Аутор Тема: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар  (Прочитано 6328 пута)

Ван мреже Азот

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 396
Пошто је закључана тема, немам могућност да укажем на неке пропусте
Типа да се 45 хромозома наслеђују од мајке, а 1од оца?!
То није тачно 23 хромозома наслеђујемо од оца, 23 од мајке (осим код одређених синдрома, када неки од родитеља да 1-2 више или мање хромозома, па се деди проблем у развоју нпр Даунов синдром

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5484
  • Y134591 Тарски Никшићи
Телесна ћелија човека има 46 хромозома или две гарнитуре по 23 хромозома, при чему једна гарнитура потиче од мајке, а друга од оца, па се тако образује 23 пара хомологих хромозома.
22 пара чине аутозоми и један пар су полни хромозоми (гонозоми). Пар полних хромозома је хомолог само у ћелијама жена, у којима се састоји од два X хромозома, док је у ћелијама мушкарца асиметричан (нехомолог) и састоји се од једног X и једног Y хромозома.

Ван мреже Азот

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 396
Х хромозом је много већи од свог Y пара и сматра се да при преклапању ова два хромосома измењују своје секвенце (мешају се) у проценту од 10-15% процената. Али сами Yхромосоми никад не могу да се мешају са Y хромосомом друге особе јер немогу да се у исто време нађу у организму тако да они остају чврсти и без утицаја више милиона година, али то се односи на само језгро односно 85-90% " мушких гена на Y хромосому "такодје научници сматрају да скоро цео (85-90%) Y хромозом нема репетиције односно понављања која су одлика Х хромосома. Док је код женских особа тј Х хромосома тај случај другачији јер свака жена у принципу може да има Х хромосоме од две различите биолошке мајке, и тада наступа њихово интензивно мешање. Са мушким Y хромосомима то није случај јер се никада као што смо већ напоменули не може наћи Y хромосоми од два различита претка у истој ћелији просто из разлога да будем баналан што мускарци не могу да рађају децу!

Није ми јасно како то жена може имати две биолошке мајке.

Ван мреже Азот

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 396
Телесна ћелија човека има 46 хромозома или две гарнитуре по 23 хромозома, при чему једна гарнитура потиче од мајке, а друга од оца, па се тако образује 23 пара хомологих хромозома.
22 пара чине аутозоми и један пар су полни хромозоми (гонозоми). Пар полних хромозома је хомолог само у ћелијама жена, у којима се састоји од два X хромозома, док је у ћелијама мушкарца асиметричан (нехомолог) и састоји се од једног X и једног Y хромозома.

Лепо објашњено

Ван мреже Азот

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 396
Да се надовежем нај мој предходни коментар где је плавом бојом цитат текста који  сам пренела из закључане теме.
Кросинг овер илити размена делова хромозома постоји и између Y и Х хромозома. Тако да  У хромозом није недодирив

Више о томе можете да пронађете на сл.  линку
https://www.google.rs/url?sa=t&source=web&rct=j&url=http://medicine.jrank.org/pages/2107/Crossing-Over-X-Y-Crossovers-Unequal-Crossovers.html&ved=2ahUKEwjnu5aih8nZAhUmAsAKHRNQAzsQFjALegQICRAB&usg=AOvVaw3aH2E3VpqZVV_EbamWPy-O


Ван мреже Азот

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 396
Цитирам

Новонастали плод у себи има нови пар хромозома један од оца и један од мајке. Претпоставимо да плод који ми описујемо има од оца Y хромозом тај плод ће бити мушког пола и од мајке ће наследити преко јајне ћелије и њене митохондријске ДНК, X хромозом! Сада генетским истраживањима


mDNK нема  Х хромозом!

Ван мреже Азот

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 396
Низ нелогичности и грешака у даљем тексту

Цитирам
Сада плод настао спајањем јајне ћелије и сперматозоида и њиховим "уједињењем" има 23 нова пара хромозома која су створена у јајној ћелији процесом који може да траје 16-20 сати од уласка сперматозоида у јајну ћелију тада се ови хаплоидни полни хромосоми умножавају стварајући диплоидну ћелију која се зове зигот и од које настаје ембрион. Од ових нових (односно само умножених старих) хромосома 22 представљају ХХ пар хромозома и код женског и код мушког пола, док се на основу задњег пара одређује пол детета или плода. Код мушкараца овај задњи пар је XY, а код  жена XX.
   

Како хаплоидни полни хромозоми стварају диплоидну ћелију?...
Од ових нових, старих..?

22 представљају хх пар?..

