Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију

ДНК порекло > Основе генетичке генеалогије

<< < (2/5) > >>

Kor:
Када се одлучите на генетички тест на порекло по мушкој линији, тестира се ваш хромозом Y. У првом посту смо објаснили шта је то STR. Као резултате тог теста, добићете нешто слично овоме:

DYS 393 DYS 390 DYS 19 DYS 391 DYS 385a DYS 385b DYS 426 DYS 388 DYS 439 DYS 389i DYS 392 DYS 389ii
13 25 16 10 11 14 12 12 10 13 11 30

Шта ово све значи?
У претходном посту смо рекли да на Y хромозому имамо 50 милиона базних парова. Да би се лакше снашли у тако великој количини података, научници су поделили Y хромозом на сегменте који се најчешће називају DYS ( енгл. DNA Y Segment, сегмент од Y хромозома ДНК). На доста места ћете за одређено место у геному чути да се назива локус.

На слици видимо да се пребројавају вредности низа нуклеотида од 2. милиона па све до 30. милиона.

р је кратка рука хромозома, док се дуга рука означава са q.

Kor:
Видимо да се локација DYS 393 налази негде на око 3,1 милиона базних локација од почетка. Када уз помоћ софтистициране опреме погледамо садржај те локације, видећемо тамо следећи низ нуклеотида:

GTGGTCTTCTACTTGTGTCAATACAТATАGAT/AGAT/AGAT/AGAT/ AGAT/AGAT/AGAT/AGAT/AGAT/AGAT/AGAT/AGAT/AGAT/AGAT/ ATGTATGTCTTTTCTATGAGACATACCTCATTTTTTGGACTTGAGTTC

Дакле, на локацији DYS 393 у нашем случају имамо 13 понављања кратких секвенци (за које смо рекли да се називају STR).

Kor:
и даље пратимо резултате нашег тестирања, број STR-ова на DYS 390 = 25

Ако будемо посматрали нуклеотиде, то ће изгледати овако:

TATATTTTACACATTTTTGGGCCCTGCATTTTGGTACCCCATAATATATTCTATCTA/TCTG
/TCTG/TCTG/TCTG/TCTG/TCTG/TCTG/TCTG/TCTA/TCTA/TCTA/TCTA/TCTA/T
CTA/TCTA/TCTA/TCTA/TCTA/TCTA/TCTA/TCTG/TCTA/TCTA/TCTA/TCTA/TCATCTATCTATCTTTCCTTGTTTCTGAGTATACACATTGCAATGTTTTCATTTTACTGTCAC

25 понављања али овај пут се рачунају два различита STR ланца: TCTG и TCTA
=======
следећи је DYS 19:
DYS19 је доста популарније име за DYS394 али је то у суштини једно те исто (означавају исту локацију).

у нашем случају имамо 16 STR понављања:

ACTACTGAGTTTCTGTTATAGTGTTTTTTAATATATATATAGTATTATATATA
TAGTGTTATATATATATAGTGTTT/TAGA/TAGA/TAGA/TAGG/TAGA/TAG
A/TAGA/TAGA/TAGA/TAGA/TAGA/TAGA/TAGA/TAGA/TAGA//TAGA/TAGA/TATAGT
GACACTCTCCTTAACCCAGATGGACTCCTTGTCCTCACTACATGGCCATGGCC
CGAAGTATTACTCCTGGTGCCCCAGCCACTATTTCCAGGTGCAGAGATTGAC

=======
Следећи је DYS 391= 10

TTCATCATACACCCATATCTGTCTGTCTG/TCTA/TCTA/
TCTA/TCTA/TCTA/TCTA/TCTA/TCTA/TCTA/TCTA/
TCTA/TCTGCCTATCTGCCTGCCTACCTATCCCTCTATC

Надам се да је после овога јасно шта се мери путем генетичких тестова и шта те вредности заправо значе.

Генетички код саставњен од четири нуклеотида A,C, T и G једнак је за сва жива бића. Од бактерије преко наранче, купуса, траве, риба па све до човека. Колико моћан програм је у питању говори чињеница да од информација записаних у једној јединој ћелији настају читави организми са стотинама милијарди ћелија!

Kor:
Већ сада знамо да се информација Y хромозома на потомство преноси искључиво преко мушкараца.

Као што видимо, преноси се са пра-прадеда на прадеда, са прадеде на деда, са деда на оца, са оца на сина.

Информације са Y хромозома о мушким потомцима са мајчине стране се НЕ ПРЕНОСЕ! Међутим, све остале генетичке информације се могу пренети пошто у процесу оплођавања учествује 50% гена од оца и 50% гена од мајке. Тако можемо наследити облик носа, боју очију или косе коју има отац наше мајке.

Због ове карактеристике Y хромозома можемо пратити порекло мушкарца до дубоко у прошлост.

Kor:
Како утврђујемо рођачке везе између два мушкарца?

Погледајмо следећу табелу:

Овде имамо податке о 3 хаплотипа за три мушкарца. Означени су као брат1, брат2 и не-брат.

У случају брата1 и брата2, њихови резултати тестирања (хаплотипови) се разликују у једној мутацији на 12 маркера. Они спадају у исту хаплогрупу али је њихов заједнички предак живео пре од прилике 40 генерација, што је у просеку 1000-1200 година.

Да су брат1 и брат2 радили тестирање на рецимо 17 маркера, могли би одредити њиховог заједничког претка у диапазону од 250 година. Што се више повећава број тестираних маркера, већа је прецизност времена живота заједнјичког претка два рођака. Тако у случају 111 маркера који се разликују у само једној вредности своди заједничког претка два човека на свега три генерације.

не-брат из наше табеле има преко 20 мутација више од брата1 и брата 2 на 12 маркера, што значи да је њихов заједнички предак живео пре више од 20000 година. Због тога припада хаплогрупи која се разликује од оне коју имају браћа 1 и 2 и у њој ће бити људи чији хаплотип је много сличнији његовом.

Запамтимо следеће: хаплотип је скуп STR вредности добијен тестирањем појединца, док је хаплогрупа категорија блиских сродника у коју смештамо тај хаплотип.

Навигација