Аутор Тема: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа  (Прочитано 5844 пута)

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« послато: Децембар 09, 2021, 12:43:53 поподне »
Друштво српских родословаца “Порекло” покренуло је пројекат истраживања ретких подграна различитих Y-ДНК хаплогрупа. Детаљнијом профилизацијом ретких подграна, које су често и “базалне” односно представљају нека од првих гранања Y-ДНК хаплогрупа које проучавамо, добила би се јаснија слика настанка и раног ширења појединачних хаплогрупа, што су подаци који би били од користи за целокупну генетичко-генеалошку заједницу.

Потреба за овим пројектом се првобитно јавила након што се на Y-ДНК стаблу компаније Yfull, која се бави анализом сирових резултата “великих тестова” генома, појавио резултат под шифром YF89281 (порекло – Босна и Херцеговина), који је означен као I2*. Тестирани YF89281 припада једној од базалних грана I2 хаплогрупе која је изузетно ретка на светском нивоу и до сада је дефинисана само у бази компаније FTDNA, у питању је I2b-L415. С обзиром да је она имала врло рано одвајање и прилично различит “развојни пут” у односу на остале, знатно бројније подгране хаплогрупе I2, њеним даљим проучавањем и профилизацијом (од којих би први корак био “упаривање” тестираног YF89281 са још једним припадником I2b-L415 који би урадио неки од “великих тестова” и свој резултат проследио Yfull-у, чиме би грана I2b-L415 била видљива и на стаблу компаније Yfull) би био омогућен увид и у рану историју и ширење саме I2 хаплогрупе.

Овај пројекат је замишљен као место где појединци који су заинтересовани за проучавање и профилизацију ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа које се јављају на простору југоисточне Европе могу да изврше новчану донацију ради:

-сакупљања финансијских средстава за наручивање STR теста или појединачног SNP теста за кандидате за које постоје индиције да припадају некој од ретких подграна;

-сакупљања финансијских средстава за наручивање неког од “великих тестова” генома (YSEQ, Dante Labs, Nebula Genomics) за потврђене припаднике ретких подграна;

-сакупљања финансијских средстава ради плаћања услуге анализе сирових резултата већ урађеног “великог теста” неког од припадника ретких подграна код компаније Yfull.

Први приоритет овог пројекта би био да се сакупе средства за наручивање теста целог генома код компанија Dante Labs, Nebula Genomics или YSEQ за још једног припадника гране I2b-L415, са прослеђивањем резултата теста Yfull-у након завршетка секвенцирања. Осим овога, могуће је предложити и донирати и за истраживање других ретких подграна различитих Y-ДНК хаплогрупа.

Донације за пројекат се могу уплатити путем Paypal-a, позивом на имејл адресу [email protected], и са назнаком “Пројекат истраживања ретких подграна“. Ако желите да средства донирате само за истраживање одређене подгране, онда у наставку требате написати назив те подгране, нпр. “Пројекат истраживања ретких подграна – I2b-L415”.

Донације се могу уплатити и на динарски рачун у банци Banca Intesa [Прималац: Друштво српских родословаца “Порекло”, Љуба Вучковића 11/2, Београд − Сврха: Пројекат истраживања ретких подграна − Број рачуна : 160-536822-04].

https://www.poreklo.rs/2021/12/07/projekat-istrazivanja-retkih-podgrana-y-dnk-haplogrupa/

Доступна је и верзија на енглеском језику:

https://www.poreklo.rs/2021/12/08/y-dna-rare-subclades-research-project/
Чињеницама против самоувереног незнања.

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #1 послато: Децембар 09, 2021, 12:52:12 поподне »
На овој теми, као и на чланцима на порталу, ћемо водити списак приложника за овај пројекат по датумима. Биће наведено име и презиме приложника (осим у случају да жели да остане анониман) и сума која је донирана. Укупни збир средстава ће бити обрачунаван у еврима.

Чињеницама против самоувереног незнања.

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #2 послато: Децембар 09, 2021, 01:26:23 поподне »
08.12.2021.

Владимир Бојановић (I2b-L415) - 5000 динара
Драган Обреновић (I2b-L415) - 5000 динара

Збир - 85,02 евра
« Последња измена: Децембар 10, 2021, 10:38:14 пре подне НиколаВук »
Чињеницама против самоувереног незнања.

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #3 послато: Децембар 09, 2021, 08:57:11 поподне »
09.12.2021.

