Аутор Тема: Древна ДНК - научни радови  (Прочитано 227155 пута)

Ван мреже Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2511
  • I2-BY55783>BY79593
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #860 послато: Мај 16, 2022, 09:08:59 поподне »
Stable population structure in Europe since the Iron Age, despite high mobility

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.15.491973v1

Древни геноми из периода од гвозденог доба до позног средњег века, а што је најбитније велики број њих са наших простора: 18 из Србије (Виминацијум, Сирмијум, Наисус, Крушевље, Бешка), 6 из Црне Горе (Доклеа-Бјеловине), 29 из Хрватске...

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #861 послато: Мај 16, 2022, 09:28:04 поподне »
Stable population structure in Europe since the Iron Age, despite high mobility

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.15.491973v1

Древни геноми из периода од гвозденог доба до позног средњег века, а што је најбитније велики број њих са наших простора: 18 из Србије (Виминацијум, Сирмијум, Наисус, Крушевље, Бешка), 6 из Црне Горе (Доклеа-Бјеловине), 29 из Хрватске...

Ово је одличан пресјек тестираних локација. Надам се да ће резултати донијети нешто суштинско ново у сазнањима. Не видим да је негдје извучен преглед основних хаплогрупа?

Ван мреже Неродимац

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 627
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #862 послато: Мај 16, 2022, 10:13:50 поподне »
Када ће овај рад угледати светлост дана? 😀

Ван мреже Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2511
  • I2-BY55783>BY79593
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #863 послато: Мај 16, 2022, 10:46:14 поподне »
Ово је одличан пресјек тестираних локација. Надам се да ће резултати донијети нешто суштинско ново у сазнањима. Не видим да је негдје извучен преглед основних хаплогрупа?

У доступним табелама нажалост нема података о хаплогрупама, можда и грешком. Свакако ће бити доступне када рад буде званично објављен.

Када ће овај рад угледати светлост дана? 😀

Не зна се ништа за сад, може бити неколико месеци, може и више од годину дана.

Ван мреже CosicZ

  • Редакција СДНКП
  • Истраживач
  • ******
  • Поруке: 898
  • Ђурђевдан Y:I1>P109>FGC22045 Панчево
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #864 послато: Мај 17, 2022, 05:47:51 пре подне »
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.15.491973v1.full.pdf
Цитат
In contrast to the homogeneity of the Armenian population, most of the regions,
including Italy, Southeastern Central Europe, and Western Europe, had strikingly
heterogeneous populations. Newly collected samples reinforce previous findings of high
heterogeneity in Rome, including a large portion of the population having affinities for
present-day Near Eastern populations (Antonio et al., 2019; Posth et al., 2021) (Figure
3 - figure supplement 1). Interestingly, Southeastern Central European and Western
European individuals during the Imperial Roman & Late Antiquity period also exhibit
high heterogeneity, on par with that of contemporaneous Italy (Figures 3 and 4).
Furthermore, these ancestries are often shared across regions. In Southeastern
Central Europe, a core group of individuals have ancestry similar to that of present-day
and contemporaneous Central Europeans (C10), while other clusters have ancestry
similar to that of Northern Europeans (C4) and Eastern Mediterraneans (C6) (Figure
3C). These ancestry groups are found in contemporaneous Italy and Western Europe
as well (Figure 4C, Figure 3 - figure supplement 1). We also observe outliers of eastern
nomadic ancestry, similar to that of Sarmatian individuals previously reported, in both
Western Europe (C5, n=2) and Southeastern Central Europe (C1, n=2).
Overall, we see remarkable local genetic heterogeneity as well as cross-regional
similarities which point to common ancestry sources and, on a broader scale,
demographic events affecting different regions in similar ways.

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #865 послато: Мај 17, 2022, 08:17:28 пре подне »
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.15.491973v1.full.pdf

Ако се сад не појави J-M205 на старим налазиштима код нас, неће никад. :) Иако је период нешто старији у односу на старост актуелне подгране. Мада у обзир долазе и многе друге J лозе.

Ван мреже Be like Bill

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 842
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #866 послато: Мај 17, 2022, 10:30:50 пре подне »
Ima nas još :). Kad vidim ove lepe libanske rezultate na istočnoj obali Jadrana i unutrašnjosti Srbije i meni rastu apetiti.

Ja bih u stvari trebao pomoć.

