Аутор Тема: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције  (Прочитано 199475 пута)

Ван мреже Be like Bill

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 842
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #640 послато: Јул 23, 2020, 04:48:43 поподне »
Pozdrav Drajveru i hvala na trudu. Samo par malih napomena

Jedini potvrđeni ZS4376 (x4452) su Goss i uzorci sa Sardinije (Francalacci et al 2015). Ne znam za nekog Iračanina koji je ZS4376 (x4452). Ima par koji su testirali pojedine SNP, jedan Kurd i jedan Arapin sa juga Iraka (Al Abedi Mudahij- ako nisam nešto pogrešio) ali oni ne žive u Bagdadu. Moguće i da je Gasban ali on živi u Americi i nakon testa kod FTDNA gde mu je ostalo ZS4376 uradio je test kod YSEQ gde je ispao BY38105. Ne znam koji bi drugi Iračanin mogao biti u pitanju

Što se tiče BY157609 tu su potvrđeni i jedan Nemac i jedan Englez

To je u suštini to. :)

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #641 послато: Јул 23, 2020, 05:45:39 поподне »
Pozdrav Drajveru i hvala na trudu. Samo par malih napomena

Jedini potvrđeni ZS4376 (x4452) su Goss i uzorci sa Sardinije (Francalacci et al 2015). Ne znam za nekog Iračanina koji je ZS4376 (x4452). Ima par koji su testirali pojedine SNP, jedan Kurd i jedan Arapin sa juga Iraka (Al Abedi Mudahij- ako nisam nešto pogrešio) ali oni ne žive u Bagdadu. Moguće i da je Gasban ali on živi u Americi i nakon testa kod FTDNA gde mu je ostalo ZS4376 uradio je test kod YSEQ gde je ispao BY38105. Ne znam koji bi drugi Iračanin mogao biti u pitanju

Što se tiče BY157609 tu su potvrđeni i jedan Nemac i jedan Englez

To je u suštini to. :)

Радоне, претпоставио сам да ћеш се јавити.  :)

На ФТДНА стаблу постоји само један тестирани који је урадио BigY, а да је ZS4376 (хZS4452). Мислио сам да се ради о Гасбану јер има 111 маркера, а не о Госу који има 67 маркера. Претпостављам да си у праву за Госа. Што се тиче Сардинијаца, њих нема на YFullu ( не знам да ли су некад били?). У сваком случају гледао сам ФТДНА и YFull и постављао само оне који су радили BigY или WGS тест.

Што се тиче овог BY157609 овај за ког пишеш да је Нијемац, заправо као мјесто поријекла стоји Амстердам, једино је напомена да је могуће пољског поријекла. Енглеза сам заборавио, треба га свакако додати.

Допуњено стабло:

J1-PF7263>ZS4736 Нијемац, Сардинијци?
J1-PF7263> ZS4736>ZS4452 Либан, Француз/Аквитанија
J1-PF7263> ZS4736>ZS4452>ZS10589>ZS10568 Јеврејин Украјина
J1-PF7263> ZS4736>ZS4452>ZS10589>ZS10568>BY69315 Јеврејин Украјина
J1-PF7263> ZS4736>ZS4452>ZS10589>ZS10568>BY69315>FT233390 Јеврејин Чешка
J1-PF7263> ZS4736>ZS4452>ZS10589>ZS10568>BY69315>FT233390>FT108812 Јеврејин Мађарска
J1-PF7263> ZS4736>ZS4452>ZS10589>ZS12115 Арапи Саудијци
J1-PF7263> ZS4736>ZS4452>BY157609 Холанђанин (могуће пољског поријекла), Енглез
J1-PF7263> ZS4736>ZS4452>ZS9951 Нијемац/Хесен
J1-PF7263> ZS4736>ZS4452>ZS9951>ZS11470 Срби и Бугарин
J1-PF7263> ZS4736>ZS4452>BY38105 Португалац, Норвежанин
J1-PF7263> ZS4736>ZS4452>BY38105>BY137125 Италијани
J1-PF7263> ZS4736>ZS4452>BY38105>BY137125>BY67911 Италијани, Сицилија
J1-PF7263> ZS4736>ZS4452>BY38105>FT22957 Руска Федерација (Татарстан)
J1-PF7263> ZS4736>ZS4452>BY38105>FT22957>BY102071 Ирачанин, Азербејџан


Ван мреже Be like Bill

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 842
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #642 послато: Јул 23, 2020, 07:43:50 поподне »
He he ;)

Gossa imamo na staroj fotografiji Viktarovog stabla, tako da on nije u pitanju.



Što se tiče Sardinijaca, oni imaju jednog predstavnika na stablu, ERS256732, odmah ispod Holanđanina. Problem sa tim uzorkom je što ga stalno šetaju, povremeno ga uklone sa stabla pa opet vrate. Jedno vreme bio je vođen kao ZS10589 pošto je bio pozitivan na ZS10588A i ZS10588B SNP (ne znam gde je njihovo mesto u stablu) no sad je opet vraćen na staro mesto. Ne znam da li Guja ima vremena da ponovo pogleda te Francallaccijeve rezultate

https://www.yfull.com/tree/J-ZS4416/

https://science.sciencemag.org/content/341/6145/565?

