IBD (Identity by descent) анализа аутосомалне генетике

[Ивица Јовановић]

Samo ftDNA. Znam da nema veze nego mi je bilo zanimljivo da su ti zapadno od Drine ljudi sa tom grupom. Napravio sam csv sa poklapanjima sa myheritage, ima ih mnogo vise. Poslao sam Nikcu, pa kada uradi uradi.

[Ивица Јовановић]

Ovo su poklapanja ftDNA+MyHeritage

[Exiled]

Молим вас да ми наведете број ваших подударања у Мађарској. Ја их имам 69 и то све Мађари, један има који није него је само по пребивалишту. Баш ме занима како наши људи стоје са Мађарима.

[Никац]

Молим вас да ми наведете број ваших подударања у Мађарској. Ја их имам 69 и то све Мађари, један има који није него је само по пребивалишту. Баш ме занима како наши људи стоје са Мађарима.

слично, 56

међу ближима које сам мапирао сви су из сјеверне половине Мађарске

[Ивица Јовановић]

Iznenadjujuce malo. Na gedmatch ni jedan u prvih 100, ali zato imam jednog belgijanca i dvoje brazilaca u prvih 10 sto je strejndz. Na myheritage u prvih 50 imam troje, to jest tri zene. Jedna se preziva Konrad, druga Arbel a treca Radoi i mislim da ni jedna nije Madjarica. Neuporedivo vise imam Poljaka i Ukrajinaca od severnih (pored Srba, Rumuna i Grka koji su mi najbrojniji). Uradicu ove godine i 23andme i ancestry testove pa cu videti kakva je situacija tamo. Na ftDNA je slicno, 1 u prvih 100 (i taj Madjar zivi u Hrvatskoj).

[Небојша]

Молим вас да ми наведете број ваших подударања у Мађарској. Ја их имам 69 и то све Мађари, један има који није него је само по пребивалишту. Баш ме занима како наши људи стоје са Мађарима.

Где ти се јављају Мађари? Проверио сам MyHeritage, имам око 40-ак њих из Мађарске, од тога преко 30 са мађарским презименима, могуће да се заломио и који Словак.

Ово јесте интересантно, ако се узме у обзир да са територије Хрватске постоји сличан број поклапања. Али наши људи на MH често уписују локацују где тренутно бораве (већина је USA, Germany, итд). Mогуће да је популаран овај сајт код Мађара. У сваком случају, од тих 40, чак 38 има компоненту Балкан, која се јавља код 82% Мађара са MyHeritage.

[Exiled]

Где ти се јављају Мађари? Проверио сам MyHeritage, имам око 40-ак њих из Мађарске, од тога преко 30 са мађарским презименима, могуће да се заломио и који Словак.

Ово јесте интересантно, ако се узме у обзир да са територије Хрватске постоји сличан број поклапања. Али наши људи на MH често уписују локацују где тренутно бораве (већина је USA, Germany, итд). Mогуће да је популаран овај сајт код Мађара. У сваком случају, од тих 40, чак 38 има компоненту Балкан, која се јавља код 82% Мађара са MyHeritage.

Видовић,мој најближи рођак са пројекта их има 86. Нисам провераво по регијама али су ко што рекох све Мађари и претпостављам наши који су мађаризовани у последњих 300/400 година.Доста их је везано са презименом Хорват што је јасан знак. Убаци ми Драган буву да би моја веза са Војнићима на АС могла бити не по очинској линији,како сам раније капиро ту везу,већ другачије и овај број и мојих и Видовићевих подударања тамо нам нешто сугерише.

[Exiled]

Пратим мало БДП од како су се вратили у живот и има једна ствар која ми се јако свиђа а нисам знао да је могућа. Наиме они људима који су радили аутосомал предлажу слање података њима и они им на основу истих проналазе хаплогрупу. Можда би могли украсти ову идеју. Стручњаци вероватно знају како извући те податке из аутосомала.

[Небојша]

Пратим мало БДП од како су се вратили у живот и има једна ствар која ми се јако свиђа а нисам знао да је могућа. Наиме они људима који су радили аутосомал предлажу слање података њима и они им на основу истих проналазе хаплогрупу. Можда би могли украсти ову идеју. Стручњаци вероватно знају како извући те податке из аутосомала.

Може се на основу RAW фајла са MyHeritage (могуће и Ancestry) одредити нека основна подграна попут I-M438, R-M198 и слично. Програм је MorleyDNA.

https://ytree.morleydna.com/

Требаш дакле вући за рукав људе који су радили тамо тест, да ти пошаљу RAW, или сами убаце и добију неку основну подграну. Када су подгране у питању, 23andMe је YFull у односу на ово, али важан је сваки податак.

Недавно сам баш добио информацију да је један Боговац (Св. Јован), Запужане/Бенковац, са MyHeritage, испао I-M438 на MorleyDNA.

