Аутор Тема: Новинарски текстови о генетици  (Прочитано 348395 пута)

Ван мреже Ojler

  • Члан Управног одбора
  • Бели орао
  • *
  • Поруке: 5270
  • Y-DNK: I2-Y3120 Z17855>PH3414 Мириловићи
Одг: Новинарски текстови о генетици
« Одговор #1420 послато: Март 23, 2023, 12:31:06 поподне »
Додуше , кажу можда не конкретно њему, већ у тој његовој грани у пар колена уназад неко од комшија је био довољно досадан.

Да, између Лудвига и његовог претка Арнолда, који су на шеми представљени као носиоци различитих хаплогрупа, било је шест генерација:
http://www.lvbeethoven.com/Famille/FamilyTreeBeethoven.html
Kамене рабъ и госодинъ

Ван мреже ДушанВучко

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 7223
  • I2-Y250780, род Никшића, U5a2b мт-ДНК
Одг: Новинарски текстови о генетици
« Одговор #1421 послато: Март 24, 2023, 12:11:04 пре подне »
Без "инцидента" се не би прославило ни име линије, а могуће ни потомство "кривца" инцидента са неким другим именом и другим путевима које би понеле друге околности. Овде је музички свет на добитку и светска културна баштина :)

Ван мреже sbk

  • Почетник
  • **
  • Поруке: 38
Одг: Новинарски текстови о генетици
« Одговор #1422 послато: Март 30, 2023, 10:25:38 пре подне »
Ех, како то људи увек замишљају неке комшијске љубавне афере и доколицу, а ретко ко помисли да је могло да се ради и о силовању (у рату или миру), преко немогућности да се има пород па су се ко зна како довијали, па до једноставно "доводаца", да је мајка могла да доведе децу из првог брака (регистрованог или не) која су касније узела очево презиме.  Ко је направио мало веће породично стабло и истраживао, уз праве изворе (разговор са људима), зна о чему причам.

Што се тиче Бетовена, повукла ме радозналост да видим има ли његове генетике на Пореклу, не видим у табели ни I-Z139, нити I-FT396000...

Ван мреже сɣнце

  • Памтиша
  • ********
  • Поруке: 1674
  • I-A1328
Одг: Новинарски текстови о генетици
« Одговор #1423 послато: Март 30, 2023, 10:47:30 пре подне »
Што се тиче Бетовена...

Порука чисто за оне које ово занима: ово презиме се ваљано изговара "Бéт-Хóвен".  :)
Лијеп бит није лијеп се родит,
јербо љепоти може се научит;
а кад душом љепује человјек,
које вањско с тијем поредит?

Ван мреже CosicZ

  • Редакција СДНКП
  • Истраживач
  • ******
  • Поруке: 898
  • Ђурђевдан Y:I1>P109>FGC22045 Панчево
Одг: Новинарски текстови о генетици
« Одговор #1424 послато: Март 31, 2023, 06:29:01 пре подне »
Ех, како то људи увек замишљају неке комшијске љубавне афере и доколицу, а ретко ко помисли да је могло да се ради и о силовању (у рату или миру), преко немогућности да се има пород па су се ко зна како довијали, па до једноставно "доводаца", да је мајка могла да доведе децу из првог брака (регистрованог или не) која су касније узела очево презиме.  Ко је направио мало веће породично стабло и истраживао, уз праве изворе (разговор са људима), зна о чему причам.

Што се тиче Бетовена, повукла ме радозналост да видим има ли његове генетике на Пореклу, не видим у табели ни I-Z139, нити I-FT396000...
Блиске везе са Србима за сада нема, али могуће је да је словенског порекла, јер има рођака у Пољској и Словачкој ( ако нису они немачког порекла).
https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-FT396000/tree
https://www.yfull.com/tree/I-Y61915/

https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(23)00181-1
Цитат
Principal component analyses (PCAs) performed on the high-coverage Beethoven genome placed it among Europeans, clustering with modern Germans (Figures S1–S3). Testing for admixture among five global populations using ADMIXTURE22 revealed that Beethoven’s ancestry was >99% European (Figures S4 and S5). We assessed geographic clustering of ancestors of 665 FamilyTreeDNA customers who share long (≥6 cM) autosomal IBD segments with Beethoven and used a novel GGT method (STAR Methods) to analyze the place names documented in their genealogical records. We found strong geographic clustering of matches along the Rhine River and within present-day North Rhine-Westphalia in Germany (Figure 4; Methods S1L–S1O), largely consistent with the geographic distribution of the birthplaces of Beethoven’s German ancestors.23 We were unable to identify any shared ancestors with Beethoven among genealogical records for 30 customers with the longest shared IBD segments.


