Форум - Порекло

ДНК порекло => Aрхеологија и археогенетика => Тему започео: Kyrios Септембар 10, 2014, 04:34:57 поподне

Наслов: Древна ДНК
Порука од: Kyrios Септембар 10, 2014, 04:34:57 поподне
Ево једног веома занимљивог прегледног чланка, не сећам се да је до сада помињан:

Joseph Pickrell, David Reich, Towards a new history and geography of human genes informed by ancient DNA, bioRxiv first posted online March 21, 2014, the most recent version: doi: http://dx.doi.org/10.1101/003517

Има пуно занимљивих закључака, ево неколико њих који се тичу Европе:

"Ancient DNA studies have also revealed population turnover over shorter timescales (Bramanti et al., 2009; Brandt et al., 2013; Haak et al., 2005, 2010; Keller et al., 2012; Lazaridis et al., 2013; Malmström et al., 2009; Skoglund et al., 2012). A major debate in the last few decades among archaeologists and geneticists has been about whether the arrival of agriculture in Europe involved the spread of people or culture. Skoglund et al. (2012) addressed this controversy by analyzing genome-­‐ wide genetic data from Swedish hunter-­‐gatherer and agriculturalist populations that lived around 5,000 years ago. The farmer population appears most genetically similar to southern Europeans today, while the hunter-­‐gatherers are more similar to northern Europeans. Thus, at least in Scandinavia, the spread of agriculture was accompanied by the spread of people. Mitochondrial DNA studies have shown that such population turnovers accompanied the arrival of agriculture throughout Europe (Bramanti et al., 2009; Brandt et al., 2013; Haak et al., 2005, 2010).

The arrival of farmers was not the end of pre-­‐historic population turnover in Europe (and we do not even discuss here the turnovers that occurred in the few thousand years in Europe since the invention of writing; see Davies, 1998; Hellenthal et al., 2014; Moorjani et al., 2011; Ralph and Coop, 2013). The most notable study in this regard is the one of Brandt et al. (2013), which assembled mtDNA data from 364 human samples from archaeological cultures ranging from the early Neolithic to the Bronze Age from the same geographic area in Germany. This study documented discontinuity between people of early and late Neolithic cultures, with people of late Neolithic cultures bearing more relatedness to the present-­‐day populations of Eastern Europe and Russia than do people of early Neolithic cultures. Thus, major demographic turnover has happened at least twice over the course of the last eight thousand years of European prehistory. This makes inferences about the inhabitants of Europe tens of thousands of years ago based on the locations of people today unreliable."
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Kyrios Септембар 11, 2014, 08:46:37 пре подне
Рад Brandt et al. (2013) на који се позивају Pickrell & Reich анализиран је на Dienekes' Anthropology Blog - http://dienekes.blogspot.com/2013/10/ancient-central-european-mtdna-across.html

Ево графикона који је тамо дат и који врло јасно осликава дисконтинуитет mtDNA хаплогрупа у неолиту:

(http://4.bp.blogspot.com/-t_KXpJ8f80w/Ulbx5NVzpmI/AAAAAAAAJLE/4ygZg4byqIc/s640/timeline.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Септембар 11, 2014, 09:20:42 пре подне
Ево једног веома занимљивог прегледног чланка, не сећам се да је до сада помињан:

Joseph Pickrell, David Reich, Towards a new history and geography of human genes informed by ancient DNA, bioRxiv first posted online March 21, 2014, the most recent version: doi: http://dx.doi.org/10.1101/003517

Има пуно занимљивих закључака, ево неколико њих који се тичу Европе:

"Ancient DNA studies have also revealed population turnover over shorter timescales (Bramanti et al., 2009; Brandt et al., 2013; Haak et al., 2005, 2010; Keller et al., 2012; Lazaridis et al., 2013; Malmström et al., 2009; Skoglund et al., 2012). A major debate in the last few decades among archaeologists and geneticists has been about whether the arrival of agriculture in Europe involved the spread of people or culture. Skoglund et al. (2012) addressed this controversy by analyzing genome-­‐ wide genetic data from Swedish hunter-­‐gatherer and agriculturalist populations that lived around 5,000 years ago. The farmer population appears most genetically similar to southern Europeans today, while the hunter-­‐gatherers are more similar to northern Europeans. Thus, at least in Scandinavia, the spread of agriculture was accompanied by the spread of people. Mitochondrial DNA studies have shown that such population turnovers accompanied the arrival of agriculture throughout Europe (Bramanti et al., 2009; Brandt et al., 2013; Haak et al., 2005, 2010).

The arrival of farmers was not the end of pre-­‐historic population turnover in Europe (and we do not even discuss here the turnovers that occurred in the few thousand years in Europe since the invention of writing; see Davies, 1998; Hellenthal et al., 2014; Moorjani et al., 2011; Ralph and Coop, 2013). The most notable study in this regard is the one of Brandt et al. (2013), which assembled mtDNA data from 364 human samples from archaeological cultures ranging from the early Neolithic to the Bronze Age from the same geographic area in Germany. This study documented discontinuity between people of early and late Neolithic cultures, with people of late Neolithic cultures bearing more relatedness to the present-­‐day populations of Eastern Europe and Russia than do people of early Neolithic cultures. Thus, major demographic turnover has happened at least twice over the course of the last eight thousand years of European prehistory. This makes inferences about the inhabitants of Europe tens of thousands of years ago based on the locations of people today unreliable."

Ова три велика таласа насељавања Европе, чини ми се да су прилично добро подупрта доказима. Искључујући неке новије миграције, имамо три основне групације: палеолитске ловце сакупљаче, неолитске землљораднике и индоевропске сточаре.

Ако бисмо односе унутар Y-днк пренијели на односе укупне днк, онда бисмо за данашње Србе могли рећи да су:

40% палеолитски ловци сакупљачи
30% индоевропски сточари
25% неолитски земљорадници
5% остали
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Đorđo Септембар 12, 2014, 10:43:22 пре подне
Another upcoming ancient DNA paper.

Insights into British and European population history from ancient DNA sequencing of Iron Age and Anglo-Saxon samples from Hinxton, England. S. Schiffels, W. Haak, B. Llamas, E. Popescu, L. Loe, R. Clarke, A. Lyons, P. Paajanen, D. Sayer, R. Mortimer, C. Tyler-Smith, A. Cooper, R. Durbin.
British population history is shaped by a complex series of repeated immigration periods and associated changes in population structure. It is an open question however, to what extent each of these changes is reflected in the genetic ancestry of the current British population. Here we use ancient DNA sequencing to help address that question. We present whole genome sequences generated from five individuals that were found in archaeological excavations at the Wellcome Trust Genome Campus near Cambridge (UK), two of which are dated to around 2,000 years before present (Iron Age), and three to around 1,300 years before present (Anglo-Saxon period). Good preservation status allowed us to generate one high coverage sequence (12x) from an Iron Age individual, and four low coverage sequences (1x-4x) from the other samples. By providing the first ancient whole genome sequences from Britain, we get a unique picture of the ancestral populations in Britain before and after the Anglo-Saxon immigrations. We use modern genetic reference panels such as the 1000 Genomes Project to examine the relationship of these ancient samples with present day population genetic data. Results from principal component analysis suggest that all samples fall consistently within the broader Northern European context, which is also consistent with mtDNA haplogroups. In addition, we obtain a finer structural genetic classification from rare genetic variants and haplotype based methods such as FineStructure. Reflecting more recent genetic ancestry, results from these methods suggest significant differences between the Iron Age and the Anglo-Saxon period samples when compared to other European samples. We find in particular that while the Anglo-Saxon samples resemble more closely the modern British population than the earlier samples, the Iron Age samples share more low frequency variation than the later ones with present day samples from southern Europe, in particular Spain (1000GP IBS). In addition the Anglo-Saxon period samples appear to share a stronger older component with Finnish (1000GP FIN) individuals. Our findings help characterize the ancestral European populations involved in major European migration movements into Britain in the last 2,000 years and thus provide more insights into the genetic history of people in northern Europe.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Окир СРБ Октобар 21, 2014, 10:17:57 поподне
http://www.nature.com/ncomms/2014/141021/ncomms6257/fig_tab/ncomms6257_T1.html

Колико видим пронађене су Y хаплогрупе I2a, J2a1, N и C6.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Октобар 22, 2014, 08:21:28 пре подне
http://www.nature.com/ncomms/2014/141021/ncomms6257/fig_tab/ncomms6257_T1.html

Колико видим пронађене су Y хаплогрупе I2a, J2a1, N и C6.

Видим да у Мађарској интензивно настављају са анализом старе ДНК.

I2a ништа неочекивано, преживјели ловци сакупљачи одржали су се у и у неолитским културама на нашем простору.

C6 V20 европска грана хаплогрупе C која је представљала велико изненађење када је откривена на мезолитском налазишту Ла Брана у Шпанији, сад је пронађена и на неолитском налазишту у Мађарској. Ово су заиста добри кандидати за најстарију европску популацију хомо сапиенса, јер је познато да је хаплогрупа C прва изашла из Африке и дошла чак до далеке Аустралије. Да ли је једна грана (C6 V20) том приликом дошла у Европу? Пос вему судећи јесте. Данас је ова грана хаплогрупе C присутна само код Европљана у веома малом проценту.

Ј2а1- први налаз хаплогрупе Ј у старој ДНК у Европи, међутим прилично касно у Бронзаном добу 1200 пне у Кјатице култури у Словачкој. Треба провјерити везе ове културе па видјети да ли је ова Ј2а могла да дође са Р1а или Р1б популацијом.

N- нађена као дио Mezőcsát Culture. Колико сма видио ова култура је култура неке групе степских дошљака са истока (800 пне). Дали је међу њима било и неких уралских народа. Сасвим могуће. Било би добро да знамо детаљнији СНП овог N. Грана N P189 присутна код нас је такође карактеристична само за Европу и удаљена је од свих осталих N. Питам се да ли постоји каква веза између N P189 и овог налаза у Мађарској.

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Октобар 22, 2014, 11:30:42 пре подне
Имамо 6 тестираних појединаца на y хромозому на територији Мађарске из различитих праисторијских епоха. Занимљиво је са којим се данашњим популацијама подударају у аутосомалном резултату, као и каква им је генетски претпостављена боја косе и очију:

КО1 мезолит-неолит I2a- нема блиских данашњих популација- црна тамна коса, плаве очи
NE5 неолит C6- данашње становништво Сардиније- тамно до свјетло смеђа коса, смеђе очи
NE6 неолит C6- данашње становништво Сардиније- тамно до свјетло смеђа коса, очи прелазне боје
NE7 неолит I2a- данашње становништво Сардиније- свјетло смеђа до тамно плава коса, плаве очи
BR2 касно бронзано доба J2a1- данашње становништво Француске- тамно до свјетло смеђа коса, смеђе очи
IR1 жељезно доба N-данашње становништво Јерменије и Грузије- свјетло смеђа до тамно плава коса, смеђе очи
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Октобар 22, 2014, 12:17:58 поподне


Ј2а1- први налаз хаплогрупе Ј у старој ДНК у Европи, међутим прилично касно у Бронзаном добу 1200 пне у Кјатице култури у Словачкој. Треба провјерити везе ове културе па видјети да ли је ова Ј2а могла да дође са Р1а или Р1б популацијом.


Култура Kјатице у западној Словачкој регионална је варијанта културе Урнфилд или културе поља урни Централна Европе. Ову културу неки истраживачи дефинишу као прото Келтску. Ако узмемо у обзир да је анализирани Ј2a1 у Мађарској аутосомално близак данашњој популацији Француске, мислим да је реално претпоставити да је Ј2а1 дошла у Европу заједно са R1b Бел Беакер.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Sirius Октобар 22, 2014, 12:23:45 поподне
Ј2а1- први налаз хаплогрупе Ј у старој ДНК у Европи, међутим прилично касно у Бронзаном добу 1200 пне у Кјатице култури у Словачкој. Треба провјерити везе ове културе па видјети да ли је ова Ј2а могла да дође са Р1а или Р1б популацијом.

Zaključak saznanja od prije petnaestak dana:
The main conclusion of all the Hypotheses is that J2a did not reach the Eastern Mediterranean area before the Bronze Age, maybe even not before the Iron Age (1,200 BC). http://j2-m172.info/2014/10/ancient-y-dna-discussion-no-j2a-in-pre-antiquity-europe/ (http://j2-m172.info/2014/10/ancient-y-dna-discussion-no-j2a-in-pre-antiquity-europe/)
Misli se na bliskoistočno Sredozemlje.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Октобар 22, 2014, 12:56:39 поподне

N- нађена као дио Mezőcsát Culture. Колико сма видио ова култура је култура неке групе степских дошљака са истока (800 пне). Дали је међу њима било и неких уралских народа. Сасвим могуће. Било би добро да знамо детаљнији СНП овог N. Грана N P189 присутна код нас је такође карактеристична само за Европу и удаљена је од свих осталих N. Питам се да ли постоји каква веза између N P189 и овог налаза у Мађарској.

Сад читам неке коментаре који сматрају да је за овај налаз пермутована y i mtdna хаплогрупа, односно да тестирани није N већ G2a1 по y хромозому. Наиме у додатном материјалу наведено је да му је МТДНА=G2a1, а Y dnk= N. Са друге стране у текстуалном дијелу се каже:
"This result, supported by mtDNA and Y-chromosome haplogroups (N and G2a1, respectively, both with Asian affinities) suggests genomic influences from the East. "

Исто тако аутосомални резултати показују да се овај узорак поклапа најбоље са данашњом популацијом Јерменије и Грузије, што би опет боље одговарало хаплогрупи G2a1 за хаплогрупе на Y хромозому него N.

Видјећемо, ваљда ће се разјаснити.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Октобар 22, 2014, 01:16:01 поподне
Култура Kјатице у западној Словачкој регионална је варијанта културе Урнфилд или културе поља урни Централна Европе. Ову културу неки истраживачи дефинишу као прото Келтску. Ако узмемо у обзир да је анализирани Ј2a1 у Мађарској аутосомално близак данашњој популацији Француске, мислим да је реално претпоставити да је Ј2а1 дошла у Европу заједно са R1b Бел Беакер.

The Bell Beaker people were probably the first intrusive brachycephals to enter the Austrian Alps, and the mountains of northeastern Bohemia, for the push of Lake Dwelling Alpines southeastward toward the Balkans happened later in the Bronze Age. It is, therefore, possible that the present Dinaric populations of the Dinaric Alps and the Carpathians may be derived in part from this eastward irvasion. The small numbers and scattered burial habits of the Bell Beaker people on the more densely populated plains of Europe must have made them of much less ethnic importance there than in the mountains.

C. S. Coon: "The Copper Age in Europe North of the Mediterranean Lands: Danubian Movements and Bell Beakers"

Можда су у овим крајевима Словени апсорбовали Bell Beaker остатке. Међутим, сасвим је могуће да су ови други пренели на неке Словене динарски тип, па су вероватно I2a на Балкан дошли делимично динаризовани. Термин "I2a Dinaric South" би тако имао више смисла. :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Октобар 22, 2014, 01:24:30 поподне
Сад читам неке коментаре који сматрају да је за овај налаз пермутована y i mtdna хаплогрупа, односно да тестирани није N већ G2a1 по y хромозому. Наиме у додатном материјалу наведено је да му је МТДНА=G2a1, а Y dnk= N. Са друге стране у текстуалном дијелу се каже:
"This result, supported by mtDNA and Y-chromosome haplogroups (N and G2a1, respectively, both with Asian affinities) suggests genomic influences from the East. "

Исто тако аутосомални резултати показују да се овај узорак поклапа најбоље са данашњом популацијом Јерменије и Грузије, што би опет боље одговарало хаплогрупи G2a1 за хаплогрупе на Y хромозому него N.

Видјећемо, ваљда ће се разјаснити.

Изгледа да је ипак N.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Октобар 22, 2014, 01:34:29 поподне
Комплетан текст са прилозима имате овдје http://www.nature.com/ncomms/2014/141021/ncomms6257/full/ncomms6257.html#supplementary-information
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Октобар 23, 2014, 10:28:23 поподне
Нешто су учестали са древном днк у посљедње вријеме. Колико видим у ово истраживање су били укључен и Руси и Кинези и Американци и сви остали. Oво је уједно најстарија досад испитана древна днк. Ради се о палеолитском Евроазијцу са Алтаја којем су успјели издвојити чак и y-днк. Не прочитах детаљно рад. Само видим да је овај човјек, стар 45 000 година, припадао хаплогрупи К(xLT) M526. Ово је иначе период кад још није ни постојала R хаплогрупа.

Овај резултат је дакле "предачки" за хаплогрупе M, N, Q, О, P, R i S.

Честитам нашим Р-овима (Р1а и р1б) ,Н-овима и Q-овима. Побили су све рекорде хаплогрупе I.

http://www.nature.com/nature/journal/v514/n7523/full/nature13810.html
http://www.nature.com/nature/journal/v514/n7523/extref/nature13810-s1.pdf
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Đorđo Октобар 24, 2014, 01:01:26 поподне
Изгледа да је ипак N.
na eupedijinom forumu neki čovek je napisao :

IR1 in Iron Age Hungary was N1a, he have these snps of haplogroup N1a tested
Y6503+, Y6511+, Y6559+, Y6560+, Y6561+, Y6562+, Y6564+, Y6566+, Y6470+, Y6482+, Y6494+, Y6515+, Y6518+, Y6521+, Y6523+, Y6525+, Y6536+, Y6537+, Y6541+, Y6542+, Y6543+, Y6544+, Y6546+, Y6548+, Y6549+, Y6553+, Y6557+, Y6569+, Y6570+, Y6571+, Y6572+, Y6576+, Y6577+, Y6586+, Y6587+, Y6589+
P189-, Y6466-, Y6498-, Y6504-, Y6505-, Y6508-, Y6509-, Y6512-, Y6565-, Y6468-, Y6471-, Y6473-, Y6476-, Y6478-, Y6481-, Y6486-, Y6488-, Y6514-, Y6522-, Y6528-, Y6533-, Y6539-, Y6540-, Y6550-, Y6551-, Y6556-, Y6558-, Y6573-, Y6580-, Y6581-, Y6583-
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Александар Невски Новембар 06, 2014, 08:33:56 поподне
BR2 касно бронзано доба J2a1- данашње становништво Француске- тамно до свјетло смеђа коса, смеђе очи

Йуче од нашега човѣка добих обавѣштење да йе Felix Chandrakumar на мрежу поставио податке Бр2 узорка из Мађарске, од око тисушту годин прѣ Христа, у ФТДНА облику.
http://www.fc.id.au/2014/11/analysis-of-hungarian-bronze-age-genome.html

Скидох их, и срачунах неколике рачуначе и намазах хромозоме. И ево исходъ.
К7б, прво мазање хромозомов, па онда и рачунач.

(http://s30.postimg.org/pul96voyp/BR2_K7b_N_250.png)

У другом стубцу су за поређење подаци просѣчна Мађара из збирке Бехара.
Atlantic_Baltic:     69.9041%  69.2%
Southern:      19.5065%         14.7%
West_Asian:   10.1055%         14.5%
African:      0.4819%            0%
South_Asian:      0.0016%    0.1%
Siberian:      0.0004%             1.5%
East_Asian:      0.0001%     0.1%

Примѣтно йе на овом рачуначу да Бр2 од данашњих Мађаръ више вуче ка Западному Срѣдоземљу, а мање ка Западной Азийи.


А сада рачунач К12б, на слици йе приказан поравнато.

(http://s30.postimg.org/s0oqsv76p/BR2_K12b_N_250_poravnato.png)

North_European:      41.6621%          48.4%
Atlantic_Med:      36.2882%  27%
Caucasus:      16.5732%    16.2%
Southwest_Asian:      3.4698%     3%
Gedrosia:      1.1421%                 4.1%
Sub_Saharan:      0.4573%       0%
Northwest_African:      0.4072%   0%
East_African:      0.0000%   0%
South_Asian:      0.0000%    0.3%
Siberian:      0.0000%   0.7%
Southeast_Asian:      0.0000%  0%
East_Asian:      0.0000%      0.3%

Примѣтно йе да Бр2 има знатно мање генетике Сѣверне Европе од данашњих становникъ Мађарске, али да утолико има више генетике Йугозападне Европе. Видљиво йе да данашњи Мађари имайу значайно више Сибира и Источне Азийе него ли Бр2, не само на овом него на свих рачуначих.

И на крайу рачунач ВВеац2.

(http://s2.postimg.org/t64o61l2h/BR2_Weac2_N_250.png)

Atlantic_Baltic :      74.8257%   74.7%
Near_East :      23.8978%      20.4%
Sub_Saharan :      0.8079%       0%
South_Asian :      0.4678%     3.3%
Northeast_Asian :      0.0006%    1.6%
Palaeoafrican :      0.0001%      0%
Southeast_Asian :      0.0001%      0%

На свих рачуначих йе примѣтно веће учешће Йужне Азийе у Мађаръ него ли у Бр2-а.

У слѣдећем ПОС прорачуну ћу свакако срачунати и Бр2 као и Лошбура и вѣроватно йош неке старе узорке.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Александар Невски Новембар 06, 2014, 09:06:48 поподне
А ово йе Лошбур, древни узорак ловца-сакупљача из Луксембурга, од прѣ доласка Индоевропљана. Процѣњен на око 6 тисушт година прѣ Христа. Ако се ико може назвати "чистим Европљанином", то йе он.

http://www.fc.id.au/2014/10/loschbour-ancient-dna-matches-living.html

К7б

(http://s4.postimg.org/rqgb6uf31/Loschbour_K7b_N_250.png)

Atlantic_Baltic:      98.7186%
Siberian:      0.6160%
African:      0.3470%
East_Asian:      0.3078%
South_Asian:      0.0105%
Southern:      0.0000%
West_Asian:      -0.0000%


К12б, поравнат.

(http://s28.postimg.org/rixbnahct/Loschbour_K12b_N_250_poravnat.png)

North_European:      68.8688%
Atlantic_Med:      30.5947%
East_Asian:      0.3049%
Sub_Saharan:      0.2029%
Southeast_Asian:      0.0287%
Siberian:      0.0000%
Caucasus:      0.0000%
South_Asian:      0.0000%
Gedrosia:      0.0000%
Southwest_Asian:      0.0000%
East_African:      0.0000%
Northwest_African:      -0.0000%

ВВеац 2

(http://s30.postimg.org/59yk2al5t/Loschbour_Weac2_N_250.png)

Atlantic_Baltic :      98.8338%
Southeast_Asian :      0.8348%
Sub_Saharan :      0.3283%
Northeast_Asian :      0.0031%
Palaeoafrican :      0.0000%
South_Asian :      0.0000%
Near_East :      0.0000%

Можемо упоредити Лошбура са узорком из Норвешке. Очигледно йе колико и данашњи "найчистийи" Европљани имайу изворно неевропске генетике.

(http://s27.postimg.org/jywf9qh8z/Norwegian11_Weac2_Sh_250.png)

Atlantic_Baltic :      81.7202%
Near_East :      12.9268%
South_Asian :      3.8911%
Northeast_Asian :      1.4613%
Southeast_Asian :      0.0006%
Palaeoafrican :      0.0000%
Sub_Saharan :      0.0000%
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Новембар 08, 2014, 08:30:25 пре подне
Невски, баш сам се скоро питао да ли је ико стару ДНК "провлачио" кроз рачуначе, тј. интересовало ме је колико је палеолитског човјека остало данас у нама. Ако правилно схватам Атлантик-Балтик је јасан удио палеолитског Европљанина у нама. Преко свог Гедмеч налога урадио сам К7б анализу и ево резултата:

(http://s18.postimg.org/v5t1l4ruh/procenti.jpg)

Као што се види, од Лошбура до мене, смањивао се проценат Атлантик-Балтика што је и логично, иако носимо исту Y dna хаплогрупу.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Муњени Ћелић Новембар 08, 2014, 08:55:15 пре подне
Мој прилог:)
(https://lh6.googleusercontent.com/-b6crDclbmhQ/VKXODCsUusI/AAAAAAAAAJc/SKuPH87pSa8/w892-h581-no/Gedmatch%2BDodecad%2BK7b.jpg)

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Новембар 08, 2014, 09:06:14 пре подне
Мој прилог:)

Очекивао сам мало више Атлантик-Балтик од Викинга :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Муњени Ћелић Новембар 08, 2014, 09:10:31 пре подне
Очекивао сам мало више Атлантик-Балтик од Викинга :)

Жене нас искварише  ;D
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Александар Невски Новембар 08, 2014, 11:41:19 пре подне
А ово йе ЛБК Штутгарт, земљорадница од прѣ око 7,5 тисушт година из Нѣмачке. Сушта супротност Лошбуру, очигледно с прѣовлађуйућом генетиком Блискога Истока, али и уз знатно учешће генетике Йугозападне Европе. Генетика Сѣверне Европе (чак и у данашњих Срба прѣовлађуйућа) се у ње може наћи само  у траговах. Генетике Блискога Истока има знатно више него ли и у Гркъ, йедино су Йужни Италияни можда упоредиви са њом по том, мада се они доста разликуйу од ње по распореду европских генетика.
http://dienekes.blogspot.com/2013/12/europeans-neolithic-farmers-mesolithic.html

И ето одговора Ацу зашто се ми толико разликуйемо од старих европских ловаца сакупљачъ. Овакве не "искварише"  :D. И стари Европљани су попут Балашевића "хтѣли йедну малу гараву". http://www.youtube.com/v/i12AfsVLjp0 (http://www.youtube.com/v/i12AfsVLjp0)
Шалу на страну, читах негдѣ да се сматра да йе Штутгартица била свѣтлия тена од Лошбура.

К7б

(http://s27.postimg.org/90yr52jr7/LBK_Stutgart_K7b_N_250.png)

Southern:      51.2592%
Atlantic_Baltic:      44.0316%
West_Asian:      4.5433%
African:      0.1657%
East_Asian:      0.0002%
South_Asian:      0.0000%
Siberian:      0.0000%


К12б

(http://s21.postimg.org/qaj1d2zw7/LBK_Stutgart_K12b_N_250.png)

Atlantic_Med:      54.8900%
Caucasus:      30.2706%
Southwest_Asian:      10.7944%
Northwest_African:      3.7844%
North_European:      0.1995%
Southeast_Asian:      0.0612%
East_Asian:      0.0000%
South_Asian:      0.0000%
Sub_Saharan:      0.0000%
Siberian:      -0.0000%
Gedrosia:      -0.0000%
East_African:      -0.0000%

ВВеац2

(http://s13.postimg.org/atcy81jfr/LBK_Stutgart_Weac2_N_250.png)

Near_East :      56.5007%
Atlantic_Baltic :      43.0782%
Sub_Saharan :      0.4089%
Palaeoafrican :      0.0120%
Southeast_Asian :      0.0001%
Northeast_Asian :      0.0000%
South_Asian :      0.0000%
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Александар Невски Новембар 08, 2014, 11:56:16 пре подне
А ово йе Мотала 12, из Шведске, од прѣ около 7 тисушт година. Йош йедан чист Европљанин. Доста йе сличан Лошбуру, йедино што има нешто више генетике Сѣверне Европе од њега.

К7б

(http://s18.postimg.org/rp68kl0qh/Motala_12_K7b_N_250.png)

Atlantic_Baltic:      98.2714%
Siberian:      1.6850%
African:      0.0433%
East_Asian:      0.0002%
South_Asian:      0.0001%
West_Asian:      0.0000%
Southern:      0.0000%


К12б

(http://s12.postimg.org/46td1r6gd/Motala_12_K12b_N_250.png)

North_European:      86.2076%
Atlantic_Med:      12.7883%
Siberian:      0.9354%
Northwest_African:      0.0641%
Southeast_Asian:      0.0046%
East_Asian:      0.0000%
Sub_Saharan:      0.0000%
South_Asian:      0.0000%
Gedrosia:      0.0000%
East_African:      0.0000%
Southwest_Asian:      0.0000%
Caucasus:      0.0000%

ВВеац2

(http://s29.postimg.org/pmgo70vjb/Motala_12_Weac2_N_250.png)

Atlantic_Baltic :      98.0572%
Northeast_Asian :      1.8748%
Palaeoafrican :      0.0677%
Sub_Saharan :      0.0003%
Southeast_Asian :      0.0000%
South_Asian :      0.0000%
Near_East :      0.0000%
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Новембар 08, 2014, 06:57:30 поподне
Невски, да ли би могли групе унутар К7б да повежемо са три таласа насељавања Европе о којем се у скорије вријеме говори:

палеолитски ловци сакупљачи= Atlantic Baltic
неолитски земљорадници= Southern
Индоевропљани= West Asien

Иначе видим да се у аутосомалним прорачунима за поменуте популације спомињу Литванци као најизразитији представници палолитских ловаца сакупљача, а Сардињани као најтипичнији представници неолитских земљорадника.

Ако је ово горе тачно, онда би то значило да, без обзира што хаплогрупе R1a i R1b доминирају у данашњим европским очинским линијама, у аутосомалној днк представљају мањину.



Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Đorđo Новембар 08, 2014, 07:54:22 поподне
Невски, да ли би могли групе унутар К7б да повежемо са три таласа насељавања Европе о којем се у скорије вријеме говори:

палеолитски ловци сакупљачи= Atlantic Baltic
неолитски земљорадници= Southern
Индоевропљани= West Asien

Иначе видим да се у аутосомалним прорачунима за поменуте популације спомињу Литванци као најизразитији представници палолитских ловаца сакупљача, а Сардињани као најтипичнији представници неолитских земљорадника.

Ако је ово горе тачно, онда би то значило да, без обзира што хаплогрупе R1a i R1b доминирају у данашњим европским очинским линијама, у аутосомалној днк представљају мањину.
tako ispada, ali to je meni protivrečno, ne znam kako vama
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Александар Невски Новембар 08, 2014, 08:32:16 поподне
Невски, да ли би могли групе унутар К7б да повежемо са три таласа насељавања Европе о којем се у скорије вријеме говори:

палеолитски ловци сакупљачи= Atlantic Baltic
неолитски земљорадници= Southern
Индоевропљани= West Asien

Иначе видим да се у аутосомалним прорачунима за поменуте популације спомињу Литванци као најизразитији представници палолитских ловаца сакупљача, а Сардињани као најтипичнији представници неолитских земљорадника.

Атлантик-Балтик йе спой Сѣверне и Йугозападне Европе, а за другу ми се чини да йе нешто између Сѣверне Европе и Блискога Истока.
Мени се чини да йе генетика древних европских ловаца-сакупљачъ найближа генетици данашње Сѣверне Европе. Док бих рекао да йе генетика древних Индоевропљана одговорна за  знатан дѣо данашње западноазийске генетике у Европи.

Ако је ово горе тачно, онда би то значило да, без обзира што хаплогрупе R1a i R1b доминирају у данашњим европским очинским линијама, у аутосомалној днк представљају мањину.

Мислим да си у праву. Тако се и мени чини.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Новембар 08, 2014, 08:58:47 поподне
Ако су дошљаци R1 "истребили" староседеоце I и E групе, а потом се и мешали са њиховим женама, ово има логике. Зато у Италији и Шпанији имамо пуно R1b, али сам сигуран да би у аутосомалном прорачуну видели значајно присуство југа.

Слично је у централној и западној Европи. Најзаступљенија хаплогрупа је R1, а видимо да аутосомални рез. показују да доминира генетика ловаца сакупљача, док је генетика западне Азије присутна у веома малом проценту.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Новембар 08, 2014, 09:27:12 поподне
Сетих се речи Милоша Богдановића да Y хромозом заправо не даје реалну слику о пореклу једног народа, постоји ту више фактора. Ацо је помињао већ на форуму да је битна и mtDNA.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Александар Невски Новембар 09, 2014, 11:27:23 пре подне
Ако су дошљаци R1 "истребили" староседеоце I и E групе, а потом се и мешали са њиховим женама, ово има логике. Зато у Италији и Шпанији имамо пуно R1b, али сам сигуран да би у аутосомалном прорачуну видели значајно присуство југа.

Слично је у централној и западној Европи. Најзаступљенија хаплогрупа је R1, а видимо да аутосомални рез. показују да доминира генетика ловаца сакупљача, док је генетика западне Азије присутна у веома малом проценту.

Мислим да се то добро види не само у случайу лоз Р1 него и финске Н1ц. Напрѣднийи припадници лоза Р1 и Н стижу на нова боравишта, брзо покоравайу неразвийене камено-добске старосѣдеоце атланто-балтичке генетике и као плѣн узимайу их жене. Слична ствар се догађа и у наредних колѣнах, сада већ генетски смѣшани, али опет Р1-овци и Н1ц-овци иду даље, осваяйу нова подручя од дивљакъ. И наравно, опет узимайу их жене, што доводи до даљега повећања атланто-балтичке генетике у њих, и до смањења изворних општих генетика их лозъ. И тако се за прилично кратко врѣме може догодити да мушка лоза остане, али се општагенетика  промѣни.  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Đorđo Новембар 09, 2014, 12:52:43 поподне
Moje mišljenje je da su Arijevici u vreme najezde na Evropu bili mnogoženci i da to lepo objašnjava neke stvari. Nisu bili mnogo brojni ali su se mnogoženstvom brzo namnožili i potisnuli starince. Žene su uglavnom otimali od starinaca i zato imamo diskontinuitet u y-dna a kontinuitet u mtdna i autosomalnoj.

P.s. Kod nekih IE naroda pa i kod Srba sačuvan je običaj (doduše iscenirane) otmice mlade pre venčanja. To je izgleda samo eho prakse iz davnina kada su žene stvarno bile otimane
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Александар Невски Јануар 01, 2015, 10:42:53 пре подне
Прво хоћу свим члановом и читатељемъ нашега разговаралишта пожелѣти срећну Нову годину, и пуно здравља. И наравно, пуно нових исходъ са Ы - хромозома. :-) И подразумева се, што йе могуће више ћирилице у наших животах.

А сада новина у найновийем ПОС прорачуну: по први пут укључих у прорачун доступне древне узорке, захваљуйући раду Феликса Чандракумара, прилагодившега их општенаслѣдне податке за ширу употрѣбу.
На осах 1-3 ПОС прорачуна Европе са Блиским Истоком се налазе: Лошбур (заокружен црвеним), Штутгарт(ица) (заокружена наранџастим), НЕ1 (бледо љубичастим), и БР1 (заокружен зеленим).
Имам йош нешто древних узорака (Мотала 12, йош неколики "Мађари", "Хинкстони" из келтске Британийе, Костенки 14 ...), али их нѣсам укључио у прорачун йер имайу знатно мање ПЙР-ова од броя мноме коришћенога. ПОС йе прилично осѣтљив на велике разлике у бройу улазних података, па то може знатно искривити добийене исходе.

(http://s12.postimg.org/omycwecu5/Evropa_sa_Bliskim_Istokom_2_1_Drevni_uzorci.png)

(http://s10.postimg.org/fme1wsyvd/Evropa_sa_Bliskim_Istokom_1_3_Drevni_uzorci.png)

Лошбур йе древни узорак ловца-сакупљача из Луксембурга, процѣњен на око 6 тисушт година прѣ Христа. видимо да он на осах 1 и 2 бѣжи далеко од свих данашњих Европљана.  А ипак прорачуни измѣшаности веле да йе он чист Европљанин, готово 100% Атлантик-Балтик. То ранийе стављах овдѣ.

Штутгартица йе земљорадница процѣњена на око 5.5 тисушт година прѣ Христа, и као што йой име каже, она йе из Штутгарта из Нѣмачке (гдѣ су сада домаћи "Вуковци" да ме исправе и кажу како трѣба "ШтуДГарт" а не "ШтуТГарт", због "правила йедначења по звучности"?).
НЕ1 йе млађе-камено-добски узорак земљорадника, из данашње Мађарске. Вѣроватно йе из сличнога раздобља као Штутгартица. Обойе се постављайу на првих двейу осах између Сардинияца, Сицилиянаца и данашњих Йужних Италияна. На оси три се упадљиво поклапайу са првима. С тим да йе Штутгартица нешто "йужния".

БР2 йе такође из данашње Мађарске, али йе прилично скорийи, из бронзанога доба, процѣњен на око тисушту година прѣ Христа. Он йе по генетици врло близак данашњим Французомъ.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Љиљан Јануар 26, 2015, 12:30:46 поподне
чини ми се да нико није помињао који су СТР-ови нађени код неких од 12 мађарских узорака са линка http://www.nature.com/ncomms/2014/141021/ncomms6257/fig_tab/ncomms6257_T1.html.

Нашао сам један сајт, извјесни Феликс (http://www.fi.id.au/2014/10/ancient-hungarian-genome-br2-y-dna-and.html), гдје он даје вриједност СТР-ова за налаз Ј2а1 (око 1100пне), као и то да осим што је био Ј2а1 (Л26+) био је и М67+. Ми на пореклу имамо М92 (Перуновић, Биџевић и претпостављам и други). М92 је низводно од М67. Мало сам гледао ове стр-ове и чини ми се да је најближи његовим резултатима Јаблић - Александровац (додуше тестиран само на 17 маркера). Највеће промјене (за 4) је доживио маркер 389и.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Јануар 26, 2015, 12:52:28 поподне
чини ми се да нико није помињао који су СТР-ови нађени код неких од 12 мађарских узорака са линка http://www.nature.com/ncomms/2014/141021/ncomms6257/fig_tab/ncomms6257_T1.html.

Нашао сам један сајт, извјесни Феликс (http://www.fi.id.au/2014/10/ancient-hungarian-genome-br2-y-dna-and.html), гдје он даје вриједност СТР-ова за налаз Ј2а1 (око 1100пне), као и то да осим што је био Ј2а1 (Л26+) био је и М67+. Ми на пореклу имамо М92 (Перуновић, Биџевић и претпостављам и други). М92 је низводно од М67. Мало сам гледао ове стр-ове и чини ми се да је најближи његовим резултатима Јаблић - Александровац (додуше тестиран само на 17 маркера). Највеће промјене (за 4) је доживио маркер 389и.

Не знам за ове СТР маркере, али сам гледао аутосомалне резултате за сву ову стару ДНК која има своје шифре на Гедмечу. Овај БР2 из Мађарске збирке припада култури Кујатице у Словачкој. То је локална варијаната протокелтске Urnfield културе тако да је у том смислу интересантан и овај Ј2а-М67 налаз (колико ми је познато ово је најстарија Ј хаплогрупа нађена, ако не и једина од старе ДНК). Гедмеч показује да овај узорак има највеће подударање са данашњим становништвом Француске.

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Фебруар 12, 2015, 02:52:14 поподне
Видим да је објављено ново истраживање старе ДНК у Европи. Нажалост, немам тренутно времена да погледам детаљније. Више информација на овом линку:

http://biorxiv.org/content/early/2015/02/10/013433

http://dienekes.blogspot.com/2015/02/a-story-of-69-ancient-europeans.html
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Фебруар 14, 2015, 07:47:54 пре подне
Горе поменути рад донио је мноштво нових резултата, али и нових закључака. Суштински се слика насељавања Европе није промјенила. Оно што је новост јесте да се по први пут једним резултатом потврђује присуство хаплогрупе R1a у Источној Европи у мезолитском периоду и то код популације ловаца сакупљача. Такође потврђено је и поријекло хаплогрупе R1b у Јамнаја култури у степама Црног мора и њена каснија миграција у Европу кроз Бел Беакер културу.

Табела која даје преглед свих тестираних узорака са одређењем хаплогрупа и археолошких култура којима припадају:

(http://s8.postimg.org/r762v7u4l/stara_dnk.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Kyrios Фебруар 14, 2015, 09:50:57 пре подне
Мислим да је вредно посебно истаћи и следеће две реченице из увода овог рада:

"Two hunter-gatherers from Russia included in our study belonged to R1a (Karelia) and R1b (Samara), the earliest documented ancient samples of either haplogroup discovered to date. These two hunter-gatherers did not belong to the derived lineages M417 within R1a and M269 within R1b that are predominant in Europeans today, but all 7 Yamnaya males did belong to the M269 subclade of haplogroup R1b."
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Фебруар 23, 2015, 07:49:16 пре подне
Gedmatch резултат "неолитског човека". Узорак је наводно стар 7500 год., а потиче из Штутгарта, Немачка (LBK).

Admix Results (sorted):

PopulationPercent

1 WEST_MED 45.92
2 EAST_MED 28.45
3 ATLANTIC 11.1
4 NORTH-CENTRAL_EURO 8.46
5 MIDDLE_EASTERN 6.06

Single Population Sharing:

Population (source)Distance

1 Sardinian 15.24
2 Tuscan 26.53
3 North_Italian 28.54
4 South_Italian_&_Sicilian 28.62
5 GR 30.21
6 PT 30.78
7 ES 30.98
8 AJ 32.59
9 Moroccan 33.76
10 FR 37.06
11 RO 37.73
12 Algerian 38.95
13 French_Basque 39.58
14 Serbian 39.98
15 Mozabite_Berber 41.81
16 Samaritan 41.95
17 AT 42.64
18 HU 43.29
19 TR 44.03
20 Druze 45.07

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: vojinenad Март 19, 2015, 08:13:06 пре подне
http://www.krstarica.com/s/index.php?s=http://www.blic.rs/&r=http://www.krstarica.com/lat/katalog/Mediji/Novine/
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Крсто Април 07, 2015, 07:26:25 поподне
ПДФ: http://tinyurl.com/p5pfoks


ДРЕВНА ДНК И НЕАНДЕРТАЛАЦ
Да ли Неандерталски митохондријални геном подржава еволуцију?





Недавно је објављен (1) распоред пуне дужине митохондријалног генома Неандерталца. Ово није потпун нуклеарни геном, већ само онај из једне мале органеле (митохондрије) која постоји у свим животињским ћелијама. Из њихове анализе су закључили, "Неандерталци нису начинили трајан допринос модерном људском фонду мтДНК гена." Иако овај примарни закључак није нужно у сукобу са креационистичком позицијом да су Неандерталци живели након потопа и су потпуно људи, постоји много еволуционистичких претпоставки иза те изјаве које се морају пажљиво размотрити. Постоје заправо три одвојена питања овде:
Да ли је тачна секвенца (низ)?
Да ли секвенца доказује да су Неандерталаци били различита врста?
Да ли је број варијација између Неандерталца и савремених људи доказује да нас раздваја огроман временски период?




Тачност сенквенцирања древне ДНК

Древна ДНК (дДНК) је проблематична. ДНК је дуг макромолекул који се ломи лако, нарочито између G-Т остатака где су пуцања скоро три пута чешћа него на другим местима. (1,2) У овом конкретном случају, фрагменти ДНК који су сачувани из кости Неандерталца имали су просечну дужину од само 69.4 бп (базних парова). То значи да би било потребно на хиљаде делова да би се поново успоставио мтДНК геном од 16,5 хиљада бп, и потребно је исправити вишеструке копије сваког одељка због високих стопа грешака које су својствене приликом сенквенцирања дДНК.  Ричард Грин и група научника које је предводио (научници који су сенквенцирали мтДНК Неандерталца - http://en.wikipedia.org/wiki/Neanderthal_genome_project) процењују да би било потребно најмање дванаестострука (12) покривеност (очитавање гена) да се постигне стопа грешака од 1 у 10.000. Да направимо поређење, приликом Пројекта Људског Генома (http://sr.wikipedia.org/wiki/Projekat_ljudskog_genoma) била је потребана покривеност од само 4-5 пута да се заврши нацрт секвенце. МтДНК од Неандерталца је завршена са просечном покривеношћу од 34.9 пута, али без потпуне мтДНК модерног човека за поређење, Неандерталски склоп би био немогућ.

Контаминација древних узорака од стране модерног ДНК је константна тема, приликом редоследа реакције имају тенденцију да појачају квалитет модерне ДНК на рачун фрагментиране дДнк. Присуство нуклеарних копија мтДНК је такође проблем. Нуклеарне копије нису баш идентичне мтДНК и раздвајање то двоје може бити тешко, посебно са кратком просечном дужином прочитаног. Заправо постоје четири врсте мтДНК због којих би аутори морали да буду забринути: фрагментирана (расцепкана) мтДНК Неандерталца, мали број копија фрагментираних нуклеарних примерака мтДНК Неандерталца, контаминиција (загађење) модерне мтДНК, и мали број копија нуклеарних примерака загађене модерне мтДНК. Аутори су уложили велики труд да се тај проблем реши и вероватно нису могли да ураде много више, са обзиром на природу материјала.

У древној ДНК, поједини ДНК остаци су хемијски измењени током времена. Нарочито, честа деаминација (http://sr.wikipedia.org/wiki/Deaminacija) остатака цитозина доводи до великог смањења броја цитозин-тимин (C-T) транзиција и аденин-гуанин (А-G) транзиција (прелаза) на комплементарном штранду). Ово се дешава много чешће близу крајева фрагмената ДНК,(3) што је значајан проблем када се узме у обзир мала просечна величина добијених ДНК фрагмената. Објављена мтДНК Неандерталца се разликује од стандардних људских митохондрија(4) за 206 нуклеотида (1.2% од 16,569 нуклеотида митохондријалног генома), укључујући 195 транзиција и 11 трансверзија.(5) Да направимо поређење, било која два савремена човека случајно изабрана ће се разликовати у просеку за око 40 нуклеотида, а највише дивергентне мтДНК из живих људи се разликују нешто више од 120 нуклеотида.(6) Мутације пронађене у Неандерталској мтДНК су прилично стандардане. Нису пронађени велики индели (мутације брисања или уметања) и трансверзије су ретке. Уствари, највећи део разлика које су пронађене између Неандерталске и модерне мтДНК су цитозин-тимин (C-T) транзиције (прелази). То су једне од најчешћих мутација које се дешавају унутар живих организама, али није јасно да ли су резултат наслеђивања или измене после смрти на Неандерталској секвенци. Многе од тих мутација могу бити показатељи грешака у склопу генома, које су, и поред свих напора аутора, проносили кроз њихову анализу.

(http://i57.tinypic.com/ddnk9l.jpg) http://oi60.tinypic.com/ng66as.jpg
Упркос неким мањим разликама у њиховом облику и еволуционистичке пристрасности у многим реконструкцијама (као овде ход са оба колена савијена, што их чини изгледају више налик мајмунима, али ово је невероватно неефикасан и невероватан начин кретања), костури Неандерталца су веома слични као код савремених људи. Геном Неандерталца је исто изузетно сличaн људском.


Посебно треба истаћи откриће неколико не-синонимних промена амино киселина у областима протеинског кодирања у Неандерталском митохондријалном геному, поготово она код субјединице 2. од гена цитохром ц оксидазе (http://sr.wikipedia.org/wiki/Citohrom_c_oksidaza). Они тврде да је ово доказ да је селекција пречишћавања (у природној селекцији) на Неандерталској мтДНК вероватно смањена услед мале величине популације. То је зато што су ове врсте замена (мутација) ретке јер се претпоставља да је већина штетна, и зато што се селекција разбија у малим популацијама због високих стопа случајних замена у генским фреквенцијама (стопа фиксација нових мутација је обрнуто пропорционална броју становника). Али мале популације су такође у опасности због високе стопе акумулације мутација,(7) која на крају могу довести до истребљења због "катастрофе са грешкама". Акумулација не-синонимних мутација на важним генима је доказ да висока стопа мутације делује на малој популацији под претњом изумирања. То такође може указивати на присуство после-смртне ДНК дегенерације коју њихове технике нису могле препознати. Ако су резултати валидни, акумулација штетних мутација може да објасни нестанак Неандерталаца. Међутим, значај стопе прилагодљивости синонимних ка не-синонимним се недавно нашао на удару,(8,9) тако да морамо да пажљиво тумачити ове налазе.

Постоји огромна количина литературе која се бави замкама и претпоставкама које су својствене у раду са древном ДНК. Аутори су свесни овог знања и дали све од себе да избегну потенцијалне проблеме, али време је променљив судија претходних напора сенквенцирања дДНК. Грин и остали су закључили да ова једна Неандерталска мтДНК 'недвосмислено' пада ван домета савремених људи. Ово је узето као истина здраво за готово, јер се претпоставља да је секвенца је тачна.


Да ли су Неандерталци били различита врста?

Претпоставимо да је Неандерталска мтДНК секвенца тачна. Чак и тада, поредећи један Неандерталски узорак са репрезентативним узорком од савремених људи није високо информативано. Може бити да су Неандерталци били јединствени огранак модерних људи са ограниченом генетском разноврсношћу због инцеста. Алтернативно, може бити да су Неандерталци били веома хетерогена група са богатим генетским наслеђем које обухвата модерне људе. Све у свему мораћемо да сачекамо да додатне Неандерталске секвенце постану доступне пре него што би могли да донесемо јаке закључке.

Сасвим је могуће да су Неандерталци нагомилавали мутације веома брзо у годинама после Потопа. На основу овог једног узорка, Неандерталци имају много мутација које нису виђене и било ком модерном човеку. Чак и поред тога, ова Неандерталска секвенца је ближа модерном човеку него што су многе живе шимпанзе једне другима! Разноликост унутар живих шимпанза до три-четири пута већа од оне у модерној људској популацији,(11,12) иако шимпанзе потичу од једног препотопног пара па би требале да имају мање генетске разноврсности него људи. Ово је доказ да је геном шимпанза у брзом паду и  то може да укаже да је неке степен ентропије деловао на Неандерталски геном.

Теорија коалесценције(13) (ретроспективни модел у популационој генетици који покушава да прати алеле у генима које деле сви чланови популације да би се пронашао најскорашњи заједнички предак) предвиђа да би данашњи народи требали бити потомци само једног малог дела популације предака. "Теорија о недавном афричком пореклу човека"(14) је првобитно претпостављала да сви људи који су данас живи потичу од једне жене ("Митохондријске Еве") која је живела у Африци пре око 200.000 година (процењени датум варира од аутора до аутора). То не значи да је она била једина жена која је била жива у то време, већ да се лозе сваке живе особе спајају у овој једној особи. Теорија је од тада проширена и укључује и "Y-хромозомског Адама".(15) Сједињавање линија је показано у популацији на Исланду, где су само 6,6% жена и 10% мушкараца, који су били живи између 1698-1742 године, преци 62% жена и 71% мушкараца који су живи данас.(16) Сједињавање (коалесценција) је можда општа појава у свим популацијама, делујући као левак за каналисање генетичке разноврсности од ограниченог броја предака. Изгледа да је дошло до губитка варијација у оквиру становништва у Енглеској током протеклих 1000 година(17) због болести и других фактора. Ако су процеси попут овога постојали током људске историје, не би требали очекивати да модерни човек и Неандерталац деле исте "мутације".

Коалесценција у малим популацијама се могла десити неколико пута у својој историји. Један оснивач може бити митохондријални предак целокупне популације, фиксирајући те оснивачке мутације. Ако је број становника и даље мали, догађај са другим оснивачем би се могао догодити, додајући мутације које су нагомилале у каснијем појединцу у фонд фиксних мутација. Ово је забрињујуће за одржавање угрожених врста заточених у зоо вртовима и ово постаје очигледно у разним расама домаћих животиња када су приказале карактеристичне онеспособљавајуће (дебилитантне) мутације. Мале популације нестају брзо и то је оно што се можда десило са Неандерталцима, омогућавајући брзо нагомилавање нових мутација.

Грин и остали су направили експлицитном стандардну претпоставку да се мтДНК наслеђује само матернално и да се митохондријална рекомбинација не дешава. Они су онда закључили Неандерталци нису дали трајан допринос савременом људском мтДНК генетском фонду. Иако се о овим двема претпоставкама расправљало у литератури напред и назад неколико година, најновији докази изгледа да указују да оне уствари могу бити погрешне.(18) Ако се докази за митохондријалну рекомбинацију наставе да акумулирају, овај закључак ће морати да се преиспита, јер онда може бити могуће да су делови  Неандерталског митохондријалног генома присутни код модерних људи. Грин и остали су нашли једну мутацију у модерном човеку, која није пронађена нигде другде него код Неандерталца и они су то приписали назад Неандерталцима. Исправан закључак је вероватно да се мутација појавила два пута у два одвојена рода (лозе), али је занимљиво запажање.


Да ли је ово доказ велике старости?

Грин и остали датирају време дивергенције (разилажења) модерних људских и Неандерталских родних линија на 660.000 плус/минус 140.000 година бп. Да би ово урадили, они су површно изјавили да су ово засновали на претпоставци молекуларног сата, на наводном раздвајању човека и шимпанзе пре 6-8 милиона година, и на Стандардном Неутралном Моделу Еволуције(19) (http://sr.wikipedia.org/wiki/Neutralna_teorija_molekulske_evolucije). Неутрални модел претпоставља да се нагомилавање мутација у митохондријама дешава без природне селекције и да се генетски (и културолошки) фактори, који контролишу стопе мутација, не разликују широм људске популације или током времена. Али пошто не знамо актуелне стопе мутација, и пошто не знамо стопе мутација током историје, и пошто су све претпоставке иза Стандардног Неутралног Модела под знаком питања,(20) морамо закључити да је степен повезаности овог једног узорка Неандерталца са савременим човеком непознат у овом тренутку.

Они су дали занимљиво признање, "Међутим, ако се процењени датум разилажења између људи и шимпанза, или садашње претпоставке о томе како мтДНК еволуира, покажу нетачаним, процене у календарским годинама разилжења Неандерталцских и људских мтДНК би требало да се ревидирају." Они такође признају да су "еволуциони датуми јасно зависни од многих слабих претпоставки"...

Постоји неколико одређених проблема који се односе на старост овог фосила које бих желео да продискутујем.


Стопе мутације су непознате

Већина процена стопе мутација које видимо у научној литератури су пристрасне и стављене надоле (да су ниске) због претпоставке о дугорочној еволуцији. Ово је проблем из два разлога. Прво, они могу рачунати време разилажење за две врсте које су створене одвојено (нпр. шимпанзе и људи) и које због тога нису технички упоредиве. Друго, прорачуни стопа разилажења (дивергенције) су одређене упоређујући их са замишљеним прошлим догађајима. На пример, ако су људи и шимпанзе X% различити, да би израчунали стопе мутације, они поделе Х са 6-8 милиона (број година пре колико смо се наводно разишли од шимпанза). Време раздвајања савременог човека и Неандерталца је засновано на стопи дивергенције (разилажења) која се обрачунава преко претпостављеног времена разилажења човека и шимпанзе. Стопе мутација засноване на генеалогији су много веће од оних које су засноване на филогенији (http://sr.wikipedia.org/wiki/Filogenija) и вероватно су много реалније. Недавне студије су показале да су мерљиве стопе мутација много веће него оне које филогенетске или чак и оне које генеолошке методе предвиђају.(21)

Неутрална теорија не дозвољава мутацијама, у ДНК полимерази (http://sh.wikipedia.org/wiki/DNK_polimeraza) или у било чему што утиче на ДНК копирање или поравку, да се догоде у само једној субпопулацији. То би уништило сам појам молекуларног сата, јер се тада не би очекивало да се мутације равномерно нагомилавају широм света. Али можемо да меримо тачност ДНК полимеразе, укључујући и људску митохондријалну ДНК полимеразу,(22) и знамо да мутације у ДНК полимерази могу да уздигну стопе грешака у људским митоцхондријама.(23)


Рапидне мутације у суровим условима

Брус Ејмс (http://en.wikipedia.org/wiki/Bruce_Ames), члан престижне америчке Националне академије наука, је предложио да генетска оштећења могу бити директно повезана са лошом исхраном.(24) Према теорији, када је под претњом умирања од глади, тело мора да одлучи које ће системи да наставе да раде и које ће системе да угаси. Овај механизам генетске "тријаже" би могао одржати организам живим, али на рачун мање критичних ћелијских операција попут поправке ДНК.

Било је предложено од стране неколико креациониста да је Неандерталско становништво живело у Европи под мање идеалним условима и било подвргнуто нутритивним ограничењима, посебно недеостатку витамина Д услед стално облачног времена током послепотопног леденог доба. Додајте сурове услове и лошу исхрану на мало инцесоидно становништво и имате инстант рецепт за рапидну акумулацију мутација у било којој људској популацији.


Унапред одређене стазе мутација?

Једна од претпоставки иза неутралне теорије је да су све мутације независне и насумичне. Вероватно би била грешка веровати да се мутације дешавају случајно и да нису повезане, међутим, било која мутација се само може десити у оквиру околне генетске информације. Једна мутација може бити искључена од друге (јер комбинације могу бити смртоносне) или може довести до низа других мутација (јер неки сетови мутација се могу искључити одређеним  појединачним мутацијама). Докази за овакву врсту интеракција између мутација су ограничени, али постоје. Ако неке мутације доводе до других, не би требало да очекујемо да две одвојене лозе (линије) имају исти мутацини пут. Ово је посебно тачно  ако мутација утиче на исправност  механизма за ДНК копирање.


Закључци

Док ће еволуционисти (укључујући теистичке еволуционистe) и "прогресивни креационисти" вероватно трубети са овим новим документом и показивати га као доказ да су Неандерталци и савремени људи две различите врсте, ја верујем да су њихови закључци преурањени. Као што сам укратко горе навео, постоји много тога што не знамо о науци модерне генетике. И постоје фактори, попут коалесценције, брзог генетичког дрифта, и генетичке тријаже, у малим изолованим популацијама који потенцијално могу објаснити открића. У сваком случају, савремене шимпанзе се могу разликовати више једне од других у њиховој мтДНК него што се модерни људи разликују од овог примерка Неандерталца, па се пазите свакога ко тврди да су Неандерталци посебана врста на основу генетских разлика.

Када приступамо оваквим доказима, морамо да будемо скептични, морамо разумети теорију која је довела до таквих закључака и морамо да доводимо у питање претпоставке иза те теорије. Ако то урадимо ове три ствари, не морамо се бојати да се Неандерталски човек на неки начин неће уклопити у библијски модел стварања.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Крсто Април 07, 2015, 07:27:32 поподне
(текст изнад)



ЛИТЕРАТУРА:

1.   Green, R.E. et al., A complete Neandertal mitochondrial genome sequence determined by high-throughput sequencing, Cell 134:416–426, 2008.
2.   Briggs, A.W. et al., Patterns of damage in genomic DNA sequences from a Neandertal, Proceedings of the National Academy of Science (USA)         104:14616–14621, 2007.
3.   See Green et al., ref. 1, for supplementary information of details on the deamination of residues close to fragment ends.
4.   Andrews, R.M. et al., Reanalysis and revision of the Cambridge reference sequence for human mitochondrial DNA, Nature Genetics 23:147,              1999.
5.   A transition is a mutational change in DNA from one purine (A or G) to another or from one pyrimidine (T or C) to another. Transitions are                much more likely to occur than transversions, which involve the replacement of a purine with a pyrimidine (e.g. A to C) or visa versa.
6.   Carter, R., Mitochondrial diversity within modern human populations, Nucleic Acids Research 35(9):3039–3045, 2007.
7.   Lynch, M., Conery, J. and Burger, R., Mutation accumulation and the extinction of small populations, American Naturalist 146:489–518, 1995.
8.   Albu, M. et al., Uncorrected nucleotide bias in mtDNA can mimic the effects of positive Darwinian selection, Molecular Biology and Evolution              25(12):2521–2524, 2008.
9.   Hasegawa, M., Cao, Y. and Yang, Z., Preponderance of slightly deleterious polymorphism in mitochondrial DNA: nonsynonymous/synonymous
      rate ratio is much higher within species than between species, Molecular Biology and Evolution 15(11):1499–1505, 1998.
10.   Criswell, D., Neandertal DNA and modern humans, Creation Research Society Quarterly, 2009 (in press).
11.   Becquet, C. et al., Genetic structure of chimpanzee populations, PLoS Genetics 3(4):617–626, 2007.
        See also www.sciencedaily.com/releases/2007/04/070420104723.htm..
12.   Kaessmann, H., Wiebe, V. and Pääbo, S., Extensive nuclear DNA sequence diversity among chimpanzees, Science 286:1159–1162, 1999.
        See also www.sciencedaily.com/releases/1999/11/991108090738.htm .
13.   Kingman, J.F.C., Origins of the coalescent: 1974–1982, Genetics 156:1461–1463, 2000.
14.   Cann R.L., Stoneking, M. and Wilson, A.C., Mitochondrial DNA and human evolution, Nature 325:31–36, 1987.
15.   Ke, Y. et al., African origin of modern humans in East Asia: a tale of 12,000 Y chromosomes, Science 292:1151–1153, 2001.
16.   Helgason, A. et al., A populationwide coalescent analysis of Icelandic matrilineal and patrilineal genealogies: evidence for a faster evolutionary
        rate of mtDNA lineages than Y chromosomes, American Journal of Human Genetics 72:1370–1388, 2003.
17.   Töpf1, A.L. et al., Ancient human mtDNA genotypes from England reveal lost variation over the last millennium,
        Biology Letters 3:550– 553, 2005.
18.   Zsurka, G. et al., Inheritance of mitochondrial DNA recombinants in double-heteroplasmic families: potential implications for phylogenetic
        analysis, American Journal of Human Genetics 80:298–305, 2007.
19.   Kimura, M., Evolutionary rate at the molecular level, Nature 217:624– 626, 1968.
20.   Howell, N. et al., The pedigree rate of sequence divergence in the human mitochondrial genome: there is a difference between phylogenetic
        and pedigree rates, American Journal of Human Genetics 72:659–670, 2003.
21.   Elliott, H.R. et al., Pathogenic mitochondrial DNA mutations are common in the general population,
        American Journal of Human Genetics 83:254–260, 2008.
22.   Lee, H.R. and Johnson, K.A., Fidelity of the human mitochondrial DNA polymerase,
        The Journal of Biological Chemistry 281(47): 36236–36240, 2006.
23.   Copeland, W.C. et al., Mutations in DNA polymerase gamma cause error prone DNA synthesis in human mitochondrial disorders.
         Acta Biochemica Polonica 50(1):155–167, 2003.
24.   Ames, B., Low micronutrient intake may accelerate the degenerative diseases of aging through allocation of scarce micronutrients by triage,
        Proceedings of the National Academy of Science (USA) 103(47): 17589–17594, 2006.

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Kyrios Април 07, 2015, 07:45:21 поподне
Крсто, умеш ли ти нешто паметније него да преписујеш ове глупости са креационистичких сајтова? Са темом коју си сам започео можеш да радиш шта хоћеш, али молим те да не загађујеш ову тему коју сам ја започео. Ја сам је покренуо са намером да се ту прикупе најновији резултати о древној ДНК, а твојим креационистичким глупостима није место овде (мада није ни на овом форуму).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Крсто Април 07, 2015, 08:17:26 поподне
Као што се да видети из литературе на којој је текст заснован да су све у питању званични (еволуционистички) научни часописи (означено плавим словима).
Према томе, ако имаш нешто да приговориш што се тиче садржине текста, изволи, а ако хоћеш да вртиш празне приче као и до сада, замолио би те да то не радиш.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Љиљан Април 07, 2015, 08:56:50 поподне
 Molim administrstore da se ovim pozabave. Zaista, ovo što Krsto radi na forumu je potpuna degradacija. Hajde da promijenimo naziv foruma u "Krstin kreacionistički" forum. Ili možda da vidimo šta imaju da kažu na ovu temu pripadnici drugih konfesija? Možda oni imaju treće mišljenje?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Kyrios Април 08, 2015, 12:18:52 пре подне
Као што се да видети из литературе на којој је текст заснован да су све у питању званични (еволуционистички) научни часописи (означено плавим словима).
Према томе, ако имаш нешто да приговориш што се тиче садржине текста, изволи, а ако хоћеш да вртиш празне приче као и до сада, замолио би те да то не радиш.

Крсто, једна од особина паметних људи је да уколико су упали негде где не припадају, као уљези, то схвате и повуку се пре но што дође до непријатности. Ја се надам да си ти довољно паметан да схватиш да ти овде није место, да су на овај форум дошли људи који размишљају другачије од тебе, и да су ту да би са другима који размишљају на сличан начин расправљали о питањима које све њих заједно занимају, да би размењивали информације о тим питањима. То што ти потенцираш овде никога не интересује и својим псеудоаргументима нећеш никога успети да убедиш ни у шта. Зато буди паметан и остави нас на миру, престани да нам досађујеш, и публику која ће бити довољно наивна да прогута то што ти нудиш потражи на неком другом месту. Нама овде заиста није стало до твог егзибиционизма.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Крсто Април 08, 2015, 12:31:19 пре подне
Нека друже, смири се. Ако ти мислиш да су ови аргументи псеудонични (и то кажеш без иједног изнетог контра-аргумента), у реду, то говори о теби и твојој способности да аргументовано расправљаш. Друге пусти да сами просуде.

