским Скитима. R1a (више грана, међу којима и Z93) је свакако најбројнија, јавља се и Q1-L332, E1b-M84, J1-P58 и J2a.
Из овог рада "Shifts in the Genetic Landscape of the Western Eurasian Steppe Associated with the Beginning and End of the Scythian Dominance"
Цитат
The Chernyakhiv culture was likely an ethnically heterogeneous mix based on Goths (Germanic tribes) but also including Sarmatians, Alans, Slavs, late Scythians, Dacians and the antique population of the northern coast of the Black Sea [24, 25, 26, 27].

https://els-jbs-prod-cdn.jbs.elsevierhealth.com/cms/attachment/9b6af6d8-23e4-48d0-94a6-84abddce83d1/gr2.jpg
https://marlin-prod.literatumonline.com/cms/attachment/9b6af6d8-23e4-48d0-94a6-84abddce83d1/gr2.jpg
(https://marlin-prod.literatumonline.com/cms/attachment/9b6af6d8-23e4-48d0-94a6-84abddce83d1/gr2.jpg)

такође и на https://indo-european.eu/2019/05/dinaric-i2a-and-the-expansion-of-common-slavs-from-east-central-europe/
https://indo-european.eu/wp-content/uploads/2019/05/chernyakhov-goths-uralic-clines.png?x59466
(https://indo-european.eu/wp-content/uploads/2019/05/chernyakhov-goths-uralic-clines.png?x59466)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Прерад Јун 11, 2021, 06:00:18 поподне
Када се може очекивати званична објава резултата из Виминацијума? Прошле године се је нешто расправљало о томе али никако да видимо коначни исход истраживања.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јул 06, 2021, 08:51:33 пре подне
Ових дана је објављен нови археогенетички рад. Не знам да ли је раније објављиван у препринту и да ли су већ били познати резултати. У сваком случају ради се о налазишту Културе лоптастих амфора (Globular Amphora culture) или скраћено GAC, из периода 3000-2500 г.пне из мјеста Kierzkowo у централној Пољској.

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34208224/

(https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/8d/Map_Corded_Ware_culture-en.svg/1920px-Map_Corded_Ware_culture-en.svg.png)

Y-DNK је извучен за три узорка и сви припадају  хаплогрупи I2, при чему неки још специфичније подгранама I2-M223, односно I2-М223>L801

Узорак3.4 I2-FGC3552
Узорак7.6 I2-CTS8444
Узорак8.5 I2-FGC3587

Овакви резултати су у сагласности и са ранијим резултатима археогенетичких студија ове културе, гдје такође доминира I2-M223, па и I2-М223>L801. Могло би се на основу тих неколико студија претпоставити да је то била најтипичнија хаплогрупа ове популације.

О овој култури се раније говорило као раној индоевропској или у крајњем случају индоевропеизованој, међутим генетичке студије указују да се ради о својеврсном острву неиндоевропског становништва усред индоевропске Corded Ware културе. Има мишљења, а на основу неких пронађених гробница, да је овај сусрет придошлих Индоверопљана и неолитског становништва био насилан. У једну руку, и слаба данашња присутност I2-M223 на тим просотрима, вјероватно иде у прилог таквој претпоставци.

У раду је урађена и фенотипска генетичка анализа и углавном се ради о свијетлој пути, свијетлој коси и плавим очима.

Занимљиво је да се ова култура у енеолиту простирала на подручјима на којима ће много касније почети процеси словенске етногенезе, али међу припадницима ове културе досад није пронађена словенска I2-L621 нити њени деривати. Ово такође иде у прилог тези о каснијем доласку I2-L621 на просторе источне Европе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Август 01, 2021, 12:40:22 пре подне
 https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.07.30.454498v1.supplementary-material

 Изашао рад о Даунима, месапском народу из Италије.

 Прелиминари Y-DNA, основни SNP calls. Сигурно да су ови M241 пуно ниже због мање покривености. Док ови M269 би могли бити Z2103 или PF7562.

R1b-M269
R1b-P312
J2b2-L283
I2d-Z2093/Y3670
J2b-M241
J2b-M241
I2d-M223
I1-M253
R1b-M269

 Такођер одличан резултат за хг E-V13, дакле нема је..  8) 8) Мислим што би требало да буде трачких хаплогрупа у знатном проценту међу Илирима??  :D :D Исто као да се очекује да су Скити носили доста R-U106 или да су Германи доминантно R1a..

 Алојз Бенац пише да су Месапи поријеклом по археолошким доказима са југа Албаније, а не из Далмације како се некада тврдило, да са археолошке стране нема основа за то. Овакво нешто указује да неће E-V13 чинити ишта више од малог процента Илира са југа Илирије такођер..
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Август 01, 2021, 10:09:56 пре подне
Ово су корисни резултати из периода који је вјероватно и најзанимљивији за генетичку генеалогију- Гвозденог доба.

Дакле, југ Италије у Гвозденом добу: J2b-M241, R1b-P312 и I2-M223. Надам се да ће се открити и неке ниже подгране.

Овај I1-M253 je из средњег вијека, могао би бити лангобрдски или нормански. Близу је њихових центара, нађен у San Giovanni Rotondo.

Што се тиче E-V13, да нема их, али њих иначе слабо има на археогенетичким налазиштима. Некако су, што би Рвати рекли, самозатајни.  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Август 01, 2021, 11:20:23 пре подне
Нека врста закључка у апстракту, везано за Дауне:

In this light, the genetic profile of Daunians may be compatible with an autochthonous origin, with plausible contributions from the Balkan peninsula.


Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Август 01, 2021, 12:35:18 поподне
Надам се да ће моћи да се сазнају и ниже подгране од наведених из рада, нарочито за R1b-M269. Било би занимљиво сазнати да ли је у питању PF7562, Z2103 или нешто треће.  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Август 01, 2021, 08:37:25 поподне
Надам се да ће моћи да се сазнају и ниже подгране од наведених из рада, нарочито за R1b-M269. Било би занимљиво сазнати да ли је у питању PF7562, Z2103 или нешто треће.  :)

 Оф Фљора: SGR002, San Giovanni Rotondo, 571 cal BCE, is R-Z2103+ Мора да је и ово мигрант преко мора.

 Исто иако још нема BAM фајлова као да су два узорка Z1297+.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Август 02, 2021, 11:02:33 поподне
 Два даунска узорка су изгледа J-BY23734.

 Ја сам управо нашао да је један I-M223 узорак Y7501+, SNP на нивоу I-Y7219. Та грана је испод P78. Код паралелне I-S25733 постоје два албанска огранка, нити један нема рођаке код германских народа ближе од бронзаног доба а њихов TMRCA је 4700 г. И неки српски родови су I-Y4884, могуће да нису повезани са овим Албанцем што би још донијело разноврсности P78 на Балкану.

 Треба споменути сарматски узорак из Казахстана који је I-S17511. I-Y5362* је и један Кинез. I-Y11261 је руско-пољско-јеврејска.

 I-L699 и  I-L702 доминирају Езеро културом. А I-L699 је нађена код степске Јамнаја културе као и код Јамнаје из Бугарске у надолазећој студији. Да нису можда ови Езеро L702 узорци негативни на L699? I-L699 свакако нема везе са германским сеобама, а мени се чини да би исто могао врло лако бити случај и за P78 дакле да су палеобалканског поријекла.

 Наравно ово је све без BAM фајлова, ови J-BY23734 су позитивни на два различита снипа на том нивоу тако да би требали бити поуздано ту док је овај узорак бар Y7501+ уз плус на M223 нивоу.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Август 03, 2021, 12:01:03 пре подне
 Ковачани су A427+ 23andme, Поповски из Македоније Y4884+. I-Y6405 дефинише dys19=16 што они немају значи нису у вези са овим Албанцем I-Y6396*. Ковачани по хаплотипу су 100 % Y4884+.

 Паштровићи су на 23andme потврђени као S25733+ , при томе се може рећи на основу STR да су 100 % Y4884-. Нису у вези по STR са албанском граном I-PH2670, бар некој иоле ближој вези.

 Значи 4 гране везе немају једна с другом , а ови са NGS нико ближи од бронзаног доба. Нисам гледао на истоку Балкана шта има око ове гране. Мислим да ова грана везе нема са германским сеобама. превише има разноврсности и још ако буде потврђен овај даунски узорак P78..
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Август 03, 2021, 12:23:11 пре подне
 Један Бугарин је могуће у вези са Паштровићима (да није његовог чудног 438 рекао бих 100% у ближој вези) а други Бугарин је сигурно у вези са Ковачанима..

 Мислим да је НиколаВук помињао већ да би P78 могли бити "локалци" по разноврсности ове гране на Балкану..
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Август 13, 2021, 02:31:02 поподне
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.07.30.454498v1.supplementary-material

 Изашао рад о Даунима, месапском народу из Италије.

 Прелиминари Y-DNA, основни SNP calls. Сигурно да су ови M241 пуно ниже због мање покривености. Док ови M269 би могли бити Z2103 или PF7562.

R1b-M269
R1b-P312
J2b2-L283
I2d-Z2093/Y3670
J2b-M241
J2b-M241
I2d-M223
I1-M253
R1b-M269

 Такођер одличан резултат за хг E-V13, дакле нема је..  8) 8) Мислим што би требало да буде трачких хаплогрупа у знатном проценту међу Илирима??  :D :D Исто као да се очекује да су Скити носили доста R-U106 или да су Германи доминантно R1a..

 Алојз Бенац пише да су Месапи поријеклом по археолошким доказима са југа Албаније, а не из Далмације како се некада тврдило, да са археолошке стране нема основа за то. Овакво нешто указује да неће E-V13 чинити ишта више од малог процента Илира са југа Илирије такођер..


Био сам оправдано одсутан неко време али сам испратио те резултате. Иначе слажем се, иако је E-V13 изостао такав исход је значајан за разумевање историје ове хаплогрупе.

Поред овога, пре 2-3 дана су постали доступни BAM фајлови из још необјављеног рада The origin and legacy of the Etruscans through a 2,000-year archeogenomic time transect (https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB42866)

Нисам сигуран који број фајлова се односи на Y-ДНК али по свему судећи ради се о неколико десетина. Од свих тих резултата само један са ознаком VEN008 је потенцијално E-V13.
Обзиром да рад још увек није објављен није са сигурношћу познат контекст (локација и старост) ни за један од резултата па тако ни за VEN008. Међутим све указује да се ради о грчкој колонији која се звала Venusia и налазила се у регији која се данас зове Базиликата.

Ово је по мени још један аргумент у прилог става да E-V13 у данашњој Јужној Италији углавном потиче из периода грчке колонизације. А поред тога то је и аргумент да Западни Балкан па и Балкан генерално није била област одакле из које је кренуло ширење E-V13.
Да се не враћам на то, већ је писано о све израженијем консензусу да се велика већина E-V13 заправо може везати за Дако-Трачке народе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Август 13, 2021, 09:57:51 поподне
Поред овога, пре 2-3 дана су постали доступни BAM фајлови из још необјављеног рада The origin and legacy of the Etruscans through a 2,000-year archeogenomic time transect (https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB42866)


Користан преглед резултата дао је Maciamo са Eupediе. Изоставио је оне мање поуздане, тј резултате код којих је узорак био слабијег квалитета:

Цитат
- E1b1b-L618 (1x)
- G2a (x10, including the Neolithic PF3359 (2x) and L140>CTS342 (2x) and the Italo-Celtic L140>L497 (2x))
- I2a2a-Y3259 (1x)
- I2c1 (3x)
- J1 (1x)
- J1-P58 (x1)
- J2 (x1)
- J2a1-L26 (3x)
- J2b2 (5x)
- R1b-Z2103 (1x)
- R1b-L51 (6x)
- R1b-P312 (2x)
- R1b-U152 (x12, including 10x L2, 1x Z36)


Based on these 45 samples, it looks like the Etruscans were primarily R1b (47%), G2a (22%) and J2 (20%).

Interestingly the Latins seemed to have more R1b-Z2103 and R1b-U152>Z56, while the Etruscans are mostly R1b-L51 and R1b-U152>L2. I am starting to wonder whether the R1b-L2 outside of Italy is really Celtic or if most of it could be ultimately of Italian origin, be it Latin/Italic, Etruscan or even Cisalpine Celtic.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Август 14, 2021, 09:18:59 пре подне

Користан преглед резултата дао је Maciamo са Eupediе. Изоставио је оне мање поуздане, тј резултате код којих је узорак био слабијег квалитета:

Мене једино чуди да нема ни I2a Динарика ни R1a. Шта је онда са оним Етрурци-Расени-Рашани-Трачани? Јесу ли ови тестирани прави Етрурци? Не знам, све је то мени сумњиво.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милан Петровић Август 14, 2021, 10:31:51 пре подне
Мене једино чуди да нема ни I2a Динарика ни R1a. Шта је онда са оним Етрурци-Расени-Рашани-Трачани? Јесу ли ови тестирани прави Етрурци? Не знам, све је то мени сумњиво.
Ватикан и Беч су сакрили те узорке.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Август 19, 2021, 05:20:03 пре подне
Распоред већине данашњих припадника E-V13 и J2-L283 највероватније је последица сеоба Индоевропљана.  J2-L283 је доста рано стигла до Италије, а врло је мало има на Блиском Истоку. Изгледа да је из Мале Азије прешла на Балкан, па у Подунавље, а одатле се раширила по Европи.  E-V13 је до Италије стигла касније, а присутнија је на Блиском Истоку. Изгледа да је њено ширење започело негде северно од Црног Мора, одакле су неке подгрупе кренуле према Блиском Истоку, а друге према Европи. На крају бронзаног доба главни извор и E-V13 и J2-L283 постаје горње Подунавље, а одатле потиче и добар део њихових данашњих припадника на Балкану.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Август 19, 2021, 08:34:41 пре подне
Распоред већине данашњих припадника E-V13 и J2-L283 највероватније је последица сеоба Индоевропљана.  J2-L283 је доста рано стигла до Италије, а врло је мало има на Блиском Истоку. Изгледа да је из Мале Азије прешла на Балкан, па у Подунавље, а одатле се раширила по Европи.  E-V13 је до Италије стигла касније, а присутнија је на Блиском Истоку. Изгледа да је њено ширење започело негде северно од Црног Мора, одакле су неке подгрупе кренуле према Блиском Истоку, а друге према Европи. На крају бронзаног доба главни извор и E-V13 и J2-L283 постаје горње Подунавље, а одатле потиче и добар део њихових данашњих припадника на Балкану.


Да отприлике тако некако.  :)

Само што је присуство E-V13 на Блиском Истоку релевантно исто колико и присуство ове хаплогрупе у Британији. Тј ове области немају везе са главним путевима миграција али могу послужити као један од многих индикатора у сврху препознавања како је до ширења дошло.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Август 19, 2021, 09:22:43 пре подне
Распоред већине данашњих припадника E-V13 и J2-L283 највероватније је последица сеоба Индоевропљана.  J2-L283 је доста рано стигла до Италије, а врло је мало има на Блиском Истоку. Изгледа да је из Мале Азије прешла на Балкан, па у Подунавље, а одатле се раширила по Европи.  E-V13 је до Италије стигла касније, а присутнија је на Блиском Истоку. Изгледа да је њено ширење започело негде северно од Црног Мора, одакле су неке подгрупе кренуле према Блиском Истоку, а друге према Европи. На крају бронзаног доба главни извор и E-V13 и J2-L283 постаје горње Подунавље, а одатле потиче и добар део њихових данашњих припадника на Балкану.

Што се гране J2-L283, не вјерујем да она има икакве везе са ширењем Индоевропљана. Из досад доступних археогенетичких и савремених узорака, јасно се сагледава образац њеног ширења са Кавказа као матице преко Медитерана до обала Италије и Балкана, при чему скоро да је непостојећа у централној Анадолији, и прије ће бити да је мигрирала морским путем него преко Анадолије. Томе у прилог би ишло и њено присуство у овиру Нурагик културе Сардиније, у којој одсуствује степска индоверопска генетика и индоевропске хаплогрупе. Значи, J2-L283 је у Европу стигла након неолита, прије или истовремено са индоевропским ширењем, али из другог изворишта.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Август 19, 2021, 10:26:26 пре подне
Што се E-V13 тиче она само посредно може бити повезана са сеобама Индоевропљана, као евентуално хаплогрупа која им се нашла на путу или су је успут покупили. Проблем са E-V13 је недостатак археогенетичких налаза из ранијих периода. Ипак, не треба заборавити да су најранији налази коријенске L618 повезани са неолитском приобалном Импресо културом од Шпаније до Балкана. С тим у вези није на одмет поменути и тезу украјаинског археолога Дмитра Гаскевича о постојању Импресо неолитске културе и на тлу данашље Украјине.

Његов рад може да се нађе на сљедећој адреси
https://www.researchgate.net/publication/272651024_A_new_approach_to_the_problem_of_the_Neolithisation_of_the_North-Pontic_area_Is_there_a_north-eastern_kind_of_Mediterranean_Impresso_pottery

А ово је нека врста закључка:

"For all these reasons I have proposed a third hypo-thetical scenario of Neolithisation in the Northern Black  Sea  area  in addition  to the  two available, which  proposes  that  Neolithisation  in  the  region began with a process of demic diffusion consisting of the rapid spread of small Mediterranean seafaring communities along its coastline in the first half orthe middle of the 7th millennium calBC. Their beach-head colonies are probably submerged now. The process of cultural diffusion, when some elements of the ‘Neolithic package’ were adopted by local Mesolithic populations  began  afterwards.  A  possible  consequence of this is the occurrence of the first pottery with decoration using  pin-action and comb  stamp impression techniques, and also the polished stoneartefacts and livestock in inland territories. The evidence of direct contacts of interior groups with their coastal neighbours is the pottery found far from the sea, but made of sand with the remains of brackishwater ostracods, and decorated by marine cockle-shells prints. Simultaneously, the first farmers of the Balkan  region  and the  Carpathian-Danube basin, who were  of Anatolian  origin, migrated overland from the west to the Northern Black Sea area. As a result, the Neolithic of the Dnister and South Buh river basins became syncretic. It combines traits of the early Danubian Neolithic and the Mediterranean Neolithic with Impresso – Cardium pottery (Bug-Dniester culture). In the remaining territory of the North-ern Black Sea area, traditions based on the cultural complex of  the  Mediterranean  maritime  migrants continued to develop.

Питам се да ли је ова претпостављена неолитска обалска црноморска миграција могла бити извориште E-V13 у балканско-карпатском региону и да су се управо они могли наћи на путу и бити захваћени индоевропским продорима у Европу.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Август 19, 2021, 11:01:13 пре подне
Такође треба имати у виду да с обзиром на своју старост, у вријеме експанзије Индовропљана (око 2500 г пне), популација која је носила мутацију V13 није била претјерано бројна.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Август 19, 2021, 12:42:49 поподне
Што се E-V13 тиче она само посредно може бити повезана са сеобама Индоевропљана, као евентуално хаплогрупа која им се нашла на путу или су је успут покупили.

Слажем се.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Август 19, 2021, 06:54:19 поподне
Стиже нови рад:

Reconstructing genetic histories and social organisation in Neolithic and Bronze Age Croatia

https://www.nature.com/articles/s41598-021-94932-9/tables/1


Од 13 мушких скелета, 7 је G2a.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Август 19, 2021, 07:15:37 поподне
Стиже нови рад:

Reconstructing genetic histories and social organisation in Neolithic and Bronze Age Croatia

https://www.nature.com/articles/s41598-021-94932-9/tables/1


Од 13 мушких скелета, 7 је G2a.


Без већих изненађења. Опет одсуство E-V13.

Занимљив је овај R1a-Z93 из римског периода. Најниже је одређен као https://www.yfull.com/tree/R-F1345/ Можда открију нешто још ниже. Аутосомално има прилично велик удио степске генетике.

Било би такође интересантно ако би се могло специфичније одредити POP04 (J хаплогрупа).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Август 19, 2021, 10:34:50 поподне
Занимљив је овај R1a-Z93 из римског периода. Најниже је одређен као https://www.yfull.com/tree/R-F1345/ Можда открију нешто још ниже. Аутосомално има прилично велик удио степске генетике.

 Знам једног Грка поријеклом из Влашке који припада овој грани. Па врло могуће да је сарматска грана.
https://www.yfull.com/tree/R-YP5153/

 Изненађујући резултати у оквиру јужне варијанте Трансданубијске инкрустриране керамике. Не због G2a већ због јако чудног аутозомалног профила ове групе. Међутим баш сам јучер уочио тај профил у необјављеној студији БД Мађарске, панонско-карпатског подручја. И то управо код мађарске варијанте културе Трансданубијске иинкрустриране керамике.

 Висок проценат ловачкосакупљачке генетике (WHG), као и степске генетике. Што је занимљиво у тој необјаљеној студији на истом подручју у Хрватској у раном бронзаном добу се јавља сродна аутозомална генетика са још више WHG елемента.

 Иначе контекст у којем су нађени сви E-V13 узорци Жељезног доба је такав да индицира поријекло од групе Инсула Банулуи са Ђердапа која је у себи имала јаку компоненту Дубовачко-Жутобрдске групе која потиче управо од културе Трансданубијске инкрустриране керамике.

 Мислио сам да је можда нека група из Цетинске културе скончала у овој групи у БД па да се одатле почео углавнм ширити E-V13. Међутим ови резултати оповргавају такво што.

 Друга компонента генезе групе Инсула Банулуи је источна Урнефелдер Гава култура. Може се рећи да се код ње већ јавља једна подграна R1a (што је открио Гуја). Међутим гледајући ове процурене информације из необјављене студије Мађарске, постоји узорак који је E-L539+ по само ISOGG стаблу, овдје су све хаплогрупе базално одређене само су развојени нпр. Z2103 и P312, тако да је то само базална идентификација. Овај узорак је са самог сјевероистока Мађарске или југоистока Словачке и има висок проценат степске генетике. Тешко да је ово неки E-V12, E-V22, E-V65, као и да постоје њихове гране које се могу доводити у такав контекст.. Датиран је око 1100 г. п.н.е. и дакле ранији је од постојећих V13 налаза из ЖД (укључујући необјављену студију Бугарске).

 У раном Бронзаном Добу, око 2000 г. п.н.е. у истој студији негдје у Мађарској или сјеверније можда, пуно теже одредити гдје тачно, јавља се још један E-L539+, са нешто мање степске генетике.
 
 Нисам прије видио ово о присуству Импресо културе у Украјини, свакако да E-L618 показује јаку везу с том групом, а ови резултати говоре у прилог ипак поријејклу од неког остатка Импреса сјевероисточно.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Август 19, 2021, 10:50:42 поподне
Што се гране J2-L283, не вјерујем да она има икакве везе са ширењем Индоевропљана. Из досад доступних археогенетичких и савремених узорака, јасно се сагледава образац њеног ширења са Кавказа као матице преко Медитерана до обала Италије и Балкана, при чему скоро да је непостојећа у централној Анадолији, и прије ће бити да је мигрирала морским путем него преко Анадолије. Томе у прилог би ишло и њено присуство у овиру Нурагик културе Сардиније, у којој одсуствује степска индоверопска генетика и индоевропске хаплогрупе. Значи, J2-L283 је у Европу стигла након неолита, прије или истовремено са индоевропским ширењем, али из другог изворишта.

 Види се велика базална разноврсност код J-YP157, а и сама ова грана има велику старост на Сардинији од 4500-500 година по брону снипова (само 4 на том нивоу) гдје су нурагијски узорци. Затим испод њих на Z585+, Z615- нивоу још једна саринијска грана J-YP113, па NA20763 из Тоскане из неке студије, те нови узорак J-FT289318 опет из Тоскане.

 Балканска експанзија  J-L283 почиње од J-Z597 те узорка Мокринске културе који је Z615+ а Z597-. Иначе је Посушка култура одакле је и I4331 имала и директне утицаје из Мокрина па се тако вјероватно може и објаснити балкански J-L283.

 Но мокрински и сви балкански J-L283 су међусобно ближи једни другима него и једна од ове четири талијанске гране међу собом.

 Фљор који детаљније то истражује је лансирао тезу да је степска група богата са базалним J-L283 мигрирала у Италију, иако ови Нурагијци немају ту компоненту (тј. као имали су некад али се "испрала" до 1200 г п.н.е. што је опет чиста шпекулација). Но тешко се могу довести нурагијски утицаји са Индоевропљанима. Јесте било неких Бел Бикер утицаја прије 4000 г. међутим  J-L283 није пронађена код културе Звонастих пехара.

 Аргумент да се J-L283 јавља на Сардинији само у позном БД, не раније. Међутим и у том случају обзиром да је J-L283 новина у односу на пред-нурагијски период, би се најприје требала везати за носиоце прото-нурагијске културе који нису били Индоевропљани.

 Постоји неки "J" узорак из Бакарног доба Молдавије, за који кажу да би могао бити J2b, међутим и са њим је нејасан долазак J-L283.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Август 19, 2021, 11:35:56 поподне
Друга компонента генезе групе Инсула Банулуи је источна Урнефелдер Гава култура. Може се рећи да се код ње већ јавља једна подграна R1a (што је открио Гуја). Међутим гледајући ове процурене информације из необјављене студије Мађарске, постоји узорак који је E-L539+ по само ISOGG стаблу, овдје су све хаплогрупе базално одређене само су развојени нпр. Z2103 и P312, тако да је то само базална идентификација. Овај узорак је са самог сјевероистока Мађарске или југоистока Словачке и има висок проценат степске генетике. Тешко да је ово неки E-V12, E-V22, E-V65, као и да постоје њихове гране које се могу доводити у такав контекст.. Датиран је око 1100 г. п.н.е. и дакле ранији је од постојећих V13 налаза из ЖД (укључујући необјављену студију Бугарске).

 Дошао сам до још неких информација о аутосомалној генетици овог узорка која се потпуно поклапа са свим овим трачким узорцима жељезног доба који су E-V13. Изгледало ми је да се трачка аутозомална генетика не може увезати са налазима ових постојећих Гава налаза, очито и са генетиком Трансданубијске инкрустриране керамике и то је тачно. Али се идеално уклапа у овај узорак. Дакле ако је овај E-L539+ узорак E-V13 а то је скоро сигурно, индоевропско језгро из којег су изникле све прото-трачке групе је било потпуно доминирано од стране E-V13 са процентима од вјероватно 80%+. Да, чини се да је изгледна веза предака данашњих E-V13 са овим украјинским Импресом. А и постоји онај Трипољски узорак који је неки E-M78, и он може бити од те групе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Август 20, 2021, 04:15:49 поподне
Знам једног Грка поријеклом из Влашке који припада овој грани. Па врло могуће да је сарматска грана.
https://www.yfull.com/tree/R-YP5153/

По локацији и периоду није искључено да узорак припада Јазигима.

Иначе у оквиру F1345 гране се налази и она велика ашкенаска левитска грана R1a-Y2619 https://www.yfull.com/tree/R-Y2619/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Неродимац Август 20, 2021, 10:42:43 поподне
А шта је са овом двојицом I2a шта се о њима зна, коке су подгране?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Август 24, 2021, 06:03:28 пре подне

Да отприлике тако некако.  :)

Само што је присуство E-V13 на Блиском Истоку релевантно исто колико и присуство ове хаплогрупе у Британији. Тј ове области немају везе са главним путевима миграција али могу послужити као један од многих индикатора у сврху препознавања како је до ширења дошло.
Управо баш тако, Блиски Исток, Британија и друге периферне области данашњих E-V13 ( и J2-L283) могу нам указати на разлике у њиховим путањама. Ове две хаплогрупе имају доста сличности: потомци су хаплогрупа E-L618 и J2-M241 које су почетком неолита вероватно живеле на Блиском Истоку, данас претежно живе у Европи, релативно су честе на Балкану, прошириле су скоро у исто време ( TMRCA J2-L283 5300 година, E-V13 4800 година).

Разлике су на периферији: J2-L283 има доста старих подгрупа у Италији, E-V13 на Блиском Истоку ( такође и у Источној Европи). Зато ми изгледа да је почетна тачка ширења J2-L283 била Мала Азија, а почетна тачка ширења E-V13 је морала бити мало северније. У походу ка западу Европе J2-L283 је чинила "лево крило", а E-V13 "десно". Са простора северно од Црног Мора E-V13 је лако могла доспети на Блиски Исток у друштву са R1a-Z93.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Септембар 01, 2021, 07:02:48 пре подне
Ancient DNA news from the Balkans!

With very High E-L539 (E-M78) and E-M35 lineages detected as well.

Viminacium - 28 (labeled Serbia_Roman):
E x 13 (L618 x 6; L618>V13 x 3; Z830 x 1; Z830>M123 x 1; Z1902 x 1; M96 x 1)
G x 5 (PF3148 x 1; PF3148>L91 x 1; P303 x 1; L497 x 1; L497>Z1815 x 1)
R1b x 3 (Z2103 x 1; U106 x 1; U152>L2>Z367 x 1)
R1a x 2 (Z2124>Z2122 x 1; Z2124>Z2123 x 1)
J x 2 (M304 x 1; L24 x 1)
T x 1 (M184)
I1 x 1 (M253)
I2 x 1 (L596)

Timacum Minus, Slog necropolis - 10 (labeled Serbia_Roman):
E x 3 (M35 x 1; L618 x 1; L618>V13 x 1)
J x 3 (M304 x 1; M410 x 1; M241 x 1)
R1b x 2 (Z2103 x 1; Z2103>CTS1450 x 1)
G x 1 (CTS342>FGC12126)
I1 x 1 (Z58>CTS8647)

Timacum Minus, Kuline necropolis - 5 (labeled Serbia_Early_Middle_Age):
I2 x 2 (M423 x 2)
E x 1 (L618)
J x 1 (M304)
R1b x 1 (P312>DF99)

Lepenski Vir - 2:
E x 1 (M35) - Serbia_Roman
J x 1 (M102) - Serbia_Medieval

Mediana - 2 (labeled Serbia_Gepid):
G x 1 (P287)
I1 x 1 (Z58>CTS8647)

Gomolava - 1 (labeled Serbia_Medieval):
I2 x 1 (M423>L621>CTS4002)

Cosmopolitanism at the Roman Danubian Frontier, Slavic Migrations, and the Genomic Formation of Modern Balkan Peoples
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.08.30.458211v1
Цитат
Abstract

The Roman Empire expanded through the Mediterranean shores and brought human mobility and cosmopolitanism across this inland sea to an unprecedented scale. However, if this was also common at the Empire frontiers remains undetermined. The Balkans and Danube River were of strategic importance for the Romans acting as an East-West connection and as a defense line against "barbarian" tribes. We generated genome-wide data from 70 ancient individuals from present-day Serbia dated to the first millennium CE; including Viminacium, capital of Moesia Superior province. Our analyses reveal large scale-movements from Anatolia during Imperial rule, similar to the pattern observed in Rome, and cases of individual mobility from as far as East Africa. Between ca 250-500 CE, we detect gene-flow from Central/Northern Europe harboring admixtures of Iron Age steppe groups. Tenth-century CE individuals harbored North-Eastern European-related ancestry likely associated to Slavic-speakers, which contributed >20% of the ancestry of today's Balkan people.
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.08.30.458211v1.full.pdf
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.08.30.458211v1.supplementary-material
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2021/08/31/2021.08.30.458211/DC1/embed/media-1.docx?download=true
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2021/08/31/2021.08.30.458211/DC2/embed/media-2.xlsx?download=true
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2021/08/31/2021.08.30.458211/DC3/embed/media-3.xlsx?download=true
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2021/08/31/2021.08.30.458211/DC4/embed/media-4.xlsx?download=true
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 01, 2021, 11:16:41 пре подне
Cosmopolitanism at the Roman Danubian Frontier, Slavic Migrations, and the Genomic Formation of Modern Balkan Peoples

Коначно да и овај рад угледа свјетло дана, додуше у препринту.

Кључни закључци рада везани и за поријекло данашњег становништва.

"The remaining five individuals clustered in the West-Eurasian PCA (Figure 1C) on top of the “present-day Balkan genetic cline”, close to present-day Serbian speaking individuals that we newly genotyped for this study, but this apparent similarity is a projection artifact as their ancestry could not be fitted using the same qpAdm models (Supplementary section 12.). To understand this, we performed a PCA using present-day Germanic- and Slavic-speaking populations (Supplementary section 9; Figure S9) that we expected would be sensitive to more recent drift separating Central, Northern and Eastern European populations. The Kuline individuals are more shifted towards present-day Slavic speaking populations as compared to individuals in the Central/Northern European cluster, agreeing with the presence of Y-chromosome lineage I2-L621 in Kuline, which is common in present-day Slavic-speaking groups and absent in earlier periods. In light of these results, we modeled the ancestry of the Kuline individuals as a mixture of 56% deriving from the local Balkan Iron Age substratum and 44% deriving from Northeastern European Iron Age groups, and obtained a good statistical fit (Figure 2; Supplementary section 12.). Our results point to a strong demographic impact of Eastern European groups in the Balkans during the Medieval period, likely associated to the arrival of Slavic-speaking populations. Yet, our results rule out a complete demographic replacement, as we observe a significant portion of local Iron Age Balkan ancestry in Kuline individuals."

"Our study shows that the Iron Age native Balkan populations were not completely replaced with the arrival of Slavic migrations. These later events generated a cline of populations with relatively similar genetic profiles, yet, three unrelated language groups (Hungarian, Romanian and Southern Slavic) are spoken today in the Central-Northern Balkans area."
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ojler Септембар 01, 2021, 11:39:35 пре подне
Коначно да и овај рад угледа свјетло дана, додуше у препринту.

Кључни закључци рада везани и за поријекло данашњег становништва.

"The remaining five individuals clustered in the West-Eurasian PCA (Figure 1C) on top of the “present-day Balkan genetic cline”, close to present-day Serbian speaking individuals that we newly genotyped for this study, but this apparent similarity is a projection artifact as their ancestry could not be fitted using the same qpAdm models (Supplementary section 12.). To understand this, we performed a PCA using present-day Germanic- and Slavic-speaking populations (Supplementary section 9; Figure S9) that we expected would be sensitive to more recent drift separating Central, Northern and Eastern European populations. The Kuline individuals are more shifted towards present-day Slavic speaking populations as compared to individuals in the Central/Northern European cluster, agreeing with the presence of Y-chromosome lineage I2-L621 in Kuline, which is common in present-day Slavic-speaking groups and absent in earlier periods. In light of these results, we modeled the ancestry of the Kuline individuals as a mixture of 56% deriving from the local Balkan Iron Age substratum and 44% deriving from Northeastern European Iron Age groups, and obtained a good statistical fit (Figure 2; Supplementary section 12.). Our results point to a strong demographic impact of Eastern European groups in the Balkans during the Medieval period, likely associated to the arrival of Slavic-speaking populations. Yet, our results rule out a complete demographic replacement, as we observe a significant portion of local Iron Age Balkan ancestry in Kuline individuals."

"Our study shows that the Iron Age native Balkan populations were not completely replaced with the arrival of Slavic migrations. These later events generated a cline of populations with relatively similar genetic profiles, yet, three unrelated language groups (Hungarian, Romanian and Southern Slavic) are spoken today in the Central-Northern Balkans area."

Да ли је то ово истраживање?

Ево само укратко о поменутим I2 налазима из Timacum Minus-a. Тачно је да су два узорка са некрополе Кулине означена као I2a1b, што би, према старој ISOGG номенклатури која је коришћена, требало означавати M423, која је између осталог предачка и за грану Y3120. Међутим, не ради се ни о каквом првом веку, већ су ти узорци на основу археолошког материјала датирани оквирно у период раног средњег века (400-700 н.е.), а и сами аутори рада су их груписали као Serbia_Early_Middle_Age_Slavic_possible, тако да би и било очекивано да су Y3120.

Иначе, недавно смо сазнали и званичан назив овог археогенетичког рада, па је врло могуће да ће бити објављен до краја године:

Olalde Iñigo et al.: Human mobility at the Roman Danubian Limes before and after the fall of the Empire
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 01, 2021, 11:42:02 пре подне
Да ли је то ово истраживање?

Требало би бити.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 01, 2021, 11:59:37 пре подне
Интересантно је генетичко шаренило становника ових простора у периоду Рима и сеоба народа. Можда је то посљедица тога што је највећи број узорака из Виминацијума, а то је ипак био већи град. Сахрањени легионар по свој прилици из Нубије, који припада хаплогрупи E-V12>V32, и аутосомално је мање више чист Африканац.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ojler Септембар 01, 2021, 12:09:15 поподне
Требало би бити.

Штета што није утврђена млађа грана којој припадају ови I2-L621 узорци. Ако се локалитет Кулине датира оквирно у период 400-700 година н.е, у питању су вероватно рани представници I-Y3120 на Балкану.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 01, 2021, 12:13:45 поподне
Штета што није утврђена млађа грана којој припадају ови I2-L621 узорци. Ако се локалитет Кулине датира оквирно у период 400-700 година н.е, у питању су вероватно рани представници I-Y3120 на Балкану.

Ови узорци из Кулина су датирани у 10. вијек (897-1021 cal CE (1075±15 BP, PSUAMS-8555). Њихова аутосомална генетика показује да је већ било значајног мијешања са локалном популацијом. А слажем се да би би било корисно знати ниже гране, можда би се могла претпоставити и хаплогрупа словенског племена Тимочана.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 01, 2021, 12:23:02 поподне
Оно што се може видјети из аутосомалних мапа јесте да најстарији слој балканског становништва (Balkan Iron Age cluster како су га означили) није опстао до данас у чистој форми. Чак и Албанци и Грци који су сачували највише те генетике имају словенски уплив који их издваја од тог првобитног кластера. Неке од најмлађих грана тог слоја већ представљене у раду су: E-V13>CTS9320, R1b-U152>L2>L20, J2b-M241>Z1043, G2a-PF3148, G2a-L140>FGC12126, R1b-Z2103.

И ово би углавном требао бити профил мезијско-трачког становништва, што показује блискост и са аутосомланим профилом Iron Age Bulgaria из ранијих радова.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ojler Септембар 01, 2021, 12:38:38 поподне
Ови узорци из Кулина су датирани у 10. вијек (897-1021 cal CE (1075±15 BP, PSUAMS-8555). Њихова аутосомална генетика показује да је већ било значајног мијешања са локалном популацијом. А слажем се да би би било корисно знати ниже гране, можда би се могла претпоставити и хаплогрупа словенског племена Тимочана.

Сад сам и ја видео да је у питању 10. век, а и да су потврђени као I-Y3120.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 01, 2021, 12:40:46 поподне
Такође, занимљиво је да су међу словенско-балканским мјешанцима у Кулинама, пронађена два близанца, која уопште немају словенски уплив нити су генетички блиски Balkans Iron age кластеру. Припадају грани https://www.yfull.com/tree/R-DF99/ и аутосомално генетички имају блискост на подручју југозападне Европе (Иберије).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 01, 2021, 12:41:24 поподне
Сад сам и ја видео да је у питању 10. век, а и да су потврђени као I-Y3120.

I-Y3120 мени лично није довољно, могло би то ниже.  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 01, 2021, 01:12:09 поподне
Још један битан закључак рада везан је и за коегзистенцију двије групе становништва током период Рима на тлу источне Србије. Једну домицилну (горе поменути Balkans Iron Age cluster) и другу досељену, римску, космполитску популацију. Ова друга група са јасним генетичким источномедитеранским и блискоисточним везама, није оставила значајнијег наслеђа данашњем становништву Србије. То је по свему судећи било градско, римско становништво Виминацијума и других градова. Они су се највише и нашли на удару Хуна, Германа и касније Авара и Словена. Неки су страдали, а неки се раселили. Домаће балканско становништво (као махом рурално) лакше је поднијело те ударе.

Аутосомално је то становништво било најближе данашњим Кипранима, Крићанима, острвским Грцима.

Судећи по раду, код њих су нађене сљедеће хаплогрупе: J1-BY94, T-L131, E-M123>L791, J2a-L70, G2a-L91>Y140827, I2-L596>Y16419, E-V13
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Септембар 01, 2021, 01:15:41 поподне
Да ли ће можда у пуној верзији рада бити представљене ниже подгране од ових утврђених, или ће то успети да одраде неки "слободни стрелци" као у ранијим радовима овог типа?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 01, 2021, 01:17:48 поподне
Да ли ће можда у пуној верзији рада бити представљене ниже подгране од ових утврђених, или ће то успети да одраде неки "слободни стрелци" као у ранијим радовима овог типа?

Мислим да у самом раду неће бити ништа мијењано, али надам се да ће бити доступни сирови резултати и да ће још понешто моћи "исциједити".
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Be like Bill Септембар 01, 2021, 01:22:37 поподне
Да ли ће можда у пуној верзији рада бити представљене ниже подгране од ових утврђених, или ће то успети да одраде неки "слободни стрелци" као у ранијим радовима овог типа?

Taman sam i ja ovo hteo da pitam. :) Inače čestitam našim ZS3128 pošto je BY94 (drugo ime i L1189) predački SNP za njih. Pokušao sam naći nešto više informacija u radu o tom haplotipu ali nisam uspeo. Da li ima nešto više informacija o njihovom autosomalnom rezultatu i zagrobnim poklonima?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 01, 2021, 01:31:41 поподне
Taman sam i ja ovo hteo da pitam. :) Inače čestitam našim ZS3128 pošto je BY94 (drugo ime i L1189) predački SNP za njih. Pokušao sam naći nešto više informacija u radu o tom haplotipu ali nisam uspeo. Da li ima nešto više informacija o njihovom autosomalnom rezultatu i zagrobnim poklonima?

Овај узорак је сахрањен у дрвеном сандуку. Гробница под шифром G-3082.

2.1.1 Pećine necropolis:

The necropolis of Pećine is the largest on Viminacium and archaeological research on it is still ongoing. So far, over 6,000 graves from the prehistoric periods (including a Celtic cemetery) to the Middle Ages have been found. For this project we selected samples from cemeteries were archeologically dated to the 1st to 4th century CE. All the de-ceased can be classified as having had a modest type of burial, so they are attributed to the rather poorer citizens of Viminacium. Archaeological finds are also modest. Graves 5757 and 5762 (not sampled for ancient DNA) can be classified according to the find-ing of coins in the period of the fourth decade of the 4th century CE, and according to the west-east and east-west orientation they might be early Christians. This agrees well with two radiocarbon dates from G-5665 (258-413 cal CE (1700±20 BP, PSUAMS-8554));  and G-5736 (246-365 cal CE (1745±15 BP, PSUAMS-8591)). Another radio-carbon date from G-2771 (70-208 cal CE (1910±20 BP, PSUAMS-8553)) yielded an earlier date within the 2nd century CE, implying a long-term use of the necropolis (Table ST1; Additional Table 1). Burial practices are typical of the Roman period at Vimi-nacium (grave with no construction, deceased in wooden coffin or graves with brick construction with the seal of the legion).

Sampled Graves:
Freely buried deceased: G-5665 (S-N), G-5703 (N-S), G-5736 (E-W), G-2771 (W-E), G-4661 (Burial in prehistoric pit, S-N), G-5924 (NW-SE), G-5769 (NW-SE).
Deceased in a wooden coffin: G-5752 (E-W), G-3082 (SE-NW), G-3053 (NE-SW).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Септембар 01, 2021, 01:46:00 поподне
Између осталог, рад значајан из два разлога:

1. срушен мит да су Словени населили "пуст Балкан". Мада се то више односи на западне делове Балкана, тј провинцију Далмацију.

2. није тачна тврња да није било мешања Словена и староседелачког становништва пре 14, 15. века. Многи су изводили такав закључак на основу оне реченице из законика, где се наводи да се Срби не мешају у Влахе и обрнуто. Очигледно је да се мисли на статус.

Судећи по још неким старим налазима (Далмација, Албанија), изгледа да је J2b2-M241 била раније заступљенија на простору Балкана (ако ништа, равномерније распоређена).

Нисам проверавао аутосомалну за узорак J2a-Z6055>Y7010 Serbia_Slavic, али то би лако могла бити она дробњачка J2a-Y14439. Падало ми је на памет да би та и још неке друге J2 подгране, могле бити, условно речено, словенског порекла. Тј. да су дошле у тој миграцији.

Још један битан закључак рада везан је и за коегзистенцију двије групе становништва током период Рима на тлу источне Србије. Једну домицилну (горе поменути Balkans Iron Age cluster) и другу досељену, римску, космполитску популацију. Ова друга група са јасним генетичким источномедитеранским и блискоисточним везама, није оставила значајнијег наслеђа данашњем становништву Србије. То је по свему судећи било градско, римско становништво Виминацијума и других градова. Они су се највише и нашли на удару Хуна, Германа и касније Авара и Словена. Неки су страдали, а неки се раселили. Домаће балканско становништво (као махом рурално) лакше је поднијело те ударе.

Аутосомално је то становништво било најближе данашњим Кипранима, Крићанима, острвским Грцима.

Судећи по раду, код њих су нађене сљедеће хаплогрупе: J1-BY94, T-L131, E-M123>L791, J2a-L70, G2a-L91>Y140827, I2-L596>Y16419, E-V13

С обзиром на даље порекло и миграције, очекивао бих у овој групи J-M205. Проблем је што се ова хаплогрупа, на основу распореда и бројности, никако не уклапа у то градско становништво. Много више у рурално. :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ojler Септембар 01, 2021, 01:53:52 поподне
I-Y3120 мени лично није довољно, могло би то ниже.  :)

Имамо међу ауторима рада и нама познатих имена, па се можда може доћи до неких инсајдерских информација. Али ја типујем на нас "Бугараше", Z17855 :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 01, 2021, 01:56:28 поподне
Имамо међу ауторима рада и нама познатих имена, па се можда може доћи до неких инсајдерских информација. Али ја типујем на нас "Бугараше", Z17855 :)

Не знам, има и PH908 међу Бугарима прилично и то разноврсне.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 01, 2021, 02:00:21 поподне
Аутори рада су израдили једну занимљиву мапу која показује удјеле словенске аутосомалне генетике (Northeastern European-related ancestry) у савременим балканским популацијама, тамни дио круга, као и у раносредњовјековном узорку из Кулине (оивчено црвеним).

Figure 3. Proportions of Northeastern European-related ancestry (in black) for present day Balkans populations. 10th century CE Kuline individuals are indicated with a red
outline.

(https://i.postimg.cc/sgD9Ckxz/slavs-viminacium.png)

Као што се може видјети све је то прилично блиско и неким ранијим нашим претпоставкама. Мађари и Румуни имају чак више словенског удјела од Срба и Бугара.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Be like Bill Септембар 01, 2021, 02:36:23 поподне
Овај узорак је сахрањен у дрвеном сандуку. Гробница под шифром G-3082.

2.1.1 Pećine necropolis:

The necropolis of Pećine is the largest on Viminacium and archaeological research on it is still ongoing. So far, over 6,000 graves from the prehistoric periods (including a Celtic cemetery) to the Middle Ages have been found. For this project we selected samples from cemeteries were archeologically dated to the 1st to 4th century CE. All the de-ceased can be classified as having had a modest type of burial, so they are attributed to the rather poorer citizens of Viminacium. Archaeological finds are also modest. Graves 5757 and 5762 (not sampled for ancient DNA) can be classified according to the find-ing of coins in the period of the fourth decade of the 4th century CE, and according to the west-east and east-west orientation they might be early Christians. This agrees well with two radiocarbon dates from G-5665 (258-413 cal CE (1700±20 BP, PSUAMS-8554));  and G-5736 (246-365 cal CE (1745±15 BP, PSUAMS-8591)). Another radio-carbon date from G-2771 (70-208 cal CE (1910±20 BP, PSUAMS-8553)) yielded an earlier date within the 2nd century CE, implying a long-term use of the necropolis (Table ST1; Additional Table 1). Burial practices are typical of the Roman period at Vimi-nacium (grave with no construction, deceased in wooden coffin or graves with brick construction with the seal of the legion).

Sampled Graves:
Freely buried deceased: G-5665 (S-N), G-5703 (N-S), G-5736 (E-W), G-2771 (W-E), G-4661 (Burial in prehistoric pit, S-N), G-5924 (NW-SE), G-5769 (NW-SE).
Deceased in a wooden coffin: G-5752 (E-W), G-3082 (SE-NW), G-3053 (NE-SW).

Buni me što je je klasifikovana kao NE cluster. To bi bio Bliski istok (Near East) klaster. Nisam mislio da bi ta grana dolazila odatle.

Našao sam nešto u knjizi Antropološka kolekcija Viminacium I- Nekropola Pećine, autori Korać i Mikić. Zanimljivo je da su prema antropološkoj analizi ostaci u tom grobu određeni kao ženski

Цитат
Grob br. 3082 je pronađen u sondi 336, na dubini
250 cm. Tehnički je zabeležen na skici 1097 i opisan
na stranama dnevnika 2303 i 2304. Konkretno, radi
se o sahrani u drvenom kovčegu, čije su dimenzije
168 х 46 cm, dok su dimenzije ukopa 170 х 60 х 27
cm. Od kovčega su očuvane spoljne konture, kao
daska na koju je bio položen pokojnik u ispruženom stavu. Lobanja je licem bila okrenuta prema
istoku. Desna ruka je ispružena pored tela, a leva je
savijena u laktu i položena na stomak. Orijentacija
skeleta se prostire po pravcu jugoistok - severozapad, sa odstupanjem 10° jugoistočnim delom prema jugu. Mada je ovaj skelet, uključujući i lobanju,
dobro očuvan, konstatovano je da tzv. sitne kosti
šaka i stopala nedostaju. Posledica toga je i izmerena dužina in situ 145 cm.
Ovaj grob se nalazi severno od G-3052 i potkolenim delom zalazi pod G-3062. U delu između kolena prilikom arheoloških iskopavanja pronađen
je crveno pečeni žižak sa rozetom na disku. To je
ujedno bio i jedini grobni prilog.
* * *
Lobanja br. 3082 je delimično oštećena na desnoj
strani, na kojoj je i ležala u grobu, što je uticalo i na
broj antropoloških mera. Moglo je biti dobijeno 11
sledećih lobanjskih mera:
najveća dužina lobanje 182 mm
najveća širina lobanje 135
minimalna širina čela 93
visina porion – bregma 111
bizigomatična širina 122
visina gornjeg lica 59
visina očne duplje 33
širina očne duplje 36
širina nosnog otvora 24
nazalna visina 43
širina donje vilice 90 mm
Iz dobijenih mera izračunati dužinsko - širinski indeks 74,18 pokazuje da se radi o lobanji dolihokrane kategorije, sasvim blizu prelazu u mezokraniju.
U njenoj morfostrukturi dominira dužina i nisko zasvođena kurvookcipitalija.
Svi polno-morfološki elementi ukazuju na ženu,
kod koje su feminini znaci sasvim jasno izraženi.

Njena individualna starost nije prelazila 30 godina
života.
Zubni nalaz je uredan, ukoliko izuzmemo gubitak
posebno frontalnih zuba tokom kasnijih manipulacija.

http://viminacium.org.rs/wp-content/uploads/files/pdf/Antropoloska_kolekcija_Viminacium_I-web.pdf

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 01, 2021, 02:41:38 поподне
Buni me što je je klasifikovana kao NE cluster. To bi bio Bliski istok (Near East) klaster. Nisam mislio da bi ta grana dolazila odatle.

Они су то означили као Near East, али чини ми се да је ту било свега. Више је то Источномедитерански кластер.

Ево њиховог описа те групе:
"The other major cluster (44% of the samples from Viminacium between 1-250 CE) is
represented by individuals who projected towards ancient and present-day Eastern
Mediterranean groups in PCA (Figure 1A), close to ancient individuals from Rome during
Imperial times 3. Their ancestry can be modelled as deriving deeply from Chalcolithic Western
Anatolian groups (Figure 2; Supplementary section 12.2), and we refer to this cluster as the
Near Eastern-related cluster. The same signal of arrivals individuals with Anatolian/Near
Eastern ancestral origins is also evident in Rome during the same period 3
, consistent with largescale gene-flow originating from the major eastern urban centers of the Empire (such as
Constantinople, Antioch, Smyrna and Alexandria). These results suggest that immigration from
the east was a common feature across urban centers in the Roman Empire, including in border
areas and large cities/military outposts such as Viminacium. Individuals with Eastern
Mediterranean ancestry could have high social status: 3 out of the 4 individuals buried in two
sarcophagi (each containing a male-female pair) with exceptionally rich grave goods at the Rit
necropolis in Viminacium belonged to the Near Eastern-related cluster, while the remaining
one belonged to the Balkans Iron Age-related cluster. This kind of burial was common in the
Eastern Roman settlements for aristocratic members of society 20. Individuals from this cluster
were also more likely to be inhumated in a wooden coffin rather than freely buried, which could
also be an indication of higher social prestige.


У суштини дрвени сандук је ипак значио нешто виши статус.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 01, 2021, 02:57:54 поподне
Иначе, видим да су неки од ових узорака из Виминацијума раније антрополошки реконструисани.

(https://scontent.fbeg5-1.fna.fbcdn.net/v/t1.6435-9/120073276_2648128098832266_742797443291285323_n.jpg?_nc_cat=111&ccb=1-5&_nc_sid=9267fe&_nc_ohc=shmINhP7V9QAX8RFppf&_nc_ht=scontent.fbeg5-1.fna&oh=bbb80d2ae812fbe573edad399d5d6df6&oe=61556017)

Нађох описе на сљедећој страници
https://www.facebook.com/archeoserbia/photos/reconstruction-of-faces-of-some-anthropological-types-of-the-citizens-of-ancient/2648128095498933/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Mr. J Септембар 01, 2021, 06:15:50 поподне
Између осталог, рад значајан из два разлога:

1. срушен мит да су Словени населили "пуст Балкан". Мада се то више односи на западне делове Балкана, тј провинцију Далмацију.

2. није тачна тврња да није било мешања Словена и староседелачког становништва пре 14, 15. века. Многи су изводили такав закључак на основу оне реченице из законика, где се наводи да се Срби не мешају у Влахе и обрнуто. Очигледно је да се мисли на статус.

Судећи по још неким старим налазима (Далмација, Албанија), изгледа да је J2b2-M241 била раније заступљенија на простору Балкана (ако ништа, равномерније распоређена).

Нисам проверавао аутосомалну за узорак J2a-Z6055>Y7010 Serbia_Slavic, али то би лако могла бити она дробњачка J2a-Y14439. Падало ми је на памет да би та и још неке друге J2 подгране, могле бити, условно речено, словенског порекла. Тј. да су дошле у тој миграцији.

С обзиром на даље порекло и миграције, очекивао бих у овој групи J-M205. Проблем је што се ова хаплогрупа, на основу распореда и бројности, никако не уклапа у то градско становништво. Много више у рурално. :)

Moguće je da je neki J2a mogao doći sa slovenskim seobama, mada mislim da je verovatnije da je predak po očevoj liniji
J2a-Z6055> I7010 Srbija_Slavički uzorak iz Kulina potiče od starosedelaca iz balkanskog gvozdenog doba ili čak rimskog vojnika. J2a-Z6055 nađen je u dva neolitska uzorka iz sopotske kulture u Hrvatskoj, kao i u neolitskom i bakarnom dobu Italije.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Септембар 01, 2021, 06:19:43 поподне
Уколико је онај узорак који је окачио Имоћанин релевантан, онда је реч углавном о Србима из Србије и Црне Горе.  овакве аутосомалне слике.
У Supplementary Table 2 се може видети да је реч о узорцима из базе Српског ДНК пројекта. ;) Е сад, не знам да ли су сви тестирани ''чистог'' обласног порекла.

(https://i.imgur.com/iDU34pl.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 01, 2021, 07:12:04 поподне
Иначе, узорци из овог рада су добар показатељ за становништво централне и источне балканске зоне (онај дио који се углавном везује за трачке народе). Било би добро имати овакав пресјек и за дословенско становништва са простора римске провинције Далмације, односно из илирске зоне. А поготово би било интересантно видјети да ли је било каквих разлика између трачке и илирске зоне, аутосомалних нпр.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Септембар 01, 2021, 08:18:12 поподне
Иначе, узорци из овог рада су добар показатељ за становништво централне и источне балканске зоне (онај дио који се углавном везује за трачке народе). Било би добро имати овакав пресјек и за дословенско становништва са простора римске провинције Далмације, односно из илирске зоне. А поготово би било интересантно видјети да ли је било каквих разлика између трачке и илирске зоне, аутосомалних нпр.

 Постоји узорак жељезног доба који је сличан аутосомално бронзанодобским узорцима Посушке културе. Тако да је на западу изгледа постојао континуитет.

 А видимо и у овом узорку два узорка се приближавају њима. Већина је с друге стране око узорка жељезног доба из Бугарске, очекивано.

 Обзиром да по епиграфским показатељима јесте било и досељавања неких Илира са запада, иако их је било мање од Трачана, неки од ових узорака би се могли уклопити и у недавне доласке.

 Постоје значајне разлике између илирских и трачких узорака. Генерално трачки узорак је доста сличнији Микенцима него Илирима. Трачки ареал карактерише присуство анадолијско-кавкаске компоненте и одсуство WHG, уз нижи степски елемент. Код узорака Скита из Молдавије, који су и по неким археолошким доказима гетског поријекла, постоји слична тенденција с тим да имају више степске компоненте од узорка из Бугарске.

 Колико видим у студији, унутар Iron Age Balkans кластера E-V13 узорци су сви заједно и сви су у крајности тог кластера, насупрот J-L283 узорцима који су исто блиски међусобно а ближи су централноевропском кластеру, а на том крају кластера је и R-L20 узорак. Изгледа да су E-V13 узорци генерално око узорка из Бугарске, а J-L283 би могли бити ови који нањигу Илирима ж.д. у ком случају би могли бити и недавни досељеници са запада. Ту је и R-L20 узорак који нагиње непубликованим узорцима жељезног доба из Словеније (Панон ?).

 То би само даље ишло у прилог томе да је аутозомалне разлике пратила и оштра подвојеност по хаплогрупама, да је трачко подручје изразито E-V13, док је илирско J-L283. У том смислу сигурно и да је већина "западнобалканских" E-V13 источнијег поријекла.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Септембар 01, 2021, 10:22:10 поподне
Између осталог, рад значајан из два разлога:

1. срушен мит да су Словени населили "пуст Балкан". Мада се то више односи на западне делове Балкана, тј провинцију Далмацију.
2. није тачна тврња да није било мешања Словена и староседелачког становништва пре 14, 15. века. Многи су изводили такав закључак на основу оне реченице из законика, где се наводи да се Срби не мешају у Влахе и обрнуто. Очигледно је да се мисли на статус.

Судећи по још неким старим налазима (Далмација, Албанија), изгледа да је J2b2-M241 била раније заступљенија на простору Балкана (ако ништа, равномерније распоређена).

Нисам проверавао аутосомалну за узорак J2a-Z6055>Y7010 Serbia_Slavic, али то би лако могла бити она дробњачка J2a-Y14439. Падало ми је на памет да би та и још неке друге J2 подгране, могле бити, условно речено, словенског порекла. Тј. да су дошле у тој миграцији.

Ови узорци из Кулина су датирани у 10. вијек (897-1021 cal CE (1075±15 BP, PSUAMS-8555). Њихова аутосомална генетика показује да је већ било значајног мијешања са локалном популацијом. А слажем се да би би било корисно знати ниже гране, можда би се могла претпоставити и хаплогрупа словенског племена Тимочана.

Пропустих и ово као значајно откриће. ;) Један у низу доказа да је I2-Y3120, готово сигурно, дошла са Словенима. Уколико ово указује на потенцијалну (доминантну) хаплогрупу старих Тимочана, утолико значајније.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Септембар 01, 2021, 11:59:19 поподне
 Но иако је E-V13 код трачких група била доминантна хг. Долазећа студија Паноније, доноси два узорка која сам већ спомињао. E-L539 у процуреним информацијама, практично сигурно су E-V13. један је са границе Мађарске и Словачке из источне варијанте културе Гава-Голиград. Та група се доста разликује од стандардних узорака Културе Поља са Жарама па и западне Гава групе, јер нема WHG компоненту.

 Други узорак, који је старији и занимљивији, око 4000 г. стар. Дошавши до свих археолошких локација из студије и методом елиминације, сам утврдио да се највјероватније ради о узорку из културе Њиршег која је била присутна у СИ Мађарској, СЗ Румунији, ЈИ Словачкој.. Ако није онда само култура Ђулаваршанд тј. Отомани.

 Иначе у тој студији су узорци подгрупе Винковци, позни Вучедол. Узорци са Љубљанског барја, Љубљанска култура. Узорци вучедолске подгрупе Зок.

 У Зок групи је Q1b или I-L699 са доста степске компоненте. Викновачка група носи аутозомалну генетику сличну узорцима из мало каснијег периода из јужне културе Инкрустриране керамике. Тешко се по томе уклапа у овај E1b1b1a налаз иако по датацији су слични.

 Затим узорци Тумулус културе из Мађарске који су углавном R-L51.

 Генерално у Мађарској је доминирала генетика са израженом WHG компонентом, и посебно хг. I2a1, Кишапоштаг, култура Инкрустриране керамике. Осим изгледа на самом истоку гдје је било пуно мање WHG.

 Занимљиво да ови E1b1b1a узорци прилично одударају од Трачана жељезног доба, и Илира. Имају доста више степске компоненте. Ако је овако изгледала Њиршег група (пола-пола микс неолитско-степски), Отомани култура је чини се имала доста јужнију генетику која сличи балканској у жељезном добу, могуће да су на путу E-V13 покупили доста те генетике.

 Иначе је и Њиршег група један поствучедолски изданак. Међутим из налаза свих вучедослких група не изгледа да је то била генетски компактна култура. Постојало је средиште са већом степском компонентом, Зок, Бели Манастир кој ису и близу. Винковачка и Мако група су биле генетиски доста различите од тога. Љубљанска култура изгледно носи R-Z2103 али и више неолитске аутосомалне компоненте. Генерално врло тешко је увезати Њиршег групу са ранијим тезама о V13 и Цетинској култури, тако да сам одустао од тога по први пут.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Септембар 17, 2021, 06:34:06 пре подне
Рад о генетици Скита:
https://advances.sciencemag.org/content/7/13/eabe4414 .
Чекајући .бам фајлове ово је преглед хаплогрупа, 72 узорка:

AIG005.A0101   R1(R-P234,R-M173)
ALN001.A0101   Q1a1a1(Q-M265,Q-M120)
ALN002.A0101   R1a(R-L62,R-M420)
ALN003.A0101   Q1a2a1c(Q-L330)
ALN005.A0101   R1a1a1b2a(R-Z94)
ALN008.A0101   E1b1b1b2a(E-M123)
ALN004.A0101   R1b1a2(R-PF6475,R-M269)
BGD004.A0101   NO(NO-M2313)
BIY006.A0101   CT(CT-M5812,CT-M168)
BIY011.A0101   R1(R-P225,R-M173)
BSB004.A0101   CT(CT-M5715,CT-M168)
CHK004.A0101   J2a(J-L212,J-M410)
HUN001.merged   R1a1a1b (R-Z645)
KRY001.A0101   R1a1a1b2a  (R-Z94)
KKB001.A0101   J2a (J-L212; J-M410)
KKB002.A0101   R1a1a1b2 (R-Z93)
KLK002.A0101   C2b1c(C-F1918)
KNT004.A0101   D1b2a  (D-Z17175;  D-CTS220)
KNT005.A0101   L1a2  (L-M357)
KOK001.A0101   Q1b1b1(Q-FGC4872,Q-Y2990)
KNT001.A0101   E1b1b1a1b1a  (E-V13)
KNT003.A0101   J2a1h2  (J-L25)
KBO001.A0101   Q1a2a1(Q-L54)
BDY003.B0101   R1a1a(R-L449,R-M512)
KSH003.A0101   R1a1a1b2 (R-Z93)
MMR001.A0101   J(J-CTS852,J-M304)
BRE005.A0101   Q1a2a1c  (Q-L334; Q-L330)
BRE002.A0101   Q1a2a1c  (Q-L330)
CSP001.A0101   Q1a(Q-M1088,Q-L472)
KEN001.A0101   J2a(J-L212,J-M410)
KEN003.A0101   R1a1a1b(R-Z647,R-Z645)
CSP003.A0101   L(L-PF5747,L-M20)
CSP004.A0101   R1a1a(R-M512)
BGD002.A0101   R1a(R-L62,R-M420)
BIY001.A0101   NO(NO-F549,NO-M2313)
BIY002.A0101   Q1a2a(Q-L475,Q-L53)
BIY003.A0101   N1c1(N-L395,N-M46)
BIY005.A0101   F(F-P14,F-M89)
BIY007.A0101   G(G-M3509.1,G-M201)
BIY008.A0101   N1c1a1a(N-L392)
BIY009.A0101   N1c1a1a2(N-CTS10082,N-Z1936)
BIY010.A0101   Q1a(Q-M1155,Q-L472)
BIY012.A0101   CT(CT-M5603,CT-M168)
KOK002.A0101   CF(CF-M3690,CF-P143)
SHD001.A0101   Q1a2a(Q-L53)
SMV001.A0101   N1c1a(N-P298,N-M178)
SMV002.A0101   G(G-M3544,G-M201)
AIG001.A0101   P1(P-P243,P-M45)
AIG002.A0101   R1(R-P238,R-M173)
AIG006.A0101   R1a(R-L63,R-M420)
BSB001.A0101   R1a1a(R-M198,R-M512)
CLK001.A0101   R1a1a1(R-Page7,R-M417)
KBU003.A0101   R1a1a1(R-M417)
SHD002.A0101   BT(BT-M9267,BT-M42)
TAL003.A0101   R1a1a1b2  (R-Z93)
TAL005.A0101   C2b  (C-L1373)
AKB001.A0101   R1a1a1b (R-Z645)
BKT001.A0101   R1a1a1b2a (R-Z94)
ESZ001.A0101   R1a1a1  (R-M417)
KKM001.A0101   R1a1a1b (R-Z645)
KSH001.A0101   R1a1a1b2 (R-Z93)
KSH004.A0101   R1a1a1b (R-Z647; R-Z645)
KYZ001.A0101   R1a1a1b2a (R-Z94)
NUR002.A0101   R1a1a1b (R-Z647; R-Z645)
TAL004.A0101   R1a1a1b  (R-Z645)
WAR001.A0101   Q1a2a (Q-L475; Q-L53)
BIR010.A0101   Q1a1(Q-F1215,Q-F1096)
VOR003.A0101   BT(BT-Z12003,BT-M42)
BRE011.A0101   Q1a1b1a  (Q-L713)
BRE004.A0101   Q1a1b1a  (Q-L715; Q-L713)
BRE013.A0101   Q1a2a1c  (Q-L330)
BRE014.A0101   R1a1a1b  (R-Z645)
Са https://indo-european.eu/ancient-dna/
https://drive.google.com/drive/folders/1FNQNLQs93tmsX5_G728zE4DTIS0WUsXR

Цитат
Object-ID   Colloquial-Skeletal   Latitude   Longitude   Sex   mtDNA-coverage   mtFAR   mtDNA-haplogroup   mtDNA-Haplotree   mt-FTDNA   mtree   mt-YFull   FTDNA-mt-Haplotree   mt-Simple   mt-Symbol   HVS-I   HVS-II   HVS-NO   mt-SNPs   Responsible-mtDNA   Y-DNA   Y-New   SNP-positive   SNP-negative   SNP-dubious   NRY   Y-FAR   Y-Simple   YTree   Y-Haplotree-Variant   Y-Haplotree-Public   Y-FTDNA   YFull   Y-YFull   ISOGG2019   FTDNA-Y-Haplotree   Y-Symbol   Y-Symbol2   Responsible-SNP   SNPs   Autosomal-Coverage   Damage-Rate   Assessment   Kinship-Notes   Source   Method-Date   Date   Mean   CalBC_top   CalBC_bot   Age   Simplified_Culture   Culture_Grouping   Label   Location   SiteID   Country   LP   Skin   Hair   Eye   P1104A   Other   Index

scy197   K50B1S1, KX977312.1   46,6684   29,8001   M   ..   0,138629283   U5a1a1   U5a1a1*   https://www.familytreedna.com/public/mt-dna-haplotree/U;name=U5a1a1   U5a1a1l   https://www.yfull.com/mtree/U5a1a1l/   U>U5>U5a'b>U5a>U5a1>U5a1-T16192C!>U5a1a>U5a1a1>U5a1a1l   U5   U   A73G, A263G, A750G, A1438G, T1700C, A2706G, T3197C, A4769G, C5229T, T5495C, C7028T, T8705C, G9477A, A11467G, G11719A, A12308G, G12372A, T13617C, C14766T, A14793G, A15218G, A15326G, G15734A, A15924G, C16256T, C16270T, A16399G         T8705C   YFull   R1b1a1a2   E1b1b1a1b1   M78, V13, Z1057, L618/CTS1273   BY6203,FT27407      68740   0,618571031   E1bV13   E1b-BY6357*   E-BY6357*   E-BY6357   https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/E;name=E-BY6357   E-BY6357*   https://www.yfull.com/tree/E-BY6357*/   E1b1b1a1b1a24~   E-M96>CTS9083>P147>P177>M215>M35>V68>M78>PF2179>Z1919>L618>V13>CTS8814>CTS5856>BY4877>BY3880>FGC44169>BY6357   E   E1b1b1a   Vladimir Tagankin   308321   0,310283   ..   PASS (literature)   n/a   KrzewińskaSciAdv2018   Context: Based on dates from the same cultural site/Context (scy305, scy300, scy301, scy311, scy304, scy303, scy332)   400-150 BCE   -275   -400   -150      Scythian   Western Scythian   Moldova_Glinoe_Scythian.SG   Glinoe   Barrow 50, Burial 1   Moldova                     6127
E-BY6357*,
такође
Цитат
KNT001   K1/16_1f   41,412   68,7974   M   50,04   0,408485446   I1c1   I1c1   https://www.familytreedna.com/public/mt-dna-haplotree/I;name=I1c1   I1c1   https://www.yfull.com/mtree/I1c1/   N>N1'5>N1>N1a>N1a1'2>N1a1>N1a1b>I>I1>I1c>I1c1   I1   I                  E1b1b1a1b1a  (E-V13)      CTS9320   BY20093; BY4526>BY4529>BY4523, BY4526>BY4552, BY4526>S10743, BY4526>S19928; Z16988>A11826, Z16988>BY4197>BY34282>BY50887, Z16988>BY4197>BY34282>Z38664, Z16988>BY66796   BY4526; Z16988   123308   0,447567568   E1bV13   E1b-CTS9320(xBY20093)   E-CTS9320   E-CTS9320   https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/E;name=E-CTS9320   E-CTS9320   https://www.yfull.com/tree/E-CTS9320/   E1b1b1a1b1a6a1~   E-M96>CTS9083>P147>P177>M215>M35>V68>M78>PF2179>Z1919>L618>V13>CTS8814>CTS5856>BY4877>BY3880>Z5017>Z5016>SK888>CTS6377>CTS9320   E   E1b1b1a   FTDNA   948837   2,695   0,0026         GnecchiRusconeSciAdv2021   2th-5th c. CE; Otyrar culture   245-343 calAD   294   245   343      Steppe_Central_Nomad_IA   Otrar-Karatau culture   Konyr_Tobe_300CE   K1/16_1f      Kazakhstan                     14119
E1b-CTS9320(xBY20093).

https://indo-european.eu/2021/04/iron-age-nomads-of-west-siberia-of-hg-q1b-r1a-and-basal-n1a-l1026/
Цитат
BIY012: U5a1a2a. N-M231(xB482>FT324; xL735). It could be thus of hg. N-M231*, N-M231>B482* or within the N-M231>B482>MF52704 branch.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Септембар 25, 2021, 08:32:12 поподне
Ево и званично одличног археогенетичког рада о Етрурцима (https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.abi7673?fbclid=IwAR1kTlLG3W9ML_kV3EejNPtE3gbdAlU0lzw7Rd31yGuVu4quW-5fwp8Bq74). Резултати и закључци рада су многе идеје и теорије о њиховом пореклу и етногенези оповргле.

Цитат
In conclusion, our study sheds light on five main aspects of Italian population history. First, individuals associated with the Etruscan culture carried a high proportion of steppe-related ancestry, despite speaking a non–Indo-European language. If the Etruscan language was indeed a relict language that predated Bronze Age expansions, then it would represent one of the rare examples of language continuity despite extensive genetic discontinuity (24, 50). The steppe-related ancestry in Etruscans may have been mediated by Bronze Age Italic speakers, possibly through a prolonged admixture process resulting in a partial language shift. Second, after the Bronze Age admixture, the Etruscan-related gene pool remained generally homogeneous for almost 800 years, notwithstanding the sporadic presence of individuals of likely Near Eastern, northern African, and central European origins. Third, eastern Mediterranean ancestries replaced a large portion of the Etruscan-related genetic profile during the Roman Imperial period. Fourth, a substantial genetic input from northern European ancestries was introduced during the Early Middle Ages, possibly through the spread of Germanic tribes into the Italian peninsula. Fifth, the genetic makeup of present-day populations from central and southern Italy was mostly in place by the end of the first millennium CE.

Нажалост, нема древних Расена и Сораба. Једина веза са Србљима колико видех постоји преко овог узорка (а чини ми се да има још један L497) 770-540 BCE C.Italy_Etruscan G2a2b2a1a1b L497/S317. Sample ID: CAM003.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Христифор Септембар 26, 2021, 01:12:23 пре подне
Иначе, видим да су неки од ових узорака из Виминацијума раније антрополошки реконструисани.

(https://scontent.fbeg5-1.fna.fbcdn.net/v/t1.6435-9/120073276_2648128098832266_742797443291285323_n.jpg?_nc_cat=111&ccb=1-5&_nc_sid=9267fe&_nc_ohc=shmINhP7V9QAX8RFppf&_nc_ht=scontent.fbeg5-1.fna&oh=bbb80d2ae812fbe573edad399d5d6df6&oe=61556017)

Нађох описе на сљедећој страници
https://www.facebook.com/archeoserbia/photos/reconstruction-of-faces-of-some-anthropological-types-of-the-citizens-of-ancient/2648128095498933/

Да ли су овај црнац и Герман оставили генетски траг, веома интересантно за истраживање.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Септембар 26, 2021, 09:36:15 пре подне
Да ли су овај црнац и Герман оставили генетски траг, веома интересантно за истраживање.

Јесу. Има о томе у раду о Виминацијуму који је недавно изашао.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Христифор Септембар 26, 2021, 12:13:36 поподне
Волео бих да видим тај рад.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Септембар 26, 2021, 12:26:04 поподне
Иначе, видим да су неки од ових узорака из Виминацијума раније антрополошки реконструисани.

(https://scontent.fbeg5-1.fna.fbcdn.net/v/t1.6435-9/120073276_2648128098832266_742797443291285323_n.jpg?_nc_cat=111&ccb=1-5&_nc_sid=9267fe&_nc_ohc=shmINhP7V9QAX8RFppf&_nc_ht=scontent.fbeg5-1.fna&oh=bbb80d2ae812fbe573edad399d5d6df6&oe=61556017)

Нађох описе на сљедећој страници
https://www.facebook.com/archeoserbia/photos/reconstruction-of-faces-of-some-anthropological-types-of-the-citizens-of-ancient/2648128095498933/

Ево описа антрополошких типова са слике:

1 – Mediteranski antropološki tip, na osnovu lobanje iz groba G-343, sa nekropole na lokalitetu Više grobalja u Viminacijumu.

2 – Negroidni antropološki tip, na osnovu lobanje iz groba G-595, sa nekropole na lokalitetu Više grobalja u Viminacijumu.

3 – Žena mediteranskog antropološkog tipa, na osnovu lobanje iz groba G-4661, sa nekropole na lokalitetu Pećine u Viminacijumu.

4 – Nordijski antropološki tip, na osnovu veštački deformisane i izdužene lobanje* iz groba G-1318, sa nekropole na lokalitetu Više grobalja u Viminacijumu.

*интересантно да се код нордијца помиње вештачки деформисана лобања. Читао сам негде да су раније, у оквиру појединих култура, повезивали главе у детињству како би биле издуженог облика, не зам да ли је то и овде случај

"Takođe, pronađeni su i ostaci 31 osobe sa veštački deformisanim i izduženim lobanjama, koji su pripadali nekom germanskom plemenu."

"Viminacijum je bio utvrđeni rimski grad, centar provincije Gornja Mezija i sedište VII Klaudija legije. Imao je oko 30 000 stanovnika, a populaciju su činili ne samo ljudi lokalnog porekla, već i ljudi koji su poticali iz udaljenih krajeva Rimskog carstva, ka oi pograničnih i dalekih područja koja nisu bila potčinjena Rimu. Arheolozi su u Viminacijumu otkrili preko 14 000 grobova sa 20 000 skeletnih ostataka, među kojima su identifikovali 10 antropoloških tipova. Među njima je najzastupljeniji mediteranski antropološki tip."

Иначе су ови медитерански типови, уколико су верно приказани, већ делимично динаризовани (краћа глава, већи нос, оштре црте лица). И Медитеранац и Медитеранка са слике. Дакле то одговара оној тези да је од илирског периода, па вероватно све до доласка Словена, на Балкану најдоминантнији тип био динаризовани Медитеранац.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Христифор Септембар 26, 2021, 01:08:33 поподне
Надати се да ће овако реконструисати остатке из ранословенских некропола да видимо који је тип преовлађивао приликом досељавања на Балкан.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Селаковић Септембар 28, 2021, 05:45:49 поподне
Не знам је ли већ било, знам да се знало да је Бела III R1a:

Genome-wide autosomal, mtDNA, and Y chromosome analysis of King Bela III of the Hungarian Arpad dynasty

https://www.nature.com/articles/s41598-021-98796-x?fbclid=IwAR0POGvQvrDjFb354uE5JtHgGzFvoL2t5hk3KlWGxZQHC4-FRf6OYAwoun8

Надајмо се једног дана раду са оваквим насловом који се тиче неког нашег средњевековног владара.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Exiled Септембар 28, 2021, 05:47:35 поподне
Не знам је ли већ било, знам да се знало да је Бела III R1a:

Genome-wide autosomal, mtDNA, and Y chromosome analysis of King Bela III of the Hungarian Arpad dynasty

https://www.nature.com/articles/s41598-021-98796-x?fbclid=IwAR0POGvQvrDjFb354uE5JtHgGzFvoL2t5hk3KlWGxZQHC4-FRf6OYAwoun8

Надајмо се једног дана раду са оваквим насловом који се тиче неког нашег средњевековног владара.
Нада последња умире😉
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 28, 2021, 06:04:34 поподне
Не знам је ли већ било, знам да се знало да је Бела III R1a:

Genome-wide autosomal, mtDNA, and Y chromosome analysis of King Bela III of the Hungarian Arpad dynasty

https://www.nature.com/articles/s41598-021-98796-x?fbclid=IwAR0POGvQvrDjFb354uE5JtHgGzFvoL2t5hk3KlWGxZQHC4-FRf6OYAwoun8

Надајмо се једног дана раду са оваквим насловом који се тиче неког нашег средњевековног владара.

Да, то је стара вијест. Послије су проширили истраживање још и са Арпадовићима у ширем контексту. У том посљедњем истраживању открили су да један Србин из Новог Сада (тако је означен у раду, не знам д али је баш етнички Србин) припада Арпадовићима и то прилично поуздано.

Ево га и овдје на стаблу Арпадовића на YFullu.
https://www.yfull.com/tree/R-ARP5/

Баш бих волио знати о коме се ради.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: сɣнце Септембар 29, 2021, 02:56:31 поподне
Да, то је стара вијест. Послије су проширили истраживање још и са Арпадовићима у ширем контексту. У том посљедњем истраживању открили су да један Србин из Новог Сада (тако је означен у раду, не знам д али је баш етнички Србин) припада Арпадовићима и то прилично поуздано.

Ево га и овдје на стаблу Арпадовића на YFullu.
https://www.yfull.com/tree/R-ARP5/

Баш бих волио знати о коме се ради.

Занимљиво је да је братски огранак Арпадовском сав башкирски. То је једна од двије Р1а гране у Башкира.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 29, 2021, 05:43:37 поподне
Занимљиво је да је братски огранак Арпадовском сав башкирски. То је једна од двије Р1а гране у Башкира.

Ови резултати су потврдили неке раније претпоставке о формирању прото-Мађара на подручју јужног Урала, управо у Башкирији. Мислим да је и раније писано о томе, на теми Мађари. Прото-Мађари су били федерација разнородних племена, у којој је ипак језички превладао угро-фински елемент N хаплогрупе. Без обзира што је предводнички клан очигледно даљим поријеклом био турског поријекла.

Изгледа да се то иницијално формирање десило управо на подручју Башкирије.

Оригинални Мађари су изгледали вјероватно овако:
(https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/8/8b/Baschkiren%2C_Baymak_rayon_2.jpg)

или овако, ако су на путу до Европе покупили и нешто словенске днк:
(https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/1/1f/Young_bashqorts.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Септембар 29, 2021, 07:03:43 поподне
Ови резултати су потврдили неке раније претпоставке о формирању прото-Мађара на подручју јужног Урала, управо у Башкирији.

Magna Hungaria, домовина Мађара пре него што су се упутили ка Црном мору, и јесте била на подручју Башкирије.

https://en.wikipedia.org/wiki/Magna_Hungaria

(https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/5/53/History_Hungary_1.png)

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Септембар 29, 2021, 11:56:10 поподне
Надати се да ће овако реконструисати остатке из ранословенских некропола да видимо који је тип преовлађивао приликом досељавања на Балкан.
Колико ми је познато, углавном су пронађени долихокефали.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: barbarylion Септембар 30, 2021, 10:57:27 пре подне
Нада последња умире😉

Mislim da od toga nema 'leba..
Još sada imamo najezdu lažnih Nemanjića po ovim internet televizijama.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Exiled Септембар 30, 2021, 11:02:59 пре подне
Mislim da od toga nema 'leba..
Još sada imamo najezdu lažnih Nemanjića po ovim internet televizijama.
Знам да нема него мора човек да буде позитиван😇
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Be like Bill Октобар 14, 2021, 10:49:36 пре подне
Krajem septembra izašao je rad "Twenty-Seven Y-Chromosome Short Tandem Repeats Analysis of Italian Mummies of the 16th and 18th Centuries: An Interdisciplinary Research" koje se bavi ostacima pronađenim u kripti crkve u malom mestu Roccapelago u Italiji. S obzirom da je mesto i danas malo, nekih tridesetak stanovnika i da ima sve karakteristike izoliranog mesta, naučnici su bili zainteresovani da li će se haplotipovi današnjih stanovnika razlikovati od preminulih, tj da li je došlo do zamene stanovništva, kao i kolike su mutacije na markerima u haplotipovima starijeg i savremenog stanovništva te kakva je brzina raspadanja DNK, tj koji markeri su najpodložniji opadanju kvaliteta.

U radu je kao jedan od prediktora korišten Nevgen

https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fgene.2021.720640/full
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: нцп Октобар 14, 2021, 11:02:23 пре подне
Krajem septembra izašao je rad "Twenty-Seven Y-Chromosome Short Tandem Repeats Analysis of Italian Mummies of the 16th and 18th Centuries: An Interdisciplinary Research" koje se bavi ostacima pronađenim u kripti crkve u malom mestu Roccapelago u Italiji. S obzirom da je mesto i danas malo, nekih tridesetak stanovnika i da ima sve karakteristike izoliranog mesta, naučnici su bili zainteresovani da li će se haplotipovi današnjih stanovnika razlikovati od preminulih, tj da li je došlo do zamene stanovništva, kao i kolike su mutacije na markerima u haplotipovima starijeg i savremenog stanovništva te kakva je brzina raspadanja DNK, tj koji markeri su najpodložniji opadanju kvaliteta.

U radu je kao jedan od prediktora korišten Nevgen

https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fgene.2021.720640/full

Благодарни смо на прилогу.

Ја га ишчитах  све са аутоматским преводом на србски језик ...
Мада ту су и графикони и слике.

Видим да су нађене 4 хаплогрупе Y хромозома

I2a
J1
J2b (мислим да је b)
R1b.


Па би било корисно свим посетиоцима форума, који се зове српски ДНК пројекат, а у стварности прате се све линије на Балкану и у Европи, да им неко од стручнјиих лица  мало ближе представи односно објасни које су то (детаљније) мушке линије нађене и да ли имају  икакве везе са Балканом и какве. Или немају  никакве везе.

Па и ако немају - опет су занимљиви. Можда ми је баш нађен неки аутосомални рођак  ::)!

Тако да једва чекам појашњење....


Наравно све то кад нађу време ....
 :)


Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Октобар 14, 2021, 11:33:01 пре подне
Узорци J2b сви припадају хаплогрупи J2b-M241>L283. Могуће подграни J-Y15058. Постоји више специфичних вредности (390=25, 385=15-18, 391=9), па нема поклапања међу тестираним Србима, али видим да су им нашли "парњаке" на простору Италије.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: нцп Октобар 14, 2021, 03:45:43 поподне
Узорци J2b сви припадају хаплогрупи J2b-M241>L283. Могуће подграни J-Y15058. Постоји више специфичних вредности (390=25, 385=15-18, 391=9), па нема поклапања међу тестираним Србима, али видим да су им нашли "парњаке" на простору Италије.

Хвала Небојша  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Драган Обреновић Новембар 05, 2021, 09:14:11 поподне
Укупно 1672 узорка:

“Large-Scale Migration into Southern Britain During the Middle to Late Bronze Age", Harvard.

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB47891?show=reads
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Неродимац Новембар 06, 2021, 11:03:12 пре подне
Било би добро кад би yfull ово ставио на своје стабло.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Новембар 06, 2021, 11:18:34 пре подне
Било би добро кад би yfull ово ставио на своје стабло.
Рад још није званично објављен, а YFull ће свакако постепено стављати на стабло оне резултате који су довољног квалитета, којих је срећом велики број, од Словеније до Енглеске.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Новембар 06, 2021, 11:33:12 пре подне
Надајмо се да је ово први заиста древни I2-Din узорак, што ће рећи старији од периода средњег века:


I18719; I2a1a2b1a1-CTS10228>Y3120 (xY4882,Y5596)


ниво CTS10228: S17076/YP188+ A>C (2C); FGC12081/V2129/SK1237/Y3111+ C>G (1G); FGC12084/Y3775+ C>A (1A); Y3774/FGC12082+ G>A (4A); FGC12075/YP194+ G>C (13C); Y3121/FGC12096+ G>C (4C); S12235+ T>C (2C); CTS5966+ T>A (2A); CTS5996+ T>C (1C)

ниво CTS10228>Y81696: Y85622- A>G (5A); Y85279- G>A (1G); Y96226- G>A (1G); FT208119- T>G (4T)

ниво CTS10228>Y3120: Y3116+ G>C (3C-4G)

ниво CTS10228>Y3120>Y18331: *нема очитавања*

ниво CTS10228>Y3120>Z17855: *нема очитавања*

ниво CTS10228>Y3120>Y4460: *нема очитавања*

ниво CTS10228>Y3120>S17250: *нема очитавања*

ниво CTS10228>Y3120>S17250>Y4882: Y4883/Z16970- G>C (4G)

ниво CTS10228>Y3120>S17250>Y5596: Y5596/BY128- A>C (9A)

ниво CTS10228>Y3120>S17250>PH908: *нема очитавања*
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Новембар 06, 2021, 11:50:42 пре подне
На основу аутосомала рекло би се да је ипак средњовековни узорак у питању, нажалост:

Distance to: Celtic_paper:I18719
0.02133739 Montenegrin
0.02395463 Serbian
0.02700447 Romanian
0.02747612 Moldovan
0.02904085 Bosnian

Distance to: Celtic_paper:I18719
0.02650526 Romanian:G408
0.02680971 Montenegrin:Montenegro6
0.02720836 Serbian:717
0.02749230 Serbian:729
0.02775372 Serbian:726
0.02815494 Montenegrin:Montenegro4
0.02837617 Italian_Northeast:ALP435
0.02922570 Montenegrin:Montenegro7
0.02929583 Serbian:712
0.02940872 Romanian:A362
0.02985321 Croatian:Croatia_Cro305
0.03002988 Bosnian:Bosnian_13
0.03089066 Moldovan:MOL-069
0.03092124 Moldovan:44618757461C01
0.03103640 Montenegrin:Montenegro5
0.03157693 Serbian:710
0.03160384 Serbian:724
0.03167525 Serbian:728
0.03175789 Romanian:A343
0.03176351 Bosnian:Bosnian_12
0.03177463 Bosnian:Bosnian_10
0.03193091 Slovenian:Slovenian172
0.03218606 VK2020_ITA_Foggia_MA:VK538
0.03247129 Moldovan:44618757472C01
0.03285979 Moldovan:44618757482C02
0.03302922 Moldovan:44618758492C02
0.03312324 Bulgarian:BulgarianF2
0.03325667 Montenegrin:Montenegro1
0.03331539 Moldovan:MOL-066
0.03337098 Serbian:Serbian_Serbia4
0.03338342 Slovenian:Slovenian136
0.03373781 Serbian:Serbian_Serbia2
0.03437026 Croatian:Croatia_Cro142
0.03484171 Moldovan:44618757802C01
0.03484869 Romanian:G434
0.03491474 Italian_Northeast:ALP220
0.03545940 Moldovan:44618757471C01
0.03551250 Serbian:Serbian_Serbia5
0.03555611 Moldovan:44618757252C02
0.03569559 VK2020_DNK_Langeland_VA:VK362
0.03572019 Serbian:722
0.03585976 Bulgarian:Bulgaria1
0.03586028 Serbian:715
0.03605834 Italian_Northeast:KF2700922
0.03607715 Moldovan:44618757481C02
0.03610442 Serbian:721
0.03627556 Italian_Northeast:KF1803129
0.03663181 Moldovan:44618758062C02
0.03679381 Italian_Northeast:ALP093
0.03690259 BGR_EBA:I2165
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: нцп Новембар 06, 2021, 11:53:48 пре подне
Надајмо се да је ово први заиста древни I2-Din узорак, што ће рећи старији од периода средњег века:


I18719; I2a1a2b1a1-CTS10228>Y3120 (xY4882,Y5596)


ниво CTS10228: S17076/YP188+ A>C (2C); FGC12081/V2129/SK1237/Y3111+ C>G (1G); FGC12084/Y3775+ C>A (1A); Y3774/FGC12082+ G>A (4A); FGC12075/YP194+ G>C (13C); Y3121/FGC12096+ G>C (4C); S12235+ T>C (2C); CTS5966+ T>A (2A); CTS5996+ T>C (1C)

ниво CTS10228>Y81696: Y85622- A>G (5A); Y85279- G>A (1G); Y96226- G>A (1G); FT208119- T>G (4T)

ниво CTS10228>Y3120: Y3116+ G>C (3C-4G)

ниво CTS10228>Y3120>Y18331: *нема очитавања*

ниво CTS10228>Y3120>Z17855: *нема очитавања*

ниво CTS10228>Y3120>Y4460: *нема очитавања*

ниво CTS10228>Y3120>S17250: *нема очитавања*

ниво CTS10228>Y3120>S17250>Y4882: Y4883/Z16970- G>C (4G)

ниво CTS10228>Y3120>S17250>Y5596: Y5596/BY128- A>C (9A)

ниво CTS10228>Y3120>S17250>PH908: *нема очитавања*

Хвала. Да ли је то све што се тиче I2 хаплогрупе? Немам могућност скидања.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Новембар 06, 2021, 11:55:51 пре подне
Хвала. Да ли је то све што се тиче I2 хаплогрупе? Немам могућност скидања.