Цитат
Could there have been an error in Beethoven’s legal genealogy? We conclude against this possibility also, given the well-established paternal genealogy for Ludwig van Beethoven.23,60 With the exception of his father, Johann van Beethoven (ca. 1739–1792), each step in the patrilineage is documented in at least two different archival records, which were reviewed thoroughly on observing the mismatch. Moreover, the strong concordance between surname and Y chromosome haplogroup observed in historical Belgium,61 supporting the accuracy of local record-keeping, renders the mismatch very difficult to account for by genealogical error. The possibility that remains, therefore, is that an EPP event took place in one of the generations between Aert and Ludwig van Beethoven. In Western Europe over the last 400 years, such events were rare but did take place, at an average frequency of 1%–2% per generation.62 One Beethoven biographer63 has previously suggested, on circumstantial grounds, that Ludwig senior may not have been Johann van Beethoven’s biological father. Our genetic findings, however, do not allow us to favor any particular generation for the occurrence of an EPP event.

Такође и на https://dna-explained.com/2023/03/23/beethovens-dna-reveals-surprises-does-your-dna-match/ .

Ван мреже CosicZ

  • Редакција СДНКП
  • Истраживач
  • ******
  • Поруке: 898
  • Ђурђевдан Y:I1>P109>FGC22045 Панчево

Ван мреже НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Чињеницама против самоувереног незнања.

На мрежи Небо_Сав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 623
  • I-Y3120>I-PH908>I-BY93199
Одг: Новинарски текстови о генетици
« Одговор #1427 послато: Мај 09, 2023, 11:56:35 поподне »
https://www.politika.rs/scc/clanak/551736/beba-dnk

Рођена прва беба која има ДНК од три особе


ЛОНДОН – Након револуционарне лекарске процедуре вантелесне оплодње која има за циљ да спречи преношење неизлечивих наследних болести, у Великој Британији је рођена прва беба која има ДНК од три особе.

Пионирски подухват британских лекара, познат као третман донирања митохондрија, користи делове јајних ћелија здравих женских донора за зачеће ембриона поступком вештачке оплодње без штетних мутација које носе биолошке мајке и које би вероватно биле пренете на њихово потомство, пише Гардијан.


Ембрион се формира комбиновањем сперме и јајних ћелија биолошких родитеља са микро-структурама званим митохондрије из јајне ћелије донора, а новорођена беба као и након природне оплодње има ДНК од мајке и оца, плус малу количину генетског материјала, око 37 гена, од донора, јавља Танјуг.

Овај метод је назван „бебе са три родитеља”, иако више од 99,8 одсто бебине ДНК потиче од биолошке мајке и оца.

Људи наслеђују све своје митохондрије од мајке, тако да штетне мутације у митохондријским батеријама могу утицати на сву рођену децу.


За жене код којих постоји проблем са митохондријама, природно зачеће је често лутрија, наводи Гардијан.

Неке бебе могу бити рођене здраве јер ће наследити само мали део мутираних митохондрија, али друге могу да развију тешке, прогресивне и често фаталне болести, додаје лондонски дневник.

Истраживања су показала да је отприлике једна од 6.000 беба погођена митохондријалним поремећајима.

На мрежи Небо_Сав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 623
  • I-Y3120>I-PH908>I-BY93199
Одг: Новинарски текстови о генетици
« Одговор #1428 послато: Мај 18, 2023, 08:06:28 поподне »

https://www.nature.com/articles/d41586-023-01664-z?utm_source=Nature+Briefing&utm_campaign=2146693532-briefing-dy-20230518&utm_medium=email&utm_term=0_c9dfd39373-2146693532-45991618


18. Maj 2023.
Priča o evoluciji ljudi prepravljena novim podacima i računarskom snagom
Ljudi nisu potekli iz jednog regiona Afrike, sugeriše studija. Naprotiv, naši preci su se kretali i mešali hiljadama godina.

Savremeni ljudi su evoluirali širom Afrike, a ne samo iz jedne lokacije, otkrila je nova studija koja istražuje raznolikost ljudskog genoma.

