Аутор Тема: Пољаци  (Прочитано 6139 пута)

На мрежи Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5014
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: Пољаци
« Одговор #20 послато: Октобар 23, 2020, 10:42:00 пре подне »
По броју узорака (2075) значајан рад, по свему осталом приличан промашај. Не могу да схватим да у 2020. години нису били у стању да тестирају ниже гране I2a групе ни R1a, код Пољака најприсутнијих хаплогрупа.

Ураде анализу по регионима и оставе хаплогрупу I као јединствену хаплогрупу, као да су I1 и I2a-YP196 имале исту генетичку историју. Онда дају неку мршаву подјелу на ниже гране, али за читаву узорак Пољака, а не по регионима.

Може се претпоставити да је I2a-YP196 међу Пољацима на око 8-9%. Оно што ме је зачудило јесте присуство само два тестирана E-V13, што је мање од 0,1%. То ми не дјелује превише реално. Примјетио сам и један М205.

У наслову и уводу као да је акценат стављен на варијабилност хаплогрупа. У делу текста се може видети да су и целу R хаплогрупу сврстали као једну, па показују проценте у одређеним областима, где достижу негде и до 80%. Процентуално присуство и варијабилност немају везе једно са другим, па ми није јасна поента. 

Технологија која је коришћена је iScan, Illumina. Постоји NGS датабаза, али приступ подацима је ограничен. Могуће да је ипак рађена дубља анализа.

https://ega-archive.org/studies/EGAS00001004111

Ван мреже drajver

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2270
Одг: Пољаци
« Одговор #21 послато: Октобар 23, 2020, 11:26:00 пре подне »
У наслову и уводу као да је акценат стављен на варијабилност хаплогрупа. У делу текста се може видети да су и целу R хаплогрупу сврстали као једну, па показују проценте у одређеним областима, где достижу негде и до 80%. Процентуално присуство и варијабилност немају везе једно са другим, па ми није јасна поента. 

Технологија која је коришћена је iScan, Illumina. Постоји NGS датабаза, али приступ подацима је ограничен. Могуће да је ипак рађена дубља анализа.

https://ega-archive.org/studies/EGAS00001004111

Видио сам да за приступ подацима потребно одобрење. Нисам схватио да је рађен NGS, већ само SNP тестирање, нешто слично оном што ради 23andme.

Ван мреже Bane

  • Истраживач
  • *******
  • Поруке: 831
  • E-Z16988+BY99620+
Одг: Пољаци
« Одговор #22 послато: Октобар 23, 2020, 11:40:17 пре подне »
Има у supplementary material табела 6 (последња табела) прогноза мало нижих грана.
« Последња измена: Октобар 23, 2020, 11:41:55 пре подне Bane »

Ван мреже drajver

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2270
Одг: Пољаци
« Одговор #23 послато: Октобар 23, 2020, 12:07:40 поподне »
Има у supplementary material табела 6 (последња табела) прогноза мало нижих грана.

Табела 3 је најинформативнија, јер даје конкретне СНП-ове, али је проблем што нема подјеле по регионима да би се неки закључци могли изводити. Има само распоред нижих грана ( а и то донекле) за цијелу Пољску.

Ван мреже drajver

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2270
Одг: Пољаци
« Одговор #24 послато: Октобар 23, 2020, 03:14:57 поподне »
Карта распореда хаплогрупе I у Пољској из горе постављеног рада није баш информативна. Важнију информацију доносе зоне са ниским присуством, него оне са високим, јер не знамо који проценат отпада на I1, I2, и које гране I2 (пошто је поред Динарика присутна и L38 и M223 и M26). Међутим претпостављам да зоне високог присуства I хаплогрупе у источној Пољској, посебно крај око  Бјалистока који се наслања на Полесје (зона 25), источни дио Лублинске области (зона 33) и област Бескида(зона 12) ипак треба приписати Динарику.



По овој карти, хаплогрупа I, а самим тим и Динарик је слабо присутна на подручју Централне Пољске, Мазурије и неких сјеверозападних региона.

Ствари са географским распоредом хаплогрупа у Пољској додатно компликује и чињеница да је у Пољској послије Другог свјетског рата дошло до масовних пресељавања становништва, тако да се нека повезница са ранијим раздобљима на основу овакавих мапа тешко може успоставити.
« Последња измена: Октобар 23, 2020, 03:33:23 поподне drajver »

Ван мреже Акса

  • Косовци
  • Познавалац
  • *
  • Поруке: 622
Одг: Пољаци
« Одговор #25 послато: Новембар 15, 2020, 10:13:39 поподне »
Покушао сам да проучим ово велико пољско истраживање. Оваква врста СНП-тестирања није од никакве помоћи, паметније би им било да су користили предвиђаче. Све похвале за узорак и за тестирање које су спровели по свим војводствима.