Има још много I2 узорака, али је ово једини динарац.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: нцп Новембар 06, 2021, 11:56:29 пре подне
На основу аутосомала рекло би се да је ипак средњовековни узорак у питању, нажалост:

Distance to: Celtic_paper:I18719
0.02133739 Montenegrin
0.02395463 Serbian
0.02700447 Romanian
0.02747612 Moldovan
0.02904085 Bosnian

Distance to: Celtic_paper:I18719
0.02650526 Romanian:G408
0.02680971 Montenegrin:Montenegro6
0.02720836 Serbian:717
0.02749230 Serbian:729
0.02775372 Serbian:726
0.02815494 Montenegrin:Montenegro4
0.02837617 Italian_Northeast:ALP435
0.02922570 Montenegrin:Montenegro7
0.02929583 Serbian:712
0.02940872 Romanian:A362
0.02985321 Croatian:Croatia_Cro305
0.03002988 Bosnian:Bosnian_13
0.03089066 Moldovan:MOL-069
0.03092124 Moldovan:44618757461C01
0.03103640 Montenegrin:Montenegro5
0.03157693 Serbian:710
0.03160384 Serbian:724
0.03167525 Serbian:728
0.03175789 Romanian:A343
0.03176351 Bosnian:Bosnian_12
0.03177463 Bosnian:Bosnian_10
0.03193091 Slovenian:Slovenian172
0.03218606 VK2020_ITA_Foggia_MA:VK538
0.03247129 Moldovan:44618757472C01
0.03285979 Moldovan:44618757482C02
0.03302922 Moldovan:44618758492C02
0.03312324 Bulgarian:BulgarianF2
0.03325667 Montenegrin:Montenegro1
0.03331539 Moldovan:MOL-066
0.03337098 Serbian:Serbian_Serbia4
0.03338342 Slovenian:Slovenian136
0.03373781 Serbian:Serbian_Serbia2
0.03437026 Croatian:Croatia_Cro142
0.03484171 Moldovan:44618757802C01
0.03484869 Romanian:G434
0.03491474 Italian_Northeast:ALP220
0.03545940 Moldovan:44618757471C01
0.03551250 Serbian:Serbian_Serbia5
0.03555611 Moldovan:44618757252C02
0.03569559 VK2020_DNK_Langeland_VA:VK362
0.03572019 Serbian:722
0.03585976 Bulgarian:Bulgaria1
0.03586028 Serbian:715
0.03605834 Italian_Northeast:KF2700922
0.03607715 Moldovan:44618757481C02
0.03610442 Serbian:721
0.03627556 Italian_Northeast:KF1803129
0.03663181 Moldovan:44618758062C02
0.03679381 Italian_Northeast:ALP093
0.03690259 BGR_EBA:I2165
Ако не грешим - тај  и такав аутосомални резултат те неке "древне" јединке треба да покаже на коју од данашњих популација упућује. У супротном није ми јасно о чему се ради

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: нцп Новембар 06, 2021, 11:58:47 пре подне
Има још много I2 узорака, али је ово једини динарац.

Да ли је то тај?

I18719; I2a1a2b1a1-CTS10228>Y3120 (xY4882,Y5596
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Неродимац Новембар 06, 2021, 05:44:32 поподне
А да ли се зна локација одакле су узорци са овог истраживања?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милан Петровић Новембар 07, 2021, 11:55:32 пре подне
Нека теорија можда?  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: нцп Новембар 07, 2021, 02:37:30 поподне
А да ли се зна локација одакле су узорци са овог истраживања?


Јужна Енглеска и Велс (пише  у одредници). Нема детаљнијег навођења места

Ја не могу да отворим фаил. Да могу, поделила бих са заинтересованима на форуму.

Не разумем више ове тзв. уреднике овог форума. Чувају за себе знање (сазнање) или још нису обрадили податке (и не морају али нек нама напишу основну хаплогрупу) или је у питању нешто друго (мрзи их и томе слично).

Хвала Црној Гуји и за овог једног.

Мени је криво јер мене све занима из тог рада. Сваки зарез. 



Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милан Петровић Новембар 07, 2021, 02:43:26 поподне
Нешто ту не штима. Римљани долазе тек 55пне, сувише касно да би стигао са њима. Келти долазе 1000пне, то је касно бронзано доба у Британији.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Мића Новембар 07, 2021, 04:47:30 поподне

Јужна Енглеска и Велс (пише  у одредници). Нема детаљнијег навођења места

Ја не могу да отворим фаил. Да могу, поделила бих са заинтересованима на форуму.

Не разумем више ове тзв. уреднике овог форума. Чувају за себе знање (сазнање) или још нису обрадили податке (и не морају али нек нама напишу основну хаплогрупу) или је у питању нешто друго (мрзи их и томе слично).

Хвала Црној Гуји и за овог једног.

Мени је криво јер мене све занима из тог рада. Сваки зарез.

Који је фајл у питању?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: нцп Новембар 07, 2021, 05:14:18 поподне
Који је фајл у питању?

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB47891?show=reads

Сви ти појединачни резултати могу збирно да се преузму (downland) у ЗИП-у који ја немам. Може да се инсталира. Али ја то не умем. Тренутно немам никога ко то зна.

Реално, обиман је материјал.

Хоћу да видим које су хаплогрупе сви ти "древни" појединци.

Занимају ме све гране I хаплогрупе. Не морају да имају никакве везе са садашњим мушким линијама на Балкану.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: archduke Новембар 07, 2021, 06:26:17 поподне
Који оперативни систем имаш? Windows 10 може да отвори зип формат без инсталација посебних програма. Јеси ли сигуран да је формат зип?

Ако имаш старији оперативни систем инсталирај WinRAR он отвара више формата укључујући и зип и рар. Инсталација је тривијална (next, next, yes варијанта)

Поздрав
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Новембар 07, 2021, 06:56:46 поподне
Не бисте могли ништа урадити са тим фајловима чак и да их успете скинути, а и то бисте тешко успели с обзиром да се ради о више стотина гигабајта података. Рад још увек није званично објављен па детаљи о појединачним резултатима (локација, временско датирање и сл.) још увек нису познати. На основу допунских материјала из рада о Виминацијуму "процурели" су подаци за један мали број узорака, и у питању су узорци француског Ла Тена, словеначког Халштата и гвозденог доба Холандије. Хаплогрупе мушких узорака одређене на основу Yleaf-a могу се преузети овде (https://drive.google.com/file/d/1gbnd7t60VseUtOB52aNWC7s8xumae0zD/view), мада их не треба узимати као 100% тачне, пошто сам већ наишао на неколико њих који су приписани погрешној грани. Фајл отворите помоћу програма notepad и једноставно ископирајте у ексел ради боље прегледности.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: нцп Новембар 07, 2021, 07:51:49 поподне
Који оперативни систем имаш? Windows 10 може да отвори зип формат без инсталација посебних програма. Јеси ли сигуран да је формат зип?

Ако имаш старији оперативни систем инсталирај WinRAR он отвара више формата укључујући и зип и рар. Инсталација је тривијална (next, next, yes варијанта)

Поздрав

Хвала најлепше
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: нцп Новембар 07, 2021, 07:53:02 поподне
Не бисте могли ништа урадити са тим фајловима чак и да их успете скинути, а и то бисте тешко успели с обзиром да се ради о више стотина гигабајта података. Рад још увек није званично објављен па детаљи о појединачним резултатима (локација, временско датирање и сл.) још увек нису познати. На основу допунских материјала из рада о Виминацијуму "процурели" су подаци за један мали број узорака, и у питању су узорци француског Ла Тена, словеначког Халштата и гвозденог доба Холандије. Хаплогрупе мушких узорака одређене на основу Yleaf-a могу се преузети овде (https://drive.google.com/file/d/1gbnd7t60VseUtOB52aNWC7s8xumae0zD/view), мада их не треба узимати као 100% тачне, пошто сам већ наишао на неколико њих који су приписани погрешној грани. Фајл отворите помоћу програма notepad и једноставно ископирајте у ексел ради боље прегледности.

Хвала ЦГ!
Значи да се стрпимо!
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Новембар 07, 2021, 10:47:09 поподне
Мапа аутосомалне блискости узорка I18719 (I2-Din) модерним популацијама, на основу које је готово извесно да је у питању средњовековни узорак, или, праштајте на дрскости, средњовековни Србин ;D :

(https://i.imgur.com/9PKTV2o.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Be like Bill Новембар 07, 2021, 10:53:59 поподне
Bio bih tako slobodan da kažem da je u pitanju srednjovekovni Ozrinić ;D
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 10, 2021, 01:52:30 поподне
Мапа аутосомалне блискости узорка I18719 (I2-Din) модерним популацијама, на основу које је готово извесно да је у питању средњовековни узорак, или, праштајте на дрскости, средњовековни Србин ;D :

(https://i.imgur.com/9PKTV2o.png)

Сремац је прије неки дан упоредио аутосомално резултате овог I18719 са мојим скалираним резултатима и како ми је написао, овај узорак ми је најближи од свих досад доступних древних и модерних узорака. То се види и на овој слици:
(https://i.postimg.cc/GmnF6sXy/Capture.png)

Тако да ме баш интересује одакле је и колико је стар овај узорак.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Новембар 10, 2021, 06:17:28 поподне
Сремац је прије неки дан упоредио аутосомално резултате овог I18719 са мојим скалираним резултатима и како ми је написао, овај узорак ми је најближи од свих досад доступних древних и модерних узорака. То се види и на овој слици:
(https://i.postimg.cc/GmnF6sXy/Capture.png)

Тако да ме баш интересује одакле је и колико је стар овај узорак.

Аутосомал без сумње иде у прилог томе да је у питању средњовековни узорак, па сам ипак одлучио проверити и гране низводно од Y3120. Почећу од PH908, па ћу поставити овде резултате мало касније.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: нцп Новембар 10, 2021, 07:47:04 поподне
Мапа аутосомалне блискости узорка I18719 (I2-Din) модерним популацијама, на основу које је готово извесно да је у питању средњовековни узорак, или, праштајте на дрскости, средњовековни Србин ;D :

(https://i.imgur.com/9PKTV2o.png)

Хм.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Новембар 10, 2021, 08:03:43 поподне
Овај узорак има јако добру покривеност, па ћу резултате објављивати у више порука. Крећем од гране FT16449 (сам SNР FT16449 није очитан).


FT16449>Y151633: Y151633-  T>C (2T)

FT16449>MF2888: MF2888-  A>G (5A)

FT16449>FT138628: FTA37577-  A>G (3A); FTA10430-  C>T (1C); Y100323-  C>T (2C)

FT16449>Y57291: Y57291-  T>C (1T)

FT16449>FT52705: BY89222-  T>A (28T-1C)

FT16449>FT36524: FT37766-  C>G (1C)

FT16449>FT166563: FT167474-  G>A (4G); FT171013-  A>G (4A)

FT16449>BY173300>BY67102: FT154100-  T>A (2T); Y183257-  G>T (1G)

FT16449>Y126296>FT215325: FT215325-  G>C (2G)

FT16449>Y126296>FT19919: FT15733-  G>A (1G)

FT16449>Y126296>Y81557>Y109645: Y109645-  T>C (6T)

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: нцп Новембар 10, 2021, 08:49:37 поподне
Овај узорак има јако добру покривеност, па ћу резултате објављивати у више порука. Крећем од гране FT16449 (сам SNР FT16449 није очитан).


FT16449>Y151633: Y151633-  T>C (2T)

FT16449>MF2888: MF2888-  A>G (5A)

FT16449>FT138628: FTA37577-  A>G (3A); FTA10430-  C>T (1C); Y100323-  C>T (2C)

FT16449>Y57291: Y57291-  T>C (1T)

FT16449>FT52705: BY89222-  T>A (28T-1C)

FT16449>FT36524: FT37766-  C>G (1C)

FT16449>FT166563: FT167474-  G>A (4G); FT171013-  A>G (4A)

FT16449>BY173300>BY67102: FT154100-  T>A (2T); Y183257-  G>T (1G)

FT16449>Y126296>FT215325: FT215325-  G>C (2G)

FT16449>Y126296>FT19919: FT15733-  G>A (1G)

FT16449>Y126296>Y81557>Y109645: Y109645-  T>C (6T)

Да ли то значи да је негативан на све ове СНП-е (црвено)?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Новембар 10, 2021, 09:21:58 поподне
FT14506 такође није очитан. Испод имамо:


FT14506>Y251275: Y262292-  T>C (1T)

FT14506>Y70799: Y70799-  C>A (1C)

FT14506>BY140506: BY140506-  G>C (2G)

FT14506>A13912: BY37512-  G>A (2G)

FT14506>Y179535: Y179535-  G>C (1G); FT41224-  T>G (1T)

FT14506>FT177529>FT176058: FT177917-  G>C (1G); FT177623-  T>C (3T)

FT14506>Y56203>Y134578: Y190064-  A>G (2A); BY8728/FGC51403-  G>A (2G); Y61610-  G>A (6G)

FT14506>Y56203>FTA22808: FTA24441/Y238060-  T>C (1T); FTA22974/Y238062-  A>G (2A); FTA23185/Y238058-  C>G (4C); FTA23768/Y238063-  G>A (1G)







Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: нцп Новембар 10, 2021, 10:02:40 поподне
FT14506 такође није очитан. Испод имамо:


FT14506>Y251275: Y262292-  T>C (1T)

FT14506>Y70799: Y70799-  C>A (1C)

FT14506>BY140506: BY140506-  G>C (2G)

FT14506>A13912: BY37512-  G>A (2G)

FT14506>Y179535: Y179535-  G>C (1G); FT41224-  T>G (1T)

FT14506>FT177529>FT176058: FT177917-  G>C (1G); FT177623-  T>C (3T)

FT14506>Y56203>Y134578: Y190064-  A>G (2A); BY8728/FGC51403-  G>A (2G); Y61610-  G>A (6G)

FT14506>Y56203>FTA22808: FTA24441/Y238060-  T>C (1T); FTA22974/Y238062-  A>G (2A); FTA23185/Y238058-  C>G (4C); FTA23768/Y238063-  G>A (1G)

Није му очитан ФТ16449, ни ФТ14506, а колико схватих ни ПХ908.

Мени (као лаику који прати ГГ са великим питањем колико баш све увек схвати) код тезе у раду (у апстракту) да се ради о праисторијским узорцима (предхришћанским у најмању руку) Јужне Енглеске  и Велса (сазнаће се одакле је тачно тај "наш" да тако кажем) све ово наликује на то да је :

1).узорак мнооого млађи од оног за шта се сматра и потиче из периода највише 100 -  пре наше ере односно 100+ од наше ере и везује се за доба некакве римске експанзије на те просторе, што баш и не спада у средњи век па чак ни у рани средњи век

2. процене старости  Yfull за ову грану 12a нису адекватне  и она је старија но што се мисли - можда 2300-2500 година до последњег заједничког претка .

3. неки залутали лик из 2-4 века у те крајеве (заробљен негде, авантуриста, и ко зна ко све) али то онда обара тезу из рада. Није то онда нека древност.

4. Али за нас - ово је сјајан проналазак. Да ли нам је то најстарији којег имамо тренутно или није?

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Новембар 10, 2021, 10:36:09 поподне
BY93199: FT382557-  C>T (3C); BY111699-  C>A (1C); BY127711-  T>G (2T)

Y84307: Y84307-  G>C (14G)

Y51673: BY97555-  G>A (2G)

Y199272: FT280010-  G>A (3G)

Y178551: Y178619-  A>C (2A); Y178589-  C>T (1C)

Y32084: Y32084-  A>G (7A)

FT169314: FT169314-  A>G (1A); FT168203-  C>G (1A); FGC7943/ZS4957/Y10955-  G>A (4G)

Y45765: Y47382-  A>G (1A); Y45765-  G>T (1G); BY219325-  G>T (4G)

A5913>A16863: A16863-  T>C (1T)

A5913>A22312: A22312-  T>G (1T)

FT355750>FT355524: FT355524-  A>G (1A)

Y262301>Y265455: Y265798-  C>G (12C); Y265720-  C>T (1C); Y265409-  C>T (2C); Y265325-  G>T (1G); Y265544-  G>A (1G)

Z16983>Y97246: Y110105-  A>T (1A)

Z16983>Y4789>Y45843: Y45843-  A>G (2A)

Z16983>Y4789>Y6651: Y6658-  G>T (2G)

Z16983>Y4789>FT69556>FT69508: FT69595-  A>T (1A); FGC75097/Y94684-  C>T (1C)

FT277965>YP206: YP206-  C>T (1C)

BY198275>FT162921: FT162921-  T>C (3T)

BY198275>BY200456: BY200456-  G>C (1G)

FT277965>Y93865>Y95760: Z40310-  G>A (7G)


Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Новембар 10, 2021, 10:38:14 поподне
Није му очитан ФТ16449, ни ФТ14506, а колико схватих ни ПХ908.

Мени (као лаику који прати ГГ са великим питањем колико баш све увек схвати) код тезе у раду (у апстракту) да се ради о праисторијским узорцима (предхришћанским у најмању руку) Јужне Енглеске  и Велса (сазнаће се одакле је тачно тај "наш" да тако кажем) све ово наликује на то да је :

1).узорак мнооого млађи од оног за шта се сматра и потиче из периода највише 100 -  пре наше ере односно 100+ од наше ере и везује се за доба некакве римске експанзије на те просторе, што баш и не спада у средњи век па чак ни у рани средњи век

2. процене старости  Yfull за ову грану 12a нису адекватне  и она је старија но што се мисли - можда 2300-2500 година до последњег заједничког претка .

3. неки залутали лик из 2-4 века у те крајеве (заробљен негде, авантуриста, и ко зна ко све) али то онда обара тезу из рада. Није то онда нека древност.

4. Али за нас - ово је сјајан проналазак. Да ли нам је то најстарији којег имамо тренутно или није?

НЦП, замолио бих вас да сачекате док Црна Гуја не објави сва очитавања испод Y3120 за дати узорак и да не спамујете тему. Стрпљење је врлина. Поздрав.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Новембар 10, 2021, 10:39:01 поподне
Да ли то значи да је негативан на све ове СНП-е (црвено)?

Тако је.

4. Али за нас - ово је сјајан проналазак. Да ли нам је то најстарији којег имамо тренутно или није?

Нећемо знати док се не објави рад.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: нцп Новембар 11, 2021, 05:58:57 пре подне
НЦП, замолио бих вас да сачекате док Црна Гуја не објави сва очитавања испод Y3120 за дати узорак и да не спамујете тему. Стрпљење је врлина. Поздрав.


У тишини....

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Новембар 11, 2021, 07:48:06 пре подне
Није му очитан ФТ16449, ни ФТ14506, а колико схватих ни ПХ908.

Мени (као лаику који прати ГГ са великим питањем колико баш све увек схвати) код тезе у раду (у апстракту) да се ради о праисторијским узорцима (предхришћанским у најмању руку) Јужне Енглеске  и Велса (сазнаће се одакле је тачно тај "наш" да тако кажем) све ово наликује на то да је :

1).узорак мнооого млађи од оног за шта се сматра и потиче из периода највише 100 -  пре наше ере односно 100+ од наше ере и везује се за доба некакве римске експанзије на те просторе, што баш и не спада у средњи век па чак ни у рани средњи век

2. процене старости  Yfull за ову грану 12a нису адекватне  и она је старија но што се мисли - можда 2300-2500 година до последњег заједничког претка .

3. неки залутали лик из 2-4 века у те крајеве (заробљен негде, авантуриста, и ко зна ко све) али то онда обара тезу из рада. Није то онда нека древност.

4. Али за нас - ово је сјајан проналазак. Да ли нам је то најстарији којег имамо тренутно или није?
За сада знамо да је позитиван на Y3116 и негативан на поменуте SNP-ове. Према YFull-у Y3116 је настао вероватно пре 3400 до 2200 година https://www.yfull.com/tree/I-Y3120/ . Наравно, овај узорак може бити и млађи, јер сви до сада испитани припадници I2-Y3120 су позитивни н на Y3116.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: нцп Новембар 11, 2021, 08:16:02 пре подне
За сада знамо да је позитиван на Y3116 и негативан на поменуте SNP-ове. Према YFull-у Y3116 је настао вероватно пре 3400 до 2200 година https://www.yfull.com/tree/I-Y3120/ . Наравно, овај узорак може бити и млађи, јер сви до сада испитани припадници I2-Y3120 су позитивни н на Y3116.

Хвала на овом појашњењу.

 :)


То мења и мој угао гледања. Збуњује у причи о њему тај ауто сомални резултат...?

И да исправим своју грешку није реч о процени старости целе  I2a (ненамерна грешка), већ ту мислим на њену грану ПХ 908.

Али, хајде да сачекам.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: filipi Новембар 11, 2021, 08:17:57 пре подне
Iz ovog rada bit će i 15 uzoraka iz Slovenije i 20 iz Hrvatske.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милан Петровић Новембар 11, 2021, 08:30:01 пре подне
Гујо, само низводне гране оспод FT277965 су читане, а не и сама FT277965?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: нцп Новембар 11, 2021, 08:30:04 пре подне
Из поменутог рада

"Large-Scale Migration into Southern Britain During the Middle to Late Bronze Age", Harvard.

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB47891?show=reads

Пројекат: ПРЈЕБ47891

Данашње становништво из Енглеске и Велса има више порекла који потичу од раних европских фармера (ЕЕФ) него људи из раног бронзаног доба.

Да бисмо проучили како се то догодило, генерисали смо податке о геному од 803 особе, скоро све из средњег до касног бронзаног доба и гвозденог доба, повећавајући податке у овом периоду из Британије за 12 пута, а из западне и централне Европе за више него двоструко.

 Између 1000-875 пре нове ере, ЕЕФ порекло се повећало у јужној Британији (Енглеска и Велс), али не и у северној Британији (Шкотска), због укључивања у популацију тока миграната који су стигли у ово време и у претходним вековима и који су генетски најсличнији античким појединцима из Француске.
Ови мигранти су кумулативно допринели око половине порекла људи из гвозденог доба у Енглеској и Велсу, чиме се документује раније непознати демографски процес који је вероватан вектор за ширење раних келтских језика у Британију.

 Ови обрасци су део ширег тренда пропорција ЕЕФ предака који постају сличнији широм централне и западне Европе у средњем и касном бронзаном добу, што се подудара са интензивирањем културне размене и наглашавањем овог периода као врхунца интеракције и мобилности. Не налазимо доказе о упоредивој стопи миграција у Британију у гвозденом добу.

Различите генетске путање Британије и континенталне Европе у гвозденом добу такође су илустроване чињеницом да је алел који даје перзистентност лактазе порастао на ~50% учесталости у Британији до тог времена, док је био само ~7% у Централној Европи и прошао је упоредиву пораст учесталости само миленијум касније, ::)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Новембар 11, 2021, 09:48:21 пре подне
Гујо, само низводне гране оспод FT277965 су читане, а не и сама FT277965?

Тако је Милане, FT277965 нажалост није очитан.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милан Петровић Новембар 11, 2021, 10:50:30 пре подне
Тако је Милане, FT277965 нажалост није очитан.
Хвала.
То значи да је и даље могуће FT277965 и Y93865?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 17, 2021, 08:30:40 пре подне
Препринт рада о неолитском становништву Европе и Анадолије

Demogenomic modeling of the timing and the processes of early European farmers differentiation
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.11.23.394502v2
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.11.23.394502v2.full.pdf
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.11.23.394502v2.supplementary-material

Секвенцирано је 15 нових узорака, од којих су неки и са наших налазишта. Ово је преглед узорака са Y и MTDNA хаплогрупама.

(https://i.postimg.cc/7PsTnXFN/new-study.png)

Један од закључака из рада:
"Based on demogenomic modeling of high-quality ancient genomes, we show that the early farmers of Anatolia and Europe emerged from a multiphase mixing of a Near Eastern population with a strongly bottlenecked Western hunter-gatherer population after the Last Glacial Maximum."

Географска позиција нових узорака.

(https://i.postimg.cc/6pdrcnL5/new-study-map.png)


Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 17, 2021, 08:42:01 пре подне
Још један препринт везан за каснонеолитску Трипољску културе са новим узорцима из Вертеба пећине у Западној украјини.

https://www.researchsquare.com/article/rs-1044480/v1

(https://i.postimg.cc/tT59pqQH/verteba.png)

Један од закључака из рада:

"The results reveal that the CTCC individuals’ ancestry is related to both western hunter gatherers and Near Eastern farmers, lacks local ancestry associated with Ukrainian Neolithic hunter gatherers and has steppe ancestry."
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Новембар 17, 2021, 01:30:47 поподне
Још један препринт везан за каснонеолитску Трипољску културе са новим узорцима из Вертеба пећине у Западној украјини.

https://www.researchsquare.com/article/rs-1044480/v1

(https://i.postimg.cc/tT59pqQH/verteba.png)

Један од закључака из рада:

"The results reveal that the CTCC individuals’ ancestry is related to both western hunter gatherers and Near Eastern farmers, lacks local ancestry associated with Ukrainian Neolithic hunter gatherers and has steppe ancestry."

Зна ли се којим подгранама припадају ова два I2a узорка?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 17, 2021, 01:43:49 поподне
Зна ли се којим подгранама припадају ова два I2a узорка?

У раду наводе да су користили Yleaf за извлачење хаплогрупа, а ако су користили посљедњу верзију Yleaf онда би то требала бити номенкалтура ISOGG 2019,тј. ова два I2 узорка би требала припадати гранама I2-M423>L161 (Isles) и I2-L596
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Новембар 17, 2021, 01:45:44 поподне
У раду наводе да су користили Yleaf за извлачење хаплогрупа, а ако су користили посљедњу верзију Yleaf онда би то требала бити номенкалтура ISOGG 2019,тј. ова два I2 узорка би требала припадати гранама I2-M423>L161 (Isles) и I2-L596

Видех да су за једног написали да је I2a2 а други да је I2a1, па ми је то створило недоумицу. Који је онда овај I2c?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 17, 2021, 02:04:30 поподне
Видех да су за једног написали да је I2a2 а други да је I2a1, па ми је то створило недоумицу. Који је онда овај I2c?

Изгледа да су ипак користили старију верзију YLeaf односно ISOGG јер I2c нема на  стаблу 2019. I2c се посљедњи пут користило на стаблу из 2017. године. И ако се примјени то стабло, онда ствар овако стоји:
I2a2a1- M223>CTS616
I2a1a2a- L1286
I2c- L596

Мислим да је ово исправно одређење.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 17, 2021, 02:14:26 поподне
Ако примјенимо стабло ISOGG 2017 за хаплогрупу G2a у овом раду добијамо одређење за двије гране:

https://www.yfull.com/tree/G-Z6885/ G2a2b2a3
https://www.yfull.com/tree/G-PF3177/ G2a2a1a
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Новембар 17, 2021, 04:23:30 поподне
Изгледа да су ипак користили старију верзију YLeaf односно ISOGG јер I2c нема на  стаблу 2019. I2c се посљедњи пут користило на стаблу из 2017. године. И ако се примјени то стабло, онда ствар овако стоји:
I2a2a1- M223>CTS616
I2a1a2a- L1286
I2c- L596

Мислим да је ово исправно одређење.

Један од узорака из мокринске културе је такође L1286, као и још један древни узорак са територије Србије. Изгледа да је у неолиту и бронзаном добу ова подграна I2 хаплогрупе била једна од чешћих на нашим просторима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Новембар 18, 2021, 06:20:12 пре подне
Препринт рада о неолитском становништву Европе и Анадолије

Demogenomic modeling of the timing and the processes of early European farmers differentiation
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.11.23.394502v2
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.11.23.394502v2.full.pdf
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.11.23.394502v2.supplementary-material

Секвенцирано је 15 нових узорака, од којих су неки и са наших налазишта. Ово је преглед узорака са Y и MTDNA хаплогрупама.

(https://i.postimg.cc/7PsTnXFN/new-study.png)

Један од закључака из рада:
"Based on demogenomic modeling of high-quality ancient genomes, we show that the early farmers of Anatolia and Europe emerged from a multiphase mixing of a Near Eastern population with a strongly bottlenecked Western hunter-gatherer population after the Last Glacial Maximum."

Географска позиција нових узорака.

(https://i.postimg.cc/6pdrcnL5/new-study-map.png)
Цитат
Demographic scenario inferred from the sampled genomes.
(A) This demographic history was obtained by compiling the best models of all tested scenarios (see Supp. Text - Demographic inferences with fastsimcoal2 - Final Model). Times of the events (y-axis) and population ages (shown below their symbol) are indicated in ky BP. Under each population name, we indicate their sampled genomes, their diploid population size and their associated inbreeding coefficient. Empty symbols indicate ancestral populations we simulated after or before key events (admixture or split). The X symbols indicate bottlenecks that occurred on ancestral branches, modeled as one generation bottleneck through a population of a size indicated in italic. Admixture proportions >10% from the Western metapopulation populations are represented with green arrows. (B) MDS analysis performed on data simulated according to the parameters of the scenario shown in pane A. Empty symbols are for simulated ancestral populations; grey arrows indicate the trajectory of the populations after admixture events and/or episodes of drift.
(https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2021/11/15/2020.11.23.394502/F3.large.jpg)
Цитат
Fig. 4
Possible scenario of the population history of SW Asia and Europe between the Last Glacial Maximum (LGM) and the early Neolithic period, i.e. approximately 26,000 to 7,000 years ago.

Colored shaded areas indicate putative distributions of populations at different time points. See main text for a detailed description. Note that warmer periods (Bölling, Allerød interstadials; Holocene) correspond to population range expansions while colder periods (LGM, Older Dryas) are associated with contractions.
(https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2021/11/15/2020.11.23.394502/F4.large.jpg)
https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=1791.msg147312#msg147312
https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=1791.msg147359#msg147359
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Драган Обреновић Новембар 24, 2021, 09:09:22 пре подне
На FTDNA групи "R1b Y DNA project" на фејсбуку објављени су резултати анализе узорака из већ дискутоване студије "Large-Scale Migration into Southern Britain During the Middle to Late Bronze Age", који припадају некој подграни хаплогрупе R1b.

У неким случајевима, покривеност узорка је била слабија, па резултат није нужно најмлађа (терминална) хаплогрупа којој узорак припада, већ најмлађи SNP који се могао очитати. Такође, нису сви скелети из студије географски из Британије (прва колона је идентификатор узорка, тј. префикс назива BAM фајла).

Питао сам да ли је FTDNA објављивао резултате и за анализиране скелете које су припадали другим хаплогрупама - чекам одговор.


I16394  R-P297       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297
I13621  R-P297       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297
I16269  R-P297       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297
I19207  R-M269       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269
I11631  R-M269       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269
I2824   R-M269       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269
I12900  R-M269       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269
I13026  R-M269       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269
I2575   R-M269       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269
I21315  R-M269       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269
I20740  R-M269       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269
I20634  R-M269       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269
I14468  R-M269       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269
I20624  R-M269       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269
I19722  R-M269       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269
I16086  R-M269       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269
I16467  R-M269       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269
I16479  R-M269       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269
I19047  R-M269       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269
I16791  R-M269       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269
I1774   R-M269       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269
I17616  R-M269       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269
I17613  R-M269       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269
I14188  R-L51        R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51
I26829  R-PF7589     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>PF7589
I15955  R-CTS6889    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>PF7589>CTS10379>CTS6889
I25507  R-BY61900    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>PF7589>CTS10379>CTS6889>BY61900
I12110  R-Z6817      R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>PF7589>CTS10379>CTS6889>Z2120>FGC48821>S1141>CTS11824>CTS11659>Z6817
I18531  R-A614       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>PF7589>CTS10379>CTS6889>Z2120>FGC48821>S1141>CTS11824>CTS11659>Z6817>A614
I2598   R-P310       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310
I17324  R-P310       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310
I3083   R-P310       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310
I3019   R-P310       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310
I21403  R-P310       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310
I21307  R-P310       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310
I14097  R-P310       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310
I17320  R-P310       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310
I20827  R-P310       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310
I2693   R-P310       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310
I20632  R-P310       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310
I20625  R-P310       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310
I11146  R-P310       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310
I16600  R-P310       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310
I5440   R-L151       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151
I19653  R-L151       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151
I13623  R-L151       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151
I14200  R-L151       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151
I11715  R-L151       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151
I16422  R-L151       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151
I20517  R-L151       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151
I14743  R-L151       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151
...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Драган Обреновић Новембар 24, 2021, 09:11:02 пре подне
...наставак...


I3320   R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I21313  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I21308  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I18529  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I12774  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I3321   R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I2569   R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I13028  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I10342  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I2656   R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I19363  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I2470   R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I13728  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I22065  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I13754  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I21399  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I19360  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I17145  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I17323  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I20735  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I19046  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I14552  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I14742  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I14803  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I14809  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I14859  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I6776   R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I20525  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I14987  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I16273  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I20522  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I15033  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I19990  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I19358  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I17146  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I16469  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I16475  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I17607  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I2695   R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I16440  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I3315   R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I14105  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I13620  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I20989  R-P312       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312
I26830  R-S4281      R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>DF19>DF88>FGC11833>S4281
I16400  R-Z290       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290
I16454  R-Z290       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290
I27380  R-Z290       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290
I16455  R-Z290       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290
I16591  R-Z290       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290
I19858  R-Z290       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290
I5505   R-L21        R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21
I19211  R-L21        R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21
I14353  R-L21        R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21
I14358  R-L21        R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21
I16458  R-L21        R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21
I16488  R-L21        R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21
I13680  R-L21        R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21
I13713  R-L21        R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21
I27384  R-L21        R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21
I20586  R-L21        R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21
I3566   R-L21        R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21
I12793  R-L21        R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21
I2611   R-L21        R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21
I20630  R-L21        R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21
I12926  R-L21        R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21
I19855  R-L21        R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21

...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Драган Обреновић Новембар 24, 2021, 09:11:54 пре подне
I5508   R-BY11863    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>A5846>BY11863
I19868  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I16599  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I13615  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I13712  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I13731  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I13760  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I21305  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I21302  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I21277  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I14100  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I14104  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I21181  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I21180  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I18606  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I20628  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I19911  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I12786  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I19863  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I19656  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I7629   R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I16403  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I16405  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I16504  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I11991  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I11992  R-DF13       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13
I12783  R-DF21       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>DF21
I12785  R-DF21       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>DF21
I12935  R-DF21       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>DF21
I21272  R-S5488      R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>DF21>S5488
I11153  R-FGC33066   R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>DF21>S5488>BY518>FGC33060>FGC33066
I11156  R-CTS8704    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>DF21>Z30233>CTS8704
I12778  R-DF5        R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>DF21>Z30233>CTS8704>Z246>DF25>DF5
I16611  R-Z16539     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>DF21>Z30233>CTS8704>Z246>DF25>DF5>FGC3899>ZZ32_1>CTS3655>Z16539
I12775  R-BY9405     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>DF21>Z30233>BY9405
I13730  R-S5668      R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>L513>S5668
I2982   R-Z16400     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>L513>S6365>Z16400
I20997  R-A286       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>FGC11134>FGC12055>A286
I14096  R-FTA11009   R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>FGC11134>BY105095>FTA11009
I16592  R-FGC19329   R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>FGC5494>FGC5561>FGC19329
I12927  R-PR1289     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>FGC5494>FGC5561>FGC5495>FGC7448>FGC5496>PR1289
I11142  R-PR1289     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>FGC5494>FGC5561>FGC5495>FGC7448>FGC5496>PR1289
I19044  R-FT50512    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>FGC5494>FGC5561>FGC5495>FGC7448>FGC5496>PR1289>FT50512
I13732  R-A7835      R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>FGC5494>A7835
I14800  R-Z253       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>ZZ10_1>Z253
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Драган Обреновић Новембар 24, 2021, 09:14:13 пре подне
I13689  R-BY4297     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>ZZ10_1>Z253>Z2534>ZZ5_1>Z2185>A7037>BY4297
I17264  R-BY4297     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>ZZ10_1>Z253>Z2534>ZZ5_1>Z2185>A7037>BY4297
I27385  R-L1066      R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>ZZ10_1>Z253>Z2534>ZZ5_1>Z2185>BY44331>Z2186>Z2183>L1066
I3568   R-A277       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>ZZ10_1>Z253>Z2534>ZZ5_1>A16>BY10>A14>A277
I3567   R-FT221759   R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>ZZ10_1>Z253>Z2534>ZZ5_1>A16>BY10>A14>FT221759
I14102  R-FT84170    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>ZZ10_1>Z253>BY4086>BY312>FT199713>FT84170
I11150  R-FT335377   R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>ZZ10_1>Z253>BY4086>FGC17436>A494>FGC73657>FT335377
I20583  R-BY175423   R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>ZZ10_1>Z253>FGC3268>FT31956>BY175423
I5509   R-PH4760     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>ZZ10_1>CTS10201>PH4760
I21182  R-BY15941    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>BY15941
I2799   R-DF49       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>DF49
I16597  R-DF49       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>DF49
I14807  R-DF49       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>DF49
I14347  R-DF23       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>DF49>Z2980>Z2976>DF23
I22060  R-BY154824   R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>DF49>Z2980>Z2976>DF23>Z2961>ZP75>ZP77>A8255>BY154824
I27382  R-BY116228   R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>DF49>Z2980>Z2976>DF23>BY35099>BY113887>BY116228
I16499  R-ZP18       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>DF49>ZP20>FGC11175>ZP21>ZP18
I16380  R-ZP298      R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>DF49>ZP298
I13753  R-Z251       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>Z251
I11145  R-Z251       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>Z251
I27379  R-FGC56332   R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>Z251>Z16943>CTS4157>FGC56344>FGC56332
I17016  R-BY3231     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>Z251>S11556>S9294>BY3229>BY3231
I14553  R-S15808     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>Z251>S11556>S9294>A10556>S15808
I17260  R-S1051      R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>S1051
I21312  R-Z22253     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>S1051>Z22253
I21309  R-FGC33840   R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>S1051>FGC17906>FGC33841>FGC33840
I11144  R-A9857      R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>Z16500>A8816>A9857
I19909  R-BY9003     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>FGC35996>BY9003
I22062  R-BY23382    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>FGC35996>BY23382
I17143  R-BY23433    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>FT404207>BY23433
I13726  R-BY23964    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF13>Z39589>BY23964
I13710  R-DF63       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF63
I17261  R-DF63       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF63
I17014  R-DF63       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF63
I5511   R-DF63       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF63
I20587  R-DF63       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF63
I20987  R-DF63       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF63
I2448   R-DF63       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF63
I13714  R-CTS6919    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF63>CTS6919
I14107  R-CTS6919    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF63>CTS6919
I11997  R-FGC36434   R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF63>BY592>Z16245>Z16246>Z17553>BY3070>BY3004>BY7782>FGC36434
I11151  R-FT44983    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF63>BY592>A7810>FT44983
I13711  R-BY28644    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF63>FT91736>BY28644
I14380  R-FTB53005   R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>Z290>L21>S552>DF63>FT42464>FTB53005
I16503  R-Z30597     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>FGC84729>ZZ37_1>ZZ38_1>Z30597
I16416  R-Z30597     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>FGC84729>ZZ37_1>ZZ38_1>Z30597
I18530  R-L2         R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2

...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Драган Обреновић Новембар 24, 2021, 09:15:46 пре подне
I14191  R-L2         R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2
I14189  R-L2         R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2
I14185  R-L2         R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2
I12103  R-L2         R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2
I5690   R-L2         R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2
I1389   R-L2         R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2
I13794  R-L2         R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2
I13793  R-L2         R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2
I10348  R-L2         R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2
I13792  R-L2         R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2
I16182  R-L2         R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2
I13758  R-L2         R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2
I11160  R-L2         R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2
I11701  R-L2         R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2
I15041  R-L2         R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2
I14984  R-L2         R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2
I14986  R-L2         R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2
I18489  R-L2         R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2
I24342  R-L2         R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2
I18490  R-FTC607     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2>FGC59563>DF90>FGC14641>FGC59581>FTC607
I25504  R-S18462     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2>FGC59563>DF90>FGC14641>S18462
I18492  R-FTC607     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2>FGC59563>DF90>FGC14641>FGC59581>FTC607
I19873  R-BY3616     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2>Z49>Z142>Z12222>BY3616
I11712  R-BY33533    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2>Z49>Z142>Z12222>BY33533
I20589  R-Z52        R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2>Z49>Z142>Z51>L562>Z57>Z148>Z149>Z52
I19916  R-BY33655    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2>Z49>Z142>Z51>L562>BY158668.1>BY186156>FT15832>BY33655
I13786  R-BY96884    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2>Z49>BY96884
I5695   R-BY96884    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2>Z49>BY96884
I5696   R-BY96884    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2>Z49>BY96884
I5288   R-BY55682    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2>Z49>BY96884>BY55682
I15951  R-FGC22516   R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2>FGC22501>FGC22538>FGC22516
I18837  R-PAGES00073 R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2>FGC22501>FGC22538>PAGES00073
I21402  R-PH4714     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2>ZZ48_1>PH4714
I15954  R-BY96779    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2>ZZ48_1>BY96779
I20982  R-L20        R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2>Z258>Z367>L20
I14192  R-S1610      R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>L2>Z258>Z367>L20>Z291>BY198578>S1610
I20817  R-Z37        R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>Z36>CTS5531>Z54>CTS1595>Z37
I15048  R-BY32273    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>Z36>A7966>A7982>BY32273
I25519  R-BY39621    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>Z36>FT344906>BY9459>V2488>BY39621
I15042  R-PF6658     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>U152>PF6658
I20519  R-Z209       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>DF27>Z195>Z274>Z209
I21306  R-BY31082    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>DF27>Z195>Z274>DF17>CTS13028>FT44718>FGC14113>BY31082
...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Драган Обреновић Новембар 24, 2021, 09:16:30 пре подне
Последњи део:

I11713  R-BY3268     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>DF27>Z195>Z198>CTS4188>S14445>Z29704>BY3268
I19991  R-Y31393     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>DF27>ZZ12_1>Z225>Y16019>Y31393
I14861  R-FGC23071   R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>DF27>ZZ12_1>FGC23071
I15027  R-BY164284   R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>DF27>ZZ12_1>BY3332>PH4023>BY164284
I14327  R-BY41416    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>DF27>ZZ12_1>FGC78762>ZZ19_1>Z31644>FT318890>A431>A432>FGC70972>BY41416
I13682  R-BY168376   R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>DF27>ZZ12_1>FGC78762>ZZ19_1>Z31644>FT150984>BY168376
I6769   R-BY168376   R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>DF27>ZZ12_1>FGC78762>ZZ19_1>Z31644>FT150984>BY168376
I16450  R-FT32396    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>DF27>ZZ12_1>FGC78762>ZZ19_1>Z31644>FGC78763>A2146>PH133>FT32396
I12413  R-BY50764    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>DF27>ZZ12_1>FGC78762>ZZ19_1>Z31644>FGC78763>BY14233>FGC18052>BY50764
I5502   R-FT96564    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>DF27>ZZ12_1>FGC78762>ZZ19_1>Z31644>FGC78763>FGC13128>FT21556>BY33282>FT96564
I13759  R-BY3865     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>DF27>ZZ12_1>FGC78762>ZZ19_1>Z34609>Z2571>CTS11567>BY3865
I12771  R-FT5780     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>DF27>ZZ12_1>FGC78762>BY21074>BY21075>FT5780
I11143  R-FT5780     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>DF27>ZZ12_1>FGC78762>BY21074>BY21075>FT5780
I19857  R-L617       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>P312>ZZ11>DF27>ZZ12_1>Z2552>L617
I13025  R-U106       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>U106
I11972  R-Z381       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>U106>Z2265>BY30097>Z381
I11149  R-Z156       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>U106>Z2265>BY30097>Z381>Z156
I23978  R-FT221936   R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>U106>Z2265>BY30097>Z381>Z156>S5520>FT221936
I17019  R-Z304       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>U106>Z2265>BY30097>Z381>Z156>Z306>Z307>Z304
I12907  R-Z304       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>U106>Z2265>BY30097>Z381>Z156>Z306>Z307>Z304
I13788  R-Z304       R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>U106>Z2265>BY30097>Z381>Z156>Z306>Z307>Z304
I15950  R-BY12482    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>U106>Z2265>BY30097>Z381>Z156>Z306>Z307>Z304>BY12480>BY12482
I3035   R-A7208      R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>U106>Z2265>BY30097>Z381>Z156>Z306>Z307>Z304>BY12480>FGC8365>DF96>FGC13326>FGC79603>A7208
I7632   R-CTS4528    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>S1194>CTS4528
I18838  R-CTS4528    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>S1194>CTS4528
I18835  R-CTS4528    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>L51>P310>L151>S1194>CTS4528
I17312  R-M12149     R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>Z2103>M12149
I13467  R-Z2109      R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>Z2103>M12149>Z2106>Z2109
I23207  R-CTS7556    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>Z2103>M12149>Z2106>Z2109>CTS7822>CTS7556
I23209  R-CTS7556    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>Z2103>M12149>Z2106>Z2109>CTS7822>CTS7556
I14983  R-PH925      R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>Z2103>M12149>Z2106>Z2109>CTS7822>PH925
I4996   R-BY31671    R-M207>M173>M343>L754>L389>P297>M269>L23>Z2103>M12149>Z2106>Z2109>Y14416>FT47913>Y14513>Y14515>Y14414>Y16158>Y16005>BY31671
I26735  R-FT83437    R-M207>M173>M343>L754>PF6323>V88>PF6343>PF6287>BY17643>BY17644>BY111613>FT83437
I15826  R-FTC352     R-M207>M173>M343>L754>PF6323>V88>PF6343>FTC352
I15650  R-FTC352     R-M207>M173>M343>L754>PF6323>V88>PF6343>FTC352
I15648  R-FTC352     R-M207>M173>M343>L754>PF6323>V88>PF6343>FTC352
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Новембар 25, 2021, 03:21:07 поподне
На FTDNA групи "R1b Y DNA project" на фејсбуку објављени су резултати анализе узорака из већ дискутоване студије "Large-Scale Migration into Southern Britain During the Middle to Late Bronze Age", који припадају некој подграни хаплогрупе R1b.

У неким случајевима, покривеност узорка је била слабија, па резултат није нужно најмлађа (терминална) хаплогрупа којој узорак припада, већ најмлађи SNP који се могао очитати. Такође, нису сви скелети из студије географски из Британије (прва колона је идентификатор узорка, тј. префикс назива BAM фајла).

Питао сам да ли је FTDNA објављивао резултате и за анализиране скелете које су припадали другим хаплогрупама - чекам одговор.

Проверио сам све J2b2a узорке добре покривености, и занимљиво је да већина њих припада грани PH1602>Y86930 (https://www.yfull.com/tree/J-Y86930/):

I23911; J2b2a1a1a1b2-Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930>FT115799
I24638; J2b2a1a1a1b2-Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930>FT115799
I24882; J2b2a1a1a1b2-Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930 (xFT115799)
I23995; J2b2a1a1a1b2-Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930 (xFT150993)
I24639; J2b2a1a1a1b2-Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930 (xFT150993)
I26742; J2b2a1a1a1b2-Y15058>Z38240>Z38241 (xFT108123,Y130843,Y91418,PH502,Y86930)
I26726; J2b2a1a1a1a1a-Z638>Z1297 (xY27522,Y21878,Z8421)
I5691; J2b2a1a1a-Z597 (xZ2507,FT29034,FGC64029)

Већина ових узорака требала би бити са подручја Хрватске, осим последњег на листи, за који сигурно знамо да је из Словеније, па је могуће да је управо ова грана била заступљена/доминантна међу Либурнима, Јаподима и/или Далматима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Децембар 08, 2021, 12:50:17 пре подне
Доступни су резултати из препринта "Social stratification without genetic differentiation at the site of Kulubnarti in Christian Period Nubia".

На брзину погледах:

I6255   S50   J-M92 (xZ504   CTS333-)
I6325   S73   J-M92 (xZ504   CTS333-)
I17475   S144   J-M92 (xZ8096 xSK1344     CTS4132-   Z6256-)

изгледа да су нека неоткривена Ј-М92 грана.

Започео, I19140 R123 LT


Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Децембар 16, 2021, 03:54:51 поподне
Не знам је ли већ било, знам да се знало да је Бела III R1a:

Genome-wide autosomal, mtDNA, and Y chromosome analysis of King Bela III of the Hungarian Arpad dynasty

https://www.nature.com/articles/s41598-021-98796-x?fbclid=IwAR0POGvQvrDjFb354uE5JtHgGzFvoL2t5hk3KlWGxZQHC4-FRf6OYAwoun8


Image(s) Illustration(s) Béla III (King Bela III \'Harmadik\' King of Hungary) of Árpád King of Hungary & Croatia
(http://photos.geni.com/p13/63/c9/15/57/534448399fc19902/iii_large.jpg)
(http://farm3.staticflickr.com/2853/10076980715_a6f82f5070_o.jpg)
https://www.nature.com/articles/s41598-021-98796-x/figures/1
(https://media.springernature.com/full/springer-static/image/art%3A10.1038%2Fs41598-021-98796-x/MediaObjects/41598_2021_98796_Fig1_HTML.png)
Бела III је по аутосомалној генетици близак данашњим Мађарима и Хрватима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Децембар 18, 2021, 09:35:22 пре подне
Да ли је на форуму помињан рад који је скоро објављен Genomic transformation and social organization during the Copper Age–Bronze Age transition in southern Iberia?
https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.abi7038#

Да ли је неко овдје или на мрежи провјеравао узорак BAS025? Колико сам видио на брзину тај узорак би требао бити L618+, V13-
Југ Иберије, око 2000 г. пне , не знам да ли упада у групу ранијег становништва или у степске дошљаке.
Колико видим негативан је и на ниво који се налази између L618 и V13, CTS10912. Требао би дакле бити прави L618* , с тим да не знам да ли цијепа и тај ниво, има доста позиција за преглед, па нисам провјеравао.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Децембар 18, 2021, 10:45:59 пре подне
Да ли је на форуму помињан рад који је скоро објављен Genomic transformation and social organization during the Copper Age–Bronze Age transition in southern Iberia?
https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.abi7038#

Да ли је неко овдје или на мрежи провјеравао узорак BAS025? Колико сам видио на брзину тај узорак би требао бити L618+, V13-
Југ Иберије, око 2000 г. пне , не знам да ли упада у групу ранијег становништва или у степске дошљаке.
Колико видим негативан је и на ниво који се налази између L618 и V13, CTS10912. Требао би дакле бити прави L618* , с тим да не знам да ли цијепа и тај ниво, има доста позиција за преглед, па нисам провјеравао.

Проверио сам га ја, BAS025 је L618>pre-CTS10912 (https://www.yfull.com/tree/E-CTS10912/).


ниво CTS10912: PF2126/CTS1975+ G>A (2A); PF2252- G>A (5G)


Сви SNP-ови на нивоу L618 су позитивни, а сви SNP-ови на нивоима испод CTS10912 (BY6578, Y182141 и V13) су негативни.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Децембар 18, 2021, 10:56:41 пре подне
Проверио сам га ја, BAS025 је L618>pre-CTS10912 (https://www.yfull.com/tree/E-CTS10912/).


ниво CTS10912: PF2126/CTS1975+ G>A (2A); PF2252- G>A (5G)


Сви SNP-ови на нивоу L618 су позитивни, а сви SNP-ови на нивоима испод CTS10912 (BY6578, Y182141 and V13) су негативни.

Хвала, Гујо. Јеси ли можда провјеравао и овај M423 узорак CDM004? Једино што сам стигао д апрегледам јесте да има нека позитивна читања на нивоу М423 и негативна на нивоу Y3104. Сумњам на иберијску грану I-Y24694, али видим да ту има доста непокривених позиција, па нисам гледао до краја.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Децембар 22, 2021, 09:24:02 поподне
Навали народе.

Large-scale migration into Britain during the Middle to Late Bronze Age
 (https://www.nature.com/articles/s41586-021-04287-4?fbclid=IwAR0ilv9TnBgFOlpZEAtP9UjNQnx8Vd1_8V44XUj5foSA7otp2vAlmJUi2Rk)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Децембар 22, 2021, 09:41:27 поподне
За муштулук.

Цитат
I18719   P3779; BzV 10a   Pinhasi, Ron   This study   Context: Archaeological - Period   3200   144   1500-1000 BCE   Croatia_MBA_LBA   Bezdanjača Cave   Croatia   44.8520052   15.4199444   1240K   2   3.747999   825868   M   n/a (no relatives detected)   I-Y3120
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ojler Децембар 22, 2021, 09:53:14 поподне
За муштулук.

Упс...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Децембар 22, 2021, 10:00:42 поподне
За муштулук.

Да, сад сам и ја видио. Вјерујем ипак да се ради о грешци у датирању узорка. Нема логике, не само због хаплогрупе, већ и због аутосомалне слике.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ojler Децембар 22, 2021, 10:02:36 поподне
Да, сад сам и ја видио. Вјерујем ипак да се ради о грешци у датирању узорка. Нема логике, не само због хаплогрупе, већ и због аутосомалне слике.

Шта год да је, остаје забележено. Неће сад нико моћи жив остати од аутохтонаша...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Децембар 22, 2021, 10:13:29 поподне
 Шарић вас поништи. ;D Зачудио сам се недавно колико "casual" људи зна за Шарића а не зна за Порекло, и сличне пројекте. Кад се прича о поријеклу углавном помињу Шарића, не само у Србији већ и другдје.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Децембар 22, 2021, 10:20:43 поподне
Шта год да је, остаје забележено. Неће сад нико моћи жив остати од аутохтонаша...

Ако сам добро разумио, аутори рада нису радили радиокарбонску датацију, већ су за тај узорак из Бездањаче преузели неке претходно рађене. "Radiocarbon analysis of several wood samples from the site yielded dates of 1350–1100 BCE (Sliepčević and Srdoč 1979/1980). Recent radiocarbon dates for two individuals from Bezdanjača align with the previous radiocarbon dates from the same site." "A petrous bone from one of the individuals (BzV 10a) excavated from the eastern channel yielded sample I18719 (male). This mature adult displayed possible peri-mortem trauma. Unfortunately, only the left side of the cranium is preserved."
На табели Supplementary Table 4: Direct radiocarbon dates for which this study serves as the primary report (n=123),  нема излистаног I18719. Не знам да ли то значи, да му они нису радили радиокарбонско датирање.

При томе је изгледа било и неке контаминације.
S18719.Y1.E1.L1   no red flags
S18719.Y1.E2.L1   Xcontam=[0.005,0.01]

Не би ме чудило да се ради о остацима неке жртве из Другог свјетског рата.


Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Децембар 22, 2021, 10:39:05 поподне
Довољно је упоредити аутосомалну слику свих претходних и ''илирских'' резултата из ове студије и видети да овај узорак нема никакве везе са њима, који плотују ка Италијанима и Шпанцима, већ је близак савременим јужнословенским популацијама. Како су у раду учествовали и знаственици из Загреба, све је могуће.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Децембар 22, 2021, 10:45:05 поподне
Проверио сам све J2b2a узорке добре покривености, и занимљиво је да већина њих припада грани PH1602>Y86930 (https://www.yfull.com/tree/J-Y86930/):

I23911; J2b2a1a1a1b2-Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930>FT115799
I24638; J2b2a1a1a1b2-Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930>FT115799
I24882; J2b2a1a1a1b2-Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930 (xFT115799)
I23995; J2b2a1a1a1b2-Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930 (xFT150993)
I24639; J2b2a1a1a1b2-Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930 (xFT150993)
I26742; J2b2a1a1a1b2-Y15058>Z38240>Z38241 (xFT108123,Y130843,Y91418,PH502,Y86930)
I26726; J2b2a1a1a1a1a-Z638>Z1297 (xY27522,Y21878,Z8421)
I5691; J2b2a1a1a-Z597 (xZ2507,FT29034,FGC64029)

Већина ових узорака требала би бити са подручја Хрватске, осим последњег на листи, за који сигурно знамо да је из Словеније, па је могуће да је управо ова грана била заступљена/доминантна међу Либурнима, Јаподима и/или Далматима.

Узорци јесу из Хрватске, тачније из Лике (Смиљан). Данас је ова подграна присутна код Хрвата из Босне, а паралелне J-PH1602 подгране присутне су и широм српског етничког подручја. Важан резултат за припаднике J2b1-M241>PH1602, мада се и раније наслућивала веза ове хаплогрупе Илирима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Децембар 22, 2021, 10:51:16 поподне
Узорци јесу из Хрватске, тачније из Лике (Смиљан). Данас је ова подграна присутна код Хрвата из Босне, а паралелне J-PH1602 подгране присутне су и широм српског етничког подручја. Важан резултат за припаднике J2b1-M241>PH1602, мада се и раније наслућивала веза ове хаплогрупе Илирима.

По локацији упада у јаподску зону, по датацији у неки протојаподски период.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Децембар 23, 2021, 01:55:30 пре подне
За муштулук.
Биће лако утврдити да ли овај I-Y3120 потиче из бронзаног доба, средњег века или од археолога који су руковали узорком. Ако је скоријег датума вероватно ће бити позитиван и на неки SNP присутан у подгрупама I-Y3120. Ако је ипак из бронзаног доба, уклапа се у оно се може закључити о I-Y3120 на основу данашњих популација. У бронзано доба била је присутна у горњем Подунављу, а најкасније у антици стигла је до Источне Европе, али нам није познат њен пут између тих подручја. Различите подгрупе E-V13, J2b, R1b и других хаплогрупа имају распоред који сугерише да су се у бронзаном добу и касније шириле из горњег Подунавља према Источној Европи и Балкану. Зато не би било чудо наћи I-Y3120 на бронзанодобном Балкану. Очигледно, I-Y3120 у Источној Европи је била плоднија.

Мапа аутосомалне блискости узорка I18719 (I2-Din) модерним популацијама, на основу које је готово извесно да је у питању средњовековни узорак, или, праштајте на дрскости, средњовековни Србин ;D :

(https://i.imgur.com/9PKTV2o.png)
Ова мапа се може тумачити сеобом Словена од Карпата према ка доњем Подунављу, а одатле ка горњем и према Балкану и Лаби, мада тешко да су Словени стигли до западне Француске. Можда је реч о неким источногерманским везама.

Друго објашњење би било ширење из горњег Подунавља на запад ка Француској и на исток низ Дунав све до Карпата где би ушла у састав Словена. Одсуство блискости у Турској и на острвима Егеја сугерише да је ова аутосомална генетика на истоку Балкана присутна тек одскора.

Треће, басен Дунава може се посматрати као место где су се сударали генетски утицаји са Медитерана, са истока и запада Европе. Места где су ти утицаји у равнотежи одговарају максималним вредностима блискости данашњих популација узорку I18719, па те популације нису нужно његови блиски рођаци, само имају сличну аутосомалну мешавину као он.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Децембар 23, 2021, 07:44:28 пре подне
Које би објашњење било за овај узорак:

I23205   I23205   Grave 226; P7485   Pinhasi, Ron   This study   Context: Archaeological - Period   3900   87   2100-1800 BCE   Serbia_Mokrin_EBA_Maros   
North Banat, Kikinda, Mokrin
Serbia   45,934722   20,404444   1240K   1   6   838781   M   
North Banat District, Kikinda, Mokrin Necropolis Family A (7 members) (MOK28A.SG-MOK23.SG have a 1d relationship; MOK28A.SG-MOK20.SG have a 2d or 3d relationship; MOK28A.SG-I23205 have a 2d or 3d relationship; I23205-MOK12.SG have a 2d or 3d relationship; I23205-MOK17A.SG have a 2d or 3d relationship; I23205-MOK18A.SG have a 2d or 3d relationship)
I-L161   I2a1a2

?

Видим да су пронашли и објавили у овом раду још узорака те хг у Британији. Чини ми се да је закључак да је она у Бронзаном добу дошла у Британију из централне Европе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: barbarylion Децембар 23, 2021, 07:50:17 пре подне
Gde može da se dođe do tog uzorka? Da li ga je neko propustio kroz ove popularne računače? Eurogenes i slično?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Децембар 23, 2021, 08:25:56 пре подне
Биће лако утврдити да ли овај I-Y3120 потиче из бронзаног доба, средњег века или од археолога који су руковали узорком. Ако је скоријег датума вероватно ће бити позитиван и на неки SNP присутан у подгрупама I-Y3120. Ако је ипак из бронзаног доба, уклапа се у оно се може закључити о I-Y3120 на основу данашњих популација. У бронзано доба била је присутна у горњем Подунављу, а најкасније у антици стигла је до Источне Европе, али нам није познат њен пут између тих подручја. Различите подгрупе E-V13, J2b, R1b и других хаплогрупа имају распоред који сугерише да су се у бронзаном добу и касније шириле из горњег Подунавља према Источној Европи и Балкану. Зато не би било чудо наћи I-Y3120 на бронзанодобном Балкану. Очигледно, I-Y3120 у Источној Европи је била плоднија.
Ова мапа се може тумачити сеобом Словена од Карпата према ка доњем Подунављу, а одатле ка горњем и према Балкану и Лаби, мада тешко да су Словени стигли до западне Француске. Можда је реч о неким источногерманским везама.


Да не трчим пред руди, али чини ми се да је ово подебљано врло извесно у овом случају.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Децембар 23, 2021, 09:20:09 пре подне
Gde može da se dođe do tog uzorka? Da li ga je neko propustio kroz ove popularne računače? Eurogenes i slično?

До узорка се може доћи у раду чији је линк овде поделио Atlantische. Ја сам само прегледао приложену табелу али видим да је приложен и .zip датотека са подацима испитиваних генотипова.

Навали народе.

Large-scale migration into Britain during the Middle to Late Bronze Age
 (https://www.nature.com/articles/s41586-021-04287-4?fbclid=IwAR0ilv9TnBgFOlpZEAtP9UjNQnx8Vd1_8V44XUj5foSA7otp2vAlmJUi2Rk)


Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Децембар 23, 2021, 11:45:19 пре подне
Које би објашњење било за овај узорак:

I23205   I23205   Grave 226; P7485   Pinhasi, Ron   This study   Context: Archaeological - Period   3900   87   2100-1800 BCE   Serbia_Mokrin_EBA_Maros   
North Banat, Kikinda, Mokrin
Serbia   45,934722   20,404444   1240K   1   6   838781   M   
North Banat District, Kikinda, Mokrin Necropolis Family A (7 members) (MOK28A.SG-MOK23.SG have a 1d relationship; MOK28A.SG-MOK20.SG have a 2d or 3d relationship; MOK28A.SG-I23205 have a 2d or 3d relationship; I23205-MOK12.SG have a 2d or 3d relationship; I23205-MOK17A.SG have a 2d or 3d relationship; I23205-MOK18A.SG have a 2d or 3d relationship)
I-L161   I2a1a2

?

Видим да су пронашли и објавили у овом раду још узорака те хг у Британији. Чини ми се да је закључак да је она у Бронзаном добу дошла у Британију из централне Европе.

Мокрински узорак би требало да је ова подграна:

https://yfull.com/tree/I-Y13336/

Изгледа да су га из неког разлога склонили са Yfull стабла, раније је био присутан са заставом Србије и ознаком севернобанатског округа.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Imoćanin Децембар 23, 2021, 01:19:14 поподне
Evo, postavili su Ličanina na vrh piramide ;-)

https://www.yfull.com/tree/I-CTS10228/

S obzirom da su očitovanja na Y3120 kontradiktorna (4G- i 3C+), možda zaista imamo prvog CTS10228*.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Децембар 23, 2021, 01:28:56 поподне
Evo, postavili su Ličanina na vrh piramide ;-)

https://www.yfull.com/tree/I-CTS10228/

S obzirom da su očitovanja na Y3120 kontradiktorna (4G- i 3C+), možda zaista imamo prvog CTS10228*.

Не знам, много је тога контрадикторно. Да има бар једно негативно очитање на нивоу CTS10228 па да се човјек замисли, али аутосомална генетика је заправо та која га заиста не може смјестити у тај временски контекст на том подручју. Има такође доста непокривених грана испод I2-Y3120.

Већ сам писао да ми је тај узорак аутосомално веома близак (најближи од свих досадашњих узорака), али би се онда требало објаснити одакле том узорку балто-словенски удио  у истим омјерима као код данашњег становништва ових простора.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Imoćanin Децембар 23, 2021, 01:35:26 поподне
Не знам, много је тога контрадикторно. Да има бар једно негативно очитање на нивоу CTS10228 па да се човјек замисли, али аутосомална генетика је заправо та која га заиста не може смјестити у тај временски контекст на том подручју. Има такође доста непокривених грана испод I2-Y3120.

Већ сам писао да ми је тај узорак аутосомално веома близак (најближи од свих досадашњих узорака), али би се онда требало објаснити одакле том узорку балто-словенски удио  у истим омјерима као код данашњег становништва ових простора.

Da, vidio sam. Ali ipak bi isključio mogućnost da je kontaminacija u pitanju. Zanimljiva mu je i mtDNA haplogrupa, vuče dosta na sjever a i autosomalno ima neki germanski upliv:

https://www.yfull.com/mtree/HV0a1a/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Децембар 23, 2021, 01:46:41 поподне
Da, vidio sam. Ali ipak bi isključio mogućnost da je kontaminacija u pitanju. Zanimljiva mu je i mtDNA haplogrupa, vuče dosta na sjever a i autosomalno ima neki germanski upliv:

https://www.yfull.com/mtree/HV0a1a/

Да, али тај германски уплив може бити посљедица мијешања након досељења са неком од германских популација присутном на Балкану. И ја имам тај сјеверозападни уплив, моја аутосомална днк се скоро у потпуности поклапа са овим узорком.

Једино што би мислим била добра провјера за овај узорак, било би неко поређење по IBD сегментима. Уколико би имао крупне дијељене сегменте са неким савременим тестираним, онда би ситуација била јасна (тј. радило би се о контаминацији).

Колико видим, рад још није прошао провјеру, па можда до коначног објављивања, додатно провјере и овај узорак.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Imoćanin Децембар 23, 2021, 01:59:14 поподне
Da, vidjet ćemo. Mislim da je jedino realno pretpostaviti krivu dataciju. Za kontaminaciju postoji dosta strog protokol i po profilu degradacije baznih parova vrlo lako se mogu razlučiti stare i moderne uzroke. I u tabeli mu pod tom kategorijom piše "no red flag".
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милан Петровић Децембар 23, 2021, 03:03:56 поподне
Evo, postavili su Ličanina na vrh piramide ;-)

https://www.yfull.com/tree/I-CTS10228/

S obzirom da su očitovanja na Y3120 kontradiktorna (4G- i 3C+), možda zaista imamo prvog CTS10228*.
Iz kog perioda je ovaj uzorak?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Imoćanin Децембар 23, 2021, 03:43:58 поподне
Iz kog perioda je ovaj uzorak?

Oko 1300 prije Krista.

https://www.bib.irb.hr/1040818

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Децембар 24, 2021, 01:16:29 пре подне
Које би објашњење било за овај узорак:

I23205   I23205   Grave 226; P7485   Pinhasi, Ron   This study   Context: Archaeological - Period   3900   87   2100-1800 BCE   Serbia_Mokrin_EBA_Maros   
North Banat, Kikinda, Mokrin
Serbia   45,934722   20,404444   1240K   1   6   838781   M   
North Banat District, Kikinda, Mokrin Necropolis Family A (7 members) (MOK28A.SG-MOK23.SG have a 1d relationship; MOK28A.SG-MOK20.SG have a 2d or 3d relationship; MOK28A.SG-I23205 have a 2d or 3d relationship; I23205-MOK12.SG have a 2d or 3d relationship; I23205-MOK17A.SG have a 2d or 3d relationship; I23205-MOK18A.SG have a 2d or 3d relationship)
I-L161   I2a1a2

?

Видим да су пронашли и објавили у овом раду још узорака те хг у Британији. Чини ми се да је закључак да је она у Бронзаном добу дошла у Британију из централне Европе.
https://forum.molgen.org/index.php?PHPSESSID=k7c2cr74e48993h8u7nr6tl2j7&topic=70.msg535071#msg535071
Цитат
I23205   I2a1a2a2   I-Y13573/etc*(xY13588)
https://www.yfull.com/tree/I-Y13336/ се вероватно проширила из степе са Индоевропљанима, па је данас има од Ирака до Шкотске. Братска https://www.yfull.com/tree/I-S2639/ је вероватно већ дуже време била присутна на западу Европе. Има археогенетских налаза из Британије и Ирске старијих од 5000 година.

Цитат
I18719   I2a1a2b1a1   I-S12235/etc*(xBY128,A7318,A14301,Y16810)
Да не трчим пред руди, али чини ми се да је ово подебљано врло извесно у овом случају.
Можда ако је археолог Црногорац, боље је поклапање него са Хрватима.

Da, vidio sam. Ali ipak bi isključio mogućnost da je kontaminacija u pitanju. Zanimljiva mu je i mtDNA haplogrupa, vuče dosta na sjever a i autosomalno ima neki germanski upliv:

https://www.yfull.com/mtree/HV0a1a/
https://www.yfull.com/mtree/HV0a1a/ formed 2100 ybp, TMRCA 800 ybp
https://www.familytreedna.com/public/mt-dna-haplotree/R;name=HV0a1a
http://www.ianlogan.co.uk/sequences_by_group/hv0a_genbank_sequences.htm HV0a1a A200G T3200C G16346C
HV0a1a изгледа млада хаплогрупа претежно присутна у Немачкој, мада питање је колико су те процене старости тачне. HV0a1 је углавном присутна у Скандинавији, али је има и међу Словенима. На https://www.yfull.com/mtree/HV0a/ је 4500 година стари узорак из Пољске, можда одатле потиче HV0a.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Децембар 24, 2021, 02:25:56 пре подне
Проверио сам све J2b2a узорке добре покривености, и занимљиво је да већина њих припада грани PH1602>Y86930 (https://www.yfull.com/tree/J-Y86930/):

I23911; J2b2a1a1a1b2-Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930>FT115799
I24638; J2b2a1a1a1b2-Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930>FT115799
I24882; J2b2a1a1a1b2-Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930 (xFT115799)
I23995; J2b2a1a1a1b2-Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930 (xFT150993)
I24639; J2b2a1a1a1b2-Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930 (xFT150993)
I26742; J2b2a1a1a1b2-Y15058>Z38240>Z38241 (xFT108123,Y130843,Y91418,PH502,Y86930)
I26726; J2b2a1a1a1a1a-Z638>Z1297 (xY27522,Y21878,Z8421)
I5691; J2b2a1a1a-Z597 (xZ2507,FT29034,FGC64029)

Већина ових узорака требала би бити са подручја Хрватске, осим последњег на листи, за који сигурно знамо да је из Словеније, па је могуће да је управо ова грана била заступљена/доминантна међу Либурнима, Јаподима и/или Далматима.
Појавили су се на Yfull-у:
https://www.yfull.com/live/tree/J-Z38241/
id:I26742 HRV [HR-17] 2650 ybp
https://forum.molgen.org/index.php?PHPSESSID=k7c2cr74e48993h8u7nr6tl2j7&topic=70.msg535071#msg535071
Цитат
I26742   J2b2a1a1a1b~   J-Y15058/etc*(xZ40053,Y22038,Y38002,Y36169)

https://www.yfull.com/live/tree/J-Y86930/
id:I23911 HRV [HR-09] 2660 ybp
Цитат
I23911   J2b2a1a1a1b~   J-Y15058*(xZ40053,CTS473,Y33800,Y36170)
id:I24882 HRV [HR-17] 2510 ybp
Цитат
I24882   J2b2a1a1a1b~   J-Y15058/etc*(xZ40053,Y22038,Y38002,Y36169)
id:I24639 HRV [HR-09] 2545 ybp
Цитат
I24639   J2b2a1a1a1b~   J-CTS9215/etc*(xZ40053,Y33800,Y36169)

https://www.yfull.com/live/tree/J-Z1297/
id:I26726 HRV [HR-17] 3190 ybp
Цитат
I26726   J2b2a1a1a1a1a   J-Z1298*(xZ639,B440)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Владимир Бојановић Децембар 24, 2021, 07:57:37 пре подне
Појавили су се на Yfull-у:
https://www.yfull.com/live/tree/J-Z38241/
id:I26742 HRV [HR-17] 2650 ybp
https://forum.molgen.org/index.php?PHPSESSID=k7c2cr74e48993h8u7nr6tl2j7&topic=70.msg535071#msg535071
https://www.yfull.com/live/tree/J-Y86930/
id:I23911 HRV [HR-09] 2660 ybpid:I24882 HRV [HR-17] 2510 ybpid:I24639 HRV [HR-09] 2545 ybp
https://www.yfull.com/live/tree/J-Z1297/
id:I26726 HRV [HR-17] 3190 ybp
Само бих додао и овог из старије гране:
https://www.yfull.com/live/tree/J-Z38240/
id:I4331HRV [HR-17] age 3550 ybp

Oво су фантастична открића, посебно за наше припаднике ових Ј2 подграна. Срећници.  :)

Да ли постоји још неки узорак са I хаплогрупом, осим оног CTS10228*?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Селаковић Децембар 24, 2021, 08:45:19 пре подне
За муштулук.

Цитат
I18719   P3779; BzV 10a   Pinhasi, Ron   This study   Context: Archaeological - Period   3200   144   1500-1000 BCE   Croatia_MBA_LBA   Bezdanjača Cave   Croatia   44.8520052   15.4199444   1240K   2   3.747999   825868   M   n/a (no relatives detected)   I-Y3120

Зна ли се можда какав је статус СНПова FT386376 и BY116090 за овај узорак?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Владимир Бојановић Децембар 24, 2021, 08:54:25 пре подне
Само бих додао и овог из старије гране:
https://www.yfull.com/live/tree/J-Z38240/
id:I4331HRV [HR-17] age 3550 ybp

Oво су фантастична открића, посебно за наше припаднике ових Ј2 подграна. Срећници.  :)

Наравно, ко воли да машта о могућем, вишемиленијумском развојном путу његових предака као и даљих рођака, уз ове налазе из Лике може се "користити" и претходним скелетним анализама:
https://www.yfull.com/tree/J-L283/
id:KDC001RUS [RU-KB] аge 3824 ybp (Северни Кавказ, Русија)

https://www.yfull.com/tree/J-Z615*/
id:MOK15SRB [RS-VO] аge 3900 ybp (Мокрин, Србија)

https://www.yfull.com/tree/J-L283*/
id:ORC007ITA [IT-CA] аge 2922 ybp (Каљари, Италија)

https://www.yfull.com/tree/J-Z600/
id:ORC008ITA [IT-CA] аge 2820 ybp (Каљари, Италија)

https://www.yfull.com/tree/J-Z2509/
id:ORC003ITA [IT-CA] аge 2926 ybp (Каљари, Италија)
id:I10553ITA [IT-CA] аge 2880 ybp (Каљари, Италија)

Нисам до сада обраћао пажњу али на овим примерима се заправо види колико одступају процене старости YFull-а (TMRCA) од процена које су обављене на костима. Мишљења сам да ипак овим другим треба више веровати.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Децембар 24, 2021, 08:55:17 пре подне

Можда ако је археолог Црногорац, боље је поклапање него са Хрватима.


У сваком случају "модерна" му генетика. :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Децембар 24, 2021, 09:56:04 пре подне


Зна ли се можда какав је статус СНПова FT386376 и BY116090 за овај узорак?

Провјерио сам, нису му покривени.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Децембар 25, 2021, 09:59:23 пре подне
Мокрински узорак би требало да је ова подграна:

https://yfull.com/tree/I-Y13336/

Изгледа да су га из неког разлога склонили са Yfull стабла, раније је био присутан са заставом Србије и ознаком севернобанатског округа.

Хвала на информацији. Видим да је узорак ипак враћен на Yfull стабло.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Децембар 25, 2021, 10:59:20 пре подне
Биће лако утврдити да ли овај I-Y3120 потиче из бронзаног доба, средњег века или од археолога који су руковали узорком. Ако је скоријег датума вероватно ће бити позитиван и на неки SNP присутан у подгрупама I-Y3120. Ако је ипак из бронзаног доба, уклапа се у оно се може закључити о I-Y3120 на основу данашњих популација. У бронзано доба била је присутна у горњем Подунављу, а најкасније у антици стигла је до Источне Европе, али нам није познат њен пут између тих подручја. Различите подгрупе E-V13, J2b, R1b и других хаплогрупа имају распоред који сугерише да су се у бронзаном добу и касније шириле из горњег Подунавља према Источној Европи и Балкану. Зато не би било чудо наћи I-Y3120 на бронзанодобном Балкану. Очигледно, I-Y3120 у Источној Европи је била плоднија.
Ова мапа се може тумачити сеобом Словена од Карпата према ка доњем Подунављу, а одатле ка горњем и према Балкану и Лаби, мада тешко да су Словени стигли до западне Француске. Можда је реч о неким источногерманским везама.

Друго објашњење би било ширење из горњег Подунавља на запад ка Француској и на исток низ Дунав све до Карпата где би ушла у састав Словена. Одсуство блискости у Турској и на острвима Егеја сугерише да је ова аутосомална генетика на истоку Балкана присутна тек одскора.

Треће, басен Дунава може се посматрати као место где су се сударали генетски утицаји са Медитерана, са истока и запада Европе. Места где су ти утицаји у равнотежи одговарају максималним вредностима блискости данашњих популација узорку I18719, па те популације нису нужно његови блиски рођаци, само имају сличну аутосомалну мешавину као он.

Ако се ради ипак о аутентичном узорку из бронзаног доба можда би објашњење било у раној сеоби популације која је предачка каснијим Словенима. Могуће да је сеоба била део догађаја који се зове Колапс бронзаног доба.

Штета што није до сада генетски обрађен још неки узорак из Бездањаче. Колико сам успео да се информишем, ово је први и једини за сада скелет који је археогенетски обрађен а има их приличан број (остатаци око 200 особа из 57 различитих гробова) и то из два културна хоризонта, средњег (1500–1200 BCE) и касног (1200–1000 BCE) бронзаног доба.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Imoćanin Децембар 25, 2021, 12:00:25 поподне
Navodno su sa tog nalazišta 37 uzoraka u laborskoj obradi:

http://pastlives.inantro.hr/wp-content/uploads/2019/04/Jankovic-AAPA-2019-poster.pdf

Valjalo bi ovog Jankovića direktno upitat.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Децембар 25, 2021, 05:25:50 поподне
Само бих додао и овог из старије гране:
https://www.yfull.com/live/tree/J-Z38240/
id:I4331HRV [HR-17] age 3550 ybp

Oво су фантастична открића, посебно за наше припаднике ових Ј2 подграна. Срећници.  :)

Да ли постоји још неки узорак са I хаплогрупом, осим оног CTS10228*?
Тренутно их на Yfull-у има само неколико, а према подацима са:
https://forum.molgen.org/index.php?topic=70.msg535071#msg535071
https://forum.molgen.org/index.php?topic=14036.msg540296#msg540296
https://forum.molgen.org/index.php?topic=70.msg535101#msg535101
има их на следећим местима.

I12312   I2a1b   I-P218/etc*(xA2330,Y34579,Z2092,S8112,Y35895,Y7206,Y30845,Y16513,BY44769,Y18922)
I12312:Result ( 98.2% 55 -0 +1): K1-a4

I12317   I2a1a2a   I-L161.1/etc*(xAMM068,A812,Y13336)
I12317:Result ( 95.9% 49 -1 +0): H5m

I12791   I2a1a1a1a1   I-CTS7201/etc*(xZ26452,Z26528,Y3951,Z26606,Z26628,Z26644,Z26663,PF4238,Z26697,PF4309,PF4326,Z26715,PF4368,PF4398,PF4421,Z118,Z27032,PF4115,Y23407,Z27146)
I12791:Result ( 94.2% 51 -1 +1): H1e1a-b

I13468   I2a2a2a1~   I-Z45444*(xPF6910)
I13468   Czech_EBA_Unetice   3850   I-S6635   I2a2a   U5a1b1
I13468:Result ( 98.2% 55 -0 +1): U5a1b1

I13469   I2a2a2   I-Z45426*(xZ45438)
I13469   Czech_EBA_Unetice   3850   I-S6635   I2a2a   J1c15
I13469:Result ( 88.3% 57 -2 +3): J1c15c

I13471   I2a2a2   I-BY431*(xZ45433)
I13471   Czech_EBA_Unetice   3850   I-S6635   I2a2a   V
I13471:Result ( 94.1% 48 -0 +3): V

I13890   I2a1b1a1a1b~   I-Y27463*(xFGC14240,Y20873,A544)
I13890:Result ( 98.4% 62 -0 +1): T2e1c

I13891   I2a1b1a1a1b~   I-FGC14257/etc*(xS7714,Y20873,FGC7184)
I13891:Result ( 96.4% 53 -0 +2): U5b1-a1

I13892   I2a1b1a1a1b~   I-FGC14257*(xFGC14267,Y20873,FGC7207)
I13892:Result ( 98.4% 62 -0 +1): T2e1c

I13893   I2a1b1a1a1b~   I-Y27463/etc*(xFGC14254,A10514,FGC14453,FGC7156)
I13893:Result ( 91.7% 57 -1 +3): K1a4r

I13897   I2a1b1a1a1b~   I-FGC14257*(xFGC14240,Y20873,A544,FGC7218)
I13897:Result ( 96.0% 48 -0 +2): V

I13898   I2a1b1a1a1b~   I-FGC14257/etc*(xS7708,Y21510,FGC7207)
I13898:Result ( 95.1% 58 -0 +3): K1a3a1

I13899   I2a1b1a1a1b1~   I-FGC14261*(xY3684)
I13899:Result ( 93.4% 57 -0 +4): U3a1


I14190   I2a1a1b1b~   I-Y28229
I14190   Czech_MN   6450   I-S21825   I2a1a1b   T2e
I14190:Result ( 98.4% 60 -0 +1): T2e

I14481   Czech_LBA_Knoviz   2850   I-Z2069   I2a1b1a1b1a   W3a
I14481:Result ( 98.3% 57 -0 +1): W3a1

I14866   I2a1b1a1a1~   I-FGC14233/etc*(xL369,FGC7173)
I14866:Result (100.0% 49 -0 +0): H1at1

I15029   I2a1a1a1a2b~   I-Y21997
I15029   France_N   5700   I-Y21997   I2a1a1a1a2b~   V
I15029:Result ( 94.1% 48 -0 +3): V

I15030   I2a1a1a1a1a1a1e6b1b1b~   I-Z26966
I15030   France_N   5700   I-L160   I2a1a1a1a1   U5b1+16189+@16192
I15030:Result ( 94.6% 53 -0 +3): U5b1-a1

I15032   France_N   5700   I-L161   I2a1a2   H3
I15032:Result ( 97.9% 47 -0 +1): H3

I15040   I2a1b1a2a   I-L702*(xS23897,Y7500,Y8952)
I15040   Czech_IA_LaTene   2240   I-L699   I2a1b1a2a2a   U5b1b1+@16192
I15040:Result ( 93.1% 56 -1 +2): U5b1b1-a

I15071   I2a1b1a1b1b   I-SK1247*(xL1230)
I15071   Czech_IA_Hallstatt   2625   I-S18331   I2a1b1a1b1b   U5b1b1+@16192
I15071:Result ( 90.0% 56 -1 +4): U5b1b1-b

I15643   I2a2a2~   I-Y5826.2*(xZ45438)
I15643   Czech_EBA_Unetice   3850   I-S6635   I2a2a   U4d1
I15643:Result ( 98.2% 56 -0 +1): U4d1

I15646   I2a2a2a1~   I-Z45444/etc*(xPF6910)
I15646   Czech_EBA_Unetice_son.I13470   3850   I-S6635   I2a2a   H
I15646:Result ( 97.9% 47 -0 +1): H-h

I16092   I2a1a2a1a1   I-AMM068
I16092   Czech_IA_Hallstatt_o   2600   I-L161   I2a1a2   U5b3b
I16092:Result ( 98.2% 56 -0 +1): U5b3b

I16099   I2a1b1a1b~   I-Z2086/etc*(xZ2089)
I16099   Czech_MBA_Tumulus   3325   I-L1229   I2a1b1a1b1   HV0+195
I16099:Result ( 97.9% 46 -0 +1): HV0-a

I16109   Czech_EBA_Unetice   3850   I-Y14158   I2   K1a1b2b
I16109:Result ( 96.7% 59 -0 +2): K1a1b2b

I16110   Czech_EBA_Unetice_brother.I7958   3850   I-PF3885   I2a2a2   I4a
I16110:Result ( 98.1% 53 -0 +1): I4a

I16170   I2a1a1a1a1   I-CTS6406/etc*(xPF4184,Z27036,Z27041,PF4119,A17272,S6040,Z27161,Z27173,Z27183)
I16170   Italy_Sardinia_MBA   3337   I-Y21970   I2a1a1a1a1b~   H3
I16170:Result ( 97.9% 47 -0 +1): H3

I16247   I2a1a1a1~   I-CTS1369*(xCTS3404,Y11896)
I16247   France_GrandEst_EBA   4534   I-Y3992   I2a1a1a1~   U5b3b
I16247:Result ( 94.9% 56 -0 +3): U5b3b

I16412   I2a1b   I-FGC3538*(xL700,Y83181,Y68424,S11561)
I16412:Result ( 83.3% 53 -4 +1): J1c17-a

I16418   I2a1b1a1a1~   I-FGC20049/etc*(xY29077,Y22518,Y17398,Y31616,Y21732,Z45267,Y14340,FGC7197)
I16418:Result ( 95.1% 58 -0 +3): U5a1d2a1-a

I16427   I2a1a2~   I-AM01272*(xA14301)
I16427:Result ( 92.5% 49 -0 +4): X2b-a

I16436   I2a1a2~   I-AM01260*(xBY2116,FGC30457)
I16436:Result ( 89.7% 56 -2 +2): J1c5

I16438   I2a1b1a2b2~   I-S11391
I16438:Result ( 91.8% 56 -0 +5): J1c2

I16444   I2a1a2~   I-AM01288/etc*(xAMM088,S20061)
I16444:Result ( 98.3% 59 -0 +1): J1c1b1

I16453   I1~   I-FGC9452/etc*(xY7923,Y13496,Y17936,A8585,CTS10028,FGC54147,A12964,A1553,Y18586,Z44249,Y22408,Y30056,A6397,FGC19395,A6837,Y11822,Y3984,FGC29230,FGC45110,A8778)
I16453   England_IA   2350   I1   I1   U5a2a1
I16453:Result ( 96.6% 57 -0 +2): U5a2a1

I16463   I2a1b1a1a1~   I-FGC14219/etc*(xAMM083,FGC7174)
I16463:Result ( 96.4% 54 -0 +2): H4a1a2

I16491   I2   I-L68/etc*(xPF3798,BY49916)
I16491:Result ( 96.9% 62 -0 +2): U5b2b3-a1
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Децембар 25, 2021, 05:26:55 поподне
I16549   I2a1b1a1b1~   I-Z2092*(xFGC15098,Y4904)
I16549   Czech_LBA_Knoviz   3000   I-L1229   I2a1b1a1b1   H1an1
I16549:Result ( 94.2% 49 -0 +3): H1an1

I17259   I2a1b1b1~   I-S23467*(xY6127)
I17259:Result ( 90.9% 50 -0 +5): H5a1

I17327   I2a1b2a2a1b1a1a   I-BY25367
I17327   Czech_IA_LaTene   2250   I-S2606   I2a1b2a2   U5b2b1a1
I17327:Result ( 95.3% 61 -0 +3): U5b2b1a1

I18428   I2a1b1b   I-Y6098*(xY6101)
I18428   France_LN   5400   I-Y6098   I2a1b1b   K1a1b1
I18428:Result ( 94.8% 55 -0 +3): K1a1b1

I18719   I2a1a2b1a1   I-S12235/etc*(xBY128,A7318,A14301,Y16810)
I18719   Croatia_MBA_LBA   3200   I-Y3120   I2a1a2b1a1   HV0a1a
https://www.yfull.com/live/tree/I-CTS10228/ id:I18719 HRV [HR-09] 3200 ybp
I18719:Result ( 93.0% 53 -0 +4): HV0a1a1

I19286   I2a1a2   I-L178.1*(xCTS311,Y13591,YP225)
I19286:Result ( 95.2% 59 -0 +3): J1c1b1

I19859   I2a1b2   I-FGC29567/etc*(xS2520)
I19859:Result ( 95.9% 47 -0 +2): H3

I20504   I2a1a2~   I-AM01272*(xBY2063,Y13589,S12452)
I20504   Czech_IA_LaTene   2250   I-Y14338   I2a1a2a1a1a   H3ag
I20504:Result ( 90.6% 48 -0 +5): H3ag

I20518   I2a1b2a   I-FGC29563*(xY16417,FGC36969)
I20518   Czech_IA_LaTene   2255   I-M436   I2a1b   H2
I20518:Result ( 79.6% 45 -1 +9): H40d

I20622   I2a1b1a2b1a2a2a   I-CTS661*(xY5717)
I20622:Result ( 88.1% 65 -3 +2): T2c1d1b4

I20626   I2a1b1b~   I-Y6106*(xY6101)
I20626:Result ( 98.0% 48 -0 +1): H7b

I20988   I2a1b1a1a1b1a~   I-FGC14240*(xY33755,FGC14277,Y22540)
I20988:Result ( 95.2% 61 -1 +1): T2b19

I21385   I2a1a1b~   I-S15308/etc*(xL1286,Y22650)
I21385:Result ( 93.2% 57 -1 +2): K1d

I23205   I2a1a2a2   I-Y13573/etc*(xY13588)
I23205   Serbia_Mokrin_EBA_Maros   3900   I-L161   I2a1a2   U3a1
https://www.yfull.com/live/tree/I-Y13336/ id:I23205
I23205:Result ( 98.3% 57 -0 +1): U3a1

I2405   I2a1b1a2b1~   I-FGC3574*(xY11921,Y9161,M8963.2,Y11154,Y33288,Y23369)
I2405   Poland_Globular_Amphora   5132   I-Y3259   I2a1b1   W5
I2405:Result ( 84.2% 48 -0 +9): W5a

I2435   I2a1b1~   I-FGC3551/etc*(xY17536,CTS661)
I2435   Poland_Globular_Amphora_brother.I2407_son.I2433_son.I2440   4950   I-Y3259   I2a1b1   H28a
I2435:Result ( 85.7% 42 -0 +7): H28a

I2629   I2a   I-CTS4039*(xCTS8968,Y19490,Y21981,Y12084,Y20873,Y22950,Y18116,Y18290,Y4763,Y33170,Y30326,CTS4765,BY93658)
I2629:Result ( 74.4% 29 -0 +10): J1c1b

I2658   I2a1b1a2b1a2a1b2a~   I-Y32639
I2658:Result (100.0% 54 -0 +0): H6a1b2

I2796   I2a1a2a   I-AMM078*(xA12014)
I2796:Result ( 95.9% 47 -0 +2): H3

I3137   I2a   I-PF3801*(xAM00527,L368,FGC18580)
I3137:Result ( 93.9% 46 -0 +3): HV0-a

I4188   I2a1b1a2   I-CTS10057*(xL702,CTS4693)
I4188   Hungary_MN_ALPc_new   7050   I-CTS10057   I2a1b1a2   K1a
I4188:Result ( 91.4% 55 -1 +3): K1a1

I4949   I2a1b1a1a1~   I-FGC14219*(xY36954,Y33451,Y14603,FGC7170)
I4949:Result ( 93.8% 61 -0 +4): T2b

I5689   I2a1b1a1b1a1a~   I-FGC15091*(xY11521,Y10648,Y7243,FGC15111,Y13325,Y31802)
I5689   Slovenia_EIA   2540   I-Y3672   I2a1b1a1b1a1a~   K1b1
https://www.yfull.com/live/tree/I-Y3672/ id:I5689 SVN 2450 ybp
I5689:Result ( 88.2% 64 -2 +4): K1b1a1i

I7952   I2a1b1a2b   I-Z161*(xL801,S24151,Y5220)
I7952   Czech_N   7200   I-CTS10057   I2a1b1a2   N1a1a
https://www.yfull.com/live/tree/I-Z161/ id:I7952
I7952:Result ( 89.7% 56 -2 +2): N1a1a1a

I7959   I2a1b2a   I-L38/etc*(xL533,S10269,PH1237,BY14051,BY25364,Y18919)
I7959   Czech_EBA_Unetice   3850   I-L38   I2a1b2a   K2b2
I7959:Result ( 96.7% 58 -0 +2): K2b2

I7960   I2a2a2a1~   I-Z45444*(xZ26447)
I7960   Czech_EBA_Unetice   3850   I-S6635   I2a2a   U2e2a1a2
I7960:Result ( 92.6% 65 -1 +3): U2e2a1a2

I7962   I2a2a2a1~   I-Z45445*(xPF6910)
I7962   Czech_EBA_Unetice   3850   I-S6635   I2a2a   T2e
I7962:Result ( 96.8% 61 -0 +2): T2e4

I7963   I2a2a2a1~   I-Z45444*(xZ45447)
I7963   Czech_EBA_Unetice   3850   I-S6635   I2a2a   U2e2
I7963:Result ( 86.6% 60 -1 +7): U2e2
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Децембар 25, 2021, 05:35:13 поподне
Још неколико занимљивих резултата:
https://www.yfull.com/live/tree/R-Y20993/
 id:I0438 RUS [RU-SAM] 4254 ybp
 I0438   Russia_Samara_EBA_Yamnaya   4785   R-Y20993   R1b1a1b1b3   U5a1a1
 I0438   R1b1a1b1b3a   R-CTS1843*(xS12460)
 I0438:Result ( 96.6% 56 -0 +2): U5a1a1

 id:I0231 RUS [RU-SAM] 4260 ybp
 I0231   Russia_Samara_EBA_Yamnaya   4844   R-Y20993   R1b1a1b1b3   U4a1
 I0231   R1b1a1b1b3a   R-CTS1843*(xS12460)
 I0231:Result ( 96.6% 56 -0 +2): U4a1-a

https://www.yfull.com/live/tree/R-Z2110/ id:I23209
 I23209   Serbia_BA_Maros   3900   R-CTS7556   R1b1a1b1b3a1a   K1a1a
 I23209   R1b1a1b1b3a1a   R-CTS7556*(xCTS9219)
 I23209:Result ( 93.3% 56 -0 +4): K1a1a

https://www.yfull.com/live/tree/R-CTS7556/ id:I23207
 I23207   Serbia_Mokrin_EBA_Maros   3900   R-CTS7556   R1b1a1b1b3a1a   H6a1b2
 I23207   R1b1a1b1b3a1a   R-CTS7556*(xCTS9219)
 I23207:Result ( 98.2% 54 -0 +1): H6a1b2

https://www.yfull.com/live/tree/R-BY17643/ id:I26735 HRV [HR-14] 2075 ybp
 I26735   Croatia_LIA_LaTene   2050   R-V88   R1b   J1c12    млађи рођак Лепенаца
 I26735   R1b1b   R-PF6287/etc*(xPF6379,FGC21030)
 I26735:Result ( 95.1% 58 -0 +3): J1c12
 
https://www.yfull.com/live/tree/R-BY96884/
 id:I5695 SVN [SI-009] 3086 ybp      старији рођак Моравца id:POH27 CZE [CZ-JM] 1162 ybp
 I5695   Slovenia_MBA   3296   R-L2   R1b1a1b1a1a2b1   N1a1a1
 I5695   R1b1a1b1a1a2c1a5b1a1c1a   R-S7209
 I5695:Result ( 87.9% 53 -1 +5): N1a1a

https://www.yfull.com/live/tree/R-M458/ id:I25524
 I25524   Hungary_IA_LaTene_o3   2175   R-PF6155   R1a1a1   K1a+195
 I25524   R1a1a1b1a1a~   R-PF6202*(xFGC32020,BY32070,CTS11962.1,A11452)
 I25524:Result ( 91.7% 55 -0 +5): K1-a4

https://www.yfull.com/live/tree/R-L1029/ id:I13780 CZE [CZ-ST] 2250 ybp     најстарији R1a-L1029
 I13780   Czech_IA_LaTene   2250   R-YP5267   R1a1a1b1a1a1c1a3a~   K1a26
 I13780   R1a1a1b1a1a1c1a3a~   R-YP5269
 I13780:Result ( 93.3% 56 -0 +4): K1a26

https://www.yfull.com/live/tree/R-Z280/
 id:I14193 CZE [CZ-ST] 3850 ybp
 I14193   Czech_EBA_Unetice   3850   R-Z280   R1a1a1   T2e
 I14193   R1a1a1b1a2b3a1c2~   R-YP587*(xY10895,Y35753,A7020)
 I14193:Result ( 96.8% 61 -0 +2): T2e4

 id:I13795 CZE [CZ-US] 3000 ybp
 I13795   Czech_LBA_Knoviz   3000   R-Z280   R1a1a1   J1c8a
 I13795   R1a1a1b1a2   R-S204*(xS205,CTS1211)
 I13795:Result ( 91.4% 55 -1 +3): J1c8

 id:I11158
 I11158   Czech_EBA_son.I14193_son.I7198   4025   R-Z280   R1a1a1   U5b2c
 I11158   R1a1a1b1a2   R-S204*(xYP569,Y1401,YP4370,FGC46006,CTS1211)
 I11158:Result ( 96.7% 58 -0 +2): U5b2c3a

https://www.yfull.com/live/tree/G-Z16775/ id:I19356
 I19356   France_GrandEst_IA2   2200   G-Z16775   G2a2b2a1a1b1a1a2b   H1
 I19356   G2a2b2a1a1b1a1a2b   G-Z16775*(xZ16770,Z41654,Z41659,Z45000,FT6200,Z41151)
 I19356:Result ( 95.9% 47 -0 +2): H1

I20509   400-200 BCE   Czech_IA_LaTene   Central Bohemia, Prague 5, Prague-Jinonice (Holmanʼs Garden Centre)   Czech Republic   50.054385   14.363387   M   N-L550   N1a1a1a1a1a1a
I20509   N1a1a1a1a1a1a   N-CTS8428*(xB189,Y20413,A14018,A917,Y21046,CTS8287,Y17114)
I20509   Czech_IA_LaTene   2250   N-L550   N1a1a1a1a1a1a   H7b
I20509:Result ( 94.1% 48 -0 +3): H7b

I16184   2000-800 BCE   France_BA_GalloRoman   Salonnes, Burthecourt   France   48.781655   6.48666   M   N-L708   N1a1a1a   H17
I16184   France_BA_GalloRoman   3350   N-L708   N1a1a1a   H17
I16184:Result ( 85.2% 48 -1 +6): H17a1
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Децембар 25, 2021, 05:38:44 поподне
Да подсетим на један раније нађен I2-CTS10228 са сумњивом словенском аутосомалном генетиком.
Пренећу Синишина занимљива запажања о хаплотиповима из горе поменутог рада:

"Свега два припадника Динарика, један на Готланду (налазиште Копарсвик) и други у Украјини(Чернигову). Први je СНП одређен као I2-CTS10228, a други као I2-YP196. Иако сам се понадао да би овај готландски могао бити старија веза која недостаје, чини ми се да се такође ради о Словену,а не о Викингу, јер аутосомално има јаку словенску компоненту, баш као и узорак у Чернигову. Осим тога, на истом налазишту у Готланду присутан је и један тестирани са словенском R1a-Z280>CTS1211 и са такође наглашеном словенском аутосомалном компоненетом. С обзиром да је то већ 10. вијек, није чудно да су неки Словени били присутни на Готланду."


