Аутор Тема: Древна ДНК - научни радови  (Прочитано 233500 пута)

На мрежи Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2519
  • I2-BY55783>BY79593
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #680 послато: Новембар 10, 2021, 09:21:58 поподне »
FT14506 такође није очитан. Испод имамо:


FT14506>Y251275: Y262292-  T>C (1T)

FT14506>Y70799: Y70799-  C>A (1C)

FT14506>BY140506: BY140506-  G>C (2G)

FT14506>A13912: BY37512-  G>A (2G)

FT14506>Y179535: Y179535-  G>C (1G); FT41224-  T>G (1T)

FT14506>FT177529>FT176058: FT177917-  G>C (1G); FT177623-  T>C (3T)

FT14506>Y56203>Y134578: Y190064-  A>G (2A); BY8728/FGC51403-  G>A (2G); Y61610-  G>A (6G)

FT14506>Y56203>FTA22808: FTA24441/Y238060-  T>C (1T); FTA22974/Y238062-  A>G (2A); FTA23185/Y238058-  C>G (4C); FTA23768/Y238063-  G>A (1G)








Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1602
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #681 послато: Новембар 10, 2021, 10:02:40 поподне »
FT14506 такође није очитан. Испод имамо:


FT14506>Y251275: Y262292-  T>C (1T)

FT14506>Y70799: Y70799-  C>A (1C)

FT14506>BY140506: BY140506-  G>C (2G)

FT14506>A13912: BY37512-  G>A (2G)

FT14506>Y179535: Y179535-  G>C (1G); FT41224-  T>G (1T)

FT14506>FT177529>FT176058: FT177917-  G>C (1G); FT177623-  T>C (3T)

FT14506>Y56203>Y134578: Y190064-  A>G (2A); BY8728/FGC51403-  G>A (2G); Y61610-  G>A (6G)

FT14506>Y56203>FTA22808: FTA24441/Y238060-  T>C (1T); FTA22974/Y238062-  A>G (2A); FTA23185/Y238058-  C>G (4C); FTA23768/Y238063-  G>A (1G)

Није му очитан ФТ16449, ни ФТ14506, а колико схватих ни ПХ908.

Мени (као лаику који прати ГГ са великим питањем колико баш све увек схвати) код тезе у раду (у апстракту) да се ради о праисторијским узорцима (предхришћанским у најмању руку) Јужне Енглеске  и Велса (сазнаће се одакле је тачно тај "наш" да тако кажем) све ово наликује на то да је :

1).узорак мнооого млађи од оног за шта се сматра и потиче из периода највише 100 -  пре наше ере односно 100+ од наше ере и везује се за доба некакве римске експанзије на те просторе, што баш и не спада у средњи век па чак ни у рани средњи век

2. процене старости  Yfull за ову грану 12a нису адекватне  и она је старија но што се мисли - можда 2300-2500 година до последњег заједничког претка .

3. неки залутали лик из 2-4 века у те крајеве (заробљен негде, авантуриста, и ко зна ко све) али то онда обара тезу из рада. Није то онда нека древност.

4. Али за нас - ово је сјајан проналазак. Да ли нам је то најстарији којег имамо тренутно или није?

« Последња измена: Новембар 10, 2021, 10:05:37 поподне нцп »

На мрежи Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2519
  • I2-BY55783>BY79593
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #682 послато: Новембар 10, 2021, 10:36:09 поподне »
BY93199: FT382557-  C>T (3C); BY111699-  C>A (1C); BY127711-  T>G (2T)

Y84307: Y84307-  G>C (14G)

Y51673: BY97555-  G>A (2G)

Y199272: FT280010-  G>A (3G)

Y178551: Y178619-  A>C (2A); Y178589-  C>T (1C)

Y32084: Y32084-  A>G (7A)

FT169314: FT169314-  A>G (1A); FT168203-  C>G (1A); FGC7943/ZS4957/Y10955-  G>A (4G)

Y45765: Y47382-  A>G (1A); Y45765-  G>T (1G); BY219325-  G>T (4G)

A5913>A16863: A16863-  T>C (1T)

A5913>A22312: A22312-  T>G (1T)

FT355750>FT355524: FT355524-  A>G (1A)