А ако ниси приметио овај форум се зове "порекло", што значи да се на њему расправља о пореклу и истражује порекло. Ако ти мислиш да си настао од камена који је постојао пре пар милијарди година, у реду, али пусти друге да размишљају.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Април 17, 2015, 10:36:02 пре подне
Научници пронашли J2a и J2b2 на налазишту у Холандији (провинција Лимбург):

http://j2-m172.info/2015/04/three-j2-found-at-merovingian-buriel-site-roman-frankish-transitional-period/

(http://j2-m172.info/wp-content/uploads/sites/3/2015/04/Borgharen-Roman-Merovingian-site-300x200.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Sirius Април 27, 2015, 08:04:49 пре подне
Novi češki rad. Analiza skeleta starog 700 godina.

http://omicsonline.org/open-access/complex-analysis-of-700yearold-skeletal-remains-found-in-an-unusualgravecase-report-2332-0915-1000138.pdf (http://omicsonline.org/open-access/complex-analysis-of-700yearold-skeletal-remains-found-in-an-unusualgravecase-report-2332-0915-1000138.pdf)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Април 27, 2015, 09:00:47 пре подне
Novi češki rad. Analiza skeleta starog 700 godina.

http://omicsonline.org/open-access/complex-analysis-of-700yearold-skeletal-remains-found-in-an-unusualgravecase-report-2332-0915-1000138.pdf (http://omicsonline.org/open-access/complex-analysis-of-700yearold-skeletal-remains-found-in-an-unusualgravecase-report-2332-0915-1000138.pdf)

Занимљив рад, Сириус.

Успјели су да издвоје днк из скелета човјека који је био сахрањен у Чешкој, у првој половини 14. вијека. Сахрањен је ван хришћанског гробља, па аутор разматра двије опције, или је био Јевреј или вампир (тј. да су људи вјеровали да је био вампир). И за једну и за другу тезу налази потврде, али мислим да је јеврејска теза доста вејроватна. Из днк анализе /СТР) види се да је појединац припадао хаплогрупи E-V13, његов хаплотип је постављен и на y search. Најближи му је Товиах из Чешке који има јеврејске коријене.

Занимљива је реконструкција изгледа тестираног.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Април 27, 2015, 11:18:52 пре подне
Занимљиво. Више личи на вампира (Носферату из 1922. год), него на Јевреја. :) Видим да се и аутори слажу око изгледа.

Сириус, један од аутора, форензирач Даниел Ванек, је поставио и Месичеков хаплотип на Ysearch. Да ли си покушао да ступиш с њим у контакт?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Nebo Април 27, 2015, 11:46:52 пре подне
Више личи на вампира него на Јевреја.

Узе ми реч  ;D
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Đorđo Мај 05, 2015, 07:26:09 поподне
http://polishgenes.blogspot.com/2015/05/r1a1a-from-early-bronze-age-warrior.html

Р1а1а из бронзаног доба из Пољске
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Мај 05, 2015, 07:44:22 поподне
http://polishgenes.blogspot.com/2015/05/r1a1a-from-early-bronze-age-warrior.html

Р1а1а из бронзаног доба из Пољске

Прилично очекивано. Има ли негдје линк на научни рад из којег је ово?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Đorđo Мај 05, 2015, 08:06:29 поподне
Прилично очекивано. Има ли негдје линк на научни рад из којег је ово?
покушао сам да нађем линк за научни рад али нисам успео, нико није поставио линк ка њ(на форуму еупедије), има пар линкова ка пољским страницама али колико сам видео на њима нигде нема помена о ДНК
http://www.eupedia.com/forum/threads/31197-R1a1-found-in-Bronze-age-warrior-from-Poland
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Đorđo Јун 07, 2015, 07:44:19 поподне
http://novostink.ru/science-technology/111924-sovremennye-armyane-yavlyayutsya-potomkami-lyudey-naselyavshih-territoriyu-armenii-5-tys-let-nazad.html
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Korisnik77 Јун 07, 2015, 10:08:04 поподне
Da li je se kod nas uopšte. pokušavalo u zadnjih par godina uzeti uzorke drevne dnk? Jasno mi je da smo siromašni ali baš ni jedan uzorak drevne dnk!?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Đorđo Јун 10, 2015, 07:27:36 поподне
http://novostink.ru/science-technology/111924-sovremennye-armyane-yavlyayutsya-potomkami-lyudey-naselyavshih-territoriyu-armenii-5-tys-let-nazad.html
У случају да нисте читали горепоменути чланак на руском, између осталог, каже се да ће у наредним данима бити објављени резултати 101 древне ДНК из Еуразије

Данас један од форумаша на Еупедиа форуму окачи и следећу поруку:
Цитат
Samples I didn't know where going to be in this study....

>Remedello culture from Italy. The oldest is from 2908-2578 BC and the youngest is from 2134-1773 BC. SOme are male, so we'll get Y DNA.
>Late Bronze age Montenegro.

The rest are Armenian, a shit load of samples from Russia ranging Yamnya-Iron age, Corded Ware, Bell Beaker, Unetice, LN/BA Scandinavia, LN/BA Hungary. Stuff we've mostly already seen or have a good idea what the results will be.

The Remedello in Italy were chosen because they're suppose to be the earliest IEs of Italy, who gave rise to Italics(got that from Wikipedia), etc. I would rather have Pre-IE DNA from deep in Italy. A good guess is the males will turn out R1b-U152.
Тако да ће бити и један Црногорац из позног гвозденог доба

П.С. Сад сам нашао да су геноми су јавно објављени, али неће бити речено који је са којег локалитета док се званично не објави научни рад (у наредним данима)
http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB9021
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Јун 10, 2015, 08:02:37 поподне
У случају да нисте читали горепоменути чланак на руском, између осталог, каже се да ће у наредним данима бити објављени резултати 101 древне ДНК из Еуразије

Данас један од форумаша на Еупедиа форуму окачи и следећу поруку:Тако да ће бити и један Црногорац из позног гвозденог доба

П.С. Сад сам нашао да су геноми су јавно објављени, али неће бити речено који је са којег локалитета док се званично не објави научни рад (у наредним данима)
http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB9021

Биће интересантно видјети ове резултате. Можда се у њима нађе и неких наших грана за које нисмо знали одакле су...
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Đorđo Јун 10, 2015, 08:33:23 поподне
Биће интересантно видјети ове резултате. Можда се у њима нађе и неких наших грана за које нисмо знали одакле су...
Сад сам поново погледао, може се видети одакле је који узорак, уђе се на онај линк из моје претходне поруке, па се доле изабере реад филес па се иде на сампле ассецион па на атрибутес. Има два узорка из ЦГ али женска а не мушка, тако да ништа од мушке ДНК
http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/SAMEA3325429
DNA sex F
Age class Adult
Country Montenegro
Site Velika Gruda
Culture or Age LBA
Sample infoGrave 3

http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/SAMEA3325430
DNA sex F
Age class Adult
Country Montenegro
Site Velika Gruda
Culture or AgeIron Age
Sample infoGrave 36


Остали узорци су из следећих земаља: Шведска, Данска, Естонија, Пољска, Русија, Мађарска, Казахстан, Јерменија, Италија, Немачка, Чешка и један из Литваније
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Јун 10, 2015, 09:41:24 поподне
Сад сам поново погледао, може се видети одакле је који узорак, уђе се на онај линк из моје претходне поруке, па се доле изабере реад филес па се иде на сампле ассецион па на атрибутес. Има два узорка из ЦГ али женска а не мушка, тако да ништа од мушке ДНК
http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/SAMEA3325429
DNA sex F
Age class Adult
Country Montenegro
Site Velika Gruda
Culture or Age LBA
Sample infoGrave 3

http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/SAMEA3325430
DNA sex F
Age class Adult
Country Montenegro
Site Velika Gruda
Culture or AgeIron Age
Sample infoGrave 36


Остали узорци су из следећих земаља: Шведска, Данска, Естонија, Пољска, Русија, Мађарска, Казахстан, Јерменија, Италија, Немачка, Чешка и један из Литваније

Штета што неће бити y-dnk за ова два узорка из Црне Горе, али надам се да ће Гедмеч уврстити аутосомалну днк у своју базу, ап ће се бар нека врста информације моћи извући. Не знам да ли Невски може да искористи ове податке за своје аутосомалне рачуначе...
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Korisnik77 Јун 10, 2015, 09:54:34 поподне
Vidim da je u grupi Human Population Genetics Vinzencio Passarielo ibjavio da je u okviru ovog istrazivanja nadjen E1b u Jermeniji.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Александар Невски Јун 10, 2015, 10:04:39 поподне
Штета што неће бити y-dnk за ова два узорка из Црне Горе, али надам се да ће Гедмеч уврстити аутосомалну днк у своју базу, ап ће се бар нека врста информације моћи извући. Не знам да ли Невски може да искористи ове податке за своје аутосомалне рачуначе...

На жалост, немам начина изчитати ФАСТКу и БАМ спремишта. Али не сумњам да ће се они врло брзо появити у читљивом облику. Вѣроватно ће многе од њих прѣрадити и поставити на мрежу Аустралиянац Феликс Чандракумар, као што уради са многими другими. Онда ћемо их лако срачунати, на разне начине.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Đorđo Јун 11, 2015, 08:41:32 пре подне
Слика са уделима мушких и женских лоза по локалитетима

(http://www.nature.com/nature/journal/v522/n7555/images/nature14507-sf6.jpg)

Упада у очи неочекивано огромна заступљеност Р мушких лоза на већини локалитета и одсуство старих европских лоза као што су И и Г. Е1б је нађена једино у Јерменији
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Љиљан Јун 12, 2015, 01:22:29 поподне
Neke od Y haplogrupa za nedavno objavljen rad 101 drevne dnk:
Id            Država          Kultura           HG
RISE512  Russia          Andronovo      R1a1a1b-S224/Z645
RISE566  Czech R.       Bell Beaker    R1b1a2a1a-P310/PF6546/S129
RISE560  Germany      Bell Beaker    R1b1a2-L150.1/PF6274.1/S351.1
RISE563  Germany      Bell Beaker    R1b1a2a1a2b-PF6570/S28/U152
RISE564  Germany      Bell Beaker    R1b1a2a1-L51/M412/PF6536/S167
RISE434  Germany      Corded Ware  P1
RISE436  Germany      Corded Ware  CT
RISE446  Germany     Corded Ware  R1a1a1-M417
RISE1       Poland       Corded Ware  CT
RISE431  Poland        Corded Ware  K(xLT)
RISE555  Russia        EBA                 R1b1a2a2-CTS7340/Z2107
RISE492  Russia        Iron Age         R1
RISE494  Russia        Karasuk          R1a1a1-Page7
RISE397  Armenia         LBA            R1b1a2a2-Y4371/Z8128
RISE408  Armenia         LBA             J
RISE598  Lithuania       LBA            BT
RISE553  Russia          LBA             P
RISE554  Russia          LBA             I?
RISE374  Hungary       Maros        G2a2a1a-PF6308
RISE413  Armenia         MBA          R1b1-M415/PF6251
RISE416  Armenia         MBA          DE
RISE423  Armenia         MBA          E1b1b1b2a1-PF2020/Z1153
RISE524  Russia         Meshovskaya  R1b1a2-PF6494
RISE525  Russia          Meshovskaya  R1a1a1-Page7
RISE21   Denmark         Nordic BA    ?
RISE47   Denmark         Nordic BA    R1b1a2-M520/PF6410
RISE175  Sweden          Nordic BA    I
RISE207  Sweden          Nordic BA    I1-M450/S109
RISE276  Denmark         Nordic LBA   R1b1a2-L265/PF6431
RISE42   Denmark         Nordic LN    CT
RISE179  Sweden          Nordic LN    I
RISE61   Denmark         Nordic MN B  R1a1a1-Page7
RISE546  Russia          Pit Grave    R1b1a2-PF6482/YSC0000203
RISE550  Russia          Pit Grave    R1b1a2(xL51)
RISE486  Italy           Remedello    I2a1a1a-L672/S327
RISE487  Italy           Remedello    I
RISE139  Poland          Unetice      ?
RISE247  Hungary         Vatya        I2a2a-L368
RISE254  Hungary         Vatya        I2a2a-L59
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јун 13, 2015, 04:58:36 поподне
Неки резултати су мање-више очекивани (R1a Corded Ware, R1b Bell Beaker, J2b Armenia).

(http://i59.tinypic.com/2pys0nt.png)

CA, Copper Age; MN, Middle Neolithic; LN, Late Neolithic; EBA, Early Bronze Age; MBA, Middle Bronze Age; LBA, Late Bronze Age; IA, Iron Age; BAC, Battle Axe culture; CWC, Corded Ware culture

(http://i58.tinypic.com/4iylox.png)

(http://i61.tinypic.com/1zdugif.png)

(http://www.nature.com/nature/journal/v522/n7555/images/nature14507-f2.jpg)

(http://www.nature.com/nature/journal/v522/n7555/images/nature14507-f3.jpg)



Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Јун 14, 2015, 08:25:35 пре подне
Заиста значајан рад који потврђује и неке раније налазе и поставке.

Могли би га слободно назвати Рад о ширењу Индоевропљана. Аутори сматрају да је обрада метала из области Јужног кавказа (јерменија) пренешена у област сјеверног Кавказа и даље у степу. Преносиоци су били први Индоевропљани. Ако посматрамо резултате то су могли бити припадници хаплогрупе Р1б, којих у бронзаном добу налазимо у Јерменији, што није случај са Р1а. Аутори сматрају да је Р1б који је остао у области јужно од Кавказа повезан са индоевропским Хетитима, а свакако и са каснијим Јерменима. Сјеверно од Кавказа, у степској зони настаје нова култура, Јамнаја. Јамнаја култура која је приказана на горњим картама је најоригиналнија и генетски најчистија Индоевропска култура, састављена и од припадника Р1а и Р1б хаплогрупе. Одатле је прво кренуло ширење на запад, у источну, централну и сјеверну Европу гдје је дошло до мјешања са популацијама неолитских земљорадника и ловаца сакупљача, па Кордед Варе култура садржи већ значајну примјесу у односу на Јамнају. Индоевропљани су се затим ширили и на исток. Аутосомални резултати показују јасну везу Јамнаја и Афанасјево културе, док Синташта култура из које ће касније проистећи Андроново култура (Индоиранска) показује везу са европским Кордед Варе културом. И Јамнаја и Синташта су се кретале источно ка Алтају, гдје су већ почели да се мјешају са источноазијским популацијама.Ово појашњава и постојање Тохарског индоевропског језика у источној Кини.

Занимљиво је у резултатима Y-днк да се хаплогрупа Ј2 појављује тек у узорцима из жељезног доба (у Јерменији се појављује чак грана Ј2б у жељезном, а у бронзаном добу у Јерменији је нема). Слично је и за жељезно доба у Русији и на Алтају гдје се појављује Ј2а хаплогрупа. Не знам како се ова појава Ј2 хаплогрупе у каснијем периоду може објаснити. Једино као каснија инфилтрација неког Ј2 слоја у индоевропску масу. Овај Ј2б налаз у Јерменији жељезног доба је колико знам први налаз Ј2б у древној днк. Такође треба видјети какво је то кретање у жељезном добу могло да избаци Ј2 хаплогрупу на површину.

Такође је интересантно да узорци из Ремедело културе у Италији и Бронзаног доба у Мађарској, као да нису били захваћени миграцијом Индоевропљана, јер и бронзаном добу задржавају добар дио претходне генетике неолитско-палеолитске иако у материјалној култури користе бронзу и све тековине нових технологија које су донијели Индоевропљани.

Оно што чуди јесте појава неког И2а у чисто индоевропској Јамнаја култури. Нажалост у раду не постоји табела са СНП-овима по узорцима. Видим само ово што је Љиљан окачио, али не знам који је извор.

У сваком случају надам се да ће се посложити сва ова новооткривена древна днк, јер има још материјала за анализу у овом раду.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јун 14, 2015, 12:25:09 поподне
Population genomics of Bronze Age Eurasia

http://www.nature.com/nature/journal/v522/n7555/full/nature14507.html


Into, out of, and across the Eurasian steppe (Dienekes' Anthropology blog)

http://dienekes.blogspot.de/2015/06/into-out-of-and-across-eurasian-steppe.html


Nomadic herders left a strong genetic mark on Europeans and Asians

http://news.sciencemag.org/archaeology/2015/06/nomadic-herders-left-strong-genetic-mark-europeans-and-asians
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Маргита Војвотк. Бањанска Јун 14, 2015, 12:36:43 поподне
Standing at the Gateway to Europe - The Genetic Structure of Western Balkan Populations Based on Autosomal and Haploid Markers Published: August 22, 2014- DOI: 10.1371/journal.pone.0105090

http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0105090
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Маргита Војвотк. Бањанска Јун 14, 2015, 02:41:28 поподне
Није баш за тему Древна ДНК, али нек се нађе:

Белгијски резултати из 2013 (1000 тестираних)

https://docs.google.com/file/d/0B1RIQRMwAdjpdklnWllhUUtCMGc/edit?pli=1

Сицилија и јужна Италија из 2014 (326 тестираних)

http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0096074
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Korisnik77 Јун 14, 2015, 04:43:01 поподне
Interesantno vec 4-5 ancient dna rezultat I2a u Mađarskoj. Što se tiče ovih gore snipova to sam nasao na nekom linku sa eurogenes bloga, odnosno sa komentara na blogu. Koliko su relevantni ne znam, ali navodno su dobijeni analizom bam fajla iz pomenutog rada. Interesuje me u vezi ovih i2a sniooca, u kom odnosu stoje prema i2a dinariku?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Александар Невски Јун 14, 2015, 06:38:41 поподне
Interesantno vec 4-5 ancient dna rezultat I2a u Mađarskoj. Što se tiče ovih gore snipova to sam nasao na nekom linku sa eurogenes bloga, odnosno sa komentara na blogu. Koliko su relevantni ne znam, ali navodno su dobijeni analizom bam fajla iz pomenutog rada. Interesuje me u vezi ovih i2a sniooca, u kom odnosu stoje prema i2a dinariku?

Двойица из Мађарске имайу ПЙРове из огранка И2а2-М223. А они су доста удаљени од Динараца, Динарцемъ су рецимо ближи Сардинийци.
И2а узорака из Мађарске има йош неколико, видѣћемо ускоро шта ћейу они испасти.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Јун 15, 2015, 09:19:40 пре подне
Jean Manco на свом сајту http://www.ancestraljourneys.org/ урадила је, по мени, најбољи преглед досадашње древне ДНК. Могу се пронаћи и најновији резултати из студије за Бронзано доба Евроазије, међутим нема СНП-ова. Ауторка је написала да је податке из те студије добила у директној преписци са ауторима.

http://www.ancestraljourneys.org/ancientdna.shtml
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Муњени Ћелић Јун 15, 2015, 04:57:18 поподне
Изгледа лепе вести за I1 Z63:

RISE175  Sweden          Nordic BA    I1a3a2
RISE179  Sweden          Nordic LN    I1a3a2
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јун 15, 2015, 06:05:38 поподне
Занимљиво је у резултатима Y-днк да се хаплогрупа Ј2 појављује тек у узорцима из жељезног доба (у Јерменији се појављује чак грана Ј2б у жељезном, а у бронзаном добу у Јерменији је нема). Слично је и за жељезно доба у Русији и на Алтају гдје се појављује Ј2а хаплогрупа. Не знам како се ова појава Ј2 хаплогрупе у каснијем периоду може објаснити. Једино као каснија инфилтрација неког Ј2 слоја у индоевропску масу. Овај Ј2б налаз у Јерменији жељезног доба је колико знам први налаз Ј2б у древној днк. Такође треба видјети какво је то кретање у жељезном добу могло да избаци Ј2 хаплогрупу на површину.

У Јерменији је пронађена J2b2f (RISE 408). Изгледа да је у питању подграна J2b-M241.

http://www.isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpJ11.html

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Јун 15, 2015, 07:55:28 поподне
Није ми баш најјасније зашто аутори студије за Евроазију нису до краја обрадили податке за Y-днк. Сад се појављују разна тумачења, која се доста разликују. Jean Manco је сабрала све ове разлике у једну табелу. Ту се виде одређења хаплогрупа које су дали аутори, Генетикер и Феликс.

https://drive.google.com/file/d/0B9vzsK0Ig1mNdlB4LTgzN2ZMNW8/view
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Sirius Јун 15, 2015, 09:40:11 поподне
Na periferiji genetike koja se zove genetička genealogija, kolo vode različita dobrovoljna/komercijalna društva koja su nametnula svaka svoju nomenklaturu i sopstvena tumačenja genetičkih rezultata. Tako se i došlo do situacije da i u toj sivoj zoni niko ne zna ili neće da kaže koji je snip uzvodno, a koji nizvodno. Takve stvari se događaju iz neznanja, pogrešnog/različitog tumačenja ili iz komercijalnih razloga.

Hoću da kažem da ne vidim zašto bi se neki profesionalni genetičar povodio za nomenklaturom i rasporedom koji je ustanovilo nekakvo dobrovoljno genetičko-genealoško društvo (kao što je npr. ISOGG). 
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Љиљан Јун 16, 2015, 07:30:41 пре подне
Još neki uzorci:
RISE397_Kapan_LBA_Armenia L23/PF6534/S141+ > Y4371/Z8128+ > Z2106+ > PH4902+ > Y:18249219(A/C)+ CTS9219- (assigned to CTS7763 branch), R1b1a2a2

RISE547_Temrta IV_Yamnaya_Russia L478/PF6403+ > CTS9416+ > Z2106+ Y:9992926(T/C)-, R1b1a2a2
RISE548_Temrta IV_Yamnaya_Russia PF6494+ > L23/PF6534/S141+ > Z8128/Y4371+ Z2105+ CTS9416+ CTS1843/Z2109- CTS9219- Y:22971205(G/C)- Y:7033880(C/T)- PH4503-, R1b1a2a2
RISE550_Peshany V_Yamnaya_Russia PF6399/S10+ PF6494+ > Z8129/Y12537+ CTS8966-, R1b1a2a2   
RISE555_Stalingrad Quarry_EBA_Russia PF6399/S10+ > CTS7340/Z2107+ > Z2106+ Y:8025025(G/A)- , R1b1a2a2   

Nejasan mi je raspored R1b i R1a u ovom ranom periodu. Proizilazi da je u Jamna kulturi, suprotno mojim očekivanjima, bila brojnija R1b nego R1a.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Љиљан Јун 16, 2015, 08:06:40 пре подне
Interesantni su rezultati K15 za uzorak iz Sintašte.
K15:
North Sea: 40.16
Atlantic: 22.94
Baltic: 12.34
East Euro: 14.68
West Asian: 7.74
Sub Saharan: 2.14

Iz ovoga proizilazi da je stanovništvo Sintašte većinskim dijelom evropsko, te predstavlja povratnu migraciju iz Evrope u Aziju. Sintašta kultura (2800-1600BC) se obično smatra istočnim "produžetkom" Jamnaja kulture. Njen centar je bio istočno od Uralskih planina u oblasti oko 1000km udaljenoj od Kaspijskog mora, u pravcu sjeversjeveroistok.

Izgleda da je uzorak RISE386 iz Sintašte R1a1a1b2a2-Z2124
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Лепеничанин Јун 16, 2015, 08:49:39 пре подне
Зна ли неко постоји ли узорак неког припадника "Јамнаја" културе који припада Р1а или некој другој хаплогрупи осим Р1б?

Сви узорци које сам ја до сада видео су Р1б.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Јун 16, 2015, 11:59:03 пре подне
Зна ли неко постоји ли узорак неког припадника "Јамнаја" културе који припада Р1а или некој другој хаплогрупи осим Р1б?

Сви узорци које сам ја до сада видео су Р1б.

Сад сам гледао, нисам нашао.

Мада на истоку су се Р1а и Р1б мјешали. Култура Межовскаја има и Р1а и Р 1б.На западу више дјелују раздвојено. Колико видим први спој се десио у Нордијском бронзаном периоду гдје има и Р1а и Р1б, али то је био спој дошљака са запада, и оних са истока.

Вјерујем да су Р1а и Р1б у неком периоду говорили међусобно разумљивим језиком и да је размјена технологије (металургије) између ове двије популације била интензивна. Не треба заборавити ни резултате из претходне студије гдје је Р1а нађен на простору европске Русије још у мезолиту.

Јамнаја култура је по свему судећи била доминантно Р1б и главни преносилац нових знања из области јужно од Кавказа.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Љиљан Јун 22, 2015, 12:49:45 поподне
Na Dienekes-ovom sajtu sam našao nešto novo: http://dienekes.blogspot.com/2015/06/dna-from-hot-climates-technically.html

Izgleda da ćemo u narednih nekoliko dana imati prve rezultate drevne dnk sa prostora sadašnje Srbije: nalazište Gomolava kod Rume, uzorak star cca 6600g.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Љиљан Јун 22, 2015, 12:51:02 поподне
Mogli bismo da napravimo kladionicu :)

Ja predviđam C haplogrupu.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Nebo Јун 22, 2015, 01:08:56 поподне
Mogli bismo da napravimo kladionicu :)

Ja predviđam C haplogrupu.

I2  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Муњени Ћелић Јун 22, 2015, 04:27:19 поподне
Нека буде G2a (пошто ми је С већ заузета)  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Korisnik77 Јун 22, 2015, 05:14:40 поподне
Kako je to 5.vijek bc moze biti da su neolitski stocari i farmeri vec dosli do ovog podrucja, te je lako moguce da je bas G2a. Pokusavao sam da saznam nesto vise o ovom lokalitetu u neolitu, ali uglavnom se nailazi na podatke o lokalitetu iz bronzanog doba. Nisam uspio naci nesto vise podstaka o privredi ove zajednice u doba neolita, osim da se smatra dijelom vincanske kulture.
Šteta sto je nalaz iz okoline Istanbula zenski. Bilo bi vrlo interes.vidjeti koja bi tu bila hg
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Korisnik77 Јун 22, 2015, 05:59:39 поподне
Kako je to 5.vijek bc moze biti da su neolitski stocari i farmeri vec dosli do ovog podrucja, te je lako moguce da je bas G2a. Pokusavao sam da saznam nesto vise o ovom lokalitetu u neolitu, ali uglavnom se nailazi na podatke o lokalitetu iz bronzanog doba. Nisam uspio naci nesto vise podstaka o privredi ove zajednice u doba neolita, osim da se smatra dijelom vincanske kulture.
Šteta sto je nalaz iz okoline Istanbula zenski. Bilo bi vrlo interes.vidjeti koja bi tu bila hg
hocu reci 5.milenijum
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Korisnik77 Јун 22, 2015, 07:42:22 поподне
Izgleda da su objavljeni rezultati drevne y dnk za uzorak iz sj.istocne Rumunije, Pestera cu Oase, uzorak Oase 1, star izmedju 37 i 42ky: hg F. Nisam jos doznao too koji su konkretno snipovi. To je doba ranog paleolita, lovaca sakupljača, koji su tumarali evropom. Ono što je interesantno, i znalo se jos ranije, da ovaj uzorak ima izmedju 6 i 9% neandertalske dnk, što je do sada najviše nađeno. Smatra se da su upravo negdje između 39 i 41000 godina Neandertalci izumrli. Kako su nađeni dosta dugi odsječci neandertalske dnk smatra se da je ona prenesena 4-6generacija ranije. Osim toga smatra se da genom ovog yzorka nije mnogo doprinjeo sadašnjem evropskom stanovništvu. http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature14558.html
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Лепеничанин Јун 22, 2015, 08:44:55 поподне
Гомолава Ха2 (H2)  ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Јун 23, 2015, 04:30:49 поподне
Pretpostavljam da ce nekome biti zanimljivo: http://umap.openstreetmap.fr/en/map/ancient-human-dna_41837#6/44.143/24.456 (http://umap.openstreetmap.fr/en/map/ancient-human-dna_41837#6/44.143/24.456)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Александар Невски Јун 23, 2015, 08:36:31 поподне
Добих обавѣштење да су доступни родствени подаци нових узорака древне ДНК. Међу њими су узорак из данашње Србийе (Рума) и данашње Црне Горе ().
Узорак из Србийе йе мушке лозе ЦТ, значи сви сте у праву или сте сви у криву. :-)
Ништа боље стање нѣйе ни са опште родственима подацима. Од около 166 тисушт потрѣбних ПЙРов за рачуначе Додекада за узорка из Руме йе познато само 1474, што йе мање од 1% потрѣбних.
Када помоћу њих срачунам три рачунача, добиям слѣдеће:

Древни узорак из данашње Србийе НГ21

Рачунач Свѣт 9

Atlantic_Baltic:   56.6379%
Southern:      36.0146%
Siberian:      3.8659%
African:      3.4800%
Caucasus_Gedrosia:   0.0015%
Amerindian:      0.0000%
East_Asian:      0.0000%
Australasian:      0.0000%
South_Asian:      0.0000%

К12б

Atlantic_Med:      41.4180%
North_European:      23.5598%
Caucasus:      17.8110%
Southwest_Asian:   8.0637%
Sub_Saharan:      4.4252%
Siberian:      3.6650%
Northwest_African:   1.0574%
Gedrosia:      0.0000%
Southeast_Asian:   0.0000%
South_Asian:      0.0000%
East_African:      0.0000%
East_Asian:      0.0000%

К7б

Atlantic_Baltic:   54.0523%
Southern:      38.6311%
African:      4.4302%
Siberian:      2.8834%
West_Asian:      0.0031%
East_Asian:      0.0000%
South_Asian:      0.0000%


Древни узорак из данашње Црне Горе има нешто више ПЙРов, 2729, но йе и то прѣмало:

Рачунач Свѣт 9:

Atlantic_Baltic:   59.4383%
Southern:      33.4530%
Caucasus_Gedrosia:   7.1088%
Amerindian:      0.0000%
East_Asian:      0.0000%
African:      0.0000%
Australasian:      0.0000%
Siberian:      0.0000%
South_Asian:      0.0000%

К7б:

Atlantic_Baltic:   63.8053%
Southern:      36.0348%
West_Asian:      0.1599%
South_Asian:      0.0000%
Siberian:      0.0000%
African:      0.0000%
East_Asian:      0.0000%

К12б

Atlantic_Med:      48.6216%
North_European:      26.8667%
Caucasus:      17.8453%
Southwest_Asian:   6.6570%
Northwest_African:   0.0095%
Gedrosia:      0.0000%
Sub_Saharan:      0.0000%
Southeast_Asian:   0.0000%
South_Asian:      0.0000%
East_Asian:      0.0000%
East_African:      0.0000%
Siberian:      0.0000%

Обявљуйем их иако сматрам да су готово неупотрѣбљиви за ма каква поређења а поготово за закључке. Доказ да су крайње непоуздани йе чињеница да када мой узорак сведем на 1% случайно одабраних ПЙРова добиям чак 13% већи Атлантик-Балтик него када рачунам са свима. Или у другом случайу 7%. Слично йе и са осталими узорними становништви.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Љиљан Јун 23, 2015, 10:40:25 поподне
Nevski, gdje si našao podatak da je muški uzorak kod Hrtkovaca CT hg? Ja sam dobio informaciju da je F, tj. da se nalazi nizvodno od F, što ipak isključuje C i E, ali može biti i I2a i G2a (što je vrlo vjerovatno ako su tada, prije 6600g, rani neolitski farmeri došli do ovdje).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Александар Невски Јун 24, 2015, 05:35:12 пре подне
Nevski, gdje si našao podatak da je muški uzorak kod Hrtkovaca CT hg? Ja sam dobio informaciju da je F, tj. da se nalazi nizvodno od F, što ipak isključuje C i E, ali može biti i I2a i G2a (što je vrlo vjerovatno ako su tada, prije 6600g, rani neolitski farmeri došli do ovdje).

Нѣсам видѣо извор, рече ми човѣк упутивши ме на податке општега родства.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Љиљан Јун 24, 2015, 08:09:55 пре подне
A šta kažeš na ovo da je y hg nizvodno od F?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Korisnik77 Јун 24, 2015, 03:59:31 поподне
http://www.oslobodjenje.ba/vijesti/bih/nekropola-koposici-kod-ilijasa-pronadjene-kosti-u-knezevskoj-grobnici

Kazu u tekstu da ce raditi dnk analizu, ukoliko budu "našli koštanih ostataka". Bilo bi interesantno vidjeti ima li živih potomaka, ilu srodnika.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Александар Невски Јун 24, 2015, 05:36:41 поподне
A šta kažeš na ovo da je y hg nizvodno od F?

Сасвим йе могуће, али не знам нийедан СНП узорка, па не могу ништа рећи. Вѣруйем да ћемо ускоро имати више података о њем.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Маргита Војвотк. Бањанска Јун 24, 2015, 10:44:03 поподне
http://www.oslobodjenje.ba/vijesti/bih/nekropola-koposici-kod-ilijasa-pronadjene-kosti-u-knezevskoj-grobnici
Kazu u tekstu da ce raditi dnk analizu, ukoliko budu "našli koštanih ostataka". Bilo bi interesantno vidjeti ima li živih potomaka, ilu srodnika.

Овај истраживачки подухват Проф. Др. Куртовића и његових колега  је за сваку похвалу! Крајње је време је да се и наши историчари/археолози и етнолози лате истог посла.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јун 25, 2015, 12:00:48 пре подне
Y chromosomes of Corded Ware at Wroclaw-Jagodno (SW Poland)

(http://4.bp.blogspot.com/-4PBuujOPtko/US1d3NqI5CI/AAAAAAAAIpI/GO2yu0c2WyE/s1600/predictions.jpg)

Two teeth coming from fossil human skeletons were examined in the Molecular Technology Institute of Forensic Medicine Department, Wroclaw Medical University. It was stated that both teeth came from two men on the basis of the gene of amelogenin variants study. Determining polymorphisms of SNP type from chromosome Y resulted in categorizing skeleton from grave no. 1 with very high probability into haplogroup G, whereas skeleton from grave no. 2 with very high probability into one of three haplogroups J, I or E*.

Један узорак готово сигурно припада хаплогрупи G. Други би могао бити J, I, или E.


Прегледао сам базу хаплотипова за Вроцлав (100 хаплотипова на 23 маркера).

Постоји неколико E1b и I2a, затим један J2b M205, док су остали углавном R1a.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Јун 29, 2015, 02:15:11 поподне
Jos jedna nova studija sa ne malim brojem uzoraka praistorijskog DNK: http://ubm.opus.hbz-nrw.de/volltexte/2015/4075/pdf/doc.pdf (http://ubm.opus.hbz-nrw.de/volltexte/2015/4075/pdf/doc.pdf)

(http://i61.tinypic.com/23sessx.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јун 29, 2015, 03:46:09 поподне
Занимљива студија. Ево шта кажу за J2:

"Haplogroup J2 (M172) has today its highest frequency in the Caucasus and Iraq (Mesopotamia), and in the geographic region of Levant. In early modern genetic studies, J2 (together with F and G) was claimed to be an indicator of the Neolithic expansion (Semino etal., 2000), based on the clinal pattern of its frequency among the modern European and Western Asian populations. The theory has been further specified since the early 2000ies, and frequency distribution plots and surface distribution maps have revealed the J2a (M410)(Sengupta et al., 2006) as a possible marker for early farmers’ eastward migration in Central Asia.

Furthermore, the subgroup J2b (M12) has also been suggested as a marker for the European Neolithic expansion (King et al., 2008). Its less frequent occurrence in modern west Turkey (Cinnioğlu et al., 2004), but more frequent appearance in Greece has been even interpreted as an indication for a maritime route of Neolithic colonisation in South Europe (King et al., 2008).

It is interesting, that J2 (M172) has not been detected in Neolithic context yet, and it is not present in the western Carpathian Early/Middle Neolithic dataset either. It might have come first with the people of the Late Neolithic cultures into Transdanubia, which means either that it is not the marker for the earliest dispersal of farmers, or that it halted in southeastern Europe for about millennium, before reaching the Carpathian Basin."
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Đorđo Јун 29, 2015, 05:45:35 поподне
Хвала богу да је коначно нађено нешто Е хаплогрупе у Lengyel култури и Сопоту
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: ... Јун 30, 2015, 09:31:46 поподне
Ево неких анализа и резултата за древну ДНК на које сам налетео на интернету:

https://drive.google.com/file/d/0BzQ7ajrn9vY6Y1pLZ1JmcGc1R2s/view?usp=sharing
 
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Đorđo Јул 30, 2015, 08:29:16 поподне
За нас интересантан рад о древној ДНК у најави

http://www.ethnos.gr/article.asp?catid=22784&subid=2&pubid=64225380

Цитат
RESEARCH ON DNA 5.500 YEARS
Farmers of Macedonia before 5500 years
Lactose intolerance were the village residents of the Bronze Age (2500 BC-1850 BC) to position Xeropigado Valley Kozani and therefore could not digest milk.
  Terracotta figurine from Stavroupolis Thessaloniki


Terracotta figurine from Stavroupolis Thessaloniki
Moreover they had brown eyes and dark skin. The new data revealed DNA analysis of skeletal remains found in the cemetery of the Bronze Age, one of the few such periods were investigated systematically in the area of ​​Macedonia.
The ancient DNA opens a new window on archaeological research and analysis provides valuable data, such as those in the cemetery Xeropigado spanning 1,500 square meters, retained 214 graves and "hosted" 22 dead. More will be known at a workshop organized in the Archaeological Museum of Thessaloniki, on Thursday (30/7), at the exhibition entitled "Ancient DNA. Window to the past and the future ", which will last until May 2016.
Data
Distinguished palaiogenetistes from around the world will give complementary information and details on the collection of data and the responses to the DNA in a series issues.
Clay female figurine from Pontokomi and lower bottle Paliambela Pieria (both objects date back to the Middle Neolithic Period)
Clay female figurine from Pontokomi and lower bottle Paliambela Pieria (both objects date back to the Middle Neolithic Period)
"The analysis of ancient DNA gives us the morphological characteristics, pathologies, the functioning of the body and movements of the population of ancient human," explains the "Nation", the assistant professor of Physical Anthropology at the Department of History and Ethnology, Democritus University of Thrace scientific responsible of the workshop, Christina Papageorgopoulou. An equally important finding for Greece is the recovery of entire genomes of three prehistoric farmers who lived in northern Greece 7500-5500 thousand years ago. These farmers from Neolithic settlements in Paliampela Kolindrou and Revenia Korinou Pieria and the Kleitos Kozanis so scientists have now concentrated their whole DNA.
"These data are analyzed and will certainly shed light on the ancestral relationships of the first Europeans and provide a wealth of information related to functional and morphological characteristics," noted Ms. Papageorgopoulou. The ancient DNA is any amount of DNA that can be recovered from dead organisms skeletons, mummies, prehistoric remains and extinct animals. Through complex and time-consuming laboratory analyzes reconstructed biological history and evolution of ancient and modern populations, humans and animals.
By studying the scientists can now understand the genetic relationship of modern humans with extinct species of the genus Homo, such as Neanderthals, seek answers to questions such as the introduction of the Neolithic way of production, to study the evolution of morphological characteristics, to determine the degree of relatedness among ancient skeletons to certify the existence of pathologies and longitudinal study on the development of diseases.
"We can reconstruct a real biography of prehistoric people," say the scientists.
RICH VISUAL MATERIAL
The exhibition "Ancient DNA. Window on the Past and Future "introduces the visitor in a simple and concise manner, without compromising the scientific validity, the study of ancient DNA and its results. With concise way shows all successive stages of palaiogenetikis investigation, ie the collection and sampling of the material, the laboratory analysis, processing and interpretation of data, as well as all categories of results that may be offered.
It also includes rich visual material, film projection and display of objects used in the laboratory in the process of analysis of ancient DNA. The material is framed by ancient objects discovered during archaeological investigations in the same places in northern Greece from which comes the skeletal material underlying the research of the Democritus University of Thrace.
MARIA RITZALEOU [email protected]
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Kyrios Август 04, 2015, 05:41:52 поподне
Ево новог рада о древној ДНК:

Allentoft et al., Bronze Age population dynamics, selection, and the formation of Eurasian genetic structure, Nature 522, 167–172 (11 June 2015) doi:10.1038/nature14507

Веза:
http://www.nature.com/nature/journal/v522/n7555/full/nature14507.html

Сажетак:
The Bronze Age of Eurasia (around 3000–1000 BC) was a period of major cultural changes. However, there is debate about whether these changes resulted from the circulation of ideas or from human migrations, potentially also facilitating the spread of languages and certain phenotypic traits. We investigated this by using new, improved methods to sequence low-coverage genomes from 101 ancient humans from across Eurasia. We show that the Bronze Age was a highly dynamic period involving large-scale population migrations and replacements, responsible for shaping major parts of present-day demographic structure in both Europe and Asia. Our findings are consistent with the hypothesized spread of Indo-European languages during the Early Bronze Age. We also demonstrate that light skin pigmentation in Europeans was already present at high frequency in the Bronze Age, but not lactose tolerance, indicating a more recent onset of positive selection on lactose tolerance than previously thought.

Додатне информације:
http://www.nature.com/nature/journal/v522/n7555/full/nature14507.html#supplementary-information
http://www.nature.com/nature/journal/v522/n7555/extref/nature14507-s1.pdf
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Kyrios Август 04, 2015, 06:18:23 поподне
Занимљиво је да међу 5 узорака из Yamnaya културе који су анализирани у раду Allentoft et al. четири узорка припадају Y-DNA хаплогрупи R1b а један Y-DNA хаплогрупи I2a2a1b1b2 (S12195).

Потсећам да је у раду Haak et al., Massive migration from the steppe is a source for Indo-European languages in Europe, Nature 522, 207–211 (11 June 2015) doi:10.1038/nature14317, за све анализиране узорке из Yamnaya културе установљено да припадају Y-DNA хаплогрупи R1b.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Korisnik77 Август 04, 2015, 08:59:37 поподне
Čini se da je tehnologija u pretjodnoj godini značajno napredovala, te da je moguće ispitati uzorke dnk u mnogo lošijem stanju nego do sada. Da li ima kakvih indicija da će se ponovo pokušati sa uzimanjem uzorka Despota Stefana? Da li su nove tehnologije dostupne manjim istraživačkim centrima (kao što je našu BG)?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Kyrios Август 04, 2015, 09:13:40 поподне
Čini se da je tehnologija u pretjodnoj godini značajno napredovala, te da je moguće ispitati uzorke dnk u mnogo lošijem stanju nego do sada. Da li ima kakvih indicija da će se ponovo pokušati sa uzimanjem uzorka Despota Stefana? Da li su nove tehnologije dostupne manjim istraživačkim centrima (kao što je našu BG)?

Пратећи шта раде у тој области стекао сам утисак да сама технологија није основни проблем, основни проблем је колико је узорак очуван и колико је контаминиран. Зато ме и не чуди то што највише успешно анализираних узорака потиче из крајева где клима доприноси томе да се боље очувају. Такође, не можеш, на пример, да очекујеш да узорак из моштију кнеза Лазара није контаминиран имајући у виду шта су његове мошти све прошле.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Август 07, 2015, 01:52:53 поподне
Ево како су изгледали неолитски фармери (E1b + G2?) са простора северне Грчке:

Very important recent finding is the recovery of entire genomes of three prehistoric farmers who lived in northern Greece 7500-5500 years BP. These data are analyzed and are expected to shed light on the ancestral relationships of the first Europeans and provide a wealth of information, related to functional and morphological characteristics. Already it is known that some of our neolithic ancestors could not digest milk, ie it was intolerant to lactose and had brown eyes and dark skin.

https://www.youtube.com/v/iVI3y3I8wnk

http://dienekes.blogspot.de/2015/08/prehistoric-farmers-from-northern.html

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bozidar Stevana Ostojic Август 07, 2015, 07:53:09 поподне
Ево како су изгледали неолитски фармери (E1b + G2?) са простора северне Грчке:

How Europeans evolved white skin
By Ann Gibbons

Common European traits like pale skin evolved relatively recently in central and southern Europe
ST. LOUIS, MISSOURI - Most of us think of Europe as the ancestral home of white people. But a new study shows that pale skin, as well as other traits such as tallness and the ability to digest milk as adults, arrived in most of the continent relatively recently. The work, presented here last week at the 84th annual meeting of the American Association of Physical Anthropologists, offers dramatic evidence of recent evolution in Europe and shows that most modern Europeans don’t look much like those of 8000 years ago.
The origins of Europeans have come into sharp focus in the past year as researchers have sequenced the genomes of ancient populations, rather than only a few individuals. By comparing key parts of the DNA across the genomes of 83 ancient individuals from archaeological sites throughout Europe, the international team of researchers reported earlier this year that Europeans today are a mix of the blending of at least three ancient populations of hunter-gatherers and farmers who moved into Europe in separate migrations over the past 8000 years. The study revealed that a massive migration of Yamnaya herders from the steppes north of the Black Sea may have brought Indo-European languages to Europe about 4500 years ago.
Now, a new study from the same team drills down further into that remarkable data to search for genes that were under strong natural selection - including traits so favorable that they spread rapidly throughout Europe in the past 8000 years. By comparing the ancient European genomes with those of recent ones from the 1000 Genomes Project, population geneticist Iain Mathieson, a postdoc in the Harvard University lab of population geneticist David Reich, found five genes associated with changes in diet and skin pigmentation that underwent strong natural selection.
First, the scientists confirmed an earlier report that the hunter-gatherers in Europe could not digest the sugars in milk 8000 years ago, according to a poster. They also noted an interesting twist: The first farmers also couldn’t digest milk. The farmers who came from the Near East about 7800 years ago and the Yamnaya pastoralists who came from the steppes 4800 years ago lacked the version of the LCT gene that allows adults to digest sugars in milk. It wasn’t until about 4300 years ago that lactose tolerance swept through Europe.
When it comes to skin color, the team found a patchwork of evolution in different places, and three separate genes that produce light skin, telling a complex story for how European’s skin evolved to be much lighter during the past 8000 years. The modern humans who came out of Africa to originally settle Europe about 40,000 years are presumed to have had dark skin, which is advantageous in sunny latitudes. And the new data confirm that about 8500 years ago, early hunter-gatherers in Spain, Luxembourg, and Hungary also had darker skin: They lacked versions of two genes—SLC24A5 and SLC45A2—that lead to depigmentation and, therefore, pale skin in Europeans today.
But in the far north—where low light levels would favor pale skin—the team found a different picture in hunter-gatherers: Seven people from the 7700-year-old Motala archaeological site in southern Sweden had both light skin gene variants, SLC24A5 and SLC45A2. They also had a third gene, HERC2/OCA2, which causes blue eyes and may also contribute to light skin and blond hair. Thus ancient hunter-gatherers of the far north were already pale and blue-eyed, but those of central and southern Europe had darker skin.
Then, the first farmers from the Near East arrived in Europe; they carried both genes for light skin. As they interbred with the indigenous hunter-gatherers, one of their light-skin genes swept through Europe, so that central and southern Europeans also began to have lighter skin. The other gene variant, SLC45A2, was at low levels until about 5800 years ago when it swept up to high frequency.
The team also tracked complex traits, such as height, which are the result of the interaction of many genes. They found that selection strongly favored several gene variants for tallness in northern and central Europeans, starting 8000 years ago, with a boost coming from the Yamnaya migration, starting 4800 years ago. The Yamnaya have the greatest genetic potential for being tall of any of the populations, which is consistent with measurements of their ancient skeletons. In contrast, selection favored shorter people in Italy and Spain starting 8000 years ago, according to the paper now posted on the bioRxiv preprint server. Spaniards, in particular, shrank in stature 6000 years ago, perhaps as a result of adapting to colder temperatures and a poor diet.
Surprisingly, the team found no immune genes under intense selection, which is counter to hypotheses that diseases would have increased after the development of agriculture.
The paper doesn’t specify why these genes might have been under such strong selection. But the likely explanation for the pigmentation genes is to maximize vitamin D synthesis, said paleoanthropologist Nina Jablonski of Pennsylvania State University (Penn State), University Park, as she looked at the poster’s results at the meeting. People living in northern latitudes often don’t get enough UV to synthesize vitamin D in their skin so natural selection has favored two genetic solutions to that problem - evolving pale skin that absorbs UV more efficiently or favoring lactose tolerance to be able to digest the sugars and vitamin D naturally found in milk. “What we thought was a fairly simple picture of the emergence of depigmented skin in Europe is an exciting patchwork of selection as populations disperse into northern latitudes,” Jablonski says. “This data is fun because it shows how much recent evolution has taken place.”
Anthropological geneticist George Perry, also of Penn State, notes that the work reveals how an individual’s genetic potential is shaped by their diet and adaptation to their habitat. “We’re getting a much more detailed picture now of how selection works.”
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Korisnik77 Август 16, 2015, 10:24:44 поподне
Genetiker je na svojoj stranici ( https://genetiker.wordpress.com/2015/08/ ) objavio rezultate koje do sada nisam vidio.Radi se o uzorku lovca-sakupljača iz Mezolita (5500 b.c) sa ostrvca Stora Förvar, u blizini Gotlanda. Za rezultate komentariše da su ili I1 ili pre I1, i daje na koje snp-ove je pozitivan odziv.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Септембар 01, 2015, 05:45:01 поподне
More Y-SNP calls from Iron and Bronze Age Bulgaria

https://genetiker.wordpress.com/2015/09/01/more-y-snp-calls-from-iron-and-bronze-age-bulgaria/
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Септембар 01, 2015, 08:16:44 поподне
More Y-SNP calls from Iron and Bronze Age Bulgaria

https://genetiker.wordpress.com/2015/09/01/more-y-snp-calls-from-iron-and-bronze-age-bulgaria/

Колико видим, углавном се ради о трачанским гробовима, четири мушка скелета, од којих је један Е1б, други Ј2а , за трећег Генетикер вјерује да је Р1б источни, а за четвртог ништа није написано.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Септембар 02, 2015, 08:45:16 поподне
Колико видим, углавном се ради о трачанским гробовима, четири мушка скелета, од којих је један Е1б, други Ј2а , за трећег Генетикер вјерује да је Р1б источни, а за четвртог ништа није написано.

Узорак K8 је највероватније припадао аристократском слоју. Видимо да је J2a. Веровало се да је тај слој Трачана R1a.

Треба се осврнути и на аутосомалне резултате:

К8

globe4

97.86% European
1.65% Amerindian
0.49% African
0.00% Asian

globe10

46.81% West_Asian
36.90% Atlantic_Baltic
13.62% Southern
2.68% Palaeo_African
0.00% Amerindian
0.00% Australasian
0.00% East_Asian
0.00% Neo_African
0.00% Siberian
0.00% South_Asian

globe13

39.15% West_Asian
36.95% Mediterranean
20.05% North_European
2.99% Palaeo_African
0.85% Southwest_Asian
0.00% Amerindian
0.00% Arctic
0.00% Australasian
0.00% East_African
0.00% East_Asian
0.00% Siberian
0.00% South_Asian
0.00% West_African

Чак 36.90% Атлантик-Балтик?

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Korisnik77 Септембар 11, 2015, 10:32:03 поподне
http://news.sciencemag.org/archaeology/2015/09/dna-neandertal-relative-may-shake-human-family-tree

Vrlo interesantan članak. Piše, izmedju ostalog, da novi rezultati pomjeraju nastanak homo sapiensa izmedju 100000 i 400000 godina. To bi moglo znaciti da je se Homo Sapiens odvojio  prije 350000 ili cak 600000 godina.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Септембар 14, 2015, 02:30:30 поподне
Puno G2a u Anatoliji pre 8300 god, Genome-wide data on 34 ancient Anatolians identifies the founding population of the European Neolithic: http://www.unz.com/gnxp/ashg-2015-abstracts-of-interest/ (http://www.unz.com/gnxp/ashg-2015-abstracts-of-interest/)

I nijedna E haplogrupa.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Korisnik77 Септембар 20, 2015, 09:32:38 пре подне
Jedan ruski rad, nisam uspio da ga prevedem i pročitam ali konačno prvi drevni J1: dva Sarmatska uzorka iz 2.-3.v.n.e. su J1. Nadjeni su u Beslanu. U sjevernoj Osetiji.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Korisnik77 Септембар 20, 2015, 01:36:17 поподне
(https://scontent-vie1-1.xx.fbcdn.net/hphotos-xpa1/v/t1.0-9/12033052_10206741712095346_717622204604554353_n.jpg?efg=eyJpIjoidCJ9&oh=9c39dd07fe1575ef4e6a8d5eed0ea296&oe=5694CE9A)

https://www.academia.edu/15713987/Афанасьев_Г.Е._Ван_Л._Вень_Ш._Вэй_Л._Добровольская_М.В._Коробов_Д.С._Решетова_И.К._Ли_Х._Тун_С._Хазарские_конфедераты_в_бассейне_Дона_Тезисы_докладов_на_Всероссийской_научной_конференции_Естественнонаучные_методы_исследования_и_парадигма_современной_археологии_._М._ИА_РАН._2015
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Radonić II Септембар 20, 2015, 02:23:56 поподне
Sarmati, Sarmati... dušu mi vade ;D

Sama lokacija nije iznenađnje, Kavkaz je pun pripadnika J1 haplogrupe i ima ih i u Osetiji, ali nisam očekivao da će se naći u okviru sarmatske kulture. Ne mogu da prežalim što nisu pronađeni muški ostaci u humci gde je pronađena sarmatska princeza sa natpisom na hebrejskom.
Pogledaću rad, koliko se snađem
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Radonić II Септембар 20, 2015, 04:22:03 поподне
ljiljane, da li ima neki drugi link? Za ovaj mi daje obaveštenje da nije moguće pristupiti materijalu.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Октобар 12, 2015, 09:50:08 поподне
Eight thousand years of natural selection in Europe: http://www.biorxiv.org/content/early/2015/10/10/016477 (http://www.biorxiv.org/content/early/2015/10/10/016477)
I tabela koja sadrzi rezultate velikog broja uzoraka stare DNK. Veci deo je poznat od ranije ali ima i novih: docs.google.com/spreadsheets/d/1Vjbp450AwI7R-Y9J1YGSm9FjJWu9s9lx1azjUJbS8hQ (http://docs.google.com/spreadsheets/d/1Vjbp450AwI7R-Y9J1YGSm9FjJWu9s9lx1azjUJbS8hQ)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Новембар 16, 2015, 06:21:00 поподне
Пронађена днк дечака из племена Инка:

http://www.latimes.com/science/sciencenow/la-sci-sn-inca-mummy-dna-20151112-story.html

Припада хаплогрупи C1

(https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/c/ca/World_Map_of_Y-DNA_Haplogroups.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Новембар 16, 2015, 06:39:48 поподне
Skoro 14000 godina stara I2a u Svajcarskoj i preko 13000 godina stara J2a u Gruziji, Upper Palaeolithic genomes reveal deep roots of modern Eurasians: http://www.nature.com/ncomms/2015/151116/ncomms9912/full/ncomms9912.html (http://www.nature.com/ncomms/2015/151116/ncomms9912/full/ncomms9912.html)

Supplementary Information: http://www.nature.com/ncomms/2015/151116/ncomms9912/extref/ncomms9912-s1.pdf (http://www.nature.com/ncomms/2015/151116/ncomms9912/extref/ncomms9912-s1.pdf)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Новембар 16, 2015, 09:37:15 поподне
Skoro 14000 godina stara I2a u Svajcarskoj i preko 13000 godina stara J2a u Gruziji, Upper Palaeolithic genomes reveal deep roots of modern Eurasians: http://www.nature.com/ncomms/2015/151116/ncomms9912/full/ncomms9912.html (http://www.nature.com/ncomms/2015/151116/ncomms9912/full/ncomms9912.html)

Supplementary Information: http://www.nature.com/ncomms/2015/151116/ncomms9912/extref/ncomms9912-s1.pdf (http://www.nature.com/ncomms/2015/151116/ncomms9912/extref/ncomms9912-s1.pdf)

Бане, хвала на линку.

Овај налаз је веома значајан за све припаднике хаплогрупе Ј, јер је то уједно најстарији налаз ове хаплогрупе досада нађен, и што је још важније лоцира предачку популацију, која је у аутосомалној днк била прилично изолована на подручју Кавказа. У раду су ову популацију назвали Кавкаски ловац сакупљач (CHG) за разлику од Западноевропског ловца сакупљача (WHG). Првог карактерише хаплогрупа Ј, а другог хаплогрупа I.

Занимљиве су ми и тезе Диенекеса са његовог блога, везано за ову студију:

"Earlier this year, the study by Haak et al. showed that steppe invaders after 5kya brought into Europe a 50/50 mix of "Eastern European Hunter-Gatherer" (EHG) ancestry/An unknown population from the Near East/Caucasus. The "unknown population" was most similar to Caucasians/Near Easterners like Armenians but did not correspond to any ancient sample.

A new paper in Nature Communications by Jones et al. finds this "missing link" in the flesh in Upper Paleolithic/Mesolithic hunter-gatherers from Georgia which they call "Caucasus Hunter-Gatherers" (CHG)."

Управо се овдје говори о оној R i J смјеши која је ушла у Европу у Бронзаном добу, али се ширила и према Јужној Азији. Мислим да се етногенеза Индоевропљана без ове друге "Ј" половине досад није могла ваљано објаснити. Овај налаз је зато велики помак у том смислу.

Ова CHG популација је била различита и у односу на прве неолитске земљораднике и у односу на европске ловце сакупљаче.

Аутори студије сматрају да је ову популацију покренула заправо Јамнаја култура.

Уосталом и досад се вјеровало да је Кавказ колијевка за хаплогрупу Ј (тамо је и највећа разноврсост хаплотипова), сада је то прилично потврђено.

Налаз И2а 11000 г пне у пећини Швајцарске и није неко изненађење, али је свакако значајан јер је ово досад најстарији европски налаз старе ДНК (искључујући Костенски у Русији) и уједно најстарија пронађена И тј. И2а хаплогрупа.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Новембар 16, 2015, 10:27:41 поподне
Аутори студије сматрају да је ову популацију покренула заправо Јамнаја култура.

Уосталом и досад се вјеровало да је Кавказ колијевка за хаплогрупу Ј (тамо је и највећа разноврсост хаплотипова), сада је то прилично потврђено.

Сетимо се и оног J2b M241 из рада Population genomics of Bronze Age Eurasia. На основу ових резултата, али и садашњег распореда ових хаплогрупа, може се закључити да се део J2b2 и J2a ширио са Индоевропљанима.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Новембар 20, 2015, 10:21:35 поподне
Na eupediji je jedan clan foruma napisao da je na osnovu BAM fajla za "Grotte du Bichon" I2a dobio da je uzorak:
I-P37+L1286+(xM423xM26)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Новембар 20, 2015, 11:07:40 поподне
Na eupediji je jedan clan foruma napisao da je na osnovu BAM fajla za "Grotte du Bichon" I2a dobio da je uzorak:
I-P37+L1286+(xM423xM26)

Има логике да буде тако. Један огранак L1286 се раније називао Alpine. Иначе је цијела група L1286+ карактеристична за сјеверозападну Европу: западну Њемачку, Бенелукс, Француску, Британска Острва.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Новембар 26, 2015, 09:41:44 пре подне
Prvi G2a iz neolitske Grcke, Early farmers from across Europe directly descended from Neolithic Aegeans: http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2015/11/25/032763.full.pdf

Ako povezemo sa rezultatima iz Starceva mislim da i stari DNK polako postaje argument za veoma drugaciju sliku Balkana u Neolitiku, u poredjenju sa danasnjom.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Љиљан Децембар 25, 2015, 11:36:10 поподне
Изгледа да нас у 2016 чека права поплава резултата древне днк. Према објавам на форуму антрогеника, у 2016 ћемо између осталог имати древну днк:
- из Бугарске - Бронзано доба (Varna, Yunanitse )
- Бронзано доба - Румунија
- Трипољска култура (4800-3000пне)
- Мезолитске и неолитске културе Бугарска и Србија
- mtDNA из Грчке (Бронзано доба)
- Палеолит: резултати из Кремса (узорци 2005.г. пронађених тек рођених близанаца из Аустрије) рад проф. Johanes Krause-а
- Globular amphora culture
- Iranian Belt caves Mesolithic
- South Asia : Harappan DNA from 2500 BC.

Мене посебно интересује узорак из палеолита из Кремса у Аустрији. Ради се о највјероватније о близанцима, који су умрли одмах по рођењу. Ови узорци су стари око 32000г. Надам се да ће бити мушког пола и да ће се моћи утврдити У днк.
Ако се данас сматра да су Ј и И хг раздвојене прије око 27000.г., произилази да ови први Кромањонци у Европи нису могли бити ни И ни Ј, тј. ни ИЈ, јер се као мјесто раздвајања ове двије хг узима или блиски исток, или Кавказ (што је мање вјероватно). Претпостављам да би онда ови узорци из Кремса могли бити Ц ХГ, или можда Ф.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Александар Невски Децембар 26, 2015, 08:07:15 пре подне
Изгледа да нас у 2016 чека права поплава резултата древне днк. Према објавам на форуму антрогеника, у 2016 ћемо између осталог имати древну днк:

Честитам, Љиљане. Ово йе датељни (трећи) падеж множине, и то правилно употрѣбљен, пошто он иде уз прѣдлог "према". Он йе прѣкраяњем србскога йезика Йернейем Копитарем и Вуком Стефановић-Караџићем постао непожељан, йер тобоже "нѣйе срПски" него "славенски". Лѣпо йе видѣти да га йош неко користи.

А древну ДНК чекамо са нестрпљењем.  :) Нарочито ону са Балкана.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Јануар 04, 2016, 01:43:01 поподне
Још једно истраживање старе ДНК. Без већих изненађења, рекао бих.

Тестирана је аутосомална ДНК неолитске жене из налазишта Ballynahatty у Ирској, стара око 5000 година. Њена аутосомална генетика је неолитска блискоисточна са нешто палеолитске европске примјесе, услијед мијешања са ловцима сакупљачима.

Тестирана су и три мушкарца из Бронзаног доба са налазишта Rathlin, стара око 4000 година. Њихова аутосомална днк открива јасну везу са степском културом Јамнаја из источне Европе. Припадају хаплогрупи R1b-L21. Ово је колико знам најстарији налаз L21 досад, гране која је иначе карактеристична за келтску популацију данашње западне Европе.

Укратко ово је још један доказ о доласку R1b преко Бел Бикер културе са истока и промјени у слојевима становништва данашње западне Европе.

Линкови:

http://dienekes.blogspot.ba/2015/12/bronze-age-people-from-ireland-had.html

http://www.pnas.org/content/early/2015/12/22/1518445113.abstract

http://www.pnas.org/content/early/2015/12/22/1518445113.full.pdf?with-ds=yes
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јануар 19, 2016, 08:17:17 поподне
Iron Age and Anglo-Saxon genomes from East England reveal British migration history

http://www.nature.com/ncomms/2016/160119/ncomms10408/full/ncomms10408.html

Резултати:

http://www.nature.com/ncomms/2016/160119/ncomms10326/fig_tab/ncomms10326_T1.html
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јануар 23, 2016, 09:47:01 поподне
Хаплогрупа R1b, древна днк

(http://i1295.photobucket.com/albums/b627/ness50/R1b_zpspkhpvoga.jpg)


Хаплогрупа J, древна днк

(http://i1295.photobucket.com/albums/b627/ness50/J_zpst6dukghi.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Жика Јануар 24, 2016, 06:47:10 поподне
Хаплогрупа R1b, древна днк

(http://i1295.photobucket.com/albums/b627/ness50/R1b_zpspkhpvoga.jpg)


Хаплогрупа J, древна днк

(http://i1295.photobucket.com/albums/b627/ness50/J_zpst6dukghi.jpg)



Изненађујуће је, колико скорашња ДНК открића Ј2а/б из меровиншко/франачког доба подупиру давну изнету (подсмевану па чак и Богохулну) тезу о могућем орођивању франачких Меровинга (https://en.wikipedia.org/wiki/Jesus_bloodline)[size=78%] [/size][/size]са рођацима Господа Исуса Христа пре 2000 година.[size=78%]
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јануар 30, 2016, 05:13:41 поподне
A Community in Life and Death: The Late Neolithic Megalithic Tomb at Alto de Reinoso (Burgos, Spain)

http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0146176
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Фебруар 05, 2016, 04:00:07 поподне
[...The genetic diversity of the first modern humans who spread into Europe during the Late Pleistocene and the impact of subsequent climatic events on their demography are largely unknown. Here we analyze 55 complete human mitochondrial genomes (mtDNAs) of hunter-gatherers spanning 35,000 years of European prehistory. We unexpectedly find mtDNA lineage M in individuals prior to the Last Glacial Maximum (LGM). This lineage is absent in contemporary Europeans, although it is found at high frequency in modern Asians, Australasians, and Native Americans. Dating the most recent common ancestor of each of the modern non-African mtDNA clades reveals their single, late, and rapid dispersal less than 55,000 years ago. Demographic modeling not only indicates an LGM genetic bottleneck, but also provides surprising evidence of a major population turnover in Europe around 14,500 years ago during the Late Glacial, a period of climatic instability at the end of the Pleistocene.]

http://www.cell.com/current-biology/pdfExtended/S0960-9822%2816%2900087-7 (http://www.cell.com/current-biology/pdfExtended/S0960-9822%2816%2900087-7)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Фебруар 22, 2016, 06:08:38 поподне
Извршена је детаљна анализа скелета који су тестирани на древном налазишту у Британији (римско доба), међу којима је и онај Ј2б1.

http://news.nationalgeographic.com/2016/01/160119-gladiator-headless-skeletons-dna/?platform=hootsuite

Реч је о крупним и добро развијеним (well-muscled) мушкарцима, испод 45 година. Занимљиво је да су многи били обезглављени.