Široko prihvaćena ideja da su savremeni ljudi potekli iz jednog regiona Afrike se preispituje modeliranjem koje je analiziralo ogromnu količinu genetskih podataka. Modeli ukazuju na to da su ljudi potekli iz više pradrevnih populacija širom kontinenta. Te drevne populacije - koje su živele pre više od milion godina - bi bile ista vrsta hominida ali genetski malo različite.

Modeli koji podržavaju ovu teoriju se oslanjaju na novi softver i podatke o sekvenciranju genoma iz trenutnih afričkih i evropskih populacija, kao i DNK neandertalaca. Istraživači su rezultate objavili 17. maja u Nature1.

Studija donosi više dokaza za ideju da "nema jednog mesta rođenja u Africi, i da je ljudska evolucija proces sa vrlo dubokim afričkim korenima", kaže Eleanor Scerri, evolucionarni arheolog na Max Planck institutu za geoantropologiju u Jeni, Nemačka.

Teorija o jednom mestu porekla je popularna već decenijama, i delimično se zasniva na fosilnim zapisima. Ali teorija ne odgovara dobro podacima, kaže Scerri. Alati i fizičke osobine koje se pripisuju Homo sapiensu se pojavljuju širom Afrike u slično vreme. Da su ljudi zračili iz jedne lokacije, arheolozi bi očekivali da vide novije fosile dalje od centralne tačke, a starije bliže njoj.

Praistorijsko stablo
Drevne vrste hominida, ili 'praistorijsko stablo', imale su lokalizovane populacije koje su se očigledno mešale tokom hiljada godina, deleći bilo kakve genetske razlike koje su se razvile. Takođe su se kretali po Africi tokom vremena. "Naši koreni leže u vrlo raznolikoj ukupnoj populaciji koja se sastoji od fragmentiranih lokalnih populacija", kaže Scerri. Preplitanje ovih

 stabala, samo slabije odvojenih genetikom, dovelo je do koncepta ljudske evolucije koji istraživači opisuju kao "slabo strukturirano stablo" - više nalik na zapetljanu lozu nego na 'stablo života'.

Dok ideja o više tačaka porekla nije nova, objašnjenje 'slabo strukturiranog stabla' jeste. Drugi modeli koji istražuju više tačaka porekla nisu koristili toliko parametara kao ova studija, kaže Brenna Henn, koautor studije i humani genetičar na Univerzitetu u Kaliforniji, Dejvis.

Tim je koristio softver koji je razvio koautor Simon Gravel sa McGill Univerziteta u Montrealu, Kanada, koji može da se nosi sa obimnom računarskom snagom potrebnom za prošireno modeliranje. Prethodni radovi su takođe bili nedostatni na genetskim podacima, fokusirajući se uglavnom na Zapadnu Afriku, što znači da se ogromna genetska raznolikost kontinenta nije uključivala. To je stvorilo nepotpunu sliku o tome kako su se preci savremenih ljudi mogli mešati i kretati kroz pejzaž, te su naučnici morali da prave više pretpostavki kako bi popunili praznine u znanju.

Genetski podaci
Najnovija studija je uključila sekvenciranje genoma iz postojećih istočnoafričkih i zapadnoafričkih populacija, kao i ljudi Nama sa juga Afrike. Ovaj raspon genetskih podataka pomogao je istraživačima da razumeju i prate istorijsko kretanje gena kroz generacije.

"Stvarno smo želeli da sednemo i vrlo sistematski evaluiramo modele na kreativniji način", kaže Henn. "To je novi model za ljudsku evoluciju koji je konkretno."

Modeli koriste varijable kao što su migracija i spajanje populacija da predvide protok gena tokom hiljada godina. Te predikcije se upoređuju sa genetskim varijacijama koje se vide danas kako bi se utvrdilo koji modeli najbolje odgovaraju podacima.

Jedno prethodno predloženo objašnjenje za današnju ljudsku raznolikost je da se H. sapiens mešao sa drugim arhaičnim ljudskim vrstama koje su se ogranale i postale izolovane. Ali Henn i kolege su otkrili da je model slabo strukturiranog stabla bolje pristajao, jasnije objašnjavajući varijacije koje se danas vide kod ljudi.