Y262301>Y265455: Y265798-  C>G (12C); Y265720-  C>T (1C); Y265409-  C>T (2C); Y265325-  G>T (1G); Y265544-  G>A (1G)

Z16983>Y97246: Y110105-  A>T (1A)

Z16983>Y4789>Y45843: Y45843-  A>G (2A)

Z16983>Y4789>Y6651: Y6658-  G>T (2G)

Z16983>Y4789>FT69556>FT69508: FT69595-  A>T (1A); FGC75097/Y94684-  C>T (1C)

FT277965>YP206: YP206-  C>T (1C)

BY198275>FT162921: FT162921-  T>C (3T)

BY198275>BY200456: BY200456-  G>C (1G)

FT277965>Y93865>Y95760: Z40310-  G>A (7G)


« Последња измена: Новембар 10, 2021, 10:46:00 поподне Црна Гуја »

Ван мреже НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8513
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #683 послато: Новембар 10, 2021, 10:38:14 поподне »
Није му очитан ФТ16449, ни ФТ14506, а колико схватих ни ПХ908.

Мени (као лаику који прати ГГ са великим питањем колико баш све увек схвати) код тезе у раду (у апстракту) да се ради о праисторијским узорцима (предхришћанским у најмању руку) Јужне Енглеске  и Велса (сазнаће се одакле је тачно тај "наш" да тако кажем) све ово наликује на то да је :

1).узорак мнооого млађи од оног за шта се сматра и потиче из периода највише 100 -  пре наше ере односно 100+ од наше ере и везује се за доба некакве римске експанзије на те просторе, што баш и не спада у средњи век па чак ни у рани средњи век

2. процене старости  Yfull за ову грану 12a нису адекватне  и она је старија но што се мисли - можда 2300-2500 година до последњег заједничког претка .

3. неки залутали лик из 2-4 века у те крајеве (заробљен негде, авантуриста, и ко зна ко све) али то онда обара тезу из рада. Није то онда нека древност.

4. Али за нас - ово је сјајан проналазак. Да ли нам је то најстарији којег имамо тренутно или није?

НЦП, замолио бих вас да сачекате док Црна Гуја не објави сва очитавања испод Y3120 за дати узорак и да не спамујете тему. Стрпљење је врлина. Поздрав.
Чињеницама против самоувереног незнања.

На мрежи Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2519
  • I2-BY55783>BY79593
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #684 послато: Новембар 10, 2021, 10:39:01 поподне »
Да ли то значи да је негативан на све ове СНП-е (црвено)?

Тако је.

4. Али за нас - ово је сјајан проналазак. Да ли нам је то најстарији којег имамо тренутно или није?

Нећемо знати док се не објави рад.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1602
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #685 послато: Новембар 11, 2021, 05:58:57 пре подне »
НЦП, замолио бих вас да сачекате док Црна Гуја не објави сва очитавања испод Y3120 за дати узорак и да не спамујете тему. Стрпљење је врлина. Поздрав.


У тишини....


Ван мреже CosicZ

  • Редакција СДНКП
  • Истраживач
  • ******
  • Поруке: 898
  • Ђурђевдан Y:I1>P109>FGC22045 Панчево
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #686 послато: Новембар 11, 2021, 07:48:06 пре подне »
Није му очитан ФТ16449, ни ФТ14506, а колико схватих ни ПХ908.

Мени (као лаику који прати ГГ са великим питањем колико баш све увек схвати) код тезе у раду (у апстракту) да се ради о праисторијским узорцима (предхришћанским у најмању руку) Јужне Енглеске  и Велса (сазнаће се одакле је тачно тај "наш" да тако кажем) све ово наликује на то да је :

1).узорак мнооого млађи од оног за шта се сматра и потиче из периода највише 100 -  пре наше ере односно 100+ од наше ере и везује се за доба некакве римске експанзије на те просторе, што баш и не спада у средњи век па чак ни у рани средњи век

2. процене старости  Yfull за ову грану 12a нису адекватне  и она је старија но што се мисли - можда 2300-2500 година до последњег заједничког претка .

3. неки залутали лик из 2-4 века у те крајеве (заробљен негде, авантуриста, и ко зна ко све) али то онда обара тезу из рада. Није то онда нека древност.