Стручњаци сматрају да је реч о Гладијаторима.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Фебруар 27, 2016, 12:22:45 поподне
Puno G2a u Anatoliji pre 8300 god, Genome-wide data on 34 ancient Anatolians identifies the founding population of the European Neolithic: http://www.unz.com/gnxp/ashg-2015-abstracts-of-interest/ (http://www.unz.com/gnxp/ashg-2015-abstracts-of-interest/)

I nijedna E haplogrupa.

Статистика из поменутог рада:

(https://scontent-vie1-1.xx.fbcdn.net/hphotos-xat1/v/t1.0-9/11063482_1529980613960609_1183328698122794567_n.jpg?oh=66bbb69aa0db5f04c0416b37313e576a&oe=575C8375)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Март 21, 2016, 05:33:28 поподне
Нађох на једном руском сајту, веома корисна ствар (стара ДНК)

https://docs.google.com/spreadsheets/d/1HuNPykGuq2PbHkUOL5dCiwrveIy-OGO2qOklwfsayW8/htmlview?pli=1#
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Март 22, 2016, 10:08:44 поподне
Вероватно је већини на форуму познато да су до сада сви древни узорци из Јамне културе редом били Р1б (З2103), а изгледа да смо сада добили први древни узорак из Јамне који је Р1а. Узорак потиче из археолошког налазишта Надеждинка у долини Волге, у Саратовској области, и по свему судећи је старији од 5000 година (3400 - 2900 п.н.е.). Информацију је објавио Павел Кузњецов, један од ко-аутора велике прошлогодишње студије http://www.nature.com/nature/journal/v522/n7555/full/nature14317.html (http://www.nature.com/nature/journal/v522/n7555/full/nature14317.html), и по његовим речима овог узорка нема у раду јер су резултати тестирања стигли тек након објављивања рада. Узевши у обзир да је тестирање вршено у лабораторији Дејвида Рајха, не би требали сумњати у тачност резултата. Оно што мало буни, и око чега се још увек воде расправе на неким страним форумима је то што је узорак тестиран као Р1а1а1д2а, што би одговарало СНП-у П98 http://dgmweb.net/DNA/Straub/StraubDNA-results-HgR1a.html (http://dgmweb.net/DNA/Straub/StraubDNA-results-HgR1a.html). Овај СНП се налази низводно од Р1а-З283 и Р1а-З282 https://www.yfull.com/tree/R-YP694/ (https://www.yfull.com/tree/R-YP694/), а како је З282 настала око 3000 година п.н.е, и просторно и временски овај резултат не делује претерано вероватан. Вероватније је да је негде у писању дошло до грешке, и да је узорак тестиран као Р1а1а1б2а, што би био СНП Р1а-З94, поготово узевши у обзир да већ имамо један З94 из истог подручја, из периода наредне Полтавка културе (I0432/SVP 42, Potapovka I, Sok River, Samara, 2925-2536 BC).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Мај 02, 2016, 09:52:03 поподне
Коначно је стигао нови велики рад о древној ДНК, обрађен је 51 нови узорак са простора Евроазије из периода од пре 45000-7000 година. Неки од занимљивијих узорака су 14000 година стар Р1б из Италије и 7000 година стар Р1б фармер из Шпаније. Опширније на:

http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature17993.html#access (http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature17993.html#access)

http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/extref/nature17993-s1.pdf (http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/extref/nature17993-s1.pdf)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Мај 02, 2016, 09:55:25 поподне
Коначно је стигао нови велики рад о древној ДНК, обрађен је 51 нови узорак са простора Евроазије из периода од пре 45000-7000 година. Неки од занимљивијих узорака су 14000 година стар Р1б из Италије и 7000 година стар Р1б фармер из Шпаније. Опширније на:

http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature17993.html#access (http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature17993.html#access)

http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/extref/nature17993-s1.pdf (http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/extref/nature17993-s1.pdf)

Свака част, Црна Гујо. Погледаћу.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Мај 02, 2016, 10:06:34 поподне
Коначно је стигао нови велики рад о древној ДНК, обрађен је 51 нови узорак са простора Евроазије из периода од пре 45000-7000 година. Неки од занимљивијих узорака су 14000 година стар Р1б из Италије и 7000 година стар Р1б фармер из Шпаније. Опширније на:

http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature17993.html#access (http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature17993.html#access)

http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/extref/nature17993-s1.pdf (http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/extref/nature17993-s1.pdf)

Да, а генетикер је за један узорак из тог рада дао резултат по коме је IJ* био у Европи још пре 30000 година.
Y-SNP calls for Vestonice 43: https://genetiker.wordpress.com/y-snp-calls-for-vestonice-43 (https://genetiker.wordpress.com/y-snp-calls-for-vestonice-43)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Мај 02, 2016, 10:07:55 поподне
Неки од занимљивијих узорака су 14000 година стар Р1б из Италије и 7000 година стар Р1б фармер из Шпаније. Опширније на:

Значи ипак није немогуће да се један део R1b ширио још у време неолита.

(http://s32.postimg.org/fonuq2t79/rrr.jpg)



Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Мај 02, 2016, 10:17:59 поподне
Значи ипак није немогуће да се један део R1b ширио још у време неолита.

(http://s32.postimg.org/fonuq2t79/rrr.jpg)

Небојша, ови налази у новообјављеном раду су из периода прије неолита, дубока палеолитска прошлост Европе.

Колико сам видио уопште нису пронађене класичне неолитске хаплогрупе. Доминирају I и C хаплогрупа. Свакако је изненађење R1b тако западно, али је и ранније било познато да је је R1 хаплогрупа била присутна прилично давно у Источној Европи. Видим да у овим налазима има доста R1 хаплогрупе која није ни R1a ни R1b.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Мај 02, 2016, 10:20:57 поподне
Небојша, ови налази у новообјављеном раду су из периода прије неолита, дубока палеолитска прошлост Европе.

Колико сам видио уопште нису пронађене класичне неолитске хаплогрупе. Доминирају I и C хаплогрупа. Свакако је изненађење R1b тако западно, али је и ранније било познато да је је R1 хаплогрупа била присутна прилично давно у Источној Европи. Видим да у овим налазима има доста R1 хаплогрупе која није ни R1a ни R1b.

У праву си. Поптуно сам превидео наслов, а и Шпанија ме одвукла на ту страну. :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Đorđo Мај 02, 2016, 10:58:32 поподне
Небојша, ови налази у новообјављеном раду су из периода прије неолита, дубока палеолитска прошлост Европе.

Колико сам видио уопште нису пронађене класичне неолитске хаплогрупе. Доминирају I и C хаплогрупа. Свакако је изненађење R1b тако западно, али је и ранније било познато да је је R1 хаплогрупа била присутна прилично давно у Источној Европи. Видим да у овим налазима има доста R1 хаплогрупе која није ни R1a ни R1b.
ово са древном днк је врзино коло, јер ми не знамо ни генетску слику Европе ни пре 2000 година а камоли пре 20 000 да бисмо могли нешто да покушамо да реконструишемо (не само ми него ни врхунски светски научници из те области)... Интересантно свакако јесте, али само доноси главобољу што се више размишља о томе
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Мај 02, 2016, 11:05:43 поподне
ово са древном днк је врзино коло, јер ми не знамо ни генетску слику Европе ни пре 2000 година а камоли пре 20 000 да бисмо могли нешто да покушамо да реконструишемо (не само ми него ни врхунски светски научници из те области)... Интересантно свакако јесте, али само доноси главобољу што се више размишља о томе

Да, видим сад је права пометња са овом R1b у Италији. Да се исправим, нема R1 пронађене, већ само R1b. Нисам добро прочитао резултате.

Генерално, изузев R1b, све остало у истраживању је очекивано. Старији слој хаплогрупа C, па млађи хаплогрупа I...

Дефинитивно нам је C хаплогрупа преузела примат најстарије у Европи  :'(
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Мај 02, 2016, 11:30:37 поподне
Још мало података везано за пронађену палеолитску R1b у Европи, покупљено са иностраних форума.

Изгледа да се ради о прилично старој грани, која је старија од цијепања R1b на V88 (афричку грану) и М269(евроазијску). Можда је у том смислу разумљив и ранији проналазак R1b-V88 на неолитском налазишту у Шпанији. Занимљиво је такође да овај пронађени палеолитски R1b показује аутосомалну везу са Блискоисточном популацијом.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Мај 02, 2016, 11:59:55 поподне
Ево га комплетан рад, требало би да може да се скине без регистрације, мени је успело:

https://www.researchgate.net/publication/301742169_The_genetic_history_of_Ice_Age_Europe (https://www.researchgate.net/publication/301742169_The_genetic_history_of_Ice_Age_Europe)

И једна исправка, није у питању 51 нови узорак већ 38, 13 је старих који су коришћени за поређење. Од тих 38, за 17 мушких је утврђена хаплогрупа.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Јун 08, 2016, 09:34:54 пре подне
Нови рад везан за неолитску ДНК. Нисам још успио да га прегледам, али свеједно качим линк са пуним текстом и прилозима

http://www.pnas.org/content/early/2016/06/01/1523951113.full
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Јун 08, 2016, 10:31:55 пре подне
Интересантни налази, али углавном очекивани, везани за  горе поменути рад.

Тестирано је 5 старих днк неолитских налаза, два из сјеверозападне Турске и три из централне и сјеверне Грчке. Археолози претпостављају да је миграција неолитских земљорадника у Европу кренула управо са Блиског Истока, преко Анадолије и Грчке. Овим истраживањем, а и многим претходним то је и потврђено.

Што се тиче Y-днк она је издвојена из два узорка и оба припадају хаплогрупи G2a, при чему је један тестирани G2a-L30, а други G2a-L91. Ништа неочекивано, јер је G2a иначе доминантна међу неолитским становништвом из Европе. Скоро смо имали тестираног из Варварина који је G2a-L91 (можда директни потомак ових неолитских земљорадника, овој грани је припадао и ледени чиовјек из Алпа)

Налази аутосомалне днк су још интересантнији. Поређењем аутосомалне днк ових 5 узорака и аутосомалне днк савременог становништва као и рнаије тестираних древних узорака, аутори студије су закључили да је у данашњој популацији Грчке и Турске дошло до дисконтинуитета у вези са овим неолитским земљорадницима, тј. да им нису аутосомално блиски. са друге стране ови узорци су веома блиски западномедитеранском савременом становништву као и другим неолитским тестираним у Европи. данашња популација која је најближа овим старим неолићанима јесу Сардинијци (што се додуше знало и раније). Треба рећи да и српски узорци који су радили аутосомалну днк, показују значајан удио ове неолитске генетике и она аутосомална днк која код нас није словенска углавном је западномедитеранска, а не источномедитеранска тј. приближава се овим неолитским узорцима.

Аутори такође показују да су се неолитски земљорадници у Европу ширили у два правце, преко Дунава и Рајне и другим правцем преко Медитерана. Неолитски земљорадници који су ишли дунавским путем показују већ значајно мјешање са палолитским ловцима скупљачима.

За крај, као илустрацију каkо су могли изгледати неолићани о којима је овдје ријеч постављам слику сардинијског дјевојчета у народној ношњи  :):

(http://pre11.deviantart.net/3f86/th/pre/i/2007/284/7/2/sardinian_woman_by_toporagno.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јун 08, 2016, 02:05:16 поподне
Налази аутосомалне днк су још интересантнији. Поређењем аутосомалне днк ових 5 узорака и аутосомалне днк савременог становништва као и рнаије тестираних древних узорака, аутори студије су закључили да је у данашњој популацији Грчке и Турске дошло до дисконтинуитета у вези са овим неолитским земљорадницима, тј. да им нису аутосомално блиски. са друге стране ови узорци су веома блиски западномедитеранском савременом становништву као и другим неолитским тестираним у Европи. данашња популација која је најближа овим старим неолићанима јесу Сардинијци (што се додуше знало и раније). Треба рећи да и српски узорци који су радили аутосомалну днк, показују значајан удио ове неолитске генетике и она аутосомална днк која код нас није словенска углавном је западномедитеранска, а не источномедитеранска тј. приближава се овим неолитским узорцима.

Ово је са једне стране логично, с обзиром да је тај илирски простор одувек у уској вези са Римом.

Римско царство, 476. год:

(https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/f/f9/628px-Western_and_Eastern_Roman_Empires_476AD%283%29.PNG)

Ипак, добар део римског царства насељен је управо са истока, на шта указују и генетски резултати.

Ткаође, данас помоћу хаплогрупа, тј. Y-DNA видимо да су нам Грци много ближи од Италијана нпр. (што словенско/германске, што староседелачке гране).

Тешко је поверовати да је једном Србину из Врања аутосомално ближи Италијан, него Грк :) (али као што си рекао, ни данашњи Грци аутосомално нису једно са тим ист. медитеранским прецима). Претпостављам да је на глобалном нивоу код Срба та западнометиреанска мешавина превладала због самог положаја по доласку на Балкан и вековног мешања са староседелачким становништвом.

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Јун 08, 2016, 04:27:45 поподне
Добар рад, мало се детаљније бави везама између неолитских популација Егеја и средње Европе, можда најважнија ствар је што је одлично урађена и прегледно представљена аутозомална анализа узорака. Нажалост, нема никаквих нових резултата што се тиче древне У-ДНК, и Bar31 и Klei10 су узорци обрађени у ранијим радовима.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Јун 17, 2016, 01:37:40 поподне
нова студија: The genetic structure of the world's first farmers (http://biorxiv.org/content/early/2016/06/16/059311)

(http://i.imgur.com/o4Zxux6.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Јун 17, 2016, 02:10:43 поподне
Ови резултати показују оно што се и раније претпостављало, а то је да је E1b старији на простору Леванта од J хаплогрупе. Такође, ово још јасније опредјељује E1b хаплогрупу као носиоце афроазијатске групе језика у коју спадају и семитски језици.

Сад баш читам на википедији шта пише о овој Natufian култури у Израелу и ево шта пише о претпостављеном језику којим су говорили:

"The view that the Natufians spoke an Afro-Asiatic language is accepted by Vitaly Shevoroshkin.[25] Alexander Militarev and others have argued that the Natufian may represent the culture which spoke Proto-Afroasiatic,[26] which he in turn believes has a Eurasian origin associated with the concept of Nostratic languages. The possibility of Natufians speaking proto-Afro-Asiatic, and that the language was introduced into Africa from the Levant, is approved by Colin Renfrew with caution, as a possible hypothesis for proto-Afro-Asiatic dispersal.[27]

Some scholars, for example Christopher Ehret, Roger Blench and others, contend that the Afroasiatic Urheimat is to be found in North or North East Africa, probably in the area of Egypt, the Sahara, Horn of Africa or Sudan.[28][29][30][31][32] Within this group, Ehret, who like Militarev believes Afroasiatic may already have been in existence in the Natufian period, would associate Natufians only with the Near Eastern pre-Proto-Semitic branch of Afroasiatic."

Такође о неким антрополошким налазима Натуфијанаца:

"The Epipalaeolithic Natufian of Israel from whom the Neolithic realm was assumed to arise is described as having a clear link to Sub-Saharan Africa. The Sub-Saharan element in the remains is also said to be of almost equal importance to that of the Eurasian element. The authors, however, remain cautious because of the small sample size. The authors further speculate that the admixture process between Neolithic people and in situ foragers diluted any discoverable trace of Sub-Saharan ancestry that may have been present."

Ј1 се у Јордану појављује тек у налазима раног Бронзаног доба.

Како год, чини се да ови налази који су уписани под Левантом представљају генетски профил Прото-семитске популације.

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јун 17, 2016, 03:10:00 поподне
Видим да је L1a присутна у Јерменији у време касног неолита. Да ли је то уствари L1b (стара ознака), с обзиром да се за ову хг каже следеће:

"L1b (M317) is found chiefly in the South Caucasus, eastern Anatolia and Lebanon. It has also been found in South Tyrol, Russia and Central Asia. Its main subclade L1b1 (M349) has been found in Italy, Switzerland, Austria, Germany, Belgium, England, northern Ireland, and scattered around most of central and eastern Europe and the eastern Mediterranean. The presence of L1b and L1b1 in Europe probably dates back to the Neolithic period."

L1a је најзаступљенија у Пакситану, док ове L1b гране има пуно у Анадолији (код Турака и Грка), затим у Јерменији, а присутна је и на југу Русије. Има је нешто мало и у Грчкој. С обзиром на овај налаз, може ли се и она повезати са ширењем неолитских земљорадника (видимо да и ови са Еупедие верују у то)?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јун 23, 2016, 12:17:55 поподне
Ево свих резултата:

https://genetiker.wordpress.com/2016/06/22/y-snp-calls-from-the-ancient-near-east/
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Јул 15, 2016, 03:26:30 пре подне
Нови рад који доноси неколико древних узорака са подручја западног Ирана: http://science.sciencemag.org/content/early/2016/07/13/science.aaf7943 (http://science.sciencemag.org/content/early/2016/07/13/science.aaf7943). Сам рад се не може видети у целини, али је доступан обиман додатни материјал:

http://science.sciencemag.org/content/sci/suppl/2016/07/13/science.aaf7943.DC1/Broushaki.SM.pdf (http://science.sciencemag.org/content/sci/suppl/2016/07/13/science.aaf7943.DC1/Broushaki.SM.pdf)

Нажалост, само су два нова Y-DNK резултата, један из неолита и један из гвозденог доба:

WC1  (7455-7082 п.н.е.)  G2b  Wezmeh Cave

F38    (971-832 п.н.е.)      R1b-CTS1078/Z2103  Tepe Hasanlu
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Никола Стојановић Јул 15, 2016, 02:41:37 поподне
https://hr.sott.net/article/8325-Filistejsko-groblje-otkriveno-u-izraelskom-gradu-moglo-bi-pomoci-rasvjetiliti-kulturu-tog-zagonetnog-naroda
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јул 17, 2016, 04:07:20 поподне
Р. Кинг је управо објавио вест да је у Ирану (неолит) пронађена J2b (узорак AH2). Нисам сигуран која је грана у питању, можда Црна Гуја може да растумачи:

https://genetiker.wordpress.com/

https://genetiker.wordpress.com/y-snp-calls-for-ah2/

Вероватно је реч о следећем раду:

http://science.sciencemag.org/content/early/2016/07/13/science.aaf7943.full

http://science.sciencemag.org/content/suppl/2016/07/13/science.aaf7943.DC1

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Јул 18, 2016, 03:08:33 пре подне
Позитиван је на 31 мутацију на М102 (Ј2б) нивоу, негативан на све мутације на нивоима М205 и Z1825(>М241), тако да је највероватније припадао некој изумрлој грани, јер колико сам видео не постоји ни један М102* на Ј2 ФТДНА пројекту. У сваком случају радује што је овако стар Ј2б узорак пронађен, и он потврђује да је матица хаплогрупа Ј1 и Ј2 подручје источне Анадолије, јужног Кавказа и западног Ирана, где су пронађени и остали најстарији Ј узорци (Satsurblia-J1b и Kotias-J2a из Грузије, HotuIIIb-J2a и сад AH2-Ј2b у Ирану). До краја године би требало да стигне и ДНК из Харапе и још неких локалитета из долине Инда, биће занимљиво видети да ли ће се и тамо појавити који Ј узорак.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јул 18, 2016, 07:15:40 пре подне
Позитиван је на 31 мутацију на М102 (Ј2б) нивоу, негативан на све мутације на нивоима М205 и Z1825(>М241), тако да је највероватније припадао некој изумрлој грани, јер колико сам видео не постоји ни један М102* на Ј2 ФТДНА пројекту. У сваком случају радује што је овако стар Ј2б узорак пронађен, и он потврђује да је матица хаплогрупа Ј1 и Ј2 подручје источне Анадолије, јужног Кавказа и западног Ирана, где су пронађени и остали најстарији Ј узорци (Satsurblia-J1b и Kotias-J2a из Грузије, HotuIIIb-J2a и сад AH2-Ј2b у Ирану). До краја године би требало да стигне и ДНК из Харапе и још неких локалитета из долине Инда, биће занимљиво видети да ли ће се и тамо појавити који Ј узорак.

Хвала, Гујо. По свему судећи припада "обичној" J2b (M241-, M205-), која се спорадично јавља и данас и нема је нигде у већем проценту. Знам да је у Европи има код Мађара, постоји и један Бугарин, али и неки Грци. Ти хаплотипови који постоје код Грка из Атине, могу се наћи и код Грка из Смирне (западна Анадолија), где је ова грана такође присутна. Видех да је у мањем проценту има и код Кипарских Грка (не мањем од M241).

Постоји још неколико хаплотипова на Блиском истоку и на западу Европе.

У сваком случају, што се древне J2b тиче, сада имамо M241 из Јерменије (бронзано доба), M205 из Јордана (бронзано доба) и Британије (римско доба, порекло Левант), као и ову J2b из Ирана (неолит).

Ови крајеви источно у последње време доста раде на истраживању древне днк. Мислим да би добар потез био одрадити нешто слично нпр. за Грчку.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Селаковић Јул 22, 2016, 12:42:41 поподне
Нови рад који доноси неколико древних узорака са подручја западног Ирана: http://science.sciencemag.org/content/early/2016/07/13/science.aaf7943 (http://science.sciencemag.org/content/early/2016/07/13/science.aaf7943). Сам рад се не може видети у целини, али је доступан обиман додатни материјал:

Гујо, ево послао сам ти рад на мејл. Жао ми је што сам тек сад видео ову поруку.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јул 22, 2016, 07:43:11 поподне
Early Neolithic genomes from the eastern Fertile Crescent

http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB14180

Колико видим, убачени су и BAM фајлови, што може бити од користи за детаљнију анализу.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Август 01, 2016, 09:30:40 пре подне
Ancient DNA study probes origin of first farmers

http://www.pasthorizonspr.com/index.php/archives/07/2016/ancient-dna-study-probes-origin-of-first-farmers

"The team’s analyses alter what is known about the genetic heritage of present-day people in western Eurasia. They now appear to have descended from four major groups: hunter-gatherers in what is now western Europe, hunter-gatherers in eastern Europe and the Russian steppe, the Iran farming group and the Levant farming group."

By comparing the genomes to one another as well as to those of nearly 240 previously studied ancient people from nearby regions and about 2,600 present-day people, the researchers learned that the first farming cultures in the Levant, Iran and Anatolia were all genetically distinct. Farmers in the Levant and Iran were genetically similar, however, to earlier hunter-gatherers who had lived in the same areas.

“Maybe one group domesticated goats and another began growing wheat, and the practices were shared in some way,” said Lazaridis. “These different populations all invented or adopted some facets of the farming revolution, and they all flourished.”

“The findings tell a different story from what researchers believe happened later in Europe, when the first farmers moved in from Anatolia and largely replaced the hunter-gatherer populations who’d been living there.”

"The researchers also learned how descendants of each early farming group, even as they began to intermingle, contributed to the genetic ancestry of people in different parts of the world: Farmers related to the Anatolian group spread west into Europe, people related to the Levant group moved south into East Africa, people related to those in Iran or the Caucasus went north into the Russian steppe, and people related to both the farmers in Iran and hunter-gatherers from the steppe spread into South Asia/"
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Септембар 05, 2016, 07:27:09 поподне
Докторска теза, у којој је обрађен велики број древних узорака са подручја Бајкала, са два налазишта из периода раног неолита и два налазишта из периода касног неолита-раног бронзаног доба. Већина узорака којима је тестирана Y-DNK припадају хаплогрупи Q, што и није неко изненађење. Присутне су још и хаплогрупе C, K, а вероватно најинтересантнија су два узорка из ранонеолитске Китои културе (6000-4800 п.н.е.) која припадају хаплогрупи R1a1-M17.

https://era.library.ualberta.ca/files/wm117r51m/Moussa_Nour_M_201509_PhD.pdf (https://era.library.ualberta.ca/files/wm117r51m/Moussa_Nour_M_201509_PhD.pdf)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Септембар 05, 2016, 08:03:11 поподне
Када смо код древне ДНК, вреди поменути и један узорак из Србије, који је обрађен у раду из прошле године:

http://journals.plos.org/plosone/article/asset?id=10.1371%2Fjournal.pone.0129102.PDF (http://journals.plos.org/plosone/article/asset?id=10.1371%2Fjournal.pone.0129102.PDF)

Узорак је из периода средњег неолита (4600 п.н.е.), и потиче са налазишта Гомоглава код Руме. Иако је узорак био доста доброг квалитета, и пронађено је преко 600000 аутозомалних SNP-ова, резултати Y-DNK анализе су јако слаби, потврђено је само да је позитиван на BT, CT i F, па о низводној хаплогрупи можемо само нагађати. Аутозомална анализа на DNA.land-у показује да се ради о класичном неолитском фармеру:

(https://s15.postimg.io/b901jyzkb/NG21_10_Serbia_6600_ybp.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Септембар 05, 2016, 09:50:55 поподне
Узорак је из периода средњег неолита (4600 п.н.е.), и потиче са налазишта Гомоглава код Руме.

Мала исправка, налазиште се зове Гомолава; вишеслојно је, има стратуме од средњег неолита (старчевачка култура) до доласка Рима на те просторе. 4600 п.н.е би по хронологији централнобалканског неолита пре припадала касном неолиту, тј. периоду винчанске културе (5300/5200-4300/4200 п.н.е.).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Септембар 05, 2016, 10:20:26 поподне
Потпуно невероватно, прешао сам преко овог чланка више пута, и тек сада на твоју интервенцију сам уочио да је Гомолава, а не Гомоглава. :D Што се тиче неолитске хронологије, ту нисам експерт, само сам пренео како је наведено у чланку.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Септембар 06, 2016, 11:09:35 пре подне
Потпуно невероватно, прешао сам преко овог чланка више пута, и тек сада на твоју интервенцију сам уочио да је Гомолава, а не Гомоглава. :D Што се тиче неолитске хронологије, ту нисам експерт, само сам пренео како је наведено у чланку.

Сами научници са тим својим хронологијама изазивају приличну конфузију.  :) Најраније се неолит јавља на подручју Блиског Истока (још око 8000. п.н.е. прекерамички неолит А), док у Скандинавији нпр. неолита малтене није ни било, тј. врло касно се појавио и кратко је трајао. Отуд за различите области Европе важе различите хронологије, нпр. када је у Енглеској био пуни неолит, на Балкану је већ бронзано доба, итд.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Септембар 09, 2016, 08:56:11 пре подне
Ово би требало да буде презентовано на некој конференцији у другој половини октобра: Genome-wide ancient DNA from Europe’s first encounter of farmers and hunter-gatherers (https://ep70.eventpilot.us/web/page.php?page=IntHtml&project=ASHG16&id=160122024)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Септембар 09, 2016, 09:03:13 пре подне
Ово би требало да буде презентовано на некој конференцији у другој половини октобра: Genome-wide ancient DNA from Europe’s first encounter of farmers and hunter-gatherers (https://ep70.eventpilot.us/web/page.php?page=IntHtml&project=ASHG16&id=160122024)

Бане, ово дјелује интересантно. Надам се да ће бити и Y-днк резултата. Пошто видим да учествују углавном бугарске институције, претпостављам да је главнина узорака са подручја Бугарске.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Be like Bill Септембар 09, 2016, 09:48:05 пре подне
Prošle godine je objavljen rad mađarske genetičarke Ane S. Nađ "Molecular genetic investigation of the Neolithic population history in the western Carpathian Basin", sa nekim genetičkim rezultatima. Uglavnom je u pitanju mt DNK, dok ima samo 30-ak Y-DNA u periodu oko 6000-4000 godina pr ne ere. Mislim da su neki rezultati pominjani ali se ne sećam da sam video i sam rad da je postavljen na forumu

http://ubm.opus.hbz-nrw.de/volltexte/2015/4075/pdf/doc.pdf

Ovo je biografija gospođe(ice) Nađ. Pošto je mlada mislim da ćemo još slušati o njoj pošto joj je jedan od istraživačkih interesa DNK distribucija na prostoru karpatskog bazena (ili panonske nizije kako je uobičajeno kod nas)

http://ri.btk.mta.hu/archaeogenetika/szecsenyi_en.html
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Септембар 09, 2016, 09:04:46 поподне
Бане, ово дјелује интересантно. Надам се да ће бити и Y-днк резултата. Пошто видим да учествују углавном бугарске институције, претпостављам да је главнина узорака са подручја Бугарске.

Да, ако буде Y-ДНК биће врло занимљиво. Можда сам пристрасан али мислим да ће студија бити посебно важна за E-V13, наравно у зависности од тога да ли ће тај SNP бити међу резултатима или не.
А можда можемо да добијемо и одговор када је R-M269(xL51) стигао на наше просторе. Ја и даље мислим да је то било мало пре E-V13.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Септембар 09, 2016, 10:54:15 поподне
Наравно да ће бити Y-ДНК, Рајх, Матиесон и екипа су се управо за њу и специјализовали, ја се само надам да ће бити и неки узорак из Србије, пошто по именима сарадника изгледа да ће највећи део бити са територије Бугарске уз понеки узорак из Македоније. Свакако би требало очекивати доста G2a2 и E-V13, и уз њих понеки примерак C1a2, I2c, J2a који су пронађени и међу до сада тестираним неолитским фармерима, мада сигурно ће бити и неких изненађења.

Бане, мало је вероватно, да не кажем немогуће, да је источна R1b стигла на Балкан пре E-V13, на основу чега си извео такав закључак?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Септембар 10, 2016, 04:40:30 поподне
Бане, мало је вероватно, да не кажем немогуће, да је источна R1b стигла на Балкан пре E-V13, на основу чега си извео такав закључак?

О томе сам писао ОВДЕ (http://www.poreklo.rs/forum/index.php?topic=425.0).
Тада сам направио грешку за G2a и J-M410 јер сам чак и за њих претпоставио да нису дошли из Анатолије. Међутим, мало касније сам увидео да се те две хаплогрупе јесу шириле из правца Анатолије.

А што се тиче временског редоследа доласка на Балкан и даље мислим да моја претпоставка стоји. Уз неке ситне допуне. Нпр сада мислим да је мали део R-Z283 дошао заједно са I1 a неко време пре I-CTS10028 , мада већим делом R-Z283 и I-CTS10028 могу да се посматрају заједно. Поред тога време доласка E-M123 можда може да се веже за J-M410.

Дакле по мени у зависности од времена из ког потичу узорци са Балкана, вероватноћа да припадају овим хаплогрупама је респективно највећа: G2a, J-M410, E-M123, R1b-M269(xL51). Ово се односи на хаплогрупе које и данас постоје. А могуће је наравно да буде и неких изумрлих грана пре свега хаплогрупе I, али заиста не могу да претпоставим тачно која подграна.

То је наравно само моје мишљење, а кад студија буде изашла то ће бити добра прилика да будем оповргнут.  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Септембар 10, 2016, 08:15:40 поподне
Бане, мало је вероватно, да не кажем немогуће, да је источна R1b стигла на Балкан пре E-V13, на основу чега си извео такав закључак?

Зашто ти мислиш да је то мало вероватно, тј немогуће.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Септембар 10, 2016, 08:26:56 поподне
Зашто ти мислиш да је то мало вероватно, тј немогуће.
E-V13 je нeoлитcкa, штo cу пoкaзaлa и нeкa apxeoгeнeтcкa иcтpaживaњa, дoк je R1b вeзaнa зa ceoбу Индoeвpoпљaнa, у нajбoљeм cлучajу у бpoнзaнo дoбa.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Септембар 10, 2016, 08:42:09 поподне
E-V13 je нeoлитcкa, штo cу пoкaзaлa и нeкa apxeoгeнeтcкa иcтpaживaњa, дoк je R1b вeзaнa зa ceoбу Индoeвpoпљaнa, у нajбoљeм cлучajу у бpoнзaнo дoбa.

То је тачно ако се односи на подручје Европе, али тренуна дискусија се бави Балканом (тј само делом Европе).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Септембар 10, 2016, 09:03:44 поподне
То је тачно ако се односи на подручје Европе, али тренуна дискусија се бави Балканом (тј само делом Европе).
И штo ce тичe Бaлкaнa, иcтo je. R1b и њeнa иcтoчнa гpaнa je нajвepoвaтниje дoнeшeнa ca Tpaчaнимa, дoк je E-V13 paшиpeнa пo читaвoм Бaлкaну и мoжe ce вeзaти зa paзнe нeoлитcкe култуpe нa Бaлкaну. Нa Eupedia пишe дa cу нa Бaлкaн дoшли пpeкo Aпeнинcкoг пoлуocтpвa, кao лoвци-caкупљaчи. Кacниje cу oд cтapoceдeлaчкoг cтaнoвништвa (J2b) кoje je дoнeлo зeмљopaдњу, пpeшao нa ceдeлaчки нaчин живoтa.
Teк дoлacкoм Индoeвpoпљaнa и Tpaчaнa (R1b) пpeлaзe и нa тpaнcxумaнтнo cтoчapeњe, чимe ce шиpe пo читaвoм Бaлкaну.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Септембар 11, 2016, 03:27:00 пре подне
Зашто ти мислиш да је то мало вероватно, тј немогуће.

Источна R1b-Z2103 је према yfull-у настала око 4300. године п.н.е, а вероватно нешто мало раније, по досадашњим налазима негде у црноморским или каспијским степама, па свакако пре тог периода није могла бити на Балкану. Најраније је могла доћи на Балкан за време културе Средњи Стог II (4400-3300 п.н.е.), тачније са делом племена те културе која су продрла на запад до делте Дунава, и у једном тренутку преко њега на Балкан. Овај продор се десио око 4200. п.н.е. и назива се Суворово-Новоданиловка. Неки аутори сматрају да то уопште нису била посебна племена, већ елитни ратнички слој културе Средњи Стог II, али у сваком случају ово се сматра првим таласом (Прото)Индоевропљана. Велики број аутора због тога ова племена повезује са народима који су говорили анатолијским језицима (Хетитима, Лувијцима, Палајцима итд.), за које је одавно доказано да су се први одвојили од остатка индоевропских језика. Мапа учесталости R1b-Z2103 показује појачано присуство ове гране управо на територији на којој је настала првобитна хетитска држава, па се може рећи да и то даје додатну тежину теорији да је управо та група "анатолијских" племена прва донела источну R1b.

Што се тиче Е-V13, моје је мишљење да је настала или на Балкану или нешто пре доласка на Балкан. Са Балкана до сада нажалост нема древних узорака, али има један узорак из Мађарске из периода Сопот културе, BICS4 (5000-4800 п.н.е.) који је тестиран као Е-М78, али мислим да се можемо сложити да је прилично сигурно да је такође и Z1919 и L618, а врло могуће и V13, пошто су друге подгране М78 скоро непостојеће у овим крајевима. Нека логика говори да ако је Е-М78 (V13?) пронађена у Мађарској да ће је сигурно бити и на Балкану, јер одакле је могла стићи у Мађарску ако не са Балкана? У сваком случају очекујем да ће у овом новом истраживању бити пронађена и V13, па би то могло разрешити нека питања.

Наравно ово се односи само на источну R1b-Z2103, неке старије гране R1b би се могле наћи на Балкану и пре Е-L618 и Е-V13, што је потврдио и палеолитски узорак Вилабруна из Италије. И R1b и R1а су вероватно биле присутне, можда чак и доминантне међу источним Граветијанцима, па не би требало да зачуди ако би се пронашле у палеолитским узорцима из источне и средње Европе.

И штo ce тичe Бaлкaнa, иcтo je. R1b и њeнa иcтoчнa гpaнa je нajвepoвaтниje дoнeшeнa ca Tpaчaнимa, дoк je E-V13 paшиpeнa пo читaвoм Бaлкaну и мoжe ce вeзaти зa paзнe нeoлитcкe култуpe нa Бaлкaну. Нa Eupedia пишe дa cу нa Бaлкaн дoшли пpeкo Aпeнинcкoг пoлуocтpвa, кao лoвци-caкупљaчи. Кacниje cу oд cтapoceдeлaчкoг cтaнoвништвa (J2b) кoje je дoнeлo зeмљopaдњу, пpeшao нa ceдeлaчки нaчин живoтa.
Teк дoлacкoм Индoeвpoпљaнa и Tpaчaнa (R1b) пpeлaзe и нa тpaнcxумaнтнo cтoчapeњe, чимe ce шиpe пo читaвoм Бaлкaну.

Милоше, слажем се да је источна R1b једним делом донешена и са Трачанима (и Грцима, Фригијцима), али мислим да нема сумње да је на Балкану присутна и дуго пре тога, јер пре Трачана, Грка и сличних народа који су потекли из позне Катакомбне (Multi-cordoned Ware) културе (2200-1800 п.н.е.), било је већ неколико таласа Индоевропљана који су сигурно донели део источне R1b на Балкан. Било би изузетно значајно сазнати које су хаплогрупе биле заступљене у Костолачкој (3300-3000 п.н.е.) и Вучедолској (3000-2200 п.н.е.) култури, чији су бар један део становништва чинила индоевропска племена.

Теорија да је E-V13 дошла на Балкан са Апенинског полуострва се мени одавно чини могућом, јер колико се сећам на Сицилији (или Сардинији) су пронађене неке подгране Е-М78 којих нема нигде другде, што указује на могућност да је било преласка њених носилаца из Северне Африке директно преко Медитерана у Европу, можда чак још у мезолиту. Сицилија и Апенинско полуострво се чине као најближа варијанта, а одатле је Балкан на дохват руке. Оно што, бар за сада, чини ову теорију привлачном је и одсуство E-V13 (и Е-L618) међу свим досадашњим узорцима из Анадолије и са Блиског Истока, мада у питању је ипак мали број узорака, пре свега са подручја Леванта, па не треба доносити још увек никакве дефинитивне закључке.

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Be like Bill Септембар 11, 2016, 02:13:59 поподне
(http://i61.tinypic.com/23sessx.jpg)

Ovo je tabela sa strane 138 rada koji sam postavio par poruka iznad (br 170). U par strana posle njega razrađuje svoje nalaze drevne Y DNK na prostoru karpatskog bazena. Na str 22 nalazi se karta kultura koje su bile predmet ispitivanja, od Starčeva do bronzanog doba. R1b rezltati su povezani sa vučedolskom kulturom
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Септембар 18, 2016, 08:26:21 поподне
На форуму Антрогеника наиђох на нови рад старе ДНК.

Наиме, у Монголији су анализирана тијела из 13. вијека за која се претпоставља да су из круга монголске владајуће породице Џингис кана. Рад је настао сарадњи монголских и јужнокорејских научних институција. Занимљиви су закључци изведени.

Нађено је неколико мушких и женских остатака, од којих се за четири са великом сигурношћу може рећи да су припадала породици Џингис-кана. Ради се или о мајци и три сина или о сестри и три брата. Анализиране су све врсте днк: мтднк, ипсилон(SNP и STR) и аутосомална. Не зна се да ли се ради о ћерки Џингис кана и њеној дјеци или о снахи Џингис-кана и њезиној дјеци. У том смислу би и Y-днк пронађена код ових остатака могла бити и днк Џингис-кана. А Y-днк која је пронађена супростављена је ранијој тези да је Џингис кан био C хаплогрупе.

Наиме успјели су изоловати днк двојице браће и они оба припадају истом хаплотипу хаплогрупе R1b. Како СТР резултати показују ради се о грани М73, заступљеној управо код централноазијских популација некадашњег монголског царства. За ову грану R1b не бих ни знао да се у истраживању САНУ није појавио и један тестирани из Србије који јој припада.

Иако су антрополошки нађени остаци монголоидни, генетски резултати показују  кавказоидно-монголоидно мјешање. Резултати мтднк упућују на источноазијске линије док Y-днк упућује на запaдноевроазијске линије. Тако и трећи пронађени Y-днк у гробници, који по неким другим подацима, не припада царској породици, већ се ради о ратнику, припада хаплогрупи R1a. Аутори затим наводе изворе који показују кретање неких монголских кланова управо из подручја централне Азије на исток. Спомињу и оновремене физичке описе самог Џингис кана, за којег се каже да је био висок, са дугом брадом, риђ, као и помене тога да већ Кублај-кан није наслиједио физички изглед Џингис кана.

Пажњу ми је привукао податак да међу поклапањима овог R1a монголског ратника има и један хаплотип из Хрватске. Онда сам убацио тај хаплотип у Невски претраживач хапловрста и видио да на 17 маркера, заиста се појављују као блиска поклапања, неки наши хаплотипови из словенске CTS1211 хаплогрупе. Наравно, то је варка због малог броја маркера. Исто тако блиско монголском хаплотипу су и многи R1a-Z93 хаплотипови из Азије, што већ има логике.

Што се тиче монголске царске хаплогрупе R1b-M73, у бази могу на 17 маркера да се нађу и пуна поклапања и то највише у централној Азији,  нађох једног у Таџикистану.

Ово истраживање је, чини ми се, сасвим професионално и солидно урађено. Да ми је неко реко да ће Монголија прије Србије урадити y-днк анализу старе днк, не бих му вјеровао.

Пуни рад са додацима може да се нађе на сљедећем линку:

http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0161622#sec026


Ово су стр профили(Гата Х4 већ смањен за 1):

"царске" R1b M73    13 22 14 11 13-17 12 13 13 13 30 15 15 20 10 15 10 23

ратник R1a-Z93?       13 26 16 11 11-14 10 13 11 29 17 14 20 12 15 11 23
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Септембар 25, 2016, 04:16:53 поподне
Сјајно предавање Дејвида Рајха о древној ДНК, са посебно детаљним освртом на Европу:

https://videocast.nih.gov/summary.asp?Live=19940&bhcp=1 (https://videocast.nih.gov/summary.asp?Live=19940&bhcp=1)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Октобар 06, 2016, 01:40:22 поподне
Hurrians and the others

http://eurogenes.blogspot.de/2016/10/hurrians-and-others.html

http://www.anthrogenica.com/showthread.php?8768-J2-Bronze-Age-speculations-ancient-J2b2-Balkan-J2a-Caucasus-Anatolia-amp-Mesopotamia&p=190954#post190954
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Октобар 23, 2016, 10:15:02 пре подне
Ово би требало да буде презентовано на некој конференцији у другој половини октобра: Genome-wide ancient DNA from Europe’s first encounter of farmers and hunter-gatherers (https://ep70.eventpilot.us/web/page.php?page=IntHtml&project=ASHG16&id=160122024)

Рад још увек није објављен али је неко био у прилици да пита аутора и добио је одговор да су рани фармери на Балкану били G2a: извор (http://eurogenes.blogspot.rs/2016/10/ashg-2016-open-thread.html?showComment=1477173713652#c2500150752496849419).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Никола Стојановић Октобар 28, 2016, 04:36:09 пре подне
As of October 2016, 15 Mesolithic European Y-DNA samples have been tested. Among them one belonged to haplogroup C1a2 (in Spain), one to F (in Germany), two to I* (in France), and six to I2 (Luxembourg and Sweden), including to I2a1* (P37.2), I2a1a1a (L672), I2a1b (M423) and I2c2 (PF3827). The maternal (mtDNA) lineages that they carried were U2e, U4, U5a1, U5a2 and U5b.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Đorđo Новембар 05, 2016, 08:54:38 пре подне
Урађена је раномађарска древна днк, испале су хаплогрупе R1b и I2а

http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00438-016-1267-z
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Новембар 05, 2016, 09:27:34 пре подне
Урађена је раномађарска древна днк, испале су хаплогрупе R1b и I2а

http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00438-016-1267-z

Примјетио сам некидан овај рад, али нисам стига да детаљније погледам резултате.

Мало су ме збунили Y-днк резултати и закључци из уводног дијела који кажу: "...we revealed that a significant portion of the Hungarians probably originated from a long ago consolidated gene pool in Central Asia-South Siberia, which still persists in modern Hungarians."

Овакакв закључак су аутори могли да изведу само на основу аутосомалне или мтднк генетике, а не на основу Y-днк резултата, јер су два I2a у ствари I2a Динарик, док су два  R1b R1b-U106.

Ако су ово гробови из прве генерације досељених Мађара како објаснити присуство типично словенских и типично германских хаплогрупа међу њима? И како објаснити сибирску генетику у аутосомалној или мтднк?

Мађари јесу били конфедерација племена различитог поријекла (било је ту и турских и угарских и индоевропских племена), али остаје питање да ли су ове пронађене Y-днк хаплогрупе ушле у мађарско племе у Панонији ( само једна генерација послије досељавања не иде у прилог томе) или су донесене са Мађарима из источне Европе (R1b-U106 се баш не уклапа у ту причу)?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Đorđo Новембар 05, 2016, 09:38:11 пре подне
са древном днк увек више нових питања него одговора  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Никола Стојановић Новембар 09, 2016, 02:25:37 поподне
Ажуриран сајт:
http://www.eupedia.com/europe/ancient_european_dna.shtml
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Никола Стојановић Новембар 09, 2016, 05:00:04 поподне
Преглед у форми мапе са детаљима:
http://umap.openstreetmap.fr/en/map/ancient-human-dna_41837#11/52.4385/51.1408
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Новембар 10, 2016, 11:51:24 пре подне
Преглед у форми мапе са детаљима:
http://umap.openstreetmap.fr/en/map/ancient-human-dna_41837#11/52.4385/51.1408

Одлично су ово одрадили. Y-днк + мтДНК са све изворима.

Ово је најсвежије са Еупедије:

http://www.eupedia.com/genetics/linear_pottery_culture.shtml

(http://www.eupedia.com/images/content/early_middle_neolithic_map.png)

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Србин Новембар 11, 2016, 01:44:50 поподне
Објављен је нови рад у вези Мађара из 9. и 10. века.

http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00438-016-1267-z (http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00438-016-1267-z)

Цитат
Another genetic layer of the early Hungarians was obtained during their westward migrations by admixing with various populations of European origin, and an important component of these was derived from the Caucasus region.

https://static-content.springer.com/esm/art%3A10.1007%2Fs00438-016-1267-z/MediaObjects/438_2016_1267_MOESM2_ESM.xlsx (https://static-content.springer.com/esm/art%3A10.1007%2Fs00438-016-1267-z/MediaObjects/438_2016_1267_MOESM2_ESM.xlsx)

Од четири узорка двојица су R-M269 а друга двојица I-M170.

Локација гробља је место Карос на граници са Словачком.

https://www.google.com/maps/place/Karos,+3962+Hungary/@47.2037332,19.9915805,7z/data=!4m5!3m4!1s0x4738c619866a51a7:0x4c1f2c08e98430a7!8m2!3d48.3312141!4d21.7406654 (https://www.google.com/maps/place/Karos,+3962+Hungary/@47.2037332,19.9915805,7z/data=!4m5!3m4!1s0x4738c619866a51a7:0x4c1f2c08e98430a7!8m2!3d48.3312141!4d21.7406654)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Amicus Новембар 19, 2016, 05:47:29 поподне
Овде је било речи о Џингис кану и његовом генетском наслеђу међу данашњим становништвом евро-азијског континента, па ме занима, да ли је можда неко имао прилику да пореди неке хапловрсте таквог порекла и убацује у неки од рачунача најстаријег заједничког претка?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Србин Новембар 25, 2016, 06:17:00 поподне
На Еупедији (и Антрогеници) већ има занимљиве дискусије у вези Мађарског истраживања.

http://www.eupedia.com/forum/threads/33054-Genetic-structure-of-the-early-Hungarian-conquerors-inferred-from-mtDNA-and-Y-DNA/page4 (http://www.eupedia.com/forum/threads/33054-Genetic-structure-of-the-early-Hungarian-conquerors-inferred-from-mtDNA-and-Y-DNA/page4)

Када се провуку кроз предвиђач "НЕВГЕН" I2a узорци 12 (грађанин) и 17 (ратник) су CTS10228 Carpathian-Dinaric. Провлачио сам оба хаплотипа да проверим и стварно избацује тај резултат. Грађанин је позитиван на мтднк A а ратник на мтднк H.

Осим I2a резултата ту је и R1b чија оба узорка припадају грани U106. R1b узорак грађанина има мтднк B а ратник припада мтднк хаплогрупи H. Дакле на први поглед оба ратника имају Европску генетику док са друге стране оба грађанина показују Азијску генетику по мајци. Међутим може да се деси да је ова мтднк H нека источнија варијанта.

С обзиром на горе поменуто могу се видети коментари типа да су освајале Мађарице, да су ова два Динарика такорећи међу најстаријим Словенским узорцима, те да би било добро видети аутозамални састав како би се утврдило где се мешање догодило - да ли западније од постојбине или не, одноно да ли се догодило касније током сеобе или не.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Децембар 04, 2016, 07:10:48 поподне
Тестирана су два древна скелета из хазарског периода пронађена у курганима на југоистоку Ростовске области, и оба припадају грани R1a-Z93. На основу 20 маркера утврђено је да један (1251, крај 7. почетак 8. века) припада дубљој подграни Z93>Z2122>Y57, која се и раније повезивала са Хазарима јер је данас заступљена скоро искључиво међу Ашкеназима источне и централне Европе. Други узорак (1986, крај 8. почетак 9. века) по Невгену припада грани Z93>L657>Y9, што је помало неочекивано јер се ова грана повезује пре свега са индо-аријским племенима, и до сада није пронађена ни у једном древном узорку. Ево и маркера (вредност на YGATAH4 умањена за један):

Узорак      DYS393   DYS390   DYS19   DYS391   DYS385    DYS439   DYS389i   DYS392   DYS389ii   DYS458    DYS447   DYS437   DYS448   DYS449   Y-GATA-H4    DYS456       DYS576     DYS438     DYS635

1251       14   25   16   11   10-14   10   13   11   33   15   24   14   20   33   10   15   19   11   23

1986       13   25   16   11   11-15   10   13   11   32   16   24   14   20   32   12   15   18   11   23

http://www.anatole-klyosov.com/09_06_2016.pdf (http://www.anatole-klyosov.com/09_06_2016.pdf)

Подсећам да је прошле године тестирано неколико узорака из Салтово-Мајаки културе која се повезује са Хазарима, и утврђене су хаплогрупе код три мушка скелета: R1a-Z93>Z94, G и J2a.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Децембар 27, 2016, 12:00:59 пре подне
Рад из новембра.
Цитат
Y-chromosomal DNA analyzed for four prehistoric cemeteries from Cis-Baikal, Siberia
http://haplogroup.org/sources/y-chromosomal-dna-analyzed-for-four-prehistoric-cemeteries-from-cis-baikal-siberia/ (http://haplogroup.org/sources/y-chromosomal-dna-analyzed-for-four-prehistoric-cemeteries-from-cis-baikal-siberia/)
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352409X16306927 (http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352409X16306927)
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352409X16306927 (http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352409X16306927)
Укратко, анализирани су скелети из раног неолита и касног неолита/раног бронзаног доба у близини Бајкалског језера у Сибиру.
Цитат
Results have been obtained from 16 males from the EN cemeteries Lokomotiv and Shamanka II representing haplogroups K, R1a1 and C3, and 20 males from the LN-EBA Ust'-Ida and Kurma XI cemeteries representing haplogroups Q, K and unidentified SNP (L914). For those males belonging to haplogroup Q, further experiments were obtained to examine sub-haplogroups of Q, and the results showed that those males belong to sub-haplogroup Q1a3.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Јануар 19, 2017, 07:37:43 поподне
Први објављени рад Кљосова из 2017.
Цитат
Excavated DNA from Two Khazar Burials
http://file.scirp.org/pdf/AA_2017011815275855.pdf (http://file.scirp.org/pdf/AA_2017011815275855.pdf)
The DNA in both cases was extracted from teeth of the ancient skeletons. The
teeth were cleaned and ground in a vibration mill, the DNA was isolated by
phenol extraction, and other routine procedures were employed for quantitation
of the isolated DNA, such as the polymerase chain reaction. In both cases the
Y-chromosomal haplogroup of the ancient Khazars was identified as R1a, and
the primers specific to SNP mutations R1a-Z280 and R1a-Z93 revealed that the
both samples showed negative Z280 and positive Z93 mutations. Thus, both ancient
Khazars’ DNA was interpreted to be of the R1a-Z93 “signature”.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јануар 26, 2017, 01:19:40 поподне
Yamna Culture (c. 3500-2500 BCE) (Еупедија)

http://www.eupedia.com/genetics/yamna_culture.shtml
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Јануар 30, 2017, 06:22:01 поподне
Владимир Таганкин, један од ко-администратора FTDNA R1a пројекта, је анализирао узорак древне ДНК из Пољске, чији "сиров"  резултат је објављен пре пар дана на ENA (http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/SAMN04633627):

PL_N17; Gustorzyn; Early Bronze Age; C14 dating: 1953 BC - 1880 BC (68.2% probability); age: 40-50 years; sex: male

Узорак је потврђен као R1a-Z280>S24902 (https://www.yfull.com/tree/R-S24902/), дакле припада једној од мањих грана испод Z280 која данас није значајније заступљена код словенских и балтичких народа, већ се углавном јавља у Западној и Северној Европи (Британија, Француска, Шпанија, Немачка, Шведска).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Јануар 30, 2017, 07:03:59 поподне
Владимир Таганкин, један од ко-администратора FTDNA R1a пројекта, је анализирао узорак древне ДНК из Пољске, чији "сиров"  резултат је објављен пре пар дана на ENA (http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/SAMN04633627):

PL_N17; Gustorzyn; Early Bronze Age; C14 dating: 1953 BC - 1880 BC (68.2% probability); age: 40-50 years; sex: male

Узорак је потврђен као R1a-Z280>S24902 (https://www.yfull.com/tree/R-S24902/), дакле припада једној од мањих грана испод Z280 која данас није значајније заступљена код словенских и балтичких народа, већ се углавном јавља у Западној и Северној Европи (Британија, Француска, Шпанија, Немачка, Шведска).

Занимљив налаз, Гујо. Не знам да ли се у раду помиње конкретна култура којој је тестирани припадао, али видим да у том периоду на том простору има неколико култура које су проистекле из Corded Ware, па је у складу са тим очекиван и резултат.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Јануар 30, 2017, 07:35:50 поподне
Занимљив налаз, Гујо. Не знам да ли се у раду помиње конкретна култура којој је тестирани припадао, али видим да у том периоду на том простору има неколико култура које су проистекле из Corded Ware, па је у складу са тим очекиван и резултат.

Не зна се конкретна култура јер рад још увек није изашао, али регион Кујавије је у том периоду био неко гранично подручје између Уњетичке културе на западу и ране Тшињецке културе на истоку па верујем да је нека од те две.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Јануар 30, 2017, 09:24:50 поподне
Географски налаз највише одговара тзв. Mierzanowice culture

За њу се на Википедији каже сљедеће:

East of the Unetice culture, in Lesser Poland and further north to the Masovia region, during roughly the same span of time, lay the territory of the Mierzanowice culture, named after the type-site village near Opatów. These people, culturally also descendants of the Corded Ware culture, at first lived as mobile cattle breeders, but around 2200 BC started building permanent settlements and engaged in agriculture as well. Mierzanowice culture was a conservative society, frequently still using stone tools and reserving copper for decorations.

Значи, вјероватно се ради о сточарима који су временом почели да се баве земљорадњом и почели да живе у сталним насељима.

Занимљива грана, јер се чини да излази ван подручја балто-словенске етногенезе, а опет је најближа R1a балтичкој и словенској Z280 (Z92 и CTS1211). Мислим да је у неком каснијем историјском периоду ушла у етногенезу германске популације.

И временска процјена на Y Fullu се поклапа са овом из истраживања 4600-4300 година старости.

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Јануар 30, 2017, 10:02:07 поподне
Географски налаз највише одговара тзв. Mierzanowice culture

За њу се на Википедији каже сљедеће:

East of the Unetice culture, in Lesser Poland and further north to the Masovia region, during roughly the same span of time, lay the territory of the Mierzanowice culture, named after the type-site village near Opatów. These people, culturally also descendants of the Corded Ware culture, at first lived as mobile cattle breeders, but around 2200 BC started building permanent settlements and engaged in agriculture as well. Mierzanowice culture was a conservative society, frequently still using stone tools and reserving copper for decorations.

Значи, вјероватно се ради о сточарима који су временом почели да се баве земљорадњом и почели да живе у сталним насељима.

Занимљива грана, јер се чини да излази ван подручја балто-словенске етногенезе, а опет је најближа R1a балтичкој и словенској Z280 (Z92 и CTS1211). Мислим да је у неком каснијем историјском периоду ушла у етногенезу германске популације.

И временска процјена на Y Fullu се поклапа са овом из истраживања 4600-4300 година старости.

И мени је то била прва асоцијација, двоумио сам се да ли да напишем касна Миерзановицка или рана Тшињецка, пошто је Тшињецка настала управо на темељу Миерзановицке и још неких мањих култура, на крају се одлучих за другу опцију. :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Фебруар 04, 2017, 08:26:04 пре подне
February 02, 2017

The Neolithic Transition in the Baltic Was Not Driven by Admixture with Early European Farmers
http://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(16)31542-1 (http://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(16)31542-1)


Y-SNP calls from Mesolithic and Neolithic Latvia and Ukraine (https://genetiker.wordpress.com/2017/02/04/y-snp-calls-from-mesolithic-and-neolithic-latvia-and-ukraine/)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Фебруар 04, 2017, 10:39:11 пре подне

Y-SNP calls from Mesolithic and Neolithic Latvia and Ukraine (https://genetiker.wordpress.com/2017/02/04/y-snp-calls-from-mesolithic-and-neolithic-latvia-and-ukraine/)

Занимљиво... Видим да је у Украјини у питању место Васиљевка,  на југоистоку земље,  у Запорожју. Мало необеична област за I2-M223... Мада када је у питању мезолит,  ништа није изненађујуће.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Фебруар 04, 2017, 03:49:23 поподне

Y-SNP calls from Mesolithic and Neolithic Latvia and Ukraine (https://genetiker.wordpress.com/2017/02/04/y-snp-calls-from-mesolithic-and-neolithic-latvia-and-ukraine/)

Бане, хвала на линку. Сваки нови резултат старе ДНК отвори нова питања, тако и у овом случају.

Колико сам успио схватити, читајући рад, главна теза аутора јесте да неолит на подручју Источне Европе није био под утицајем неолитских досељеника из Анатолије, како је то случај са већим дијелом Централне и Западне Европе.

Свакако је велико изненађење и овакво сјеверозападно позиционирање R1b-M73 у Латвији и то у мезолиту, с обзиром да ово чак није ни европска грана хаплогрупе R1b. Честа Честа је међу Башкирима и другим турским народима. међутим, с обзиром да је у Карелији у мезолиту већ регисторвана R1a, мислим да све то говори у прилог некој већој старости протоиндоевропске популације у источној Европи, коју су аутосомалном днк још раније означили као EHG (Источни ловци сакупљачи). Оно што је такође евидентно јесте да су западноевропски (I) и источноевропски ловци сакупљачи (R1a, R1b) почели да се мјешају на Балтику и у источној Европи још у мезолиту. Разлика је наступила у неолиту, када источни ловци сакупљачи нису примили генетски утицај неолитских земљорадника како је то био случај у остатку Европе, већ утицаје популација из Евроазије, јужних степа и Кавказа.

Мезолитску мјешавину ловаца сакупљача /западних и источних) на подручју источне Европе показује и овај налаз I2a2 M223 који није први у том периоду на том подручју.

Вјерујем да ће овај налаз R1b-M73 у Латвији нарочито обрадовати Кљосова. :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Мића Фебруар 04, 2017, 05:56:48 поподне

Вјерујем да ће овај налаз R1b-M73 у Латвији нарочито обрадовати Кљосова. :)
Мала семантичка исправка, на српском је Летонија. :)
Велики поздрав
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Фебруар 04, 2017, 09:37:20 поподне
Мала семантичка исправка, на српском је Летонија. :)
Велики поздрав

Прихваћено. ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небо_Сав Фебруар 10, 2017, 11:09:20 поподне
О тешкоћама приликом одређивања древне ДНК
https://www.youtube.com/v/ZxgMTzSf2FE
(Разговор је на руском језику).

Руски генетичар Балановски (23:00) говори о својим искуствима из рада у лабораторијама и тешкоћама приликом утврђивања древне ДНК из костију. Наводи два  примера:
1. Повлачи руком испред свог носа пред камерама и каже да је у ваздуху испред његовог  остало више његовог ДНК материјала него што обично буде у остацима костију приликом археолошких ископавања. Могућност "загађења" материјала је врло велика: каже да-ако археолог има кијавицу, велика је вероватноћа да ће његова ДНК остати на костима.
2. Наводи пример истраживања феничана. Каже да је резултат испитивања указао на  постојање источно-азијске ДНК у древним костима,  тако да су  закључили да су "Кинези" обитавали далеко западније него што би се очекивало. На крају се испоставило да је узорак древних костију  био контаминиран  коришћењем пластичних рукавица произведених у савременој Кини  :)

 
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Фебруар 19, 2017, 01:27:45 поподне
Да ли неко зна о каквим је ДНК анализама реч и која лабораторија ће да их ради? Видим да ће се тешко доћи до ДНК материјала деспота Ђурђа, уколико је о њему реч...

http://www.novosti.rs/vesti/naslovna/reportaze/aktuelno.293.html:650718-Sarkofag-otkriva-tajnu-grobnice-despota-Djurdja
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Фебруар 19, 2017, 01:33:03 поподне
Да ли неко зна о каквим је ДНК анализама реч и која лабораторија ће да их ради? Видим да ће се тешко доћи до ДНК материјала деспота Ђурђа, уколико је о њему реч...

http://www.novosti.rs/vesti/naslovna/reportaze/aktuelno.293.html:650718-Sarkofag-otkriva-tajnu-grobnice-despota-Djurdja
99% ће радити анализе где ће покушати да утврде ко је са ким у сродству, када већ скрнаве кости могли би да одраде и тестирање Y-dna, али ово је ипак Србија, можда се за 50 година одлуче за тако нешто.  ::)
Један човек је дао добар коментар.
Цитат
Uporedice DNK sa drugim clanovima porodice ili predaka za koje se zna gde su im posmrtni ostaci. Ostatke Lazara Brankovica ce uporediti sa Despotom Stefanom Lazarevicem. Ako se pojave slicnosti izmedju dva DNK, znace da su u krvnom srodstvu bili. Ako su sarkofagi sakriveni, bilo je razloga da tako bude. Neko koga su krili od Turaka.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Март 07, 2017, 01:16:21 поподне
Parallel ancient genomic transects reveal complex population history of early European farmers

http://biorxiv.org/content/early/2017/03/06/114488
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Март 07, 2017, 01:48:18 поподне
Parallel ancient genomic transects reveal complex population history of early European farmers

http://biorxiv.org/content/early/2017/03/06/114488

Шта рећи, дуго је трајала суша, а сад одједном сва ова силна стара ДНК. Колико видим има  127 нових узорака (од којих добар дио и са Y хромозомом) позног неолита и раног бронзаног доба у Европи. Реако бих да је то још увијек генетика "старе Европе" , G2a убједљиво влада, ту је и I2a, H2...
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Март 07, 2017, 02:05:55 поподне
Шта рећи, дуго је трајала суша, а сад одједном сва ова силна стара ДНК. Колико видим има  127 нових узорака (од којих добар дио и са Y хромозомом) позног неолита и раног бронзаног доба у Европи. Реако бих да је то још увијек генетика "старе Европе" , G2a убједљиво влада, ту је и I2a, H2...

Колико сам успео да приметим док сам летимично прегледао чланак, само један E1b1b, а ови I2a су углавном I2a2 M436, мада има и неколико I2a1a, и колико сам разумео већина њих је L1286. Изгледа да су I2a1b у то време били северније, тј. да су слободно крстарили од Северног мора до Балтика у потрази за ловином... ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Синиша Јерковић Март 07, 2017, 02:15:45 поподне
Колико сам успео да приметим док сам летимично прегледао чланак, само један E1b1b, а ови I2a су углавном I2a2 M436, мада има и неколико I2a1a, и колико сам разумео већина њих је L1286. Изгледа да су I2a1b у то време били северније, тј. да су слободно крстарили од Северног мора до Балтика у потрази за ловином... ;)

Да у праву си, чуди непостојање E1b, само овај један из Ленђел културе у Мађарској (то је иначе стари узорак). Не знам шта је објашњење, можда једноставно нису захватили културу у којој је Е1б био доминантан.

Интересантна је и ова хаплогрупа H2 коју су иначе раније наводили као F. данас је та грана веома минорно заступљена међу Европљанима, а судећи по новим налазима изгледа да је била прилично присутна у културама Винче и Старчева.

То је слична ситуација као са старовропском C граном, а рекао бих и већином I2a грана. Ова познонеолитска европска популација је очигледно прилично десеткована. О узроцима депопулације можемо само нагађати (Арбини, епидемија, метеор???), али је чињеница да су све те гране једва опстале и да су све практично имале уско грло.