Два I2a и три R1a поређани по уделу пољске компоненте, растући низ:

VK53 I-CTS10228 Копарсвик (https://www.google.com/maps/place/Kopparsviksgatan,+Visby,+Sweden/@53.7649347,17.0299431,6z/data=!4m5!3m4!1s0x46f7af2e326f8395:0x535609c37ed57da4!8m2!3d57.6295317!4d18.2788548), Шведска 63,5% Пољска (R1a?), 6,8%↓ Балкан (I2a), 20,7%↑ Балтик (N?)


https://www.google.com/maps/d/viewer?ll=52.844126963372304%2C25.136866598596804&z=5&mid=1hZ28c61g0tNMYLfrvoo3a2Y0chPeGTlH

https://dna-explained.com/2020/09/18/442-ancient-viking-skeletons-hold-dna-surprises-does-your-y-or-mitochondrial-dna-match-daily-updates-here/
Цитат
Sample: VK53 / Gotland_Kopparsvik-161/65
Location: Kopparsvik, Gotland, Sweden
Age: Viking 900-1050 CE
Y-DNA: I-CTS10228
mtDNA: HV9b
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Децембар 26, 2021, 04:30:19 пре подне
Да још мало забиберимо чорбу. Тренутно стање на https://www.yfull.com/mtree/HV0a1a/ . Стварно је за (ГГ) Нобела.
(https://i.ibb.co/c1B69Rm/yfull-commtree-HV0a1a-20211226.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Владимир Бојановић Децембар 26, 2021, 07:22:28 пре подне
Да још мало забиберимо чорбу. Тренутно стање на https://www.yfull.com/mtree/HV0a1a/ . Стварно је за (ГГ) Нобела.
(https://i.ibb.co/c1B69Rm/yfull-commtree-HV0a1a-20211226.png)
Изгледа да је драјвер био у праву када је посумњао у исправно датирање id:I18719 на Y стаблу, јер ако се погледају бочне линије HV0a1a на mtDNA стаблу: https://www.yfull.com/mtree/HV0a1/, тамо у једној од њих се налази и резултат једног скелетног узорка из Норвешке: https://www.yfull.com/mtree/HV0a1c/ id:VK524NOR [NO-18] age 1000 ybp.
Потражио сам Y хаплогрупу овог узорка и ево је овде (датација се савршено слаже):
https://www.yfull.com/tree/I-Y3000/ id:VK524NOR [NO-18] age 1000 ybp.

Шарић вас поништи. ;D
Аха, кад би се зезали. ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: filipi Децембар 26, 2021, 09:04:02 пре подне
Ono sto sada znamo za ovaj uzorak iz Bezdnjace je da se radi o uzorku iz 70-tih godina (iskopano) prošlog vijeka. Nije rađeno uopšte radiokarbonsko datiranje već su na osnovu keramike, položaja, metala itd ustanovili da se radi o middle/late bronze age.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Децембар 26, 2021, 01:18:54 поподне
Ono sto sada znamo za ovaj uzorak iz Bezdnjace je da se radi o uzorku iz 70-tih godina (iskopano) prošlog vijeka. Nije rađeno uopšte radiokarbonsko datiranje već su na osnovu keramike, položaja, metala itd ustanovili da se radi o middle/late bronze age.

Да ли је којим случајем познато да ли су у ту јаму/пећину бацани убијени Срби за време НДХ? Тренутно ми контаминација или "залутали" скелет неког убијеног Србина од усташке руке делују као најлогичније решење ове загонетке.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Децембар 26, 2021, 02:35:54 поподне
Да ли је којим случајем познато да ли су у ту јаму/пећину бацани убијени Срби за време НДХ? Тренутно ми контаминација или "залутали" скелет неког убијеног Србина од усташке руке делују као најлогичније решење ове загонетке.

Ја сам већ писао детаљно Yfull-у зашто да буду опрезни око овог узорка. До сада су на моје поруке одговарали прилично брзо. Ова громогласна тишина са њихове стране овог пута ми је сумњива. :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Децембар 26, 2021, 03:30:55 поподне
Ја сам већ писао детаљно Yfull-у зашто да буду опрезни око овог узорка. До сада су на моје поруке одговарали прилично брзо. Ова громогласна тишина са њихове стране овог пута ми је сумњива. :)

Проследио ми је Филипи поруку коју је добио од једног хрватског истраживача тог локалитета, он је навео да Харвард има врло строге протоколе што се тиче контаминације, али се то претпостављам односи на неко недавно руковање скелетима, а шта ако је до контаминације дошло приликом самих ископавања 70-их година прошлог века, што се највероватније и десило? Колико ме памћење служи, у тим ранијим ископавањима није било никаквих посебних предострожности у вези са руковањем скелетним материјалом јер је ДНК анализа била у повоју или није ни постојала, па су скелети обрађивани искључиво класичним методама физичких антрополога (нпр. мерење дужине костију), те је могућност контаминације свакако била огромна.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Be like Bill Децембар 26, 2021, 03:44:24 поподне
Проследио ми је Филипи поруку коју је добио од једног хрватског истраживача тог локалитета, он је навео да Харвард има врло строге протоколе што се тиче контаминације, али се то претпостављам односи на неко недавно руковање скелетима, а шта ако је до контаминације дошло приликом самих ископавања 70-их година прошлог века, што се највероватније и десило? Колико ме памћење служи, у тим ранијим ископавањима није било никаквих посебних предострожности у вези са руковањем скелетним материјалом јер је ДНК анализа била у повоју или није ни постојала, па су скелети обрађивани искључиво класичним методама физичких антрополога (нпр. мерење дужине костију), те је могућност контаминације свакако била огромна.

Koliko znam, DNK ekstrakciju obično vrše iz zuba ili kosti gde je mala šansa da je moglo doći do zagađenja. Ovde bih pre posumnjao da se radi o ostacima nekog Srbina iz Drugog svetskog rata, ali me buni mitohondrijalni DNK svojom starošću
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Децембар 26, 2021, 04:10:22 поподне
Koliko znam, DNK ekstrakciju obično vrše iz zuba ili kosti gde je mala šansa da je moglo doći do zagađenja. Ovde bih pre posumnjao da se radi o ostacima nekog Srbina iz Drugog svetskog rata, ali me buni mitohondrijalni DNK svojom starošću

Замолио бих да ми објасните, како се митохондријални ДНК не уклапа у хипотезу да је скелет пропадао особи која је живела у двадесетом веку, кад припада хаплогрупи која је стара само 800 година. Налаз мени делује пре свега контра-аргумент датирању узорка из рада.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Децембар 26, 2021, 04:16:02 поподне
Koliko znam, DNK ekstrakciju obično vrše iz zuba ili kosti gde je mala šansa da je moglo doći do zagađenja. Ovde bih pre posumnjao da se radi o ostacima nekog Srbina iz Drugog svetskog rata, ali me buni mitohondrijalni DNK svojom starošću

Сви остаци који су у директном контакту са кожом, пљувачком или неким другим ДНК материјалом истраживача имају велику шансу да буду контаминирани, нарочито јер је у питању стара ДНК, подложна брзом пропадању. Као што написах, археолози на овим просторима нису томе придавали никакав значај те су слободно руковали тим остацима, без коришћења рукавица и друге опреме.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Be like Bill Децембар 26, 2021, 04:30:29 поподне
Сви остаци који су у директном контакту са кожом, пљувачком или неким другим ДНК материјалом истраживача имају велику шансу да буду контаминирани, нарочито јер је у питању стара ДНК, подложна брзом пропадању. Као што написах, археолози на овим просторима нису томе придавали никакав значај те су слободно руковали тим остацима, без коришћења рукавица и друге опреме.

Slažem se, ali prema opisu postupka za dobijanje drevne DNK mislim da je mala verovatnoća da humani ostaci koji će biti podvrgnuti DNK analizi dođu u dodir sa DNK materijalom istraživača, pošto, koliko sam shvatio, taj materijal se uzima iz unutrašnjosti koštanog materijala a sam postupak uzimanja je tehnički dosta dobro zaštićen da ne dođe do zagađenja

Цитат
Extracting this DNA starts by finding the right kinds of bones, like teeth or the small, dense bones of the inner ear (petrous bone), that preserve enough DNA inside. Researchers then grind a section or drill into the bone and prepare the resulting powder for DNA extraction and sequencing. It’s a delicate, carefully-controlled process: Raghavan’s new lab is located in the sub-basement of the Gordon Center for Integrative Science, purposefully separated from other genetic labs to avoid contaminating the samples with modern DNA.

https://www.uchicagomedicine.org/forefront/biological-sciences-articles/ancient-dna-tools-help-scientists-study-human-evolution-directly-from-the-source

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Be like Bill Децембар 26, 2021, 04:36:17 поподне
Замолио бих да ми објасните, како се митохондријални ДНК не уклапа у хипотезу да је скелет пропадао особи која је живела у двадесетом веку, кад припада хаплогрупи која је стара само 800 година. Налаз мени делује пре свега контра-аргумент датирању узорка из рада.

Ja smatram da sam upravo to i rekao :) Ne verujem da ispitivani DNK pripada osobi starijoj od 500-800 godina. Kako je došla u taj kraj Like mi je zagonetka, pogotovo što je i po Y-DNK i po autosomalnim rezultatima vezana za prostor Balkana, tačnije srpskih prostora na Balkanu dok po mtDNK vuče na severnija područja
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Децембар 26, 2021, 04:49:00 поподне
Koliko znam, DNK ekstrakciju obično vrše iz zuba ili kosti gde je mala šansa da je moglo doći do zagađenja. Ovde bih pre posumnjao da se radi o ostacima nekog Srbina iz Drugog svetskog rata, ali me buni mitohondrijalni DNK svojom starošću

Управо мтДНК, уз аутосомалну, показује да је реч о модерном узорку.  Када кажемо модеран, он може бити и из касног средњег века, али и из 20. века. Суштина је да није из бронзаног доба, ни из антике.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Децембар 26, 2021, 05:02:09 поподне
Ja smatram da sam upravo to i rekao :) Ne verujem da ispitivani DNK pripada osobi starijoj od 500-800 godina. Kako je došla u taj kraj Like mi je zagonetka, pogotovo što je i po Y-DNK i po autosomalnim rezultatima vezana za prostor Balkana, tačnije srpskih prostora na Balkanu dok po mtDNK vuče na severnija područja

Извињавам се, погрешно сам Вас разумео :) То што је митохондријална ДНК северњачка, може бити лако прихватљиво. Довољно је да је покојник имао прабабу из Немачке ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Децембар 26, 2021, 05:05:36 поподне
Истина је да се скелетни остаци могу лако контаминирати, али се исто тако лако и та контаминација открива NGS секвенцирањем генома, поготово ако је у питању мушки узорак. Овај узорак дефинитивно није контаминиран, у супротном би био обележен као такав од стране аутора, а контаминација би била видљива и у неконзистентним SNP-овима на Y-хромозому, а таквих у овом случају нема. Код овог узорка и аутосомални профил и Y-хаплогрупа, па можда чак и mt-хаплогрупа, указују да се ради о остацима из много каснијег периода, а верујем да би све недоумице биле решене директним датирањем овог скелета. Ускоро би требао изаћи још један рад (Lazaridis et al.), у коме ће између осталих бити и око 30 додатних узорака из ове исте пећине, па ће се и поређењем аутосомалног профила са њима моћи релативно лако утврдити да ли је у питању "уљез" из каснијег периода.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ojler Децембар 26, 2021, 05:49:30 поподне
Ја сам већ писао детаљно Yfull-у зашто да буду опрезни око овог узорка. До сада су на моје поруке одговарали прилично брзо. Ова громогласна тишина са њихове стране овог пута ми је сумњива. :)

Не би било лоше указати и ауторима рада на контрадикторност датирања са аутозомалним и mtDNA налазима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Децембар 26, 2021, 11:49:01 поподне
Изгледа да је драјвер био у праву када је посумњао у исправно датирање id:I18719 на Y стаблу, јер ако се погледају бочне линије HV0a1a на mtDNA стаблу: https://www.yfull.com/mtree/HV0a1/, тамо у једној од њих се налази и резултат једног скелетног узорка из Норвешке: https://www.yfull.com/mtree/HV0a1c/ id:VK524NOR [NO-18] age 1000 ybp.
Потражио сам Y хаплогрупу овог узорка и ево је овде (датација се савршено слаже):
https://www.yfull.com/tree/I-Y3000/ id:VK524NOR [NO-18] age 1000 ybp.

Аха, кад би се зезали. ;)
Један проблем је да су процене старости за mtDNA хаплогрупе мање поуздане него за хаплогрупе Y хромозома. Yfull је израчунао да је вероватноћа 95% да је HV0a1a1 настала пре између 1700 и 325 година, а да има TMRCA 1250 до 175 година. Притом I18719 вероватно није уврштен у процену засновану на три савремена узорка.

Археогенетски налази су обично слабије покривени од савремених, па је тешко рећи где се тачно налазе у односу на њих. Тако је и за I18719 тешко рећи да ли је I2-CTS10228* или I2-Y3120* (Y3116) или нека њена подгрупа. На пример, овде https://www.yfull.com/branch-info/J-YP157/#t4-tab су два древна 1X и два савремена 3X узорка, па TMRCA није ни израчуната. Али јесте овде https://www.yfull.com/branch-info/I-Y141086/#t4-tab где је древни 1X и савремени 39X узорак.

Шарић и њему слични су популарнији код публике која има мањак знања надокнађен вишком патриотизма. Но ствари стоје овако: од Лепенског Вира до Римског Царства преовлађују неке друге хаплогрупе. Остаје да се испита да ли су се I2-Y3120 или њени непосредни преци можда крили у неком кутку Балкана ( ала Астериксово село). Теоретски, ако се не би мешали са околним популацијама, њихова аутосомална генетика се не би много мењала, једино би прошла кроз врло уско грло. Али то баш звучи сумануто. А на основу хаплогрупа види се да су се Срби итекако мешали и са околним и са удаљеним популацијама.

У суштини сви Европљани су мешавина палеолитских домородачких ловаца-сакупљача, неолитских блискоисточних пољопривредника и степских Индоевропљана. Ако је I18719 стварно из бронзаног доба, а има аутосомалну генетику као данашњи Срби, највероватније објашњење би било да је то зато што се налазе на месту где је то мешање било најинтезивније, а не на југу, северозападу или североистоку Европе где претежу поједине прапопулације.

Да ли је којим случајем познато да ли су у ту јаму/пећину бацани убијени Срби за време НДХ? Тренутно ми контаминација или "залутали" скелет неког убијеног Србина од усташке руке делују као најлогичније решење ове загонетке.
Мени је пао на памет онај несретни домаћин што је угостио Људевита. Ако би се мало растегла старост HV0a1a1 таман довољно за "прабабу" из Бојке.

ДНК из савремених узорака је обично лако разликовати од древних, јер се ДНК временом распада на све мање делове, а брзина распада зависи од услова у којима се налази. Ако се не варам, мислим да је био неки налаз из Немачке за који се мислило да је бронзанодобни, а показало се да је раносредњовековни.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Владимир Бојановић Децембар 27, 2021, 01:39:20 пре подне
Један проблем је да су процене старости за mtDNA хаплогрупе мање поуздане него за хаплогрупе Y хромозома. Yfull је израчунао да је вероватноћа 95% да је HV0a1a1 настала пре између 1700 и 325 година, а да има TMRCA 1250 до 175 година. Притом I18719 вероватно није уврштен у процену засновану на три савремена узорка.
Можда је рачуница за HV0a1a1 несигурна, међутим ако погледамо осталe подгранe испод https://www.yfull.com/mtree/HV0a1/, којој је TMRCA 2100 година, видљив је солидан број узорака (међу којима је и један археогенетски резултат, због чега сам окачио HV0a1c , ради поређења) који су учествовали у прорачунима и иста процена времена настанка свакој од њих: formed 2100 ybp. Ако је на MTree већ утврђено толико генетски сродних женских линија I18719, испод HV0a1, где су са друге стране мушкарци? Ово је довољно да се тренутна позиција I18719 на Y стаблу I2-CTS10228* прогласи као крајње непоузданом.

Археогенетски налази су обично слабије покривени од савремених, па је тешко рећи где се тачно налазе у односу на њих. Тако је и за I18719 тешко рећи да ли је I2-CTS10228* или I2-Y3120* (Y3116) или нека њена подгрупа. На пример, овде https://www.yfull.com/branch-info/J-YP157/#t4-tab су два древна 1X и два савремена 3X узорка, па TMRCA није ни израчуната. Али јесте овде https://www.yfull.com/branch-info/I-Y141086/#t4-tab где је древни 1X и савремени 39X узорак.
Рекао бих за J-YP157 да су сва четири узорка древна, не само два, управо због малих дубина очитавања локуса, па отуд можда није израчуната TMRCA за ову подграну.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милош Децембар 27, 2021, 11:02:17 пре подне
Ја сам већ писао детаљно Yfull-у зашто да буду опрезни око овог узорка. До сада су на моје поруке одговарали прилично брзо. Ова громогласна тишина са њихове стране овог пута ми је сумњива. :)

Оно што су ми одговорили из Yfull-а се може свести на то да су и они свесни да је врло могуће у питању модеран узорак, али да су га пренели из рада, па све док се не одради додатна радиокарбонска анализа, остаће тако. По њиховим речима овај узорк има веома слабу покривеност и очитан му је једино Y3116, који је на нивоу Y3120. Као пример сахрањивања у истој хумци у различитим епохама, дали су ми пример Sungir узорака. Тако да они признају да је можда у питању "модеран" човек, али без додатне радиокарбонске анализе то не могу да тврде.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Децембар 29, 2021, 11:17:53 поподне
Чини ми се да има још неколико занимљивих узорака из овог рада који нису овде поменути. На пример:

I25524 IAP066; inv. 12967   Szécsényi-Nagy, Anna   This study   Context: Archaeological - Period   2175   130   450-1 BCE   Hungary_IA_LaTene_o3   Komárom–Esztergom county, Tokod-Altáró   Hungary   47,726454   18,665632   1240K   1   2,6   800538   M   n/a (no relatives detected)   R-PF6155

који је изгледа већ додат на YFull кao https://www.yfull.com/tree/R-M458/ (https://www.yfull.com/tree/R-M458/). Има из Мађарске и Чешке још узорака са Словенима блиских подграна хаплогрупе R1a, aли се уз то појављују и узорци хаплогрупе E-Z1057 (I16272 400-200 BCE Czech_IA_LaTene и два потенцијално контаминирана I18527 и I18832). Можда су R1a узорци назнака потенцијалне зоне мешања са популацијом која је учествовала у етногенези Словена, а присуство хаплогрупе E-Z1057 (коју имамо и код нас на ДНК пројекту) можда може да указује на то да је делимично на Балкан дошла и са Словенима у 6. и 7. веку.

Ништа не тврдим, али ето, да напоменем овде. Можда је још неко овде размишљао у том правцу.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Децембар 30, 2021, 06:08:16 пре подне
Поменути су:

https://www.yfull.com/live/tree/R-M458/ id:I25524
 I25524   Hungary_IA_LaTene_o3   2175   R-PF6155   R1a1a1   K1a+195
 I25524   R1a1a1b1a1a~   R-PF6202*(xFGC32020,BY32070,CTS11962.1,A11452)
 I25524:Result ( 91.7% 55 -0 +5): K1-a4

https://www.yfull.com/live/tree/R-L1029/ id:I13780 CZE [CZ-ST] 2250 ybp     најстарији R1a-L1029
 I13780   Czech_IA_LaTene   2250   R-YP5267   R1a1a1b1a1a1c1a3a~   K1a26
 I13780   R1a1a1b1a1a1c1a3a~   R-YP5269
 I13780:Result ( 93.3% 56 -0 +4): K1a26

https://www.yfull.com/live/tree/R-Z280/
 id:I14193 CZE [CZ-ST] 3850 ybp
 I14193   Czech_EBA_Unetice   3850   R-Z280   R1a1a1   T2e
 I14193   R1a1a1b1a2b3a1c2~   R-YP587*(xY10895,Y35753,A7020)
 I14193:Result ( 96.8% 61 -0 +2): T2e4

 id:I13795 CZE [CZ-US] 3000 ybp
 I13795   Czech_LBA_Knoviz   3000   R-Z280   R1a1a1   J1c8a
 I13795   R1a1a1b1a2   R-S204*(xS205,CTS1211)
 I13795:Result ( 91.4% 55 -1 +3): J1c8

 id:I11158
 I11158   Czech_EBA_son.I14193_son.I7198   4025   R-Z280   R1a1a1   U5b2c
 I11158   R1a1a1b1a2   R-S204*(xYP569,Y1401,YP4370,FGC46006,CTS1211)
 I11158:Result ( 96.7% 58 -0 +2): U5b2c3a

R1a
https://www.yfull.com/tree/R-M458/ id:I25524 HUN [HU-TB]  2176 ybp
    https://www.yfull.com/tree/R-L1029/ id:I13780 CZE [CZ-ST]  2250 ybp
https://www.yfull.com/tree/R-Z280/ id:I13795 CZE [CZ-US]  3000 ybp
    https://www.yfull.com/tree/R-FT6375/
    https://www.yfull.com/live/tree/R-FT6375/ id:I14193 CZE [CZ-ST]  3850 ybp
    https://www.yfull.com/tree/R-S24902/
    https://www.yfull.com/live/tree/R-YP563/ id:I11158 CZE [CZ-PR]  4025 ybp

R1b
https://www.yfull.com/tree/R-U106/ id:I23978 SVN [SI-142]  2521 ybp
https://www.yfull.com/tree/R-U152/ id:I7286 CZE [CZ-US]  4251 ybp
    https://www.yfull.com/tree/R-L2/
    id:I5696 SVN [SI-009]  2255 ybp
    id:I5690 SVN [SI-054]  2544 ybp
    id:I24342 HRV [HR-13]  3411 ybp
    id:I21402 FRA [FR-51]  2200 ybp
    id:I11701 AUT [AT-3]  2300 ybp
     https://www.yfull.com/tree/R-FGC59581/ id:I18492 HUN [HU-GS]  2240 ybp
     https://www.yfull.com/tree/R-S18462/ id:I25504 HUN [HU-VA]  2850 ybp
     https://www.yfull.com/tree/R-BY96884/ id:I5695 SVN [SI-009]  3086 ybp

Или је централна Европа била место где су се мешали источноевропски и западноевропски Индоевропљани или су Индоевропљани већ од самог почетка били мешавина R1a и R1b ( и E-V13 и других хаплогрупа), па је генетским дрифтом настала данашња ситуација - R1a претежно на истоку, R1b на западу, E-V13 на југу.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Децембар 31, 2021, 07:43:28 пре подне
Можда је рачуница за HV0a1a1 несигурна, међутим ако погледамо осталe подгранe испод https://www.yfull.com/mtree/HV0a1/, којој је TMRCA 2100 година, видљив је солидан број узорака (међу којима је и један археогенетски резултат, због чега сам окачио HV0a1c , ради поређења) који су учествовали у прорачунима и иста процена времена настанка свакој од њих: formed 2100 ybp. Ако је на MTree већ утврђено толико генетски сродних женских линија I18719, испод HV0a1, где су са друге стране мушкарци? Ово је довољно да се тренутна позиција I18719 на Y стаблу I2-CTS10228* прогласи као крајње непоузданом.
Рекао бих за J-YP157 да су сва четири узорка древна, не само два, управо због малих дубина очитавања локуса, па отуд можда није израчуната TMRCA за ову подграну.
Проблем није HV0a1a1 или HV0a1, већ mtDNA генерално. Мутација на mtDNA се може десити у следећој генерацији или у двадесетој. На дуге стазе, а то значи хиљаде и хиљаде година, број мутација у некој грани ће бити у оквиру просека, али гране са малим бројем мутација као што су ове могу значајно одударати од просека. Неколико екстремних примера:
https://www.yfull.com/mtree/H6a1b/ formed 3900 ybp, TMRCA 2900 ybp
https://www.yfull.com/mtree/H6a1b2/ formed 2900 ybp, TMRCA 1850 ybp
 id:I23207 SRB [RS-VO] age 3900 ybp
 id:NLKG218_M61 CHN [CN-XJ] age 2213 ybp
 id:BLT_M19 CHN [CN-XJ] age 4632

https://www.yfull.com/mtree/H6a1a/ formed 3900 ybp, TMRCA 2500 ybp
https://www.yfull.com/mtree/H6a1a4b1/ formed 950 ybp, TMRCA 550 ybp
 id:Hetian_M16A CHN [CN-XJ] age 1709 ybp
https://www.yfull.com/mtree/H6a1a26/ formed 2500 ybp, TMRCA 700 ybp
 id:AKB001 KAZ [KZ-KAR] age 2638 ybp

https://www.yfull.com/mtree/H4a-a/ formed 6600 ybp, TMRCA 5200 ybp
https://www.yfull.com/mtree/H4a1/ formed 5200 ybp, TMRCA 4000 ybp
 d:I2510 BGR [BG-04] age 4756 ybp
https://www.yfull.com/mtree/H4a1a1/ formed 2900 ybp, TMRCA 1500 ybp
 id:PB768 IRL [IE-CE] age 3811 ybp
https://www.yfull.com/mtree/H4a1a1a/ formed 1500 ybp, TMRCA 850 ybp ???
 id:CTH217 TUR [TR-42] age 8278 ybp !!!
https://www.yfull.com/mtree/H4a1a1a1a1/ formed 500 ybp, TMRCA 200 ybp
 id:VK203 GBR [GB-ORK] age 1600 ybp
https://www.yfull.com/mtree/H4a1a1a3/ formed 850 ybp, TMRCA 550 ybp
 id:PLEper327 HUN [HU-HB] age 1000 ybp
https://www.yfull.com/mtree/H4a1a1a6/ formed 850 ybp, TMRCA 600 ybp
 id:MHper15 HUN [HU-HB] age 1000 ybp
 id:MF498663.1 DEU [DE-BY] age 3811 ybp
https://www.yfull.com/mtree/H4a1c1a/ formed 1800 ybp, TMRCA 850 ybp
 id:I5696 SVN [SI-009] age 2255 ybp

https://www.yfull.com/mtree/U5b3a1/ formed 6800 ybp, TMRCA 5500 ybp
 id:R19 ITA [IT-AN] age 7290 ybp

https://www.yfull.com/mtree/U5b2c3/ formed 6600 ybp, TMRCA 3000 ybp
 id:MA969 EST [EE-37] age 4688 ybp
https://www.yfull.com/mtree/U5b2c3a/ formed 3000 ybp, TMRCA 1550 ybp
 id:I11158 CZE [CZ-PR] age 4025 ybp
 id:I7198 CZE [CZ-PR] age 4036 ybp

Наравно бројнији су примери где је старост налаза мања од старости хаплогрупе. Али мислим да ово показује да у целој заврзлами, прорачуни старости mtDNA су најмање поуздани. Надајмо се да ће неко утврдити колико је тачно стар I18719.

Yfull обично археогенетске узорке означава ружичастом бојом. Друга двојица су из рада "Low-pass DNA sequencing of 1200 Sardinians reconstructs European Y-chromosome phylogeny" где је квантитет имао предност над квалитетом.
https://yfull.com/sardinians/
https://www.yfull.com/samples-from-paper/2/?page=2
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23908240
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Јануар 03, 2022, 07:36:18 поподне
Стиже нови рад:

Reconstructing genetic histories and social organisation in Neolithic and Bronze Age Croatia

https://www.nature.com/articles/s41598-021-94932-9/tables/1


Од 13 мушких скелета, 7 је G2a.

Без већих изненађења. Опет одсуство E-V13.

Занимљив је овај R1a-Z93 из римског периода. Најниже је одређен као https://www.yfull.com/tree/R-F1345/ Можда открију нешто још ниже. Аутосомално има прилично велик удио степске генетике.

Било би такође интересантно ако би се могло специфичније одредити POP04 (J хаплогрупа).
https://www.nature.com/articles/s41598-021-94932-9/tables/1
Цитат
POP23   Beli Manastir-Popova zemlja Roman Period   260–402 calCE   Croatia_Pop_RomanP   M   962,966   T2f2   R1a1a1b2a2b1
https://www.yfull.com/tree/R-F1019/ formed 3100 ybp, TMRCA 2500 ybp
https://www.yfull.com/mtree/T2f2c/ formed 5100 ybp, TMRCA 2400 ybp
id:POP23 HRV [HR-14] age 258 ybp ( надам се да је грешка до Yfull-а, а да нису ископали попа)?

https://www.nature.com/articles/s41598-021-94932-9
https://www.nature.com/articles/s41598-021-94932-9/figures/1
(https://media.springernature.com/full/springer-static/image/art%3A10.1038%2Fs41598-021-94932-9/MediaObjects/41598_2021_94932_Fig1_HTML.png)
https://www.nature.com/articles/s41598-021-94932-9/figures/2
(https://media.springernature.com/full/springer-static/image/art%3A10.1038%2Fs41598-021-94932-9/MediaObjects/41598_2021_94932_Fig2_HTML.png)
https://www.nature.com/articles/s41598-021-94932-9/figures/3
(https://media.springernature.com/full/springer-static/image/art%3A10.1038%2Fs41598-021-94932-9/MediaObjects/41598_2021_94932_Fig3_HTML.png)
Цитат
To further characterise differential genetic affinities of the Jagodnjak group to the Dalmatian Bronze Age and other genomes, we visualised genetic substructures among post-Neolithic genomes from the region with increased resolution using UMAP and default parameters (Fig. 3c, Methods). While UMAP does not reflect genetic distances in a linear way, clearly defined clusters become apparent, in which Croatia_Pop_CA and Croatia_Dal_BA cluster with ancient genomes from Bulgaria, Montenegro, Romania and some Hungarians together with predominantly present-day Italian_North genomes, pointing to a genetic profile consistent with southern Europe. Testing with qpWave confirmed that Croatia_Pop_CA provides a feasible single source of ancestry for the Dalmatian Bronze Age (Supplementary Table S4). Croatia_Jag_MBA contrastingly falls to the left of present-day genomes from Hungary, Germany, Czech Republic and Croatia, indicating a Central European genetic signature. Other ancient genomes in this cloud also include individuals from the Carpathian Basin belonging to Makó EBA, Vatya MBA, and an LBA individual.

Genetic transformation following the Bronze Age
Neither the Jagodnjak nor the Dalmatian Bronze Age groups approximate present-day populations from the region in PCA space, indicating that further significant population changes have since occurred. Our single individual from Popova zemlja, Croatia_Pop_RomanP, provides rare genomic data for Croatia after the Bronze Age33. (Table 1, Fig. 4a, Supplementary Table S1). We find this individual clustering with present-day populations of Croatia, Bulgaria and Romania in PCA and UMAP space (Figs. 2, 3c).We investigated this clustering with f4-statistics and could confirm cladality of this individual with present-day Croatians compared to other ancient and present-day populations in Europe (Supplementary Table S7). We then tested population continuity with qpWave, and found Croatia_RomanP was consistent with forming a genetic clade with present-day Croatians, as well as Bulgarians or Hungarians (p = 0.78 respectively) (Supplementary Table S4). Although based on a single individual who may or may not be representative for the wider population in that time period, this data point indicates that a broadly present-day genetic signature had already formed by Roman times, and any further population turnovers were not as significant as previous ones.
https://www.nature.com/articles/s41598-021-94932-9/figures/4
(https://media.springernature.com/full/springer-static/image/art%3A10.1038%2Fs41598-021-94932-9/MediaObjects/41598_2021_94932_Fig4_HTML.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Јануар 12, 2022, 10:26:49 поподне
Ево једног право занимљивог археогенетичког рада.

Determining Y-DNA and mtDNA haplogroups for the Twelveth-Century Medieval Slavic Burial near Zagoryansky Settlement on the Upper Klyazma (Moscow Region). Part II (https://cyberleninka.ru/article/n/rezultaty-opredeleniya-gaplogrupp-y-dnk-i-mtdnk-dlya-srednevekovogo-slavyanskogo-zahoroneniya-xii-v-v-okrestnostyah-posyolka/viewer)

Анализирана су четири средњовјековна мушка склелета из околине Москве. Два припадају Е1b1b а друга два J2a1. Оно што је занимљиво јесте што узорке повезују са Србима. Помињу и неке резултате из Србије из непубликованих радова:

"Поскольку по результатам определения Y-гаплогруппы первого образца было сделано предположение о наличии связей с Балкано-Дунайским регионом, в анализ включены также группы с территории Центральной Сербии (могильники Омолица и Дупляя, расположенные в 20 км к юго-востоку от Белграда, XI–XII вв., неопубликованные данные Н.Н. Гончаровой)".
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НУки ⚔🦅⚔ Јануар 12, 2022, 11:44:52 поподне
Da li znaš na osnovu čega ih povezuju sa teritorijom Srbije i u koje vreme je datirana ta povezanost? Ne ide mi prevođenje sa ruskog baš najbolje😅
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Јануар 13, 2022, 12:32:03 пре подне
Da li znaš na osnovu čega ih povezuju sa teritorijom Srbije i u koje vreme je datirana ta povezanost? Ne ide mi prevođenje sa ruskog baš najbolje😅

 Вјероватно површног дилетантизма на првом мјесту типичног за многе публикације (типа I2a мезолитски Балканци). Помињу се проценти те хг на Балкану те то као правац недавне миграције. Спомињу и антрополошке налазе о блискостима са западним и јужним Словенима.

 По ограниченим STR вриједностима први E1b најприје припада грани E-CTS10880. А први Ј2а (прилично) могуће припада грани J-Z6046 у ком случају и не изгледају те везе нешто балканско-дунавски. Логично би се ту јавио и неки I-Y3120.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: сɣнце Јануар 13, 2022, 05:04:07 поподне
Da li znaš na osnovu čega ih povezuju sa teritorijom Srbije i u koje vreme je datirana ta povezanost? Ne ide mi prevođenje sa ruskog baš najbolje😅

На мјесту ископаних узорака по податцима из археологије живјели су некада фински Вијеси ( самоназвање Вепси ). Находи женских украшења из гробнице указују на племе Кривића које се је у тај крај насељавало у оно вријеме. По краниологијским поређењима може се приближно казати кому племену припадају остатци. Обзор лобања двају мужских узорака дао је вриједности које се приближавају вриједностима Поморјана и јужних Словијена.  То је побудило помисао, да сви узорци могу ( али не морају ) имати везу  са средњим Балканом и јоште даље, да је једно из овдашњих племена учествовало у етногенези тога дијела Кривића. Да би се та теорија провјерила или оповргла, као поредбена грађа узети су у рассматрање необјављени краниологички податци находа који потичу из 11./12. вијека са простора средишње Србије.

Заиста низводно добивенога снп J-PF5087 постоји један огранак https://www.yfull.com/tree/J-FGC4975/ (https://www.yfull.com/tree/J-FGC4975/) који указује на поријекло са простора Солуна, но постоје и други огранци који су присутни у Татара и Мордве.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Владимир Бојановић Јануар 13, 2022, 06:09:55 поподне
Заиста низводно добивенога снп J-PF5087 постоји један огранак https://www.yfull.com/tree/J-FGC4975/ (https://www.yfull.com/tree/J-FGC4975/) који указује на поријекло са простора Солуна, но постоје и други огранци који су присутни у Татара и Мордве.
Можда су и ови Турци из Једрена потомци тог племена? Свакако им се подграна J-Y237396 налази испод J-FGC30508 гране којој припада поменути Грк из Солуна.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Јануар 13, 2022, 06:49:37 поподне
Можда су и ови Турци из Једрена потомци тог племена? Свакако им се подграна J-Y237396 налази испод J-FGC30508 гране којој припада поменути Грк из Солуна.

Заиста низводно добивенога снп J-PF5087 постоји један огранак https://www.yfull.com/tree/J-FGC4975/ (https://www.yfull.com/tree/J-FGC4975/) који указује на поријекло са простора Солуна, но постоје и други огранци који су присутни у Татара и Мордве.

 Ако је Грк онда је јеврејског поријекла. Тај "Турчин" је Сефард из Турске. Та цијела грана је јеврејска. Ако видите да нека блискоисточна грана има огроман број припадника на YFull-у из Украјине, Литве, Румуније, Мађарске итд. а грана је bottleneck по правилу се ради о јеврејској грани (јер су јако добро покривени дубљим тестовима).

 Нису рађени SNP тестови за Y-DNA и стоји да су користили Невген предиктор. Један J2a има 437=16 што само мислим има J-Z6046 од свих или скоро свих грана, а то је доста спор маркер па је до добра индикација за ту грану. Други има доста чешћи модалнији 15 и само 3 маркера па се не може предвиђати баш шта је.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Јануар 20, 2022, 06:10:50 пре подне
За муштулук.
Цитат
I18719   P3779; BzV 10a   Pinhasi, Ron   This study   Context: Archaeological - Period   3200   144   1500-1000 BCE   Croatia_MBA_LBA   Bezdanjača Cave   Croatia   44.8520052   15.4199444   1240K   2   3.747999   825868   M   n/a (no relatives detected)   I-Y3120
Шта год да је, остаје забележено. Неће сад нико моћи жив остати од аутохтонаша...
Штуцавица је почела http://www.genealogywise.com/profiles/blogs/haplogroup-i2a1-l621-cts10228-y3120 .
Цитат
According to data collected from an extensive research that has been conducted in the last dozen years, and thousands of ancient and modern DNA test results from different European countries, it seems that the haplogroup I2a-L621 appeared somewhere along the Lower Danube about 12.000 YBP. There is also archeogenetic evidence that some I2a-L621 people lived in the middle of today’s Bulgaria 5000 years ago.[3] However, the carriers of its oldest lineages have managed to survive until today in central-western Europe. (https://www.yfull.com/tree/I-L621/) No one can tell (yet) how or when they arrived in the area, and, besides, it has been impossible to determine if the subclade Y3120 (formed 3400 YBP) “was born” there or not.

 Fortunately, the recent publication of the paper "Large-Scale Migration into Southern Britain during the Middle to Late Bronze Age"[4]  shed some light on the problem. The study includes genome-wide data from 793 individuals, all from the Middle to Late Bronze Age and the Iron Age, and, as it happens, one of these individuals (“I18719”) was I-CTS10228>Y3120 male who lived in (today’s) Croatia between 1200 and 1000 BCE and had south European autosomal background.

[At present, it should also be pointed out that the “Y3120* men”, negative for downstream branches, live in the Balkans (9 different surnames from Serbia, Bosnia and Herzegovina, Croatia https://dnk. poreklo.rs/DNK-projekat/ ). And, there are some Montenegrins who are yet to be verified.]
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: barbarylion Јануар 20, 2022, 12:56:07 поподне
Штуцавица је почела http://www.genealogywise.com/profiles/blogs/haplogroup-i2a1-l621-cts10228-y3120 .

Au, koje gluposti čovek napisa/ispriča.
U stilu montenegrinskog ,,Vlaho-arbanasa".
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 21, 2022, 03:56:43 поподне
Сад видјех на Biorxiv да је објављен препринт рада

Whole genome analysis sheds light on the genetic origin of Huns, Avars and conquering Hungarians

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.01.19.476915v1

Не стигох да погледам има ли шта интересантно.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 21, 2022, 04:41:48 поподне
Сад видјех на Biorxiv да је објављен препринт рада

Whole genome analysis sheds light on the genetic origin of Huns, Avars and conquering Hungarians

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.01.19.476915v1

Не стигох да погледам има ли шта интересантно.

Колико видим секвенциран је велики број узорака. Ту би требало бити доста новог материјала.

Не видим још да су bam фајлове поставили на ENA иако у раду стоји да јесу, дали су и шифру рада.

Има неких који би потенцијално могли бити и I2-PH908, такође видим да има доста E-V13.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 21, 2022, 04:55:16 поподне
Ово су I2a Dinaric узорци из рада. За овај посљедњи сумњам да би могао бити I2-PH908.

(https://i.postimg.cc/HsrSsVBJ/i2a-dinaric-hungary-ancient.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 21, 2022, 05:07:13 поподне
А ово су E-V13 из рада:

(https://i.postimg.cc/kgTXFJ0d/e-v13-hungary-ancient.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Exiled Јануар 21, 2022, 05:20:57 поподне
Ово су I2a Dinaric узорци из рада. За овај посљедњи сумњам да би могао бити I2-PH908.

(https://i.postimg.cc/HsrSsVBJ/i2a-dinaric-hungary-ancient.png)
Опа Мићо,ево нас међ мађарском елитом. Видим ја да ми латиница не гине😀Кажу да процену елите дају на основу онога са чим су покопани, оружје,накит и слично...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 21, 2022, 05:32:53 поподне
Опа Мићо,ево нас међ мађарском елитом. Видим ја да ми латиница не гине😀Кажу да процену елите дају на основу онога са чим су покопани, оружје,накит и слично...

Зар не видиш да је негативан на PH3310?

Измаче се елита, али замало. ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Uzi Јануар 21, 2022, 05:36:05 поподне
Сад видјех на Biorxiv да је објављен препринт рада

Whole genome analysis sheds light on the genetic origin of Huns, Avars and conquering Hungarians

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.01.19.476915v1

Не стигох да погледам има ли шта интересантно.

Занимљив рад. Од N хаплогрупа опет је само N1 пронађена, N2 ни трага. N1 и N2 су удаљене 22000 година али ће опет неки "интернет стручњаци" причати да је N2 дошла на Балкан са Аварима. Или још горе да је N2 некаква Угро-финска хаплогрупа, а међу Угрима и Финцима ни трага од N2.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 21, 2022, 05:38:19 поподне
Иначе Conqueror period се односи на период 10. вијека и доласка Мађара,а ту је већ могло бити свега и свачега. Ево извода из рада о аутосомалним резултатима из тог периода:

Summarizing the genetic makeup of the Conqueror period samples from Table S1b, we found that approximately 25% of the elite carried Conq_Asia_Core genomes, 25% Hun/Avar related genomes, 20% were locals with pure EU_Core makeup, while 30% were admixed between locals and immigrants. The same calculation for the commoners gives 55% local (pure EU_Core), 40% admixed between locals and immigrants, 3% Avar/Hun related, and ~2% Conq_Asia_Core-like genome distribution. These numbers imply that most individuals in the commoner cemeteries
represented local individuals as had been inferred from mitogenome data and that the Conquerors rapidly integrated the local population via intermarriage.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Exiled Јануар 21, 2022, 05:39:06 поподне
Зар не видиш да је негативан на PH3310?

Измаче се елита, али замало. ;)
Позитива је у оку посматрача😉
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 21, 2022, 05:40:11 поподне
Занимљив рад. Од N хаплогрупа опет је само N1 пронађена, N2 ни трага. N1 и N2 су удаљене 22000 година али ће опет неки "интернет стручњаци" причати да је N2 дошла на Балкан са Аварима. Или још горе да је N2 некаква Угро-финска хаплогрупа, а међу Угрима и Финцима ни трага од N2.

Да, погледах и ја за N хаплогрупу. Очекивао сам да се ако ништа друго због карпатске географије појави бар један N2. Али ништа.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 21, 2022, 05:51:00 поподне
Занимљиво је да су присутна два узорка словенске R1a-CTS3402>YP237 у хунском периоду (крај 4. прав половина 5. вијека). Ово би били неки најранији словенски трагови у Панонској низији. Неки који су претходили сеоби Словена у 6. вијеку.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Јануар 22, 2022, 10:00:12 пре подне
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2022/01/20/2022.01.19.476915/DC1/embed/media-1.pdf?download=true
страна 73
Цитат
EU_Core1: This group is located at the southernmost part of the EU-cline, and their PC2 position overlaps with modern Greeks, Albanians, Italians and European Neolithic-Chalcolithic samples. This group is best represented by samples; ALT-224, KK1-251, KK1-252, SZK-83, SZK-180 and SZOD-376 (Extended Data Fig.1b), all of them from the Avar period, except for the 11th century commoner SZOD-376.
On PC50 clustering EU_Core1 clusters together with Langobards from Hungary11, Iron Age, Imperial and Medieval individuals from Italy12, as well as with Minoans and Mycenaeans from Greece13 (Table S3), indicating an ancient southern European genetic affinity of this group.
страна 94
Цитат
From the 9 Avar_Asia_Core males 7 carried the N1a1a1a1a3a (N1a-F4205) Y-Hg, one C2a1a1b1b and one R1a1a1b~ (very likely R1a-Z94) confirming, that N1a-F4205, most prevalent in modern Chukchis and Buryats42, was also prevailing among the Avar elite as shown before22,43. This Hg was indeed common in members of the Avar-cline, and also seems to cluster in certain cemeteries. In the Ároktő (ACG), Felgyő (FU), Szegvár-Oromdűlő (SZOD), Csepel-Kavicsbánya (CS), Kiskőrös-Vágóhídi dűlő (KV), Kunpeszér-Felsőpeszér (KFP), Csólyospálos-Felsőpálos (CSPF), Kiskundorozsma-Kettőshatár II (KK2), Tatárszentgyörgy (TTSZ), Madaras-Téglavető (MT) Avar graveyards all, or the majority of males carried the N1a-F4205 Hg, mostly accompanied with Asian maternal lineages. These cemeteries must have belonged to the immigrant Avar population, while the local population seems to have separated, as many Avar period cemeteries show no sign of Asian ancestry. Latter include Mélykút-Sándordűlő (MS), Szeged-Fehértó A (SZF), Szeged-Kundomb (SZK), Szeged-Makkoserdő (SZM), Kiskundorozsma-Kettőshatár I (KK1), Kiskundorozsma-Daruhalom (KDA), Orosháza-Bónum Téglagyár (OBT), Székkutas-Kápolnadűlő (SZKT), Homokmégy-Halom (HH), Alattyán-Tulát (ALT), Kiskőrös-Pohibuj Mackó dűlő (KPM), and Sükösd-Ságod (SSD), in which Asian lineages barely occur. In the SZK, ALT, KK1, OBT, SZKT, HH and SZM cemeteries most males belonged to the E1b1b1a1b1 (E-V13) Hg, which is most prevalent in the Balkan44, and accordingly many of the samples from these cemeteries fell in EU_Core1, or its vicinity, with typical Southern European genomes.
страна 95
Цитат
The Conqueror population had a more heterogeneous Hg composition than the Huns and Avars. In the 6 males of Conq_Asia_Core we detected three N1a1a1a1a2~, one D1a1a1a1b, one C2a1a1b1b and one Q1a1a1 Y-Hg, generally accompanied by Asian maternal lineages. Two other N1a1a1a1a2a1c~ Y-Hgs were detected in the SO-5 Conqueror elite and the PLE-95 commoner individuals, thus this Hg was specific for the Conqueror group. Obviously this Hg links Conquerors with Mansis, as had been shown before45. Another related Y-Hg, N1a1a1a1a4 (M2128) was detected in two Conqueror elite samples from present study, as well as from other two Conqueror elite samples in our previous study22. This Hg is typical for modern Yakuts, and occurs with lower frequency among Khantys, Mansis and Kazakhs42, thus may also link Conquerors and Mansis, though it was also present in one Middle Avar individual. It is notable, that the European Y-Hg I2a1a2b1a1a was also specific for the Conqueror group, especially for the elite, as also shown before22, very often along with Asian maternal lineages, indicating that this Hg could be more typical for the immigrants than to the local population. Additionally, two other Y-Hgs appeared with notable frequencies among the Conquerors, R1a-Z94 was present in 3 elite and 2 commoner individuals, while Hg Q was carried by 3 elite individuals, which may be sign of Hun relations, also detected at the genome level.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Јануар 22, 2022, 10:03:30 пре подне
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2022/01/20/2022.01.19.476915/DC2/embed/media-2.xlsx?download=true

Издвојио бих неке који ми изгледају занимљиво:
ALTper77 J2b2a1a1a1a1a1b~ J-Y21878*(xY37121)
CSBper3 R1b1a1b1b3a1a1 R-CTS9219*(xA1777)
IBEper107 I2a1b1a2b1a~ I-FGC7880/etc*(xCTS327,FGC3622,S12606,Y7157,Y31861,FGC30184,Y16445,Y22370,Y7205,Y36556)
IBEper154 I1a1a1~ I-S4767*(xS4763,Y17936,Y24819,S24397,Y6348,Y6339)
K2per26S I1a3 I-S243*(xFGC9519,S17023,FGC14493,A8229,PH2195,Y7073,Y14661,Y13961,S19965)
KHper500 N1a1a1a1a4 N-M1992/etc*(xM2108)
KKper251 E1b1b1a1b1a10a2 E-Z21363/etc*(xZ21360,BY5520,BY5675,BY5670,BY5650,BY5625,BY5575,BY5502)
HUNper2 ( mtDNA D4j8) R1b1a1b1a1a1c2b2b1a~ R-S1746/etc*(xFGC10367,S21728,Z83)
KPMper14 J2a1a1b2a1b1b~ J-PF5430*(xF801,Z2177,FGC6750,FGC54172)
KPMper23 J2a1a1b2a1b1 J-L397*(xPH2725,FGC52116,Z40772)
MHper88  I1a3a~ I-FGC9505*(xFGC9509,FGC14870,FGC14479,Y20876,Y24458,Y16523,S2097)
OBTper3 R1a1a1b1a2a~ R-CTS9412/etc*(xYP569,YP270,Z685)
OBTper56 R1a1a1b1a2a~ R-CTS9412*(xYP577,YP1700,BY30708,YP5523,YP272,Z685)
PLEper195 J2a1a1a2b2a2b2b~ J-Z6271
PVper125 I2a1b1a2a1a1~ I-S8269/etc*(xS23612)
SPper2 J2b2a1a1a1a1a J-Z1297*(xCTS1317,Y27523)
SSDper198 J2a1a2b2a2~ J-Y14449*(xZ27879,Y21178) 
SZKper180 R1b1a1b2a2b4 R-PH2558*(xPH4238)
SZMper24 I1a1a1a1a~ I-Y4782/etc*(xY19809,Y7925)
SZMper332 E1b1b1a1b2c1a~ E-BY7452
SZMper38 I1a2a2 I-Z2041*(xY3564,Z44266,Z26340,FGC24368,Y5391)
TMHper38 R1a1a1b1a2b3a3a2~ R-FGC10190/etc*(xCTS11142,YP1447,Y35213,BY32477,YP6085,Y4383,FGC56507,FGC10352)
TMHper50 I1a3a1a2~ I-FGC14870*(xS15301,L1243)
TMHper79 I1a3a1a2~ I-FGC14870*(xS15301,L1243)
VPBper279 R1a1a1b2a2b2b3a~ R-YP5644
VPBper307 J2b2a1 J-Z595/etc*(xAM00228,YP155)
VPBper561 T1a2b T-L446/etc*(xCTS12204,FGC23010)
VZper1267 R1a1a1b2a2a3c2~ R-S12380/etc*(xY73177)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Јануар 22, 2022, 10:47:19 пре подне
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2022/01/20/2022.01.19.476915/DC2/embed/media-2.xlsx?download=true
Издвојио бих неке који ми изгледају занимљиво:

PLEper195 J2a1a1a2b2a2b2b~ J-Z6271

Ова подграна J-M67 је можда значајније заступљена код Срба из јужне и централне Србије. Нажалост, нико од тестираних није радио дубље тестове, па овај генетички род још увек није конкретно профилисан.

SSDper198 J2a1a2b2a2~ J-Y14449*(xZ27879,Y21178)

Низводно од J-Y4449*, тј. J-Y7013 налази се J-Y14439 која је код Срба присутна углавном у рашкој области, Старом Вклаху, племену Дробњака и Крајини. Нико од Срба није дубински тестиран, али сва је прилика да ће упасти у J-Y14439* којој припадају један Саудијац и Бугарин са Yfull.


Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 22, 2022, 06:50:28 поподне
Доступни су bam фајлови из рада Y-chromosome haplogroups from Hun, Avar and conquering Hungarian nomadic people of the Carpathian Basin

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB31764?show=reads
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милан Петровић Јануар 22, 2022, 06:55:23 поподне
Доступни су bam фајлови из рада Y-chromosome haplogroups from Hun, Avar and conquering Hungarian nomadic people of the Carpathian Basin

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB31764?show=reads
Хоће ли бити на YFull-у?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 22, 2022, 07:35:21 поподне
Хоће ли бити на YFull-у?

Вјероватно хоће.

Ово што сам видио, чини ми се да на ENA нису поставили све резултате. Бар нису оне који су мени најинтересантнији.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 22, 2022, 08:12:33 поподне
Доступни су bam фајлови из рада Y-chromosome haplogroups from Hun, Avar and conquering Hungarian nomadic people of the Carpathian Basin

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB31764?show=reads

Моја грешка, ово су стари бамови из рада из 2019. године. Неки узорци се преклапају па сам их помијешао. Ови нови још ипак нису објављени.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Јануар 28, 2022, 09:29:34 поподне
Новости са Антрогенике: https://www.eupedia.com/forum/threads/40865-High-levels-of-HG-in-LN-German-settlement?p=618462#post618462

У питању је Имел ет ал. студија под називом Genome-wide study of a Neolithic Wartberg grave community reveals distinct HLA variation and hunter-gatherer ancestry (https://www.nature.com/articles/s42003-020-01627-4)

Узорци са немачког неолитског локалитета Вартберг указују на већу отпорност западних ловаца-сакупљача на вирусе од савремених популација, али не и на бактеријске инфекције. Узорци, међу којим они мушког пола сви припадају хаплогрупи I2 (I2a1, I2a2, I2c1) датирани су на 3300-3200 п.н.е (калибрисано), непосредно пре миграције сточара са истока. мтДНК хаплогрупе су разноврсне. Удео WHG компоненте достиже чак 34-58%. Временом су ти алели могли изгубити предност мутирањем патогена, а дошло је до селекције оних везаних за отпорност на бактерије, попут Јерсиније Пестис која изазива Кугу (након доласка сточара).
Занимљиво је да на скоро сваком нивоу између L621 и Y3120 (што покрива период од оквирно 3500 година) имамо модерне узорке пореклом из једне исте југозападне немачке провинције, Баден-Виртемберга (https://sr.wikipedia.org/wiki/%D0%91%D0%B0%D0%B4%D0%B5%D0%BD-%D0%92%D0%B8%D1%80%D1%82%D0%B5%D0%BC%D0%B1%D0%B5%D1%80%D0%B3). Ово би могло указивати да су се грана L621 и гране испод ње у том временском периоду развијале управо негде на том простору.

(https://i.postimg.cc/1Xt5gwKL/1-1.png)

Археолошке културе које најбоље одговарају том периоду и простору су каснонеолитске Михелсбершка (4400-3500 п.н.е.) (https://en.wikipedia.org/wiki/Michelsberg_culture) и Вартбершка (3500-2800 п.н.е.) (https://en.wikipedia.org/wiki/Wartberg_culture), па би се можда управо у мегалитским гробницама ових култура могли пронаћи преци гране Y3120. У раду Immel et al. (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/851188v1.full.pdf) од прошле године тестирани су скелети баш из једне мегалитске гробнице (https://en.wikipedia.org/wiki/Niedertiefenbach_(megalithic_tomb)) Вартбершке културе, и за два мушка скелета је утврђено да припадају грани I2a1-M423 (https://www.yfull.com/tree/I-M423/) (из које је проистекла L621). Занимљиво је да је за већину мушких скелета из ове гробнице (чак 16) утврђено да припадају грани I2c-L596>Y14158>S9234 (https://www.yfull.com/tree/I-S9234/), а по један је припадао гранама I2a2-S23680* (https://www.yfull.com/tree/I-S23680/) и I2a1-M838 (https://www.yfull.com/tree/I-M838/).

(https://i.postimg.cc/xjxL6PBN/michelsberg-wartberg.png)

https://www.haplotree.info/maps/ancient_dna/slideshow_samples.php?searchcolumn=Y_Haplotree_Variant&searchfor=I-CTS5375*&ybp=500000,0
https://www.yfull.com/tree/I-Y3104/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Фебруар 01, 2022, 01:45:33 поподне
Нови препрпинт рада древне днк

A genomic snapshot of demographic and cultural dynamism in Upper Mesopotamia during the Neolithic Transition
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.01.31.478487v1
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.01.31.478487v1.full.pdf
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2022/02/01/2022.01.31.478487/DC1/embed/media-1.pdf?download=true
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2022/02/01/2022.01.31.478487/DC2/embed/media-2.xlsx?download=true

Анализирано је 13 генома древне днк неолитске културе Çayönü на југоистоку Турске. Старост узорака је из око 8000 г. пне. Колико сам успио видјети, успјели су изоловати Y-днк из само два узорка.

Узорак cay007 припада хаплогрупи Ј2
Узорак cay012 припада хаплогрупи C-M407

Када буду доступни сирови резултати, било би добро провјерити да ли нешто испод Ј2 може да се открије.

Претпоставља се да су у оквиру ове културе први пут свиње почеле да се користе као домаће животиње. Тако да хвала им на сланини и чварцима. Ништа без ових Ј2.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Фебруар 07, 2022, 08:30:42 пре подне
Нови препринт рада древне ДНК

Бронзано доба западне Паноније

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.02.03.478968v1
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.02.03.478968v1.full.pdf
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2022/02/06/2022.02.03.478968/DC1/embed/media-1.pdf?download=true

И овдје би могао бити један необичан резултат, узорак S9 припада хаплогрупи R1a-Z280>CTS3402(V2670)

(https://i.postimg.cc/gkxvSL4m/bronze-age-hungary.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Фебруар 07, 2022, 08:56:08 пре подне
Везано за узорак S9 R1a-Z280>CTS3402 ево неколико навода из самог рада:

"Interestingly, a tumor marker on the BRCA2 gene (rs80358920, GL=0.999) in individual S9 is nowadays only prevalent in Asian populations."

"At Balatonkeresztúr-Réti-dűlő only one burial (individual S9) can be associated with this archaeological culture according to its 14C date (3929±30 BP, 2560-2290 cal BCE, 95.4% CI). Remains of this individual (Fig. S.1.4.1) were discovered in a settlement pit, lying in a special position, on his back and with the knees and head on the left side, oriented with N/NES/SW 13. Here, only pottery shards and animal bones were found, probably belonging to the waste pit. Bones were preserved in worse condition than other human remains discovered in the group of burials, suggesting bad life conditions. The skeletal remains of this individual consist of a moderately preserved skull and well preserved bone material. Determined as a male of 35-40 years with a calculated height of 154.8 cm, his anthropological features, mainly his skull shape (ultradolichokran curvoccipital) are resembling more to the preceding Copper Age population 14–16. No particular pathological condition could be observed, except some cribra orbitalia (porotic lesions on the upper wall of the eye-orbit), which may resulted from the increased erythrocyte number that signalise a wide variety of pathological conditions from malnutrition to malaria."

"Grave of individual S9 surrounded by animal remains, such as cattle metatarsus under his skull. His burial position shows resemblance to people of high steppe ancestry13, that which this individual possesses too."

"Individual S9 from Bk-I has the R1a-Z280>>V2670 Y chromosome subgroup, which according to STR network analysis of modern samples is identical with a number of individuals from Northeastern Europe. Although the poor diversity pattern of this Y subgroup makes the results conditional."

"As expected based on the chronological gap, individual S9 from Bk-I does not show genetic relationship to any individual from Bk-II nor Bk-III up to the second degree (uncle-nephew, half-sibling, grandparentgrandchild)."

"S9 from Bk-I had European light, almost pale skin that probably had no freckles and was likely a bit less sensitive to sunburn. His hair was dark blonde and his eyes were likely blue, which traits are in accordance with previous studies of people with steppe origin."

"Bk-I surprisingly show rather similar makeup, although the HG levels (and coverage) for S9 are so low that it could bias the results"

"Bk-I (individual S9) resembles most to Northern Bronze Age groups in terms of HG affinity"
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Фебруар 10, 2022, 06:44:45 пре подне
Препринт рада који који говори о генетици прото-Мађара

Tracing genetic connections of ancient Hungarians to the 6-14th century populations of the Volga-Ural region

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.02.04.478947v1
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.02.04.478947v1.full.pdf
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2022/02/08/2022.02.04.478947/DC1/embed/media-1.pdf?download=true
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2022/02/08/2022.02.04.478947/DC2/embed/media-2.xlsx?download=true
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: filipi Фебруар 15, 2022, 02:01:10 поподне
Ancient DNA at the edge of the world: Continental immigration and the persistence of Neolithic male lineages in Bronze Age Orkney

https://www.pnas.org/content/119/8/e2108001119

Y-Chromosome Variation.
There are 16 known Y-chromosome (Y-DNA) haplotypes from Neolithic Orkney, of which 14 appear to be well resolved (13, 32). All 14 belong to haplogroup I2a, of which seven are I2a1b-M423, four are I2a1b1-S185, one is I2a2-S33, one is I2a2a1b-CTS10057, and one is I2a2a1a2-Y3679 (the remaining two are poorly resolved I and I2). In BA LoN, even though the majority of genome-wide and female lineages most likely arrived in Britain and Orkney with the BBC or BA, all but one of the nine Y-DNA lineages belong to haplogroup I2a1b-M423, with just one belonging to R1b-M269 (SI Appendix, Section S6 and Dataset S1H). We found four distinct haplotypes within I2a1b: I2a1b-M423, I2a1b1-S185, and the more derived I2a1b1a1b-A1150 and I2a1b1a1b1-A8742.

This predominance of I2a1b-M423 is surprising because it is completely absent elsewhere in CA/BA Europe, where the Y-DNA landscape is heavily dominated by R1b-M269 (Figs. 2–4 and SI Appendix, Figs. S13–S15). For example, in a dataset of 21 BBC males from Britain, 20 carry the R1b-M269 lineage and only one I2a, which is on the distinct I2a2a-M223 lineage. If we include CA and EBA Britain and Ireland, 41 out of 43 males carried R1b-M269, two I2a2a-M223, and none I2a1b-M423.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милан Петровић Фебруар 15, 2022, 03:09:47 поподне
Ancient DNA at the edge of the world: Continental immigration and the persistence of Neolithic male lineages in Bronze Age Orkney

https://www.pnas.org/content/119/8/e2108001119

Y-Chromosome Variation.
There are 16 known Y-chromosome (Y-DNA) haplotypes from Neolithic Orkney, of which 14 appear to be well resolved (13, 32). All 14 belong to haplogroup I2a, of which seven are I2a1b-M423, four are I2a1b1-S185, one is I2a2-S33, one is I2a2a1b-CTS10057, and one is I2a2a1a2-Y3679 (the remaining two are poorly resolved I and I2). In BA LoN, even though the majority of genome-wide and female lineages most likely arrived in Britain and Orkney with the BBC or BA, all but one of the nine Y-DNA lineages belong to haplogroup I2a1b-M423, with just one belonging to R1b-M269 (SI Appendix, Section S6 and Dataset S1H). We found four distinct haplotypes within I2a1b: I2a1b-M423, I2a1b1-S185, and the more derived I2a1b1a1b-A1150 and I2a1b1a1b1-A8742.

This predominance of I2a1b-M423 is surprising because it is completely absent elsewhere in CA/BA Europe, where the Y-DNA landscape is heavily dominated by R1b-M269 (Figs. 2–4 and SI Appendix, Figs. S13–S15). For example, in a dataset of 21 BBC males from Britain, 20 carry the R1b-M269 lineage and only one I2a, which is on the distinct I2a2a-M223 lineage. If we include CA and EBA Britain and Ireland, 41 out of 43 males carried R1b-M269, two I2a2a-M223, and none I2a1b-M423.

I2a1b-M423 likely arrived in Orkney with the first farmers. In the Neolithic, I2a1b-M423 was largely distributed in an arc around the Atlantic façade of Europe, from the western Mediterranean to the Baltic. Outside Britain, most I2a1b-M423 lineages are from Middle/Late Neolithic Spain and France, with one from Germany and a small number from Sweden, where, at a megalithic site on Gotland, all four genotyped males belonged to I2a1b-M423 (Fig. 4) (32). It is also present in several hunter-gatherers in northern and central Europe, including Mesolithic Ireland. This distribution, the molecular-clock age of the two major subclades (I2a1b1-S185 and I2a1b2-S392 both date to ∼7 ka)

I2a1b2-S392, je L621, зар не?  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Фебруар 15, 2022, 03:59:57 поподне
This distribution, the molecular-clock age of the two major subclades (I2a1b1-S185 and I2a1b2-S392 both date to ∼7 ka)

I2a1b2-S392, je L621, зар не?  :)

У тексту је поменут само у контексту датовања настанка ових грана, нигде није поменуто да је S392 пронађен на бронзанодопским налазиштима на Оркнијским острвима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милан Петровић Фебруар 15, 2022, 04:23:16 поподне
У тексту је поменут само у контексту датовања настанка ових грана, нигде није поменуто да је S392 пронађен на бронзанодопским налазиштима на Оркнијским острвима.
Аха, схватам.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Фебруар 20, 2022, 11:52:59 пре подне
Везано за узорак S9 R1a-Z280>CTS3402 ево неколико навода из самог рада:

"Interestingly, a tumor marker on the BRCA2 gene (rs80358920, GL=0.999) in individual S9 is nowadays only prevalent in Asian populations."

"At Balatonkeresztúr-Réti-dűlő only one burial (individual S9) can be associated with this archaeological culture according to its 14C date (3929±30 BP, 2560-2290 cal BCE, 95.4% CI). Remains of this individual (Fig. S.1.4.1) were discovered in a settlement pit, lying in a special position, on his back and with the knees and head on the left side, oriented with N/NES/SW 13. Here, only pottery shards and animal bones were found, probably belonging to the waste pit. Bones were preserved in worse condition than other human remains discovered in the group of burials, suggesting bad life conditions. The skeletal remains of this individual consist of a moderately preserved skull and well preserved bone material. Determined as a male of 35-40 years with a calculated height of 154.8 cm, his anthropological features, mainly his skull shape (ultradolichokran curvoccipital) are resembling more to the preceding Copper Age population 14–16. No particular pathological condition could be observed, except some cribra orbitalia (porotic lesions on the upper wall of the eye-orbit), which may resulted from the increased erythrocyte number that signalise a wide variety of pathological conditions from malnutrition to malaria."

"Grave of individual S9 surrounded by animal remains, such as cattle metatarsus under his skull. His burial position shows resemblance to people of high steppe ancestry13, that which this individual possesses too."

"Individual S9 from Bk-I has the R1a-Z280>>V2670 Y chromosome subgroup, which according to STR network analysis of modern samples is identical with a number of individuals from Northeastern Europe. Although the poor diversity pattern of this Y subgroup makes the results conditional."

"As expected based on the chronological gap, individual S9 from Bk-I does not show genetic relationship to any individual from Bk-II nor Bk-III up to the second degree (uncle-nephew, half-sibling, grandparentgrandchild)."

"S9 from Bk-I had European light, almost pale skin that probably had no freckles and was likely a bit less sensitive to sunburn. His hair was dark blonde and his eyes were likely blue, which traits are in accordance with previous studies of people with steppe origin."

"Bk-I surprisingly show rather similar makeup, although the HG levels (and coverage) for S9 are so low that it could bias the results"

"Bk-I (individual S9) resembles most to Northern Bronze Age groups in terms of HG affinity"

Још пар занимљивих цитата:

"Interestingly, a tumor marker on the BRCA2 gene (rs80358920, GL=0.999) in individual S9 is nowadays only prevalent in Asian populations22. For further discussions, see Supplementary Information section 3.2."

"According to the principal component analysis (PCA) based on 590k nuclear SNPs (Fig. 3 a.) Bk-I is clearly separated from Bk-II and Bk-III, where Bk-II has a strong shift towards HG samples23 overlapping with only a fraction of known archaic samples23 and Bk-III. Admixture and qpAdm analyses for assessing genetic components (Supplementary Tables S9, S12-16; Supplementary Information sections 5.2 and 5.5.2) revealed ~17% HG, ~40% European farmer, and ~43% steppe ancestry for Bk-I, similar to average Bronze Age Europeans. Bk-I is most likely derived from a single source that is genetically related to a Poland Southeast Bell Beaker culture (BBC) associated population (p = 0.784) in line with archaeological observations24."

Узорак S9 би по свему судећи могао да се протумачи као један од чланова популације која је директно учествовала у етногенези Словена у наредним миленијумима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Србин Март 07, 2022, 07:16:31 поподне
Објављен рад "Палеогенетско испитивање остатака из једног масовног гроба у Јарославу из 1238 године", Мустафин ет ал. С Антрогенике: https://anthrogenica.com/showthread.php?97-Genetic-Genealogy-amp-Ancient-DNA-in-the-News-(TITLES-ABSTRACTS-ONLY)&p=835755&viewfull=1#post835755

Текст је на 107. страни, а Y STR резултати на 111. страни, па не би било лоше упоредити их са хаплотиповима из других база.

4xR-Z280 (2xR-Z92, 2xR-CTS1211>CTS3402)
1xR-M458>L1029
1xN-M46>L1026
1xN-CTS6380>VL67
1xE-V13
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Март 10, 2022, 09:43:52 пре подне
Недавно је изашао рад у руском часопису "Генетика" који се бави археогенетском анализом скелета са подручја Хазарског каганата, односно из 8-9. века са територије ростовске области. У питању је 57. том, бр. 4 тог часописа, који је изашао ове године и до чијег апстракта се може доћи преко следећег линка:

http://vigg.ru/genetika/

Име чланка је "Y-ГАПЛОГРУППЫ КОСТНЫХ ОСТАНКОВ ИЗ КУРГАННЫХ ПОГРЕБЕНИЙ ХАЗАРСКОГО ВРЕМЕНИ НА ТЕРРИТОРИИ ЮГА РОССИИ". О саставу хаплогрупа се из апстракта може сазнати следеће - три скелета су носиоци R1a хаплогрупе, два су C2b, и по један скелет припада G2a, N1a, Q и R1b хаплогрупи. Рађено је само SNP тестирање, не и NGS тест, а помињу се и маркери.


Тек сам јуче успио доћи до пуног текста овог рада. Рађено је SNP тестирање, али веома сведено, само на мутације R-M207, R1a-M420, R1b-M343, N-M231, Q-M242. Добро је што су урадили STR профилисање и то на проширени YFiller (17 маркера плус), па су извучене хаплогрупе и за неке од узорака којима није успјело SNP тестирање. Укупно, профилисано је девет хазарских узорака.

Сви су са простора доњег Дона, данашње Ростовске области на југу Русије. Датирани су на основу археолошких података у период 7-9. вијека. Ради се о хазарској војној елити (на то указује богат археолошки инвентар гробова). Тако да би ово заиста могао бити неки генетички пресјек Хазара, бар тог њиховог владајућег слоја.

(https://i.postimg.cc/2SRg5Qjp/hazari1.png)
(https://i.postimg.cc/0jKHkQL2/hazari2.png)
(https://i.postimg.cc/XYnS8fRf/hazari3.png)

Сам текстуални дио рада и анализа веома су површни.  Довољно је индикативно да на самом почетку опредјељују R1a и R1b као европске хаплогрупе, иако су и те гране међу Хазарима азијског поријекла. Користили су више предиктора међу њима и Невген, али се нису упуштали у ближе одређење грана.

Прошао сам кроз хаплотипове и у односу на основне хаплогрупе дате у самом раду може се сљедеће закључити у вези припадности узорака одређеним гранама:

Узорак 67      R1b-M73    (Близак му је на 17 маркера један тестирани из околине Пирота из САНУ истраживања)
Узорак 457   G2a-U1>L1266   (највећа је блискост са граном L1266, која нагиње углавном кавкаској зони)
531   R1a-M417 (не може се грана тачно одредити, али мислим да се ради о R1a-Z93)   
619   Q-F1096   
656   C-F1756   (није предалеко тестирани из Баната)
1251   R1a-Z93   
1564   C-F1756   (није предалеко тестирани из Баната)
1566   N1c   (вјероватно грана M2019, није далеко тестирани из Задра)
1986   R1a-Z93   

Очигледно је у етногенези Хазара учествовао источноазијски елемент, али је постојао и сарматски (алански?) удио. Узорци су обрађени антрополошки и преовладава монголоидни тип са значајним учешћем европеидног типа, а присутни су и мијешани типови.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: crni Март 10, 2022, 07:40:39 поподне

Тек сам јуче успио доћи до пуног текста овог рада. Рађено је SNP тестирање, али веома сведено, само на мутације R-M207, R1a-M420, R1b-M343, N-M231, Q-M242. Добро је што су урадили STR профилисање и то на проширени YFiller (17 маркера плус), па су извучене хаплогрупе и за неке од узорака којима није успјело SNP тестирање. Укупно, профилисано је девет хазарских узорака.

Сви су са простора доњег Дона, данашње Ростовске области на југу Русије. Датирани су на основу археолошких података у период 7-9. вијека. Ради се о хазарској војној елити (на то указује богат археолошки инвентар гробова). Тако да би ово заиста могао бити неки генетички пресјек Хазара, бар тог њиховог владајућег слоја.

...

Сам текстуални дио рада и анализа веома су површни.  Довољно је индикативно да на самом почетку опредјељују R1a и R1b као европске хаплогрупе, иако су и те гране међу Хазарима азијског поријекла. Користили су више предиктора међу њима и Невген, али се нису упуштали у ближе одређење грана.

Прошао сам кроз хаплотипове и у односу на основне хаплогрупе дате у самом раду може се сљедеће закључити у вези припадности узорака одређеним гранама:

Узорак 67      R1b-M73    (Близак му је на 17 маркера један тестирани из околине Пирота из САНУ истраживања)
Узорак 457   G2a-U1>L1266   (највећа је блискост са граном L1266, која нагиње углавном кавкаској зони)
531   R1a-M417 (не може се грана тачно одредити, али мислим да се ради о R1a-Z93)   
619   Q-F1096   
656   C-F1756   (није предалеко тестирани из Баната)
1251   R1a-Z93   
1564   C-F1756   (није предалеко тестирани из Баната)
1566   N1c   (вјероватно грана M2019, није далеко тестирани из Задра)
1986   R1a-Z93   

Очигледно је у етногенези Хазара учествовао источноазијски елемент, али је постојао и сарматски (алански?) удио. Узорци су обрађени антрополошки и преовладава монголоидни тип са значајним учешћем европеидног типа, а присутни су и мијешани типови.

Према истраживању из 2019. године, Wen, SQ., Yao, HB., Du, PX. et al. Molecular genealogy of Tusi Lu’s family reveals their paternal relationship with Jochi, Genghis Khan’s eldest son (https://www.nature.com/articles/s10038-019-0618-0), аутори закључују да: "наши резултати показују да би хаплогрупа C2b1a1b1-F1756 могла бити још један кандидат за праву Y лозу Џингис Кана (https://en.wikipedia.org/wiki/Genghis_Khan)".

Овдје заиста необично изгледа и податак о налазу европеидног антрополошког типа овог двојца C2b1a1b1-F1756, припадника хазарске војне елите 7-9. вијека, узорака број 656 и 1564?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Драган Обреновић Март 18, 2022, 08:47:13 поподне
Origin and mobility of Iron Age Gaulish groups in present-day France revealed through archaeogenomics

Published: March 17, 2022  DOI: https://doi.org/10.1016/j.isci.2022.104094

Summary

The Iron Age period occupies an important place in French history, as the Gauls are regularly presented as the direct ancestors of the extant French population. We documented here the genomic diversity of Iron Age communities originating from six French regions. The 49 acquired genomes permitted us to highlight an absence of discontinuity between Bronze Age and Iron Age groups in France, lending support to a cultural transition linked to progressive local economic changes rather than to a massive influx of allochthone groups. Genomic analyses revealed strong genetic homogeneity among the regional groups associated with distinct archaeological cultures. This genomic homogenisation appears to be linked to individuals’ mobility between regions as well as gene flow with neighbouring groups from England and Spain. Thus, the results globally support a common genomic legacy for the Iron Age population of modern-day France that could be linked to recurrent gene flow between culturally differentiated communities.


https://www.cell.com/iscience/fulltext/S2589-0042(22)00364-9 (https://www.cell.com/iscience/fulltext/S2589-0042(22)00364-9)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Март 18, 2022, 09:03:22 поподне
Origin and mobility of Iron Age Gaulish groups in present-day France revealed through archaeogenomics


https://www.cell.com/iscience/fulltext/S2589-0042(22)00364-9 (https://www.cell.com/iscience/fulltext/S2589-0042(22)00364-9)

Цитат
Most individuals were found
1146 to carry haplogroup R1b1a (69%), other males belonging to haplogroups G2a2 (17,24%)

Није лоше.  8)

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Exiled Март 18, 2022, 09:09:29 поподне
Није лоше.  8)
Ох воденицо, мила ли си за вазда и на вијек😀
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Март 18, 2022, 09:33:38 поподне
Origin and mobility of Iron Age Gaulish groups in present-day France revealed through archaeogenomics

Published: March 17, 2022  DOI: https://doi.org/10.1016/j.isci.2022.104094

Summary

The Iron Age period occupies an important place in French history, as the Gauls are regularly presented as the direct ancestors of the extant French population. We documented here the genomic diversity of Iron Age communities originating from six French regions. The 49 acquired genomes permitted us to highlight an absence of discontinuity between Bronze Age and Iron Age groups in France, lending support to a cultural transition linked to progressive local economic changes rather than to a massive influx of allochthone groups. Genomic analyses revealed strong genetic homogeneity among the regional groups associated with distinct archaeological cultures. This genomic homogenisation appears to be linked to individuals’ mobility between regions as well as gene flow with neighbouring groups from England and Spain. Thus, the results globally support a common genomic legacy for the Iron Age population of modern-day France that could be linked to recurrent gene flow between culturally differentiated communities.


https://www.cell.com/iscience/fulltext/S2589-0042(22)00364-9 (https://www.cell.com/iscience/fulltext/S2589-0042(22)00364-9)

Хвала на информацији, Драгане. Колико видим нема Supplementary files. Волио бих видјети о којој се I2 ради.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 05, 2022, 08:20:58 пре подне
Препринт новог рада о Аварима под називом: Ancient genomes reveal origin and rapid trans-Eurasian migration of 7th century Avar elites

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(22)00267-7?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0092867422002677%3Fshowall%3Dtrue

Нисма ни сам стигао да погледам садржину, па не знам да ли има неких нових узорака или су користили узорке из ранијих радова.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 05, 2022, 08:46:35 пре подне
Изгледа да се ипак ради о 66 нових узорака. Од тога 39 узорака су мушки. Ово је преглед локација, периода и хаплогрупа за мушке узорке.

(https://i.postimg.cc/tJcXP6GM/avars.png)

На ENA се налазе и сирови резултати:
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB50368?show=reads
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Април 05, 2022, 08:48:04 пре подне
Препринт новог рада о Аварима под називом: Ancient genomes reveal origin and rapid trans-Eurasian migration of 7th century Avar elites

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(22)00267-7?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0092867422002677%3Fshowall%3Dtrue

Нисма ни сам стигао да погледам садржину, па не знам да ли има неких нових узорака или су користили узорке из ранијих радова.

Изгледа да су у питању сасвим нови узорци. Код аварске елите доминира грана N1-F4205:

https://www.yfull.com/tree/N-F4205/

Такође сам на брзину приметио и двојицу R1b-CTS9219 и једног нешто узводнијег CTS7556, који би могли у ствари бити R1b-Z2705, као и једног E-L618, који је вероватно E-V13, уз њега има још један који има само ISOGG а не и SNP ознаку а који је исто тако E-V13. Ови скелети потичу са позноаварских некропола и колико видех, нису припадали елити. Такође су ту двојица I2-M223 којима су очитани снипови испод L801 (CTS4348 и CTS10743) и двојица I1-Z141 (један има и ниже очитан снип S2205), али су они са "касносарматске" некрополе из 5. века, дакле пре доласка Авара. Изгледа да нема ниједног I2-Y3120.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 05, 2022, 09:03:52 пре подне
Изгледа да су у питању сасвим нови узорци. Код аварске елите доминира грана N1-F4205:

https://www.yfull.com/tree/N-F4205/

Такође сам на брзину приметио и двојицу R1b-CTS9219 и једног нешто узводнијег CTS7556, који би могли у ствари бити R1b-Z2705, као и једног E-L618, који је вероватно E-V13, уз њега има још један који има само ISOGG а не и SNP ознаку а који је исто тако E-V13. Ови скелети потичу са позноаварских некропола и колико видех, нису припадали елити. Такође су ту двојица I2-M223 којима су очитани снипови испод L801 (CTS4348 и CTS10743) и двојица I1-Z141 (један има и ниже очитан снип S2205), али су они са "касносарматске" некрополе из 5. века, дакле пре доласка Авара. Изгледа да нема ниједног I2-Y3120.

Да, изгледа да у овом сету уопште нема словенских узорака. Примјетио сam само један R1a-Z92.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 05, 2022, 12:38:51 поподне
Такође сам на брзину приметио и двојицу R1b-CTS9219 и једног нешто узводнијег CTS7556, који би могли у ствари бити R1b-Z2705

Провјерио сам овог који је означен као R1b-CTS9219 и негативан је на Z2705, има шест негативних читања на тој позицији. Узорак није богзна како покривен, па засад нисам успио да лоцирам ништа испод CTS9219
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 23, 2022, 09:43:50 пре подне
Нови рад древне ДНК, неолитско налазиште у Нормандији, Француска, старост узорака око 4500 г. пне.

Тестирано укупно 15 узорака, од чега је 9 узорака раније објављено у студији Rivollat et al 2020 SciAdv. Од ових 15, 13 јe мушких узорака и свима су успјели издвојити Y-DNA. Ситуација је сљедећа:

(https://i.postimg.cc/Vvr6mqhq/neolithic-normandy1.png)

(https://i.postimg.cc/PxNfQbTg/neolithic-normandy2.png)

Од ових новобјављених два су узорка I2a, један I2-M423, други I2-L1294. Не знам да ли прегледом бам фајлова може нешто дубље да се пронађе.

https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2120786119?url_ver=Z39.88-2003&rfr_id=ori%3Arid%3Acrossref.org&rfr_dat=cr_pub++0pubmed#supplementary-materials
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 23, 2022, 09:58:00 пре подне
Још један рад који не доноси нове генетичке резултате, већ се бави основним тезама ширења људске популације у далекој прошлости.

Genetics and Material Culture Support Repeated Expansions into Paleolithic Eurasia from a Population Hub Out of Africa

https://academic.oup.com/gbe/article/14/4/evac045/6563828?login=false
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 09, 2022, 01:20:18 поподне
Не знам да ли је помињан овај рад чији је препринт изашао половином марта ове године.

A Genetic History of Continuity and Mobility in the Iron Age Central Mediterranean

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.03.13.483276v1

Ради се о новим геномским узорцима са неколико картагинских и етрурских налазишта. У самом раду нису поменуте Y-днк хаплогрупе, али их геномски узорци свакако садрже. У априлу су постали видљиви и bam фајлови. Неки од узорака су прегледани, али не знам ни ко их је прегледао ни гдје су објављени. Ако неко зна нешто више нека напише. Ови етрурски би свакако били интересантни.

Ово је оно што сам успио да ископам на мрежи:

AU41086   R11746   R-Y7777   Tunisia   2022-04-30 08:54:29
AU40967   R11793   J-PF7415   Tunisia   2022-04-29 06:29:55
AU40965   R11753   J-Z597   Tunisia   2022-04-29 06:23:57
AU40964   R11751   J-Z597   Tunisia   2022-04-29 06:23:31
AU40963   R10341   J-Z1884   Italy   2022-04-29 06:23:05
AU40962   R10339   R-Y24836   Italy   2022-04-29
AU40465   R11835   H-Y20838   Italy   2022-04-17 16:45:23
AU40464   R11828   I-L160   Italy   2022-04-17 16:45:00
AU40463   R11104   I-L160   Italy   2022-04-17 16:44:31
AU40462   R10363   G-Y7538   Italy   2022-04-17 16:44:04
AU40461   R10361   R-L2   Italy   2022-04-17 16:43:31
AU40460   R10344   R-Y146438   Italy   2022-04-17 16:43:03
AU40459   R10342   R-Z2572   Italy   2022-04-17 16:42:41
AU40458   R10340   R-P312   Italy   2022-04-17 16:42:14
AU40457   R10338   R-U152   Italy   2022-04-17 16:41:22
AU40456   R10337   R-FT258284   Italy   2022-04-17 16:14:11

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Мај 09, 2022, 02:25:24 поподне
Не знам да ли је помињан овај рад чији је препринт изашао половином марта ове године.

