Древна ДНК - научни радови

[Atlantische]

Велико разочарање за мене, нити један једини G2a-L497. 

[drajver]

Велико разочарање за мене, нити један једини G2a-L497. 

Али има доста I2-M423, вјероватно Лошбурових рођака. Видим и један Ислес L161 прилично стар. Ваљало би свакако проћи кроз сирове резултате, видим да су доступни на ENA. Можда се открије и који предачки за наше М423.

[Црна Гуја]

Узорак MX265 који је једини R1a-М458 узорак у овом раду, уједно је и најмлађи датирани узорак (763-431 BC), дакле потиче из периода Халштатске културе.

[drajver]

Могуће је да су сви I2-M423 из овог рада L161+. Насумице сам погледао сирове резултате од MX188 који је означен као M423, и он има једно позитивно читање на L161 (Isles-по ранијој терминологији) .

[Nenad M]

Узорак MX265 који је једини R1a-М458 узорак у овом раду, уједно је и најмлађи датирани узорак (763-431 BC), дакле потиче из периода Халштатске културе.

Једно питање, да бих иоле могао да пратим причу: отворио сам YFull.com, кликнуо на R1a и тражио преко ctrl-F све оне ознаке које су наведене у табели код тог узорка и - ништа. Како знате да је то М458? Да ли је у питању неко старије означавање? Што се тиче М458, то сам нашао, али оно што стоји у табели - L146, M420, PF6229, тога нема. Претпостављам да је разлог моје танко предзнање, али можда још има наде за мене  Или баш груб превид, али у то сумњам.
Хвала.

[drajver]

Могуће је да су сви I2-M423 из овог рада L161+. Насумице сам погледао сирове резултате од MX188 који је означен као M423, и он има једно позитивно читање на L161 (Isles-по ранијој терминологији) .

Детаљније сам прошао узорак МХ188 из Spreitenbach (Швица). Изгледа да овај резултат дијели постојећи I2-M423>L161 ниво, јер је МХ188 позитиван на L161 (додуше једно позитивно читање, али без негативних),а истовремено негативан на S2660, S2727, S2680 који се тренутно налазе на нивоу L161.

Очитања за ове позиције су сљедећа:
S2660 (12 негативних)
S2727 (2 негативна)
S2680 (1 негативан)

Остале позиције на нивоу L161 су без одазива.

Прије него што сам схватио ситуацију на L161 нивоу очитао сам негативно и неке позиције испод L161:

Y1339 (1-)
Y13577 (1-)
S2703 (7-)
BY11027 (2-)
Y12993 (1-)
Y12064 (1-)

Такође постоје негативна очитања за друге подгране испод М423:

ниво L621- S13737 (13-)
ниво Y24694- A20191 (5-)

Укратко, узорак МХ188 је I2-M423>L161* и није оставио живих потомака (бар да их досад знамо). Инвазија Индоевропљана Азијата слистила је ову стару европску грану што мачем, што биолошким оружјем, нико није претекао. Једино наши преци што се склонише у шуме десно од Keiserslauterna. 

Не знам да ли су и остали узорци из Spreitenbach такође на овом нивоу. С обзиром на још једног очитаног L161 из Lingolsheima из 4600 г пне. сасвим могуће. Изгледа да је L161 била раније много присутнија у овом дијелу Европе, него што је то данас случај.

[drajver]

Узорак SX33 из Lingolsheima у Алзасу који се датира у 4600 пне означен је у раду као I2-M423>L161. Иако му позиција L161 није очитана, може се претпоставити да је L161+ јер је позитиван на S2660 и S2727, који се налазе на нивоу L161, а на које је негативно очитан MX188 из Spreitenbach. Ово би значило да је SX33:

I2-M423>L161>S2660/S2727

Нисам га провјеравао на остале позиције на нивоу L161, као ни на низводне гране.

Како год, ово показује већ значајну разноврсност гране на поменутом подручју: сјевер Швајцарске/Алзас.

[drajver]

Занимљиви су и аутосомални резултати и закључци из овог рада.

Из прегледа тестираних појединаца и учешћа степске генетике у њиховим резултатима, може се претпоставити кад су до подручја Швајцарске и Рајне стигли први "степски" дошљаци. То се десило око 2700 године пне, а први талас је свакако био повезан са Corded Ware који је долазио из правца Њемачке.

На овим тестрианим I2-M423>L161 се управо види тај прелаз. Старији узорак SX33 из Алзаса (Lingolsheim) нема степску аутосомалну компоненту, док је имају узорци из  Spreitenbach Швјацарска (датирани око 2500 г пне). Што ће рећи да је први додир Corded Ware и Old Europe ипак био такав да је дошло до генетичког мијешања, при чему се очувала мушка линија Old Europe. Ипак у неком каснијем периоду ове линије L161 су изумрле.