Веселинко Васић - 18,57 евра
Никола Павловић - 84,56 евра

Збир - 188,15 евра
« Последња измена: Децембар 10, 2021, 11:49:19 пре подне НиколаВук »
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Владимир Бојановић

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 1360
  • I2>PH908>Y52621>FT190799 Лимски (Тарски) Никшић
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #4 послато: Децембар 10, 2021, 08:33:23 пре подне »
Поздрављам Николу и овај пројекат, надам се да ће довољан број људи препознати значај ове акције и учествовати у донирању средстава. Само да додам један предлог, део средстава из овог буџета би могао бити искоришћен и за прослеђивање YFull-у Y анализе једног скелета из Лепенског вира, који је припао I2b-BY32198, узводној I2b-L415: https://haplotree.info/maps/ancient_dna/slideshow_samples.php?searchcolumn=Y_Haplotree_Variant&searchfor=I-BY32198*&ybp=500000,0 (потребно је да обухватите цео текст линка који сам налепио, укључујући и део текста који недостаје *&ybp=500000,0  копирате и отворите њиме нову страницу, како би имали конкретан увид у археогенетски резултат).

Уколико неко поседује аутентичан ВАМ фајл, потребно је да се фајл пошаље YFull-у како би ова подграна била видљива на стаблу. Тако ће позиција тестираног YF89281 из Босне и Херцеговина бити доста јаснија и разумљивија, као уосталом и наша акција.

« Последња измена: Децембар 10, 2021, 08:42:56 пре подне Владимир Бојановић »

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #5 послато: Децембар 10, 2021, 10:35:51 пре подне »
Поздрављам Николу и овај пројекат, надам се да ће довољан број људи препознати значај ове акције и учествовати у донирању средстава. Само да додам један предлог, део средстава из овог буџета би могао бити искоришћен и за прослеђивање YFull-у Y анализе једног скелета из Лепенског вира, који је припао I2b-BY32198, узводној I2b-L415: https://haplotree.info/maps/ancient_dna/slideshow_samples.php?searchcolumn=Y_Haplotree_Variant&searchfor=I-BY32198*&ybp=500000,0 (потребно је да обухватите цео текст линка који сам налепио, укључујући и део текста који недостаје *&ybp=500000,0  копирате и отворите њиме нову страницу, како би имали конкретан увид у археогенетски резултат).

Уколико неко поседује аутентичан ВАМ фајл, потребно је да се фајл пошаље YFull-у како би ова подграна била видљива на стаблу. Тако ће позиција тестираног YF89281 из Босне и Херцеговина бити доста јаснија и разумљивија, као уосталом и наша акција.

Хвала Владо, потпуно се слажем што се тиче скелета. Која би била процедура за слање његовог BAM фајла, односно како се древни узорци "кандидују" за слање на Yfull анализу?
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Драган Обреновић

  • Члан Управног одбора
  • Истраживач
  • *
  • Поруке: 955
  • R1b-U152>FTA27217
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #6 послато: Децембар 10, 2021, 11:06:27 пре подне »
Не знам стварно како то иде, али видим да они на стаблу имају неке археогенетске резултате из Лепенског Вира,  рецимо:

https://www.yfull.com/tree/I-BY33164/
https://www.yfull.com/tree/R-V88/

Основно питање је ко уопште има сирове BAM фајлове са резултатима секвенцирања скелета из Лепенског Вира који нису на YFull стаблу? Ако бисмо их лоцирали, верујем да би било довољно контактирати Татјану из YFulla путем мејла и питати за даљу процедуру, обично су врло респонзивни. Верујем да они овакве резултате анализирају бесплатно.
« Последња измена: Децембар 10, 2021, 11:15:35 пре подне Драган Обреновић »

Ван мреже Никац

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 938
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #7 послато: Децембар 10, 2021, 11:57:59 пре подне »
Не знам стварно како то иде, али видим да они на стаблу имају неке археогенетске резултате из Лепенског Вира,  рецимо:

https://www.yfull.com/tree/I-BY33164/
https://www.yfull.com/tree/R-V88/

Основно питање је ко уопште има сирове BAM фајлове са резултатима секвенцирања скелета из Лепенског Вира који нису на YFull стаблу? Ако бисмо их лоцирали, верујем да би било довољно контактирати Татјану из YFulla путем мејла и питати за даљу процедуру, обично су врло респонзивни. Верујем да они овакве резултате анализирају бесплатно.

fajlovi su dostupni ovdje:
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB22652?show=reads

Ван мреже Драган Обреновић

  • Члан Управног одбора
  • Истраживач
  • *
  • Поруке: 955
  • R1b-U152>FTA27217
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #8 послато: Децембар 10, 2021, 12:15:28 поподне »
Браво! То би требало да је овај BAM:

ftp://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/run/ERR221/ERR2216773/I4870.bam

Accession: SAMEA104422934
Sample Title: Iron_Gates_HG
Center Name: HARVARD MEDICAL SCHOOL
Sample Alias: I4870
Checklist: ERC000011
ENA-CHECKLIST: ERC000011
ENA-SPOT-COUNT: 5277988
ENA-BASE-COUNT: 256304603
ENA-FIRST-PUBLIC: 2018-02-19