Ради се о новим геномским узорцима са неколико картагинских и етрурских налазишта. У самом раду нису поменуте Y-днк хаплогрупе, али их геномски узорци свакако садрже. У априлу су постали видљиви и bam фајлови. Неки од узорака су прегледани, али не знам ни ко их је прегледао ни гдје су објављени. Ако неко зна нешто више нека напише. Ови етрурски би свакако били интересантни.

Ово је оно што сам успио да ископам на мрежи:

AU41086   R11746   R-Y7777   Tunisia   2022-04-30 08:54:29
AU40967   R11793   J-PF7415   Tunisia   2022-04-29 06:29:55
AU40965   R11753   J-Z597   Tunisia   2022-04-29 06:23:57
AU40964   R11751   J-Z597   Tunisia   2022-04-29 06:23:31
AU40963   R10341   J-Z1884   Italy   2022-04-29 06:23:05
AU40962   R10339   R-Y24836   Italy   2022-04-29
AU40465   R11835   H-Y20838   Italy   2022-04-17 16:45:23
AU40464   R11828   I-L160   Italy   2022-04-17 16:45:00
AU40463   R11104   I-L160   Italy   2022-04-17 16:44:31
AU40462   R10363   G-Y7538   Italy   2022-04-17 16:44:04
AU40461   R10361   R-L2   Italy   2022-04-17 16:43:31
AU40460   R10344   R-Y146438   Italy   2022-04-17 16:43:03
AU40459   R10342   R-Z2572   Italy   2022-04-17 16:42:41
AU40458   R10340   R-P312   Italy   2022-04-17 16:42:14
AU40457   R10338   R-U152   Italy   2022-04-17 16:41:22
AU40456   R10337   R-FT258284   Italy   2022-04-17 16:14:11

Прегледао сам их и ја, али за већину ових "западних" R1b није ми се дало тражити дубље гране, што због мноштва грана, што због слабије покривености узорака:
   
R11104; 1923-1614 BC; Pian Sultano; Italy BA; I2-L158>Y3992>Z2049>L160>PF4088>CTS1758>Y2177>BY130413>Y38933 (xY40338,BY42227)
R11828; 1115-984 BC; Sant'Imbenia; Sardinia BA; I2-L158>Y3992>Z2049>L160>F1295>Y21970 (xZ27158,PF6951,BY18705,Y138751,Y62321)
R11835; 801-774 BC; Sant'Imbenia; Sardinia IA; H2-P96>Y19966>FT1696>Y21618>Y19962>Z19072>Y21592>Y21612>Y21654>pre-Y20838
R11746; 733-411 BC; Kerkouane; Tunisia IA; R1b-V2219>V88>PF6287>pre-Y7777
R11751; 729-409 BC; Kerkouane; Tunisia IA; J2b2a-L283>Z622>Z600>Z2509>Z585>Z615>Z597>Z2507>Y15058>Z38240>Z38241>PH1602
R11753; 656-405 BC; Kerkouane; Tunisia IA; J2b2a-L283>Z622>Z600>Z2509>Z585>Z615>Z597>Z2507>Y15058>Z38240
R11793; 761-405 BC; Kerkouane; Tunisia IA; J2a-Z6064>Z6055>Z6057>Y7013>Y7010>Y13128>Y14434>Y14439>Z28527>Z35779>PF7415* (xZ28524)
R10344; 759-538 BC; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; R1b-P312
R10338; 759 BC- 3 AD; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; R1b-U152
R10340; 759 BC-3 AD; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; R1b-P312
R10361; 759 BC-3 AD; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; R1b-U152>L2
R10363; 389-207 BC; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; G2a2b-L497>Z1815>Y7538>Z1816>Y8903>BY27899* (xBY113517,Z45474)
R10339; 160-49 BC; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; R1b-L151
R10341; 160-49 BC; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; J1-YSC234>Z1884*
R10342; 158-44 BC; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; R1b-U152>L2
R10337; 151 BC-3 AD; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; R2-FGC50231>FGC50227* (xFGC50302)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 09, 2022, 02:42:21 поподне
Прегледао сам их и ја, али за већину ових "западних" R1b није ми се дало тражити дубље гране, што због мноштва грана, што због слабије покривености узорака:
   
R11104; 1923-1614 BC; Pian Sultano; Italy BA; I2-L158>Y3992>Z2049>L160>PF4088>CTS1758>Y2177>BY130413>Y38933 (xY40338,BY42227)
R11828; 1115-984 BC; Sant'Imbenia; Sardinia BA; I2-L158>Y3992>Z2049>L160>F1295>Y21970 (xZ27158,PF6951,BY18705,Y138751,Y62321)
R11835; 801-774 BC; Sant'Imbenia; Sardinia IA; H2-P96>Y19966>FT1696>Y21618>Y19962>Z19072>Y21592>Y21612>Y21654>pre-Y20838
R11746; 733-411 BC; Kerkouane; Tunisia IA; R1b-V2219>V88>PF6287>pre-Y7777
R11751; 729-409 BC; Kerkouane; Tunisia IA; J2b2a-L283>Z622>Z600>Z2509>Z585>Z615>Z597>Z2507>Y15058>Z38240>Z38241>PH1602
R11753; 656-405 BC; Kerkouane; Tunisia IA; J2b2a-L283>Z622>Z600>Z2509>Z585>Z615>Z597>Z2507>Y15058>Z38240
R11793; 761-405 BC; Kerkouane; Tunisia IA; J2a-Z6064>Z6055>Z6057>Y7013>Y7010>Y13128>Y14434>Y14439>Z28527>Z35779>PF7415* (xZ28524)
R10344; 759-538 BC; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; R1b-P312
R10338; 759 BC- 3 AD; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; R1b-U152
R10340; 759 BC-3 AD; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; R1b-P312
R10361; 759 BC-3 AD; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; R1b-U152>L2
R10363; 389-207 BC; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; G2a2b-L497>Z1815>Y7538>Z1816>Y8903>BY27899* (xBY113517,Z45474)
R10339; 160-49 BC; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; R1b-L151
R10341; 160-49 BC; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; J1-YSC234>Z1884*
R10342; 158-44 BC; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; R1b-U152>L2
R10337; 151 BC-3 AD; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; R2-FGC50231>FGC50227* (xFGC50302)

Хвала Гујо, за информацију.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 09, 2022, 02:55:43 поподне
Ако би гледали по популацијама,

Етрурци
R10344; 759-538 BC; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; R1b-P312
R10338; 759 BC- 3 AD; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; R1b-U152
R10340; 759 BC-3 AD; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; R1b-P312
R10361; 759 BC-3 AD; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; R1b-U152>L2
R10363; 389-207 BC; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; G2a2b-L497>Z1815>Y7538>Z1816>Y8903>BY27899* (xBY113517,Z45474)
R10339; 160-49 BC; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; R1b-L151
R10341; 160-49 BC; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; J1-YSC234>Z1884*
R10342; 158-44 BC; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; R1b-U152>L2
R10337; 151 BC-3 AD; Tarquinia Monterozzi; Italy IA; R2-FGC50231>FGC50227* (xFGC50302)

Картагињани
R11746; 733-411 BC; Kerkouane; Tunisia IA; R1b-V2219>V88>PF6287>pre-Y7777
R11751; 729-409 BC; Kerkouane; Tunisia IA; J2b2a-L283>Z622>Z600>Z2509>Z585>Z615>Z597>Z2507>Y15058>Z38240>Z38241>PH1602
R11753; 656-405 BC; Kerkouane; Tunisia IA; J2b2a-L283>Z622>Z600>Z2509>Z585>Z615>Z597>Z2507>Y15058>Z38240
R11793; 761-405 BC; Kerkouane; Tunisia IA; J2a-Z6064>Z6055>Z6057>Y7013>Y7010>Y13128>Y14434>Y14439>Z28527>Z35779>PF7415* (xZ28524)

Nuragic Сардинија
R11828; 1115-984 BC; Sant'Imbenia; Sardinia BA; I2-L158>Y3992>Z2049>L160>F1295>Y21970 (xZ27158,PF6951,BY18705,Y138751,Y62321)
R11835; 801-774 BC; Sant'Imbenia; Sardinia IA; H2-P96>Y19966>FT1696>Y21618>Y19962>Z19072>Y21592>Y21612>Y21654>pre-Y20838

Апенинско Бронзано доба
R11104; 1923-1614 BC; Pian Sultano; Italy BA; I2-L158>Y3992>Z2049>L160>PF4088>CTS1758>Y2177>BY130413>Y38933 (xY40338,BY42227)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Мај 09, 2022, 03:56:47 поподне
Видех да нам се разликује грана код узорка R10342 па га проверих опет, и биће ипак да је грана коју си ти навео тачна. Ја чим сам наишао на L2+ одустао сам од даљег тражења, међутим L2 је C>T транзиција и покривена је само са једним T, па је вероватно у питању "лажно позитивно" очитавање. Са друге стране, и Z2571 и Z2572 су трансверзије, па самим тим и много поузданије код древних узорака. R10342 има:

Z2571+  C>G (1G)

Z2572+  C>G (1G)

а поред тога и:

FT445874+  G>T (1T)

па према томе готово извесно припада грани: Z2571>Z2572>BY31431>FT37983* (xFT37000,FTA7413) (https://www.yfull.com/tree/R-FT37983/)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Мај 09, 2022, 05:00:40 поподне
Ако би гледали по популацијама,

Картагињани
R11746; 733-411 BC; Kerkouane; Tunisia IA; R1b-V2219>V88>PF6287>pre-Y7777
R11751; 729-409 BC; Kerkouane; Tunisia IA; J2b2a-L283>Z622>Z600>Z2509>Z585>Z615>Z597>Z2507>Y15058>Z38240>Z38241>PH1602
R11753; 656-405 BC; Kerkouane; Tunisia IA; J2b2a-L283>Z622>Z600>Z2509>Z585>Z615>Z597>Z2507>Y15058>Z38240
R11793; 761-405 BC; Kerkouane; Tunisia IA; J2a-Z6064>Z6055>Z6057>Y7013>Y7010>Y13128>Y14434>Y14439>Z28527>Z35779>PF7415* (xZ28524)

Да, са тим што је по аутосомалном профилу једино овај први "прави" картагињанин, док су остала тројица сврстана у источномедитерански кластер (Sicily/Greece). И ипсилон хаплогрупе се уклапају у ту слику, јер је грана Ј2а-PF7415 или неолитског европског или блискоисточног порекла, док је грана J2b2a-Z38240>PH1602 доказано (прото-)илирска, па је њено присуство на овом налазишту у овом периоду још већа мистерија. Грчки утицај је са друге стране очекиван, с обзиром да су на њега указивали и поједини археолошки налази:

Цитат
A black-figure wine jug decorated with a scene from The Odyssey found with an Ionian cup, and Greek architectural elements like peristyle courtyards and stucco plaster decorations found among the remains of upscale private homes, show the town was influenced by the culture of the greater Mediterranean world.

https://en.wikipedia.org/wiki/Kerkouane?msclkid=db0d92d4cfa611ecaaaa59614a2563d7 (https://en.wikipedia.org/wiki/Kerkouane?msclkid=db0d92d4cfa611ecaaaa59614a2563d7)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 09, 2022, 06:47:50 поподне
Да, са тим што је по аутосомалном профилу једино овај први "прави" картагињанин, док су остала тројица сврстана у источномедитерански кластер (Sicily/Greece). И ипсилон хаплогрупе се уклапају у ту слику, јер је грана Ј2а-PF7415 или неолитског европског или блискоисточног порекла, док је грана J2b2a-Z38240>PH1602 доказано (прото-)илирска, па је њено присуство на овом налазишту у овом периоду још већа мистерија. Грчки утицај је са друге стране очекиван, с обзиром да су на њега указивали и поједини археолошки налази:

https://en.wikipedia.org/wiki/Kerkouane?msclkid=db0d92d4cfa611ecaaaa59614a2563d7 (https://en.wikipedia.org/wiki/Kerkouane?msclkid=db0d92d4cfa611ecaaaa59614a2563d7)

Грана J2b2a-Z38240>PH1602 има и један прилично изолован арапски огранак на подручју Палестине, Јордана и Сирије. Нисам нешто детаљније прегледао PH1602, али ми на памет паде прича
"Prema grčkoj mitologiji, postojao je junak Ilirijus, sin Kadma i Harmonije, koji je zavladao cijelom Ilirijom i legenda dalje kaže da je on predak svih Ilira."

"Kadmo (starogrčki: Κάδμος) bio je, u grčkoj mitologiji, feničanski princ, sin tirskog kralja Agenora i kraljice Telefase te brat Fenika, Kilika i Europe. Kad je Zevs oteo Europu, Agenor je poslao svoje sinove u potragu za sestrom i naredio im da se bez nje ne vraćaju u Fenikiju."

Управо су феничански досељеници из Тира основали Картагину.
Наравно, постоји и оно друго предање које Илире повезује са келтским народима.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Мај 09, 2022, 07:07:07 поподне
Да, са тим што је по аутосомалном профилу једино овај први "прави" картагињанин, док су остала тројица сврстана у источномедитерански кластер (Sicily/Greece). И ипсилон хаплогрупе се уклапају у ту слику, јер је грана Ј2а-PF7415 или неолитског европског или блискоисточног порекла, док је грана J2b2a-Z38240>PH1602 доказано (прото-)илирска, па је њено присуство на овом налазишту у овом периоду још већа мистерија.

Да ли можете мало детаљније да елаборирате тврдњу да је грана J2b2a-Z38240>PH1602 доказано (прото-)илирска?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Мај 09, 2022, 07:34:18 поподне
Грана J2b2a-Z38240>PH1602 има и један прилично изолован арапски огранак на подручју Палестине, Јордана и Сирије. Нисам нешто детаљније прегледао PH1602, али ми на памет паде прича
"Prema grčkoj mitologiji, postojao je junak Ilirijus, sin Kadma i Harmonije, koji je zavladao cijelom Ilirijom i legenda dalje kaže da je on predak svih Ilira."

"Kadmo (starogrčki: Κάδμος) bio je, u grčkoj mitologiji, feničanski princ, sin tirskog kralja Agenora i kraljice Telefase te brat Fenika, Kilika i Europe. Kad je Zevs oteo Europu, Agenor je poslao svoje sinove u potragu za sestrom i naredio im da se bez nje ne vraćaju u Fenikiju."

Управо су феничански досељеници из Тира основали Картагину.
Наравно, постоји и оно друго предање које Илире повезује са келтским народима.


Само што се распоред саме J-PH1602 много више уклапа и у Келте (да изузмемо Илире), него у Феничане. Али свакако занимљива легенда. Као да је настала у тренутку додира индоевропских популација са неким популацијама источномедитеранског порекла на самом Балкану.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Мај 09, 2022, 08:29:02 поподне
Да ли можете мало детаљније да елаборирате тврдњу да је грана J2b2a-Z38240>PH1602 доказано (прото-)илирска?

На (прото-)илирско порекло ове (али и већине других грана испод Z597 (https://www.yfull.com/tree/J-Z597/)) указује велики број до сада објављених древних узорака бронзаног и гвозденог доба са подручја Хрватске:

I23911; 891-797 BC; Smiljan; Croatia_IA; J2b2a-Z2507>Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930>FT115799
I24638; 795-567 BC; Smiljan; Croatia_IA; J2b2a-Z2507>Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930>FT115799
I24882; 774-549 BC; Mala Metaljka; Croatia_IA; J2b2a-Z2507>Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930 (xFT115799)
I23995; 810-675 BC; Smiljan; Croatia_IA; J2b2a-Z2507>Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930 (xFT150993)
I24639; 795-567 BC; Smiljan; Croatia_IA; J2b2a-Z2507>Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930 (xFT150993)
I26742; 800-600 BC; Jazinka Cave; Croatia_IA; J2b2a-Z2507>Y15058>Z38240>Z38241 (xFT108123,Y130843,Y91418,PH502,Y86930)
I4331; 1631-1521 BC ; Veliki Vanik; Croatia_MBA; J2b2a-Z2507>Y15058>Z38240*
I26726; 1507-1415 BC; Gudnja cave; Croatia_MBA; J2b2a-Z2507>Z638>Z1297 (xY27522,Y21878,Z8421)

Смиљан и Мала Метаљка налазе се на подручју које је у гвозденом добу насељавало илирско племе Јапода, а Јазинка на подручју које је насељавало племе Далмата. Такође је прилично индикативно да су узорци из бронзаног доба из Великог Ваника и Гудње који припадају сестринским гранама Z2507>Y15058>Z38240 и Z2507>Z638>Z1297, удаљени свега неких 50-ак километара ваздушном линијом, иако су се ове две гране раздвојиле још у раном бронзаном добу (око 2400 п.н.е.).

Ево мапе са свим древним узорцима који припадају хаплогрупи J2a2b-L283:

https://www.google.com/maps/d/u/0/viewer?mid=1luwBVUlmGoqbj7yzO2tyKKIJlvh7mtQX&ll=43.48442581449614%2C16.637907326504408&z=7 (https://www.google.com/maps/d/u/0/viewer?mid=1luwBVUlmGoqbj7yzO2tyKKIJlvh7mtQX&ll=43.48442581449614%2C16.637907326504408&z=7)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Мај 09, 2022, 08:59:44 поподне
На (прото-)илирско порекло ове (али и већине других грана испод Z597 (https://www.yfull.com/tree/J-Z597/)) указује велики број до сада објављених древних узорака бронзаног и гвозденог доба са подручја Хрватске:

I23911; 891-797 BC; Smiljan; Croatia_IA; J2b2a-Z2507>Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930>FT115799
I24638; 795-567 BC; Smiljan; Croatia_IA; J2b2a-Z2507>Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930>FT115799
I24882; 774-549 BC; Mala Metaljka; Croatia_IA; J2b2a-Z2507>Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930 (xFT115799)
I23995; 810-675 BC; Smiljan; Croatia_IA; J2b2a-Z2507>Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930 (xFT150993)
I24639; 795-567 BC; Smiljan; Croatia_IA; J2b2a-Z2507>Y15058>Z38240>Z38241>PH1602>Y86930 (xFT150993)
I26742; 800-600 BC; Jazinka Cave; Croatia_IA; J2b2a-Z2507>Y15058>Z38240>Z38241 (xFT108123,Y130843,Y91418,PH502,Y86930)
I4331; 1631-1521 BC ; Veliki Vanik; Croatia_MBA; J2b2a-Z2507>Y15058>Z38240*
I26726; 1507-1415 BC; Gudnja cave; Croatia_MBA; J2b2a-Z2507>Z638>Z1297 (xY27522,Y21878,Z8421)

Смиљан и Мала Метаљка налазе се на подручју које је у гвозденом добу насељавало илирско племе Јапода, а Јазинка на подручју које је насељавало племе Далмата. Такође је прилично индикативно да су узорци из бронзаног доба из Великог Ваника и Гудње који припадају сестринским гранама Z2507>Y15058>Z38240 и Z2507>Z638>Z1297, удаљени свега неких 50-ак километара ваздушном линијом, иако су се ове две гране раздвојиле још у раном бронзаном добу (око 2400 п.н.е.).

Ево мапе са свим древним узорцима који припадају хаплогрупи J2a2b-L283:

https://www.google.com/maps/d/u/0/viewer?mid=1luwBVUlmGoqbj7yzO2tyKKIJlvh7mtQX&ll=43.48442581449614%2C16.637907326504408&z=7 (https://www.google.com/maps/d/u/0/viewer?mid=1luwBVUlmGoqbj7yzO2tyKKIJlvh7mtQX&ll=43.48442581449614%2C16.637907326504408&z=7)

Хвала на одговору и илустративној мапи. Оно што ипак упада у очи је да потпуно изостају узорци са територије познате по томе што су је насељавали прави Илири Illirii proprii dicti познати из описа Страбона и Плинија. Е сад, изгледа да је та територија слабо археогенетски покривена узорцима генерално, што је баш штета према мом мишљењу.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Мај 09, 2022, 10:06:04 поподне
Хвала на одговору и илустративној мапи. Оно што ипак упада у очи је да потпуно изостају узорци са територије познате по томе што су је насељавали прави Илири Illirii proprii dicti познати из описа Страбона и Плинија. Е сад, изгледа да је та територија слабо археогенетски покривена узорцима генерално, што је баш штета према мом мишљењу.

У новом раду који би ускоро требао да се појави биће неколико десетина древних узорака из Црне Горе, Албаније и Македоније, тако да би слика требала бити нешто јаснија. Слутим да ће међу узорцима са подручја које помињете бити пронађена и грана Z2507>Z638>Y21045 (https://www.yfull.com/tree/J-Y21045/), која би по некој логици требала бити присутна међу јужним ("правим") Илирима, и која показује велику разноврсност међу данашњим Албанцима. Ово наравно не значи да су Албанци директни потомци тих Илира, али су дефинитивно по доласку на подручје данашње Албаније асимиловали један део тада већ романизованих Илира, а касније су неке од тих оригинално илирских грана као што је Y21045>>>PH1271 доживеле значајну демографску експанзију међу прото-Албанцима током раног средњег века.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Мај 09, 2022, 10:53:50 поподне
У новом раду који би ускоро требао да се појави биће неколико десетина древних узорака из Црне Горе, Албаније и Македоније, тако да би слика требала бити нешто јаснија. Слутим да ће међу узорцима са подручја које помињете бити пронађена и грана Z2507>Z638>Y21045 (https://www.yfull.com/tree/J-Y21045/), која би по некој логици требала бити присутна међу јужним ("правим") Илирима, и која показује велику разноврсност међу данашњим Албанцима. Ово наравно не значи да су Албанци директни потомци тих Илира, али су дефинитивно по доласку на подручје данашње Албаније асимиловали један део тада већ романизованих Илира, а касније су неке од тих оригинално илирских грана као што је Y21045>>>PH1271 доживеле значајну демографску експанзију међу прото-Албанцима током раног средњег века.

Знаш ли која ће бити тематика тог новог рада, односно које све популације и периоде ће да покрије?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Мај 10, 2022, 08:20:07 пре подне
Грана J2b2a-Z38240>PH1602 има и један прилично изолован арапски огранак на подручју Палестине, Јордана и Сирије. Нисам нешто детаљније прегледао PH1602, али ми на памет паде прича
"Prema grčkoj mitologiji, postojao je junak Ilirijus, sin Kadma i Harmonije, koji je zavladao cijelom Ilirijom i legenda dalje kaže da je on predak svih Ilira."

"Kadmo (starogrčki: Κάδμος) bio je, u grčkoj mitologiji, feničanski princ, sin tirskog kralja Agenora i kraljice Telefase te brat Fenika, Kilika i Europe. Kad je Zevs oteo Europu, Agenor je poslao svoje sinove u potragu za sestrom i naredio im da se bez nje ne vraćaju u Fenikiju."

Управо су феничански досељеници из Тира основали Картагину.
Наравно, постоји и оно друго предање које Илире повезује са келтским народима.
Можда је Грцима феничанско порекло изгледало угледније од европског. Име Европе је семитског порекла, а није ми познато ког су порекла имена Кадма, Агенора, Телефасе, Феника и Килика.

https://www.yfull.com/tree/J-PH1602/
https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/J;name=J-PH1601
J2-PH1602 има данас припадника од Британије и Ирске до Пољске и Русије са TMRCA од око 3100 година, па изгледа да је почетна тачка тог ширења била у централној Европи, можда на тлу данашње Немачке.

Арапски огранак https://www.yfull.com/tree/J-FT150993/ , https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/J;name=J-FT150340 је настао пре око 2900 година, а има TMRCA од око 850 година, тако да су га на Блиски Исток ( Палестина?) могли донети грчки трговци, македонски или римски војници, избеглице са Балкана у време досељавања Словена или крсташи. Падају ми на памет и Либурни, познати морепловци, можда су стизали и до Леванта и Картагине.

У новом раду који би ускоро требао да се појави биће неколико десетина древних узорака из Црне Горе, Албаније и Македоније, тако да би слика требала бити нешто јаснија. Слутим да ће међу узорцима са подручја које помињете бити пронађена и грана Z2507>Z638>Y21045 (https://www.yfull.com/tree/J-Y21045/), која би по некој логици требала бити присутна међу јужним ("правим") Илирима, и која показује велику разноврсност међу данашњим Албанцима. Ово наравно не значи да су Албанци директни потомци тих Илира, али су дефинитивно по доласку на подручје данашње Албаније асимиловали један део тада већ романизованих Илира, а касније су неке од тих оригинално илирских грана као што је Y21045>>>PH1271 доживеле значајну демографску експанзију међу прото-Албанцима током раног средњег века.
Можда и https://www.yfull.com/tree/E-BY4465/ и неке подгрупе https://www.yfull.com/tree/R-PF7563/ .
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 10, 2022, 09:41:24 пре подне
За генетичку профилацију Феничана свакако треба више узорака. Колико ми је познато има више феничанских узорака у раду
https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0190169

али су они само митохондријално обрађени. Није ми познато да је још у неком раду било обрађених феничанских древних Y-днк.

С обзиром да су Феничани (Семити) и Грци (Индоевропљани) господарили Медитераном стотинама година, све до успона Рима, било би идеално ако би се могле издвојити неке специфично грчке и специфично феничанске Y-днк линије.

Најинтересантнија прича везана за Феничане је она о пурпуру, порфири или финику, боји захваљујући којој су Феничани били тако економски успјешни. Као некад Кинези са свилом и свиленом бубом, тако су и Феничани дуго чували технологију добијања пупрпурне боје из морских шкољки. Цијена пурпурне боје је често била изједначена са цијеном сребра,а боја је постала симболом империјалне моћи и њена употреба је бивала и законски ограничена. Латини су, приликом освајања Цариграда 1204. године уништили посљедњу производњу пурпура из шкољки. Такође, занимљиво је да тај феничански или тирски пурпур временом није блиједио, већ да је постајо још интензивнији и сјајнији под утицајем временских прилика.

Не знам да ли је неко данас, ако ништа друго због пробе, покушао оживити ту технологију. Имам осјећај да ни данас тканина обојена том бојом не би била јефтина.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Мај 10, 2022, 10:56:38 пре подне
Можда кључ у појави ових PH1602 код Картагињана лежи у нешто ранијем периоду - времену колапса бронзаног доба и појаве Народа са мора. Изгледа да је солидан део ових бронзанодопских пирата потицао са простора северне Италије (Терамаре култура), који су били наслоњени и на североисточну и источну обалу Јадрана. Приликом миграција ка Леванту, могли су да "покупе" неке припаднике J2b-PH1602 хаплогрупе (ако већ они сами нису били присутни на северу Италије) са источне јадранске обале. Неки од тих миграната или њихових потомака су се вероватно утопили у доминантну популацију на подручју Сирије, Феникије и Палестине, па су као део Феничана могли да се населе на северу Африке. Да би се стекао увид у размере популационих кретања са подручја Европе ка Леванту крајем бронзаног доба, препоручујем гледање ових занимљивих видеа:

https://www.youtube.com/v/oL5GDXq1acE

https://www.youtube.com/v/SnpA4ukxbPQ

https://www.youtube.com/v/8IUWvk4MuNw
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Мај 10, 2022, 11:02:47 пре подне
За генетичку профилацију Феничана свакако треба више узорака. Колико ми је познато има више феничанских узорака у раду
https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0190169

али су они само митохондријално обрађени. Није ми познато да је још у неком раду било обрађених феничанских древних Y-днк.

С обзиром да су Феничани (Семити) и Грци (Индоевропљани) господарили Медитераном стотинама година, све до успона Рима, било би идеално ако би се могле издвојити неке специфично грчке и специфично феничанске Y-днк линије.

Најинтересантнија прича везана за Феничане је она о пурпуру, порфири или финику, боји захваљујући којој су Феничани били тако економски успјешни. Као некад Кинези са свилом и свиленом бубом, тако су и Феничани дуго чували технологију добијања пупрпурне боје из морских шкољки. Цијена пурпурне боје је често била изједначена са цијеном сребра,а боја је постала симболом империјалне моћи и њена употреба је бивала и законски ограничена. Латини су, приликом освајања Цариграда 1204. године уништили посљедњу производњу пурпура из шкољки. Такође, занимљиво је да тај феничански или тирски пурпур временом није блиједио, већ да је постајо још интензивнији и сјајнији под утицајем временских прилика.

Не знам да ли је неко данас, ако ништа друго због пробе, покушао оживити ту технологију. Имам осјећај да ни данас тканина обојена том бојом не би била јефтина.

Раније сам веровао да би се део J-M205 могао повезати са феничанским колонијама. У прилог томе би ишао стари налаз ове хаплогрупа у Сидону (Либан). Иако се распоред донекле поклапа, чини се да се још боље поклапа са простором грчке колонизације (обала Црног Мора, Јужна Италија, Кипар, Исток Шпаније).

(https://preview.redd.it/0uho63ekxxz11.jpg?auto=webp&s=750f539aed33aef1082eff3b86de827536aa4491)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Мај 10, 2022, 12:27:59 поподне
Знаш ли која ће бити тематика тог новог рада, односно које све популације и периоде ће да покрије?

Потврђени узорци од енеолита до антике, можда буде и покоји ранији/каснији. Фокус највероватније на Балкан/југоисточну Европу, могуће да ће бити узорака и из Анадолије и Леванта. Потврђено да ће бити узорака из Словеније, Хрватске, БиХ, Црне Горе, Србије, Албаније, Македоније, Бугарске, Грчке, Румуније, Молдавије. И врло вероватно ће бити три засебна рада објављена одједном, уместо првобитно најављеног јединственог рада.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Мај 10, 2022, 12:43:57 поподне
Потврђени узорци од енеолита до антике, можда буде и покоји ранији/каснији. Фокус највероватније на Балкан/југоисточну Европу, могуће да ће бити узорака и из Анадолије и Леванта. Потврђено да ће бити узорака из Словеније, Хрватске, БиХ, Црне Горе, Србије, Албаније, Македоније, Бугарске, Грчке, Румуније, Молдавије. И врло вероватно ће бити три засебна рада објављена одједном, уместо првобитно најављеног једнинственог рада.

То ће баш бити пун погодак. Надам се да ће бити што више узорака из гвозденог доба. Нарочито из гвозденог доба Србије и Северне Македоније, пошто мислим да одатле немамо ниједан узорак из тог периода. Додуше, и БиХ је под знаком питања.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: filipi Мај 10, 2022, 01:15:02 поподне
То ће баш бити пун погодак. Надам се да ће бити што више узорака из гвозденог доба. Нарочито из гвозденог доба Србије и Северне Македоније, пошто мислим да одатле немамо ниједан узорак из тог периода. Додуше, и БиХ је под знаком питања.
Biti će 10ak iz Srbije, 20ak iz CG, 1 iz BiH, 20ak iz Makedonije, 80ak iz Hrvatske, plus Albanija...
Razdoblje je od praistorije do antike. Ne znam tačno o kojem se razdoblju radi za ove gore uzorke.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 10, 2022, 05:02:08 поподне
Прије пар дана је објављен препринт рада под називом "Population Genomics of Stone Age Eurasia"

Наводи се секвенцирање "317 genomes of primarily Mesolithic and Neolithic individuals from across Eurasia" Ако сам добро схватио ради се о узорцима који нису раније секвенцирани (нисам детаљније провјеравао па не знам сигурно). Ако је то тачно, ради се о правом благу.

Само сам бацио поглед на рад, дјелује обећавајуће.

ово су линкови
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.04.490594v2
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.04.490594v2.full.pdf
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2022/05/06/2022.05.04.490594/DC1/embed/media-1.pdf?download=true
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2022/05/06/2022.05.04.490594/DC2/embed/media-2.pdf?download=true
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2022/05/06/2022.05.04.490594/DC3/embed/media-3.xlsx?download=true
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 10, 2022, 06:44:51 поподне
Ово су у раду написали та хаплогрупу I

Haplogroup I
855
856 Haplogroup I2 was common among newly reported samples from western Eurasian hunter gatherer contexts, as well as later Neolithic farmers. In particular, the 25 Danish Mesolithic
858 male individuals were exclusively carriers of haplogroup I2, albeit with considerable diversity
859 across different sub-haplogroups (Fig. S3b.3). Neolithic farmer individuals from Scandinavia
860 were predominantly placed within an ancient-only subclade of haplogroup I2a1a2, containing
861 other individuals from Neolithic farmer contexts across Europe.
862
863 The earliest presence of haplogroup I1, which is the most common haplogroup among
864 present-day Scandinavians, was found ~4,000BP among late Neolithic and early Bronze Age
865 Scandinavians newly reported in this study (Fig. S3b.3). A single Swedish Mesolithic
866 individual (sf11) was placed at the base of the I1 clade; however, its low coverage (0.1X)
867 precludes to conclude with certainty whether early I1-related lineages were indeed present
868 among Scandinavian hunter-gatherers.

Дали су у прилогу и ову Fig. S3b.3 која би требало да приказује филогенетско стабло I2 и позицију узорака, али у тако лошој резолуцији да је нечитљиво. Бојим се да се до објављивања рада или постављања генома у базу, неће моћи доћи до специфичнијих грана узорака.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 10, 2022, 07:04:21 поподне
У ексцел табели бр. VII има нешто одређенија профилација.

Ови узорци би требали бити I2-M423 (то је најдубље што је означено)

NEO627   Banks tomb   UK   WesternEurope   Britain_Neolithic
NEO626   Banks tomb   UK   WesternEurope   Britain_Neolithic
NEO625   Banks tomb   UK   WesternEurope   Britain_Neolithic
NEO717   Banks tomb   UK   WesternEurope   Britain_Neolithic
NEO91   Strøby Grøftemark   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Mesolithic
NEO587   Kongemose   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Mesolithic
NEO589   Korsør Nor   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Mesolithic
NEO749   Henriksholm-Bøgebakken (Vedbæk)   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Mesolithic
NEO790   Tysmose   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Neolithic
NEO595   Pandebjerg   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Neolithic
NEO23   Jorløse mose   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Neolithic
NEO28   Salpetermosen syd 8   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Neolithic
NEO886   Dalmosegaard   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Neolithic
NEO795   Porsmose   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Neolithic
NEO935   Vibygårds Mose   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Neolithic
NEO597   Storelyng (Øgårde boat III)   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Neolithic
NEO898   Svinninge Vejle   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Neolithic
NEO792   Næs   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Neolithic
NEO39   Hindby mosse   Sweden   NorthernEurope   Sweden_Neolithic
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 10, 2022, 07:06:52 поподне
За носиоце E-V13 изгледа нема среће ни овај пут. Нисам видио да има иједан Е узорак.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 10, 2022, 07:31:23 поподне
https://www.yfull.com/tree/J-Z1295/ налазиште Grotta delle Mura, бронзано доба Италија, око 1000 г пне.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Uzi Мај 10, 2022, 07:51:46 поподне
Изгледа да су поново секвенцирали и N2 узорак RISE554 из Афонтове Горе, овог пута под ознаком NEO70. Надам се да ће сада узорак бити бољег квалитета, мада су га због неког разлога сврстали у N1.

NEO70*   Bazaiha   Russia   tooth   -802   3.44   YES   222.4   F1b1b   97.6   N1   XY   20.9   Merged with NEO107 & NEO108 (same individual)  and also same indvidual as RISE554 (Allentoft et al. 2015)
 
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 10, 2022, 07:53:13 поподне
Што се дубље одређених узорака R1a хаплогрупе тиче:

https://www.yfull.com/tree/R-CTS1211/ налазиште Falköping, јужна Шведска, око 1750 година пне.
https://www.yfull.com/tree/R-Z93/ налазиште Игрен, централна Украјина, могуће Сармати, око 200 г. пне
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милан Петровић Мај 10, 2022, 08:07:41 поподне
Дај Боже да буде неки L621 коначно.  ;D
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 10, 2022, 08:16:53 поподне
Дај Боже да буде неки L621 коначно.  ;D

Ова концентрација I2-M423 у данском неолиту дјелује обећавајуће. Надам се да неће опет бити Isles.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: MiroN Мај 10, 2022, 09:33:59 поподне
https://www.yfull.com/tree/J-Z1295/ налазиште Grotta delle Mura, бронзано доба Италија, око 1000 г пне.
Везано за овај узорак на eupedi-i се појавила информација да је овај узорак сврстан под грану J-Y21878. У линку који је дат узорак се не појављује и немогу се наћи додатне информације.

https://www.eupedia.com/forum/threads/34165-J2b2-L283-(proto-illyrian)/page53

Такође испод гране Ј-Y32373 убачен је још један древни узорак из мађарске.


Sent from my iPhone using Tapatalk
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 10, 2022, 09:46:32 поподне
Везано за овај узорак на eupedi-i се појавила информација да је овај узорак сврстан под грану J-Y21878. У линку који је дат узорак се не појављује и немогу се наћи додатне информације.

https://www.eupedia.com/forum/threads/34165-J2b2-L283-(proto-illyrian)/page53

Такође испод гране Ј-Y32373 убачен је још један древни узорак из мађарске.


Sent from my iPhone using Tapatalk

На ISOGG стаблу Z1295 и Y21878 су још увијек на истом нивоу, тако да доке се не појави конкретна информација на који је од ова два SNP-a узорка имао позитивна читања, сигурније је држати се узводнијег SNP-a, у овом случају Z1295.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Мај 11, 2022, 07:30:05 пре подне
Раније сам веровао да би се део J-M205 могао повезати са феничанским колонијама. У прилог томе би ишао стари налаз ове хаплогрупа у Сидону (Либан). Иако се распоред донекле поклапа, чини се да се још боље поклапа са простором грчке колонизације (обала Црног Мора, Јужна Италија, Кипар, Исток Шпаније).

(https://preview.redd.it/0uho63ekxxz11.jpg?auto=webp&s=750f539aed33aef1082eff3b86de827536aa4491)
Мислим да би добар кандидат за феничанске колонисте била https://www.yfull.com/tree/J-Y213011/ : Либијац и Италијан TMRCA 3000 година са даљим рођаком у Ираку https://www.yfull.com/live/tree/J-Y213190/ . Можда и https://www.yfull.com/tree/J-Y134209/ .
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 11, 2022, 08:21:30 пре подне
Експанзија кавкаско-иранске компоненте (коју би условно могли повезати са хаплогрупом Ј) на Медитерану, не би требало сводити само на миграције и колоније Грка и Феничана у гвозденом добу, већ је то кретање кренуло и раније, током бронзаног доба. Ова медитеранска миграција исток-запад није повезана са степском миграцијом из континенталне Европе. У раду "The Spread of Steppe and Iranian Related Ancestry in the Islands of the Western Mediterranean" из 2020. године дат је сљедећи закључак:

"Second, our analysis shows that Iranian-related ancestry, which was widespread in the Aegean by the Middle Bronze Age in association with the Minoan and Mycenaean cultures, had also spread as west as Sicily in substantial proportion at least by the time of the Mycenaeans. One possibility is this ancestry spread west along with the Mycenaean cultural expansion. However, the presence of artifacts associated with the Sicilian Castellucian culture in Malta, Greece, and Anatolia before the peak of the Mycenaean culture leaves open the possibility of earlier gene flows, a hypothesis that could be investigated once pre-Minoan data from the Aegean become available. We find no evidence of substantial proportions of Iranian-related ancestry in the Balearic islands or Sardinia until the Phoenician period, but this does not mean that these islands were isolated from the eastern Mediterranean, and indeed the opposite is true. Archaeological evidence shows that this was a period of unprecedented material culture exchange, with substantial westward flows of goods as reflected for example in the importation of Cypriot copper in Late Bronze Age Sardinia."



Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Мај 13, 2022, 04:03:22 пре подне
Археогенетски узорци из Либана и Туниса.
https://www.haplotree.info/maps/ancient_dna/slideshow_samples.php?searchcolumn=Country&searchfor=Lebanon&ybp=500000,0&orderby=MeanYBP&ascdesc=DESC
https://www.haplotree.info/maps/ancient_dna/slideshow_samples.php?searchcolumn=Country&searchfor=Tunisia&ybp=500000,0

Био сам убеђен да су их време и империје прегазили, али појавио се један.
https://www.yfull.com/live/tree/J-ZS5907*/
(https://i.ibb.co/2hhSXD8/yfull-comlivebranch-info-J-ZS5907-t4-tab-20220513.png)
Хеј, Феничани, још( с)те живи...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: нцп Мај 13, 2022, 04:17:25 поподне
Археогенетски узорци из Либана и Туниса.
https://www.haplotree.info/maps/ancient_dna/slideshow_samples.php?searchcolumn=Country&searchfor=Lebanon&ybp=500000,0&orderby=MeanYBP&ascdesc=DESC
https://www.haplotree.info/maps/ancient_dna/slideshow_samples.php?searchcolumn=Country&searchfor=Tunisia&ybp=500000,0

Био сам убеђен да су их време и империје прегазили, али појавио се један.
https://www.yfull.com/live/tree/J-ZS5907*/
(https://i.ibb.co/2hhSXD8/yfull-comlivebranch-info-J-ZS5907-t4-tab-20220513.png)
Хеј, Феничани, још( с)те живи...

Значи Ј1.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Мај 13, 2022, 07:36:51 поподне
The genomic origins of the world’s first farmers

https://www.cell.com/action/showPdf?pii=S0092-8674%2822%2900455-X (https://www.cell.com/action/showPdf?pii=S0092-8674%2822%2900455-X)

Цитат
DNA was extracted from skeletons recovered from some of the most important archaeological sites in early Holocene Europe and Anatolia, including the first farming villages in the Aegean basin (Barcın, Aktopraklık, Nea Nikomedeia); Mesolithic and Neolithic sites from the Iron Gates gorges and other areas of the Central Balkans (Lepenski Vir, Vlasac, Grad-Starcevo, Vinca-Belo Brdo); and the oldest cemeteries and mass grave or ‘‘massacre’’ sites of the Central European EN (Kleinhadersdorf, Asparn-Schletz, Essenbach-Ammerbreite, Dillingen-Steinheim, Herxheim)
                                                                                                                                  (https://i.ibb.co/BL88Dbb/FFARMER.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Мај 15, 2022, 11:03:54 пре подне
Прегледао сам свих пет мушких узорака из Србије, и припадају следећим гранама:


VLASA7; 6814-6390 BC; Vlasac, Serbia; Iron Gates_HG; I2b-BY32198>pre-L417 (https://www.yfull.com/tree/I2/)

На YFull-у ће са тестираним из Босне и Херцеговине коначно формирати грану раније познату као I2b-L417/L415. Има отприлике 40% позитивних SNP-ова на том нивоу на FTDNA стаблу.


VLASA32; 7791-7518 BC; Vlasac, Serbia; Iron Gates_HG; R1b1a2-V2219>V88>Y127541>FTA35749 (https://www.yfull.com/tree/R-Y127541/)


LEPE48; 6062-5917 BC; Lepenski Vir, Serbia; Iron Gates_Neolithic; C1a2b-V20>V86>Y83490>FT59486 (https://www.yfull.com/tree/C-FT59486/)


LEPE52; 6005-5845 BC; Lepenski Vir, Serbia; Iron Gates_Neolithic; G2a2b2a1a1c-CTS342>pre-PF4202 (https://www.yfull.com/tree/G-PF4202/)


VC3-2; 5615-5476 BC; Vinča-Belo Brdo, Serbia; Starčevo_EN; G2a2a1a3-FGC34725>BY133179* (xBY225910) (https://www.yfull.com/tree/G-BY133179/)

У овој грани се већ налазе два узорка са Гомолаве из периода Винчанске културе, узорак из Поточана који припада Ласињској култури, као и велики број узорака из неолита и енеолита са Иберијског полуострва.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Мај 16, 2022, 09:08:59 поподне
Stable population structure in Europe since the Iron Age, despite high mobility

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.15.491973v1 (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.15.491973v1)

Древни геноми из периода од гвозденог доба до позног средњег века, а што је најбитније велики број њих са наших простора: 18 из Србије (Виминацијум, Сирмијум, Наисус, Крушевље, Бешка), 6 из Црне Горе (Доклеа-Бјеловине), 29 из Хрватске...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 16, 2022, 09:28:04 поподне
Stable population structure in Europe since the Iron Age, despite high mobility

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.15.491973v1 (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.15.491973v1)

Древни геноми из периода од гвозденог доба до позног средњег века, а што је најбитније велики број њих са наших простора: 18 из Србије (Виминацијум, Сирмијум, Наисус, Крушевље, Бешка), 6 из Црне Горе (Доклеа-Бјеловине), 29 из Хрватске...

Ово је одличан пресјек тестираних локација. Надам се да ће резултати донијети нешто суштинско ново у сазнањима. Не видим да је негдје извучен преглед основних хаплогрупа?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Неродимац Мај 16, 2022, 10:13:50 поподне
Када ће овај рад угледати светлост дана? 😀
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Мај 16, 2022, 10:46:14 поподне
Ово је одличан пресјек тестираних локација. Надам се да ће резултати донијети нешто суштинско ново у сазнањима. Не видим да је негдје извучен преглед основних хаплогрупа?

У доступним табелама нажалост нема података о хаплогрупама, можда и грешком. Свакако ће бити доступне када рад буде званично објављен.

Када ће овај рад угледати светлост дана? 😀

Не зна се ништа за сад, може бити неколико месеци, може и више од годину дана.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Мај 17, 2022, 05:47:51 пре подне
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.15.491973v1.full.pdf
Цитат
In contrast to the homogeneity of the Armenian population, most of the regions,
including Italy, Southeastern Central Europe, and Western Europe, had strikingly
heterogeneous populations. Newly collected samples reinforce previous findings of high
heterogeneity in Rome, including a large portion of the population having affinities for
present-day Near Eastern populations (Antonio et al., 2019; Posth et al., 2021) (Figure
3 - figure supplement 1). Interestingly, Southeastern Central European and Western
European individuals during the Imperial Roman & Late Antiquity period also exhibit
high heterogeneity, on par with that of contemporaneous Italy (Figures 3 and 4).
Furthermore, these ancestries are often shared across regions. In Southeastern
Central Europe, a core group of individuals have ancestry similar to that of present-day
and contemporaneous Central Europeans (C10), while other clusters have ancestry
similar to that of Northern Europeans (C4) and Eastern Mediterraneans (C6) (Figure
3C). These ancestry groups are found in contemporaneous Italy and Western Europe
as well (Figure 4C, Figure 3 - figure supplement 1). We also observe outliers of eastern
nomadic ancestry, similar to that of Sarmatian individuals previously reported, in both
Western Europe (C5, n=2) and Southeastern Central Europe (C1, n=2).
Overall, we see remarkable local genetic heterogeneity as well as cross-regional
similarities which point to common ancestry sources and, on a broader scale,
demographic events affecting different regions in similar ways.
(https://i.ibb.co/7XcGfY2/biorxiv-orgcontent10-1101-2022-05-15-491973v1-full-mix-20220517.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Мај 17, 2022, 08:17:28 пре подне
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.15.491973v1.full.pdf(https://i.ibb.co/7XcGfY2/biorxiv-orgcontent10-1101-2022-05-15-491973v1-full-mix-20220517.png)

Ако се сад не појави J-M205 на старим налазиштима код нас, неће никад. :) Иако је период нешто старији у односу на старост актуелне подгране. Мада у обзир долазе и многе друге J лозе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Be like Bill Мај 17, 2022, 10:30:50 пре подне
Ima nas još :). Kad vidim ove lepe libanske rezultate na istočnoj obali Jadrana i unutrašnjosti Srbije i meni rastu apetiti.

Ja bih u stvari trebao pomoć.

U pitanju je rad iz 2019:"The genomic history of the Iberian peninsula over the past 8000 years" autora Olalde et al. Jedan od rezultat koji se pominju jeste i uzorak I8216 pronađen u Empuriesu na severu današnje Katalonije. Potiče iz perioda ranog carstva negde oko 100 godine naše ere. Koliko sam video, niko nije bolje analizirao njegov haplotip. U samom radu označen je samo kao J i prenet je par SNP-ova na koje je pozitivan a koji su na razini M267, koliko sam shvatio. Na nekim mestima našao sam da je kao krajnji SNP označen L620 (koji je par koraka iznad P58 i PF7264)

https://haplotree.info/maps/ancient_dna/slideshow_samples.php?searchcolumn=Y_Haplotree_Variant&searchfor=J-L620&ybp=500000,0

Jučer sam slučajno na profilu jednog korisnika na FB našao nešto za što ne znam da li je rezultat analize ili samo priželjkivanja. Uglavnom, po njemu je pomenuti rezultat I8216 pozitivan na ZS4416

https://www.facebook.com/Hicham.hiccc/posts/394266402547347

Ukoliko bi to bilo tačno, to bi bio velik korak za nas, pre svega jer bi to bio prvi pripadnik PF7263 grane pronađen u arheološkim ostacima, a drugo sigurno bi pružio i dodatne informacije o kulturnom krugu sa kojim se širio (mada već odavno pretpostavljamo da je širenje počelo sa stvaranjem Rimskog carstva)

Ono što bih trebao jeste pomoć oko analize njegovog fajla pošto se u tome uopšte ne snalazim. Ovde je rad u kom se pominje a ispod njegov uzorka koji sam pronašao u bazi podataka drevne DNK.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6436108/

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/SAMEA5229473
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Мај 17, 2022, 04:38:59 поподне
Ако се сад не појави J-M205 на старим налазиштима код нас, неће никад. :) Иако је период нешто старији у односу на старост актуелне подгране. Мада у обзир долазе и многе друге J лозе.
J-M205 ће се можда појавити, јер је период од пре 3000 до 1200 година вероватно време када многе њене подгрупе долазе са Блиског Истока у Европу.
https://www.yfull.com/tree/J-Y64012/
https://www.yfull.com/tree/J-FT45018/
https://www.yfull.com/tree/J-FT73408/
https://www.yfull.com/tree/J-Y134209/
https://www.yfull.com/tree/J-CTS5338/
https://www.yfull.com/tree/J-YP13/
https://www.yfull.com/tree/J-Y213011/
Али за проналажење J-Y22059 ће требати још доста копања по Балкану или на неком другом месту, јер у време Римљана ова подгрупа је чинила мање од 1% J-M205.

Цитат
All sequence data newly generated for this study are available at the European
Nucleotide Archive (ENA) database under the accession number PRJEB52852, as well
as PRJEB49419 for individuals reported by Moots et al.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Мај 18, 2022, 05:45:18 поподне
Ево прелиминарних хаплогрупа за једина два узорка из Црне Горе, и за један део узорака из Србије:


R3481; 211-321 AD; Doclea_Bjelovine, Montenegro; J2b2a-Z638>Z1297>Z1295>Z8421>Z631>Z1043 (https://www.yfull.com/tree/J-Z1043/)

R9918; 997-1151 AD; Doclea_Bjelovine, Montenegro; J2b2a-Y15058>Z38240>CTS6190 (https://www.yfull.com/tree/J-CTS6190/)

R6693; 236-332 AD; Svilos_Krusevlje, Serbia; J2b2a-L283>Z622>Z600>Z2509>Z585 (https://www.yfull.com/tree/J-Z585/)

R6701; 236-332 AD; Svilos_Krusevlje, Serbia; R1b1a-Z2118>Z2116>S1161>CTS6718>FGC48821>FGC12521>FGC24139>BY157588 (https://www.yfull.com/tree/R-BY157588/)

R6730; 266-430 AD; Sirmium, Serbia; I2a2a-L701>P78>S25733>A427>S17511>Y41633 (https://www.yfull.com/tree/I-Y41633/)

R3918; 994-1149 AD; Sirmium, Serbia; J2b2a-Y15058>Z38240>CTS6190 (https://www.yfull.com/tree/J-CTS6190/)

R3906; 1479-1634 AD; Sirmium, Serbia; I1a1a1a-Z2336>Y3866>S4767>Y4781>S4770>M227>A11380 (https://www.yfull.com/tree/I-A11380/)

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Мај 18, 2022, 05:50:34 поподне
Ево прелиминарних хаплогрупа за једина два узорка из Црне Горе, и за један део узорака из Србије:


R3481; 211-321 AD; Doclea_Bjelovine, Montenegro; J2b2a-Z638>Z1297>Z1295>Z8421>Z631>Z1043 (https://www.yfull.com/tree/J-Z1043/)

R9918; 997-1151 AD; Doclea_Bjelovine, Montenegro; J2b2a-Y15058>Z38240>CTS6190 (https://www.yfull.com/tree/J-CTS6190/)

R6693; 236-332 AD; Svilos_Krusevlje, Serbia; J2b2a-L283>Z622>Z600>Z2509>Z585 (https://www.yfull.com/tree/J-Z585/)

R6701; 236-332 AD; Svilos_Krusevlje, Serbia; R1b1a-Z2118>Z2116>S1161>CTS6718>FGC48821>FGC12521>FGC24139>BY157588 (https://www.yfull.com/tree/R-BY157588/)

R6730; 266-430 AD; Sirmium, Serbia; I2a2a-L701>P78>S25733>A427>S17511>Y41633 (https://www.yfull.com/tree/I-Y41633/)

R3918; 994-1149 AD; Sirmium, Serbia; J2b2a-Y15058>Z38240>CTS6190 (https://www.yfull.com/tree/J-CTS6190/)

R3906; 1479-1634 AD; Sirmium, Serbia; I1a1a1a-Z2336>Y3866>S4767>Y4781>S4770>M227>A11380 (https://www.yfull.com/tree/I-A11380/)

Каква је ситуација са узорцима из Хрватске и С. Македоније? Видех да их има прилично.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Мај 18, 2022, 06:15:52 поподне
Ево прелиминарних хаплогрупа за једина два узорка из Црне Горе, и за један део узорака из Србије:


R3481; 211-321 AD; Doclea_Bjelovine, Montenegro; J2b2a-Z638>Z1297>Z1295>Z8421>Z631>Z1043 (https://www.yfull.com/tree/J-Z1043/)

R9918; 997-1151 AD; Doclea_Bjelovine, Montenegro; J2b2a-Y15058>Z38240>CTS6190 (https://www.yfull.com/tree/J-CTS6190/)

R6693; 236-332 AD; Svilos_Krusevlje, Serbia; J2b2a-L283>Z622>Z600>Z2509>Z585 (https://www.yfull.com/tree/J-Z585/)

R6701; 236-332 AD; Svilos_Krusevlje, Serbia; R1b1a-Z2118>Z2116>S1161>CTS6718>FGC48821>FGC12521>FGC24139>BY157588 (https://www.yfull.com/tree/R-BY157588/)

R6730; 266-430 AD; Sirmium, Serbia; I2a2a-L701>P78>S25733>A427>S17511>Y41633 (https://www.yfull.com/tree/I-Y41633/)

R3918; 994-1149 AD; Sirmium, Serbia; J2b2a-Y15058>Z38240>CTS6190 (https://www.yfull.com/tree/J-CTS6190/)

R3906; 1479-1634 AD; Sirmium, Serbia; I1a1a1a-Z2336>Y3866>S4767>Y4781>S4770>M227>A11380 (https://www.yfull.com/tree/I-A11380/)

Фина разноврсност J2b-M241. Подгране J-CTS6190 за сада нема на простору Црне Горе, али ови резултати указују на то да је свакако била присутна и ту.

Интересантно је присуство I2-A427 пре сеоба Словена и Германа. То може бити генетички траг Келта. Мада, колико видим, конкренто ова подграна гравитира више ка истоку Европе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Мај 18, 2022, 07:58:17 поподне
R3745 (Zadar_Hypo_banka, Croatia, 1878.25bp):
https://www.yfull.com/tree/E-Y30977
https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/E;name=E-BY66293

Далеки рођак Васојевића и Рајовића.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: гаша Мај 18, 2022, 09:55:28 поподне
Опа, појавила се и наша подграна I1 M227 у Сирмијуму, како ово коментаришете?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Мај 18, 2022, 10:42:57 поподне
Опа, појавила се и наша подграна I1 M227 у Сирмијуму, како ово коментаришете?

Ништа чудно рекао бих, с обзиром на старост узорка.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 19, 2022, 09:27:11 пре подне
R3745 (Zadar_Hypo_banka, Croatia, 1878.25bp):
https://www.yfull.com/tree/E-Y30977
https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/E;name=E-BY66293

Далеки рођак Васојевића и Рајовића.

Бане, да ли си сигуран да је овај узорак из овог новог рада? Колико ја видим, то је узорак из рада The genetic origin of Huns, Avars and conquering Hungarians
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Мај 19, 2022, 10:52:13 пре подне
Бане, да ли си сигуран да је овај узорак из овог новог рада? Колико ја видим, то је узорак из рада The genetic origin of Huns, Avars and conquering Hungarians

Supplementary Material (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.15.491973v1.supplementary-material) рада "Stable population structure in Europe since the Iron Age, despite high mobility" има табелу "Individual Metadata" са листом узорака која укључује и R3745.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Мај 19, 2022, 11:41:08 пре подне
Каква је ситуација са узорцима из Хрватске и С. Македоније? Видех да их има прилично.

Из Хрватске има укупно 29 узорака, из Македоније нема ниједан. Ево шта имам за до сада обрађене узорке из Хрватске:


R3742; 127-228 AD; Zadar_Relja, Croatia; E-L791>Z20942>Y4971>Y4972>K257>Y4970>Y143722>Y16298>Y16161 (https://www.yfull.com/tree/E-Y16161/)

R3745; 23-121 AD; Zadar_Hypo_banka, Croatia; E-V13>Z1057>Y30977>Y30976>Y99739>BY66293 (https://www.yfull.com/tree/E-Y99739/)

R3544; 550-601 AD; Gardun, Croatia; J2b2a-Z638>Z1297>Z1295>Z8421>Z631>Z1043 (https://www.yfull.com/tree/J-Z1043/)

R3665; 124-217 AD; Trogir_Dragulin, Croatia; J2a-Z6065>Y13341>Z7515>FGC15877>FGC15895>FGC15923>YP879>Y83702>FT68608>Y154988 (https://www.yfull.com/tree/J-Y154988/)

R3659; 249-378 AD; Scitarjevo, Croatia; E-V13>Z1057>CTS1273>BY3880>Z5017>BY4642>Z38334* (xBY4710,BY4715,Z37883) (https://www.yfull.com/tree/E-BY4642/)

R3685; 435-565 AD; Velic, Croatia; G2a2b-L497>Z1815>Y7538>Z1816>Z1823>Z726>CTS4803>S2808>Y3098>Y3101>FGC8322>FGC8346* (xFGC8327) (https://www.yfull.com/tree/G-FGC8346/)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 19, 2022, 12:00:53 поподне
Supplementary Material (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.15.491973v1.supplementary-material) рада "Stable population structure in Europe since the Iron Age, despite high mobility" има табелу "Individual Metadata" са листом узорака која укључује и R3745.

Знам да је R3745 из овог новог рада, али мислио сам да указујеш на узорак ERS9945244 на YFull стаблу, који  је из рада The genetic origin of Huns, Avars and conquering Hungarians. Овај R3745 још није постављен на стабло. Нисмо се разумјели.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Мај 20, 2022, 07:43:03 пре подне
Да још мало забиберимо чорбу. Тренутно стање на https://www.yfull.com/mtree/HV0a1a/ . Стварно је за (ГГ) Нобела.
(https://i.ibb.co/c1B69Rm/yfull-commtree-HV0a1a-20211226.png)
Издвојен је у подгрупу https://www.yfull.com/mtree/HV0a1a1b/ , додуше са малим нивоом поузданости.
Мутацију A16235G има и узорак 23andMe('wonderfalls-1016) на http://www.ianlogan.co.uk/sequences_by_group/hv0a_genbank_sequences.htm .

ERS9945252 ( https://www.yfull.com/live/tree/E-BY5617/ , https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/E;name=E-BY5617 ) има млађег рођака у данашњем Алжиру, можда римског или вандалског порекла.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Мај 20, 2022, 11:32:37 поподне
Један мање-више очекиван резултат:


R3931; 130-231 AD; Viminacium, Serbia; E-V13>Z1057>CTS1273>BY3880>Z5018>Z16242>pre-Y178966 (https://www.yfull.com/tree/E-Y178966/)


ниво Y178966: FGC91388+ A>T (1T); FGC91362+ C>T (1T); Y144293- T>C (1T); FT297285- T>C (1T)


И један прилично изненађујући резултат:


R9673; 79-213 AD; Viminacium, Serbia; R1a-Z280>Z92>Y4459>YP617>Y29965>pre-Y88926 (https://www.yfull.com/tree/R-Y29965/)


ниво Z280: S204/Z91+ G>A (1A)

ниво Z92: Z683+ T>A (2A); Z660/S344/CTS91+ T>G (1G)

ниво Y4459: *нема очитавања*

ниво YP617: YP617+ C>G (1G)

ниво Y29965: Y29965+ C>A (1A)

ниво Y29965>BY30709: BY30707/Y45985- C>G (1C); BY30708/Y47237- G>C (1G); BY30709- G>A (2G); BY30713/Y58068- T>C (1T)

ниво Y29965>Y88926: Y91425+ C>T (1T); BY87472- G>T (1G); Y107811- C>T (1C); FT308832- C>T (2C)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 21, 2022, 07:09:36 пре подне
Један мање-више очекиван резултат:


R3931; 130-231 AD; Viminacium, Serbia; E-V13>Z1057>CTS1273>BY3880>Z5018>Z16242>pre-Y178966 (https://www.yfull.com/tree/E-Y178966/)


ниво Y178966: FGC91388+ A>T (1T); FGC91362+ C>T (1T); Y144293- T>C (1T); FT297285- T>C (1T)


Мени је и ово прилично необичан резултат, јер ове гране колико видим нема данас на Балкану. Генерално, већина "старобалканских" линија које сам досад видио са наших простора из овог истраживања су прилично нетипичне за данашње наше становништво. Као да је добар дио становништва био измијењен након доласка Словена, и то не само оригинални словенски , већ и несловенски дио. Да ли је до мијешања словенског и несловенског елемента код Срба дошло раније негдје другдје? Овако изгледа као да наше несловенске линије нису са подручја Илирика.

Не знам, може се рећи да је узорак мали, али очекивао сам више поклапања са данашњим становништвом наших простора.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Мај 21, 2022, 07:42:02 пре подне
Мени је и ово прилично необичан резултат, јер ове гране колико видим нема данас на Балкану. Генерално, већина "старобалканских" линија које сам досад видио са наших простора из овог истраживања су прилично нетипичне за данашње наше становништво. Као да је добар дио становништва био измијењен након доласка Словена, и то не само оригинални словенски , већ и несловенски дио. Да ли је до мијешања словенског и несловенског елемента код Срба дошло раније негдје другдје? Овако изгледа као да наше несловенске линије нису са подручја Илирика.

Не знам, може се рећи да је узорак мали, али очекивао сам више поклапања са данашњим становништвом наших простора.

Колико видим, J2b2-M241 се у овом облику среће и данас. Мењала се вероватно заступљеност по областима и подгранана. Можда би се јаче везе пронашле ако би се урадила анализа старе ДНК са простора централног, јужног и источног Балкана. И код многих словенских линија налазимо "парњаке" у тим областима, па је могуће исти случај и са староседелачким хаплогрупама.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 21, 2022, 08:10:45 пре подне
Колико видим, J2b2-M241 се у овом облику среће и данас. Мењала се вероватно заступљеност по областима и подгранана. Можда би се јаче везе пронашле ако би се урадила анализа старе ДНК са простора централног, јужног и источног Балкана. И код многих словенских линија налазимо "парњаке" у тим областима, па је могуће исти случај и са староседелачким хаплогрупама.

M241 је широк појам, мислио сам на конкретније везе у задњих 2000 година, што би било очекивано обзиром на локације и старост узорака. Могуће је да централни Балкан крије више ових за нас специфичних линија. Друго објашњење би било да овим истраживањима није захваћено рурално становништво Илирика, које се , што смо видјели по истраживању Виминацијума, генетички разликовало од космпополитске популације већих римских градова на нашим просторима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Мај 21, 2022, 05:05:18 поподне
Интересантно је присуство I2-A427 пре сеоба Словена и Германа. То може бити генетички траг Келта. Мада, колико видим, конкренто ова подграна гравитира више ка истоку Европе.

У датотеци media-2.tsv пише да је узорак R6730 одбачен као контаминиран, тако да не знам да ли овај узорак може да се узме у разматрање.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Мај 21, 2022, 07:19:05 поподне
Мени је и ово прилично необичан резултат, јер ове гране колико видим нема данас на Балкану. Генерално, већина "старобалканских" линија које сам досад видио са наших простора из овог истраживања су прилично нетипичне за данашње наше становништво. Као да је добар дио становништва био измијењен након доласка Словена, и то не само оригинални словенски , већ и несловенски дио. Да ли је до мијешања словенског и несловенског елемента код Срба дошло раније негдје другдје? Овако изгледа као да наше несловенске линије нису са подручја Илирика.

Не знам, може се рећи да је узорак мали, али очекивао сам више поклапања са данашњим становништвом наших простора.

Опет, већ сада је на основу учесталости међу тестираним узорцима индикативно да је добар део илирске популације (не целокупне романизоване популације Илирика) припадао хаплогрупи J2b-M241>Z250. Како због оних узорака из позног бронзаног и гвозденог доба објављених зимус, тако и због ових од пре неки дан. Оно што мени ту заправо ствара недоумицу јесте ништа мања присутност ове хаплогрупе и на налазиштима из антике која су била урбани центри, а где су истовремено пронађене егзотичне гране различитих хаплогрупа којих данас практично нема међу овдашњим становништвом.

Иако антички узорак са западног Балкана тренутно није ни приближно меродаван за неке озбиљније закључне, за сада је само J2b-M241>Z597 као неспорно тада локална хаплогрупа била шире заступљена међу овдашњим римским грађанством, док су разне наше E1b-V13, J, G на основу овог узорка углавном биле ван тестираног подручја. Опет, врло је могуће да су неки од ових М241 из Дукље и Задра, пре свега онај CTS6190, потицали са Апенина. Колико сам испратио, илирски узорци се у принципу аутосомално наслањају на узорке из истог периода са подручја Италије, па је преко тога теже разликовати локалце од дошљака са друге стране Јадрана, поготово имајући увиду то што су М241 гране код обрађених узорака довољно старе и разгранате да покривају оба подручја.

Да сваки узорак треба посматрати у комбинацији са аутосомалном сликом говори податак да се касноантички G2a-L497>FGC8346*, чији се филогенетички најближи сродници налазе углавном на западу Европе аутосомално наслања на најужније Европске популације (Грке и јужне Италијане линк (https://i.imgur.com/2FqZhjZ.png)). Опет, E1b-V13 из Задра који може бити и локалац је аутосомално најближи средишњој Италији (https://i.imgur.com/p6N3Rrf.png).

Пошто су динарско-централнобалканске везе и словенских и предсловенских хаплогрупа већински из раносредњевековног периода, поставља се питање које је то подручје ''произвело'' толики број заједничких грана, чији се број не може објаснити само ширењем Немањићке државе односно из супротног правца каснијим досељавањем сточарских популација са југа и истока. На основу ово мало узорака не делује да су досељени Срби и Словени несловенско становништво асимиловали у најужем приобалном појасу. Штета је што овај рад садржи само један мушки антички узорак са подручја централног Балкана (Нишлију).

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Мај 21, 2022, 07:33:49 поподне
Као да је добар дио становништва био измијењен након доласка Словена, и то не само оригинални словенски , већ и несловенски дио. Да ли је до мијешања словенског и несловенског елемента код Срба дошло раније негдје другдје? Овако изгледа као да наше несловенске линије нису са подручја Илирика.

Не знам, може се рећи да је узорак мали, али очекивао сам више поклапања са данашњим становништвом наших простора.

Биће да је већи број староседелачких хаплогрупа у Срба пре у вези са Трачанима, него са Илирима. Гледајући барем данашњи распоред и правце миграција. Хаплогрупе старог Илирика најпре треба тражити међу популацијом са хрватских острва. И ту се, колико се сећам, у појединим крајевима издваја као веома заступљена хаплогрупа J2b-M102 (по свему судећи J-M241).



Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Мај 21, 2022, 07:37:21 поподне
У оном прегледу који је окачио Ћосић, видех да се код многих узорака среће у високом проценту и блискоистична компонента (Либан и сл). Да ли је у овом раду до сада било таквих узорака са познатом Y-DNA?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 21, 2022, 08:33:52 поподне
Пошто су динарско-централнобалканске везе и словенских и предсловенских хаплогрупа већински из раносредњевековног периода, поставља се питање које је то подручје ''произвело'' толики број заједничких грана, чији се број не може објаснити само ширењем Немањићке државе односно из супротног правца каснијим досељавањем сточарских популација са југа и истока. На основу ово мало узорака не делује да су досељени Срби и Словени несловенско становништво асимиловали у најужем приобалном појасу. Штета је што овај рад садржи само један мушки антички узорак са подручја централног Балкана (Нишлију).

Штета је што до данас нису објављени геноми из рада "Cosmopolitanism at the Roman Danubian Frontier, Slavic Migrations, and the Genomic Formation of Modern Balkan Peoples" (рад је још на нивоу препринта), јер има више E-V13 узорака са простора Виминацијума и Тимакум Минуса, који нису дубље истражени. При томе мислим на оне који су у том раду аутосомално одређени као Balkans IA cluster.

Биће да је већи број староседелачких хаплогрупа у Срба пре у вези са Трачанима, него са Илирима. Гледајући барем данашњи распоред и правце миграција. Хаплогрупе старог Илирика најпре треба тражити међу популацијом са хрватских острва. И ту се, колико се сећам, у појединим крајевима издваја као веома заступљена хаплогрупа J2b-M102 (по свему судећи J-M241).

Не знам шта бих рекао. Ствари ће за нас бити јасније тек кад у археогенетичким истраживањима "убоду" J-Y22059, G-Y128028, Е-A18833 и сличне огранке. Овај примјер са I1-A11380 је добар примјер шта нам треба.  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Мај 21, 2022, 09:24:44 поподне
Мени је и ово прилично необичан резултат, јер ове гране колико видим нема данас на Балкану. Генерално, већина "старобалканских" линија које сам досад видио са наших простора из овог истраживања су прилично нетипичне за данашње наше становништво. Као да је добар дио становништва био измијењен након доласка Словена, и то не само оригинални словенски , већ и несловенски дио. Да ли је до мијешања словенског и несловенског елемента код Срба дошло раније негдје другдје? Овако изгледа као да наше несловенске линије нису са подручја Илирика.

Не знам, може се рећи да је узорак мали, али очекивао сам више поклапања са данашњим становништвом наших простора.

Avari iz istočne Mađarske (prije toga Rimska Dakija) imaju linije bliže današnjem stanovništvu Balkana, uglavnom Albancima. Mislim da je dio odgovora tu.
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.01.19.476915v1.full

1) ALTper442; Middle-Late Avar (670-750 CE); E-PF2211 (http://"https://www.yfull.com/tree/E-V13/")
2) KKper541; Late Avar (seventh century CE); E-PF2211 (http://"https://www.yfull.com/tree/E-V13/")
3) KKper251; Late Avar (seventh century CE); E-Z21363 (http://"https://www.yfull.com/tree/E-L241/")
4) SZKTper70; Late Avar (700-830 CE); E-Z21357 (http://"https://www.yfull.com/tree/E-L241/")
5) PLEper23; Merged Conquering Hungarian and Commoner (tenth century CE); E-FGC11451 (http://"https://www.yfull.com/tree/E-FGC11451/")
6) SZKTper265; Late Avar (eighth century CE); E-B409 (http://"https://www.yfull.com/tree/E-FGC11457/")
7) SZKper130; Late Avar (700-750 CE); E-A10158 (http://"https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/E;name=E-A10158")
8) TCSper18; Conquering Hungarian Elite (tenth century CE); E-BY6245 (http://"https://www.yfull.com/tree/E-BY6245/")
9) SSDper144; Middle Avar (670-710 CE); E-BY5023 (http://"https://www.yfull.com/tree/E-BY5022/")
10) KKper252; Late Avar (seventh century CE); E-Z36885
11) PVper12; Late Avar (700-750 CE); E-Z5016 (http://"https://www.yfull.com/tree/E-Z5016/")
12) TMHper199; Late Avar (700-760 CE); E-Z5016 (http://"https://www.yfull.com/tree/E-Z5016/")
13) SZODper829; Early Avar (620-660 CE); E-CTS6377 (http://"https://www.yfull.com/tree/E-CTS6377/")
14) OBTper51; Late Avar (700-750 CE); E-CTS9320 (http://"https://www.yfull.com/tree/E-CTS9320/")
15) SHper182; Conquering Hungarian Commoner (tenth century CE); E-CTS9320 (http://"https://www.yfull.com/tree/E-CTS9320/")
16) OBTper106; Late Avar (eighth century CE); E-A10955 (http://"https://www.yfull.com/tree/E-BY4529*/")
17) ALTper369; Late Avar (710-750 CE); E-Z42778 (http://"https://www.yfull.com/tree/E-Z17293/")
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Мај 22, 2022, 12:00:34 поподне
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.15.491973v1.full.pdf(https://i.ibb.co/7XcGfY2/biorxiv-orgcontent10-1101-2022-05-15-491973v1-full-mix-20220517.png)
Када се погледа расподела генома данашњег становништва уочава се велика празнина између генома Источне Европе и Балкана с једне стране и Кавказа, Мале Азије и Блиског Истока с друге стране ( ту су једино три Турчина који су вероватно делимично балканског порекла). Међутим у гвозденом добу у тој празнини се налазило становништво означено као степско. Очигледно је то становништво или изумрло или се иселило, што је довело до стварања те празнине. Видимо да се у време Римског Царства појединци степског порекла појављују у Западној Европи и "Југоисточној Централној Европи", тако да је сигурно да се бар део степског становништва преселио тамо.

Изгледа да је становништво "SeCE" у гвозденом добу по геномима било слично становницима Италије, а да је у време Римског Царства дошло до прилива становништва различитог порекла: из степе, са источног Средоземља, као и становништва сличног данашњим Скандинавцима и Источноевропљанима. Средњовековно становништво "SeCE" слично је данашњем, налази се између Италијана и Источноевропљана, што је вероватно последица досељавања Словена.

Могуће је да су пре доласка Словена, припадници J2b-L283 претежно живели у јадранском сливу, а E-V13 у црноморском, све до Карпата, а да су под притиском Словена или са њима мигрирали на југ.

Приметио бих и да је становништво јужног дела Шпаније и Португала у гвозденом добу било слично данашњем становништву Француске и северног дела Шпаније, а да се током римске власти и у средњем веку приближило Италијанима и гвозденодобним Балканцима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Мај 22, 2022, 07:00:41 поподне
Када се погледа расподела генома данашњег становништва уочава се велика празнина између генома Источне Европе и Балкана с једне стране и Кавказа, Мале Азије и Блиског Истока с друге стране ( ту су једино три Турчина који су вероватно делимично балканског порекла). Међутим у гвозденом добу у тој празнини се налазило становништво означено као степско. Очигледно је то становништво или изумрло или се иселило, што је довело до стварања те празнине. Видимо да се у време Римског Царства појединци степског порекла појављују у Западној Европи и "Југоисточној Централној Европи", тако да је сигурно да се бар део степског становништва преселио тамо.

Усудио бих се да кажем да су то вероватно били Сармати који су масовно примани у римске легије и распоређивани по целом римском лимесу. Можда је добар кандидат за сарматску хаплогрупу I2-A427 коју већ имамо потврђену код једног Сармата из Казахстана 1. в.н.е.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Мај 24, 2022, 10:01:27 пре подне
Опет, већ сада је на основу учесталости међу тестираним узорцима индикативно да је добар део илирске популације (не целокупне романизоване популације Илирика) припадао хаплогрупи J2b-M241>Z250. Како због оних узорака из позног бронзаног и гвозденог доба објављених зимус, тако и због ових од пре неки дан. Оно што мени ту заправо ствара недоумицу јесте ништа мања присутност ове хаплогрупе и на налазиштима из антике која су била урбани центри, а где су истовремено пронађене егзотичне гране различитих хаплогрупа којих данас практично нема међу овдашњим становништвом.

Иако антички узорак са западног Балкана тренутно није ни приближно меродаван за неке озбиљније закључне, за сада је само J2b-M241>Z597 као неспорно тада локална хаплогрупа била шире заступљена међу овдашњим римским грађанством, док су разне наше E1b-V13, J, G на основу овог узорка углавном биле ван тестираног подручја. Опет, врло је могуће да су неки од ових М241 из Дукље и Задра, пре свега онај CTS6190, потицали са Апенина. Колико сам испратио, илирски узорци се у принципу аутосомално наслањају на узорке из истог периода са подручја Италије, па је преко тога теже разликовати локалце од дошљака са друге стране Јадрана, поготово имајући увиду то што су М241 гране код обрађених узорака довољно старе и разгранате да покривају оба подручја.

Да сваки узорак треба посматрати у комбинацији са аутосомалном сликом говори податак да се касноантички G2a-L497>FGC8346*, чији се филогенетички најближи сродници налазе углавном на западу Европе аутосомално наслања на најужније Европске популације (Грке и јужне Италијане линк (https://i.imgur.com/2FqZhjZ.png)). Опет, E1b-V13 из Задра који може бити и локалац је аутосомално најближи средишњој Италији (https://i.imgur.com/p6N3Rrf.png).

Пошто су динарско-централнобалканске везе и словенских и предсловенских хаплогрупа већински из раносредњевековног периода, поставља се питање које је то подручје ''произвело'' толики број заједничких грана, чији се број не може објаснити само ширењем Немањићке државе односно из супротног правца каснијим досељавањем сточарских популација са југа и истока. На основу ово мало узорака не делује да су досељени Срби и Словени несловенско становништво асимиловали у најужем приобалном појасу. Штета је што овај рад садржи само један мушки антички узорак са подручја централног Балкана (Нишлију).

Моја је претпоставка да, што се тиче староседелачких линија на западном Балкану, постоје два фактора - рурално становништво самог Илирика које се по свој прилици разликовало од урбаног и које је овим истраживањем вероватно само "окрзнуто", али и утицај каснијих, средњовековних сеоба, највећим делом у правцу исток-запад. Имам утисак да староседелачке линије које су сада доминантне на том подручју датирају најраније од раног средњег века, односно да у раној и касној антици ту уопште нису ни биле присутне, већ им је извориште источније (Горња Мезија и даље на исток). Разлог би се могао тражити у повлачењу популационо бројнијег становништва централног Балкана током периода Сеобе народа (нарочито током периода досељавања Словена) са тог "трусног" подручја ка јадранској обали, као и у каснијим миграцијама становништва са влашким статусом.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Драган Обреновић Мај 26, 2022, 09:58:02 поподне
Видех на YFull страници на фејсбуку:

(https://i.postimg.cc/sx4RFvpZ/image.png)

Сам научни рад је доступан овде:

https://www.nature.com/articles/s41598-022-10899-1 (https://www.nature.com/articles/s41598-022-10899-1)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 27, 2022, 07:17:12 пре подне
Сад видјех на Biorxiv да је објављен препринт рада

Whole genome analysis sheds light on the genetic origin of Huns, Avars and conquering Hungarians

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.01.19.476915v1

Не стигох да погледам има ли шта интересантно.

Однедавно су објављени bam фајлови из овог рада. Дио узорака су на YFull већ поставили.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 29, 2022, 01:26:20 поподне
Прегледао сам још два I2-Y3120 узорка (поред узорака SH-251 и SP-10) и то  из периода 10. вијека са налазишта Magyarhomorog-Kónyadomb (MH; Hajdú–Bihar County). Сврстани су у раду у слој мађарских освајача. Oво су описи тих узорака:

MH1-4: Grave No. 4:
The burial of a young adult male with Europid characteristics. Shroud fragments, arrowheads,
traces of quiver, a girth buckle, a knife, and fire-lighting equipment were found in the grave.
The burial was dated to the 10th century CE.

MH1-9: Grave No. 9:
A middle adult male with European characteristics (Cromagnoid) was buried in the grave. The
grave goods were partial horse burial with a girth buckle, antler bow plates, traces of quiver,
and fire-lighting tools. The burial was dated to the 10th century CE

MH1-4 припада грани https://www.yfull.com/live/tree/I-FT108909/ старој око 1500 година, која је изолована само на YFullu у којој се налазе Украјинци и Руси (из Татарстана). Низ за MH1-4 је сљедећи:

I2-Y3120>Y4460>B57>Y3106>Z16973>Y3118>FT16121>Y125625>FT108909

MH1-9 сам детаљно прегледао, није позитиван ни на једну подграну I2-Y3120. Има солидан број покривених позиција и негативних читања. Од мутација које одређују веће гране није му покривена позиција Z17855, мада је негативан на већи дио њених подграна. Прегледао сам му и Јашовићеве новеле (који је Z17855*), али није било позитивних читања. Дакле, оно што могу написати за MH1-9  јесте (наведена су сва негативна читања):

I2-Y3120 (xY4460,Y3548,Y18331, FT76511, FGC12095, FGC12098, FGC12097, BY154615, BY155937, FT393161, Y60793, PH3414,Y187196, FT173833, FT25344, A16413, FT14212)




Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 29, 2022, 01:32:01 поподне
Такође сам примјетио да су на YFull стабло уврстили тестираног под шифром K3-12 са налазишта Karos-Eperjesszög I, II, III (K1, K2, K3; Borsod–Abaúj–Zemplén County)1

K3-12: Grave No. 12:
The burial of a middle adult male with Europid characteristics (Cromagnoid-Pamirian) and
trepanation on the skull. The grave contained partial horse burial and skull fragments of cattle.
In addition, a green metal plaque was recorded on the human bones (e.g., on the radius, ulna,
forehead, and teeth)

Терминално је одређен као Y3120>Y4460>B57(xY3106)

Овај узорак је заправо поцијепао постојећи ниво I2-Y3106, на начин да је B57 старији од Y3106.

https://www.yfull.com/live/tree/I-B57/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Неродимац Мај 29, 2022, 06:16:15 поподне
Један мање-више очекиван резултат:


R3931; 130-231 AD; Viminacium, Serbia; E-V13>Z1057>CTS1273>BY3880>Z5018>Z16242>pre-Y178966 (https://www.yfull.com/tree/E-Y178966/)


ниво Y178966: FGC91388+ A>T (1T); FGC91362+ C>T (1T); Y144293- T>C (1T); FT297285- T>C (1T)


И један прилично изненађујући резултат:


R9673; 79-213 AD; Viminacium, Serbia; R1a-Z280>Z92>Y4459>YP617>Y29965>pre-Y88926 (https://www.yfull.com/tree/R-Y29965/)


ниво Z280: S204/Z91+ G>A (1A)

ниво Z92: Z683+ T>A (2A); Z660/S344/CTS91+ T>G (1G)

ниво Y4459: *нема очитавања*

ниво YP617: YP617+ C>G (1G)

ниво Y29965: Y29965+ C>A (1A)

ниво Y29965>BY30709: BY30707/Y45985- C>G (1C); BY30708/Y47237- G>C (1G); BY30709- G>A (2G); BY30713/Y58068- T>C (1T)

ниво Y29965>Y88926: Y91425+ C>T (1T); BY87472- G>T (1G); Y107811- C>T (1C); FT308832- C>T (2C)

Да ли за узорке из Виминацију има опис о ком се гробу ради, и да ли уопште има објашњења за сваки узорак понаособ, мислим само на Виминацијум?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Неродимац Мај 30, 2022, 12:07:06 поподне
VLASA7; 6814-6390 BC; Vlasac, Serbia; Iron Gates_HG; I2b-BY32198>pre-L417

Да ли ће овај узорак бити обрађен у Yfull, било би јако занимљиво видети њега са овим Босанцем и нашим скоро тестираним L417?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Драган Обреновић Мај 30, 2022, 12:36:30 поподне
VLASA7; 6814-6390 BC; Vlasac, Serbia; Iron Gates_HG; I2b-BY32198>pre-L417

Да ли ће овај узорак бити обрађен у Yfull, било би јако занимљиво видети њега са овим Босанцем и нашим скоро тестираним L417?

Мутација BY32198 још увек није на YFull стаблу, али Аничић је позитиван на њу, управо сам проверио (перфектан квалитет, 17 очитавања).

Видећемо, за сада су јаке индиције да је ова мушка линија опстала од Лепенског Вира до данас на подручју Балкана :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Неродимац Мај 30, 2022, 01:15:50 поподне
Мутација BY32198 још увек није на YFull стаблу, али Аничић је позитиван на њу, управо сам проверио (перфектан квалитет, 17 очитавања).

Видећемо, за сада су јаке индиције да је ова мушка линија опстала од Лепенског Вира до данас на подручју Балкана :)

То је супер, али њега нема на Yfull и да ли ће бити? Можда да питамо њих да ли ће овај узорак да анализирају?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Мај 30, 2022, 02:40:05 поподне
VLASA7; 6814-6390 BC; Vlasac, Serbia; Iron Gates_HG; I2b-BY32198>pre-L417

Да ли ће овај узорак бити обрађен у Yfull, било би јако занимљиво видети њега са овим Босанцем и нашим скоро тестираним L417?

Поднео сам још прошле недеље захтев на YFull-u за додавање овог узорка на стабло, а разлог зашто га тамо још увек нема је вероватно зато што нису још ни формирали грану L417. С обзиром да је покривеност генома наведеног узорка јако добра, нема сумње да ће он у скорије време бити додат на стабло.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Неродимац Мај 30, 2022, 02:45:24 поподне
Поднео сам још прошле недеље захтев на YFull-u за додавање овог узорка на стабло, а разлог зашто га тамо још увек нема је вероватно зато што нису још ни формирали грану L417. С обзиром да је покривеност генома наведеног узорка јако добра, нема сумње да ће он у скорије време бити додат на стабло.
Хвала Грујо ја сам свакако на њиховом Face профилу поставио питање да ће бити овај узорак бити додат на Yfull па ћемо видети шта ћемо добити као одговор. Хвала још једном.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: сɣнце Јун 03, 2022, 03:40:40 поподне
Изгледа да су у питању сасвим нови узорци. Код аварске елите доминира грана N1-F4205:

https://www.yfull.com/tree/N-F4205/

Такође сам на брзину приметио и двојицу R1b-CTS9219 и једног нешто узводнијег CTS7556, који би могли у ствари бити R1b-Z2705, као и једног E-L618, који је вероватно E-V13, уз њега има још један који има само ISOGG а не и SNP ознаку а који је исто тако E-V13. Ови скелети потичу са позноаварских некропола и колико видех, нису припадали елити. Такође су ту двојица I2-M223 којима су очитани снипови испод L801 (CTS4348 и CTS10743) и двојица I1-Z141 (један има и ниже очитан снип S2205), али су они са "касносарматске" некрополе из 5. века, дакле пре доласка Авара. Изгледа да нема ниједног I2-Y3120.

Што се тиче N-F4205 која преовладава у Early Avar Elite она има има три гране:

1. Y226011 има монголски етнос који спада под Бурјате, а зову се Хори (хорь-түмэд).
https://www.wikiwand.com/ru/%D0%A5%D0%BE%D1%80%D0%B8-%D1%82%D1%83%D0%BC%D0%B0%D1%82%D1%8B (https://www.wikiwand.com/ru/%D0%A5%D0%BE%D1%80%D0%B8-%D1%82%D1%83%D0%BC%D0%B0%D1%82%D1%8B) Познато је да је један њихов огранак, исто утопљен у Јакуте и зову се Уранхај. Овој грани припадају и казашко племе Ујсун који су по поријеклу од Монгола Хуушун.

Историјска позадина: По "Дријевној историји династије Тан" Уранхај се зову по мандарину Улонхо и један су огранак племена Шиуеј ( 失韋 shīwéi). По кинесским историјама «Юань-цзянь-лэй-хань» и «Сюй-Вэнь-сянь-тун-каом», уранхајци су изравни потомци дријевних Монгола Шањ-Жун (Shen Róng, горски Жуни, а опет Жун значи тек ратник) и скоријих Хи (Кумохи) те су насељавали исту земљу својих предака. Сами Кумохи који су били поробљени у 4. в. су једно од племена Сјенби, чије самоназвање се реконструира као Серби.

2. Y63966 припада једном огранку Туркмена који наводно потичу из Казахстана

3. F2231 која се налази у Мађарској, Пољској те у једнога дријевнога примјера из источнога Казахстана - Павлодарска област;


Ове гране су се расчланиле пређе приближно 2200 г. и знамо да је грана паралелна Аварској од племена Жун, а сами Авари као и Жуни припадали би савезу племена које су Кинези звали Беј Ди (сјеверни Ди)
https://www.wikiwand.com/ru/%D0%96%D1%83%D0%BD (https://www.wikiwand.com/ru/%D0%96%D1%83%D0%BD)

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Селаковић Јун 16, 2022, 08:57:30 пре подне
Аутори новог рада у часопису Nature тврде да су открили могуће извориште "Црне смрти" из 14. века - у Киргистану:

https://www.nature.com/articles/s41586-022-04800-3
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Драган Обреновић Јун 22, 2022, 07:58:59 пре подне
Не знам да ли је већ помињано на форуму, али ја сам управо сазнао за ову страницу на YFull, где су побројани сви аргеогенетски узорци на стаблу:

https://www.yfull.com/ancient/ (https://www.yfull.com/ancient/)

Такође, ово је врло корисна и информативна мапа:

https://umap.openstreetmap.fr/en/map/ancient-human-dna_41837#11/44.6835/22.0537 (https://umap.openstreetmap.fr/en/map/ancient-human-dna_41837#11/44.6835/22.0537)

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Јул 06, 2022, 06:34:43 пре подне
Преглед млађих археогенетских налаза са Балкана.
https://www.google.com/maps/d/viewer?mid=1lKBWR3HpqtJlpCnbXGIN48Uxa2LwQ1Nq&ll=44.89392589954054%2C20.86038925625&z=6

Укључени су и резултати из рада "Cosmopolitanism at the Roman Danubian Frontier, Slavic Migrations, and the Genomic Formation of Modern Balkan Peoples".
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Христифор Јул 06, 2022, 09:22:39 пре подне
Имамо и И2, ево мамца за аутохтонисте.   Срби из Виминацијума,  Сирмијума и Мокрина из леденог доба, кључни доказ да није било никакве сеобе Словена.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Јул 20, 2022, 09:21:15 поподне
Један мање-више очекиван резултат:


R3931; 130-231 AD; Viminacium, Serbia; E-V13>Z1057>CTS1273>BY3880>Z5018>Z16242>pre-Y178966 (https://www.yfull.com/tree/E-Y178966/)


ниво Y178966: FGC91388+ A>T (1T); FGC91362+ C>T (1T); Y144293- T>C (1T); FT297285- T>C (1T)


И један прилично изненађујући резултат:


R9673; 79-213 AD; Viminacium, Serbia; R1a-Z280>Z92>Y4459>YP617>Y29965>pre-Y88926 (https://www.yfull.com/tree/R-Y29965/)


ниво Z280: S204/Z91+ G>A (1A)

ниво Z92: Z683+ T>A (2A); Z660/S344/CTS91+ T>G (1G)

ниво Y4459: *нема очитавања*

ниво YP617: YP617+ C>G (1G)

ниво Y29965: Y29965+ C>A (1A)

ниво Y29965>BY30709: BY30707/Y45985- C>G (1C); BY30708/Y47237- G>C (1G); BY30709- G>A (2G); BY30713/Y58068- T>C (1T)

ниво Y29965>Y88926: Y91425+ C>T (1T); BY87472- G>T (1G); Y107811- C>T (1C); FT308832- C>T (2C)
На Yfull-у су се појавили R9673 https://www.yfull.com/live/tree/R-Y88926/ , R6759 https://www.yfull.com/live/tree/R-YP578/ и R11536 https://www.yfull.com/live/tree/I-Y16419/ .
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Јул 21, 2022, 11:57:57 пре подне
Ancient Maltese genomes and the genetic geography of Neolithic Europe (Ariano, 2022)
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960982222007059
https://www.cell.com/current-biology/pdf/S0960-9822(22)00705-9.pdf
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Август 05, 2022, 04:59:41 пре подне
The genomic origins of the world’s first farmers

https://www.cell.com/action/showPdf?pii=S0092-8674%2822%2900455-X (https://www.cell.com/action/showPdf?pii=S0092-8674%2822%2900455-X)
                                                                                                                                  (https://i.ibb.co/BL88Dbb/FFARMER.png)
Узорци из овог рада су се појавили на Yfull-у https://www.yfull.com/samples-from-paper/610/ .
Ако нису погрешили, VC3-2 има веома ретку митохондријалну хаплогрупу О, присутну међу домороцима Аустралије.
https://www.yfull.com/mtree/O/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Август 05, 2022, 01:24:55 поподне
Ако нису погрешили, VC3-2 има веома ретку митохондријалну хаплогрупу О, присутну међу домороцима Аустралије.
https://www.yfull.com/mtree/O/

Кад се жени српски цар Стјепане,
надалеко запроси ђевојку,…


Шалу на страну. Имају ли данашњи Срби икаквих поклапања у смислу митохондријалних или Y хаплогрупа са неолитским узорцима из овог рада?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НикПав Август 25, 2022, 09:10:44 поподне
Објављен је рад The genetic history of the Southern Arc: A bridge between West Asia and Europe

https://www.science.org/doi/10.1126/science.abm4247 (https://www.science.org/doi/10.1126/science.abm4247)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Август 25, 2022, 11:00:48 поподне
Објављен је рад The genetic history of the Southern Arc: A bridge between West Asia and Europe

https://www.science.org/doi/10.1126/science.abm4247 (https://www.science.org/doi/10.1126/science.abm4247)

То је изгледа онај најављени рад са 35 скелета из Бездањаче. Само 8 су мушкарци и припадају хаплогрупи R-P312. Али је датирање свакако утврдило да су сви из Бронзаног доба.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НикПав Август 25, 2022, 11:26:37 поподне
То је изгледа онај најављени рад са 35 скелета из Бездањаче. Само 8 су мушкарци и припадају хаплогрупи R-P312. Али је датирање свакако утврдило да су сви из Бронзаног доба.

