Поставља се питање да ли је добро повезивати далматинске Кубате са муслиманима Кубатима, пореклом из Кубатовине у Херцеговини. Многи аутори сматрају да постоји веза.
Кубати су иначе староседеоци у Херцеговини. Према предању, воде порекло од неке властелинске породице која је прешла на ислам у другој половини 15. века.
Неки чак повезују Кубате из Далмације са Кубетима из Босанске Крајине. Крајишки Кубети су лучинштаци и воде порекло од Опачића, који су по свему судећи I2a DN. Мислим ипак да ту веза не постоји.
Оно што можда везује херцеговачке и далматинске Кубате је чињеница да Кубати спадају у старије жегарске родове, који су се тек крајем 17. века покрстили. Судећи по томе што су од старине били лоцирани у најбољем делу Жегарског Поља и то у близини старе турске куле, њихови преци су вероватно били земљопоседничка (спахијска, беговска, или агинска) фамилија у Жегару у време турске власти.