Ван мреже Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2511
  • I2-BY55783>BY79593
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #9 послато: Децембар 10, 2021, 02:38:54 поподне »
Поднео сам управо захтев за додавање узорка I4870 на стабло. YFull не наплаћује додавање древних и академских узорака на стабло, али су прилично ригорозни по питању квалитета/покривености узорка. Захваљујући јако доброј очуваности ендогене ДНК у костима, велики део узорака из Лепенског Вира је shotgun ресеквенциран и одличног су квалитета, и скоро сви мушки се већ налазе на YFull стаблу:

https://www.yfull.com/tree/I-BY33164/

https://www.yfull.com/tree/I-CTS10057/

https://www.yfull.com/tree/I-Z161/

https://www.yfull.com/tree/I-L801/

https://www.yfull.com/tree/I-Y7240/

https://www.yfull.com/tree/R-V2219/

I4870 је нажалост један од ретких узорака који није ресеквенциран, тако да је доступан само 1240K BAM који нема толико добру покривеност, али мислим да има довољно добру да би се могла формирати нова грана испод I2. FTDNA је далеко мање ригорозна по питању квалитета древних узорака, али они из неког разлога не постављају информације о узорцима на стаблу, већ их искључиво користе како би додали/поцепали гране. Очигледно је да је FTDNA управо овај узорак користила како би поцепала грану L417, јер је позитиван баш на ових шест SNP-ова који сада карактеришу узводни ниво BY32198, док су SNP-ови који су остали на нивоу L417 негативни или нису покривени.

« Последња измена: Децембар 10, 2021, 02:41:32 поподне Црна Гуја »

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #10 послато: Децембар 10, 2021, 04:55:24 поподне »
10.12.2021.

Радосав Чворовић - 6000 динара
Данило Лукић - 1000 динара
Живорад Милићевић - 1200 динара

Збир - 257,88 евра
Чињеницама против самоувереног незнања.

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #11 послато: Децембар 11, 2021, 10:17:36 поподне »
11.12.2021.

Зоран Ћосић (I2b-L415) - 3000 динара
Срђан Полић (I2b-L415) - 23,48 евра

Збир - 306,87 евра
« Последња измена: Децембар 13, 2021, 12:23:27 поподне НиколаВук »
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Бећар

  • Члан Друштва
  • Помоћник
  • *****
  • Поруке: 169
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #12 послато: Децембар 12, 2021, 08:52:02 поподне »
Пар речи у подршци коментара Драгану Обреновићу и активности од Цргна Гуја.  Да ли се овим фондом може више подржавати-организовати детаљније ДНК тестирање наших архолошких и сличних налазишта која су слабо заступљена на јавним ДНК базама података?  Ми имамао јако мало ДНК информација за нас важан историски период од негде 8ог па до 15ог века. Добро, сви су период важни и ја само дајем пример времена великих династија западног Балкана, почетка тог периода кад смо скоро сви били православци, па до доласка Отоман Турака.

Видим да ту људи већ знају ... у већини случајева таква тестирања би била урађена бесплатно ако само неко реши проблеме везане за осигуравње примерака, и све комуникације везаних унутар и ван наше земље.  Наравно да ти проблеми нису лаки код нас решити, али нећемо сада одма почети са шта се не може и шта је тешко.

Постићи тестирање неког из једних од словенских династија Балкана би привукло локално и интернационално интересовање. Можда би и повезало неочекивана географска места и повезало нас за династије ван Србије и Балкана. Погледај те колико интересовања привлаче налазиша Викинга у Пољској, Данској, Енглеској и све дискусије око оснивања Русије везано за Рурик династију и налазишта везана у Скандинавији, Кијеву, и Пољској.

Зар то није боље коришћење пара јер би се радило о тршковима комуникација и решавања логистичких проблема везаних за наше људе и институције. То је често главна препрека успеха код нас. Зар постићи тако нешто неби било више од интереса Друштву Порекло и дало пажњу многих других, него истрживање једне од чудних грана на И2, И1 или слично?
« Последња измена: Децембар 12, 2021, 08:54:11 поподне Бећар »

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #13 послато: Децембар 14, 2021, 01:35:11 поподне »
13.12.2021.

Дамјан Мартић - 3000 динара

Збир - 332,38 евра
Чињеницама против самоувереног незнања.

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #14 послато: Децембар 14, 2021, 02:07:27 поподне »
Пар речи у подршци коментара Драгану Обреновићу и активности од Цргна Гуја.  Да ли се овим фондом може више подржавати-организовати детаљније ДНК тестирање наших архолошких и сличних налазишта која су слабо заступљена на јавним ДНК базама података?  Ми имамао јако мало ДНК информација за нас важан историски период од негде 8ог па до 15ог века. Добро, сви су период важни и ја само дајем пример времена великих династија западног Балкана, почетка тог периода кад смо скоро сви били православци, па до доласка Отоман Турака.

Видим да ту људи већ знају ... у већини случајева таква тестирања би била урађена бесплатно ако само неко реши проблеме везане за осигуравње примерака, и све комуникације везаних унутар и ван наше земље.  Наравно да ти проблеми нису лаки код нас решити, али нећемо сада одма почети са шта се не може и шта је тешко.

