Аутор Тема: Древна ДНК - научни радови  (Прочитано 139190 пута)

Ван мреже Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2079
  • I2-BY55783>BY79593
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #840 послато: Мај 10, 2022, 12:27:59 поподне »
Знаш ли која ће бити тематика тог новог рада, односно које све популације и периоде ће да покрије?

Потврђени узорци од енеолита до антике, можда буде и покоји ранији/каснији. Фокус највероватније на Балкан/југоисточну Европу, могуће да ће бити узорака и из Анадолије и Леванта. Потврђено да ће бити узорака из Словеније, Хрватске, БиХ, Црне Горе, Србије, Албаније, Македоније, Бугарске, Грчке, Румуније, Молдавије. И врло вероватно ће бити три засебна рада објављена одједном, уместо првобитно најављеног јединственог рада.
« Последња измена: Мај 10, 2022, 12:36:45 поподне Црна Гуја »

Ван мреже НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 7232
  • I2-PH908>Y189944>Y250780, род Никшића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #841 послато: Мај 10, 2022, 12:43:57 поподне »
Потврђени узорци од енеолита до антике, можда буде и покоји ранији/каснији. Фокус највероватније на Балкан/југоисточну Европу, могуће да ће бити узорака и из Анадолије и Леванта. Потврђено да ће бити узорака из Словеније, Хрватске, БиХ, Црне Горе, Србије, Албаније, Македоније, Бугарске, Грчке, Румуније, Молдавије. И врло вероватно ће бити три засебна рада објављена одједном, уместо првобитно најављеног једнинственог рада.

То ће баш бити пун погодак. Надам се да ће бити што више узорака из гвозденог доба. Нарочито из гвозденог доба Србије и Северне Македоније, пошто мислим да одатле немамо ниједан узорак из тог периода. Додуше, и БиХ је под знаком питања.
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже filipi

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1087
  • I-CTS10228_Y4882_A1328*
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #842 послато: Мај 10, 2022, 01:15:02 поподне »
То ће баш бити пун погодак. Надам се да ће бити што више узорака из гвозденог доба. Нарочито из гвозденог доба Србије и Северне Македоније, пошто мислим да одатле немамо ниједан узорак из тог периода. Додуше, и БиХ је под знаком питања.
Biti će 10ak iz Srbije, 20ak iz CG, 1 iz BiH, 20ak iz Makedonije, 80ak iz Hrvatske, plus Albanija...
Razdoblje je od praistorije do antike. Ne znam tačno o kojem se razdoblju radi za ove gore uzorke.

Ван мреже drajver

  • Уредник СДНКП
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 3321
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #843 послато: Мај 10, 2022, 05:02:08 поподне »
Прије пар дана је објављен препринт рада под називом "Population Genomics of Stone Age Eurasia"

Наводи се секвенцирање "317 genomes of primarily Mesolithic and Neolithic individuals from across Eurasia" Ако сам добро схватио ради се о узорцима који нису раније секвенцирани (нисам детаљније провјеравао па не знам сигурно). Ако је то тачно, ради се о правом благу.

Само сам бацио поглед на рад, дјелује обећавајуће.

ово су линкови
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.04.490594v2
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.04.490594v2.full.pdf
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2022/05/06/2022.05.04.490594/DC1/embed/media-1.pdf?download=true
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2022/05/06/2022.05.04.490594/DC2/embed/media-2.pdf?download=true
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2022/05/06/2022.05.04.490594/DC3/embed/media-3.xlsx?download=true

Ван мреже drajver

  • Уредник СДНКП
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 3321
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #844 послато: Мај 10, 2022, 06:44:51 поподне »
Ово су у раду написали та хаплогрупу I

Haplogroup I
855
856 Haplogroup I2 was common among newly reported samples from western Eurasian hunter gatherer contexts, as well as later Neolithic farmers. In particular, the 25 Danish Mesolithic
858 male individuals were exclusively carriers of haplogroup I2, albeit with considerable diversity
859 across different sub-haplogroups (Fig. S3b.3). Neolithic farmer individuals from Scandinavia
860 were predominantly placed within an ancient-only subclade of haplogroup I2a1a2, containing
861 other individuals from Neolithic farmer contexts across Europe.
862
863 The earliest presence of haplogroup I1, which is the most common haplogroup among
864 present-day Scandinavians, was found ~4,000BP among late Neolithic and early Bronze Age
865 Scandinavians newly reported in this study (Fig. S3b.3). A single Swedish Mesolithic
866 individual (sf11) was placed at the base of the I1 clade; however, its low coverage (0.1X)
867 precludes to conclude with certainty whether early I1-related lineages were indeed present
868 among Scandinavian hunter-gatherers.