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Март 07, 2017, 02:19:13 поподне
Све чекам да се појави нека стара Ј2. Има овај један J2a, али је то слабо. :)

Не знам у којим би сеобама могли доћи ови силни J2 по Европи. Остаје да је део дошао са Индоевропљанима, а део касније за време Рима? Мада, вероватно није све тако једноставно.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Март 07, 2017, 02:23:37 поподне
Лепота, и за очи и душу. Шта рећи осим - доминација  8)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Март 07, 2017, 04:28:36 поподне
Овај узорак из студије је веома занимљив за род А L497>L42.
G2a2b2a1a1b1=Z1815, under L497, Budakalász-Luppa csárda, Hungary sample circa 3000 BCE.
Z1815 је предачка грана L42 а налази се испод L497.
Након ове велике студије, већ видим да ће се мењати опис G2a на Еупедији.  :D
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Април 02, 2017, 12:14:56 пре подне
Пре 3 дана је објављен рад у коме су тестирани  Y-ДНК и Mt-ДНК Пјера Тераила (1473 —  30. април 1524), француског националног хероја.
https://sr.wikipedia.org/wiki/%D0%9F%D1%98%D0%B5%D1%80_%D0%A2%D0%B5%D1%80%D0%B0%D0%B8%D0%BB,_%D0%B3%D0%BE%D1%81%D0%BF%D0%BE%D0%B4%D0%B0%D1%80_%D0%91%D0%B0%D1%98%D0%B0%D1%80%D0%B0 (https://sr.wikipedia.org/wiki/%D0%9F%D1%98%D0%B5%D1%80_%D0%A2%D0%B5%D1%80%D0%B0%D0%B8%D0%BB,_%D0%B3%D0%BE%D1%81%D0%BF%D0%BE%D0%B4%D0%B0%D1%80_%D0%91%D0%B0%D1%98%D0%B0%D1%80%D0%B0)
http://file.scirp.org/pdf/OJGen_2017033014592625.pdf (http://file.scirp.org/pdf/OJGen_2017033014592625.pdf)
Y-ДНК:  R1b-M269
Mt-ДНК:  H5
(http://farm8.staticflickr.com/7040/6962335221_6eee61b7bd_o.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Април 02, 2017, 12:23:00 пре подне
Y-ДНК:  R1b-U106/M269
Има неких нелогичности, Невген му на основу 15 маркера даје.
Haplogroup   Probability   Fitness
1   I2a2a M223 99.63   16.88
2   E1b1b 0.19   10.8
3   G1-M342 0.06   9.99
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Април 02, 2017, 01:19:01 пре подне
Цитат из рада
''The predicted Y-haplogroup I-M223 is equivalent to I2a2a, previously known
as I2b1 of haplogroup I [8]. In fact one of us (G.L.) established that this haplogroup
corresponds to the sub-clade S21/U106 of the major haplogroup R1bM269''

Па ови који су радили анализу везе с' везом немају.  ;D
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Април 02, 2017, 12:56:36 поподне
Цитат из рада
''The predicted Y-haplogroup I-M223 is equivalent to I2a2a, previously known
as I2b1 of haplogroup I [8]. In fact one of us (G.L.) established that this haplogroup
corresponds to the sub-clade S21/U106 of the major haplogroup R1bM269''

Па ови који су радили анализу везе с' везом немају.  ;D

Какав, што би рекли Амери, epic fail.  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Тромеђа Април 13, 2017, 10:27:21 пре подне
https://www.youtube.com/v/Wg5IHN5t1X8

Интересантан документарац о ископавању залеђених гробница Источних Скита (Пазирик култура).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Никола Стојановић Април 20, 2017, 05:49:55 поподне
Ажуриране мапе:

http://www.eupedia.com/europe/neolithic_europe_map.shtml
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Ojler Април 29, 2017, 10:32:53 пре подне
Истраживачи Шпанског природњачког музеја у Мадриду пронашли су у седиментним стенама неколико различитих пећина ДНК трагове неандерталаца:

U pećinama pronađeni DNK tragovi izumrle vrste ljudi (http://www.b92.net/zivot/vesti.php?yyyy=2017&mm=04&dd=28&nav_id=1255114)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Мај 10, 2017, 01:36:52 поподне
Ово би требало да буде објављено врло ускоро (мерено данима): The Genomic History Of Southeastern Europe (http://biorxiv.org/content/early/2017/05/09/135616)

Цитат
Farming was first introduced to southeastern Europe in the mid-7th millennium BCE - brought by migrants from Anatolia who settled in the region before spreading throughout Europe. However, the dynamics of the interaction between the first farmers and the indigenous hunter-gatherers remain poorly understood because of the near absence of ancient DNA from the region. We report new genome-wide ancient DNA data from 204 individuals-65 Paleolithic and Mesolithic, 93 Neolithic, and 46 Copper, Bronze and Iron Age-who lived in southeastern Europe and surrounding regions between about 12,000 and 500 BCE. We document that the hunter-gatherer populations of southeastern Europe, the Baltic, and the North Pontic Steppe were distinctive from those of western Europe, with a West-East cline of ancestry. We show that the people who brought farming to Europe were not part of a single population, as early farmers from southern Greece are not descended from the Neolithic population of northwestern Anatolia that was ancestral to all other European farmers. The ancestors of the first farmers of northern and western Europe passed through southeastern Europe with limited admixture with local hunter-gatherers, but we show that some groups that remained in the region mixed extensively with local hunter-gatherers, with relatively sex-balanced admixture compared to the male-biased hunter-gatherer admixture that we show prevailed later in the North and West. After the spread of farming, southeastern Europe continued to be a nexus between East and West, with intermittent steppe ancestry, including in individuals from the Varna I cemetery and associated with the Cucuteni-Trypillian archaeological complex, up to 2,000 years before the Steppe migration that replaced much of northern Europe's population.

Биће весело.  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Мај 10, 2017, 01:39:22 поподне
Ово би требало да буде објављено врло ускоро (мерено данима): The Genomic History Of Southeastern Europe (http://biorxiv.org/content/early/2017/05/09/135616)

Биће весело.  :)

Занимљиво, једва чекам.  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Мај 10, 2017, 01:40:43 поподне
Ово би требало да буде објављено врло ускоро (мерено данима): The Genomic History Of Southeastern Europe (http://biorxiv.org/content/early/2017/05/09/135616)

Биће весело.  :)

Није било ништа скоро, једва чекам...Поготово ове: "and 46 Copper, Bronze and Iron Age-who lived in southeastern Europe"
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: nikolic Мај 10, 2017, 01:45:31 поподне
"We document that the hunter-gatherer populations of southeastern Europe, the Baltic, and the North Pontic Steppe were distinctive from those of western Europe, with a West-East cline of ancestry."

Мене ово највише интересује.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Мај 10, 2017, 01:46:10 поподне
Видим да најављују истовремено The Beaker Phenomenon And The Genomic Transformation Of Northwest Europe

Значи имаћемо Југоисток и Сјеверозапад Европе у једном дану.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 10, 2017, 01:52:56 поподне
Ово би требало да буде објављено врло ускоро (мерено данима): The Genomic History Of Southeastern Europe (http://biorxiv.org/content/early/2017/05/09/135616)

Биће весело.  :)
Дакле ипак ће бити нешто од овог рада. Поменух га на некој теми пре нека 2 месеца, баш сам се ових дана питао шта ће бити од тога. Већина ових неолитских узорака су из БЈРМ и Бугарске, тако да мислим да су Србију опет заобишли. За разлику од Светског ДНК дана, овде не стрепим за резултате, ту ће G2a бити доминантна.   :)
Видим да најављују истовремено The Beaker Phenomenon And The Genomic Transformation Of Northwest Europe

Значи имаћемо Југоисток и Сјеверозапад Европе у једном дану.
Largest study of Bell Beaker aDNA coming (http://www.anthrogenica.com/showthread.php?10492-Largest-study-of-Bell-Beaker-aDNA-coming)
 
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Мај 10, 2017, 01:53:50 поподне
Ово би требало да буде објављено врло ускоро (мерено данима): The Genomic History Of Southeastern Europe (http://biorxiv.org/content/early/2017/05/09/135616)

Биће весело.  :)

Нajзaд нeштo oпипљивo.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Мај 10, 2017, 01:58:10 поподне
"We document that the hunter-gatherer populations of southeastern Europe, the Baltic, and the North Pontic Steppe were distinctive from those of western Europe, with a West-East cline of ancestry."

Мене ово највише интересује.

То јесте интересантно, а мене такође занима и шта ће испасти из овога:
"We show that the people who brought farming to Europe were not part of a single population, as early farmers from southern Greece are not descended from the Neolithic population of northwestern Anatolia that was ancestral to all other European farmers."

Да ли овај навод открива могуће поријекло E-V13?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Мај 10, 2017, 02:19:09 поподне
То јесте интересантно, а мене такође занима и шта ће испасти из овога:
"We show that the people who brought farming to Europe were not part of a single population, as early farmers from southern Greece are not descended from the Neolithic population of northwestern Anatolia that was ancestral to all other European farmers."

Да ли овај навод открива могуће поријекло E-V13?

Колико се сећам предавања из археологије неолита, ти неолитски становници јужне Грчке су били међу првима који су се населили на простору до тада искључиво мезолитског европског континента, дакле чак пре протостарчевачке фазе, па се водила дискусија да ли су они ту дошли морским путем или копненим (преко данашњих егејских острва која су у то време можда формирала неку врсту земљоуза између Мале Азије и Грчке); чим се у чланку говори о томе да нису истог порекла као каснији досељеници из северозападне Анадолије, вероватно је у питању нека изолована популација која није оставила неког већег генетског трага, али можда и грешим; ако бих морао да погађам, мислим да у обзир осим E-V13 долазе и неке друге Е гране (можда E-M123) као и Ј1 и Ј2а/J2b, па и Т.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Мај 10, 2017, 02:38:04 поподне
Значи имаћемо Југоисток и Сјеверозапад Европе у једном дану.

А тај дан је изгледа данашњи. :D Не могу ишчекати.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 10, 2017, 02:46:34 поподне
А тај дан је изгледа данашњи. :D Не могу ишчекати.
This paper is still processing; please check again shortly.
;D ;D
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Мај 10, 2017, 03:02:34 поподне
This paper is still processing; please check again shortly.
;D ;D

На свака два минута. ;D
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 10, 2017, 03:06:49 поподне
На свака два минута. ;D
Тај рад!
(http://i.imgur.com/6iKKG14.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Мај 10, 2017, 03:34:40 поподне
Тај рад!
(http://i.imgur.com/6iKKG14.png)

Изгледа да ћемо чекати још који сат. Али вреди чекати, 170+204= 374 нова узорка, не могах пожелети бољи (рани) поклон за рођендан. ;D
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: nikolic Мај 10, 2017, 03:45:22 поподне
Идеја да је хг Е донела земљорадњу из северне Африке делује парадоксално, али треба имати у виду да је Сахара до пре око 5 хиљада година била плодна територија са другачијом климом. Можда је баш та промена климе натерала те људе да масовно крену у потрагу за  повољнијим условима крајем неолита. Хг Е до сада забележена свега пар пута на европском тлу у неолиту (Шпанија и Мађарска), и то колико се сећам са не баш великом поузданошћу предвиђача. Да ли је дошла преко Гибралтара или Крита, опет је нејасно. Диенекес је писао да Минојци нису потомци северноафриканаца према мтдна, али са оградом да ни ови други сада нису оно што су били пре неколико хиљада година.

http://dienekes.blogspot.rs/2013/05/mtdna-from-minoan-crete-hughey-et-al.html (http://dienekes.blogspot.rs/2013/05/mtdna-from-minoan-crete-hughey-et-al.html)

Надам се да ће овај рад успети да недвосмислено одговори на неколико питања (као што пише у најави):

1. Која хг чини основу палеолитско-мезолитског становништва Балкана,
2. Када и којим путем Е долази у Европу,
3. Какав микс постоји на Балкану у бронзано доба.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 10, 2017, 04:02:47 поподне
Ево га!
The Genomic History Of Southeastern Europe (http://biorxiv.org/content/early/2017/05/09/135616)

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 10, 2017, 04:05:27 поподне
Ево га!
The Genomic History Of Southeastern Europe (http://biorxiv.org/content/early/2017/05/09/135616)
И наши су изгледа узели учешће.
13 Institute of Archaeology, Belgrade;
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Nebo Мај 10, 2017, 04:08:14 поподне
Добро је што може да се даунлоудује документ, па да се чита натенане.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 10, 2017, 04:11:49 поподне
За почетак  :)
J2b2a-L283 from Bronze Age Croatia 1500-1700 BCE
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 10, 2017, 04:13:36 поподне
I3151 4000-3600 BCE Trypillia E
I4550 6000-5100 BCE Latvia_HG Q1a2
Честитам Банету! ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Đorđo Мај 10, 2017, 04:15:00 поподне
Лепенски Вир R1b1a:CTS4244:15510064T->G; R1b1:L822:7960019G->A; R:F652:23631629C->A; R:M799:23134896C->T
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 10, 2017, 04:16:49 поподне
I3948 5600-5470 BCE Balkans_Neolithic E1b1b1a1b1
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Мај 10, 2017, 04:27:17 поподне
I3948 5600-5470 BCE Balkans_Neolithic E1b1b1a1b1

За сада очекивано, E1b неолит, J2b2 бронз. доба. Има ли још шта? :)

Честитке припадницима E1b!
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 10, 2017, 04:33:16 поподне
Ево целе Y-ДНК листе! :)
http://biorxiv.org/highwire/filestream/40047/field_highwire_adjunct_files/1/135616-2.xlsx (http://biorxiv.org/highwire/filestream/40047/field_highwire_adjunct_files/1/135616-2.xlsx)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 10, 2017, 04:47:33 поподне
Први узорци древне ДНК са територије Републике Србије.  8)

(http://i.imgur.com/iyeaBXl.png)
(http://i.imgur.com/3IKgYwW.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Đorđo Мај 10, 2017, 04:48:09 поподне
"по сељачки"

Лепенски вир Р1б, И2а
Кордед вер - Р1а
Бел бикер - Р1б
Глобурал амфора И2 разни
Вучедол Р1б Г2а
Анатолија неолит Г2а Х2 И2ц Ц1а И
балкан неолит Г2а И2а
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: nikolic Мај 10, 2017, 04:50:58 поподне
Некако је чудно ово у вези Е1б. Само један резултат на Балкану и то у неолиту. Бронзано доба - ништа за сада. Нашли су И2а2, Р1а, Ј2б2, Х2, И, Г2а.

Разочарење из Грчке, само један потврђени Г2а, ништа више...

"по сељачки"

Лепенски вир Р1б, И2а


Ово је можда и највеће изненађење.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Мај 10, 2017, 04:53:54 поподне
Прилично изненађујуће, толико I2-M223 и R1b-Z2103 на Балкану...

Изгледа да за грчки јужни Неолит нису извукли Y-днк, штета...

Трипољци G2a.

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Никола Стојановић Мај 10, 2017, 05:01:06 поподне
Власац махом I2
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Мај 10, 2017, 05:11:08 поподне
Значајан налаз.

Култура пресоване керамике у Хрватској, пећина Земуница, 5500 пне, E-L618, очинска за E-V13
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Свевлад Мај 10, 2017, 05:13:22 поподне
"по сељачки"

Лепенски вир Р1б, И2а
Кордед вер - Р1а
Бел бикер - Р1б
Глобурал амфора И2 разни
Вучедол Р1б Г2а
Анатолија неолит Г2а Х2 И2ц Ц1а И
балкан неолит Г2а И2а
Лепенски Вир I2a  ;D.

Значи да већина Срба има дубље корене на Балкану од већине Албанаца!  ;D

Арнаути на апаратима!!!   ;D
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Мај 10, 2017, 05:13:56 поподне
Значајан налаз.

Култура пресоване керамике у Хрватској, пећина Земуница, 5500 пне, E-L618, очинска за E-V13

Пре ће бити рођак него предак.
А да је значајан налаз то јесте.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Jelic Мај 10, 2017, 05:14:32 поподне
Лепенски Вир I2a  ;D.

Значи да већина Срба има дубље корене на Балкану од већине Албанаца!  ;D

Арнаути на апаратима!!!   ;D

Не ради се о истој грани I2a.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Мај 10, 2017, 05:16:05 поподне
I2-M223 широко присутна на Балкану и у Источној Европи од палеолита, доминантна у најстаријем мезолитском слоју Лепенског Вира.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Свевлад Мај 10, 2017, 05:16:53 поподне
Не ради се о истој грани I2a.
Нема везе али та грана и ова коју Срби имају, имају заједничко порекло у прошлости, без обзира кад су се раздвојиле.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Мај 10, 2017, 05:18:26 поподне
Пре ће бити рођак него предак.
А да је значајан налаз то јесте.

Сви који су E-V13 позитивни су на E-L618, дакле је предачка.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Мај 10, 2017, 05:27:12 поподне
Зачуђујуће присуство хаплогрупе R1b у најстаријим палеолитским слојевима Лепенског Вира (тј. Ђердапске клисуре).

Као да R1b1 и I2-M223 представљају енку посебну комбинацију, старо преднеолитско становништво југоисточне Европе и црноморских степа.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Nebo Мај 10, 2017, 05:29:13 поподне
I2а свуда по Европи, баш како смо и до сада мислили – од Шпаније до Летоније.

Мени је занимљив налаз из Летоније:

Zvejnieki   ..   Latvia   M   U4b1a2   I2a1
Zvejnieki   ..   Latvia   M   U4a1   I2a1
Zvejnieki   ..   Latvia   M   U5a1c   I2a2a1b
Zvejnieki   ..   Latvia   M   U5a2c3   I2a2a1
Zvejnieki   ..   Latvia   M   U5a1c   I2a2a1
Zvejnieki   ..   Latvia   M   U5a2d   I2a2a1b

То је прилично североисточно за I2а.
Колико видим на википедији, тамо се не помињу ови I2а, већ само R1b?
https://en.wikipedia.org/wiki/Zvejnieki_burial_ground
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Мај 10, 2017, 05:29:25 поподне
Сви који су E-V13 позитивни су на E-L618, дакле је предачка.

Predacki SNP da, ali je moguce da je bio V13- tj da nije bio predak V13.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 10, 2017, 05:34:33 поподне
Још један рад са древном ДНК је објављен данас.
The population genomics of archaeological transition in west Iberia.
 (http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2017/05/10/134254.full.pdf)
(https://s4.postimg.org/lwopfcdr1/IMG_1573.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 10, 2017, 05:36:32 поподне
И трећи рад са древном ДНК  данас!
The Beaker Phenomenon And The Genomic Transformation Of Northwest Europe (http://biorxiv.org/content/early/2017/05/09/135962)

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Лепеничанин Мај 10, 2017, 05:38:36 поподне
Цитат
Зачуђујуће присуство хаплогрупе R1b у најстаријим палеолитским слојевима Лепенског Вира (тј. Ђердапске клисуре).

Како бре зачућујуће? Како бих иначе оправдао ник на форуму?  :D

Ваљда ће сад неко знати ово да растумачи, баш је да заболи глава колико је компликовано.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Мај 10, 2017, 05:46:26 поподне
Како бре зачућујуће? Како бих иначе оправдао ник на форуму?  :D

Ваљда ће сад неко знати ово да растумачи, баш је да заболи глава колико је компликовано.

Арбини узвраћају ударац. Кљосов неће бити најсретнији... ;)

Вучедолска култура R1b-Z2103 и G2a-L91.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Мај 10, 2017, 05:51:17 поподне
Предлажем да неко отвори нову тему за ову студију која се бави Југоисточном Европом. Ја немам времена извините.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Мај 10, 2017, 05:52:42 поподне
Арбини узвраћају ударац. Кљосов неће бити најсретнији... ;)

Вучедолска култура R1b-Z2103 и G2a-L91.

Билo би дoбpo иcцpтaти cвe oвo. Пpocтиpaњe култуpe, лoкaлитeт и xaплoгpупe...
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Мај 10, 2017, 06:16:24 поподне
Зачуђујуће присуство хаплогрупе R1b у најстаријим палеолитским слојевима Лепенског Вира (тј. Ђердапске клисуре).

Као да R1b1 и I2-M223 представљају енку посебну комбинацију, старо преднеолитско становништво југоисточне Европе и црноморских степа.

Зaиcтa зaчуђуjући peзултaт, кojи мeњa мнoгo тoгa, a пpe cвeгa вpeмe индoeвpoпeизaциje Бaлкaнa. C дpугe cтpaнe нeкa I2a je мopaлa бити пpиcутнa, кao xг лoвaцa-caкупљaчa.

Je л' oвa R1b-Z2103 пpeдaчкa BY611?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Мај 10, 2017, 06:18:33 поподне
Колико сам разумео, Е пронађена у Трипољу није рашчлањена на подгране, тако да се не зна да ли је у питању E-V13, док је Е из Хрватске L618, надграна одмах изнад V13, тако да је много већа вероватноћа да је овај налаз из Хрватске заиста E-V13, што се не може са великом сигурношћу рећи и за налаз из Трипоља.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Мај 10, 2017, 06:21:56 поподне
Зaиcтa зaчуђуjући peзултaт, кojи мeњa мнoгo тoгa, a пpe cвeгa вpeмe индoeвpoпeизaциje Бaлкaнa. C дpугe cтpaнe нeкa I2a je мopaлa бити пpиcутнa, кao xг лoвaцa-caкупљaчa.

Je л' oвa R1b-Z2103 пpeдaчкa BY611?

Јесте предачка, мада их доста међуграна дели, тако да је питање какво је тачно гранање од ове вучедолске.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Мај 10, 2017, 06:23:48 поподне
Колико сам разумео, Е пронађена у Трипољу није рашчлањена на подгране, тако да се не зна да ли је у питању E-V13, док је Е из Хрватске L618, надграна одмах изнад V13, тако да је много већа вероватноћа да је овај налаз из Хрватске заиста E-V13, што се не може са великом сигурношћу рећи и за налаз из Трипоља.

Да, управо тако. Сем тога је трипољска и млађа. У Трипољу доминира G2a-P303, при чему један трипољац одређен као G2a-P303>L497>L43 што је само једна мутација изнад наше G2a-L42.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Мај 10, 2017, 06:26:22 поподне
Зaиcтa зaчуђуjући peзултaт, кojи мeњa мнoгo тoгa, a пpe cвeгa вpeмe индoeвpoпeизaциje Бaлкaнa. C дpугe cтpaнe нeкa I2a je мopaлa бити пpиcутнa, кao xг лoвaцa-caкупљaчa.

Je л' oвa R1b-Z2103 пpeдaчкa BY611?

С тим да треба имати на уму да ова R1b присутна у Ђердапу у мезолиту, није Z2103 већ предачка варијанта за већину и источних и западних R1b.

Видјећемо кад неки, попут генетикера, проврте ове резултате, да ли ће моћи извући неку мутацију ниже.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Мај 10, 2017, 06:27:40 поподне
Приметио сам велику распрострањеност I2a2 М223 по Европи у свим периодима, од мезолита па до бронзаног доба, буквално нема где их нема.  :) Можда би наши балкански I2a2 пре могли да се повежу са неолитским становништвом Балкана него са келтским или германским дошљацима?

Приметио сам у оквиру Културе Лепенског Вира да се јавља и I2a1 (P37.2). Штета што нису одредили дубље подгране. Највероватније се ту ради или о CTS595 (испод које су М26, L1286 и L1294) или о L161.1 Isles.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 10, 2017, 06:33:27 поподне
Да, управо тако. Сем тога је трипољска и млађа. У Трипољу доминира G2a-P303, при чему један трипољац одређен као G2a-P303>L497>L43 што је само једна мутација изнад наше G2a-L42.
То је овај друшкан. :)
Изгледа да је госн М.Р. био у праву када нас је на једном другом форуму повезивао са Трипољском културом, ја сам више циљао на Линеарнотракасту керамику Немачке. :)
(http://i.imgur.com/OdmLfw4.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 10, 2017, 06:39:11 поподне
Хаплогрупе из рада са Бел Бикерима.
http://biorxiv.org/highwire/filestream/40100/field_highwire_adjunct_files/1/135962-2.xlsx (http://biorxiv.org/highwire/filestream/40100/field_highwire_adjunct_files/1/135962-2.xlsx)
Потребно је ући у прву табелу и потом провући линију скроз лево.
(http://i.imgur.com/LCAEj6M.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Мај 10, 2017, 06:43:34 поподне
Приметио сам велику распрострањеност I2a2 М223 по Европи у свим периодима, од мезолита па до бронзаног доба, буквално нема где их нема.  :) Можда би наши балкански I2a2 пре могли да се повежу са неолитским становништвом Балкана него са келтским или германским дошљацима?

И ја мислим тако. И неки ранији узорци су показивали у том правцу. Мада и даље треба свакој подграни прићи посебно.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Мај 10, 2017, 06:49:21 поподне
Хаплогрупе из рада са Бел Бикерима.
http://biorxiv.org/highwire/filestream/40100/field_highwire_adjunct_files/1/135962-2.xlsx (http://biorxiv.org/highwire/filestream/40100/field_highwire_adjunct_files/1/135962-2.xlsx)
Потребно је ући у прву табелу и потом провући линију скроз лево.
(http://i.imgur.com/LCAEj6M.png)

Хвала на линку, Атлантише.

I2-M423 присутна 3500-4500 г пне у Француској, Енглеској и Шкотској. У Шкотској неки од хаплотипова одређени као Ислес.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Мај 10, 2017, 06:52:08 поподне
Зачуђујуће одсуство J хаплогрупе у Бел Бикеру, а и у овом раду за Југоисточну Европу.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 10, 2017, 06:59:49 поподне
Зачуђујуће одсуство J хаплогрупе у Бел Бикеру, а и у овом раду за Југоисточну Европу.
Овај налаз и онај R1b Z2103 (изнад BY611) из Вучедола би се могли повезати са прото-Илирима односно том индоевропском заједницом која је била предачка данашњим Албанцима.
J2b2a-L283 from Bronze Age Croatia 1500-1700 BCE
J2b2-L283 се на филогенетском стаблу налази изнад типичне албанске Z1296.

Овај је такође занимљив.
I5068 5500-4775 BCE LBK_Austria J2
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: шкрњо Мај 10, 2017, 08:38:53 поподне
Приметио сам велику распрострањеност I2a2 М223 по Европи у свим периодима, од мезолита па до бронзаног доба, буквално нема где их нема.  :) Можда би наши балкански I2a2 пре могли да се повежу са неолитским становништвом Балкана него са келтским или германским дошљацима?
Судећи по данашњој географској распрострањености I2a2 и древној ДНК источне Европе, њихово веома рано уклапање у Индоевропљане је заслужно за велику распрострањеност по Европи.


П.С. сад примијетих да су узорак Мотала12, за разлику од ранијих студија, означили као сигуран динарик:
(http://i.imgur.com/SPXjt2y.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Мај 10, 2017, 08:39:18 поподне
У табели из рада ”The Beaker Phenomenon And The Genomic Transformation Of Northwest Europe” је узорак Motala12 са хаплогрупом I2a1b2a1.
Јел то I-CTS10228???
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 10, 2017, 08:40:28 поподне
У табели из рада ”The Beaker Phenomenon And The Genomic Transformation Of Northwest Europe” је узорак Motala12 са хаплогрупом I2a1b2a1.
Јел то I-CTS10228???

Судећи по данашњој географској распрострањености I2a2 и древној ДНК источне Европе, њихово веома рано уклапање у Индоевропљане је заслужно за велику распрострањеност по Европи.


П.С. сад примијетих да су узорак Мотала12, за разлику од ранијих студија, означили као сигуран динарик:
(http://i.imgur.com/SPXjt2y.png)
Слично размишљате! ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Jelic Мај 10, 2017, 08:40:49 поподне
У табели из рада ”The Beaker Phenomenon And The Genomic Transformation Of Northwest Europe” је узорак Motala12 са хаплогрупом I2a1b2a1.
Јел то I-CTS10228???

http://www.eupedia.com/forum/threads/31961-I2a1b2a1-(I-CTS10228)-a-strong-marker-of-Slavic-expansion

Јесте ???
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Никола Стојановић Мај 10, 2017, 09:03:22 поподне
Зaиcтa зaчуђуjући peзултaт, кojи мeњa мнoгo тoгa, a пpe cвeгa вpeмe индoeвpoпeизaциje Бaлкaнa. C дpугe cтpaнe нeкa I2a je мopaлa бити пpиcутнa, кao xг лoвaцa-caкупљaчa.
Можда управо ово објашњава процес "динаризације"...
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Мај 10, 2017, 09:19:50 поподне
Пpимeтиx и R1a1a1b2 у Бугapcкoj, бpoнзaнo дoбa. Дa ли je тo R1a-Z93?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 10, 2017, 09:21:01 поподне
Пpимeтиx и R1a1a1b2 у Бугapcкoj, бpoнзaнo дoбa. Дa ли je тo R1a-Z93?
Јесте.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Мај 10, 2017, 09:55:22 поподне
Овај налаз и онај R1b Z2103 (изнад BY611) из Вучедола би се могли повезати са прото-Илирима односно том индоевропском заједницом која је била предачка данашњим Албанцима.
J2b2a-L283 from Bronze Age Croatia 1500-1700 BCE
J2b2-L283 се на филогенетском стаблу налази изнад типичне албанске Z1296.

Овај је такође занимљив.
I5068 5500-4775 BCE LBK_Austria J2


J2b2 L283 је општеевропска грана ове хаплогрупе, предачка је и од PH1602 коју имају неки Крајишници исто колико и од Z1296, тако да без дубљих подграна никакве сигурне закључке не можемо да извлачимо. Исто тако, Z2103 је сувише широк појам, без дубљих подграна је беспредметно говорити о некој вези са садашњим европским народима. Хоћу рећи, ова вучедолска Z2103 би могла бити BY611, али исто тако и BY250, L584 (био је један овакав хаплотип у херцеговачком подухвату), или било која друга подграна која се налази испод Z2103 а има их много, да не рачунамо могућност да је овде у питању нека изумрла подграна. Највећа разноврсност BY611 и њених сродних, паралелних грана је на истоку Балкана, док на западном делу имамо само ону која је повезана са Албанцима и босанско-крајишничку, која је вероватно исто дошла из источнијих крајева током раног модерног периода; с друге стране, чини ми се да се на западу Балкана, иако је има мало (за сад), U152 истиче својом разноврсношћу, што би је по мени чинило бољим кандидатом за основни R1b хаплотип Илира (јер није могла да дође на Балкан само посредством Келта и Римљана). Надам се да ће ускоро неко да обрађује скелете из гвозденог доба Балкана и античког периода, јер само на тај начин ћемо доћи до дефинитивног одговора о Y-ДНК генетској структури Илира, Трачана и осталих балканских староседелаца.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Александар Невски Мај 10, 2017, 10:05:07 поподне
У табели из рада ”The Beaker Phenomenon And The Genomic Transformation Of Northwest Europe” је узорак Motala12 са хаплогрупом I2a1b2a1.
Јел то I-CTS10228???

Я се не бих много поуздао у Л147. То йе познато непоуздано мѣсто на Ы хромозому, койе се явља у бар шест хаплоскупин. Колико се сѣћам, већ йе се негдѣ о том расправљало на мрежи. Вѣроватно се овдѣ ради о малом бройу читањ.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 10, 2017, 10:32:59 поподне
J2b2 L283 је општеевропска грана ове хаплогрупе, предачка је и од PH1602 коју имају неки Крајишници исто колико и од Z1296, тако да без дубљих подграна никакве сигурне закључке не можемо да извлачимо. Исто тако, Z2103 је сувише широк појам, без дубљих подграна је беспредметно говорити о некој вези са садашњим европским народима. Хоћу рећи, ова вучедолска Z2103 би могла бити BY611, али исто тако и BY250, L584 (био је један овакав хаплотип у херцеговачком подухвату), или било која друга подграна која се налази испод Z2103 а има их много, да не рачунамо могућност да је овде у питању нека изумрла подграна. Највећа разноврсност BY611 и њених сродних, паралелних грана је на истоку Балкана, док на западном делу имамо само ону која је повезана са Албанцима и босанско-крајишничку, која је вероватно исто дошла из источнијих крајева током раног модерног периода; с друге стране, чини ми се да се на западу Балкана, иако је има мало (за сад), U152 истиче својом разноврсношћу, што би је по мени чинило бољим кандидатом за основни R1b хаплотип Илира (јер није могла да дође на Балкан само посредством Келта и Римљана). Надам се да ће ускоро неко да обрађује скелете из гвозденог доба Балкана и античког периода, јер само на тај начин ћемо доћи до дефинитивног одговора о Y-ДНК генетској структури Илира, Трачана и осталих балканских староседелаца.
Aпсолутно се слажем, али хоћу рећи да имамо 2 хаплогрупе које са обе своје гране које су пронађене (J2b2-L283> + R1b-Z2103) могу чинити потенцијалне прото-Илире, или пак неке пра-прото-албанце, пре свега јер су пронађенe на  међусобно веома блиским географским локацијама и  обе чине (потенцијално) предачке гране данашњих Албанаца. Код Албанаца су данас заступљене  и једна и друга грана ''испод'' пронађених, иако су потомци људи над чијим скелетима је вршена анализа можда припадали некој другој подграни која је мутирала кад и ове типично албанске. А одавно смо причали о тој вези J2b2-L283>Z1296 + R1b-Z2103>BY611.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Мај 10, 2017, 10:49:17 поподне
Aпсолутно се слажем, али хоћу рећи да имамо 2 хаплогрупе које са обе своје гране које су пронађене (J2b2-L283> + R1b-Z2103) могу чинити потенцијалне прото-Илире, или пак неке пра-прото-албанце, пре свега јер су пронађенe на  међусобно веома блиским географским локацијама и  обе чине (потенцијално) предачке гране данашњих Албанаца. Код Албанаца су данас заступљене  и једна и друга грана ''испод'' пронађених, иако су потомци људи над чијим скелетима је вршена анализа можда припадали некој другој подграни која је мутирала кад и ове типично албанске. А одавно смо причали о тој вези J2b2-L283>Z1296 + R1b-Z2103>BY611.

За вучедолску културу се углавном сматра да представља индоевропско језгро из кога су се касније развили Илири на простору Западног Балкана, мада ни то не мора бити тачно; археолошки гледано, изгледније је да ова култура заиста јесте, може се рећи, пре-прото-илирска; с друге стране, Балкан је преживео толико "тумбања" народа током праисторије да ме уопште не би зачудило да су Вучедолци неки далеки преци Трачана (али мислим да је то заиста мало изгледно).  :) Због тога кажем, све недоумице би решило једино испитивање скелета који се могу сигурно везати за историјске Илире, Трачане, Панонце, Дарданце, Дачане, итд.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 10, 2017, 11:34:00 поподне
Да, управо тако. Сем тога је трипољска и млађа. У Трипољу доминира G2a-P303, при чему један трипољац одређен као G2a-P303>L497>L43 што је само једна мутација изнад наше G2a-L42.
Синиша, још једном сам проверио овај узорак, када се копира тај део документа и пејстује у Ворду добије се ово:
G2a2b2a1a1b1a1a1:L42:16660759C->A
Дакле ради се о G-L42.  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Мај 11, 2017, 12:58:21 пре подне
Значајан налаз.

Култура пресоване керамике у Хрватској, пећина Земуница, 5500 пне, E-L618, очинска за E-V13

Peкao биx дa je Никoлa биo кopaк иcпpeд oвиx peзултaтa... :)

Мислим да је велика грешка археогенетичара и археолога уопште што се у узимању узорака фокусирају на средњу и нарочито северну Европу, а потпуно заобилазе Балкан. По мом мишљењу, Балкан је кључ за целу Европу што се тиче неолитских и каснијих енеолитских и бронзанодопских миграција. Преко њега су прешли сви они који су накнадно "подарили" неолит централној, западној и северној Европи, а по свему судећи је Балкан био и једна од главних "неуралгичних" тачака индоевропске експанзије. Што се тиче E-V13, мислим да је неолитска бутмирска култура, раширена на простору БиХ, ЦГ и Хрватске, била један од главних "резервоара" ове хаплогрупе, али да су њени припадници остали на неки начин изоловани од главних неолитских миграторних токова (хаплогрупе G2a, H2 и остале); накнадна нагла експанзија E-V13 је вероватно последица асимилације њених носилаца са ИЕ. Тако да, сада када уопштено знамо генетску слику "неолићана" на подручју Паноније и централне Европе, требало би се позабавити унутрашњошћу ЈИ Европе.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Мај 11, 2017, 01:01:53 пре подне
Peкao биx дa je Никoлa биo кopaк иcпpeд oвиx peзултaтa... :)

A Бoгa ми и Гуja...

Troc 3 је дефинитивно V88, али мислим да је мало вероватно да је у Иберију прешао из Северне Африке, пре ће бити да је обратно, јер се све старије гране налазе у Европи, висока фреквенција међу појединим афричким народима је последица founder effecta у задњих 4000-5000 година. Древни узорци пронађени до сада упућују да је Р1б1 по свој прилици у позном палеолиту и мезолиту боравила негде на простору Источне Европе, вероватно у степама северно од Црног Мора (тада језера), и врло могуће на Балкану. Оваквим положајем Р1б1 би се по мом мишљењу најбоље објаснили Вилабруна L754 и Els Trosc V88 који су кренули ка западу, док су M73 и M269 вероватно обитавали нешто источније где за сада имамо (пре)М73 међу летонским ловцима сакупљачима и врло вероватно код ловца-сакупљача из Самаре.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 11, 2017, 01:25:17 пре подне
A Бoгa ми и Гуja...
Слажем се, што омладина каже ''обрнули игрицу''.  :)

Да се вратимо на тему:
We find that four southern Greek (Peloponnese) Neolithic individuals – three from Diros Cave and one from Franchthi Cave, plus one previously published individual from Diros27 – are not consistent with descending from the same source population as other European farmers. In PCA these individuals are outliers; shifted away from northwestern Anatolian and European Early Neolithic individuals, in a direction opposite from WHG. D-statistics show that in fact, these “Peloponnese Neolithic” individuals have less WHG related ancestry than Anatolia Neolithic ones, and that they form an outgroup relative to Anatolian and Balkans Neolithic populations, suggesting an independent migration into Europe from a population that split off from the ancestors of the northwest Anatolian individuals from which we have data. ....One possibility is that this independent migration is related to an earlier Aceramic Neolithic in Greece that was derived from the pre-pottery Neolithic (PPN of Cyprus and the Levant. Under this model, the earliest Neolithic populations in Greece migrated from the Levant, perhaps via the southwestern Anatolian coast as early as 7000 BCE, but the majority of Neolithic ancestry arrived around 500 years later via a route that passed through northwestern Anatolia.
Дакле, неспорни факт је да су рани неолитски становници грчког Пелопонеза били другачијег порекла од осталих неолитских становника Европе, чији су већину тада чинили земљорадници који су мигрирали са подручја Анадолије, кроз Балкан до низија централне Европе.
Е-V13, директна миграција морем се севера Африке?  :)

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Мај 11, 2017, 01:43:29 пре подне
Дакле, неспорни факт је да су рани неолитски становници грчког Пелопонеза били другачијег порекла од осталих неолитских становника Европе, чији су већину тада чинили земљорадници који су мигрирали са подручја Анадолије, кроз Балкан до низија централне Европе.
Е-V13, директна миграција морем се севера Африке?  :)

Могуће, а могуће и са Леванта, и тамо је пронађен један М78, додуше са звјездицом.

Пре-керамички неолитик Б (8700 - 6000 п.н.е.): I1710  7733-7526 п.н.е.  M78* (CTS675+, L618-, V22-, V65-, V12-)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 11, 2017, 02:02:51 пре подне
Могуће, а могуће и са Леванта, и тамо је пронађен један М78, додуше са звјездицом.

Пре-керамички неолитик Б (8700 - 6000 п.н.е.): I1710  7733-7526 п.н.е.  M78* (CTS675+, L618-, V22-, V65-, V12-)
Управо. Е сада, пошто имамо онај E1b1b1a1b1 који је врло вероватно предачки грани Е-V13 из околине Сплита датиран 7600-7470  пне, ту би се, као што је НиколаВук пре извесног времена навео, дефинитивно могло рећи да је некада био ''хотспот'' Е-V13 након касномезолитских/ранонеолитских миграција са југа Балкана, одакле се она ширила даље у Европи, ''стидљиво'' неолитом (Трипољска култура (Verteba Cave E 6000-5600 ybp)), Сопот Ленгел култура (E-M78 (7200-5800 ybp) E-M78 (7000-6300 ybp)) али и након тога ''бумом'' након доласка Индоевропљана и успостављања Вучедолске и сродних култура (географска блискост са J2b2-L283). Ово је наравно само претпоставка мене као лаика и љубитеља ове области под условом да се даљим археогенетским налазима докаже да је E-V13 била присутна у млађим културама и локалитетима од оног из околине Сплита. Такође је занимљиво да је овај E-V13  из Далмације за минимум 470 година старији од оног из Каталоније.
(http://i.imgur.com/r4SuBeB.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Мај 11, 2017, 03:05:27 пре подне
Управо. Е сада, пошто имамо онај E1b1b1a1b1 који је врло вероватно предачки грани Е-V13 из околине Сплита датиран 5600-5470  пне, ту би се, као што је НиколаВук пре извесног времена навео, дефинитивно могло рећи да је некада био ''хотспот'' Е-V13 након касномезолитских/ранонеолитских миграција са југа Балкана, одакле се она ширила даље у Европи, ''стидљиво'' неолитом (Трипољска култура (Verteba Cave E 6000-5600 ybp)), Сопот Ленгел култура (E-M78 (7200-5800 ybp) E-M78 (7000-6300 ybp)) али и након тога ''бумом'' након доласка Индоевропљана и успостављања Вучедолске и сродних култура (географска блискост са J2b2-L283). Ово је наравно само претпоставка мене као лаика и љубитеља ове области под условом да се даљим археогенетским налазима докаже да је E-V13 била присутна у млађим културама и локалитетима од оног из околине Сплита. Такође је занимљиво да је овај E-V13  из Далмације за минимум 470 година старији од оног из Каталоније.

Слажемо се, ја после овог узорка из Хрватске немам сумње да је извориште грана L618 и V13 у Европи управо простор данашње БиХ и Далмације, грубо речено. Северно од тог простора, у Мађарској, имамо М78 и L618 у оквиру Сопотске и Ленђелске културе, чије порекло је са југа, са друге стране у Далмацији смо сада добили још један L618, тако да је по мени сасвим извесно да је L618 била заступљена и на територији између Далмације и простора северно од Саве, што би археолошки гледано биле Какањска и касније Бутмирска култура. Ширење гране L618 је по свој прилици било прилично ограничено током неолита, на шта указује и "уско грло" од скоро 3000 година између МRCА за L618 и V13. Овај простор је касније захваћен Вучедолском културом, и у том периоду је вероватно дошло до индоевропеизације L618 популације. Распадом Вучедолске културе око 2500 п.н.е. долази до формирања више регионалних група, а једна од њих је била и Цетинска култура, која је обухватала скоро целокупан приморски појас Хрватске и Црне Горе, а што је такође битно, имала је и једну варијанту дубље у копну, на територији која се скоро у потпуности подударала са матичном територијом касније Гласиначке културе. Око 2300. године почиње ширење Цетинске културе (што се поклапа са ширењем V13 чији је MRCA живео око 2700 п.н.е.), пре свега према југу и истоку, па су налази ове културе пронађени на целокупној територији Албаније, у Епиру, чак и на Пелопонезу. Превелико је искушење не повезати овај феномен Цетинске културе, и грану V13, са Пелазгима из историјских извора. :D
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Мај 11, 2017, 08:22:51 пре подне
Гледам овај други рад везан за Бел Бикер и сјеверозападну Европу. Грана I2-M423 по сада доступним налазима изгледа да је доминантна хаплогрупа неолитске Британије. Колико ми је познато досад ниједна друга грана из неолитске или палеолитске Британије није пронађена. Бел Бикеровци на британско тло долазе око 2500 г пне и доносе западну R1b1, гдје већ има R1b-L21 хаплогрупе.

Ово би значило да је Стоунхенџ највјероватније наслеђе I2-M423 популације. Није баш Лепенски Вир, али требало је оно камење подићи  :)

Занимљиво је да се најстарији налази М423 срећу управо око Догерланда, у Британији, Шведској, Луксембургу, мада видимо да допиру и до Иберије и до Летоније, тако да вјерујем да је доминантно становништво Догерланда могло припадати I2-M423 грани.
(https://media.nationalgeographic.org/assets/photos/000/318/31836.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Sergius Мај 11, 2017, 08:32:25 пре подне
Мислим да једну тему треба посветити само R1b Z2103. Чињеница да је у Европи присутна још од Мезолита мијења много ствари. Мислим да је и на Еупедији Маћамо доста конфузан по том питању. Он је, чини ми се, повезује са Хетитима. Свакако сматра да је она најзаступљенија R1b код Грка. Али не говори о којим подгранама се ради, нити је то извео у стаблу.

Да ли се подграна CTS9219 може повезати, тј. успоставити континуитет са присуством R1b Z2103 у Лепенском виру? Колико је она сложена, тј. да ли она укључује више индоевропских инвазија?

Овдје стварно нисам на свом терену, у смислу у шта би мутирала та R1b Z2103 из Лепенског Вира, тј. шта су њени насљедници. Видим да има и недоумица и код V-13.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Мај 11, 2017, 08:37:22 пре подне
Мислим да једну тему треба посветити само R1b Z2103. Чињеница да је у Европи присутна још од Мезолита мијења много ствари. Мислим да је и на Еупедији Маћамо доста конфузан по том питању. Он је, чини ми се, повезује са Хетитима. Свакако сматра да је она најзаступљенија R1b код Грка. Али не говори о којим подгранама се ради, нити је то извео у стаблу.

Да ли се подграна CTS9219 може повезати, тј. успоставити континуитет са присуством R1b Z2103 у Лепенском виру? Колико је она сложена, тј. да ли она укључује више индоевропских инвазија?

Овдје стварно нисам на свом терену, у смислу у шта би мутирала та R1b Z2103 из Лепенског Вира, тј. шта су њени насљедници. Видим да има и недоумица и код V-13.

Мислим да би прво требало добро претрести ове радове и гране R1b које се налазе у њему. Уколико је мезолитска R1b заправо V88 то доста мијења на ствари.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Sergius Мај 11, 2017, 09:05:46 пре подне
Ако је R1b заправо V88, онда то већ има много више смисла. На Еупедији је R1b Z2103* смјештена између раног и средњег бронзаног доба.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Мај 11, 2017, 10:22:17 пре подне
Мислим да би прво требало добро претрести ове радове и гране R1b које се налазе у њему. Уколико је мезолитска R1b заправо V88 то доста мијења на ствари.

Aкo je у питaњу V88, oндa je вepoвaтнo њиxoв дoлaзaк нa Бaлкaн из пpaвцa jугa, a нe ceвepa. Пpиcуcтвo G2a уз њиx, мoглo би дa укaзуje дa cу нa пpocтop Бaлкaнa дoшли "у пaкeту", ca пpocтopa "плoднoг пoлумeceцa", дoнeвши ca coбoм нoви нaчин пpивpeђивaњa-зeмљopaдњу.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Мај 11, 2017, 10:29:07 пре подне
Aкo je у питaњу V88, oндa je вepoвaтнo њиxoв дoлaзaк нa Бaлкaн из пpaвцa jугa, a нe ceвepa. Пpиcуcтвo G2a уз њиx, мoглo би дa укaзуje дa cу нa пpocтop Бaлкaнa дoшли "у пaкeту", ca пpocтopa "плoднoг пoлумeceцa", дoнeвши ca coбoм нoви нaчин пpивpeђивaњa-зeмљopaдњу.

Заправо је ова R1b1 у Ђердапској клисури из слоја који је претходио неолитској фази и који није повезан са G2a земљорадницима, већ са I2a2 ловцима сакупљачима. Дакле, они нису дошли са земљорадницима с југа, већ су били ту кад су G2a дошли.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Сремац Мај 11, 2017, 10:50:25 пре подне
Заправо је ова R1b1 у Ђердапској клисури из слоја који је претходио неолитској фази и који није повезан са G2a земљорадницима, већ са I2a2 ловцима сакупљачима. Дакле, они нису дошли са земљорадницима с југа, већ су били ту кад су G2a дошли.

Аутосомална узорака из Лепенског Вира показује и примесе Источног ловца сакупљача, што може бити одговарајуће R1b1 хаплогрупи, тј. она је могла бити донета непосредно Источним ловцем сакупљачем (EHG).

(http://i.imgur.com/ihXpgaF.png)

Плава боја-WHG
Црвена-EHG

Иначе, узорци из Ђердапске клисуре аутосомално показују највише склоности ка Скандинавском ловцу сакупљачу (Мотала)-зелена боја, који је пројектован чини ми се управо као мешавина Западног и Источног ловца сакупљача. Када се узорак из Мотале убаци у модел, као резултат се добија четврта слика по реду, која узорке из Лепенског Вира приказује као мешавину Мотале и Западног ловца сакупљача (различитог од Мотале):

(http://i.imgur.com/0eskw3X.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Мај 11, 2017, 10:53:17 пре подне
Аутосомална узорака из Лепенског Вира показује и примесе Источног ловца сакупљача, што може бити одговарајуће R1b1 хаплогрупи, тј. она је могла бити донета непосредно Источним ловцем сакупљачем (EHG).

Да, то има највише логике.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Мај 11, 2017, 11:32:18 пре подне
Не знам да ли споменусмо проналазак R1b>U152>L2 код Бел Бикер популације на простору Мађарске. То је из оног другог рада о Бел Бикеру.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Мај 11, 2017, 03:33:19 поподне
Гледам овај други рад везан за Бел Бикер и сјеверозападну Европу. Грана I2-M423 по сада доступним налазима изгледа да је доминантна хаплогрупа неолитске Британије. Колико ми је познато досад ниједна друга грана из неолитске или палеолитске Британије није пронађена. Бел Бикеровци на британско тло долазе око 2500 г пне и доносе западну R1b1, гдје већ има R1b-L21 хаплогрупе.

Ово би значило да је Стоунхенџ највјероватније наслеђе I2-M423 популације. Није баш Лепенски Вир, али требало је оно камење подићи  :)

Занимљиво је да се најстарији налази М423 срећу управо око Догерланда, у Британији, Шведској, Луксембургу, мада видимо да допиру и до Иберије и до Летоније, тако да вјерујем да је доминантно становништво Догерланда могло припадати I2-M423 грани.

Јесте најбројнија, али колико видех није једина. Ја пребројах 12 неолитских узорака који су М423 (I2a1b), 10 који су М436 (I2a2), два I и један I2. Скоро сви дубље тестирани I2a2 припадају грани Y3721>M284>L1195 (https://www.yfull.com/tree/I-L1195/), која је и данас заступљена скоро искључиво у Британији.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Мај 11, 2017, 03:37:18 поподне
Јесте најбројнија, али колико видех није једина. Ја пребројах 12 неолитских узорака који су М423 (I2a1b), 10 који су М436 (I2a2), два I и један I2. Скоро сви дубље тестирани I2a2 припадају грани Y3721>M284>L1195 (https://www.yfull.com/tree/I-L1195/), која је и данас заступљена скоро искључиво у Британији.

Да, у праву си. Превидио сам и I2a2.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Мај 11, 2017, 03:40:09 поподне
Треба напоменути да је J2b2 L283 из бронзаног доба (1700-1500. п.н.е.) пронађен у тумулу Велики Ваник код Вргорца у Далмацији, док је R1b Z2103 из вучедолске културе пронађен у Белом Манастиру у Барањи (2800-2500. п.н.е.). R1b1a који су пронађени на лепенским локалитетима су вероватно L754 (то је СНП који на Еупедијином стаблу додељују за R1b1a), а то је предачки снип од V88 и од L388 (од кога је настало 99% садашњег R1b). Дакле могуће је да су лепенски R1b или V88 или нека изумрла линија паралелна са V88. Као што је већ напоменуто, Z2103 се везује тек за рано бронзано доба, тако да она у доба мезолита није ни постојала.

Можда налаз L283 из близине Вргорца у Далмацији подупире ону претпоставку да су J2b2 дошли морским путем до Балкана, негде током енеолита или бронзаног доба? Очигледно је, за сада, њихово неприсуство у балканском неолиту...
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Мај 11, 2017, 03:46:51 поподне
Занимљив је и проналазак I2a2 CTS616>Y3721>Y3670>L1229 у оквиру бронзанодопске Ваћа (Vatya) културе у Мађарској (2000-1500. п.н.е.). На Еупедији су ову грану I2a2 сврстали у мезолитско-неолитске староседеоце Западне Европе (Megalith Builders), а овај налаз то оповргава и говори да је та грана у Западну Европу вероватно дошла са Индоевропљанима.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: шкрњо Мај 11, 2017, 06:16:26 поподне
Занимљив је и проналазак I2a2 CTS616>Y3721>Y3670>L1229 у оквиру бронзанодопске Ваћа (Vatya) културе у Мађарској (2000-1500. п.н.е.). На Еупедији су ову грану I2a2 сврстали у мезолитско-неолитске староседеоце Западне Европе (Megalith Builders), а овај налаз то оповргава и говори да је та грана у Западну Европу вероватно дошла са Индоевропљанима.
Да, изгледа да већина данашње I2a2 на сјеверозападу нема везе са старосједилачком гранама I2a2 на том простору, већ да је дошла из степа.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Александар Невски Мај 11, 2017, 07:15:44 поподне
Јесте најбројнија, али колико видех није једина. Ја пребројах 12 неолитских узорака који су М423 (I2a1b), 10 који су М436 (I2a2), два I и један I2. Скоро сви дубље тестирани I2a2 припадају грани Y3721>M284>L1195 (https://www.yfull.com/tree/I-L1195/), која је и данас заступљена скоро искључиво у Британији.

Црна Гуйо, можеш ли окачити везу ка хапловрстам рада?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Мај 11, 2017, 08:09:17 поподне
Црна Гуйо, можеш ли окачити везу ка хапловрстам рада?

Изволи Невски, подаци за ипсилон хаплогрупе су у трећој табели документа:

http://biorxiv.org/highwire/filestream/40100/field_highwire_adjunct_files/1/135962-2.xlsx (http://biorxiv.org/highwire/filestream/40100/field_highwire_adjunct_files/1/135962-2.xlsx)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Александар Невски Мај 11, 2017, 09:26:22 поподне
Изволи Невски, подаци за ипсилон хаплогрупе су у трећој табели документа:

http://biorxiv.org/highwire/filestream/40100/field_highwire_adjunct_files/1/135962-2.xlsx (http://biorxiv.org/highwire/filestream/40100/field_highwire_adjunct_files/1/135962-2.xlsx)

Хвала пуно, Црна Гуйо. :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Sergio Мај 12, 2017, 10:08:45 пре подне
Ted Kandell (YFull FB група).
Коментар у вези северозападне и југозападне Европе плус 3 слике:
"The new Olade et al. (2017) Bell Beaker study shows that *all* Neolithic Britons who were sequenced were in haplogroup I2.
Cassidy (2016) showed that the highest shared autosomal IBD between a Neolithic farmer from Ireland is with modern southern and eastern Iberians and Sardinians.
Sardinians are primarily (40%-45%) I-M26 (I-L158 in YFull) and Central Iberians are about 20% I-M26:
https://www.yfull.com/tree/I-L158/
Here we can see the same suffixes in pre-Indo-European Nuraghic Sardinian tribal names that we see in pre-Roman Ancient Iberian tribal names."
Слике:
(https://s15.postimg.org/rrxo9khyj/123.jpg)


(https://s8.postimg.org/4bqc7zfhx/124.jpg)


(https://s27.postimg.org/y2jq39bgz/125.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Sergio Мај 12, 2017, 10:15:19 пре подне
Ted Kandell (YFull FB група).
Коментар плус слика:
"A Bell Beaker Mystery: A single Bell Beaker individual from Augsburg Germany, from 2471–2300 calBCE in G2a2a1a2a1a-L166, matches a very few Germans and Sardinians (and possibly a couple of others from Franch and England) today. G-L166 is the Y clade of Otzi the Iceman, from c. 5200 BCE in Northern Italy just south of the Alps. (The Remodello culture.) However .... Otzi the Iceman and this German Bell Beaker *also* match a 1000 Genomes Punjabi from Lahore (PJL). This Punjabi is clearly of *European* patrilineal origin.There are no other G-L166s outside of Europe.
Why? Does this have something to do with the Ancient Greeks, who ruled Punjab for 240 years, from 250 BCE to 10 BCE?"

Слика:

(https://s14.postimg.org/6rncamy8x/111.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Мај 12, 2017, 10:51:54 пре подне
Треба напоменути да је J2b2 L283 из бронзаног доба (1700-1500. п.н.е.) пронађен у тумулу Велики Ваник код Вргорца у Далмацији, док је R1b Z2103 из вучедолске културе пронађен у Белом Манастиру у Барањи (2800-2500. п.н.е.). R1b1a који су пронађени на лепенским локалитетима су вероватно L754 (то је СНП који на Еупедијином стаблу додељују за R1b1a), а то је предачки снип од V88 и од L388 (од кога је настало 99% садашњег R1b). Дакле могуће је да су лепенски R1b или V88 или нека изумрла линија паралелна са V88. Као што је већ напоменуто, Z2103 се везује тек за рано бронзано доба, тако да она у доба мезолита није ни постојала.

Можда налаз L283 из близине Вргорца у Далмацији подупире ону претпоставку да су J2b2 дошли морским путем до Балкана, негде током енеолита или бронзаног доба? Очигледно је, за сада, њихово неприсуство у балканском неолиту...

Пpe ћe бити дa je изумpлa гpaнa, a дa je дaнaшњa R1b нa Бaлкaну из кacниjeг пepиoдa.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Предраг56 Мај 16, 2017, 07:45:09 поподне
Колико су ова најновија истраживања потврдила, а колико оповргла ранија истраживања на сличну или исту тeму?!!

Сeргио јe 13.11.2016.годинe  поставио одличнe  картe - мапе распрострањености хаплогрупа на другој тeми на овом форуму.

Кретање Y-DNK хаплогрупа у Европи током историје (http://www.poreklo.rs/forum/index.php?topic=1643.0)

Оригинални линк: http://www.abroadintheyard.com/maps-of-europes-ancient-tribes-kingdoms-and-y-dna/

7000 година пре нове ере.
Слика 1:

(http://www.abroadintheyard.com/wp-content/uploads/Europe-c-7000-BC-2k-jpg.jpg)

2000 година пре нове ере.
Слика 2:

(http://www.abroadintheyard.com/wp-content/uploads/Europe-c-2000-BC-2k-jpg.jpg)

117. година нове ере.
Слика 3:

(http://www.abroadintheyard.com/wp-content/uploads/Europe-c-117-AD-2k-jpg.jpg)

1227. година нове ере.
Слика 4:

(http://www.abroadintheyard.com/wp-content/uploads/Europe-c-1227-AD-2k-jpg.jpg)

Прве две су баш интересантне. :)


Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 26, 2017, 11:29:10 пре подне
Нови рад са древном ДНК, овога пута са простора данашње Румуније и Шпаније.

О студији:
Ancient DNA evidence shows hunter-gatherers and farmers were intimately linked (https://phys.org/news/2017-05-ancient-dna-evidence-hunter-gatherers-farmers.html)
Студија:
Paleogenomic Evidence for Multi-generational Mixing between Neolithic Farmers and Mesolithic Hunter-Gatherers in the Lower Danube Basin
 (http://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(17)30559-6)
Најзанимљивији закључци из студије:

"All three Romanian Mesolithic individuals were predicted to have dark hair and brown eyes, whereas the Eneolithic individual was predicted to have dark hair and light eye pigmentation ...
Три узорка из мезолита су биле индивидуе са тамном косом и браон очима, док је једна енеолитска особа имала тамну косу и светле очи.

At the level of mitochondrial DNA sequences... U5b ....U5a ... K1...
Мање битно.

At the Y chromosome level, all of our three male samples, SC1_Meso, SC2_Meso, and OC1_Meso, were assigned to the R1 and R1b haplogroups, both common in modern Europeans"
Такође занимљиво, наслањају се, барем што се тиче Y-ДНК на узорке из Лепенског Вира.

(https://3.bp.blogspot.com/-6wTyrhNIuWM/WSc8Tti_WqI/AAAAAAAAFqA/JlTXFMfDt5Ai5PwD0m4hLcgLdjfOWVYBQCLcB/s1600/Gonzalez-Fortes_Table_1.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: шкрњо Мај 26, 2017, 03:56:13 поподне
Колико су ова најновија истраживања потврдила, а колико оповргла ранија истраживања на сличну или исту тeму?!!

Сeргио јe 13.11.2016.годинe  поставио одличнe  картe - мапе распрострањености хаплогрупа на другој тeми на овом форуму.

Кретање Y-DNK хаплогрупа у Европи током историје (http://www.poreklo.rs/forum/index.php?topic=1643.0)
Ове мапе дјелују прилично непрецизно.
На првој на сјеверу и западу треба доминирати I2a1 (I2a1b и сјеверна I2a1a), а не недиференцирана I*. I1 треба бити више југозападније, не знам по којој основи је стављен у источну Европу (такође, најскорији заједнички предак свеукупне I1 је живио пар хиљада гоина касније). Већина I2a2 такође треба бити источније (јер је већина дошла из степа са Индоевропљанима).
На другој карти нема основа за присуство I2a1 на Балкану.
At the Y chromosome level, all of our three male samples, SC1_Meso, SC2_Meso, and OC1_Meso, were assigned to the R1 and R1b haplogroups, both common in modern Europeans"
Такође занимљиво, наслањају се, барем што се тиче Y-ДНК на узорке из Лепенског Вира.
Изгледа да је у јужној Европи све од касног палеолита R1b била честа међу ловцима-сакупљачима, међутим, била је ближа афричкој V88 него данашњoj европскoj, те тако данас немамо њихових потомака.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Предраг56 Мај 26, 2017, 04:35:24 поподне
Ове мапе дјелују прилично непрецизно.
На првој на сјеверу и западу треба доминирати I2a1 (I2a1b и сјеверна I2a1a), а не недиференцирана I*. I1 треба бити више југозападније, не знам по којој основи је стављен у источну Европу (такође, најскорији заједнички предак свеукупне I1 је живио пар хиљада гоина касније). Већина I2a2 такође треба бити источније (јер је већина дошла из степа са Индоевропљанима).
На другој карти нема основа за присуство I2a1 на Балкану.Изгледа да је у јужној Европи све од касног палеолита R1b била честа међу ловцима-сакупљачима, међутим, била је ближа афричкој V88 него данашњoj европскoj, те тако данас немамо њихових потомака.



Хвала на труду за одговор.
И ја сам отприлике дошао до неких закључака, наравно да су они и даље прилично лаички. Али, ето неко је направио те мапе, оне круже интернетом, мени су просто биле пријемчиве,ауторство је често спорно, а наравно и питање када и за коју употребу и на основу којих извора су направљене и да ли имају било какву научну вредност. Мада, верујем да би много обичног света, лаика, стало иза ових мапа. Јер прича са Винчом и Старчевом је одавно отишла у етар. И заживела.

Па видећемо шта ће будућност донети и да ли ће уопште бити више овако "капиталних генетичких истраживања" остатака становништва праисторијских култура из овог поднебља и оваквог занимања за југоисточну Европу.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Мај 26, 2017, 09:15:04 поподне
Continuity and admixture in the last five millennia of Levantine history from ancient Canaanite and present-day Lebanese genome sequences

http://biorxiv.org/content/early/2017/05/26/142448 (http://biorxiv.org/content/early/2017/05/26/142448)

Тестирано пет бронзанодопских (~1700 п.н.е.) скелета из Сидона, од тога су два мушка Ј1-P58 и Ј2b-М102.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 26, 2017, 09:18:31 поподне
Continuity and admixture in the last five millennia of Levantine history from ancient Canaanite and present-day Lebanese genome sequences

http://biorxiv.org/content/early/2017/05/26/142448 (http://biorxiv.org/content/early/2017/05/26/142448)

Тестирано пет бронзанодопских (~1700 п.н.е.) скелета из Сидона, од тога су два мушка Ј1-P58 и Ј2b-М102.
Ето и занимљивог резултата за P56 и остале Криче! :)
Kолике су шансе да је овај J2b уствари J2b1? По коментарима које видех на Антрогеници особа која је направила тему  верује да је у питању J2b1.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 26, 2017, 09:31:54 поподне
Ето и занимљивог резултата за P56 и остале Криче! :)
Kолике су шансе да је овај J2b уствари J2b1? По коментарима које видех на Антрогеници особа која је направила тему  верује да је у питању J2b1.
Изгледа да се ипак ради о J2b2, штета, али не сумњам да ће убудуће у даљим истраживањима бронзаног доба и млађих периода историје Леванта испливати и неки J2b1-M205 (поред оног из Јордана). Ј1 је  J1-L818.
(http://i.imgur.com/Jbd9rCb.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Мај 26, 2017, 09:38:37 поподне
Изгледа да се ипак ради о J2b2, штета, али не сумњам да ће убудуће у даљим истраживањима бронзаног доба и млађих периода историје Леванта испливати и неки J2b1-M205 (поред оног из Јордана). Ј1 је  J1-L818.