Постићи тестирање неког из једних од словенских династија Балкана би привукло локално и интернационално интересовање. Можда би и повезало неочекивана географска места и повезало нас за династије ван Србије и Балкана. Погледај те колико интересовања привлаче налазиша Викинга у Пољској, Данској, Енглеској и све дискусије око оснивања Русије везано за Рурик династију и налазишта везана у Скандинавији, Кијеву, и Пољској.

Зар то није боље коришћење пара јер би се радило о тршковима комуникација и решавања логистичких проблема везаних за наше људе и институције. То је често главна препрека успеха код нас. Зар постићи тако нешто неби било више од интереса Друштву Порекло и дало пажњу многих других, него истрживање једне од чудних грана на И2, И1 или слично?

У вези овога се јављају два кључна проблема - институционални и технолошки.

Наше Друштво је удружење грађана, није званична државна институција и нема могућност да усмерава токове археолошких и археогенетских истраживања, самим тим ми не можемо бити покретачи таквих истраживања, то могу радити само институције које су за то задужене (музеји, Археолошки и Историјски институт, заводи за заштиту споменика, Филозофски факултет, итд.). Највише што би ми могли урадити је да сачинимо предлог одређеног пројекта, за одређени јасно постављен циљ и да га потом изложимо институцији која може да обави такво истраживање, на сличан начин како је урађено пре археолошког и археогенетског истраживања гробнице Николе Рашковића Дробњака у Церници код Гацка. Такође не треба губити из вида да је за овакве делатности увек неопходно имати људе у тим институцијама који могу да погурају ствари, јер "падобрански" приступ готово сигурно неће водити до остварења зацртаног циља, колико год он био добро осмишљен и колико год био од вишеструке историјске, културне и сваке друге важности.

У вези технолошких проблема је писао Црна Гуја на теми на затвореном делу форума, па прослеђујем линк ка теми:

https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=6433.msg165768#msg165768
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Бећар

  • Члан Друштва
  • Помоћник
  • *****
  • Поруке: 169
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #15 послато: Децембар 14, 2021, 11:11:04 поподне »
Никола хвала на твом одговору. Разумем одакле пројекат мора официонално да започне и свакао се слажем са тим и коментаром подршке унутар институција. Да наставим са твојом војном терминологијом, ја не предлажем падобранце него извиђаче и комуникационе инжењере.

Моја поента је да такви пројекти ретко започну унутар институција јер за то је неопходно имати неког ко поред веће позиције, мора имати знање, искуство, и јаку мотивацију да се упусти у тај посао са некавим тимом запослених. У институцијама се нажалост ретко нађу такви људи и ситуација. Као што ти већ наводиш, пројекти морају прво бити припремљени са пуно истраживања и презентацијом. Потребно је неко у Друштво Порекло да припреми презентазију и нађе начина како да има прилику за такву презентацију. Да, то наравно није лако. Али ако се презентација припреми тако да жељена слика успеха може постати и "идеја институције", то ће довести до налажења инстутитиционог или политичког спонзора. Онда и помоћи са разним пословима које људи у институцијам не сматрају за своје или једноставно не знају како. Значи гледати то као почетну инвестицију. Осим тога, нису ту само домаће институције у питању, већ сарадња са другим Ex-YU институцијама и спонзорима. Из форума се види да нека познаства постоје, у другим нам блиским државама. Па да ли постоји потенцијал за неки заједнички интересе? Да ли има одабраних поројеката да се истрже и презентује на обе стране ... и тако то. Ако се покрене два лакша, један ће можда узети маха. Са више искуства и повећања познанства, наградити на значјније али теже циљеве.

То наравно има потенцијал да повећа видљивост и углед друштва. Започети на мање компликованим местима. После користити то за презентацију институцијама, црквама ... као кредабилност за значајније циљеве.

Разумем ја да ово није нека оригинална нити лака идеја. Ја знам да ту има мала група добровољаца који доприносе пуно и само вас пар запослених који исто имате пуне руке посла. Можда постоји боље место за ове моје коментаре. Па ти или Бранко преместите их јер не желим да саботирам ову твоју добру иницијативу.

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #16 послато: Децембар 21, 2021, 11:33:30 пре подне »
17.12.2021.

Мира Паунова (I2c-L596) - 28,33 евра

Збир - 360,71 евра
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Васић.РС

  • Шегрт
  • ***
  • Поруке: 69
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #17 послато: Април 19, 2022, 03:13:37 поподне »
Има ли каквих планова за тестирање ових ретких хаплогрупа ?
Поздрав

Ван мреже Драган Обреновић

  • Члан Управног одбора
  • Истраживач
  • *
  • Поруке: 955
  • R1b-U152>FTA27217
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #18 послато: Април 19, 2022, 03:50:35 поподне »
Па послат је у Nebulu узорак од особе предвиђене од НЕВГЕН-а да припада I2 хаплогрупи. Секвенцирање је у току, нека очекивања су да ће формирати нову подграну директно испод I2, заједно са тестираним из БиХ, под бројем YF089281:



НиколаВук је боље упућен докле је стигло секвенцирање, пошто он администрира овај кит.