C-M216   C-M130 =5 C1: 0.18
                     
E-M34 =2
E-M96 =3
E-V13 =2
E-M5389   E-M96 =97 E1: 3.84
Низводно од E-M5389  E-M96 су у великом броју припадници E1b-V13. Друге варијанте Е хаплогрупе су малобројне Е-М123, V22 и др., и претпостављам да су они E-M34 =2, E-M96 =3. Има их нешто можда и низводно од E-M5389  E-M96.
                 
G-L13 =5
G-L14 =2
G-L30 =1
G-L42 =1
G-P15 =22  G2a: 1.22
Хаплогрупа G2a према пољском ФТДНА пројекту је заступљена са L497 и ретким U1, M406 и другим гранама.

G-M342 =1  G1: 00.4

G-M377 =1  G2b: 00.4  
                                   
H-M282   H-P96 =1  H1: 00.4   

I-M170 =6  I: 0.22
Овде се ради можда о припадницима I2c-L596 или о неким веома ретким гранама I2a.
                                       
I-L22 =13
I-P109 =7
I-M253 =7
I-M72 =4
I-M307.2   I-M253 =6
I-L80   I-M253 =120  I1: 5.80

I-M26 =2
I-L38 =5   
I-M223 =20                                   
I-L460 =235  I2: 9.69
Низводно од I-L460 су у великом броју припадници I2-CTS10228. Како је СНП L460 предачки за све гране I2a, можда има низводно од L460 још припадника I2-M223 као и ретких грана: I2-L38, I2-M26, I2-L233 и др. 
                           
J-L24 =4
J-L70 =1
J-M67 =1
J-L27   J-L26 =9
J-M92 =13  J2a: 1.03
                                 
J-M172 =35  J2: 1.30
Овде се у великом броју ради о припадницима J2b-M241. Пошто је СНП M172 предачки и за J2a, можда има нешто сврстаних Ј2а хаплотипа под овим СНП-ом
                                       
J-M205 =1  J2b1: 00.4  
                                     
J-P58 =1                                     
J-M267 =22  J1: 0.85

NO-P193   NO-M214 =2  N: 00.8    
Нека веома ретка грана.
                                 
N-M178 =114  N1c: 4.21    
                           
O-P201 =1  O2a: 00.4   
                                   
Q-L214   Q-M378 =3  Q1b: 0.11 
                                   
Q-M25 =4    Q1a: 0.15 
                                   
R-M459 =1
R-P278.2 =1
R-M417 =1538  R1a: 56.93
Од чак 1540 хаплотипа, само су један успели да тестирају баш низводно, а то је P278.2. Овај СНП M459 би могао бити нека стара R1a. Гледајући пољске и друге пројекте у којима су учлањени Пољаци и националне мањине из Пољске, могу да се нађу и они који не припадају низводним гранама Z280 и M458, веома су ретки и рекао би да сви скупа чине 1 до 2%, а то су;  R-Z284, L664, Z283, Z282, PF6155, Z93, ови последњи су нешто мало више заступљенији, углавном пореклом Јевреји што се види из њихових имена и презимена.
                       
R-L20 =6
R-L21 =13
R-L48 =3
R-M269 =3
R-Z278 =2
R-P297 =1
R-U152 =4
R-L23 =119
R-P311 =230  R1b: 14.09   
Хаплогрупа R1b као што је познато највише је заступљена у Пољској са U106, U152, има Y14300 и друге гране.
           
T-L131 =2
T-M70 =3  T1a: 0.18 

Ван мреже Sergio

  • Памтиша
  • ********
  • Поруке: 1811
  • Y-DNA: I2-PH908>Y81557 | mtDNA: K1a-C150T
Одг: Пољаци
« Одговор #26 послато: Март 30, 2021, 11:48:23 пре подне »

Ван мреже Христифор

  • Шегрт
  • ***
  • Поруке: 71
Одг: Пољаци
« Одговор #27 послато: Април 28, 2021, 09:42:29 поподне »
Пољаци су 1945 изгубили исток, али добили запад и добар део Балтика.  Више него фер надокнада.

Ван мреже CosicZ

  • Члан Друштва
  • Писар
  • *****
  • Поруке: 291
  • Ђурђевдан Y:I1>P109>FGC22045 Панчево
Одг: Пољаци
« Одговор #28 послато: Јул 20, 2021, 06:45:45 пре подне »
‘The Thousand Polish Genomes Project’ - a national database of Polish variant allele frequencies
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.07.07.451425v1.full
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2021/07/09/2021.07.07.451425/F1.medium.gif
Цитат
The studied population consisted of participants recruited within the “Search for genomic markers predicting the severity of the response to COVID-19” project related to genetic predisposition to COVID-19 severity. Samples were collected from 1079 individuals of Polish origin between April 2020 and April 2021. The whole cohort comprises three groups: (1) 441 participants from the Central Clinical Hospital of the Ministry of Interior and Administration in Warsaw. Majority of them (391 out of 441) were patients suffering from COVID-19 caused by SARS-CoV-2 coronavirus, peripheral blood samples from this group were collected during hospitalization. (2) 608 individuals were self-enrolled volunteers for the project. Samples from this group were collected in blood collecting facilities from all over Poland. Almost all Polish local administrative units (15 out of 16 voivodeships) were represented (Figure 1). (3) 30 individuals were collected in the Multidisciplinary Municipal Hospital of Józef Struś in Poznań from patients suffering from COVID-19. The study participants were unrelated individuals (N=943) or families. Among participating families (N= 117) there were 69 trios, 12 quartets, 5 pairs of siblings and 31 families consisting of one parent and a child.