Na kraju, i dalje postoje brojna pitanja o poreklu ljudi. Henn

želi da doda više DNK iz drugih afričkih regiona u modele kako bi videla da li podaci menjaju njihove rezultate. Takođe se nada da će koristiti podatke kako bi predvidela fosilne zapise, na primer, predviđajući koje bi karakteristike mogli pronaći u ljudskim fosilima iz određenog područja.

doi: https://doi.org/10.1038/d41586-023-01664-z

Ван мреже Gorance

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 694
Одг: Новинарски текстови о генетици
« Одговор #1429 послато: Мај 19, 2023, 10:15:09 пре подне »
Знам да ћу звучати смешно,али мени ти милиони година звуче све мање вероватно. Зар нисмо од У хромозом Адама сви ,без сумње из Африке? :)

Ван мреже Ojler

  • Члан Управног одбора
  • Бели орао
  • *
  • Поруке: 5270
  • Y-DNK: I2-Y3120 Z17855>PH3414 Мириловићи
Одг: Новинарски текстови о генетици
« Одговор #1430 послато: Мај 19, 2023, 10:42:39 пре подне »
Знам да ћу звучати смешно,али мени ти милиони година звуче све мање вероватно. Зар нисмо од У хромозом Адама сви ,без сумње из Африке? :)

Адам Y-хромозом је само реконструкција изведена из модела Y филогенетичког стабла. Сасвим извесно нисмо сви од једне јединке потекли. Еволуција није "револуција", па да се може прецизно одредити генерација у којој једна врста постаје друга, нити постоји Први припадник неке врсте. Тако је и са Хомо сапијенсом.
Kамене рабъ и госодинъ

Ван мреже Кековац

  • Уредник СДНКП
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 482
  • I2-S25733>PH2670>Y200040
Одг: Новинарски текстови о генетици
« Одговор #1431 послато: Мај 19, 2023, 10:43:33 пре подне »
Знам да ћу звучати смешно,али мени ти милиони година звуче све мање вероватно. Зар нисмо од У хромозом Адама сви ,без сумње из Африке? :)

Тако се чини на основу тренутно доступних података али то није у супротности са резултатом овог рада, јер има и других хромозома, а не само Y. Чак и да је могуће да се израчуна TMRCA за сваки хромозом и да се он поклопи са израчунатим TMRCA за Y хромозом то не би било у супротности са предложеним моделом из рада. Да карикирам, сваки хромозом је могао да потекне из различите популације (подврсте људи) које су у исто бћвреме могле да живе у различитим регионима. У пракси је то мало компликованије код осталих хромозома због рекомбинације па тврдња не важи на нивоу хромозома као у случају Y хромозома, него на случају фрагмената.

Ван мреже Gorance

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 694
Одг: Новинарски текстови о генетици
« Одговор #1432 послато: Мај 19, 2023, 10:45:16 пре подне »
Адам Y-хромозом је само реконструкција изведена из модела Y филогенетичког стабла. Сасвим извесно нисмо сви од једне јединке потекли. Еволуција није "револуција", па да се може прецизно одредити генерација у којој једна врста постаје друга, нити постоји Први припадник неке врсте. Тако је и са Хомо сапијенсом.
Јасно је да је било више јединки, али сам мислио да је један од њих био ,,срећник" чије је потомство успело да преживи до данас.

Ван мреже Ojler

  • Члан Управног одбора
  • Бели орао
  • *
  • Поруке: 5270
  • Y-DNK: I2-Y3120 Z17855>PH3414 Мириловићи
Одг: Новинарски текстови о генетици
« Одговор #1433 послато: Мај 19, 2023, 10:58:56 пре подне »
Јасно је да је било више јединки, али сам мислио да је један од њих био ,,срећник" чије је потомство успело да преживи до данас.

Суштинско питање је дефинисати ко су "они", па се онда може разговарати о томе да ли сви потичемо од једног претка. Моје разумевање је да се тренутак када се за неку јединку може рећи да припада различитој врсти у односу на свог родитеља не може бинарно одредити.
Kамене рабъ и госодинъ

Ван мреже CosicZ

  • Редакција СДНКП
  • Истраживач
  • ******
  • Поруке: 898
  • Ђурђевдан Y:I1>P109>FGC22045 Панчево
Одг: Новинарски текстови о генетици
« Одговор #1434 послато: Јун 19, 2023, 07:20:11 пре подне »
Сви подаци које ће човечанство произвести до 2025 могли би стати у пинг-понг лоптицу ако би били записани у ДНК.
https://www.scientificamerican.com/article/dna-the-ultimate-data-storage-solution/
Цитат
In a world flooded with data, figuring out where and how to store it efficiently and inexpensively becomes a larger problem every day. One of the most exotic solutions might turn out to be one of the best: archiving information in DNA molecules.

