YFull helper екстензија за Google Chrome & Microsoft Edge

ДНК порекло > ГГ Разно

<< < (3/4) > >>

vid.knezevic:

--- Цитат: Драган Обреновић Фебруар 22, 2022, 06:32:21 поподне ---У следећој верзији YFull екстензије, која ће се појавити у Google Chrome Web Store и Microsoft Edge Add-Ons продавницама за који дан, додата је функционалност за "обогаћен" приказ табеле Српског ДНК пројекта. Напомињем да све ради аутоматски, довољно је имати инсталирану YFull екстензију у Google Chrome или Microsoft Edge прегледачу док се гледа табела СДНКП.

Сва побољшања табеле су "неинтрузивна". Само се на постојеће функционалности додају још неке згодне информације:

Ако курсор миша задржите изнад назива хаплогрупе, добићете у балончићу (tooltip) приказ старости гране на YFull стаблу (дакле није интерни прорачун за наше тестиране у табели СДНКП, већ званична старост гране са YFull стабла).

Шта је додатно побољшање - као што знате, ако кликнете на назив хаплогрупе у табели Српског ДНК пројекта, отвара се интерно стабло хаплогрупа. Екстензија на то додатно "убуџи" и линк на YFull стабло исте хаплогрупе:

Ако је екстензија активна и кликнете на назив хаплогрупе у табели СДНКП, у прозору се подразумевано отвара приказе хаплогрупе СДНКП (подразумевано понашање), али се додатно у новом табу отвара и YFull стабло исте хаплогрупе.

Ако желите само приказ YFull стабла, можете кликнути десним тастером миша на назив хаплогрупе и одабрати опцију "Open link in new tab".

--- Крај цитата ---
Мени се баш свиђа пример :)

Драган Обреновић:

--- Цитат: Exiled Фебруар 22, 2022, 06:56:56 поподне ---Свака вам част за ово, браво. Имам један предлог што се тиче табеле. Да ли је изводљиво обележити маркере по угледу рецимо на табеле код ФТДНА а тиче се њихове брзине мутације?

--- Крај цитата ---

Добра идеја, а није ни претерано тешка за реализацију у програмерском смислу. Може нијанса боје позадине ћелије може да буде индикатор склоности мутацијама.

Само што не знам коју/чију категоризацију користити, има их пуно, па ако неко има предлог...

https://isogg.org/wiki/Mutation_rates

У некој перспективи би то било боље "фабрички" имплементира у самој табели СДНКП, јер заиста је корисно приликом поређења хаплотипова имати јасан визуелни индикатор колико је посматрани маркер генерално стабилан (подложан мутирању).

Exiled:

--- Цитат: Драган Обреновић Фебруар 22, 2022, 07:19:47 поподне ---Добра идеја, а није ни претерано тешка за реализацију у програмерском смислу. Може нијанса боје позадине ћелије може да буде индикатор склоности мутацијама.

Само што не знам коју/чију категоризацију користити, има их пуно, па ако неко има предлог...

https://isogg.org/wiki/Mutation_rates

У некој перспективи би то било боље "фабрички" имплементира у самој табели СДНКП, јер заиста је корисно приликом поређења хаплотипова имати јасан визуелни индикатор колико је посматрани маркер генерално стабилан (подложан мутирању).

--- Крај цитата ---
Ваљало би то уредници међу собом да договоре и да се то решење примени...ваљало би свима.

НиколаВук:
Свака част на убацивању нових функција, Драгане. Што се тиче стопе мутација STR маркера, постоји груба подела на споро-, средње- и брзомутирајуће маркере, међутим оно што се да приметити је да се код различитих хаплогрупа дешавају својеврсна одступања у овим стопама мутација, па је тако код неких подграна маркер који се обично сматра нпр. средњемутирајућим прилично стабилан и "непроменљив", и обрнуто, маркери који се обично сматрају споријим код неких подграна мутирају чешће него иначе. Због тога је упитно да ли постоји неки општи образац мутација за све хаплогрупе, или сваку хаплогрупу, па и подгране унутар ње, треба посматрати засебно што се тога тиче.

Драган Обреновић:
Објављена је верзија 3.0 екстензије за YFull. Линкови за преузимање су и даље исти:

1) Google Chrome
https://chrome.google.com/webstore/detail/yfullcom-helper/ohbnmfhafhiimebngkhbhbdimhnpfcgl

2) Microsoft Edge
https://microsoftedge.microsoft.com/addons/detail/yfullcom-helper/amflkfajkdhgglphflhndfnconfclkcm

3) Mozilla Firefox
https://addons.mozilla.org/en-US/firefox/addon/yfull-helper

Новост је што сада можете додати и напомену/коментар за неку хаплогрупу (чвор у стаблу), рецимо у случају када се ради о јасно профилисаном роду/племену, као на примеру испод:

За подешавање напомена о хаплогрупама (родовима/племенима) потребно је изабрати опцију "Подаци о хаплогрупама..." ("Haplogroup configuration..." ако је језик у прегледачу енглески) и унети рецимо следећу конфигурацију:

{
"E-Z13591" : "Бјелопавлићи",
"Q-Y172657" : "Братоножићи",
"R-Y104972" : "Букумири",
"E-Y126722" : "Васојевићи",
"I-Y135653" : "Војинићи-Љешњани",
"J-Y22059" : "Годијељи",
"J-Y182188" : "Груде",
"J-Y22063" : "Дедејићи",
"J-Y22063" : "Кецмани",
"E-Y182900" : "Клименти",
"J-Y155375" : "Кричке",
"E-BY165837" : "Кучи",
"E-FT104106" : "Матаруге",
"I-Y58629" : "Мириловићи",
"R-FT367738" : "Мурићи",
"I-FT190799" : "Никшићи",
"I-BY93199" : "Озринићи",
"N-FGC28435" : "Пивљани - Руђићи и Браниловићи",
"R-FT49714" : "Пипери",
"E-A24066" : "Ракоњци",
"J-Y22069" : "Расјани",
"J-Y22063" : "Угреновићи",
"J-Y22063" : "Усорци",
"J-Y166564" : "Хоти",
"I-A16413" : "Цеклињани-Горњаци",
"J-Y182188" : "Шкријељи"
}

Кратка видео демонстрација функционисања екстензије, на енглеском језику и без ове последње додате функционалности, доступна је на YouTube линку:

https://www.youtube.com/v/uNIfw4Tok8k

Навигација