Što se tiče BY157609, ja sam pogrešio ;D. Nemac Muler nije potvrđen kao BY157609 nego se samo vodi u toj grupi na osnovu markera. Potvrđen je Saey koji je Englez poreklom. On sa Van Elburgom tvori tu granu, s tim što na žalost Saey nije poslao svoj BAM fajl YFull-u.

https://drive.google.com/file/d/1jo2CLttUgyEQkS4Q2nQf2Lx7zrvj_8r0/view?usp=sharing

U granu BY38105 trebalo bi ubrojiti i Aleksandrinog oca, tj jedan Grk pride

Pozdrav i svako dobro

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #643 послато: Јул 23, 2020, 07:54:10 поподне »
Što se tiče Sardinijaca, oni imaju jednog predstavnika na stablu, ERS256732, odmah ispod Holanđanina. Problem sa tim uzorkom je što ga stalno šetaju, povremeno ga uklone sa stabla pa opet vrate. Jedno vreme bio je vođen kao ZS10589 pošto je bio pozitivan na ZS10588A i ZS10588B SNP (ne znam gde je njihovo mesto u stablu) no sad je opet vraćen na staro mesto. Ne znam da li Guja ima vremena da ponovo pogleda te Francallaccijeve rezultate

Да, видим га, међутим он на стаблу стоји испод ZS4452, тако да само Гос онда остаје на нивоу ZS4736.

Ван мреже Be like Bill

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 842
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #644 послато: Јул 23, 2020, 09:32:17 поподне »
Да, видим га, међутим он на стаблу стоји испод ZS4452, тако да само Гос онда остаје на нивоу ZS4736.

Da, sad i ja vidim da je ispod ZS4452. Zanimljivo da Viktar nije pronašao te snipove kad je proveravao sardinijske rezultate.

Za one koji vole karte dve karte, da se odprilike vidi rasprostranjenost PF7263 u svetu i posebno u Evropi i Bliskom istoku. U YHRD pretraživač sam uneo sledeće vrednosti: 393-12; 19-13; 389I-12; 392-11; 437-14; GATA H4-10; 438-10. U osnovi to je dovoljno da se prepozna jedan deo PF7263 haplotipova. Vrednost 12 sam uneo da bi ih razdvojio od nekih grana E1b.

https://drive.google.com/file/d/19RuUpUKoQYHFCZ1moU9vW7_Gu1car1Pc/view?usp=sharing

https://drive.google.com/file/d/1SPBrA9fe9I6ftnPJ2vyEji6H4fULj5Pk/view?usp=sharing

Kao što se može videti, najveća koncentracija je u zapadnom Iranu posebno na teritorijama koje naseljavaju Kurdi, u provincijama Kurdistan i Kermanšah. To je slično situaciji u Iraku gde je isto povećano prisustvo PF7263 haplogrupe kod kurdske populacije na prostoru Erbila i Sulejmanije u SI Iraku. Sa druge strane, irački haplotipovi nemaju veliku raznovrsnost, ima dosta identičnih haplotipova pa se postavlja pitanje starosti kao i preciznije određivanje kojoj grani pripadaju. Moglo bi se reći da je u pitanju "founder" efekat

A crvena tačka tačno usred BiH nisu Vlahovići nego haplotipovi Turaka koji danas žive u Sarajevu. Ali to je već neka druga priča ;)

Ван мреже Љиљан

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 318
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #645 послато: Јул 24, 2020, 10:30:35 поподне »
Љиљане, ушао сам на твој налог и прегледао твоје новеле. Као што смо мање-више већ знали на тих 5 твојих новела негативни су и Синобад и Куленски. При томе они имају и своје новеле на које си ти негативан, Синобад 7 и Куленски 6. Колико видим, Куленски и ти сте радили BigY500 за разлику од Синобада који је радио BiGY700, дакле је његова покривеност већа. Нажалост, Синобад ми још није одобрио приступ његовом налогу и не могу да директно видим његове новеле тј. да провјерим да ли он посједује неке новеле из повећане покривености на који нисте тестирани ти и Куленски. Уколико има таквих новела, то би могла бити корисна ствар из Синобадових резултата, наравно ако бисте и ти и Куленски тестирали таква новеле, па се покаже да је рецимо Куленски негативан,а ти позитиван. У сваком случају , треба провјерити да ли таквих новела има, надам се да ће Синобад одобрити приступ налогу.

Што се тиче Синобадове позиције на YFullu рекао бих да је он тамо прослиједио само свој vcf фајл, што значи да га неће ни обрађивати везано за старост гране. На пројекту видим да Синобад није скинуо свој bam фајл, праве сирове податке ( то се сад додатно плаћа око 100 долара).

Значи, могуће је да се у тој разлици у покривености тестова вас тројице крије још неки SNP који би могао да одреди нову подграну.
Hvala puno na trudu! To nam je neprocjenjivo.
Danas mi je se javio Sinobad i reče da ti je upravo odobrio pristup njegovim podacima. Nisam znao da su sada na FTDNA počeli naplaćivati skidanje bam fajla, to je u najmanju ruku sramota. Ne urade ništa po pitanju obrade BigY podataka (čak ga ne uvrste ispravno ni u tabelu projekta), a hoće dodatnih $100 - strašno.
Nadam se da ćeš uspjeti nešto novo naći.

