Аутор Тема: Y-ДНК Прѣдвиђач НЕВГЕН  (Прочитано 34750 пута)

Синиша Јерковић

  • Гост
Одг: Y-ДНК Прѣдвиђач НЕВГЕН
« Одговор #40 послато: Септембар 10, 2016, 09:25:18 поподне »
Ево мало о новинах у НевГен прѣдвиђачу, койе се ускоро трѣбайу наћи на мрежном сѣдишти.

Невски, свака част на труду и на новим могућностима предвиђача.

Ван мреже Željko

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 295
  • I1-P109>FGC22061
Одг: Y-ДНК Прѣдвиђач НЕВГЕН
« Одговор #41 послато: Септембар 11, 2016, 12:44:54 пре подне »
Моје похвале за рад на усавршавање и даљи развој НевГен'а.
Језик је од меса и свашта меље.

Ван мреже Александар Невски

  • Редакција СДНКП
  • Истраживач
  • ******
  • Поруке: 1135
Одг: Y-ДНК Прѣдвиђач НЕВГЕН
« Одговор #42 послато: Септембар 22, 2016, 08:47:39 поподне »
Ево мало о новинах у НевГен прѣдвиђачу, койе се ускоро трѣбайу наћи на мрежном сѣдишти.

Новина се односи на цртачки приказ поређења двѣйу расподѣла, расподѣле подогранка и надогранка. Како би се разумѣо значай и сврха новине койу сматрам изузетно значайном и важном потрѣбан йе мало шири увод. Навешћу за примѣр лозу Р1б, односно задатак одређивања подгране койой тражена хапловрста припада. Утврђивање припадности или неприпадности хапловрсте од рецимо 67 ознак лози Р1б нѣйе тежак задатак. Али одређивање койой (дубљой или плићой) подграни Р1б-а узорак припада йе далеко теже и често нерѣшиво без испитивања ПЙРов. Йедан од приступа често коришћен уредницими разних подухватов йе од прилике овакав: уредник зна койе су уобичайене врѣдности за вас Р1б (рецимо за ДЫС458 то йе 17 а за Гату Х4 то йе 11).
Исто тако уредник Р1б подухвата зна да су рецимо за огранак Р1б У106>Z381> Z301>>Z30>> Z344> Z6 уобичайене врѣдности за наведене двѣ ознаке другачийе него за вас Р1б, за ДЫс458 йе овдѣ 19 (а не 17) а за Гату Х4 йе 10 (а не 11). И онда, ако уредник налети на хапловрсту имайућу овѣ двѣ особене врѣдности (и рецимо йош неколике друге особене) койе упућуйу на подогранак Р1б У106>Z381> >> Z6, он и без ПЙРа може бити прилично увѣрен да хапловрста припада баш овоме огранку. Ово йе вѣроватно найчешћи начин како се ручно утврђуйе койему подогранку хапловрста припада, поређењем особених врѣдностий узорка са особеними врѣдностими разних дубљих подогранака. Али, тешкоћа йе што йе врло тешко баратати са бройними подогранки и памтити койе су све особене врѣдности за свакога од њих.

Е, ако сада у НевГен на примѣр убацимо хапловрсту на 67 ознак из подогранка Р1б У106>Z381> >> Z6, добия се слѣдећа слика, на койой су нацртане расподѣле како самога подогранка (бѣлом мастйу), тако и читавога Р1б-а (плавом мастйу). Тамо гдѣ се двѣ расподѣле прѣклапайу (шта йе у већини случай) црта се блѣдо плавом, односно мѣшавином бѣле и плаве. И сада се на слици ясно оцртавайу врѣдности койе су уобичайене за дубок подогранак али не и за вас Р1б, то су бѣли стубићи койе видите. Са слике се види да се срѣдње врѣдности подогранка и читавога Р1б-а разликуйу на 5-6 ознак од 67 их. И ясно се види койе су, то су ДЫСови 390, 458, 447, 464б, 576 и 492.



Е, сада иде друга слика гдѣ се поред двѣйу расподѣл зеленом и наранџастом мастйу цртайу и обѣлѣжавайу врѣдности хапловрсте уобичайене за подогранак али не и за вас Р1б (зеленом, особене врѣдности подогранка) и врѣдности уобичайене за Р1б али не и за подогранак (наранџастом мастйу). Очито йе, што йе више "зеленила" а мање "наранџастила" вѣроватнийе йе да хапловрста припада подогранку. Йер што йе више зеленога, значи хапловрста има више особених врѣдностий подогранка.



