Древна ДНК - научни радови

[Црна Гуја]

Хвала. Да ли је то све што се тиче I2 хаплогрупе? Немам могућност скидања.

Има још много I2 узорака, али је ово једини динарац.

[нцп]

На основу аутосомала рекло би се да је ипак средњовековни узорак у питању, нажалост:

Distance to: Celtic_paper:I18719
0.02133739 Montenegrin
0.02395463 Serbian
0.02700447 Romanian
0.02747612 Moldovan
0.02904085 Bosnian

Distance to: Celtic_paper:I18719
0.02650526 Romanian:G408
0.02680971 Montenegrin:Montenegro6
0.02720836 Serbian:717
0.02749230 Serbian:729
0.02775372 Serbian:726
0.02815494 Montenegrin:Montenegro4
0.02837617 Italian_Northeast:ALP435
0.02922570 Montenegrin:Montenegro7
0.02929583 Serbian:712
0.02940872 Romanian:A362
0.02985321 Croatian:Croatia_Cro305
0.03002988 Bosnian:Bosnian_13
0.03089066 Moldovan:MOL-069
0.03092124 Moldovan:44618757461C01
0.03103640 Montenegrin:Montenegro5
0.03157693 Serbian:710
0.03160384 Serbian:724
0.03167525 Serbian:728
0.03175789 Romanian:A343
0.03176351 Bosnian:Bosnian_12
0.03177463 Bosnian:Bosnian_10
0.03193091 Slovenian:Slovenian172
0.03218606 VK2020_ITA_Foggia_MA:VK538
0.03247129 Moldovan:44618757472C01
0.03285979 Moldovan:44618757482C02
0.03302922 Moldovan:44618758492C02
0.03312324 Bulgarian:BulgarianF2
0.03325667 Montenegrin:Montenegro1
0.03331539 Moldovan:MOL-066
0.03337098 Serbian:Serbian_Serbia4
0.03338342 Slovenian:Slovenian136
0.03373781 Serbian:Serbian_Serbia2
0.03437026 Croatian:Croatia_Cro142
0.03484171 Moldovan:44618757802C01
0.03484869 Romanian:G434
0.03491474 Italian_Northeast:ALP220
0.03545940 Moldovan:44618757471C01
0.03551250 Serbian:Serbian_Serbia5
0.03555611 Moldovan:44618757252C02
0.03569559 VK2020_DNK_Langeland_VA:VK362
0.03572019 Serbian:722
0.03585976 Bulgarian:Bulgaria1
0.03586028 Serbian:715
0.03605834 Italian_Northeast:KF2700922
0.03607715 Moldovan:44618757481C02
0.03610442 Serbian:721
0.03627556 Italian_Northeast:KF1803129
0.03663181 Moldovan:44618758062C02
0.03679381 Italian_Northeast:ALP093
0.03690259 BGR_EBA:I2165

Ако не грешим - тај  и такав аутосомални резултат те неке "древне" јединке треба да покаже на коју од данашњих популација упућује. У супротном није ми јасно о чему се ради

[нцп]

Има још много I2 узорака, али је ово једини динарац.

Да ли је то тај?

I18719; I2a1a2b1a1-CTS10228>Y3120 (xY4882,Y5596

[Неродимац]

А да ли се зна локација одакле су узорци са овог истраживања?

[Милан Петровић]

Нека теорија можда? 

[нцп]

А да ли се зна локација одакле су узорци са овог истраживања?

Јужна Енглеска и Велс (пише  у одредници). Нема детаљнијег навођења места

Ја не могу да отворим фаил. Да могу, поделила бих са заинтересованима на форуму.

Не разумем више ове тзв. уреднике овог форума. Чувају за себе знање (сазнање) или још нису обрадили податке (и не морају али нек нама напишу основну хаплогрупу) или је у питању нешто друго (мрзи их и томе слично).

Хвала Црној Гуји и за овог једног.

Мени је криво јер мене све занима из тог рада. Сваки зарез. 

[Милан Петровић]

Нешто ту не штима. Римљани долазе тек 55пне, сувише касно да би стигао са њима. Келти долазе 1000пне, то је касно бронзано доба у Британији.

[Мића]

Јужна Енглеска и Велс (пише  у одредници). Нема детаљнијег навођења места

Ја не могу да отворим фаил. Да могу, поделила бих са заинтересованима на форуму.

Не разумем више ове тзв. уреднике овог форума. Чувају за себе знање (сазнање) или још нису обрадили податке (и не морају али нек нама напишу основну хаплогрупу) или је у питању нешто друго (мрзи их и томе слично).

Хвала Црној Гуји и за овог једног.

Мени је криво јер мене све занима из тог рада. Сваки зарез.

Који је фајл у питању?

[нцп]

Који је фајл у питању?

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB47891?show=reads

Сви ти појединачни резултати могу збирно да се преузму (downland) у ЗИП-у који ја немам. Може да се инсталира. Али ја то не умем. Тренутно немам никога ко то зна.

Реално, обиман је материјал.

Хоћу да видим које су хаплогрупе сви ти "древни" појединци.

Занимају ме све гране I хаплогрупе. Не морају да имају никакве везе са садашњим мушким линијама на Балкану.

[archduke]

Који оперативни систем имаш? Windows 10 може да отвори зип формат без инсталација посебних програма. Јеси ли сигуран да је формат зип?