На мрежи Полић

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 587
  • I2-Y56203
Да се надовежем нај мој предходни коментар где је плавом бојом цитат текста који  сам пренела из закључане теме.
Кросинг овер илити размена делова хромозома постоји и између Y и Х хромозома. Тако да  У хромозом није недодирив

Више о томе можете да пронађете на сл.  линку
https://www.google.rs/url?sa=t&source=web&rct=j&url=http://medicine.jrank.org/pages/2107/Crossing-Over-X-Y-Crossovers-Unequal-Crossovers.html&ved=2ahUKEwjnu5aih8nZAhUmAsAKHRNQAzsQFjALegQICRAB&usg=AOvVaw3aH2E3VpqZVV_EbamWPy-O
Свакако, кросинг овер је позната ствар, ја сам то још у гимназији учио из билологије. Тачно ипсилон хромозом није недодирљив, као ни било који други хромозом, али секвенца гена која се посматра у генетичкој генеалогији није подложна кросинг оверу, а и веома споро мутира. Не дешава се кросинг овер баш на сваком делу хромозома.

Ван мреже Златан

  • Познавалац
  • ******
  • Поруке: 553
  • Y: E-V13>А18833>А9739
Jeдно питање... пошто сам релативно нов у овој теми, покушавам да неке основне ствари научим путем видеа на јутјубу итд.

Пошто један од видеа каже, да генерално сви ДНК подаци немају користи док се не упореде да неким другим ДНК подацима, имам једно питање.

Ја ћу се ускоро тестирати на 111 маркера. Да ли то значи ће моји подаци само моћи да се упореде са људима који су правили исти такав тест или ће моћи да ме пореде и са неким који су правили са (нпр) 37 маркера или слично. Можете ли ми дати неке смернице како функционише поређење ако анализа није урађена на истом броју маркера.

Хвала!

Ван мреже Ojler

  • Члан Управног одбора
  • Бели орао
  • *
  • Поруке: 5294
  • Y-DNK: I2-Y3120 Z17855>PH3414 Мириловићи
Jeдно питање... пошто сам релативно нов у овој теми, покушавам да неке основне ствари научим путем видеа на јутјубу итд.

Пошто један од видеа каже, да су генерално сви ДНК подаци немају користи док се не упореде да неким другим ДНК подацима, имам једно питање.

Ја ћу се ускоро тестирати на 111 маркера. Да ли то значи ће моји подаци само моћи да се упореде са људима који су правили исти такав тест или ће моћи да ме пореде и са неким који су правили са (нпр) 37 маркера или слично. Можете ли ми дати неке смернице како функционише поређење ако анализа није урађена на истом броју маркера.

Хвала!

Раде се поређења на оним маркерима за које су тестове урадила обојица тестираних. Ако урадиш тест на 111 маркера сигурно ћеш бити упоредив са неким који је урадио хаплотип на 37 маркера, на свим маркерима за које је он урадио тестирање. Што више имате упоредивих маркера то се прецизније може одредити ваша међусобна веза.
Kамене рабъ и госодинъ

Ван мреже Platin

  • Одбор за архивистику
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 984
Наравно да је упоредиво :)
Ја сам урадио само 23 маркера. Следећи "корак" је 37... то је оних првих 23 маркера и још 14.
Постоје тестови од 67 и од 111 маркера - сваки је све старо па још део маркера који раније нису узети у разматрање.

Честитам свакоме ко је у могућности да уради 111 маркера :D

Ван мреже Златан

  • Познавалац
  • ******
  • Поруке: 553
  • Y: E-V13>А18833>А9739
Јасно, хвала вам. Главно питање ми је било колико је упоредиво ако нпр један уради на Y-111 а већина на Y-24 или 37, али драго ми је да одговор позитиван. На лето ћу имати резултате свог Y-111 теста. 

Ван мреже роквић

  • Помоћник
  • ****
  • Поруке: 170
Наводно, ново откриће у вези ДНК.

Цитат
Научна сензација: У људској ћелији откривен нови облик ДНК

Научници су по први пут детектовали ДНК структуру унутар живе људске ћелије и она изгледа више као четвороструки чвор него елегантна двострука спирала о којој учимо у школама.

https://frontal.rs/naucna-senzacija-u-ljudskoj-celiji-otkriven-novi-oblik-dnk/
бити Србин је светиња

Ван мреже Ojler

  • Члан Управног одбора
  • Бели орао
  • *
  • Поруке: 5294
  • Y-DNK: I2-Y3120 Z17855>PH3414 Мириловићи
Налетех на овај кратки, занимљиви видео прилог за који не знам баш где бих га поставио, па ми се ова тема учинила најприближнијом:

<a href="https://www.youtube.com/v/mnYSMhR3jCI" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="bbc_link bbc_flash_disabled new_win">https://www.youtube.com/v/mnYSMhR3jCI</a>
Kамене рабъ и госодинъ

Ван мреже Азот

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 396
Налетех на овај кратки, занимљиви видео прилог за који не знам баш где бих га поставио, па ми се ова тема учинила најприближнијом:

<a href="https://www.youtube.com/v/mnYSMhR3jCI" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="bbc_link bbc_flash_disabled new_win">https://www.youtube.com/v/mnYSMhR3jCI</a>
Одличан је

Ван мреже Platin

  • Одбор за архивистику
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 984
Одличан видео :)

Ван мреже Romanijski

  • Познавалац
  • ******
  • Поруке: 783
  • Ја ратујем сам...
 Moram da pitam malopre gledah na Bošnjačkom FTDNA G2 Hadrović ina DYS19=15-16
Ovo prvi put vidim na ovom markeru. čisto iz radoznalosti da čujem imali ovo neko značenje i objašnjenje. Nadamse da nisam ovo pisao na pogrešnoj temi....   :-[  :-[  :-[

Ван мреже Atlantische

  • Уредник СДНКП
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1943
  • G2a-FT221531
Moram da pitam malopre gledah na Bošnjačkom FTDNA G2 Hadrović ina DYS19=15-16
Ovo prvi put vidim na ovom markeru. čisto iz radoznalosti da čujem imali ovo neko značenje i objašnjenje. Nadamse da nisam ovo pisao na pogrešnoj temi....   :-[  :-[  :-[
За припаднике хаплогрупе G2a-PF3147 у које спадају и Хадровићи је карактеристично да на маркеру DYS19 поседују двоструку вредност.
''Заведени светским чудима, заборависмо на себе и на своје порекло." - М. Капор

Ван мреже vojislav.ananic

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 1382

Ван мреже Милан Петровић

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1076
  • I2-PH908 FT277965>Y93865>Y95760 Род Зорића
Можете ли ми објаснити шта значи овај графикон који сам добио са резултатима:

Догодине у Холштајну!

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13154
Можете ли ми објаснити шта значи овај графикон који сам добио са резултатима:



То је графикон из базе YHRD, кроз коју је провучен ваш хаплотип (Yfiler, или PowerPlex23 распоред). Дакле на 17, или на 23 маркера. Као што пише, показује релативну и апсолутну блискост са осталим хаплотиповима из базе (кроз државе). Ви, као I2 динарик, природно имате највише поклапања међу Источним, Западним и Јужним Словенима.

Ово изађе мени нпр. када убацим модални хаплотип J2b-M205>Y22066 (Yfiler)

Ван мреже Милан Петровић

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1076
  • I2-PH908 FT277965>Y93865>Y95760 Род Зорића
Хвала Небојша. Сада видим, а нуди ми и ову мапу са 48 поклапања:

Догодине у Холштајну!

Ван мреже Панић

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 253
  • y: I1-M227, mt: H2a1c
Можда (готово сигурно, пошто будим стару тему) је погрешно место да питам за резултате аутосомалног теста, али нисам нашао боље:
Колико су тачна родбинска подударања које, рецимо ФТДНА даје?
Односно, кад мени каже ФТДНА да са неким имам, рецимо:
Relationship Range
3rd Cousin - 5th Cousin

Shared DNA
29 cM

Longest Block
23 cM

а немам никакву идеју откуд би та веза могла бити с том особом, које су шансе да у ствари и нисмо у некој родбинској вези?
Да ли је ту веза несумњива, само није сигурно која тачно? Или да преформулишем, које су величине shared DNA које скоро сигурно говоре о стварној вези?

Питам пошто на ФТДНА и myHeritage често и за себе и за жену видим неке прилично рендом људе из других земаља који су ми, рецимо, процењени на 3rd Cousin.

Надам се да сам јасно формулисао дилему коју имам :)
Столећима је мој род крш оро
и поповао или кметовао

Ван мреже Драган Обреновић

  • Члан Управног одбора
  • Истраживач
  • *
  • Поруке: 962
  • R1b-U152>FTA27217
Можда (готово сигурно, пошто будим стару тему) је погрешно место да питам за резултате аутосомалног теста, али нисам нашао боље:
Колико су тачна родбинска подударања које, рецимо ФТДНА даје?
Односно, кад мени каже ФТДНА да са неким имам, рецимо:
Relationship Range
3rd Cousin - 5th Cousin

Shared DNA
29 cM

Longest Block
23 cM

а немам никакву идеју откуд би та веза могла бити с том особом, које су шансе да у ствари и нисмо у некој родбинској вези?
Да ли је ту веза несумњива, само није сигурно која тачно? Или да преформулишем, које су величине shared DNA које скоро сигурно говоре о стварној вези?

Питам пошто на ФТДНА и myHeritage често и за себе и за жену видим неке прилично рендом људе из других земаља који су ми, рецимо, процењени на 3rd Cousin.

