Аутор Тема: I2-PH908>FT14506>Y56203  (Прочитано 32111 пута)

симо

  • Гост
Одг: I2-PH908>FT14506>Y56203
« Одговор #160 послато: Август 17, 2018, 04:04:05 поподне »
Нашао сам овај СНП који недостје 20324699   C>G.

У питању је BY53303. Међутим код Yfull-a сам негативан на њега.

Није то иста промјена, али јесте на истој позицији. BY53303 је C>А

Могуће је да га зато нису ни ставили у листу новела. У сваком случају можеш пробати да га кандидујеш код Yseqa, ако прође њихову провјеру, не видим зашто не би остао.

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5484
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: I2-PH908>FT14506>Y56203
« Одговор #161 послато: Август 17, 2018, 04:13:21 поподне »
Није то иста промјена, али јесте на истој позицији. BY53303 је C>А

Могуће је да га зато нису ни ставили у листу новела. У сваком случају можеш пробати да га кандидујеш код Yseqa, ако прође њихову провјеру, не видим зашто не би остао.

Провери, мислим да је ту направљена грешка. Пише:

Sample allele:   G
Reference (hg19) allele:   C
Known SNPs at this position:   
BY53303   C    to    A      

Требало би да стоjи C to G.

симо

  • Гост
Одг: I2-PH908>FT14506>Y56203
« Одговор #162 послато: Август 17, 2018, 04:18:57 поподне »
Провери, мислим да је ту направљена грешка. Пише:

Sample allele:   G
Reference (hg19) allele:   C
Known SNPs at this position:   
BY53303   C    to    A      

Требало би да стоjи C to G.

Није грешка, ево слике.



Значи нађени СНП на тој позицији је BY53303   C    to    A
Код тебе је ту C to    G (као и на ФТДНА резултатима)
Код мене је C to C, јер немам никакву промјену на тој позицији. Ти имаш, из C у G, али не из C у А као код већ нађеног BY53303. Зато ти јавља да си негативан на тај СНП.
« Последња измена: Август 17, 2018, 04:22:39 поподне симо »

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5484
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: I2-PH908>FT14506>Y56203
« Одговор #163 послато: Август 17, 2018, 09:31:19 поподне »
У сваком случају можеш пробати да га кандидујеш код Yseqa, ако прође њихову провјеру, не видим зашто не би остао.

Одговор из Yseq-a:

"unfortunately your wished SNP is located in the DYZ19 125 bp repeat region. The obtained results would be not reliable."

симо

  • Гост
Одг: I2-PH908>FT14506>Y56203
« Одговор #164 послато: Август 17, 2018, 10:12:58 поподне »
Одговор из Yseq-a:

"unfortunately your wished SNP is located in the DYZ19 125 bp repeat region. The obtained results would be not reliable."

Ок, пробао си. Није прошло провјеру. Имаш опет она 4 већ постављена.

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5484
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: I2-PH908>FT14506>Y56203
« Одговор #165 послато: Август 17, 2018, 10:17:49 поподне »
Ок, пробао си. Није прошло провјеру. Имаш опет она 4 већ постављена.

Мораћу да кандидујем и BY49469. Њега нема у понуди.

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5484
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: I2-PH908>FT14506>Y56203
« Одговор #166 послато: Август 18, 2018, 08:25:06 пре подне »


Дакле нова грана за Тарске Никшиће је
 I2a-PH908>Y56203>Y134578


Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5484
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: I2-PH908>FT14506>Y56203
« Одговор #167 послато: Август 18, 2018, 10:00:09 пре подне »
Претпостављам, а на основу неке идеалне калкулације, да је 1 од 4 СНП-а која делим са Рабреновићем, одређујући за јужно-словенску грану. На тај један СНП би требали бити позитивни ови што имају 448=18, док би на остала 3 били негативни (Лукић, Џаић, Дошен, Ерлић, Батур). На тај и још један би требали бити позитивни сви 448=19, док би ови који су 481=30 били на остала два негативни (Полић, Краљевић, Шкарић, Леонард). Они који су 448=19, 481=31, а 643=10, требали би бити позитивни на три СНП-а (Комадина, Фетаховић). И на крају би имали СНП Тарских Никшића, који одваја маркер 643=11. Y134578 је вероватно узет као најпоузданији, али не мора да значи да је он одређујући само за Тарске Никшиће. Надам се да ћемо распетљати ово релативно брзо и видети да ли је ова калкулација тачна.
« Последња измена: Август 18, 2018, 10:36:47 пре подне Милош »