4. Али за нас - ово је сјајан проналазак. Да ли нам је то најстарији којег имамо тренутно или није?
За сада знамо да је позитиван на Y3116 и негативан на поменуте SNP-ове. Према YFull-у Y3116 је настао вероватно пре 3400 до 2200 година https://www.yfull.com/tree/I-Y3120/ . Наравно, овај узорак може бити и млађи, јер сви до сада испитани припадници I2-Y3120 су позитивни н на Y3116.

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1602
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #687 послато: Новембар 11, 2021, 08:16:02 пре подне »
За сада знамо да је позитиван на Y3116 и негативан на поменуте SNP-ове. Према YFull-у Y3116 је настао вероватно пре 3400 до 2200 година https://www.yfull.com/tree/I-Y3120/ . Наравно, овај узорак може бити и млађи, јер сви до сада испитани припадници I2-Y3120 су позитивни н на Y3116.

Хвала на овом појашњењу.

 :)


То мења и мој угао гледања. Збуњује у причи о њему тај ауто сомални резултат...?

И да исправим своју грешку није реч о процени старости целе  I2a (ненамерна грешка), већ ту мислим на њену грану ПХ 908.

Али, хајде да сачекам.
« Последња измена: Новембар 11, 2021, 08:20:53 пре подне нцп »

Ван мреже filipi

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1141
  • I-CTS10228_Y4882_A1328*
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #688 послато: Новембар 11, 2021, 08:17:57 пре подне »
Iz ovog rada bit će i 15 uzoraka iz Slovenije i 20 iz Hrvatske.

Ван мреже Милан Петровић

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1076
  • I2-PH908 FT277965>Y93865>Y95760 Род Зорића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #689 послато: Новембар 11, 2021, 08:30:01 пре подне »
Гујо, само низводне гране оспод FT277965 су читане, а не и сама FT277965?
Догодине у Холштајну!

Ван мреже нцп

  • Члан Друштва
  • Памтиша
  • *****
  • Поруке: 1602
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #690 послато: Новембар 11, 2021, 08:30:04 пре подне »
Из поменутог рада

"Large-Scale Migration into Southern Britain During the Middle to Late Bronze Age", Harvard.

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB47891?show=reads

Пројекат: ПРЈЕБ47891

Данашње становништво из Енглеске и Велса има више порекла који потичу од раних европских фармера (ЕЕФ) него људи из раног бронзаног доба.

Да бисмо проучили како се то догодило, генерисали смо податке о геному од 803 особе, скоро све из средњег до касног бронзаног доба и гвозденог доба, повећавајући податке у овом периоду из Британије за 12 пута, а из западне и централне Европе за више него двоструко.

 Између 1000-875 пре нове ере, ЕЕФ порекло се повећало у јужној Британији (Енглеска и Велс), али не и у северној Британији (Шкотска), због укључивања у популацију тока миграната који су стигли у ово време и у претходним вековима и који су генетски најсличнији античким појединцима из Француске.
Ови мигранти су кумулативно допринели око половине порекла људи из гвозденог доба у Енглеској и Велсу, чиме се документује раније непознати демографски процес који је вероватан вектор за ширење раних келтских језика у Британију.

 Ови обрасци су део ширег тренда пропорција ЕЕФ предака који постају сличнији широм централне и западне Европе у средњем и касном бронзаном добу, што се подудара са интензивирањем културне размене и наглашавањем овог периода као врхунца интеракције и мобилности. Не налазимо доказе о упоредивој стопи миграција у Британију у гвозденом добу.

Различите генетске путање Британије и континенталне Европе у гвозденом добу такође су илустроване чињеницом да је алел који даје перзистентност лактазе порастао на ~50% учесталости у Британији до тог времена, док је био само ~7% у Централној Европи и прошао је упоредиву пораст учесталости само миленијум касније, ::)

На мрежи Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2519
  • I2-BY55783>BY79593
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #691 послато: Новембар 11, 2021, 09:48:21 пре подне »
Гујо, само низводне гране оспод FT277965 су читане, а не и сама FT277965?

Тако је Милане, FT277965 нажалост није очитан.