Овде можете видети попис узорака са хаплогрупом, датирањем и именом археолошког налазишта.

Видим да је и Бездањача на листи.

https://docs.google.com/spreadsheets/d/1SDNwXADx4lxAr5myxOdJkLHw3K_CgzFibIKyrz-jhBU/edit?usp=drivesdk (https://docs.google.com/spreadsheets/d/1SDNwXADx4lxAr5myxOdJkLHw3K_CgzFibIKyrz-jhBU/edit?usp=drivesdk)

E-V13 осам узорака из Бугарске, један из Хрватске, два из Турске и један E-L618 из Северне Македоније.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Август 25, 2022, 11:49:21 поподне
Овде можете видети попис узорака са хаплогрупом, датирањем и именом археолошког налазишта.

Видим да је и Бездањача на листи.

https://docs.google.com/spreadsheets/d/1SDNwXADx4lxAr5myxOdJkLHw3K_CgzFibIKyrz-jhBU/edit?usp=drivesdk (https://docs.google.com/spreadsheets/d/1SDNwXADx4lxAr5myxOdJkLHw3K_CgzFibIKyrz-jhBU/edit?usp=drivesdk)

E-V13 осам узорака из Бугарске, један из Хрватске, два из Турске и један E-L618 из Северне Македоније.

Хвала. Дакле ипак има I-CTS10228 у Бездањачи. Чак је и дубља грана I-Y3120 одређена за узорак I18721 ако се не варам?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НикПав Август 25, 2022, 11:57:25 поподне
Хвала. Дакле ипак има I-CTS10228 у Бездањачи. Чак је и дубља грана I-Y3120 одређена за узорак I18721 ако се не варам?

Да, али без радиокарбонског датирања контроверза око овог узорка ће вероватно опстати. А можда буде могла да се одреди још дубља подграна и утврди од када овај узорак потиче.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Август 26, 2022, 12:17:29 пре подне
Да, али без радиокарбонског датирања контроверза око овог узорка ће вероватно опстати. А можда буде могла да се одреди још дубља подграна и утврди од када овај узорак потиче.

Нема више контроверзе рекао бих. Овде је још таквих узорака. Имамо сада и I1879 који је директно датиран на 1468-1636 calCE (348±26 BP, BRAMS-1303) а пронађен је такође у Хрватској код Винковаца. Хаплогрупа I-CTS10228. Уз друге узорке са Балкана који припадају узводним и низводним гранама, ствар је јасна што се ове хаплогрупе тиче.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Lajbnic Август 26, 2022, 12:25:19 пре подне
Објављен је рад The genetic history of the Southern Arc: A bridge between West Asia and Europe

https://www.science.org/doi/10.1126/science.abm4247 (https://www.science.org/doi/10.1126/science.abm4247)

I-L621, Bulgaria EBA, 3000-2000 BCE, Kazanlak, Tell Kran (Central, Yasenovo).

I-CTS4002, Romania BA, 2150-1850 BCE, Cârlomănești Arman.


Врло занимљиво.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Август 26, 2022, 12:32:09 пре подне
I-L621, Bulgaria EBA, 3000-2000 BCE, Kazanlak, Tell Kran (Central, Yasenovo). Врло занимљив узорак.

Ту је и I10479, I-CTS4002, ROU_Arman_BA, 2150-1850 BCE, Cârlomănești Arman, Romania.

Иако су оба ова узорка датирана само на основу археолошког контекста добро се уклапају у шири контекст са узорцима из Хрватске.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Сол Август 26, 2022, 12:37:11 пре подне
I-L621, Bulgaria EBA, 3000-2000 BCE, Kazanlak, Tell Kran (Central, Yasenovo).

I-CTS4002, Romania BA, 2150-1850 BCE, Cârlomănești Arman.


Врло занимљиво.

да, овај I-CTS4002 се уклапа у https://www.academia.edu/10102140/Transylvania_in_the_dark_2nd_c_BC_Celts_and_Dacians
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Август 26, 2022, 12:46:49 пре подне
Нема више контроверзе рекао бих. Овде је још таквих узорака. Имамо сада и I1879 који је директно датиран на 1468-1636 calCE (348±26 BP, BRAMS-1303) а пронађен је такође у Хрватској код Винковаца. Хаплогрупа I-CTS10228. Уз друге узорке са Балкана који припадају узводним и низводним гранама, ствар је јасна што се ове хаплогрупе тиче.

Велика је разлика у датирању I18721 и I1879. Старост I1879 је око 500 година.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Август 26, 2022, 03:58:48 пре подне
(https://www.science.org/cms/10.1126/science.abm4247/asset/c7390a59-4071-4f9b-a182-c8b7991adf38/assets/images/large/science.abm4247-fa.jpg)

Повезани чланак https://www.science.org/doi/10.1126/science.abq0755 .
Цитат
Abstract
Literary and archaeological sources have preserved a rich history of Southern Europe and West Asia since the Bronze Age that can be complemented by genetics. Mycenaean period elites in Greece did not differ from the general population and included both people with some steppe ancestry and others, like the Griffin Warrior, without it. Similarly, people in the central area of the Urartian Kingdom around Lake Van lacked the steppe ancestry characteristic of the kingdom’s northern provinces. Anatolia exhibited extraordinary continuity down to the Roman and Byzantine periods, with its people serving as the demographic core of much of the Roman Empire, including the city of Rome itself. During medieval times, migrations associated with Slavic and Turkic speakers profoundly affected the region.

https://www.science.org/content/article/phenomenal-ancient-dna-data-set-provides-clues-origin-farming-early-languages
Цитат
Their genetic story starts with the early days of farming, a period known as the Neolithic. Farming began in Anatolia in what is present-day Turkey. But the DNA shows that the people who experimented with planting wheat and domesticating sheep and goats starting about 10,000 years ago weren’t simply descendants of earlier hunter-gatherers living in the area. Dozens of newly sequenced genomes suggest Anatolia absorbed at least two separate migrations from about 10,000 to 6500 years ago. One came from today’s Iraq and Syria and the other from the Eastern Mediterranean coast. In Anatolia they mixed with each other and with the descendants of earlier hunter-gatherers. By about 6500 years ago, the populations had coalesced into a distinct genetic signature.

Another genetic contribution came from the east about 6500 years ago, as hunter-gatherers from the Caucasus entered the region. Then about 5000 years ago, a fourth group—nomads from the steppes north of the Black Sea, known as the Yamnaya—arrived, adding to the genetic picture but not fundamentally redrawing it. “The people of the Southern Arc are mostly coming from Levantine, Anatolian, and Caucasus components,” Lazaridis says. “The Yamnaya are like a layer of sauce, added after 3000 B.C.E.”

Because of similarities between Indo-European and Anatolian languages such as ancient Hittite, linguists had guessed the Yamnaya had left both genes and language in Anatolia, as well as Europe. But the new analysis finds no Yamnaya ancestry among ancient Anatolians. The team suggests they and the Yamnaya instead share common ancestors in a hunter-gatherer population in the highlands east of Anatolia, including the Caucasus Mountains. That area, they argue, is the most likely place for people to have spoken an Anatolian-Indo-European root language, perhaps between 5000 and 7000 years ago. “That Caucasus component is a unifying type of ancestry we find in all places where ancient Indo-European languages are spoken,” says Lazaridis, who is first author on all three papers.

However, Guus Kroonen, a linguist at Leiden University, says this contradicts linguistic data. The early people of the Caucasus would have been familiar with farming, he says, but the deepest layers of Indo-European have just one word for grain and no words for legumes or the plow. Those speakers “weren’t very familiar with agriculture,” he says. “The linguistic evidence and the genetic evidence don’t seem to match.”

На https://www.yfull.com/live/tree/I-FGC20479/ је тренутно YF107484 из Румуније, али тешко је рећи да ли је у питању домородац или неко немачког порекла, није уписао језик.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Август 26, 2022, 08:34:50 пре подне
Велика је разлика у датирању I18721 и I1879. Старост I1879 је око 500 година.

За тај узорак се слажем, он је из средњег века. Постоји чини ми се и узорак из Бурсе који је око 1000 година старији од овог али би и он могао бити последица сеобе Словена. Међутим чињеница је да је још један скелет из Бездањаче датиран и одређен као I-CTS10228 и публикован у још једном престижном научном часопису, уз предачке гране из Румуније и Бугарске које су из периода непосредно уочи оног или истом оном кад су живели људи који су сахрањени у Бездањачи.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Август 26, 2022, 10:01:18 пре подне
Појавио се велики број J2b (готово све J2b-M241) на простору Албаније, Хрватске и Црне Горе. На простору Албаније, очекивано, присутне разне подгране J2b-M241 и то у приоду од бронзаног доба до средњег века. На простору Хрватске/Далмације (Цетина) више узорака J2b-M241, али и два узорка J2b-M102 (2000-1600 BCE). На старим налазиштима у Хрватској поново J-PH1602, али и J-Z38240.

Солидан број узорака J2b-M241 на налазишту Велика Груда у Црној Гори, који показују извесну везу са старим узорцима из Хрватске (претежно Далмација).

Од старијих резултата издвојио бих: IJ Gornja Vrba - Savsko polje, 5000-4000 BCE;
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Август 26, 2022, 10:16:50 пре подне
IJ? Како ли је то преживело толике миленијуме?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Август 26, 2022, 10:24:33 пре подне
Ускоро би требало да се појаве резултати из ове две студије:

Ancient DNA from Mesopotamia suggests distinct Pre-Pottery and Pottery Neolithic migrations into Anatolia
https://www.science.org/doi/10.1126/science.abq0762

A genetic probe into the ancient and medieval history of Southern Europe and West Asia
https://www.science.org/doi/10.1126/science.abq0755

Други рад може бити посебно занимљив, пре свега за српске J2.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ojler Август 26, 2022, 10:29:17 пре подне
IJ? Како ли је то преживело толике миленијуме?

Пошто није ни I ни J, онда је нека њима паралелна грана која је очигледно пролазила кроз тешко уско грло, док није (највероватније) сасвим изумрла.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Август 26, 2022, 10:52:04 пре подне
Нема више контроверзе рекао бих. Овде је још таквих узорака. Имамо сада и I1879 који је директно датиран на 1468-1636 calCE (348±26 BP, BRAMS-1303) а пронађен је такође у Хрватској код Винковаца. Хаплогрупа I-CTS10228. Уз друге узорке са Балкана који припадају узводним и низводним гранама, ствар је јасна што се ове хаплогрупе тиче.

Није ствар јасна. I2 узорци из Бездањаче су фрагменти лобање који не могу бити радиокарбонски датирани, него се само претпоставља да су из бронзаног доба на темељу осталих узорака из те пећине, који су сви R1b.

Ови из Румуније и Бугарске су највјероватније у паралелним гранама које нису преци словенском I2а-динарку.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Август 26, 2022, 10:56:18 пре подне
Ускоро би требало да се појаве резултати из ове две студије:

Ancient DNA from Mesopotamia suggests distinct Pre-Pottery and Pottery Neolithic migrations into Anatolia
https://www.science.org/doi/10.1126/science.abq0762

A genetic probe into the ancient and medieval history of Southern Europe and West Asia
https://www.science.org/doi/10.1126/science.abq0755

Други рад може бити посебно занимљив, пре свега за српске J2.

Мислим да су на овом линку који је НикПав поставио Y-ДНК резултати из сва три рада.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Август 26, 2022, 11:01:12 пре подне
Ускоро би требало да се појаве резултати из ове две студије:

Ancient DNA from Mesopotamia suggests distinct Pre-Pottery and Pottery Neolithic migrations into Anatolia
https://www.science.org/doi/10.1126/science.abq0762

A genetic probe into the ancient and medieval history of Southern Europe and West Asia
https://www.science.org/doi/10.1126/science.abq0755

Други рад може бити посебно занимљив, пре свега за српске J2.

fingers crossed, што би се рекло
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НУки ⚔🦅⚔ Август 26, 2022, 11:01:33 пре подне
I18721  Context: Archaeological - Period, Full Date: 1500-800 BCE, Locality: Bezdanjača Cave, Y-DNA: I2-Y3120, mtDNA: T2b11
Је ли ово онај стари резултат или неки нови? Колико се сећам, онај стари је имао митохондријску хаплогрупу H.

Још један занимљив резултат:
I6185 Method for Determining Date: Direct: IntCal20, Full Date: 1873-1630 calBCE (3430±25 BP, PSUAMS-3982), Locality: Trestiana, Romania,
Y-DNA: R-Y2613, mtDNA: U2e1b
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Август 26, 2022, 11:07:38 пре подне
Пошто није ни I ни J, онда је нека њима паралелна грана која је очигледно пролазила кроз тешко уско грло, док није (највероватније) сасвим изумрла.

Ствар је вероватно мало једноставнија, узорак је јако слабог квалитета (свега ~21000 SNP-ова), па њихов алгоритам за утврђивање хаплогрупа није покупио ниједан SNP на нивоима I и J. Сигуран сам да бисмо провером BAM-а успели сместити овај узорак у неку грану испод I или J.

Ускоро би требало да се појаве резултати из ове две студије:

Ancient DNA from Mesopotamia suggests distinct Pre-Pottery and Pottery Neolithic migrations into Anatolia
https://www.science.org/doi/10.1126/science.abq0762

A genetic probe into the ancient and medieval history of Southern Europe and West Asia
https://www.science.org/doi/10.1126/science.abq0755

Други рад може бити посебно занимљив, пре свега за српске J2.

Сва три рада су заснована на истој бази од 700+ узорака, тако да је то то, нових узорака повезаних са овим радовима више неће бити.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ojler Август 26, 2022, 11:23:22 пре подне
Ствар је вероватно мало једноставнија, узорак је јако слабог квалитета (свега ~21000 SNP-ова), па њихов алгоритам за утврђивање хаплогрупа није покупио ниједан SNP на нивоима I и J. Сигуран сам да бисмо провером BAM-а успели сместити овај узорак у неку грану испод I или J.
...

Да, то свакако звучи као много вероватније и логичније објашњење. Слично као и за онај I2-Y3120 узорак из Бездањаче.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Јовица Кртинић Август 26, 2022, 11:55:52 пре подне
Објављен је интервју са биоархеологом Мариом Новаком, везано за истраживање које је управо објављено
(https://static.jutarnji.hr/images/slike/2022/08/25/f_10468831_1280.jpg?2022-08-25-19-29-50)

Занимало нас је јесу ли Славени након доласка потпуно промијенили генетску слику Балкана или је ипак данашње становништво мјешавина старосједилачких популација и новопридошлих Славена. Према добивеним подацима, чини се да су популације које данас наставају ове краје доиста конгломерат новопридошлих Славена те старосједилачких елемената, тј, својим сеобама на Балкан Славени нису у потпуности избрисали пријашње становништво како су неки знанственици претпостављали. У сваком случају, у припреми је велика генетичка студија која се бави управо сеобама Славена на ова подручја гдје ће бити анализирани раносредњовјековни геноми из Хрватске и регије па ћемо вјеројатни тада добити и коначну потврду за ову претпоставку.

https://www.jutarnji.hr/life/znanost/veliko-istrazivanje-o-slavenima-uzorci-iz-hrvatske-bili-su-kljucni-za-razrjesavanje-dva-pitanja-15239325?fbclid=IwAR2b9AhI0SM-G-oQHR808cAuSdBBV4KBBtfK7k_lr9Byd_fe9tCz6UzHHHA
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Imoćanin Август 26, 2022, 12:18:30 поподне
Odlične vijesti, izgleda da će i ovi novi uzorci iz Trogira biti dio tog istraživanja.

Netko na Eupedii (Lukas) je uspio provući sirove podatke (neznam kako je došao do njih?) tih uzoraka kroz K36-calculator. Izgleda da imamo prvu slavensku Dalmatinku datiranu na 718AD:

Distance to:   HRV_Trogir_Byz_outlier_I15742
1.11950319   Moldova_nord
1.13217851   Slovakia_east
1.14606206   Carpathian_Rusyns
1.24469354   Ukraine_Bukovina
1.24584821   Moldova_centru
1.24758039   UKR_Volhyn
1.26901014   UKR_Western
1.29218213   Croatia_Kvarner
1.29680058   UKR_Black_Sea_coast
1.31529051   Croatia_Dalmatia
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: vid.knezevic Август 26, 2022, 12:31:54 поподне
Још један занимљив резултат:
I6185 Method for Determining Date: Direct: IntCal20, Full Date: 1873-1630 calBCE (3430±25 BP, PSUAMS-3982), Locality: Trestiana, Romania,
Y-DNA: R-Y2613, mtDNA: U2e1b
Овај резултат је мени јако интересантан:
Ја сам Mtdna U1a1a1 573.XC G9575A а Y  R1aY2613>Y2608>YP6098>BY68536>BY149000
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Imoćanin Август 26, 2022, 01:45:46 поподне
I18721  Context: Archaeological - Period, Full Date: 1500-800 BCE, Locality: Bezdanjača Cave, Y-DNA: I2-Y3120, mtDNA: T2b11
Је ли ово онај стари резултат или неки нови? Колико се сећам, онај стари је имао митохондријску хаплогрупу H.

Da, ovo je očigledno drugi uzorak. Prijašni je ID18719, nalazište BzV10a, mtDNA: HV0a1a1b, a ovaj novi je ID18721, nalazište BzV11a, mtDNA: T2b11.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Август 26, 2022, 03:31:15 поподне
Један од за нас занимљивијих резултата је раносредњевековни I14622 из Албаније, који припада хаплогрупи T1a2b1-L131>Y6033>Z19917>CTS933>FGC47678 (https://www.yfull.com/tree/T-FGC47678/). Ова грана налази се непосредно изнад гране Y206597 у којој се налази Јовановић из Драгова код Рековца и двојица Албанаца. Узорак је директно датиран у период 773-885 године н.е., што се практично поклапа са периодом када је по процени YFull-a живео најскорији заједнички предак гране Y206597 (око 800 године н.е.), па би било важно проверити SNP-ове ове гране када BAM фајл буде доступан. Узорак је иначе из североисточног дела Албаније, са налазишта Кенете у округу Кукес, који се директно наслања на Метохију.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Август 26, 2022, 04:41:36 поподне
Још један занимљив узорак за СДП је I14686 из Албаније, локалитет Bardhoc (Northeastern, Kukes District), 1400-1700 CE који је дели хаплогрупу са Ковачанима I-Y4884 .
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Август 26, 2022, 07:43:23 поподне
Оно што ми је такође необично јесте да у овако широком обухвату истраживања пронађен само један J2b-M205 узорак и то у Јерменији на простору некадашњег краљевства Урарту https://en.wikipedia.org/wiki/Urartu

Пронађена је грана https://www.yfull.com/tree/J-Y128487/, узорак I18237
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Август 26, 2022, 07:56:09 поподне
Прилично необична грана хаплогрупе E-V13 нађена је на налазишту Sv. Križ Brdovečki код Загреба. Узорак је директно датиран у 3-4 в. пне.

https://www.yfull.com/tree/E-Y16721/

На истом налазишту нађени су још и:
https://www.yfull.com/tree/R-Y4355/
https://www.yfull.com/tree/J-Z622/

На том подручју се у том периоду углавном помињу келтска племена, али није искључено да је било и неке келтско-илирске или келтско-панонске мјешавине.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Imoćanin Август 26, 2022, 08:19:06 поподне
Izašli su G25-koordinati za sve uzorke. I ovaj I18721 je upitan:


Distance to:   2215:I18721
0.02672901   Slovenian:Slovenian137
0.02761481   Bosnian:Bosnian_12
0.02764732   Moldovan:44618757471C01
0.02861282   Moldovan:44618757481C01
0.02890859   Moldovan_o:Moldovan_V02612
0.02899812   Croatian:Croatia_Cro142
0.02977557   Croatian:Croatia_Cro133
0.02989119   German_East:German_East4
0.02995612   Ukrainian_Zakarpattia:EG600002
0.03010560   Ukrainian_Zakarpattia:EG600010
0.03028678   Slovenian:Slovenian172
0.03061823   German_Erlangen:GSM1658630
0.03074522   Moldovan:44618758492C02
0.03078524   Moldovan:44618757801C01
0.03084364   Ukrainian_Zakarpattia:EG600004
0.03085190   Moldovan:44618757462C02
0.03102073   Hungarian:NA15203
0.03112636   Hungarian:NA15201
0.03132022   Bosnian:Bosnian_13
0.03137562   Moldovan:44618758062C02
0.03145900   Bosnian:Bosnian_10
0.03169760   Ukrainian_Zakarpattia:EG600096
0.03170474   Ukrainian_Zakarpattia:EG600035
0.03222111   Moldovan:44618757472C01
0.03234611   Ukrainian_Zakarpattia:EG600007


Distance to:   2215:I18721
0.02501747   Croatian
0.02646716   Bosnian
0.02683697   Slovenian
0.02837865   Hungarian
0.02884779   Moldovan
0.02958781   Ukrainian_Zakarpattia
0.03129790   Serbian
0.03529429   Montenegrin
0.03533615   Austrian
0.03630108   Ukrainian_Lviv
0.03701869   Moldovan_o
0.03734735   Czech
0.03896192   German_East
0.03902853   German_Erlangen
0.03963473   Slovakian
0.04177768   Romanian
0.04431982   Macedonian
0.04504359   Polish
0.04605459   German
0.04613055   German_Hamburg
0.04681243   Sorb_Niederlausitz
0.04794357   Ukrainian_Zhytomyr
0.04817948   Bulgarian
0.04928401   Russian_Belgorod
0.04975646   Ukrainian_Rivne


A ovaj Y3120 iz 8. stoljeća je čisti Slaven (I10430   732   TUR_Marmara_Ilıpınar_Byz3)


Distance to:   5569:I10430
0.02676286   Russian_Belgorod:Rbgp-203
0.02771681   Ukrainian_Zakarpattia:EG600076
0.02771726   Polish:S_Polish-1
0.02851051   Ukrainian_Dnipro:EG600072
0.02883327   Ukrainian_Zakarpattia:EG600095
0.02886720   Ukrainian_Zakarpattia:EG600096
0.03004074   Slovakian:Slovakia96
0.03051965   Polish:Polish26
0.03058873   Croatian:Croatia_Cro133
0.03066153   Ukrainian_Zakarpattia:EG600020
0.03147032   Ukrainian_Zakarpattia:EG600001
0.03162636   Sorb_Niederlausitz:Niederlausitz1
0.03193127   Ukrainian_Rivne:EG600043
0.03204162   Ukrainian_Zakarpattia:EG600034
0.03206621   Ukrainian_Lviv:EG600062
0.03210471   Ukrainian_Lviv:EG600006
0.03228183   Slovakian:Slovakia77
0.03229504   Polish:Polish27
0.03246282   Ukrainian_Chernihiv:EG600053
0.03259070   Ukrainian_Sumy:EG600083
0.03267830   Croatian:Croatia_Cro43
0.03272284   Ukrainian_Zakarpattia:EG600002
0.03280040   Ukrainian_Lviv:EG600089
0.03289379   Ukrainian_Lviv:EG600063
0.03347092   Ukrainian_Lviv:EG600064

Distance to: 5569:I10430
0.02694256 Ukrainian_Zakarpattia
0.02920055 Ukrainian_Lviv
0.03162636 Sorb_Niederlausitz
0.03213918 Croatian
0.03217329 Slovakian
0.03259193 Polish
0.03406269 Hungarian
0.03488959 Russian_Belgorod
0.03510534 Slovenian
0.03537839 Czech
0.03576314 Moldovan_o
0.03600572 Ukrainian_Zhytomyr
0.03642749 Ukrainian_Rivne
0.03715411 Ukrainian_Chernihiv
0.03765813 Ukrainian_Sumy
0.03835016 Ukrainian_Dnipro
0.03905775 Bosnian
0.04025769 Russian_Voronez
0.04026005 Russian_Orel
0.04229933 Cossack_Ukrainian
0.04236659 German_East
0.04319858 Russian_Kursk
0.04357817 Austrian
0.04403420 Russian_Smolensk
0.04512946 Russian_Ryazan
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Август 26, 2022, 08:26:37 поподне
Још један занимљив резултат:
I6185 Method for Determining Date: Direct: IntCal20, Full Date: 1873-1630 calBCE (3430±25 BP, PSUAMS-3982), Locality: Trestiana, Romania,
Y-DNA: R-Y2613, mtDNA: U2e1b

Слажем се да је занимљив резултат. Локацијом он није тако далеко од подручја словенске етногенезе, па географски и не чуди толико. Чуди по датирању, јер премашује и старију границу процјене старости за R-Y2613. А датирање овог узорка би требало бити поуздано јер се ради о директном датирању. У крајњем случају очекивало би се да поцијепа ниво R-Y2613. Треба сачекати преглед сирових резултата. Сам узорак  I6185 је пронађен без икаквог археолошког контекста, смјештен је у бронзано доба на основу директне датације узорка.

На том налазишту пронађен је још један доста старији узорак, који није датиран директно али је по археолошком контексту позициониран у неолит. И он је одређен као R1a, додуше као R1a-M417.

Период и локација за узорак I6185 одговарају култури Монтеору https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9C%D0%BE%D0%BD%D1%82%D0%B5%D0%BE%D1%80%D1%83 мада видим да у раду помињу везано за то налазиште нешто каснију културу Ноуа https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9D%D0%BE%D1%83%D0%B0

Осим овог узорка, колико видим никаквих других узорака словенске R1a нема у раду. Не рачунам скорији узорак са подручја Албаније (грана https://www.yfull.com/tree/R-Y81700/ )
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Август 26, 2022, 08:54:14 поподне
У Бездањачи убједљиво доминира грана R1b-L2, једино одударају ова два I2-Y3120 узорка. Један од R1b-L2 узорака из Бездањаче је терминално одређен као https://www.yfull.com/tree/R-BY150850/, грана у којој су данас тројица родословно блиских Нијемаца. Грана која је именована по овој мутацији одвојила се прије неких 3100 година, тако да би логично било да овај узорак из Бездањаче поцијепа ниво BY150850.

 
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Александар Невски Август 26, 2022, 09:02:54 поподне
Момци, зна ли ко гдѣ се могу наћи општеродствени податци занимљивих узорака из рада, употрѣбљиви да сами рачунамо рачуначе? То нарочито важи за спорне, попут овога из Бездањаче.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Август 26, 2022, 09:20:42 поподне
Момци, зна ли ко гдѣ се могу наћи општеродствени податци занимљивих узорака из рада, употрѣбљиви да сами рачунамо рачуначе? То нарочито важи за спорне, попут овога из Бездањаче.
аутосоми:
https://dataverse.harvard.edu/file.xhtml?fileId=6415407&version=1.1

подаци о узорцима:
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1SDNwXADx4lxAr5myxOdJkLHw3K_CgzFibIKyrz-jhBU/edit#gid=56320326
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Август 26, 2022, 09:24:19 поподне
Груба слика највећих налазишта илирске зоне из овог рада:

Бездањача, Лика- доминира R1b-L2
Цетина, Далмација- доминира J2b-M241>PH1602
Велике Груде, Бока Которска- доминира J2b-M241>Z1297 (J-Z1297>Y21878)

Због велике разноврсности и присутности нема бољег кандидата за "илирску хаплогрупу" од хаплогрупе J2b-M241>Z597 https://www.yfull.com/tree/J-Z597/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Август 26, 2022, 09:47:04 поподне
I18721 je Y3120:

Y3116+  G>C (4C-1G)

Сви SNP-ови на нивоу CTS10228 су позитивни.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Август 26, 2022, 10:03:46 поподне
Ситуација што се тиче E-V13 опет танка. Осим узорка са специфичном подграном из хрватског Загорја, ког сам већ споменуо и једног из Македоније, сви остали узорци су из Бугарске, али се тамо појављују тек од гвозденог доба, уопште их нема у бронзаном добу. Можда је занимљиво да једина хаплогрупа која се   јавља заједно са E-V13 на налазиштима у Бугарској јесте R1a-Z93, што је занимљиво због раније помињане трако-кимеријске везе.

Хаплогрупа E-V13 није нађена ни у Грчкој ни и у Албанији ни у Црној Гори, што јесте прилично изненађујуће са обзиром на данашњу концентрацију. Постоје два узорка из Турске, али из периода раног средњег вијека.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Август 26, 2022, 10:10:31 поподне
Možda E-V13 i jeste došla u gvozdeno doba, to je doba velikih turbulencija na istočnom mediteranu.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Август 26, 2022, 10:31:03 поподне
Један од за нас занимљивијих резултата је раносредњевековни I14622 из Албаније, који припада хаплогрупи T1a2b1-L131>Y6033>Z19917>CTS933>FGC47678 (https://www.yfull.com/tree/T-FGC47678/). Ова грана налази се непосредно изнад гране Y206597 у којој се налази Јовановић из Драгова код Рековца и двојица Албанаца. Узорак је директно датиран у период 773-885 године н.е., што се практично поклапа са периодом када је по процени YFull-a живео најскорији заједнички предак гране Y206597 (око 800 године н.е.), па би било важно проверити SNP-ове ове гране када BAM фајл буде доступан. Узорак је иначе из североисточног дела Албаније, са налазишта Кенете у округу Кукес, који се директно наслања на Метохију.

Чини се да је I14622 аутосомално најближи данашњим Грцима:

Distance to: Kënetë:1I14622

0.03061483 Greek_Argolis
0.03071466 Greek_Laconia
0.03095288 Greek_Corinthia
0.03118718 Greek_Elis
0.03198615 Greek_Messenia
0.03234149 Greek_Achaea
0.03253668 Greek_Thessaly
0.03270101 Greek_East_Taygetos
0.03285301 Greek_Peloponnese
0.03332341 Greek_Arcadia
0.03394883 Greek_Izmir
0.03444205 Greek_South_Tsakonia
0.03446732 Himarë
0.03464034 Greek_North_Tsakonia
0.03475057 Labëria
0.03503558 Greek_West_Taygetos
0.03511235 Central_Albania
0.03516569 Italian_Molise
0.03548251 Greek_Central_Macedonia
0.03555590 Dibra
0.03578799 Mirditë
0.03632769 Greek_Macedonia
0.03656088 Korçë
0.03672170 Italian_Abruzzo
0.03696599 Pukë
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Глигорија Август 26, 2022, 11:18:20 поподне
Колко могу да видим од тестираних има и 20-так мојих са I-Y16649 и наравно сви су са простора Јерменије. Има само један узорак из Црне Горе међу њима, чини ми се бр.153, али бих рекао да није мој....Било би стварно занимљиво наћи маркере и упоредити их са својима...то би био врх...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Август 27, 2022, 07:01:17 пре подне
I10479 je CTS4002+, CTS10228-, Y44940- и BY31905-.
Да ли је позитиван на неки од https://www.yfull.com/live/branch-info/I-FGC20479/#t2-tab и https://www.yfull.com/live/branch-info/I-FGC20473/#t2-tab ?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Август 29, 2022, 10:37:55 пре подне
Мени је и ово прилично необичан резултат, јер ове гране колико видим нема данас на Балкану. Генерално, већина "старобалканских" линија које сам досад видио са наших простора из овог истраживања су прилично нетипичне за данашње наше становништво. Као да је добар дио становништва био измијењен након доласка Словена, и то не само оригинални словенски , већ и несловенски дио. Да ли је до мијешања словенског и несловенског елемента код Срба дошло раније негдје другдје? Овако изгледа као да наше несловенске линије нису са подручја Илирика.

Не знам, може се рећи да је узорак мали, али очекивао сам више поклапања са данашњим становништвом наших простора.

Виминацијум је био гранични град/тврђава. Можда би било наследника данас да је та популација имала неко дубље простирање. Можда си његови потомци, ако их је било, као робови одведени на север и исток.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Август 30, 2022, 04:02:01 пре подне
I13167 се појавио на https://www.yfull.com/tree/J-Y21878/ .

О "The genetic history of the Southern Arc: A bridge between West Asia and Europe" се расправља и овде https://forum.molgen.org/index.php/topic,14420.0.html .
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Владимир Бојановић Август 30, 2022, 07:17:05 пре подне
О "The genetic history of the Southern Arc: A bridge between West Asia and Europe" се расправља и овде https://forum.molgen.org/index.php/topic,14420.0.html .
Видим у неколико кратких коментара да је и њима прилично јасна ситуација око E-V13: https://forum.molgen.org/index.php/topic,14420.msg551594.html#msg551594

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: MiroN Август 30, 2022, 07:42:04 пре подне
I13167 се појавио на https://www.yfull.com/tree/J-Y21878/ .

О "The genetic history of the Southern Arc: A bridge between West Asia and Europe" се расправља и овде https://forum.molgen.org/index.php/topic,14420.0.html .
Да ли постоји могућност да се за овај узорак утврди дубља грана на основу доступних сирових података?


Sent from my iPhone using Tapatalk
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Август 30, 2022, 01:56:20 поподне
Један од за нас занимљивијих резултата је раносредњевековни I14622 из Албаније, који припада хаплогрупи T1a2b1-L131>Y6033>Z19917>CTS933>FGC47678 (https://www.yfull.com/tree/T-FGC47678/). Ова грана налази се непосредно изнад гране Y206597 у којој се налази Јовановић из Драгова код Рековца и двојица Албанаца. Узорак је директно датиран у период 773-885 године н.е., што се практично поклапа са периодом када је по процени YFull-a живео најскорији заједнички предак гране Y206597 (око 800 године н.е.), па би било важно проверити SNP-ове ове гране када BAM фајл буде доступан. Узорак је иначе из североисточног дела Албаније, са налазишта Кенете у округу Кукес, који се директно наслања на Метохију.

I14622 има два SNP-а покривена на нивоу T-Y206597, и (очекивано) оба су позитивна:

ниво Y206597: Y206601+ G>C (1C); Y337160+ A>G (1G)

Мислим да овај узорак даје јаку основу за претпоставку да је даље порекло Јовановића негде са подручја северне Албаније, чему би у прилог ишло и њихово предање о пореклу из Црне Горе. Тројица дубље тестираних Албанаца припадају овој грани, један из региона Лаберије у јужној Албанији, један из Дебарске области у Македонији, и један из Ђаковице, који би даљим пореклом требао бити из места Geghyseni (https://www.google.com/maps/place/Geghyseni/@42.3142388,20.0248884,15z/data=!4m5!3m4!1s0x13524146f94bc437:0x8678c3f70e267ac5!8m2!3d42.3162341!4d20.0283645), из области племена Краснићи. Оно што је занимљиво је да за разлику од већине других средњовековних узорака из Албаније, који су аутосомално најближи модерним Албанцима, I14622 најближа поклапања има са модерним Грцима, и то онима са Пелопонеза, што би могло указивати на још јужније порекло у даљој прошлости.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Драган Обреновић Август 30, 2022, 02:25:31 поподне
Један од чланака који се баве анализом недавно објављеног рада:

New DNA Analysis Redirects the Cradle of Indo-Europeans, Sheds Light on Proto-Greeks


https://greekreporter.com/2022/08/28/dna-indo-european-proto-greek/ (https://greekreporter.com/2022/08/28/dna-indo-european-proto-greek/)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: marigold Август 30, 2022, 10:24:51 поподне
I14622 има два SNP-а покривена на нивоу T-Y206597, и (очекивано) оба су позитивна:

ниво Y206597: Y206601+ G>C (1C); Y337160+ A>G (1G)

Мислим да овај узорак даје јаку основу за претпоставку да је даље порекло Јовановића негде са подручја северне Албаније, чему би у прилог ишло и њихово предање о пореклу из Црне Горе. Тројица дубље тестираних Албанаца припадају овој грани, један из региона Лаберије у јужној Албанији, један из Дебарске области у Македонији, и један из Ђаковице, који би даљим пореклом требао бити из места Geghyseni (https://www.google.com/maps/place/Geghyseni/@42.3142388,20.0248884,15z/data=!4m5!3m4!1s0x13524146f94bc437:0x8678c3f70e267ac5!8m2!3d42.3162341!4d20.0283645), из области племена Краснићи. Оно што је занимљиво је да за разлику од већине других средњовековних узорака из Албаније, који су аутосомално најближи модерним Албанцима, I14622 најближа поклапања има са модерним Грцима, и то онима са Пелопонеза, што би могло указивати на још јужније порекло у даљој прошлости.

Веома значајан резултат, хвала на анализи и повезивању са аутосомалним резултатима. Увек сам веровала да је даље порекло из Грчке.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Глигорија Август 30, 2022, 11:18:47 поподне
Дали је неко расположен на прокоментарише оних 10 древних узорака I-Y16419 са подручја Јерменије. Мада је све поприлично јасно, али опет ја лаик за генетику можда нешто не видим....
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Август 31, 2022, 08:48:56 поподне
(https://www.science.org/cms/10.1126/science.abm4247/asset/c7390a59-4071-4f9b-a182-c8b7991adf38/assets/images/large/science.abm4247-fa.jpg)

(https://greekreporter.com/wp-content/uploads/2022/08/Indo-European_migrations.jpg)

Археогенетски узорци имају већу "тежину" од данашњих популација при одређивању географског порекла хаплогрупа и гененетике уопште. На пример, https://www.yfull.com/tree/R-L52/ данас претежно живи на западу Европе, док се најстарији налази јављају чак у Монголији.
https://haplotree.info/maps/ancient_dna/slideshow_samples.php?searchcolumn=Y_Haplotree_Variant&searchfor=R-P310*&ybp=500000,0

Могла би се Евроазија поделити на степску "ветрометину" која је извор бројних народа ( и хаплогрупа), који се углавном нису задржали у њој, и ободне "сигурне луке" где данас пребивају.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 01, 2022, 10:38:12 пре подне
Занимљива разноврсност хаплогрупе R1b-M269 у бронзаном и гвозденом добу на налазишту Çinamak у сјевероисточној Албанији (округ Кукеш). Пронађене су чак четири гране R1b-M269 удаљене међусобно неколико хиљада година.

I14689  R1b-M269 (L23-) могуће PF7562 рано бронзано доба
I16251  R1b-M269>L23>Z2103>Z2105 (CTS7556-) гвоздено доба
I14688  R1b-M269>L23>L51 гвоздено доба
I14690 R1b-M269>L23>Z2103>Z2105>CTS7556>CTS1450 бронзано-гвоздено доба

Ако се не варам, овај регион на граници је илирске и дарданске зоне. Има у овом налазишту и "илирске" J2b-Z597, али можда ова разноврсност R1b-M269 указује на нешто другачији генетички састав у дарданској зони.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Септембар 01, 2022, 11:27:39 пре подне
Још један занимљив узорак за СДП је I14686 из Албаније, локалитет Bardhoc (Northeastern, Kukes District), 1400-1700 CE који је дели хаплогрупу са Ковачанима I-Y4884 .

Бардоц се налази у области Љуме, која је у 19. и 20. веку постала злогласна због арбанашких зулумћара који су у њој живели, али је њено становништво све до Великих сеоба Срба крајем 17. и почетком 18. века већински било православно, о чему говоре и извештаји страних путописаца. Овај касносредњовековни-нововековни узорак би по мом мишљењу ишао у прилог томе да су старинци у том крају, пре 18. века, били Срби.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Септембар 04, 2022, 10:30:43 поподне
Аутосомална генетика узорака из Балкана.
https://forum.molgen.org/index.php/topic,14420.msg551926.html#msg551926
(https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEhrTbbbrooswkd964dehZWnsvchKv2twc8mZjj_zMKfbU6EiQK9VRRh-Vz5kVUjP4qnWc3JpYma4PCCFMfpdPqRdVix0BS49amzlJkz2331kYanLGicwu2JXeKLmlpg9fsJZkNYNsXEdW30wcYpEgxnMg8XDjQhmCXOX4k2L4gUSZ0s2YQ0iuCbR8DC/s1536/Illyria.png)

https://forum.molgen.org/index.php/topic,14420.msg552061.html#msg552061
(https://i.ibb.co/FBcr1VG/image.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Септембар 04, 2022, 11:19:01 поподне
Аутосомална генетика узорака из Балкана.
https://forum.molgen.org/index.php/topic,14420.msg551926.html#msg551926
(https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEhrTbbbrooswkd964dehZWnsvchKv2twc8mZjj_zMKfbU6EiQK9VRRh-Vz5kVUjP4qnWc3JpYma4PCCFMfpdPqRdVix0BS49amzlJkz2331kYanLGicwu2JXeKLmlpg9fsJZkNYNsXEdW30wcYpEgxnMg8XDjQhmCXOX4k2L4gUSZ0s2YQ0iuCbR8DC/s1536/Illyria.png)

https://forum.molgen.org/index.php/topic,14420.msg552061.html#msg552061
(https://i.ibb.co/FBcr1VG/image.png)

Зна ли се тачно која два узорка из Бездањаче оволико штрче доле десно у односу на остале? Близу њих би били вероватно I14689 и I18801 судећи према ознаци на дијаграму.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 23, 2022, 05:59:22 поподне
Малоприје примјетих да је објављен нови рад (претпостављам да је препринт) под називом
The Anglo-Saxon migration and the formation of the early English gene pool

Има доста нових узорака древне днк. На први преглед примјетио сам да је нађен један J2b-M205 у Јоркширу (из периода сеобе народа). Нисам резултате детаљно прегледао.

Ово су линкови
https://www.nature.com/articles/s41586-022-05247-2#Sec34
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 29, 2022, 06:37:32 пре подне
Препринт са новим археогеномским резултатима

Investigating community formation through dense spatial and temporal sampling of 5-6th century cemeteries in Pannonia

Језеро Балатон, Мађарска, 5-6 вијек н.е.

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.09.26.509582v1
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.09.26.509582v1.full.pdf
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.09.26.509582v1.supplementary-material

Колико сam на брзину могао видјети, нађене су сљедеће хаплогрупе: I1-L22, I2-L161>Y13330, J2a-Z6065, J2b-M241>Z1043, R1b, E-L241>A7065, G2a-L497>Z726. Требало би свакако прегледати и сирове резултате.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Јовица Кртинић Септембар 29, 2022, 03:59:16 поподне
На нашем Јутјуб каналу постављен је снимак предавања проф. др Карлеса Лалуезе Фокса, одржаног 28. јуна 2022. године. Предавање је на енглеском језику, али смо урадили и превод на српски (треба само да кликнете на иконицу са титл).

https://www.poreklo.rs/2022/09/29/video-predavanje-prof-dr-karlesa-lalueze-foksa-slovenske-migracije-i-geneticko-poreklo-balkanskih-naroda/?fbclid=IwAR0qKzhKBuoPxr6V7x0DAIdmVn17XXdoYU2poJbavqdXJBk4Wv4UK3fNVQM
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Христифор Септембар 29, 2022, 05:14:55 поподне
Свака част, надамо се да је то увод за почетак снимања садржаја за шире масе. Биће прави хит и освежење у мору глупости којима се интернет запљускује.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bokez Октобар 01, 2022, 02:14:03 поподне
На нашем Јутјуб каналу постављен је снимак предавања проф. др Карлеса Лалуезе Фокса, одржаног 28. јуна 2022. године. Предавање је на енглеском језику, али смо урадили и превод на српски (треба само да кликнете на иконицу са титл).

https://www.poreklo.rs/2022/09/29/video-predavanje-prof-dr-karlesa-lalueze-foksa-slovenske-migracije-i-geneticko-poreklo-balkanskih-naroda/?fbclid=IwAR0qKzhKBuoPxr6V7x0DAIdmVn17XXdoYU2poJbavqdXJBk4Wv4UK3fNVQM

Имам сугестију једну. Обзиром да се веома лоше чују питања публике не би било лоше да неко и за тај дио клипа одради титл.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ojler Октобар 01, 2022, 02:43:17 поподне
Имам сугестију једну. Обзиром да се веома лоше чују питања публике не би било лоше да неко и за тај дио клипа одради титл.

Ако можеш да урадиш транскрипцију на српском, није проблем да се уради превод.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Октобар 04, 2022, 01:34:24 поподне
The diverse genetic origins of a Classical period Greek army (https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2205272119)

Цитат: Abstract
Trade and colonization caused an unprecedented increase in Mediterranean human mobility in the first millennium BCE. Often seen as a dividing force, warfare is in fact another catalyst of culture contact. We provide insight into the demographic dynamics of ancient warfare by reporting genome-wide data from fifth-century soldiers who fought for the army of the Greek Sicilian colony of Himera, along with representatives of the civilian population, nearby indigenous settlements, and 96 present-day individuals from Italy and Greece. Unlike the rest of the sample, many soldiers had ancestral origins in northern Europe, the Steppe, and the Caucasus. Integrating genetic, archaeological, isotopic, and historical data, these results illustrate the significant role mercenaries played in ancient Greek armies and highlight how participation in war contributed to continental-scale human mobility in the Classical world.

(https://i.imgur.com/V20aROg.png)

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Октобар 04, 2022, 01:40:43 поподне
Lazaridis, rad o genetici vojnika anticke Grcke poginulih u nekoj bitci na Siciliji. Spekulise se da je bilo dosta najamnika a da su lokalni Grci svoje poginule nosili na svoja groblja i sahranjivali u individualnim grobnicama. Citao sam juce, opet nista L70.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Октобар 05, 2022, 01:44:28 пре подне
I10944 N* - можда се неки N2 ту крије?
I10949 I-L233 старији од TMRCA на https://www.yfull.com/tree/I-L233/ https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-FT3139/tree .
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Октобар 05, 2022, 08:14:02 пре подне
I10944 N* - можда се неки N2 ту крије?
I10949 I-L233 старији од TMRCA на https://www.yfull.com/tree/I-L233/ https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-FT3139/tree .

Занимљив је овај Пре-Прото-Словен, R1a-Y35*, као и R1b-Y13200* (стари назив ове гране је био М73).

https://www.yfull.com/tree/R-Y35/
https://www.yfull.com/tree/R-Y13200/

Вероватно су обојица потпадали под "Ските". Ови налази само говоре како се иза класичног назива "Скити" крију ко зна који све народи из тог евроазијског простора.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Октобар 06, 2022, 03:47:54 поподне
I10944 N* - можда се неки N2 ту крије?
I10949 I-L233 старији од TMRCA на https://www.yfull.com/tree/I-L233/ https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-FT3139/tree .

I10944 (752-416 п.н.е.) припада истој грани као и нешто ранији узорак Мезочат културе (IR1) из Мађарске:

N2-Y6503>Y147969>Y147658* (xY148364) (https://www.yfull.com/tree/N-Y147969/)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Октобар 22, 2022, 06:25:37 пре подне
На https://www.theytree.com/tree/I-L621 су поставили неколико средњовековних узорака из Мађарске.
За овај https://www.theytree.com/sample/b414202afd9fe607d6b77ed68f2a3752.html тврде да је I-Y18331, али изгледа ми да су нешто побркали.
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/ERR8050108?show=reads
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/ERX7616825?show=reads
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/SAMEA12338306
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB49971?show=reads
https://lundiak.wordpress.com/2022/07/26/my-genetics-and-hungarians-huns-avars/
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/ERS9945111
https://www.yfull.com/samples-from-paper/600/
https://www.yfull.com/tree/I-B57/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Октобар 28, 2022, 06:44:19 поподне
Dual ancestries and ecologies of the Late Glacial Palaeolithic in Britain
https://www.nature.com/articles/s41559-022-01883-z (https://www.nature.com/articles/s41559-022-01883-z)

У раду су анализирана само два јако стара скелета из Британије. Један је генетски мушкарац и аутозомално припада WHG популацији. Штета што се не зна његова Y-DNK хаплогрупа. Митохондријална хаплогрупа узорка је U5a2, а ове друге особе која је припадала староседелачкој магдаленској популацији је U8a.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Новембар 18, 2022, 10:45:41 пре подне
The genetic legacy of the Hunyadi descendants

The Hunyadi family is one of the most influential families in the history of Central Europe in the 14th-16th centuries. The family's prestige was established by Johannes Hunyadi, a Turk-beater who rose to the position of governor of the Kingdom of Hungary. His second son, Matthias Hunyadi, became the elected ruler of the Kingdom of Hungary in 1458. The Hunyadi family had unknown origin. Moreover, Matthias failed to found a dynasty because of lacking a legitimate heir and his illegitimate son Johannes Corvinus was unable to obtain the crown. His grandson, Christophorus Corvinus, died in childhood, thus the direct male line of the family ended. In the framework of on interdisciplinary research, we have determined the whole genome sequences of Johannes Corvinus and Christophorus Corvinus by next-generation sequencing technology. Both of them carried the Y-chromosome haplogroup is E1b1b1a1b1a6a1c ~, which is widespread in Eurasia. The father-son relationship was verified using the classical STR method and whole genome data. Christophorus Corvinus belongs to the rare, sporadically occurring T2c1+146 mitochondrial haplogroup, most frequent around the Mediterranean, while his father belongs to the T2b mitochondrial haplogroup, widespread in Eurasia, both are consistent with the known origin of the mothers. Archaeogenomic analysis indicated that the Corvinus had an ancient European genome composition.

https://www.cell.com/action/showPdf?pii=S2405-8440%2822%2903019-5 (https://www.cell.com/action/showPdf?pii=S2405-8440%2822%2903019-5)

Укратко, тестирани су скелети Јаноша и Кристофера Корвина (оца и сина), припадника династије Хуњади (https://en.wikipedia.org/wiki/Hunyadi_family), и утврђено је да припадају хаплогрупи https://www.yfull.com/tree/E-PH1173/ (https://www.yfull.com/tree/E-PH1173/). С обзиром да су тестирани и STR маркери, можемо их упоредити са припадницима ове гране из табеле нашег пројекта. Колико видех на брзину, Хуњади се од наших разликују на 3 маркера: DYS385=16-17 (код наших 16-18), DYS448=18 (код наших 19) и DYS481=21 (код наших 22).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Новембар 18, 2022, 11:02:27 пре подне
Укратко, тестирани су скелети Јаноша и Кристофера Корвина (оца и сина), припадника династије Хуњади (https://en.wikipedia.org/wiki/Hunyadi_family), и утврђено је да припадају хаплогрупи https://www.yfull.com/tree/E-PH1173/ (https://www.yfull.com/tree/E-PH1173/). С обзиром да су тестирани и STR маркери, можемо их упоредити са припадницима ове гране из табеле нашег пројекта. Колико видех на брзину, Хуњади се од наших разликују на 3 маркера: DYS385=16-17 (код наших 16-18), DYS448=18 (код наших 19) и DYS481=21 (код наших 22).

Значи није био пореклом Мађар него Келт.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Exiled Новембар 18, 2022, 11:06:25 пре подне
The genetic legacy of the Hunyadi descendants

The Hunyadi family is one of the most influential families in the history of Central Europe in the 14th-16th centuries. The family's prestige was established by Johannes Hunyadi, a Turk-beater who rose to the position of governor of the Kingdom of Hungary. His second son, Matthias Hunyadi, became the elected ruler of the Kingdom of Hungary in 1458. The Hunyadi family had unknown origin. Moreover, Matthias failed to found a dynasty because of lacking a legitimate heir and his illegitimate son Johannes Corvinus was unable to obtain the crown. His grandson, Christophorus Corvinus, died in childhood, thus the direct male line of the family ended. In the framework of on interdisciplinary research, we have determined the whole genome sequences of Johannes Corvinus and Christophorus Corvinus by next-generation sequencing technology. Both of them carried the Y-chromosome haplogroup is E1b1b1a1b1a6a1c ~, which is widespread in Eurasia. The father-son relationship was verified using the classical STR method and whole genome data. Christophorus Corvinus belongs to the rare, sporadically occurring T2c1+146 mitochondrial haplogroup, most frequent around the Mediterranean, while his father belongs to the T2b mitochondrial haplogroup, widespread in Eurasia, both are consistent with the known origin of the mothers. Archaeogenomic analysis indicated that the Corvinus had an ancient European genome composition.

https://www.cell.com/action/showPdf?pii=S2405-8440%2822%2903019-5 (https://www.cell.com/action/showPdf?pii=S2405-8440%2822%2903019-5)

Укратко, тестирани су скелети Јаноша и Кристофера Корвина (оца и сина), припадника династије Хуњади (https://en.wikipedia.org/wiki/Hunyadi_family), и утврђено је да припадају хаплогрупи https://www.yfull.com/tree/E-PH1173/ (https://www.yfull.com/tree/E-PH1173/). С обзиром да су тестирани и STR маркери, можемо их упоредити са припадницима ове гране из табеле нашег пројекта. Колико видех на брзину, Хуњади се од наших разликују на 3 маркера: DYS385=16-17 (код наших 16-18), DYS448=18 (код наших 19) и DYS481=21 (код наших 22).
Тако то раде озбиљне државе и институције, чича мича завршена прича а ми се убисмо форумајући који је од којих а мого бити од оних...ја тамо кад оно међутим. Свака част Мађарима!
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Драган Обреновић Новембар 18, 2022, 11:57:28 пре подне
The genetic legacy of the Hunyadi descendants

The Hunyadi family is one of the most influential families in the history of Central Europe in the 14th-16th centuries. The family's prestige was established by Johannes Hunyadi, a Turk-beater who rose to the position of governor of the Kingdom of Hungary. His second son, Matthias Hunyadi, became the elected ruler of the Kingdom of Hungary in 1458. The Hunyadi family had unknown origin. Moreover, Matthias failed to found a dynasty because of lacking a legitimate heir and his illegitimate son Johannes Corvinus was unable to obtain the crown. His grandson, Christophorus Corvinus, died in childhood, thus the direct male line of the family ended. In the framework of on interdisciplinary research, we have determined the whole genome sequences of Johannes Corvinus and Christophorus Corvinus by next-generation sequencing technology. Both of them carried the Y-chromosome haplogroup is E1b1b1a1b1a6a1c ~, which is widespread in Eurasia. The father-son relationship was verified using the classical STR method and whole genome data. Christophorus Corvinus belongs to the rare, sporadically occurring T2c1+146 mitochondrial haplogroup, most frequent around the Mediterranean, while his father belongs to the T2b mitochondrial haplogroup, widespread in Eurasia, both are consistent with the known origin of the mothers. Archaeogenomic analysis indicated that the Corvinus had an ancient European genome composition.

https://www.cell.com/action/showPdf?pii=S2405-8440%2822%2903019-5 (https://www.cell.com/action/showPdf?pii=S2405-8440%2822%2903019-5)

Укратко, тестирани су скелети Јаноша и Кристофера Корвина (оца и сина), припадника династије Хуњади (https://en.wikipedia.org/wiki/Hunyadi_family), и утврђено је да припадају хаплогрупи https://www.yfull.com/tree/E-PH1173/ (https://www.yfull.com/tree/E-PH1173/). С обзиром да су тестирани и STR маркери, можемо их упоредити са припадницима ове гране из табеле нашег пројекта. Колико видех на брзину, Хуњади се од наших разликују на 3 маркера: DYS385=16-17 (код наших 16-18), DYS448=18 (код наших 19) и DYS481=21 (код наших 22).

Хвала за вест, значајан и интересантан резултат. Било би лепо када бисмо и ми сазнали генетичко порекло још неких наших знаменитих личности и владара и видели да ли можда има њихових далеких рођака још међу нама. Својевремено сам ставио на мапу где су сахрањени сви српски владари за које сам успео да пронађем информације о гробном месту (ако неко има допуну или исправку - молим да напише). Велики број њих има статус свеца или су сахрањени у црквама и манастирима, што је реално проблем, јер добити сагласност је велики изазов.

https://www.google.com/maps/d/viewer?mid=1kY_492g4dlX0aWNF1XRwX9sJQl2cp37A&usp=sharing (https://www.google.com/maps/d/viewer?mid=1kY_492g4dlX0aWNF1XRwX9sJQl2cp37A&usp=sharing)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Новембар 18, 2022, 12:12:08 поподне
Одакле су ти наши са којима се Хуњади разликују на та три маркера?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Новембар 18, 2022, 12:22:40 поподне
Важно је напоменути да је родоначелник Хуњадија наводно био румунског поријекла. Ова грана је присутна код Румуна.

https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=295.msg132141#msg132141
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Новембар 18, 2022, 12:29:08 поподне
Не разумем откуд Келт :D Келти нестају са историјске сцене миленијум пре но што имамо ту династију.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Новембар 18, 2022, 01:37:49 поподне
Не разумем откуд Келт :D Келти нестају са историјске сцене миленијум пре но што имамо ту династију.

Наравно да нестају али сам то рекао везано за даље порекло његове мушке линије које изгледа није везано за прото-Мађаре, јер дистрибуција ове хаплогрупе упућује на ширење са Келтима у гвозденом добу. О томе кад и како су Хуњади постали Мађари нисам ништа рекао. Можда су били ближег влашког порекла.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Новембар 18, 2022, 01:40:55 поподне
Наравно да нестају али сам то рекао везано за даље порекло његове мушке линије које изгледа није везано за прото-Мађаре, јер дистрибуција ове хаплогрупе упућује на ширење са Келтима у гвозденом добу. О томе кад и како су Хуњади постали Мађари нисам ништа рекао. Можда су били ближег влашког порекла.

На основу чега сте извели закључак да је ова грана даљег келтског порекла?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 18, 2022, 06:06:01 поподне
The genetic legacy of the Hunyadi descendants

The Hunyadi family is one of the most influential families in the history of Central Europe in the 14th-16th centuries. The family's prestige was established by Johannes Hunyadi, a Turk-beater who rose to the position of governor of the Kingdom of Hungary. His second son, Matthias Hunyadi, became the elected ruler of the Kingdom of Hungary in 1458. The Hunyadi family had unknown origin. Moreover, Matthias failed to found a dynasty because of lacking a legitimate heir and his illegitimate son Johannes Corvinus was unable to obtain the crown. His grandson, Christophorus Corvinus, died in childhood, thus the direct male line of the family ended. In the framework of on interdisciplinary research, we have determined the whole genome sequences of Johannes Corvinus and Christophorus Corvinus by next-generation sequencing technology. Both of them carried the Y-chromosome haplogroup is E1b1b1a1b1a6a1c ~, which is widespread in Eurasia. The father-son relationship was verified using the classical STR method and whole genome data. Christophorus Corvinus belongs to the rare, sporadically occurring T2c1+146 mitochondrial haplogroup, most frequent around the Mediterranean, while his father belongs to the T2b mitochondrial haplogroup, widespread in Eurasia, both are consistent with the known origin of the mothers. Archaeogenomic analysis indicated that the Corvinus had an ancient European genome composition.

https://www.cell.com/action/showPdf?pii=S2405-8440%2822%2903019-5 (https://www.cell.com/action/showPdf?pii=S2405-8440%2822%2903019-5)

Укратко, тестирани су скелети Јаноша и Кристофера Корвина (оца и сина), припадника династије Хуњади (https://en.wikipedia.org/wiki/Hunyadi_family), и утврђено је да припадају хаплогрупи https://www.yfull.com/tree/E-PH1173/ (https://www.yfull.com/tree/E-PH1173/). С обзиром да су тестирани и STR маркери, можемо их упоредити са припадницима ове гране из табеле нашег пројекта. Колико видех на брзину, Хуњади се од наших разликују на 3 маркера: DYS385=16-17 (код наших 16-18), DYS448=18 (код наших 19) и DYS481=21 (код наших 22).

Веома занимљиви резултати. Скоро сам поменуо ову грану кад сам радио стабло за хаплогрупу E-CTS9320>Z17264. Тад сам о овој грани записао сљедеће:

"док је на Балкану и на Карпатима, а самим тим и међу Србима, карактеристична грана E-PH1173>Y7168. Грану E-Y7168 карактерише специфична вриједност DYS439=9, а старост би јој се могла процијенити на период краја антике и почетка средњег вијека. Данас ову мутацију носе не само Срби, већ и Хрвати из Херцеговине, Бугари, Грци, Македонци, Секељи, Румуни. Код Срба је, иако у невеликим процентима, ова подграна присутна у свим етнографским зонама: источнохерцеговачко-крајишкој, шумадијско-војвођанској, зетској, јужноморавској, смедеревско-вршачкој. Могло би се на основу овог закључити да су носиоци гране E-PH1173>Y7168 били присутни и у српској средњовјековној популацији."

По хаплотипу би се Хуњадији требали уклапати у овај профил. Нисма гледао детаљније шта је од SNP-ова покривено.

Не треба заборавити да су се најстарији преци Хуњадија звали Војко и Србo.  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ojler Новембар 18, 2022, 06:22:01 поподне
Веома занимљиви резултати. Скоро сам поменуо ову грану кад сам радио стабло за хаплогрупу E-CTS9320>Z17264. Тад сам о овој грани записао сљедеће:

"док је на Балкану и на Карпатима, а самим тим и међу Србима, карактеристична грана E-PH1173>Y7168. Грану E-Y7168 карактерише специфична вриједност DYS439=9, а старост би јој се могла процијенити на период краја антике и почетка средњег вијека. Данас ову мутацију носе не само Срби, већ и Хрвати из Херцеговине, Бугари, Грци, Македонци, Секељи, Румуни. Код Срба је, иако у невеликим процентима, ова подграна присутна у свим етнографским зонама: источнохерцеговачко-крајишкој, шумадијско-војвођанској, зетској, јужноморавској, смедеревско-вршачкој. Могло би се на основу овог закључити да су носиоци гране E-PH1173>Y7168 били присутни и у српској средњовјековној популацији."

По хаплотипу би се Хуњадији требали уклапати у овај профил. Нисма гледао детаљније шта је од SNP-ова покривено.

Не треба заборавити да су се најстарији преци Хуњадија звали Војко и Србo.  :)

Ма од Шкипина са Удрежња гарант  ;D
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 18, 2022, 06:27:17 поподне
Видим да су их терминално одредили као BY4281, BY4330 а то само зато што су радили предвиђање преко YLeaf односно ISOGG стабла, гдје ништа испод нивоа BY4281, BY4330 не постоји. Значи биће занимљиво видјети кад се објаве WGS резултати да ли ће резултат Хуњадија цијепати E-Y164554 грану, или ће бити E-Y7168 или још нешто ниже од тога.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 18, 2022, 06:28:43 поподне
Ма од Шкипина са Удрежња гарант  ;D

Или од Деура из Грахова.  ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Христифор Новембар 18, 2022, 06:39:44 поподне
Можемо само да учимо и преписујемо од Мађара како се генетичка истраживања стављају у историјски контекст.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ДушанВучко Новембар 18, 2022, 07:25:22 поподне
Можемо само да учимо и преписујемо од Мађара како се генетичка истраживања стављају у историјски контекст.
Свака част на генетским истраживањима историјских личности, али не знам да ли ће се бавити историјским контекстом самих грана (код Арпадовића је њихова изворна грана, али да ли ће да се труде да тумаче предмађарско порекло једног од најомиљенијих краљева, не верујем ( ако се испостави напр. да су Јанош Хуњади и Матија Корвин српског порекла, тешко да ће то да објаве)...Али опет, свака част, мада то ипак не бих поредио са нама и некој нашој мањкавости жеље за истим подухватима и код нас (ипак је то и религијско питање пошто су наши средњовековни владари светитељи)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 18, 2022, 07:39:57 поподне
Кад се све узме у обзир, ови Хуњади су типичан примјер балканско-карпатско-панонског касносредњовјековног melting pot. Српска народна епика их без двојбе сматра Србима (Сибињанин Јанка прије свега), Мађари видим више не инсистирају на мађарском или секељском поријеклу, независни научници се мање више слажу да је поријекло углавном влашко или словенско. Ја бих их најприје окарактерисао као мађаризоване Србе у влашком статусу.

Импозантан је и њихов успон на друштвеној љествици. Од групе влашких вођа, до мађарског племства и на крају до мађарског краља. И то све у три генерације. Мислим да је мало сличних примјера. Веома способни. Мађари су највеће војне успјехе у средњој Европи доживјели управо захваљујући Корвиновој Црној армији (освојили Беч, Чешку, Лужицу).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Новембар 18, 2022, 07:48:04 поподне
На основу чега сте извели закључак да је ова грана даљег келтског порекла?

Грана Е-PH1173/BY4280 настаје у време експанзије Келта и одмах се грана на бројне огранке који су данас раштркани од Британије до Турске и од Гибралтара до Русије. Оваква дистрибуција, старост и бројност најстаријих огранака указује рекао бих на келтско порекло. Уз то се на основу доступних археогенетских узорака зна да је хаплогрупа E-V13>Z1057>BY3880 била заступљена у Латенској култури, мада дубље подгране нису познате.
 
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Новембар 18, 2022, 09:23:52 поподне
 Хуњади су ван сваке сумње E-Y7168 по STR маркерима. Јавља се код Румуна из Трансилваније (Кришане боље речено), а и код једног Мађара из Румуније.
 Предак Хуњадија је
- Serbe, брат му Radoul
-- Voyko
---John Olah
-- Mogoche
-- Radoul

 Писано "s", "sz", ово би требало бити лично име Шербе или Шербан које је било учестало код Румуна. Војко није било често али се јављало као лично име међу Румунима. Могош иако изведено из мађарског је било румунско име (С њим повезани и род Мугоша у Пиперима који су E-L241, потврда њиховог влашког поријекла о којем су говорили аутори већ). Радул ипак лешће код Румуна (а и код Срба је влашког коријена).

 Поријекло гране E-Y7168 прије око 1000 г. је највјероватније негдје око границе данашње Бугарске и Грчке Македоније судећи по најудаљенијим припадницима тог кластера код којих се није десила мутација на 448.

 Докази упућују најприје на румунско поријекло Хуњадија.
 
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: сɣнце Новембар 21, 2022, 12:27:11 поподне
Само њеке споредне занимљивости.
По србским пјесмама Јанко је син Стефана Лазаревића и неке дјевојке Мађарке, но Јанко је заиста био тек војвода у служби Стефана, а доцније је прешао у службу Жигизмунду.
Јанкову отцу Жигизмунд је подарио дворац Eisenmarkt (Vaydahunyad) и Јанко је, по википедији, у њеким документима оглашавао, да је његов отац заправо син Жигизмунда.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Новембар 21, 2022, 12:38:38 поподне
Да ли то Војк његовог оца може бити од Вук? Ако је његов отац био у Стефановој служби па прешао Мађарима сигурно да није био било ко. Не деле се дворци плебејцима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Новембар 23, 2022, 12:55:17 поподне
Да ли се поклапају са човеком са форума који је имао ник Геџа?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Imoćanin Новембар 29, 2022, 02:09:02 поподне
Хуњади су ван сваке сумње E-Y7168 по STR маркерима. Јавља се код Румуна из Трансилваније (Кришане боље речено), а и код једног Мађара из Румуније.
 Предак Хуњадија је
- Serbe, брат му Radoul
-- Voyko
---John Olah
-- Mogoche
-- Radoul

 Писано "s", "sz", ово би требало бити лично име Шербе или Шербан које је било учестало код Румуна. Војко није било често али се јављало као лично име међу Румунима. Могош иако изведено из мађарског је било румунско име (С њим повезани и род Мугоша у Пиперима који су E-L241, потврда њиховог влашког поријекла о којем су говорили аутори већ). Радул ипак лешће код Румуна (а и код Срба је влашког коријена).

 Поријекло гране E-Y7168 прије око 1000 г. је највјероватније негдје око границе данашње Бугарске и Грчке Македоније судећи по најудаљенијим припадницима тог кластера код којих се није десила мутација на 448.

 Докази упућују најприје на румунско поријекло Хуњадија.

Izgleda da je FTDNA smjestio Korvine ispod grane E-BY203425>COR1. Drugi pripadnice grane E-BY203425 su jedan Bugarin, jedan rod iz Grabove Drage kod Mostara i jedan rod iz Viteza.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Bane Новембар 29, 2022, 03:03:05 поподне
Izgleda da je FTDNA smjestio Korvine ispod grane E-BY203425>COR1. Drugi pripadnice grane E-BY203425 su jedan Bugarin, jedan rod iz Grabove Drage kod Mostara i jedan rod iz Viteza.

Пројекту приступио Црногорчић, вероватно Ђурђевдан, Невесиње, E-V13>Z5017>Y7168 (439=9)

ЦРНОГОРЧИЋИ су Хајровићи од Никшића, становали су у Дабру, одакле су амо доселили прије 50 година. Њихово су браство Муслимани Ајровићи у Невесињу. Славе Ђурђевдан.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Imoćanin Новембар 29, 2022, 03:29:21 поподне


Da, all nažalost bez dubinskog testa. Ima tu dosta Bugara, Grka, Mađara i Rumuna relativno bliski po STR-profilu. Koliko vidim, Crnogorčić je na 5/17 udaljenosti, a najbliži je dosad ovaj rod iz Grabove Drage, 3/23.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 29, 2022, 03:33:50 поподне
Da, all nažalost bez dubinskog testa. Ima tu dosta Bugara, Grka, Mađara i Rumuna relativno bliski po STR-profilu. Koliko vidim, Crnogorčić je na 5/17 udaljenosti, a najbliži je dosad ovaj rod iz Grabove Drage, 3/23.

Срба нема ниједног?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Imoćanin Новембар 29, 2022, 03:37:05 поподне
Срба нема ниједног?

Koliko vidim pomenuti Crnogorčić i na E-M35 projektu Deura i neki Stanković (neznam odakle).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 29, 2022, 03:42:32 поподне
Koliko vidim pomenuti Crnogorčić i na E-M35 projektu Deura i neki Stanković (neznam odakle).

На српском ДНК пројекту овој грани средњовјековне старости припада близу 30 тестираних, и то из практично свих српских области, од Далмације до Косова, Баната, Црне Горе, Тимочке крајине, Мачве, Шумадије. Мислим д аје ова грана најкаркатеристичнија управо за српску популацију и да је у оквиру исте и настала, у раном средњем вијеку.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Новембар 29, 2022, 03:48:23 поподне
На српском ДНК пројекту овој грани средњовјековне старости припада близу 30 тестираних, и то из практично свих српских области, од Далмације до Косова, Баната, Црне Горе, Тимочке крајине, Мачве, Шумадије. Мислим д аје ова грана најкаркатеристичнија управо за српску популацију и да је у оквиру исте и настала, у раном средњем вијеку.

https://anthrogenica.com/showthread.php?18885-A-theory-about-the-origin-of-E-V13&p=891824&viewfull=1#post891824
https://anthrogenica.com/showthread.php?18885-A-theory-about-the-origin-of-E-V13&p=891837&viewfull=1#post891837

https://www.yfull.com/tree/E-Y164554/
https://discover.familytreedna.com/y-dna/E-BY203425/tree

Са Србима и Хрватима у грани је вјероватно и Бугарин из Свиленграда, а Хуњади су вјероватно у грани koja je паралелнa овој српско-хрватско-бугарској.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Imoćanin Новембар 29, 2022, 03:58:18 поподне
На српском ДНК пројекту овој грани средњовјековне старости припада близу 30 тестираних, и то из практично свих српских области, од Далмације до Косова, Баната, Црне Горе, Тимочке крајине, Мачве, Шумадије. Мислим д аје ова грана најкаркатеристичнија управо за српску популацију и да је у оквиру исте и настала, у раном средњем вијеку.

Pa ja sam htio samo prenijeti informaciju da su im izvukli na FTDNA privatne mutacije COR 1, 2, 3 itd. i da imamo 23 markera koja se mogu usporediti a ne ulazit u raspravu oko toga gdje je nastala haplogrupa sa TMRCA od 1200 godina. Nego, zna li netko tko su ova dvojica ispod te grane: https://www.yfull.com/tree/E-Y332616/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 29, 2022, 04:01:32 поподне
Pa ja sam htio samo prenijeti informaciju da su im izvukli na FTDNA privatne mutacije COR 1, 2, 3 itd. i da imamo 23 markera koja se mogu usporediti a ne ulazit u raspravu oko toga gdje je nastala haplogrupa sa TMRCA od 1200 godina. Nego, zna li netko tko su ova dvojica ispod te grane: https://www.yfull.com/tree/E-Y332616/

И ја сам само пренио информацију да има и Срба у тој грани. Све у реду.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 29, 2022, 06:04:47 поподне
Nego, zna li netko tko su ova dvojica ispod te grane: https://www.yfull.com/tree/E-Y332616/

Ова грана E-Y332616 је издвојена тек у октобру ове године. Очигледно се ради о два блиско повезана појединца. Један је свакако Небула резултат док би други могао бити и Хрват са FTDNA.

Важније је питање ко је E-Y164554* односно на ком нивоу се десила промјена DYS439=9. Засад сигурно знамо да сав ниво E-Y7168 посједује DYS439=9, a исто тако ниво E-PH1173 je DYS439=12. Ту постоји прилично дуго уско грло од око 1700 година. На пола тог уског грла је неко ко је E-Y164554*. Било би важно знати да ли је тај DYS439=9.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 29, 2022, 06:36:03 поподне
Један занимљив детаљ, можда подударност, а можда и не.

Као припадници гране E-PH1173 DYS439=9 тестиране су Властелице из Липнице код Чачка које славе св. Враче. Поријеклом су из драгачевског села Властељица, гдје је о овом роду и имену села остало записано сљедеће предање:

"Кад је Сибињанин Јанко пропао с војском на Косову, и отуда се вратио сам самцит, преко планина и врлети, дође он у данашње село Властељицу једноме човеку на конак. To je било у очи светих Врачева који падају 1. новембра. Домаћин је био свечар. Јанка као путника прими он како је боље могао, и ако није знао ни ко је ни откуд је. За вечером дође време и здравицама. Између многих других гости капију и за здравље војводи Сибињанин Јанку, где је да је нека му је Бог помотњик, да сатре силу Турску!
То је Јанко и слушао и гледао али се није хтео казати.
Сутра дан пође да иде; домаћин га поведе, да га као непозната човека упути. На растанку Јанко се каже ко је и шта је било с његовом војском.
– Него хвала ти на дочеку, рекве он домаћину, – и да Бог да ти се власт никад не укратила, него да си богат и властан до века.
Тај се човек прозове после Властељица, али како су за Турака из те породице бивали кнезови, фамилија се та доцније прозове Кнежевићи?) а име Властељица остане селу и до данас."

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Exiled Новембар 29, 2022, 06:50:32 поподне
Један занимљив детаљ, можда подударност, а можда и не.

Као припадници гране E-PH1173 DYS439=9 тестиране су Властелице из Липнице код Чачка које славе св. Враче. Поријеклом су из драгачевског села Властељица, гдје је о овом роду и имену села остало записано сљедеће предање:

"Кад је Сибињанин Јанко пропао с војском на Косову, и отуда се вратио сам самцит, преко планина и врлети, дође он у данашње село Властељицу једноме човеку на конак. To je било у очи светих Врачева који падају 1. новембра. Домаћин је био свечар. Јанка као путника прими он како је боље могао, и ако није знао ни ко је ни откуд је. За вечером дође време и здравицама. Између многих других гости капију и за здравље војводи Сибињанин Јанку, где је да је нека му је Бог помотњик, да сатре силу Турску!
То је Јанко и слушао и гледао али се није хтео казати.
Сутра дан пође да иде; домаћин га поведе, да га као непозната човека упути. На растанку Јанко се каже ко је и шта је било с његовом војском.
– Него хвала ти на дочеку, рекве он домаћину, – и да Бог да ти се власт никад не укратила, него да си богат и властан до века.
Тај се човек прозове после Властељица, али како су за Турака из те породице бивали кнезови, фамилија се та доцније прозове Кнежевићи?) а име Властељица остане селу и до данас."
Ако би се ово испоставило тачним, тј.ако би се евентуално дошло до неког TRMCA онда је ово најчуднија прича коју сам ја прочито на форуму од како га пратим и учествујем и то у позитивном смислу. Требало би с тим људима попричати о најдубљем тесту а да то Друштво изгура финансијски.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Драган Обреновић Новембар 29, 2022, 07:15:57 поподне
Заиста врло интригантна прича….
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Новембар 30, 2022, 05:47:47 пре подне

Nego, zna li netko tko su ova dvojica ispod te grane: https://www.yfull.com/tree/E-Y332616/
На https://www.yfull.com/tree/E-Y332616/ је био YF107988, другог нисам нашао. Још увек се налази на https://www.yfull.com/mtree/T1b3/ која има TMRCA 5700 година, па би могао потицати из било којег краја Евроазије ( https://www.familytreedna.com/public/mt-dna-haplotree/T;name=T1b3 ), али узимајући у обзир велику концентрацију ове митоходријске хаплогрупе у Малој Азији и околини ( GRC14392041 је Јерменин), вероватно и он потиче са тог подручја, бар са мајчине стране.

Или је можда Мађар са Кавказа као IBEper64 https://www.yfull.com/mtree/T1b3b/ ?
https://www.haplotree.info/maps/ancient_dna/slideshow_samples.php?searchcolumn=mtDNA_haplogroup&searchfor=T1B3&ybp=500000,0
https://www.haplotree.info/maps/ancient_dna/slideshow_samples.php?searchcolumn=mtDNA_haplogroup&searchfor=T1B&ybp=500000,0
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Imoćanin Новембар 30, 2022, 11:17:47 пре подне
На https://www.yfull.com/tree/E-Y332616/ је био YF107988, другог нисам нашао. Још увек се налази на https://www.yfull.com/mtree/T1b3/ која има TMRCA 5700 година, па би могао потицати из било којег краја Евроазије ( https://www.familytreedna.com/public/mt-dna-haplotree/T;name=T1b3 ), али узимајући у обзир велику концентрацију ове митоходријске хаплогрупе у Малој Азији и околини ( GRC14392041 је Јерменин), вероватно и он потиче са тог подручја, бар са мајчине стране.

Или је можда Мађар са Кавказа као IBEper64 https://www.yfull.com/mtree/T1b3b/ ?
https://www.haplotree.info/maps/ancient_dna/slideshow_samples.php?searchcolumn=mtDNA_haplogroup&searchfor=T1B3&ybp=500000,0
https://www.haplotree.info/maps/ancient_dna/slideshow_samples.php?searchcolumn=mtDNA_haplogroup&searchfor=T1B&ybp=500000,0

Odlično, hvala!
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Децембар 01, 2022, 12:28:54 поподне
Објављени су аутосоми Јаноша и Кристофора Корвина.

CJM_scaled,0.122929,0.128972,0.041106,0.009367,0.030467,0.001394,0.00658,0.003692,0.00225,0.010023,-0.003248,0.005845,-0.006541,-0.003441,0,0.012994,0.011474,-0.001774,0.003394,-0.002001,-0.006863,-0.002597,0.004437,0.008194,-0.013172
CKM_scaled,0.113823,0.135065,0.036204,-0.009367,0.025543,0.00251,0.004465,-0.001846,0.006136,0.02442,-0.00065,0.007343,-0.013974,-0.00055,0.005157,0.002519,0.000782,-0.003674,-0.003897,-0.002376,-0.005241,-0.001978,0.000246,-0.002169,-0.005987

Јанош би требало да је 50% Аустријанац, 37,5% Мађар и 12,5% Влах.

Target: CJM_scaled
Distance: 1.7935% / 0.01793495 | R4P
52.0   Italian_Aosta_Valley
22.8   Rumelia_East
21.8   Slovakian
3.4   Shor_Khakassia

Target: CJM_scaled
Distance: 1.7596% / 0.01759589 | R4P
48.6   Italian_Aosta_Valley
29.8   Slovakian
19.4   Greek_Izmir
2.2   Sakha

Резултати показују дефинитивно недавно поријекло из западне Европе (Аоста, функционише и неки микс Француска, Швајцарска, Шпанија) , то му је ваљда по мађарским и аустријским линијама.
И с друге стране нешто с истока Балкана или западне Анадолије, прије истока Балкана, по влашкој линији.

И на крају нешто источне Азије. Његов прадјед је био Влах, али његово име Војк или Вајк неки повезују с Куманима.

Све у свему, необична мјешавина у поређењу с данашњим Европљанима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Децембар 10, 2022, 12:34:14 поподне
https://www.nature.com/articles/s41467-020-15560-x

Ancient genomes reveal social and genetic structure of Late Neolithic Switzerland

(https://i.postimg.cc/s2rVpvWh/FB-IMG-1587392618569.jpg)

(https://i.postimg.cc/Y26qCNmw/FB-IMG-1587392643655.jpg)
Ancient Y-DNA from Corded
War

https://drive.google.com/file/d/1rrfL3ZXEeFyGNggiM9hck7NiQEG4sP2e/view
https://haplotree.info/maps/ancient_dna/slideshow_samples.php?searchcolumn=Country&searchfor=SWITZERLAND&ybp=500000,0&orderby=MeanYBP&ascdesc=DESC
https://haplotree.info/maps/ancient_dna/slideshow_samples.php?searchcolumn=Y_Haplotree_Variant&searchfor=I-CTS5375*&ybp=500000,0&orderby=MeanYBP&ascdesc=DESC
https://haplotree.info/maps/ancient_dna/slideshow_samples.php?searchcolumn=mtDNA_haplogroup&searchfor=U2e2a1d&ybp=500000,0&orderby=MeanYBP&ascdesc=DESC
https://www.yfull.com/tree/I-Y3104/
https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-CTS5375/tree
https://www.yfull.com/mtree/U2e2a1d/
https://www.familytreedna.com/public/mt-dna-haplotree/U;name=U2e2a1d

Међутим, овде је MX190 из Шпрајтенбаха I-L621:
https://www.theytree.com/tree/I-M423
https://www.theytree.com/mttree/U2e2a
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: vid.knezevic Децембар 23, 2022, 12:10:14 поподне
Изгледа да је узрак YF112409 са Yfull-a, из гране E-Y377409* блиске са Корвинима, Марић из Врди код Мостара.
https://www.yfull.com/live/tree/E-Y164554/
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Децембар 23, 2022, 12:21:08 поподне
Jeste, video sam njenu objavu na fejsbuku. Zena testirala tri ogranka Marica Hrvata i njihovi rezultati se tek ocekuju. Od 1790. su u tom selu, sada zive u Australiji. Zena jos uvek nije svesna implikacija toga sto su u istoj grani sa Korvinima, nije neki ljubitelj istorije ocigledno. Vise je zanima onaj Bosnjak iz Viteza i Bugarin sto su iznad njih. Zamisli to covece, kakva ironija, ja verujem da bi mnoge plemicke kuce u Evropi dusu dale da dobiju taj rezultat XD a dobije ga seoska porodica iz okoline Mostara.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Децембар 23, 2022, 12:54:25 поподне
Глуми неутралност и неизаинтересованост,а изнутра ври. 💯 Гарант  :D
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: vid.knezevic Децембар 23, 2022, 12:57:10 поподне
Jeste, video sam njenu objavu na fejsbuku. Zena testirala tri ogranka Marica Hrvata i njihovi rezultati se tek ocekuju. Od 1790. su u tom selu, sada zive u Australiji. Zena jos uvek nije svesna implikacija toga sto su u istoj grani sa Korvinima, nije neki ljubitelj istorije ocigledno. Vise je zanima onaj Bosnjak iz Viteza i Bugarin sto su iznad njih. Zamisli to covece, kakva ironija, ja verujem da bi mnoge plemicke kuce u Evropi dusu dale da dobiju taj rezultat XD a dobije ga seoska porodica iz okoline Mostara.
С обзиром на друштво, не сумњам да неки наш близак резултат чучи ту негде.
Надам се да ће га неко пронаћи. Било би битно и за макро и микро историјиографију.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Децембар 23, 2022, 01:06:46 поподне
Могуће, мада чудно да се до сада није појавио ако постоји с обзиром на постотак тестиран Срба у Херцеговини. Видећемо, потребни су дубљи тестови. Биће их временом све више, надајмо се.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Децембар 23, 2022, 01:09:06 поподне
Глуми неутралност и неизаинтересованост,а изнутра ври. 💯 Гарант  :D

Глуми неизаинтересованост а овамо букира први лет за Будимпешту  ;D
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Владимир Бојановић Децембар 23, 2022, 01:10:55 поподне
Глуми неутралност и неизаинтересованост,а изнутра ври. 💯 Гарант  :D
Тек ће да ври када им се придруже драгачевске Властељице.  :D
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Јануар 17, 2023, 10:10:30 поподне
Објављен је нови археогенетски рад Ancient DNA reveals admixture history and endogamy in the prehistoric Aegean https://www.nature.com/articles/s41559-022-01952-3#MOESM4 (https://www.nature.com/articles/s41559-022-01952-3#MOESM4).

Међу узорцима су и остаци једне породице са локалитета Mygdalia из микенског периода, старости око 3500 година, која је имала хаплогрупу J2b2a1 што је према YFull номенклатури J-L283 ако се не варам.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 25, 2023, 08:38:28 пре подне
Видим да је ових дана објављен рад са средњовјековним узорцима из околине Травника. И раније су ови налази помињани, ради се о узорцима хаплогрупе J2a. Било би добро кад би неко успио доћи до интегралног текста и прилога рада, јер на овом линку на мрежи дат је само апстракт.

https://www.fsigenetics.com/article/S1872-4973(23)00004-2/fulltext

Ради се о својеврсној родовској групи, која је могла припадати племству.

https://genubih.ba/wp-content/uploads/2021/09/Tamara-Lukic.pdf
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Јануар 25, 2023, 09:52:43 пре подне
Видим да је ових дана објављен рад са средњовјековним узорцима из околине Травника. И раније су ови налази помињани, ради се о узорцима хаплогрупе J2a. Било би добро кад би неко успио доћи до интегралног текста и прилога рада, јер на овом линку на мрежи дат је само апстракт.

https://www.fsigenetics.com/article/S1872-4973(23)00004-2/fulltext

Ради се о својеврсној родовској групи, која је могла припадати племству.

https://genubih.ba/wp-content/uploads/2021/09/Tamara-Lukic.pdf

Да ли се зна која подграна Ј2а хаплогрупе је у питању?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 25, 2023, 10:13:14 пре подне
Да ли се зна која подграна Ј2а хаплогрупе је у питању?

И ја бих то волио знати, маркери постоје, али нисам нашао да су негдје објављени.

Ако ништа друго бар се зна име и презиме једног од сахрањених, пошто стећак има натпис.

(https://i.postimg.cc/X7w2s5YV/kusetic.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 25, 2023, 10:42:51 пре подне
Možda sam i ranije postavljao arheološki rad o ovoj grupi nalazišta, ali evo da postavim ponovo

https://www.anubih.ba/godisnjak/god44/Godisnjak44-12.pdf
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Јануар 25, 2023, 11:50:24 пре подне
Видим да је ових дана објављен рад са средњовјековним узорцима из околине Травника. И раније су ови налази помињани, ради се о узорцима хаплогрупе J2a. Било би добро кад би неко успио доћи до интегралног текста и прилога рада, јер на овом линку на мрежи дат је само апстракт.

https://www.fsigenetics.com/article/S1872-4973(23)00004-2/fulltext

Ради се о својеврсној родовској групи, која је могла припадати племству.

https://genubih.ba/wp-content/uploads/2021/09/Tamara-Lukic.pdf

Piše da su generisani puni profili
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 25, 2023, 11:53:07 пре подне
Још један детаљ у вези ових налаза је занимљив. Крстача Петра Кушетића са задње стране има приказ љиљана. Подручје села гдје су анализирани ови гробови, у средњем вијеку било је у посједу Котроманића. Не знам да ли је још нека породица осим Котроманића у Босни користила љиљане на свом грбу. Можда тај приказ љиљана на гробу Кушетића и не носи неко хералдичко значење. Како год радило се о неком великашком роду присутном на том подручју с краја 14. и почетком 15. вијека.

Да је само остао сачуван натпис који слиједи послије "старином..." ствари би биле много јасније.

(https://i.postimg.cc/HW2JqVG9/kusetic-krstaca.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 25, 2023, 12:01:00 поподне
Ископах профиле, али их нисам прегледао.

https://papers.ssrn.com/sol3/Delivery.cfm/a64a3fba-1ac0-4795-9dcd-9733954b822b-MECA.pdf?abstractid=4169879&mirid=1
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Јануар 25, 2023, 12:20:18 поподне
Као што смо негде и очекивали, сви припадају хаплогрупи J2a-L70. Врло вероватно подграни J-CTS3601>PF5456>Y24651>Z40772. Маркерима им је доста близак Јовановић из Браничева, као и још неке породице са југа Србије.

Због 481=22 није искључено да постоји нека веза са оним родом J2a-L70 Јовањдан, чијих припадника има на Змијању, у Босанској Посавини па и у Барањи (презиме Бошњак).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Јануар 25, 2023, 12:23:46 поподне
Grob 2 po Nevgenu je J-Z387
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Јануар 25, 2023, 12:24:46 поподне
Као што смо негде и очекивали, сви припадају хаплогрупи J2a-L70. Врло вероватно подграни J-CTS3601>PF5456>Y24651>Z40772. Маркерима им је доста близак Јовановић из Браничева, као и још неке породице са југа Србије.

Због 481=22 није искључено да постоји нека веза са оним родом J2a-L70 Јовањдан, чијих припадника има на Змијању, у Босанској Посавини па и у Барањи (презиме Бошњак).

Зовите ме змај од Босне
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Јануар 25, 2023, 12:28:55 поподне
Зовите ме змај од Босне

Зваћемо те Змај од Шипова. :D
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 25, 2023, 12:36:41 поподне
У цијелој овој причи је најинтересантније што се ради о очигледно разгранатом роду на том подручју. То није био неки залутали појединац. При томе J2a-L70 је далеко од типичне за Босну.

Колико видим, најближа поклапања су Грчка, Македонија, Италија.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Јануар 25, 2023, 12:40:31 поподне
Не знам какав је историјски пут ове племићке куће Кушетића, али делује да је њихова старина негде на југу. Е сад којим су путевима господњим дошли до Средње Босне.

Приметих и на неким истраживањима за БиХ муслимане појачану J2a-L70, али сам је и сам често повезивао (делом, не читаву) са османским утицајем са истока. Изгледа да је делом "староседелачка" у БиХ. Наравно има ту још подграна J2a неиспитаног порекла.

