Форум - Порекло

ДНК порекло => Основе генетичке генеалогије => Тему започео: Азот Фебруар 28, 2018, 07:18:21 поподне

Наслов: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Азот Фебруар 28, 2018, 07:18:21 поподне
Пошто је закључана тема, немам могућност да укажем на неке пропусте
Типа да се 45 хромозома наслеђују од мајке, а 1од оца?!
То није тачно 23 хромозома наслеђујемо од оца, 23 од мајке (осим код одређених синдрома, када неки од родитеља да 1-2 више или мање хромозома, па се деди проблем у развоју нпр Даунов синдром
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Милош Фебруар 28, 2018, 07:34:39 поподне
Телесна ћелија човека има 46 хромозома или две гарнитуре по 23 хромозома, при чему једна гарнитура потиче од мајке, а друга од оца, па се тако образује 23 пара хомологих хромозома.
22 пара чине аутозоми и један пар су полни хромозоми (гонозоми). Пар полних хромозома је хомолог само у ћелијама жена, у којима се састоји од два X хромозома, док је у ћелијама мушкарца асиметричан (нехомолог) и састоји се од једног X и једног Y хромозома.
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Азот Фебруар 28, 2018, 07:35:34 поподне
 Х хромозом је много већи од свог Y пара и сматра се да при преклапању ова два хромосома измењују своје секвенце (мешају се) у проценту од 10-15% процената. Али сами Yхромосоми никад не могу да се мешају са Y хромосомом друге особе јер немогу да се у исто време нађу у организму тако да они остају чврсти и без утицаја више милиона година, али то се односи на само језгро односно 85-90% " мушких гена на Y хромосому "такодје научници сматрају да скоро цео (85-90%) Y хромозом нема репетиције односно понављања која су одлика Х хромосома. Док је код женских особа тј Х хромосома тај случај другачији јер свака жена у принципу може да има Х хромосоме од две различите биолошке мајке, и тада наступа њихово интензивно мешање. Са мушким Y хромосомима то није случај јер се никада као што смо већ напоменули не може наћи Y хромосоми од два различита претка у истој ћелији просто из разлога да будем баналан што мускарци не могу да рађају децу!

Није ми јасно како то жена може имати две биолошке мајке.
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Азот Фебруар 28, 2018, 07:36:58 поподне
Телесна ћелија човека има 46 хромозома или две гарнитуре по 23 хромозома, при чему једна гарнитура потиче од мајке, а друга од оца, па се тако образује 23 пара хомологих хромозома.
22 пара чине аутозоми и један пар су полни хромозоми (гонозоми). Пар полних хромозома је хомолог само у ћелијама жена, у којима се састоји од два X хромозома, док је у ћелијама мушкарца асиметричан (нехомолог) и састоји се од једног X и једног Y хромозома.

Лепо објашњено
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Азот Фебруар 28, 2018, 07:44:17 поподне
Да се надовежем нај мој предходни коментар где је плавом бојом цитат текста који  сам пренела из закључане теме.
Кросинг овер илити размена делова хромозома постоји и између Y и Х хромозома. Тако да  У хромозом није недодирив

Више о томе можете да пронађете на сл.  линку
https://www.google.rs/url?sa=t&source=web&rct=j&url=http://medicine.jrank.org/pages/2107/Crossing-Over-X-Y-Crossovers-Unequal-Crossovers.html&ved=2ahUKEwjnu5aih8nZAhUmAsAKHRNQAzsQFjALegQICRAB&usg=AOvVaw3aH2E3VpqZVV_EbamWPy-O

Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Азот Фебруар 28, 2018, 08:22:13 поподне
Цитирам

Новонастали плод у себи има нови пар хромозома један од оца и један од мајке. Претпоставимо да плод који ми описујемо има од оца Y хромозом тај плод ће бити мушког пола и од мајке ће наследити преко јајне ћелије и њене митохондријске ДНК, X хромозом! Сада генетским истраживањима

mDNK нема  Х хромозом!
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Азот Фебруар 28, 2018, 08:30:01 поподне
Низ нелогичности и грешака у даљем тексту

Цитирам
Сада плод настао спајањем јајне ћелије и сперматозоида и њиховим "уједињењем" има 23 нова пара хромозома која су створена у јајној ћелији процесом који може да траје 16-20 сати од уласка сперматозоида у јајну ћелију тада се ови хаплоидни полни хромосоми умножавају стварајући диплоидну ћелију која се зове зигот и од које настаје ембрион. Од ових нових (односно само умножених старих) хромосома 22 представљају ХХ пар хромозома и код женског и код мушког пола, док се на основу задњег пара одређује пол детета или плода. Код мушкараца овај задњи пар је XY, а код  жена XX.
   
Како хаплоидни полни хромозоми стварају диплоидну ћелију?...
Од ових нових, старих..?