Ван мреже Слобо

  • Члан Друштва
  • Шегрт
  • *****
  • Поруке: 77
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #19 послато: Април 19, 2022, 04:55:40 поподне »
Поднео сам управо захтев за додавање узорка I4870 на стабло. YFull не наплаћује додавање древних и академских узорака на стабло, али су прилично ригорозни по питању квалитета/покривености узорка. Захваљујући јако доброј очуваности ендогене ДНК у костима, велики део узорака из Лепенског Вира је shotgun ресеквенциран и одличног су квалитета, и скоро сви мушки се већ налазе на YFull стаблу:

https://www.yfull.com/tree/I-BY33164/

https://www.yfull.com/tree/I-CTS10057/

https://www.yfull.com/tree/I-Z161/

https://www.yfull.com/tree/I-L801/

https://www.yfull.com/tree/I-Y7240/

https://www.yfull.com/tree/R-V2219/

I4870 је нажалост један од ретких узорака који није ресеквенциран, тако да је доступан само 1240K BAM који нема толико добру покривеност, али мислим да има довољно добру да би се могла формирати нова грана испод I2. FTDNA је далеко мање ригорозна по питању квалитета древних узорака, али они из неког разлога не постављају информације о узорцима на стаблу, већ их искључиво користе како би додали/поцепали гране. Очигледно је да је FTDNA управо овај узорак користила како би поцепала грану L417, јер је позитиван баш на ових шест SNP-ова који сада карактеришу узводни ниво BY32198, док су SNP-ови који су остали на нивоу L417 негативни или нису покривени.

Sta nam ovi rezultati analiziranih uzoraka is Lepenskog Vira govore? Vidim da 5 od 6 navedenih uzoraka pripada nekoj od podgrupa I2?

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #20 послато: Април 19, 2022, 05:19:33 поподне »
Па послат је у Nebulu узорак од особе предвиђене од НЕВГЕН-а да припада I2 хаплогрупи. Секвенцирање је у току, нека очекивања су да ће формирати нову подграну директно испод I2, заједно са тестираним из БиХ, под бројем YF089281:



НиколаВук је боље упућен докле је стигло секвенцирање, пошто он администрира овај кит.

Као што рече Драган, узорак је у поступку секвенцирања, кад буде дошао резултат највероватније ће на Yfull-у формирати нову подграну са тестираним из БиХ која ће бити на истом нивоу као и I2-L415 са FTDNA стабла.
Чињеницама против самоувереног незнања.

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #21 послато: Мај 19, 2022, 12:09:49 пре подне »
На Небули је завршено секвенцирање I2b-L415 појединца о којем је било речи и његов резултат је прослеђен Yfull-у, који га је прелиминарно одредио као I2*. У питању је Аничић из Дебеље код Нове Вароши (слава Никољдан). Он се првобитно тестирао на 23 STR маркера у оквиру подухвата ДНК истраживања староседелачких родова Старог Влаха и Старе Рашке (чији резултати нису јавни још увек), на основу чега се сазнало да припада овој реткој грани I2 хаплогрупе. Пошто је урађен тест целог генома, његов резултат ће постати јаван, такође ће он вероватно, након завршетка анализе, да формира нову грану на нивоу L415 (видећемо који СНП ће изабрати Yfull) са тестираним из БиХ.

https://www.yfull.com/tree/I2/
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Христифор

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 880
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #22 послато: Мај 19, 2022, 01:19:46 пре подне »
Може мало више речи о овој реткој грани И2b? Делује интригантно.

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #23 послато: Мај 19, 2022, 09:13:44 пре подне »
Може мало више речи о овој реткој грани И2b? Делује интригантно.

Проследићу мој коментар резултата Ђорђевића из Бањице код Чачка, који је до сада био једини јавни припадник ове гране на СДНКП:

30. Ђорђевић, Никољдан, Бањица, Чачак

Припада хаплогрупи I2b-L415. Ђорђевић је први јавни припадник ове изузетно ретке гране I2 хаплогрупе у табели Српског ДНК пројекта, док са необјављених истраживања имамо једног тестираног припадника ове хаплогрупе на 17 маркера (САНУ), који потиче из околине Рибника у Босанској Крајини, и једног тестираног на 23 маркера ("Стари Влах и Стара Рашка") који је из нововарошког краја. У јавној бази FTDNA постоји укупно 7 потврђених или предвиђених припадника ове хаплогрупе, од којих су двојица пореклом из Италије, по један из Ирана, Шкотске и Немачке и двојица непознатог порекла. Због њене реткости и шароликог географског порекла до сада тестираних припадника, не може се са било каквог дозом сигурности рећи какви су у глобалу били миграцијски путеви њених носилаца током праисторијског и историјског периода. Тројица наведених припадника ове хаплогрупе у табели СДНКП су сврстани у један род ("род А"), с обзиром да славе исту славу а за барем двојицу (Ђорђевића и тестираног из околине Нове Вароши) се може установити и директна миграцијска веза, док тестирани из Босанске Крајине вероватно представља огранак који се у ранијем периоду иселио из Старог Влаха ка западу. Kарактеристичнe вредности српског огранка ове хаплогрупе су DYS393=11, DYS385=12-14, DYS456=12 и DYS643=14. Ђорђевић се на 23 упоредивих маркера од тестираног из нововарошког краја разликује на 3 (DYS390, DYS19 и DYS448) за по једну вредност, док се на 17 упоредивих маркера од тестираног из Босанске Крајине такође разликује на 3 (DYS389II, DYS458 и DYS437) за по једну вредност. Занимљиво је да вредности варирају код маркера који су код других хаплогрупа углавном стабилнији и имају спору или средњу стопу мутације, што би можда могла бити још једна од карактеристика овог ретког огранка I2 хаплогрупе.

Тестирани у упитнику није навео никакве податке о даљем пореклу. У књизи "Хроника Јежевице, Бањице, Липнице и Рајца" аутора Младена Стефановића је о пореклу Ђорђевића из Бањице наведено следеће:

"Ђорђевићи (5 кућа), Боровићи (2 куће), Нешковићи (7 кућа), Јелесијевићи (9 кућа), Видојевићи (2 куће), Симовићи (7 кућа) и вероватно Иконићи (6 кућа) су, по свој прилици, један род. Сви славе Никољдан. Дошли су у време Кочине крајине из Косатице код Пријепоља. Истог су порекла, кажу, и Николићи (1 кућа), мада славе Аранђеловдан.

Ђорђевићи приповедају да су стигли од Јавора, али не кажу кога, да су дошли у Острушат (на Ђорђевића косу), где су убили неког Турчина, па побегли у Баре изнад манастира Стјеника, одакле су се после другог српског устанка вратили. На претка Ђорђа упућује њихово презиме. После другог светског рата образовали су три домаћинства у Трнави (срез трнавски), два у Чачку и једно у Пожеги (ужичкој). Занимљива је појединост да се Ђорђевићи јављају, као досељеници, и касније – Панто Ђорђевић, досељен из Бјелуше код Ариља, погинуо је у „јаворском„ рату 1876. године, али његових потомака више нема у Бањици; није јасно шта се са њима догодило (имао је, иначе, потомака).
"

Занимљиво су и подаци о сродним Боровићима и Николићима, преко којих се дознаје вероватни ранији назив целог овог рода (групе породица):

"Боровићи су потомци Борисава Мунигузице, који се помиње у једном документу из 1845. године. Од његовог надимка Боро образовано им је презиме. (Ваља знати да Мунигуза има у Белој Реци, златиборској). После другог светског рата настанили су се и у Трнави (срез трнавски), Београду, Крушевцу и Чачку."

"Николићи су потомци Николе Мунигузице, који се, такође помиње 1845. године остављајући своје име као корен презимену својих потомака. После 1950. године настанили су се (по једно домаћинство) и у Чачку и у Америци."
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Драган Обреновић

  • Члан Управног одбора
  • Истраживач
  • *
  • Поруке: 955
  • R1b-U152>FTA27217
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #24 послато: Мај 19, 2022, 09:38:12 пре подне »
Па да, тешко је нешто поуздано закључити о овој хаплогрупи и путевима њених припадника кроз праисторију, јер су махом били ловци сакупљачи, у сталном покрету. У сваком случају, помогли смо заједнички својим прилозима да се открије и формира нова "базална" хаплогрупа на YFull стаблу, директно испод основне хаплогрупе I2. На FTDNA стаблу је већ ова подграна постојала и доста је шаролика географија (Енглеска, Шкотска, Немачка, Италија, Сирија, Иран).

Што се тиче самог Аничића, као што Никола рече, он је припадник једног ширег рода у региону Старог Влаха, за који је карактеристично да огранци/братства славе Никољдан.

У сваком случају, када се погледа масовност и разгранатост осталих базалних грана I2 хаплогрупе, то само по себи говори да Аничић и раније тестирани мушкарац из БиХ припадају једној невероватно реткој, практично реликтној мушкој лози, чији су данашњи припадници прошли кроз брутално генетичко уско грло и ето, хвала Богу, данас су међу нама.
« Последња измена: Мај 19, 2022, 09:39:57 пре подне Драган Обреновић »

Ван мреже ivanc79

  • Члан Друштва
  • Помоћник
  • *****
  • Поруке: 199
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #25 послато: Мај 19, 2022, 11:06:31 пре подне »
Он се првобитно тестирао на 23 STR маркера у оквиру подухвата ДНК истраживања староседелачких родова Старог Влаха и Старе Рашке (чији резултати нису јавни још увек), на основу чега се сазнало да припада овој реткој грани I2 хаплогрупе.
Да извинете, кад ће бити објављени? Можда има брдо нас којима би ти резултати олакшали потрагу за прецима.