The prevailing long-term cold-storage method, which dates from the 1950s, writes data to pizza-sized reels of magnetic tape. By comparison, DNA storage is potentially less expensive, more energy-efficient and longer lasting. Studies show that DNA properly encapsulated with a salt remains stable for decades at room temperature and should last much longer in the controlled environs of a data center. DNA doesn’t require maintenance, and files stored in DNA are easily copied for negligible cost.

Even better, DNA can archive a staggering amount of information in an almost inconceivably small volume. Consider this: humanity will generate an estimated 33 zettabytes of data by 2025—that’s 3.3 followed by 22 zeroes. DNA storage can squeeze all that information into a ping-pong ball, with room to spare. The 74 million million bytes of information in the Library of Congress could be crammed into a DNA archive the size of a poppy seed—6,000 times over. Split the seed in half, and you could store all of Facebook’s data.

Ван мреже Кековац

  • Уредник СДНКП
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 482
  • I2-S25733>PH2670>Y200040
Одг: Новинарски текстови о генетици
« Одговор #1435 послато: Јун 28, 2023, 12:27:26 поподне »
Археогенетска истраживања улазе у нову еру у којој је могуће секвенцирати генетски материјал древних људи чији земни остаци нису доступни али јесу предмети које су поседовали. Питам се да ли ћемо једног дана имати археогенетски обрађене узорке старих народа, као што су Стари Словени и Мези, који су практиковали спаљивање мртвих уместо скелетног сахрањивања захваљујући овој методи.

https://sveoarheologiji.com/naucnici-znaju-ko-je-nosio-ovaj-privezak-pre-25-000-godina-na-osnovu-drevne-dnk/

Ван мреже CosicZ

  • Редакција СДНКП
  • Истраживач
  • ******
  • Поруке: 898
  • Ђурђевдан Y:I1>P109>FGC22045 Панчево
Одг: Новинарски текстови о генетици
« Одговор #1436 послато: Јун 28, 2023, 10:53:45 поподне »
Може и овако:
https://www.npr.org/2023/01/12/1148810057/extracting-dna-from-neanderthal-urine-and-other-breakthrough-technologies-of-the
Цитат
KELLY: So much as I would love to get through all 10 of these, I'm going to try to zoom in on just a few of the ones that surprised me. And I will start with that Neanderthal DNA that I mentioned. Tell us about the emerging field of paleogenetics.

NORDRUM: Sure. This is a field of science that has really been growing for the last decade or so, and it's all about using ancient DNA to investigate early humans and related species and just help us better understand our origins. And what's really changed here, recently, is that scientists have become a lot better at processing and preparing ancient DNA to be analyzed. It makes it easier and more legible for sequencing machines, and they've created new kinds of machines that are more specialized for handling this kind of DNA, which can sometimes be really damaged. And they've gotten so good at this that they can now extract human DNA from samples of dirt just taken from archaeological sites. They don't even need a bone or a tooth to learn about the people who lived there.

KELLY: The detail that blew my mind is you can extract DNA from dirt that contains Neanderthal pee - urine. I mean, that's - it's mind-blowing.

NORDRUM: That's right. It's incredible. It's not just human DNA, either. Researchers have now been able to sequence DNA that was more than a million years old that came from a mammoth and also DNA from fish and plants that was more than 2 million years old.

KELLY: This is fascinating, in and of itself. But what might this tell us about ourselves, about humans today?

NORDRUM: Well, there's lots of things. Using these techniques, scientists have discovered two extinct species of humans that we didn't know existed before these techniques were available. And there's lots of things, as well, that it can tell us about early ecosystems. When we're learning about these ancient plants and animals that lived together, you can really get a picture of what an entire ecosystem looked like and also how it's evolved since that time.

https://www.theguardian.com/science/2021/may/16/tiny-traces-of-dna-found-in-cave-dust-may-unlock-secret-life-of-neanderthals
Цитат
The discovery is the first important demonstration of a powerful new technique that allows researchers to study DNA recovered from cave sediments. No fossils or stone tools are needed for such studies. Instead, minuscule traces of genetic material that have accumulated in the dust of a cavern floor are employed to reveal ancient secrets.