Негативан је на Ј2б2 и све испод, па је 100% Ј2б1 у питању. :) Овај други је само Р58 за сад, видећемо да ли ће се открити нека дубља грана када се објаве сирови подаци.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 26, 2017, 09:49:23 поподне
Негативан је на Ј2б2 и све испод, па је 100% Ј2б1 у питању. :) Овај други је само Р58 за сад, видећемо да ли ће се открити нека дубља грана када се објаве сирови подаци.
Yeah, checked the table again, I misread. So I probably didn't speak too fast after all. Thanks for making me notice!
Овај одговор важи и за мене.  :D
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Βασιλεία Ῥωμαίων Мај 26, 2017, 10:11:51 поподне
Continuity and admixture in the last five millennia of Levantine history from ancient Canaanite and present-day Lebanese genome sequences

http://biorxiv.org/content/early/2017/05/26/142448 (http://biorxiv.org/content/early/2017/05/26/142448)

Тестирано пет бронзанодопских (~1700 п.н.е.) скелета из Сидона, од тога су два мушка Ј1-P58 и Ј2b-М102.

У случају да је ријеч о J2b1-M205 то би био трећи налаз и сва три би била источњачког поријекла.
Овдје сам навео податке о претходна два налаза:
АНТИЧКИ НАЛАЗИ
Почетком 2016. године добили смо први антички налаз хаплогрупе J2b-M205.
Ријеч је о налазу из Јорка (Енглеска), који је датиран у вријеме Римског царства (100-300 године након Христа).
http://j2-m172.info/2016/01/exogenous-roman-era-york-3drif-26-is-j2b1-m205-and-likely-middle-eastener/
Крајем јуна мјесеца 2016. године добили смо и нови антички налаз.
Ријеч је о налазу из Аин Газала (Јордан), који је датиран у вријеме раног бронзаног доба (2489-2299 године прије Христа).
http://j2-m172.info/2016/06/first-ancient-j2-from-iran-mesolithic-copper-age-and-levant-bronze-age-lazaridis-et-al-first-farmers/

Милане, какво је твоје мишљење о ширењу хаплогрупе J2b1-M205 на основу ових налаза?
Подсјетићу да је према ономе што имамо (11 људи са 67 маркера) старост кричког рода процјењена на неких 1290 година (са могућношћу да иде и према 1500 година).
Да ли би било превише смјело претпоставити да су припадници кричког рода на Балкан дошли са Истока у вријеме касног Рима или ране Византије и како ти дјелује тај сценарио?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Мај 26, 2017, 11:08:10 поподне
Милане, какво је твоје мишљење о ширењу хаплогрупе J2b1-M205 на основу ових налаза?
Подсјетићу да је према ономе што имамо (11 људи са 67 маркера) старост кричког рода процјењена на неких 1290 година (са могућношћу да иде и према 1500 година).
Да ли би било превише смјело претпоставити да су припадници кричког рода на Балкан дошли са Истока у вријеме касног Рима или ране Византије и како ти дјелује тај сценарио?

Раније је већ доста говорено о овој теми, и мислим да смо се сви сложили да је даље порекло гране М205 са подручја Блиског Истока, највероватније Леванта. Што се тиче временског периода када је она могла стићи на Балкан у оптицају су биле разне варијанте, од Феничана и Грка до Римљана и Византије. Мени се управо због релативно мале старости кричке гране највероватнијим чинио период касне антике/раног средњег века, а и даље сматрам да је тај сценарио најизвеснији. Мислим да сада баратамо већ једним прилично великим узорком, и због тога сматрам да се старост кричке гране неће значајно повећати у будућности. Што се тиче гране М205 у целини, занимљиво је да су оба М205 бронзандопска узорка (рачунам да је и овај нови М205) пронађена уз Ј1-Р58, што можда може указивати да су се ове две гране заједно кретале у далекој прошлости, и да су заједно учествовале у формирању семитских народа, с тим што је Ј1-Р58 доживела наглу експанзију у енеолиту па је данас значајно више заступљена.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Βασιλεία Ῥωμαίων Мај 26, 2017, 11:30:09 поподне
Раније је већ доста говорено о овој теми, и мислим да смо се сви сложили да је даље порекло гране М205 са подручја Блиског Истока, највероватније Леванта. Што се тиче временског периода када је она могла стићи на Балкан у оптицају су биле разне варијанте, од Феничана и Грка до Римљана и Византије. Мени се управо због релативно мале старости кричке гране највероватнијим чинио период касне антике/раног средњег века, а и даље сматрам да је тај сценарио најизвеснији. Мислим да сада баратамо већ једним прилично великим узорком, и због тога сматрам да се старост кричке гране неће значајно повећати у будућности. Што се тиче гране М205 у целини, занимљиво је да су оба М205 бронзандопска узорка (рачунам да је и овај нови М205) пронађена уз Ј1-Р58, што можда може указивати да су се ове две гране заједно кретале у далекој прошлости, и да су заједно учествовале у формирању семитских народа, с тим што је Ј1-Р58 доживела наглу експанзију у енеолиту па је данас значајно више заступљена.

Хвала, Милане.
Наша позиција на стаблу хаплогрупе J2b1-M205 такође указује на источњачко поријекло:
http://tree.j2-m172.info/?Hg=J2b1
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Мај 27, 2017, 11:15:32 пре подне
Ето и занимљивог резултата за P56 и остале Криче! :)
Kолике су шансе да је овај J2b уствари J2b1? По коментарима које видех на Антрогеници особа која је направила тему  верује да је у питању J2b1.

Хвала, брате! Лепа вест! Већ трећи стари налаз из тих крајева. Ту и данас постоји висока концентрација J-M205 (Кипар, Либан, Јордан, итд), па су свакако бити за даље порекло групе.

Нека сеоба са истока, као што рече Милан, звучи реално (питање у које доба). Уколико наравно није "уско грло" у питању, мада према досптупним подацима, највероватније није реч о томе. Група за сада не постоји на античким налазиштима у Европи/на Балкану, а опет је сама грана Y22066 релативно млада. Како год, припадници шире групе PH4306 су за сада на Блиском истоку.

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Предраг56 Мај 27, 2017, 11:56:01 пре подне
Ето и занимљивог резултата за P56 и остале Криче! :)
Kолике су шансе да је овај J2b уствари J2b1? По коментарима које видех на Антрогеници особа која је направила тему  верује да је у питању J2b1.

Слатко сам се насмејао. Само је фалило да напишу узорак бр.P56 (зуб) припада Ј2б -М205!  :) и да му поставе дијагнозу "боловао од наследне парадентозе"!
Мени су оне мапе што сам горе "окачио" биле интересантне пре свега и највише због хаплогрупе И2а која се "код нас у кући" највише прати, па Р1а (строги матријархат је у питању :(), па тек онда Ј2б М205 (то због моје маленкости) која хаплогрупа је збиља врло скромно учествовала у етногенези српског народа (то ми се мало-мало саопшти, а тако је то када се жене дохвате ове теме), али стабилно и срчано (то онда ја сваки пут прокоментаришем).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Сремац Мај 27, 2017, 12:13:12 поподне
Занимљив и читљив рад.
Колико сам схватио Хананци су аутосомално били уједначена мешавина древних, неолитских становника Блиског Истока и Ирана:

...and found good support for the model of Sidon_BA being a mixture
of Levant_N (48.4± 4.2%) and Iran_ChL (51.6± 4.2%).


Ево када се мешање десило:

The admixture time also overlaps with the rise and fall of the Akkadian Empire which controlled the region from Iran to the Levant between ~4.4 and 4.2 kya. The Akkadian collapse is argued to have been the result of a widespread aridification event around 4,200 ya, possibly caused by a volcanic eruption.
Archaeological evidence in this period documents large-scale influxes of refugees from Northern
Mesopotamia towards the south, where cities and villages became overpopulated. Future sampling
of ancient DNA from Northern Syria and Iraq may reveal if these migrants carried the Iran_ChL-related
ancestry we observe in Bronze Age Sidon and Jordan.


Хаплогрупа J се управо доводи у везу са иранским наслеђем:

...haplogroup J was absent in all Natufian and Neolithic Levant male individuals
examined thus far, but emerged during the Bronze Age in Lebanon and Jordan along with ancestry
related to Iran.


Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Мај 28, 2017, 09:47:41 пре подне
At the Y chromosome level, all of our three male samples, SC1_Meso, SC2_Meso, and OC1_Meso, were assigned to the R1 and R1b haplogroups, both common in modern Europeans"
Такође занимљиво, наслањају се, барем што се тиче Y-ДНК на узорке из Лепенског Вира.

Скела Кладовеј и Островул Корбулуј су такође локалитети Културе Лепенског Вира, па је и логично што се генетски поклапају са узорцима са српске стране Ђердапа. Скела Кладовеј се налази преко пута Кладова (nomen est omen), док је Островул Корбулуј преко пута Корбова у Србији (опет, име све говори).  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Никола Стојановић Мај 28, 2017, 11:46:02 пре подне

At the Y chromosome level, all of our three male samples, SC1_Meso, SC2_Meso, and OC1_Meso, were assigned to the R1 and R1b haplogroups, both common in modern Europeans"
Такође занимљиво, наслањају се, барем што се тиче Y-ДНК на узорке из Лепенског Вира.

R1a у време Лепенског Вира?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 28, 2017, 11:54:07 пре подне
R1a у време Лепенског Вира?
Ако Кљосов прочита ово  :D  :D.
Шалу на страну, сумњам да је у питању R1a. ''Сувише'' је R1b узорака у Лепенском Виру да бисмо поверовали да је овај један неидентификовани R1 био R1a. Мислим да су, а верујем да се и остали слажу, тадашњи носиоци R1a обитавали много источнје, као и  преци већине данашњих носилаца R1b. Уосталом, видећемо шта ће рећи тзв raw data који после сваке студије бива објављен на неком од ова два блога.
genetiker (https://genetiker.wordpress.com/)
eurogenes
 (http://eurogenes.blogspot.rs/)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Мај 30, 2017, 07:27:40 пре подне
Стара днк (мапа)
http://umap.openstreetmap.fr/en/map/ancient-human-dna_41837#4/40.91/30.59

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Мај 30, 2017, 09:11:32 пре подне
Стара днк (мапа)
http://umap.openstreetmap.fr/en/map/ancient-human-dna_41837#4/40.91/30.59
Ево и Гуглове мапе на тај фазон, некако ми је прегледније од ове прве, па ко шта воли. :)
Линк (https://www.google.com/maps/d/viewer?mid=1TYJrkLXUap0Ip-8EIeTH-uzN4V8&hl=en_US&ll=33.395925408812445%2C0&z=2)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Be like Bill Јун 01, 2017, 10:08:37 пре подне
Continuity and admixture in the last five millennia of Levantine history from ancient Canaanite and present-day Lebanese genome sequences

http://biorxiv.org/content/early/2017/05/26/142448 (http://biorxiv.org/content/early/2017/05/26/142448)

Тестирано пет бронзанодопских (~1700 п.н.е.) скелета из Сидона, од тога су два мушка Ј1-P58 и Ј2b-М102.

Izgleda da su stigli SNP rezultati za ovaj rad. Jedan je u svakom slučaju M205 PF7314 :)

https://genetiker.wordpress.com/2017/06/01/y-snp-calls-from-ancient-egypt/
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јун 01, 2017, 10:15:17 пре подне
Izgleda da su stigli SNP rezultati za ovaj rad. Jedan je u svakom slučaju M205 PF7314 :)

https://genetiker.wordpress.com/2017/06/01/y-snp-calls-from-ancient-egypt/

Хвала, радоне. Потврда!
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Јун 01, 2017, 01:12:44 поподне
Izgleda da su stigli SNP rezultati za ovaj rad. Jedan je u svakom slučaju M205 PF7314 :)

https://genetiker.wordpress.com/2017/06/01/y-snp-calls-from-ancient-egypt/

Ови резултати се односе на други рад од пре неки дан у коме су тестиране египатске мумије. Дакле, још нема дефинитивне потврде за Сидонца, али добили смо новог древног Ј2б1-М205 из Египта.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јун 01, 2017, 01:22:25 поподне
Ови резултати се односе на други рад од пре неки дан у коме су тестиране египатске мумије. Дакле, још нема дефинитивне потврде за Сидонца, али добили смо новог древног Ј2б1-М205 из Египта.

https://www.youtube.com/v/ZEeUitEhonQ

Значи, мумија J2b1-M205. :) Качио сам баш пре неки дан овај J налаз.

И било ми је чудно ово кад је радон окачио:
Below are Y-SNP calls for JK2911, a sample from Pre-Ptolemaic Egypt. Positive calls are in bold, and negative calls are in non-bold
https://genetiker.wordpress.com/y-snp-calls-for-jk2911/
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Јун 01, 2017, 01:29:08 поподне
Izgleda da su stigli SNP rezultati za ovaj rad. Jedan je u svakom slučaju M205 PF7314 :)

https://genetiker.wordpress.com/2017/06/01/y-snp-calls-from-ancient-egypt/

Занимљиво. Тај период историје старог Египта, колико сам успио да видим, карактерише појачан грчки утицај (спомињу се и неке грчке колоније у самом Египту). Са друге стране, Египат је у том периоду под Асирцима, касније Персијанцима.

Ако узмемо у обзир виши проценат M205 на Кипру, можда не треба да нас чуди и појава М205 у Египту.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јун 01, 2017, 01:37:06 поподне
Сад ова Кингова мапа J-M205 изгледа интересантно:
(http://pichoster.net/images/2016/06/20/J2b1-M205.jpg)

Наводно највећа концентрација M205 (поред Кипра) постоји у Јордану и јужној Сирији (J. Chiaroni, необјављено истраживање). Видех сад да је један од аутора поменутих радова (Р. Кинг) још 2016. отворио тему на којој има речи и о M205:

Early Bronze Age Levantines: Reflecting a Kura-Araxes Migration from Armenia?
http://www.anthrogenica.com/showthread.php?7501-Early-Bronze-Age-Levantines-Reflecting-a-Kura-Araxes-Migration-from-Armenia
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Be like Bill Јун 01, 2017, 01:50:06 поподне
https://www.youtube.com/v/ZEeUitEhonQ

Значи, мумија J2b1-M205. :) Качио сам баш пре неки дан овај J налаз.

И било ми је чудно ово кад је радон окачио:
Below are Y-SNP calls for JK2911, a sample from Pre-Ptolemaic Egypt. Positive calls are in bold, and negative calls are in non-bold
https://genetiker.wordpress.com/y-snp-calls-for-jk2911/

Izvinjavamo se, mnogo se izvinjavamo ;D
Meni je bilo važno da prenesem dobre vesti, a koji je rad u pitanju je bilo manje bitno ;)

Da li se zna možda kad bi mogao biti objavljen ovaj Kingov rad? Ova karta je zaista zanimljiva
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јун 01, 2017, 02:16:56 поподне
Izvinjavamo se, mnogo se izvinjavamo ;D
Meni je bilo važno da prenesem dobre vesti, a koji je rad u pitanju je bilo manje bitno ;)

Da li se zna možda kad bi mogao biti objavljen ovaj Kingov rad? Ova karta je zaista zanimljiva

Хвала ти још једном, радоне. ;) Мапа је из рада који је изашао прошле године: Y-chromosome phylogeographic analysis of the Greek-Cypriot population reveals elements consistent with Neolithic and Bronze Age settlements
https://investigativegenetics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13323-016-0032-8

Овај рад о Сирији тек треба да изађе, или сам ја бар тако схватио. Можда су у питању неки старији резултати, који не смеју бити објављени и сл.

Ево те реченице:
"Both genetic data from the literature and Syria (Chiaroni J, unpublished results) show a frequency peak of J2b-M205 in the Southern Levant in which the frequency decreases northwards with latitude (Pearson’s R 2 = 0.282, p value = 0.011)."

Оно што јесте интересантно, јесте да се J2b1 за сада јавља уз J1 на истоку. Питам се да ли су се и наши J2b-M205 и J1-PF7263 могли кретати заједно?

Обе групације су бројне на простору Крајине, где се "преплићу" (Јањатовићи, па затим Тинтори који су "требали бити" ваши, итд.). Ви имате македонског Грка, ми анадолског Грка.

Једино се у старој Херцеговини распоред коси. Вас за сада нема у Потарју и Полимљу, али може се и то променити (постоје назнаке да вас има у Полимљу). Нас нема превише у источној Херцеговини, али нас има у западној Херцеговини у слабом проценту.

Наравно, из овог угла звучи као научна фантастика да су се две групе толико дуго заједно кретале, али с обзиром да су специфичне хг у питању, ко зна.


Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Be like Bill Јун 01, 2017, 05:38:22 поподне
Хвала ти још једном, радоне. ;) Мапа је из рада који је изашао прошле године: Y-chromosome phylogeographic analysis of the Greek-Cypriot population reveals elements consistent with Neolithic and Bronze Age settlements
https://investigativegenetics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13323-016-0032-8

Овај рад о Сирији тек треба да изађе, или сам ја бар тако схватио. Можда су у питању неки старији резултати, који не смеју бити објављени и сл.

Ево те реченице:
"Both genetic data from the literature and Syria (Chiaroni J, unpublished results) show a frequency peak of J2b-M205 in the Southern Levant in which the frequency decreases northwards with latitude (Pearson’s R 2 = 0.282, p value = 0.011)."

Оно што јесте интересантно, јесте да се J2b1 за сада јавља уз J1 на истоку. Питам се да ли су се и наши J2b-M205 и J1-PF7263 могли кретати заједно?

Обе групације су бројне на простору Крајине, где се "преплићу" (Јањатовићи, па затим Тинтори који су "требали бити" ваши, итд.). Ви имате македонског Грка, ми анадолског Грка.

Једино се у старој Херцеговини распоред коси. Вас за сада нема у Потарју и Полимљу, али може се и то променити (постоје назнаке да вас има у Полимљу). Нас нема превише у источној Херцеговини, али нас има у западној Херцеговини у слабом проценту.

Наравно, из овог угла звучи као научна фантастика да су се две групе толико дуго заједно кретале, али с обзиром да су специфичне хг у питању, ко зна.

Ovo je nešto što je i meni ponekad padalo na pamet. Već nabrojanim "bliskim susretima" mislim da možemo dodati i istok Srbije, područje Stare planine pošto i tamo postoje neki M205 haplotipovi, a i sa bugarske strane planine postoje neki J1 PF7263 haplotipovi, dva iz anonimnog istraživanja i Kulenski testiran na FT DNA
Gledajući razmeštaj, čini mi se, ako pretpostavimo da su mesta u kojima danas žive naši rođaci ona u kojima su živeli i na početku srednjeg veka, što jeste malo nategnuto, da su bili postavljeni na kako bi se reklo "strateškim položajima", na prometnicama koje su bile važne u antici i ranom srednjem veku. Kroz Diluntum (Stolac) je prolazio važan put Narona- Scardona, Kroz Pljevlja je prolazio put iz Panonije ka moru, starobalkanski rođaci su bili blizu Moravsko- Vardarske doline koja isto ima strateško značenje za politički status na Balkanu. Čak i Q1b L275 Bratonožići bi mogli biti potomstvo kakve grupe određene da čuva put prema Diokleji i Skadru.

Meni je zanimljivo da slika J2b M205 odudara od one karakteristične za ostale J2 haplotipove. Koliko se sećam onog rada o razmeštaju haplogrupa, J2 haplogrupe više dominiraju u priobalnom kraju sa više padavina pogodnima za agrokulturu. sa druge strane raspored J2b M205 je bliži rasporedu J1 haplotipova koji su karakterističniji za unutrašnjost Bliskog istoka i čiji broj raste kako se ide od mora prema obali. Pitam se da li se i njima ekonomija zasnivala na stočarstvu ili možda na rudarstvu pošto je za taj kraj karakteristična i dosta stara tradicija rudarenja. Jedna od karakteristika unutrašnjosti jeste i tribalizam i relativno homogena unutrašnja organizacija sa verovatno manjim prilivom stranaca u odnosu na priobalne teritorije. To bi verovatno dovelo i do čvrstih plemenski organizovanih plemena sa tradicijom ratovanja što je isto bilo zahvalno da ih Rimljani mobiliziraju i prebace na mesto gde je bilo dosta nemirnih urođenika, a gde treba da se radi neki posao oko čuvanja puteva i proizvodnju dobara.

Za ova spajanja rodova na prostoru Balkana mislim da su najzaslužnije srednjovekovne migracije pošto smo bili u istom biznisu i imali slične karakteristike. pošto smo mi čuvali zapadne kapije Zahumlja nije bilo potrebe za Kričima na tom prostoru i obrnuto. Tamo gde su bili Kriči moglo se mirno putovati i nije bilo potrebe za angažovanjem Vlahovića :)
kao stari mafijaši podelili smo prostore  ;D (a i mafija je mediteranska tvorevina puna J2 i J1 haplotipova)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јун 02, 2017, 10:45:14 поподне
Сад видех неки податак из 2004., да је наводно пронађен днк феничанског краља из Сидона (Tabnit sarcophagus). Хаплогрупа J2.

Ово је занимљиво с обзиром на последње резултате старе днк из тог краја. И у оној студији где су обрађене области које су биле под јаким грчко-феничански утицајем, има прилично ове хаплогрупе (J2-M172).

Морам да пронађем тај извор, како би потврдили причу.

(http://phoenicians.info/phoenicians99.jpg)
(http://phoenicians.info/map.jpg)

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: шкрњо Јун 24, 2017, 01:26:11 поподне
Доступна је древна ДНК из касноантичке (100-400) и средњовјековне (900-1200) Пољске: http://www.anthrogenica.com/showthread.php?6522-Early-Medieval-aDNA-from-Poland-coming-soon&p=251005&viewfull=1#post251005
Проблем је у томе што су доступни само "сирови" подаци, и тренутно ни један од узорака није обрађен... ко зна, нека покуша.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Јун 24, 2017, 01:41:30 поподне
Доступна је древна ДНК из касноантичке (100-400) и средњовјековне (900-1200) Пољске: http://www.anthrogenica.com/showthread.php?6522-Early-Medieval-aDNA-from-Poland-coming-soon&p=251005&viewfull=1#post251005
Проблем је у томе што су доступни само "сирови" подаци, и тренутно ни један од узорака није обрађен... ко зна, нека покуша.

Најзад! Још само да неко протумачи ове сирове податке.  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: шкрњо Јун 24, 2017, 01:59:36 поподне
Најзад! Још само да неко протумачи ове сирове податке.  :)
Изгледа да су се аутори студије завалили у столице и чекају да интернет хоби-генетичари обраде макар дио. :)

Да подсјетим, до сад су "процурела" (нисам сигуран у тачност овога) три узорка из Ковалевка:
- I1a3a1
- I2a1a1a
- G2

Изгледа да ће резултати бити прилично занимљиви и разнолики, судећи по јасној генетској подвојености тадашње Пољске, макар што се аутозомалне и мтДНК тиче.
Са Polishgenes блога:

Hints of deep genetic substructure in Iron Age Poland:

"The DNA of individuals from two early Roman-Period populations of Linowo and Rogowo was analysed. The distribution of three mutations varied significantly when compared to the modern Polish population. The TAFT analysis suggests that the decreased frequency of SLC11A1 D543N in modern Poles as compared to 2nd century Linowo samples is the result of non-stochastic mechanisms, such as purifying or balancing selection. The disparity in frequency of other mutations is most likely the result of genetic drift, an evolutionary force which is remarkably amplified in low-size groups. Together with the FST analysis, mtDNA haplotypes' distribution and deviation from the Hardy-Weinberg equilibrium, we suggest that the two populations were not interbreeding (despite the close proximity between them), but rather inbreeding, the results of which are particularly pronounced among Rogowo habitants.

Although no sound evidence of population differentiation was found when comparing the samples of Linowo and Rogowo, it is worth noticing that the distribution of mtDNA haplotypes between these two settlements differs remarkably. Apart from the two haplotypes (rCRS and 16126C) that occur in both studied groups, no other pattern of mtDNA SNPs is shared between them. The lack of reflection of these dissimilarities in the FST analysis is probably a result of the low-size group which is more exposed to result bias or low diversity of haplotypes among Rogowo individuals. All of the above allows to draw the theoretical conclusion that although these two settlements date back to the same period and are located within 55 km (or around 160 km along the Vistula River) of one another, they are genetically remote."
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Jelic Јун 24, 2017, 08:07:30 поподне
Није ми јасно, како се до сада није појавио нико да обради пристигле податке...
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: nikolic Јун 29, 2017, 10:52:56 поподне
Vadim Verenich:
 
Цитат
I sent a link to Vladimir T. from Yfull. He promised to analyse Y-haplogroups by the next Monday.
So far he said that Kow_55 is I1, Kow_22 - G-P303, Kow_57 - G-L30 and Mar_7 - I1, probably I-Y3603.
Kow_45 - I2, I2: Z2631/PF3623+ Z2673/CTS12003/PF3846+,I-M436: L35/S150/PF3862+ S5818/FGC3530+I-L801: S12350/FGC3570+

Аутосомално такође мешавина, има Германа, Словена, Сармата и још понечега.

http://www.anthrogenica.com/showthread.php?6522-Early-Medieval-aDNA-from-Poland-coming-soon/page70 (http://www.anthrogenica.com/showthread.php?6522-Early-Medieval-aDNA-from-Poland-coming-soon/page70)

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Јун 29, 2017, 11:03:53 поподне
Колико сам успео да видим на Еупедији, један корисник је изнео информацију да је пронађена и I1-Z63.
Што се тиче Y-ДНК из ове студије која је у току, за сада делује као типична староевропска (палеолит + неолит). Што се тиче ових G2a узорака, најреалније ми делује да су у питању потомци енеолитске културе која се пре свега простирала на потезу између северне Немачке, Данске, јужне Норвешке, Шведске, Холандије и западне Пољске, такозване Funnelbeaker culture. Подсетићу да у узорцима из ове културе имамо тестирана 2 G2a2a узорка. Најреалније гране које ми делују да би могле бити пронађене у студији која је у току су пре свега G2a>L497>CTS2230 и евентуално неки нижи снп. Овде сам помињао ту грану. Линк (http://www.poreklo.rs/forum/index.php?topic=21.msg56251#new)

Funnelbeaker culture

(https://i2.wp.com/www.geocities.ws/reginheim/funnelbeakerculture.gif)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Јун 30, 2017, 11:42:34 поподне
Докторска дисертација са 86 древних узорака, од чега је чак 59 са територије Србије, са мезолитских налазишта Лепенски Вир (33 узорка), Власац (16) и Падина (1), и неолитских налазишта Винча-Бело Брдо (8 ) и Гривац (1). Присутни су још и узорци са два локалитета у Румунији и три локалитета у Турској. Нажалост, нису тестирани целокупни геноми већине узорака, за велики део је тестирана само митохондријална ДНК.

https://publications.ub.uni-mainz.de/theses/volltexte/2017/100001355/pdf/100001355.pdf (https://publications.ub.uni-mainz.de/theses/volltexte/2017/100001355/pdf/100001355.pdf)

Када су у питању узорци са територије Србије, доступне су ипсилон хаплогрупе за четири узорка из Лепенског Вира (I2, I2a2, G2a, C2c, с тим да је СНП овог последњег непоуздан) и за пет узорака са Власца (2 x I2, 2 x R1, R1b1a2-V88). Овај последњи, уз још један узорак из Румуније (SC1) који је такође V88, указује да су врло вероватно и сви остали узорци културе Лепенског Вира из претходне студије који су тестирани као R1b1a(х R1b1a1) такође V88.

https://genetiker.wordpress.com/y-snp-calls-for-sc1/ (https://genetiker.wordpress.com/y-snp-calls-for-sc1/)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Јул 01, 2017, 12:03:26 пре подне
Хвала!
Мало чудно да рад није раније примећен, мислим обзиром на број и локације узорака.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Јул 06, 2017, 11:02:16 пре подне
Рад о мтДНК хаплогрупама раносредњовековних Мађара; у раду се наглашава да традиционалне PCR методе одређивања хаплотипова нису најпрецизније и понекад дају погрешне резултате, односно класификују узорке у погрешне хаплогрупе, а то су доказали поновним тестирањем узорака уз помоћ NGS (Next Generation Sequencing) метода:

http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0174886

Колико сам видео, у поменутој студији су откривена 3 таква "лажна" резултата - U4 (PCR), уствари N1a (NGS); H (R0) (PCR), уствари К1c (NGS); R (R1) (PCR), уствари J1c (NGS).

Да ли су овакве грешке могуће и при секвенцирању Y-хромозома или то важи само за митохондријалну ДНК?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Сол Јул 06, 2017, 08:33:58 поподне

Да ли има обљављених археогенетских налаза Пуховске културе (Моравска, Словачка, Пољска- од око 300. пре Хр. до 100 пос.Хр.)?

https://en.wikipedia.org/wiki/Púchov_culture
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Јул 07, 2017, 11:17:20 пре подне
Zenczak M, Handschuh L, Juras A, Marcinkowska-Swojak M, Philips A, Piontek J, Stoiarek I, Figlerowicz M

Institute of Bioorganic Chemistry, Polish Academy of Sciences, Poznan, Poland, Adam Mickiewicz University in Poznan, Department of Human Evolutionary Biology, Poznan, Poland

Y-chromosome haplogroup assignment through next generation sequencing of enriched ancient DNA libraries (https://www.academia.edu/33791135/2017_Zenczak_.....Piontek_..._Y-chromosome_haplogroup_assignment_through_next_generation_sequencing_of_enriched_ancient_DNA_libraries)

Цитат: Abstract
The Y-chromosome is passed down only from father to son and it contains the longest nonrecombining portion of DNA in the human genome. This feature makes it a perfect object for studying patterns of human migrations and genealogical reconstruction. Here, we present the analysis of Y-chromosome obtained from seventeen, not yet reported, ancient male samples excavated from different burial sites in Poland: Kowalewko (Roman Iron Age), Maslomecz (Roman Iron Age), Legowo (early Middle Ages) and Niemcza (early Middle Ages). We used a custom-design approach for target enrichment of over 5K Y-chromosome SNPs which were selected from the International Society of Genetic Genealogy (ISOGG, https:// www.isogg.org) database. Enriched libraries were sequenced on lllumina Genome Analyzer I lx. Raw reads were mapped with BWA against the hgl9 reference genome. The Genome Analysis Tool Kit (GATK) was utilized to recalibrate base quality scores and call genotypes. To determine haplogroups we used sites that overlap 9.99-Mb of the non-recombining region of the Y-chromosome as proposed by Poznik et al. (Science, 2013) where alleles were observed in the derived state and MAPQ > 30. We successfully assigned haplogroups to sixteen individuals. Eight belonged to haplogroup I1 (I-M253). Three of them belonged to the sub-branch Ila3alala (I-L1237) and one to I1a2a (I-Z59). I1 is the most common haplogroup in present day Scandinavia, and it is found in all places invaded by ancient Germanic tribes and Vikings. Four samples belonged to haplogroup G2a (G-P15) which is spread uniformly throughout Europe. Other individuals were assigned to I2a2 (I-M436), R1a (R-M420), R1bl (R-L278), E1b1 (E-P2). The next portion of samples is under investigation. With this study we hope to shed new light into the genetic structure of populations inhabiting lands of contemporary Poland during the Roman Iron Age and the Middle Ages.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Јул 17, 2017, 10:40:34 поподне
Genomics of Mesolithic Scandinavia reveal colonization routes and high-latitude adaptation
 (http://www.biorxiv.org/content/early/2017/07/17/164400)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Јул 17, 2017, 11:05:58 поподне
Genomics of Mesolithic Scandinavia reveal colonization routes and high-latitude adaptation
 (http://www.biorxiv.org/content/early/2017/07/17/164400)

Хвала, Атлантише. Чини се занимљив рад. Скандинавски мезолит, три тестирана Y-ДНК, сва тројица I2 хаплогрупе,од којих један М423 ( и то са налазишта Стеиген на сјеверу Норвешке). Аутосомално стоје на пола пута између EHG и WHG. Заправо су њихова мјешавина. Од саврмених популација аутосомално најближи су Литванцима, Естонцима и Летонцима.

Видим да су се у раду доста бавили фенотипом, генетски условљен, нажалост немам времена детаљно да читам. Урадили су и једну 3д реконструкцију лица.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: filipi Јул 17, 2017, 11:19:33 поподне
Genomics of Mesolithic Scandinavia reveal colonization routes and high-latitude adaptation
 (http://www.biorxiv.org/content/early/2017/07/17/164400)
Steigen
Steigen belonged to I2a1b-M423 and displayed derived alleles at 14 sites leading to this
haplogroup (Table S5.2). As this individual was ancestral for L161 and L621 downstream of
I2a1b we conclude that he does not belong further down in this lineage. Ancestral states at 13
29
additional sites within the I2 phylogeny exclude the lineages I2a2 and I2c to further corroborate
the I2a1b haplogroup call.

Haplogroup I
Three Mesolithic males in this study belong either to haplogroup I2 (Hum2 and SBj) or I2a1b
Steigen). Unfortunately, there was not enough Y-chromosomal data from the SF11 male to define
his haplogroup. Haplogroup I is one of the most frequently occurring lineages in pre-Neolithic
samples from Europe from which both Y-chromosomal and genome-wide data have been
generated. The earliest hg I individual has been found in a Gravettian context in the Paglicci cave
in Italy and is dated to 34,580-31,210 BP (118). This date is slightly older than a previous
estimate of the age of the haplogroup (ca 20,000-25,000 years) (119), but more in line with
newer estimates (ca 21,390-36,863 years) (120). Haplogroups I and I2 have also been found in
individuals dated to 16,000-12,830 BP from Magdalenian (Burkhardtshohle and HohleFels49),
Azilian (Bichon) and Epipaleolithic (Rochedane) contexts in Germany, Switzerland and France
respectively (118, 121). In line with our results, five other Mesolithic males from Sweden
(Motala2, Motala3, Motala6, Motala9 and Motala12), belong to I2 lineages (I2a1, I2a1b and I2c)
(81, 82, 118, 122). Three additional Mesolithic individuals from France (BerryAuBac and
Chaudardes1) and Luxembourg (Loschbour) belong to I and I2a1b respectively (81, 118). Other,
less prevalent, lineages found in pre-Neolithic European samples are C, F, J and
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: filipi Јул 17, 2017, 11:24:28 поподне
(https://s10.postimg.org/5qfphwv6x/aascandinavia_new.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јул 31, 2017, 06:16:30 поподне
Continuity and Admixture in the Last Five Millennia of Levantine History from Ancient Canaanite and Present-Day Lebanese Genome Sequences
http://www.cell.com/ajhg/fulltext/S0002-9297(17)30276-8
http://www.cell.com/cms/attachment/2101574577/2080017559/mmc1.pdf

Р. Кинг за онај стари узорак M205 из Сидона каже да највероватније припада подграни J-CTS1969. Ова грана је стара 6100 година. Толико је процењена и старост PH4306, односно оне подгране којој припадају и Кричи. Проблем је што је на FTDNA PH4306 низводно од CTS1969, док су на YFull-у ове подгране паралелене. Вероватно је процена на основу Yfull-a тачнија.

Иначе су опет мало променили TMRCA за неке гране (што значи да се нешто ипак ради). Тако је сада TMRCA J-CTS1969 и Y22059/PH4306 процењен на 6100 год. До недавно је било 6200, а пре тога испод 6000 година.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Јул 31, 2017, 06:44:31 поподне
Continuity and Admixture in the Last Five Millennia of Levantine History from Ancient Canaanite and Present-Day Lebanese Genome Sequences
http://www.cell.com/ajhg/fulltext/S0002-9297(17)30276-8
http://www.cell.com/cms/attachment/2101574577/2080017559/mmc1.pdf

Р. Кинг за онај стари узорак M205 из Сидона каже да највероватније припада подграни J-CTS1969. Ова грана је стара 6100 година. Толико је процењена и старост PH4306, односно оне подгране којој припадају и Кричи. Проблем је што је на FTDNA PH4306 низводно од CTS1969, док су на YFull-у ове подгране паралелене. Вероватно је процена на основу Yfull-a тачнија.

Иначе су опет мало променили TMRCA за неке гране (што значи да се нешто ипак ради). Тако је сада TMRCA J-CTS1969 и Y22059/PH4306 процењен на 6100 год. До недавно је било 6200, а пре тога испод 6000 година.

Genetiker је такође данас објавио SNP-ове (https://genetiker.wordpress.com/y-snp-calls-for-ers1790732/) за овај узорак, и судећи по њима је М205*. Позитиван је на 55 SNP-ова на М205 нивоу, а само један низводни позитиван SNP (CTS1969-YP13-PF7300-YP20) је највероватније последица оштећења која се јављају код древне ДНК, јер је негативан на све остале SNP-ове на том нивоу.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јул 31, 2017, 07:44:51 поподне
Genetiker је такође данас објавио SNP-ове (https://genetiker.wordpress.com/y-snp-calls-for-ers1790732/) за овај узорак, и судећи по њима је М205*. Позитиван је на 55 SNP-ова на М205 нивоу, а само један низводни позитиван SNP (CTS1969-YP13-PF7300-YP20) је највероватније последица оштећења која се јављају код древне ДНК, јер је негативан на све остале SNP-ове на том нивоу.

Тренутно постоје неки технички проблеми на сајту али, ако се не варам, J-CTS1969>YP13 су Велшанин, затим M205 из Катара, а низводно су и Шпанци, као и неки узорци са Сардиније.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Јул 31, 2017, 07:49:12 поподне
Genetiker је такође данас објавио SNP-ове (https://genetiker.wordpress.com/y-snp-calls-for-ers1790732/) за овај узорак, и судећи по њима је М205*. Позитиван је на 55 SNP-ова на М205 нивоу, а само један низводни позитиван SNP (CTS1969-YP13-PF7300-YP20) је највероватније последица оштећења која се јављају код древне ДНК, јер је негативан на све остале SNP-ове на том нивоу.

Уствари, ово би значило да можда није ни CTS1969?:)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Август 02, 2017, 09:23:09 поподне
Дуго очекивани рад је коначно објављен.
Genetic origins of the Minoans and Mycenaeans
 (http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature23310.html?foxtrotcallback=true)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Август 02, 2017, 09:25:09 поподне
Дуго очекивани рад је коначно објављен.
Genetic origins of the Minoans and Mycenaeans
 (http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature23310.html?foxtrotcallback=true)

Управо куцам поруку.:)

(https://scontent.fbeg1-1.fna.fbcdn.net/v/t1.0-9/20476276_10211629109495656_4593057142871097744_n.jpg?oh=6e7d4b01d7007e0c8484d65b2476b11a&oe=5A014E59)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Август 02, 2017, 09:40:07 поподне
Дуго очекивани рад је коначно објављен.
Genetic origins of the Minoans and Mycenaeans
 (http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature23310.html?foxtrotcallback=true)

Рекло би се, без већих изненађења.

Не знам да ли под овим J2a1d подразумјевају J2a-M319, који је и данас присутна на Криту.

Спомињу неки мањи утицај степске источноевропске компоненете у Микењанима, али очигледно се то односи на аутосомалну днк.

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Полић Август 02, 2017, 09:44:58 поподне
Дуго очекивани рад је коначно објављен.
Genetic origins of the Minoans and Mycenaeans
 (http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature23310.html?foxtrotcallback=true)
B92: Otkrivena velika misterija porekla drevnih Grka http://www.b92.net/zivot/vesti.php?yyyy=2017&mm=08&dd=02&nav_id=1289240

:)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Đorđo Август 02, 2017, 10:22:11 поподне
(http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/images/nature23310-st2.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Август 03, 2017, 08:30:01 пре подне
Рекло би се, без већих изненађења.

Не знам да ли под овим J2a1d подразумјевају J2a-M319, који је и данас присутна на Криту.

Спомињу неки мањи утицај степске источноевропске компоненете у Микењанима, али очигледно се то односи на аутосомалну днк.

Узорак I0070 (Minoan, Lasithi) је J2a-M319. Ова подграна је на Криту данас присутна са 8.8%.

Узорак I0073 је J2a-L26 (Minoan, Lasithi), исто као и узорак I9041 (Mycenaean, Peloponesse).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Август 03, 2017, 09:17:20 пре подне
Узорак I0070 (Minoan, Lasithi) је J2a-M319. Ова подграна је на Криту данас присутна са 8.8%.

Како рекоше и у закључку рада, континуитет да, али не и изолација.

Сјетих се како смо се на факултету спрдали с Грцима, који су и даље доживљавали античку грчку архитектуру као своју националну архитектуру. Међутим, сад кад видим ове резултате...
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Август 03, 2017, 10:54:05 пре подне
Рекло би се, без већих изненађења.

Не знам да ли под овим J2a1d подразумјевају J2a-M319, који је и данас присутна на Криту.

Спомињу неки мањи утицај степске источноевропске компоненете у Микењанима, али очигледно се то односи на аутосомалну днк.

Јесте мали узорак, али нема трагова Индоевропљана (Y-DNA), а могло би се то очекивати код Микенаца? Вероватно је и код њих превладао тај медитерански слој становништва.

(http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/images/nature23310-st2.jpg)

Сетих се оних прича да су Стари Грци били плави нордијци и сл. На основу овога, видимо да су изгледали исто као и данас. :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Август 03, 2017, 11:31:00 пре подне
Јесте мали узорак, али нема трагова Индоевропљана (Y-DNA), а могло би се то очекивати код Микенаца? Вероватно је и код њих превладао тај медитерански слој становништва.
Сувише је мали број узорака којима је успешно извучен Y-ДНК, свега пет, од тога 4 из минојског и 1 из микенског периода.
Код Минојаца видимо тотално одсуство тзв степског уплива код аутосомалне ДНК, док је код Микенаца нешто израженија, што је и логично с' обзиром на то да су се Микенци касније појавили и полако преовладали тим простором.
Не треба заборавити ни на очигледне индоевропске Y-ДНК хаплогрупе из рада The Genomic History of Southeastern Europe - Mathieson, Reich, et al. датиране на бронзано доба у Бугарској 1750-1625 calBCE R1a1a1b2 (R1a-Z93) односно Хрватској 1700-1500 BCE J2b2a, што је управо време када почиње период микенске и зенит односно касније пропаст минојске цивилизације. Тако да у неким будућим радовима свакако треба очекивати и неку R1 код Микенаца, док је код тадашњих Минојаца очигледан изолациони елемент потомака неолитских земљорадника.
(http://i.imgur.com/mLyxZ8h.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Radul Август 03, 2017, 04:06:14 поподне
Коначно мало и Ј2а екипе 8)

Individual Population Haplogroup
I2495 Anatolia_BA J1a(xJ1a2b)
I0070 Minoan_Lasithi J2a1d
I0073 Minoan_Lasithi J2a1(xJ2a1a, J2a1b1a, J2a1b2, J2a1c, J2a1e, J2a1h, J2a1i)
I9130 Minoan_Odigitria G2a2b2a(xG2a2b2a1b1a2a, G2a2b2a1c1a)
I9041 Mycenaean J2a1(xJ2a1a, J2a1b1, J2a1b2, J2a1c, J2a1e, J2a1g, J2a1h, J2a1i)

I0073 (Minoan from Lasithi)
This individual was derived for mutation L26:22942897T->C (J2a1) as well as upstream mutations
M410, L559, L152 (J2a). He was ancestral for several downstream haplogroups: M322:15469740C-
53>A (J2a1a), L560:21899860C->T (J2a1b1a), M166:21764694C->T (J2a1b2), M68:21878700A->G
(J2a1c), M339:2881367T->G (J2a1e), L24:14286528G->A (J2a1h), L88.2:17595842T->C and
L198:17595861A->C (J2a1i). He could thus be designated as J2a1(xJ2a1a, J2a1b1a, J2a1b2, J2a1c,
J2a1e, J2a1h, J2a1i).

I9041 (Mycenaean from Galatas Apatheia in the Peloponnese)
This individual was derived for mutations L26:22942897T->C and F4326:23021978A->G (J2a1) as
well as upstream mutations M410:2751678A->G, L559:21674327A->G, L152:22243566C->T,
L212:22711465T->C (J2a). He was ancestral for M322:15469740C->A (J2a1a), M260:15025506G-
>A and M92:21904023T->C (J2a1b1), M166:21764694C->T (J2a1b2), L210:16492197A->T
(J2a1b3), M68:21878700A->G (J2a1c), M339:2881367T->G (J2a1e), P81:6739856G->A (J2a1g),
L207.1:6753448A->G and L24:14286528G->A (J2a1h), L88.2:17595842T->C and
L198:17595861A->C (J2a1i). He could thus be designated as J2a1x(J2a1a, J2a1b1, J2a1b2, J2a1c,
J2a1e, J2a1g, J2a1h, J2a1i).

Узорак I0070 (Minoan, Lasithi) је J2a-M319. Ова подграна је на Криту данас присутна са 8.8%.

Узорак I0073 је J2a-L26 (Minoan, Lasithi), исто као и узорак I9041 (Mycenaean, Peloponesse).

Кинг је писао 2008. године, да се линије М319 и М92 повезују са Минојом. 8)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Август 03, 2017, 04:29:38 поподне

Кинг је писао 2008. године, да се линије М319 и М92 повезују са Минојом. 8)

Добар је Кинг. ;) Како време пролази, све више постаје јасно колико је битна та стара ДНК. Битна је наравно и савремена, она нам показује где су данас присутне одређене хг. Али за оно што нас занима, прапорекло народа и народности, неприкосновена је стара ДНК. :)

Честикте J2a екипи. Као што Синиша рече, нешто слично се и очекивало.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Бакс Август 03, 2017, 09:07:15 поподне
Сетих се оних прича да су Стари Грци били плави нордијци и сл. На основу овога, видимо да су изгледали исто као и данас. :)

Класични медитерански изглед. Сличан се може данас наћи у Либану и Сирији. Највећи број је црнокос, често се могу наћи и смеђококоси, а рецимо, сваки десети има мало плављу косу.
Вероватно је тако и у данашњој Грчкој, али боље познајем народе Леванта због тамошње ситуације.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Август 04, 2017, 10:51:22 пре подне
Ипак су и I0070 и I0073 (Minoan) J2a-M319*.
https://genetiker.wordpress.com/2017/08/03/y-snp-calls-for-minoans-and-mycenaeans/

Као што рекосмо, ова подграна је на Криту данас присутна са 6-9%.

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Август 04, 2017, 12:00:58 поподне
Ипак су и I0070 и I0073 (Minoan) J2a-M319*.
https://genetiker.wordpress.com/2017/08/03/y-snp-calls-for-minoans-and-mycenaeans/

Као што рекосмо, ова подграна је на Криту данас присутна са 6-9%.

Што се тиче Минојаца посебно је интересантан начин облачења њихових жена, јелек са обнаженим грудима.

Још је Артур Еванс Минојску културу назвао "Саманта Фокс" култура  ;)

(http://www.ancientgreece.com/media/img/Minoan_Queens_Fresco.jpg)

(https://i.pinimg.com/736x/e5/67/5a/e5675a37579425da8c62d2f95a4cfc2a--minoan-mycenaean.jpg)

(http://www.veniceclayartists.com/wp-content/uploads/2013/09/2669630579_5b11d7d41e.jpg)

(http://ancient-greece.org/images/museums/heraklion-mus/images/154_5465b_jpg.jpg)

(https://s-media-cache-ak0.pinimg.com/736x/0a/84/97/0a8497141228cdce4380f035b9512a11--creta-minoan.jpg)

Ко зна, како је почело, можда се ово опет врати у моду једног дана.  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Август 04, 2017, 01:00:25 поподне
Што се тиче Минојаца посебно је интересантан начин облачења њихових жена, јелек са обнаженим грудима.

Још је Артур Еванс Минојску културу назвао "Саманта Фокс" култура  ;)

(http://www.ancientgreece.com/media/img/Minoan_Queens_Fresco.jpg)

(https://i.pinimg.com/736x/e5/67/5a/e5675a37579425da8c62d2f95a4cfc2a--minoan-mycenaean.jpg)

(http://www.veniceclayartists.com/wp-content/uploads/2013/09/2669630579_5b11d7d41e.jpg)

(http://ancient-greece.org/images/museums/heraklion-mus/images/154_5465b_jpg.jpg)

(https://s-media-cache-ak0.pinimg.com/736x/0a/84/97/0a8497141228cdce4380f035b9512a11--creta-minoan.jpg)

Ко зна, како је почело, можда се ово опет врати у моду једног дана.  :)

На општу радост мушке популације.  ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Бакс Август 04, 2017, 02:34:12 поподне
На општу радост мушке популације.  ;)

Кад имаш нешто "на изволте" онда јако брзо досади.  :)

Видимо да је овде, као и у раном Риму, било популарно да жене буду што блеђе, а мушкарци изузетно потамнели.
Вероватно бледа кожа указује на то да је жена из "господске куће", то јест, да се није мучила у животу.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Август 05, 2017, 02:08:25 поподне
I2-L621 у Португалији пре око 5000 година: Y-SNP calls from prehistoric Portugal (https://genetiker.wordpress.com/2017/08/04/y-snp-calls-from-prehistoric-portugal/)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Србин Август 05, 2017, 03:11:02 поподне
Много југоисточно мада када се боље размисли ипак су људи у то доба били много покретнији. Не треба да нас чуди то што су тада били присутни у различитим крајевима континента.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Август 05, 2017, 03:37:49 поподне
Много југоисточно

Претпостављам да си хтео да напишеш - југозападно. :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Август 05, 2017, 03:57:32 поподне
I2-L621 у Португалији пре око 5000 година: Y-SNP calls from prehistoric Portugal (https://genetiker.wordpress.com/2017/08/04/y-snp-calls-from-prehistoric-portugal/)

Да, ово је доста југозападно за грану L621, међутим већ је било неколико налаза старе М423 и L161 на Пиринејском полуострву,а од М423>L161 има и тестираних савремених.

Ово су досад нађени стари М423 на том југозападном правцу:

Els Trocs [I0412 / Troc 5] Spain 5310-5206 BC I2a1b1    L161+, CTS1293+
Clos de Roque, Saint Maximin-la-Sainte-Baume [I4304 / ST2224]    France 4710–4540 calBCE  I2a1b:M423:19096091G->A; I:CTS48:2688442T->A; etc.
Clos de Roque, Saint Maximin-la-Sainte-Baume [I4303 / ST2009]    4680–4460 calBCE I2a1b:M423:19096091G->A; I:CTS48:2688442T->A; etc.
Portugal    Cabeco da Arruda I    3330 to 2885 cal BC I2a1b   

Од данас присутних грана М423 на Пиринејском полуострву имамо:

М423>L161>Y13338
М423>L161>Y5451

Ту би могли додати и грчко-шпанско-јеврејску I2-YP196>A2512>A7134 која је највјероватније дошла из Грчке у скоријем периоду.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Србин Август 05, 2017, 05:53:07 поподне
Претпостављам да си хтео да напишеш - југозападно. :)

Да, била је грешка. Југозападно.  :D

У савременој популацији постоји један L621* узорак из Лондона. Двојица која припадају млађој грани CTS4002* су из Немачке (Баден-Виртемберг) и Пољске (Светокришко Војводство).

Очигледно је некада та популација била прилично распрострањена. Данас имамо супротну ситуацију где имамо већину носилаца млађих мутација у источној и југоисточној Европи.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Август 06, 2017, 08:29:13 пре подне
Yfull стабло J-M319 након најновијих резултата старе ДНК са Крита:
http://open-genomes.org/genomes/Lazaridis%20(2017)/Hagios_Charalambos/Hagios_Charalambos_Minoans_on_the_YFull_5.05_tree.html

Још једна занимљивост, глумац Бен Афлек је испао J2a-M319, па су већ кренуле шале како је Бетмен био Минојац. :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Никола Стојановић Август 06, 2017, 06:18:57 поподне
Има ли наговештаја одакле ИЕ језик и митологија код Микењана и Минојаца?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Август 06, 2017, 09:40:04 поподне
Има ли наговештаја одакле ИЕ језик и митологија код Микењана и Минојаца?

Само је микенски био индоевропски. Линеар Б писмо је дешифровано и испоставило се да је њиме писан језик који представља један архаичан облик старогрчког језика, са именима богова која су малтене истоветна са каснијим старогрчким, а и њихове функције се углавном поклапају. Линеар А писмо, које је вероватно коришћено за писање минојског језика, до данас није дешифровано; Минојци свакако нису били Индоевропљани, о томе сведоче остаци њиховог језика као и религија која се више заснивала на староевропским (неолитским) мотивима Богиње Мајке-Природе, хтонског карактера (змије које богиња држи у рукама). Микенци доносе свој језик на Крит тек након велике природне катастрофе која је задесила острво Теру (Санторини) , ерупцијом подземног вулкана који је пола острва потопио (17-16. век п.н.е.) и изазвао велике цунамије који су допринели свеопштој катастрофи и постепеном слабљењу минојске цивилизације које је од тад наступило; неки историчари верују да је историјско сећање на ове катастрофичне догађаје било основа Платону за његов наратив о изгубљеном континенту Атлантиди.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Август 06, 2017, 09:50:09 поподне
Микенци доносе свој језик на Крит тек након велике природне катастрофе која је задесила острво Теру (Санторини) , ерупцијом подземног вулкана који је пола острва потопио (17-16. век п.н.е.) и изазвао велике цунамије који су допринели свеопштој катастрофи и постепеном слабљењу минојске цивилизације које је од тад наступило; неки историчари верују да је историјско сећање на ове катастрофичне догађаје било основа Платону за његов наратив о изгубљеном континенту Атлантиди.

A мoгућe дa cу пocлужили и пиcцимa Cтapoг зaвeтa вeзaнo зa пoшacти кoje cу пoгoдилe Eгипaт...
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Trubadur Август 11, 2017, 11:31:23 пре подне
Нисам нашао на коментаре на ову вест

http://www.pravda.rs/2017/05/15/ispitan-dnk-lepenskog-vira-vince-i-starceva-stigli-rezultati-srbi-su-starosedeoci-balkana/
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Август 11, 2017, 11:48:48 пре подне
Нисам нашао на коментаре на ову вест

http://www.pravda.rs/2017/05/15/ispitan-dnk-lepenskog-vira-vince-i-starceva-stigli-rezultati-srbi-su-starosedeoci-balkana/

Од ове поруке па на доле је писано о том истраживању:
http://www.poreklo.rs/forum/index.php?topic=679.msg51117#msg51117

Што се тиче ових помпезних новинарских наслова, не узимајте их за озбиљно, јер резултати тог истраживања уопште не могу да се подведу под наратив "Срби су староседеоци Балкана".
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Август 11, 2017, 11:55:00 пре подне
Нисам нашао на коментаре на ову вест

http://www.pravda.rs/2017/05/15/ispitan-dnk-lepenskog-vira-vince-i-starceva-stigli-rezultati-srbi-su-starosedeoci-balkana/

Нa oвaквa тумaчeњa, cвaки кoмeнтap je cувишaн...
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Be like Bill Септембар 04, 2017, 03:06:10 поподне
Ne sećam se da sam ranije viđao ovu kartu sa uzorcima drevne DNK:

http://umap.openstreetmap.fr/en/map/ancient-human-dna_41837#2/40.0/34.5
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Септембар 05, 2017, 07:50:05 поподне
Female exogamy and gene pool diversification at the transition from the Final Neolithic to the Early Bronze Age in central Europe
 (http://www.pnas.org/content/early/2017/08/29/1706355114)
Текст на B92 о овој студији, додуше са таблоидном подлогом.

Zapanjujuća saznanja naučnika o bronzanom dobu (http://www.b92.net/zivot/nauka.php?yyyy=2017&mm=09&dd=05&nav_id=1300319)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Септембар 05, 2017, 08:41:26 поподне
Female exogamy and gene pool diversification at the transition from the Final Neolithic to the Early Bronze Age in central Europe
 (http://www.pnas.org/content/early/2017/08/29/1706355114)
Текст на B92 о овој студији, додуше са таблоидном подлогом.

Zapanjujuća saznanja naučnika o bronzanom dobu (http://www.b92.net/zivot/nauka.php?yyyy=2017&mm=09&dd=05&nav_id=1300319)

Ово добро објашњава релативну уједначеност мтДНК хаплогрупа по Европи у односу на Y-ДНК хаплогрупе.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Септембар 10, 2017, 07:46:55 поподне
A female Viking warrior confirmed by genomics
 (http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ajpa.23308/full)

Spektakularno otkriće u oklopu vikinškog ratnika
 (http://www.b92.net/zivot/vesti.php?yyyy=2017&mm=09&dd=10&nav_id=1302149)
Naučnici sa Univerziteta u Stokholmu otkrili su da je skelet velikog i snažnog vikinškog ratnika iz 10. veka pripadao ženi, a ne muškarcu.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Be like Bill Септембар 10, 2017, 07:52:48 поподне
A female Viking warrior confirmed by genomics
 (http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ajpa.23308/full)

Spektakularno otkriće u oklopu vikinškog ratnika
 (http://www.b92.net/zivot/vesti.php?yyyy=2017&mm=09&dd=10&nav_id=1302149)
Naučnici sa Univerziteta u Stokholmu otkrili su da je skelet velikog i snažnog vikinškog ratnika iz 10. veka pripadao ženi, a ne muškarcu.

(https://media.tenor.co/images/7f9303bb93032af101ad148948774032/tenor.gif)

 :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Септембар 20, 2017, 01:43:52 поподне
The Genomic History Of Southeastern Europe

http://www.biorxiv.org/content/early/2017/09/19/135616.figures-only
http://www.biorxiv.org/content/biorxiv/suppl/2017/09/19/135616.DC4/135616-2.xlsx

Не би било да лоше да наши стручњаци за стару ДНК погледају овај рад.

Видим да су пронашли неку неолитску J2a и G2a (очекивано) у Хрватској (Осијек).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Септембар 20, 2017, 03:17:12 поподне
Ништа чудно бар што се тиче неолита, J2a смо већ имали у сличној култури у Мађарској (Сопот чини ми се) док је G2a2а постала ''стандард'' и не представља изненађење када се пронађе у том периоду.

Код овог допунског рада је свакако најзанимљивији R1a-M417 датиран на енеолит Украјине.

I6561, Alexandria Ukraine, 5000-3500 BCE, Y DNA R1a M417, mtDNA H2a1a.

Ради се о грани која је предачка за Z283 (самим тим и за Z280, M458 итд) и Z93, док сама M417 по Yfull-у настаје пре 8500 са најскоријим заједничким претком свих њених припадника управо у време на које је датиран овај узорак (3500 год п.н.е.), односно енеолит. Остаје да се види одакле толики генетски бум у то време, односно шта је утицало на нагли фаундер ефекат.

На први поглед делује као да су енеолитски М417 са тог подручја који су отишли на исток образовали Андроново а на западу Кордер Вер културу (обе доминантно R1a).

(https://i.imgur.com/jnfm0xm.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Септембар 20, 2017, 05:46:39 поподне
Колико је посве битан и занимљив овај узорак говори и податак да је налазиште са којег је узет узорак припадало култури Средњи Стог II, које се по Марији Гимбутас сматра прадомовином Прото-индоевропских језика. Самим тим што се ради о снп-у који је предачки за велики број грана широм Евроазије, може се рећи да ову хипотезу Марије Гимбутас која је писана и стварана много пре археогенетике након свега треба сматрати итекако могућом.

Alexandria (1 individual)An Eneolithic cemetery of the Sredny Stog II culture was excavated by D. Telegin in 1955-1957 near the village of Alexandria, Kupyansk district, Kharkov region on the left bank of theriver Oskol.105A total of 33 individuals were recovered.106 Based on craniometric analysis (I.Potekhina 1999) it was suggested that the Eneolithic inhabitants of Alexandria were nothomogeneous and resulted from admixture of local Neolithic hunter-gatherers and earlyfarmers, possibly Trypillian groups.107 We report genetic data from one individual:• I6561

Довољно је погледати аутосомални уплив код M417 узорка и видети да се теорија по којој су на подручју Средњег Стога живели људи мешаног порекла (фармерско-сточарског) односно Трипољци и придошли Индоевропски сточари може уважити.

Two Copper Age individuals (I4110 and I6561,215 Ukraine_Eneolithic) from Dereivka and Alexandria dated to ~3600-3400 BCE (and thus 216 preceding the Yamnaya complex) also have mixtures of steppe- and NW Anatolian Neolithic-217 related ancestry (Figure 1D, Supplementary Data Table 2).

(http://www.anthrogenica.com/attachment.php?attachmentid=18879&d=1505889469)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Никола Стојановић Септембар 20, 2017, 06:42:54 поподне
Довољно је погледати аутосомални уплив код M417 узорка и видети да се теорија по којој су на подручју Средњег Стога живели људи мешаног порекла (фармерско-сточарског) односно Трипољци и придошли Индоевропски сточари може уважити.
Која друга хаплогрупа би могла да учествује у овој генези, с обзиром на аутосомални резултат?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Септембар 20, 2017, 06:50:05 поподне
Која друга хаплогрупа би могла да учествује у овој генези, с обзиром на аутосомални резултат?
Имамо из прве верзије овог рада изашле у мају неколико G2a (један L43+) један Е1b1b и чини ми се неколицину I2a2 . Углавном у питању је становништво истока тадашње "старе Европе". С' обзиром на јачину NW Anatolian Neolithic-а свакако је у питању доминантна Ј/G Y-ДНК комбинација.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Септембар 24, 2017, 07:06:57 поподне
Neolithization of North Africa involved the migration of people from both the Levant and Europe
 (https://www.biorxiv.org/content/early/2017/09/21/191569?rss=1)

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: ... Октобар 06, 2017, 07:00:16 поподне
Немам приступ раду: http://science.sciencemag.org/content/early/2017/10/04/science.aao1807/tab-article-info
По форумима се помиње случајан промалазак И2а1б из 12. века

Индивидуум   Покрытие   Пол   мтДНК   Y-ДНК   Возраст
Sunghir 1              1.11   M   U8c          C1a2           33,875-31,770
Sunghir 2              4.08   M   U2          C1a2           35,283-33,185
Sunghir 3            10.75   M   U2          C1a2            35,154-33,031
Sunghir 4              3.87   M   U2          C1a2           34,485-33,499
Sunghir 5           0.001      -   -   -           30,780-29,746*
Sunghir 6   4.19      M   W3a1   I2a1b2   730-850*
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Селаковић Октобар 06, 2017, 07:12:17 поподне
Немам приступ раду: http://science.sciencemag.org/content/early/2017/10/04/science.aao1807/tab-article-info
По форумима се помиње случајан промалазак И2а1б из 12. века

Скинух рад, па ако неком треба нек ми пише у сандиче на који мејл да шаљем.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: ... Октобар 08, 2017, 10:04:28 пре подне
Немам приступ раду: http://science.sciencemag.org/content/early/2017/10/04/science.aao1807/tab-article-info
По форумима се помиње случајан промалазак И2а1б из 12. века

Индивидуум   Покрытие   Пол   мтДНК   Y-ДНК   Возраст
Sunghir 1              1.11   M   U8c          C1a2           33,875-31,770
Sunghir 2              4.08   M   U2          C1a2           35,283-33,185
Sunghir 3            10.75   M   U2          C1a2            35,154-33,031
Sunghir 4              3.87   M   U2          C1a2           34,485-33,499
Sunghir 5           0.001      -   -   -           30,780-29,746*
Sunghir 6   4.19      M   W3a1   I2a1b2   730-850*

Средњевековни (12. век) I2a1b2 из Владимирске области у Русији припада подграни:
 S17250-->Z16971-->>A16681
На ФТдна постоје три припадника ове гране, двоје су из Украјине, трећи је навео само порекло из Аустро-Угарске.

Извор: https://genetiker.wordpress.com/y-snp-calls-for-sungir-6/
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Октобар 08, 2017, 01:46:53 поподне
Средњевековни (12. век) I2a1b2 из Владимирске области у Русији припада подграни:
 S17250-->Z16971-->>A16681
На ФТдна постоје три припадника ове гране, двоје су из Украјине, трећи је навео само порекло из Аустро-Угарске.

Извор: https://genetiker.wordpress.com/y-snp-calls-for-sungir-6/

Подручје гдје је нађен овај узорак је подручје тзв. Залеске Украјине или могли бисмо је назвати Крајина иза Шуме. Уједно то су биле најисточније области раних руских кнежевина. Земљу првобитно насељену угро-финским племенима (Мерја, Муром, Веси) Словени су колонизовали у 10. вијеку и то највише словенско племе Кривича.

Питање је сад да ли би се овај резултат могао прибројити племенској групи Кривича.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Октобар 08, 2017, 02:08:46 поподне
Иначе грана S17250>Z16971 чини ми се да није значајније присутна међу Србима. Засад само један потврђени припадник Стојшин из Српске Црње.

На нашим просторима присутна је још само код Хрвата Крајана из Драганића, из кајкавске зоне. Могуће да и Кландер из истог мјеста припада овој грани.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Србин Октобар 09, 2017, 11:29:05 поподне
Занимљиви нови постови на Молгену.

http://forum.molgen.org/index.php/topic,10359.105.html?PHPSESSID=fdad4dc1141b482a8704180d62d21e36 (http://forum.molgen.org/index.php/topic,10359.105.html?PHPSESSID=fdad4dc1141b482a8704180d62d21e36)

Превод Јарославовог цитата:

Цитат
Groundwater cemetery Sungirsky, X-XII centuries. The right bank of the river. Klyazma, to the north-east of the Sungir fort.