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5484
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: I2-PH908>FT14506>Y56203
« Одговор #168 послато: Август 18, 2018, 11:00:02 пре подне »
Сада је и BY49469 у понуди. Тако да код Yseq-a имамо сва 4 СНП која су испод Y56203 и које делим са Рабреновићем.

Y134578
https://www.yseq.net/product_info.php?products_id=62082

Y134603
https://www.yseq.net/product_info.php?products_id=61973

Y134611
https://www.yseq.net/product_info.php?products_id=62085

BY49469
https://www.yseq.net/product_info.php?products_id=81524

Па браћо извол'те!

симо

  • Гост
Одг: I2-PH908>FT14506>Y56203
« Одговор #169 послато: Август 18, 2018, 11:10:49 поподне »
Претпостављам, а на основу неке идеалне калкулације, да је 1 од 4 СНП-а која делим са Рабреновићем, одређујући за јужно-словенску грану. На тај један СНП би требали бити позитивни ови што имају 448=18, док би на остала 3 били негативни (Лукић, Џаић, Дошен, Ерлић, Батур). На тај и још један би требали бити позитивни сви 448=19, док би ови који су 481=30 били на остала два негативни (Полић, Краљевић, Шкарић, Леонард). Они који су 448=19, 481=31, а 643=10, требали би бити позитивни на три СНП-а (Комадина, Фетаховић). И на крају би имали СНП Тарских Никшића, који одваја маркер 643=11. Y134578 је вероватно узет као најпоузданији, али не мора да значи да је он одређујући само за Тарске Никшиће. Надам се да ћемо распетљати ово релативно брзо и видети да ли је ова калкулација тачна.

Џаић је био активан на форуму. Добро би било да истестира ова 4 СНП-а као представник групе 448=18.

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5484
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: I2-PH908>FT14506>Y56203
« Одговор #170 послато: Август 18, 2018, 11:25:08 поподне »
Џаић је био активан на форуму. Добро би било да истестира ова 4 СНП-а као представник групе 448=18.

Био је активан, али га дуго нема. Видим да је задњи пут на Форуму био пријављен 7. маја. Могао би то и Лукић да уради. Иако није на Форуму, у току је.
« Последња измена: Август 18, 2018, 11:29:39 поподне Милош »

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5484
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: I2-PH908>FT14506>Y56203
« Одговор #171 послато: Август 22, 2018, 11:30:18 пре подне »
https://www.yfull.com/tree/I-Y56203/

TMRCA пао на 1000 ybp. Још ће се ту мењати ствари.

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5484
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: I2-PH908>FT14506>Y56203
« Одговор #172 послато: Август 23, 2018, 09:32:27 пре подне »
https://www.yfull.com/tree/I-Y56203/

https://www.yfull.com/tree/I-Y134578/

По овоме што се види са Рабреновићем делим 5 СНП-а испод Y56203. То су већ споменути Y134578, Y134603, Y134611, али и Y134585, на који се Полић тестирао и негативан је. Такође делим са Рабреновићем и јуче споменут FGC51403/BY8728, тако да и није више занимљив :).BY49469 није коришћен у анализи.

По Yfull-y остала су ми још 3 приватна СНП-а.

Y134582
Y134591
Y134636

Тренутни TMRCA на основу моја 3 СНП-а је 550 ybp.

Моје мишљење је да осим ова три, постоје још три приватна СНП-а, која су сврстана у тзв. "двосмислене".