Ван мреже Јовица Кртинић

  • Помоћник уредника
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 4187
  • Нема ни могућег ако не желимо немогуће!
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #26 послато: Мај 19, 2022, 04:12:42 поподне »
Да извинете, кад ће бити објављени? Можда има брдо нас којима би ти резултати олакшали потрагу за прецима.
Резултати су део заједничког истраживања са Биолошким факултетом и свакако не можемо да их објавимо пре него што их они публикују, а ни пре него што ми објавимо студију. То се односи и на резултате Херцеговаца. Ми студију јесмо завршили и објавили, али ћемо свакако сачекати са објављивањем резултата у табели Српског ДНК пројекта док не буде објављена студија колега са Биолошког факултета.

Ван мреже Христифор

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 880
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #27 послато: Мај 19, 2022, 04:21:03 поподне »
Јасно, зна ли се неки оквирни рок?

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #28 послато: Мај 20, 2022, 05:31:39 поподне »
20.05.2022.

Издатак - обавезна месечна претплата за Небулу - 19,72 евра

Издатак - Yfull анализа за тестираног Аничића, I2b-L415 - 41 евро

Збир - 299,99 евра
Чињеницама против самоувереног незнања.

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #29 послато: Јун 07, 2022, 06:35:44 поподне »
На "живом" стаблу Yfull-a се најзад појавила грана I2b. Као одређујући снип је одабран Y283553, а о колико дугачком генетском "уском грлу" се ради говори бројка од преко 290 снипова на истом нивоу.  :) За сада су једини њени припадници на Yfull стаблу Аничић из Дебеље код Нове Вароши и тестирани из БиХ. Било би занимљиво када би још неки ванбалкански припадници ове гране који су радили BigY тест проследили свој резултат Yfull-у, како би се видело време раздвајања. Вероватно ћемо у следећој верзији стабла видети и процену старости и TMRCA.

https://www.yfull.com/live/tree/I-Y283553/
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Драган Обреновић

  • Члан Управног одбора
  • Истраживач
  • *
  • Поруке: 955
  • R1b-U152>FTA27217
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #30 послато: Јун 07, 2022, 07:21:54 поподне »
На "живом" стаблу Yfull-a се најзад појавила грана I2b. Као одређујући снип је одабран Y283553, а о колико дугачком генетском "уском грлу" се ради говори бројка од преко 290 снипова на истом нивоу.  :) За сада су једини њени припадници на Yfull стаблу Аничић из Дебеље код Нове Вароши и тестирани из БиХ. Било би занимљиво када би још неки ванбалкански припадници ове гране који су радили BigY тест проследили свој резултат Yfull-у, како би се видело време раздвајања. Вероватно ћемо у следећој верзији стабла видети и процену старости и TMRCA.

https://www.yfull.com/live/tree/I-Y283553/

Аууу, ово је фасцинантно генетичко "уско грло":



Аничићу је остало 14 приватних мутација, ако отприлике толико има и тестирани из ВиХ, то би по YFull методологији за рачунање TMRCA значило да су имали заједничког претка пре око 2000 година, ако сам добро израчунао.

Ван мреже CosicZ

  • Редакција СДНКП
  • Истраживач
  • ******
  • Поруке: 898
  • Ђурђевдан Y:I1>P109>FGC22045 Панчево
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #31 послато: Јун 07, 2022, 08:12:59 поподне »

Ван мреже Драган Обреновић

  • Члан Управног одбора
  • Истраживач
  • *
  • Поруке: 955
  • R1b-U152>FTA27217
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #32 послато: Јун 07, 2022, 08:47:00 поподне »
Требало би да су овде https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/I;name=I-Y97483 .

Ево и "блок дијаграма" хаплогрупе I-L417 са FTDNA Big Y стабла, где има нешто више тестираних па се боље види како се ова древна хаплогрупа гранала. Приказ је скраћен по висини, јер L417 хаплогрупу тренутно дефинише око 150 мутација.


Ван мреже Драган Обреновић

  • Члан Управног одбора
  • Истраживач
  • *
  • Поруке: 955
  • R1b-U152>FTA27217
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #33 послато: Јун 11, 2022, 10:04:17 пре подне »
Проверио сам, што кроз Excel, што кроз YFull опцију "Check SNPs", како се Аничић уклапа у FTDNA Big Y филогенетско стабло и ствари стоје овако:

1) Позитиван је на све дефинишуће мутације хаплогрупа I-BY32198, I-L417, I-BY32152 и  I-BY65900, уз ограду да су за неколико SNP-ова очитавања контроверзна а два нису уопште очитана WGS тестом, али се такве позиције могу апсолутно сматрати за "derived positive" јер је Аничић позитиван на филогенетски млађе мутације, низводно од њих.