Интересантна би била ова српска група J2a-L70 Јовањдан са простора БиХ. Да ли они могу бити у вези са овим резултатима. Њима чини се и фали нека озбиљнија повезница са матичним српским областима на истоку (Херцеговина, Стари Влах, Црна Гора), па лако могу бити старинци.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 25, 2023, 12:51:21 поподне
Не знам какав је историјски пут ове племићке куће Кушетића, али делује да је њихова старина негде на југу. Е сад којим су путевима господњим дошли до Средње Босне.

Приметих и на неким истраживањима за БиХ муслимане појачану J2a-L70, али сам је и сам често повезивао (делом, не читаву) са османским утицајем са истока. Изгледа да је делом "староседелачка" у БиХ. Наравно има ту још подграна J2a неиспитаног порекла.

Интересантна би била ова српска група J2a-L70 Јовањдан са простора БиХ. Да ли они могу бити у вези са овим резултатима. Њима чини се и фали нека озбиљнија повезница са матичним српским областима на истоку (Херцеговина, Стари Влах, Црна Гора), па лако могу бити старинци.

Свакако да су ови јовањштаци са Мањаче добри кандидати за везу. Има и неких муслиманских хаплотипова у Босни који су блиски. У Херцеговини међу Србима има род Кукурића, који такође није далеко.

Значи нека J2a-L70 је била присутна на простору Босне и Херцеговине у средњем вијеку.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Imoćanin Јануар 25, 2023, 01:32:20 поподне
Још један детаљ у вези ових налаза је занимљив. Крстача Петра Кушетића са задње стране има приказ љиљана. Подручје села гдје су анализирани ови гробови, у средњем вијеку било је у посједу Котроманића. Не знам да ли је још нека породица осим Котроманића у Босни користила љиљане на свом грбу. Можда тај приказ љиљана на гробу Кушетића и не носи неко хералдичко значење. Како год радило се о неком великашком роду присутном на том подручју с краја 14. и почетком 15. вијека.

Да је само остао сачуван натпис који слиједи послије "старином..." ствари би биле много јасније.

(https://i.postimg.cc/HW2JqVG9/kusetic-krstaca.png)

Možda stvarno tu postoji neka veza sa Kotromanićima.

Stanko Andrić, O obitelji bosanskog protukralja Radivoja Ostojića:

„Općenito su malobrojni izvori o Radivoju i njegovoj obitelji tijekom 1450-ih. Znamo tek da je Radivoj pri kraju toga desetljeća sudjelovao u bosanskim pregovorima s ugarsko-hrvatskim kraljem Matijom Korvinom i srpskom despotskom kućom, koji su na kraju 1458. doveli do sporazuma na ugarskom Saboru u Segedinu. Na temelju toga sporazuma Radivoj je u ožujku 1459. otpratio kraljeva sina, mladog Stjepana Tomaševića, u despotsku prijestolnicu Smederevo, gdje je ovaj proglašen novim srpskim despotom i vjenčan s Jelenom (Marom), kćeri pokojnoga despota Lazara Brankovića.

No već 20. lipnja 1459. sultan Mehmed II. prisilio je nove gospodare Smedereva da mu predaju utvrđeni grad, uklanjajući time zadnji ostatak Srpske Despotovine. Kralj Matija nato je oštro optužio Kotromaniće za izdaju, prihvaćajući glasinu da je Smederevo izručeno Turcima u zamjenu za novac. Bosanski kralj Tomaš uložio je mnogo truda u pobijanje tih glasina koje su se proširile po Europi, zabrinutoj za sve teže i beznadnije stanje na Balkanu. “Krivce” za pad Smedereva kralj Matija bez oklijevanja je kaznio oduzimanjem posjeda koje su oni držali u Ugarskoj.

Sačuvana je, između ostalog, povelja o jednoj takvoj Matijinoj odluci protiv Radivoja. Tiče se posjeda Pake u Požeškoj županiji. Taj posjed u sjevernom podnožju Dilj-gore imao je zanimljivu pretpovijest. Kralj Žigmund Luksemburgovac dao ga je 1425. Vuku Družiću od Gučje Gore i njegovim dvjema kćerima u zamjenu za  Družićeve utvrde u Usori i u županiji Sani, od kojih se poimence navodi samo utvrda Kozara (kod Prijedora) u Sanskoj županiji. Poslije je Paka na zasad nepoznat način došla u ruke obitelji Kastellanffy (Kaštelanović) iz Križevačke županije. Otud je Gašpar Kastellanffy, nekadašnji kaštelan u Srebreniku u Bosni i slavonski podban, mogao za 400 zlatnih florena založiti polovicu posjeda Pake “Radivoju Komotinskom, bratu Tomaša, kralja Bosne”. To je učinjeno pred požeškim kaptolom u veljači 1459. godine.“

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Христифор Јануар 25, 2023, 01:49:45 поподне
Гуча Гора код Травника где се налази истоимени самостан? Буни мало ово Гучија гора.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Јануар 25, 2023, 02:09:40 поподне
Свакако да су ови јовањштаци са Мањаче добри кандидати за везу. Има и неких муслиманских хаплотипова у Босни који су блиски. У Херцеговини међу Србима има род Кукурића, који такође није далеко.

Значи нека J2a-L70 је била присутна на простору Босне и Херцеговине у средњем вијеку


Да ли неко од ове господе има урађен неки дубљи тест и да ли жели да га уради?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 25, 2023, 03:02:24 поподне
Možda stvarno tu postoji neka veza sa Kotromanićima.

Stanko Andrić, O obitelji bosanskog protukralja Radivoja Ostojića:

„Općenito su malobrojni izvori o Radivoju i njegovoj obitelji tijekom 1450-ih. Znamo tek da je Radivoj pri kraju toga desetljeća sudjelovao u bosanskim pregovorima s ugarsko-hrvatskim kraljem Matijom Korvinom i srpskom despotskom kućom, koji su na kraju 1458. doveli do sporazuma na ugarskom Saboru u Segedinu. Na temelju toga sporazuma Radivoj je u ožujku 1459. otpratio kraljeva sina, mladog Stjepana Tomaševića, u despotsku prijestolnicu Smederevo, gdje je ovaj proglašen novim srpskim despotom i vjenčan s Jelenom (Marom), kćeri pokojnoga despota Lazara Brankovića.

No već 20. lipnja 1459. sultan Mehmed II. prisilio je nove gospodare Smedereva da mu predaju utvrđeni grad, uklanjajući time zadnji ostatak Srpske Despotovine. Kralj Matija nato je oštro optužio Kotromaniće za izdaju, prihvaćajući glasinu da je Smederevo izručeno Turcima u zamjenu za novac. Bosanski kralj Tomaš uložio je mnogo truda u pobijanje tih glasina koje su se proširile po Europi, zabrinutoj za sve teže i beznadnije stanje na Balkanu. “Krivce” za pad Smedereva kralj Matija bez oklijevanja je kaznio oduzimanjem posjeda koje su oni držali u Ugarskoj.

Sačuvana je, između ostalog, povelja o jednoj takvoj Matijinoj odluci protiv Radivoja. Tiče se posjeda Pake u Požeškoj županiji. Taj posjed u sjevernom podnožju Dilj-gore imao je zanimljivu pretpovijest. Kralj Žigmund Luksemburgovac dao ga je 1425. Vuku Družiću od Gučje Gore i njegovim dvjema kćerima u zamjenu za  Družićeve utvrde u Usori i u županiji Sani, od kojih se poimence navodi samo utvrda Kozara (kod Prijedora) u Sanskoj županiji. Poslije je Paka na zasad nepoznat način došla u ruke obitelji Kastellanffy (Kaštelanović) iz Križevačke županije. Otud je Gašpar Kastellanffy, nekadašnji kaštelan u Srebreniku u Bosni i slavonski podban, mogao za 400 zlatnih florena založiti polovicu posjeda Pake “Radivoju Komotinskom, bratu Tomaša, kralja Bosne”. To je učinjeno pred požeškim kaptolom u veljači 1459. godine.“

У сваком случају ови Дружићи су интересантни јер се и временски и географски уклапају са налазиштем. Можда су Кушетићи само огранак Дружића. Можда је оно "старином Л..." заправо "старином Д..." јер Л и Д су на ћирилици доста слични. Тј. можда је Петар Кушетић, старином Дружић. Јер ми ово Дружић не личи на патроним, већ прије на неко родовско име.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Imoćanin Јануар 25, 2023, 03:42:21 поподне
У сваком случају ови Дружићи су интересантни јер се и временски и географски уклапају са налазиштем. Можда су Кушетићи само огранак Дружића. Можда је оно "старином Л..." заправо "старином Д..." јер Л и Д су на ћирилици доста слични. Тј. можда је Петар Кушетић, старином Дружић. Јер ми ово Дружић не личи на патроним, већ прије на неко родовско име.

To sigurno je. Kao svjedok se u poveljama 1332, 1333 i 1345g. pojavljuje Stjepan Družić, a 1355g. njegov sin Stjepša Družić. O Vuku Družiću Petar Anđelić piše ovo: "Iz drugih izvora zna se za Miloša i njegova sina Vuka Družića, koji je 1415g. ratovao protiv Hrvoja Vukčića i Bosanaca, a na strani kralja Žigmunda."
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Јануар 25, 2023, 05:59:43 поподне
Замолио бих главне уреднике да наше Србе, племство Босне и кнеза Николу уврстите јавно у табелу Пројекта.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Јануар 25, 2023, 06:05:43 поподне
Још један детаљ у вези ових налаза је занимљив. Крстача Петра Кушетића са задње стране има приказ љиљана. Подручје села гдје су анализирани ови гробови, у средњем вијеку било је у посједу Котроманића. Не знам да ли је још нека породица осим Котроманића у Босни користила љиљане на свом грбу. Можда тај приказ љиљана на гробу Кушетића и не носи неко хералдичко значење. Како год радило се о неком великашком роду присутном на том подручју с краја 14. и почетком 15. вијека.

Да је само остао сачуван натпис који слиједи послије "старином..." ствари би биле много јасније.

(https://i.postimg.cc/HW2JqVG9/kusetic-krstaca.png)
Љиљани су били право популарни, тако да их на свако мало срећемо на грбовима по Босни итд...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: barbarylion Јануар 25, 2023, 06:15:05 поподне
Što se Ljiljana tiče on je bio prisutan na novcu još kod Milutina,Dragutina itd..
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Јануар 25, 2023, 07:14:21 поподне
Свакако да су ови јовањштаци са Мањаче добри кандидати за везу. Има и неких муслиманских хаплотипова у Босни који су блиски. У Херцеговини међу Србима има род Кукурића, који такође није далеко.

Значи нека J2a-L70 је била присутна на простору Босне и Херцеговине у средњем вијеку


Да ли неко од ове господе има урађен неки дубљи тест и да ли жели да га уради?
Роде (Ј2а), дубинске тестове још нису урадили, треба их анимирати.

Екипа јовањштака и витезови из централне Босне су највјероватније једно. Како је отекло 6 вијекова dys458 је мутирао напријед за 1 корак. Тај маркер и није спор у мутирању; што се тиче осталих маркера, то је то.
Небојша брате?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Неродимац Јануар 25, 2023, 07:16:46 поподне
Можда није љиљан у питању. У речнику Вука Караџића помиње реч КУШ а о њој дао следеће објашњење:

Ку̏ш , m. (у Хрв. око Перушића ) некаква трава, бијела или жута цвијета ,  Art Pflanze , herba quaedam.

Могуће је да је презиме добијено по овој трави или цвету коју је био поштован у породици. Нисам од оних који много улази у машти шта би било кад би било али сам читајући ову дискусију и проверавајући реч КУШ дошао до ове информације. Куш је иначе и турска реч али ако знамо да су ови гробови пре Турака ту могућност можемо избацити већ да користимо речи становништва пре Турака. Ова би одговарала а могуће је да су у средњовековној Босни имучнији људи имали заштитне биљке као симболе, ето имамо Љиљане који се везују за Котроманиће што КУШ не би био симбол КУШетића, може да буде, не мора да значи. Људи који се баве хералдриком би могли да ускоче у помоћ и покушају да дају одговор на ову констатацију. Извините акомреметим дискусију али сам некако морао да се умешам 😀
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ДушанВучко Јануар 25, 2023, 07:23:50 поподне
Куш је жалфија:
https://sh.m.wikipedia.org/wiki/Kadulja
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Јануар 25, 2023, 07:25:40 поподне
Роде (Ј2а), дубинске тестове још нису урадили, треба их анимирати.

Екипа јовањштака и витезови из централне Босне су највјероватније једно. Како је отекло 6 вијекова dys458 је мутирао напријед за 1 корак. Тај маркер и није спор у мутирању; што се тиче осталих маркера, то је то.
Небојша брате?

Рекао бих да може бити везе. Доста је прошло од тад, довољно за ту мутацију. Код наших припадника J2a-L70 је незгодно што су сви мање-више блиски хаплотиповима. Тако и ови хаплотипови из Средње Босне имају досла сличних чак и на југу Србије. Од екипе Јовањштака их највише дели тај маркер DYS458, али узевши у обзир географију, веза може бити логична.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Зрно Јануар 25, 2023, 07:45:38 поподне
Куш је жалфија:
https://sh.m.wikipedia.org/wiki/Kadulja

Кушета је неки надимак, физичка особина највероватније. У Мирловић Пољу у Далмацији има презиме Кушета настало не тако давно од Бузова (католици). А рекао бих да су и Срби Кужети из Далмације иста ствар.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ДушанВучко Јануар 25, 2023, 07:58:19 поподне
Кушета је неки надимак, физичка особина највероватније. У Мирловић Пољу у Далмацији има презиме Кушета настало не тако давно од Бузова (католици). А рекао бих да су и Срби Кужети из Далмације иста ствар.
Не знам дал може тај надимак да буде језички изведен од "куждрав" или "куштрав" у смислу физичке особине:
https://sr.m.wiktionary.org/sr-ec/ku%C5%BEdrav
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Imoćanin Јануар 25, 2023, 09:41:34 поподне
Kušet je u Dalmaciji taljanizam za “Butina”; “Kušeta” = čovjek sa debelim bedrima.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Јовица Кртинић Јануар 25, 2023, 09:45:36 поподне

Да ли неко од ове господе има урађен неки дубљи тест и да ли жели да га уради?

Пошто имам везе с овом краљевском лозом с Мањаче, неће бити проблем да их дубље тестирамо. Једино што нисам сигуран да ли су у могућности и да ли желе да плате дубље тестирање.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 25, 2023, 09:49:42 поподне
Ове двије породице јовањштака J2a са Мањаче, из Добрње, очигледно међусобно блиско повезане, по наводима из етнографске литературе сматрају се старинцима, не досељеним.

Добрња је расељено село на Мањачи, некадашње четничко упориште у Другом свјетском рату, на чијем је земљишту послије расељавања направљена касарна и војни полигони ЈНА.

За љубитеље римско/Ј2а-L70 веза, кроз Добрњу је у античком периоду пролазио важан римски пут (магистрала) Салона-Сервицијум.  :)

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Јануар 25, 2023, 10:34:49 поподне
Пошто имам везе с овом краљевском лозом с Мањаче, неће бити проблем да их дубље тестирамо. Једино што нисам сигуран да ли су у могућности и да ли желе да плате дубље тестирање.

Ако њима није битна потенцијална веза са овим у намању руку значајним родом из средњег века ту нема помоћи. Нека се угледају на Мариће из околине Мостара, ено их само пакују нове резултате на Yfull.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Јовица Кртинић Јануар 25, 2023, 10:43:14 поподне
Ако њима није битна потенцијална веза са овим у намању руку значајним родом из средњег века ту нема помоћи. Нека се угледају на Мариће из околине Мостара, ено их само пакују нове резултате на Yfull.
Кандидат с Мањаче је тестиран на моју иницијативу и нема превише интересовања за ову област. Његов отац, један од најплеметнијих људи које сам знао, већ скоро 10 година није међу живима. Да је ту, сигуран сам да не би часио часа да учини лепу ствар за овај занимљив род.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Јануар 25, 2023, 10:45:48 поподне
Ове двије породице јовањштака J2a са Мањаче, из Добрње, очигледно међусобно блиско повезане, по наводима из етнографске литературе сматрају се старинцима, не досељеним.

Добрња је расељено село на Мањачи, некадашње четничко упориште у Другом свјетском рату, на чијем је земљишту послије расељавања направљена касарна и војни полигони ЈНА.

За љубитеље римско/Ј2а-L70 веза, кроз Добрњу је у античком периоду пролазио важан римски пут (магистрала) Салона-Сервицијум.  :)

Пут Horreum Margi и утврда Iovis Pagus су ми овог момента на 100м од места где седим па се не хвалим  ;D Без шале, нека скупе некако тих 200 евра и нека реше то. У супротном ово ће  заувек остати недоречено и материјал за разне спекулације.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НикПав Јануар 25, 2023, 10:58:25 поподне
Пошто имам везе с овом краљевском лозом с Мањаче, неће бити проблем да их дубље тестирамо. Једино што нисам сигуран да ли су у могућности и да ли желе да плате дубље тестирање.

Увек може да се организује прикупљање средстава, уколико тај резултат има неку важност за нашу историју.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Јовица Кртинић Јануар 26, 2023, 08:40:09 пре подне
Увек може да се организује прикупљање средстава, уколико тај резултат има неку важност за нашу историју.
Слажем се. Што се мене тиче данас уплаћујем 10 одсто (2.400 динара) за набавку Данте Лабс за ово тестирање. Толико сам тренутно у могућности. (надам се да је попуст у Данте Лабс још на снази)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Јануар 26, 2023, 02:47:41 поподне
Занимљиво је и да је прошли налаз босанског племства исто имао најближе поклапање са Србима из Босне, мислим с Озрена.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НикПав Јануар 26, 2023, 05:45:18 поподне
Слажем се. Што се мене тиче данас уплаћујем 10 одсто (2.400 динара) за набавку Данте Лабс за ово тестирање. Толико сам тренутно у могућности. (надам се да је попуст у Данте Лабс још на снази)

Ја ћу следеће недеље убацити у касицу прасицу.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Јануар 26, 2023, 05:52:46 поподне
Онда треба направити  "Ванредни Y-NGS тест" фонд, одредити човјека са задужењем.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: barbarylion Јануар 26, 2023, 06:08:51 поподне
Занимљиво је и да је прошли налаз босанског племства исто имао најближе поклапање са Србима из Босне, мислим с Озрена.

Koliko mi je poznato do sada svi nalazi bosanskoga plemstva, čak i Kotromanića imaju veze sa Srbima.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Јовица Кртинић Јануар 26, 2023, 06:28:01 поподне
Ја ћу следеће недеље убацити у касицу прасицу.
Свака част! Поручили смо прибор из Данте Лабс, сад је само остало да прикупимо новац, а сигуран сам да то неће бити проблем. Колико следеће недеље већ ћемо моћи да узмемо узорак и шаљемо га Италију.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Драган Обреновић Јануар 26, 2023, 06:52:05 поподне
Свака част! Поручили смо прибор из Данте Лабс, сад је само остало да прикупимо новац, а сигуран сам да то неће бити проблем. Колико следеће недеље већ ћемо моћи да узмемо узорак и шаљемо га Италију.

Ево учествујем и ја са 20 EUR.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Grbić Јануар 26, 2023, 07:03:23 поподне
Свака част! Поручили смо прибор из Данте Лабс, сад је само остало да прикупимо новац, а сигуран сам да то неће бити проблем. Колико следеће недеље већ ћемо моћи да узмемо узорак и шаљемо га Италију.
Takodje 20€!
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Јануар 26, 2023, 07:15:48 поподне
Уплаћено за браћу 6000. Чекам их на Yfull са нестрпљењем.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Јовица Кртинић Јануар 26, 2023, 07:45:25 поподне
Уплаћено за браћу 6000. Чекам их на Yfull са нестрпљењем.
Хвала, Ивице! Тренутно на рачуну имамо 8.400 динара за овај подухват. Позивам и остале заинтересоване да се придруже макар и најскромнијим прилогом. Уплате примамо на рачун Друштва српских родословаца "Порекло".
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Драган Обреновић Јануар 26, 2023, 08:12:13 поподне
Уплаћено 2400 динара на рачун Друштва.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Uzi Јануар 26, 2023, 08:47:28 поподне
Послао 20 евра за краљевску лозу са Мањаче.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НикПав Јануар 26, 2023, 11:03:09 поподне
Послао $50. Заборавио да назначим да је за овај подухват, али јесте.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Јовица Кртинић Јануар 27, 2023, 10:44:43 пре подне
Хвала свима на уплатама!

Тренутно стање (ПејПал узима неке проценте, па наводим колико је легло на наш налог):
10.800 динара (у еврима 91,90)
61,80 евра

Све скупа тренутно: 153,70 евра

Још мало па покривамо цео износ теста за Данте Лабс (199 евра), а онда остаје да прикупимо и 49 долара за убацивање резултата на Y-Full.

Дакле, још нам је потребно 94,30 евра.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Јануар 27, 2023, 10:56:20 пре подне
Ја ћу покрити убацивање на Yfull.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НикПав Јануар 28, 2023, 03:59:27 пре подне
Ја ћу онда додати то што фали за Данте у уторак.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Јовица Кртинић Јануар 28, 2023, 09:38:19 пре подне
Ја ћу онда додати то што фали за Данте у уторак.
Хвала, НикПав!
У међувремену је стигао још један прилог од 2.400 динара, тако да нам за пуно покривање тестирања у Данте Лабс недостаје још 29 евра. Ситнооо :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Јовица Кртинић Јануар 29, 2023, 11:25:31 поподне
Само да обавестим, у међувремену је уплаћен и остатак новца - 6.000 динара за Y-Full и 29 евра.
Хвала свима још једном! Наредне недеље узимам узорак од кандидата с Мањаче па шаљемо за Италију.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НикПав Јануар 29, 2023, 11:41:50 поподне
Браво дечице!
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Јовица Кртинић Јануар 29, 2023, 11:42:57 поподне
Браво дечице!
Хвала теби, НикПав. Прави си мецена Порекла :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Јовица Кртинић Фебруар 02, 2023, 08:50:30 пре подне
Само да обавестим, у међувремену је уплаћен и остатак новца - 6.000 динара за Y-Full и 29 евра.
Хвала свима још једном! Наредне недеље узимам узорак од кандидата с Мањаче па шаљемо за Италију.
Узет узорак, а сад предстоји тежи део подухвата - наћи начина да узорак стигне до Италије...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Фебруар 02, 2023, 04:13:48 поподне
Ancient DNA reveals admixture history and
endogamy in the prehistoric Aegean

Изашао рад, анализирано 102 скелета. Преовлађују Ј2а мушкараци  8)

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Фебруар 02, 2023, 04:28:26 поподне
Ancient DNA reveals admixture history and
endogamy in the prehistoric Aegean

Изашао рад, анализирано 102 скелета. Преовлађују Ј2а мушкараци  8)

Ancient DNA reveals admixture history and endogamy in the prehistoric Aegean
https://www.nature.com/articles/s41559-022-01952-3#Sec20

Колико видим, Микењани J2b-M241.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Фебруар 02, 2023, 04:32:47 поподне
Ух овакав сам рад чекао, коначно и Медитеран да се почне радити како требује.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Фебруар 02, 2023, 06:01:52 поподне
Ancient DNA reveals admixture history and endogamy in the prehistoric Aegean
https://www.nature.com/articles/s41559-022-01952-3#Sec20

Колико видим, Микењани J2b-M241.

Има један узорак који је E1b, у табели је наведена шифра XAN014. Прегледао сам тај узорак, међутим није E1b. Послије видим да је изгледа ту дошло до неког мијешања шифара.

Тај узорак која год да је шифра требао би бити https://www.yfull.com/tree/E-BY6578/

Са Антхрогенике "XAN014- Chania LBA E-BY6578, in the tree mistakenly (?) labeled as XAN016"
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ak Фебруар 02, 2023, 06:12:35 поподне
ima li neko da uradi "TLDR"...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ak Фебруар 02, 2023, 06:18:07 поподне

https://www.yfull.com/ancient/

https://www.yfull.com/samples-from-paper/707/

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Март 07, 2023, 09:29:43 поподне
Јуче је објављен препринт рада под називом Medieval social landscape through the genetic history of Cambridgeshire before and after the Black Death

Колико видим садржи неких нових 275 геномских узорака из касносредњовјековне Енглеске.

Вјероватно ништа интересантно за нас, али никад се не зна, присутан је шири дијапазон хаплогрупа.

Ово су линкови.

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.03.03.531048v1
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.03.03.531048v1.full.pdf
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2023/03/06/2023.03.03.531048/DC1/embed/media-1.pdf?download=true
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2023/03/06/2023.03.03.531048/DC2/embed/media-2.xlsx?download=true
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Март 08, 2023, 09:09:37 пре подне
Јуче је објављен препринт рада под називом Medieval social landscape through the genetic history of Cambridgeshire before and after the Black Death

Колико видим садржи неких нових 275 геномских узорака из касносредњовјековне Енглеске.

Вјероватно ништа интересантно за нас, али никад се не зна, присутан је шири дијапазон хаплогрупа.

Ово су линкови.

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.03.03.531048v1
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.03.03.531048v1.full.pdf
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2023/03/06/2023.03.03.531048/DC1/embed/media-1.pdf?download=true
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2023/03/06/2023.03.03.531048/DC2/embed/media-2.xlsx?download=true

Узорци 919 и 936 са некрополе Чери Хинтон би можда могли да буду интересантни, припадају L1b-B374 хаплогрупи (M11489 на Yfull) где се налази и један Словенац из Постојне:

https://www.yfull.com/tree/L-M11489/

Можда овој грани припада и наш L1b род Доброгорана. Сазнаћемо то у току ове године.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Март 14, 2023, 02:03:26 поподне
Нова два рада о древним ловцима-сакупљачима:

 https://www.nature.com/articles/s41586-023-05726-0 (https://www.nature.com/articles/s41586-023-05726-0)

Преко 100 нових резултата. Почеле су хаплогрупе да пристижу и на YFull:

 https://www.yfull.com/samples-from-paper/710/ (https://www.yfull.com/samples-from-paper/710/)

Чини ми се да нема већих изненађења. Међутим изгледа је сељакање различитих група ловаца-сакупљача у палеолиту и мезолиту коначно добило обрисе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Март 14, 2023, 05:29:14 поподне
Нова два рада о древним ловцима-сакупљачима:

 https://www.nature.com/articles/s41586-023-05726-0 (https://www.nature.com/articles/s41586-023-05726-0)

Преко 100 нових резултата. Почеле су хаплогрупе да пристижу и на YFull:

 https://www.yfull.com/samples-from-paper/710/ (https://www.yfull.com/samples-from-paper/710/)

Чини ми се да нема већих изненађења. Међутим изгледа је сељакање различитих група ловаца-сакупљача у палеолиту и мезолиту коначно добило обрисе.

Хаплогрупа I2 доминантна на Догерлeнду. При том прилично разноврсна. Присутне све три главне гране I2-M223, I2-M423 и I2-L596.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Март 14, 2023, 06:00:13 поподне
Чини ми се да је узорак OKL002 из предграђа Бона (Oberkassel) досад најстарија нађена I2-M423. Старост узорка је процијењена на период око 11.000 г. пне.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милан Петровић Март 14, 2023, 07:38:24 поподне
Чини ми се да је узорак OKL002 из предграђа Бона (Oberkassel) досад најстарија нађена I2-M423. Старост узорка је процијењена на период око 11.000 г. пне.
  Ово је онда добар знак да су наши преци из Оберкасел кластера?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Март 14, 2023, 09:15:15 поподне
  Ово је онда добар знак да су наши преци из Оберкасел кластера?

Далека је то прошлост, а и I2-M423 је доста узводно. Ипак, евидентно је да је у палеолиту и мезолиту ова грана углавном присутна на сјеверу и западу Европе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Март 14, 2023, 11:16:32 поподне
Чини ми се да је узорак OKL002 из предграђа Бона (Oberkassel) досад најстарија нађена I2-M423. Старост узорка је процијењена на период око 11.000 г. пне.

Мислим да је оборен још један рекорд што се тиче хаплогрупе I. Узорак DLV005 из Чешке је стар 31.000 година. Имали смо до сада најстарији узорак исто из Чешке али је био ипак мало млађи, око 30.250 година.
 
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Март 15, 2023, 04:31:26 пре подне
Хаплогрупе.
Цитат
The genetic distinction between the Oberkassel and Sidelkino clusters is also clearly noticeable in the diversity of uniparentally inherited markers, as the Oberkassel cluster is dominated by mtDNA haplogroup U5 and Y-chromosome haplogroup I, whereas individuals from the Sidelkino cluster show a higher frequency of mtDNA haplogroups U2, U4 and R1b, and carry uniquely Y-chromosome haplogroups Q, R and J (Extended Data Figs. 1 and 2).
https://www.nature.com/articles/s41586-023-05726-0/figures/6
(https://media.springernature.com/full/springer-static/esm/art%3A10.1038%2Fs41586-023-05726-0/MediaObjects/41586_2023_5726_Fig6_ESM.jpg)
https://www.nature.com/articles/s41586-023-05726-0/figures/7
(https://media.springernature.com/full/springer-static/esm/art%3A10.1038%2Fs41586-023-05726-0/MediaObjects/41586_2023_5726_Fig7_ESM.jpg)

О фенотипу.
(https://media.springernature.com/full/springer-static/image/art%3A10.1038%2Fs41586-023-05726-0/MediaObjects/41586_2023_5726_Fig5_HTML.png)
Цитат
a, The genetic ancestry of hunter-gatherers dated between 14 ka and 5.2 ka modelled using qpAdm, with Oberkassel, Yuzhniy Oleniy Ostrov, Goyet Q-2 and Neolithic farmers from present-day Turkey (Barcın, Menteşe and Boncuklu sites) representing Oberkassel (WHG) (blue), Sidelkino (EHG) (red), GoyetQ2 (orange) and Anatolian Neolithic farmer (green) ancestries, respectively. The average calibrated date is shown, with pie charts indicating the estimated proportion of ancestry for each group or individual. Details of the modelling are provided in Supplementary Data 3.E,F. The expansion of farming by 9, 8, 7.5 and 7 ka is shown as green shades. Adapted from https://doi.org/10.5281/zenodo.5903165 (CC BY 4.0). b, Allele frequencies of different hunter-gatherer groups (coloured dots) on four SNPs related to skin colour (SLC24A5 and SLC45A2), eye colour (HERC2/OCA2) and lactase persistence (LCT). Dots are maximum likelihood estimates and error bars show 95% confidence intervals of the derived allele frequencies (n, the number of individuals in each group, is provided in Supplementary Data 3.G). Dashed lines show the frequencies estimated for the indicated present-day 1000 Genomes Project populations (CEU, Utah residents of northern and western European ancestry; GBR, British; IBS, Spanish; TSI, Tuscan )37.

Phenotypically relevant variants
Leveraging the substantially increased sample size, we investigated genetically distinct hunter-gatherer groups for allele frequencies at selected loci that are known to be associated with specific phenotypic traits in present-day Europeans (Fig. 5b and Supplementary Figs. 27 and 28). Consistent with previous findings, none of the analysed groups show the derived allele at SNP rs4988235 on the LCT gene, which is responsible for lactase persistence. As previously hinted37, we find a large frequency variation in alleles related to skin and eye pigmentation among post-LGM hunter-gatherer groups. For the SNP associated with light eye colour (HERC2/OCA2 (rs12913832)), individuals from the Villabruna cluster, Oberkassel cluster, Baltic HG and SHG groups show high frequencies of the derived allele (>90%), which is responsible for the green or blue eye phenotype, whereas Sidelkino cluster, Ukraine HG and Iron Gates HG groups show low occurrence of this allele (10–25%). Instead, for the two SNPs associated with skin colour (SLC24A5 (rs1426654) and SLC45A2 (rs16891982)), Sidelkino cluster and Ukraine HG groups show a higher frequency (>90% for SLC24A5 and 29–61% for SLC45A2) of the derived alleles related to light skin colour, compared with Oberkassel and Villabruna clusters, where those alleles are almost completely absent (<1%). On the basis of the genetic variation of present-day Europeans, this could imply phenotypic differences between post-14 ka hunter-gatherer populations across Europe, with individuals in the Oberkassel cluster possibly exhibiting darker skin and lighter eyes, and individuals in the Sidelkino cluster possibly lighter skin and darker eye colour.

Мешање истока и запада.
https://www.nature.com/articles/s41586-023-05726-0/figures/13
(https://media.springernature.com/full/springer-static/esm/art%3A10.1038%2Fs41586-023-05726-0/MediaObjects/41586_2023_5726_Fig13_ESM.jpg)
Цитат
The bivariate plots show the expansion of Oberkassel and Sidelkino ancestries through time in two European areas (longitude below and above 30 degrees). The x-axis shows the average age of each tested individual/group and the y-axis shows the proportion of Sidelkino ancestry, relative to the total hunter-gatherer ancestry (Oberkassel + Sidelkino) in each group. The three squares highlight Baltic HG groups associated with the Comb Ceramic Culture (CCC) that show a marked increase in Sidelkino-related ancestry compared to older Baltic HG groups.
Цитат
Fifth, the Oberkassel ancestry in western and central Europe and the Sidelkino ancestry in eastern Europe remained largely isolated for almost 6,000 years until genetic interactions were first observed—around 8 ka in northeastern Germany, possibly associated with cultural exchanges along the Baltics49 and around 7.5 ka in the upper Volga region, possibly linked to the spread of pottery in the region50.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Март 15, 2023, 04:39:51 пре подне
Аутосомална генетика у поређењу са данашњим популацијама.
https://www.nature.com/articles/s41586-023-05726-0/figures/11
(https://media.springernature.com/full/springer-static/esm/art%3A10.1038%2Fs41586-023-05726-0/MediaObjects/41586_2023_5726_Fig11_ESM.jpg)

Балкански рефугијум?
Цитат
In conclusion, our study reveals that western and southwestern Europe served as climatic refugia for the persistence of human groups during the coldest phase of the last Ice Age whereas populations in the Italian peninsula and the eastern European plain were genetically overturned, challenging the role of these regions as glacial refugia for humans. The incoming Villabruna ancestry later became the most widespread hunter-gatherer ancestry across Europe. Further palaeogenomic studies on Upper Palaeolithic individuals from the Balkans will be essential for understanding whether southeastern Europe represents the source of the Villabruna ancestry and a climatic refugium for human populations during the LGM.
https://www.nature.com/articles/s41586-023-05726-0/figures/14
(https://media.springernature.com/full/springer-static/esm/art%3A10.1038%2Fs41586-023-05726-0/MediaObjects/41586_2023_5726_Fig14_ESM.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Март 15, 2023, 01:16:35 поподне
Далека је то прошлост, а и I2-M423 је доста узводно. Ипак, евидентно је да је у палеолиту и мезолиту ова грана углавном присутна на сјеверу и западу Европе.

Постоје и L621 узорци из неолита и бакреног доба из Португала, Француске и острва Guernsey између Француске и Британије.
https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-CTS7213/tree

Налазе се на нивоу I-CTS7213 (на yfull-у еквивалент с L621) , а неки су у засебној грани I-FT376000, видјети на дну странице.

Миграција L621 на исток Европе се могла десити (једна од опција) истовремено с раздвајањем грана I-BY37319/I-Y45825 (пронађена код Чеха, Нијемца и Енглеза) и I-CTS10936 (пронађена код узорка из Румуније, датираног око 4000 п.н.е.), дакле око 4500 п.н.е. (бакрено доба).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Март 15, 2023, 02:55:56 поподне
Постоје и L621 узорци из неолита и бакреног доба из Португала, Француске и острва Guernsey између Француске и Британије.
https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-CTS7213/tree

Налазе се на нивоу I-CTS7213 (на yfull-у еквивалент с L621) , а неки су у засебној грани I-FT376000, видјети на дну странице.

Миграција L621 на исток Европе се могла десити (једна од опција) истовремено с раздвајањем грана I-BY37319/I-Y45825 (пронађена код Чеха, Нијемца и Енглеза) и I-CTS10936 (пронађена код узорка из Румуније, датираног око 4000 п.н.е.), дакле око 4500 п.н.е. (бакрено доба).

Не треба губити из вида ни чињеницу да је грана I2-L621 данас разноврснија на сјеверозападу Европе, као и постојање гране I-Y81696, локализоване на подручју Њемачке и Француске, која представља најближег филогенетичког "рођака" I-Y3120, са старошћу везе око 3400 година тј. 1400 г. пне.

Без обзира на нека гранања старе L621  на подручју Карпата, мислим да су и даље све опције на столу, па и она да се  I-CTS10228 помјерила ка истоку крајем гвозденог доба са подручја Њемачке.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Март 15, 2023, 06:17:45 поподне
Балкански рефугијум?https://www.nature.com/articles/s41586-023-05726-0/figures/14
(https://media.springernature.com/full/springer-static/esm/art%3A10.1038%2Fs41586-023-05726-0/MediaObjects/41586_2023_5726_Fig14_ESM.jpg)
Раније сам мислио да је хаплогрупа I била прилично широко распрострањена по Европи и пре LGMа па је можда и једина преживела уско грло целокупне људске популације у Европи за време LGMа управо захваљујући својој разгранатости. Међутим, резултати из овог рада изгледа да упућују на нешто другачији сценарио а то је да је хаплогрупа C1a-V20 била широко распрострањена у Европи пре LGMа док се хаплогрупа I јављала само спорадично, тако да је вероватније да је једино хаплогрупа C1a-V20 преживела LGM у Европи и то у франко-кантабријском рефугијуму. Хаплогрупа I је дошла након LGMа прво са Балкана на Апенинско полуострво па онда полако и на Пиринејско да би пре 14.000 година нагло овладало целом Европом и потпуно потиснула хаплогрупу C1a-V20.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Март 18, 2023, 10:35:54 пре подне
Следи наставак лудила везано за J-Z40772.

Sample name
新疆 C793 HRR579189 铁器时代
AU number
AU40421
Sample Type
Ancient
Reference assembly
CP086569.2 / T2T CHM13 v2.0
Y-haplogroup
J-FGC51673
MT-haplogroup
D4j5
Gender
Male
Quality T2T
Coverage: 69.25% Average Depth: 4
Scientific institution

Country
中国 ( China )
Native place
新疆 ( Xinjiang )


Source of the sample : https://www.science.org/doi/10.1126/science.abk1534

 :o
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Март 18, 2023, 11:30:00 пре подне
Изгледа да им се провукла грешка, нашао сам тај узорак на јфулл у тотално другој грани Ј2.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Март 18, 2023, 11:34:05 пре подне
Узорак C793 не припада L70, већ је безбедно ушушкан овде:

https://www.yfull.com/tree/J-Y152335/ (https://www.yfull.com/tree/J-Y152335/)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Март 18, 2023, 11:46:31 пре подне
Да, грешка. претрагом HRR579189 је изашао у J-Y164969 грани. Какав шук  :) Американци из те гране усијали телефоне али јадац  ;D
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Март 21, 2023, 04:01:17 пре подне

R6701; 236-332 AD; Svilos_Krusevlje, Serbia; R1b1a-Z2118>Z2116>S1161>CTS6718>FGC48821>FGC12521>FGC24139>BY157588 (https://www.yfull.com/tree/R-BY157588/)

На не баш поузданом TheYtree стаблу R6701 је овде https://www.theytree.com/tree/R-FT189235 .
https://www.theytree.com/sample/68cd7735ef277ba1e46dff25fb80a0f1.html
https://www.yfull.com/tree/R-Y189664/
https://discover.familytreedna.com/y-dna/R-FT186340/tree
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Март 21, 2023, 03:41:32 поподне
На не баш поузданом TheYtree стаблу R6701 је овде https://www.theytree.com/tree/R-FT189235 .
https://www.theytree.com/sample/68cd7735ef277ba1e46dff25fb80a0f1.html
https://www.yfull.com/tree/R-Y189664/
https://discover.familytreedna.com/y-dna/R-FT186340/tree

Баш зато што је не баш поуздано (а ја бих рекао баш непоуздано) не би требало ни делити њихове (theYtree) "анализе", јер само могу уносити забуну. Али добро је да си поменуо овај узорак, јер је са целим тим радом испала велика збрка, односно аутори су помешали називе за велики број БАМ фајлова, па су их касније поново објавили под новом PRJEB шифром, наводно су ту требале бити исправљене све грешке. Ја сам највећи део БАМ-ова прегледао чим су их први пут објавили, тако да ту има доста резултата који нису тачни, не у смислу да очитавања са БАМ-ова нису тачна, већ у смислу да су називи узорака били измешани, па у одређеном броју случајева добијене хаплогрупе не одговарају узорцима којима би требали, већ некима под сасвим другим називом. Такав је случај и са наведеним R6701, који није R1b1a-Z2118..., већ припада грани:

R1b-U152>L2>Z49>S15208>L202>BY3614>Y231917>BY3618>S18998>S26226>FTD9497

https://discover.familytreedna.com/y-dna/R-S18998/tree (https://discover.familytreedna.com/y-dna/R-S18998/tree)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Март 27, 2023, 08:45:58 поподне
https://biomuse.eu/project/?lang=en

Изаћи ће нови рад о Грчкој са узорцима из античке Македоније и других периода.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Март 27, 2023, 09:32:21 поподне
https://biomuse.eu/project/?lang=en

Изаћи ће нови рад о Грчкој са узорцима из античке Македоније и других периода.

Надам се да ће бити нешто од овога, мада питање колико ће им фокус бити на Y-DNA. Видим да се спомиње реконструкција фенотипа и сличне ствари. Ако ништа, бар ће утврдити да су и стари Грци изгледали као ови данашњи. Мало је ту било Ахила плавушана. ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Март 27, 2023, 10:11:36 поподне
https://anthrogenica.com/showthread.php?26105-Preview-Upcoming-Ancient-Greek-Transect-(Mesolithic-to-Medieval)-from-Biomuse&highlight=biomuse

резултати су већ ту. неки и јесу свјетлије пигментације, али што је индикативније стеспке генетике је мало, као и у досадашњим древним грчким резултатима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Март 27, 2023, 10:27:56 поподне
нема још Y-DNK додуше. само фацијалне реконструкције и аутосомални PCA.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Gorance Март 28, 2023, 01:15:34 поподне
Могли су бар ове тете мало лепше да прикажу ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Март 28, 2023, 01:49:07 поподне
Надам се да ће бити нешто од овога, мада питање колико ће им фокус бити на Y-DNA. Видим да се спомиње реконструкција фенотипа и сличне ствари. Ако ништа, бар ће утврдити да су и стари Грци изгледали као ови данашњи. Мало је ту било Ахила плавушана. ;)

Ko zna može biti i plavušana. Šta je sve silazilo sa R1b ekipom, šta sam sve pročitao i video za ove dve godine više apsolutno ništa ne može da me iznenadi. Posle onog I1 mongoloidnog Huna, one dvojice u I-Y283553 i Cincara sa haplogrupom C-V20 može da me iznenadi samo sletanje Marsovaca.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Exiled Март 28, 2023, 01:53:55 поподне
Ko zna može biti i plavušana. Šta je sve silazilo sa R1b ekipom, šta sam sve pročitao i video za ove dve godine više apsolutno ništa ne može da me iznenadi. Posle onog I1 mongoloidnog Huna, one dvojice u I-Y283553 i Cincara sa haplogrupom C-V20 može da me iznenadi samo sletanje Marsovaca.
Гледај док буде да су Марсовци I2a😃
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Март 28, 2023, 02:04:35 поподне
Vi uzmite marsovce mi ćemo filipa makedonskog  ;D
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Exiled Март 28, 2023, 02:05:21 поподне
Vi uzmite marsovce mi ćemo filipa makedonskog  ;D
Договорено
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Март 31, 2023, 01:10:16 поподне
Не могу да поново нађем линк али најављује се рад који ће изаћи ове године, а у коме ће се обрадити узорци из Белорусије из периода од 5000 до око 1500 године пре нове ере. Па држите фиге, можда буде неки усамљени Y3120 или CTS10228.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 10, 2023, 08:23:04 поподне
Нових 38 археогенетичких резултата из Паноније (језеро Балатон) из 5-6. вијека

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.09.26.509582v2

Fine-scale sampling uncovers the complexity of migrations in 5th-6th century Pannonia
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Милан Петровић Април 10, 2023, 08:43:18 поподне
Нових 38 археогенетичких резултата из Паноније (језеро Балатон) из 5-6. вијека

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.09.26.509582v2

Fine-scale sampling uncovers the complexity of migrations in 5th-6th century Pannonia
Има ли наших?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 10, 2023, 08:54:24 поподне
Има ли наших?

 ;D Бићу политички некоректан па ћу ти одговорити директно. Нема.

Ово су гробови из периода неких сто двјесто година прије него што су "наши" дошли. Оно што је занимљиво је да је изгледа присутан један из гране I2-M423>L161 https://www.yfull.com/tree/I-Y13339/

Постоје такође тројица E-V13, од којих је један E-V13>L241>A7065.

Остали су I1, J2a, G2a, J2b-M241, R1b.

Ово све закључујем на основу ISOGG ознака, свакако треба прегледати и сирове резултате.

Тестирани су из хунског периода, али има ту доста панонских римских старосједилаца и вјероватно нешто и досељених азијата и Германа. Ово колико сам успио на брзину прочитати.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Април 10, 2023, 08:56:17 поподне
Нових 38 археогенетичких резултата из Паноније (језеро Балатон) из 5-6. вијека

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.09.26.509582v2

Fine-scale sampling uncovers the complexity of migrations in 5th-6th century Pannonia

Доминирају R1b-P312 и G2a уз мањи број J2b2 и E-V13, као и код узорака из келтског периода с овог истог подручја.

Ту су и J2a и I1, можда везани уз Римљане и Германе, и један I2a1a2a2a1 (мислим да ово није динарска грана)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 10, 2023, 09:23:10 поподне
Ова G2a у налазишту Balatonszemes - Szemesi berek требала би припадати грани G-L497>BY28079. Ова грана још ни у коријену није издвојена на YFull стаблу, али јесте на FTDNA и најближе филогенетичке везе су са скандинавским простором (Норвешка), тако да би и она могла бити сјеверњачка, а не домицилна.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Април 10, 2023, 11:04:42 поподне
;D Бићу политички некоректан па ћу ти одговорити директно. Нема.

Ово су гробови из периода неких сто двјесто година прије него што су "наши" дошли. Оно што је занимљиво је да је изгледа присутан један из гране I2-M423>L161 https://www.yfull.com/tree/I-Y13339/

Постоје такође тројица E-V13, од којих је један E-V13>L241>A7065.

Доминирају R1b-P312 и G2a уз мањи број J2b2 и E-V13, као и код узорака из келтског периода с овог истог подручја.

Ту су и J2a и I1, можда везани уз Римљане и Германе, и један I2a1a2a2a1 (мислим да ово није динарска грана)

 Мислим да сма видио све ове узорке у другом папиру.
 Хаплогрупе узорака који су аутосомално врло блиски ранијем узорку Szolad19 који је опет врло близак Трачанима жељезног доба , а радикално различити од осталих:

I-Y13339
E-V13
E-V13
E-A7065

 Дакле E-V13 узорци су очито у то доба недавни мигранти из Тракије као и I-Y13339 и нису аутохтони (за разлику од J2b2 узорака). А као што и проистиче из овог резултата, ради се о трачкој грани обзиром на модерне Помаке у њој, а и грани са сличним миграторним правцима као и E-V13 судећи по древној ДНК и археологији.

 Дакле овај мали узорак је може се рећи и на извјестан начин и један трачки узорак.

 Још један показатељ да скоро никакав модерни E-V13 на западном Балкану није ту аутохтон.. Они који и нису везани за средњевјековне и позније миграције са истока опет су најприје везани за неке позноантичке миграције са истока Балкана мало прије Словена.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Април 15, 2023, 10:17:26 пре подне
Дакле E-V13 узорци су очито у то доба недавни мигранти из Тракије као и I-Y13339 и нису аутохтони (за разлику од J2b2 узорака). А као што и проистиче из овог резултата, ради се о трачкој грани обзиром на модерне Помаке у њој, а и грани са сличним миграторним правцима као и E-V13 судећи по древној ДНК и археологији.

Што се тиче хаплогрупе I-Y13339 она би исто могла бити локалног панонског, а не трачког порекла. Чак три узорка су пронађена у Мокрину са налазишта из Бронзаног доба, а припадају очинској грани ове хаплогрупе. https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-Y13335/tree (https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-Y13335/tree)

Ни данашња дистрибуција не иде у прилог томе да је грана ексклузивно трачког порекла, већ евентуално један њен млађи огранак.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Април 15, 2023, 02:00:25 поподне
Што се тиче хаплогрупе I-Y13339 она би исто могла бити локалног панонског, а не трачког порекла. Чак три узорка су пронађена у Мокрину са налазишта из Бронзаног доба, а припадају очинској грани ове хаплогрупе. https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-Y13335/tree (https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-Y13335/tree)

Ни данашња дистрибуција не иде у прилог томе да је грана ексклузивно трачког порекла, већ евентуално један њен млађи огранак.

 И рекао сам да је панонска, само што је за разумјевање моје реченице потребно познавање археологије.. Локално источно-панонско = прото-трачко поријекло.

А као што и проистиче из овог резултата, ради се о трачкој грани обзиром на модерне Помаке у њој, а и грани са сличним миграторним правцима као и E-V13 судећи по древној ДНК и археологији.

 I-Y13331 се на исток Балкана могла довући само из Паноније и само већ давно утврђеним археолошким рутама. Овај узорак обзиром на аутосомалну днк као и на то што тај аутосомални профил дијели са E-V13 узорцима са истог налазишта не може бити потомак локалаца.

 До тог доба а вјероватно и до позног жељезног доба, на подручју Паноније су сукцесивним миграторним валовима највјероватније потпуно збрисани било какви носиоци I-Y13331 који потичу од старосједилачког елемента БД. Тако да су шансе добре да су сви познији I-Y13331 потомци раножељезнодобних миграната на (будућа) трачка подручја.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Април 16, 2023, 12:33:55 поподне
И рекао сам да је панонска, само што је за разумјевање моје реченице потребно познавање археологије.. Локално источно-панонско = прото-трачко поријекло.

 I-Y13331 се на исток Балкана могла довући само из Паноније и само већ давно утврђеним археолошким рутама. Овај узорак обзиром на аутосомалну днк као и на то што тај аутосомални профил дијели са E-V13 узорцима са истог налазишта не може бити потомак локалаца.

 До тог доба а вјероватно и до позног жељезног доба, на подручју Паноније су сукцесивним миграторним валовима највјероватније потпуно збрисани било какви носиоци I-Y13331 који потичу од старосједилачког елемента БД. Тако да су шансе добре да су сви познији I-Y13331 потомци раножељезнодобних миграната на (будућа) трачка подручја.

Сад сам разумео. Радило би се у овом случају о повратној миграцији. Занимљиво би било видети да ли је могуће сместити негде дубље на стабло овај узорак, то јест д ли припада некој од познатих подграна ове хаплогрупе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Zor Април 18, 2023, 09:50:33 поподне
Сад сам разумео. Радило би се у овом случају о повратној миграцији. Занимљиво би било видети да ли је могуће сместити негде дубље на стабло овај узорак, то јест д ли припада некој од познатих подграна ове хаплогрупе.

 Да, ови Помаци одмах узводно су изолирани и вјероватно су локалци, аутосомални профил овог узорка опет вуче према њима, и то дакле то су већ двије гране ове хаплогрупе на трачком подручју. Дубовачко-жутобрдска група (која је осим грана I2a имала и аутосомално осјетан WHG елемент) је одиграла улогу у генези трачких култура раног жељезног доба и то је најприје поријекло ових узорака.

 I-Y13339 има TMRCA управо из раног жељезног доба, и по овим узорцима могуће да се ради о огранцима који су мигрирали сјеверније (Дако-Гети).

 Занимљив је овај археолошки контекст и ваљало би пронаћи евентуално еке јасније везе ових узорака са неким подручјем.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Април 20, 2023, 11:40:56 пре подне
Једно занимљиво поклапање код мене на 23andMe. Иницијали Ф.М., аутосомална пола Немачка-Француска, пола Балкан, локација бабе по мајци Гуча Гора/Травник (остале локације нису уписане), очева хаплогрупа J2a-L70.

Презимена на М пописана у овом месту, према попису из 1991. године:

Travnik, Guča Gora, Marelja, 12
Travnik, Guča Gora, Martinović, 22
Travnik, Guča Gora, Matković, 49
Travnik, Guča Gora, Mišković, 103

Због оних старих налаза J2a-L70 из Гуче Горе (касни средњи век) било би интересантно да постоји веза. Ово би уједно могло да значи да на простору Средње Босне на неки начин јесте постојао континуитет у неким местима, од средњег века, на овамо.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 20, 2023, 12:11:49 поподне
Због оних старих налаза J2a-L70 из Гуче Горе (касни средњи век) било би интересантно да постоји веза. Ово би уједно могло да значи да на простору Средње Босне на неки начин јесте постојао континуитет у неким местима, од средњег века, на овамо.

У средњој Босни можда и понајвише.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Gorance Април 20, 2023, 01:03:38 поподне
У средњој Босни можда и понајвише.
Поред муслимана, мислим да су католици средње Босне најзанимљивији за истраживање, поготово староседелачког становништва. Крешево, Фојница итд. С друге стране, додао бих ту и Шокце из Славоније и зап. Бачке који имају предање о пореклу из Босне. Конкретно, мој другар, Шокац по оцу негује то предање. Занимљиво да им се данашње презиме помиње почетком 18-ог века у Бачкој. Вероватно су дошли 1690-е кад су Хабзурзи допрли до Сарајева па покупили хришћанско становништво.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Април 20, 2023, 01:28:11 поподне
Само да се утврди од када је та Л70 ту. По тим налазима то је период много пре Турака, још ако су Кушетићи старином Дружићи (што 99% јесу јер је Петар највероватније син, или унук, Кушете Стефановића. При томе постојало је више Дружића са именом Стефан и слично). Када би Босанци били вољни да ураде велики тест једног од оног скелета то би било супер. Знамо да су се на јадранској обали Романи одржали и након доласка Словена, није искуључена ни унутрашњост. Дружићи се спомињу и у Херцеговини и у Дубровачким документима, можда су старином из Дубровачког залеђа или околине.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Април 20, 2023, 01:57:45 поподне
Само да се утврди од када је та Л70 ту. По тим налазима то је период много пре Турака, још ако су Кушетићи старином Дружићи (што 99% јесу јер је Петар највероватније син, или унук, Кушете Стефановића. При томе постојало је више Дружића са именом Стефан и слично). Када би Босанци били вољни да ураде велики тест једног од оног скелета то би било супер. Знамо да су се на јадранској обали Романи одржали и након доласка Словена, није искуључена ни унутрашњост. Дружићи се спомињу и у Херцеговини и у Дубровачким документима, можда су старином из Дубровачког залеђа или околине.

Можда су то остаци из овог римског муниципијума
https://sr.wikipedia.org/wiki/%D0%91%D0%B8%D1%81%D1%82%D1%83%D0%B0_%D0%9D%D0%BE%D0%B2%D0%B0
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Мај 07, 2023, 03:12:15 поподне
Касноантичко становништво данашње Словеније, урађена је анализа четири скелета са локације Блед-Пристава у Словенији. По свему судећи ради се о оцу и његово троје дјеце, двије ћерке и сину. Извучен је STR хаплотип оца и сина, у питању је хаплогрупа E-V13. Нисам примјетио да код нас у бази имају ближих поклапања, НЕВГЕН им највише шанси даје за грану https://www.yfull.com/tree/E-Y37092/, мада на том броју маркера не треба узимати превише сигурно.

Ради се о  предсловенском становништву данашње Словеније с краја 5. вијека н.е.

https://www.fsigenetics.com/article/S1872-4973(23)00061-3/fulltext
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Мај 27, 2023, 12:12:43 поподне
Objavljeni su BAM fajlovi iz rada "Genetic continuity, isolation, and gene flow in Stone Age Central and Eastern Europe".

The genomic landscape of Stone Age Europe was shaped by multiple migratory waves and population replacements, but different regions do not all show the same patterns. To refine our understanding of the population dynamics before and after the dawn of the Neolithic, we generated and analyzed genomic sequence data from human remains of 56 individuals from the Mesolithic, Neolithic and Eneolithic across Central and Eastern Europe. We found that Mesolithic European populations formed a geographically widespread isolation-by-distance zone ranging from Central Europe to Siberia, which was already established 10,000 years ago. We also found contrasting patterns of population continuity during the Neolithic transition: people around the lower Dnipro Valley region, Ukraine, showed continuity over 4,000 years, from the Mesolithic to the end of Neolithic, in contrast to almost all other parts of Europe where population turnover drove this cultural change, including vast areas of Central Europe and around the Danube River.

Data is available:

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB59598
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: filipi Јун 05, 2023, 09:01:46 пре подне
Nieoficjalny arkusz z jeszcze niepełnymi danymi z nadchodzącego badania dotyczącego łowców zbieraczy z Europy środkowo-wschodniej (głównie Polska i Ukraina).
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1Uk1_35ppeBcjYWr2tnt9uMBP4r174X42/htmlview
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Јун 06, 2023, 03:54:43 поподне
Прегледна мапа са узорцима старе ДНК који се могу повезати са Словенима (углавном период 9. до 15. века)

https://www.google.com/maps/d/u/0/viewer?mid=1hZ28c61g0tNMYLfrvoo3a2Y0chPeGTlH&ll=49.84842526832148%2C18.501412059844867&z=5

Подсетих се и овог J2b-Y22075 узорка из Белорусије (10-12 век). Интересантно би било видети која је дубља подграна, низводно је и кричка J-Y22059.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Јун 06, 2023, 04:20:04 поподне
Прегледна мапа са узорцима старе ДНК који се могу повезати са Словенима (углавном период 9. до 15. века)

https://www.google.com/maps/d/u/0/viewer?mid=1hZ28c61g0tNMYLfrvoo3a2Y0chPeGTlH&ll=49.84842526832148%2C18.501412059844867&z=5

Подсетих се и овог J2b-Y22075 узорка из Белорусије (10-12 век). Интересантно би било видети која је дубља подграна, низводно је и кричка J-Y22059.


Ово му је терминална грана:

https://www.yfull.com/tree/J-Y263419/ (https://www.yfull.com/tree/J-Y263419/)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Јун 06, 2023, 04:23:20 поподне

Ово му је терминална грана:

https://www.yfull.com/tree/J-Y263419/ (https://www.yfull.com/tree/J-Y263419/)

Хвала на инфо. Гујо. Интересантно да му је аутосомална прилично "словенска". 
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Христифор Јун 06, 2023, 06:06:52 поподне
Дефинитивно чак и у Босни више раде на испитивању средњовековних узорака. Да Порекло није одрадило тестирање у Церници и да професор Кораћ не води испитивања у Виминацијуму били би апсолутна црна рупа у овоме.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Exiled Јун 06, 2023, 06:09:32 поподне
Дефинитивно чак и у Босни више раде на испитивању средњовековних узорака. Да Порекло није одрадило тестирање у Церници и да професор Кораћ не води испитивања у Виминацијуму били би апсолутна црна рупа у овоме.
Апсолутна нула.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Христифор Јун 06, 2023, 06:27:17 поподне
Сумњам да је до новца и да га надлежни који раде на испитивању у БиХ имају више од колега у Србији. Мислим да је на делу незаинтересованост и незнање  о генетици у 2023 години ма колико то чудно звучало.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Exiled Јун 06, 2023, 06:32:13 поподне
Сумњам да је до новца и да га надлежни који раде на испитивању у БиХ имају више од колега у Србији. Мислим да је на делу незаинтересованост и незнање  о генетици у 2023 години ма колико то чудно звучало.
Нема то везе са новцем, то ти је више везано за "гусле"😊
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Јун 06, 2023, 06:37:01 поподне
Прегледна мапа са узорцима старе ДНК који се могу повезати са Словенима (углавном период 9. до 15. века)

https://www.google.com/maps/d/u/0/viewer?mid=1hZ28c61g0tNMYLfrvoo3a2Y0chPeGTlH&ll=49.84842526832148%2C18.501412059844867&z=5

Подсетих се и овог J2b-Y22075 узорка из Белорусије (10-12 век). Интересантно би било видети која је дубља подграна, низводно је и кричка J-Y22059.

Откуд овај узорак са локалитета Гомолава? Пише у опису да је из рада Cosmopolitanism at the Roman Danubian Frontier, Slavic Migrations, and the Genomic Formation of Modern Balkan Peoples али тамо не видим да постоји узорак са овог локалитета већ само из Виминацијума, Књажевца и Ниша.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јун 08, 2023, 10:23:04 пре подне
Јуче објављен препринт рада са прилично храбрим насловом Ancient DNA reveals the origins of the Albanians

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.06.05.543790v1
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јун 08, 2023, 01:30:06 поподне
Пребацићу ову дискусију на тему о Албанцима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јун 12, 2023, 06:27:40 пре подне
Видим да су ових дана објављени сирови резултати из рада Early contact between late farming and pastoralist societies in southeastern Europe

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB62503

Гуја је неке од ових већ детаљније прегледао, надам се да ће нешто од тога објавити и овдје.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јун 12, 2023, 06:43:29 пре подне
Ово је неки списак узорака са прелиминарно одређеним хаплогрупама.

BOY001.merge_Y.bam: Total SNPs: 19141 Result (56.4% 317 -7 +208): R-Z2103
BOY008.merge_Y.bam: Total SNPs: 9801 Result (59.9% 157 -0 +105): R-Y14420
BOY008.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 1475 Result (96.0% 24 -0 +1): R-M269 
BOY009.merge_Y.bam: Total SNPs: 14394 Result (57.6% 257 -4 +168): R-Z2103
BOY009.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 17435 Result (70.0% 242 -2 +95): R-Z2108
BOY014.merged_Y.bam: Total SNPs: 2574 Result (82.1% 26 -1 +2): J-M205 
BOY019.merge_Y.bam: Total SNPs: 4403 Result (55.6% 65 -0 +52): R-Z2108
BOY019.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 8496 Result (69.3% 88 -0 +39): R-Z2108
KTL001.merge_Y.bam: Total SNPs: 25466 Result (82.7% 383 -2 +73): I-S12195
KTL001.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 17841 Result (74.9% 182 -0 +61): I-S12195
KTL002.merge_Y.bam: Total SNPs: 130 Result (100.0% 2 -0 +0): F       
KTL003.merge_Y.bam: Total SNPs: 173 Result (100.0% 2 -0 +0): R-CTS3065
KTL004.merge_Y.bam: Total SNPs: 299 Result (50.0% 2 -0 +2): A0-T   
KTL005.merge_Y.bam: Total SNPs: 26336 Result (82.8% 378 -1 +75): R-V1636
KTL005.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 14024 Result (74.4% 128 -0 +44): R-V1636
KTL006.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 57662 Result (84.8% 698 -2 +118): I-L699 
KTL006.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 117582 Result (85.8% 1012 -0 +168): I-L699 
KTL007.merge_Y.bam: Total SNPs: 170
KTL008.merge_Y.bam: Total SNPs: 142 Result (-50.0% 2 -1 +0): A-L602 
MAJ002.B0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 281 Result (-33.3% 2 -1 +1): F       
MAJ003.merge_Y.bam: Total SNPs: 44628 Result (92.1% 780 -1 +64): G-P303 
MAJ003.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 42195 Result (88.2% 463 -0 +62): G-Z39332
MAJ004.merge_Y.bam: Total SNPs: 405 Result (75.0% 3 -0 +1): P-P337 
MAJ008.merge_Y.bam: Total SNPs: 58 Result (100.0% 1 -0 +0): T-L206 
MAJ009.merge_Y.bam: Total SNPs: 10962 Result (87.0% 181 -0 +27): R-L754 
MAJ009.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 5016 Result (80.3% 61 -0 +15): R-L754 
MAJ017.merge_Y.bam: Total SNPs: 46666 Result (88.7% 673 -0 +86): R-M12149
MAJ017.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 68881 Result (82.2% 666 -1 +141): R-Z2103
MAJ019.merge_Y.bam: Total SNPs: 106 Result (100.0% 2 -0 +0): CT     
MAJ020.merge_Y.bam: Total SNPs: 335 Result (63.6% 7 -0 +4): G-Y292455
MAJ023.merge_Y.bam: Total SNPs: 163 Result (100.0% 2 -0 +0): R-P297 
PIE003.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 41 Result (100.0% 1 -0 +0): R-BY161172
PIE004.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 29668 Result (84.4% 379 -0 +70): R-PF6287
PIE004.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 143502 Result (80.2% 1097 -2 +264): R-PF6287
PIE005.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 21476 Result (85.2% 288 -2 +43): C-Y83490
PIE006.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 59
PIE008.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 62 Result (100.0% 1 -0 +0): E-CTS12954
PIE009.A.merge_trim2_Y.bam: Total SNPs: 841 Result (80.0% 8 -0 +2): J-M410 
PIE010.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 11
PIE012.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 37
PIE013.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 11252 Result (86.2% 172 -1 +24): R-Y7777
PIE014.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 47 Result (100.0% 3 -0 +0): R-BY161172
PIE015.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 22789 Result (85.3% 366 -2 +56): G-FGC12126
PIE015.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 140276 Result (83.6% 1193 -3 +224): G-FGC12126
PIE017.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 26587 Result (79.5% 348 -2 +82): R-PF6287
PIE018.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 29
PIE019.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 12997 Result (90.7% 198 -1 +17): R-PF6287
PIE022.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 2789 Result (87.9% 51 -0 +7): G-PF3147
PIE023.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 30831 Result (87.6% 407 -1 +54): R-Y7777
PIE023.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 153887 Result (84.6% 1175 -2 +207): R-PF6287
PIE025.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 7310 Result (81.4% 105 -0 +24): T-M70   
PIE025.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 49068 Result (77.4% 405 -0 +118): T-Y14629
PIE026.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 3068 Result (81.7% 49 -0 +11): R-L754 
PIE028.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 22644 Result (83.1% 305 -0 +62): J-Z6050
PIE028.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 116237 Result (79.4% 883 -1 +225): J-Z6050
PIE029.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 9445 Result (83.3% 169 -0 +34): G-PH488
PIE030.A.merge_trim2_Y.bam: Total SNPs: 11Result (100.0% 2 -0 +0): R-BY161172
PIE032.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 2201 Result (92.5% 49 -0 +4): G-P15   
PIE033.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 28606 Result (87.1% 457 -1 +64): G-Z6484
PIE033.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 138233 Result (81.8% 1186 -2 +256): G-Z6128
PIE034.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 98 Result (50.0% 1 -0 +1): J-Y947 
PIE035.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 13

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јун 12, 2023, 06:43:59 пре подне
PIE037.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 21733 Result (85.9% 274 -0 +45): H-Y19962
PIE037.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 121907 Result (82.2% 934 -3 +191): H-FTC500
PIE038.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 42 Result (-50.0% 2 -1 +0): J-Y947 
PIE039.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 24
PIE041.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 122 Result (100.0% 1 -0 +0): R-YP555
PIE042.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 1361 Result (82.4% 28 -0 +6): R-V88   
PIE043.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 128 Result (100.0% 1 -0 +0): G-FTA27302
PIE044.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 2209 Result (74.4% 32 -1 +7): J-PF4610
PIE048.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 15
PIE050.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 38169 Result (88.1% 461 -1 +59): C-Y83490
PIE050.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 154524 Result (86.1% 1270 -6 +184): C-FT59486
PIE053.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 73 Result (100.0% 1 -0 +0): J-Y947 
PIE054.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 28635 Result (86.7% 448 -1 +65): G-P303 
PIE054.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 141697 Result (85.4% 1226 -4 +195): G-PF3345
PIE057.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 43294 Result (85.3% 556 -6 +75): C-BY36620
PIE057.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 173177 Result (86.1% 1469 -13 +192): C-BY36620
PIE058.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 24856 Result (85.7% 381 -1 +60): G-L140 
PIE06061.merge_trim2_Y.bam: Total SNPs: 35813 Result (85.1% 472 -1 +79): I-L701 
PIE061.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 113088 Result (79.9% 893 -4 +209): I-Y5606
PIE062.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 3838 Result (91.9% 57 -0 +5): G-P15   
PIE063.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 20168 Result (85.3% 290 -2 +43): C-Y83490
PIE064.C0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 2355 Result (97.3% 36 -0 +1): R-M269 
PIE064.D0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 19
PIE065.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 55 Result (100.0% 1 -0 +0): E-CTS12954
PIE069.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 87
PIE071631.merge.trim2_trim2_Y.bam: Total SNPs: 18829 Result (80.3% 284 -5 +51): J-Y15913
PIE074.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 34
PIE075.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 23
PIE076.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 26699 Result (86.4% 327 -1 +48): C-Y83490
PIE076.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 97323 Result (81.8% 798 -3 +166): C-Y83490
PIE077.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 72 Result (100.0% 1 -0 +0): E-CTS12954
PIE078.G0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 8364 Result (88.0% 117 -0 +16): I-L621 
PTK001.A0101.TF1.1_trim10_Y.bam: Total SNPs: 16618 Result (59.8% 202 -1 +131): IJK     
PTK003.merged_trim10_Y.bam: Total SNPs: 2179 Result (62.5% 20 -0 +12): R-PF6287
PTK004.A0101.TF1.1_trim10_Y.bam: Total SNPs: 6055 Result (65.9% 87 -0 +45): I-Y344225
PTK005.A0101.TF1.1_trim10_Y.bam: Total SNPs: 20056 Result (73.1% 357 -3 +119): G-CTS342
UBK003.merge_Y.bam: Total SNPs: 238 Result (100.0% 3 -0 +0): G       
UBK006.merge_Y.bam: Total SNPs: 17345 Result (80.5% 265 -0 +64): I-BY33169
UBK006.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 12527 Result (74.1% 109 -0 +38): I-M838 
USV004.merge_Y.bam: Total SNPs: 234 Result (100.0% 2 -0 +0): I       
USV005.merge_Y.bam: Total SNPs: 486 Result (71.4% 5 -0 +2): I-CTS10228
VAR002.B0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 17 Result (100.0% 1 -0 +0): G-P15   
VAR003.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 48 Result (100.0% 1 -0 +0): R-BY161172
VAR004.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 16465 Result (87.2% 258 -0 +38): G-PH488
VAR006.A0101.TF1.2_trim2_Y.bam: Total SNPs: 11627 Result (82.0% 143 -2 +24): I-L596 
VAR008.B0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 8322 Result (87.7% 131 -1 +15): R-PF6287
VAR009.A0101.TF1.2_trim2_Y.bam: Total SNPs: 31674 Result (88.4% 506 -1 +63): E-L618 
VAR010.B0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 32855 Result (91.0% 496 -1 +46): T-Y6033
VAR011.A0101.TF1.2_trim2_Y.bam: Total SNPs: 32621 Result (83.9% 489 -3 +83): G-PF3148
VAR012.B0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 100 Result (100.0% 1 -0 +0): H-Z34873
VAR016.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 13935 Result (84.7% 211 -0 +38): T-L162 
VAR017.B0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 75 Result (25.0% 1 -0 +3): E-CTS12954
VAR018.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 23163 Result (85.2% 369 -2 +57): E-L618 
VAR019.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 21811 Result (89.2% 346 -0 +42): R-PF6287
VAR020.A0101.TF1.2_trim2_Y.bam: Total SNPs: 15683 Result (86.5% 212 -0 +33): R-Y7777
VAR021.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 44 Result (100.0% 2 -0 +0): R-BY161172
VAR022.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 44237 Result (88.4% 607 -0 +80): T-Y6033
VAR023_ANI160.merge_trim2_Y.bam: Total SNPs: 13441 Result (89.1% 229 -0 +28): G-PH488
VAR026.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 2761 Result (86.2% 50 -0 +8): R-PF6287
VAR027.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 52 Result (100.0% 1 -0 +0): J-Y947 
VAR030.B0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 15395 Result (83.8% 223 -2 +36): I-L699 
VAR032.B0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 28790 Result (85.9% 396 -2 +58): T-Y6033
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јун 12, 2023, 06:44:34 пре подне
VAR033.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 62 Result (66.7% 2 -0 +1): R-FGC52936
VAR034.A0101.TF1.2_trim2_Y.bam: Total SNPs: 28
YUN001.merge_Y.bam: Total SNPs: 56 Result (100.0% 1 -0 +0): R-Y111961
YUN003_049.merge_Y.bam: Total SNPs: 112 Result (50.0% 1 -0 +1): R-Y62620
YUN005.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 50 Result (50.0% 1 -0 +1): F       
YUN006_031.merge_Y.bam: Total SNPs: 188 Result (33.3% 2 -0 +4): E-CTS12954
YUN007.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 33166 Result (88.6% 453 -1 +55): J-Y13128
YUN007.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 140533 Result (84.2% 1112 -4 +195): J-Z36834
YUN009.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 27227 Result (88.9% 420 -1 +49): G-FGC82036
YUN009.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 133898 Result (85.7% 1171 -4 +181): G-FGC82036
YUN012.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 75 Result (33.3% 1 -0 +2): E-CTS12954
YUN013.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 20254 Result (79.6% 266 -3 +57): C-F15182
YUN013.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 109129 Result (74.4% 908 -6 +289): C-F16270
YUN014.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 50
YUN015.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 6266 Result (90.6% 96 -0 +10): G-L30   
YUN019.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 78
YUN021.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 107 Result (33.3% 1 -0 +2): E-CTS447
YUN025.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 77 Result (100.0% 1 -0 +0): J       
YUN026.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 19851 Result (82.1% 238 -0 +52): J-Y13128
YUN026.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 64945 Result (71.2% 504 -3 +191): J-Y13128
YUN027_I0781.merge_trim2_Y.bam: Total SNPs: 422 Result (37.5% 3 -0 +5): R-BY34758
YUN028.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 42
YUN033.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 26 Result (100.0% 1 -0 +0): B-L1388
YUN034.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 7
YUN035.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 47
YUN036.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 14 Result (100.0% 1 -0 +0): E-CTS12954
YUN037.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 17132 Result (82.6% 239 -2 +43): I-L621 
YUN038.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 26912 Result (85.2% 363 -2 +56): I-S19848
YUN038.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 105625 Result (80.2% 846 -5 +190): I-S19848
YUN039.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 34
YUN041.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 77 Result (100.0% 1 -0 +0): J-Y947 
YUN042.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 59 Result (100.0% 1 -0 +0): J-Y947 
YUN043.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 95 Result (100.0% 1 -0 +0): J-Y947 
YUN044.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 20
YUN045.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 29 Result (100.0% 1 -0 +0): O-Y141174
YUN048.A0101.TF1.1_trim2_Y.bam: Total SNPs: 10848 Result (79.4% 142 -1 +33): H-Y19966
YUN048.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 40816 Result (76.1% 330 -2 +96): H-Y19966
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Јун 12, 2023, 07:20:18 пре подне
Ово је неки списак узорака са прелиминарно одређеним хаплогрупама.
BOY001.merge_Y.bam: Total SNPs: 19141 Result (56.4% 317 -7 +208): R-Z2103
BOY008.merge_Y.bam: Total SNPs: 9801 Result (59.9% 157 -0 +105): R-Y14420
BOY008.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 1475 Result (96.0% 24 -0 +1): R-M269 
BOY009.merge_Y.bam: Total SNPs: 14394 Result (57.6% 257 -4 +168): R-Z2103
BOY009.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 17435 Result (70.0% 242 -2 +95): R-Z2108
BOY014.merged_Y.bam: Total SNPs: 2574 Result (82.1% 26 -1 +2): J-M205 
BOY019.merge_Y.bam: Total SNPs: 4403 Result (55.6% 65 -0 +52): R-Z2108
BOY019.Ymerged_Y.bam: Total SNPs: 8496 Result (69.3% 88 -0 +39): R-Z2108

Која ли је ово M205 у мору R1b-Z2103. :) Божаново, Бугарска. Знамо ли тачно из код периода датирају сви ови узорци? Видим да се међу резултатима јавља и J-Y13128, низводно је она J2a-Y14439 присутна данас код динарских Срба, Бугара и Италијана.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Јун 12, 2023, 07:32:57 пре подне
https://anthrogenica.com/showthread.php?28491-Early-contact-between-late-farming-and-pastoralist-societies-in-southeastern-Europe
Цитат
YUN037.A0101.TF1.1_trim2_Y   I-L621*(xI-Y44940,I-Y81696,I-Y39505,I-Y85905,I-Y5596,I-Y140266,I-Y32084,I-FT138628,I-Y39942,I-BY31905)   S10302   14054   1340
YUN038.A0101.TF1.1_trim2_Y   I-S19848*(xI-Y85772,I-Y81696,I-Y225862,I-Y140266,I-Y188845,I-PH3310,I-Y56203,I-Y251275,I-Y265455,I-Y62880,I-BY89974)   S19848   20164   2443
YUN038.Ymerged_Y   I-S19848*(xI-Y85772,I-Y44940,I-CTS10228,I-FGC20473,I-BY31905)   S19848   225924   20951
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јун 12, 2023, 08:20:20 пре подне
Која ли је ово M205 у мору R1b-Z2103. :) Божаново, Бугарска. Знамо ли тачно из код периода датирају сви ови узорци? Видим да се међу резултатима јавља и J-Y13128, низводно је она J2a-Y14439 присутна данас код динарских Срба, Бугара и Италијана.

Текстуални дио рада још увијек није објављен, тако да треба сачекати са тачнијим временским позиционирањем.

Оно што наводе у апстракту даје грубу слику из ког периода су узорци: "However, what happened between the demise of the Copper Age settlements ~4250 BCE and the expansion of pastoralists remains poorly understood. To address this question, we analysed genome-wide data from 135 ancient individuals from the contact zone between southeastern Europe and the northwestern Black Sea region spanning this critical time period."
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јун 12, 2023, 08:23:26 пре подне
https://anthrogenica.com/showthread.php?28491-Early-contact-between-late-farming-and-pastoralist-societies-in-southeastern-Europe

Прегледао је Гуја оба ова узорка, има објављено на теми на антхрогеници, оба су негативна на CTS4002. Нису ближе повезани са I-Y3120.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Глигорија Јун 12, 2023, 09:25:08 пре подне
11627 Result (82.0% 143 -2 +24): I-L596
А овај узорак? Колко је стар и колико је далеко од I-Y16418?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Јун 12, 2023, 10:56:27 пре подне
Прегледао је Гуја оба ова узорка, има објављено на теми на антхрогеници, оба су негативна на CTS4002. Нису ближе повезани са I-Y3120.

А овај узорак USV005.merge_Y.bam: Total SNPs: 486 Result (71.4% 5 -0 +2): I-CTS10228 ?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јун 12, 2023, 11:39:47 пре подне
А овај узорак USV005.merge_Y.bam: Total SNPs: 486 Result (71.4% 5 -0 +2): I-CTS10228 ?

То су програмски избачене предикције хаплогрупа. Прилично непоуздане и са могућим лажним очитавањима. Ништа без ручне провјере.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Јун 12, 2023, 12:34:14 поподне
Прегледао је Гуја оба ова узорка, има објављено на теми на антхрогеници, оба су негативна на CTS4002. Нису ближе повезани са I-Y3120.

Прегледао сам синоћ тек пар узорака, оних нама најзанимљивијих:


YUN037; ~4600-4300 BC; Yunatsite, Pazardzhik, Bulgaria; KGK_VI_CA; I2-L621 (xY45825,CTS4002,Y85772)

L621 level: 8 derived SNPs

L621>Y45825 level: 6 ancestral SNPs

L621>CTS10936 level: *no calls*

L621>CTS10936>S19848 level: DEL

L621>CTS10936>S19848>CTS4002 level: CTS4002- C>A (1C); S23503/SK1240/YP198- G>A (1G)

L621>CTS10936>S19848>Y85772 level: Y101018- C>T (1C); Y94278- G>A (1G)


YUN038; ~4600-4300 BC; Yunatsite, Pazardzhik, Bulgaria; KGK_VI_CA; I2-L621>CTS10936>S19848* (xCTS4002,Y85772)

L621 level: 26 derived SNPs, 1 ambiguous SNP, 1 ancestral SNP

L621>CTS10936 level: CTS11768+ C>A (2A); FGC12092/YP224+ G>A (2A)

L621>CTS10936>S19848 level: S19848+  T>A (4A)

L621>CTS10936>S19848>CTS4002 level: CTS4002- C>A (2C)

L621>CTS10936>S19848>Y85772 level: 11 ancestral SNPs


Занимљиво је да два узорка из Варне (VAR009 и VAR018) припадају прилично реткој грани, паралелној са E-V13:

https://www.yfull.com/tree/E-Y182141/ (https://www.yfull.com/tree/E-Y182141/)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Јун 12, 2023, 08:19:18 поподне
Локалитет Јунаците је велики тел, на тој локацији се са повременим прекидима живело од раног неолита па до краја праисторије. Узорци које је Гуја прегледао потичу из халколитске (енеолитске, бакарнодобне) фазе која се везује за културу Караново VI (једног од основних стубова археолошког комплекса Коџадермен-Гумелница-Караново VI); та фаза је имала насилан крај, приликом чега је дошло до спаљивања насеља и погибије његових становника (за које су написали да су се у тренутку напада углавном састојали од жена, деце и старих људи); у спаљеним остацима станишта су налажени и скелетни остаци погинулих, често са јасним знацима насилне смрти. Било би добро проверити да ли узорци YUN037 и YUN038 припадају некима од тих насилно страдалих или су укопани на стандардан начин, односно да су пронађени унутар некрополе. Цео археолошки комплекс коме је припадала култура Караново VI се наслањао и био у блиским односима са североисточнијом Кукутени-Трипоље културом, са којом се прожимао на простору Влашке низије (такође култура Варне припада овом комплексу и прилично је блиска са Караново VI културом). Ако се добро сећам, још неки I2-L621 узорци су нађени и у Румунији, нисам сигуран да ли се исто датују као и Караново VI (друга половина 5. миленијума п.н.е.), у сваком случају мени делује да се I2-L621 најпре може везати уз Кукутени-Трипоље, иако на тамошњим налазиштима није још увек нађена (можда је била присутна јужније, односно само на простору Румуније?). Занимљив је и проналазак гране паралелне E-V13 на некрополи у Варни, то њене почетке чини ми се чвршће повезује са ареалом Црног мора (и то можда баш западне обале Црног мора).

https://bg.wikipedia.org/wiki/%D0%A1%D0%B5%D0%BB%D0%B8%D1%89%D0%BD%D0%B0_%D0%BC%D0%BE%D0%B3%D0%B8%D0%BB%D0%B0_%E2%80%9E%D0%AE%D0%BD%D0%B0%D1%86%D0%B8%D1%82%D0%B5%E2%80%9C
https://bg.wikipedia.org/wiki/%D0%9A%D0%B0%D1%80%D0%B0%D0%BD%D0%BE%D0%B2%D0%BE_VI
https://bg.wikipedia.org/wiki/%D0%9A%D0%BE%D0%B4%D0%B6%D0%B0%D0%B4%D0%B5%D1%80%D0%BC%D0%B5%D0%BD_%E2%80%93_%D0%93%D1%83%D0%BC%D0%B5%D0%BB%D0%BD%D0%B8%D1%86%D0%B0_%E2%80%93_%D0%9A%D0%B0%D1%80%D0%B0%D0%BD%D0%BE%D0%B2%D0%BE_VI

https://en.wikipedia.org/wiki/Tell_Yunatsite
https://en.wikipedia.org/wiki/Gumelni%C8%9Ba_culture
https://en.wikipedia.org/wiki/Gumelni%C8%9Ba%E2%80%93Kod%C5%BEadermen-Karanovo_VI_complex
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Јун 12, 2023, 11:16:08 поподне
Локалитет Јунаците је велики тел, на тој локацији се са повременим прекидима живело од раног неолита па до краја праисторије. Узорци које је Гуја прегледао потичу из халколитске (енеолитске, бакарнодобне) фазе која се везује за културу Караново VI (једног од основних стубова археолошког комплекса Коџадермен-Гумелница-Караново VI); та фаза је имала насилан крај, приликом чега је дошло до спаљивања насеља и погибије његових становника (за које су написали да су се у тренутку напада углавном састојали од жена, деце и старих људи); у спаљеним остацима станишта су налажени и скелетни остаци погинулих, често са јасним знацима насилне смрти. Било би добро проверити да ли узорци YUN037 и YUN038 припадају некима од тих насилно страдалих или су укопани на стандардан начин, односно да су пронађени унутар некрополе. Цео археолошки комплекс коме је припадала култура Караново VI се наслањао и био у блиским односима са североисточнијом Кукутени-Трипоље културом, са којом се прожимао на простору Влашке низије (такође култура Варне припада овом комплексу и прилично је блиска са Караново VI културом). Ако се добро сећам, још неки I2-L621 узорци су нађени и у Румунији, нисам сигуран да ли се исто датују као и Караново VI (друга половина 5. миленијума п.н.е.), у сваком случају мени делује да се I2-L621 најпре може везати уз Кукутени-Трипоље, иако на тамошњим налазиштима није још увек нађена (можда је била присутна јужније, односно само на простору Румуније?). Занимљив је и проналазак гране паралелне E-V13 на некрополи у Варни, то њене почетке чини ми се чвршће повезује са ареалом Црног мора (и то можда баш западне обале Црног мора).

https://bg.wikipedia.org/wiki/%D0%A1%D0%B5%D0%BB%D0%B8%D1%89%D0%BD%D0%B0_%D0%BC%D0%BE%D0%B3%D0%B8%D0%BB%D0%B0_%E2%80%9E%D0%AE%D0%BD%D0%B0%D1%86%D0%B8%D1%82%D0%B5%E2%80%9C
https://bg.wikipedia.org/wiki/%D0%9A%D0%B0%D1%80%D0%B0%D0%BD%D0%BE%D0%B2%D0%BE_VI
https://bg.wikipedia.org/wiki/%D0%9A%D0%BE%D0%B4%D0%B6%D0%B0%D0%B4%D0%B5%D1%80%D0%BC%D0%B5%D0%BD_%E2%80%93_%D0%93%D1%83%D0%BC%D0%B5%D0%BB%D0%BD%D0%B8%D1%86%D0%B0_%E2%80%93_%D0%9A%D0%B0%D1%80%D0%B0%D0%BD%D0%BE%D0%B2%D0%BE_VI

https://en.wikipedia.org/wiki/Tell_Yunatsite
https://en.wikipedia.org/wiki/Gumelni%C8%9Ba_culture
https://en.wikipedia.org/wiki/Gumelni%C8%9Ba%E2%80%93Kod%C5%BEadermen-Karanovo_VI_complex

Узорци из Румуније су били из бакарног (I7137 Bodrogkeresztur I-L621) и бронзаног доба (I10479 Carlomanesti Arman I-L621>CTS4002).

Био је још један из Бугарске I19454 из раног бронзаног доба који је ако се не варам I-L621* са локалитета TellKran.

Мислим да имамо тренутно два хотспота хаплогрупе L621 у бронзаном добу, једну у данашњој Румунији око Карпата, а другу јужно од планине Балкан на северозападу Тракије. Можда су обронци Карпатско-балканског планинског венца служили дуго као рефугијум за мезолитску генетику, кроз цео неолит и халколит.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Јун 13, 2023, 06:03:35 пре подне
https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-S10302/tree
https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-S10302/ancient

Колико видим I-L621 је и PIE078.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Јун 13, 2023, 06:06:58 пре подне
Оно што је још занимљиво је старост узорка 7137 из Румуније, а то је око 6000 година, што је веома близу TMRCA гране L621 који је 6500 година. Мада, узорак је додат на FTDNA стабло и изгледа да цепа овај ниво тако што формира грану S10302.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Јун 13, 2023, 10:57:53 пре подне
Да ли је неко проверио можда онај M205 узорак? Последње што сам видео је да је аутосомално преко 80% "Western Yamnaya". Која је тачна локација ових узорака R1b-Z2103/M205.

То би, ако је уопште M205, био прилично стар европски узорак за ову хаплогрупу, а можда би открио и нове миграционе правце појединих подграна. Не сећам се да смо помињали, али на још једном старом налазишту се неочекивано налази и M205. У питању је рад: Early Medieval Genetic Data from Ural Region Evaluated in the Light of 2 Archaeological Evidence of Ancient Hungarians

(https://i.postimg.cc/gjssMH95/n.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Јун 14, 2023, 07:11:20 пре подне
BOY014: 3000-2000 BC; Boyanovo, Bulgaria; LCA/EBA; J2b1-M205

Нажалост, слабо је покривен овај узорак. Свега један SNP на нивоу M205 (PF7301) и три на M102 нивоу. Али по свему судећи јесте J2b-M205. Узорак поседује углавном степску аутосомалну. Доста интересантан резултат. Посебно зато што је пронађен уз R1b-Z2103 која је и данас раширена и разноврсна на простору источног и централног Балкана. Данас на простору Бугарске и нема друге J2b-M205 осим J-Y22059. Поцењена старост подгране 4600 година, што тачно пада у овај период 3000-2000 пре Христа.

Не може се на основу ових информација извући неки конкретан закључак, али балканска Y22059 и изгледа као да је прошла неко уско грло (писали смо о томе више пута). Углавном, ово је први стари узорак J2b-M205 са Балкана.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Morski Јун 30, 2023, 09:10:08 пре подне
А овај узорак USV005.merge_Y.bam: Total SNPs: 486 Result (71.4% 5 -0 +2): I-CTS10228 ?

То су програмски избачене предикције хаплогрупа. Прилично непоуздане и са могућим лажним очитавањима. Ништа без ручне провјере.

Ako je vec Crna Guja rucno provjerio i prva dva I-L621 rezultata iz Pazarcika, sto je problem da se provjeri i ovaj ?
Bilo bi dobro i da saznamo odakle je bio ovaj USV005 covjek i kada je zivio.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јул 01, 2023, 09:31:40 пре подне
Нови препринт

Западна Панонија, касни енеолит и рано бронзано доба

Interdisciplinary analyses of Bronze Age communities from Western Hungary reveal complex population histories

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.02.03.478968v3
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јул 10, 2023, 09:54:13 пре подне
Нови препринт

Неолит на простору Мађарске, Словачке, Румуније, Хрватске, Србије и Аустрије, културе Старчево и LBK

Social and genetic diversity in first farmers of central Europe

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.07.07.548126v1

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.07.07.548126v1.full.pdf

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.07.07.548126v1.supplementary-material
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јул 10, 2023, 10:12:57 пре подне
Само један узорак припада хаплогрупи E, терминално одређен као E-M78, са LBK налазишта у Аустрији. Свакако би било добро прегледати сирове податке, можда би се могла открити и нека нижа грана.

Углавном доминира хаплогрупа G2a-L1259
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јул 10, 2023, 10:46:23 пре подне
Још један скорији рад древне ДНК

Енеолит, италијански Алпи, два узорка (отац и син), припадају грани G2a-L497>Z17815 https://www.yfull.com/tree/G-Z1815/

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352409X2300278X
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Јул 14, 2023, 07:13:35 поподне
Само један узорак припада хаплогрупи E, терминално одређен као E-M78, са LBK налазишта у Аустрији. Свакако би било добро прегледати сирове податке, можда би се могла открити и нека нижа грана.