Надам се да сам јасно формулисао дилему коју имам :)

Увек се ради о вероватноћи да се ради о овом или оном степену сродства, нарочито на тако малом проценту поклапања. У суштини FTNDA и MyHeritage вас нису слагали, само што се ради о прилично различитим вероватноћама да је особа 3rd cousin или 5th cousin.

Препоручујем "Shared cM Project tool v4" на сајту DNA Painter.

https://dnapainter.com/tools/sharedcmv4

Као што ћете видети када унесете 29 у рачунач вероватноћа, могућност да вам је особа са којом имате поклапање 29cM заправо неки "3rd cousin" (преведено на српски - да сте делили заједничког претка пре 4 генерације) заиста постоји али је само 9% вероватна.

Могућност да вам је та особа 5th cousin (дакле да сте делили заједничког претка пре 6 генерација) је већ 55%.

Ван мреже Панић

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 253
  • y: I1-M227, mt: H2a1c
Одг: Објашњење главних појмова везаних за генетичку генеалогију - Коментар
« Одговор #24 послато: Јануар 09, 2024, 11:19:55 пре подне »
Увек се ради о вероватноћи да се ради о овом или оном степену сродства, нарочито на тако малом проценту поклапања. У суштини FTNDA и MyHeritage вас нису слагали, само што се ради о прилично различитим вероватноћама да је особа 3rd cousin или 5th cousin.

Препоручујем "Shared cM Project tool v4" на сајту DNA Painter.

https://dnapainter.com/tools/sharedcmv4

Као што ћете видети када унесете 29 у рачунач вероватноћа, могућност да вам је особа са којом имате поклапање 29cM заправо неки "3rd cousin" (преведено на српски - да сте делили заједничког претка пре 4 генерације) заиста постоји али је само 9% вероватна.

Могућност да вам је та особа 5th cousin (дакле да сте делили заједничког претка пре 6 генерација) је већ 55%.

Хвала. Ови конкретни подаци које сам изнео су само пример, питао сам пре свега колико је вероватно да уопште нема никаквог сродства кад ФТДНА или неко други избаци некога као match.
Столећима је мој род крш оро
и поповао или кметовао

Ван мреже Ojler

  • Члан Управног одбора
  • Бели орао
  • *
  • Поруке: 5294
  • Y-DNK: I2-Y3120 Z17855>PH3414 Мириловићи
Хвала. Ови конкретни подаци које сам изнео су само пример, питао сам пре свега колико је вероватно да уопште нема никаквог сродства кад ФТДНА или неко други избаци некога као match.

Зависи како дефинишеш сродство. Ако под тиме подразумеваш да си са неком особом имао заједничког претка, то ти је скоро 100%  сигурно. Али за то ти не треба ни тест као потврда, то је тако по природи ствари.
Kамене рабъ и госодинъ

Ван мреже Драган Обреновић

  • Члан Управног одбора
  • Истраживач
  • *
  • Поруке: 962
  • R1b-U152>FTA27217
Шанса да нема никаквог сродства, а да FTDNA (или било који други тест) прикаже подударање је јако мала, да не кажем непостојећа. Дакле, у општем случају, не треба сумњати у тачност ових тестова, у смислу да они погрешно рачунарју величину сегмената, или да конструишу поклапања која заправо не постоје.

Међутим, постоје ситуације када могу да се појаве лажно блиска поклапања, односно да је реална родословна удаљеност није у сагласју са центиморганима. То се најчешће дешава када наши преци потичу са истог географској простора.

Наиме, познато је да се једни исти ДНК сегменти могу преносити преко више предачких линија (мушких и женских), што је посебно изражено у ендогамним популацијама, где је због "суженог избора" у одређеној географској области долазило до свесног (или најчешће несвесног) ступања у брак између особа које у блиској прошлости деле истог претка. Делови генома истог заједничког претка наслеђени преко више предачких линија могу довести до тога да нам нека поклапања изгледају ближа (сроднија) него што заиста јесу, барем гледајући родословно стабло, односно матичне књиге.

Такође, због насумичности процеса рекомбинације, понекад се дешава да се рекомбинацијом пренесу много већи "комади" ДНК него што је неки просек за одређени степен сродства.

У сваком случају, као што је Ојлер рекао, ако се особа појави у аутозомалним поклапањима, нема дилеме да заиста делите заједничког претка, али је доста тешко на основу тако малог сегмента ДНК лоцирати ко би тај заједнички предак могао бити. Стога је добро тестирати и оца и мајку, као и рођене ујаке и стричеве, јер се тако добрим делом може барем преполовити број кандидата који се анализирају.

Ван мреже НикПав

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 513
  • Y: E-BY148067 Никољдан Y (M): E-FT61303 Јовањдан
Мени и даље није јасно како моја тетка од 2805 поклапања, само 989 дели са својим родитељима на MyHeritage.
Са њиховим алгоритмом нешто није како ваља.