3) Приличан број SNP-ова које FTDNA нормално користи као дефинишиће за хаплогрупу , YFull уопште не користи за анализу ("Not used for analysis"), иако су поуздано очитани. Дакле не ради се о томе да се не користе за рачунање TMRCA као што је случај код хомологних снипова, већ се уопште не користе за анализу, тј. формирање хаплогрупа. Било би интересантно чути од аналитичара YFull откуда таква разлика у пракси у односу на FTDNA.

Углавном, Аничић извесно на Big Y стаблу стоји овде негде, са Италијаном и Немцем, као што је CosicZ сугерисао:


На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #34 послато: Јун 15, 2022, 09:35:16 поподне »
15.06.2022.

Издатак - куповина WGS теста на попусту код Dante Labs - 249 евра

Збир - 50,99 евра
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Неродимац

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 627
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #35 послато: Јун 15, 2022, 09:39:12 поподне »
15.06.2022.

Издатак - куповина WGS теста на попусту код Dante Labs - 249 евра

Збир - 50,99 евра

Здраво ако није тајна кога планирате да тестирате?

Ван мреже CosicZ

  • Редакција СДНКП
  • Истраживач
  • ******
  • Поруке: 898
  • Ђурђевдан Y:I1>P109>FGC22045 Панчево
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #36 послато: Јул 03, 2022, 10:56:15 поподне »
https://www.yfull.com/tree/I-Y283553/ formed 21500 ybp, TMRCA 700 ybp

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #37 послато: Јул 04, 2022, 08:53:41 пре подне »
Здраво ако није тајна кога планирате да тестирате?

Постоји више кандидата. Тек треба да направимо "ужи избор" и да одлучимо.
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #38 послато: Јануар 11, 2023, 01:17:48 поподне »
Може ли се на крају закључити да је старовлашки род Мунигузица (Мунигуза) носилац ове хаплогрупе? ТЈ. да ли има породица које се предањски изводе од Мунигуза, а да су тестирани на неку другу хаплогрупу?

Колико сам видио и Ђорђевићи и Аничићи се предањски повезују са Мунигузицама.

Ово је значајан род. Под презименом Мунигузица, јавља се у изворима још 1708. године. Као матица у литератури се наводи Косатица и Матаруге код Пљевљи, али и средњовјековни Комарани код Бродарева.

Тестирани из Крајине вјероватно је дио ове старовлашке струје, јер се и слава поклапа.

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #39 послато: Јануар 11, 2023, 02:14:43 поподне »
Може ли се на крају закључити да је старовлашки род Мунигузица (Мунигуза) носилац ове хаплогрупе? ТЈ. да ли има породица које се предањски изводе од Мунигуза, а да су тестирани на неку другу хаплогрупу?

Колико сам видио и Ђорђевићи и Аничићи се предањски повезују са Мунигузицама.

Ово је значајан род. Под презименом Мунигузица, јавља се у изворима још 1708. године. Као матица у литератури се наводи Косатица и Матаруге код Пљевљи, али и средњовјековни Комарани код Бродарева.

Тестирани из Крајине вјероватно је дио ове старовлашке струје, јер се и слава поклапа.

Био је један кандидат из околине Чачка, који је по предању требало да припадне овом роду али је приликом појединачног тестирања код YSEQ испао негативан на L415 или на неки његов еквивалент. Након тога смо се одлучили за тестирање Аничића код Дантеа.
Чињеницама против самоувереног незнања.

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #40 послато: Јун 30, 2023, 09:46:51 пре подне »
05.06.2023.

Никола Павловић - 84,35 евра

Збир - 135,34 евра
Чињеницама против самоувереног незнања.

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #41 послато: Фебруар 22, 2024, 01:27:30 поподне »
12.01.2024.

Горан Глигоријевић - 4000 динара

Збир - 169,38 евра
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Неродимац

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 627
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #42 послато: Март 13, 2024, 11:13:02 пре подне »
Да ли се зна ко је новотестирани у грани Y283553?

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #43 послато: Март 13, 2024, 11:33:12 пре подне »
Да ли се зна ко је новотестирани у грани Y283553?

Није ми познато. Из околине Вуковара је:

https://www.yfull.com/tree/I-Y283553/
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Ивица Јовановић

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 882
  • J-L70 > J-Z40772* mdDNA:HV-b15a
Одг: Пројекат истраживања ретких подграна Y-ДНК хаплогрупа
« Одговор #44 послато: Март 13, 2024, 11:56:34 пре подне »
Било би интересантно ако би померио тмрца. Да ли је еквивалент на фтДНА I-BY32198?
Милутин Бранковић, 4. ескадрон Коњичке дивизије. Крф 26.04.1916.
Сава Питић, 13. Пук. Острво Видo 24.01.1916.
Сима Мијуцић, 9. пешадијски пук. Браунау 1917.