IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике

[Exiled]

Има једна ствар која ме мало баца у недоумицу мада није толико ни круцијална но да је поменем,можда неко има слично искуство. Наиме, код једне компаније имам 10.5 цМ са Војнић Пурчарем а код друге компаније имам 12.5 цМ са Војнич Хајдуком. Питање је да ли ових 2.5 цМ можемо приписати компанијским мерилима или ово може бти разлика у евентуално једном снипу? Да напоменем да генерално са Војнићима сам на око 900 година, по Yfull процени.

[Небојша]

Србин, отац Херцеговина, мајка Црна Гора


Србин, отац Дувно, мајка Куршумлија


Српкиња, Бања Лука


Србин, отац околина Прњавора, мајка Сарајевска регија


Србин, Котор Варош


Србин из Лике


Српкиња из Црне Горе (Црмница)


Српкиња из југоисточне Србије (јабланички и топлички округ)



Код Срба који имају прекодринске корене, често се срећу јача аутосомална поклапања на простору Западне Србије. И даље је доста интересантно да се и поред солидне покривености, Србима на мапи појављују пре Румунија и Грчка, него Албанија и Македонија. Ту углавном постоји једна аутосомална рупа. Вероватно јесте до узорка, пошто видим да се и Албанцима те области слабо јављају.

[Никац]

Има једна ствар која ме мало баца у недоумицу мада није толико ни круцијална но да је поменем,можда неко има слично искуство. Наиме, код једне компаније имам 10.5 цМ са Војнић Пурчарем а код друге компаније имам 12.5 цМ са Војнич Хајдуком. Питање је да ли ових 2.5 цМ можемо приписати компанијским мерилима или ово може бти разлика у евентуално једном снипу? Да напоменем да генерално са Војнићима сам на око 900 година, по Yfull процени.

аутосомална ДНК је јако нестабилна. веза родитељ-дијете може бити било која вриједност између 3330 и 3720 центиморгана:

https://www.yourdnaguide.com/scp

10-12 може стварно бити свашта. у овој конкретној ситуацији највјеровтаније сегмент заједничког претка тебе и ова два војнића који је остао очуван код све тројице.

да ли се поклапање с обојицом налази на истој позицији и хромозому?

[Никац]

Код Срба који имају прекодринске корене, често се срећу јача аутосомална поклапања на простору Западне Србије. И даље је доста интересантно да се и поред солидне покривености, Србима на мапи појављују пре Румунија и Грчка, него Албанија и Македонија. Ту углавном постоји једна аутосомална рупа. Вероватно јесте до узорка, пошто видим да се и Албанцима те области слабо јављају.

Мислим да је комбинација малог узорка, и тога што су подијелили Албанију, Македонију и ЦГ на премалене регије, поготово Македонију.

Поставићу касније резултате са MyHeritage , гдје 99% Срба добива везу са ЦГ, а са Бугарском и Румунијом готово нико.

Чини се 23andme да детектира неке везе из средњег вијека (Румунија, Пелопонез), а пропушта неке скорије (Црна Гора)

[Exiled]

аутосомална ДНК је јако нестабилна. веза родитељ-дијете може бити било која вриједност између 3330 и 3720 центиморгана:

https://www.yourdnaguide.com/scp

10-12 може стварно бити свашта. у овој конкретној ситуацији највјеровтаније сегмент заједничког претка тебе и ова два војнића који је остао очуван код све тројице.

да ли се поклапање с обојицом налази на истој позицији и хромозому?

То нисам  покушавао да проверим него сам узео као готову ствар по мушкој линији јер је то предањска ствар код Војнића,ради се само о шпиц надимку. У принципу сам и то мислио да нема велике важности. Можда би се могла извући нека математика пошто са стричевом унуком, од нјегове ћерке, делим 46 цМ и онда покушавам да направим слику од пре 900 година до данашњих дана. Да се разумемо, добро знам да је АС главобоља али се некако надам да може да искрсне нешто.