FGC12101
Y134622
BY145692

То би сазнали једино ако би неко од ближих рођака радио BigY.
« Последња измена: Август 23, 2018, 09:34:20 пре подне Милош »

симо

  • Гост
Одг: I2-PH908>FT14506>Y56203
« Одговор #173 послато: Август 23, 2018, 09:45:13 пре подне »
https://www.yfull.com/tree/I-Y56203/

https://www.yfull.com/tree/I-Y134578/

По овоме што се види са Рабреновићем делим 5 СНП-а испод Y56203. То су већ споменути Y134578, Y134603, Y134611, али и Y134585, на који се Полић тестирао и негативан је. Такође делим са Рабреновићем и јуче споменут FGC51403/BY8728, тако да и није више занимљив :).BY49469 није коришћен у анализи.

По Yfull-y остала су ми још 3 приватна СНП-а.

Y134582
Y134591
Y134636

Тренутни TMRCA на основу моја 3 СНП-а је 550 ybp.

Моје мишљење је да осим ова три, постоје још три приватна СНП-а, која су сврстана у тзв. "двосмислене".

FGC12101
Y134622
BY145692

То би сазнали једино ако би неко од ближих рођака радио BigY.

Да, у сваком случају, веза са Ћисофским је прије сеобе Словена. Остаје да се види преко тестирања Полића и херцеговачких 19=14, који је први српски СНП ове гране и гдје би му могло бити матично подручје.


Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5484
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: I2-PH908>FT14506>Y56203
« Одговор #174 послато: Август 24, 2018, 08:13:26 пре подне »
Панел је прошао проверу. И сад га има у понуди. Мало је скупљи него што сам очекивао, али можда је моја грешка што сам кандидовао чак 10 СНП-а за панел. У сваком случају исплативије је него ићи на поједначне СНП-ове.

https://www.yseq.net/product_info.php?products_id=81587

симо

  • Гост
Одг: I2-PH908>FT14506>Y56203
« Одговор #175 послато: Август 24, 2018, 08:20:57 пре подне »
Панел је прошао проверу. И сад га има у понуди. Мало је скупљи него што сам очекивао, али можда је моја грешка што сам кандидовао чак 10 СНП-а за панел. У сваком случају исплативије је него ићи на поједначне СНП-ове.

https://www.yseq.net/product_info.php?products_id=81587

И ја сам мислио да ће се држати стандардне цијене за панеле , до 100 долара. Овако како сам видио од укупне цијене за појединачне СНП-ове скидају око 20%.


симо

  • Гост
Одг: I2-PH908>FT14506>Y56203
« Одговор #176 послато: Август 24, 2018, 08:33:31 пре подне »
Иначе, старост гране Тарских Никшића по СНП-овима и по СТР-овима је прилично усклађена. Упоредио сам на Невски рачуначу 111- маркерне хаплотипове Милетића и Рабреновића и резултат је 19 генерација, ако рачунамо по 30 година по генерације дође се до 570 година. Прорачун на основу СНП код YFulla је 550 година.

То отприлике заједничког претка Милетића и Рабреновића смјешта у прву половину 15. вијека. С обзиром да се Никшићи из Таре као племенска група први пут у изворима јављају 1447. године, сасвим је извјесно да су као такви настали нешто раније. Можемо претпоставити да је предак Тарских Никшића, носилац мутације Y134578 ( или неке друге од преостале 4, пошто редослијед још не знамо) живио негдје на прелазу 14. у 15. вијек на подручју данашњих општина Колашина и Мојковца.
« Последња измена: Август 24, 2018, 08:35:42 пре подне симо »

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5484
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: I2-PH908>FT14506>Y56203
« Одговор #177 послато: Август 24, 2018, 09:06:35 пре подне »
Иначе, старост гране Тарских Никшића по СНП-овима и по СТР-овима је прилично усклађена. Упоредио сам на Невски рачуначу 111- маркерне хаплотипове Милетића и Рабреновића и резултат је 19 генерација, ако рачунамо по 30 година по генерације дође се до 570 година. Прорачун на основу СНП код YFulla је 550 година.

