ДНК порекло > Aрхеологија и археогенетика
Неандерталци
Прерад:
Везано на претходну поруку и вијест о КОВИД-19, на овом линку је исто објашњено нешто једноставније за нас лаике.
--- Цитат ---A recent large-scale study on Spanish and Italian COVID-19 cases identified the minor variant of rs11385942 as the polymorphism most strongly associated with severe infection. The authors defined COVID-19 infections as ‘severe’ when they required hospitalization due to respiratory failure [R].
The risk variant was most common among patients who required mechanical ventilation when compared to those only needing oxygen supplementation. Additionally, hospitalized patients carrying two copies of the risk allele were in average 7 years younger than the rest [R].
Interestingly, this variant is practically always inherited together with 12 other minor alleles. These polymorphisms form a genome region that entered the modern genome from the Neanderthals and is especially common in South Asian and European descendants.
Primary SNP: rs11385942
‘AAA’ = Associated with severe COVID-19 infection, need for mechanical ventilation, and younger age at hospitalization
‘AA’ = Not associated with severe COVID-19 infection
83% of the world population only carries the major allele
The variant is most common in South Asian descendants, less so in people with European ancestry, and extremely rare in the rest of ethnicities
Proxy SNPs:
rs10490770
‘T’ = Not inherited with the risk variant of rs11385942. Not associated with severe COVID-19 infection.
‘C’ = Inherited with the risk variant of rs11385942. Associated with severe COVID-19 infection.
Only 2% of the world population is ‘CC’
The genotype distribution is very similar to that of rs11385942
rs35731912
‘C’ = Not inherited with the risk variant of rs11385942. Not associated with severe COVID-19 infection.
‘T’ = Inherited with the risk variant of rs11385942. Associated with severe COVID-19 infection.
Only 2% of the world population is ‘TT’
The genotype distribution is very similar to that of rs10490770 and rs11385942
--- Крај цитата ---
Они који су тестирани код ДантеЛабса могу провјерити поменуте СНП-ове преко њихове алатке DNA Explorer. БАМ фајл се такођер може претраживати на компјутеру са алатком IGV.
Локације СНП-ова:
rs11385942 (insert A) - chr3:45876460-45876461 (GRCh37.p13) / chr3:45834968-45834969 (GRCh38.p12)
rs10490770 (C) - chr3:45823240 (GRCh37.p13) / chr3:45864732 (GRCh38.p12)
rs35731912 (T) - chr3:45889949 (GRCh37.p13) / chr3:45848457 (GRCh38.p12)
rs13081482 (T) - chr3:45908116 (GRCh37.p13) / chr3:45866624 (GRCh38.p12)
rs35044562 (G) - chr3:45867532 (GRCh37.p13) / chr3:45909024 (GRCh38.p12)
rs35624553 (G) - chr3:45867440 (GRCh37.p13) / chr3:45825948 (GRCh38.p12)
rs71325088 (C) - chr3:45862952 (GRCh37.p13) / chr3:45821460 (GRCh38.p12)
rs13078854 (A) - chr3:45861932 (GRCh37.p13) / chr3:45820440 (GRCh38.p12)
rs17713054 (A) - chr3:45859651 (GRCh37.p13) / chr3:45818159 (GRCh38.p12)
rs35508621 (C) - chr3:45880481 (GRCh37.p13) / chr3:45838989 (GRCh38.p12)
rs35081325 (T) - chr3:45889921 (GRCh37.p13) / chr3:45848429 (GRCh38.p12)
rs73064425 (T) - chr3:45901089 (GRCh37.p13) / chr3:45848429 (GRCh38.p12)
rs34288077 (G) - chr3:45888690 (GRCh37.p13) / chr3:45847198 (GRCh38.p12)
CosicZ:
--- Цитат: Бећар Јул 08, 2020, 07:47:52 поподне ---Недаван чланак на тему генетике Неандерталаца даје нам више значај у време КОВИД-19. Макс Планк институт у Лајпцигу (Немачка) је нашао директну везу измећу 6 гена низа трећег хромозома Ненадерталаца и подложности компликацијама од болести које доноси вирус COVID-19 (SARS-CoV-2).
The major genetic risk factor for severe COVID-19 is inherited from Neandertals https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.07.03.186296v1
По оцени Макс Планк научника и коментара из Шведске Каролинска института медицине, око 8% Европе има ову исту групу од 6 гена која статистички доводи до већих проблеме са овим вирусом. Ова група гена, на хромозому #3, је заступљена код 30% данашњих људи јужне Азије, нарочито Бангладеша и делова Индије. Медјутим само 4% у Источној Азији и скоро 0% у Африци. Даљи коментари које је објавио Нју Јорк Тајмс, наводе да смо ми изгубили већину Ненадерталских гена јер су вероватно били инферирорни за наш опстанак. Ипак ген који жене имају за повећану плодност-трудноћу су од неандерталаца и још увек са нама. Изгледа да смо и сакупили неке од отпорности на друге вирусе из шире облати Русије (Северна Азија) од Неандерталаца.
