Аутор Тема: Dante Labs  (Прочитано 108406 пута)

Ван мреже ak

  • Шегрт
  • ***
  • Поруке: 68
Одг: Dante Labs
« Одговор #780 послато: Април 15, 2023, 02:15:45 поподне »
Taj famozni BAM VCF fajl...

kolika je sada velicina, da li je uvijek priblizno ista, kojeg je reda MG, GB

da li je to velicina zipovanog fajla ili plain?

ako je plain, kolika bude velicina ako se kompresuje/zipuje
« Последња измена: Април 15, 2023, 02:20:56 поподне ak »

Ван мреже ak

  • Шегрт
  • ***
  • Поруке: 68
Одг: Dante Labs
« Одговор #781 послато: Април 15, 2023, 02:18:54 поподне »
Taj famozni BAM VCF fajl...

da li u 2023/APR i dalje ima tih nedoumica oko tog nekog output formata v19 i v38, da li je to sada standardizovano na v38, da se covjek ne zamara da im salje mail oko promjene

u slucaju da je default v19, koliko je fleksibilno za kasnije i koji je scenario

npr da li kada se jednom preda Yfull-u fajl moze se kasnije opet slati i da li se u tom slucaju ponovo placa sekvenciranje

 
« Последња измена: Април 15, 2023, 02:21:27 поподне ak »

Ван мреже ak

  • Шегрт
  • ***
  • Поруке: 68
Одг: Dante Labs
« Одговор #782 послато: Април 15, 2023, 02:31:52 поподне »

Taj famozni BAM VCF fajl...

spominjali su neki clanovi da je za ekstrakciju .bam iz .vcf moguce koristiti neke alate, eh sad nema svako 1TB disk i 32GB RAM-a, meni je naumpadalo da se renta masina na nekom provideru aws, azure itd ali haj reko da vidim

https://www.google.com/search?q=extract+wgs+bam+file+on+aws+ec2
 

https://genomedad.com/tag/ec2/

da neko nije probao?

Ван мреже ak

  • Шегрт
  • ***
  • Поруке: 68
Одг: Dante Labs
« Одговор #783 послато: Април 15, 2023, 02:41:38 поподне »
Има на овој теми укратко
https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=6887.msg177351#msg177351

Наравно,прелистајте и ову тему.

listao pola dana :D uglavnom prica oko posiljki u Srbiju, sreca nisam imao taj problem, inace moglo bi se ovo najnovije agregirano nekako pinovati da ima sve ukratko, kao neki FAQ

Ван мреже Неродимац

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 627
Одг: Dante Labs
« Одговор #784 послато: Април 24, 2023, 12:56:19 поподне »
Да ли је некоме стигао резултат од Dantea још од прошлогодишњег наручивања?

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5486
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: Dante Labs
« Одговор #785 послато: Април 24, 2023, 01:39:20 поподне »
Да ли је некоме стигао резултат од Dantea још од прошлогодишњег наручивања?

Ја знам за три која већ три месеца чекају у чекаоници за секвенцирање...

Ван мреже ak

  • Шегрт
  • ***
  • Поруке: 68
Одг: Dante Labs
« Одговор #786 послато: Април 24, 2023, 01:41:06 поподне »
Nema ni kod mene jos nista... Mada ja sam ovo nedavno...

Ван мреже Grbić

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 220
  • R1A>BY149000>FTA3227
Одг: Dante Labs
« Одговор #787 послато: Април 24, 2023, 01:55:46 поподне »
Да ли је некоме стигао резултат од Dantea још од прошлогодишњег наручивања?
Ne,čekam dva iz Novembra.Izvinjavaju se,kažu da su u gužvi i nude neke medicinske rezultate gratis.

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5486
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: Dante Labs
« Одговор #788 послато: Април 25, 2023, 01:59:55 поподне »
Ne,čekam dva iz Novembra.Izvinjavaju se,kažu da su u gužvi i nude neke medicinske rezultate gratis.

Изгледа да се ради о генерисаној поруци, коју свима шаљу,  који их контактирају. Исто је стигло и овој тројици које сам споменуо.

Ван мреже Tracer

  • Гост
  • *
  • Поруке: 12
Одг: Dante Labs
« Одговор #789 послато: Мај 05, 2023, 04:02:26 поподне »
Битно је да они све време рекламирају нове попусте и примају нове узорке. Ми нека чекамо годину дана, ко нас шиша...  ;D

Ван мреже Ojler

  • Члан Управног одбора
  • Бели орао
  • *
  • Поруке: 5314
  • Y-DNK: I2-Y3120 Z17855>PH3414 Мириловићи
Одг: Dante Labs
« Одговор #790 послато: Мај 05, 2023, 04:58:07 поподне »
Битно је да они све време рекламирају нове попусте и примају нове узорке. Ми нека чекамо годину дана, ко нас шиша...  ;D

Па мора од нечега да се живи, а ви сте своје већ платили :)
Тако су и Језда и Дафина радили док није ђаво дошао по своје.
Kамене рабъ и госодинъ

Ван мреже ДушанПан

  • Члан Друштва
  • Помоћник
  • *****
  • Поруке: 129
  • Панић - Сирдија, Осечина I2-PH908
Одг: Dante Labs
« Одговор #791 послато: Мај 09, 2023, 05:03:38 поподне »
Из чисте радозналости посладох им мејл прошле недеље. Данас су одговорили:

We appreciate that you are concerned about the waiting time as you read about other customers' experiences. The company is dealing with an unprecedented situation at the moment, so the turnaround time of 8 weeks may not be adhered to. ​
The company is working very hard on resolving the current situation, but it may take some time to clear the backlog completely.