Дали су у прилогу и ову Fig. S3b.3 која би требало да приказује филогенетско стабло I2 и позицију узорака, али у тако лошој резолуцији да је нечитљиво. Бојим се да се до објављивања рада или постављања генома у базу, неће моћи доћи до специфичнијих грана узорака.

Ван мреже drajver

  • Уредник СДНКП
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 3321
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #845 послато: Мај 10, 2022, 07:04:21 поподне »
У ексцел табели бр. VII има нешто одређенија профилација.

Ови узорци би требали бити I2-M423 (то је најдубље што је означено)

NEO627   Banks tomb   UK   WesternEurope   Britain_Neolithic
NEO626   Banks tomb   UK   WesternEurope   Britain_Neolithic
NEO625   Banks tomb   UK   WesternEurope   Britain_Neolithic
NEO717   Banks tomb   UK   WesternEurope   Britain_Neolithic
NEO91   Strøby Grøftemark   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Mesolithic
NEO587   Kongemose   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Mesolithic
NEO589   Korsør Nor   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Mesolithic
NEO749   Henriksholm-Bøgebakken (Vedbæk)   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Mesolithic
NEO790   Tysmose   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Neolithic
NEO595   Pandebjerg   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Neolithic
NEO23   Jorløse mose   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Neolithic
NEO28   Salpetermosen syd 8   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Neolithic
NEO886   Dalmosegaard   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Neolithic
NEO795   Porsmose   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Neolithic
NEO935   Vibygårds Mose   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Neolithic
NEO597   Storelyng (Øgårde boat III)   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Neolithic
NEO898   Svinninge Vejle   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Neolithic
NEO792   Næs   Denmark   NorthernEurope   Denmark_Neolithic
NEO39   Hindby mosse   Sweden   NorthernEurope   Sweden_Neolithic

Ван мреже drajver

  • Уредник СДНКП
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 3321
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #846 послато: Мај 10, 2022, 07:06:52 поподне »
За носиоце E-V13 изгледа нема среће ни овај пут. Нисам видио да има иједан Е узорак.

Ван мреже drajver

  • Уредник СДНКП
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 3321
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #847 послато: Мај 10, 2022, 07:31:23 поподне »
https://www.yfull.com/tree/J-Z1295/ налазиште Grotta delle Mura, бронзано доба Италија, око 1000 г пне.

Ван мреже Uzi

  • Уредник СДНКП
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 1363
  • N2-P189.2>FT182494>FGC28435
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #848 послато: Мај 10, 2022, 07:51:46 поподне »
Изгледа да су поново секвенцирали и N2 узорак RISE554 из Афонтове Горе, овог пута под ознаком NEO70. Надам се да ће сада узорак бити бољег квалитета, мада су га због неког разлога сврстали у N1.

NEO70*   Bazaiha   Russia   tooth   -802   3.44   YES   222.4   F1b1b   97.6   N1   XY   20.9   Merged with NEO107 & NEO108 (same individual)  and also same indvidual as RISE554 (Allentoft et al. 2015)
 

Ван мреже drajver

  • Уредник СДНКП
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 3321
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #849 послато: Мај 10, 2022, 07:53:13 поподне »
Што се дубље одређених узорака R1a хаплогрупе тиче:

https://www.yfull.com/tree/R-CTS1211/ налазиште Falköping, јужна Шведска, око 1750 година пне.
https://www.yfull.com/tree/R-Z93/ налазиште Игрен, централна Украјина, могуће Сармати, око 200 г. пне

Ван мреже Милан Петровић

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1002
  • I2-PH908 FT277965>Y93865>Y95760 Род Зорића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #850 послато: Мај 10, 2022, 08:07:41 поподне »
Дај Боже да буде неки L621 коначно.  ;D
Догодине у Холштајну!