U pitanju je rad iz 2019:"The genomic history of the Iberian peninsula over the past 8000 years" autora Olalde et al. Jedan od rezultat koji se pominju jeste i uzorak I8216 pronađen u Empuriesu na severu današnje Katalonije. Potiče iz perioda ranog carstva negde oko 100 godine naše ere. Koliko sam video, niko nije bolje analizirao njegov haplotip. U samom radu označen je samo kao J i prenet je par SNP-ova na koje je pozitivan a koji su na razini M267, koliko sam shvatio. Na nekim mestima našao sam da je kao krajnji SNP označen L620 (koji je par koraka iznad P58 i PF7264)

https://haplotree.info/maps/ancient_dna/slideshow_samples.php?searchcolumn=Y_Haplotree_Variant&searchfor=J-L620&ybp=500000,0

Jučer sam slučajno na profilu jednog korisnika na FB našao nešto za što ne znam da li je rezultat analize ili samo priželjkivanja. Uglavnom, po njemu je pomenuti rezultat I8216 pozitivan na ZS4416

https://www.facebook.com/Hicham.hiccc/posts/394266402547347

Ukoliko bi to bilo tačno, to bi bio velik korak za nas, pre svega jer bi to bio prvi pripadnik PF7263 grane pronađen u arheološkim ostacima, a drugo sigurno bi pružio i dodatne informacije o kulturnom krugu sa kojim se širio (mada već odavno pretpostavljamo da je širenje počelo sa stvaranjem Rimskog carstva)

Ono što bih trebao jeste pomoć oko analize njegovog fajla pošto se u tome uopšte ne snalazim. Ovde je rad u kom se pominje a ispod njegov uzorka koji sam pronašao u bazi podataka drevne DNK.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6436108/

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/SAMEA5229473

Ван мреже CosicZ

  • Редакција СДНКП
  • Истраживач
  • ******
  • Поруке: 898
  • Ђурђевдан Y:I1>P109>FGC22045 Панчево
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #867 послато: Мај 17, 2022, 04:38:59 поподне »
Ако се сад не појави J-M205 на старим налазиштима код нас, неће никад. :) Иако је период нешто старији у односу на старост актуелне подгране. Мада у обзир долазе и многе друге J лозе.
J-M205 ће се можда појавити, јер је период од пре 3000 до 1200 година вероватно време када многе њене подгрупе долазе са Блиског Истока у Европу.
https://www.yfull.com/tree/J-Y64012/
https://www.yfull.com/tree/J-FT45018/
https://www.yfull.com/tree/J-FT73408/
https://www.yfull.com/tree/J-Y134209/
https://www.yfull.com/tree/J-CTS5338/
https://www.yfull.com/tree/J-YP13/
https://www.yfull.com/tree/J-Y213011/
Али за проналажење J-Y22059 ће требати још доста копања по Балкану или на неком другом месту, јер у време Римљана ова подгрупа је чинила мање од 1% J-M205.

Цитат
All sequence data newly generated for this study are available at the European
Nucleotide Archive (ENA) database under the accession number PRJEB52852, as well
as PRJEB49419 for individuals reported by Moots et al.

Ван мреже Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2511
  • I2-BY55783>BY79593
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #868 послато: Мај 18, 2022, 05:45:18 поподне »
Ево прелиминарних хаплогрупа за једина два узорка из Црне Горе, и за један део узорака из Србије:


R3481; 211-321 AD; Doclea_Bjelovine, Montenegro; J2b2a-Z638>Z1297>Z1295>Z8421>Z631>Z1043

R9918; 997-1151 AD; Doclea_Bjelovine, Montenegro; J2b2a-Y15058>Z38240>CTS6190

R6693; 236-332 AD; Svilos_Krusevlje, Serbia; J2b2a-L283>Z622>Z600>Z2509>Z585

R6701; 236-332 AD; Svilos_Krusevlje, Serbia; R1b1a-Z2118>Z2116>S1161>CTS6718>FGC48821>FGC12521>FGC24139>BY157588

R6730; 266-430 AD; Sirmium, Serbia; I2a2a-L701>P78>S25733>A427>S17511>Y41633

R3918; 994-1149 AD; Sirmium, Serbia; J2b2a-Y15058>Z38240>CTS6190

R3906; 1479-1634 AD; Sirmium, Serbia; I1a1a1a-Z2336>Y3866>S4767>Y4781>S4770>M227>A11380


Ван мреже НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #869 послато: Мај 18, 2022, 05:50:34 поподне »
Ево прелиминарних хаплогрупа за једина два узорка из Црне Горе, и за један део узорака из Србије:


R3481; 211-321 AD; Doclea_Bjelovine, Montenegro; J2b2a-Z638>Z1297>Z1295>Z8421>Z631>Z1043

R9918; 997-1151 AD; Doclea_Bjelovine, Montenegro; J2b2a-Y15058>Z38240>CTS6190

R6693; 236-332 AD; Svilos_Krusevlje, Serbia; J2b2a-L283>Z622>Z600>Z2509>Z585

R6701; 236-332 AD; Svilos_Krusevlje, Serbia; R1b1a-Z2118>Z2116>S1161>CTS6718>FGC48821>FGC12521>FGC24139>BY157588

R6730; 266-430 AD; Sirmium, Serbia; I2a2a-L701>P78>S25733>A427>S17511>Y41633

R3918; 994-1149 AD; Sirmium, Serbia; J2b2a-Y15058>Z38240>CTS6190

R3906; 1479-1634 AD; Sirmium, Serbia; I1a1a1a-Z2336>Y3866>S4767>Y4781>S4770>M227>A11380

Каква је ситуација са узорцима из Хрватске и С. Македоније? Видех да их има прилично.
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #870 послато: Мај 18, 2022, 06:15:52 поподне »
Ево прелиминарних хаплогрупа за једина два узорка из Црне Горе, и за један део узорака из Србије:


R3481; 211-321 AD; Doclea_Bjelovine, Montenegro; J2b2a-Z638>Z1297>Z1295>Z8421>Z631>Z1043

R9918; 997-1151 AD; Doclea_Bjelovine, Montenegro; J2b2a-Y15058>Z38240>CTS6190

R6693; 236-332 AD; Svilos_Krusevlje, Serbia; J2b2a-L283>Z622>Z600>Z2509>Z585

R6701; 236-332 AD; Svilos_Krusevlje, Serbia; R1b1a-Z2118>Z2116>S1161>CTS6718>FGC48821>FGC12521>FGC24139>BY157588

R6730; 266-430 AD; Sirmium, Serbia; I2a2a-L701>P78>S25733>A427>S17511>Y41633

R3918; 994-1149 AD; Sirmium, Serbia; J2b2a-Y15058>Z38240>CTS6190

R3906; 1479-1634 AD; Sirmium, Serbia; I1a1a1a-Z2336>Y3866>S4767>Y4781>S4770>M227>A11380

Фина разноврсност J2b-M241. Подгране J-CTS6190 за сада нема на простору Црне Горе, али ови резултати указују на то да је свакако била присутна и ту.

Интересантно је присуство I2-A427 пре сеоба Словена и Германа. То може бити генетички траг Келта. Мада, колико видим, конкренто ова подграна гравитира више ка истоку Европе.

Ван мреже Bane

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 977
  • E-Z16988+BY99620+
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #871 послато: Мај 18, 2022, 07:58:17 поподне »
R3745 (Zadar_Hypo_banka, Croatia, 1878.25bp):
https://www.yfull.com/tree/E-Y30977
https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/E;name=E-BY66293

Далеки рођак Васојевића и Рајовића.

Ван мреже гаша

  • Шегрт
  • ***
  • Поруке: 76
  • I1-M227
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #872 послато: Мај 18, 2022, 09:55:28 поподне »
Опа, појавила се и наша подграна I1 M227 у Сирмијуму, како ово коментаришете?

Ван мреже Кековац

  • Уредник СДНКП
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 482
  • I2-S25733>PH2670>Y200040
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #873 послато: Мај 18, 2022, 10:42:57 поподне »
Опа, појавила се и наша подграна I1 M227 у Сирмијуму, како ово коментаришете?

Ништа чудно рекао бих, с обзиром на старост узорка.

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #874 послато: Мај 19, 2022, 09:27:11 пре подне »
R3745 (Zadar_Hypo_banka, Croatia, 1878.25bp):
https://www.yfull.com/tree/E-Y30977
https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/E;name=E-BY66293

Далеки рођак Васојевића и Рајовића.

Бане, да ли си сигуран да је овај узорак из овог новог рада? Колико ја видим, то је узорак из рада The genetic origin of Huns, Avars and conquering Hungarians

Ван мреже Bane

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 977
  • E-Z16988+BY99620+
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #875 послато: Мај 19, 2022, 10:52:13 пре подне »
Бане, да ли си сигуран да је овај узорак из овог новог рада? Колико ја видим, то је узорак из рада The genetic origin of Huns, Avars and conquering Hungarians

Supplementary Material (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.15.491973v1.supplementary-material) рада "Stable population structure in Europe since the Iron Age, despite high mobility" има табелу "Individual Metadata" са листом узорака која укључује и R3745.