Puno podrava!!!

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #646 послато: Јул 25, 2020, 12:00:07 пре подне »
Hvala puno na trudu! To nam je neprocjenjivo.
Danas mi je se javio Sinobad i reče da ti je upravo odobrio pristup njegovim podacima. Nisam znao da su sada na FTDNA počeli naplaćivati skidanje bam fajla, to je u najmanju ruku sramota. Ne urade ništa po pitanju obrade BigY podataka (čak ga ne uvrste ispravno ni u tabelu projekta), a hoće dodatnih $100 - strašno.
Nadam se da ćeš uspjeti nešto novo naći.

Puno podrava!!!

Љиљане, управо сам ушао у Синобадов налог и прегледао његове новеле. Како сам и очекивао, с обзиром на повећану покривеност његовог BiGY700 теста има и већи број новела од тебе и Куленског, укупно 18. Од тих 18, девет је који су тестирани негативно код тебе и Куленског. Значи то су прави Синобадови новели који нису спорни, ради се о сљедећим позицијама:

12071733   C>T
12533246   G>A
15025462   C>T
16002646   C>A
16626291   G>C
19531764   G>A
20642799   A>C
6963911   G>T
7197975   C>T

Оних других девет Синобадових новела нису тестирани код тебе и Куленског, јер ти региони нису покривени BiGY500 тестом. Ради се о сљедећим промјенама:

10818518   C>T
11436963   C>G
11666052   T>C
12061139   C>T
12374260   G>C
3457888   T>A
5001552   A>G
6210856   C>T
6672692   A>T

И ово су управо они међу којима се можда крије неки СНП који би спојио тебе и Синобада у односу на Куленског или можда Куленског и Синобада у односу на тебе. Морали би их ти и Куленски посебно тестирати,и једино би имало смисла кад бисте их тестирали обојица. За то постоје двије опције, да код FTDNA наручите надоградњу са BiGY500 на BigY700 или да ових девет позиција кандидујете код YSeqa и да их појединачно тестирате.

Успио сам погледати твој bam фајл и занимљиво је да на позицији 11666052 T>C имаш једно позитивно читање, не знам какав је статус Куленског на тој позицији, кад би био негативан, то би рецимо могао бити одређујући СНП за тебе и Синобада.

Укратко, постоји девет SNP-ова који "висе у ваздуху" и који траже позицију на стаблу.




Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #647 послато: Јул 25, 2020, 12:11:10 пре подне »
Успио сам погледати твој bam фајл и занимљиво је да на позицији 11666052 T>C имаш једно позитивно читање, не знам какав је статус Куленског на тој позицији, кад би био негативан, то би рецимо могао бити одређујући СНП за тебе и Синобада.

Сад додуше видим да се овај 11666052 T>C налази у "ѕynthetic assembled centromeric region, CEN" и да не би прошао процес кандидовања код Yseqa,тј. није поуздан. Исто тако не би прошли ни 10818518   C>T ;  11436963   C>G из истог разлога.

Остаје дакле шест из поузданих региона:

12061139   C>T
12374260   G>C
3457888   T>A
5001552   A>G
6210856   C>T
6672692   A>Т
« Последња измена: Јул 25, 2020, 12:15:03 пре подне drajver »

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5481
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #648 послато: Јул 25, 2020, 09:25:51 пре подне »

Остаје дакле шест из поузданих региона:

12061139   C>T
12374260   G>C
3457888   T>A
5001552   A>G
6210856   C>T
6672692   A>Т

Неким СНП-овима су познати и називи. Ниједан није у понуди код Ysеq-а.

FT335337 / Y208114

-----------------

FT341029

FT341681

FT342214

FT342329

Ван мреже Kor

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 1000
  • реверзни инжињеринг историје
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #649 послато: Јул 26, 2020, 06:30:40 поподне »
Је ли то све од информације што се може добити из поређења та два хаплотипа?

Ван мреже Љиљан

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 318
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #650 послато: Јул 27, 2020, 09:12:54 поподне »
Љиљане, управо сам ушао у Синобадов налог и прегледао његове новеле. Како сам и очекивао, с обзиром на повећану покривеност његовог BiGY700 теста има и већи број новела од тебе и Куленског, укупно 18. Од тих 18, девет је који су тестирани негативно код тебе и Куленског. Значи то су прави Синобадови новели који нису спорни, ради се о сљедећим позицијама:

12071733   C>T
12533246   G>A
15025462   C>T
16002646   C>A
16626291   G>C
19531764   G>A
20642799   A>C
6963911   G>T
7197975   C>T

Оних других девет Синобадових новела нису тестирани код тебе и Куленског, јер ти региони нису покривени BiGY500 тестом. Ради се о сљедећим промјенама:

10818518   C>T
11436963   C>G
11666052   T>C
12061139   C>T
12374260   G>C
3457888   T>A
5001552   A>G
6210856   C>T
6672692   A>T

И ово су управо они међу којима се можда крије неки СНП који би спојио тебе и Синобада у односу на Куленског или можда Куленског и Синобада у односу на тебе. Морали би их ти и Куленски посебно тестирати,и једино би имало смисла кад бисте их тестирали обојица. За то постоје двије опције, да код FTDNA наручите надоградњу са BiGY500 на BigY700 или да ових девет позиција кандидујете код YSeqa и да их појединачно тестирате.

