ДНК порекло > Основе генетичке генеалогије

Јан Мекдоналд објавио нови рад на тему израчунавања TMRCA

(1/1)

Драган Обреновић:
Доктор Јан Мекдоналд (Iain McDonald) je данас у научном часопису "Genes" објавио свој нови рад на тему израчунавање функције расподеле вероватноће за TMRCA. Управо по овој методологији FamilyTreeDNA тренутно имплементира TMRCA калкулације за своје хаплостабло (није познато када ће бити пуштено о продукцију).

Мекдоналдов прелиминарни рад на ту тему доступан је на http://www.jb.man.ac.uk/~mcdonald/genetics/pipeline-summary.pdf, а доле преносим вест коју је он лично данас објавио.
Текст је иначе изузетно комплексан за читање, пун озбиљне математике, али сигуран сам да на форуму итекако има људи којима ово може бити интересантно штиво.

-----------------------------------------

TMRCA update

Hi folks,

Another update on the TMRCA calculations. My article on the subject has just been accepted for a special issue in the journal Genes, following peer review. I have placed a pre-print on my personal website for the time being:

http://www.jb.man.ac.uk/~mcdonald/genetics/TMRCA.pdf

There's a lot in this article besides the method itself, and some of you may be interested in the calibration section at the bottom.

In the article, you'll also find a GitHub link to some example code. This code is a fairly simple implementation of the method, and generates the examples in the paper, so would need some investment to code up fully for an entire haplogroup. It's published under GNU public licence, so you can use it as you please.

To pre-empt the question, this code is not directly related to the implementation that Family Tree DNA will be using. I don't know all the details of what they'll be doing, and it would be improper of me to divulge what I do know anyway. However, I would expect various features of this method to show up in their final implementation.

Cheers,
Iain.

Навигација

[0] Индекс порука

Иди на пуну верзију