Ако имаш старији оперативни систем инсталирај WinRAR он отвара више формата укључујући и зип и рар. Инсталација је тривијална (next, next, yes варијанта)

Поздрав

[Црна Гуја]

Не бисте могли ништа урадити са тим фајловима чак и да их успете скинути, а и то бисте тешко успели с обзиром да се ради о више стотина гигабајта података. Рад још увек није званично објављен па детаљи о појединачним резултатима (локација, временско датирање и сл.) још увек нису познати. На основу допунских материјала из рада о Виминацијуму "процурели" су подаци за један мали број узорака, и у питању су узорци француског Ла Тена, словеначког Халштата и гвозденог доба Холандије. Хаплогрупе мушких узорака одређене на основу Yleaf-a могу се преузети овде, мада их не треба узимати као 100% тачне, пошто сам већ наишао на неколико њих који су приписани погрешној грани. Фајл отворите помоћу програма notepad и једноставно ископирајте у ексел ради боље прегледности.

[нцп]

Који оперативни систем имаш? Windows 10 може да отвори зип формат без инсталација посебних програма. Јеси ли сигуран да је формат зип?

Ако имаш старији оперативни систем инсталирај WinRAR он отвара више формата укључујући и зип и рар. Инсталација је тривијална (next, next, yes варијанта)

Поздрав

Хвала најлепше

[нцп]

Не бисте могли ништа урадити са тим фајловима чак и да их успете скинути, а и то бисте тешко успели с обзиром да се ради о више стотина гигабајта података. Рад још увек није званично објављен па детаљи о појединачним резултатима (локација, временско датирање и сл.) још увек нису познати. На основу допунских материјала из рада о Виминацијуму "процурели" су подаци за један мали број узорака, и у питању су узорци француског Ла Тена, словеначког Халштата и гвозденог доба Холандије. Хаплогрупе мушких узорака одређене на основу Yleaf-a могу се преузети овде, мада их не треба узимати као 100% тачне, пошто сам већ наишао на неколико њих који су приписани погрешној грани. Фајл отворите помоћу програма notepad и једноставно ископирајте у ексел ради боље прегледности.

Хвала ЦГ!
Значи да се стрпимо!

[Црна Гуја]

Мапа аутосомалне блискости узорка I18719 (I2-Din) модерним популацијама, на основу које је готово извесно да је у питању средњовековни узорак, или, праштајте на дрскости, средњовековни Србин :

[Be like Bill]

Bio bih tako slobodan da kažem da je u pitanju srednjovekovni Ozrinić

[drajver]

Мапа аутосомалне блискости узорка I18719 (I2-Din) модерним популацијама, на основу које је готово извесно да је у питању средњовековни узорак, или, праштајте на дрскости, средњовековни Србин :

Сремац је прије неки дан упоредио аутосомално резултате овог I18719 са мојим скалираним резултатима и како ми је написао, овај узорак ми је најближи од свих досад доступних древних и модерних узорака. То се види и на овој слици:


Тако да ме баш интересује одакле је и колико је стар овај узорак.

[Црна Гуја]

Сремац је прије неки дан упоредио аутосомално резултате овог I18719 са мојим скалираним резултатима и како ми је написао, овај узорак ми је најближи од свих досад доступних древних и модерних узорака. То се види и на овој слици:


Тако да ме баш интересује одакле је и колико је стар овај узорак.

Аутосомал без сумње иде у прилог томе да је у питању средњовековни узорак, па сам ипак одлучио проверити и гране низводно од Y3120. Почећу од PH908, па ћу поставити овде резултате мало касније.

[нцп]

Мапа аутосомалне блискости узорка I18719 (I2-Din) модерним популацијама, на основу које је готово извесно да је у питању средњовековни узорак, или, праштајте на дрскости, средњовековни Србин :

Хм.

[Црна Гуја]

Овај узорак има јако добру покривеност, па ћу резултате објављивати у више порука. Крећем од гране FT16449 (сам SNР FT16449 није очитан).


FT16449>Y151633: Y151633-  T>C (2T)

FT16449>MF2888: MF2888-  A>G (5A)

FT16449>FT138628: FTA37577-  A>G (3A); FTA10430-  C>T (1C); Y100323-  C>T (2C)

FT16449>Y57291: Y57291-  T>C (1T)

FT16449>FT52705: BY89222-  T>A (28T-1C)

FT16449>FT36524: FT37766-  C>G (1C)

FT16449>FT166563: FT167474-  G>A (4G); FT171013-  A>G (4A)

FT16449>BY173300>BY67102: FT154100-  T>A (2T); Y183257-  G>T (1G)

FT16449>Y126296>FT215325: FT215325-  G>C (2G)

FT16449>Y126296>FT19919: FT15733-  G>A (1G)

FT16449>Y126296>Y81557>Y109645: Y109645-  T>C (6T)

[нцп]

Овај узорак има јако добру покривеност, па ћу резултате објављивати у више порука. Крећем од гране FT16449 (сам SNР FT16449 није очитан).


FT16449>Y151633: Y151633-  T>C (2T)

FT16449>MF2888: MF2888-  A>G (5A)

FT16449>FT138628: FTA37577-  A>G (3A); FTA10430-  C>T (1C); Y100323-  C>T (2C)

FT16449>Y57291: Y57291-  T>C (1T)

FT16449>FT52705: BY89222-  T>A (28T-1C)

FT16449>FT36524: FT37766-  C>G (1C)

FT16449>FT166563: FT167474-  G>A (4G); FT171013-  A>G (4A)

FT16449>BY173300>BY67102: FT154100-  T>A (2T); Y183257-  G>T (1G)

FT16449>Y126296>FT215325: FT215325-  G>C (2G)

FT16449>Y126296>FT19919: FT15733-  G>A (1G)

FT16449>Y126296>Y81557>Y109645: Y109645-  T>C (6T)

Да ли то значи да је негативан на све ове СНП-е (црвено)?