Investigations (NN Moshenina, 1972-1973) 33 burials performed according to the rituals of inhumation (predominate) and cremations (cremation) on the side, in shallow burial pits subtriangular and oval in shape. Orientation of the buried - north-west and west (typical for the most recent burials).

The burial ground was in the X-XII centuries. and attributed by researchers to a mixed, Slavonic-Meryan population. P.N. Tretyakov rightly notes that cremations, which are not peculiar to the Finno-Ugric population of the Volga-Oka interfluve, are brought here by the Slavs from the Dnieper region. The appearance of the rite of cremation was accompanied by the appearance of Slavic imports from the Dnieper. Consequently, we can note that on the materials of the cemetery there is an ethnic picture of the settlement population. It can not be said that for Finno-Ugric culture there is no burning at all. On the monuments of Anani culture (traditionally considered the ancestors of the Finno-Ugrians), the burning was recorded, but they did not prevail. It should also be noted that cremations are absent on the monuments of the Finno-Ugrians, who later became acquainted with the Slavic culture. On the contrary, the materials of Malyshevsky, Podbolotievsky and Sungirsky burial ground show that cremation occupies 1/3 of all burials. During the period of the rite of cremation, the ritual of inhumation on these cemeteries passes to the non-intrusive burial, which, in turn, allows one to trace the shift of religious views of the population of Sungir (Tretyakov, 1957).

Значи 1/3 се кремирала за коју археолози мисле да су Словени (уствари нису ништа погрешили), међутим овај Динарик није кремиран.  :o

Руси се чуде како на Eurogenes K36 има мало Феноскандије у односу на њих који су се касније измешали са N1. ::)  Сунгир 6 истовремено нема никакве монголоидне карактеристике, дакле практично потпуно исти случај као са Динарицима и R1b-U106 Мађарске елите са налазишта Карос-Еперјешег из 9. века.

И то није све.

https://genetiker.wordpress.com/2017/10/08/phenotype-snps-from-sungir/ (https://genetiker.wordpress.com/2017/10/08/phenotype-snps-from-sungir/)

Генетикер је провукао податке везане за фенотип кроз рачунач. Сунгир 6 (Динарик) је кавказоид светлог тена, светле косе и очију док су сви остали палеолитски узорци потпуно супротно - дравидоидног тена, тамне косе и очију.

Можда је неки асимилован Словен?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Сремац Октобар 10, 2017, 10:50:27 поподне
Занимљиви нови постови на Молгену.

http://forum.molgen.org/index.php/topic,10359.105.html?PHPSESSID=fdad4dc1141b482a8704180d62d21e36 (http://forum.molgen.org/index.php/topic,10359.105.html?PHPSESSID=fdad4dc1141b482a8704180d62d21e36)

Превод Јарославовог цитата:

Значи 1/3 се кремирала за коју археолози мисле да су Словени (уствари нису ништа погрешили), међутим овај Динарик није кремиран.  :o

Руси се чуде како на Eurogenes K36 има мало Феноскандије у односу на њих који су се касније измешали са N1. ::)  Сунгир 6 истовремено нема никакве монголоидне карактеристике, дакле практично потпуно исти случај као са Динарицима и R1b-U106 Мађарске елите са налазишта Карос-Еперјешег из 9. века.

И то није све.

https://genetiker.wordpress.com/2017/10/08/phenotype-snps-from-sungir/ (https://genetiker.wordpress.com/2017/10/08/phenotype-snps-from-sungir/)

Генетикер је провукао податке везане за фенотип кроз рачунач. Сунгир 6 (Динарик) је кавказоид светлог тена, светле косе и очију док су сви остали палеолитски узорци потпуно супротно - дравидоидног тена, тамне косе и очију.

Можда је неки асимилован Словен?

Хвала на значајним информацијама Србине,
Ево његовог резултата по к36 рачуначу (поред је мој ради поређења):

Arabian                      -         -
Armenian                      -      0.06   
Basque                   1.69       -
Central_African               -         -
Central_Euro           8.12    7.71
East_African              -         -
East_Asian              -         -
East_Balkan           7.02    7.95
East_Central_Asian      -         -
East_Central_Euro     23.49  15.12
East_Med                      -       8.41   
Eastern_Euro          22.27   12.62
Fennoscandian           6.56     2.72
French                   8.82     4.38
Iberian                   0.91     5.98
Indo-Chinese             -          -
Italian                     -       20.44
Malayan                     -          -
Near_Eastern             -          -
North_African             -        1.13
North_Atlantic           7.48     2.78
North_Caucasian   0.49     0.50
North_Sea                   9.40     4.02
Northeast_African      -         -
Oceanian                      -         -
Omotic                      -         -
Pygmy                      -         -
Siberian                      -         -
South_Asian              -       0.38
South_Central_Asian      -         -
South_Chinese              -         -
Volga-Ural                    0.86    0.27
West_African              -         -
West_Caucasian         -       3.95
West_Med                    2.89    0.92

Најсличнији је савременим Пољацима и Украјинцима, југозападним Русима. Упоредио сам свој резултат и солидно се уклапам, очекивано одударам у постоцима Италије, Источног Медитерана и Иберије.

Ево и nMonte резултата са додатим Sunghir 6 узорком:

329 узорака свих раздобља:

[1] "3. RESTRICTED nMONTE"
[1] "distance%=7.3181 / distance=0.073181"
                         
BA_Mycenaean_I9041   30.10
EMA_Slavic_RISE568    19.15
MA_Sunghir_Slav     19.10
CA_Iran_I1670             9.15
BA_Hungary_RISE371   8.30
EMA_Slavic_Mar7          8.20
N_Levant_AinGhazal3    2.50
BA_Hungary_RISE374   2.20
CCC_Estonia_MA974     1.30

Бронзано доба, Метално доба и Средњи век:

[1] "3. RESTRICTED nMONTE"
[1] "distance%=8.118 / distance=0.08118"
                           
BA_I9041_Mycenaean         39.10
MA_Sunghir_Slav           32.30
EMA_Czech_Slav_RISE568  13.60
BA_Hungary_RISE371          4.90
LBA_Lithuania_RISE598       3.50
LBA_Armenia_RISE412        2.65
EBA_Anatolia_Kum4            2.45
BA_Hungary_RISE374         1.50
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Србин Октобар 10, 2017, 11:44:29 поподне
Хвала на значајним информацијама Србине,

Најсличнији је савременим Пољацима и Украјинцима, југозападним Русима. Упоредио сам свој резултат и солидно се уклапам, очекивано одударам у постоцима Италије, Источног Медитерана и Иберије.

Да, имаш и IBD сегменте. Црногорци, Срби и Словенци међу првих 10:

http://forum.molgen.org/index.php/topic,10359.135.html (http://forum.molgen.org/index.php/topic,10359.135.html)

Мапа:

http://s018.radikal.ru/i500/1710/53/89ca399a974e.png (http://s018.radikal.ru/i500/1710/53/89ca399a974e.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Сремац Октобар 10, 2017, 11:53:28 поподне
Да, имаш и IBD сегменте. Црногорци, Срби и Словенци међу првих 10:

http://forum.molgen.org/index.php/topic,10359.135.html (http://forum.molgen.org/index.php/topic,10359.135.html)

Мапа:

http://s018.radikal.ru/i500/1710/53/89ca399a974e.png (http://s018.radikal.ru/i500/1710/53/89ca399a974e.png)

Да, хвала, видех и то, изгледа врло значајним открићем за нас.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Октобар 10, 2017, 11:58:05 поподне
Да, имаш и IBD сегменте. Црногорци, Срби и Словенци међу првих 10:

http://forum.molgen.org/index.php/topic,10359.135.html (http://forum.molgen.org/index.php/topic,10359.135.html)

Мапа:

http://s018.radikal.ru/i500/1710/53/89ca399a974e.png (http://s018.radikal.ru/i500/1710/53/89ca399a974e.png)

Из приложеног је видљиво да је најближа зона Сунгирца Полесје (Украјинско и Белоруско) што је донекле очекивано. Такође су занимљиви ове повишене блискости у Србији, Црној Гори и Словенији.

Како ми је Сремац објаснио аутосомално имамо солидна уклапања са Сунгирцем. Мислим да је налаз Сунгирца значајан као репер аутосомала ране словенске популације и то по свему судећи оне која је проистекла из Прашко-Корчаковске групације. По разликама између нас и Сунгирца видимо који су елементи ушли у наше генетско наслеђе са несловенске, балканске стране.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Сол Октобар 22, 2017, 08:15:43 поподне
I2-L621 у Португалији пре око 5000 година: Y-SNP calls from prehistoric Portugal (https://genetiker.wordpress.com/2017/08/04/y-snp-calls-from-prehistoric-portugal/)

Оваи налаз даие смисао атлантскои Тартессо - Ибериискои миграционои теории келтске културе са иуга на север

https://www.youtube.com/v/brxu_h_pzBg

New ideas on the origins of the Celts /Барри Кунлиффе
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Сол Октобар 24, 2017, 07:24:18 поподне
Изгледа, да "ускоро" y-dna резултати учесника битке у долини Толлензе пре 3250. год., следе

Battered skulls and shattered bones in Europe's oldest battlefield reveal the fallen men were trained warriors who travelled thousands of miles to fight 3,250 years ago

http://www.dailymail.co.uk/sciencetech/article-5012653/Shedding-new-light-Europe-s-oldest-battlefield.html


Tollense Valley Bronze Age battle: preliminary ancient DNA analysis

http://eurogenes.blogspot.de/2017/10/tollense-valley-bronze-age-battle.html
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Nebo Октобар 25, 2017, 08:53:04 поподне
https://genetiker.wordpress.com/2017/10/25/phenotype-snps-for-bronze-age-german-warriors/

Ваљда је то - то.
Послао ми Божа Остојић.
Зна ли неко ово да растумачи?
Занимљиви су описи фенотипа.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Октобар 25, 2017, 08:56:17 поподне
https://genetiker.wordpress.com/2017/10/25/phenotype-snps-for-bronze-age-german-warriors/

Ваљда је то - то.
Послао ми Божа Остојић.
Зна ли неко ово да растумачи?
Занимљиви су описи фенотипа.
Овде се конкретно ради о генима који имају утицај на пигмент тена, косе и очију.

И даље се чекају Y-ДНК резултати.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Nebo Октобар 25, 2017, 08:58:36 поподне
Да, видим да то није У-ДНК. Занимљив је састав према фенотипу. Има ту свега и свачега.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Октобар 25, 2017, 08:59:27 поподне
Да, видим да то није У-ДНК. Занимљив је састав према фенотипу. Има ту свега и свачега.

Староевропљани против Индоевропљана. :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Октобар 26, 2017, 10:04:59 поподне
У ишчекивању Y-ДНК резултата, занимљив чланак са Еурогена о аутосомалној компоненти анализираних скелета.

Tollense Valley Bronze Age warriors were very close relatives of modern-day Slavs
 (http://eurogenes.blogspot.rs/2017/10/tollense-valley-bronze-age-warriors.html)
So what's going on? Did the proto-Slavs come into existence during the Bronze Age, as opposed to the more generally accepted early Medieval Period? And did they expand from what is now Hungary? Or did they migrate there from the Baltic region?

Верујем да овај рад може имати утицаја на решавање проблема порекла I2a-CTS10228-Y3120, односно Динарика.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Radul Октобар 26, 2017, 11:19:49 поподне
У ишчекивању Y-ДНК резултата, занимљив чланак са Еурогена о аутосомалној компоненти анализираних скелета.

Tollense Valley Bronze Age warriors were very close relatives of modern-day Slavs
 (http://eurogenes.blogspot.rs/2017/10/tollense-valley-bronze-age-warriors.html)
So what's going on? Did the proto-Slavs come into existence during the Bronze Age, as opposed to the more generally accepted early Medieval Period? And did they expand from what is now Hungary? Or did they migrate there from the Baltic region?

Верујем да овај рад може имати утицаја на решавање проблема порекла I2a-CTS10228-Y3120, односно Динарика.

Поред очекиваних хаплогрупа, R1a, R1b, G2a, I2a можда би требало очекивати и N2?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Октобар 26, 2017, 11:30:42 поподне
Поред очекиваних хаплогрупа, R1a, R1b, G2a, I2a можда би требало очекивати и N2?
Спортским речником, лаички, овако на ''прву'', када би сви узорци били идеално обрађени и када би био доступан већи број Y-ДНК узорака бих ''играо'' на следеће хаплогрупе присутне међу учесницима те битке: R1a-CTS4385, R1b-U106, I2a2-M223>CTS616, I2a1b>L621 и L161, I1 (све гране), G2a>L497>CTS2230 и N1c1>L392.

Видећемо колико сам био непрецизан.  ;D
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Nebo Октобар 31, 2017, 11:29:55 пре подне
Y-SNP calls for Guanches.

„In the table below are links to Y-SNP calls for DNA samples from Guanches, the aboriginal inhabitants of the Canary Islands. It’s quite convenient for mainstream narratives about the Canary Islands that genome-wide data for the Guanche DNA samples found to belong to Y haplogroups R1b and I didn’t appear in the recent paper that the samples below came from.“

https://genetiker.wordpress.com/
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Новембар 11, 2017, 11:05:32 поподне
Ј2 узорак из познонеолитске Ленђелске културе припада грани Z6055 (https://www.yfull.com/tree/J-Z6055/). Од тестираних са нашег Пројекта, овој грани (односно њеној дубљој подграни Y14439) за сада сигурно припада само Сатарић из Милатовића код Лучана. Од осталих резултата најзанимљивији су неолитски узорци из Немачке за које је утврђено да припадају грани R1b1a2-V88, истој оној као и велики део ранијих становника културе Лепенског Вира, па се чини да су неолитски земљорадници на путу ка Централној Европи покупили и асимиловали део лепенсковирске или неке сродне популације.

https://genetiker.wordpress.com/2017/11/08/y-snp-calls-from-neolithic-europe/ (https://genetiker.wordpress.com/2017/11/08/y-snp-calls-from-neolithic-europe/)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Новембар 12, 2017, 10:03:06 пре подне
Да ли ће бити у скорашње време неких прецизнијих снипова за недавне узорке из гвозденог доба и раног средњег века Пољске?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Новембар 12, 2017, 12:29:56 поподне
Да ли ће бити у скорашње време неких прецизнијих снипова за недавне узорке из гвозденог доба и раног средњег века Пољске?

Објавили су пре неки месец БАМ фајлове за неколико узорака, и они су анализирани детаљније, не верујем да ће остатак бити доступан пре но што се рад званично објави. Ја забележих ове:

KO_45,  100-300 AD,  Kowalewko,  Poland,  Wielbark Culture, I2a2a1b2а-M223>CTS616>CTS10057>Z161>L801

KO_55,  100-300 AD,  Kowalewko,  Poland,  Wielbark Culture, I1a3a1a1a-Z63>BY151>S2078>S2077>Y2245>L1237

NA_13,  900-1000 AD,  Niemcza,  Poland,  Medieval,  I2a1b2-L621

ME_7,  1000-1200 AD,  Markowice,  Poland,  Medieval,  I1a2a2a5-Z58>Z59>Z2041>Z2040>Z382>Y5384






Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Новембар 12, 2017, 12:51:48 поподне
Има и ових:

KO_22, Kowalewko (100-300 AD), G2a2b-L30
KO_57, Kowalewko (100-300 AD), G2a2b-L30

GO_1, Gniezno (1000-1200 AD), R1b1a2-L150.1
NA_18, Niemcza, (900-1000 AD), J2a1a-L26

Тј има свега само нема R1a  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Новембар 16, 2017, 01:55:12 поподне
Нови рад на ову тему (Parallel palaeogenomic transects reveal complex genetic history of early European farmers)

https://www.nature.com/articles/nature24476#supplementary-information
https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB22629

Посао за наше стручњаке за стару ДНК. :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Новембар 16, 2017, 03:08:25 поподне
Нови рад на ову тему (Parallel palaeogenomic transects reveal complex genetic history of early European farmers)

https://www.nature.com/articles/nature24476#supplementary-information
https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB22629

Посао за наше стручњаке за стару ДНК. :)

Исцима ме Небојша, помислих да је заиста нови рад у питању. :D Ово је коначна верзија рада који је објављен пролетос, додуше сада су доступни и сирови подаци, па се може анализирати. Рад се може видети у целини на следећој адреси:

https://sci-hub.ac/10.1038/nature24476 (https://sci-hub.ac/10.1038/nature24476)

А Генетикер је већ урадио неке анализе узорака:

https://genetiker.wordpress.com/2017/11/08/y-snp-calls-from-neolithic-europe/ (https://genetiker.wordpress.com/2017/11/08/y-snp-calls-from-neolithic-europe/)

https://genetiker.wordpress.com/2017/11/09/phenotype-snps-from-neolithic-europe/ (https://genetiker.wordpress.com/2017/11/09/phenotype-snps-from-neolithic-europe/)

https://genetiker.wordpress.com/2017/11/12/k-14-admixture-analysis-of-neolithic-european-genomes/ (https://genetiker.wordpress.com/2017/11/12/k-14-admixture-analysis-of-neolithic-european-genomes/)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Банија Новембар 16, 2017, 03:21:09 поподне
Исцима ме Небојша, помислих да је заиста нови рад у питању. :D Ово је коначна верзија рада који је објављен пролетос, додуше сада су доступни и сирови подаци, па се може анализирати. Рад се може видети у целини на следећој адреси:

https://sci-hub.ac/10.1038/nature24476 (https://sci-hub.ac/10.1038/nature24476)

А Генетикер је већ урадио неке анализе узорака:

https://genetiker.wordpress.com/2017/11/08/y-snp-calls-from-neolithic-europe/ (https://genetiker.wordpress.com/2017/11/08/y-snp-calls-from-neolithic-europe/)

https://genetiker.wordpress.com/2017/11/09/phenotype-snps-from-neolithic-europe/ (https://genetiker.wordpress.com/2017/11/09/phenotype-snps-from-neolithic-europe/)

https://genetiker.wordpress.com/2017/11/12/k-14-admixture-analysis-of-neolithic-european-genomes/ (https://genetiker.wordpress.com/2017/11/12/k-14-admixture-analysis-of-neolithic-european-genomes/)

Јесам ли ја преспавао нешто или је узорак I4185 из Мађарске (Сопот) раније био означен као J2a1?
Сада је означен као J2~M172(xJ2b).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Новембар 16, 2017, 03:29:17 поподне
Јесам ли ја преспавао нешто или је узорак I4185 из Мађарске (Сопот) раније био означен као J2a1?
Сада је означен као J2~M172(xJ2b).

Колико је мени познато није никада ни био Ј2а1. Можда си мислио на I5078, он је Ј2а1, исто из Сопотске културе?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Банија Новембар 16, 2017, 03:47:56 поподне
Колико је мени познато није никада ни био Ј2а1. Можда си мислио на I5078, он је Ј2а1, исто из Сопотске културе?

Нешто сам се ја пребацио, мислио сам да су оба узорка са подручја Мађарске J2a1.

Да ли је овај позитиван на J2b?
(https://s7.postimg.org/5xnxjm8gb/Untitled.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Новембар 16, 2017, 03:58:53 поподне
Нешто сам се ја пребацио, мислио сам да су оба узорка са подручја Мађарске J2a1.

Да ли је овај позитиван на J2b?
(https://s7.postimg.org/5xnxjm8gb/Untitled.png)

То значи да је негативан на J2b. :) Извини Гујо, "моша". Видех после да је само допуна у питању.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Новембар 16, 2017, 04:01:38 поподне
Нешто сам се ја пребацио, мислио сам да су оба узорка са подручја Мађарске J2a1.

Да ли је овај позитиван на J2b?

Није, х у загради значи да је негативан.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Банија Новембар 16, 2017, 04:04:15 поподне
То значи да је негативан на J2b. :)
Није, х у загради значи да је негативан.

Хвала! :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Новембар 16, 2017, 04:08:59 поподне
Извини Гујо, "моша". Видех после да је само допуна у питању.

 ;)

Нешто сам се ја пребацио, мислио сам да су оба узорка са подручја Мађарске J2a1.

Да се исправим/допуним, имају два Ј2а1, I1902 из овог рада (Ленђелска култура, Мађарска), и онај кога малопре поменух, I5078 (Сопотска култура, Хрватска), али је он из другог рада (Mathieson et al. 2017).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Децембар 29, 2017, 12:57:23 поподне
Занимљив чланак са Генетикера.

Pigmentation of Neolithic Europeans (https://genetiker.wordpress.com/2017/11/29/pigmentation-of-neolithic-europeans/)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Radul Јануар 17, 2018, 03:17:16 поподне
Може ли се на основу овога извући закључак да је I9041 J2a L26>M67?>М92?
https://genetiker.wordpress.com/y-snp-calls-for-i9041/

Y-SNP calls for I9041
Below are Y-SNP calls for I9041, a Mycenaean sample from Greece. Positive calls are in bold, and negative calls are in non-bold.

The calls show that I9041 belonged to Y haplogroup J2a1-L26(xabcdeghi).

Издојени позитивни:

J2-M410-L559/PF4986
J2-M410-M410/PF4941
J2-M410-CTS5482/PF4968
J2-M410-PF4985
J2-M410-CTS6586/PF4970
J2-M410-CTS9781/PF4978
J2-M410-Z7740
J2-M410-L379
J2-M410-L375
J2-M410-L373
J2-M410-PF5008-L581-Z37823-PF5000-PF4993-Z37822
J2-M410-PF4610-CTS7683/PF5100/P354
J2-M410-PF4610-L26-L27/PF5111/F4326/S396
J2-M410-PF4610-L26-L26/PAGE55/S57/PF5110/PAGES00055

J2-M410-PF4610-L26-Z6064-Z6055-Z6057-Z6057
J2-M410-PF4610-L26-PF5087-PF5116-PF5119-L558-M67-Y4036-Z467-S11842-Y15913-FGC21366
J2-M410-PF4610-L26-PF5087-PF5116-PF5119-L558-M67-Z500-M92-PF7412-Z515-Z517
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Фебруар 20, 2018, 11:55:34 поподне
Генетикерови резултати за неке древне узорке из бакарног и бронзаног доба Европе (нарочито из оквира Културе звонастих пехара - Bell Beaker):

https://genetiker.wordpress.com/2018/02/19/y-snp-calls-for-bell-beaker-genomes/

Sample   Country   Culture   Date BC   Haplogroup
I0457   Spain   Copper Age   2920–2340   I2~M438
I0261   Spain   Bell Beaker   2850–2250   R1b1a2~V88
I0257   Spain   Bell Beaker   2571–2350   R1b1a2~V88
I2416   England   Bell Beaker   2460–2200   R1b1a1a2a1a~L151
I2575   France   Bell Beaker   2476–2211   R1b1a1a2~M269
I4248   Germany   Bell Beaker   2500–2000   R~M207
E09568   Germany   Bell Beaker   2461–2210   pre-R1b1a1a2a1a-L151
I3604   Germany   Bell Beaker   2300   R1b1a1a2~M269
I3607   Germany   Bell Beaker   2300   R1b1a1a~P297
I3596   Germany   Bell Beaker   2300–2150   R1b1a1a2~M269
I4178   Hungary   Bell Beaker   2500–2200   R1b1a1a2a1~L51
I2787   Hungary   Bell Beaker   2458–2202   R1b1a1a2a2-Z2103
I4251   Poland   Bell Beaker   2837–2672   R1b1a1a2~M269
I4253   Poland   Bell Beaker   2571–2208   R1b1a1a2a2-Z2103
I4252   Poland   Bell Beaker   2463–2142   R1b1a1a2a1a~L151
I2598   England   Early Bronze Age   2140–1940   R1b1a1a2a1a~L151
I2464   England   Early Bronze Age   1750–1610   R1b1a1a2a1-L51
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Март 04, 2018, 03:19:10 поподне
Ко зна руски, не би било лоше да погледа ово. Колико сам разумео, у вези је са средњовековним налазом I2a-YP196 у владимирској области:

http://xn--c1acc6aafa1c.xn--p1ai/?page_id=29377
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Март 04, 2018, 03:43:44 поподне
Ко зна руски, не би било лоше да погледа ово. Колико сам разумео, у вези је са средњовековним налазом I2a-YP196 у владимирској области:

http://xn--c1acc6aafa1c.xn--p1ai/?page_id=29377

Аутор је на крају дошао до тезе, анализирајући аутосомалну днк Сунгирца, да су једино I2-YP196 исконски Словени,а сви остали, укључујући и разне гране R1a, заправо словенизовани. У једну руку, у праву је што се тиче тврдње да I2-YP196 учествује у самом коријену словенске етногенезе, али прецјењује  њен значај. Чини ми се да изједначава аутосомалну компоненту "неолитских земљорадника" коју назива "јужноевропском" са Y-днк I2-YP196, иако знамо да је "неолитска" компонента присутна у практично свим европским популацијама, па је у одређеном проценту свакако морала бити присутна и међу разним припадницима R1a у источној Европи и прије доласка I2-YP196.

У сваком случају, анализа је рекао бих сасвим једнодимензионална, ослања се само на генетичке резултате. У неким дијеловим је коректна, у неким мислим да не гађа суштину.

Занимљиве су карте блискости Сунгирца са саврменим популацијама, са Србијом као великим поклапањем.

(http://xn--c1acc6aafa1c.xn--p1ai/wp-content/uploads/Sunghir6-IBD.png)

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Сремац Март 04, 2018, 04:05:58 поподне
IBD (Једнакост по пореклу) анализа најближих народа:

Ukrainian-West-and-Center 95,77

Belarusian 95,5

Polish 90,57

Balt 90,4

Montenegrian 88,66

Russian-West 87,97

Serbian 87,8

Estonian 87,17

Slovenian 86,42

Russian-South 86,29

Занимљиво да смо у врху народа који деле највише заједничких сегмената са Сунгирцем. Присуство јужнословенских народа у првих десет најсроднијих народа, аутор, ако сам га добро схватио, објашњава релативном блискошћу Сунгирца са временом словенског ширења:

Отдельно стоит отметить присутствие в первой десятке трех славянских выборок с Балкан — черногорцев, сербов и словенцев. К сожалению, на карте их «пятнышки» плохо видны из-за небольшого размера. Думаю, объяснять их наличие следует в первую очередь тем, что время жизни «сунгирца» гораздо ближе к эпохе экспансии славян, чем наши дни, поэтому в его геноме сохранилось большее число относительно длинных IBD-сегментов, связанных именно с этим событием.

Али додаје да за поткрепљење ове анализе треба више узорака одличног квалитета (Сунгирац није баш најбољег квалитета јер је контаминиран):

По моему опыту, для твердой уверенности в итогах IBD-анализа следует сформировать выборку из 4-5 геномов отличного качества прочтения. Пока же у нас в наличии один геном среднего качества прочтения, поэтому к результатам следует относиться, как к предварительным.



Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Vidak Март 04, 2018, 09:04:09 поподне
IBD (Једнакост по пореклу) анализа најближих народа:

Ukrainian-West-and-Center 95,77

Belarusian 95,5

Polish 90,57

Balt 90,4

Montenegrian 88,66

Russian-West 87,97

Serbian 87,8

Estonian 87,17

Slovenian 86,42

Russian-South 86,29

Занимљиво да смо у врху народа који деле највише заједничких сегмената са Сунгирцем. Присуство јужнословенских народа у првих десет најсроднијих народа, аутор, ако сам га добро схватио, објашњава релативном блискошћу Сунгирца са временом словенског ширења:

Отдельно стоит отметить присутствие в первой десятке трех славянских выборок с Балкан — черногорцев, сербов и словенцев. К сожалению, на карте их «пятнышки» плохо видны из-за небольшого размера. Думаю, объяснять их наличие следует в первую очередь тем, что время жизни «сунгирца» гораздо ближе к эпохе экспансии славян, чем наши дни, поэтому в его геноме сохранилось большее число относительно длинных IBD-сегментов, связанных именно с этим событием.

Али додаје да за поткрепљење ове анализе треба више узорака одличног квалитета (Сунгирац није баш најбољег квалитета јер је контаминиран):

По моему опыту, для твердой уверенности в итогах IBD-анализа следует сформировать выборку из 4-5 геномов отличного качества прочтения. Пока же у нас в наличии один геном среднего качества прочтения, поэтому к результатам следует относиться, как к предварительным.

Da li po ovim procentima bliskosti ispada da je u crnoj Gori veci procenat Slovenske genetike nego u Srbiji? Po haplogrupama bi trebalo biti obratno.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Сремац Март 04, 2018, 09:50:17 поподне
Испада да је коришћени узорак црногорског становништва аутосомално мало сроднији Сунгирцу но узорак становништва Србије.
Хаплогрупе и нису толико битне...Овде је реч о идентичним деловима ДНК. То би значило да Сунгирац дели више заједничких предака са становништвом Црне Горе, него са становништвом Србије...Уопште, као што и аутор примећује, присуство три јужнословенска народа међу првих десет изгледа необично...
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Март 20, 2018, 05:37:00 поподне
Интервју са Дејвидом Рајхом, шефом Харвардске лабораторије која је до сада у радовима обрадила преко 900 древних узорака, а још преко 3000 узорака је "ускладиштено" и чека на анализу:

David Reich Unearths Human History Etched in Bone (https://www.nytimes.com/2018/03/20/science/david-reich-human-migrations.html)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Март 20, 2018, 11:51:57 поподне
Интервју са Дејвидом Рајхом, шефом Харвардске лабораторије која је до сада у радовима обрадила преко 900 древних узорака, а још преко 3000 узорака је "ускладиштено" и чека на анализу:

David Reich Unearths Human History Etched in Bone (https://www.nytimes.com/2018/03/20/science/david-reich-human-migrations.html)

Одличан чланак. На ову техничку ствар се, изгледа, мора приликом обраде узорка највише обратити пажња:

Dr. Reich oversees a team with many different skills, from genetics to mathematics. But the “clean lab” is where the raw material for all their work — ancient DNA — is recovered. The head-to-toe suits that the researchers don in an airlock each morning ensure that no stray flake of skin or bead of sweat contaminates the bones with modern DNA. Each night the entire lab is bathed in gene-destroying ultraviolet light.

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Април 02, 2018, 10:09:20 пре подне
Дpeвнa ДНК нeaндepтaлaцa:

https://www.nature.com/articles/nature26151

http://www.eva.mpg.de/documents/Nature/Hajdinjak_Reconstructing_Nature_2018_2522088.pdf

http://genomes.yseq.net/WGS/Neanderthal/
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Свевлад Април 03, 2018, 03:05:30 пре подне
Пигментација људи који су живели у југоисточној Европи од пре око 12 000 до пре 2500 година.

https://genetiker.wordpress.com/2018/02/24/pigmentation-of-ancient-southeastern-europeans/ (https://genetiker.wordpress.com/2018/02/24/pigmentation-of-ancient-southeastern-europeans/)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: filipi Април 16, 2018, 08:38:34 пре подне
95 Y хромозома из древне Евроазијске Степе!
55 хаплогрупа

https://docs.google.com/spreadsheets/d/1Rja6ZyjQrz3UK7_HTagkzczoOFjwcXOGdNOm9FC3Rik/edit#gid=0
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Зрно Април 16, 2018, 09:31:04 пре подне
95 Y хромозома из древне Евроазијске Степе!
55 хаплогрупа

https://docs.google.com/spreadsheets/d/1Rja6ZyjQrz3UK7_HTagkzczoOFjwcXOGdNOm9FC3Rik/edit#gid=0

Од 55 примерака, нема ниједан R1b источни, само 2-3 западна.

???
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Април 16, 2018, 03:16:54 поподне
Од 55 примерака, нема ниједан R1b источни, само 2-3 западна.

???

Осим P312 (DA111) и U106 (DA119), има и мало "егзотичнијих" R1b - Y14051 (подграна од типично монголске M478/M73) у два узорка, Y20750 (такође подграна од M478/M73) у једном узорку и PH200 (подграна од PH155, која је нађена код оног "Гепида", уствари највероватније Хуна из Виминацијума) у једном узорку.

https://yfull.com/tree/R-Y14051/
https://yfull.com/tree/R-Y20750/
https://yfull.com/tree/R-PH200/

На брзину сам прегледао снипове, чини ми се као мешавина централно- и источно-азијатских и блискоисточних/европских. Недостаје контекст за ове узорке, да ли су сви они били Scythians, Xiongnu, Huns, Turks and Mongols као што пише на табели, тј. да ли су се сви сахрањивали на начин уобичајен за ове степске номаде или неки узорци можда представљају и заробљенике/робове? Потврдило се, међутим, да је PH155 била присутна међу средњовековним степским номадима (највероватније Хунима, с обзиром на виминацијумски налаз). Занимљиво је код N халогрупе присуство две давно раздвојене гране - L1025 (која се углавном везује за европске народе) и Y16220 (присутна код Бурјата и Турака); можда се у једном случају ради о заробљенику/робу, а у другом случају о припаднику номадског племена?

https://yfull.com/tree/N-L1025/
https://yfull.com/tree/N-Y16220/

Све у свему, ни трага од N2 Y6503, што сам и очекивао.  ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: МучаСR1bин Април 18, 2018, 12:08:15 поподне
www.rts.rs/page/magazine/ci/story/2520/nauka/3107035/srednjovekovne-neveste-sa-vanzemaljskim-glavama.html
вест која се тиче везе наших простора и Баварске у раном средњем веку
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Април 18, 2018, 12:38:47 поподне
www.rts.rs/page/magazine/ci/story/2520/nauka/3107035/srednjovekovne-neveste-sa-vanzemaljskim-glavama.html
вест која се тиче везе наших простора и Баварске у раном средњем веку

Врло занимљиво. Бајуварско-гепидско-хунска веза.  ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Мај 01, 2018, 10:37:47 поподне
Табела са резултатима древне ДНК из евроазијске степе (Scythians, Xiongnu, Huns, Turks and Mongols):

http://open-genomes.org/analysis/Eurasian_Steppe_Y-DNA_mtDNA_Gedmatch.html

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Гмитар Јун 02, 2018, 03:59:55 поподне
Извињавам се ако је неко ово већ поделио раније, налетео сам на веома занимљив сајт где се могу пронаћи разни узорци из различитих историјских временских периода.


https://web.archive.org/web/20171028022010/http://www.ancestraljourneys.org:80/ancientdna.shtml (https://web.archive.org/web/20171028022010/http://www.ancestraljourneys.org:80/ancientdna.shtml)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Никола Стојановић Јун 02, 2018, 06:16:36 поподне
Извињавам се ако је неко ово већ поделио раније, налетео сам на веома занимљив сајт где се могу пронаћи разни узорци из различитих историјских временских периода.


https://web.archive.org/web/20171028022010/http://www.ancestraljourneys.org:80/ancientdna.shtml (https://web.archive.org/web/20171028022010/http://www.ancestraljourneys.org:80/ancientdna.shtml)
Одличан, али мислим да се више не ажурира и да нема радове који су изашли у задњих годину и нешто.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Јун 02, 2018, 10:04:15 поподне
Извињавам се ако је неко ово већ поделио раније, налетео сам на веома занимљив сајт где се могу пронаћи разни узорци из различитих историјских временских периода.


https://web.archive.org/web/20171028022010/http://www.ancestraljourneys.org:80/ancientdna.shtml (https://web.archive.org/web/20171028022010/http://www.ancestraljourneys.org:80/ancientdna.shtml)

Недавно сам помињао тај сајт https://www.poreklo.rs/forum/index.php?topic=1791.msg90574#msg90574 и излистао научне радове са њега.

Уредница сајта Jean Manco је преминула почетком ове године https://www.poreklo.rs/forum/index.php?topic=3214.msg86248#msg86248

То је био свакако најбоље уређен сајт старе ДНК на интернету. Колико сам видио, задњи уноси су били крајем 2017. године (октобар-новембар). Мислим да је 90% свих старих налаза унесено у њене табеле.
Драго ми је што је сајт бар у архивском облику опстао, иако се даље неће допуњавати.
За сваки случај сам прекопирао све важне информације које су се тамо налазиле.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Јун 06, 2018, 07:26:45 поподне
Револуција:

Scientists discover DNA proving original Native Americans were White (http://en.protothema.gr/scientists-discover-dna-proving-original-native-americans-were-white/)

Нисам сигуран да ли су подаци из овог чланка заиста научни или ипак псеудонаучни. Некако ми "мирише" на ово друго, али нека потврди Црни Гуја.  ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Јул 06, 2018, 10:07:19 поподне
По свему судећи, очекује нас доста занимљивих студија у скоријем периоду.

SMBE 2018 abstracts
 (http://eurogenes.blogspot.com/2018/07/smbe-2018-abstracts.html)

The first Epipaleolithic Genome from Anatolia suggests a limited role of demic diffusion in the Advent of Farming in Anatolia


Demographic processes in Estonia from Bronze Age through Iron Age to Medieval times


Genetic transition in the Swiss Late Neolithic and Early Bronze Age


Genome-Wide Ancient DNA Portrays the Forming of the Finnish Population Along a 1400-Year Transect


Population migration and dairy pastoralism on the Bronze Age Mongolian steppe


The Transition to Farming in Eneolithic (Copper Age) Ukraine was Largely Driven by Population Replacement
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Никола Стојановић Јул 09, 2018, 06:40:11 поподне
То је био свакако најбоље уређен сајт старе ДНК на интернету. Колико сам видио, задњи уноси су били крајем 2017. године (октобар-новембар). Мислим да је 90% свих старих налаза унесено у њене табеле.
Драго ми је што је сајт бар у архивском облику опстао, иако се даље неће допуњавати.
За сваки случај сам прекопирао све важне информације које су се тамо налазиле.
Имаш Excel?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Јул 12, 2018, 08:49:25 пре подне
Имаш Excel?

Имам, пошаљи ми на пп мејл и послаћу ти.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Август 16, 2018, 01:33:21 поподне
На Антхрогеници се коментаришу сирови резултати налаза древне днк са алеманског налазишта у Западној Њемачкој из 7. вијека. Чини се да је на једном од узорака нађена R1b-U106>Z331 ( то је између осталог и грана на коју је СНП-ом потврђен Великић из Сопота).
https://www.yfull.com/tree/R-Z331/

Дати су прегледи аутосомалних резултата у K36 рачуначу. Доста изражена компонента North Sea код алеманског узорка. На брзину сам упоредио своје К36 резултате са овим алеманским. У односу на древног Алемана, ја сам прави Медитеранац.  :)

https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB26982
https://anthrogenica.com/showthread.php?15049-Two-Alemanni-samples-in-K36-and-PCA/page3
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Август 16, 2018, 01:48:35 поподне
Ово су неке информације о узорцима:

https://core.ac.uk/download/pdf/29050864.pdf

Видим да су успјели да дешифрују још Y-днк , углавном се ради о R1b. Има више на горе постављеном линку ка Антхрогеници.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Август 16, 2018, 01:59:40 поподне
Други узорак је такође дешифрован као R1b-U106>Z331 с тим да му је нађена још нижа грана Z325
 https://www.yfull.com/tree/R-Z325/

Колико сам успио разабрати у коментарима, неки мисле да ти узорци и нису алемански, већ лангобардски и да би се могли повезати са недавно нађеном лангобардском R1b-U106 у Мађарској.

Такође један од узорака из налазишта није германског поријекла, прилично се разликује аутосомално од двојице R1b-U106, код њега преовлађују К36 Италиан и Ибериан компонента. Очигледно у том периоду популације још нису биле измијешане.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Август 20, 2018, 01:29:23 поподне
Нови рад са 22 древна узорка из Израела, из периода позног енеолитика (~4500-3800 п.н.е.). Аутори су установили да се ова популација може моделовати као мешавина неколико ранијих популација: неолитске левантске (~57%), неолитске анадолијске (~26%) и енеолитске иранске (~17%). 9 од 10 мушких узорака припада хаплогрупи Т (квалитетнији узорци припадају грани L208 (https://www.yfull.com/tree/T-L208/) и њеној подграни CTS2214 (https://www.yfull.com/tree/T-CTS2214/) ), а ту је и један E1b1b1b2-Z830 (https://www.yfull.com/tree/E-Z830/). И Т и E-Z830 су већ пронађене у ранијим неолитским популацијама са подручја јужног Леванта.

https://www.nature.com/articles/s41467-018-05649-9.pdf (https://www.nature.com/articles/s41467-018-05649-9.pdf)

https://static-content.springer.com/esm/art%3A10.1038%2Fs41467-018-05649-9/MediaObjects/41467_2018_5649_MOESM1_ESM.pdf (https://static-content.springer.com/esm/art%3A10.1038%2Fs41467-018-05649-9/MediaObjects/41467_2018_5649_MOESM1_ESM.pdf)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Август 23, 2018, 06:50:04 поподне
Нови рад који се бави археогенетиком, овај пут са севера Европе.

Genomic and Strontium Isotope Variation Reveal Immigration Patterns in a Viking Age Town
 (https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(18)30844-3)
The impact of human mobility on the northern European urban populations during the Viking and Early Middle Ages and its repercussions in Scandinavia itself are still largely unexplored. Our study of the demographics in the final phase of the Viking era is the first comprehensive multidisciplinary investigation that includes genetics, isotopes, archaeology, and osteology on a larger scale. This early Christian dataset is particularly important as the earlier common pagan burial tradition during the Iron Age was cremation, hindering large-scale DNA analyses. We present genome-wide sequence data from 23 individuals from the 10th to 12th century Swedish town of Sigtuna. The data revealed high genetic diversity among the early urban residents. The observed variation exceeds the genetic diversity in distinct modern-day and Iron Age groups of central and northern Europe. Strontium isotope data suggest mixed local and non-local origin of the townspeople. Our results uncover the social system underlying the urbanization process of the Viking World of which mobility was an intricate part and was comparable between males and females. The inhabitants of Sigtuna were heterogeneous in their genetic affinities, probably reflecting both close and distant connections through an established network, confirming that early urbanization processes in northern Europe were drive.

We observed haplogroup R1b, in three of the eight male individuals for which the haplogroup assignment was possible. R1b is one of the most common haplogroups in Europe and has been previous pointed out as one of the most common haplogroups in Scandinavia and Northern Europe [28, 29, 106, 107]. Three more individuals were assigned to major Y chromosome haplogroup I∗. Two of those assignments could be further narrowed down to haplogroup I1∗ major I component in Scandinavia, while one male (grt035) was assigned to a rare I2a2 haplogroup, previously identified among Scandinavian hunter-gatherers [37]. The other individual buried in the vicinity (grt036) was a carrier of another widespread European haplogroup G2a2 [108]. Finally, individual 84001 was a probable carrier of N1a1a, a haplogroup associated with East Baltic region (Tables 1 and S3; Data S1, sheet 2).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Jelic Август 23, 2018, 08:01:19 поподне
was assigned to a rare I2a2 haplogroup, previously identified among Scandinavian hunter-gatherers [37]

Да није ово "бивша" I2c, која се сада означава управо као I2a2? Томе у прилог иде и ово што се помиње да је нађена код ловаца-сакупљача из Скандинавије, а заиста јесте пронађена у Мотали.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Август 23, 2018, 08:10:05 поподне
Да није ово "бивша" I2c, која се сада означава управо као I2a2? Томе у прилог иде и ово што се помиње да је нађена код ловаца-сакупљача из Скандинавије, а заиста јесте пронађена у Мотали.

Добро си приметио, биће вероватно да је то у питању, јер су у раду коришћене ознаке претходног ISOGG стабла.

The nomenclature used includes both branch names as defined in PhyloTreeY and nomenclature according to International Society of Genetic Genealogy (ISOGG) Y-DNA haplogroup tree 2017 version 12.29.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Jelic Август 23, 2018, 08:12:44 поподне
Добро си приметио, биће вероватно да је то у питању, јер су у раду коришћене ознаке претходног ISOGG стабла.

The nomenclature used includes both branch names as defined in PhyloTreeY and nomenclature according to International Society of Genetic Genealogy (ISOGG) Y-DNA haplogroup tree 2017 version 12.29.

Па ако је кориштена претходна верзија, а не садашња, значи да ипак није "бивша" I2c у питању?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Август 23, 2018, 08:13:42 поподне
Добро си приметио, биће вероватно да је то у питању, јер су у раду коришћене ознаке претходног ISOGG стабла.

The nomenclature used includes both branch names as defined in PhyloTreeY and nomenclature according to International Society of Genetic Genealogy (ISOGG) Y-DNA haplogroup tree 2017 version 12.29.

Тачно.  ;D
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Август 23, 2018, 08:18:34 поподне
Да није ово "бивша" I2c, која се сада означава управо као I2a2? Томе у прилог иде и ово што се помиње да је нађена код ловаца-сакупљача из Скандинавије, а заиста јесте пронађена у Мотали.

Није I2c, већ I2-M436, узводно од I2-M223, дати су СНП-ови у раду.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Jelic Август 23, 2018, 08:20:33 поподне
Није I2c, већ I2-M436, узводно од I2-M223, дати су СНП-ови у раду.

Хвала.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Август 23, 2018, 08:24:13 поподне
Сљедећи хаплогрупе су пронађене (махом узводне коријенске):

N1c-L392
I1-P109>Z74
G2a-L1259
I2-M436
R1b-L51>L11
R1b-L51>L11>P312
R1-M173

Штета што нису пронађени неки низводнији, млађи SNP-ови.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Август 23, 2018, 10:10:28 поподне
R1-M173
Штета што нису пронађени неки низводнији, млађи SNP-ови.

У питању је R1a-Z280>YP331 (https://www.yfull.com/tree/R-YP331/).

Надам се да ће и за остале Y-ДНК резултате ентузијасти пронаћи ниже гране.

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: filipi Август 27, 2018, 12:25:57 пре подне
https://www.b92.net/zivot/vesti.php?yyyy=2018&mm=08&dd=26&nav_id=1435521
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Август 27, 2018, 10:11:02 пре подне
https://www.b92.net/zivot/vesti.php?yyyy=2018&mm=08&dd=26&nav_id=1435521

То је овај рад

https://www.nature.com/articles/nature23310
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Септембар 05, 2018, 10:58:04 поподне
На Антхрогеници се коментаришу сирови резултати налаза древне днк са алеманског налазишта у Западној Њемачкој из 7. вијека. Чини се да је на једном од узорака нађена R1b-U106>Z331 ( то је између осталог и грана на коју је СНП-ом потврђен Великић из Сопота).
https://www.yfull.com/tree/R-Z331/

Дати су прегледи аутосомалних резултата у K36 рачуначу. Доста изражена компонента North Sea код алеманског узорка. На брзину сам упоредио своје К36 резултате са овим алеманским. У односу на древног Алемана, ја сам прави Медитеранац.  :)

https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB26982
https://anthrogenica.com/showthread.php?15049-Two-Alemanni-samples-in-K36-and-PCA/page3

Објављен је коначно рад:

http://advances.sciencemag.org/content/4/9/eaao1262 (http://advances.sciencemag.org/content/4/9/eaao1262)

8 узорака припада хаплогрупи R1b, од њих петорица припадају грани U106>Z325 https://www.yfull.com/tree/R-Z325/ (https://www.yfull.com/tree/R-Z325/). Један узорак припада хаплогрупи G2a2b1-M406, а занимљиво је да се он и аутосомално разликује од осталих, јер најближа аутосомална поклапања има са Грцима. На основу Y и митохондријалних хаплогрупа аутори су реконструисали и породично стабло које обухвата 6 од 13 тестираних:

(https://s22.postimg.cc/nhxj6xl35/image.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Септембар 05, 2018, 11:28:51 поподне
Шесторица тестираних по свој прилици припадају још низводнијој грани Z325>S1734>Y9083>FGC23165>FGC23143 (https://www.ytree.net/DisplayTree.php?blockID=4089).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Септембар 07, 2018, 06:51:15 поподне
Судећи по програму 8th International Symposium on Biomolecular Archaeology (https://www.isba8.de/fileadmin/congress/media/isba2018/druckelemente/ISBA2018%20Programm.pdf) који се одржава средином септембра у Јени у Немачкој, у будућности нас очекује обиље нових археогенетских радова.

The genetic history of the Iberian Peninsula over the last 8000 years

Ancient DNA and the peopling of the British Isles – pattern and process of the Neolithic transition

Ancient genomes from the Lech Valley, Bavaria, suggest socially stratified households in the European Bronze Age

Genomics of Middle Neolithic farmers at the fringe of Europe

Tracing the origin and expansion of the Turkic and Hunnic confederations

The Genomic Formati on of South and Central Asia

The first Epipaleolithic genome from Anatolia suggests a limited role of demic diffusion in the developmentof farming in Anatolia

North African ancestry in Islamic Medieval Spain

Genetic transition in the Swiss Late Neolithic and Early Bronze Age
(мени лично најзанимљивије) ;)

и још доста тога...
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Септембар 07, 2018, 08:25:16 поподне

Ancient genomes from the Lech Valley, Bavaria, suggest socially stratified households in the European Bronze Age

Tracing the origin and expansion of the Turkic and Hunnic confederations


Ова два чекам са нестрпљењем.  ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Voljen od Boga Септембар 08, 2018, 09:23:19 поподне
То ће бити занимљиво.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Александар Невски Септембар 13, 2018, 05:34:00 поподне
Народе, ево новога рада о узорцих шестога вѣка. Мађарска и Сѣверна Италия. Йош га не погледах људски.

https://www.nature.com/articles/s41467-018-06024-4
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Ojler Септембар 13, 2018, 06:05:41 поподне
Народе, ево новога рада о узорцих шестога вѣка. Мађарска и Сѣверна Италия. Йош га не погледах људски.

https://www.nature.com/articles/s41467-018-06024-4

Изгледа у Панонији опет лоше вести за новоромантичаре...
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Александар Невски Септембар 13, 2018, 06:20:28 поподне
Ево и хаплоскупин. Очекивано прѣтежно германске, обзиром да се ради о лангобардских гробљих.

(https://scontent.fbeg2-1.fna.fbcdn.net/v/t1.0-9/41617480_10217084196674752_1054088865402322944_n.jpg?_nc_cat=0&oh=71af69690c0eb5ab0e588c4ebc8bcf4d&oe=5C3702E8)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Септембар 17, 2018, 02:00:01 поподне
Једна врло добро урађена и занимљива мапа, са линквима за научне радове. Посебно што неке радове први пут видим.

http://umap.openstreetmap.fr/en/map/ancient-human-dna_41837#4/31.20/21.80
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Септембар 21, 2018, 03:29:56 пре подне
Анадолски ловац-сакупљач (C1a2-V20) и рани земљорадници Анадолије (C, G2a2b2b-PF3359) и Леванта:

Late Pleistocene human genome suggests a local origin for the first farmers of central Anatolia (https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2018/09/20/422295.full.pdf)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Септембар 21, 2018, 09:52:12 пре подне
Анадолски ловац-сакупљач (C1a2-V20) и рани земљорадници Анадолије (C, G2a2b2b-PF3359) и Леванта:

Late Pleistocene human genome suggests a local origin for the first farmers of central Anatolia (https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2018/09/20/422295.full.pdf)

C1a2 је са локалите Pınarbaşı Gölü , док су C и G2a2b2b са локалитета  Boncuklu Höyük, оба у близини Коније.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Септембар 21, 2018, 02:54:54 поподне
Два палеолитска (~24000 п.н.е.) узорка из Грузије:

https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2018/09/20/423079.full.pdf (https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2018/09/20/423079.full.pdf)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Септембар 21, 2018, 03:08:23 поподне
Два палеолитска (~24000 п.н.е.) узорка из Грузије:

https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2018/09/20/423079.full.pdf (https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2018/09/20/423079.full.pdf)

Ово је изгледа само аутосомална.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: filipi Октобар 04, 2018, 08:39:08 пре подне
http://advances.sciencemag.org/content/4/10/eaat4457
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Октобар 04, 2018, 09:48:23 пре подне
Анализирали су узорке из касног бронзаног доба и раног гвозденог доба који су повезани са номадским степским културама тог периода (уопштено говорећи су их означили као "Ските" и "Кимерце"), са локалитета у југоисточном делу данашње Молдавије, черкаске области у централној Украјини и оренбуршке и башкирске области у Русији (јужни обод Урала). Што се тиче Y-ДНК, углавном су у питању варијанте R1a (код узорака касног бронзаног доба) и R1b (код узорака раног гвозденог доба); један узорак (cim358) раног гвозденог доба припада Q1 хаплогрупи и он је са локалитета Черногоровка културе у ЈИ Молдавији, која се везује за народ Кимераца споменут код Херодота. Подсетићу на IR1 налаз у североисточној Мађарској који припада N2 хаплогрупи (у оквиру културе која се везује за Кимерце), и то грани која је ближа анонимном тестираном N2 Алтајцу него P189.2; очигледно је код Кимераца дошло до извесног источноазијског уплива, што се још боље очитава на мтДНК хаплогрупама које су пронађене у оквиру ове студије (A, C, D и M), поред западно-евроазијских које су биле присутне и код популације касног бронзаног доба (H, J1, K1, T2, U2, U4, и U5).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Октобар 04, 2018, 10:16:28 пре подне
Анализирали су узорке из касног бронзаног доба и раног гвозденог доба који су повезани са номадским степским културама тог периода (уопштено говорећи су их означили као "Ските" и "Кимерце"), са локалитета у југоисточном делу данашње Молдавије, черкаске области у централној Украјини и оренбуршке и башкирске области у Русији (јужни обод Урала). Што се тиче Y-ДНК, углавном су у питању варијанте R1a (код узорака касног бронзаног доба) и R1b (код узорака раног гвозденог доба); један узорак (cim358) раног гвозденог доба припада Q1 хаплогрупи и он је са локалитета Черногоровка културе у ЈИ Молдавији, која се везује за народ Кимераца споменут код Херодота. Подсетићу на IR1 налаз у североисточној Мађарској који припада N2 хаплогрупи (у оквиру културе која се везује за Кимерце), и то грани која је ближа анонимном тестираном N2 Алтајцу него P189.2; очигледно је код Кимераца дошло до извесног источноазијског уплива, што се још боље очитава на мтДНК хаплогрупама које су пронађене у оквиру ове студије (A, C, D и M), поред западно-евроазијских које су биле присутне и код популације касног бронзаног доба (H, J1, K1, T2, U2, U4, и U5).

Колико сам успио схватити само код прве двије популације у студији: Срубнаја и Кимераца су успјели констатовати неки образац. Срубнаја као популација без сибирског уплива (најближа данашњим Русима, Угрофинима) и Кимерци са значајним удјелом сибирске генетике. У случају Скита и Сармата те обрасце је већ теже испратити, тј. као да се формира нека нова степска мјешавина састављена из неколико локалних варијанти на чије формирање су имале утицаја и популације са којима су долазили у додир.

Иако Кимерци из студије не стоје блиско у односу на било коју савремену популацију, ипак као да се налазе у троуглу Чуваши, Ногајци, Черкези, а колико се сјећам и N2 узорак из Мезочата је имао неку сличну аутосомалну позицију (нагињао је савременим популацијама Кавказа). Уколико у студији под Hungary_IA подразумјевају IR1 (Мезочат), онда и један од Кимераца Cim357 не стоји далеко од њега.

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Октобар 04, 2018, 10:22:32 пре подне
Уколико у студији под Hungary_IA подразумјевају IR1 (Мезочат), онда и један од Кимераца Cim357 не стоји далеко од њега.

Сад сам провјерио, Hungary_IA јесте IR1 (Мезочат).

Ево те блискости на коју сам мислио:

(https://i.postimg.cc/RVy52jLN/iron_age.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Сремац Октобар 04, 2018, 11:11:43 пре подне
(https://i.imgur.com/Ie1umq2.png)

Мени ове компоненте нису јасне, утисак је да су прилично рђаво одређене. Нисам сигуран да је WHG компонента превише битна за степске номаде. Такође, нејасан је и неразрешен њен однос према EHG компоненти, тако да ми се чини прилично лошом идејом модел са WHG, а без EHG, ANE или степске компоненте, јер ће се у WHG компоненту слити гени наслеђени од EHG или сличне (Јамна) популације, што може утицати на тумачење историјских процеса и односа.

Такође, на приказу се види да узорци из анадолијског раног неолита имају више од трећине WHG-а, тако да је однос WHG компоненте и раних неолитских узорака прилично опскуран, ја га схватам као однос Vilabruna - Natufian, јер судећи по слици Вилабруна баштини готово искључиво WHG компоненту, а Натуфиан неолитску (NEN).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Октобар 04, 2018, 11:41:08 пре подне
(https://i.imgur.com/Ie1umq2.png)
Мени ове компоненте нису јасне, утисак је да су прилично рђаво одређене. Нисам сигуран да је WHG компонента превише битна за степске номаде. Такође, нејасан је и неразрешен њен однос према EHG компоненти, тако да ми се чини прилично лошом идејом модел са WHG, а без EHG, ANE или степске компоненте, јер ће се у WHG компоненту слити гени наслеђени од EHG или сличне (Јамна) популације, што може утицати на тумачење историјских процеса и односа.

И ја сам то примјетио. Имам осјећај као да су кроз компоненте хтјели да направе неку подјелу Европа/Азија али у савременом смислу.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Октобар 04, 2018, 12:39:59 поподне
(https://i.imgur.com/Ie1umq2.png)

Мени ове компоненте нису јасне, утисак је да су прилично рђаво одређене. Нисам сигуран да је WHG компонента превише битна за степске номаде. Такође, нејасан је и неразрешен њен однос према EHG компоненти, тако да ми се чини прилично лошом идејом модел са WHG, а без EHG, ANE или степске компоненте, јер ће се у WHG компоненту слити гени наслеђени од EHG или сличне (Јамна) популације, што може утицати на тумачење историјских процеса и односа.
Мени најрационалније објашњење недостатка ANE/EHG компоненте у овој студији јесте тај да су аутори хтели да виде да ли су компоненте географски удаљеније од тог подручја (попут SA и NEA) имале и у којој мери утицај на аутосомалну слику тестираних популација. Јер је логично да би скитски и сарматски узорци били доминантно ANE/EHG, што би аутосомалну слику прилично поједноставило.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Сремац Октобар 04, 2018, 03:34:12 поподне
И ја сам то примјетио. Имам осјећај као да су кроз компоненте хтјели да направе неку подјелу Европа/Азија али у савременом смислу.

Да, могуће, WHG као општеевропска тачније северноевропска компонента која је упила и добар део наслеђа EHG (тако је и одређена West & North European HGs & Modern North European populations - WHG) против остатка света...Вероватно су хтели да направе јасно разлучене компоненте, али резултати ми не делују баш импресивно.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Сремац Октобар 04, 2018, 04:32:40 поподне
Мени најрационалније објашњење недостатка ANE/EHG компоненте у овој студији јесте тај да су аутори хтели да виде да ли су компоненте географски удаљеније од тог подручја (попут SA и NEA) имале и у којој мери утицај на аутосомалну слику тестираних популација. Јер је логично да би скитски и сарматски узорци били доминантно ANE/EHG, што би аутосомалну слику прилично поједноставило.

Мислим да схватам шта хоћеш да кажеш и могуће да би EHG, а посебно ANE утицали на SEA и NEA компоненту и да се овако добијају сигурнији постоци Источне Азије код степских популација Гвозденог доба, али се не бих сложио да би слика била поједностављена, мислим да би била информативнија и прецизнија, не само у оквиру разулучивања WHG - EHG (које је већ довољан разлог), већ би регулисала ове мале постотке посебно код Срубне и осталих узорака из Бронзаног доба, који су вероватно последица изостанка EHG компоненте, које се не би смела занемарити у контексту степских популација.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Октобар 04, 2018, 06:42:30 поподне
али се не бих сложио да би слика била поједностављена, мислим да би била информативнија и прецизнија, не само у оквиру разулучивања WHG - EHG (које је већ довољан разлог), већ би регулисала ове мале постотке посебно код Срубне и осталих узорака из Бронзаног доба, који су вероватно последица изостанка EHG компоненте, које се не би смела занемарити у контексту степских популација.
Да, у том случају имаш право. Рецимо, види се да WHG доминира управо због недостатка EHG и ANE категорија, а ове слабије категорије долазе више до изражаја (изузев можда код Кимеријаца, који дефинитивно имају јачи уплив источноазијских популација). Сигуран сам да би прилично опао тај проценат када би постојале те две категорије. Колико се сећам из неких пређашњих студија EHG би био ловац-сакупљач присутан на широком подручју од Балтика до Степе?  Делује ми да недостатак EHG и ANE код ових узорака представља те резултате (говорећи као да се ради о резултатима данашњих људи) као када би особа са ових простора због недостатка балканске категорије неког рачунача имала нпр. 70% северозападно европске и 30% блискоисточне мешавине.

Иначе, занимљиво је где се на PCA анализи налазе поједини скитски узорци.

A group of three Scythians (scy301, scy304, and scy311) formed a discrete group between the SC and SE and had genetic affinities to present-day Bulgarian, Greek, Croatian, and Turkish populations, hereafter referred to as a central cluster (CC).

Мада, колико видим узорак scy010 је најближи овим просторима.

Такође, скитски узорци имају највише ANF (блискоисточног уплива). Претпостављам да је то објашњиво њиховим продорима и контактима са тамошњим популацијама?

(https://i.imgur.com/haYo3Nm.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Сремац Октобар 04, 2018, 08:34:56 поподне
Колико се сећам из неких пређашњих студија EHG би био ловац-сакупљач присутан на широком подручју од Балтика до Степе?

Да, међутим још увек није баш најјаснија веза са WHG, иако се EHG може представити као мешавина WHG и ANE, са мало већом склоношћу ка ANE. Вероватно зато се у оваквим моделима EHG гени преливају у WHG компоненту.

Иначе, занимљиво је где се на PCA анализи налазе поједини скитски узорци.

A group of three Scythians (scy301, scy304, and scy311) formed a discrete group between the SC and SE and had genetic affinities to present-day Bulgarian, Greek, Croatian, and Turkish populations, hereafter referred to as a central cluster (CC).

Мада, колико видим узорак scy010 је најближи овим просторима.

Такође, скитски узорци имају највише ANF (блискоисточног уплива). Претпостављам да је то објашњиво њиховим продорима и контактима са тамошњим популацијама?

(https://i.imgur.com/haYo3Nm.png)

Изгледа да су Скити у великој мери упијали друге народе тј. домороце на које су наилазили. Можда се овај ANF може објаснити грчким упливом са Црног мора.
Иначе у раду 137 ancient human genomes from across the Eurasian steppes обрађено је неколико скитских узорака из Мађарске и колико сам видео више личе на локалце него на степске народе укључујући и Ските са осталих налазишта. Такође, мање више сви су различити, неки су најближи савременим средњеевропским, неки балканским, а неки западноевропским популацијама.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Октобар 04, 2018, 10:27:59 поподне
Изгледа да су Скити у великој мери упијали друге народе тј. домороце на које су наилазили. Можда се овај ANF може објаснити грчким упливом са Црног мора.
Иначе у раду 137 ancient human genomes from across the Eurasian steppes обрађено је неколико скитских узорака из Мађарске и колико сам видео више личе на локалце него на степске народе укључујући и Ските са осталих налазишта. Такође, мање више сви су различити, неки су најближи савременим средњеевропским, неки балканским, а неки западноевропским популацијама.

Да, то има смисла, узевши у обзир колики географски простор су покривали и са колико различитих популација су били у контакту.

Самим тим, неке од тих популација су морали и асимиловати, односно наметнути им језик и културу, и на крају крајева ''умешати'' им се у генетску слику.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Сремац Октобар 04, 2018, 10:41:07 поподне
Ево најближих популација за 5 скитских узорке из Мађарске (DA195 је у "нашем" кластеру):

(https://i.imgur.com/YycR0fj.png)

(https://i.imgur.com/vZR3KMI.png)

(https://i.imgur.com/zND4Of5.png)

(https://i.imgur.com/cWwCpVX.png)

(https://i.imgur.com/Dtxf85h.png)

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Zor Октобар 05, 2018, 01:12:56 пре подне
Мени најрационалније објашњење недостатка ANE/EHG компоненте у овој студији јесте тај да су аутори хтели да виде да ли су компоненте географски удаљеније од тог подручја (попут SA и NEA)

 Компоненте у овој као и свакој другој студији немају подударања са комерцијалним аутосомалним компонентама, неко ће их прерачунати у ове "уобичајене". Нпр. CHG је моделиран као доминантно "CHG" + нешто NEN, SA али и мало WHG. Мађарски рани неолит који је код генетикера доминантно EEF + мало WHG овдје је 48 % NEN + 45 WHG + 7 % CHG. Ту се јавља још компоненти за које није појашњено шта су (јер су мање учестале).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Сремац Октобар 05, 2018, 01:26:19 пре подне
Компоненте у овој као и свакој другој студији немају подударања са комерцијалним аутосомалним компонентама, неко ће их прерачунати у ове "уобичајене". Нпр. CHG је моделиран као доминантно "CHG" + нешто NEN, SA али и мало WHG. Мађарски рани неолит који је код генетикера доминантно EEF + мало WHG овдје је 48 % NEN + 45 WHG + 7 % CHG. Ту се јавља још компоненти за које није појашњено шта су (јер су мање учестале).