Углавном доминира хаплогрупа G2a-L1259

Сјајно, прегршт узорака из старијег неолита. Резултати се поклапају са досадашњим налазима из неолита ако се не варам. Златна медаља за хаплогрупу G2a2. Сребро осваја C-V20, а бронзу бих дао хаплогрупи I2a-M223/CTS10057(Z161). Занимљиво да имамо и један узорак из Румуније који је R1b. Погађам да се ради о R-V88, пошто је била заступљена у мезолиту, а видели смо из других радова да је у Румунији опстала та популација све до бронзаног доба и поред најезде анадолских фармера током неолита.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Јул 22, 2023, 10:25:08 поподне
drevna DNK iz Poljske

bronzano doba
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1Uk1_35ppeBcjYWr2tnt9uMBP4r174X42/edit?pli=1#gid=787345754

gvozdeno doba, srednji vijek:
https://anthrogenica.com/showthread.php?28606-Genomic-history-of-present-day-Poland&p=939012&viewfull=1#post939012

Stžižov i Mježanovice - uglavnom R1a-Z280, ali im nedostaje lovačko-sakupljačka autosomalna dnk koji imaju današnji Balto-Sloveni.
Tščinjec kultura - autosomalno blisko srodni Balto-slovenima, ali pripadaju uglavnom nekim granama i2a koje su danas rijetke u istočnoj Evropi, pa se čini da nisu direktni preci današnjih Slovena, barem ne ova grupa iz zapadne Poljske koja je testirana.
Pševorsk kultura - autosomalno slična Keltima i današnjim Francuzima
Wielbark kultura- autosomalno slični Skandinavcima, oko Gdanjskog zaliva ima i genetskih Skandinavaca i Slovena (tu se pominju Goti i Venedi)
srednji vijek - Sloveni, ima nešto Balta i "južnih Slovena" s jakom paleobalkanskom primjesom, kao i kod srednjovjekovnih Čeha i Rusa.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Јул 23, 2023, 11:04:06 пре подне
drevna DNK iz Poljske

bronzano doba
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1Uk1_35ppeBcjYWr2tnt9uMBP4r174X42/edit?pli=1#gid=787345754

gvozdeno doba, srednji vijek:
https://anthrogenica.com/showthread.php?28606-Genomic-history-of-present-day-Poland&p=939012&viewfull=1#post939012

Stžižov i Mježanovice - uglavnom R1a-Z280, ali im nedostaje lovačko-sakupljačka autosomalna dnk koji imaju današnji Balto-Sloveni.
Tščinjec kultura - autosomalno blisko srodni Balto-slovenima, ali pripadaju uglavnom nekim granama i2a koje su danas rijetke u istočnoj Evropi, pa se čini da nisu direktni preci današnjih Slovena, barem ne ova grupa iz zapadne Poljske koja je testirana.
Pševorsk kultura - autosomalno slična Keltima i današnjim Francuzima
Wielbark kultura- autosomalno slični Skandinavcima, oko Gdanjskog zaliva ima i genetskih Skandinavaca i Slovena (tu se pominju Goti i Venedi)
srednji vijek - Sloveni, ima nešto Balta i "južnih Slovena" s jakom paleobalkanskom primjesom, kao i kod srednjovjekovnih Čeha i Rusa.

Позна Пшеворска култура је се ширила према југоистоку и дошла у додир са Зарубињецком културом преко своје волинско-подолске групе. Можда су они пренели хаплогрупу I-CTS10228 Старим Словенима. TMRCA се добро уклапа у тај сценарио а и постојање другог несловенског огранка Y81696 ове хаплогрупе у Француској.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Јул 24, 2023, 07:38:46 пре подне
Видим да су ових дана објављени сирови резултати из рада Early contact between late farming and pastoralist societies in southeastern Europe

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB62503

Гуја је неке од ових већ детаљније прегледао, надам се да ће нешто од тога објавити и овдје.
https://www.nature.com/articles/s41586-023-06334-8
(https://media.springernature.com/full/springer-static/image/art%3A10.1038%2Fs41586-023-06334-8/MediaObjects/41586_2023_6334_Fig1_HTML.png)

Цитат
A principal finding from our study indicates early contact and admixture between CA farming groups from SEE and Eneolithic groups from the steppe zone in today’s southern Ukraine, possibly starting in the middle of the fifth millennium BC when settlement densities shifted further north, connecting the lower Danube region with the coastal steppe and Cucuteni–Trypillia groups of the forest–steppe. Archaeological evidence shows that the early CA Gumelniţa groups had already settled deep into the steppe zone by the mid-fifth millennium BC, introducing elements of a farming lifestyle but also carrying cultural influences from local HG groups53. The succeeding Cernavodă I and Usatove archaeological cultures were heavily influenced by local CA cultures and surrounds. During the fourth millennium BC, the northwestern Pontic region experienced intensified contact with Steppe Eneolithic groups, while these in turn also had contact with groups in the North Caucasus, such as Maykop, all of which are mirrored by the genomic data presented here. Moreover, despite the close geographical proximity of the Ukrainian sites studied, we were able to trace different admixture histories. Here, the heterogeneity of the individuals from the site Kartal stands out, which is located on the Danube delta at the northern end of the former distribution of the Chalcolithic Gumelniţa–Kodžadermen–Karanovo VI complex and thus represents the transformative nature and dynamics of the fourth millennium BC in action. By contrast, the more homogenous Majaky and Usatove groups, located north of the Dniester River, show that such assimilation processes had already occurred, suggesting that contact and exchange between transitional foragers and early pastoralist groups from the forest–steppe zone and non-local SEE farmer-associated groups had started already in the late fifth millennium BC. Moreover, variable cultural influences attested by the archaeological record40,41,53 are also traceable genetically. We argue that livestock, innovations and technological advances were exchanged through these zones of interaction, which then led to the establishment of fully developed pastoralism in the steppe by the end of the fourth millennium BC. Gene flow from both contact zones into the steppe could also explain the small amounts of farmer-related ancestry in the emerging Yamnaya pastoralists, which differentiates them from the Steppe Eneolithic substrate and accounts for subtle geographical structure in the vastly expanding territory/range.

The early admixture during the Eneolithic presented in this study appears to be local to the northwestern Black Sea region of the fourth millennium BC and did not affect the hinterland in SEE. In fact, EBA individuals from the fourth and third millennia BC from YUN and PIE do not show traces of steppe-like ancestry but instead a resurgence of HG ancestry observed widely in Europe during the fourth millennium BC (refs. 4,29,54,55). This indicates the presence of remnant HG groups in various non-farmed regions, for example, highlands and uplands or densely forested zones and wetlands and a mosaic of ancestries rather than a genetically uniform CA and EBA Europe.

While only a few tell sites have been resettled by local and/or incoming groups who did not originate in the North Pontic region, we can trace the appearance of migrants from the steppe, clearly attributed to Yamnaya culturally and genetically, in the local time transect at Majaky but also at Boyanovo in the Bulgarian lowlands of the Thracian Plain. The subtle differences in genetic ancestries between these two when compared to different Yamnaya-associated groups account for their geographical locations and different stages of genetic and perhaps, cultural assimilation. Two outlier individuals from EBA YUN and BOY bear witness to occasional admixture between inhabitants of EBA tells and incoming steppe pastoralists. Ultimately, the third millennium BC form of ‘steppe’-ancestry is expected to have reached the Great Hungarian plain, from where it diversified and spread further west. The interaction between local and incoming groups in SEE did not result in archaeologically visible conflicts or a near-complete autosomal genetic turnover as observed in Britain or a replacement of the Y-chromosome lineages in the Iberian Peninsula36,56.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Јул 24, 2023, 09:14:44 пре подне
Прегледао сам синоћ тек пар узорака, оних нама најзанимљивијих:


YUN037; ~4600-4300 BC; Yunatsite, Pazardzhik, Bulgaria; KGK_VI_CA; I2-L621 (xY45825,CTS4002,Y85772)

L621 level: 8 derived SNPs

L621>Y45825 level: 6 ancestral SNPs

L621>CTS10936 level: *no calls*

L621>CTS10936>S19848 level: DEL

L621>CTS10936>S19848>CTS4002 level: CTS4002- C>A (1C); S23503/SK1240/YP198- G>A (1G)

L621>CTS10936>S19848>Y85772 level: Y101018- C>T (1C); Y94278- G>A (1G)


YUN038; ~4600-4300 BC; Yunatsite, Pazardzhik, Bulgaria; KGK_VI_CA; I2-L621>CTS10936>S19848* (xCTS4002,Y85772)

L621 level: 26 derived SNPs, 1 ambiguous SNP, 1 ancestral SNP

L621>CTS10936 level: CTS11768+ C>A (2A); FGC12092/YP224+ G>A (2A)

L621>CTS10936>S19848 level: S19848+  T>A (4A)

L621>CTS10936>S19848>CTS4002 level: CTS4002- C>A (2C)

L621>CTS10936>S19848>Y85772 level: 11 ancestral SNPs


Занимљиво је да два узорка из Варне (VAR009 и VAR018) припадају прилично реткој грани, паралелној са E-V13:

https://www.yfull.com/tree/E-Y182141/ (https://www.yfull.com/tree/E-Y182141/)

Ова два узорка су заправо око 2000 година млађа, из 2800 п.н.е. Реч је о два блиска рођака. Један од њих, YUN037, је у допунској табели означен као CTS4002.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Јул 24, 2023, 11:08:07 пре подне
Ова два узорка су заправо око 2000 година млађа, из 2800 п.н.е. Реч је о два блиска рођака. Један од њих, YUN037, је у допунској табели означен као CTS4002.

Реч је о рођеној браћи, а један од њих (YUN038) је директно датиран у период 2911-2765 п.н.е., тј. у рано бронзано доба. Обојици је терминална позиција на стаблу I2-L621>CTS10936>S19848* (xCTS4002,Y85772) (https://www.yfull.com/tree/I-S19848/), што ће рећи да су негативни на CTS4002. YUN038 има CTS4002-  C>A (2C), а YUN037 има CTS4002-  C>A (1C) и S23503/SK1240/YP198-  G>A (1G).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Јул 24, 2023, 02:11:23 поподне
Реч је о рођеној браћи, а један од њих (YUN038) је директно датиран у период 2911-2765 п.н.е., тј. у рано бронзано доба. Обојици је терминална позиција на стаблу I2-L621>CTS10936>S19848* (xCTS4002,Y85772) (https://www.yfull.com/tree/I-S19848/), што ће рећи да су негативни на CTS4002. YUN038 има CTS4002-  C>A (2C), а YUN037 има CTS4002-  C>A (1C) и S23503/SK1240/YP198-  G>A (1G).

Хвала на појашњењу. Мислим да је ово веома интересантно откриће јер је старост хаплогрупе S19848 процењена на YFull-у на 5500 година. Уз већ раније откривене узорке ове хаплогрупе на Источном Балкану из раног бронзаног доба упућује на матицу ове хаплогрупе на овом подручју, упркос данашњој већој разноврсности на западу Европе. Ту је и мало старији узорак PIE078 који је означен као L621/S392 а стар је преко 5000 година (директно датиран).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Јул 25, 2023, 12:00:04 пре подне
BOY014: 3000-2000 BC; Boyanovo, Bulgaria; LCA/EBA; J2b1-M205

Нажалост, слабо је покривен овај узорак. Свега један SNP на нивоу M205 (PF7301) и три на M102 нивоу. Али по свему судећи јесте J2b-M205. Узорак поседује углавном степску аутосомалну. Доста интересантан резултат. Посебно зато што је пронађен уз R1b-Z2103 која је и данас раширена и разноврсна на простору источног и централног Балкана. Данас на простору Бугарске и нема друге J2b-M205 осим J-Y22059. Поцењена старост подгране 4600 година, што тачно пада у овај период 3000-2000 пре Христа.

Не може се на основу ових информација извући неки конкретан закључак, али балканска Y22059 и изгледа као да је прошла неко уско грло (писали смо о томе више пута). Углавном, ово је први стари узорак J2b-M205 са Балкана.

У приложеној табели је наведено да је овај узорак жена.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Јул 27, 2023, 12:28:05 пре подне
Нови археогенетски рад везан за један неолитски локалитет у Француској https://www.nature.com/articles/s41586-023-06350-8 (https://www.nature.com/articles/s41586-023-06350-8). Од 57 мушких скелета само две хаплогрупе су присутне: G2a2b2a1a2 и H2m. Изгледа да су и неолитске заједнице биле патрилокалне.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Јул 27, 2023, 08:26:08 пре подне
Нови археогенетски рад везан за један неолитски локалитет у Француској https://www.nature.com/articles/s41586-023-06350-8 (https://www.nature.com/articles/s41586-023-06350-8). Од 57 мушких скелета само две хаплогрупе су присутне: G2a2b2a1a2 и H2m. Изгледа да су и неолитске заједнице биле патрилокалне.

Dan Davies baš o tome (o patrilokalnim neolitskim zajednicama) govori u svom poslednjem videu - This is the Oldest Family Tree in the World. Ko zna malo engleskog može da ga pogleda na njegovom kanalu - Dan Davis History.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Јул 29, 2023, 04:30:08 поподне
Локалитет Јунаците је велики тел, на тој локацији се са повременим прекидима живело од раног неолита па до краја праисторије. Узорци које је Гуја прегледао потичу из халколитске (енеолитске, бакарнодобне) фазе која се везује за културу Караново VI (једног од основних стубова археолошког комплекса Коџадермен-Гумелница-Караново VI); та фаза је имала насилан крај, приликом чега је дошло до спаљивања насеља и погибије његових становника (за које су написали да су се у тренутку напада углавном састојали од жена, деце и старих људи); у спаљеним остацима станишта су налажени и скелетни остаци погинулих, често са јасним знацима насилне смрти. Било би добро проверити да ли узорци YUN037 и YUN038 припадају некима од тих насилно страдалих или су укопани на стандардан начин, односно да су пронађени унутар некрополе. Цео археолошки комплекс коме је припадала култура Караново VI се наслањао и био у блиским односима са североисточнијом Кукутени-Трипоље културом, са којом се прожимао на простору Влашке низије (такође култура Варне припада овом комплексу и прилично је блиска са Караново VI културом). Ако се добро сећам, још неки I2-L621 узорци су нађени и у Румунији, нисам сигуран да ли се исто датују као и Караново VI (друга половина 5. миленијума п.н.е.), у сваком случају мени делује да се I2-L621 најпре може везати уз Кукутени-Трипоље, иако на тамошњим налазиштима није још увек нађена (можда је била присутна јужније, односно само на простору Румуније?).

Ова два узорка су директно датирана на рано бронзано доба, али су у раду објављени и узорци из халколита са истог локалитета. Занимљиво је да се аутозомална генетика није готово ни променила на овом локалитету, па су ови узорци аутозомално веома блиски међусобно без обзира да ли су из халколита или бронзаног доба. У оба случаја је реч о генетици неолитских земљорадника из Анадолије. Једини изузетак је узорак YUN041 из раног бронзаног доба који има доста степске генетике.

Још један узрок PIE078 који има хаплогрупу L621 је са самог почетка бронзаног доба из Румуније. И он је аутозомално сличан неолитским популацијама Балкана. С обзиром да је у раду публиковано неколико узорака из енеолитских култура североисточно од овог налазишта и да је већ тада степска генетика почела подручју Влашке и Балкана да буде значајно заступљена мислим да може да се претпостави да је хаплогрупа L621 дочекала степске сточаре на истоку Балкана.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Јул 31, 2023, 09:23:25 пре подне
Ова два узорка су директно датирана на рано бронзано доба, али су у раду објављени и узорци из халколита са истог локалитета. Занимљиво је да се аутозомална генетика није готово ни променила на овом локалитету, па су ови узорци аутозомално веома блиски међусобно без обзира да ли су из халколита или бронзаног доба. У оба случаја је реч о генетици неолитских земљорадника из Анадолије. Једини изузетак је узорак YUN041 из раног бронзаног доба који има доста степске генетике.

Још један узрок PIE078 који има хаплогрупу L621 је са самог почетка бронзаног доба из Румуније. И он је аутозомално сличан неолитским популацијама Балкана. С обзиром да је у раду публиковано неколико узорака из енеолитских култура североисточно од овог налазишта и да је већ тада степска генетика почела подручју Влашке и Балкана да буде значајно заступљена мислим да може да се претпостави да је хаплогрупа L621 дочекала степске сточаре на истоку Балкана.

Да, прва информација је била да су узорци L621 из Јунацита из халколитског периода, после је дошла информација да су млађи и да потичу из раног бронзаног доба. Било би добро прегледати за коју археолошку културу би могли да се вежу, односно да се види која култура је била присутна на телу Јунаците током раног бронзаног доба. Мени се и даље с обзиром на "географију" налазишта где су пронађени ти стари L621, а узимајући у обзир и њихов аутозомни профил, чини да би најбољи кандидат за њихово извориште требала бити неолитска Кукутени-Трипоље култура.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Јул 31, 2023, 10:27:37 пре подне
Да, прва информација је била да су узорци L621 из Јунацита из халколитског периода, после је дошла информација да су млађи и да потичу из раног бронзаног доба. Било би добро прегледати за коју археолошку културу би могли да се вежу, односно да се види која култура је била присутна на телу Јунаците током раног бронзаног доба. Мени се и даље с обзиром на "географију" налазишта где су пронађени ти стари L621, а узимајући у обзир и њихов аутозомни профил, чини да би најбољи кандидат за њихово извориште требала бити неолитска Кукутени-Трипоље култура.

Узорци из Кукутени-Трипољске културе имају значајан EHG уплив за разлику од EBA PIE078+YUN кластера које су аутозомално моделовали као анадолске пољопривреднике са упливом CHG и WHG генетике али без EHG генетике. Изгледа да су ови узорци L621 из EBA потомци Чернавода културе која се из Влашке ширила паралелно са ширењем Културе гробних јама, чији су узорци са локалитета Бојаново.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Јул 31, 2023, 01:34:11 поподне
Radi se o kulturi Ezero/Junacite gornotrakijske nizije ranog brozanog doba. Ovo područje je bilo napušteno nakon Suvorovo invazije (4400 p.n.e.). Oko 3300-3200 p.n.e. pojavljuje se ova kultura, s miješanim elementima farmera i stepe, i na vrhovima napuštenih telova podižu utvrđenja, vjerovatno za obranu od Jamnaja ekspanzije koja je tada počinjala. Oko tela Ezero postoje i tragovi naseljavanja same Jamnaja populacije.

Ranije su bili povezivani s govornicima proto-tračkog, a u novije vrijeme više s proto-anatolcima.

Ako pogledamo autosomalne rezultate, stepski uticaj u ovoj populaciji je malen, u prosjeku oko 15%, dominira neolitska genetika. Međutim WHG uticaj je svugdje iznad 10%, slično kao u Bodrogkeresturu i Tripolju, dok je kod eneolitskog stanovništva Bugarske bio u pravilu ispod 10%.

Čini se da je Ezero/Junacite bilo spoj neke neolitske populacije s Karpata (od koje dolazi L621) i starije stepske populacije (Suvorovo ili Černavoda), i nešto malo Jamna uticaja.

Već znamo da je bilo L621 u Bodrogkeresturu. Uzorak UBK006 iz Usatovo kulture je I-P37.2, a Usatovo je bilo miks Černavode i Tripolja, pa ovo možda indirekto potvrđuje da je I-L621 bila prisutna u Tripolju.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Јул 31, 2023, 02:14:12 поподне
Uzorak UBK006 iz Usatovo kulture je I-P37.2, a Usatovo je bilo miks Černavode i Tripolja, pa ovo možda indirekto potvrđuje da je I-L621 bila prisutna u Tripolju.

UBK006 je https://www.yfull.com/tree/I-M838/ (https://www.yfull.com/tree/I-M838/).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Јул 31, 2023, 02:51:20 поподне
UBK006 je https://www.yfull.com/tree/I-M838/ (https://www.yfull.com/tree/I-M838/).

Zahvaljujem. Mislim da imamo već desetak I2 rezultata iz Tripolja koji nisu I-CTS10228. Tako da za sada nema osnova za povezivanje ove haplogrupe s Tripoljem.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Јул 31, 2023, 11:12:10 поподне
Radi se o kulturi Ezero/Junacite gornotrakijske nizije ranog brozanog doba. Ovo područje je bilo napušteno nakon Suvorovo invazije (4400 p.n.e.). Oko 3300-3200 p.n.e. pojavljuje se ova kultura, s miješanim elementima farmera i stepe, i na vrhovima napuštenih telova podižu utvrđenja, vjerovatno za obranu od Jamnaja ekspanzije koja je tada počinjala. Oko tela Ezero postoje i tragovi naseljavanja same Jamnaja populacije.

Ranije su bili povezivani s govornicima proto-tračkog, a u novije vrijeme više s proto-anatolcima.


Ako pogledamo autosomalne rezultate, stepski uticaj u ovoj populaciji je malen, u prosjeku oko 15%, dominira neolitska genetika. Međutim WHG uticaj je svugdje iznad 10%, slično kao u Bodrogkeresturu i Tripolju, dok je kod eneolitskog stanovništva Bugarske bio u pravilu ispod 10%.

Čini se da je Ezero/Junacite bilo spoj neke neolitske populacije s Karpata (od koje dolazi L621) i starije stepske populacije (Suvorovo ili Černavoda), i nešto malo Jamna uticaja.

Već znamo da je bilo L621 u Bodrogkeresturu. Uzorak UBK006 iz Usatovo kulture je I-P37.2, a Usatovo je bilo miks Černavode i Tripolja, pa ovo možda indirekto potvrđuje da je I-L621 bila prisutna u Tripolju.

Јесте да је незахвално проценити језик неке популације на основу генетике али мислим да је сада и ова анадолских хипотеза на прилично климавим ногама. Заправо удео степске генетике на популацију локалитета Јунаците је миноран. Своди се само на један узорак женског пола који је генетски мешанац степске популације и локалне. Генерално ми се чини да је Езеро култура била пре свега настављач балканских култура бакарног доба осим што је у време мрачног доба енеолита добила мало WHG аутозомално примесе  и пуно израженије мезолитске хаплогрупе I-L701 и I-L621. Дакле та популација доста дуго нема степских утицаја, за разлику од подручја северно од делте Дунава и у енеолиту се повлачи на југ преко Дунава, али мислим да се креће и даље на запад према подручју где настаје Вучедолска култура. Очекивао бих да је језик овог становништва био прединдоевропски као што је била и њихова генетика, мада никад се не зна. 😀
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Август 01, 2023, 05:33:40 поподне
Јесте да је незахвално проценити језик неке популације на основу генетике али мислим да је сада и ова анадолских хипотеза на прилично климавим ногама. Заправо удео степске генетике на популацију локалитета Јунаците је миноран. Своди се само на један узорак женског пола који је генетски мешанац степске популације и локалне. Генерално ми се чини да је Езеро култура била пре свега настављач балканских култура бакарног доба осим што је у време мрачног доба енеолита добила мало WHG аутозомално примесе  и пуно израженије мезолитске хаплогрупе I-L701 и I-L621. Дакле та популација доста дуго нема степских утицаја, за разлику од подручја северно од делте Дунава и у енеолиту се повлачи на југ преко Дунава, али мислим да се креће и даље на запад према подручју где настаје Вучедолска култура. Очекивао бих да је језик овог становништва био прединдоевропски као што је била и њихова генетика, мада никад се не зна. 😀

Ako uzmemo u obzir i ostala nalazišta (npr. Kran, Smjadovo), većina Ezero kulture ima udio stepskih autosoma i Y-DNK sličan Mikenskim Grcima ili Tračanima iz gvozdenog doba, za koje znamo da su bili govornici indoevropskih jezika.

(https://i.imgur.com/X9eUoOk.png)

Na Bojanovu i Ezeru, što su poznate zone s Jamnaja nekropolama, vidimo još i viši udio stepe. Oni su se isto vjerovatno pomiješali s lokalcima i ostavili neki uticaj na jezik.

Uglavnom, ne sumnjam da su bili indo-evropljani. Samo mislim da nemaju veze s Tračanima, a možda čak ni s Anadolcima. Za sada najbliže veze pokazuju s Mikenjanima, što je pomalo neočekivano. Čekam dublje profilacije R1b uzoraka iz ovog rada, pa da vidimo da li će se situacija rasvijetliti.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Август 01, 2023, 09:39:04 поподне
Ako uzmemo u obzir i ostala nalazišta (npr. Kran, Smjadovo), većina Ezero kulture ima udio stepskih autosoma i Y-DNK sličan Mikenskim Grcima ili Tračanima iz gvozdenog doba, za koje znamo da su bili govornici indoevropskih jezika.

(https://i.imgur.com/X9eUoOk.png)

Na Bojanovu i Ezeru, što su poznate zone s Jamnaja nekropolama, vidimo još i viši udio stepe. Oni su se isto vjerovatno pomiješali s lokalcima i ostavili neki uticaj na jezik.

Uglavnom, ne sumnjam da su bili indo-evropljani. Samo mislim da nemaju veze s Tračanima, a možda čak ni s Anadolcima. Za sada najbliže veze pokazuju s Mikenjanima, što je pomalo neočekivano. Čekam dublje profilacije R1b uzoraka iz ovog rada, pa da vidimo da li će se situacija rasvijetliti.

Бојаново и Езеро су сигурно били Јамнајци али популација која је населила телове дубље у унутрашњости је доста другачије генетике и потиче од Чернавода III популације, која је доминантно генетски наследила халколитску локалну генетику али је током мрачног миленијума на крају халколита попримила доста WHG генетике, и још изразитије типичне WHG хаплогрупе I-L621 и I-L701. Ове две групе јесу припадале истом културном контексту у енеолиту али је ипак било изгледа археолошки видљивих разлика. Мешали се јесу али изгледа да је мешање било мирољубиво и патрилокалног карактера у овој фази па је питање да ли су унутар Езеро културног комплекса постојале две етничко-лингвистичке групе, с обзиром на веома различито порекло ова два скупа.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Август 02, 2023, 01:09:08 поподне
Бојаново и Езеро су сигурно били Јамнајци али популација која је населила телове дубље у унутрашњости је доста другачије генетике и потиче од Чернавода III популације, која је доминантно генетски наследила халколитску локалну генетику али је током мрачног миленијума на крају халколита попримила доста WHG генетике, и још изразитије типичне WHG хаплогрупе I-L621 и I-L701. Ове две групе јесу припадале истом културном контексту у енеолиту али је ипак било изгледа археолошки видљивих разлика. Мешали се јесу али изгледа да је мешање било мирољубиво и патрилокалног карактера у овој фази па је питање да ли су унутар Езеро културног комплекса постојале две етничко-лингвистичке групе, с обзиром на веома различито порекло ова два скупа.

Mislim da si ovdje u pravu, R1b uzorci su pronađeni samo na Ezeru i Bojanovu, i svi imaju visok udio stepe. Na ostalim nalazištima dominiraju I-L621 и I-L701 i autosomalno stepa je niska.

Možemo onda nagađati koliko dugo su koegzistirali, i da li se Jamnaja utopila u lokalce ili im nametnula svoj jezik?

Jedino se ne bih složio da je ova i2 populacija porijeklom od Černavode.

U Černavodi i Usatovu je prisutna R1b, autosomalno imaju visoku stepu i čak oko 20% Kavkasko-Anadolskog uticaja kojeg nema u Ezero kulturi. Čini se da su se ovdje odvijali neki sasim drugačiji procesi od onih u Ezeru.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Август 02, 2023, 10:26:45 поподне
Mislim da si ovdje u pravu, R1b uzorci su pronađeni samo na Ezeru i Bojanovu, i svi imaju visok udio stepe. Na ostalim nalazištima dominiraju I-L621 и I-L701 i autosomalno stepa je niska.

Možemo onda nagađati koliko dugo su koegzistirali, i da li se Jamnaja utopila u lokalce ili im nametnula svoj jezik?

Jedino se ne bih složio da je ova i2 populacija porijeklom od Černavode.

U Černavodi i Usatovu je prisutna R1b, autosomalno imaju visoku stepu i čak oko 20% Kavkasko-Anadolskog uticaja kojeg nema u Ezero kulturi. Čini se da su se ovdje odvijali neki sasim drugačiji procesi od onih u Ezeru.


Чернавода је обухватала доњи Дунав ако се не варам. На жалост немамо узорке из ове културе осим из граничног подручја, са саме делте Дунава, где се види да степски утицај већ осетно слаби у односу на Усатовску културу. Следеће разматрање из рада ме је навело на помисао да су узводно од делте Дунава остали халколитски фармери без значајнијег степског генетског уплива.

Цитат

Иначе из ранијег халколитског периода са локалитета Пиетреле на Дунаву имамо узорак PIE060 који има веома повишену WHG компоненту и хаплогрупу I-L701, што може да значи да је ту негде било подручје мешања земљорадника и популације са повећаном WHG компонентом. Али слажем се да све то није на чврстим основама.
The early admixture during the Eneolithic presented in this study appears to be local to the northwestern Black Sea region of the fourth millennium BC and did not affect the hinterland in SEE. In fact, EBA individuals from the fourth and third millennia BC from YUN and PIE do not show traces of steppe-like ancestry but instead a resurgence of HG ancestry observed widely in Europe during the fourth millennium BC (refs. 4,29,54,55). This indicates the presence of remnant HG groups in various non-farmed regions, for example, highlands and uplands or densely forested zones and wetlands and a mosaic of ancestries rather than a genetically uniform CA and EBA Europe.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Август 03, 2023, 11:05:48 пре подне
Чернавода је обухватала доњи Дунав ако се не варам. На жалост немамо узорке из ове културе осим из граничног подручја, са саме делте Дунава, где се види да степски утицај већ осетно слаби у односу на Усатовску културу. Следеће разматрање из рада ме је навело на помисао да су узводно од делте Дунава остали халколитски фармери без значајнијег степског генетског уплива.

Od Černavode imamo dva različita klastera, oba su istovremena i sa tog istog nalazišta na delti Dunava. Jedan s manje stepe a drugi s više, ali oba imaju kavkasku komponentu jaču od tadašnjeg stanovništva Balkana.

(https://i.imgur.com/AhKLnDJ.png)

Ne znam da li su ovo atipični uzorci Černavode. Neki izvori Černavodu smještaju uglavnom u sjeveroistočnu Bugarsku, a neki je šire na sjever do Moldavije, tako da je jezgro kulture upravo oko delte Dunava. Vjerovatno se mišljenja arheologa razlikuju.

Usatovo ima stabilni profil na svim nalazištima (opet s tim kavkaskim uticajem), osim ovog EBA, koji je 1000 godina mlađi od ostalih i zapravo je Jamnaja.

Uglavnom, nemaju mnogo veze s Balkanom, gdje su stepski došljaci donosili "normalni" Jamna profil s manje kavkaskog uticaja.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Август 04, 2023, 04:09:05 поподне
Od Černavode imamo dva različita klastera, oba su istovremena i sa tog istog nalazišta na delti Dunava. Jedan s manje stepe a drugi s više, ali oba imaju kavkasku komponentu jaču od tadašnjeg stanovništva Balkana.

(https://i.imgur.com/AhKLnDJ.png)

Ne znam da li su ovo atipični uzorci Černavode. Neki izvori Černavodu smještaju uglavnom u sjeveroistočnu Bugarsku, a neki je šire na sjever do Moldavije, tako da je jezgro kulture upravo oko delte Dunava. Vjerovatno se mišljenja arheologa razlikuju.

Usatovo ima stabilni profil na svim nalazištima (opet s tim kavkaskim uticajem), osim ovog EBA, koji je 1000 godina mlađi od ostalih i zapravo je Jamnaja.

Uglavnom, nemaju mnogo veze s Balkanom, gdje su stepski došljaci donosili "normalni" Jamna profil s manje kavkaskog uticaja.

Имамо од прошле године и узорке из Смјадова (околина Шумена) који су изгледа типични Балканци из кластера Пиетреле/Јунаците. Нажалост, немамо колико знам узорке из унутрашњости Румуније из касног енеолита али је по свему судећи у унутрашњости полуострва доминирала стара генетика бакарног доба, с једином разликом што су хаплогрупе I-L621 и I-L701 постале изразито доминантне.

Занимљиво је питање како су се и када ове две хаплогрупе прошириле по читавој Европи све до Велике Британије и Ирске.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Август 05, 2023, 01:03:44 поподне
Имамо од прошле године и узорке из Смјадова (околина Шумена) који су изгледа типични Балканци из кластера Пиетреле/Јунаците. Нажалост, немамо колико знам узорке из унутрашњости Румуније из касног енеолита али је по свему судећи у унутрашњости полуострва доминирала стара генетика бакарног доба, с једином разликом што су хаплогрупе I-L621 и I-L701 постале изразито доминантне.

Занимљиво је питање како су се и када ове две хаплогрупе прошириле по читавој Европи све до Велике Британије и Ирске.

Možda su onda zapravo Pietrele i Smjadovo tipični predstavnici Černavode, a ovi iz Kartala su već Usatovo, genetički gledano.

U to doba u Transilvaniji i Srbiji nestaje Bubanj-Salkuca-Krivodol nakon invazije Černavode-3, zatim se pojavljuje Kostolac-Kocofeni. Prije sam mislio da je to bila stepska populacija, ali najvjerovatnije su ipak bili nešto slično ovim L701/L261.

Za L701 se čini da je izvorno bila vezana uz neolitske lovce-sakupljače iz Ukrajine. Onda ih odatle stepski stočari potiskuju prema Balkanu, a neke grane možda asimiluju i kasnije šire po Evropi.

L621 je vjerovatno izvorno sjeverno/zapadno evropska, a na Karpate dolazi u kasnom neolitu, vezano uz megalitsku kulturu i oporavak i2 i WHG genetike koji se tada dešavao u Evropi.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Август 10, 2023, 05:40:31 пре подне
Možda su onda zapravo Pietrele i Smjadovo tipični predstavnici Černavode, a ovi iz Kartala su već Usatovo, genetički gledano.

U to doba u Transilvaniji i Srbiji nestaje Bubanj-Salkuca-Krivodol nakon invazije Černavode-3, zatim se pojavljuje Kostolac-Kocofeni. Prije sam mislio da je to bila stepska populacija, ali najvjerovatnije su ipak bili nešto slično ovim L701/L261.

Za L701 se čini da je izvorno bila vezana uz neolitske lovce-sakupljače iz Ukrajine. Onda ih odatle stepski stočari potiskuju prema Balkanu, a neke grane možda asimiluju i kasnije šire po Evropi.

L621 je vjerovatno izvorno sjeverno/zapadno evropska, a na Karpate dolazi u kasnom neolitu, vezano uz megalitsku kulturu i oporavak i2 i WHG genetike koji se tada dešavao u Evropi.

Управо је објављен нови археогенетски рад, као поручен за ову нашу дискусију  https://www.nature.com/articles/s42003-023-05131-3 (https://www.nature.com/articles/s42003-023-05131-3).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Август 10, 2023, 08:10:32 пре подне
Слаба покривеност узорака у овом раду али се на основу аутозомалног профила може закључити да Јунаците кластер из претходног рада ипак нема везе са украјинским риболовцима али се зато добро уклапа у румунски кластер из неолита и енеолита. Изгледа да је у Румунији или негде у најближем суседству опстала популација која је делимично задржала оригиналну локалну WHG генетику заосталу још од мезолитских ловаца и сакупљача. L621 би требало да потиче из те популације а не са запада Европе. Исто важи и за P78. За разлику од P78, L699 се среће у Украјини и има другачију историју гранања од L621 и P78, које су за време неолита и ранијег бакарног доба пролазиле кроз уско грло а онда почеле да се шире у познијем бакарном добу након пропасти култура балканског бакарног доба око 4250 п.н.е.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Август 10, 2023, 10:31:38 пре подне
Nema tu neke misterije, ako su tamo opstali onda je to negde oko planina Fagaras ili Parang. Neolićani tamo nisu imali šta da traže a za lov (i ribolov) je idealno.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Август 10, 2023, 01:24:33 поподне
Nema tu neke misterije, ako su tamo opstali onda je to negde oko planina Fagaras ili Parang. Neolićani tamo nisu imali šta da traže a za lov (i ribolov) je idealno.

Звучи логично, али могли су да буду и дунавски аласи, попут својих далеких рођака са Дњепра. Тренутно мислим да немамо доказа да одлучимо у корист једне или друге хипотезе. Ипак оно што знамо из археогенетике је да су сви “мешанци” са WHG компонентом већом од 30% из бакарног и бронзаног доба су са Дунава.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Август 10, 2023, 01:32:05 поподне
Слаба покривеност узорака у овом раду али се на основу аутозомалног профила може закључити да Јунаците кластер из претходног рада ипак нема везе са украјинским риболовцима али се зато добро уклапа у румунски кластер из неолита и енеолита. Изгледа да је у Румунији или негде у најближем суседству опстала популација која је делимично задржала оригиналну локалну WHG генетику заосталу још од мезолитских ловаца и сакупљача. L621 би требало да потиче из те популације а не са запада Европе. Исто важи и за P78. За разлику од P78, L699 се среће у Украјини и има другачију историју гранања од L621 и P78, које су за време неолита и ранијег бакарног доба пролазиле кроз уско грло а онда почеле да се шире у познијем бакарном добу након пропасти култура балканског бакарног доба око 4250 п.н.е.

Za L621 se ne bih složio. Prvi L621 u jugoistočnoj Evropi se pojavljuje tek u Bodrogkeresturu u bakarnom dobu na sjeveru Rumunije. Prije toga srodne grane imamo samo u Skandinaviji i zapadnoj Evropi.

L701, tako-tako. Za lovce lovce-sakupljače iz Lepenskog vira bila je tipična CTS10057>Z161 (ima je i kasnije kod neolićana) , a za ribolovce iz Ukrajine CTS10057>L701. U ranom neolitu pojavljuju se uzorci u Bugarskoj i Rumuniji s udjelom EHG (Ukrajinske) genetike (npr. na nalazištu Malak Preslavec) Oni su vjerovatno donijeli L701, pa u neolitske grupe ulazi kroz dugotrajno miješanje pri čemu se gubi EHG genetika. Prve populacije na Balkanu s visokim procentom L701 pojavljuju se tek u bronzanom dobu.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Август 10, 2023, 02:47:21 поподне
Za L621 se ne bih složio. Prvi L621 u jugoistočnoj Evropi se pojavljuje tek u Bodrogkeresturu u bakarnom dobu na sjeveru Rumunije. Prije toga srodne grane imamo samo u Skandinaviji i zapadnoj Evropi.

L701, tako-tako. Za lovce lovce-sakupljače iz Lepenskog vira bila je tipična CTS10057>Z161 (ima je i kasnije kod neolićana) , a za ribolovce iz Ukrajine CTS10057>L701. U ranom neolitu pojavljuju se uzorci u Bugarskoj i Rumuniji s udjelom EHG (Ukrajinske) genetike (npr. na nalazištu Malak Preslavec) Oni su vjerovatno donijeli L701, pa u neolitske grupe ulazi kroz dugotrajno miješanje pri čemu se gubi EHG genetika. Prve populacije na Balkanu s visokim procentom L701 pojavljuju se tek u bronzanom dobu.

Сви узорци из сродних грана су заправо из грана које су се од L621 одвојиле пре најмање 11000 година. Пошто сад већ знамо да је тада WHG генетика тек почела да се шири на запад са Балкана и Апенинског полуострва, врло је могуће да су сви пронађени узорци из сродних грана потомци миграната из југоисточне Европе, где је огранак из кога ће касније настати L621 остао. Свакако је све могуће код ових ловачко сакупљачких хаплогрупа са дугим уским грлима. Можда си и у праву. Само скрећем пажњу да је WHG популација још на Балкану, одакле је потекла, имала све главне огранке хаплогрупе I2a које данас постоје и додатно R1b-V88. Пре око 11000 година се ове гране деле на подгране које су млађе и заузимају простор целе Европе. Пре тога је на западу Европе доминирала друга генерика, потомака ловаца-сакупљача из Франко-Кантабријског рефугијума.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Август 10, 2023, 03:30:17 поподне
Сви узорци из сродних грана су заправо из грана које су се од L621 одвојиле пре најмање 11000 година. Пошто сад већ знамо да је тада WHG генетика тек почела да се шири на запад са Балкана и Апенинског полуострва, врло је могуће да су сви пронађени узорци из сродних грана потомци миграната из југоисточне Европе, где је огранак из кога ће касније настати L621 остао. Свакако је све могуће код ових ловачко сакупљачких хаплогрупа са дугим уским грлима. Можда си и у праву. Само скрећем пажњу да је WHG популација још на Балкану, одакле је потекла, имала све главне огранке хаплогрупе I2a које данас постоје и додатно R1b-V88. Пре око 11000 година се ове гране деле на подгране које су млађе и заузимају простор целе Европе. Пре тога је на западу Европе доминирала друга генерика, потомака ловаца-сакупљача из Франко-Кантабријског рефугијума.

Са почетком леденог доба формирају се у јужним деловима Европе два главна рефугијума, Франко-Кантабријски и Апенинско-Балканско-Црноморски. У првом ("Солитрејци") доминира хаплогрупа I2а1-P37 и њене потомачке гране, укључујући и претке "наше" L621, уз учешће још неких хаплогрупа (C1a2, pre-I1), док у другом ("Епиграветијанци") доминира хаплогрупа I2a2-M436, уз учешће R1b-V2219. P37 се са завршетком леденог доба шири из западне ка централној и источној Европи са Магдаленијен културом, и то најпре кроз своју најекспанзивнију грану S21825, али и кроз поједине гране M423, али не и L621, бар судећи по досадашњим резултатима. L621 без икакве сумње долази са запада, и то по свему судећи у неколико таласа почев тек од касног неолита, али је врло могуће да ниједна од тих линија није предачка данашњим "динарцима", јер кључна карика CTS10228 још увек није пронађена у древним узорцима. Ја сам и даље при ставу да се Y3120 развијала у прото-келтској популацији, и да је у прото-Словенску популацију доспела релативно касно (последњи векови старе ере), вероватно посредством Пшеворске културе.

Скоро сам на Антрогеници мало детаљније писао о томе:

Цитат
This is, in short, my understanding of what was happening in Europe, from the arrival of first Homo Sapiens to the Mesolithic:


1. The earliest IUP population, and somewhat later Aurignacians, likely brought a number of divergent lineages to Europe: K2a* (Ust'-Ishim, Oase), C1* (Bacho Kiro, Paglicci), C1a2 (Sunghir, Goyet), C1b1 (Bacho Kiro, Kostenki), F2'4 (Bacho Kiro).

2. Gravettians, that came several thousand years later, presumably from the Middle East, brought with them mainly haplogroup pre-I (Dolni Vestonice, Krems-Watchberg, Pavlov). They replaced most of the earlier populations, although some of them managed to survive, mostly in Western Europe. We even see some C1a2 among Gravettians along with pre-I in Dolni Vestonice, which means the two coexisted and mixed in at least some regions.

3. Then came the LGM. Population split and retreated into two main refugia: the Franco-Cantabrian and Italian-Balkan-Black Sea refugium. This is exactly where and when we see the principal division into two populations that differ both autosomaly and in terms of Y-haplogroups. In the Franco-Cantabrian refugium we have Solutrean (22000-17000 BC) population with a significant amount of Aurignacian-related ancestry (GoyetQ2/El Miron cluster), and dominated by haplogroups I2a1-P37, C1a2-V20>FT368070 and pre-I1. In the Italian-Balkan-Black Sea refugium we have Epigravettian (22000-10000 BC) population with a distinct ancestry composition (Riparo Tagliente/Villabruna/proto-WHG cluster), almost completely without Aurignacian-related ancestry, and dominated by haplogroup I2a2-M436, and in later period joined by some of R1b lineages of ANE origin (primarily R1b-V2219). I2c-L596 and C1a2-V20>V86 were likely also present among Epigravettians. The latter (and some of the former) were likely living in the southern Balkans, from were they crossed to Anatolia and mixed with Anatolian HGs to form Early Neolithic Farmers, with whom they back-migrated to Europe with the onset of Neolithic (C1a2-V20>V86>Y83490, C1a2-V20>V86>V182, I2c-L596>SK1271, I2c-L596>Y14158>BY160929).

4. After the LGM we have both West-to-East and East-to-West migrations, and subsequent mixing of two ancestries. Population from Franco-Cantabrian refugium expanded after the LGM with Magdalenian culture (17000-12000 BC), across Central Europe, all the way to Scandinavia in the north, and Baltic region and Ukraine in the east. The hallmark of Magdalenian migrations is without a doubt clade I2a1a1b-S21825, found in dozens of Magdalenian and Magdalenian-derived samples (Azilian, Maglemosian, Kongemose), as well as among Ukraine Mesolithic, Iron Gates, Narva and Koros HGs. The other clades (I2a1b-M423, pre-I1, C1a2-V20>FT368070, I2a1a1a-L158) were no doubt present among Magdalenians as well, but in significantly lower percentage than S21825.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: сɣнце Август 10, 2023, 07:22:29 поподне
Молим све којих се то тиче, да не говоре "узорци Јамнаје", него "узорци јамне културе" или "културе јамā".
У русском се зове ямная культура, ген. ямной культуры.
У украинском ямна культура, ген. ямноï култури.
У енглесском Pit grave culture.
У њемачком  Grubengrabkultur.

То је култура гдје су полагали мртве у јаме, зато је јамна (култура).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Август 10, 2023, 11:20:19 поподне
Са почетком леденог доба формирају се у јужним деловима Европе два главна рефугијума, Франко-Кантабријски и Апенинско-Балканско-Црноморски. У првом ("Солитрејци") доминира хаплогрупа I2а1-P37 и њене потомачке гране, укључујући и претке "наше" L621, уз учешће још неких хаплогрупа (C1a2, pre-I1), док у другом ("Епиграветијанци") доминира хаплогрупа I2a2-M436, уз учешће R1b-V2219. P37 се са завршетком леденог доба шири из западне ка централној и источној Европи са Магдаленијен културом, и то најпре кроз своју најекспанзивнију грану S21825, али и кроз поједине гране M423, али не и L621, бар судећи по досадашњим резултатима. L621 без икакве сумње долази са запада, и то по свему судећи у неколико таласа почев тек од касног неолита, али је врло могуће да ниједна од тих линија није предачка данашњим "динарцима", јер кључна карика CTS10228 још увек није пронађена у древним узорцима. Ја сам и даље при ставу да се Y3120 развијала у прото-келтској популацији, и да је у прото-Словенску популацију доспела релативно касно (последњи векови старе ере), вероватно посредством Пшеворске културе.

Скоро сам на Антрогеници мало детаљније писао о томе:

И ја сам мислио раније да је хаплогрупа I опстала у Франко-Кантабријском рефугијуму током LGM-а. Али за сада нема Солитрејаца са хаплогрупом I. За сада је само хаплогрупа C пронађена код њих. Они до душе јесу били потомци Граверијанаца који јесу имали и хаплогрупу I уз хаплогрупу C, али Граверијанаца нису били аутозомално хомогени него су имали два генетска пола: западни Фурнол и источни Вјестонице. Хаплогрупа I је за сад пронађена само код узорака који имају ову источну генетику која није преживела LGM.

Даље, након LGM-а имамо Магдаленаску групу која има и I2-P37 и C, али сви узорци ове групе већ имају Вилабруна генетику. А није тачно ни да је у Вилабруна кластери била заступљена само грана I2a2-M436 хаплогрупе I јер имамо узорак PRD001 из овог кластера који припада хаплогрупи I2a1a-P37.2.

Дакле, мислим да хаплогрупа I2a1 долази из правца Балкана јужном рутом у Франко-Кантабријски рефугијум одмах након LGM-а, а да пре тога на западу није постојала. Свакако не мислим да је целокупна хаплогрупа I2a1 мигрирали него само један њен део.

Међутим то је све далека прошлост. Ако се вратимо у енеолиту и рано бронзано доба и видимо да се у Румунији и Бугарској појављују све веће бочне гране од L621 до CTS10228 и узмемо у обзир TMRCA гране L621 од 6500 година, као и гране CTS10228 од 3400 година, према YFull-у, можемо доћи до закључка да је у периоду од позног бакарног до раног бронзаног доба предак гране CTS10228 живео негде на источном Балкану. То и даље не искључује Келте и Словене јер за сада не знамо шта се даље догађало.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Август 11, 2023, 12:11:58 пре подне
И ја сам мислио раније да је хаплогрупа I опстала у Франко-Кантабријском рефугијуму током LGM-а. Али за сада нема Солитрејаца са хаплогрупом I. За сада је само хаплогрупа C пронађена код њих. Они до душе јесу били потомци Граверијанаца који јесу имали и хаплогрупу I уз хаплогрупу C, али Граверијанаца нису били аутозомално хомогени него су имали два генетска пола: западни Фурнол и источни Вјестонице. Хаплогрупа I је за сад пронађена само код узорака који имају ову источну генетику која није преживела LGM.

Даље, након LGM-а имамо Магдаленаску групу која има и I2-P37 и C, али сви узорци ове групе већ имају Вилабруна генетику. А није тачно ни да је у Вилабруна кластери била заступљена само грана I2a2-M436 хаплогрупе I јер имамо узорак PRD001 из овог кластера који припада хаплогрупи I2a1a-P37.2.

Кад причамо о Солитрејцима, хаплогрупа C није пронађена код њих, него код њега. Код једног јединог мушког Солитрејца чији узорак није контаминиран. Сви најстарији палеолитски P37 узорци (њих десет комада) су из Западне Европе, не постоји ниједан на Балкану и у Источној Европи који је старији од Мезолита. И ти мезолитски P37 узорци из Лепенског Вира и Украјине, као и поменути PRD001 могу се објаснити ширењем Магдаленијске културе на исток.


Дакле, мислим да хаплогрупа I2a1 долази из правца Балкана јужном рутом у Франко-Кантабријски рефугијум одмах након LGM-а, а да пре тога на западу није постојала. Свакако не мислим да је целокупна хаплогрупа I2a1 мигрирали него само један њен део.

Поштујем свачије право на мишљење, али за ово што си написао не постоји ниједан једини археогенетички доказ.


Међутим то је све далека прошлост. Ако се вратимо у енеолиту и рано бронзано доба и видимо да се у Румунији и Бугарској појављују све веће бочне гране од L621 до CTS10228 и узмемо у обзир TMRCA гране L621 од 6500 година, као и гране CTS10228 од 3400 година, према YFull-у, можемо доћи до закључка да је у периоду од позног бакарног до раног бронзаног доба предак гране CTS10228 живео негде на источном Балкану. То и даље не искључује Келте и Словене јер за сада не знамо шта се даље догађало.

Није тачно да се у енеолиту и раном бронзаном добу Румуније и Бугарске појављују "све веће бочне гране од L621 до CTS10228". Појављују се четири L621 узорка, сви негативни на гране које воде до CTS10228 (CTS10936,S19848,CTS4002), један S19848, такође негативан на CTS4002, и један CTS4002 негативан на CTS10228. Не појављује се ни CTS10228, нити иједна од бочних грана (Y45825, Y85772, Y44949, FGC20479 и Y81696), а са друге стране све наведене гране се појављују у Западној Европи, па ме занима каквом логичком егзибицијом би објаснио овакву разноврсност грана испод L621 на том простору ако је миленијумима боравила у Румунији и Бугарској? Разноврсност је један ид кључних показатеља области настанка и демографског ширења неке хаплогрупе/гране, и та разноврсност у случају L621 је убедљиво на страни Западне Европе, просто јер је на Балкану и у Источној Европи та разноврсност непостојећа, тј. 100% тестираних припада само једном јако младом огранку (Y3120).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Август 11, 2023, 01:01:37 поподне
Кад причамо о Солитрејцима, хаплогрупа C није пронађена код њих, него код њега. Код једног јединог мушког Солитрејца чији узорак није контаминиран. Сви најстарији палеолитски P37 узорци (њих десет комада) су из Западне Европе, не постоји ниједан на Балкану и у Источној Европи који је старији од Мезолита. И ти мезолитски P37 узорци из Лепенског Вира и Украјине, као и поменути PRD001 могу се објаснити ширењем Магдаленијске културе на исток.

Има их још ако се убрајају у ову категорију и граветијански узорци који упадају у аутозомални Фурнол кластер и директни су преци Солитрејаца. За целу ову групу важи за сада да није пронађена хаплогрупа I, мада ту могућност не искључујем у потпуности. Али њихов огранак хаплогрупе I не може бити I2-P37 из простог разлога што је TMRCA ове гране и гране I2-M436 само 21000 година према YFull-у тако да ове две гране готово сигурно потичу из истог рефугијума. То би евентуално могла бити грана I1.

Поштујем свачије право на мишљење, али за ово што си написао не постоји ниједан једини археогенетички доказ.

Ако се пажљивије погледа аутозомална слика одмах након LGM-а уочава се да се Магдалењани већ мешају са ловцима сакупљачима који долазе са истока (почевши већ од узорка Ел Мирон старог 19k) и да се померају према североистоку, према Француској и даље у унутрашњост Европе. Али ова популација се не сели на исток према Италији. Италију је већ колонизовала Вилабруна популација и тако остаје до неолита. Постепена колонизација се види и по аутозомалним подгрупама у које се могу сврстати узорци из Италије из позног палеолита и мезолита. При томе су се Магдалењани мешали са групом 2 (Arene Candide). https://www.nature.com/articles/s41586-023-05726-0#Fig3 (https://www.nature.com/articles/s41586-023-05726-0#Fig3) али тако што су се Вилабруњана групе 2 померали према западу а не у обрнутом смеру. Ова група је према мом мишљењу пренела хаплогрупу I2-P37 Магдалењанима. Узорак Pradis 1 јесте нешто млађи али је значајан јер припада базалној аутозомалној групи 1, па се може узети као археогенетски доказ моје тезе да је хаплогрупа I2-P37 потекла из балканског рефугијума.

Није тачно да се у енеолиту и раном бронзаном добу Румуније и Бугарске појављују "све веће бочне гране од L621 до CTS10228". Појављују се четири L621 узорка, сви негативни на гране које воде до CTS10228 (CTS10936,S19848,CTS4002), један S19848, такође негативан на CTS4002, и један CTS4002 негативан на CTS10228. Не појављује се ни CTS10228, нити иједна од бочних грана (Y45825, Y85772, Y44949, FGC20479 и Y81696), а са друге стране све наведене гране се појављују у Западној Европи, па ме занима каквом логичком егзибицијом би објаснио овакву разноврсност грана испод L621 на том простору ако је миленијумима боравила у Румунији и Бугарској? Разноврсност је један ид кључних показатеља области настанка и демографског ширења неке хаплогрупе/гране, и та разноврсност у случају L621 је убедљиво на страни Западне Европе, просто јер је на Балкану и у Источној Европи та разноврсност непостојећа, тј. 100% тестираних припада само једном јако младом огранку (Y3120).

Јесте разноврсност грана савремених људи на неком подручју добар показатељ порекла неке хаплогрупе али уме и да завара. Зато археогенетски узорци имају већу тежину. Није ни очекивано да се пронађу све ове гране које си набројао у узорцима из бакарног и раног бронзаног доба јер су то млађе гране. Моје мишљење је да је пре нешто више од 4000 година дошло до сеобе ове популације према западу. Тако да су гране које су данас скоро ексклузивно западноевропске настале у западној Европи након досељавања њихових предака са Балкана. Звучи мало вероватно али има доказа о томе и у другим гранама. Узми за пример ову моју: https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-PH18/tree (https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-PH18/tree). Узорци са Балкана и Турске се од западноевропске лозе одвајају пре око 4300 година. Наслућујем да је ова популација учествовала у етногенези Келта јер је са собом носила висок удео EEF генетике примећене као нарастајуће у средњем и позном бронзаном добу широм Европе, па чак и у Британији, што је један од кључних налаза из рада Large-scale migration into Britain during the Middle to Late Bronze Age. Зато мислим да хаплогрупа I-Y3120 и даље може имати везе са Келтима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Aca Август 21, 2023, 05:54:46 поподне
🔬 In a groundbreaking new study, researchers from the PACEA laboratory in Bordeaux, France, and from the Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology in Leipzig, Germany, analyzed DNA of 94 ancient individuals from a burial site at Gurgy ‘Les Noisats.’

🧬 Through autosomal, Y chromosomal, and mitochondrial DNA analysis they were able to construct the largest pedigree of ancient DNA to date, with 64 individuals over seven generations.

♂️  Each generation identified is almost exclusively linked to the previous generation through the biological father.

Y-DNA haplogroups G and H were both found at the burial site. Individuals with haplogroup H shared a common ancestor with individuals from Neolithic Ireland.

https://rdcu.be/dj2kR
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Август 22, 2023, 03:39:29 поподне
Haplogrupa H-P96 verovatno. Iako je bila prilično raširena u Evropi u neolitu (od Turske do Irske) jedva da ih je šačica preživela. Za razliku od G.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: filipi Август 25, 2023, 06:36:47 поподне
"Avgust 2023. donio je nekoliko uzoraka DNK u FTDNA iz studije Stolarek et al 2023. (uključujući Figlerowicza ). To je vrlo poznata tema/smjer slavenskog doba u odnosu na dinastiju Piast u Poljskoj"
https://lundiak.wordpress.com/2023/08/25/i2a-slavs-piasts-me-ydna/?fbclid=IwAR1g79EE3fucP2NrTVevGPFsAp3uvk_WzxFFXabL6jYQRl__jfE-RdGrhRw
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Август 29, 2023, 08:36:55 поподне
Нови рад на тему Медитерана у гвозденом добу. Међу Италицима изразито доминира R1b-U152. Занимљиво је да се хаплогрупа J2b-M241 јавља међу Картагињанима. E-V13 није пронађена ни у једном узорку.

https://www.nature.com/articles/s41559-023-02143-4 (https://www.nature.com/articles/s41559-023-02143-4)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Август 30, 2023, 01:25:05 поподне
H-Z5857 koji je boravio na Sardiniji u gvozdeno doba nema potomaka, ili rođaka, ni blizu Evrope danas. Nije pripadao većinskoj neolitskoj grani haplogrupe H. Uzorak koji je I-L160 i dalje ima rođaka na istom ostrvu. Nesaglediv je broj grana određenih haplogrupa koje su nestale kako su vekovi proticali.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Август 30, 2023, 02:37:20 поподне
H-Z5857 koji je boravio na Sardiniji u gvozdeno doba nema potomaka, ili rođaka, ni blizu Evrope danas. Nije pripadao većinskoj neolitskoj grani haplogrupe H. Uzorak koji je I-L160 i dalje ima rođaka na istom ostrvu. Nesaglediv je broj grana određenih haplogrupa koje su nestale kako su vekovi proticali.

Ту је и хаплогрупа R2 у етрурском контексту, ако сам добро протумачио локалитет на коме је овај узорак пронађен.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Август 30, 2023, 07:12:12 поподне
Ту је и хаплогрупа R2 у етрурском контексту, ако сам добро протумачио локалитет на коме је овај узорак пронађен.

Узорак је директно датиран на 150.5 calBCE - 3 calCE па може свашта да буде, с обзиром да је то већ време када је Рим увелико покорио многе територије на Медитерану.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Август 30, 2023, 07:34:14 поподне
Mislim da si ovdje u pravu, R1b uzorci su pronađeni samo na Ezeru i Bojanovu, i svi imaju visok udio stepe. Na ostalim nalazištima dominiraju I-L621 и I-L701 i autosomalno stepa je niska.

Možemo onda nagađati koliko dugo su koegzistirali, i da li se Jamnaja utopila u lokalce ili im nametnula svoj jezik?

Jedino se ne bih složio da je ova i2 populacija porijeklom od Černavode.

U Černavodi i Usatovu je prisutna R1b, autosomalno imaju visoku stepu i čak oko 20% Kavkasko-Anadolskog uticaja kojeg nema u Ezero kulturi. Čini se da su se ovdje odvijali neki sasim drugačiji procesi od onih u Ezeru.


Овде си можда био у праву. У централној Бугарској и Тракији је тада био актуелан Караново VII хоризонт који се појављује на теловима старијег Караново VI/Гумелница слоја али након хијатуса који је трајао скоро миленијум. Ако се не варам ова култура је коегзистирала са Езеро културом, али је имала сличности са претходним балканским културама а не са Јамном културом, као што је случај са Езеро културом.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Септембар 28, 2023, 12:27:16 поподне
Радови регистровани на ENA (European Nucleotide Archive) у претходна три мјесеца. Детаљнији подаци се могу наћи на сајту ENA помоћу доле наведених шифри.

Септембар 2023
2023-09-25 PRJEB66319 Genetic Continuity and Change Among the Indigenous Peoples of California
2023-09-21 PRJEB64656 Population Genomics of Late Stone Age Western Eurasia
2023-09-06 PRJEB60689 Multi-isotope and aDNA analyses reveal long-lasting continuity at the periphery of the late antique Roman Empire
2023-09-06 PRJEB55185 Genetic population structure of Xiongnu Empire at imperial and local scales
2023-09-01 PRJEB63184 Genetic Identification of Members of the Prominent Báthory Aristocratic Family

Август 2023
2023-08-18 PRJEB56570 High coverage genome of the Tyrolean Iceman reveals unusually high Anatolian Farmer ancestry
2023-08-18 PRJEB65098 Elevated genetic risk for multiple sclerosis originated in Steppe Pastoralist populations
2023-08-18 PRJEB65118 Biological and substitute parents in Beaker period adult-child graves
2023-08-15 PRJEB61777 Male-specific Y-chromosome data for a Tai-Kadai speaking Southern Thai group

Јули 2023
2023-07-14 PRJEB61655 Ancient DNA from ancient Canarian Islanders illuminates the prehistory of North Africa and evidences the effects of insularity on human populations
2023-07-31 PRJEB51863 Genomic history of coastal societies from eastern South America
2023-07-09 PRJEB58428 Copper Age Alps
2023-07-04 PRJEB48333 Biological history of the human populations inhabiting Central Europe in the first ages of the common era
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Октобар 03, 2023, 06:20:09 пре подне
Неколико новијих радова са Biorxiv

Genomic analyses correspond with deep persistence of peoples of Blackfoot Confederacy from glacial times
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.09.25.559300v1

Bronze Age Northern Eurasian Genetics in the Context of Development of Metallurgy and Siberian Ancestry
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.10.01.560195v1

Ancient genomes illuminate Eastern Arabian population history and adaptation against malaria
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.10.01.559299v1

Postglacial genomes from foragers across Northern Eurasia reveal prehistoric mobility associated with the spread of the Uralic and Yeniseian languages
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.10.01.560332v1

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Октобар 03, 2023, 06:34:56 пре подне
Postglacial genomes from foragers across Northern Eurasia reveal prehistoric mobility associated with the spread of the Uralic and Yeniseian languages
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.10.01.560332v1

Колико сам успио да видим, у овом раду, на подручју енеолитске културе Волосово регистрована су два I2 узорка, која припадају:
https://www.yfull.com/tree/I-S21825/
https://www.yfull.com/tree/I-Z161/

https://en.wikipedia.org/wiki/Volosovo_culture

Скоро смо говорили о повишеној WHG компоненти код балтичких народа. Да ли би ова култура могла бити преносилац WHG генетике у балске, а преко њих и у словенске народе?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Октобар 05, 2023, 10:56:05 поподне
Колико сам успио да видим, у овом раду, на подручју енеолитске културе Волосово регистрована су два I2 узорка, која припадају:
https://www.yfull.com/tree/I-S21825/
https://www.yfull.com/tree/I-Z161/

https://en.wikipedia.org/wiki/Volosovo_culture

Скоро смо говорили о повишеној WHG компоненти код балтичких народа. Да ли би ова култура могла бити преносилац WHG генетике у балске, а преко њих и у словенске народе?

I-S21825 је била најзаступљенија грана хаплогрупе I у Тшињецкој култури. Да цитирам Црну Гују:

Управо заврших прегледање свих I2 узорака из ове студије. Резултат:

I2a1a1b-S21825>Y4213>Y4192>L1287>pre-L233 (https://www.yfull.com/tree/I-L233/): 12 узорака

I2a2b-S2555>Y10720>S2519>S2524>L38 (https://www.yfull.com/tree/I-L38/): 2 узорка

I2a2a-M223>CTS616>Y3721>Y3670>L1229 (https://www.yfull.com/tree/I-L1229/): 1 узорак

I2a1b-CTS10228>Y3120: 0 узорака

Не знам само колико је узорак Волосово културе удаљен филогенетски од узорака из Тшињецке културе?

Аутори рада о Тшињецкој култури су такође изнели претпоставку да би популација која је у Тшињецку културу унела повишену WHG генетику могла да потиче из субнеолитске шумске зоне која се поклапа са ареалом Волосово културе, као што се види на картама на овом линку из рада https://www.nature.com/articles/s41467-023-40072-9/figures/1 (https://www.nature.com/articles/s41467-023-40072-9/figures/1).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Октобар 05, 2023, 11:48:16 поподне
I-S21825 је била најзаступљенија грана хаплогрупе I у Тшињецкој култури. Да цитирам Црну Гују:

Не знам само колико је узорак Волосово културе удаљен филогенетски од узорака из Тшињецке културе?

Аутори рада о Тшињецкој култури су такође изнели претпоставку да би популација која је у Тшињецку културу унела повишену WHG генетику могла да потиче из субнеолитске шумске зоне која се поклапа са ареалом Волосово културе, као што се види на картама на овом линку из рада https://www.nature.com/articles/s41467-023-40072-9/figures/1 (https://www.nature.com/articles/s41467-023-40072-9/figures/1).

Проверио сам I2-S21825 узорке Волосовске културе, и сви припадају грани https://www.yfull.com/tree/I-FT344596/ (https://www.yfull.com/tree/I-FT344596/), дакле врло су филогенетички удаљени од гране L233 која је била доминантна међу узорцима Тшињецке културе. Волосовска култура свакако није никад ни била озбиљан кандидат за специфичну WHG компоненту међу Словенима (тзв. Балто-Словенски дрифт) због приличне географске удаљености у односу на прапостојбину Словена, а и због тога што су поседовали велики удео EHG аутосомалне компоненте (источноевропски ловци-сакупљачи). Пре неколико месеци је један корисник на сада угашеној Антрогеници поставио мапу субнеолитичких култура које обухватају простор Балтика, Белорусије, источне Пољске и северне Украјине, и баш је за једну од њих нагласио да је по његовом мишљењу најбољи кандидат за ту специфичну WHG популацију. Не могу тренутно да се сетим имена, али покушаћу да пронађем мапу јер мислим да сам је сачувао негде на лап-топу. Оно што је занимљиво је да су најстарији узорак који припада грани L233 (Spiginas1 4442-4243 п.н.е.) и најстарији узорак који поседује балто-словенски дрифт (Spiginas2 2132-1749 п.н.е.) пронађени на истом налазишту у Литванији, па мислим да свакако ту мистериозну WHG популацију треба тражити управо на горенаведеном подручју Балтик-Белорусија-северна Украјина.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Октобар 06, 2023, 06:45:14 пре подне
Проверио сам I2-S21825 узорке Волосовске културе, и сви припадају грани https://www.yfull.com/tree/I-FT344596/ (https://www.yfull.com/tree/I-FT344596/), дакле врло су филогенетички удаљени од гране L233 која је била доминантна међу узорцима Тшињецке културе. Волосовска култура свакако није никад ни била озбиљан кандидат за специфичну WHG компоненту међу Словенима (тзв. Балто-Словенски дрифт) због приличне географске удаљености у односу на прапостојбину Словена, а и због тога што су поседовали велики удео EHG аутосомалне компоненте (источноевропски ловци-сакупљачи). Пре неколико месеци је један корисник на сада угашеној Антрогеници поставио мапу субнеолитичких култура које обухватају простор Балтика, Белорусије, источне Пољске и северне Украјине, и баш је за једну од њих нагласио да је по његовом мишљењу најбољи кандидат за ту специфичну WHG популацију. Не могу тренутно да се сетим имена, али покушаћу да пронађем мапу јер мислим да сам је сачувао негде на лап-топу. Оно што је занимљиво је да су најстарији узорак који припада грани L233 (Spiginas1 4442-4243 п.н.е.) и најстарији узорак који поседује балто-словенски дрифт (Spiginas2 2132-1749 п.н.е.) пронађени на истом налазишту у Литванији, па мислим да свакако ту мистериозну WHG популацију треба тражити управо на горенаведеном подручју Балтик-Белорусија-северна Украјина.

Овако како си описао, једине које би одговарале су култура Нарва, и културе које су из ње проистекле: Rzucewo_culture и Brushed Pottery culture.
Ове двије потоње се везују за протобалтску етногенезу. Нарва је у сваком случају била доминантно WHG.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Октобар 27, 2023, 08:38:57 поподне
Балкански рефугијум?https://www.nature.com/articles/s41586-023-05726-0/figures/14
(https://media.springernature.com/full/springer-static/esm/art%3A10.1038%2Fs41586-023-05726-0/MediaObjects/41586_2023_5726_Fig14_ESM.jpg)

Читао сам данас поново овај рад. Мање више сам разумио њихове главне тезе. И ова шема је прилично сликовита и јасна.

Ипак једна ствар ми до краја није јасна, а то је поријекло самог Вилабруна кластера. Они претпостављају (не тврде, јер још увијек немају археогенетичких доказа) да је балкански рефугијум био извориште Вилабруна кластера. Међутим, уколико је то тачно, сљедеће питање би било: откада је овај кластер на Балкану? Да ли је он на Балкану био и током pre-LGM периода. Узимајући у обзир присуство хаплогрупе I у Вестонице кластеру у периоду од око 30.000 пне, да ли би то значило да је популација која је донијела хаплогрупу I у Европу, дошла у Европу са неким pre-Вилабруна кластером преко Балкана, почетком Граветијена. При чему би присуство хаплогрупе I у Вестонице кластеру било само блиједа слика много већег присуства ове хаплогрупе на Балкану у том истом периоду ( а зашта немамо ниједан узорак за сада). У раду такође помињу блискоисточну примјесу у Вилабруна кластеру. Можда би та иницијална популација која је дошла са Блиског истока и донијела хаплогрупу I у Европу, могла објаснити и период цијепања на нивоу IJ хаплогрупе.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Октобар 27, 2023, 10:31:23 поподне
Читао сам данас поново овај рад. Мање више сам разумио њихове главне тезе. И ова шема је прилично сликовита и јасна.

Ипак једна ствар ми до краја није јасна, а то је поријекло самог Вилабруна кластера. Они претпостављају (не тврде, јер још увијек немају археогенетичких доказа) да је балкански рефугијум био извориште Вилабруна кластера. Међутим, уколико је то тачно, сљедеће питање би било: откада је овај кластер на Балкану? Да ли је он на Балкану био и током pre-LGM периода. Узимајући у обзир присуство хаплогрупе I у Вестонице кластеру у периоду од око 30.000 пне, да ли би то значило да је популација која је донијела хаплогрупу I у Европу, дошла у Европу са неким pre-Вилабруна кластером преко Балкана, почетком Граветијена. При чему би присуство хаплогрупе I у Вестонице кластеру било само блиједа слика много већег присуства ове хаплогрупе на Балкану у том истом периоду ( а зашта немамо ниједан узорак за сада). У раду такође помињу блискоисточну примјесу у Вилабруна кластеру. Можда би та иницијална популација која је дошла са Блиског истока и донијела хаплогрупу I у Европу, могла објаснити и период цијепања на нивоу IJ хаплогрупе.

Моје је мишљење да је Вилабруна кластер настао кад се мањи број преживелих Граветијанаца током LGM-а помешао са ANE популацијом. Исто важи и за Сиделкино кластер. Стицајем околности Вилабруна популација задржава висок удео хаплогрупе I, иако је имала и хаплогрупу R1b у својим редовима. Можда је по среди била и природна селекција. У сваком случају, тренутно знамо за само два мушкарца носиоца хаплогрупе I који су живели пре 21.500 година (што је време када престаје Граветијанска и настаје Епиграветијанска култура током LGM-a), а који имају данас потомке по директној мушкој линији, а то су родоначелници хаплогрупа I1 и I2. А и они су већ тада били далеки рођаци па не можемо сасвим бити сигурни за овог првог да је био у друштву овог другог. Блискоисточне примеса у Вилабруна кластеру је могла доћи са носиоцима хаплогрупе I који су можда само мањински додатак на Вилабруна/Сиделкино популацију.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Октобар 28, 2023, 07:27:45 пре подне
Моје је мишљење да је Вилабруна кластер настао кад се мањи број преживелих Граветијанаца током LGM-а помешао са ANE популацијом. Исто важи и за Сиделкино кластер. Стицајем околности Вилабруна популација задржава висок удео хаплогрупе I, иако је имала и хаплогрупу R1b у својим редовима. Можда је по среди била и природна селекција. У сваком случају, тренутно знамо за само два мушкарца носиоца хаплогрупе I који су живели пре 21.500 година (што је време када престаје Граветијанска и настаје Епиграветијанска култура током LGM-a), а који имају данас потомке по директној мушкој линији, а то су родоначелници хаплогрупа I1 и I2. А и они су већ тада били далеки рођаци па не можемо сасвим бити сигурни за овог првог да је био у друштву овог другог. Блискоисточне примеса у Вилабруна кластеру је могла доћи са носиоцима хаплогрупе I који су можда само мањински додатак на Вилабруна/Сиделкино популацију.

Граветијански узорци из Кремса који носе хаплогрупу I (има их три ако се не варам) и узорак из Вестоница DLV005 који је такође I, стари су око 30.000 година. Дакле присуство хаплогрупе I у Европи у Граветијену, тј. у периоду прије LGM није спорно. Међутим у Граветијанској Европи не доминира хаплогрупа I већ хаплогрупа C. Иако ови узорци из Кремса и Вестоница носе хаплогрупу I, аутосомално они припадају Vestonice кластеру, за који у раду наводе да је током LGM изумро. Вилабруна кластер је ипак нешто друго у односу на Вестонице кластер. Вилабруна нема ANE компоненту, не види се у њој ни траг Вестонице/Костенки компоненте, међутим свакако је повезана са Fornuol или Goyet-Q116 кластером, али не само са њим. Недостаје нам нека, могло би се рећи "ghost population" која је живјела на Балкану, током Граветијенског периода (дакле прије LGM), која је била богата I хаплогрупом (да не кажем да је вјероватно хаплогрупа I у оквиру ње и настала), која је у мањем проценту свој генетски материјал дала и епипалеолитској популацији Анадолије (отуд та веза Блиски исток-Вилабруна).

Ово је наравно само моје слободно размишљање на тему, не нека изричита тврдња.

 
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Октобар 28, 2023, 09:21:43 пре подне
Кластер Вестонице би се могао добро измоделовати не само као мјешавина Goyet-Q116 и Kostenki како је у раду приказано, већ као тројна мјешавина Goyet-Q116, Kostenki и pre-Villаbruna кластер. То би објаснило и рано присуство хаплогрупе I у кластеру Вестонице.

У том случају би на подручју граветијанске pre-LGM Европе имали три популације: Goyet-Q116 у западној Европи, Kostenki у источној Европи и pre-Villаbruna на Балкану. До данас је успјело да опстане само Villаbruna генетичко наслеђе, али и оно у прилично симболичним омјерима. Код савремених Срба не прелази 10%.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Октобар 28, 2023, 11:17:12 пре подне
Граветијански узорци из Кремса који носе хаплогрупу I (има их три ако се не варам) и узорак из Вестоница DLV005 који је такође I, стари су око 30.000 година. Дакле присуство хаплогрупе I у Европи у Граветијену, тј. у периоду прије LGM није спорно. Међутим у Граветијанској Европи не доминира хаплогрупа I већ хаплогрупа C. Иако ови узорци из Кремса и Вестоница носе хаплогрупу I, аутосомално они припадају Vestonice кластеру, за који у раду наводе да је током LGM изумро. Вилабруна кластер је ипак нешто друго у односу на Вестонице кластер. Вилабруна нема ANE компоненту, не види се у њој ни траг Вестонице/Костенки компоненте, међутим свакако је повезана са Fornuol или Goyet-Q116 кластером, али не само са њим. Недостаје нам нека, могло би се рећи "ghost population" која је живјела на Балкану, током Граветијенског периода (дакле прије LGM), која је била богата I хаплогрупом (да не кажем да је вјероватно хаплогрупа I у оквиру ње и настала), која је у мањем проценту свој генетски материјал дала и епипалеолитској популацији Анадолије (отуд та веза Блиски исток-Вилабруна).

Ово је наравно само моје слободно размишљање на тему, не нека изричита тврдња.

Већ смо Никац и ја на овој теми (https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=7229.msg190982#msg190982) дискутовали о присуству ANE генетике у Вилабруна популацији. Изгледа да је неких утицаја било али након LGM-а. Тако да си у праву што се тиче ANE компоненте. Мислим да се хаплогрупа I пре LGM-а простирала од централне Европе на северозападу до Ирана на југоистоку и на том потезу је била вероватно и та пре-WHG популација. Дефинитивно недостаје ту негде неки аутозомални кластер који би објаснио WHG. Можда није у питању Балкан, него Грузија или Анадолија Једино ми овде није јасно како видиш везу са Fornuol или Goyet-Q116 кластерима?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Октобар 28, 2023, 11:44:06 пре подне
Додао бих још и да ми је интересантна блискост Сиделкино (EHG) и Вилабруна (WHG) популација. Можда постоји и нека дубља веза, осим доказаног ширења WHG на исток већ у раном Холоцену. Занимљиво је и да је J1 једна од хаплогрупа које су пронађене у Сиделкино кластеру.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Октобар 28, 2023, 11:51:46 пре подне
Већ смо Никац и ја на овој теми (https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=7229.msg190982#msg190982) дискутовали о присуству ANE генетике у Вилабруна популацији. Изгледа да је неких утицаја било али након LGM-а. Тако да си у праву што се тиче ANE компоненте. Мислим да се хаплогрупа I пре LGM-а простирала од централне Европе на северозападу до Ирана на југоистоку и на том потезу је била вероватно и та пре-WHG популација. Дефинитивно недостаје ту негде неки аутозомални кластер који би објаснио WHG. Можда није у питању Балкан, него Грузија или Анадолија Једино ми овде није јасно како видиш везу са Fornuol или Goyet-Q116 кластерима?

Fornuol или Goyet-Q116 је подлога на коју се калемило pre-Villabruna наслеђе. Зато и разликујем граветијанско (pre-LGM) pre-Villabruna наслеђе од класичног епиграветијанског Villabruna кластера. Епиграветијанска Villabruna популација је по мени већ мијешана и у различитим процентима садржи и дио Fornuol или Goyet-Q116 наслеђа. Проблем је само што ми у овом тренутку немамо ниједан pre-Villabruna узорак, па нам онда и сама Villabruna  у односу на Fornuol или Goyet-Q116 изгледа као чист кластер.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Октобар 28, 2023, 12:38:22 поподне
Fornuol или Goyet-Q116 је подлога на коју се калемило pre-Villabruna наслеђе. Зато и разликујем граветијанско (pre-LGM) pre-Villabruna наслеђе од класичног епиграветијанског Villabruna кластера. Епиграветијанска Villabruna популација је по мени већ мијешана и у различитим процентима садржи и дио Fornuol или Goyet-Q116 наслеђа. Проблем је само што ми у овом тренутку немамо ниједан pre-Villabruna узорак, па нам онда и сама Villabruna  у односу на Fornuol или Goyet-Q116 изгледа као чист кластер.

Мислим да би се pre-Villabruna могао вјештачки моделовати, кад би нашим мезолитским ђердапским узорцима, изузели ANE дио генетике (а то је неких 10%) и оно што би остало било би pre-Villabruna. У односу на класичну Vilabrunna, pre-Villabruna стоји незнатно источније (према Анадолији) или боље рећи да класична Vilabrunna као дериватив стоји нешто западније у односу на pre-Villabruna. Класична епиграветијенска Вилабруна би се могла моделовати као: 90% pre-Vilabrunna+10% Goyet-Q116.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Октобар 28, 2023, 01:19:48 поподне
Мислим да би се pre-Villabruna могао вјештачки моделовати, кад би нашим мезолитским ђердапским узорцима, изузели ANE дио генетике (а то је неких 10%) и оно што би остало било би pre-Villabruna. У односу на класичну Vilabrunna, pre-Villabruna стоји незнатно источније (према Анадолији) или боље рећи да класична Vilabrunna као дериватив стоји нешто западније у односу на pre-Villabruna. Класична епиграветијенска Вилабруна би се могла моделовати као: 90% pre-Vilabrunna+10% Goyet-Q116.

Наводно је узорак Pradis 1 најбазалнији епиграветијански узорак. Не знам да ли због ниског удела Goyet-Q116 компоненте.

Цитат
Next, we investigated the genetic relationships between Epigravettian-associated individuals across the Italian peninsula, by reconstructing a phylogeny based on a matrix of pairwise f2 genetic distances (Fig. 3a and Supplementary Fig. 9) and testing the relative affinity among them using f4-statistics in the form f4(Mbuti, Epigravettian A; Epigravettian B, Epigravettian C) (Supplementary Data 2.E). The inferred topology reveals a phylogeographic pattern irrespective of individual ages. In particular, the 13 ka Pradis 1 individual from northeastern Italy represents the most basal lineage compared to all other Epigravettian-associated individuals, including the older Tagliente 2 and Villabruna genomes from northern Italy (group 1). Individuals from northwestern Italy (Arene Candide 16), central Italy (Continenza) and Sicily fall on a phylogenetically more derived branch (group 2), which further diversified into a branch composed of Sicilian hunter-gatherers only (group 3). Within Sicily, the 14 ka Oriente C individual shows higher affinity with the much younger but geographically closer 10 ka Uzzo group30 (n = 2) than with the almost contemporaneous San Teodoro 2 individual from eastern Sicily.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Октобар 28, 2023, 01:34:36 поподне
Наводно је узорак Pradis 1 најбазалнији епиграветијански узорак. Не знам да ли због ниског удела Goyet-Q116 компоненте.

Могуће, међутим немам овај узорак разбијен на G25scaled координате, па не могу провјерити.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Октобар 28, 2023, 01:38:52 поподне
Мислим да би се pre-Villabruna могао вјештачки моделовати, кад би нашим мезолитским ђердапским узорцима, изузели ANE дио генетике (а то је неких 10%) и оно што би остало било би pre-Villabruna. У односу на класичну Vilabrunna, pre-Villabruna стоји незнатно источније (према Анадолији) или боље рећи да класична Vilabrunna као дериватив стоји нешто западније у односу на pre-Villabruna. Класична епиграветијенска Вилабруна би се могла моделовати као: 90% pre-Vilabrunna+10% Goyet-Q116.

У сваком случају, недостају нам узорци из LGM-а за Вилабруна кластер. С обзиром да тада Јадранско море скоро да није ни постојало јер је ниво морске обале био око 150 метара нижи него данас, вероватно су остаци људи из те популације данас претежно на дну мора. Мислим да се ипак не може тврдити да су Вилабруњани имали баш Fornuol или Goyet-Q116 компоненте. Можда би се Вилабруна исто тако могао моделовани као 90% пре-Вилабруна + 10% Вестонице?

Цитат
In the MDS plot, we find that all of the newly and previously reported Epigravettian-associated individuals fall within the Villabruna cluster (Fig. 1c). A series of f4-symmetry statistics confirm that all the Epigravettian-associated individuals are cladal, and do not share excess affinity with any local (Paglicci 12) or non-local preceding ancestries (Goyet Q116-1, Kostenki 14, Mal’ta 1 or Věstonice) (Supplementary Data 2.F). Moreover, none of the Epigravettian-associated individuals have more affinity to southern European than to central-eastern European Gravettian-associated groups, as shown by f4(Mbuti, Epigravettian-associated individual/group; Věstonice, Paglicci 12) that is consistent with 0 (Supplementary Data 2.G).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Октобар 28, 2023, 01:55:59 поподне
У сваком случају, недостају нам узорци из LGM-а за Вилабруна кластер. С обзиром да тада Јадранско море скоро да није ни постојало јер је ниво морске обале био око 150 метара нижи него данас, вероватно су остаци људи из те популације данас претежно на дну мора. Мислим да се ипак не може тврдити да су Вилабруњани имали баш Fornuol или Goyet-Q116 компоненте. Можда би се Вилабруна исто тако могао моделовани као 90% пре-Вилабруна + 10% Вестонице?

Они су свакако посебна популација, оно што добијам када убацим све претходне кластере и Вилабруну, јесте тај неки мали дио од 10% Goyet-Q116 наслеђа. Примјетићеш и на графику горе постављеном из рада да и они такође наводе да се Вилабруна мијешала са Fornuol-ом, али од Kostenki-Vestonice није наслиједила ништа. То не значи да прије LGM негдје на границама  pre-Villabruna кластера и Костенки-Вестонице кластера није долазило до мијешања те двије популације, већ сам поменуо да је Вестонице хибрид све три популације, гдје је Костенки компонента била најдоминатнија. Међутим, те популације које су се мијешале са Костенки, једноставно нису преживјеле LGM.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Октобар 28, 2023, 02:12:28 поподне
Додао бих још и да ми је интересантна блискост Сиделкино (EHG) и Вилабруна (WHG) популација. Можда постоји и нека дубља веза, осим доказаног ширења WHG на исток већ у раном Холоцену. Занимљиво је и да је J1 једна од хаплогрупа које су пронађене у Сиделкино кластеру.

Већ у Сиделкино узорку имамо присуство CHG генетике, не превише (до 10%) али довољно да неке Y-DNA линије продру у популацију. Може се само поставити питање, када је на истоку Европе CHG ушао у ову суштински ANE популацију ? Свакако још током мезолита. При чему су удјели CHG регионално могли варирати (од нижих процената на сјеверозападу до виших јужније ближе Кавказа). Присуство хаплогрупа, попут Ј у Карелији, не мора стриктно кореспондирати са аутосомалним присуством ове CHG компоненте.

При чему бих рекао да ми се чини да је прво дошло до мијешања Вилабруне и ANE популације, а да је тек накнадно у тако мијешану популацију продрло и нешто CHG. Код наших ђердапских мезолитских узорака не видим да има ове CHG компоненте, али има ANE.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Октобар 28, 2023, 02:35:37 поподне
Они су свакако посебна популација, оно што добијам када убацим све претходне кластере и Вилабруну, јесте тај неки мали дио од 10% Goyet-Q116 наслеђа. Примјетићеш и на графику горе постављеном из рада да и они такође наводе да се Вилабруна мијешала са Fornuol-ом, али од Kostenki-Vestonice није наслиједила ништа. То не значи да прије LGM негдје на границама  pre-Villabruna кластера и Костенки-Вестонице кластера није долазило до мијешања те двије популације, већ сам поменуо да је Вестонице хибрид све три популације, гдје је Костенки компонента била најдоминатнија. Међутим, те популације које су се мијешале са Костенки, једноставно нису преживјеле LGM.

На графику горе се види мешање Вилабруна популације и Фурнол популације, која је наследник Goyet-Q116, али је то представљено у жељи да се илуструје генеза GoyetQ-2 кластера који се ширио из југозападне Европе на север и североисток. Овај кластер се повезује са магдаленском културом. Ако се Goyet-Q116 добија као компонента за Вилабруна онда је то неки сигнал временски прилично далеког мешања, пошто је овај кластер прилично стар - 35 ka, Aurignacian-associated from Belgium, па може указивати на даље порекло пре-Вилабруна популације, пре леденог доба.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Октобар 28, 2023, 02:56:41 поподне
Видех сад да на графику горе постоји и ова популација скроз лево, која такође представља микс Вилабруна и Фурнила. Мислим да она представља Иберијско ловце-сакупљаче. Међутим, за ловце-сакупљаче из Италије не видим да постоји доказ о мешању са Фурнол популацијом.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Октобар 29, 2023, 12:56:24 поподне
Изгледа да веза Вилабруна и Goyet-Q116 потиче од Bacho Kiro 1653. Ево пар интересантних цитата из допунског материјала уз овај рад:

Цитат
Interestingly, we also detect minor Near Eastern affinities in pre-LGM populations associated with the Věstonice cluster, like the Věstonice group and Paglicci 12. This could be explained by a portion of shared genetic ancestry between the Villabruna and Věstonice ancestries as described in Fu et al., 2016. Moreover, considering that both Gravettian and Epigravettian cultures were also found in the Balkans, and that the 35k-year-old Bacho Kiro 1653 individual from Bulgaria has been proposed to contribute genetically to the Věstonice population, we speculate that this signal is most likely related to a deep genetic link between the Near East and the Balkans. We specifically test this hypothesis using qpGraph modelling as described in Supplementary section 10. Notably, this link has also been suggested in previous studies, based on the Near Eastern affinity found in Mesolithic hunter-gatherers from the Iron Gates in the Balkans.

Цитат
We then fit Villabruna on this graph. Interestingly, we find that the best fitted model suggests
Villabruna to result from the admixture between a Věstonice-related lineage and a branch that is basal to the split between Kostenki 14 and Goyet Q116-1 genomes. The shared part of ancestry
between Věstonice and Villabruna is related to BK-1653 and could potentially explain the affinity
between these two ancestries observed in Fu et al., 2016 with qpGraph modelling. This suggests that the previously identified shared genetic ancestry in the Věstonice and Villabruna clusters might trace back to pre-30k populations from the Balkans.

Финални граф се налази на страни 99.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Октобар 29, 2023, 05:36:05 поподне
Рекао бих да су неки трагови (али баш трагови) Goyet-Q116 генетичког наслеђа остали присутни код двије најархаичније европске популације: Сардинаца и Баска. Постоји једна компонента у њиховој генетици из WHG палете која управо на ова два подручја достиже своје максимуме, уз нешто ниже проценте код околних популација Шпанаца и Јужних Француза, а која је практично одсутна код других европских народа.

Није чудно што су те двије популације најдуже од свих успјеле одржати своје старе, неиндoевропске језике: баскијски (до данас) и палео-сардински (до античког периода).

Сардинци су свакако генетички архаичнији од Баска, јер су једина популацијa у Европи која уопште не посједује ANE генетичко наслеђе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Октобар 29, 2023, 05:51:40 поподне
И постоји још једна ствар коју сам примјетио, прегледајући аутосомалне компоненте савремених популација, а то је да код Грка, па и и у јужној Италији гдје је Грка некад било, постоји неки ANE уплив који уопште не садржи EHG компоненту и који прилично извјесно није дошао преко Балкана. Такође није то ни индо-иранска источна варијанта ANE наслеђа, које ту и тамо има по Блиском истоку, па се нађе и код Грка. Ова трећа компонента ANE уплива, чини ми се да је могла доћи само са подручја Кавказа. Прегледао сам нешто и старијих и савремених узорака. И рекао бих да тај неевропски и нејужноазијски ANE достиже највише проценте на подручју источнокавкаских језика,а у прошлости се чини да је био присутан и у културама Kura-Araxes i Maykop. Да ли је грчка варијанта овог посебног ANE наслеђа повезана са кавкаском, не бих знао рећи.

У вези са овим, пали су ми на памет изумрли индоевропски анадолски језици. Ако је ова компонента повезана са њима, онда говорници тих језика у Анадолију нису могли доћи преко Балкана, већ преко Кавказа.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Октобар 30, 2023, 09:40:35 поподне
И постоји још једна ствар коју сам примјетио, прегледајући аутосомалне компоненте савремених популација, а то је да код Грка, па и и у јужној Италији гдје је Грка некад било, постоји неки ANE уплив који уопште не садржи EHG компоненту и који прилично извјесно није дошао преко Балкана. Такође није то ни индо-иранска источна варијанта ANE наслеђа, које ту и тамо има по Блиском истоку, па се нађе и код Грка. Ова трећа компонента ANE уплива, чини ми се да је могла доћи само са подручја Кавказа. Прегледао сам нешто и старијих и савремених узорака. И рекао бих да тај неевропски и нејужноазијски ANE достиже највише проценте на подручју источнокавкаских језика,а у прошлости се чини да је био присутан и у културама Kura-Araxes i Maykop. Да ли је грчка варијанта овог посебног ANE наслеђа повезана са кавкаском, не бих знао рећи.