Ван мреже drajver

  • Уредник СДНКП
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 3321
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #851 послато: Мај 10, 2022, 08:16:53 поподне »
Дај Боже да буде неки L621 коначно.  ;D

Ова концентрација I2-M423 у данском неолиту дјелује обећавајуће. Надам се да неће опет бити Isles.

Ван мреже MiroN

  • Члан Друштва
  • Гост
  • *****
  • Поруке: 8
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #852 послато: Мај 10, 2022, 09:33:59 поподне »
https://www.yfull.com/tree/J-Z1295/ налазиште Grotta delle Mura, бронзано доба Италија, око 1000 г пне.
Везано за овај узорак на eupedi-i се појавила информација да је овај узорак сврстан под грану J-Y21878. У линку који је дат узорак се не појављује и немогу се наћи додатне информације.

https://www.eupedia.com/forum/threads/34165-J2b2-L283-(proto-illyrian)/page53

Такође испод гране Ј-Y32373 убачен је још један древни узорак из мађарске.


Sent from my iPhone using Tapatalk

Ван мреже drajver

  • Уредник СДНКП
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 3321
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #853 послато: Мај 10, 2022, 09:46:32 поподне »
Везано за овај узорак на eupedi-i се појавила информација да је овај узорак сврстан под грану J-Y21878. У линку који је дат узорак се не појављује и немогу се наћи додатне информације.

https://www.eupedia.com/forum/threads/34165-J2b2-L283-(proto-illyrian)/page53

Такође испод гране Ј-Y32373 убачен је још један древни узорак из мађарске.


Sent from my iPhone using Tapatalk

На ISOGG стаблу Z1295 и Y21878 су још увијек на истом нивоу, тако да доке се не појави конкретна информација на који је од ова два SNP-a узорка имао позитивна читања, сигурније је држати се узводнијег SNP-a, у овом случају Z1295.

Ван мреже CosicZ

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 515
  • Ђурђевдан Y:I1>P109>FGC22045 Панчево
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #854 послато: Мај 11, 2022, 07:30:05 пре подне »
Раније сам веровао да би се део J-M205 могао повезати са феничанским колонијама. У прилог томе би ишао стари налаз ове хаплогрупа у Сидону (Либан). Иако се распоред донекле поклапа, чини се да се још боље поклапа са простором грчке колонизације (обала Црног Мора, Јужна Италија, Кипар, Исток Шпаније).


Мислим да би добар кандидат за феничанске колонисте била https://www.yfull.com/tree/J-Y213011/ : Либијац и Италијан TMRCA 3000 година са даљим рођаком у Ираку https://www.yfull.com/live/tree/J-Y213190/ . Можда и https://www.yfull.com/tree/J-Y134209/ .

Ван мреже drajver

  • Уредник СДНКП
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 3321
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #855 послато: Мај 11, 2022, 08:21:30 пре подне »
Експанзија кавкаско-иранске компоненте (коју би условно могли повезати са хаплогрупом Ј) на Медитерану, не би требало сводити само на миграције и колоније Грка и Феничана у гвозденом добу, већ је то кретање кренуло и раније, током бронзаног доба. Ова медитеранска миграција исток-запад није повезана са степском миграцијом из континенталне Европе. У раду "The Spread of Steppe and Iranian Related Ancestry in the Islands of the Western Mediterranean" из 2020. године дат је сљедећи закључак:

"Second, our analysis shows that Iranian-related ancestry, which was widespread in the Aegean by the Middle Bronze Age in association with the Minoan and Mycenaean cultures, had also spread as west as Sicily in substantial proportion at least by the time of the Mycenaeans. One possibility is this ancestry spread west along with the Mycenaean cultural expansion. However, the presence of artifacts associated with the Sicilian Castellucian culture in Malta, Greece, and Anatolia before the peak of the Mycenaean culture leaves open the possibility of earlier gene flows, a hypothesis that could be investigated once pre-Minoan data from the Aegean become available. We find no evidence of substantial proportions of Iranian-related ancestry in the Balearic islands or Sardinia until the Phoenician period, but this does not mean that these islands were isolated from the eastern Mediterranean, and indeed the opposite is true. Archaeological evidence shows that this was a period of unprecedented material culture exchange, with substantial westward flows of goods as reflected for example in the importation of Cypriot copper in Late Bronze Age Sardinia."




