Древна ДНК

[Никола Стојановић]

Извињавам се ако је неко ово већ поделио раније, налетео сам на веома занимљив сајт где се могу пронаћи разни узорци из различитих историјских временских периода.


https://web.archive.org/web/20171028022010/http://www.ancestraljourneys.org:80/ancientdna.shtml

Одличан, али мислим да се више не ажурира и да нема радове који су изашли у задњих годину и нешто.

[симо]

Извињавам се ако је неко ово већ поделио раније, налетео сам на веома занимљив сајт где се могу пронаћи разни узорци из различитих историјских временских периода.


https://web.archive.org/web/20171028022010/http://www.ancestraljourneys.org:80/ancientdna.shtml

Недавно сам помињао тај сајт https://www.poreklo.rs/forum/index.php?topic=1791.msg90574#msg90574 и излистао научне радове са њега.

Уредница сајта Jean Manco је преминула почетком ове године https://www.poreklo.rs/forum/index.php?topic=3214.msg86248#msg86248

То је био свакако најбоље уређен сајт старе ДНК на интернету. Колико сам видио, задњи уноси су били крајем 2017. године (октобар-новембар). Мислим да је 90% свих старих налаза унесено у њене табеле.
Драго ми је што је сајт бар у архивском облику опстао, иако се даље неће допуњавати.
За сваки случај сам прекопирао све важне информације које су се тамо налазиле.

[НиколаВук]

Револуција:

Scientists discover DNA proving original Native Americans were White

Нисам сигуран да ли су подаци из овог чланка заиста научни или ипак псеудонаучни. Некако ми "мирише" на ово друго, али нека потврди Црни Гуја. 

[Atlantische]

По свему судећи, очекује нас доста занимљивих студија у скоријем периоду.

SMBE 2018 abstracts


The first Epipaleolithic Genome from Anatolia suggests a limited role of demic diffusion in the Advent of Farming in Anatolia


Demographic processes in Estonia from Bronze Age through Iron Age to Medieval times


Genetic transition in the Swiss Late Neolithic and Early Bronze Age


Genome-Wide Ancient DNA Portrays the Forming of the Finnish Population Along a 1400-Year Transect


Population migration and dairy pastoralism on the Bronze Age Mongolian steppe


The Transition to Farming in Eneolithic (Copper Age) Ukraine was Largely Driven by Population Replacement

[Никола Стојановић]

То је био свакако најбоље уређен сајт старе ДНК на интернету. Колико сам видио, задњи уноси су били крајем 2017. године (октобар-новембар). Мислим да је 90% свих старих налаза унесено у њене табеле.
Драго ми је што је сајт бар у архивском облику опстао, иако се даље неће допуњавати.
За сваки случај сам прекопирао све важне информације које су се тамо налазиле.

Имаш Excel?

[симо]

Имаш Excel?

Имам, пошаљи ми на пп мејл и послаћу ти.

[симо]

На Антхрогеници се коментаришу сирови резултати налаза древне днк са алеманског налазишта у Западној Њемачкој из 7. вијека. Чини се да је на једном од узорака нађена R1b-U106>Z331 ( то је између осталог и грана на коју је СНП-ом потврђен Великић из Сопота).
https://www.yfull.com/tree/R-Z331/

Дати су прегледи аутосомалних резултата у K36 рачуначу. Доста изражена компонента North Sea код алеманског узорка. На брзину сам упоредио своје К36 резултате са овим алеманским. У односу на древног Алемана, ја сам прави Медитеранац. 

https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB26982
https://anthrogenica.com/showthread.php?15049-Two-Alemanni-samples-in-K36-and-PCA/page3

[симо]

Ово су неке информације о узорцима:

https://core.ac.uk/download/pdf/29050864.pdf

Видим да су успјели да дешифрују још Y-днк , углавном се ради о R1b. Има више на горе постављеном линку ка Антхрогеници.

[симо]

Други узорак је такође дешифрован као R1b-U106>Z331 с тим да му је нађена још нижа грана Z325
 https://www.yfull.com/tree/R-Z325/

Колико сам успио разабрати у коментарима, неки мисле да ти узорци и нису алемански, већ лангобардски и да би се могли повезати са недавно нађеном лангобардском R1b-U106 у Мађарској.

Такође један од узорака из налазишта није германског поријекла, прилично се разликује аутосомално од двојице R1b-U106, код њега преовлађују К36 Италиан и Ибериан компонента. Очигледно у том периоду популације још нису биле измијешане.

[Црна Гуја]

Нови рад са 22 древна узорка из Израела, из периода позног енеолитика (~4500-3800 п.н.е.). Аутори су установили да се ова популација може моделовати као мешавина неколико ранијих популација: неолитске левантске (~57%), неолитске анадолијске (~26%) и енеолитске иранске (~17%). 9 од 10 мушких узорака припада хаплогрупи Т (квалитетнији узорци припадају грани L208 и њеној подграни CTS2214 ), а ту је и један E1b1b1b2-Z830. И Т и E-Z830 су већ пронађене у ранијим неолитским популацијама са подручја јужног Леванта.

https://www.nature.com/articles/s41467-018-05649-9.pdf

https://static-content.springer.com/esm/art%3A10.1038%2Fs41467-018-05649-9/MediaObjects/41467_2018_5649_MOESM1_ESM.pdf

[Atlantische]

Нови рад који се бави археогенетиком, овај пут са севера Европе.