Hope this answers your questions.
​Best regards
​Dante Labs Customer Support Team

Ван мреже Неродимац

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 627
Одг: Dante Labs
« Одговор #792 послато: Мај 13, 2023, 09:20:34 поподне »
Видео сам више нових тестираних који су радили тест код Danta па проверите налоге ви који чекате можда има нешто 😀

Ван мреже ak

  • Шегрт
  • ***
  • Поруке: 68
Одг: Dante Labs
« Одговор #793 послато: Мај 16, 2023, 08:14:47 поподне »
Видео сам више нових тестираних који су радили тест код Danta па проверите налоге ви који чекате можда има нешто
Valjda ce javiti na mail?

Ван мреже Неродимац

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 627
Одг: Dante Labs
« Одговор #794 послато: Мај 16, 2023, 08:17:51 поподне »
Valjda ce javiti na mail?

У сваком случају проверите налог. Мени нису јавили када ми се завршила анализа тако да проверите.

Ван мреже ak

  • Шегрт
  • ***
  • Поруке: 68
Одг: Dante Labs
« Одговор #795 послато: Мај 16, 2023, 08:20:59 поподне »
У сваком случају проверите налог. Мени нису јавили када ми се завршила анализа тако да проверите.
Nazalost

Awaiting Quality Control Inspection (QC)

We have received your kit and are readying it for quality control. Once your kit has passed QC we will process your sample. If your kit does not pass QC, we will send you a new kit free of charge.


Ван мреже ak

  • Шегрт
  • ***
  • Поруке: 68
Одг: Dante Labs
« Одговор #796 послато: Мај 16, 2023, 08:23:04 поподне »
Mada, tek je mjesec dana od kad su zaprimili uzorak

Ван мреже НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8529
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Dante Labs
« Одговор #797 послато: Мај 25, 2023, 06:30:57 поподне »
Лепе вести за људе који су своје узорке за тест целог генома код Дантеа послали преко Српског ДНК пројекта. Ових дана је стигла потврда за већи број њих да су прошли контролу квалитета (QC) и да се почело са њиховим секвенцирањем. Навешћу овде списак кандидата за које је стигла потврда:

1. Јањатовић, Ђурђевдан, Сомбор, I1-P109>FGC22061, род Дробњака
2. Вујовић, Петковдан, Ново Село, Даниловград, L1b-M349, род Доброгорана
3. Живковић, Цвети, Радијевићи, Нова Варош, непозната ХГ
4. Чокић, Ђурђиц, Ковачевац, Младеновац, R1b-U106>FT73970
5. Даниловић, Никољдан, Београд (даљим пореклом из Полога у МКД), непозната ХГ
6. Дабижљевић, Јовањдан, Дрсник, Клина, резултат ХГ из нејавног истраживања
7. Тошић, Никољдан, Бела Паланка, I1-Z63>FGC9549
8. Бодрожић, Стевањдан, Кољане, Врлика, R1b-Y13200>BY15590
9. Новаковић, Ђурђевдан, Маовице, Врлика, R1a-Y2608>BY68536
10. Стојсављевић, Аранђеловдан, Отишић, Врлика, E-V13>Z16988
11. Приметица, Никољдан, Маовице, Врлика, R1a-Z280>YP4278
12. Стричевић, Ђурђевдан, Кољане, Врлика, I2-PH908
13. Масларић, Јовањдан, Добрња, Бања Лука, J2a-L70
14. Ковачевић, Јовањдан, Ивањска, Босанска Крупа, J2a-S8230>Y230579*
15. Трифуновић, Ђурђевдан, Речице, Пожега, I1-P109>FGC22061, род Дробњака
16. Јовић, Никољдан, Драгнић Подови, Шипово, N2-Y7310>FT182494
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Ивица Јовановић

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 909
  • J-L70 > J-Z40772* mdDNA:HV-b15a
Одг: Dante Labs
« Одговор #798 послато: Мај 25, 2023, 06:54:18 поподне »
за мене је ође 13 срећан број
Милутин Бранковић, 4. ескадрон Коњичке дивизије. Крф 26.04.1916.
Сава Питић, 13. Пук. Острво Видo 24.01.1916.
Сима Мијуцић, 9. пешадијски пук. Браунау 1917.

Ван мреже Глигорија

  • Члан Друштва
  • Почетник
  • *****
  • Поруке: 47
Одг: Dante Labs
« Одговор #799 послато: Мај 25, 2023, 07:28:33 поподне »
Није искључено да је тај бр.13 пореклом из Горе....