Које су то комерцијалне компоненте, а које уобичајене? Како год, прилично је неуобичајено, а помало и комично да степски узорци буде више од половине WHG.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Zor Октобар 05, 2018, 02:36:11 пре подне
Које су то комерцијалне компоненте, а које уобичајене?

 То су моји "склепани" називи за ове компоненте које се иначе врте код комерцијално тестираних..

Како год, прилично је неуобичајено, а помало и комично да степски узорци буде више од половине WHG.

 Наравно да то доминантно није "прави" WHG.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Октобар 05, 2018, 09:02:50 пре подне
Компоненте у овој као и свакој другој студији немају подударања са комерцијалним аутосомалним компонентама, неко ће их прерачунати у ове "уобичајене". Нпр. CHG је моделиран као доминантно "CHG" + нешто NEN, SA али и мало WHG. Мађарски рани неолит који је код генетикера доминантно EEF + мало WHG овдје је 48 % NEN + 45 WHG + 7 % CHG. Ту се јавља још компоненти за које није појашњено шта су (јер су мање учестале).
Хвала на информацијама. Јасно ми је да рачуначи који се користе у студијама и које користи Давидски немају везе са комерцијалним, да су у питању потпуно другачији алгоритми и референтне популације.

Иначе, судећи по анализама bam фајлова по страним форумима Y-ДНК слика није уопште тако компактна како су закључили у студији. Рецимо, Владимир Семаргл са Молгена је написао да је scy197 уствари E1b-V13 a да је scy301 - I2-Y7219 (https://www.yfull.com/tree/I-Y7219/). Такође, cim357, tem002, tem003  по свему судећи R1b-.

Што се тиче потврђених резултата којима је одређен дубљи огранак за сада:

scy009 = R1b-P312
scy304 = R1b-Z2103 (M12149/Y4371/Z8128+)
scy305 = R1b-Z2103>Z2106 (Z2106+, Y12538/Z8131+)




Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Октобар 05, 2018, 10:49:13 пре подне
Eво табеле од Семаргла.

Scythian etc (https://docs.google.com/spreadsheets/d/1bnVJujBs_bQu_dqSVi_dSXUuz9gNIYFX_XlqRrz92mo/htmlview)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Сремац Октобар 05, 2018, 11:03:52 пре подне
То су моји "склепани" називи за ове компоненте које се иначе врте код комерцијално тестираних..

 Наравно да то доминантно није "прави" WHG.

Тим горе јер је WHG = West & North European HGs & Modern North European populations. Три у један.
И онда добијеш солидан постотак Јужне Азије код свих степских узорака Бронзаног доба.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Сремац Октобар 05, 2018, 04:20:14 поподне
https://www.nature.com/articles/s41598-018-33067-w

(https://i.imgur.com/7yT8QsX.png)

(https://i.imgur.com/YD0Pgmk.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Октобар 05, 2018, 04:39:32 поподне
https://www.nature.com/articles/s41598-018-33067-w

Заредали са радовима послије љетње паузе.  ;)

Јасно ми је како су подијелили компоненте, кренувши од четири основне WHG, EHG, Левантски неолитик и Ирански неолитик. Једино ми је изненађење да је већ Анадолски неолитик имао солидан проценат WHG-a 26%. А колико видим и први ЛБК су били мање више "чисти" Анадолски неолитик, при чему и већи дио WHG потиче од Анадолаца. То ми је мало чудно.

Колико видим успјели су издвојити само 4 Y-DNK резултата и то из Кордеда и раног Бронзаног доба: I2-M223 и R1a.

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Сремац Октобар 05, 2018, 09:48:39 поподне

Јасно ми је како су подијелили компоненте, кренувши од четири основне WHG, EHG, Левантски неолитик и Ирански неолитик. Једино ми је изненађење да је већ Анадолски неолитик имао солидан проценат WHG-a 26%. А колико видим и први ЛБК су били мање више "чисти" Анадолски неолитик, при чему и већи дио WHG потиче од Анадолаца. То ми је мало чудно.

Колико видим успјели су издвојити само 4 Y-DNK резултата и то из Кордеда и раног Бронзаног доба: I2-M223 и R1a.

Да и мени је било чудно, изгледа да још увек нису рашчивијане многе везе, с обзиром на сложеност историјских и етногенетских процеса. Вероватно је постојала нека изворна популација која спаја WHG и Анадолског земљорадника различита од Левантског. У моделима са старијим узорцима са Леванта, обично Анадолци падају између WHG и Леванта.

(https://3.bp.blogspot.com/-JLRR7mdKPH0/WDrSZJVYInI/AAAAAAAAFFs/Ck4ewB63dQYw0tVpD08_MtmiXwhFXIwJACLcB/s1600/K7_triangle.png)

(https://i.imgur.com/tljFsYp.png)

Из рада Late Pleistocene human genome suggests a local origin for the first farmers of central Anatolia , стр. 4:

These three prehistoric Anatolian populations (AHG, AAF and ACF), that represent a temporal
transect spanning the transition into farming, are positioned between Mesolithic western
European hunter-gatherers (WHG) at the far left and Levantine Epipalaeolithic Natufians
at the far right.





Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Октобар 05, 2018, 10:39:45 поподне
Да и мени је било чудно, изгледа да још увек нису рашчивијане многе везе, с обзиром на сложеност историјских и етногенетских процеса. Вероватно је постојала нека изворна популација која спаја WHG и Анадолског земљорадника различита од Левантског. У моделима са старијим узорцима са Леванта, обично Анадолци падају између WHG и Леванта.

Могуће, али на основу шеме/модела из најновијег рада испада као да су Анадолци мјешавина WHG, Левант неолитик и Иран неолитик, тј. да нису изворна већ мјешана популација. Мада по овој шеми коју си посљедњу поставио Анадолци стоје прилично далеко од WHG.

Такође, питање је и како је постављен сам WHG у раду. Морам признати да нисам у скорије вријеме детаљно гледао радове и не знам да ли су у WHG убачени и узорци са Ђердапа и како они стоје у односу на Лошбур, који је најчешће служио као референтан узорак за WHG.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Сремац Октобар 05, 2018, 11:39:38 поподне
Могуће, али на основу шеме/модела из најновијег рада испада као да су Анадолци мјешавина WHG, Левант неолитик и Иран неолитик, тј. да нису изворна већ мјешана популација.

Да, мислим да је прилично извесно да су некаква мешавина, тачније да су у вези са WHG, оно што збуњује је чињеница да су се Анадолци узимали за изворну/узорну популацију у различитим радовима, претпостављам да би се лакше установио однос са осталим популацијама са којима су се сударале у простору и времену, посебно однос према WHG који су затекли у Европи. Уосталом тешко да је иједна популација изворна у правом смислу.

Мада по овој шеми коју си посљедњу поставио Анадолци стоје прилично далеко од WHG.

Јесу далеко, али ипак теже WHG кластеру у односу на Левант.

Такође, питање је и како је постављен сам WHG у раду. Морам признати да нисам у скорије вријеме детаљно гледао радове и не знам да ли су у WHG убачени и узорци са Ђердапа и како они стоје у односу на Лошбур, који је најчешће служио као референтан узорак за WHG.

Ђердапски узорци нагињу мало ка EHG и ово болдовано би могло бити занимљиво у контексту односа WHG и Анадолских земљорадника, пре европског контакта:

Modeling Iron Gates hunter-gatherers as a mixture of WHG and EHG (Supplementary Table 3) shows that they are
– as expected given their geographic location and the hunter-gatherer ancestry cline –
intermediate between WHG (87%) and EHG (13%). However, this qpAdm model does not fit
well (p=0.0003, Supplementary table 3) and we note that the Iron Gates hunter-gatherers
carry mitochondrial haplogroups K1 (8/36) as well as other subclades of haplogroup U
(27/36) and haplogroup H (1/36). This contrasts with WHG, EHG and Scandinavian hunter
gatherers who almost all carry haplogroup U5 or U2. Therefore the Iron Gates hunter
gatherers have ancestry that is not present in WHG or EHG. This suggests either genetic
contact between the ancestors of the Iron Gates population and hunter-gatherers from
Anatolia, or that the Iron Gates population is related to the source population from which the
WHG split off during a post-LGM re-expansion into Europe.


The Genomic History of Southeastern Europe

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Октобар 06, 2018, 08:49:27 пре подне
Ђердапски узорци нагињу мало ка EHG и ово болдовано би могло бити занимљиво у контексту односа WHG и Анадолских земљорадника, пре европског контакта:

Modeling Iron Gates hunter-gatherers as a mixture of WHG and EHG (Supplementary Table 3) shows that they are
– as expected given their geographic location and the hunter-gatherer ancestry cline –
intermediate between WHG (87%) and EHG (13%). However, this qpAdm model does not fit
well (p=0.0003, Supplementary table 3) and we note that the Iron Gates hunter-gatherers
carry mitochondrial haplogroups K1 (8/36) as well as other subclades of haplogroup U
(27/36) and haplogroup H (1/36). This contrasts with WHG, EHG and Scandinavian hunter
gatherers who almost all carry haplogroup U5 or U2. Therefore the Iron Gates hunter
gatherers have ancestry that is not present in WHG or EHG. This suggests either genetic
contact between the ancestors of the Iron Gates population and hunter-gatherers from
Anatolia, or that the Iron Gates population is related to the source population from which the
WHG split off during a post-LGM re-expansion into Europe.


The Genomic History of Southeastern Europe

Хвала, Сремче, на овом цитату, доста ми је тога разјаснио тј. схватио сам да ни само моделовање популација није тако једноставно ( можда га ја превише поједностављено схватам). Мислим да је кључна ова реченица: "Therefore the Iron Gates hunter gatherers have ancestry that is not present in WHG or EHG"
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Сремац Октобар 06, 2018, 10:29:05 пре подне
Хвала, Сремче, на овом цитату, доста ми је тога разјаснио тј. схватио сам да ни само моделовање популација није тако једноставно ( можда га ја превише поједностављено схватам). Мислим да је кључна ова реченица: "Therefore the Iron Gates hunter gatherers have ancestry that is not present in WHG or EHG"

Има у додатаном материјалу од стране 55, покушаје моделовања популација, попут овог:

(https://i.imgur.com/kBRSflk.png)

Ако добро ишчитавам, на овом стаблу се добило да је предачка популација за WHG са 40% учествовала у етногенези популације из који проистичу Анадолци из Неолита, што може објаснити њихову релативну блискост.

https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/suppl/2017/09/19/135616.DC4/135616-1.pdf
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: filipi Октобар 06, 2018, 03:48:19 поподне
https://www.nature.com/articles/s41598-018-33067-w#Sec21

A genomic Neolithic time transect of hunter-farmer admixture in central Poland
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Voljen od Boga Октобар 06, 2018, 07:11:47 поподне
https://www.nature.com/articles/s41598-018-33067-w#Sec21

A genomic Neolithic time transect of hunter-farmer admixture in central Poland

Управо ово читам. Занимљива ми регија а и топоним Kujawy.
https://www.google.hr/maps/place/47-370+Kujawy,+Poljska/@50.4686251,18.5838668,6z/data=!4m5!3m4!1s0x4711a5cf1f576f03:0x11ee07d9c9821f7e!8m2!3d50.443825!4d17.8083484
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Voljen od Boga Октобар 06, 2018, 08:02:14 поподне
Чини ми се да је суштина у овим реченицама:
"We were able to derive the respective Y-chromosome haplogroup data for only four of the seven males in this study (one of which with a low confidence level). Results indicate that all three Neolithic individuals belonged to haplogroup I (I2a2a), and the fourth individual, dated to the Early Bronze Age, was assigned to haplogroup R (R1a).

The presence of haplogroup R1a is in accordance with evidence of a steppe migration into Europe from the East at the end of Neolithic."

"Uspjeli smo izvesti odgovarajući haplogrup Y-kromosoma za jednu od najnižih razina pouzdanosti. Rezultati svih triju neolitskih pojedinaca pripadali su haplogroupu I (I2a2a), a četvrti pojedinac, datiran u rano brončanom dobu, dodijeljen je haplogrupu R (R1a).

Prisutnost haplogroupa R1a je u skladu s neolitikom."


Значи ли то да је I2a1 у Неолиту био испод Карпата?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милан Петровић Октобар 06, 2018, 08:35:27 поподне
Колико сам прочитао, I је пронађен у Орињачкој култури старој четрдесетак хиљада година. А у Граветјен култури која је наследила Орињачку је пронађен F, између осталих.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: filipi Октобар 06, 2018, 10:34:45 поподне
Значи ли то да је I2a1 у Неолиту био испод Карпата?
Neolit na Balkanu se pojavljuje prije oko 5500 godina prije nove ere.Nas M423—L621 i L161 se tada a i unazad hiljadama godina nalazi od centralne Evrope,zapadne Evrope,Britanskih ostrva pa do nalaza L621 kod Bjelorusije i Poljske (CTS4002).Ne postoji nijedan nalaz M423 ispod Karpata, a jasno je poslije svih ovih godina istrazivanja da ga nece ni biti osim kroz mutaciju L621—CTS10228—YP196 koja je relativno mlada TMRCA oko 2300 godina i koja dolazi sa istoka Evrope preko svojih podgrana.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Октобар 22, 2018, 02:08:07 пре подне
Analysis of male specific region of the human Y chromosome sheds light on historical events in Nazi occupied eastern Poland (https://link.springer.com/article/10.1007/s00414-018-1943-0)

Прилично занимљив рад. Није у питању нешто што се може сматрати “древном” днк, али се свакако ради о анализираним скелетним остацима људи из ближе прошлости у односу на неке друге историјске периоде.

Одлично је и што су доступни 23 маркерни хаплотипови, а и Невген је имао значајно учешће у студији.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Александар Невски Октобар 22, 2018, 05:40:14 поподне
Analysis of male specific region of the human Y chromosome sheds light on historical events in Nazi occupied eastern Poland (https://link.springer.com/article/10.1007/s00414-018-1943-0)

Прилично занимљив рад. Није у питању нешто што се може сматрати “древном” днк, али се свакако ради о анализираним скелетним остацима људи из ближе прошлости у односу на неке друге историјске периоде.

Одлично је и што су доступни 23 маркерни хаплотипови, а и Невген је имао значајно учешће у студији.

Хвала за везу, Атлантисцхе. Врло занимљива област за примѣну одређивања хаплоскупин. Прочитах читав рад.
Мислим да би и у нас била тушта областий за сличне подухвате. На примѣр многобройна стратишта усташких, нацистичких и комунистичких жртав. А пада ми на памет и нишки торањ од лобањ...
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Sirius Октобар 27, 2018, 05:14:39 поподне
Археолог Душан Борић, истраживач Универзитета Колумбија, са двоје колега из Србије, Андрејем Старовићем и Драганом Антоновићем, дошао је до нових сазнања о ДНК и геномима древних популација. Реч је о изненађујућим закључцима о пореклу европског становништва, до којих су дошли на локалитетима Лепенски Вир и Власац.

https://rs.sputniknews.com/nauka/201810271117631372-arheolog-Srbija-otkrice-pracovek-genetika-/

Научна студија обухватила је геноме 225 древних људи који су живели до краја последњег миленијума старе ере. Њихова ДНК сачувана је у лобањи, у веома тврдој петрозној кости, објашњава Борић.

„Доказали смо оно у што се сумњало дуго времена, али није било чврстих доказа, да се десила значајна популациона миграција са подручја северозападне Анадолије, данашње Турске, у Европу и да на овом месту, пре свега у Ђердапу, имамо занимљив процес мешања придошлица — земљорадника, са локалним ловцима — сакупљачима. Они су на тим просторима вероватно већ живели хиљадама година, од леденог доба“, каже Борић.

Интеракције популација у прошлости велики су изазов за палеогенетичаре, а ово истраживање је важно јер је прва студија која се тиче разумевања геномске слике југоисточне Европе. Дошљаци изгледају и живе другачије, познају пољопривреду и имају прве житарице, а са собом доводе и стоку. Међутим, о мешању домаћина, ловаца — сакупљача и придошлица из Анадолије не говори само ДНК, каже Борић.

„У Лепенском виру постоје чак особе које су сахрањене на мезолитски начин, нашли смо елементе тог погребног процеса, из чега се види да су то земљорадници, односно дошљаци у Ђердап. Такође, имамо један занимљив скелет са локалитета Падина који има по 50 одсто од оба наслеђа, што највероватније говори о томе да се ради о потомку везе између две индивидуе са потпуно различитим генетским наслеђем из две различите популације“, открива саговорник Спутњика.

Његов тим последњих година ради на још једном важном пројекту на овим просторима, у Врбичкој пећини код Никшића. Трагови коришћења пећине стари су 24 хиљаде година. Пронађен је и људски скелет стар око 3.600 година. Значајан проналазак представљају фрагменти костију мрмота и опрема за лов. У пећини су живели ловци на мрмоте, а ловци — сакупљачи дуго су ловили крупну дивљач, објашњава археолог.

„Иако у италијанским, швајцарским и француским Алпима постоје локалитети где има специјализације у лову на мрмоте, то се све дешава много касније од овога што смо ми нашли у Врбичкој пећини. Мислимо да је у питању еволутивни процес фокусирања на одређене врсте попут мрмота, кога су вероватно лако ловили. Шалим се да је то можда питање лењости тих црногорских ловаца — сакупљача. Било им је лако да улове мрмоте који су живели по тадашњем пејзажу те регије“, каже Борић уз осмех.

Истраживања његовог тима откривају да је Балкан одувек био специфичан регион, да се налази на раскршћу између истока и запада Европе, а први „модерни људи“ на наше просторе долазе пре 40 хиљада година. Археологија, међутим, још није нашла одговор на питање зашто су из плодне Анадолије дошли на подручје данашње Србије, са кога су се касније селили на север Старог континента. Најчешћа претпоставка је да их је на то натерала промена климе.

Борић каже да је тешко рећи колико гена данас делимо са тим људима и да пример мешања становништва које је истраживао најбоље говори у прилог чињеници колико је илузорно говорити о континуитетима по генетској линији од праисторије до данас.

„Оно што се десило накнадно, после неколико хиљада година од њиховог ширења, јесте талас степских популација које долазе са истока из подручја Украјине, Русије, централне Азије. Те популације крајем бакарног доба, око 3.000 година пре наше ере, скоро у потпуности мењају тај популациони субстратум који постоји на европском континенту“, објашњава он.

На крају разговора за Спутњик, Борић каже да је, са научне тачке гледишта, прича о пирамидама у Високом измишљотина, али и тужна прича о нама, јер постоји јако пуно културног наслеђа у Босни, Србији, Црној Гори, на целом простору југоисточне Европе, које је веома богато и значајно.

Борић је докторирао на Кембриџу, две године је био кустос у Музеју Војводине у Новом Саду, а донедавно и стални професор на Универзитету у Кардифу.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: симо Јануар 16, 2019, 06:05:14 поподне
У краћем филму AlJazeere о обнови и ископавањима око средњовјековног града Дубровника, сјеверно од Сарајева, споменут је и проналазак гроба великог кнеза босанског Мирка Радојевића. Да се ради управо о овом властелину закључили су уз помоћ генетике, а на основу претходно нађених остататка његовог сина војводе Батића.
https://bs.wikipedia.org/wiki/Bati%C4%87_Mirkovi%C4%87

Археолози су од Института за генетички инжињеринг и биотехнологију Универзитета у Сарајеву добили потврду да се ради о оцу Батићевом. Могуће да се ради и о Y-днк резултатима. И раније је, чини ми се, било приче о томе да су са неких средњовјековних некропола у Босни узимани узорци, па између осталих и за неке од Котроманића. Штета што досад од тога ништа није публиковано.

Од 11:50

https://www.youtube.com/v/aXzzCacVGxA
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Voljen od Boga Јануар 16, 2019, 07:27:16 поподне
У краћем филму AlJazeere о обнови и ископавањима око средњовјековног града Дубровника, сјеверно од Сарајева, споменут је и проналазак гроба великог кнеза босанског Мирка Радојевића. Да се ради управо о овом властелину закључили су уз помоћ генетике, а на основу претходно нађених остататка његовог сина војводе Батића.
https://bs.wikipedia.org/wiki/Bati%C4%87_Mirkovi%C4%87

Археолози су од Института за генетички инжињеринг и биотехнологију Универзитета у Сарајеву добили потврду да се ради о оцу Батићевом. Могуће да се ради и о Y-днк резултатима. И раније је, чини ми се, било приче о томе да су са неких средњовјековних некропола у Босни узимани узорци, па између осталих и за неке од Котроманића. Штета што досад од тога ништа није публиковано.

Од 11:50

https://www.youtube.com/v/aXzzCacVGxA



Uzorci su uzeti još 2015. g.
https://www.klix.ba/vijesti/bih/veliko-arheolosko-otkrice-u-nekropoli-kod-ilijasa-pronadjen-skelet-bez-glave-sa-zlatnim-plastom/150626044
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Селаковић Јануар 19, 2019, 10:49:24 поподне
Видех ову објаву Теда Кандела, не знам колико је значајно (обраће се и Вадиму Урасину):

Цитат
The new Ancient Iberian Genomes unpublished study, PRJEB29189, has three whole genomes that have high-coverage Y-DNA sequences from 4500-3500 ybp. Vadim, can you add these to the YFull tree?
No "Steppe" / "Bell Beaker" ancestry in Iberia yet.
The haplogroups are as follows.
Who are the "lucky winners" here who match them on the YFull tree?

A spreadsheet of all the Y SNPs for these ancient Iberian individuals:
https://docs.google.com/…/1thcQUVLKga7YPtv1mj0d9fakXD…/edit…

https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB29189

LU339 "partial" I-Y3749:
https://yfull.com/tree/I-Y3749/
AMM080/Y4661/FGC7133+
FGC7139/Y3749-

COV20126 I-Y34539*:
https://yfull.com/tree/I-Y34539/

LD270 "partial" H-Y20838:
https://yfull.com/tree/H-Y20838/
Z19077+
Z19083+
Z19118+
Y21665-
Y21636-
Y20840-
Y20836-
Y21673-
Y21633-
Y21635-
Y21640-


https://docs.google.com/spreadsheets/d/1thcQUVLKga7YPtv1mj0d9fakXDmUhAr5EjK9GU1_pK4/edit?fbclid=IwAR2SJMWVU9F2vgrvh09G-yqBjf8gMBHdAKzO7qjfGdIjJXMOngCoMjpsvyk#gid=477864761
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Јануар 19, 2019, 11:04:14 поподне
Видех ову објаву Теда Кандела, не знам колико је значајно (обраће се и Вадиму Урасину):
 

https://docs.google.com/spreadsheets/d/1thcQUVLKga7YPtv1mj0d9fakXDmUhAr5EjK9GU1_pK4/edit?fbclid=IwAR2SJMWVU9F2vgrvh09G-yqBjf8gMBHdAKzO7qjfGdIjJXMOngCoMjpsvyk#gid=477864761

Мислим да се ради о још увек необјављеној студији Свакако занимљиви резултати. Први је I2a-L161 познат као Isles. Други је I2a-M223, а трећи H2. Занимљиво да ове подгране које Тед спомиње, нема данас у Шпанији. Посебно је занимљив овај H2.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Фебруар 07, 2019, 04:38:15 поподне
Занимљиве инсајдерске информације са Антрогенике  (https://anthrogenica.com/showthread.php?8066-DISCUSSION-THREAD-FOR-quot-Genetic-Genealogy-and-Ancient-DNA-in-the-News-quot&p=545077&viewfull=1#post545077) везане за предавање о будућој студији A 12,000-year Genetic History of Rome and the Italian Peninsula (https://events.stanford.edu/events/823/82317/) одржане јуче на Стенфорду.

Такође, видех да је један форумаш окачио ово: Different, yet similar: a multidisciplinary analysis of three individuals from the Great Migration Period from Osijek, eastern Croatia
 (https://bib.irb.hr/prikazi-rad?&lang=EN&rad=981084)

The paper presents the results of the multidisciplinary analysis of the remains belonging to the three individuals dated to the Great Migration Period (5th c. CE) from Osijek in eastern Croatia. Based on the archaeological context, radiocarbon dates and ancient DNA analysis it is possible that the studied individuals were of Asian, possibly Hunnish origin. The partially preserved skeletons were deposited within a circular pit filled with animal bones and pottery fragments. The skeletal remains belonged to three adolescents between 12 and 16 years old, two of whom exhibited intentional artificial cranial deformation. A comprehensive bioarchaeological analysis and CT imaging suggest the use of two different types of artificial deformation: the circular erect and tabular oblique type. While this phenomenon has been observed in various ancient populations, its origins and purpose are still not fully understood. Carbon and nitrogen stable isotopes analysis performed on two individuals with artificial cranial deformation showed high δ13C values (−17.0‰ and −15.5‰) and very similar δ15N values (9.5‰ and 9.9‰) suggesting a mixed terrestrial C3/C4 diet with a heavy reliance on resources such as millet. Ancient DNA analysis revealed that all individuals are males, as assessed by chromosome ratios. Individual SU 259 shows Asian ancestry on the PCA which is also supported by the estimated mitochondrial haplogroup F1b. The estimated mitochondrial haplogroups of the individuals SU 261 and 750 are H1 and H5, and they cluster around individuals from the Near/Middle East and the Caucasus. The results obtained by this study revealed new, previously unknown, information on lifestyle and biological characteristics of people inhabiting the Pannonian Basin during the 5th century.


Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Radul Фебруар 14, 2019, 01:05:19 поподне
 Nuclear and Mitochondrial DNA Analysis of a 2,000-Year-Old Necropolis in the Egyin Gol Valley of Mongolia (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1180365/)

У овом раду испитана су 62 узорка, од тога 27 мушких. Узорци датирани од 3 вијека п.н.е. до 2 н.е. . МтДНК доминирају A, C, и D4, а срећу се и F1b, J1, G2a, U2 or U5a1a. На брзину погледах Y ДНК, чини се да доминирају, C2, Q-M346, среће се и R1a? (број 70).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Дервента Април 11, 2019, 07:01:02 поподне
Изгледа да имамо новог члана наше људске породице - Homo luzonensis

https://www.nationalgeographic.com/science/2019/04/new-species-ancient-human-discovered-luzon-philippines-homo-luzonensis/ (https://www.nationalgeographic.com/science/2019/04/new-species-ancient-human-discovered-luzon-philippines-homo-luzonensis/)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Азот Април 11, 2019, 07:09:35 поподне
Изгледа да имамо новог члана наше људске породице - Homo luzonensis

https://www.nationalgeographic.com/science/2019/04/new-species-ancient-human-discovered-luzon-philippines-homo-luzonensis/ (https://www.nationalgeographic.com/science/2019/04/new-species-ancient-human-discovered-luzon-philippines-homo-luzonensis/)
Баш сам данас читала о томе.
https://www.blic.rs/slobodno-vreme/vesti/otkriveni-ostaci-nove-ljudske-vrste-u-pecini-na-filipinima-foto/k24pcgv (https://www.blic.rs/slobodno-vreme/vesti/otkriveni-ostaci-nove-ljudske-vrste-u-pecini-na-filipinima-foto/k24pcgv)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Азот Април 25, 2019, 08:31:38 поподне
Изгледа да је пронађен неандерталац и близу Ниша
https://www.bbc.com/serbian/lat/srbija-48014663?xtor=CS3-33-%5Bwsserbian~C~A14B11C13D11E15F12G11nislija~smpnislija%5D-%5BFacebook%5D-%5B23843339596380587%5D-%5B23843339596450587%5D (https://www.bbc.com/serbian/lat/srbija-48014663?xtor=CS3-33-%5Bwsserbian~C~A14B11C13D11E15F12G11nislija~smpnislija%5D-%5BFacebook%5D-%5B23843339596380587%5D-%5B23843339596450587%5D)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милан Петровић Мај 17, 2019, 03:46:42 поподне
http://umap.openstreetmap.fr/en/map/ancient-human-dna_41837#5/53.821/13.768
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милан Петровић Јун 06, 2019, 09:50:48 пре подне
Just came across Wang et al. Fascinating results obscured as usual by a lot of quasi-analysis. Confusing they have several different 'cultures' within the one kurgan.

If you look at the data through the lens of Y and my paper, you see the following instead

- 'Steppe Maykop' was not Maykop at all, it was post Event 'Poltavka R1b' that had taken on some of the  cultural trappings of the now-vanished Maykop.

-  'Catacomb' near the Caucasus was not  R1a-Z93 as you might have expected; instead it was R1b-V88 of all things. Including two 'late' early 2nd millennium samples. A couple of these samples (perhaps all) were the now very rare M18! It looks possible that a lot of that Balkans R1b was in fact V88.

-  There seem to be a lot more J than G in the Maykop, and even some L.

Will have to rewrite this into my paper. Anyone knows of any other recent papers with steppe or Balkans ancient DNA, I would appreciate.

 https://www.nature.com/articles/s41467-018-08220-8
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Јун 06, 2019, 10:39:04 пре подне
Just came across Wang et al. Fascinating results obscured as usual by a lot of quasi-analysis. Confusing they have several different 'cultures' within the one kurgan.

If you look at the data through the lens of Y and my paper, you see the following instead

- 'Steppe Maykop' was not Maykop at all, it was post Event 'Poltavka R1b' that had taken on some of the  cultural trappings of the now-vanished Maykop.

-  'Catacomb' near the Caucasus was not  R1a-Z93 as you might have expected; instead it was R1b-V88 of all things. Including two 'late' early 2nd millennium samples. A couple of these samples (perhaps all) were the now very rare M18! It looks possible that a lot of that Balkans R1b was in fact V88.

-  There seem to be a lot more J than G in the Maykop, and even some L.

Will have to rewrite this into my paper. Anyone knows of any other recent papers with steppe or Balkans ancient DNA, I would appreciate.

 https://www.nature.com/articles/s41467-018-08220-8

Милане, одакле си ископирао овај коментар?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милан Петровић Јун 06, 2019, 10:41:03 пре подне
Милане, одакле си ископирао овај коментар?
https://www.facebook.com/groups/249055928471080/
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Јун 06, 2019, 11:42:00 пре подне
https://www.facebook.com/groups/249055928471080/

Пошто су ме примили у групу, само да напоменем да је горњи коментар написао неки Joe Flood. Не знам колико је компетентан да коментарише научне радове из области археогенетике. Не судим унапред, само изражавам сумњу.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милан Петровић Јун 06, 2019, 11:57:38 пре подне
Пошто су ме примили у групу, само да напоменем да је горњи коментар написао неки Joe Flood. Не знам колико је компетентан да коментарише научне радове из области археогенетике. Не судим унапред, само изражавам сумњу.
Не знам ни ја колимо је компетентан, али деловало ми је занимљиво, па сам поделио овде да ви погледате.

Nature је свакако озбиљан часопис.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Јун 06, 2019, 12:03:12 поподне
Не знам ни ја колимо је компетентан, али деловало ми је занимљиво, па сам поделио овде да ви погледате.

Nature је свакако озбиљан часопис.

Слажем се за часопис, само не знам ко је тај Џо, с обзиром да оспорава неке ствари које су написане у том чланку. :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Јун 06, 2019, 03:31:01 поподне
Јасно је где је дошло до конфузије у ради и на тој ФБ објави - код филогенетских ознака. Наиме, у раду су нпр. R1b-Z2103 означили као R1b1a2а2 позивајући се на ISOGG стабло из 2016. године, међутим тамо је са том ознаком обележен СНП R1b-V88>M18; то је горепоменути Џо приметио али су у раду, у делу који се бави СНП-овима, јасно назначили да се ради о мутацијама низводно од M269>Z2103, конкретно:

"GW1001.A0101 could be assigned as R1b1a2a2 based on the mutation Z2105: C->A. This
individual also has three upstream mutations for haplogroup R1b1a2: PF6399: C->T, PF6430:
T->A, PF6434: A->G, PF6438: C->T, L150.1: C->T, PF6475: C->A, PF6482: A->G, PF6509:
A->G, CTS11468: T->G.
"

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милан Петровић Јун 06, 2019, 03:40:36 поподне
Онда то нису преци наших R1b?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Јун 06, 2019, 03:46:49 поподне
Онда то нису преци наших R1b?

"Наши R1b" су врло разноврсни и припадају различитим подгранама, често међусобно удаљеним хиљадама година. Z2103 је предачка од BY611>Z2705 коју поседује приличан број тестираних R1b са наших простора, док је V88 данас изузетно ретка (осим донекле у западној Африци), јавља се спорадично по Медитерану, али је изгледа била једна од доминантних хаплогрупа код припадника Културе Лепенског Вира; ниједан од до сада тестираних на нашем Пројекту није припадник те подгране. У сваком случају, Џо је погрешио (заведен лоше цитираним ISOGG стаблом), V88>M18 није пронађена у поменутим тумулима.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милан Петровић Јун 15, 2019, 03:37:03 поподне
https://indo-european.eu/2019/04/magyar-tribes-brought-r1a-z280xz92-and-n1a-l392xb197-to-the-carpathian-basin/

Да ли сте видели ове налазе и теорију? Изгледа да су поглавице биле I2-L621.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Јун 15, 2019, 03:40:27 поподне
https://indo-european.eu/2019/04/magyar-tribes-brought-r1a-z280xz92-and-n1a-l392xb197-to-the-carpathian-basin/

Да ли сте видели ове налазе и теорију? Изгледа да су поглавице биле I2-L621.
Дискутовано је о томе овде (https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=1791.msg112390#msg112390).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милан Петровић Јун 15, 2019, 03:41:31 поподне
Дискутовано је о томе овде (https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=1791.msg112390#msg112390).
Промакло ми је. Хвала!
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Дервента Јун 25, 2019, 01:00:08 пре подне
Интересантан налаз за Динарик Југ у налазима мађарских освајача из Х вијека:

https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2019/04/03/597997.full.pdf (https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2019/04/03/597997.full.pdf)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: ДушанВучко Јун 25, 2019, 01:17:36 пре подне
Интересантан налаз за Динарик Југ у налазима мађарских освајача из Х вијека:

https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2019/04/03/597997.full.pdf (https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2019/04/03/597997.full.pdf)
Мислим да се овде ради о становницима панонског басена у разним периодима:
Y-chromosome haplogroups from Hun, Avar and conquering Hungarian period nomadic people of the
Carpathian Basin

Види се да "динарик" није нађен у периоду од V до VII века, али је зато присутан од деветог века па на даље, од време доласка Мађара...мали је узорак у питању, неколико локалитета, па ови "динарици" који су нађени , верујем да су затечени од стране Мађара...јер у наслову пише "о становницима Карпатског Басена из периода Хуна , Авара и мађарских освајача" (а можемо да претпостављамо који узорци су у вези са Хунима, Аварима и Мађарима, а који са становницима Басена који су их затекли)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милан Петровић Јун 25, 2019, 01:22:11 пре подне
Претпостављам да су њих двојица поглавице Склавина који су се борили на страни Мађара.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: ДушанВучко Јун 25, 2019, 01:24:49 пре подне
Претпостављам да су њих двојица поглавице Склавина који су се борили на страни Мађара.
Није немогуће да су се неки "динарици" придружили Мађарима приликом  доласка у Панонију (то ми је само "шпекулација", јер се долазак десио брзо, ипак верујем да су ови налази "динарика" од "старинаца" на тим локалитетима, али можда је и прва опција могућа у неким околностима)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: ДушанВучко Јун 25, 2019, 01:35:03 пре подне
Једно је сигурно, да ова студија показује везу панонских "динарика" и Мађара од самог њиховог доласка у Панонију и присутност "динарика" на истраживаним локалитетима, која датира из периода доласка Мађара...једино што је спорно је то што је словенско присуство у панонском басену било и пре доласка Мађара (тако да је немогуће да се "динарик" у Панонији јавља тек са доласком Мађара)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милан Петровић Јун 25, 2019, 01:48:16 пре подне
Значи ово је најстарији Динарик пронађен овако јужно?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: ДушанВучко Јун 25, 2019, 01:54:22 пре подне
Значи ово је најстарији Динарик пронађен овако јужно?
Није, најстарија најјужнија  је она"динарик" грана из Грчке, око 200 ПНЕ  ;) (  I2-Y18331) ...а и ми смо забележени на Балкану пре ових панонских налаза из деветог века (иако су по свој логици "динарици" боравили у Панонији и пре доласка Мађара)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милан Петровић Јун 25, 2019, 01:59:34 пре подне
Није, најстарија и најјужнија  је она"динарик" грана из Грчке, око 200 ПНЕ  ;) (  I2-Y18331) ...а и ми смо забележени на Балкану пре ових панонских налаза из деветог века (иако су по свој логици "динарици" боравили у Панонији и пре доласка Мађара)
Онда су Мађари могли да их "покупе" било где од Понта до Паноније.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: ДушанВучко Јун 25, 2019, 02:01:42 пре подне
Онда су Мађари могли да их "покупе" било где од Понта до Паноније.
Или су их "покупили" или су их "затекли"у Панонији (верујем да се ради о локалном становништву са тих налаза)...били су заједно и ова студија је доказ о стапању словенског и мађарског живља од самог њиховог доласка
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милан Петровић Јун 25, 2019, 02:09:51 пре подне
Да ли је могуће утврдити и подграну на тако старим узорцима?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Петровић Мађер Јун 25, 2019, 08:13:51 пре подне
Мађарска, једна од територија са можда највише обрађених археогенетских узорака.
https://med-k-rouissi.maps.arcgis.com/apps/webappviewer/index.html?id=362af77c6ad145c8a4a5026a9177b945&extent=-2307057.137%2C549015.0046%2C16419403.2966%2C10802583.7269%2C102100&fbclid=IwAR27PHEaTfLOJqqJ63pemfQyuOs6clQwWRdl4oKu2VD5yqR618koxUOeGh4

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Јул 08, 2019, 01:49:08 поподне
Археогенетски налаз једне од основних подграна E-V22, V3262, у пећини у Танзанији, датован од 8. до 5. века п.н.е:

"Ted Kandell је са корисником Ashraf Taqatqa и још 9 особа.
Визуелни приповедач · 6. јул у 21:29
For all you E-V22 and E-M78 people out there, here is the analysis of I13980 from the Prendergast (2019) Ancient East African Herders study, dated to 740-490 BCE from Gishimangeda Cave in Tanzania,:
He's E-V3262, a basal clade directly under E-V22. His mtDNA is HV1b1 which is modal among Yemeni Jews. HV1b1a and HV1b1b however are found in both Somalia and Yemen.
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1kOVrrUKNmidekjxqhXK557aZ_DG836e9lICUzuZ-MkM/edit?usp=sharing

https://yfull.com/tree/E-V3262/
"
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Јул 21, 2019, 08:13:53 пре подне
Први случај успешног изоловања Y-ДНК хаплогрупе из неандерталских узорака:

"Ted Kandell је поделио везу у групи: Ancient DNA.
6 ч. ·
A Neanderthal Y!
(The correct branch for each SNP is listed, not the haplogroup designation as of right now.)
This is what I get for derived (positive) basal Y SNPs:
The following SNPs are derived (positive) in both Neanderthals and modern humans, but ancestral (negative) in bonobos, chimpanzees, and gorillas.
They define an earlier "Homo sapiens super-haplogroup":
A21544 (NEANDERTHAL + AMH)                           
A8834   (NEANDERTHAL + AMH)                              
These SNPs "flip" from being A0-T and A00 SNPs to the other branch. (The correct branch is listed here):
A0-T YP3663;FGC27793         
A0-T FGC25825                        
A0-T YP3204;FGC26862         
A0-T FGC26773;V6456                  
A0-T FGC26585;YP3043;V5900   
A0-T FGC27434;YP3520;V7628   
A0-T? Z9140
A00 FGC26961;YP2043         
A00 YP2254                             
A00 YP2077;FGC27094
These SNPs are the "Neanderthal-only" haplogroup, which is a sister clade to entire modern human Y tree:                          
A21642 (NEANDERTHAL)           
A21601 (NEANDERTHAL)         
A21586 (NEANDERTHAL)         
A21678 (NEANDERTHAL)   
A21639 (NEANDERTHAL)
This is what I get for ancestral (negative) basal Y SNPs. Again, the correct haplogroup is listed:
A00 YP2518;FGC25438                  
A00 YP2708;V2243;FGC25755   
A00 YP2781;FGC25876                  
A00 FGC25898;YP2790                  
A00 FGC26401                        
A00 V2858;YP2962;A2764          
A00 YP2968;FGC26450;V2888   
A00 FGC26763;YP3141                  
A00 A4985;YP3292                  
A00 YP3334;FGC27109;V3453   
A00 FGC27166;YP3368;V3699   
A00 V3736;L1139                          
A00 FGC27213;V3874                  
A00 A2939;YP3604                  
A00 A2956;YP3649                  
A00 FGC27906;YP3728                  
A00 FGC25380                          
A00 FGC25594                          
A00 FGC25618;V1567;YP2614   
A00 YP2765;FGC25847                  
A00 YP2910;V2548;FGC26335
A00 FGC26481;YP2990
A00 FGC26599
A00 YP3220;FGC26890
A00 L1148
A00 FGC27751;YP3642
A00 V1523;YP2604;FGC25592
A00 FGC25930;YP2803
A00 FGC26404;YP2949
A00 FGC26747;YP3125
A00 A2828
A00 V3481;YP3336;FGC27114
A00 FGC27176
A00 FGC27195;YP3386
A00 YP3510;FGC27422
A00 A2948;YP3615
A00 FGC27833;YP3688
A00 A3647
A00 FGC25404;YP2496
A00 FGC25466;YP2530
A00 ZS2646
A00 FGC26367;YP2930;V2627
A00 FGC26376
A00 FGC26468;YP2983;V29560
A00 FGC26512;YP3006
A00 FGC26622
A00 FGC26693;YP3098
A00 YP3294;FGC27028
A00 FGC27418;YP3506
A00 FGC27708
A00 FGC27867;YP3708
A00 Y12947;Z7152
A00 Z21469;YP2975;FGC26459;V2922
A00 Z8062;S16565
A00 A3886
A00 A3646
A00 A3780
A00 FGC26975;V6928 
A00 FGC27430;YP3517;V7622
A00 FGC25928
A00 L1115
A00 A2684
A00 FGC26673;YP3087;V6114
A00 FGC26750;YP3128;V6352
A00 YP3229;FGC26915;V6798
A00 FGC26008;V5185   
A00 YP2834;FGC26191;V5346
A00 FGC26922;YP3232;V6814
A00 FGC27008;YP3278;V7039
A00 YP3303;FGC27052;V7147
A00 A3885   
A00 FGC27584;V7830   
A0-T YP1829                                  
A0-T FGC25754;YP1834                  
A0-T YP2146;FGC27375                  
A0-T PF547                                  
A0-T FGC25471;YP1762                  
A0-T YP1798;FGC25596                  
A0-T FGC25943;YP1872                  
A0-T FGC26476;YP1939                  
A0-T YP2196;A2943                  
A0-T FGC28120                           
A Neanderthal sub-haplogroup only found in one sample but not others:
A21365   (MEZMAISKAYA 2 NEANDERTHAL)
A21432   (MEZMAISKAYA 2 NEANDERTHAL)
A21383   (MEZMAISKAYA 2 NEANDERTHAL)
A21473   (MEZMAISKAYA 2 NEANDERTHAL)
A21616   (MEZMAISKAYA 2 NEANDERTHAL)
http://cdna.eva.mpg.de/neandertal/Hohlenstein-Stadel/BAM/hg19/
"
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Јул 21, 2019, 10:49:32 поподне
Први случај успешног изоловања Y-ДНК хаплогрупе из неандерталских узорака:

"Ted Kandell је поделио везу у групи: Ancient DNA.
6 ч. ·
A Neanderthal Y!
(The correct branch for each SNP is listed, not the haplogroup designation as of right now.)
This is what I get for derived (positive) basal Y SNPs:
The following SNPs are derived (positive) in both Neanderthals and modern humans, but ancestral (negative) in bonobos, chimpanzees, and gorillas.
They define an earlier "Homo sapiens super-haplogroup":
A21544 (NEANDERTHAL + AMH)                           
A8834   (NEANDERTHAL + AMH)                              

На ISOGG Browser који уређује Томас Кран, оба ова СНП-а су старије гране. Видим да је Тед зато променио пост.

http://ybrowse.org/gb2/gbrowse/chrY/?name=chrY%3A6919653..6919653

https://www.google.com/url?sa=t&source=web&rct=j&url=https://isogg.org/tree/2019HaplogroupA.xlsx&ved=2ahUKEwjM2uyn7MbjAhVqpYsKHYtUCfMQFjABegQIBxAG&usg=AOvVaw2rN4q-SyCsfcCpk-lLdF6L

А8834 је вероватно СНП Денисоваца, док је нејасна ситуација што се тиче Неандерталца+анатомски модерног човека.

A21544 је СНП "раног" Неандерталца из Мезмајскаја 2 и SPY 94A, али не и "касног" Неандерталца из Хохленштајна, који се и аутосомално разликују.

Мене буни што нпр. мени на Yfull-у, иако се не користе ови снпови у анализи, показују да сам позитиван на оба ова снпа.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: ДушанВучко Јул 21, 2019, 11:30:02 поподне
Мене буни што нпр. мени на Yfull-у, иако се не користе ови снпови у анализи, показују да сам позитиван на оба ова снпа.
Колика је старост тих СНПова? То би значило да су сви I2 позитивни на те СНПове? Ако је по времену боравка хаплогрупе I у Европи и времену изумирања неандерталаца, период заједничког боравка у Европи неколико хиљада година, али буни што је један СНП од неандерталца, а други од денисовца)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Јул 21, 2019, 11:48:27 поподне
Колика је старост тих СНПова? То би значило да су сви I2 позитивни на те СНПове? Ако је по времену боравка хаплогрупе I у Европи и времену изумирања неандерталаца, период заједничког боравка у Европи неколико хиљада година, али буни што је један СНП од неандерталца, а други од денисовца)

Тед ми није објасни зашто мисли да нисмо позитвни на ова два снпа, али тврди да ипак нисмо.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Јул 29, 2019, 01:37:17 поподне
Коментари на нови рад о генетици Тохараца (говорника изоловане индо-европске гране, тзв. тохарске, који су живели на подручју данашње Ујгурије-Синкјанга):

R1b1a1a2-M269 Tocharians?
No, R1b2-PH155 Huns!
The complete set of aligned Y SNP calls from the Tianshan individuals:
https://docs.google.com/spreadsheets/d/15ecXQf2gRYNfMELt4H5lYuN5G9NXXIWTAhscqvfOPR0/edit?usp=sharing
• M15-2: R-PH200
https://yfull.com/tree/R-PH200/
• MO12: R-PH155
 https://yfull.com/tree/R-PH155/
• M15-1: Q-M120
https://yfull.com/tree/Q-M120/
• X3:       Q-F5400
https://yfull.com/tree/Q-F5400/
R-PH200 under R-PH155 was found in a supposed "Gepid" (VIM_2, ERS2374341 on the YFull tree) from Serbia from the 6th century CE with an artificially deformed skull who was autosomally at least 20% East Asian, and therefore likely a Hun or with a Hun father, and also a Tian Shan Hun from Uzbekistan from about the year 260 CE. Both Q-M120 and Q-F5400 are East Asian.
Autosomally, these 4 individuals from China are substantially East Asian.
https://eurogenes.blogspot.com/2019/07/they-mixed-up-tocharians-with-huns.html
This raises some interesting questions about the origins of this earliest branch of R1b, which doesn't appear to have migrated westward from the R* homeland until historic period. The first westward movement of R1b appears to have taken place after the LGM, not before 17,100 ybp, and likely later after the Bolling Interstadial ("the End of the Ice Age") at 14,700 ybp.
https://yfull.com/tree/R1b/

Изгледа да се овде ипак ради о "Прото-Хунима", а не о Тохарцима.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Јул 31, 2019, 04:17:49 поподне
Преци савремених људи су се, поред неандерталаца и денисованаца, мешали и са две још увек неидентификоване врсте хоминина (провизорно назване Extinct Hominin 1 - EH1 и Extinct Hominin 2 - EH2); прва врста је живела негде на подручју јужне Азије а друга на острву Флорес у Индонезији. Иако су познати остаци Homo floresiensis-a (тзв. "хобита", надимка који је добио због минијатурног раста) са острва Флорес, није разјашњено да ли генетски траг EH2 потиче од ове или неке друге врсте хоминина са тог острва.

Humans Interbred with Four Extinct Hominin Species, Research Finds (http://www.sci-news.com/othersciences/anthropology/humans-hominin-introgression-07438.html)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Србин Август 05, 2019, 08:49:49 поподне
Новости са Антрогенике (https://anthrogenica.com/showthread.php?8066-Genetic-Genealogy-amp-Ancient-DNA-in-the-News-(DISCUSSION-ONLY)&s=b3a618bbd8d2bbc945cca5f48584fa9a&p=588603&viewfull=1#post588603).

У питању је резултат БАМ фајла (https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB32566) једног од узорака из необјављене студије са узорцима из околине Рима.

Резултат је I-CTS8799 (https://www.yfull.com/tree/I-M436/), еквивалентан М436.

Ради се о централноапенинском локалитету Grotta Continenza (https://www.google.com/maps/place/67059+Trasacco,+Province+of+L'Aquila,+Italy/@41.9579259,13.2320278,222342m/data=!3m1!1e3!4m5!3m4!1s0x132fe271e5a3d929:0x70005c9ff8779f2d!8m2!3d41.9600762!4d13.536615) недалеко од места Trasacco, L'Aquila источно од Рима.

Остаци су из доба Мeзолита, датирани на 10100-9816 calBCE.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Сол Август 08, 2019, 11:08:40 поподне
зна ли неко нешто подробније о налазу I2a-M26 у граду Владимиру? (Known Y-DNA haplogroups from different Old Slavic burials ; Vladimir (1100–1220) I2a-M26 (Sikora, 2017))
 
HAPLOGROUP ANALYSIS FOR A MEDIEVAL RUSSIAN BURIAL OF 16TH–17TH CENTURES IN RADONEZH (MOSCOW AREA)
https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/15445/1/09-Mustafin.pdf
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Август 08, 2019, 11:29:12 поподне
зна ли неко нешто подробније о налазу I2a-M26 у граду Владимиру? (Known Y-DNA haplogroups from different Old Slavic burials ; Vladimir (1100–1220) I2a-M26 (Sikora, 2017))
 
HAPLOGROUP ANALYSIS FOR A MEDIEVAL RUSSIAN BURIAL OF 16TH–17TH CENTURES IN RADONEZH (MOSCOW AREA)
https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/15445/1/09-Mustafin.pdf

Искрено први пут видим овај рад. Веома занимљиво откриће, уколико није било контаминације. :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Септембар 20, 2019, 12:20:35 поподне
Нови метод анализе гена преко кога је могуће предвидети изглед одређене индивидуе је употребљен ради реконструкције изгледа денисованске девојчице из епонимне пећине Денисове. Судећи по њеном изгледу, денисованци су се разликовали и од неандерталаца и од модерних људи, најзначајније разлике су шира вилица и лице:

https://www.sciencemag.org/news/2019/09/ancient-dna-puts-face-mysterious-denisovans-extinct-cousins-neanderthals?fbclid=IwAR1oxVqiklDutOF-FOdPy-QB__lAYsMtxcomhZmpXdk4Mi4qFrnitnLXfNQ

(https://www.sciencemag.org/sites/default/files/styles/inline__699w__no_aspect/public/ca_0920NID_Denisovan_Reconstruction_online.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Септембар 20, 2019, 12:31:49 поподне
Нови метод анализе гена преко кога је могуће предвидети изглед одређене индивидуе је употребљен ради реконструкције изгледа денисованске девојчице из епонимне пећине Денисове. Судећи по њеном изгледу, денисованци су се разликовали и од неандерталаца и од модерних људи, најзначајније разлике су шира вилица и лице:

https://www.sciencemag.org/news/2019/09/ancient-dna-puts-face-mysterious-denisovans-extinct-cousins-neanderthals?fbclid=IwAR1oxVqiklDutOF-FOdPy-QB__lAYsMtxcomhZmpXdk4Mi4qFrnitnLXfNQ

(https://www.sciencemag.org/sites/default/files/styles/inline__699w__no_aspect/public/ca_0920NID_Denisovan_Reconstruction_online.jpg)

А косе очи? :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Септембар 20, 2019, 01:24:39 поподне
А косе очи? :)

То и ја помислих, али ни речи о томе.  ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Зрно Септембар 20, 2019, 02:00:39 поподне
Нешто као Индијанци по изгледу.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Септембар 20, 2019, 08:33:18 поподне
То и ја помислих, али ни речи о томе.  ;)

Овде је мало боље... и очи су косе.

(https://www.nationalgeographic.rs//files/images/2019/09/denisovan_aps_EPA_Maayan_Harel__Handout_221496924.jpg)

https://www.nationalgeographic.rs/vesti/14255-naucnici-rekonstruisali-skelet-praistorijskog-coveka-denisovana.html
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Полић Септембар 21, 2019, 03:01:38 поподне
Овде је мало боље... и очи су косе.

(https://www.nationalgeographic.rs//files/images/2019/09/denisovan_aps_EPA_Maayan_Harel__Handout_221496924.jpg)

https://www.nationalgeographic.rs/vesti/14255-naucnici-rekonstruisali-skelet-praistorijskog-coveka-denisovana.html

Очи јесу косо постављене, али је питање како је изгледао горњи очни капак код њих, и да ли су савремени Азијати ту особину спуштеног горњег капка наследили од Денисоваца. Ген је вероватно идентификован код савремених популација који доводи до формирања тог карактеристичног набора горњег очног капка, али да ли је и код Денисоваца тако?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: сɣнце Септембар 21, 2019, 04:19:31 поподне
Очи јесу косо постављене, али је питање како је изгледао горњи очни капак код њих, и да ли су савремени Азијати ту особину спуштеног горњег капка наследили од Денисоваца. Ген је вероватно идентификован код савремених популација који доводи до формирања тог карактеристичног набора горњег очног капка, али да ли је и код Денисоваца тако?

Највиши одстотак, чак до 5% денисовскога генома налази се у Тибећана, исконих становника Аустралије и Полинежана, а не Хан или Монгола.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: filipi Септембар 22, 2019, 12:00:36 пре подне
Nas rodjak is Loschboura. Lundiak u posjeti luksemburskom muzeju.

https://lundiak.wordpress.com/2019/09/13/how-i-met-loschbour-man-my-8000-y-o-ydna-cousin/
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Октобар 13, 2019, 09:06:29 пре подне
Ново занимљиво откриће - издвојене су Y-ДНК и мтДНК Египћанина који је живео у временском распону 1991-1802. п.н.е. У питању је Y-ДНК хаплогрупа H2-P96, прецизније H2-Y21618*. H2-P96, која је данас врло ретка, је била прилично присутна међу неолитским земљорадницима Блиског истока, Анадолије и Европе.

"‎Ted Kandell‎ за YFull.com
7 ч. ·
Everyone, meet Nakht-Ankh from Shashotep, Egypt. He lived sometime between 1991 BCE – 1802 BCE. He was the son of the Lady Khnum-Aa, and the older brother of Khnum-Nakht.
He's Y-DNA H-Y21618* and mtDNA M1a1* + G8251A, G16145A.
He's the earliest person who we can name in all of human history whose Y and mtDNA haplogroups we can identify.
Nakht-Ankh was a contemporary of the Bell Beakers in Britain, the Minoans, and the Indus Valley Civilization in South Asia. He lived 100 years before Hammurabi of Babylon.
I reanalyzed his Y SNPs using the YFull haplogroups and he's derived for 2 F* SNPs, Z19004 and Z18865 in H-P96, and BY44412 in H-Y21618. He's ancestral for G*, IJ* and K* SNPs and for Z19117 in H-Y19962 which is the immediate subgroup of H-Y21618.
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1YDssYjnyLl-e6KrPIYnQAOQpxUTmemePj3_U134h1uc/edit?pli=1#gid=0
Haplogroup H2-P96 may be a very surprising result for Egypt. It's never been seen among Egyptians today. H2 is closely associated with the Northwest Anatolian and European Neolithic. However, H2 was also found in a Pre-Pottery Neolithic C Levantine individual from about 9000 ybp. It seems like some Levantine Neolithic and Chalcolithic people made it to Egypt at the start of Egyptian civilization. Since he's ancestral for H-Y19962, he's not in the European subclade of H-P96.
The study wasn't able to identify his or his brother Khnum-Nakht's Y haplogroups, but they were able to get their mtDNA haplotype, proving that they were at least half-brothers.
http://xn--c1acc6aafa1c.xn--p1ai/wp-content/uploads/Drosou-ea-18-DNA-of-Egyptian-mummy.pdf
"
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: barbarylion Октобар 13, 2019, 11:57:36 поподне
Na sajtu mytrueancestry.com su mi nasli poklapanja sa uzorkom koji imaju za kijevskog rusa( I2a1b)..
Konkretno oni to smatraju rodbinskom vezom, međutim meni se itekako čini da je to preuveličano, obzirom da gedmec nakon 3cm ne prepoznaje slicnost...Teoretski može biti neka prastara veza..Zna li neko nesto vise što se tice I2a1b kod kijevskih rusa?  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: barbarylion Октобар 14, 2019, 11:25:44 пре подне
Испада да је коришћени узорак црногорског становништва аутосомално мало сроднији Сунгирцу но узорак становништва Србије.
Хаплогрупе и нису толико битне...Овде је реч о идентичним деловима ДНК. То би значило да Сунгирац дели више заједничких предака са становништвом Црне Горе, него са становништвом Србије...Уопште, као што и аутор примећује, присуство три јужнословенска народа међу првих десет изгледа необично...
Hvala za uput ka temi :)
Upravo na ovaj uzorak sam mislio u gore pomenutom postu.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: barbarylion Октобар 15, 2019, 01:41:44 поподне
(https://i.ibb.co/jz8vR2k/20191015-133320.jpg)

Nisam siguran šta bi ovo trebalo konkretno da znaci, moguće da se radi o tome da su mi ove 3 populacije najsličnije.
Ovo u Mađarskoj bi trebalo da su Gali? Interesantno sto je ovo mapa za medieval age
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: barbarylion Октобар 15, 2019, 03:14:51 поподне
Ovo isto može biti interesantno
(https://i.ibb.co/GVgFmx5/20191015-150730.jpg)

(https://i.ibb.co/JncsCpP/20191015-151116.jpg)

Ovde imam i tračane i Ilire, ali cini mi se i nešto sa prostora Češke. Msm da većina Srba dobija slične rezultate.
(https://i.ibb.co/hYrqy7w/20191015-151206.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милан Петровић Новембар 29, 2019, 02:38:48 пре подне
Да ли смо знали ово?

https://blog.nationalgeographic.org/2013/10/30/unveiling-the-halloween-monster-dna-in-everyone/?fbclid=IwAR2XxG73YRdqSNm3RJG-Nj9CpJbtzTCQyeQwGqDLXXbhfOvNLAVMFF0ufFU

o understand Count Dracula’s DNA we travel to Transylvania, in modern Rumania. Literary historians have suggested that fictional Dracula is based on the real Vlad the Impaler, a historical figure from the 15th century who lived in Wallachia just south of Transylvania. Anthropological studies on Wallachian and modern Rumanian populations, including Genographic’s own 2012 study into Wallachian kings and their genetic lineages, suggest that haplogroup I2 is the most common paternal group there (~40%). Throughout Eastern Europe, haplogroup H dominates the maternal lineages. Dracula was likeliest paternal haplogroup I2 and maternal haplogroup H. With so many potential relatives the undead count may live-on yet.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: ДушанВучко Новембар 29, 2019, 03:11:00 пре подне
Да ли смо знали ово?

https://blog.nationalgeographic.org/2013/10/30/unveiling-the-halloween-monster-dna-in-everyone/?fbclid=IwAR2XxG73YRdqSNm3RJG-Nj9CpJbtzTCQyeQwGqDLXXbhfOvNLAVMFF0ufFU

o understand Count Dracula’s DNA we travel to Transylvania, in modern Rumania. Literary historians have suggested that fictional Dracula is based on the real Vlad the Impaler, a historical figure from the 15th century who lived in Wallachia just south of Transylvania. Anthropological studies on Wallachian and modern Rumanian populations, including Genographic’s own 2012 study into Wallachian kings and their genetic lineages, suggest that haplogroup I2 is the most common paternal group there (~40%). Throughout Eastern Europe, haplogroup H dominates the maternal lineages. Dracula was likeliest paternal haplogroup I2 and maternal haplogroup H. With so many potential relatives the undead count may live-on yet.
Влашки владари су имали титулу "Војвода", а резултат ако је такав , и јесте изненађење, а и није :)
(https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/2e/Dinastia-basarabilor_43182400.jpg/800px-Dinastia-basarabilor_43182400.jpg)
https://en.wikipedia.org/wiki/House_of_Basarab
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милан Петровић Новембар 29, 2019, 03:18:36 пре подне
Волео бих да видим мало прецизнији резултат прво, али као што кажеш, не би било велико изненађење.  :D
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милан Петровић Новембар 29, 2019, 03:33:29 пре подне
Ево студије о Басарабима:

https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0041803
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: filipi Новембар 29, 2019, 11:44:29 пре подне
Да ли смо знали ово?

https://blog.nationalgeographic.org/2013/10/30/unveiling-the-halloween-monster-dna-in-everyone/?fbclid=IwAR2XxG73YRdqSNm3RJG-Nj9CpJbtzTCQyeQwGqDLXXbhfOvNLAVMFF0ufFU

o understand Count Dracula’s DNA we travel to Transylvania, in modern Rumania. Literary historians have suggested that fictional Dracula is based on the real Vlad the Impaler, a historical figure from the 15th century who lived in Wallachia just south of Transylvania. Anthropological studies on Wallachian and modern Rumanian populations, including Genographic’s own 2012 study into Wallachian kings and their genetic lineages, suggest that haplogroup I2 is the most common paternal group there (~40%). Throughout Eastern Europe, haplogroup H dominates the maternal lineages. Dracula was likeliest paternal haplogroup I2 and maternal haplogroup H. With so many potential relatives the undead count may live-on yet.
To je iz 2013 mislim.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Новембар 29, 2019, 12:09:04 поподне
Колико се сећам, на основу студије "Y-Chromosome Analysis in Individuals Bearing the Basarab Name of the First Dynasty of Wallachian Kings", закључак је да је Влад Цепеш највероватније припадао J2b-M241 или E-V13.

"The Basarab sample clusters into 11 lineages (Table 2), with six main lineages comprising 82.8% of the samples. Some lineages such as J-M241 and E-V13 are over-represented in the Basarab compared to the general Romanians."

https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0041803
https://www.familytreedna.com/groups/m-241/about/background
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bulajić Новембар 29, 2019, 12:55:31 поподне
Колико се сећам, на основу студије "Y-Chromosome Analysis in Individuals Bearing the Basarab Name of the First Dynasty of Wallachian Kings", закључак је да је Влад Цепеш највероватније припадао J2b-M241 или E-V13.

"The Basarab sample clusters into 11 lineages (Table 2), with six main lineages comprising 82.8% of the samples. Some lineages such as J-M241 and E-V13 are over-represented in the Basarab compared to the general Romanians."

https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0041803
https://www.familytreedna.com/groups/m-241/about/background

Ako je E-V13 onda mi je rod  ;D ;D ;D
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Новембар 30, 2019, 02:04:15 поподне
Иначе, судећи по анализама bam фајлова по страним форумима Y-ДНК слика није уопште тако компактна како су закључили у студији. Рецимо, Владимир Семаргл са Молгена је написао да је scy197 уствари E1b-V13 a да је scy301 - I2-Y7219 (https://www.yfull.com/tree/I-Y7219/). Такође, cim357, tem002, tem003  по свему судећи R1b-.


scy197* Glinoe 2885 - 2632 BCE
Према најновијим сазнањима овај узорак припада грани E-V13>CTS5856>BY3880>FGC44169 (https://www.yfull.com/tree/E-FGC44169/).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Јануар 28, 2020, 12:31:00 поподне
На једном страном форуму је постован teaser из рада Дејвида Рајха који тек треба да буде објављен:

Цитат
I see 75 samples, one of which is previously published Hun/Gepid sample Vim2b from Viminacium, so 74 new samples. Of those, 52 are from Viminacium (four necropoli: Pirivoj (100-400 AD) - 19; Rit (0-300 AD) - 13; Više Grobalja (0-300 AD) - 10 and Pećine (0-300 AD) - 10) and 17 from Timacum Minus (two necropoli: Slog (300-500 AD) - 11 and Kuline (400-700 AD) - 6). There are also 1 Roman and 1 Late Medieval sample from Lepenski Vir, 2 Gepid samples (300-500 AD) from Mediana (near Niš/Naisos) and 1 Medieval (850-950 AD) sample from Gomolava (this one belongs to I2-Din, so he's most likely Slavic).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милош Јануар 28, 2020, 02:02:45 поподне
На једном страном форуму је постован teaser из рада Дејвида Рајха који тек треба да буде објављен:

Ово ће бити јако добро. Да ли се зна када ће рад бити публикован?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bane Јануар 28, 2020, 02:45:00 поподне
Ово ће бити јако добро. Да ли се зна када ће рад бити публикован?