Цитат
Mitochondrial haplogroups
Using variant calls in the mitochondrial genome, we inferred haplogroups among the unrelated individuals. In 930 individuals with high quality haplogroup assignment the most abundant haplogroup was H with 410 (44.1%) representatives, U with 161 (17.3%), J with 92 (9.9%), and T with 83 (8.9%) individuals (Fig. 6). The largest H sub-haplogroup was H1 (N=128; 31.2% of the H haplogroup), and a similar number of individuals was divided between subclades H2, H5, H6 and H11 (N=116; together 28.3% of the H haplogroup). The second most abundant sub-haplogroup in the cohort was U5 with 98 (10.5%) individuals.

How to design a national genomic project—a systematic review of active projects
https://humgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40246-021-00315-6
https://media.springernature.com/full/springer-static/image/art%3A10.1186%2Fs40246-021-00315-6/MediaObjects/40246_2021_315_Fig2_HTML.png?as=webp


Dynasty and population of the Piast state in view of integrated historical, anthropological and genomic studies
https://www.researchgate.net/project/Dynasty-and-population-of-the-Piast-state-in-view-of-integrated-historical-anthropological-and-genomic-studies-2

Etnogeneza Słowian jako obszar badan interdysciplinarnych
https://www.researchgate.net/publication/347950319_Etnogeneza_Slowian_jako_obszar_badan_interdysciplinarnych

Goth migration induced changes in the matrilineal genetic structure of the central-east European population
https://www.researchgate.net/publication/332781862_Goth_migration_induced_changes_in_the_matrilineal_genetic_structure_of_the_central-east_European_population

ECBiG - European Center for Bioinformatics and Genomics: Genomic Map of Poland, the first step towards the creation of the Biomedicine System Center at ECBiG
https://www.researchgate.net/project/ECBiG-European-Center-for-Bioinformatics-and-Genomics-Genomic-Map-of-Poland-the-first-step-towards-the-creation-of-the-Biomedicine-System-Center-at-ECBiG
Цитат
Goal: The object of the project is to sequence at least 5000 genome of Poland inhabitants, create a multidimensional databse and construct the Polish reference genome for further use in biological and medical research.
https://ecbig.pl/
https://www.genompolski.pl/
https://ecbig.pl/page/publications/
https://newsbeezer.com/polandeng/a-genomic-map-of-poland-is-created-five-thousand-are-being-tested-poland/
Цитат
In December 2018 recruiting for the development of the so-called genome map of Poland, under which the genome of 5,000 people will be tested From Poland – Chairman of the DNA Research Center Jacek Wojciechowicz announced on Tuesday in a meeting with journalists in Warsaw

The Ancestors of Today's Poles with the Haplogroup R1a
https://www.researchgate.net/publication/352448476_The_Ancestors_of_Today%27s_Poles_with_the_Haplogroup_R1a

Ван мреже Kor

  • Члан Друштва
  • Истраживач
  • *****
  • Поруке: 969
  • реверзни инжињеринг историје
Одг: Пољаци
« Одговор #29 послато: Јул 28, 2021, 01:14:30 поподне »
Пољаци су 1945 изгубили исток, али добили запад и добар део Балтика.  Више него фер надокнада.
Ништа они нису изгубили 1945. То што су изгубили 1939. је у њихове руке је дошло 1920 а до тога је било у саставу Русије. Пре него што су се Пољаци појавили на простору Белорусије и Украјине те области су биле у саставу Руси. Становништво на том подручју је било православно али је под Пољацима покатоличено и поунијаћено. Крајем 18. века у Белорусији је живело по 40% католика и унијата и 10% Јевреја. Православних је било тек нешто више од 5%. Враћањем те територије под окриље Русије сви унијати и део католика  се враћа на православље, а у овом делу карте који је означен црвеном бојом је остао добар део католика. Данас их је у Белорусији око 15%. Они се изјашњавају као Белоруси али су сентиментом окренути према Пољској и не воле Русију. Немци су их хтели истребити али су им Руси покварили журку. Као парадокс данас имамо ситуацију да Пољаци много више воле Немце него Русе који су им дали гратис добар део немачке територије што се лепо види на карти.