На основу овога ћу за койи дан урадити и йош йедно уклапање, биће треће по реду и приказиваће се у исходах. Затим ћемо Милош и я све ово прѣбацити са рачунарскога на мрежно издање (www.nevgen.org), што йе приличан и пипав посао. Ово ће за почетак радити само за Р1б и Р1а, трѣбаће мало врѣмена да се овако нешто уради и за И1, Е1б1б, Й2а, Й1 и друге главне лозе. Али и то ће стићи прѣ или каснийе.

На НевГену йе управо пуштен нов начин цртања, гдѣ се види ово са друге (доње) слике. За сада ново ради само на Р1б и Р1а степенах, за остале трѣба врѣмена да се припреме подаци. Такође, йош увѣк нема наявљенога трећега уклапања. Можда га неће ни бити, ако буде невоља са брзином на мрежи. Надам се да ће нова могућност бити од користи корисникомъ и истраживачемъ.
Србски пѣсник Лаза Костић: "у млазових прочитам сричући" "по уздасих тако први' у јунака реч поврви"

Ван мреже Željko

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 295
  • I1-P109>FGC22061
Одг: Y-ДНК Прѣдвиђач НЕВГЕН
« Одговор #43 послато: Јануар 09, 2017, 04:57:16 пре подне »
Хтио сам мало да видим како се НЕВГЕН "понаша" на различит број СТР маркера из мог ФТДНА (Y111)- резултата.
Припадам Y-СНП огранку I1-P109.

Ево овако..
Вјероватноћа на 12 маркера је 99.93 (уклапање 89.89), предвиђена хаплогрупа I1.
Вјероватноћа на 37 маркера је 100 (уклапање 68.65), предвиђена хаплогрупа I1.
НЕВГЕН и даље предвиђа I1 све до 44 маркера (уклапање 72.88), а од 45 маркера предвиђа хаплогрупу I1-P109 са вјероватноћом 97.34 (уклапање 76.15).

Додајући маркер по маркер до 57, вјероватноћа расте мало по мало до 99.99 (уклапање 80.64), а од 58 маркера вјероватноћа је 100 (уклапање 80.94).
Педесетосми маркер је наш ”чувени” DYS481. 
На свих 111 маркера изгледа овако..



Закључак:
Ја сигурно нијесам професионалац у овој области, али морам рећи да мени све ово дјелује јако добро.
Ако упоредим своја мала/аматерска искуства са другим предвиђачима, искрено мислим да је НЕВГЕН бољи, и није чудно да су га додали на isogg.org.
Сигурно је и доста лакши за кориштење, барем мени.
Невски,
Примјетих да НЕВГЕН не предвиђа I1-P109 као прије.
Пробах са 111 маркера, и са истим хаплотипом као прошле године, али предвиђена хаплогрупа је сад само "I1".

Поздрав
Језик је од меса и свашта меље.

Ван мреже Александар Невски

  • Редакција СДНКП
  • Истраживач
  • ******
  • Поруке: 1135
Одг: Y-ДНК Прѣдвиђач НЕВГЕН
« Одговор #44 послато: Јануар 09, 2017, 06:47:25 пре подне »
Невски,
Примјетих да НЕВГЕН не предвиђа I1-P109 као прије.
Пробах са 111 маркера, и са истим хаплотипом као прошле године, али предвиђена хаплогрупа је сад само "I1".

Поздрав

Жељко, подогранци испод И1 су прѣбачени у посебан степен за И хаплоскупину. Исто тако йе о Новой години направљен и посебан степен за Й лозу, куда йе прѣбачена већина дубљих огранака лозе Й. Само у изборнику лѣво одабери степен за И лозу и можеш добити то што добияше ранийе.
Србски пѣсник Лаза Костић: "у млазових прочитам сричући" "по уздасих тако први' у јунака реч поврви"

Ван мреже Željko

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 295
  • I1-P109>FGC22061
Одг: Y-ДНК Прѣдвиђач НЕВГЕН
« Одговор #45 послато: Јануар 09, 2017, 07:44:25 поподне »
Жељко, подогранци испод И1 су прѣбачени у посебан степен за И хаплоскупину. Исто тако йе о Новой години направљен и посебан степен за Й лозу, куда йе прѣбачена већина дубљих огранака лозе Й. Само у изборнику лѣво одабери степен за И лозу и можеш добити то што добияше ранийе.
Није богами исто као раније, сад је много боље..
Прије није предвиђао и низводни огранак (Y11203).  :)




Хвала Невски.


Језик је од меса и свашта меље.