Targets for future cave dirt DNA analyses include studies of the Denisovans, a mysterious species of early humans who lived in east Asia tens of thousands of years ago. By studying sediments in caves and other sites in India, China and other parts of Asia, scientists could discover how widely the species spread before becoming extinct.

The technique could also help researchers shed new light on Homo floresiensis, the small-bodied “Hobbit” people who lived in Indonesia more than 50,000 years ago, but who left only a meagre collection of remains. In addition, it could be used to pinpoint the exact timing of the exodus of modern humans from Africa and their entry into Europe tens of millennia in the past.

In each case, current studies have been frustrated by a lack of hard evidence, an issue that does not affect cave dirt DNA analysis. Developed by scientists based at Germany’s Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology four years ago, the technique’s usefulness was demonstrated in a “proof of concept” paper published in the journal Science in 2017. Scientists revealed they could identify Neanderthal DNA among all the other scraps of genetic material left behind in caves.

Now the team have taken the technology to a new level by studying the exact genetic identity of Neanderthals who once lived in the cave Galería de las Estatuas – or the Gallery of Statues – in northern Spain. Results were again published in Science.

“Galería de las Estatuas is a well-studied cave in which we have clear evidence of Neanderthals having lived there for tens of thousands of years,” said Max Planck researcher Benjamin Vernot, who led the investigation. “We don’t think they buried their dead there but we do believe they may have butchered meat there. Occasionally, they would have cut themselves and would have bled on the cave floor. Similarly, their babies would have deposited excrement there and so left their DNA behind.”

The key point about Galería de las Estatuas is that it has been studied very carefully by palaeontologists and archaeologists so that each layer of cave sediment has been analysed and dated precisely. “That means we could put an exact date to the samples of DNA that we found in each layer,” said Vernot. And that led to an unexpected discovery. The team found that, about 100,000 years ago, the population who had been living in the cave for millennia were replaced by a completely different group of Neanderthal people.

“It was as if a modern human population of Europeans had been replaced by East Asians,” said Vernot. “However, we have no idea whether this was a violent replacement or a relatively slow process.”

However, Vernot pointed out that at around this time Earth experienced a significant change in climate when weather systems cooled. “It could be that the first population could not tolerate or survive the cold in the area surrounding Galería de las Estatuas and died out or decided to leave. Later, when the weather improved, a new population – with a different genetic signature – moved in,” added Vernot.

Ван мреже CosicZ

  • Редакција СДНКП
  • Истраживач
  • ******
  • Поруке: 898
  • Ђурђевдан Y:I1>P109>FGC22045 Панчево
Одг: Новинарски текстови о генетици
« Одговор #1437 послато: Јул 19, 2023, 11:55:09 поподне »
https://www.sci.news/genetics/grapevine-origin-domestication-11764.html
Цитат
“Grapevine is among the world’s oldest crops,” said Professor Peter Nick, a researcher in the Joseph-Gottlieb Kölreuter Institut for Plant Sciences at the Karlsruhe Institute of Technology, and his colleagues.

“Wine was one of the oldest products traded all around the world. It pushed the exchange of cultures, ideas, and religions.”

“At the end of the Ice Age, grapevine originated from the European wild vine, of which only a few relic populations have survived to date.”

“One of these populations can be found on the Ketsch peninsula between Karlsruhe and Mannheim.”

So far, the traces of when and where exactly wild vines were domesticated, of whether grapes for wine production and table grapes have the same origin, and how thousands of vines developed have been hidden in the mist of the prehistoric era.

Still, it is clear that grapevine survived partly drastic climate changes and gathered a number of genes from Asia as a result of early human migration movements.

“For some years now, it has been known that today’s Silk Road once was a wine road,” Professor Nick said.

“The Chinese symbol for alcohol is derived from Georgian wine jugs, so-called Qevri.”

In their research, Professor Nick and co-authors analyzed DNA samples of 3,525 vines, including more than 1,000 wild species, from around the world.

They then generated the most detailed model of the evolution and domestication of grapevines so far.

“Now, the origin of winegrowing (viticulture) can be dated back to earlier than 11,000 BCE in the South Caucasus,” they said.

“This means that wine is older than bread. Winegrowing technology very quickly spread across the Mediterranean to the west.”