Genomic and Strontium Isotope Variation Reveal Immigration Patterns in a Viking Age Town

The impact of human mobility on the northern European urban populations during the Viking and Early Middle Ages and its repercussions in Scandinavia itself are still largely unexplored. Our study of the demographics in the final phase of the Viking era is the first comprehensive multidisciplinary investigation that includes genetics, isotopes, archaeology, and osteology on a larger scale. This early Christian dataset is particularly important as the earlier common pagan burial tradition during the Iron Age was cremation, hindering large-scale DNA analyses. We present genome-wide sequence data from 23 individuals from the 10th to 12th century Swedish town of Sigtuna. The data revealed high genetic diversity among the early urban residents. The observed variation exceeds the genetic diversity in distinct modern-day and Iron Age groups of central and northern Europe. Strontium isotope data suggest mixed local and non-local origin of the townspeople. Our results uncover the social system underlying the urbanization process of the Viking World of which mobility was an intricate part and was comparable between males and females. The inhabitants of Sigtuna were heterogeneous in their genetic affinities, probably reflecting both close and distant connections through an established network, confirming that early urbanization processes in northern Europe were drive.

We observed haplogroup R1b, in three of the eight male individuals for which the haplogroup assignment was possible. R1b is one of the most common haplogroups in Europe and has been previous pointed out as one of the most common haplogroups in Scandinavia and Northern Europe [28, 29, 106, 107]. Three more individuals were assigned to major Y chromosome haplogroup I∗. Two of those assignments could be further narrowed down to haplogroup I1∗ major I component in Scandinavia, while one male (grt035) was assigned to a rare I2a2 haplogroup, previously identified among Scandinavian hunter-gatherers [37]. The other individual buried in the vicinity (grt036) was a carrier of another widespread European haplogroup G2a2 [108]. Finally, individual 84001 was a probable carrier of N1a1a, a haplogroup associated with East Baltic region (Tables 1 and S3; Data S1, sheet 2).

[Jelic]

was assigned to a rare I2a2 haplogroup, previously identified among Scandinavian hunter-gatherers [37]

Да није ово "бивша" I2c, која се сада означава управо као I2a2? Томе у прилог иде и ово што се помиње да је нађена код ловаца-сакупљача из Скандинавије, а заиста јесте пронађена у Мотали.

[Atlantische]

Да није ово "бивша" I2c, која се сада означава управо као I2a2? Томе у прилог иде и ово што се помиње да је нађена код ловаца-сакупљача из Скандинавије, а заиста јесте пронађена у Мотали.

Добро си приметио, биће вероватно да је то у питању, јер су у раду коришћене ознаке претходног ISOGG стабла.

The nomenclature used includes both branch names as defined in PhyloTreeY and nomenclature according to International Society of Genetic Genealogy (ISOGG) Y-DNA haplogroup tree 2017 version 12.29.

[Jelic]

Добро си приметио, биће вероватно да је то у питању, јер су у раду коришћене ознаке претходног ISOGG стабла.

The nomenclature used includes both branch names as defined in PhyloTreeY and nomenclature according to International Society of Genetic Genealogy (ISOGG) Y-DNA haplogroup tree 2017 version 12.29.

Па ако је кориштена претходна верзија, а не садашња, значи да ипак није "бивша" I2c у питању?

[Atlantische]

Добро си приметио, биће вероватно да је то у питању, јер су у раду коришћене ознаке претходног ISOGG стабла.

The nomenclature used includes both branch names as defined in PhyloTreeY and nomenclature according to International Society of Genetic Genealogy (ISOGG) Y-DNA haplogroup tree 2017 version 12.29.

Тачно. 

[симо]

Да није ово "бивша" I2c, која се сада означава управо као I2a2? Томе у прилог иде и ово што се помиње да је нађена код ловаца-сакупљача из Скандинавије, а заиста јесте пронађена у Мотали.

Није I2c, већ I2-M436, узводно од I2-M223, дати су СНП-ови у раду.

[Jelic]

Није I2c, већ I2-M436, узводно од I2-M223, дати су СНП-ови у раду.

Хвала.

[симо]

Сљедећи хаплогрупе су пронађене (махом узводне коријенске):

N1c-L392
I1-P109>Z74
G2a-L1259
I2-M436
R1b-L51>L11
R1b-L51>L11>P312
R1-M173

Штета што нису пронађени неки низводнији, млађи SNP-ови.

[Atlantische]

R1-M173
Штета што нису пронађени неки низводнији, млађи SNP-ови.

У питању је R1a-Z280>YP331.

Надам се да ће и за остале Y-ДНК резултате ентузијасти пронаћи ниже гране.

[filipi]

https://www.b92.net/zivot/vesti.php?yyyy=2018&mm=08&dd=26&nav_id=1435521