Ван мреже Јовица Кртинић

  • Помоћник уредника
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 4180
  • Нема ни могућег ако не желимо немогуће!
Одг: Y-ДНК Прѣдвиђач НЕВГЕН
« Одговор #46 послато: Јануар 10, 2017, 12:24:48 пре подне »
Није богами исто као раније, сад је много боље..
Прије није предвиђао и низводни огранак (Y11203).  :)




Хвала Невски.
И мене је пустио низ воду :)


Ван мреже Александар Невски

  • Редакција СДНКП
  • Истраживач
  • ******
  • Поруке: 1135
Одг: Y-ДНК Прѣдвиђач НЕВГЕН
« Одговор #47 послато: Јануар 10, 2017, 07:15:19 пре подне »
Није богами исто као раније, сад је много боље..
Прије није предвиђао и низводни огранак (Y11203).  :)




Хвала Невски.

Нема на чем, Жељко.

П109 йе уситњен у српњу мѣсецу. Мораће се ускоро освѣжити прѣдвиђач новими хапловрстами овога рода, како би био поузданийи.
Србски пѣсник Лаза Костић: "у млазових прочитам сричући" "по уздасих тако први' у јунака реч поврви"

Ван мреже Александар Невски

  • Редакција СДНКП
  • Истраживач
  • ******
  • Поруке: 1135
Одг: Y-ДНК Прѣдвиђач НЕВГЕН
« Одговор #48 послато: Април 24, 2017, 08:20:54 поподне »

Овдѣ йе чланак на НевГену о исходах кушања тачности прѣдвиђаний НевГен прѣдвиђача хаплоскупин, на хапловрстах лозъ И1, Р1а и Р1б. На чистом йе тарзанском енглеском.

www.nevgen.org/Testing of NevGen haplogroup predictor.html
Србски пѣсник Лаза Костић: "у млазових прочитам сричући" "по уздасих тако први' у јунака реч поврви"

Ван мреже Sergio

  • Памтиша
  • ********
  • Поруке: 1849
  • Y-DNA: I2-PH908>Y81557 | mtDNA: K1a-C150T
Одг: Y-ДНК Прѣдвиђач НЕВГЕН
« Одговор #49 послато: Април 24, 2017, 10:59:44 поподне »
У FB групи линк не ради како треба.  :-\

Слика:





Ван мреже СРБ.МНЕ

  • Шегрт
  • ***
  • Поруке: 85
Одг: Y-ДНК Прѣдвиђач НЕВГЕН
« Одговор #50 послато: Јун 29, 2017, 01:42:20 пре подне »
како да одредим имам ли крвног сроства са овима штосу тестирани преко овог какулатора

Ван мреже Александар Невски

  • Редакција СДНКП
  • Истраживач
  • ******
  • Поруке: 1135
Одг: Y-ДНК Прѣдвиђач НЕВГЕН
« Одговор #51 послато: Август 26, 2017, 10:31:17 пре подне »
Данас, 26-га коловоза лѣта Господњега 2017-га изиђе прво явно столно издање НевГен прѣдвиђача на другом йезику осим србскога. Издање йе намѣњено за разне збирке хапловрст и ограничено йе на 23 ознаке. Подржава и вишеструко прѣдвиђање (већега броя хапловрст одйедном). Издање йе на србском и енглеском йезицих, а ускоро се очекуйе и на руском.

Више о том овдѣ

http://www.nevgen.org/NevGenGenealogyTools_v1_0.html
Србски пѣсник Лаза Костић: "у млазових прочитам сричући" "по уздасих тако први' у јунака реч поврви"

Ван мреже Јовица Кртинић

  • Помоћник уредника
  • Аскурђел
  • *****
  • Поруке: 4180
  • Нема ни могућег ако не желимо немогуће!
Одг: Y-ДНК Прѣдвиђач НЕВГЕН
« Одговор #52 послато: Август 26, 2017, 10:44:08 пре подне »
Данас, 26-га коловоза лѣта Господњега 2017-га изиђе прво явно столно издање НевГен прѣдвиђача на другом йезику осим србскога. Издање йе намѣњено за разне збирке хапловрст и ограничено йе на 23 ознаке. Подржава и вишеструко прѣдвиђање (већега броя хапловрст одйедном). Издање йе на србском и енглеском йезицих, а ускоро се очекуйе и на руском.

Више о том овдѣ

http://www.nevgen.org/NevGenGenealogyTools_v1_0.html
Невски, свака ти част! Светлаш нам образ пред светском генетичком заједницом!

Ван мреже Тимар

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 685
Одг: Y-ДНК Прѣдвиђач НЕВГЕН
« Одговор #53 послато: Август 26, 2017, 10:45:39 пре подне »
Данас, 26-га коловоза лѣта Господњега 2017-га изиђе прво явно столно издање НевГен прѣдвиђача на другом йезику осим србскога. Издање йе намѣњено за разне збирке хапловрст и ограничено йе на 23 ознаке. Подржава и вишеструко прѣдвиђање (већега броя хапловрст одйедном). Издање йе на србском и енглеском йезицих, а ускоро се очекуйе и на руском.