[Exiled]

Мислим да је комбинација малог узорка, и тога што су подијелили Албанију, Македонију и ЦГ на премалене регије, поготово Македонију.

Поставићу касније резултате са MyHeritage , гдје 99% Срба добива везу са ЦГ, а са Бугарском и Румунијом готово нико.

Чини се 23andme да детектира неке везе из средњег вијека (Румунија, Пелопонез), а пропушта неке скорије (Црна Гора)

А про по постотака, добијам више аутосомала у Хрватској него у Србији,Цг,и БиХ, заједно. Имота ме закла али немам прођу у комуникацији, игнор тотални. Додуше и прађедовска линија по баби  и по деди ми је блиска бунјевачким родовима и ту ми се стварају шумови...јако тешко за распетљати.

[Никац]

На MyHeritage постоје 3 IBD кластера које добива 90% тестираних Срба:

општи јужнословенски:


Херцеговина, Црна гора, Западна Србија и Источна Босна, тј. Цвијићева динарска миграциона струја:


крајишки (добивају га и Срби из подручја далеко од Крајине)


ови су нешто рјеђи:

Црногорски кластер, поклапа се са Зетско-Рашким дијалектом, добивају га сви Црногорци, али и Срби из централне и западне Србије.


кластер муслимана Санџаклија, добивају га и неки Срби из тог подручја:


кластер Срба из Средње Босне. добивају га и Срби из Западне Србије, Срема, Славоније:

[Ивица Јовановић]

Није лоше. Само овај општи јужнословенски кластер има неку јаку тачку тамо у Румунији где на једном широком простору живи 75% Мађара.

[Никац]

Није лоше. Само овај општи јужнословенски кластер има неку јаку тачку тамо у Румунији где на једном широком простору живи 75% Мађара.

нема ту чврстих граница, имају и ови остали кластери неке насумичне концентрације по Европи, али је јасно која је главна скупина на коју се односе.

Иначе са Секељима и имамо неких веза, рецимо преко хаплогрупе N, па и неких грана I2 и R1а.

[Никац]

Покушао сам међу својим поклапањима пронаћи неке Србе који добивају Румунски, Бугарски или Грчки кластер, као што је случај за већину тестираних Срба на 23andme.

На MyHeritage је изгледа то доста рјеђи случај.

Румунију сам нашао да добивају, нпр. један Влах из источне Србије, Пироћанка, Војвођани из Баната и Срема.

Грчку добивају углавном они Срби који имају неку везу с Македонијом, обично заједно с Македонским кластером.

Бугарску нема скоро па нико међу мојим поклапањима.

Албанске кластере добивају Срби из зетско-рашке зоне, али и Војвођани.

Примијетио сам и неке западноевропске кластере (Италија, Аустрија, Њемачка), чега нема код 23andme. Опет најчешће код Војвођана, али зна се појавити и код тестираних из Шумадије или Босне.

[НикПав]

Покушао сам међу својим поклапањима пронаћи неке Србе који добивају Румунски, Бугарски или Грчки кластер, као што је случај за већину тестираних Срба на 23andme.

На MyHeritage је изгледа то доста рјеђи случај.

Код мене сви (сем бабе по оцу) имамо Румунију,
Грчку су добиле обе бабе и тетка по оцу, Бугарску само тетка по мајци а њени родитељи јок, а баба по мајци је добила Фландрију и западну Украјину, Молдавију и СИ Румунију, што су две групе које никад нисам срео код наших и Бугара.

[Gorance]

Код мене сви (сем бабе по оцу) имамо Румунију,
Грчку су добиле обе бабе и тетка по оцу, Бугарску само тетка по мајци а њени родитељи јок, а баба по мајци је добила Фландрију и западну Украјину, Молдавију и СИ Румунију, што су две групе које никад нисам срео код наших и Бугара.

Какав Oktoberfest. Шалим се,наравно. И мене чека Autosomal i mtdk, кад дође време.