22 представљају хх пар?..
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Полић Фебруар 28, 2018, 11:06:36 поподне
Да се надовежем нај мој предходни коментар где је плавом бојом цитат текста који  сам пренела из закључане теме.
Кросинг овер илити размена делова хромозома постоји и између Y и Х хромозома. Тако да  У хромозом није недодирив

Више о томе можете да пронађете на сл.  линку
https://www.google.rs/url?sa=t&source=web&rct=j&url=http://medicine.jrank.org/pages/2107/Crossing-Over-X-Y-Crossovers-Unequal-Crossovers.html&ved=2ahUKEwjnu5aih8nZAhUmAsAKHRNQAzsQFjALegQICRAB&usg=AOvVaw3aH2E3VpqZVV_EbamWPy-O
Свакако, кросинг овер је позната ствар, ја сам то још у гимназији учио из билологије. Тачно ипсилон хромозом није недодирљив, као ни било који други хромозом, али секвенца гена која се посматра у генетичкој генеалогији није подложна кросинг оверу, а и веома споро мутира. Не дешава се кросинг овер баш на сваком делу хромозома.
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Златан Април 18, 2018, 04:26:47 поподне
Jeдно питање... пошто сам релативно нов у овој теми, покушавам да неке основне ствари научим путем видеа на јутјубу итд.

Пошто један од видеа каже, да генерално сви ДНК подаци немају користи док се не упореде да неким другим ДНК подацима, имам једно питање.

Ја ћу се ускоро тестирати на 111 маркера. Да ли то значи ће моји подаци само моћи да се упореде са људима који су правили исти такав тест или ће моћи да ме пореде и са неким који су правили са (нпр) 37 маркера или слично. Можете ли ми дати неке смернице како функционише поређење ако анализа није урађена на истом броју маркера.

Хвала!
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Ojler Април 18, 2018, 04:31:10 поподне
Jeдно питање... пошто сам релативно нов у овој теми, покушавам да неке основне ствари научим путем видеа на јутјубу итд.

Пошто један од видеа каже, да су генерално сви ДНК подаци немају користи док се не упореде да неким другим ДНК подацима, имам једно питање.

Ја ћу се ускоро тестирати на 111 маркера. Да ли то значи ће моји подаци само моћи да се упореде са људима који су правили исти такав тест или ће моћи да ме пореде и са неким који су правили са (нпр) 37 маркера или слично. Можете ли ми дати неке смернице како функционише поређење ако анализа није урађена на истом броју маркера.

Хвала!

Раде се поређења на оним маркерима за које су тестове урадила обојица тестираних. Ако урадиш тест на 111 маркера сигурно ћеш бити упоредив са неким који је урадио хаплотип на 37 маркера, на свим маркерима за које је он урадио тестирање. Што више имате упоредивих маркера то се прецизније може одредити ваша међусобна веза.
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Platin Април 18, 2018, 09:29:22 поподне
Наравно да је упоредиво :)
Ја сам урадио само 23 маркера. Следећи "корак" је 37... то је оних првих 23 маркера и још 14.
Постоје тестови од 67 и од 111 маркера - сваки је све старо па још део маркера који раније нису узети у разматрање.

Честитам свакоме ко је у могућности да уради 111 маркера :D
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Златан Април 19, 2018, 09:37:01 пре подне
Јасно, хвала вам. Главно питање ми је било колико је упоредиво ако нпр један уради на Y-111 а већина на Y-24 или 37, али драго ми је да одговор позитиван. На лето ћу имати резултате свог Y-111 теста. 
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: роквић Април 26, 2018, 10:23:38 пре подне
Наводно, ново откриће у вези ДНК.

Цитат
Научна сензација: У људској ћелији откривен нови облик ДНК

Научници су по први пут детектовали ДНК структуру унутар живе људске ћелије и она изгледа више као четвороструки чвор него елегантна двострука спирала о којој учимо у школама.

https://frontal.rs/naucna-senzacija-u-ljudskoj-celiji-otkriven-novi-oblik-dnk/
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Ojler Фебруар 28, 2019, 02:29:44 поподне
Налетех на овај кратки, занимљиви видео прилог за који не знам баш где бих га поставио, па ми се ова тема учинила најприближнијом:

https://www.youtube.com/v/mnYSMhR3jCI
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Азот Фебруар 28, 2019, 03:48:47 поподне
Налетех на овај кратки, занимљиви видео прилог за који не знам баш где бих га поставио, па ми се ова тема учинила најприближнијом:

https://www.youtube.com/v/mnYSMhR3jCI
Одличан је
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Platin Фебруар 28, 2019, 10:59:27 поподне
Одличан видео :)
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Romanijski Март 01, 2019, 09:32:20 поподне
 Moram da pitam malopre gledah na Bošnjačkom FTDNA G2 Hadrović ina DYS19=15-16
Ovo prvi put vidim na ovom markeru. čisto iz radoznalosti da čujem imali ovo neko značenje i objašnjenje. Nadamse da nisam ovo pisao na pogrešnoj temi....   :-[  :-[  :-[
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Atlantische Март 01, 2019, 10:28:42 поподне
Moram da pitam malopre gledah na Bošnjačkom FTDNA G2 Hadrović ina DYS19=15-16
Ovo prvi put vidim na ovom markeru. čisto iz radoznalosti da čujem imali ovo neko značenje i objašnjenje. Nadamse da nisam ovo pisao na pogrešnoj temi....   :-[  :-[  :-[
За припаднике хаплогрупе G2a-PF3147 (https://www.yfull.com/tree/G-PF3147/) у које спадају и Хадровићи је карактеристично да на маркеру DYS19 поседују двоструку вредност.
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: vojislav.ananic Април 28, 2019, 04:49:02 поподне
ГЕНЕТИКА

http://www.planeta.rs/81/intro.php?page=temabroja01#.XMWwTugzYdU
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Милан Петровић Мај 07, 2019, 11:06:50 пре подне
Можете ли ми објаснити шта значи овај графикон који сам добио са резултатима:

(https://scontent.fbeg6-1.fna.fbcdn.net/v/t1.0-9/60185453_2269713279748838_8190578680162942976_n.jpg?_nc_cat=102&_nc_ht=scontent.fbeg6-1.fna&oh=4831fcc4d5800072290e8fb7e395fa30&oe=5D72AA51)
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Небојша Мај 07, 2019, 12:10:42 поподне
Можете ли ми објаснити шта значи овај графикон који сам добио са резултатима:

(https://scontent.fbeg6-1.fna.fbcdn.net/v/t1.0-9/60185453_2269713279748838_8190578680162942976_n.jpg?_nc_cat=102&_nc_ht=scontent.fbeg6-1.fna&oh=4831fcc4d5800072290e8fb7e395fa30&oe=5D72AA51)

То је графикон из базе YHRD, кроз коју је провучен ваш хаплотип (Yfiler, или PowerPlex23 распоред). Дакле на 17, или на 23 маркера. Као што пише, показује релативну и апсолутну блискост са осталим хаплотиповима из базе (кроз државе). Ви, као I2 динарик, природно имате највише поклапања међу Источним, Западним и Јужним Словенима.

Ово изађе мени нпр. када убацим модални хаплотип J2b-M205>Y22066 (Yfiler)
(https://i.postimg.cc/zGWT6vPx/155722372196756640.png)
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Милан Петровић Мај 07, 2019, 12:47:10 поподне
Хвала Небојша. Сада видим, а нуди ми и ову мапу са 48 поклапања:

(https://scontent.fbeg6-1.fna.fbcdn.net/v/t1.0-9/59543731_2269805199739646_2703088786438356992_o.jpg?_nc_cat=105&_nc_ht=scontent.fbeg6-1.fna&oh=c74959b317bb09e43fe1433a892fd6ce&oe=5D6FC4DC)
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Панић Јануар 05, 2024, 05:12:17 поподне
Можда (готово сигурно, пошто будим стару тему) је погрешно место да питам за резултате аутосомалног теста, али нисам нашао боље:
Колико су тачна родбинска подударања које, рецимо ФТДНА даје?
Односно, кад мени каже ФТДНА да са неким имам, рецимо:
Relationship Range
3rd Cousin - 5th Cousin

Shared DNA
29 cM

Longest Block
23 cM

а немам никакву идеју откуд би та веза могла бити с том особом, које су шансе да у ствари и нисмо у некој родбинској вези?
Да ли је ту веза несумњива, само није сигурно која тачно? Или да преформулишем, које су величине shared DNA које скоро сигурно говоре о стварној вези?

Питам пошто на ФТДНА и myHeritage често и за себе и за жену видим неке прилично рендом људе из других земаља који су ми, рецимо, процењени на 3rd Cousin.

Надам се да сам јасно формулисао дилему коју имам :)
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Драган Обреновић Јануар 05, 2024, 05:55:05 поподне
Можда (готово сигурно, пошто будим стару тему) је погрешно место да питам за резултате аутосомалног теста, али нисам нашао боље:
Колико су тачна родбинска подударања које, рецимо ФТДНА даје?
Односно, кад мени каже ФТДНА да са неким имам, рецимо:
Relationship Range
3rd Cousin - 5th Cousin

Shared DNA
29 cM

Longest Block
23 cM

а немам никакву идеју откуд би та веза могла бити с том особом, које су шансе да у ствари и нисмо у некој родбинској вези?
Да ли је ту веза несумњива, само није сигурно која тачно? Или да преформулишем, које су величине shared DNA које скоро сигурно говоре о стварној вези?