Успио сам погледати твој bam фајл и занимљиво је да на позицији 11666052 T>C имаш једно позитивно читање, не знам какав је статус Куленског на тој позицији, кад би био негативан, то би рецимо могао бити одређујући СНП за тебе и Синобада.

Укратко, постоји девет SNP-ова који "висе у ваздуху" и који траже позицију на стаблу.
Сад видим кад одем на BigY Matching, pod Non-Matching Variants vidim ove ove snp-ove (pozicije) koje si nabrojao i još neke druge:
ZS2305, 13048345, 14327227, 20094824, 20548158, 21284498, BY45210, A20016, 12533246, 7197975, 12071733, 15025462, 16002646, 19531764, 20642799
Pod kolonam Shared Variants sa Sinobadom mi stoji 572971 a sa Kulenskim 459330, što bi, pretpostavljam, značilo da mi je on bliži.Da li se na osnovu ovoga može utvrditi moj i njegov TMRCA? Za sad, znači, nema nekog SNP-a koji je zajednički za mene i Sinobada, a da ga nema Kulenski? Ako je tako, ja mislim da je možda razlog za to što moj uzorak nije dobro odrađen, pa ja imam samo 4 privatna snp-a a kulenski 7, dok sinobad evo 18 (mada je on uradio BigY700). Ja sam u kontaktu sa osobom koja vodi nalog Kulenskog, pa ako šta treba mogu da je kontaktiram. S obzirom da ima pristup svim podacima, da li bi možda Victar mogao šta da nam kaže, da mu pošaljem mail? Generalno, kada bi se sada kalkulisao TMRCA čitave grane (nas 3) da li bi se promijenio naviše ili naniže? Kako sada ukalkulisati to što BigY700 pokriva one zone koje BigY500 nije pokrivao? Sinobad je skupo  platio ovo testiranje, i ne mogu da se otmem osjećaju nemara od strane FTDNA, da nije Siniše ništa od ovoga ne bi saznali. Bilo bi dobro kada bi bilo par SNP-ova na koje se može testirati, pa kad bi ovu našu Balkansku grupu mogli da počnemo sortirati... I Sinobad i ja imamo preko 111 str rezultata, da li se oni kako mogu iskoristiti. Puno pitanja, izvinjavam se unapriijed.


puno pozdrava!!!

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #651 послато: Јул 27, 2020, 10:03:31 поподне »
Pod kolonam Shared Variants sa Sinobadom mi stoji 572971 a sa Kulenskim 459330, što bi, pretpostavljam, značilo da mi je on bliži.
Не обраћај пуно пажњу на ове цифре, оне зависе од покривености,а ту има и доста варијанти које немају филогенетски значај.

Za sad, znači, nema nekog SNP-a koji je zajednički za mene i Sinobada, a da ga nema Kulenski?
Засад нема, међутим у ових 9 односно 6 SNP-ова које сам набројао,а који нису тестирани теби и Куленском се можда крије и неки који ближе повезује тебе и Синобада или можда Синобада и Куленског.

Ako je tako, ja mislim da je možda razlog za to što moj uzorak nije dobro odrađen, pa ja imam samo 4 privatna snp-a a kulenski 7, dok sinobad evo 18 (mada je on uradio BigY700).
Може се разликовати број пронађених приватних СНП-ова код тестираних исте гране и са истог нивоа. Може зависити и од кавлитета узорка наравно, међутим јасно је да је повећан број приватних СНП-ова код Синобада посљедица веће покривености BiGY теста.

Ja sam u kontaktu sa osobom koja vodi nalog Kulenskog, pa ako šta treba mogu da je kontaktiram. S obzirom da ima pristup svim podacima, da li bi možda Victar mogao šta da nam kaže, da mu pošaljem mail?
У суштини и Виктар кад погледа податке ће ти написати исто ово што сам и ја написао. Преко твог и Синобадовог налога видио сам стање и код Куленског.

Generalno, kada bi se sada kalkulisao TMRCA čitave grane (nas 3) da li bi se promijenio naviše ili naniže? Kako sada ukalkulisati to što BigY700 pokriva one zone koje BigY500 nije pokrivao?
Процјене старости су увијек оквирне. И по маркерима сте сва тројица ту негдје око 1000 година удаљености. По BigY500 покривености се само рачуна нешто већи степен мутације него код BigY700. Не вјерујем да ће се старост претјерано промијенити. Може се само пронаћи један или два SNP-a која ће ближе повезати двојицу од вас тројице.

Sinobad je skupo  platio ovo testiranje, i ne mogu da se otmem osjećaju nemara od strane FTDNA, da nije Siniše ništa od ovoga ne bi saznali.
Не треба пуно очекивати од ФТДНА гледе детаљнијих анализа између тестираних, код њих већину ствари одрађује софтвер. Код вас је конкретно проблем у различитим покривеностима BigY500 и BIGY700. Неки Синобадови СНП-ови су остали да висе у ваздуху. Без да их ти и Куленски тестирате не може се знати да ли су битни за одвајање посебног огранка испод ZS11470.