“Within shortest terms, cross-breeding with local wild vines produced a large variety of vines that were reproduced using cuttings.”

“About 7,000 years ago in the Middle East, large-berry species developed to table vines.”

“Domestication was accompanied by climatic changes, i.e. the end of the Ice Age, as well as by the warm and moist Atlantic, a climate period between 8000 and 4000 BCE.”

“The resulting human migration movements left their traces in the genome of the vines.”

“Medieval vines in Southwest Germany, for instance, contain genes of vines from Azerbaijan and Central Asia.”

Yang Dong et al. 2023. Dual domestications and origin of traits in grapevine evolution. Science 379 (6635): 892-901; doi: 10.1126/science.add8655


https://www.sci.news/archaeology/denisova-cave-pendant-dna-11888.html
Цитат
Scientists Extract Human and Deer DNA from Paleolithic Pendant Found in Denisova Cave

Application of a novel non-destructive DNA extraction method to a Paleolithic deer tooth pendant from Denisova Cave, Siberia, resulted in the recovery of ancient human and deer genomes, which allowed researchers to estimate the age of the pendant at approximately 19,000-25,000 years. DNA analysis identifies the presumed maker or wearer of the pendant as a female individual with strong genetic affinities to a group of Ancient North Eurasian individuals who lived around the same time but were previously found only further east in Siberia.

Objects made from animal bones or teeth are particularly promising, because they are porous and therefore allow penetration of DNA-containing fluids, such as sweat, blood or saliva, which can be used to infer the makers or users of such objects.

However, DNA extraction from ancient skeletal material can be destructive or can alter the specimens, or risks alteration of specimens submerged in extraction buffer solutions, making it difficult to link these objects to specific human individuals.

“The surface structure of Paleolithic bone and tooth artifacts provides important information about their production and use,” said Dr. Marie Soressi, an archaeologist at the University of Leide.

“Therefore, preserving the integrity of the artifacts, including microstructures on their surface, was a top priority.”

Dr. Soressi and her colleagues developed a non-destructive DNA extraction method, in which the objects were submerged in a sodium phosphate buffer while gradually increasing the temperature.

DNA trapped in ancient bone and tooth artifacts is released into the solution and enables further sequencing and analysis.

“One could say we have created a washing machine for ancient artifacts within our clean lab,” said Dr. Elena Essel, a researcher at the Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology.

“By washing the artifacts at temperatures of up to 90 degrees Celsius, we are able to extract DNA from the wash waters, while keeping the artifacts intact.”

The researchers applied this new method to a deer tooth pendant from Denisova Cave and managed to recover DNA of a wapiti (species of elk) and an ancient human.

The authors conclude that their works show the potential of ancient artifacts as a previously untapped source of ancient human DNA that can directly link genetic and cultural information.

They also suggest that archaeologists apply protocols for minimizing handling during and after excavation, as surface DNA contamination can hamper these analyses.

“Forensic scientists will not be surprised that human DNA can be isolated from an object that has been handled a lot, but it is amazing that this is still possible after 20,000 years,” said Dr. Matthias Meyer, a geneticist at the Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology.

E. Essel et al. Ancient human DNA recovered from a Palaeolithic pendant. Nature, published online May 3, 2023; doi: 10.1038/s41586-023-06035-2

Ван мреже CosicZ

  • Редакција СДНКП
  • Истраживач
  • ******
  • Поруке: 898
  • Ђурђевдан Y:I1>P109>FGC22045 Панчево
Одг: Новинарски текстови о генетици
« Одговор #1438 послато: Јул 20, 2023, 01:42:08 пре подне »
Овај чланак је о некој "биолошкој истини", а не о генетици, али помиње динарску I2a и словенску R1a хаплогрупу.
https://pressmediabih.com/vijesti/2023/19/07/dr-kemal-dizdarevic-od-svih-nasih-hrvati-iz-hrvatske-su-najvise-slaveni-dok-su-bosnjaci-iz-bosne-i-srbi-iz-srbije-najmanje/#

На мрежи Небо_Сав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 623
  • I-Y3120>I-PH908>I-BY93199
Одг: Новинарски текстови о генетици
« Одговор #1439 послато: Август 24, 2023, 09:09:36 поподне »
https://rts.rs/magazin/nauka/5260290/y-hromozom-ljudski-referentni-genom.html

Цитат
Научници коначно успели да секвенцирају последњи део људског генома: Y хромозом

Прошле године, научници су први пут успели да израде најкомплетнију секвенцу људског генома без икаквих празнина – али јој је недостајао један мали део: Y хромозом. Сада је најмањи члан породице људских хромозома у потпуности секвенциран и решена загонетка за коју су биле потребне три деценије да буде решена.