Ван мреже Милан Петровић

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 1076
  • I2-PH908 FT277965>Y93865>Y95760 Род Зорића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #692 послато: Новембар 11, 2021, 10:50:30 пре подне »
Тако је Милане, FT277965 нажалост није очитан.
Хвала.
То значи да је и даље могуће FT277965 и Y93865?
Догодине у Холштајну!

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5157
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #693 послато: Новембар 17, 2021, 08:30:40 пре подне »
Препринт рада о неолитском становништву Европе и Анадолије

Demogenomic modeling of the timing and the processes of early European farmers differentiation
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.11.23.394502v2
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.11.23.394502v2.full.pdf
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.11.23.394502v2.supplementary-material

Секвенцирано је 15 нових узорака, од којих су неки и са наших налазишта. Ово је преглед узорака са Y и MTDNA хаплогрупама.



Један од закључака из рада:
"Based on demogenomic modeling of high-quality ancient genomes, we show that the early farmers of Anatolia and Europe emerged from a multiphase mixing of a Near Eastern population with a strongly bottlenecked Western hunter-gatherer population after the Last Glacial Maximum."

Географска позиција нових узорака.




« Последња измена: Новембар 17, 2021, 08:34:21 пре подне drajver »

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5157
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #694 послато: Новембар 17, 2021, 08:42:01 пре подне »
Још један препринт везан за каснонеолитску Трипољску културе са новим узорцима из Вертеба пећине у Западној украјини.

https://www.researchsquare.com/article/rs-1044480/v1



Један од закључака из рада:

"The results reveal that the CTCC individuals’ ancestry is related to both western hunter gatherers and Near Eastern farmers, lacks local ancestry associated with Ukrainian Neolithic hunter gatherers and has steppe ancestry."

Ван мреже НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8513
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #695 послато: Новембар 17, 2021, 01:30:47 поподне »
Још један препринт везан за каснонеолитску Трипољску културе са новим узорцима из Вертеба пећине у Западној украјини.

https://www.researchsquare.com/article/rs-1044480/v1



Један од закључака из рада:

"The results reveal that the CTCC individuals’ ancestry is related to both western hunter gatherers and Near Eastern farmers, lacks local ancestry associated with Ukrainian Neolithic hunter gatherers and has steppe ancestry."

Зна ли се којим подгранама припадају ова два I2a узорка?
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5157
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #696 послато: Новембар 17, 2021, 01:43:49 поподне »
Зна ли се којим подгранама припадају ова два I2a узорка?

У раду наводе да су користили Yleaf за извлачење хаплогрупа, а ако су користили посљедњу верзију Yleaf онда би то требала бити номенкалтура ISOGG 2019,тј. ова два I2 узорка би требала припадати гранама I2-M423>L161 (Isles) и I2-L596

Ван мреже НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8513
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #697 послато: Новембар 17, 2021, 01:45:44 поподне »
У раду наводе да су користили Yleaf за извлачење хаплогрупа, а ако су користили посљедњу верзију Yleaf онда би то требала бити номенкалтура ISOGG 2019,тј. ова два I2 узорка би требала припадати гранама I2-M423>L161 (Isles) и I2-L596

Видех да су за једног написали да је I2a2 а други да је I2a1, па ми је то створило недоумицу. Који је онда овај I2c?
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5157
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #698 послато: Новембар 17, 2021, 02:04:30 поподне »
Видех да су за једног написали да је I2a2 а други да је I2a1, па ми је то створило недоумицу. Који је онда овај I2c?

Изгледа да су ипак користили старију верзију YLeaf односно ISOGG јер I2c нема на  стаблу 2019. I2c се посљедњи пут користило на стаблу из 2017. године. И ако се примјени то стабло, онда ствар овако стоји:
I2a2a1- M223>CTS616
I2a1a2a- L1286
I2c- L596

Мислим да је ово исправно одређење.

Ван мреже drajver

  • Члан Друштва
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5157
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #699 послато: Новембар 17, 2021, 02:14:26 поподне »
Ако примјенимо стабло ISOGG 2017 за хаплогрупу G2a у овом раду добијамо одређење за двије гране:

https://www.yfull.com/tree/G-Z6885/ G2a2b2a3
https://www.yfull.com/tree/G-PF3177/ G2a2a1a