[filipi]

Ancient Y-DNA from Corded
War

https://drive.google.com/file/d/1rrfL3ZXEeFyGNggiM9hck7NiQEG4sP2e/view

[filipi]

https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB36529

Ancient genomes from present-day France unveil 7,000 years of its demographic history.

PER3123 Mesolithic I2a1b2
BERG157-7 Neolithic I2a1a2
BLP10 Neolithic I2~
BUCH2 Neolithic H2a
Es97-1 Neolithic I2a1a2
MDV248 Neolithic H2~
ROS102 Neolithic I2a1a2a
ROS45 Neolithic I2a1a2
ROS78 Neolithic I2a1a2a
Sch72-15 Neolithic C1
WET370 Neolithic H2~
PEI2 BellBeaker G2a2b2b1a1a
CBV95 BellBeaker R1b1a1b
BIS130 Bronze age R1b1a1b
EUG11 Bronze Age R1b1a1b
OBE3626-1 Bronze age R1b1a1b1a1
PIR3037AB Bronze age R1b1a1b
PIR3116B Bronze age R1b1a1b1a1a
PSS4170 Bronze age R1b1a1b1a1
QUIN58 Bronze age R1b1a1b
RIX15 Bronze age R1b1a1b1a1
RIX2 Bronze age R1b1a1b1a1a2
PECH5 Iron age R1b1a1b1a1
PECH8 Iron age R1b1a1b1a1
PEY163 Iron age R1b1a1b
BES1248 Iron Age I1

[Милан Петровић]

Да ли се зна у ком делу Француске је пронађен PER3123? То је L621?

[Сол]

до сада једини археогенетски налаз који се повезује са Галаћанима /Galatian Celts - Anatolia_IA_MA2197. 

http://eurogenes.blogspot.com/2018/10/a-closer-look-at-couple-of-ancients.html

[drajver]

Објављен је препринт рада који обрађује стару днк бронзаног доба са подручја Баната. Колико видим на овом што су објавили на Anthrogenici има разних грана I2a хаплогрупе, R1b и занимљиво и један J2b. Нисам детаљније гледао, не знам које су се номенкалтуре држали.

Уколико буду било објављених сирових резултата, покушаћу провјерити гране.

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.18.101337v1

Ово су објавили на Anthrogenici


Burial   Genetic Sex   Age   X-fold genomic depth   mt haplogr.   Y haplogr.   
122E   XY      6-9   1.09         U5a2b1a      I2a1b
122S   XX      35-50   0.78         H32      *
161   XX      9-11   1.20         H80      *
163   XY      45-55   1.21         U4a2      J2b
181   XX      >18   0.62         U4a2      *
186   XX      8-11   0.33         H1aj      *
211   XY      50-55   0.79         U5a2b1a      I2a1b
220   XY      15-25   0.64         T2b11      R1b1a2a2c1
223   XX      7-10   0.39         U3a1      *
224   XX      25-40   0.77         T2b      *
225   XY      25-35   0.82         J1b1a1      R1b1a2a2c1
228   XX      35-50   0.95         J1c      *
237   XX      15-20   0.89         T2b      *
243   XY      20-35   1.12         H      BT
246   XX      45-50   0.98         H80      *
247   XX      10-12   0.90         H1      *
257 A   XX      40-60   0.60         H      *
257 B   XY      inf.I   0.61         K1a4      R1b1a2a2c1a1
260   XY      15-18   0.92         J1c      I2a2a1a2a2
282   XY      15-20   1.41         H2b      BT
287   XX      20-35   0.81         U5b2a2c      *
288   XX      60+   0.81         HV0e      *
295   XY      15-20   0.82         H80      I2a1a
302   XX      20-35   0.89         J1c      *

[drajver]

Још један рад старе ДНК објављен везан за мезолит и неолит на подручју Француске и Њемачке. 101 узорак.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/629712

[drajver]

Објављен је препринт рада који обрађује стару днк бронзаног доба са подручја Баната. Колико видим на овом што су објавили на Anthrogenici има разних грана I2a хаплогрупе, R1b и занимљиво и један J2b. Нисам детаљније гледао, не знам које су се номенкалтуре држали.

Уколико буду било објављених сирових резултата, покушаћу провјерити гране.