Bilo bi dobro kada bi bilo par SNP-ova na koje se može testirati, pa kad bi ovu našu Balkansku grupu mogli da počnemo sortirati...
То су управо ових 6 које сам набројао. Знам да кошта али најбоља опција би била да и ти и Куленски наручите надоградњу са BiGY500 на BiGY700. Мислим да је око 200 долара, чини ми се да ће једино то ријешити ствар.

I Sinobad i ja imamo preko 111 str rezultata, da li se oni kako mogu iskoristiti.

Мислим да нису сви маркери на свим позицијама тестирани, па је и у том смислу тешко испратити разлике. Ово би можда имало смисла кад би се исти маркери упоредили код све тројице. Покушавао сам то раније за неке PH908 хаплотипе, али није дало резултате.
« Последња измена: Јул 27, 2020, 10:05:33 поподне drajver »

Ван мреже Љиљан

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 318
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #652 послато: Јул 28, 2020, 02:47:26 поподне »
Не обраћај пуно пажњу на ове цифре, оне зависе од покривености,а ту има и доста варијанти које немају филогенетски значај.
Засад нема, међутим у ових 9 односно 6 SNP-ова које сам набројао,а који нису тестирани теби и Куленском се можда крије и неки који ближе повезује тебе и Синобада или можда Синобада и Куленског.
Може се разликовати број пронађених приватних СНП-ова код тестираних исте гране и са истог нивоа. Може зависити и од кавлитета узорка наравно, међутим јасно је да је повећан број приватних СНП-ова код Синобада посљедица веће покривености BiGY теста.
У суштини и Виктар кад погледа податке ће ти написати исто ово што сам и ја написао. Преко твог и Синобадовог налога видио сам стање и код Куленског.
Процјене старости су увијек оквирне. И по маркерима сте сва тројица ту негдје око 1000 година удаљености. По BigY500 покривености се само рачуна нешто већи степен мутације него код BigY700. Не вјерујем да ће се старост претјерано промијенити. Може се само пронаћи један или два SNP-a која ће ближе повезати двојицу од вас тројице.
Не треба пуно очекивати од ФТДНА гледе детаљнијих анализа између тестираних, код њих већину ствари одрађује софтвер. Код вас је конкретно проблем у различитим покривеностима BigY500 и BIGY700. Неки Синобадови СНП-ови су остали да висе у ваздуху. Без да их ти и Куленски тестирате не може се знати да ли су битни за одвајање посебног огранка испод ZS11470.
То су управо ових 6 које сам набројао. Знам да кошта али најбоља опција би била да и ти и Куленски наручите надоградњу са BiGY500 на BiGY700. Мислим да је око 200 долара, чини ми се да ће једино то ријешити ствар.

Мислим да нису сви маркери на свим позицијама тестирани, па је и у том смислу тешко испратити разлике. Ово би можда имало смисла кад би се исти маркери упоредили код све тројице. Покушавао сам то раније за неке PH908 хаплотипе, али није дало резултате.
Hvala puno na stručnom i iscrpnom odgovoru. U kontaktu sam sa Sinobadom, pa je bilo i govora o tom nekom dodatnom testiranju. Do nekog drastičnog pada cijene nadogradnje ja nisam zainteresovan za tako što, a možda se vremenom i neki od ovih snp-ova iskristališu kao dobri za testiranje, pa uradim takav neki test. Ili još bolje neko od naših koji imaju malo markera uradi, pa uspijemo nekako razgranati to sve. Kao što napisah Sinobadu, ispade mi malo žao što mi je jedna tako slavna porodica ipak vrlo daleki rođak :)
Може се разликовати број пронађених приватних СНП-ова код тестираних исте гране и са истог нивоа. Може зависити и од кавлитета узорка наравно, међутим јасно је да је повећан број приватних СНП-ова код Синобада посљедица веће покривености BiGY теста.
Ovo si vjerovatno u pravu, palo mi je na pamet da ja imam samo 4 novela (u odnosu na 7 koliko ima kulenski) zato što mi je veći broj novela ostao "skriven" u tada nepokrivenom dijelu hromozoma. Vjeravatno bi mi se "otvorilo" 10ak novela kada bih uradio nadogradnju.
Zasad mi je ostao Mihić misterija, jer po njegovim str rezultatima ispada da mi je značajno dalji od Kulenskog i Sinobada. kad bi se to potvrdilo, mislim da bi to bio završni klin u kovčeg teorije da smo došli iz pravca Bugarske :) :) :)

puno pozzzz sa Jadrana!!!

Ван мреже Kor

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 1000
  • реверзни инжињеринг историје
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #653 послато: Јул 28, 2020, 11:50:44 поподне »
Zasad mi je ostao Mihić misterija, jer po njegovim str rezultatima ispada da mi je značajno dalji od Kulenskog i Sinobada. kad bi se to potvrdilo, mislim da bi to bio završni klin u kovčeg teorije da smo došli iz pravca Bugarske :) :) :)
А шта тек да ја кажем о мистерији по којој си ми ти ближи од Михића који је из истог села као моји преци и за које се раније тврдило да су наш најближи род? Ја сам увек био скептик по поводу Бугарске теорије. Више ми је логична варијанта о миграцији негде са севера или запада.