Сада коначно имамом свеобухватан референтан људски геном који можда садржи и тајну о мушкој плодности.

„Сада када имамо ову 100 посто комплетну секвенцу Y хромозома, можемо да идентификујемо и истажимо бројне генетске варијације које би могле да утичу на људске особине и болести на начин на који раније нисмо могли“, наглашава Дилан Тејлор, генетичар са Универзитета Џон Хопкинс и један од аутора студије.

Y хромозом садржи много секвенци које се понављају – укључујући неколико дугих палиндрома – који су га до сада чиниле углавном „нечитљивим“.

Предвођен геномичарем Арангом Риом из америчког Националног института за истраживање људског генома, конзорцијума који је прикладно назван Telomere-to-Telomere користио је напредне технике секвенцирања и новоразвијене биоинформатичке алгоритме да споје дугачке делове ДНК, коначно мапирајући Y хромозом у потпуности.

„Знали смо да до сада имамо непотпуну слику“, каже биоинформатичар са Универзитета Џон Хопкинс, Раџив Мекој, што је можда сувише блага оцена, с обзиром на то да је у скици Y хромозома недостајало више од половине његових база.

Те празнине, од којих су многе обухватале гене који се односе на производњу сперме, довели су до разних врста нетачних претпоставки које су направљене у другим студијама. За неке раније непознате људске Y секвенце се, на пример, погрешно сматрало да су трагови узорака који контаминирају бактеријску ДНК.

„Али сада први пут можемо да видимо цео геном од почетка до краја", истиче Мекој.

Сада имамо комплетан геном од почетка до краја
Сада имамо комплетан геном од почетка до краја
Тим је попунио више од 30 милиона „слова“ у ДНК секвенци да би саставио Y хромозом у целости: свих 62.460.029 парова база. Такође су исправили вишеструке грешке у претходно секвенцираним деловима и открили 41 нови ген који кодира протеине.

„Највеће изненађење је колико су поновљене секвенце организоване“, истиче информатичар Адам Филипи, са америчког Националног института за истраживање људског генома.

„Скоро половина хромозома је направљена од наизменичних блокова две специфичне понављајуће секвенце познате као сателитска ДНК. Прави прелепу шару налик на пачворк.“

У другој студији коју је водио генетичар Пиле Халаст из лабораторије Џексон, истраживачи су отишли корак даље, користећи референтну секвенцу за састављање људских Y хромозома од 43 мушкарца, од којих је половина представљала афричку линију.

Заједно, скупови су обухватали 183.000 година људске еволуције и открили неке изненађујуће варијације у Y хромозому.

Као прво, Y хромозоми су били веома различитих величина, у распону од 45,2 милиона до 84,9 милиона парова база у дужини.

Постојале су и упадљиве структурне разлике: прецизне секвенце гена су биле очуване (тако да су и даље кодирали праве протеине), али су понекад већи делови ДНК били окренути, оријентисани у супротном смеру дуж Y хромозома.

„Када пронађете варијацију коју раније нисте видели, увек се понадате да ће те геномске варијанте бити важне за разумевање људског здравља“, напомиње Филипи.

Сада имамо сва „слова“ људског генома
Сада имамо сва „слова“ људског генома
До скора се знало да су гени на Y хромозому били укључени у агресивне облике уобичајених карцинома код мушкараца, као и да губитак Y хромозома покреће раст карцинома бешике. Али није се знало шта све није уочено.

Нова ера персонализоване медицине све је ближа што технологија секвенцирања више напредује, омогућавајући да се цели геноми – а не само одабрани делови – јефтино секвенцирају.

Али секвенцирање генома могло би погоршати диспаритете у здравству ако се не реше историјске неправде и недостатак већег и разноврснијег броја узорака у истраживачким студијама.

„На крају, како комплетно, тачно и без празнина састављање диплоидних људских генома постане рутинско, очекујемо да ће 'референтни геноми' постати познати једноставно као 'геноми'", закључују истраживачи.

Студије су објављене у часопису Nature.