Као што добро примети drajver, право поређење би требало бити FTDNA у односу на Dante WGS + YFull. Најбитнији параметри при оцени сваке врсте теста су:
1) покривеност Y хромозома (
length coverage 0-100%), из које проистиче и
2) број непокривених базних парова (
no call base pairs), и на крају
3) просечан број очитавања сваког базног пара (
mean depth coverage)
Упоређујући већи број разних тестова (BigY-500, BigY-700, FGC Y Elite и Dante Labs WGS) дођох до следећих техничких детаља за сваку врсту теста:
____________________________________________________________________________________________________
BigY-500: сви прегледани резултати имају покривеност између
48 и 56%, преко
10 милиона непокривених базних парова, и просечан број очитавања између
30 и 80. У прилогу постављам извештај најслабијег BigY-500 теста у који сам имао увид:
____________________________________________________________________________________________________
BigY-700: сви прегледани резултати имају покривеност између
70 и 80%, између
4,6 и 6 милиона непокривених базних парова, и просечан број очитавања између
30 и 47. У прилогу постављам извештај једног од BigY-700 тестова средњег квалитета:
____________________________________________________________________________________________________
FGC Y Elite: једини резултат овог теста у који сам имао увид имао је покривеност
83,45%, нешто преко
3,9 милиона непокривених базних парова, и просечан број очитавања мало преко
39. У прилогу је извештај тог теста:
____________________________________________________________________________________________________
Dante Labs WGS: сва три теста у која сам имао увид имају покривеност преко
99,74%, између
26 и 60 хиљада непокривених базних парова, и просечан број очитавања између
10 и 17. У прилогу је извештај најбољег од та три теста:
____________________________________________________________________________________________________
Ствар је прилично јасна, са BigY-500 и BigY-700 тестом аутоматски није покривено од око 50% (BigY-500) до око 25% (BigY-700) хромозома, где је сигурно изгубљен прилично велики број филогенетски битних SNP-ова. Просечан број очитавања је већи, али то је у овом случају најмање битан параметар. Са BigY-700 тестом сигурно нећете имати очитавања за 20-30% хромозома, док са WGS тестом имате покривен скоро целокупан Y хромозом, додуше са нижим бројем очитавања, али је реално минимална шанса да неки SNP неће бити покривен ни са једним очитавањем. WGS тест код Dante Labsa (без попуста) је тренутно скупљи за неких 85 евра, са друге стране наручиоци BigY-700 теста морају издвојити додатна 92 евра уколико желе имати приступ BAM фајлу који би проследили на анализу у YFull.