У вези са овим, пали су ми на памет изумрли индоевропски анадолски језици. Ако је ова компонента повезана са њима, онда говорници тих језика у Анадолију нису могли доћи преко Балкана, већ преко Кавказа.

Мислим да би хаплогрупа J-Z7671 могла бити маркер такве једне сеобе из Анадолије.

https://discover.familytreedna.com/y-dna/J-Z7671/tree (https://discover.familytreedna.com/y-dna/J-Z7671/tree)
https://www.yfull.com/tree/J-Z7671/ (https://www.yfull.com/tree/J-Z7671/)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Новембар 01, 2023, 05:10:04 поподне
Нови археогенетски рад баца светло на генезу Граветијанаца који изгледа потичу од популације која је из правца Украјине колонизовала Европу пре скоро 40.000 година https://www.nature.com/articles/s41559-023-02211-9?utm_medium=affiliate&utm_source=commission_junction&utm_campaign=CONR_PF018_ECOM_GL_PHSS_ALWYS_DEEPLINK&utm_content=textlink&utm_term=PID100052172&CJEVENT=23a57ec678d011ee828e010b0a18ba73 (https://www.nature.com/articles/s41559-023-02211-9?utm_medium=affiliate&utm_source=commission_junction&utm_campaign=CONR_PF018_ECOM_GL_PHSS_ALWYS_DEEPLINK&utm_content=textlink&utm_term=PID100052172&CJEVENT=23a57ec678d011ee828e010b0a18ba73).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 01, 2023, 08:24:32 поподне
Нови археогенетски рад баца светло на генезу Граветијанаца који изгледа потичу од популације која је из правца Украјине колонизовала Европу пре скоро 40.000 година https://www.nature.com/articles/s41559-023-02211-9?utm_medium=affiliate&utm_source=commission_junction&utm_campaign=CONR_PF018_ECOM_GL_PHSS_ALWYS_DEEPLINK&utm_content=textlink&utm_term=PID100052172&CJEVENT=23a57ec678d011ee828e010b0a18ba73 (https://www.nature.com/articles/s41559-023-02211-9?utm_medium=affiliate&utm_source=commission_junction&utm_campaign=CONR_PF018_ECOM_GL_PHSS_ALWYS_DEEPLINK&utm_content=textlink&utm_term=PID100052172&CJEVENT=23a57ec678d011ee828e010b0a18ba73).

Рекао бих по овим шемама и уводнику да се уклапају у постојеће профиле pre-LGM европског становништва.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 03, 2023, 06:39:51 пре подне
Неки од скоријих радова регистрованих на ENA

2023-10-27 PRJEB66365 Genome-wide data from individual from Borsuka Cave
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB66365

2023-10-31 PRJEB63275 The peopling of early Kyiv - beyond Vikings and the Mongolian invasion
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB63275
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Новембар 04, 2023, 02:54:26 поподне
Кластер Вестонице би се могао добро измоделовати не само као мјешавина Goyet-Q116 и Kostenki како је у раду приказано, већ као тројна мјешавина Goyet-Q116, Kostenki и pre-Villаbruna кластер. То би објаснило и рано присуство хаплогрупе I у кластеру Вестонице.

У том случају би на подручју граветијанске pre-LGM Европе имали три популације: Goyet-Q116 у западној Европи, Kostenki у источној Европи и pre-Villаbruna на Балкану. До данас је успјело да опстане само Villаbruna генетичко наслеђе, али и оно у прилично симболичним омјерима. Код савремених Срба не прелази 10%.

Ово је суштина. Чини се да је настанак ове три популације отрпилике истовремен и да потичу од заједничке предачке West Eurasian популације. Костенки учествује у генези ANE-a па њихово наслијеђе и данас постоји, док Goyet-Q116 касније постаје El-Miron кластер, којег до мезолитика постепено потпуно замјењује Villabruna, па се ова популација чини као слијепо цријево, барем што се тиче аутосомалне генетике.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Новембар 04, 2023, 05:10:18 поподне
И постоји још једна ствар коју сам примјетио, прегледајући аутосомалне компоненте савремених популација, а то је да код Грка, па и и у јужној Италији гдје је Грка некад било, постоји неки ANE уплив који уопште не садржи EHG компоненту и који прилично извјесно није дошао преко Балкана. Такође није то ни индо-иранска источна варијанта ANE наслеђа, које ту и тамо има по Блиском истоку, па се нађе и код Грка. Ова трећа компонента ANE уплива, чини ми се да је могла доћи само са подручја Кавказа. Прегледао сам нешто и старијих и савремених узорака. И рекао бих да тај неевропски и нејужноазијски ANE достиже највише проценте на подручју источнокавкаских језика,а у прошлости се чини да је био присутан и у културама Kura-Araxes i Maykop. Да ли је грчка варијанта овог посебног ANE наслеђа повезана са кавкаском, не бих знао рећи.

У вези са овим, пали су ми на памет изумрли индоевропски анадолски језици. Ако је ова компонента повезана са њима, онда говорници тих језика у Анадолију нису могли доћи преко Балкана, већ преко Кавказа.

Ради се свакако о Kura-Araxes/Maykop упливу, који G25 може разликовати од АNЕ. Најстарији узорци с овом примјесом у западној Анадолији и Гркој су из 5000-4000 п.н.е. (бакарно доба), и неки од њих су идентични каснијим минојским узорцима, тако да се вјероватно ради о прецима Минојаца, не Индоевропљанима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 04, 2023, 07:35:59 поподне
Ово је суштина. Чини се да је настанак ове три популације отрпилике истовремен и да потичу од заједничке предачке West Eurasian популације. Костенки учествује у генези ANE-a па њихово наслијеђе и данас постоји, док Goyet-Q116 касније постаје El-Miron кластер, којег до мезолитика постепено потпуно замјењује Villabruna, па се ова популација чини као слијепо цријево, барем што се тиче аутосомалне генетике.

Kostenki и ANE су двије различите популације. Да ли су проистекле из неке базалније заједничке популације је већ друго питање. Оно што је битно јесте да EHG нема Kostenki наслеђа. оно је изумрло у Европи током LGM. И у поменутом раду то констатују

"These data suggest that the genetic ancestries identified in the pre-40 ka individuals analysed so far went largely extinct or were assimilated by subsequent expansions. The Kostenki genetic signature (related to the Kostenki 14 genome, and hereafter referred to as the Kostenki cluster or ancestry) contributed to the later Věstonice genetic cluster (hereafter, Věstonice cluster or ancestry), named after the Dolní Věstonice site in Czechia. This genetic signature is shared among individuals associated with the archaeologically defined Gravettian culture (33–26 ka) in central and southern Europe and seemingly disappeared after the Last Glacial Maximum(LGM)." ..."

"Conversely, the ancestry found in pre-30 ka eastern European individuals (Kostenki cluster and Sunghir group) contributed to Gravettian-associated individuals from central and southern Europe (Věstonice cluster), the latter without descendants retrieved in post-LGM populations from those regions."

Укратко, чини се да су у Европи буквално изумрле све популације које су се налазиле сјеверно од Алпа, Карпата и Пиринеја. ANE наслеђе у источну Европу долази тек касније, након LGM-a ширећи се вјероватно из неког јужносибирског рефугијума. EHG представља мјешавину ових сибирских ANE досељеника са истока и европског WHG (Вилабруна кластера).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 04, 2023, 07:54:06 поподне
Ради се свакако о Kura-Araxes/Maykop упливу, који G25 може разликовати од АNЕ. Најстарији узорци с овом примјесом у западној Анадолији и Гркој су из 5000-4000 п.н.е. (бакарно доба), и неки од њих су идентични каснијим минојским узорцима, тако да се вјероватно ради о прецима Минојаца, не Индоевропљанима.

Мислиш од EHG? Јер ја сам говорио о ANE упливу у Kura-Araxes/Maykop који не потиче од EHG.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 04, 2023, 08:02:35 поподне
Иначе, што се тиче ANE популације мислим да су је погрешно негдје по интернету наводили као Kostenki/Tianyuan мјешавину. ANE највећим дијелом је дериват ANS популације (Ancient North Siberians) уз примјесу неке још увијек неоткривене евроазијске популације која је филогенетички најближа била CHG и Вилабруна кластеру.

Сам ANS је до те мјере базалан да га је бесмислено изводити као мјешавину било чега. Тј. популације чија би он био мјешавина нису нама познате у чистом налазу.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 05, 2023, 08:02:33 пре подне
Видим да је јуче Давидски на свом блогу објавио коментар на нови рад "Genetic identification of Slavs in Migration Period Europe using an IBD sharing graph", додуше само на апстракт овог рада. Претпостављам да рад још није интегрално објављен.

Апстракт се може прочитати у оквиру коментара Давидског
https://eurogenes.blogspot.com/2023/11/slavs-dont-have-much-if-any-scytho.html

Надам се рад доноси квалитетне закључке, с обзиром да видим да су кориштени IBD сегменти.

Занимљива је реченица коју је и сам Давидски подебљао (додуше негирајући значајнији сарматско/скитски уплив у Словене)
"According to PCA a hypothesis for the origin of this population can be proposed: it was formed by admixture of a Baltic-related group with East Germanic people and Sarmatians or Scythians."
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Новембар 05, 2023, 09:04:09 пре подне
Мислиш од EHG? Јер ја сам говорио о ANE упливу у Kura-Araxes/Maykop који не потиче од EHG.

Мислим на ово: Да ли је грчка варијанта овог посебног ANE наслеђа повезана са кавкаском

Дефинитивно јесте, на примјер у овом моделу за Минојце додавањем Kura-Araxesa дистанца пада на одличних 1.7, а неки додатни ANE није нити потребан.

(https://i.imgur.com/qdc0Ohq.png)

Иначе, што се тиче ANE популације мислим да су је погрешно негдје по интернету наводили као Kostenki/Tianyuan мјешавину. ANE највећим дијелом је дериват ANS популације (Ancient North Siberians) уз примјесу неке још увијек неоткривене евроазијске популације која је филогенетички најближа била CHG и Вилабруна кластеру.

Сам ANS је до те мјере базалан да га је бесмислено изводити као мјешавину било чега. Тј. популације чија би он био мјешавина нису нама познате у чистом налазу.

Да, мислио сам на ову старију студију у којој су навели овакав модел: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/423079v1.full

Сметнуо сам с ума ANS који је откривен у међувремену, али он не мијења много, само помиче настанак ове популације дубље у прошлост.
 
У студији о ANS https://www.biorxiv.org/content/10.1101/448829v1.fullANS ANS моделују као 75% Early West Eurasian и 25% Early East Asian, а за Early West Eurasian користе узорак Sunghir који је сличан Kostenki-ју.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 05, 2023, 09:23:11 пре подне
Мислим на ово: Да ли је грчка варијанта овог посебног ANE наслеђа повезана са кавкаском

Дефинитивно јесте, на примјер у овом моделу за Минојце додавањем Kura-Araxesa дистанца пада на одличних 1.7, а неки додатни ANE није нити потребан.

(https://i.imgur.com/qdc0Ohq.png)


Јасно ми је сада шта си хтио рећи.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Драган Обреновић Новембар 11, 2023, 03:26:26 поподне
Један занимљив детаљ, можда подударност, а можда и не.

Као припадници гране E-PH1173 DYS439=9 тестиране су Властелице из Липнице код Чачка које славе св. Враче. Поријеклом су из драгачевског села Властељица, гдје је о овом роду и имену села остало записано сљедеће предање:

"Кад је Сибињанин Јанко пропао с војском на Косову, и отуда се вратио сам самцит, преко планина и врлети, дође он у данашње село Властељицу једноме човеку на конак. To je било у очи светих Врачева који падају 1. новембра. Домаћин је био свечар. Јанка као путника прими он како је боље могао, и ако није знао ни ко је ни откуд је. За вечером дође време и здравицама. Између многих других гости капију и за здравље војводи Сибињанин Јанку, где је да је нека му је Бог помотњик, да сатре силу Турску!
То је Јанко и слушао и гледао али се није хтео казати.
Сутра дан пође да иде; домаћин га поведе, да га као непозната човека упути. На растанку Јанко се каже ко је и шта је било с његовом војском.
– Него хвала ти на дочеку, рекве он домаћину, – и да Бог да ти се власт никад не укратила, него да си богат и властан до века.
Тај се човек прозове после Властељица, али како су за Турака из те породице бивали кнезови, фамилија се та доцније прозове Кнежевићи?) а име Властељица остане селу и до данас."

Ево само да јавим да смо се Дејан Вукићевић и ја видели данас у Чачку управо са овим Властелицом (старо презиме Кнежевић) и узели узорак за Big Y-700 тест (FTDNA). Он је раније тестиран преко Друштва "Порекло", а према хаплотипу предвиђена му је припадност грани E-Y7168 (https://www.yfull.com/tree/E-Y7168/), којој припадају и Корвини, потомци Јанка Сибињанина/Хуњадија.

Када смо пре пар месеци били у Драгачеву да представљамо књигу о Херцеговцима, сазнали смо од тамо присутних представника рода Властелица, да је пре пар година извесно друштво/удружење из Мађарске долазило у посету селу Властељице, што је још једна интригантна околност која прати овај род.

Углавном, сазнаћемо за неколико месеци да ли су и у каквој вези драгачевски род Властелица и владарска династија Хуњади/Корвин.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Новембар 11, 2023, 04:06:06 поподне
Стварно били Мађари? Не би ме зачудило. Ономад када су се хецеговачки Марићи терстирали, није се резултат још ни охладио а већ су их контактирали Мађари (односно њу). Људи раде пос'о  ;D
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Exiled Новембар 11, 2023, 04:21:17 поподне
Стварно били Мађари? Не би ме зачудило. Ономад када су се хецеговачки Марићи терстирали, није се резултат још ни охладио а већ су их контактирали Мађари (односно њу). Људи раде пос'о  ;D
Штета што нема сарадње са Мађарима могло би бити обостране користи, заједничка историја нам је јако повезана.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Новембар 11, 2023, 11:58:43 поподне
Кад смо већ код Мађара, мислим да нисмо коментарисали још један рад о генетици становништва са обала Балатона. Овога пута није 6. него је 5. век. Проверавају мало Хуни, мада доминирају Ромеји и Германи. https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(23)01035-7?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0960982223010357%3Fshowall%3Dtrue (https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(23)01035-7?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0960982223010357%3Fshowall%3Dtrue)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Новембар 12, 2023, 12:07:58 пре подне
Још једна техничка занимљивост је да је не мали број узорака прошао WGS тест, а не само 1240K панел. Као што је наведено, сви WGS тестирани су имали очитан између осталог и сваки СНП из 1240K панела, уз још много других, подразумева се.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 22, 2023, 11:55:48 пре подне
Нови рад древне ДНК, јужни Тирол, касна антика-рани средњи вијек, 20 тестираних појединаца

Ancestry and kinship in a Late Antiquity-Early Middle Ages cemetery in the Eastern Italian Alps

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589004223022927

Колико видим, још нису поставили сирове резултате на мрежу.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 22, 2023, 12:48:45 поподне
Нови рад древне ДНК, јужни Тирол, касна антика-рани средњи вијек, 20 тестираних појединаца

Ancestry and kinship in a Late Antiquity-Early Middle Ages cemetery in the Eastern Italian Alps

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589004223022927

Колико видим, још нису поставили сирове резултате на мрежу.

Y хромозомалне хаплогрупе пронађене код тестираних појединаца из поменутог рада, са терминалним SNP-овима до којих су аутори успјели доћи. Мислим да ће се то моћи спустити још који ниво ниже када буду доступни геноми.

(https://i.postimg.cc/tJJYTV2S/tirol-ancient.png)

Било би интересантно видјети нижу грану од ових појединаца са хаплогрупом J, с обзиром да су појединци 2419 и 2423 вјероватно у односу отац/син и да представљају елитни дио те заједнице.

Сви узорци су са гробља у оквиру цркве San Stefano Burgusio
(https://lh3.googleusercontent.com/p/AF1QipNvDhP5K8ofoyu7IhnzbY_lnrF-OhIvFreMT1aS=s680-w680-h510)

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небојша Новембар 22, 2023, 03:34:43 поподне
У октобру ове године објављена је студија која потврђује неке раније резултате у вези норманске династије Монтгомери (11. век)

The human Y-Chromosome DNA haplogroup of the Norman kings of England and their families

Following the Battle of Hastings in 1066, Duke William II of Normandy, became the first Norman king of England. The Norman royal dynasty ruled for many years, but they had only three patrilineal kings hence it was believed that the House of Normandy had died out in the male line. However, William was a direct male descendant of Duke Rollo of the Normans. Rollo together with the members of the House of Boulogne and the House of Montgomery are descended from the Great Norse family of Ulvungar. The members of the Ulvungar dynasty are directly descended from the ancient Semitic peoples of Mesopotamia in the Fertile Crescent. The methodology followed in this work was to obtain a DNA sample from a living direct male descendant from the members of the Ulvungar dynasty, with well-accepted documentation to confirm their human Y-Chromosome DNA haplogroup. In this study, the test results of a DNA sample obtained from a living direct male descendant of the House of Montgomery, in addition to other supporting DNA samples, are analysed to confirm the Y- Chromosome DNA haplogroup of the Norman kings of England and their families. It was found that they are positive to the human Y-Chromosome DNA haplogroup J2 which can be shown to have originated in the Fertile Crescent.

(https://encrypted-tbn0.gstatic.com/images?q=tbn:ANd9GcTPoycDZPlmGvaH7X7wln4_wk9guDLjBntyFGtbra_L7zVR5Ozsx7JYwSDddvKGhHSrDbI&usqp=CAU)

Реч је иначе о подграни која се налази низводно J2a-Z6055>Y14439, а које има и код Срба (додуше далеки рођаци). Носе је, између осталих, они Кујунџићи и Милашиновићи из Дробњака. Милашиновићи се сматрају једним од најстаријих досељеника у Дробњак (из Бањана).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Христифор Новембар 22, 2023, 04:09:25 поподне
Вилијам Освајач је колико сам читао повезан преко женске  линије са  Монтгомеријима. Док се не обраде остаци самог Рола или Вилијама нећемо знати заиста да ли је то  хаплогрупа династије Нормана.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Новембар 22, 2023, 04:13:34 поподне
Ово је велика супер потврда и вијест, Небојша.   :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Exiled Новембар 22, 2023, 07:10:55 поподне
Ово је велика супер потврда и вијест, Небојша.   :)
О каквој се потврди ради? Тврдило се раније да су ови били J2a? Појасните мало ову констатацију.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Новембар 22, 2023, 07:45:03 поподне
Да.

3. децембра 2021. у 22:57

Nebojša
Upravo naiđoh i na informaciju da Montgomery klan u Škotskoj pripada istom rodu (ukoliko dobro vidim):
Lowland Scottish Clan Montgomery, whose chiefs have held the title of Earl of Eglinton since 1508 and of Earl of Winton since 1859, belongs to haplogroup J2a1-L26 > Z6064 > Z6055 > Z6057 > Y7013 > Y7010 > Y13128 > Y14434 > Y14439 > Y16842 > Y22056 (aka Z40262) according to the results from the Montgomery DNA Project. The clade’s most recent common ancestor lived approximately 550 years ago, and might correspond to Alexander Montgomerie (died 1470), 1st Lord Montgomerie.

U svakom slučaju, ja pripadam ovom rodu i planiram da uradim Big Y test.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Exiled Новембар 22, 2023, 07:57:20 поподне
Да.

3. децембра 2021. у 22:57

Nebojša
Upravo naiđoh i na informaciju da Montgomery klan u Škotskoj pripada istom rodu (ukoliko dobro vidim):
Lowland Scottish Clan Montgomery, whose chiefs have held the title of Earl of Eglinton since 1508 and of Earl of Winton since 1859, belongs to haplogroup J2a1-L26 > Z6064 > Z6055 > Z6057 > Y7013 > Y7010 > Y13128 > Y14434 > Y14439 > Y16842 > Y22056 (aka Z40262) according to the results from the Montgomery DNA Project. The clade’s most recent common ancestor lived approximately 550 years ago, and might correspond to Alexander Montgomerie (died 1470), 1st Lord Montgomerie.

U svakom slučaju, ja pripadam ovom rodu i planiram da uradim Big Y test.
Наручуј колико сад јер јефтиније нећеш проћи.Black friday is on😊
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Новембар 22, 2023, 08:32:29 поподне
Ма нисам ја, него лик који је написао тај коментар на порталу. Копирао сам га целог. Нисам ја од Монтгомеријевих, ја сам од других влаја  ;D
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Слобо Новембар 22, 2023, 08:34:50 поподне
Ево само да јавим да смо се Дејан Вукићевић и ја видели данас у Чачку управо са овим Властелицом (старо презиме Кнежевић) и узели узорак за Big Y-700 тест (FTDNA). Он је раније тестиран преко Друштва "Порекло", а према хаплотипу предвиђена му је припадност грани E-Y7168 (https://www.yfull.com/tree/E-Y7168/), којој припадају и Корвини, потомци Јанка Сибињанина/Хуњадија.

Када смо пре пар месеци били у Драгачеву да представљамо књигу о Херцеговцима, сазнали смо од тамо присутних представника рода Властелица, да је пре пар година извесно друштво/удружење из Мађарске долазило у посету селу Властељице, што је још једна интригантна околност која прати овај род.

Углавном, сазнаћемо за неколико месеци да ли су и у каквој вези драгачевски род Властелица и владарска династија Хуњади/Корвин.

Биће на крају да су сви Деури ...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Exiled Новембар 22, 2023, 08:38:33 поподне
Ма нисам ја, него лик који је написао тај коментар на порталу. Копирао сам га целог. Нисам ја од Монтгомеријевих, ја сам од других влаја  ;D
Није да ниси од њих,личиш мало,види како си забуцио исти бивши амбасадор😎
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Новембар 22, 2023, 09:03:32 поподне
Perhaps the most famous of all the Montgomerys was Field Marshal Bernard Montgomery, 1st Viscount Montgomery of Alamein, who was a senior British Army officer during the Second World War.

 :D
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Новембар 23, 2023, 09:10:53 пре подне
Y хромозомалне хаплогрупе пронађене код тестираних појединаца из поменутог рада, са терминалним SNP-овима до којих су аутори успјели доћи. Мислим да ће се то моћи спустити још који ниво ниже када буду доступни геноми.

(https://i.postimg.cc/tJJYTV2S/tirol-ancient.png)

G-CTS2100
https://www.yfull.com/tree/G-Z1816/
https://discover.familytreedna.com/y-dna/G-Z727/tree
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Новембар 29, 2023, 09:41:53 поподне
Нови рад древне ДНК, јужни Тирол, касна антика-рани средњи вијек, 20 тестираних појединаца

Ancestry and kinship in a Late Antiquity-Early Middle Ages cemetery in the Eastern Italian Alps

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589004223022927

Колико видим, још нису поставили сирове резултате на мрежу.
Објављени су БАМ фајлови (https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB60362).

Што се тиче G2a-L497 узорака, EURAC2427 је L42>YSC33>CTS1287 (https://www.yfull.com/tree/G-CTS1287/), док је EURAC2324 позитиван на CTS4803>FT31911 и уз то ће формирати подграну са Италијаном из околине Вероне.

Понадао сам се да би макар један од њих могао бити филогенетски близак Y128028 због наших рођака из Трента, али ништа од тога. За сада нам је најближи латенски ратник из Чешке који је YSC33>Y190541>Z41323 (https://www.yfull.com/tree/G-Y440075/), док смо ми YSC33>Y190541>BY48693>Z39501>Y128028.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Новембар 29, 2023, 10:16:41 поподне
Објављени су БАМ фајлови (https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB60362).

Што се тиче G2a-L497 узорака, EURAC2427 је L42>YSC33>CTS1287 (https://www.yfull.com/tree/G-CTS1287/), док је EURAC2324 позитиван на CTS4803>FT31911 и уз то ће формирати подграну са Италијаном из околине Вероне.

Понадао сам се да би макар један од њих могао бити филогенетски близак Y128028 због наших рођака из Трента, али ништа од тога. За сада нам је најближи латенски ратник из Чешке који је YSC33>Y190541>Z41323 (https://www.yfull.com/tree/G-Y440075/), док смо ми YSC33>Y190541>BY48693>Z39501>Y128028.

Чини ми се по овим стаблима да сте почетком гвозденог доба још увијек били негдје у приалпској матици, али овај источни огранак G-BY193714 је већ могао настати на централном  Балкану у првим вијековима наше ере. То помјерање на исток могло је бити и током келтске експанзије у 4 в. пне али није искључено ни да се десило и током антике.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Atlantische Новембар 29, 2023, 10:35:56 поподне
Чини ми се по овим стаблима да сте почетком гвозденог доба још увијек били негдје у приалпској матици, али овај источни огранак G-BY193714 је већ могао настати на централном  Балкану у првим вијековима наше ере. То помјерање на исток могло је бити и током келтске експанзије у 4 в. пне али није искључено ни да се десило и током антике.
Oвај јаз између гвозденог доба (веза са Италијанима) и раног средњег века колики је TMRCA нас са Балкана ће разрешити надам се једног дана живући или узорак древне ДНК.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Децембар 08, 2023, 12:50:57 поподне
Отворена је посебна тема за нови рад:

https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=7310.0 (https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=7310.0)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Децембар 15, 2023, 07:19:59 пре подне
Нови рад древне ДНК, јужни Тирол, касна антика-рани средњи вијек, 20 тестираних појединаца

Ancestry and kinship in a Late Antiquity-Early Middle Ages cemetery in the Eastern Italian Alps

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589004223022927

Колико видим, још нису поставили сирове резултате на мрежу.


Y хромозомалне хаплогрупе пронађене код тестираних појединаца из поменутог рада, са терминалним SNP-овима до којих су аутори успјели доћи. Мислим да ће се то моћи спустити још који ниво ниже када буду доступни геноми.

(https://i.postimg.cc/tJJYTV2S/tirol-ancient.png)

Било би интересантно видјети нижу грану од ових појединаца са хаплогрупом J, с обзиром да су појединци 2419 и 2423 вјероватно у односу отац/син и да представљају елитни дио те заједнице.

Сви узорци су са гробља у оквиру цркве San Stefano Burgusio
(https://lh3.googleusercontent.com/p/AF1QipNvDhP5K8ofoyu7IhnzbY_lnrF-OhIvFreMT1aS=s680-w680-h510)

Примјетих да су узорке из овог рада већ поставили на FTDNA стабло и да узорак 2068 (105а) који je у табели означен да припада хаплогрупи I-M170 заправо припада ријеткој грани I2-M423>L621>S19848>BY54321 тј. на Yfull стаблу то је грана https://www.yfull.com/tree/I-Y85772/

Ради се дакле о даљем узводном "рођаку" наше I2-Y3120. Старост везе је из бронзаног доба са дијељеном мутацијом S19848. Подсјетићу да је ова предачка мутација S19848 регистрована и на локалитету Јунаците у Бугарској, током раног бронзаног доба.

Сам узорак 2068 (105а) из Тирола припада млађем огранку BY54321 у којем су поред њега присутни још и њемачки узорак из Баден Виртемберга и са њим повезан узорак из сјеверне Ирске, као и двојица ближе повезаних Швеђана. Старост огранка I-BY54321 се процјењује на око 1300 г пне. Узимајући у обзир данашњи распоред њених носилаца, могло би се претпоставити да је ова хаплогрупа I-BY54321 настала у оквиру Urnfield културе у приалпској зони јужне Њемачке.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Децембар 15, 2023, 08:16:56 пре подне
Y хромозомалне хаплогрупе пронађене код тестираних појединаца из поменутог рада, са терминалним SNP-овима до којих су аутори успјели доћи. Мислим да ће се то моћи спустити још који ниво ниже када буду доступни геноми.

(https://i.postimg.cc/tJJYTV2S/tirol-ancient.png)

Било би интересантно видјети нижу грану од ових појединаца са хаплогрупом J, с обзиром да су појединци 2419 и 2423 вјероватно у односу отац/син и да представљају елитни дио те заједнице.

Сви узорци су са гробља у оквиру цркве San Stefano Burgusio

Поменути узорци 2419 и 2423 припадају грани https://www.yfull.com/tree/J-Z8429/ и испод нивоа J-Z8429 формирају млађи огранак J-Y51320 са Норвежанином YF003063.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Децембар 16, 2023, 03:30:25 поподне

Примјетих да су узорке из овог рада већ поставили на FTDNA стабло и да узорак 2068 (105а) који je у табели означен да припада хаплогрупи I-M170 заправо припада ријеткој грани I2-M423>L621>S19848>BY54321 тј. на Yfull стаблу то је грана https://www.yfull.com/tree/I-Y85772/

Ради се дакле о даљем узводном "рођаку" наше I2-Y3120. Старост везе је из бронзаног доба са дијељеном мутацијом S19848. Подсјетићу да је ова предачка мутација S19848 регистрована и на локалитету Јунаците у Бугарској, током раног бронзаног доба.

Сам узорак 2068 (105а) из Тирола припада млађем огранку BY54321 у којем су поред њега присутни још и њемачки узорак из Баден Виртемберга и са њим повезан узорак из сјеверне Ирске, као и двојица ближе повезаних Швеђана. Старост огранка I-BY54321 се процјењује на око 1300 г пне. Узимајући у обзир данашњи распоред њених носилаца, могло би се претпоставити да је ова хаплогрупа I-BY54321 настала у оквиру Urnfield културе у приалпској зони јужне Њемачке.


Занимљиво да се међу савременим узорцима из југозападне Немачке, источне Фанцуске, Велике Британије и Ирске налазе скоро све хаплогрупе пронађене у раном бронзаном добу у Бугарској, а које не припадају степским дошљацима. На пример хаплогрупа I-M223>Y87044 (https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-Y87044/tree) (Y5606* на YFull) или I-M223>P78 (https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-P78/tree).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Децембар 20, 2023, 05:21:06 поподне
Нови археогенетски рад доказује на примеру једног узорка досељавање Сармата у Британију за време Римског царства. https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(23)01634-2?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0960982223016342%3Fshowall%3Dtrue (https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(23)01634-2?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0960982223016342%3Fshowall%3Dtrue)

Анализирани узорак припада хаплогрупи Y13369 (https://www.yfull.com/tree/R-Y13369/).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Децембар 20, 2023, 10:43:39 поподне
Нови археогенетски рад доказује на примеру једног узорка досељавање Сармата у Британију за време Римског царства. https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(23)01634-2?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0960982223016342%3Fshowall%3Dtrue (https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(23)01634-2?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0960982223016342%3Fshowall%3Dtrue)

Анализирани узорак припада хаплогрупи Y13369 (https://www.yfull.com/tree/R-Y13369/).

Британци већ дуго врте ову причу о сарматским коњаницима. Чак она посљедња верзија филма о краљу Артуру (Clive Owen) витезове округлог стола повезује са тим сарматским коњаницима у служби Рима. Не би ме чудило да је и ово тестирање намјенско, у склопу те приче.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Exiled Децембар 20, 2023, 10:56:55 поподне
Британци већ дуго врте ову причу о сарматским коњаницима. Чак она посљедња верзија филма о краљу Артуру (Clive Owen) витезове округлог стола повезује са тим сарматским коњаницима у служби Рима. Не би ме чудило да је и ово тестирање намјенско, у склопу те приче.
Не знам да ли пропуштам нешто, додуше ове дубинско дубоке теме слабо пратим, али реко бих да R1b чини окосницу свега европског,мислим то је наратив?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Децембар 21, 2023, 11:02:51 пре подне
Не знам да ли пропуштам нешто, додуше ове дубинско дубоке теме слабо пратим, али реко бих да R1b чини окосницу свега европског,мислим то је наратив?

Овај огранак очигледно није учествовао у сеоби раних Индоевропљана из степе према Европи, већ према Кавказу, Јерменији и Ирану. Данас је широко распрострањен на Блиском и Средњем истоку, а као што се види на стаблу има и археогенетских узорака ове хаплогрупе из Ирана. Аутозомално је узорак најсличнији узорцима из бронзаног доба Јерменије. Дакле ово јесте готово сигурно припадник неког иранског племена. Да ли је баш од тих регрутованих Сармата или је нека друга прича у позадини, на основу генетике није могуће рећи.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Децембар 21, 2023, 05:01:05 поподне
Овај огранак очигледно није учествовао у сеоби раних Индоевропљана из степе према Европи, већ према Кавказу, Јерменији и Ирану. Данас је широко распрострањен на Блиском и Средњем истоку, а као што се види на стаблу има и археогенетских узорака ове хаплогрупе из Ирана. Аутозомално је узорак најсличнији узорцима из бронзаног доба Јерменије. Дакле ово јесте готово сигурно припадник неког иранског племена. Да ли је баш од тих регрутованих Сармата или је нека друга прича у позадини, на основу генетике није могуће рећи.

Ово је једна од типичних прото-јерменских грана, у студији "The genetic history of the Southern Arc" појаваљује се у високом проценту код древних јерменских узорака, заједно с првом појавом степске аутосомалне генетике, сем тога само још на налазишту Хасанлу у Ирану које није далеко од јерменских подручја.

Ако узмемо у обзир и аутозоме овај узорак је највјероватније само Јермен и нема никакве везе са Сарматима нити с неким другим иранским народом.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Децембар 21, 2023, 05:30:14 поподне
Сармат звучи више фенси, Јермен не толико. У осталом они тамо већ снимају филмове где је Артур приказан као такав, сада то променити у Јермен, мех.

The Sarmatian Hypothesis proposes that the original, historical Arthur was a Roman military leader named Lucius Artorius Castus, who commanded of a group of Sarmatian warriors for two years in Britain, around 182.

Слободно могу то да забораве, тај Артур и ако је постојао из неке лозе локалних племенских старешина. Да је неки заостали римљанин вероватно не би га прихватли као вођу. Кажем вероватно јер је добар део становништва југа Енглеске примило латински и римски идентитет али су се у распону од мање од два века вратили на фабричка подешавања.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Децембар 21, 2023, 07:58:53 поподне
Ово је једна од типичних прото-јерменских грана, у студији "The genetic history of the Southern Arc" појаваљује се у високом проценту код древних јерменских узорака, заједно с првом појавом степске аутосомалне генетике, сем тога само још на налазишту Хасанлу у Ирану које није далеко од јерменских подручја.

Ако узмемо у обзир и аутозоме овај узорак је највјероватније само Јермен и нема никакве везе са Сарматима нити с неким другим иранским народом.

Мислим да управо аутозоми уводе сумњу у јерменско порекло овог узорка. Уклапа се добро у Armenia LBA и Russia Sarmatian Alan кластере али не и у Armenia Antiquity. Пошто је ово антички узорак вероватније је да је пореклом са аланских подручја северно од Кавказа где је још увек степска генетика била висока, него из античке Јерменије.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Децембар 22, 2023, 06:53:56 пре подне
Сармат звучи више фенси, Јермен не толико. У осталом они тамо већ снимају филмове где је Артур приказан као такав, сада то променити у Јермен, мех.

The Sarmatian Hypothesis proposes that the original, historical Arthur was a Roman military leader named Lucius Artorius Castus, who commanded of a group of Sarmatian warriors for two years in Britain, around 182.

Слободно могу то да забораве, тај Артур и ако је постојао из неке лозе локалних племенских старешина. Да је неки заостали римљанин вероватно не би га прихватли као вођу. Кажем вероватно јер је добар део становништва југа Енглеске примило латински и римски идентитет али су се у распону од мање од два века вратили на фабричка подешавања.
Ето задатка за археогенетичаре у Хрватској.
https://en.wikipedia.org/wiki/Historicity_of_King_Arthur#Lucius_Artorius_Castus_and_the_Sarmatian_connection
https://en.wikipedia.org/wiki/Lucius_Artorius_Castus

https://en.wikipedia.org/wiki/Nart_saga#Connections_to_other_mythology
https://en.wikipedia.org/wiki/Batraz#Batraz's_sword
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Децембар 22, 2023, 07:00:34 поподне
Мислим да управо аутозоми уводе сумњу у јерменско порекло овог узорка. Уклапа се добро у Armenia LBA и Russia Sarmatian Alan кластере али не и у Armenia Antiquity. Пошто је ово антички узорак вероватније је да је пореклом са аланских подручја северно од Кавказа где је још увек степска генетика била висока, него из античке Јерменије.

Могуће, али било би необично јер су се с Јерменима мијешали углавном Иранци из Персије, а Алани су се мијешали са западним Кавкажанима код којих доминира G2a. Могуће и да је узорак имао оца Јермена и мајку из неког народа с више степске генетике.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Децембар 22, 2023, 07:19:29 поподне
https://www.nature.com/articles/s41588-023-01582-w

званично је објављен рад: Accurate detection of identity-by-descent segments in human ancient DNA

Узорци из култура гробових јама (Јамна) , врпчасте керамике (Corded Ware) и Афанасијево дијеле сегменте и до 20 цм, што значи заједничког претка прије око 5 генерација.

Corded Ware дијели велике сегменте и с Globular Amphora културом, поготово узорцима из западне Украјине.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Децембар 23, 2023, 10:23:46 пре подне
https://www.nature.com/articles/s41588-023-01582-w

званично је објављен рад: Accurate detection of identity-by-descent segments in human ancient DNA

Узорци из култура гробових јама (Јамна) , врпчасте керамике (Corded Ware) и Афанасијево дијеле сегменте и до 20 цм, што значи заједничког претка прије око 5 генерација.

Corded Ware дијели велике сегменте и с Globular Amphora културом, поготово узорцима из западне Украјине.

И то ништа мање не важи чак и за географски најудаљенију варијанту, културу бојних секира у Шведској. Са друге стране код звонастих пехара (Bell Beaker) узорака GAC компонента драстично опада. Али изгледа да опада и код пољских узорака врпчасте керамике који деле веће сегменте са литванском касним неолитом, што је у најмању руку чудно.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Децембар 23, 2023, 05:58:29 поподне
И то ништа мање не важи чак и за географски најудаљенију варијанту, културу бојних секира у Шведској. Са друге стране код звонастих пехара (Bell Beaker) узорака GAC компонента драстично опада. Али изгледа да опада и код пољских узорака врпчасте керамике који деле веће сегменте са литванском касним неолитом, што је у најмању руку чудно.

Lithuania_LN су такође CWC узорци, нису фармери.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Децембар 23, 2023, 07:16:04 поподне
Lithuania_LN су такође CWC узорци, нису фармери.

Ти познонеолитски и CWC узорци носе и приличан проценат неолитске земљорадничке генетике, поред оне степске. У оваквом проценту се та генетика први пут јавља на тлу Литваније што значи да је и CWC популација која је продирала у Литванију већ прошла фазу мијешања са земљорадницима (вјероватно управо GAC). Ово крајем неолита, у енеолиту и бронзаном добу прилично мијења генетичку слику на простору Литваније. Претходно је ту живјело становништво које је носило и до 80% WHG генетику.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Децембар 23, 2023, 08:04:32 поподне
Ти познонеолитски и CWC узорци носе и приличан проценат неолитске земљорадничке генетике, поред оне степске. У оваквом проценту се та генетика први пут јавља на тлу Литваније што значи да је и CWC популација која је продирала у Литванију већ прошла фазу мијешања са земљорадницима (вјероватно управо GAC). Ово крајем неолита, у енеолиту и бронзаном добу прилично мијења генетичку слику на простору Литваније. Претходно је ту живјело становништво које је носило и до 80% WHG генетику.

GAC генетику носи и Фатјаново култура (источни огранак CWC) око данашње Москве.

неки сценарио који можемо реконструисати на темељу ових података јесте:

1)Преци Јамне и Афанасијева (R1b-Z2103) и Кордед Вера (R1a-M417 и R1b-L51) су живјели веома близу једни другима, вјероватно у некој касној вариајнти Средни Стог културе у данашњој централној Украјини.

2)Затим се Јамна шири Евроазијском степом, а CWC прво одлази у данашњу западну Украјину гдје се мијеша с GAC, па се одатле шири на сјеверозапад и сјевероисток.

отприлике све како је приказано на овој мапи:
(https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/b/b1/Indo-European_migrations.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Децембар 23, 2023, 08:15:38 поподне
Нарва, енигма. Мада и не толико, сличан проценат су носиле још неке популације, али значајно западније и у мањој мери (не 80%). Уочава се образац, обично је то био физичким особинама терена формиран запећак. Буквално се нису мешали ни по мтдна, јер су доминантно WHG mtdna U. Пошто тамо нема планина (као у Шкотској) могу захвалити шумама и мочварама што неолићани нису били заинтересовани. И хладноћи. Остаје додуше питање зашто EHG нису бацили око на тај простор.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Децембар 23, 2023, 08:25:11 поподне
Нарва, енигма. Мада и не толико, сличан проценат су носиле још неке популације, али значајно западније и у мањој мери (не 80%). Уочава се образац, обично је то био физичким особинама терена формиран запећак. Буквално се нису мешали ни по мтдна, јер су доминантно WHG mtdna U. Пошто тамо нема планина (као у Шкотској) могу захвалити шумама и мочварама што неолићани нису били заинтересовани. И хладноћи. Остаје додуше питање зашто EHG нису бацили око на тај простор.

Треба рећи да се Нарва генетика код прото-Балта донекле обновила послије овог индоевропског "удара" у енеолиту и бронзаном добу. Никад наравно на ранији ниво, али су генерално прото-балтске популације позног бронзаног и гвозденог доба више "Нарва" него што су то биле популације енеолита и раног бронзаног доба са истог простора. Може се рећи, шума је узвратила ударац.  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Децембар 23, 2023, 08:48:52 поподне
Жилава је та I2, много жилава раса. Остаће на крају само они и бубашвабе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Децембар 23, 2023, 08:53:31 поподне
Жилава је та I2, много жилава раса. Остаће на крају само они и бубашвабе.

У случају Нарве, прије ће бити да су жене биле те које су биле жилаве, јер Нарва I2 линије и нису баш преживјеле.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Децембар 23, 2023, 10:36:39 поподне
GAC генетику носи и Фатјаново култура (источни огранак CWC) око данашње Москве.

неки сценарио који можемо реконструисати на темељу ових података јесте:

1)Преци Јамне и Афанасијева (R1b-Z2103) и Кордед Вера (R1a-M417 и R1b-L51) су живјели веома близу једни другима, вјероватно у некој касној вариајнти Средни Стог културе у данашњој централној Украјини.

2)Затим се Јамна шири Евроазијском степом, а CWC прво одлази у данашњу западну Украјину гдје се мијеша с GAC, па се одатле шири на сјеверозапад и сјевероисток.

отприлике све како је приказано на овој мапи:
(https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/b/b1/Indo-European_migrations.jpg)


Јасно. А Bell Beaker је директо из степе, без много мешања са GAC?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Црна Гуја Децембар 24, 2023, 12:30:11 поподне

Јасно. А Bell Beaker је директо из степе, без много мешања са GAC?

Bell Beaker је проистекао из CWC. Рани Bell Beaker узорци су аутосомално готово идентични CWC, док каснији имају већи удео EEF, због мешања са каснонеолитским популацијама централне и западне Европе. Једина разлика између CWC и раних Bell Beaker-a су мушке лозе, код првих је била доминантна R1a-Z283, а код других R1b-L51.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Децембар 24, 2023, 02:32:48 поподне
Било би добро кад би се на основу досадашњих археогентичких узорака могла направити динамичка карта (или неки видео), продора степске генетике у Европу. Претпостављам да је све почело око 2700-2800 п.н.е. када престају да постоје "староевропске" културе, трипољска и GAC, на подручју данашње Украјине. Најмање је јасна ситуација на дунавском ушћу и источном Балкану. Да ли је ту дошло до ранијег продора Индоевропљана? Уколико јесте, у којој мјери. Судећи по раду који је љетос објављен, "староевропске" културе енеолита и прије продора Индевропљана биле су замрле. Поред тога, евидентно је да су културе са подручја дунавске делте, Чернавода и Усатово, прелазне културе у којима је било степских елемената и прије суштинског продора Индоевропљана.

Постоје теорије да су климатски услови (сушно доба) условиле да земљорадничке културе пропадну. А да су становници степе као сточари, боље прошли кроз тај период и касније у својој експанзији искористили то као предност. Посебно је интересантно што је култура балканског енеолита,  која је била технолошки напредна (са развијеном прерадом бакра), и са већ социјално стратификованим друштвом, сама од себе пропала. И то пар стотина година прије продора Индоевропљана.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 12, 2024, 06:35:17 пре подне
Не могу се сјетити да ли смо је помињали у препринту, али видим да је ових дана објављена коначна верзија студије под називом:
Population genomics of post-glacial western Eurasia
https://www.nature.com/articles/s41586-023-06865-0
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Јануар 12, 2024, 06:58:39 пре подне
Не могу се сјетити да ли смо је помињали у препринту, али видим да је ових дана објављена коначна верзија студије под називом:
Population genomics of post-glacial western Eurasia
https://www.nature.com/articles/s41586-023-06865-0

Мислим да смо о препринту дискутовали на овој теми (https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=7260.0). Такође су објављени и повезани радови као што је овај https://www.nature.com/articles/s41586-023-06862-3 (https://www.nature.com/articles/s41586-023-06862-3).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 12, 2024, 11:52:51 пре подне
Не знам да ли сам добро разумио, али чини ми се да су у горе наведеном раду аутосомално извориште за WHG популацију пронашли у палеолитском узорку са Кавказа, старом преко 20.000 година. Ради се о женском узорку NEO283 из налазишта Kotias Klde у Грузији.

Уколико јесам добро разумио, ово би могла бити аутосомална профилација првобитне IJ популације, тј. популације из које су се издвојиле I и J хаплогрупе.

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Јануар 12, 2024, 01:14:37 поподне
Не знам да ли сам добро разумио, али чини ми се да су у горе наведеном раду аутосомално извориште за WHG популацију пронашли у палеолитском узорку са Кавказа, старом преко 20.000 година. Ради се о женском узорку NEO283 из налазишта Kotias Klde у Грузији.

Уколико јесам добро разумио, ово би могла бити аутосомална профилација првобитне IJ популације, тј. популације из које су се издвојиле I и J хаплогрупе.

Мислим да је овај узорак ипак само пријелазна популација између прото-Вилабруне која је већ у палеолиту постојала на Балкану и базалних евроазијаца који су живјели на Арапском полуострву. Исто као и необјављени узорак Дзудзуана с Кавказа.

Само што још немамо узорке Вилабруне и базалних евроазијаца из палеолоита, па је у њиховом моделу од понуђених палеолитксих узорака овај најближе сродан каснијим WHG/Вилабруна узорцима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 12, 2024, 03:21:20 поподне
Мислим да је овај узорак ипак само пријелазна популација између прото-Вилабруне која је већ у палеолиту постојала на Балкану и базалних евроазијаца који су живјели на Арапском полуострву. Исто као и необјављени узорак Дзудзуана с Кавказа.

Само што још немамо узорке Вилабруне и базалних евроазијаца из палеолоита, па је у њиховом моделу од понуђених палеолитксих узорака овај најближе сродан каснијим WHG/Вилабруна узорцима.

Претпоставио сам нешто слично. Волио бих видјети, кад узорци буду доступни у scaled варијанти, како овај NEO283 стоји не само у односу на Вилабруну, већ и у односу на мезолитске CHG кавкаске узорке.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Никац Јануар 12, 2024, 04:26:41 поподне
Претпоставио сам нешто слично. Волио бих видјети, кад узорци буду доступни у scaled варијанти, како овај NEO283 стоји не само у односу на Вилабруну, већ и у односу на мезолитске CHG кавкаске узорке.

Према овом препринту https://www.biorxiv.org/content/10.1101/423079v1
-Дзудзуана је 72% Вилабруна + 28% базалан
-CHG је 63% Дзудзуана + 37% АNЕ из Сибира
-Неолитски Анадолски фармери су остали јако блиски (готово идентични) Дзудзуани

NEO283 и Дзудзуана су вјероватно иста популација, из истог су периода и подручја, а и у овој новој студији моделују NEO283 слично као и Дзудзуану:

we find that a well-fitting graph for this Caucasus Upper Palaeolithic lineage derives it as a mixture of predominantly west Eurasian Upper Palaeolithic HG ancestry (76%), with a contribution of about 24% from a ‘basal Eurasian’ ghost population
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 15, 2024, 08:39:28 пре подне
Нова студија под насловом

"Cases of Trisomy 21 and Trisomy 18 among Historic and Prehistoric Individuals discovered from Ancient DNA"

Трисомије или полисомије су као што је познато умножавање копија хромозома које доводе до генетичких поремећаја, попут Дауновог синдрома. У студији су покушавали да детектују такве случајеве у сету древних узорака и занимљиво да су више случајева трисомије нашли у иберијском гвозденом добу (углавном код дјеце). Такође из гробног инвентара закључују да су појединци са таквим поремећајима били пуноправни чланови заједнице. Ово је апстракт:

"Aneuploidies, and in particular, trisomies represent the most common genetic aberrations observed in human genetics today. To explore the presence of trisomies in historic and prehistoric populations we screen nearly 10,000 ancient human individuals for the presence of three copies of any of the target autosomes. We find clear genetic evidence for six cases of trisomy 21 (Down syndrome) and one case of trisomy 18 (Edwards syndrome), and all cases are present in infant or prenatal burials. We perform comparative osteological examinations of the skeletal remains and find overlapping skeletal markers, many of which are consistent with these syndromes. Interestingly, three cases of trisomy 21, and the case of trisomy 18 were detected in two contemporaneous sites in early Iron Age Spain (800-400 BCE), potentially suggesting a higher frequency of burials of trisomy carriers in those societies. Notably, the care with which the burials were conducted, and the items found with these individuals indicate that ancient societies likely acknowledged these individuals with trisomy 18 and 21 as members of their communities, from the perspective of burial practice."

Узорци су постављени на ENA
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB71003
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Јануар 15, 2024, 01:07:33 поподне
Шематизован приказ археогенетичке композиције савременог европског становништва из рада "The selection landscape and genetic legacy of ancient Eurasians"
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38200293/

(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/instance/10781624/bin/41586_2023_6705_Fig3_HTML.jpg)

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Јануар 15, 2024, 02:22:46 поподне
Шематизован приказ археогенетичке композиције савременог европског становништва из рада "The selection landscape and genetic legacy of ancient Eurasians"
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38200293/

(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/instance/10781624/bin/41586_2023_6705_Fig3_HTML.jpg)

Недавно сам писао о овом графикону на другој теми (https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=7260.msg192489#msg192489). Тачка раздвајања WHG и EHG би могла да објасни присуство хаплогрупе R1b-V2219, чије се рођачке гране могу везати за EHG популацију, међу узорцима WHG популације.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: сɣнце Јануар 15, 2024, 05:46:53 поподне
Шематизован приказ археогенетичке композиције савременог европског становништва из рада "The selection landscape and genetic legacy of ancient Eurasians"
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38200293/

(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/instance/10781624/bin/41586_2023_6705_Fig3_HTML.jpg)
Занимљиво питање је представљају ли извор индоевропскога језика Јамноваца Источни или Кавказски л.с. (ловци-сакупљачи). Будући да житељи предјамновске Дњепар-Донац а.к. (археологијске културе) представљају чисте Источне л.с. али исте х.г. као и наслиједни Јамновци слиједи да је удјел Кавказских л.с. унесен кроз женску лозу.

Ту се само не уклапа ово:
- Мезолитски Балканци су искључиво R1b и I2a а опет сачињени из 85% Западних л.с.
- Мезолитски Балти (Кунда-Нарва а.к.) су искључиво R1b и I2a а сачињени великом већином из Западних л.с.
- Говорници неиндоевропскога баскскога језика су искључиво R1b.

За скито-аријски језик доста је јасно да се је развио из временскога низа а.к. Фатјаново-Баланово > Абашево > Синташта. Фатјановци су искључиво R1a с доказаним R-Z93. Фатјановци ни по којим признацима не произлазе из Јамноваца и није било мијешања с њима. ( The genetics of the people of the Fatyanovo culture was found to be substantially different from preceding Volosovo culture, with whom they do not appear to have mixed. Their EEF admixture has not been detected in the earlier Yamnaya culture, suggesting that the Fatyanovo people did not directly descend from the Yamnaya. Saag et al. 2021, pp. 8).

Сјеверно од Фатјаново а.к. простире се а.к. Pit Comb Ware која се састоји из 65% Источних л.с. + 15% Западни л.с. + 20% Јамновац. При том је тачка додира ове културе и Јамноваца на Балтику, гдје је раније преовладавало становништво Западних л.с. (R1b,I2a) а у том вријеме смјењено новим натиском са југа и с истока. Lamnidis et al. (2018) found 15% Western Hunter-Gatherer (WHG) ancestry, 65% Eastern Hunter-Gatherer (EHG) - higher than among earlier cultures of the eastern Baltic, and 20% Western Steppe Herder (WSH).

Из ових уломака информација склапа ми се слика, да је морао постојати заједнички предак Фатјаново и Pit Comb Ware а.к. с претежно R1a и Источно-л.с. становништвом који је предак сатем и.е. језика и да је у јужним предјелима морала постојати додирна тачка R1a и R1b, гдје се је вршило предавање језика.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Драган Обреновић Јануар 16, 2024, 11:57:03 поподне
Наш члан и уредник Српског ДНК пројекта, Владимир Николић (Кековац на форуму), написао је за портал Друштва "Порекло" приказ научног рада "A genetic history of the Balkans from Roman frontier to Slavic migrations (https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(23)01135-2)", како би га приближио широј читалачкој публици. Искрено препоручујемо да га прочитате.

https://www.poreklo.rs/2024/01/16/od-rima-do-slovena-sta-kaze-drevna-dnk/

Владимире, заиста одличан ауторски "првенац" на Порталу, надамо се и новим чланцима од тебе :)

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Христифор Јануар 17, 2024, 12:24:05 пре подне
Када човек пише чињенично и поткрепљено тачним подацима не може да не ваља. Све похвале за више него сјајан текст.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Spajic1 Јануар 17, 2024, 02:58:24 поподне
Добар дан,
можда није питање за ову тему, али је најприближнија.
Да ли се иједна институција код нас бави арехеогенетиком?
На пример да неко случајним копањем у свом селу, наиђе на неке кости, коме би могао то послати на анализу?
Знам да је код нас у Србији немогуће у иностранство послати ни брис за ДНК анализу а камо ли део кости.
Има ли ико идеје?
На пример Ydnk и аутосомална ДНК анализа да би се потврдило сродство са земним остатцима те особе.
Хвала
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Јануар 17, 2024, 04:37:29 поподне
Код нас се археогенетским истраживањима бави Биолошки факултет, али не раде по принципу да физичко лице може тек тако да их позове да тестирају неке кости. Не иде то тако. Ако наиђеш на старе кости, а при томе си сигуран да су људске, онда најбоље јавити најближем музеју. Ако нађеш нешто новијег датума, младе кости  ;D, онда правац полиција.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Spajic1 Јануар 18, 2024, 07:48:00 пре подне
Тако сам и претпоставио.
У питању је старо гробље, без икаквих обележја.
Човек је хтео да истражи да ли је то гробље његових предака или становништва које је живело ту пре њих.
Овако ништа...
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Јануар 18, 2024, 09:32:06 пре подне
Тако сам и претпоставио.
У питању је старо гробље, без икаквих обележја.
Човек је хтео да истражи да ли је то гробље његових предака или становништва које је живело ту пре њих.
Овако ништа...

Као што рече Ивица, најбоље би било да контактирате музеј који је надлежан за то подручје и са њима видите какви су изгледи да се поменуто старо гробље истражи (ископа). Углавном су око тога највећи проблем финансије, па ако би могли удруженим снагама и приватном иницијативом да скупите одређена средства за то, можда ћете и успети да их анимирате да ураде некаква почетна ископавања.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Јануар 18, 2024, 10:53:37 поподне
Занимљиво питање је представљају ли извор индоевропскога језика Јамноваца Источни или Кавказски л.с. (ловци-сакупљачи). Будући да житељи предјамновске Дњепар-Донац а.к. (археологијске културе) представљају чисте Источне л.с. али исте х.г. као и наслиједни Јамновци слиједи да је удјел Кавказских л.с. унесен кроз женску лозу.

Ту се само не уклапа ово:
- Мезолитски Балканци су искључиво R1b и I2a а опет сачињени из 85% Западних л.с.
- Мезолитски Балти (Кунда-Нарва а.к.) су искључиво R1b и I2a а сачињени великом већином из Западних л.с.
- Говорници неиндоевропскога баскскога језика су искључиво R1b.

За скито-аријски језик доста је јасно да се је развио из временскога низа а.к. Фатјаново-Баланово > Абашево > Синташта. Фатјановци су искључиво R1a с доказаним R-Z93. Фатјановци ни по којим признацима не произлазе из Јамноваца и није било мијешања с њима. ( The genetics of the people of the Fatyanovo culture was found to be substantially different from preceding Volosovo culture, with whom they do not appear to have mixed. Their EEF admixture has not been detected in the earlier Yamnaya culture, suggesting that the Fatyanovo people did not directly descend from the Yamnaya. Saag et al. 2021, pp. 8).

Сјеверно од Фатјаново а.к. простире се а.к. Pit Comb Ware која се састоји из 65% Источних л.с. + 15% Западни л.с. + 20% Јамновац. При том је тачка додира ове културе и Јамноваца на Балтику, гдје је раније преовладавало становништво Западних л.с. (R1b,I2a) а у том вријеме смјењено новим натиском са југа и с истока. Lamnidis et al. (2018) found 15% Western Hunter-Gatherer (WHG) ancestry, 65% Eastern Hunter-Gatherer (EHG) - higher than among earlier cultures of the eastern Baltic, and 20% Western Steppe Herder (WSH).

Из ових уломака информација склапа ми се слика, да је морао постојати заједнички предак Фатјаново и Pit Comb Ware а.к. с претежно R1a и Источно-л.с. становништвом који је предак сатем и.е. језика и да је у јужним предјелима морала постојати додирна тачка R1a и R1b, гдје се је вршило предавање језика.

Фатјановци јесу повезани генетски са Јамновцима. Заправо је разлика у томе што су преци Фатјановаца, као и осталих група из Corded Ware комплекса помешали са припадницима GAC културе, који су имали висок удео EEF генетике. Али основа ових људи је иста степска генетика, као и код Јамноваца. Најбоље се ове родбинске везе виде из IBD сегмената, који се анализирају у овом раду https://www.nature.com/articles/s41588-023-01582-w (https://www.nature.com/articles/s41588-023-01582-w).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Wolf Sagash Јануар 19, 2024, 09:03:21 пре подне
Тако сам и претпоставио.
У питању је старо гробље, без икаквих обележја.
Човек је хтео да истражи да ли је то гробље његових предака или становништва које је живело ту пре њих.
Овако ништа...
Kada smo radili arheogenetska istraživanja u Cernici, čovjek koji nam je pomagao sa bagerom ispao je srodnik otkrivenih pokojnika. Takođe u blizini stećka koji smo istraživali nalazi se savremena grobnica porodice koja je takođe srodna pokojnicima iz 15 vijeka
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: сɣнце Јануар 19, 2024, 05:08:04 поподне
Фатјановци јесу повезани генетски са Јамновцима. Заправо је разлика у томе што су преци Фатјановаца, као и осталих група из Corded Ware комплекса помешали са припадницима GAC културе, који су имали висок удео EEF генетике. Али основа ових људи је иста степска генетика, као и код Јамноваца. Најбоље се ове родбинске везе виде из IBD сегмената, који се анализирају у овом раду https://www.nature.com/articles/s41588-023-01582-w (https://www.nature.com/articles/s41588-023-01582-w).

Афанасјевци јесу несумњиво повезани с Јамновцима и преко Y-хро. и преко IBD уломака.
Цитат
This long IBD sharing signal, at the same level as between various Yamnaya groups (Fig. 4), therefore clearly indicates that ancient individuals from Afanasievo contexts descend from people who migrated at most a few generations earlier across vast distances of the Eurasian Steppe.
https://www.nature.com/articles/s41588-023-01582-w (https://www.nature.com/articles/s41588-023-01582-w)
Али Афанасјевци нису потомци Фатјановаца, него изравни потомци Јамноваца. Потомци Фатјановаца су Андроновци, који су пошли на исток саодносно касније него Јамновци и с својом појавом политички и културно прогутали Афанасјевце, осим оних у долини Тарим. Предпоставка је, да су Афанасјевци предци говорника тзв. тохарскога - јединога кентум језика азије. Emil Sieg је за њих грешком предложио назив Тохари, али је показано, да су ти људи себе називали Арши.
Цитат
The Afanasievo culture is linguistically attractive because its own antecedents appear to lie in the European steppe, the same region that provides the point of departure for the Indo-Iranian expansion some thousand years later. This provides a convenient explanation for why the Tocharian languages are ultimately related to Indo-Iranian as members of the Indo-European language family, but also as to why they are very different, in that they separated from the rest of the Indo-Europeans at an early date.
https://www.penn.museum/sites/expedition/bronze-age-languages-of-the-tarim-basin/ (https://www.penn.museum/sites/expedition/bronze-age-languages-of-the-tarim-basin/)


У раду који си поменуо стоји, да је постојала размијена гена култура сјевернога обзорја од источних Фатјановаца до западних Скандинаваца.
with each other[/b] and also have IBD sharing up to 20 cM with various Yamnaya groups (Fig. 4 and Extended Data Fig. 3a,b,c).]Using IBD, we find that individuals from diverse Corded Ware cultural groups, including from Sweden (associated with the Battle Axe culture), Russia (Fatyanovo) and East/Central Europe share high amounts of long IBD with each other and also have IBD sharing up to 20 cM with various Yamnaya groups (Fig. 4 and Extended Data Fig. 3a,b,c). (http://Using IBD, we find that individuals from diverse Corded Ware cultural groups, including from Sweden (associated with the Battle Axe culture), Russia (Fatyanovo) and East/Central Europe share high amounts of long IBD [b)

Оно што спаја све ове културе по мужској лози је R1a-M417, а по аутосомалу EHG. Но није тако, да се је ту мијешало равномјерно, него постоје своје законитости.
Само Фатјановци показују присуство Z93, а источно од њих Z282 - раздвојење се дешавало у времену окол 3000-2500 г. пне.

Најзападнији Z282 ће изродити мутацију Y2395 (4800 ybp) и заједно с R1b-U106 (4800 ybp) из Јамне ће постати предачком граном Германима. По IBD уломцима такођер се види јака веза Скандинавске културе BAC с једне стране с Јамновцима, а с друге стране с Фатјановцима.

Фатјановци имају по IBD јаку везу с Скандинавцима и с Corded Ware-Њемачке ( предпостављам кроз пресељенике с R1a-Z282) и осредњу везу с простором Каснонеолитскога Балтика и најисточније Јамне, која ће вјеројатно бити кроз исти извор жена, јер Фатјановци и Јамновци имају сасвим различите мужске лозе. Мало је вјеројатно да ће исти извор жена бити разлог, да и Фатјановци и Јамновци говоре сродним језицима.

Одакле онда сеже та веза Пра-ИЕ. језика којега дијеле R1a-M417 (5400 ybp) и R1b-L23 (6100 ybp)?  :o
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Јануар 26, 2024, 08:13:47 поподне
Само ћу ово оставити овде

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352409X23004546?via%3Dihub
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Gorance Јануар 28, 2024, 10:11:05 поподне
Само ћу ово оставити овде

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352409X23004546?via%3Dihub
Значи Филип је инхумиран,није спаљен. Видим,горња вилица му је добро очувана са свим зубима. Кад мисле да раде ДНК анализу?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Бранкова Јануар 30, 2024, 08:02:58 поподне

Према објављеним текстовима 2020.г., извучен је днк iz Grobnice I .

https://www.academia.edu/44817823/The_Vergina_Tombs_A_forensic_step_away_from_identifying_the_family_of_Alexander_the_Great (https://www.academia.edu/44817823/The_Vergina_Tombs_A_forensic_step_away_from_identifying_the_family_of_Alexander_the_Great)

"Године 2016. научницима је дозвољено да тестирају разбацане кости пронађене у опљачканој гробници I и у оближњој „скривеној“ гробници близу градске агоре. Званично финансирање није обезбеђено. Иако су кости лежале изложене у тлу више од два миленијума на различитим нивоима, против свих очекивања, докази о датирању и ДНК су успешно извучени. Ови резултати тек треба да буду објављени, али би било поштено рећи да прелиминарни налази додатно поткопавају традиционалне теорије идентитета."
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Јануар 31, 2024, 12:41:04 поподне
Шта ли им значи ово прелиминарни налази додатно поткопавају традиционалне теорије идентитета? Не може бити ништа што већ није пронађено и о чему је већ писано на форуму. Највећа шанса свакако припада старој источној R1b али не само њој.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: НиколаВук Јануар 31, 2024, 12:57:16 поподне
Шта ли им значи ово прелиминарни налази додатно поткопавају традиционалне теорије идентитета? Не може бити ништа што већ није пронађено и о чему је већ писано на форуму. Највећа шанса свакако припада старој источној R1b али не само њој.

Такве језичке конструкције ме неодољиво подсећају на "воук" идеологију, где би вероватно Филип био пореклом из неког од племена подсахарске Африке или томе слично.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Селаковић Фебруар 14, 2024, 10:09:55 пре подне
https://www.youtube.com/v/mWTVx3Cx6Zc
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Јовица Кртинић Фебруар 14, 2024, 03:38:55 поподне
https://www.youtube.com/v/mWTVx3Cx6Zc
Сјајно предавање. Не памтим да сам у скорије време слушао вештијег предавача. Хвала, Живота!
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Фебруар 20, 2024, 04:54:57 поподне
Kinship practices at the early bronze age site of Leubingen in Central Germany

https://www.nature.com/articles/s41598-024-54462-6
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небо_Сав Фебруар 20, 2024, 07:01:47 поподне
Kinship practices at the early bronze age site of Leubingen in Central Germany

https://www.nature.com/articles/s41598-024-54462-6

Опет  др. Јохан Краузе, као један од аутора чланка. Он је  предавач из  претходног видеа у овој теми,  и након што сам прегледао то  предавање, прегледао сам и још неколико његових предавања на ју-тјубу. Један од уводничара на неком од тих предавања назвао га је човеком који може да "извади из ДНА шта год вам падне на памет".

Ово је, рекао бих, његова успутна делатност, пошто је један видео био посвећен анализи ДНК вируса куге. Ово је, претпостављам, профитабилнији бизнис од археогенетичких истраживања пошто га наручују фармаколшке компаније. Мени је, у том предавању, била најинтересантнија анализа појаве куге у Европи 1346 г. (због које је Стефан Душан заједно са царицом био отишао на Хиланадр, ако се добро сећам, па је царица била прекршила устав Свете горе). Елем, анализом ДНК скелета из тог периода, испало је да је почетак епидемије био негде на територији данашњег Киргистана, и да је реч о години 1338...
Па се само питам, шта ће се још све открити  ДНК анализама у наредних неколико година. Поменуо је још да у лабораторији имају опрему која може да секвенцира хиљаде ДНК  дневно..., и да се тај сегмет развоја секвенцера ДНК развија невероватном брзином.   
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Фебруар 20, 2024, 09:38:21 поподне
Нисам успио пронаћи Y-DNA резултате у горе постављеном раду, иако наводе да су их дали у прилозима. Прилози ми се чине као да су непотпуни.

Сирови резултати такође још нису постављени на ENA.

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB68333?show=xrefs
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Фебруар 20, 2024, 09:58:48 поподне
Нисам успио пронаћи Y-DNA резултате у горе постављеном раду, иако наводе да су их дали у прилозима. Прилози ми се чине као да су непотпуни.

Сирови резултати такође још нису постављени на ENA.

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB68333?show=xrefs

Има терминалних SNP у прилогу 2, први Excel sheet. Све саме Corded Ware хаплогрупе: R1b-U106, R1b-U152, R1a-Z280 и један I2a2-L596
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Фебруар 20, 2024, 10:20:10 поподне
Има терминалних SNP у прилогу 2, први Excel sheet. Све саме Corded Ware хаплогрупе: R1b-U106, R1b-U152, R1a-Z280 и један I2a2-L596

Сад видим, нисам изгледа био нешто добро отворио.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Фебруар 25, 2024, 08:50:06 поподне
Видим да се данас махнито прича о раду "Ancient DNA connects large-scale migration with the spread of Slavic-associated culture" али не могу нигде да га нађем. Ни цео рад нити фајлове.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Фебруар 25, 2024, 08:54:12 поподне
(https://i.postimg.cc/P5tyZ0XQ/GHMVr-LDWYAAC1sd.png) (https://postimages.org/)
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Фебруар 25, 2024, 09:28:39 поподне
Осим апстракта ништа:
https://submissions.e-a-a.org/eaa2024/repository/preview.php?Abstract=2928

Дио

https://submissions.e-a-a.org/eaa2024/repository/preview.php?Session=395
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Бећар Март 02, 2024, 07:08:57 поподне
https://reich.hms.harvard.edu/sites/reich.hms.harvard.edu/files/inline-files/1-s2.0-S0092867423011352-main.pdf
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Radul Март 03, 2024, 03:57:48 поподне
Авари, ДНК:
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1xZiBbFyUCSJdi7FIhnO2vA9jIYm1o6JK/edit?usp=drivesdk&ouid=113772804893042566331&rtpof=true&sd=true
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небо_Сав Март 07, 2024, 10:34:10 поподне
https://www.pnas.org/doi/full/10.1073/pnas.2310545121#abstract (https://www.pnas.org/doi/full/10.1073/pnas.2310545121#abstract)

Genomic ancestry and social dynamics of the last hunter-gatherers of Atlantic France
I2a1 (I-L460), интересантан је процењени фенотип, са тамном кожом и плавим очима

Превод: гугл
Значај
Још од раног холоцена, западну и централну Европу насељавала је генетски различита група ловаца-сакупљача. Генерисали смо различите типове биомолекуларних података, укључујући секвенцирање комплетних генома велике покривености, из људских скелетних остатака сахрањених на иконичним локацијама Тевијек и Хоедик у Бретањи, који представљају неке од последњих ловаца-сакупљача западне Европе. Подаци показују да су ови последњи сакупљачи били део мреже људи који су одржавали егзогамне праксе. Ове социјално-културне динамике допринеле су избегавању инбридинга. Неки од појединаца сакупљача временски се поклапају са доласком неолитских фармера у суседне регионе. Међутим, нисмо нашли никакво наслеђе везано за фармере у анализираним ловцима-сакупљачима и мреже за размену партнера чине се искључивим за групу сакупљача.

Апстракт
Још од раног холоцена, западну и централну Европу насељавала је генетски различита група западних ловаца-сакупљача (WHGs). Ова група је на крају замењена и асимилована од стране долазећих неолитских фармера. Западни атлантски фасад био је дом неким од последњих мезолитских локалитета континенталне Европе, представљених иконичним отвореним локалитетима у Хоедику и Тевијеку у јужној Бретањи, Француска. Ови локалитети су познати по необично добро очуваним и богатим гробљима. Геномске студије мезолитских европских ловаца-сакупљача биле су ограничене на појединачне или неколико појединаца по локацији и наше разумевање социјалне динамике последњих мезолитских ловаца-сакупљача у Европи и њихових интеракција са долазећим фармерима је ограничено. Секвенцирали смо и анализирали комплетне геноме 10 појединаца са мезолитских локалитета Хоедик, Тевијек и Шампињи у Француској, четири од којих су секвенцирани са 23 до 8 пута већим покривањем генома. Анализа геномских, хронолошких и исхранских података открила је да су популације касног мезолита у Бретањи одржавале различите социјалне јединице у мрежи која размењује партнере. Ово је резултирало ниским биолошким сродством унутар групе које је спречавало консангвинично спаривање, упркос малој величини популације касног мезолита. У анализираним ловцима-сакупљачима нисмо пронашли генетско наслеђе од неолитских фармера, иако су неки од њих можда постојали у исто време са првим пољопривредним групама у суседним регионима. Стога, за разлику од претходних закључака базираних на стабилним изотопским подацима са истих локалитета, заједница касних мезолитских сакупљача била је ограничена на размену партнера са суседним групама ловаца-сакупљача, на искључење неолитских фармера.

(https://i.postimg.cc/G2HsjJcj/screenshot-2.png)
(https://i.imgur.com/LR6lFZu.png)

https://i.imgur.com/ErSDEqQ.png

(https://i.imgur.com/NzYrB3M.png)

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Март 07, 2024, 11:06:23 поподне
https://www.pnas.org/doi/full/10.1073/pnas.2310545121#abstract (https://www.pnas.org/doi/full/10.1073/pnas.2310545121#abstract)

Genomic ancestry and social dynamics of the last hunter-gatherers of Atlantic France
I2a1 (I-L460), интересантан је процењени фенотип, са тамном кожом и плавим очима

Превод: гугл
Значај
Још од раног холоцена, западну и централну Европу насељавала је генетски различита група ловаца-сакупљача. Генерисали смо различите типове биомолекуларних података, укључујући секвенцирање комплетних генома велике покривености, из људских скелетних остатака сахрањених на иконичним локацијама Тевијек и Хоедик у Бретањи, који представљају неке од последњих ловаца-сакупљача западне Европе. Подаци показују да су ови последњи сакупљачи били део мреже људи који су одржавали егзогамне праксе. Ове социјално-културне динамике допринеле су избегавању инбридинга. Неки од појединаца сакупљача временски се поклапају са доласком неолитских фармера у суседне регионе. Међутим, нисмо нашли никакво наслеђе везано за фармере у анализираним ловцима-сакупљачима и мреже за размену партнера чине се искључивим за групу сакупљача.

Апстракт
Још од раног холоцена, западну и централну Европу насељавала је генетски различита група западних ловаца-сакупљача (WHGs). Ова група је на крају замењена и асимилована од стране долазећих неолитских фармера. Западни атлантски фасад био је дом неким од последњих мезолитских локалитета континенталне Европе, представљених иконичним отвореним локалитетима у Хоедику и Тевијеку у јужној Бретањи, Француска. Ови локалитети су познати по необично добро очуваним и богатим гробљима. Геномске студије мезолитских европских ловаца-сакупљача биле су ограничене на појединачне или неколико појединаца по локацији и наше разумевање социјалне динамике последњих мезолитских ловаца-сакупљача у Европи и њихових интеракција са долазећим фармерима је ограничено. Секвенцирали смо и анализирали комплетне геноме 10 појединаца са мезолитских локалитета Хоедик, Тевијек и Шампињи у Француској, четири од којих су секвенцирани са 23 до 8 пута већим покривањем генома. Анализа геномских, хронолошких и исхранских података открила је да су популације касног мезолита у Бретањи одржавале различите социјалне јединице у мрежи која размењује партнере. Ово је резултирало ниским биолошким сродством унутар групе које је спречавало консангвинично спаривање, упркос малој величини популације касног мезолита. У анализираним ловцима-сакупљачима нисмо пронашли генетско наслеђе од неолитских фармера, иако су неки од њих можда постојали у исто време са првим пољопривредним групама у суседним регионима. Стога, за разлику од претходних закључака базираних на стабилним изотопским подацима са истих локалитета, заједница касних мезолитских сакупљача била је ограничена на размену партнера са суседним групама ловаца-сакупљача, на искључење неолитских фармера.

(https://i.postimg.cc/G2HsjJcj/screenshot-2.png)
(https://i.imgur.com/LR6lFZu.png)

https://i.imgur.com/ErSDEqQ.png

(https://i.imgur.com/NzYrB3M.png)

Што се фенотипа тиче, то је типичан фенотип западних ловаца-сакупљача, од којих нам је остала хаплогрупа I2. Међутим неки од анализираних узорака имају другачији фенотип:

Цитат
We observe that while most individuals carry the dark skin and blue eyes characteristic of WHGs, D(4)-hoe003 and J(11)-hoe005 likely had pale to intermediate skin pigmentation.

Ово су они узорци који су поцепали грану I2a-L161. Иако су на PCA заузели сам шпиц WHG и магдаленског клина, изгледа су ипак имали и источњачке генетике, можда неку EHG примесу. О овим узорцима је већ било речи на теми https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=6835.msg195349#msg195349 (https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=6835.msg195349#msg195349).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Небо_Сав Март 07, 2024, 11:36:37 поподне
Што се фенотипа тиче, то је типичан фенотип западних ловаца-сакупљача, од којих нам је остала хаплогрупа I2. Међутим неки од анализираних узорака имају другачији фенотип:

Ово су они узорци који су поцепали грану I2a-L161. Иако су на PCA заузели сам шпиц WHG и магдаленског клина, изгледа су ипак имали и источњачке генетике, можда неку EHG примесу. О овим узорцима је већ било речи на теми https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=6835.msg195349#msg195349 (https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=6835.msg195349#msg195349).
Хвала, Кековче, извињавам се,  вероватно сам превидео сам ову тему, тако да нисам  био отворио линк и прочитао чланак. 
Тако је то кад у постовима нема табела, дијаграма, слика..  :). Зато сам их ја стављам у поруке, изгледа ми прегледније, и потребно је мање времена при читању  да се види о чему се ради. Па ако је интересантно, може да се иде на линк, односно чланак. Хвала, у сваком случају.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Јовица Кртинић Март 17, 2024, 03:19:46 поподне
Интересантна емисија емитована на РТС у којој се говори и о археогенетичким налазима у истраживању порекла Словена (од 7:20):

https://www.youtube.com/v/HdF0oasqSdQ


Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Март 18, 2024, 09:18:38 пре подне
Нова студија древне ДНК о етногенези германских народа, преко 700 нових секвенцираних узорака. Ради се о препринту.

Steppe Ancestry in western Eurasia and the spread of the Germanic Languages

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.13.584607v1

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.13.584607v1.supplementary-material
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Март 18, 2024, 09:30:14 пре подне
Колико видим, два I2-Y3120 су нађена у Данској, али у викиншком периоду, вјероватно као генетички уплив сјеверних Словена.

У Данској су пронађена и два I2-M423 (видјећемо послије да ли ће бити и нешто ниже), један из раног неолита, други из гвозденог доба.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Март 18, 2024, 09:42:24 пре подне
Што се тиче E-V13, пронађено је неколико узорака, већина из историјског периода. Најстарија два су из гвозденог доба са подручја Крима, један би требао бити https://www.yfull.com/tree/E-BY5022/ а други https://www.yfull.com/tree/E-A2192/

Доминантно словенске гране хаплогрупе R1a, R1a-Z280 и R1a-M458, пронађене само код три узорка. Хаплогрупа R1a-Z280 пронађена код једног узорка из гвозденог доба на тлу Француксе (латенска култура) и код једног узорка из Данске (антика). Хаплогрупа R1a-M458, тачније узводнија R1a-PF6155, нађена код једног узорка из Данске из периода антике.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Март 18, 2024, 10:10:40 пре подне
Занимљиво је да је грана https://www.yfull.com/tree/I-Y7627/ која је иначе приутна на нашим просторима пронађена у овом истраживању у узорку из гвозденог доба на подручју Данске (Јитланда).
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Март 18, 2024, 11:01:49 пре подне
Na koji način vršite pretragu po uzorcima?
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Март 18, 2024, 11:07:38 пре подне
Na koji način vršite pretragu po uzorcima?

У Supplementary Material постоји ексцел табела са подацима о узорцима.
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2024/03/14/2024.03.13.584607/DC4/embed/media-4.xlsx?download=true
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Март 18, 2024, 12:14:34 поподне
Занимљиво је да је грана https://www.yfull.com/tree/I-Y7627/ која је иначе приутна на нашим просторима пронађена у овом истраживању у узорку из гвозденог доба на подручју Данске (Јитланда).

Потврђена је припадност овој грани код два рода из књиге о Херцеговцима: Љубибратићи и Миљанићи и Росандићи. Занимљив резултат.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Март 18, 2024, 12:52:53 поподне
Нађох једног J-Z423, Римљани у Холандији. мтДНА K1a4.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: ВелиборЛазић13 Март 18, 2024, 02:17:00 поподне
Потврђена је припадност овој грани код два рода из књиге о Херцеговцима: Љубибратићи и Миљанићи и Росандићи. Занимљив резултат.

Бабићу је у петак стигао прибор из Дантеа (за рекордних 18 дана од уплате) тако да ћемо у догледној (надамо се) будућности имати и првог дубински тестираног Миљанића.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Март 18, 2024, 04:06:05 поподне
Интересантна емисија емитована на РТС у којој се говори и о археогенетичким налазима у истраживању порекла Словена (од 7:20):

https://www.youtube.com/v/HdF0oasqSdQ

Одличан видео. Поменули су и Никчеве Лимиганте и исто их довели у везу са Словенима.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Христифор Март 18, 2024, 05:46:27 поподне
Надам се да је емитовано у адекватном термину на јавном сервису.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: CosicZ Март 19, 2024, 05:05:47 пре подне
Нова студија древне ДНК о етногенези германских народа, преко 700 нових секвенцираних узорака. Ради се о препринту.

Steppe Ancestry in western Eurasia and the spread of the Germanic Languages

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.13.584607v1

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.13.584607v1.supplementary-material
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.13.584607v1.full-text
(https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2024/03/14/2024.03.13.584607/F4.large.jpg)

(https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2024/03/14/2024.03.13.584607/F12.large.jpg)
Цитат
By using Iron Age sources for Western, Southern and Eastern Scandinavians (set 6, Extended Data Figure 6), we are able to ascertain more specific source populations and regions for migrations previously described more broadly to Northern Europe (Gretzinger, Langobards, Stolarek). South of the Nordic region, the Jutlandic Iron Age source to be the primary Scandinavian ancestry to the west (present day Germany, the Netherlands and England). Further east, populations of present-day Poland, Lithuania, Latvia, Estonia, Öland and Finland are primarily mixtures of Eastern Scandinavian and Baltic Bronze Age ancestries.

The arrival of northern continental European ancestry during the Saxon period in England from a broad region ranging from the Netherlands to Southern Sweden has previously been shown 47. Here we find almost all samples from England fall within the Southern Scandinavian clusters, restricting the range from the Netherlands to Jutland (Extended Data Figure 7). By adding a second Iron Age Southern Scandinavian source from Mecklenburg, Northern Germany, we are able to distinguish between the two Southern Scandinavian IA sources, allowing us to restrict this range further (Extended Data Figure 7). We find Southern Scandinavian ancestry in almost all Saxons from England, Frisians from the Netherlands and Iron Age Germans to be modelled as the Northern German source. Interestingly, the distribution of those two closely related ancestries largely resembles that of the two lineages of the dominant R1b Y-chromosome in the region (Supplemental Section 6.6.4.2). In contrast, individuals from Northern Jutland are modelled primarily as the local Southern Scandinavian IA ancestry.


Similarly, we find another West Germanic speaking population, the Langobards from the Czech Republic, Hungary, and Italy to be modelled as primarily Southern Scandinavian IA (Figure S6.9.6.1), and, accordingly, to carry a few Y haplogroups lineages restricted to Scandinavia. In contrast, we find the (supposed East Germanic-speaking) Polish Wielbark individuals, to be modelled primarily as Eastern Scandinavian. However, most later individuals associated with the originally East Germanic-speaking groups, the Ukrainian Ostrogoths and the Visigoths of Iberia, appear to be locals (Supplementary Note 6.9.6). Two exceptions are from Goths from Iberia, who genetically fall on the Northeast-Southeast Baltic cline (one of which carries a Northern European Y haplogroups), suggesting an origin in North East Europe, but not Eastern Scandinavia specifically. This cline includes populations related to the spread of Slavic populations in Poland, Hungary and the Czech Republic and are to be related to the Baltic Bronze Age ancestry originating in North East Europe (Supplementary Note 6.9.7). With the current sampling, determining a more precise homeland of the Slavic migrations is not yet possible.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Март 19, 2024, 06:15:42 пре подне
Иначе једна од нових теза о поријеклу германских народа који је донио горе поменути рад јесте да су се првобитни говорници германских језика формирали у источној Скандинавији и да су били формирани од досељеника са балтичког копна. Ова сеоба која је ишла по свему судећи морским путем , преко Балтичког мора, десила се који вијек касније у односу на први продор Индоевропљана у Скандинавију. Из источне Скандинавије су се говорници прото-германског ширили на остале дијелове Скандинавије, мијешајући се са раније досељеним слојем Индоевропљана, а затим су се тако помијешани ширили по сјеверној Европи и даље.

Ово је закључак аутора рада на основу генетичке анализе и кластеровања. Као лингвистичку повезницу наводе неке заједничке изоглосе германских и балто-словенских језика, док за археолошки контекст оваквог сценарија и сами наводе да не виде повезницу.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Март 20, 2024, 10:38:23 пре подне
Још један препринт древне днк, гвоздено доба италских популација, око 50 геномских узорака

The Genomic portrait of the Picene culture: new insights into the Italic Iron Age and the legacy of the Roman expansion in Central Italy.

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.18.585512v1
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.18.585512v1.supplementary-material
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Март 20, 2024, 10:50:23 пре подне
Још један препринт древне днк, гвоздено доба италских популација, око 50 геномских узорака

The Genomic portrait of the Picene culture: new insights into the Italic Iron Age and the legacy of the Roman expansion in Central Italy.

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.18.585512v1
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.18.585512v1.supplementary-material

Углавном су тестирани узорци Пицена (италског народа са јадранске обале) и у нешто мањем броју Етрушчана. Што се тиче хаплогрупа нису ишли нешто превише дубоко у профилацију. Али су мање више присутне R1b-L23, J2-M12, I2-L460, J1-F1614, J-M304 и G2-L1259.

У апстракту рада је подцртано оно што се знало већ из ранијих студија. Римско Царство је на Апенинском полуострву довело до значајнијих промејна у мјешавини становништва, са помјерањем генетичке мјешавине више у источномедитреанском правцу. "Lastly, In the Late Antiquity period, the genetic landscape of the Middle Adriatic region drastically changed, indicating a relevant influx from the Near East."
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Март 21, 2024, 10:48:19 поподне
Иначе једна од нових теза о поријеклу германских народа који је донио горе поменути рад јесте да су се првобитни говорници германских језика формирали у источној Скандинавији и да су били формирани од досељеника са балтичког копна. Ова сеоба која је ишла по свему судећи морским путем , преко Балтичког мора, десила се који вијек касније у односу на први продор Индоевропљана у Скандинавију. Из источне Скандинавије су се говорници прото-германског ширили на остале дијелове Скандинавије, мијешајући се са раније досељеним слојем Индоевропљана, а затим су се тако помијешани ширили по сјеверној Европи и даље.

Ово је закључак аутора рада на основу генетичке анализе и кластеровања. Као лингвистичку повезницу наводе неке заједничке изоглосе германских и балто-словенских језика, док за археолошки контекст оваквог сценарија и сами наводе да не виде повезницу.

Ако сам добро разумео, приметили су три таласа насељавања Скандинавије у бронзаном добу. Први је култура бојних секира, чији су носиоци доминантно имали хаплогрупу R1a-Z284 и били су аутозомну чисти Corded Ware, друга је јужно-скандинавска популација која је имала Bell Beaker уплив и доминантну хаплогрупу R1b-U106, а трећи талас је овај покрет народа са континенталне Европе, чији су носиоци имали појачану компоненту бетонских ловаца-сакупљача и доминантну хаплогрупу I1.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Март 22, 2024, 05:46:07 пре подне
Ако сам добро разумео, приметили су три таласа насељавања Скандинавије у бронзаном добу. Први је култура бојних секира, чији су носиоци доминантно имали хаплогрупу R1a-Z284 и били су аутозомну чисти Corded Ware, друга је јужно-скандинавска популација која је имала Bell Beaker уплив и доминантну хаплогрупу R1b-U106, а трећи талас је овај покрет народа са континенталне Европе, чији су носиоци имали појачану компоненту бетонских ловаца-сакупљача и доминантну хаплогрупу I1.

Вјероватно си у праву, нисам успио ни сам најбоље разумјети ову повезницу са хаплогрупама. Мало су нејасно написали. У погледу ових ловаца сакупљача, схватио сам да се ради о ловачко-саклупљачком удјелу у генетици који није био скандинавског поријекла, већ досељен са балтичког копна.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: drajver Март 22, 2024, 07:02:00 пре подне
Мађари се не заустављају са археогенетичким истраживањима. Овај пут су испрофилисали један од најстаријих мађарских родова, род Аба, негдје се помињу и као племе. Били су уско повезани са Арпадовићима. У старим хроникама њихово поријекло је повезивано са Кабарима (Хазарима), Хунима, Куманима. Генетичка тестирања њихових остатака из средњовјековне гробнице у Абасару (сјевер Мађарске) показала су источноазијско поријекло. Профилисани су као припадници хаплогрупе https://www.yfull.com/tree/N-A9408/ која је присутна како на Далеком истоку, тако и у данашњој Мађарској. Један припадник ове гране тестиран је у околини Задра у Хрватској.
https://en.wikipedia.org/wiki/Aba_(genus)

Archaeogenetic analysis revealed East Eurasian paternal origin to the Aba royal family of Hungary
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.20.585718v1.full.pdf
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.20.585718v1.supplementary-material

У раду су дали приказ најближих филогенетичких веза хаплогрупе N-A9408

(https://i.postimg.cc/9Mn4f7KH/aba-clan.png)

Без обзира што се веома рано налазе у најужем кругу мађарске родовске елите, чини ми се да би се у случају Аба рода могло радити о оригинално аварском роду (иако аварска елита припада другој грани хаплогрупе https://www.yfull.com/tree/N-CTS1678/). Ипак чини ми се да је нека туркојезична популација била основ.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Ивица Јовановић Март 27, 2024, 07:22:38 поподне
Све координате нових аварских узорака:

https://pastebin.com/7UyfZ0pZ


Провукао сам их кроз вахадуо и дало је прилично шарену слику. Има узорака који екстремно вуку на север и запад Европе.
Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Душан Март 27, 2024, 09:16:20 поподне
Све координате нових аварских узорака:

https://pastebin.com/7UyfZ0pZ


Провукао сам их кроз вахадуо и дало је прилично шарену слику. Има узорака који екстремно вуку на север и запад Европе.

Упоредио сам са својим резултатима, HNJ004.A0101.TF2 има наш аутосомални профил.


Distance to:   Dušan_scaled
0.02278051   Avars:HNJ004.A0101.TF2
0.03480900   Avars:RKF224.A0101.TF1
0.03564977   Avars:RKF134.A0101.TF1
0.03918559   Avars:RKF183.A0101.TF1
0.03926528   Avars:KUP015.A0101.TF1


Distance to:   Avars:HNJ004.A0101.TF2
0.02327538   Serbian
0.02556610   Moldovan
0.02753676   Bosnian
0.02846663   Montenegrin
0.02881104   Romanian
0.03144305   Croatian
0.03228437   Macedonian
0.03404651   Slovenian
0.03559195   Bulgarian
0.03684031   Hungarian



Target: Avars:HNJ004.A0101.TF2
Distance: 2.0572% / 0.02057151 | ADC: 0.25x RC
43.6   Ukrainian_Lviv
32.4   Greek_Macedonia
18.0   Serbian
5.4   Spanish_Asturias
0.6   Baniya_Uttar_Pradesh_Gupta

Наслов: Одг: Древна ДНК - научни радови
Порука од: Кековац Март 27, 2024, 10:59:45 поподне
Вјероватно си у праву, нисам успио ни сам најбоље разумјети ову повезницу са хаплогрупама. Мало су нејасно написали. У погледу ових ловаца сакупљача, схватио сам да се ради о ловачко-саклупљачком удјелу у генетици који није био скандинавског поријекла, већ досељен са балтичког копна.

Узорке из Скандинавије старије од 2.800 година су издвојено кластеризовали коришћењем IBD уломака и испоставило се да се три добијена кластера корелишу са хаплогрупама мушких узорака, као што се види на једној од мапа из рада:

(https://i.postimg.cc/259ZNz5N/Scandinavia-Haplogroups.png)