Цитат
puno pozzzz sa Jadrana!!!
немој да облачиш дрес ц. звезде ни случајно  :D

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #654 послато: Јул 29, 2020, 08:56:37 пре подне »
Нисам сигуран да се на основу 2-3 BIGY резултата може одредити миграциони пут једне читаве подгране код нас. И код много дефинисанијих Yfull стабала нисмо сигурни око миграционог правца.

Углавном, овде се често заборавља, или намерно прескаче, присуство ове подгране J1 у Грчкој Македонији (осим у Бугарској). Тамо је, на оном истраживању за северну Грчку, присутна са 1.04%. Дакле више него у многим српским крајевима. Изузетак су неке области у Крајини, где се подграна раширила у последњих 400 година. Ти људи се дакле на 17 маркера потпуно уклапају у род "Влаховића", а сасвим сигурно не постоји ближа историјска веза са српским крајевима.

Сама J1 на том истраживању за Грке износи чак 7.3%. Неко је основано претпоставио да би ту могло бити струје из Мале Азије, због познате размене становништва. Дакле ово би могли бити и Анадолци, што је још интересантније. Али, да не претпостављамо, овако изгледа да је грана ипак присутна и на ширем простору Македоније, што може објаснити и присуство код Бугара. Неко ће рећи: "то су средњовековни српски исељеници из Херцеговине". Али, ако је тако, зашто, аналогно томе, тамо нема и много заступљенијих херцеговачких подграна попут I2-PH908, N2-P189.2, I1-P109, R1a-YP4278, итд.

Што се миграција тиче, треба се служити и логиком, осим резултатима. Које би то миграције са запада и севера донеле J1 на Балкан? У ситуацији када код нас и многе "словенске" подгране на Западни Балкан долазе преко Источног Балкана (неке подгране I2-PH908, I2-Z17855, R1a-YP417, итд). Да не говоримо о "староседелачким" хаплогрупама (E-V13, J2b, Ј2а, R1b-Z2705, G2a-L42, итд).

Једина хаплогрупа код које, готово са сигурношћу, можемо рећи да је из Северне, Источне или Западне Европе "пала" директно у Херцеговину, јесте N2-P189.2. Она нема никакве репове у другим крајевима Балкана.

Оно што додуше иде у прилог некој матици ове наше J-ZS9949 на простору Херцеговине, јесте чињеница да се за сада не јавља на југу и југоистоку Србије, као и да је нема код те јужноморавске струје међу Шумадинцима. Како год, не могу се игнорисати Грци и Бугари као и чињеница да су овде миграције исток-запад биле неупоредиво чешће и масивније.

Ван мреже Be like Bill

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 842
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #655 послато: Јул 29, 2020, 10:59:24 пре подне »
Hvala svima na pomoći, pogotovo Drajveru i Milošu na njihovim informacijamau vezi SNP-a

U vezi kretanja, bliži sam Nebojšinoj opciji. Na jugu, u Makedoniji i Bugarskoj imamo nešto drugačije haplotipove koji vrlo verovatno pripadaju ZS9952 liniji mada je pitanje da li pripadaju i ZS11470. U Makedoniji imamo haplotip 12-24-12-13/19..., u Grčkoj 13-24-13-13/18 koji je čisti Vlahović, a kog imamo i u našoj Raškoj. U Bugarskoj imamo "brata" Gurova i još dva haplotipa koji su 385a-13 i verovatno pripadaju ZS9952, pored Kulenskog. Čini mi se da na severu Bačke isto imamo nekog momka koji je 393-12, 385a-13.

Na jugu Srbiji imamo jednog "Vlahovića" koji je 385ab-14/19. Čini mi se da je u pitanju Zgonjanin et al 2017

Mi smo ga uvek gledali kao Bosanca/Hercegovca koji je otišao na leskovački voz i nije se vratio, ali šta ako nije? Ako je u pitanju domaća, autohtona sorta ZS11470?

Sa druge strane, meni je zanimljivo da dve linije, Šepa i Sinobad danas žive relativno blizu jedni kraj drugih iako je do razdvajanja došlo relativno davno u prošlosti. Kad bi poštovali pravila da gde je veća raznolikost to je verovatnije mesto porekla, izgledalo bi da je to stara autohtona hrvatska sorta. Možda su u pitanju oni Srbi iz župe Srb što se spominju 1300 i neke ??? Ha, zanimljivo?

Pozdrav i svako dobro

Ван мреже Be like Bill

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 842
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #656 послато: Август 02, 2020, 08:34:18 пре подне »
Izgleda da su završili analizu Sinobadovih rezultata. Velikih promena nema s tim  što je TMRC za svu trojicu povećan na 1000 godina s tim što bi mogao, gledajući samo rezultate Sinobada i Kulenskog još nešto narasti, eventualno na 1100-1200 godina. Ako se ne varam mi smo nešto slično procenjivali haplotip Mihića u odnosu na Ljiljanov prema STR podacima, po računu Nevskog (na žalost ne mogu da pronađem tu poruku) dok je Viktarova procena TMRC Mihića i Ljiljana bila je nekih 1800-1900 godina

https://www.yfull.com/tree/J-ZS9949/

https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=833.msg21750;topicseen#msg21750

Bilo bi zanimljivo kad bi Mihić uradio BigY i kad bi se ta procena pokazala točnom (ili bar približnom). U svakom slučaju, zanimljiva misterija

Ван мреже Be like Bill

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 842
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #657 послато: Август 16, 2020, 04:17:00 поподне »
Čestitam momcima na temi J2b-M205>Y22066 na novootkrivenim rođacima u Makedoniji i mogućim vezama sa Crnomorskim regionom u današnjoj Turskoj. I mi imamo neke veze za koje baš nisam siguran kako da ih tumačim, no da krenem redom.