Ван мреже Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2511
  • I2-BY55783>BY79593
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #876 послато: Мај 19, 2022, 11:41:08 пре подне »
Каква је ситуација са узорцима из Хрватске и С. Македоније? Видех да их има прилично.

Из Хрватске има укупно 29 узорака, из Македоније нема ниједан. Ево шта имам за до сада обрађене узорке из Хрватске:


R3742; 127-228 AD; Zadar_Relja, Croatia; E-L791>Z20942>Y4971>Y4972>K257>Y4970>Y143722>Y16298>Y16161

R3745; 23-121 AD; Zadar_Hypo_banka, Croatia; E-V13>Z1057>Y30977>Y30976>Y99739>BY66293

R3544; 550-601 AD; Gardun, Croatia; J2b2a-Z638>Z1297>Z1295>Z8421>Z631>Z1043

R3665; 124-217 AD; Trogir_Dragulin, Croatia; J2a-Z6065>Y13341>Z7515>FGC15877>FGC15895>FGC15923>YP879>Y83702>FT68608>Y154988

R3659; 249-378 AD; Scitarjevo, Croatia; E-V13>Z1057>CTS1273>BY3880>Z5017>BY4642>Z38334* (xBY4710,BY4715,Z37883)

R3685; 435-565 AD; Velic, Croatia; G2a2b-L497>Z1815>Y7538>Z1816>Z1823>Z726>CTS4803>S2808>Y3098>Y3101>FGC8322>FGC8346* (xFGC8327)

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5122
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #877 послато: Мај 19, 2022, 12:00:53 поподне »
Supplementary Material (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.15.491973v1.supplementary-material) рада "Stable population structure in Europe since the Iron Age, despite high mobility" има табелу "Individual Metadata" са листом узорака која укључује и R3745.

Знам да је R3745 из овог новог рада, али мислио сам да указујеш на узорак ERS9945244 на YFull стаблу, који  је из рада The genetic origin of Huns, Avars and conquering Hungarians. Овај R3745 још није постављен на стабло. Нисмо се разумјели.

Ван мреже CosicZ

  • Редакција СДНКП
  • Истраживач
  • ******
  • Поруке: 898
  • Ђурђевдан Y:I1>P109>FGC22045 Панчево
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #878 послато: Мај 20, 2022, 07:43:03 пре подне »
Да још мало забиберимо чорбу. Тренутно стање на https://www.yfull.com/mtree/HV0a1a/ . Стварно је за (ГГ) Нобела.

Издвојен је у подгрупу https://www.yfull.com/mtree/HV0a1a1b/ , додуше са малим нивоом поузданости.
Мутацију A16235G има и узорак 23andMe('wonderfalls-1016) на http://www.ianlogan.co.uk/sequences_by_group/hv0a_genbank_sequences.htm .

ERS9945252 ( https://www.yfull.com/live/tree/E-BY5617/ , https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/E;name=E-BY5617 ) има млађег рођака у данашњем Алжиру, можда римског или вандалског порекла.

Ван мреже Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2511
  • I2-BY55783>BY79593
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #879 послато: Мај 20, 2022, 11:32:37 поподне »
Један мање-више очекиван резултат:


R3931; 130-231 AD; Viminacium, Serbia; E-V13>Z1057>CTS1273>BY3880>Z5018>Z16242>pre-Y178966


ниво Y178966: FGC91388+ A>T (1T); FGC91362+ C>T (1T); Y144293- T>C (1T); FT297285- T>C (1T)


И један прилично изненађујући резултат:


R9673; 79-213 AD; Viminacium, Serbia; R1a-Z280>Z92>Y4459>YP617>Y29965>pre-Y88926


ниво Z280: S204/Z91+ G>A (1A)

ниво Z92: Z683+ T>A (2A); Z660/S344/CTS91+ T>G (1G)

ниво Y4459: *нема очитавања*

ниво YP617: YP617+ C>G (1G)

ниво Y29965: Y29965+ C>A (1A)

ниво Y29965>BY30709: BY30707/Y45985- C>G (1C); BY30708/Y47237- G>C (1G); BY30709- G>A (2G); BY30713/Y58068- T>C (1T)

ниво Y29965>Y88926: Y91425+ C>T (1T); BY87472- G>T (1G); Y107811- C>T (1C); FT308832- C>T (2C)