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.18.101337v1

Ово су објавили на Anthrogenici


Burial   Genetic Sex   Age   X-fold genomic depth   mt haplogr.   Y haplogr.   
122E   XY      6-9   1.09         U5a2b1a      I2a1b
122S   XX      35-50   0.78         H32      *
161   XX      9-11   1.20         H80      *
163   XY      45-55   1.21         U4a2      J2b
181   XX      >18   0.62         U4a2      *
186   XX      8-11   0.33         H1aj      *
211   XY      50-55   0.79         U5a2b1a      I2a1b
220   XY      15-25   0.64         T2b11      R1b1a2a2c1
223   XX      7-10   0.39         U3a1      *
224   XX      25-40   0.77         T2b      *
225   XY      25-35   0.82         J1b1a1      R1b1a2a2c1
228   XX      35-50   0.95         J1c      *
237   XX      15-20   0.89         T2b      *
243   XY      20-35   1.12         H      BT
246   XX      45-50   0.98         H80      *
247   XX      10-12   0.90         H1      *
257 A   XX      40-60   0.60         H      *
257 B   XY      inf.I   0.61         K1a4      R1b1a2a2c1a1
260   XY      15-18   0.92         J1c      I2a2a1a2a2
282   XY      15-20   1.41         H2b      BT
287   XX      20-35   0.81         U5b2a2c      *
288   XX      60+   0.81         HV0e      *
295   XY      15-20   0.82         H80      I2a1a
302   XX      20-35   0.89         J1c      *

Колико видим, ово је рад иза ког стоји Лабораторија за биоархеологију Филозофског факултета у Београду. Зна ли се нешто више о овој лабораторији?

http://bioarchlab.org/projects/344-kinship-status-and-social-inequality-in-the-early-bronze-age-of-southeastern-europe-the-case-of-mokrin-necropolis

Поготово што видим да је у току неколико археогентичких пројеката из којих стоји и Министарство науке,али и неке иностране фондације

http://bioarchlab.org/projects

[Bane]

Објављен је препринт рада који обрађује стару днк бронзаног доба са подручја Баната. Колико видим на овом што су објавили на Anthrogenici има разних грана I2a хаплогрупе, R1b и занимљиво и један J2b. Нисам детаљније гледао, не знам које су се номенкалтуре држали.

Уколико буду било објављених сирових резултата, покушаћу провјерити гране.

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.18.101337v1

Опет без E-V13. 
Ситуација са древном E-V13 постаје помало бизарна. Нигде је нема.

[НиколаВук]

Колико видим, ово је рад иза ког стоји Лабораторија за биоархеологију Филозофског факултета у Београду. Зна ли се нешто више о овој лабораторији?

http://bioarchlab.org/projects/344-kinship-status-and-social-inequality-in-the-early-bronze-age-of-southeastern-europe-the-case-of-mokrin-necropolis

Поготово што видим да је у току неколико археогентичких пројеката из којих стоји и Министарство науке,али и неке иностране фондације

http://bioarchlab.org/projects

Било је о томе више речи на овој теми:

https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=679.msg129382#msg129382

На скупу Српског археолошког друштва који је 2019. године одржан у Неготину, од 30. маја до 01. јуна, је горепоменута Жегарац заједно са археологом Маријом Кречковић имала следеће излагање: "ДРЕВНА ДНК АНАЛИЗА ИНДИВИДУА САХРАЊЕНИХ НА РАНОБРОНЗАНОДОПСКОЈ НЕКРОПОЛИ У МОКРИНУ (2100–1800. ГОДИНА ПРЕ НОВЕ ЕРЕ)". Било би добро некако доћи до резултата ових истраживања и видети које врсте испитивања су рађене (аутосомална, Y-ДНК, мтДНК).

[НиколаВук]

Нисам детаљније гледао, не знам које су се номенкалтуре држали.

Рекао бих да је у питању најновија ISOGG номенклатура из 2019. године, где би I2a1b означавао СНП М436 (тј. некадашњи I2a2), док I2a1a означава P37.2 (тј. некадашњи I2a1).

[drajver]

Рекао бих да је у питању најновија ISOGG номенклатура из 2019. године, где би I2a1b означавао СНП М436 (тј. некадашњи I2a2), док I2a1a означава P37.2 (тј. некадашњи I2a1).

Могуће, међутим номенклатура за R1b им је прилично стара, из 2015. године, грана R1b1a2a2c1 би требала бити Z2109. У стаблу из 2019. године ове ознаке нема.

Једино ако су користили номенклатуре из различитих година за различите хаплогрупе, што би за један научни рад било прилично глупо.

Друга опција би била да су и ове ознаке I хаплогрупе из 2015. године, али онда би у I2a1b могли препознати М423.

Ускоро ће неко већ објавити комплетније податке, па ће се разјаснити.

[Bulajić]

Опет без E-V13. 
Ситуација са древном E-V13 постаје помало бизарна. Нигде је нема.

У бронзаном добу E-V13 још није долазио толико на север.