Тако да је једна од хипотеза да ово група гена на хромозома #3, је накнадна мутација која је давал отпорност Неандерталцима од вирусиа пре 60.000 година. Међутим, сада утиче на претерану реакцију имуног система на инфекције мутација сличних вируса типа SARS-CoV-2.
DNA Inherited From Neanderthals May Increase Risk of Covid-19 https://www.nytimes.com/2020/07/04/health/coronavirus-neanderthals.html
--- Крај цитата ---
Неколико чланака о вези неандерталског наслеђа и подложности вирусу Covid-19.
https://www.oranews.tv/i-mbijetove-covid-19-ndoshta-duhet-te-falenderosh-paraardhesit-e-tu-te-neandertalit/
https://politiko.al/english/bota/i-mbijetove-covidit-ndoshta-per-kete-duhet-te-falendh-paraardhesit-e-tu-i430901
https://www.world-today-news.com/the-association-of-dna-inherited-from-neanderthals-with-severe-cases-of-covid-19-is-being-studied/
https://www.nature.com/articles/s41586-020-2818-3
https://www.nature.com/articles/s41586-020-2818-3.pdf
https://bopato.com/zimbabwe/risk-of-severe-coronavirus-linked-to-neanderthal-genes-from-60000-years-ago/
Драган Обреновић:
https://www.discovermagazine.com/planet-earth/a-leading-theory-behind-neanderthal-extinction-may-surprise-you
"...
Претходне теорије о изумирању Неандерталаца су се базирале на претпоставкама о њиховој инфериорности у односу на модерне људе. Ипак, ниједан истраживач није тестирао идеју да су они били подједнако способни за опстанак као ми. Дакле, уместо да претпоставимо да постоје разлике између нас и Неандерталаца, Весен и његове колеге су пошли од претпоставке да смо функционално били на истом нивоу. Да ли би и под том претпоставком Неандерталци можда изумрли?
Примењујући симулације биолошке одрживости које се користе за праћење угрожених врста као што су тигрови, они су укључили три кључна фактора који често одређују судбину угрожених врста: парење у сродству (ендогамија), „Али ефекат“ (Allee effect) и стохастичност – ефекте природних непогода као што су поплаве, суше, земљотреси и сл.
У суштини, желели су да искористе процене броја неандерталаца како би утврдили да ли демографски фактори као што су прибегавање ендогамији, варијације у бројностима полова, случајни догађаји као што су поплаве или суше, и тешкоће у проналажењу партнера могу објаснити нестанак Неандерталаца.
А по њиховом моделу - могло би. Неандерталци су провели већи део свог постојања у популацијама чија бројност је стално била на ивици изумирања, објашњава Весен. Случајне варијације у репродуктивном потенцијалу и величини популације, у комбинацији са ендогамијом који смањује и плодност и преживљавање, могли би довољно да објасне нестанак наших рођака.
Можда су модерни људи играли неку улогу, али можда и није била таква конкурентност међу њима, каже Весен. Ако су модерни људи блокирали миграционе путеве које су користили неандерталци, можда смо посредно допринели њиховом изумирању присиљавајући их да све више прибегавају ендогамији, чак и без директног контакта са њима, каже он.
..."
Интересантна хипотеза... Могла би да објасни и разлоге гашења појединих грана старих хаплогрупа у Европи, типично сачињених од ловаца сакупљача, који су вероватно живели у релативно малобројним скупинама и стога били константно изложени ризику од изумирања, из истих разлога као и Неандерталци (слаб потенцијал за одбрану од других агресивнијих група, угроженост природним непогодама, принуђеност на ендогамију и сл.).
filipi:
https://www.academia.edu/63716418/Geolo%C5%A1ke_i_tipolo%C5%A1ke_karakteristike_paleolitskih_musterijenskih_kamenih_alatki_iz_Kru%C4%8Devi%C4%87a_kod_%C4%8Citluka_Prvo_otkri%C4%87e_neandertalskih_artefakata_u_niskoj_Hercegovini_Geological_and_typological_characteristics_of_Paleolithic_Mousterian_stone_tools_from_Kru%C4%8Devi%C4%87i_near_%C4%8Citluk?pop_sutd=false
Geološke i tipološke karakteristike paleolitskih-musterijenskih kamenih alatki iz Kručevića kod Čitluka - Prvo otkriće neandertalskih artefakata u niskoj Hercegovini -- Geological and typological characteristics of Paleolithic-Mousterian stone tools from Kručevići near Čitluk
Навигација
[0] Индекс порука
[*] Претходна страна
Иди на пуну верзију