Pre nekog vremena, na YHRD bazi podatak pojavili su se haplotipovi iz istraživanja Dogana i Marjanovića:"Genetic analysis of haplotype data for 23 y-chromosome short tandem repeat loci in Turkish population recently settled in Sarajevo, Bosnia and Herzegovina". Ono što me iznenadilo su čak dva haplotipa koja pripadaju J1 PF7263 haplogrupi, od ukupno šest J1 haplotipova, što je priličan postotak s obzirom da na FTDNA trenutno postoje samo dva PF7263 poreklom iz Turske i od toga oba verovatno povezan sa Azerbejdžanom i tamošnjim haplotipovima.

To me zaintrigiralo, pogotovo mogućnost da pomoću njih dođem do neke informacije da li postoje određeni obrasci seoba sa područja Turske na područje Balkana i uže, područje na kojima danas žive Srbi, posebno nosioci SNP-a PF7263. Ispalo je da je ova grana ustvari sasvim solidno zastupljena u Turskoj i pri tome vrlo raznolika

Haplotipovi Turaka koji danas žive u Sarajevu su sledeći:

04) 12-23-13-11-12/19-14-12-11-30-18.2-14-20-10-15-10-22
55) 12-25-13-10-12/19-12-12-11-29-18.2-14-20-10-15-10-21

(redni brojevi ispred njih su njihovi redni brojevi u tabeli; haplotipovi inače sadrže 23 markera ali ja sam bio previše lenj da ih sve navodim ; ;D)

https://www.researchgate.net/publication/301619012_Dogan_Supplementary_Table

https://www.researchgate.net/publication/267633131_Genetic_analysis_of_haplotype_data_for_23_Y-chromosome_short_tandem_repeat_loci_in_the_Turkish_population_recently_settled_in_Sarajevo_Bosnia_and_Herzegovina

Ono što mogu reći za oba haplotipa jeste da nisu tipična za ovo područje Evrope, a prvi haplotip, sa DYS390-23 uopšte nije tipičan za PF7263 granu j1 haplogrupe. Sa druge strane, ispalo je da su mu najbliži haplotipovi istraživanja Kemala Murata Canturka za Black Sea region Republike Turske. u njemu ima više haplotipova koji sasvim sigurno pripadaju PF7263 grani a na DYS390 imaju vrednost 23

01) 12-23-13-11-12/19-13-12-11-30-18.2-14-20-10-15-10-21
02) 12-23-13-10-13/17-14-12-11-28-17.2-14-20-10-15-10-21
03) 12-24-13-10-12/18-12-12-11-30-18.2-14-20-10-15-10-21
04) 12-24-13-10-12/18-13-12-11-29-19.2-14-20-9-15-10-21

https://yhrd.org/YP001084-Black+Sea+Region%2C+Turkey+%5BTurkish%5D

Dakle, ovde nema haplotipa koji nije zanimljiv. Prva dva imaju vrednost 23 na DYS390, od toga prvi sasvim sigurno je vrlo blizak sa testiranim u Sarajevu pod rednim brojem 04. Drugi haplotip ima vrednost DYS385a-13 što ga čini posebno interesantnim za pripadnike ZS9952, tj za nas i Rudenklaua pošto je ta vrednost nekako uobičajena u našoj grani. Četvrti haplotip je isto zanimljiv zbog vrlo niske vrednosti na GATA H4-9 i kad sam ga prvi put video pomislio sam da ipak nema veze sa našom granom, no kasnije sam video da se ostale vrednosti odlično uklapaju i da na prostoru Turske postoje još dva haplotipa sa tom vrednošću (ali o tome nešto kasnije)

Inače, u ovom istraživanju testirano je 103 ljudi, od toga 11 pripadnika J1 haplogrupe i od njih 4 pripadnika grane J1 PF7263

Crnomorsko primorje u republici Turskoj obuhvata gotovo celu severnu obalu Crnog mora pa je teško reći odakle su došli ti haplotipovi, no mislim da se ne radi o uobičajenim kurdskim, arapskim ili persijskim migracijama koje su se dešavale tokom poslednjih 500 godina na tom prostoru več da je njihova istorija na njemu nešto duža. No dok se ne pojave konkretni testirani biće teško reći bilo što više o njihovoj ranijoj istoriji.

https://en.wikipedia.org/wiki/Black_Sea_Region

(malo kasnije ću nastaviti)
« Последња измена: Август 17, 2020, 08:37:34 пре подне Amicus »

Ван мреже Be like Bill

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 842
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #658 послато: Август 16, 2020, 05:39:15 поподне »
U ostatku Turske naš broj nije toliko velik, ali nas ima svuda po malo. U istraživanjima za celu Tursku a koji su pohranjeni u YHRD bazi podatak, među 320 testiranih imamo "čak" dva:

01) 12-24-13-10-11/18-12-12-11-30-19.2-14-19-10-15-10-21
02) 12-24-13-10-12/18-13-12-11-29-19.2-14-20-9-15-10-21

Kao što se vidi, i ova dva haplotipa su zanimljiva.