Више о том овдѣ

http://www.nevgen.org/NevGenGenealogyTools_v1_0.html
Свака част Александре

Помислио сам на нешто друго када си се огласио, ал на моју велику драгост, није тако :).
Свако добро ти желим.

Ван мреже Amicus

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 9508
  • I1 P109 FGC22045
    • Порекло.рс
Одг: Y-ДНК Прѣдвиђач НЕВГЕН
« Одговор #54 послато: Август 26, 2017, 11:49:23 пре подне »
Данас, 26-га коловоза лѣта Господњега 2017-га изиђе прво явно столно издање НевГен прѣдвиђача на другом йезику осим србскога. Издање йе намѣњено за разне збирке хапловрст и ограничено йе на 23 ознаке. Подржава и вишеструко прѣдвиђање (већега броя хапловрст одйедном). Издање йе на србском и енглеском йезицих, а ускоро се очекуйе и на руском.

Више о том овдѣ

http://www.nevgen.org/NevGenGenealogyTools_v1_0.html

Све похвале, Невски! ;)

Одлично написано и објашњено. :)



Ван мреже Александар Невски

  • Редакција СДНКП
  • Истраживач
  • ******
  • Поруке: 1135
Одг: Y-ДНК Прѣдвиђач НЕВГЕН
« Одговор #55 послато: Август 27, 2017, 06:55:06 пре подне »
Хвала свим трома!  :D
Србски пѣсник Лаза Костић: "у млазових прочитам сричући" "по уздасих тако први' у јунака реч поврви"

Ван мреже Александар Невски

  • Редакција СДНКП
  • Истраживач
  • ******
  • Поруке: 1135
Одг: Y-ДНК Прѣдвиђач НЕВГЕН
« Одговор #56 послато: Август 01, 2019, 06:29:48 поподне »

Сликовит приказ успѣшности прѣдвиђања дубљих подграна НевГен прѣдвиђача, у статистику уђоше нове хапловрсте од првога сѣчња ове године па до йучерашњега дана.







Више пойединости се може наћи овдѣ, на дну странице.

http://www.nevgen.org/Testing_of_NevGen_haplogroup_predictor.html
Србски пѣсник Лаза Костић: "у млазових прочитам сричући" "по уздасих тако први' у јунака реч поврви"

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5100
Одг: Y-ДНК Прѣдвиђач НЕВГЕН
« Одговор #57 послато: Новембар 20, 2019, 12:26:16 поподне »
У октобру ове године објављено је истраживање хаплотипова бразилске популације (1382 тестирана Yfiler Plus). Оно што је занимљиво јесте да су кроз ово истраживање хтјели провјерити и успјешност примјене предвиђача хаплогрупа, између осталих и Невгена. У поређењу са Haplogroup Predictor-ом Невген је однио побједу. То смо знали и раније, али свакако честитамо.  ;)

"The performance of Haplogroup Predictor and NevGen software in haplogroup prediction based on Yfiler Plus and Yfiler haplotypes was evaluated in a subset of 416 Brazilian samples that were also genotyped for 51 Y-SNPs. In 25% of the samples, no classification or errors were found for at least one of the prediction tools or marker sets. NevGen presented lower error rates (5.52% and 8.65% with Yfiler Plus and Yfiler, respectively) than Haplogroup Predictor (16.11% with Yfiler Plus and 13.70% with Yfiler). In conclusion, both haplogroup prediction tools can be useful to direct the SNP typing, but present large error rates to be used in forensic analysis, especially in predicting African haplogroups in admixed South American populations."

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31704485

Ван мреже Nebo

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 10023
  • I2a S17250 A1328
Одг: Y-ДНК Прѣдвиђач НЕВГЕН
« Одговор #58 послато: Новембар 20, 2019, 12:42:39 поподне »
У октобру ове године објављено је истраживање хаплотипова бразилске популације (1382 тестирана Yfiler Plus). Оно што је занимљиво јесте да су кроз ово истраживање хтјели провјерити и успјешност примјене предвиђача хаплогрупа, између осталих и Невгена. У поређењу са Haplogroup Predictor-ом Невген је однио побједу. То смо знали и раније, али свакако честитамо.  ;)

Нисмо ни сумњали  :)
"Наша мука ваља за причешћа"

Ван мреже Radul

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1682
  • J-Y230853 Башино Село, Цетиње > Кривошије
Одг: Y-ДНК Прѣдвиђач НЕВГЕН
« Одговор #59 послато: Новембар 20, 2019, 01:29:09 поподне »
Честитке :)
Ако се бојите, немојте то чинити; ако то радите, не бојте се! - Темуџин