Питам пошто на ФТДНА и myHeritage често и за себе и за жену видим неке прилично рендом људе из других земаља који су ми, рецимо, процењени на 3rd Cousin.

Надам се да сам јасно формулисао дилему коју имам :)

Увек се ради о вероватноћи да се ради о овом или оном степену сродства, нарочито на тако малом проценту поклапања. У суштини FTNDA и MyHeritage вас нису слагали, само што се ради о прилично различитим вероватноћама да је особа 3rd cousin или 5th cousin.

Препоручујем "Shared cM Project tool v4" на сајту DNA Painter.

https://dnapainter.com/tools/sharedcmv4 (https://dnapainter.com/tools/sharedcmv4)

Као што ћете видети када унесете 29 у рачунач вероватноћа, могућност да вам је особа са којом имате поклапање 29cM заправо неки "3rd cousin" (преведено на српски - да сте делили заједничког претка пре 4 генерације) заиста постоји али је само 9% вероватна.

Могућност да вам је та особа 5th cousin (дакле да сте делили заједничког претка пре 6 генерација) је већ 55%.
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Панић Јануар 09, 2024, 11:19:55 пре подне
Увек се ради о вероватноћи да се ради о овом или оном степену сродства, нарочито на тако малом проценту поклапања. У суштини FTNDA и MyHeritage вас нису слагали, само што се ради о прилично различитим вероватноћама да је особа 3rd cousin или 5th cousin.

Препоручујем "Shared cM Project tool v4" на сајту DNA Painter.

https://dnapainter.com/tools/sharedcmv4 (https://dnapainter.com/tools/sharedcmv4)

Као што ћете видети када унесете 29 у рачунач вероватноћа, могућност да вам је особа са којом имате поклапање 29cM заправо неки "3rd cousin" (преведено на српски - да сте делили заједничког претка пре 4 генерације) заиста постоји али је само 9% вероватна.

Могућност да вам је та особа 5th cousin (дакле да сте делили заједничког претка пре 6 генерација) је већ 55%.

Хвала. Ови конкретни подаци које сам изнео су само пример, питао сам пре свега колико је вероватно да уопште нема никаквог сродства кад ФТДНА или неко други избаци некога као match.
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Ojler Јануар 09, 2024, 12:52:02 поподне
Хвала. Ови конкретни подаци које сам изнео су само пример, питао сам пре свега колико је вероватно да уопште нема никаквог сродства кад ФТДНА или неко други избаци некога као match.

Зависи како дефинишеш сродство. Ако под тиме подразумеваш да си са неком особом имао заједничког претка, то ти је скоро 100%  сигурно. Али за то ти не треба ни тест као потврда, то је тако по природи ствари.
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: Драган Обреновић Јануар 09, 2024, 02:14:36 поподне
Шанса да нема никаквог сродства, а да FTDNA (или било који други тест) прикаже подударање је јако мала, да не кажем непостојећа. Дакле, у општем случају, не треба сумњати у тачност ових тестова, у смислу да они погрешно рачунарју величину сегмената, или да конструишу поклапања која заправо не постоје.

Међутим, постоје ситуације када могу да се појаве лажно блиска поклапања, односно да је реална родословна удаљеност није у сагласју са центиморганима. То се најчешће дешава када наши преци потичу са истог географској простора.

Наиме, познато је да се једни исти ДНК сегменти могу преносити преко више предачких линија (мушких и женских), што је посебно изражено у ендогамним популацијама, где је због "суженог избора" у одређеној географској области долазило до свесног (или најчешће несвесног) ступања у брак између особа које у блиској прошлости деле истог претка. Делови генома истог заједничког претка наслеђени преко више предачких линија могу довести до тога да нам нека поклапања изгледају ближа (сроднија) него што заиста јесу, барем гледајући родословно стабло, односно матичне књиге.

Такође, због насумичности процеса рекомбинације, понекад се дешава да се рекомбинацијом пренесу много већи "комади" ДНК него што је неки просек за одређени степен сродства.

У сваком случају, као што је Ојлер рекао, ако се особа појави у аутозомалним поклапањима, нема дилеме да заиста делите заједничког претка, али је доста тешко на основу тако малог сегмента ДНК лоцирати ко би тај заједнички предак могао бити. Стога је добро тестирати и оца и мајку, као и рођене ујаке и стричеве, јер се тако добрим делом може барем преполовити број кандидата који се анализирају.
Наслов: Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
Порука од: НикПав Јануар 10, 2024, 04:45:21 поподне
Мени и даље није јасно како моја тетка од 2805 поклапања, само 989 дели са својим родитељима на MyHeritage.
Са њиховим алгоритмом нешто није како ваља.