Ван мреже CosicZ

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 515
  • Ђурђевдан Y:I1>P109>FGC22045 Панчево
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #856 послато: Мај 13, 2022, 04:03:22 пре подне »
Археогенетски узорци из Либана и Туниса.
https://www.haplotree.info/maps/ancient_dna/slideshow_samples.php?searchcolumn=Country&searchfor=Lebanon&ybp=500000,0&orderby=MeanYBP&ascdesc=DESC
https://www.haplotree.info/maps/ancient_dna/slideshow_samples.php?searchcolumn=Country&searchfor=Tunisia&ybp=500000,0

Био сам убеђен да су их време и империје прегазили, али појавио се један.
https://www.yfull.com/live/tree/J-ZS5907*/

Хеј, Феничани, још( с)те живи...

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1519
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #857 послато: Мај 13, 2022, 04:17:25 поподне »
Археогенетски узорци из Либана и Туниса.
https://www.haplotree.info/maps/ancient_dna/slideshow_samples.php?searchcolumn=Country&searchfor=Lebanon&ybp=500000,0&orderby=MeanYBP&ascdesc=DESC
https://www.haplotree.info/maps/ancient_dna/slideshow_samples.php?searchcolumn=Country&searchfor=Tunisia&ybp=500000,0

Био сам убеђен да су их време и империје прегазили, али појавио се један.
https://www.yfull.com/live/tree/J-ZS5907*/

Хеј, Феничани, још( с)те живи...

Значи Ј1.

Ван мреже Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2079
  • I2-BY55783>BY79593
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #858 послато: Мај 13, 2022, 07:36:51 поподне »
The genomic origins of the world’s first farmers

https://www.cell.com/action/showPdf?pii=S0092-8674%2822%2900455-X

Цитат
DNA was extracted from skeletons recovered from some of the most important archaeological sites in early Holocene Europe and Anatolia, including the first farming villages in the Aegean basin (Barcın, Aktopraklık, Nea Nikomedeia); Mesolithic and Neolithic sites from the Iron Gates gorges and other areas of the Central Balkans (Lepenski Vir, Vlasac, Grad-Starcevo, Vinca-Belo Brdo); and the oldest cemeteries and mass grave or ‘‘massacre’’ sites of the Central European EN (Kleinhadersdorf, Asparn-Schletz, Essenbach-Ammerbreite, Dillingen-Steinheim, Herxheim)
                                                                                                                                 
« Последња измена: Мај 13, 2022, 07:38:47 поподне Црна Гуја »

Ван мреже Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2079
  • I2-BY55783>BY79593
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #859 послато: Мај 15, 2022, 11:03:54 пре подне »
Прегледао сам свих пет мушких узорака из Србије, и припадају следећим гранама:


VLASA7; 6814-6390 BC; Vlasac, Serbia; Iron Gates_HG; I2b-BY32198>pre-L417

На YFull-у ће са тестираним из Босне и Херцеговине коначно формирати грану раније познату као I2b-L417/L415. Има отприлике 40% позитивних SNP-ова на том нивоу на FTDNA стаблу.


VLASA32; 7791-7518 BC; Vlasac, Serbia; Iron Gates_HG; R1b1a2-V2219>V88>Y127541>FTA35749


LEPE48; 6062-5917 BC; Lepenski Vir, Serbia; Iron Gates_Neolithic; C1a2b-V20>V86>Y83490>FT59486


LEPE52; 6005-5845 BC; Lepenski Vir, Serbia; Iron Gates_Neolithic; G2a2b2a1a1c-CTS342>pre-PF4202


VC3-2; 5615-5476 BC; Vinča-Belo Brdo, Serbia; Starčevo_EN; G2a2a1a3-FGC34725>BY133179* (xBY225910)

У овој грани се већ налазе два узорка са Гомолаве из периода Винчанске културе, узорак из Поточана који припада Ласињској култури, као и велики број узорака из неолита и енеолита са Иберијског полуострва.
« Последња измена: Мај 15, 2022, 06:35:14 поподне Црна Гуја »