Prvi ima vrednost DYS385a-11 koja je dosta retka. Imaju je neki pripadnici ZS10589 i čini mi se da se javlja kod jednog haplotipa u Severnom Iraku. Takođe,poseduje retku vrednost DYS448-19 koja je isto dosta retka u PF7263 grani.

Drugi haplotip je identičan haplotipu pod rednim brojem četiri u istraživanju Crnomorskog regiona. Da li je i on pronađen tamo ili na nekom drugom mestu, Bog zna. Haplotipovi sa vrednošću GATA H4-9 pronađeni su i u provinciji Marmara koja se nalazi u zaleđu Istanbula pa je moguće da su poreklom iz tog kraja

https://yhrd.org/YP000423-Turkey+%5BTurkish%5D

Drugi haplotip iz istraživanja Dogana i Marijanovića blizak je haplotipu pronađenom u Cukurovi, nekad poznatijoj i kao Kilikoja, na krajnjem jugu Turske

https://en.wikipedia.org/wiki/%C3%87ukurova,_Adana

01) 12-24-13-10-13/18-12-12-11-29-18.2-14-20-10-15-10-21
02) 12-25-13-10-12/18-12-12-11-29-18.2-14-20-10-15-10-21

Drugi haplotip je blizak rezultatu iz Sarajeva, razlikujući se od njega samo na markeru DYS385b- 18 umesto 19, pa pretpostavljam da bi drugi novopečeni Sarajlija verovatno bio poreklom iz južnijih krajeva Turske.

Prvi haplotip je opet interesantan za ZS9952 granu zbog vrednosti 13 na DYS385a. Opet, bez SNP ne znamo sigurno, nego samo nagađamo i čekamo ga da se pojavi.

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22180269/

U regionu Southeastern Anatolia imamo dva haplotipa:

01) 12-24-13-10-12/19-13-12-11-29-18.2-14-20-10-15-10-21
02) 12-25-13-10-13/13-12-12-11-29-18.2-14-20-10-15-10-21

Ovde je zanimljiv drugi haplotip sa netipičnom mutacijom 13/13 na markeru DYS385ab. Ona nije ograničena na PF7263 nego se pojavljuje i u drugim granama, pa eto, i u našoj.

Gore navedeni haplotipovi su iz ovog rada. Na žalost, nisu deo rada ali se može videti prostor na kom su uzimani uzorci

https://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1080/09723757.2013.11886204

Marmara je regija u Turskoj, obuhvata evropski i azijski deo zaleđa. Iz nje imamo jedan haplotip:

12-24-14-10-12/18-13-12-11-29-19.2-14-20-9-15-10-21

Ovaj haplotip ima dva odstupanja. Prvi je vrednost DYS385a-14 dok je u većini drugih slučajeva 13 i odstupanje na GATAH4 -9 umesto uobičajenih 10. Možda se neko seća, Aleksandra je imala vrednost 14 na DYS19 i to me prilično zbunilo u prvi mah. Kasnije su se pojavili još neki haplotipovi s tom vrednošću, jedan od njih i u kontinentalnoj Grčkoj, no ovaj iz Marmare je jedini sa vrednošću ) umesto 10 na GATAH4. Nagađam da oba ova haplotipa, ustvari svi koji imaju tu vrednost na GATAH4 pripadaju grani BY38105, no za sad nemam priliku da to proverim

O provinciji Marmara, tekst iz Vikipedije

https://en.wikipedia.org/wiki/Marmara_Region

Ostala je još Mediteranska regija. Ovde imamo jedan PF7263 haplotip

12-25-13-10-12/17-12-12-11-29-19.2-14-20-10-15-10-21

Vrednosti DYS385ab-12/17 su obično uobičajene sa vrednošću 24 na DYS390 ali ih ima i sa vrednošću 25. Mongol u Sinkjangu čini mi se da ima baš tu kombinaciju

Nešto o Mediteranskoj regiji kao i približno mesto gde su uzimani haplotipovi

https://en.wikipedia.org/wiki/Mediterranean_Region,_Turkey

https://yhrd.org/YP001087-Mediterranean+Region%2C+Turkey+%5BTurkish%5D

Mislim da bi to bilo sve što se tiče J1 PF7263 grane u Turskoj. radove na sedam markera nisam uzimao u obzir pošto postoji velika mogućnost zamene sa nekim drugim haplotipovima pa sam propustio da njih uzmem u račun

Ван мреже Kor

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 1000
  • реверзни инжињеринг историје
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #659 послато: Октобар 04, 2020, 11:53:38 пре подне »
Да мало резимирамо ситуацију. Нека ме неко исправи ако сам навео нетачне податке.
1) Максимовић- Синобад cca 1000 година2) Максимовић- Куленски cca 1000 година3) Максимовић- Михић cca 1000 година (претпоставка)
Има ли неко неку идеју?