[Никац]

Код мене сви (сем бабе по оцу) имамо Румунију,
Грчку су добиле обе бабе и тетка по оцу, Бугарску само тетка по мајци а њени родитељи јок, а баба по мајци је добила Фландрију и западну Украјину, Молдавију и СИ Румунију, што су две групе које никад нисам срео код наших и Бугара.

Они су сви из јужне Србије?
Видим Молдавију и Румунију код неких својих поклапања. Мислим да је та повезница преко Влаха/Румуна, евентуално српских исељеника у Новорусију.

[НикПав]

Они су сви из јужне Србије?
Видим Молдавију и Румунију код неких својих поклапања. Мислим да је та повезница преко Влаха/Румуна, евентуално српских исељеника у Новорусију.

Нису сви, само ми је мајчина страна одоздо, очева је из Шумадије.

[НикПав]

Какав Oktoberfest. Шалим се,наравно. И мене чека Autosomal i mtdk, кад дође време.

Имајући у виду моју подграну и подграну мајчиног оца, ништа ме не изненађује, али ме јако нервира што не могу да докучим шта је тачно у питању и што морам да сарађујем са више балканских ДНК пројеката, а то расплињавање на разне стране ме јако замара  Верујем да кад бих тестирао и фамилије мојих баба, прабаба и чукунбаба тек би била луда кућа.

[НикПав]

Гледајући већину калкулатора базираних на Г25 координатама, сваки купи неко наслеђе са Блиског истока или Јемена и Саудијске Арабије.

Главни и један насумично изабран:




Target: nikola_scaled
Distance: 3.3390% / 0.03338988
47.0 Southern_European
45.6 Eastern_European
7.4 Arab_Egyptian_Levantine

Код мене та аутосомална поклапања заиста постоје. Са Блиског Истока и даље на исток.
А риђији сам (где је било риђе по бради, а имао сам наранџасте делове браде, сада је седо), остало се држи и светлији сам од већине овде, вероватно, са све овим очима 

[Никац]

Број мојих поклапања по држави (непотпуна листа), скалиран с бројем становника, бројем дијаспоре (јер се више тестирају), и ГДП-ом сваке државе:

Croatia	3.05093644574076
BosniaHerzegovina	2.84937339025858
Serbia	2.28564894273697
Montenegro	1.07428815016343
Macedonia	0.965881050650002
Albania	0.957147511998648
Romania	0.822891470749909
Austria	0.777032420247396
Bulgaria	0.765300313229185
Greece	0.756937718175148
Hungary	0.693903742541354
Slovenia	0.635093848752547
Ukraine	0.584002646546144
Czechia	0.572618340666156
Italy	0.52395144328516
Poland	0.433598938443894
Turkey	0.360303760634958
Russia	0.2236575390897
Germany	0.216861491366398

Аустрија је на високој позицији због великог броја Срба или Хрвата који су као предачку локацију поставили Аустријско Царство или Аустроугарску. Све остало има смисла.

[Никац]

ево сликовитог приказа, направљен помоћу https://www.mapchart.net/europe.html

[Никац]

Ево како до података о поријеклу за ваша поклапања на MyHeritage-у.

- под стабло>моје стабло, направите "лажно" породично стабло, и сваком претку ставите као мјесто рођења другу државу. ја сам то урадио само за државе источне и централне Европе и Балкана, јер ме оне занимају.

-сајт неће одмах учитати податке, треба му неколико дана.

-након тих неколико дана изаберите опцију: днк>подударања>филтери>има заједничко мјесто

-овако ћете добити информацију испод сваког поклапања, као на примјер:
 Места предака заједничка за вас и -- укључују Србија и Босна и Херцеговина.

-можете на дну странице поставити "Резултати по страници 50", копирати читаву страницу у неки текст едитор, и разврставати их.

[НикПав]

Комбинована heatmap поклапања мојих тетака и мене. Сигурно је да има дупликата (дељених поклапања), укупно је обрађено преко 4500 поклапања. Гусиње и Подгорица према Тузима убедљиво доминирају. У питању су поклапања са Myheritage, Ancestry и 23andme.