[Exiled]

Може се на основу RAW фајла са MyHeritage (могуће и Ancestry) одредити нека основна подграна попут I-M438, R-M198 и слично. Програм је MorleyDNA.

https://ytree.morleydna.com/

Требаш дакле вући за рукав људе који су радили тамо тест, да ти пошаљу RAW, или сами убаце и добију неку основну подграну. Када су подгране у питању, 23andMe је YFull у односу на ово, али важан је сваки податак.

Недавно сам баш добио информацију да је један Боговац (Св. Јован), Запужане/Бенковац, са MyHeritage, испао I-M438 на MorleyDNA.

Добро, значи знате како се то ради. Рукав јесте и биће увек проблем. Можда као и они објавити ту могућност  па ако се људи јаве,јаве се...Они то раде на ФБ. Какви су максимуми овог предлога незнам али осетих потребу да предложим.

[Небојша]

Добро, значи знате како се то ради. Рукав јесте и биће увек проблем. Можда као и они објавити ту могућност  па ако се људи јаве,јаве се...Они то раде на ФБ. Какви су максимуми овог предлога незнам али осетих потребу да предложим.

Свакако не би било лоше да се отвори посебна тема. Мислим да је на форуму више пута било речи о том предвиђачу MorleyDNA.

[Небојша]

Издвојио сам и најближе аутосомалне рођаке са MH, како би упоредио са 23andMe. Чини се најпре да на MH има више оних блиских и релативно блиских поклапања. На FTDNA има најмање блиских рођака, самим тим и више простора за лажна поклапања. Она сигурно постоје и на MH/23andMe, али их пре свега треба тражити међу удаљенијим рођацима.

Згодно је што MH има нешто детаљнију admixture мапу за сваког појединца, па је то некад добар траг у откривању порекла тестираног из поклапања. Такође, често су ту породична стабла, породична презимена, локације.

плаво: Срби
црвено: Хрвати
црно: Немци и Аустријанци
жуто: Бугари
зелено: Бошњаци
браон: Албанци
наранџасто: Мађари
сиво: Македонци
светлобраон: Пољаци и Словаци



У конкретно мом случају, резултати се доста поклапају. Мапа се поклапа и са оним што MyHeritage одређује преко тзв. крајишког кластера.



Код 23andMe најближи днк рођаци јављају се на простору Подгрмеча и Поткозарја, док су на MyHeritage најближа поклапња на простору Лике (околина Зрмање), околине Книна, Унца и такође Подгрмеча. Треба узети у обзир да се Крајишници знатно чешће тестирају у односу на остале Србе, али резултати свакако имају смисла.

Heat мапа на основу ближих поклапања са MyHeritage. Hotspot - Зрмања Врело! 

[Exiled]

Свакако не би било лоше да се отвори посебна тема. Мислим да је на форуму више пута било речи о том предвиђачу MorleyDNA.

Ево како ја то видим, људи ураде АС и незнајући шта раде. Кад добију резултате виде да су им сви живи рођаци и онда одустају од даљњих трагања. Е сад кад би ту ускочили и рекли људи није крај имамо опцију која ће вам помоћи да сазнате нешто више...итд.итд.

[НиколаВук]

Може се на основу RAW фајла са MyHeritage (могуће и Ancestry) одредити нека основна подграна попут I-M438, R-M198 и слично. Програм је MorleyDNA.

https://ytree.morleydna.com/

Требаш дакле вући за рукав људе који су радили тамо тест, да ти пошаљу RAW, или сами убаце и добију неку основну подграну. Када су подгране у питању, 23andMe је YFull у односу на ово, али важан је сваки податак.

Недавно сам баш добио информацију да је један Боговац (Св. Јован), Запужане/Бенковац, са MyHeritage, испао I-M438 на MorleyDNA.

Постоји и YSEQ Cladefinder од Хантера Провина, за који ми се чини да је за нијансу бољи од Морлија што се тиче проналаска нижих подграна:

https://cladefinder.yseq.net/

[Драган Обреновић]

Постоји и YSEQ Cladefinder од Хантера Провина, за који ми се чини да је за нијансу бољи од Морлија што се тиче проналаска нижих подграна:

https://cladefinder.yseq.net/

Да, Cladefinder се редовно синхронизује са стањем YFull стабла.

Нарочито је згодан у комбинацији са програмом WGS Extract - експортује се VCF фајл само за Y хромозом и пошаље на Cladefinder - добије се инстант позиција на YFull стаблу.

[НикПав]

Иако далека, интересантна су ова поклапања са Сицилије на Ancestry. Код тетке по мајци доминира презиме Cucci, Cuchi и друге варијанте, код тетке по оцу су убедљиво најбројније Матранге. Нажалост, нико ми није одговорио на понуде за тестирање.