То отприлике заједничког претка Милетића и Рабреновића смјешта у прву половину 15. вијека. С обзиром да се Никшићи из Таре као племенска група први пут у изворима јављају 1447. године, сасвим је извјесно да су као такви настали нешто раније. Можемо претпоставити да је предак Тарских Никшића, носилац мутације Y134578 ( или неке друге од преостале 4, пошто редослијед још не знамо) живио негдје на прелазу 14. у 15. вијек на подручју данашњих општина Колашина и Мојковца.

Тако је. То је отприлике и период, како многи аутори сматрају, када су они и насељени у области Потарја. Једино што ми голица машту је то, да ли су Аранђеловштаци заправо део Лучинштака, који су у том периоду или нешто касније почели да славе Аранђеловдан, а да би TMRCA за све Тарске Никшиће био нешто већи, 750-800 год. Ово кажем, јер иако на малом броју маркера, код  нпр. Татића и Радовића се примећује да су нешто удаљенији. Посебно Татић, јер има на DYS635=25, као и остали Аранђеловштци. За матицу читаве гране Y56203 сматрам долину Неретве, одакле су се у једном историјском моменту померили ка Потарју. За сада немамо потврде о етапним станицама, попут Никшићке Жупе или Ровце. Веза би можда могао бити Фетаховић, који је исто из Потарја, али старија грана. Мада би он можда био и каснија миграција из Херцеговине. Као главне моменте у историји, а који би могли имати везе са миграцијом Тарских Никшића, видим Стонску и Лимску повељу краља Уроша I из средине XIII века. То би одговарало и споменутом TMRCA од 750-800 година.

симо

  • Гост
Одг: I2-PH908>FT14506>Y56203
« Одговор #178 послато: Август 24, 2018, 09:19:54 пре подне »
Тако је. То је отприлике и период, како многи аутори сматрају, када су они и насељени у области Потарја. Једино што ми голица машту је то, да ли су Аранђеловштаци заправо део Лучинштака, који су у том периоду или нешто касније почели да славе Аранђеловдан, а да би TMRCA за све Тарске Никшиће био нешто већи, 750-800 год. Ово кажем, јер иако на малом броју маркера, код  нпр. Татића и Радовића се примећује да су нешто удаљенији. Посебно Татић, јер има на DYS635=25, као и остали Аранђеловштци. За матицу читаве гране Y56203 сматрам долину Неретве, одакле су се у једном историјском моменту померили ка Потарју. За сада немамо потврде о етапним станицама, попут Никшићке Жупе или Ровце. Веза би можда могао бити Фетаховић, који је исто из Потарја, али старија грана. Мада би он можда био и каснија миграција из Херцеговине. Као главне моменте у историји, а који би могли имати везе са миграцијом Тарских Никшића, видим Стонску и Лимску повељу краља Уроша I из средине XIII века. То би одговарало и споменутом TMRCA од 750-800 година.

Остаје могућност повећања старости, четири су "клизећа" СНП-а, мада треба имати у виду да овдје говоримо конкретно о Никшићима који су већ територијализовани у Потарју.

Скоро сам читао неке документе из украјинског архива везане за Никшиће Требјешане и њихову колонију код Одесе. Занимљиво је да се у документима Никшићи на више мјеста наводе као "народ".

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5484
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: I2-PH908>FT14506>Y56203
« Одговор #179 послато: Август 24, 2018, 10:03:56 пре подне »

Скоро сам читао неке документе из украјинског архива везане за Никшиће Требјешане и њихову колонију код Одесе. Занимљиво је да се у документима Никшићи на више мјеста наводе као "народ".

Онда остаје она прича у игри о Нижићима. ;) Једино што немамо генетску потврду за то.

https://dic.academic.ru/dic.nsf/ruwiki/1838183