Мени није познато.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Јануар 28, 2020, 03:12:55 поподне
Ово ће бити јако добро. Да ли се зна када ће рад бити публикован?
Требало би током године.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Фебруар 04, 2020, 03:19:25 поподне
Нови рад археолога Александре Жегарац, изашао у Гласнику Српског археолошког друштва бр. 35, "ДРЕВНA ДНК У АРХЕОЛОГИЈИ: ОД АРХЕОЛОШКИХ ИСКОПАВАЊА ДО ЛАБОРАТОРИЈСКИХ АНАЛИЗА". Издвојио бих апстракт рада:

"Са развојем технологије, анализе древне ДНК постале су саставни део истраживања у археологији, допринoсећи сазнањима везаним за историју популација. Међутим, анализе древне ДНК представљају изазов из неколико разлога. Деструктивне су и скупе, а осим тога, у археолошком узорку је присутна веома мала количина деградоване и хемијски измењене ендогене ДНК. Неповољни средински услови у којима је материјал пронађен и складиштен (попут високих температура и влаге) подстичу даљу деградацију органског материјала. Додатни проблем је и могућа контаминација савременом ДНК, до које може доћи у било ком кораку анализа. Оптимално и пажљивије руковање узорцима приликом ископавања и складиштења истог, доводи до повећања количине ендогене ДНК у узорку и смањивања цене секвенцирања. Показано је да се највећи принос древне ДНК постиже издвајањем из калцификованог материјала, а посебно унутрашњег дела петрозне кости. Претварање костију у прах обавља се у лабораторијама специјално посвећеним овим анализама, у којима су предузете одређене мере и протоколи како би се контамина- ција спречила. У зависности од истраживачког питања и након провере очуваности ДНК, доноси се одлука да ли ће се секвенцирати цео геном и на којој дубини или само делови генома од интереса. У случају недоступности једарне ДНК, митохондријална ДНК као и полиморфни генетички маркери на Y хромозому могу бити информативни при одређивању матералних, тј. патералних линија, али за разлику од једарне ДНК не могу пружити потпуну информацију о демографским променама и популационој динамици. Међутим, како бисмо стварно разумели прошлост, неопходна је добра комуникација и размена информација између археолога, антрополога, генетичара и лингвиста."

Такође и последњи пасус рада:

"Међутим, потпунија слика о прошлости може се добити једино кроз caрадњу стручњака из различитих области, пре свега археолога, антрополога, генетичара и лингвиста. То у првом реду подразумева кооперацију, добру комуникацију и размену информација у сваком кораку истраживања, од постављања истраживачих питања до интерпретације резултата. Ово је кључно за разумевање прошлости с обзиром на то да су биологија и култура међусобно зависни, те их стога никако не би требало одвајати приликом истраживања живота давно несталих заједница."

На скупу Српског археолошког друштва који је 2019. године одржан у Неготину, од 30. маја до 01. јуна, је горепоменута Жегарац заједно са археологом Маријом Кречковић имала следеће излагање: "ДРЕВНА ДНК АНАЛИЗА ИНДИВИДУА САХРАЊЕНИХ НА РАНОБРОНЗАНОДОПСКОЈ НЕКРОПОЛИ У МОКРИНУ (2100–1800. ГОДИНА ПРЕ НОВЕ ЕРЕ)". Било би добро некако доћи до резултата ових истраживања и видети које врсте испитивања су рађене (аутосомална, Y-ДНК, мтДНК).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Фебруар 04, 2020, 08:59:43 поподне
Нови рад археолога Александре Жегарац, изашао у Гласнику Српског археолошког друштва бр. 35, "ДРЕВНA ДНК У АРХЕОЛОГИЈИ: ОД АРХЕОЛОШКИХ ИСКОПАВАЊА ДО ЛАБОРАТОРИЈСКИХ АНАЛИЗА". Издвојио бих апстракт рада:

Било би добро некако доћи до резултата ових истраживања и видети које врсте испитивања су рађене (аутосомална, Y-ДНК, мтДНК).

Резултати нису још увек нигде званично објављени, али одлична вест је да је рађено секвенцирање целог генома у Немачкој:

Цитат
Александра Жегарац је задужена за анализе сродства и еволуције социјалне неједнакости кроз студије древне ДНК на ранобронзанодопској некрополи у Мокрину, Србија. Конкретно њен рад подразумева изолацију и секвенцирање целог генома индивидуа из Мокрина употребом NGS методе (Илумина платформа), на Одељењу за антропологију, “Јоханнес Гутенберг” Универзитета у Мајнцу, Немачка, као и биоинформатичку обраду секвенцираних генома и основне анализе популационе генетике.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Фебруар 04, 2020, 10:01:57 поподне
Александра Жегарац је задужена за анализе сродства и еволуције социјалне неједнакости кроз студије древне ДНК на ранобронзанодопској некрополи у Мокрину, Србија. Конкретно њен рад подразумева изолацију и секвенцирање целог генома индивидуа из Мокрина употребом NGS методе (Илумина платформа), на Одељењу за антропологију, “Јоханнес Гутенберг” Универзитета у Мајнцу, Немачка, као и биоинформатичку обраду секвенцираних генома и основне анализе популационе генетике.

Како се аналзира социјална неједнакост кроз студије древне ДНК?!  :o
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: сɣнце Фебруар 05, 2020, 11:56:53 пре подне
Како се аналзира социјална неједнакост кроз студије древне ДНК?!  :o

Вјеројатно је ријеч о стојишту мужска и женска унутар дружства. 
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Atlantische Фебруар 05, 2020, 12:21:19 поподне
Вјеројатно је ријеч о стојишту мужска и женска унутар дружства.
То ми је јасно. Поента је да узевши у обзир неке друге ствари које су жестоко форсиране у данашње време (родне студије, феминизам и сл, а које се пласирају и кроз неке археолошке радове, нпр. матријархат у неолиту) не изгледа немогуће да за исту ствар користе и анализе древне днк. Ово притом не говорим сматрајући то неком “теоријом завере”, већ стањем на терену.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: сɣнце Фебруар 05, 2020, 01:38:29 поподне
То ми је јасно. Поента је да узевши у обзир неке друге ствари које су жестоко форсиране у данашње време (родне студије, феминизам и сл, а које се пласирају и кроз неке археолошке радове, нпр. матријархат у неолиту) не изгледа немогуће да за исту ствар користе и анализе древне днк. Ово притом не говорим сматрајући то неком “теоријом завере”, већ стањем на терену.
То и слутим. Читах крајем прошле године један такав чланак у Њемачкој у којем су на основу археологије закључили,  да је управо у бринзаном добу почело тзв.  угњетење жена.
Чињеница,  да је то текло руку у руку с првом појавом разликовања сталежа,  робовања,  угњетења свих родова људства је прешутано; што је дало нову храну знаш-кому за знаш-што.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: сɣнце Фебруар 06, 2020, 09:04:07 пре подне
То ми је јасно. Поента је да узевши у обзир неке друге ствари које су жестоко форсиране у данашње време (родне студије, феминизам и сл, а које се пласирају и кроз неке археолошке радове, нпр. матријархат у неолиту) не изгледа немогуће да за исту ствар користе и анализе древне днк. Ово притом не говорим сматрајући то неком “теоријом завере”, већ стањем на терену.
https://www.br.de/nachrichten/wissen/bronzezeit-vor-4000-jahren-lebte-arm-und-reich-unter-einem-dach,ReJiBhI (https://www.br.de/nachrichten/wissen/bronzezeit-vor-4000-jahren-lebte-arm-und-reich-unter-einem-dach,ReJiBhI)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Фебруар 13, 2020, 06:21:18 поподне
Трагови до сад непознате врсте хоминина, која се од "главне гране" одвојила пре одвајања предака неандерталаца и модерних људи, су пронађени у ДНК структури савремених људи пореклом из западне Африке. Људска еволутивна историја из године у годину постаје све замршенија.

'Ghost' DNA In West Africans Complicates Story Of Human Origins (https://www.npr.org/2020/02/12/805237120/ghost-dna-in-west-africans-complicates-story-of-human-origins?fbclid=IwAR0cGRplbgZDSOkcQOFVH0CJVYUx5R8lvgRiOQ_3U126Pni6qwOdPRxkzOg)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Србин Фебруар 14, 2020, 11:05:20 поподне
Интересантно да је скоро објављен и овај рад у вези детектованих фрагмената неандерталске ДНК код афричких популација унешене повратном миграцијом из Евроазије: https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)30059-3

Поменути рад значајан је по закључку да је разноликост неафричке неандерталске ДНК прецењена, односно да мешања са неандерталским групама није било у оноликој мери колико се раније мислило.

Због детекције неандерталске ДНК у афричким популацијама смањена је разлика у уделу између Европљана и Источних Азијата, но ови други опет имају више.

2015 године објављена је студија Kim et al. која је дошла до закључка да мања популација и селекција не могу објаснити виши удео неандерталске генетике у геному источноазијских популација у односу на европске због чега се претпоставља да се ради о додатном мешању предака источноазијских популација са неандерталским групама у односу на европске. Линк: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0002929715000087

Још 2012 године објављена је студија о афричким ловцима-сакупљачима (Бака, Бедзан и Бакола из Камеруна, Хадза и Сандаве из Танзаније), а која се истиче по томе да је WGS тест открио знаке мешања са једном или више архаичних популација пре више од 40 хиљада година, која се притом одвојила од људског рода пре 1,2-1,3 милиона година. Линк: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3426505/

Осим наведене студије један рад новијег датума донео је закључак да је уплив ДНК непознатих архаичних афричких Хоминина утицао на еволуцију протеина Муцин 7 у пљувачки савремених афричких популација (Јоруба итд.). Линк: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5850612/

Поменуто је раздвајање непознате или непознатих лоза од људске пре 4,5 милиона година, знатно више од дотичне групе из претходно поменуте студије.

2018 објављен је још и овај рад везан за архаично мешање: https://www.researchgate.net/publication/325492331_Outstanding_questions_in_the_study_of_archaic_hominin_admixture

Интересантна је упрошћена шема основног мешања међу географски изолованим популацијама: https://www.researchgate.net/publication/325492331/figure/fig1/AS:632706387939328@1527860366006/A-simplified-model-of-admixture-history-between-archaic-and-anatomically-modern-human.png

Претпоставља се да је веома рано дошло је до људског уплива у Неандерталце, потом у корен свих евроазијских "неафричких" популација након чега Eвропљани примају компоненту још неоткривеног Базалног Евроазијата (означен као непомешан неафриканац, који је унет у Европу у саставу компоненте Неолитских Земљорадника), затим корен Источних Евроазијата прима још једну "дозу" неандерталске ДНК, па денисовске да би на крају Источни Азијати примили уплив Европске (боље рећи мешавину блискоисточне са БЕ), односно још денисовске у популације Југоисточне Азије.

Међутим поменута студија није узела у обзир остале догађаје уношења стране ДНК у геном савремених људи што би требало бити евидентно како код Афричких, тако и Азијских популација. Питање да ли су Базални Евроазијати, самим тим касније и неолитски земорадници који су у свом саставу имали поменуту аутозомалну компоненту имали још нешто не-неандерталско, не-денисовско из Африке што је допринело појединим афричким популацијама.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Србин Фебруар 16, 2020, 07:41:25 поподне
Цитирам заниљивости у вези рада Дурвасула/Санкарараман 2020 (https://advances.sciencemag.org/content/6/7/eaax5097) раније поменутог од стране НиколеВука.

Цитат
Combining our results across the West African populations, we estimate that the archaic population split from the ancestor of Neanderthals and modern humans 360 thousand years (ka) to 1.02 million years (Ma) B.P. and subsequently introgressed into the ancestors of present-day Africans 0 to 124 ka B.P. contributing 2 to 19% of their ancestry. We caution that the true underlying demographic model is likely to be more complex.

Лоза која се одвојила од Неандерталаца и савремених људи пре 360.000-1.020.000 година (средња вредност 690.000) допринела је 2-19% генетског материјала зависно од полулације са простора Западне Африке путем мешања које се догодило најраније пре 124.000 година.

Цитат
Non-African populations (Han Chinese in Beijing and Utah residents with northern and western European ancestry) also show analogous patterns in the CSFS, suggesting that a component of archaic ancestry was shared before the split of African and non-African populations.

Дакле страни удео у геному немају само Западни Африканци већ и Европљани (Американци европског порекла, Јута) и Азијати (Хан Кинези, Пекинг) што сугерише да се мешање одвило пре напуштања Африке.

Цитат
Some of these genes are at high frequency across both the YRI and MSL, including NF1, a tumor suppressor gene (83% in YRI, 85% in MSL), MTFR2, a gene involved with mitochondrial aerobic respiration in the testis (67% in YRI, 78% in MSL), HSD17B2, a gene involved with hormone regulation (74% in YRI, 68% in MSL), KCNIP4, which is a gene involved with potassium channels (73% in YRI, 69% in MSL), and TRPS1, a gene associated with trichorhinophalangeal syndrome (71% in YRI, 75% in MSL; Table 1). Three of these genes have been found in previous scans for positive selection in the YRI: NF1 (25, 26), KCNIP4 (27), and TRPS1 (28). On the other hand, we do not find elevated frequencies at MUC7, a gene previously found to harbor signatures of archaic introgression (29).

Интересантно да ова студија за разлику од старије наведене у претходном посту, није детектовала архаичну ДНК на гену Мицин 7 али јесте на већем броју других гена, укључујући и оне везане за функцију тестиса, регулацију хормона, супресију тумора али и калијумских канала у саставу ћелија. Један је везан за трихоринофалангеални синдром.

Цитат
We computed the maximum frequency of archaic segments near these genes and found that the average was 15% in YRI. This is consistent with those genes harboring archaic ancestry and confirms the results of Plagnol and Wall [2006] (7).

YRI=Yoruba 15%.

Цитат
S8.1 Results from the Luhya

Examination of the CSFS in the Luhya from Kenya (LWK) also reveals a U-shaped spectrum, similar to the other African populations examined here (Figure S5). We performed the same ABC-based parameter estimation procedure and found that a linage splitting 624,000 years ago (95% HPD: 290,100-1,137,000) with an Ne of 24,000 (95% HPD: 22,000-24,000) and introgressing 50,000 years ago (95% HPD: 11,000-113,00) is able to explain the shape of the spectrum. These parameters are similar to the other African populations. However, we find that an introgression fraction of 0.18 (95 % HPD: 0.09-0.31) is also required, which is much higher than the other populations. Inferences in the LWK could be complicated by non-African ancestry in the Luhya, resulting in increased estimates of the admixture fraction[Wall et al., 2013] (52). However, gene flow from the Neanderthals mediated through non-African ancestry into the LWK may not be enough to quantitatively explain this increase. Another possibility is other unmodeled gene flow events outside of the ones we describe here.

Лухја 19%.

Цитат
S8.2 Pre- versus post- Out-of-Africa

We performed additional modeling considering the YRI and CEU spectra jointly. Since the right (high frequency derived) side of the spectrum is most informative for this question, we only considered the allele frequency bins above 50. We simulated data using the same priors in Section S5.2, but computed the spectrum for both YRI and CEU. We found that the best fitting parameters were an archaic split time of 27,000 generations ago (95% HPD: 26,000-28,000), admixture fraction of 0.09 (95% HPD: 0.04-0.17), admixture time of 3,000 generations ago (95% HPD: 2,800-3,400), and an effective population size of 19,700 individuals (95% HPD: 19,300-20,200). We find that the lower bound of the admixture time is further back than the simulated split between CEU and YRI (2155 generations ago), providing some evidence in favor of a pre-Out-of-Africa event. This model suggests that many populations outside of Africa should also contain haplotypes from this introgression event, though detection is difficult because many methods use unadmixed outgroups to detect introgressed haplotypes [Browning et al., 2018, Skov et al., 2018, Durvasula and Sankararaman, 2019] (5, 53, 22). It is also possible that some of these haplotypes were lost during the Out-of-Africa bottleneck.

Просек за Јорубу и Американце европског порекла из Јуте јесте 9%. Претпостављају да је могло доћи до губљења дела страних хаплотипова услед уског грла при напуштању Африке.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Фебруар 17, 2020, 05:36:37 поподне
Још једна занимљивост у вези неандерталаца, изгледа да њихов Y хромозом није био компатибилан са нашом врстом и самим тим су мушки "мешанци" очева неандерталаца и мајки Homo sapiens sapiens-a били или мртворођени или неплодни.

Missing Y chromosome kept us apart from Neanderthals (https://www.newscientist.com/article/2083381-missing-y-chromosome-kept-us-apart-from-neanderthals/amp/)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Be like Bill Фебруар 25, 2020, 12:38:55 поподне
Još nije "zrelo" ali izgleda da bi ove godine moglo biti još rezultata drevne DNK sa područja Hrvatske, tačnije Lovasa. Prošle godine pronađeni su ostaci tri osobe iz peroda 3000 godina pr naše ere, bakarnog doba. Pretpostavlja se da su pripadali kostolačkoj kulturi, a sam način ukopavanja dosta je neobičan. Za analizu ostataka zadužen je dr Mario Novak sa Instituta za antropologiju u Zagrebu koji izgleda postaje vodeći naučnik za istraživanja drevne DNK na području Hrvatske

Цитат
Za analizu kostura zadužen je bioarheolog Mario Novak iz Instituta za antropologiju u Zagrebu, gdje se sada i nalaze kosturi. Oni će biti poslani na c14 datiranje, analizu izotopa i DNA analizu. Do kraja 2020. trebali bismo znati više o detaljima nalaza i odnosima između pokopanih pojedinaca.

https://www.index.hr/vijesti/clanak/u-slavoniji-pronadjen-grob-star-5000-godina-u-njemu-3-kostura-u-cudnom-polozaju/2146008.aspx
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: CosicZ Јун 28, 2020, 01:52:26 поподне
Анализирани су остаци 22 индивидуе са некрополе стећака Метаљица код Тарчина. У два узорка пронађена је Y-хаплогрупа I2a, а у једном R1b. При крају је и анализа mtDNA.
https://www.preporod.info/bs/article/17647/pojskic-geneticka-struktura-ostataka-sa-nekropole-metaljica-odgovara-nasoj
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: filipi Јун 28, 2020, 07:55:37 поподне
Анализирани су остаци 22 индивидуе са некрополе стећака Метаљица код Тарчина. У два узорка пронађена је Y-хаплогрупа I2a, а у једном R1b. При крају је и анализа mtDNA.
https://www.preporod.info/bs/article/17647/pojskic-geneticka-struktura-ostataka-sa-nekropole-metaljica-odgovara-nasoj
"dok jedna osoba pripada drugoj najučestalijoj Y-haplogrupi u BiH - R1b haplogrupi"
Ovo je vjerovatno greska. U pitanju je po svemu sudeci R1a.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Мића Август 12, 2020, 10:58:10 пре подне
https://www.danas.rs/kultura/nova-arheoloska-otkrica-u-viminacijumu/ (https://www.danas.rs/kultura/nova-arheoloska-otkrica-u-viminacijumu/)

Цитат
Na tom mestu su sahranjivani stanovnici Viminacijuma, prestonice Gornje Mezije, od početka II do kraja IV veka. Groblje je postavljeno uz antičku saobraćajnicu koja je spajala Viminacijum sa unutrašnjošću provincije na jugu.
Budući da je bila u upotrebi gotovo 300 godina, grobovi u nekropoli su postavljeni veoma gusto, a pronađeni su i neopljačkani sarkofazi sa arhefaktima. Do sada je otkopano više od 300 različitih predmeta (arhefakata) uglavnom nakita i delova odeće.
„Kada se govori o tako velikom uzorku, po pravilu se očekuju i otkrića koja iskaču iz uobičajenog grobnog inventara i koja zbune i oduševe arheologe. Celine koje se odlikuju specifičnim načinom pogrebnog rituala ili odskaču izborom predmeta položenim uz pokojnike, izlaze na svetlost dana na nedeljnom nivou“, kaže za Betu vođa arheološkog tima i direktor Arheološkog instituta u Beogradu Miomir Korać.
„Ono što je u ovom trenutku izvesno je da se arheološka istraživanja vrše na delu nekropole koji je koristilo imućnije stanovništvo, sa indicijama da se radi o ljudima iste etničke pripadnosti. Dobra očuvanost skeletnog materijala omogućiće interdisciplinarni pristup pomenutoj problematici, te arheolozi željno iščekuju analize drevne DNK, odnos izotopa stroncijuma i kalcijuma u zubima itd“, dodao je on.

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Август 12, 2020, 12:39:44 поподне
https://www.danas.rs/kultura/nova-arheoloska-otkrica-u-viminacijumu/ (https://www.danas.rs/kultura/nova-arheoloska-otkrica-u-viminacijumu/)

Прочитах да су у откривеним саркофазима сахрањене само припаднице лепшег пола, тако да ништа од Y-ДНК. 
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Владимир Бојановић Август 12, 2020, 02:36:03 поподне
Не верујем да се у свих 170 гробова налазе саркофази.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Август 12, 2020, 02:40:33 поподне
Не верујем да се у свих 170 гробова налазе саркофази.

Било је речи само о три оловна саркофага са скупоценим прилозима и накитом, у којима су нађени женски скелети.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Владимир Бојановић Август 12, 2020, 03:23:03 поподне
Па добро, то су само 3, остаје још 167 гробних места.  ;)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Август 12, 2020, 03:43:53 поподне
Па добро, то су само 3, остаје још 167 гробних места.  ;)

Рекоше да је сахрањивање у оловним саркофазима ретко и да их је до сада на целом Виминацијуму нађено мање од 30. Овај начин сахрањивања се везује за богате Левантинце, па ја "навијам" да ће можда у неком од њих бити пронађен родоначелник или барем рођак родоначелника неког од наших J1/J2 профилисаних родова.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Nebo Август 31, 2020, 08:02:53 поподне
Ancient DNA news from the Balkans!

With very High E-L539 (E-M78) and E-M35 lineages detected as well.

Viminacium - 28 (labeled Serbia_Roman):
E x 13 (L618 x 6; L618>V13 x 3; Z830 x 1; Z830>M123 x 1; Z1902 x 1; M96 x 1)
G x 5 (PF3148 x 1; PF3148>L91 x 1; P303 x 1; L497 x 1; L497>Z1815 x 1)
R1b x 3 (Z2103 x 1; U106 x 1; U152>L2>Z367 x 1)
R1a x 2 (Z2124>Z2122 x 1; Z2124>Z2123 x 1)
J x 2 (M304 x 1; L24 x 1)
T x 1 (M184)
I1 x 1 (M253)
I2 x 1 (L596)

Timacum Minus, Slog necropolis - 10 (labeled Serbia_Roman):
E x 3 (M35 x 1; L618 x 1; L618>V13 x 1)
J x 3 (M304 x 1; M410 x 1; M241 x 1)
R1b x 2 (Z2103 x 1; Z2103>CTS1450 x 1)
G x 1 (CTS342>FGC12126)
I1 x 1 (Z58>CTS8647)

Timacum Minus, Kuline necropolis - 5 (labeled Serbia_Early_Middle_Age):
I2 x 2 (M423 x 2)
E x 1 (L618)
J x 1 (M304)
R1b x 1 (P312>DF99)

Lepenski Vir - 2:
E x 1 (M35) - Serbia_Roman
J x 1 (M102) - Serbia_Medieval

Mediana - 2 (labeled Serbia_Gepid):
G x 1 (P287)
I1 x 1 (Z58>CTS8647)

Gomolava - 1 (labeled Serbia_Medieval):
I2 x 1 (M423>L621>CTS4002)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Август 31, 2020, 09:33:15 поподне
Ancient DNA news from the Balkans!

With very High E-L539 (E-M78) and E-M35 lineages detected as well.

Viminacium - 28 (labeled Serbia_Roman):
E x 13 (L618 x 6; L618>V13 x 3; Z830 x 1; Z830>M123 x 1; Z1902 x 1; M96 x 1)
G x 5 (PF3148 x 1; PF3148>L91 x 1; P303 x 1; L497 x 1; L497>Z1815 x 1)
R1b x 3 (Z2103 x 1; U106 x 1; U152>L2>Z367 x 1)
R1a x 2 (Z2124>Z2122 x 1; Z2124>Z2123 x 1)
J x 2 (M304 x 1; L24 x 1)
T x 1 (M184)
I1 x 1 (M253)
I2 x 1 (L596)

Timacum Minus, Slog necropolis - 10 (labeled Serbia_Roman):
E x 3 (M35 x 1; L618 x 1; L618>V13 x 1)
J x 3 (M304 x 1; M410 x 1; M241 x 1)
R1b x 2 (Z2103 x 1; Z2103>CTS1450 x 1)
G x 1 (CTS342>FGC12126)
I1 x 1 (Z58>CTS8647)

Timacum Minus, Kuline necropolis - 5 (labeled Serbia_Early_Middle_Age):
I2 x 2 (M423 x 2)
E x 1 (L618)
J x 1 (M304)
R1b x 1 (P312>DF99)

Lepenski Vir - 2:
E x 1 (M35) - Serbia_Roman
J x 1 (M102) - Serbia_Medieval

Mediana - 2 (labeled Serbia_Gepid):
G x 1 (P287)
I1 x 1 (Z58>CTS8647)

Gomolava - 1 (labeled Serbia_Medieval):
I2 x 1 (M423>L621>CTS4002)

Да, то је из оног великог рада који је најављиван. Постоји ли линк ка раду или је ово само неки "први поглед"?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Слатинац Септембар 01, 2020, 02:02:45 поподне
Timacum Minus, Slog necropolis - 10 (labeled Serbia_Roman):
R1b x 2 (Z2103 x 1; Z2103>CTS1450 x 1)
Ово је још једна потврда да су BY611 и њене предачке гране староседелачке на Балкану. Скелет колико видим датира из периода  између I и VI века, из римског периода. Грана R-CTS1450 (https://www.yfull.com/tree/R-CTS1450/) која је пронађена код овог скелета тренутно је најближа предачка грана нашој BY611/Y10889 (https://www.yfull.com/tree/R-Y10789/) која је пронађена код неког скелета. До сада су међу тестираним скелетима из разних археолошких налазишта у Србији и региону пронађене гране Z2103, Z2109, CTS7556 (сви ови скелети датирају из периода бронзаног доба тј. стари су између 3500-5000 година).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Септембар 01, 2020, 02:07:54 поподне
Ово је још једна потврда да су BY611 и њене предачке гране староседелачке на Балкану. Скелет колико видим датира из периода  између I и VI века, из римског периода. Грана R-CTS1450 (https://www.yfull.com/tree/R-CTS1450/) која је пронађена код овог скелета тренутно је најближа предачка грана нашој BY611/Y10889 (https://www.yfull.com/tree/R-Y10789/) која је пронађена код неког скелета. До сада су међу тестираним скелетима из разних археолошких налазишта у Србији и региону пронађене гране Z2103, Z2109, CTS7556 (сви ови скелети датирају из периода бронзаног доба тј. стари су између 3500-5000 година).

Нисам видео да је рад изашао. Након што изађе би требало да убрзо након тога изађу и BAM фајлови, где ће моћи да се изолује још низводнија грана од CTS1450, а ја верујем да ће то бити BY611, можда чак и Z2705 али видећемо. Поменути скелети из Тимакум Минуса конкретно потичу из 4-5. века, дакле касна антика односно период Сеобе народа. Очигледно је у питању мешана некропола локалаца и федерата-варвара из предела северно од Дунава.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Слатинац Септембар 03, 2020, 01:57:41 пре подне
Нисам видео да је рад изашао. Након што изађе би требало да убрзо након тога изађу и BAM фајлови, где ће моћи да се изолује још низводнија грана од CTS1450, а ја верујем да ће то бити BY611, можда чак и Z2705 али видећемо. Поменути скелети из Тимакум Минуса конкретно потичу из 4-5. века, дакле касна антика односно период Сеобе народа. Очигледно је у питању мешана некропола локалаца и федерата-варвара из предела северно од Дунава.
Изгледа да си био у праву кад си ми рекао да ће на неком налазишту из римског периода да исплива BY611 ;D Постоји велика шанса да ће да испадне BY611, али не треба бити баш 100% сигуран, можда испадне и грана R-Y5587 (https://www.yfull.com/tree/R-Y5587/) која је такође присутна на Балкану тј. само у Бугарској и Румунији. На форуму Anthrogenica кажу да овај рад садржи стотине узорака из целог Римског царства тј. из Србије, Бугарске, Македоније, Мађарске, Грчке, а требало би ваљда да буде узорака и из Албаније, Хрватске, Црне Горе, Румуније и Босне, тако да ће највероватније бити још узорака са хг R1b-Z2103. Чуди ме да нико још не зна када ће рад отприлике да буде објављен, нити какав ће бити наслов рада. На том форуму је било речи да је скелет са ознаком I15552 који припада хаплогрупи R1b-CTS1450 највероватније у питању Сармат, мада ја бих ипак ово питање оставио археолозима и историчарима.
(https://i.ibb.co/bgr1dck/01-Timacum-Minus-Slog-Necropolis-350-450-AD.png)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Септембар 03, 2020, 11:43:43 пре подне
Занимљиво је присуство I1-S2169 (https://yfull.com/tree/I-S2169/) која је данас распрострањена углавном у западној и северној Европи (налази се испод Z58>Z140). Ово је вероватно траг присуства неких германских федерата. Такође је ту и G2a-FGC12126 (https://yfull.com/tree/G-FGC12126/), која се налази испод L140>CTS342 и има две значајније подгране, од којих се једна (L660) за сад јавља искључиво у Европи, док је друга (Y36006) распрострањена само код Арапа на Блиском Истоку, вероватно као резултат ефекта оснивача (њен TMRCA је 1900 година пре садашњости, отприлике први векови нове ере). Осим E-V13 (ту укључујем и њену узводну грану L618 јер се ту вероватно ради о лоше очуваном узорку коме нису могли наћи низводнију подграну због оштећености), присутна је и J2b2-M241, што је исто тако значајан податак. 

Такође, скелет који је одређен као G2a-FGC12126 има необичну и ретку мтДНК хаплогрупу X2i, за коју на Еупедији пише следеће:

X2i: found in Turkey, around the Caucasus (Armenia, Kabardia), Italy (Sicily) and in Spain (Asturias)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: CosicZ Новембар 03, 2020, 03:14:57 пре подне
Видео сам ову вест на РТС-у, тамо је била и реконструисана слика керуше, као из неког хорор филма.
https://prokuplje.org.rs/vesti/%D1%83-%D0%BF%D0%BB%D0%BE%D1%87%D0%BD%D0%B8%D0%BA%D1%83-%D0%BF%D1%80%D0%BE%D0%BD%D0%B0%D1%92%D0%B5%D0%BD%D0%B8-%D1%81%D0%BA%D0%B5%D0%BB%D0%B5%D1%82%D0%BD%D0%B8-%D0%BE%D1%81%D1%82%D0%B0%D1%86%D0%B8/
https://www.danas.rs/kultura/plocnik-kod-prokuplja-pronadjeni-skeletni-ostaci-psa-stari-najmanje-6-500-godina/
http://niskiportal.rs/vest/460457102-11-202026616
https://prokupljenadlanu.rs/drustvo/u-plocniku-pronadjeni-skeletni-ostaci--psa--stari-najmanje-6500-godina-9223.htm
Цитат
У неолитском насељу Плочник код Прокупља, пронађени су скелетни остаци "најстаријег" пса у Србији, након што је анализа потврдила да се ради о скелету који је ту најмање 6.500 година.

То откриће представља доказе о постојању различитих врста паса у периоду непосредно након леденог доба, као и да је ова животинска врста већ тада била припитомљена.

Керуша, која је на Плочник досла током неолитске сеобе народа из Мале Азије, претеча је данашњих паса, а постоји више претпоставки о њеном изгледу, потврдила је Бети археолог Јулка Кузмановић Цветковић.

Скелетни остаци пса су пронађени у "сонди 24", у оквиру пројекта "Развој металургије у Евроазији", британског УЦЛ Универзитета из Лондона , Народног музеја из Београда и Прокупља.

Археолози су том приликом, у потрази за доказима о развоју металургији, отворили сонду која је требала да открије једну неолитску кућу. Међутим, наишли су на невероватан налаз. "Пронашли смо кости, од којих је узета доња лева чељуст, а анализа је показала задивљујуће резултате. У питању је керуша из доба древног неолита и она је, за сада најстарији пас који је откривен на просторима Србије", казала је Кузмановић Цветковић

ДНК анализу скелетних остатака древног пса са Плоцника, поред још 26 паса, из других земаља, урадили су британски Франсис Крик институт, Универзитет у Оксфорду и Универзитет у Бечу.

"То нам говори, обзиром на већ познате кретања током неолитског периода из Мале Азије на Балкан пре око 8.000 година... да су људи током миграција широм света у то време највероватније водили и своје псе са собом, и да је пас већ тада био припитомљен", каже Кузмановић Цветковић

Истовремено, она сматра да пас у то време, највероватније није био кућни љубимац, као што је то данас, јер је неолитска керуша са Плочника "потпуно другачија од данашњег пса".

"Има покушаја реконструкције, на основу скелета и на основу упоредних анализа. Претпоставља се да је керуша изгледала прилично застрашујуће, са јаком чељусти, много већа од данашњег пса. У неолитско доба, пси су животиње које су још увек месождери и које у неолиту тек почињу да се привикавају на људску исхрану", каже Кузмановић Цветковић

Приликом ископавања 24. сонде на Плочнику, поред археолога из музеја Топлице у Прокупљу и Београда, и археолога са универзитета Дурхам и Јорк у Великој Британији, била су укључена и два археозоолога, Јелена Булатовић из Лабораторије за биоархеологију Универзитета у Београду, и Ивана Стојановић са Археолошког института у Београду.

Оне су прве идентификовале остатке пса са Плочника, током рада на анализи животињских остатака за потребе овог пројекта и контактирале истраживаче са британског Крик института, који су водили глобалну студију о пореклу паса.

Најстарији пас у Србији, који је откривен на Плочнику представља ексклузивно откриће, и он се нашао у светском научном часопису "Сциенце".

Истовремено, анализом је утврђено да је непосредно након леденог доба и пре него што је било која друга животиња припитомљена, у свету већ постојало најмање пет различитих типова паса, а да су се током последњих 10.000 година ове древне лозе паса мешале и кретале, какоби настали пси које познајемо данас.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Bokez Март 04, 2021, 02:17:21 поподне
Интересује ме је ли потврђен проналазак I2-L-621 гране у Бугарској прије 5000 година? Извор би требао да буде ReichLab2020(SE_Europe)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Март 04, 2021, 03:14:16 поподне
Интересује ме је ли потврђен проналазак I2-L-621 гране у Бугарској прије 5000 година? Извор би требао да буде ReichLab2020(SE_Europe)

Није потврђен, а и не може се потврдити док BAM фајл не буде доступан. А BAM фајлови углавном постану доступни тек када се званично објави научни рад.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: barbarylion Септембар 11, 2021, 05:59:32 поподне
Hohenzollern
Pruska dinastija/germanska?
I2a1b

Gleb Svyatosavich princ of Novgorod
I2a1b

I još tri Skitska uzorka koja su I2a1b

Verovatno je ovo već poznato?
Da li je moguće da je ova dinastija u Švabiji zapravo slovenskog porekla?

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милан Петровић Септембар 11, 2021, 06:18:34 поподне
Болсингери су PH908, такође племство, такође пореклом из Пруске.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: barbarylion Септембар 11, 2021, 06:25:42 поподне
Болсингери су PH908, такође племство, такође пореклом из Пруске.

To je interesantno.
Šta misliš o tome? Od kuda PH908 među Prusima?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милан Петровић Септембар 11, 2021, 06:39:09 поподне
To je interesantno.
Šta misliš o tome? Od kuda PH908 među Prusima?
Па, некада су живели на тој територији, ратовали са Саксонцима,Францима и  Данцима. Мислим на период пре стварања Северне марке. Сигурно да су моћне дружине са Карпата залазиле и у те крајеве. Неки од њих постали моћни и богати, па и променили страну.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: barbarylion Септембар 11, 2021, 06:44:01 поподне
Па, некада су живели на тој територији, ратовали са Саксонцима,Францима и  Данцима. Мислим на период пре стварања Северне марке. Сигурно да су моћне дружине са Карпата залазиле и у те крајеве. Неки од њих постали моћни и богати, па и променили страну.

Da, to deluje logično.
Ne treba ni da čudi kada se pojavi neka slovenska grana kod germana, obzirom da su generalno bili okruženi Slovenima.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: drajver Септембар 11, 2021, 06:57:32 поподне
Hohenzollern
Pruska dinastija/germanska?
I2a1b

Gleb Svyatosavich princ of Novgorod
I2a1b

I još tri Skitska uzorka koja su I2a1b

Verovatno je ovo već poznato?
Da li je moguće da je ova dinastija u Švabiji zapravo slovenskog porekla?

За Хоенцолерне се колико видим претпоставља да су I2-M223>P78>Y7219

Дакле, не ради се о словенској хаплогрупи.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: barbarylion Септембар 11, 2021, 07:01:07 поподне
За Хоенцолерне се колико видим претпоставља да су I2-M223>P78>Y7219

Дакле, не ради се о словенској хаплогрупи.

Moguće, ja sam video samo ,, sirovu" verziju, učinilo mi se da se radi o I2a1b

Piše I2a1b1a2a1b
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Be like Bill Октобар 07, 2021, 08:15:57 поподне
Ne znam da li je neko već postavljao ovu listu rezultata drevne DNK.

https://haplogroup.info/all-ancient-dna.pdf
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Драган Обреновић Октобар 07, 2021, 09:09:01 поподне
Ово је својевсрна референтна база за Ancient DNA, колико ми је познато:

https://reich.hms.harvard.edu/allen-ancient-dna-resource-aadr-downloadable-genotypes-present-day-and-ancient-dna-data
 (https://reich.hms.harvard.edu/allen-ancient-dna-resource-aadr-downloadable-genotypes-present-day-and-ancient-dna-data)

Међутим, резултати нису у формату који је "конзумабилан" за обичног заинтересованог читаоца.

Личи ми да је тај PDF настао од снепшота ове Рајхове базе древне ДНК. Заправо убеђен сам да сам имао Excel који изгледа слично том PDF фајлу, али много је прегледнији и лакши за претраживање. Покушаћу да га нађем, па ако успем окачићу овде.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: CosicZ Октобар 08, 2021, 02:29:07 пре подне
Ne znam da li je neko već postavljao ovu listu rezultata drevne DNK.

https://haplogroup.info/all-ancient-dna.pdf
https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=23.msg132955#msg132955
Видети и
https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=5437.msg144387#msg144387
https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=1791.msg162597#msg162597
https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=4229.msg152978#msg152978

Различити формати расположиви на https://indo-european.eu/ancient-dna/ .
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Be like Bill Новембар 03, 2021, 04:29:55 поподне
Novi rad o genetici ruskih zemalja u srednjem veku:"Средневековый генофонд Водской земли Великого Новгорода". Rad je na žalost zaštićen paywall-om ali možda neko ima pristup preko drugih institucija. Zanimljivo je postojanje većeg broja E1b V13 haplotipova u tom delu Rusije u 12 stoleću

Цитат
The DNA of 17 individuals of the 12th-15th centuries was studied. from the burial grounds of Teglitsa I and II, Ratchino I on the Izhora plateau, Velikino in the Lower Poluga. Y-chromosomal haplogroups of 12 males, mitochondrial haplogroups of 12 males and females were identified. In the genetic structure of the population of the Izhora plateau, the presence of three Y-chromosomal haplogroups, confined to certain sites, was established. Individuals from Teglitsa I belong to haplogroup E1b1b1a1b (V13), from the Teglitsa II burial ground - to R1a1a1b1a (Z282), in Velikino, individuals with haplogroup N1a1 (M46) were identified. Three haplogroups were identified in Ratchino I: N1a1 (M46), N1a1a1a1a (CTS2929), E1b1b1a1b (V13). Phylogenetic networks built on the basis of STR haplotypes of the Y chromosome for haplogroup N1a (M46) showed the genetic similarity of the medieval collectives that left the burial grounds of Ratchino I and Velikino, to the modern populations of the Baltic-Finnish peoples. A surprise was the good representation of the haplogroup E1b1b1a1b (V13), which has a predominantly Carpathian-Balkan distribution, in individuals from Teglits I and its manifestation in Ratchino I.


https://www.e-anthropology.com/Katalog/Arheologia/STM_DWL_tzo1_fDZO7b8OXbzG.aspx




Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: dons Децембар 09, 2021, 12:59:12 поподне
Почетничко питање:
Са територије којих данашњих држава је вршено више генетских истраживања древних налазишта, а на којима мање/никако?
 Ко су водеће "силе" у археогенетици?
 Који су најстарији узорци обрађени са данашње Украјине Русије Пољске Белорусије,  и који почетнички уводни топик треба да прочитамо ми нови чланови о обиму генетских истраживања древних узорака?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: drajver Децембар 09, 2021, 01:25:51 поподне
Објављен је препринт рада који садржи днк палеолитске налазе са Сицилије из периода од прије 10-11.000 година. Ако сам добро на брзину видио, код једног узорка су успјели изоловати Y-днк и ради се о хаплогрупи https://www.yfull.com/tree/I-M436/. Можда је повезан са гранама ове хаплогрупе које су пронађене у Лепенском Виру.

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.08.471745v1
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.08.471745v1.full.pdf
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.08.471745v1.supplementary-material
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: drajver Децембар 09, 2021, 01:28:08 поподне
Почетничко питање:
Са територије којих данашњих држава је вршено више генетских истраживања древних налазишта, а на којима мање/никако?
 Ко су водеће "силе" у археогенетици?
 Који су најстарији узорци обрађени са данашње Украјине Русије Пољске Белорусије,  и који почетнички уводни топик треба да прочитамо ми нови чланови о обиму генетских истраживања древних узорака?

Мислим да на овом сајту имаш најкомплетније податке о древним узорцима.

https://indo-european.eu/
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Црна Гуја Децембар 09, 2021, 01:36:44 поподне
Објављен је препринт рада који садржи днк палеолитске налазе са Сицилије из периода од прије 10-11.000 година. Ако сам добро на брзину видио, код једног узорка су успјели изоловати Y-днк и ради се о хаплогрупи https://www.yfull.com/tree/I-M436/. Можда је повезан са гранама ове хаплогрупе које су пронађене у Лепенском Виру.

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.08.471745v1
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.08.471745v1.full.pdf
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.08.471745v1.supplementary-material

Цитат
The Y-chromosome haplogroup determined for San Teodoro 3 is I2a2 [M436] (Tables S5, 8 and Figure S9), a subclade of haplogroup I2 which is common among European huntergatherers, and possibly originated in southern Europe during the LGM before becoming widespread in Europe during the Neolithic15,16. This haplogroup shows high frequency in present-day populations in the Balkan peninsula, in particular within the Serbian population17.

Ево колико су поједини генетичари из једне од најпрестижнијих институција које се баве археогенетиком упућени у Y-хаплогрупе.  ::)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: drajver Децембар 09, 2021, 01:38:36 поподне
Ево колико су поједини генетичари из једне од најпрестижнијих институција које се баве археогенетиком упућени у Y-хаплогрупе.  ::)

Иако нема везе са мозгом, ајде сад остани жив од наших аутохтониста. Рећи ће, написано у научној студији, шта ми други знамо.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Симеон Волос Децембар 15, 2021, 12:38:16 поподне
https://biznis.telegraf.rs/it-biz/3432253-kako-je-tekao-proces-ozivljavanja-coveka-iz-lepenskog-vira-biokineticki-model-osobe-stare-10-milenijuma

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Be like Bill Децембар 28, 2021, 09:50:05 пре подне
Sinoć sam razmenio sa Gujom par poruka na Anthrogenici u vezi budućeg rada koji bi trebao da obuhvati više lokacija na Balkanu. Malo sam istraživao na internetu postoje li radovi koji bi se mogli povezati s njim i pronašao sam:"First archaeological investigations of barrows in the Bačka region and the question of the Eneolithic/Early Bronze Age barrows in Vojvodina" iz 2020 godine. U radu se analiziraju arheološki i koštani materijali koji pripadaju periodu Jamnaja kulture i napominje da su pojedini uzorci predviđeni i za DNK analizu. Ne znam da li bi se pomenuti uzorci trebali naći u radu o kom smo govorili ali je u svakom slučaju zanimljivo.

Цитат
Bone and teeth samples from Jabuka, Šajkaš, Vojlovica and Žabalj were taken in situ/in museum and sent
for ancient DNA analysis to Ron Pinhasi’s laboratory, University of Vienna, Austria and David Reich’s laboratory,
Harvard Medical School, USA. Due to bad preservation the samples from Žabalj (grave 1) and Jabuka did not yield any results, while another sample from Žabalj (grave 4) is still being processed. The molecular sex was established for the individuals from Vojlovica and Šajkaš, and both are females. More detailed genetic information on these samples will be published in a separate study in the near future.

https://sci-hub.se/10.1515/pz-2020-0003
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Децембар 28, 2021, 12:03:47 поподне
Sinoć sam razmenio sa Gujom par poruka na Anthrogenici u vezi budućeg rada koji bi trebao da obuhvati više lokacija na Balkanu. Malo sam istraživao na internetu postoje li radovi koji bi se mogli povezati s njim i pronašao sam:"First archaeological investigations of barrows in the Bačka region and the question of the Eneolithic/Early Bronze Age barrows in Vojvodina" iz 2020 godine. U radu se analiziraju arheološki i koštani materijali koji pripadaju periodu Jamnaja kulture i napominje da su pojedini uzorci predviđeni i za DNK analizu. Ne znam da li bi se pomenuti uzorci trebali naći u radu o kom smo govorili ali je u svakom slučaju zanimljivo.

https://sci-hub.se/10.1515/pz-2020-0003

Штета што је гвоздено доба Балкана и даље у "запећку" што се тиче археогенетских радова, у односу на неолит, енеолит и бронзано доба. С обзиром да су се тад формирале племенске групе о којима пишу и старогрчки и римски историчари, а да су и археолошки оне мање-више уочљиве, не схватам зашто је тај период код археогенетичара у оволикој мери незапажен...
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: filipi Децембар 28, 2021, 02:09:19 поподне
Sinoć sam razmenio sa Gujom par poruka na Anthrogenici u vezi budućeg rada koji bi trebao da obuhvati više lokacija na Balkanu. Malo sam istraživao na internetu postoje li radovi koji bi se mogli povezati s njim i pronašao sam:"First archaeological investigations of barrows in the Bačka region and the question of the Eneolithic/Early Bronze Age barrows in Vojvodina" iz 2020 godine. U radu se analiziraju arheološki i koštani materijali koji pripadaju periodu Jamnaja kulture i napominje da su pojedini uzorci predviđeni i za DNK analizu. Ne znam da li bi se pomenuti uzorci trebali naći u radu o kom smo govorili ali je u svakom slučaju zanimljivo.

https://sci-hub.se/10.1515/pz-2020-0003
Bit ce oko10ak iz Srbije, 20ak iz CG, 1 iz BiH, 20ak iz Makedonije, 80ak iz Hrvatske, plus Albanija...
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: drajver Фебруар 08, 2022, 06:48:11 пре подне
Filipi ми је скренуо пажњу на једно археогенетско истраживање које је презентовано прошле јесени на неком конгресу генетичара у Сарајеву. Ради се о генетичком тестирању 11 појединаца, како се послије показало повезаних по мушкој линији, из средњовјековних гробница у околини Травника. Сви припадају хаплогрупи Ј2а. На жалост, STR профили још нису објављени. Вјероватно се ради о неком разгранатом средњовјековном роду са подручја жупе Лашве (крај 14. почетка 15. вијека). Ево неких линкова:

MOLECULAR-GENETIC ANALYSIS OF SKELETAL REMAINS FROM MEDIEVAL ARCHAEOLOGICAL SITES FROM THE TRAVNIK AREA

Tamara Lukic1, Mirela Dzehverovic2, Amela Pilav2, Jasmina Cakar1,21Universityof Sarajevo, Facultyof Science,Sarajevo,Bosnia andHerzegovina2University of Sarajevo,Institute for Genetic Engineering and Biotechnology,Sarajevo, Bosnia and Herzegovina

Molecular genetic analysis of archaeological skeletal remains is important for gaining insight into the origin and genetic structure of our ancestors. The analysis of ancient DNA (aDNA) is extremely challenging since DNA is frequently found invery low concentrations and is often highly  degraded.  Regarding  mentioned,  the  main  goal  of  aDNA  studies  is  to  successfully isolate  DNA  from  skeletal  remains  with  as  little  loss  of  biological  material  and  generate usable  electropherograms  (DNA  profiles)  with  as  many  amplified  STR  loci  as  possible. Although there is not much information about the people who inhabited the Travnik region during  the  medieval  Bosnia,  it  is  believed  that  this  area  was  one  of  the  most  populated  in that period, as evidenced by thenumerous archaeological necropolises found in this area. A total  of  11  tooth  samples  from  four  localities  from  the  Travnik  area:  Glavica -Han  Bila, Fazlići, Alihodže and Klisa were analyzed. Amplification of the isolated aDNA was performed with  a  commercial  multiplex  kit PowerPlex® Fusion Systemand PowerPlex® Y23 Systemin samples in which the presence of Y chromosomes  was detected. Statistical recalculation  of the  probability  of  kinship  was  determined  using IngebKinship software.  For  Y-haplogroup prediction,  digital  software Whit  Athe's  Haplogroup  Predictorand NEVGENwere  used. Isolation  of  aDNA  and  amplification  of  STR  loci  from  analysed  samples  was  extremely successful,  generating  full  profiles  from  eight  out  of  11  samples.  The  highest  degree  of kinship  was  found  between  the  two  samples  with  a  kinship  probability  for  relationship brother-brother 99.99996%. Analysis of Y haplotypes showed that all male individuals were related by the male line and that they belonged to the J2a haplogroup.

Keywords:ancient DNA, archeology, skelet remains, STR markersCorrespondence:[email protected]

https://genubih.ba/wp-content/uploads/2021/09/Tamara-Lukic.pdf

Требало би између осталих да се ради и овој локацији:
http://www.anubih.ba/godisnjak/god44/Godisnjak44-12.pdf

Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: drajver Фебруар 08, 2022, 09:08:11 пре подне
Иначе везано за овај Ј2а род пронађен под стећцима у Лашви, добар кандидат би била средњовјековна босанска породица Дружића, што је у археолошко-антрополошком раду и наговјештено. О Дружићима нема пуно података, а ово су неки:

"Стефан Друшчић (Sthepano Druschich, Стефани Др8шчикв), 34,68; 38, 62 — сведок, представник горњобосанског властеоског рода Друшчић или Дружић чије је седиште било у Гучој Гори, на подручју жупе Лашва. Као сведок, Стефан се јавља и у исправама из 1332. и 1345. године."

"Степша (Stepse), 50, 44 — сведок, син Стефана Дружића, представник горњобосанског властеоског рода Друшчић, нема ближих података о њему.
Стефан Дружић (Sthepano Drusich), 50, 44 — у исправи се јавља као отац Степшин, представник горњобосанског властеоског рода Друшчић, видети претходни наш прилог у овој свесци."

"Други извор који говори о управи тепчије Батала над жупом Саном је исправа санског жупана Вукца од 25. маја 1396, који у граду Козари, у име војводе Хрвоја гарантује безбедност трговцима. На основу нешто каснијег податка сазнајемо да је поменут „владалац" био заправо Вук, син Милоша Дружића из Гуче Горе у Лашви. Како је тепчија Батало био господар жупе Лашве, несумњиво је дакле да је Вук био његов „човек" и да је у његово име управљао жупом Саном."

"Град Козару је у руке угарског краља предао Вук, син покојног Милоша Дружића из Гуча Горе из Лашве."

"У јеку ове кампање против херцега Хрвоја, у лето 1413, од његове власти се одметнуо и Вук, син Милоша Дружића од Гуче Горе у Лашви. Он је управљао жупом Саном и градом Козаром у име тепчије Батала Шантића, који је ове поседе добио у привремену власт, женидбом с Ресом, сестром херцега Хрвоја. Поред тога што је краљу Жигмунду предао град Козару и неке „своје тврђаве“ у жупанији Сани, Вук Дружић је у исти мах добровољно препустио certa castra sua in terra nostra Vzure. Као награду за показана „дела верности“, Жигмунд му издаје нову повељу доста касније од поменутих догађаја, 5. септембра 1425. У том документу, Вуку се обраћа као ,,aule nostre militia“, затим су споменуте његове заслуге у различитим
временима у борби против Турака и Босанаца, потом и предаја тврђава у Сани и Усори. На основу свега тога, награђен је поседом по имену Пака у Пожешкој жупанији, са свим његовим припадностима. На Вукову молбу, Жигмунд му је дао и посебну владареву дозволу да утврди свој посед, на тај начин што ће подићи ,,fortalitium seu castrum de lignis aut lapidibus“."

Видимо да су Дружићи били уско повезани са породицом тепчије Батала Шантића, такође из Лашве. Занимљиво да постоји муслиманска породица Шантића који је тестиран као припадник Ј2а цуцко-пјешивачке гране.

У сваком случају, чекамо да се објаве хаплотипови.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Небојша Фебруар 08, 2022, 09:20:08 пре подне


Видимо да су Дружићи били уско повезани са породицом тепчије Батала Шантића, такође из Лашве. Занимљиво да постоји муслиманска породица Шантића који је тестиран као припадник Ј2а цуцко-пјешивачке гране.

У сваком случају, чекамо да се објаве хаплотипови.

Ти Шантићи су однекуд из околине Пријепоља, па је упитно имају ли везе са Средњом Босном. Логичнија је веза са Старом Црном Гором, због хаплотипа. У сваком случају, ту подграну J2a свакако треба тражити међу муслиманским родовима Средње Босне и шире. Код БиХ муслимана је доста раширена J2a, а неки логичан закључак је да је тако због потенцијалне струје из Мале Азије по доласку Турака. Међутим, могуће да већи број подграна ипак одлази на предсловенско становништво Балкана.

поменућу овде неке подгране које се јављају код БиХ муслимана са 23andMe

J2a-M67: Средња Босна
J2a-M92: Стара Херцеговина, Херцеговина, Босанска Крајина
J2a-L210: Ливно
J2a-L26: Босанска Крајина
J2a-L24: Травник
J2a-L70: Херцеговина, Босанска Крајина
J2a-L47: Средња Босна
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милан Петровић Фебруар 08, 2022, 10:06:36 пре подне
Да ли смо испратили ово:

https://www.pnas.org/content/119/8/e2108001119?fbclid=IwAR0-rQVUZKZJeP1G9pFwtDuj7XheqsM8pTLRMEWgBHyH-QH566v3Cx1W2NU

Y-Chromosome Variation.
There are 16 known Y-chromosome (Y-DNA) haplotypes from Neolithic Orkney, of which 14 appear to be well resolved (13, 32). All 14 belong to haplogroup I2a, of which seven are I2a1b-M423, four are I2a1b1-S185, one is I2a2-S33, one is I2a2a1b-CTS10057, and one is I2a2a1a2-Y3679 (the remaining two are poorly resolved I and I2). In BA LoN, even though the majority of genome-wide and female lineages most likely arrived in Britain and Orkney with the BBC or BA, all but one of the nine Y-DNA lineages belong to haplogroup I2a1b-M423, with just one belonging to R1b-M269 (SI Appendix, Section S6 and Dataset S1H). We found four distinct haplotypes within I2a1b: I2a1b-M423, I2a1b1-S185, and the more derived I2a1b1a1b-A1150 and I2a1b1a1b1-A8742.

This predominance of I2a1b-M423 is surprising because it is completely absent elsewhere in CA/BA Europe, where the Y-DNA landscape is heavily dominated by R1b-M269 (Figs. 2–4 and SI Appendix, Figs. S13–S15). For example, in a dataset of 21 BBC males from Britain, 20 carry the R1b-M269 lineage and only one I2a, which is on the distinct I2a2a-M223 lineage. If we include CA and EBA Britain and Ireland, 41 out of 43 males carried R1b-M269, two I2a2a-M223, and none I2a1b-M423.

I2a1b-M423 likely arrived in Orkney with the first farmers. In the Neolithic, I2a1b-M423 was largely distributed in an arc around the Atlantic façade of Europe, from the western Mediterranean to the Baltic. Outside Britain, most I2a1b-M423 lineages are from Middle/Late Neolithic Spain and France, with one from Germany and a small number from Sweden, where, at a megalithic site on Gotland, all four genotyped males belonged to I2a1b-M423
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: drajver Фебруар 08, 2022, 10:29:23 пре подне
Да ли смо испратили ово:

https://www.pnas.org/content/119/8/e2108001119?fbclid=IwAR0-rQVUZKZJeP1G9pFwtDuj7XheqsM8pTLRMEWgBHyH-QH566v3Cx1W2NU

Y-Chromosome Variation.
There are 16 known Y-chromosome (Y-DNA) haplotypes from Neolithic Orkney, of which 14 appear to be well resolved (13, 32). All 14 belong to haplogroup I2a, of which seven are I2a1b-M423, four are I2a1b1-S185, one is I2a2-S33, one is I2a2a1b-CTS10057, and one is I2a2a1a2-Y3679 (the remaining two are poorly resolved I and I2). In BA LoN, even though the majority of genome-wide and female lineages most likely arrived in Britain and Orkney with the BBC or BA, all but one of the nine Y-DNA lineages belong to haplogroup I2a1b-M423, with just one belonging to R1b-M269 (SI Appendix, Section S6 and Dataset S1H). We found four distinct haplotypes within I2a1b: I2a1b-M423, I2a1b1-S185, and the more derived I2a1b1a1b-A1150 and I2a1b1a1b1-A8742.

This predominance of I2a1b-M423 is surprising because it is completely absent elsewhere in CA/BA Europe, where the Y-DNA landscape is heavily dominated by R1b-M269 (Figs. 2–4 and SI Appendix, Figs. S13–S15). For example, in a dataset of 21 BBC males from Britain, 20 carry the R1b-M269 lineage and only one I2a, which is on the distinct I2a2a-M223 lineage. If we include CA and EBA Britain and Ireland, 41 out of 43 males carried R1b-M269, two I2a2a-M223, and none I2a1b-M423.

I2a1b-M423 likely arrived in Orkney with the first farmers. In the Neolithic, I2a1b-M423 was largely distributed in an arc around the Atlantic façade of Europe, from the western Mediterranean to the Baltic. Outside Britain, most I2a1b-M423 lineages are from Middle/Late Neolithic Spain and France, with one from Germany and a small number from Sweden, where, at a megalithic site on Gotland, all four genotyped males belonged to I2a1b-M423

Ови I2a1b-M423 из Оркнија су били познати и раније, једино ако нису тестирали неке нове узорке. Углавном се радило о L161 Isles варијанти.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милан Петровић Фебруар 08, 2022, 10:30:26 пре подне
Ови I2a1b-M423 из Оркнија су били познати и раније, једино ако нису тестирали неке нове узорке. Углавном се радило о L161 Isles варијанти.
А ова четворица са Готланда?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: drajver Фебруар 08, 2022, 11:08:08 пре подне
А ова четворица са Готланда?

То су узорци из ранијег рада https://www.pnas.org/content/116/19/9469?ijkey=811da0c2c1974626c6207308d15631a6e0127237&keytype2=tf_ipsecsha#T1

У овом новом раду су тестирали неких 37 нових узорака, колико сма видио од М423, ради се о грани L161

Насушно нам треба неки L621+ узорак из Бронзаног доба.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Милан Петровић Фебруар 08, 2022, 11:12:33 пре подне
То су узорци из ранијег рада https://www.pnas.org/content/116/19/9469?ijkey=811da0c2c1974626c6207308d15631a6e0127237&keytype2=tf_ipsecsha#T1

У овом новом раду су тестирали неких 37 нових узорака, колико сма видио од М423, ради се о грани L161

Насушно нам треба неки L621+ узорак из Бронзаног доба.

Ето, ја кад видим нешто, понадам се. Доћиће ваљда и тај дан да добијемо недостајуће карике.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: filipi Фебруар 21, 2022, 07:38:47 поподне
I2-Y4882* iz "12 vijeka"  Češka-Jihomoravsky region.
 https://www.yfull.com/tree/I-Y4882*/
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: CosicZ Фебруар 26, 2022, 06:25:29 пре подне
I2-Y4882* iz "12 vijeka"  Češka-Jihomoravsky region.
 https://www.yfull.com/tree/I-Y4882*/
Толико је стар. Видети https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=1058.msg155951#msg155951 , https://forum.poreklo.rs/index.php?topic=5944.msg161549#msg161549 , https://www.yfull.com/samples-from-paper/516/ .
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: CosicZ Април 10, 2022, 01:27:51 поподне
О пореклу мачака у централној Европи.
https://www.researchgate.net/publication/324089744_Human-mediated_dispersal_of_cats_in_the_Neolithic_Central_Europe
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29588507/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6221894/
Цитат
Archeological and genetic evidence suggest that all domestic cats derived from the Near Eastern wildcat (Felis silvestris lybica) and were first domesticated in the Near East around 10,000 years ago. The spread of the domesticated form in Europe occurred much later, primarily mediated by Greek and Phoenician traders and afterward by Romans who introduced cats to Western and Central Europe around 2000 years ago. We investigated mtDNA of Holocene Felis remains and provide evidence of an unexpectedly early presence of cats bearing the Near Eastern wildcat mtDNA haplotypes in Central Europe, being ahead of Roman period by over 2000 years. The appearance of the Near Eastern wildcats in Central Europe coincides with the peak of Neolithic settlement density, moreover most of those cats belonged to the same mtDNA lineages as those domesticated in the Near East. Thus, although we cannot fully exclude that the Near Eastern wildcats appeared in Central Europe as a result of introgression with European wildcat, our findings support the hypothesis that the Near Eastern wildcats spread across Europe together with the first farmers, perhaps as commensal animals. We also found that cats dated to the Neolithic period belonged to different mtDNA lineages than those brought to Central Europe in Roman times, this supports the hypothesis that the gene pool of contemporary European domestic cats might have been established from two different source populations that contributed in different periods.
(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/instance/6221894/bin/41437_2018_71_Fig1_HTML.jpg)
Цитат
Fig. 1 Phylogeny of Holocene and recent cats. Bayesian phylogeny based on 160 mtDNA haplotypes of Holocene and recent cats. Haplotypes of studied samples are given in bold. Numbers at nodes indicate posterior probability and SH support values obtained with Bayesian and maximum likelihood approaches, respectively. The tree was rooted with sequence of Felis margarita (data not shown)
(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/instance/6221894/bin/41437_2018_71_Fig2_HTML.jpg)
Цитат
Calibrated radiocarbon ages of the Holocene cat remains. Calibration and δ18O curves are given according to Bronk Ramsey (2009). The climatic proxies set in the same scale are given after Starkel et al. (2006, 2013). Information about excavation context and mtDNA lineage of F.s. lybica/catus specimens are given next to age probability distribution
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: нцп Мај 28, 2022, 08:16:30 пре подне
 
Bioarchaeological and palaeogenomic portrait of two Pompeians that died during the eruption of Vesuvius in 79 AD

https://www.nature.com/articles/s41598-022-10899-1

26.05.2022.

Casa del Fabbro

Анализиране 2 јединке: мушкарац А (164cm) и жена В (151cm).

Само је мушкарац био подобан за анализу.

Хаплогрупа митохондријалне ДНК - припада хаплогрупи кладе ХВ0а, главној монофилетској грани ХВ0 и субклади хаплогрупе ХВ која  митохондријска лоза је одсутна међу објављеним римским царским појединцима из Италије. У Европи, први доказ о хаплогрупи ХВ потиче од појединца из магдаленског периода из Шпаније, док је у Италији од мезолита хаплогрупа ХВ повезана са раним расељавањем људи у Евроазији након последњег глацијалног максимума. Неравномерно је распрострањена широм Европе са највишим фреквенцијама на Блиском истоку (~11%) 33 , у јужној Европи (од ~4% до ~11%) 34 и на Балканском полуострву (~8%) 35 . ХВ0а  међу постојећим популацијама, честа је на Сардинији.

Утврђено је да појединац А, иако са малом покривеношћ, припада линији Y-хромозома А-М13 (А1б1б2б), реткој линији која је одсутна међу древним појединцима са италијанског полуострва, углавном пронађена у источној Африци (~ 40 %), али са познатим појавама, са много нижим фреквенцијама, на Блиском истоку (Турска, Јемен, Египат, Палестина, Јордан, Оман и Саудијска Арабија) и на медитеранским острвима Сардинија, Кипар и Лезбос.


Низводно од А-М13 појединац А је постављен на А-В5880, која садржи све А-М13 позитивне Сардинце из прошлих студија, а датирано је да је спајање било пре око 7,62 (± 0,92) хиљада година .
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Никац Новембар 10, 2022, 07:44:50 поподне
Анимација генетичке слике Хрватске од неолита до данас, с Антрогенике:

(https://i.imgur.com/58QYNBd.gif)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: CosicZ Јануар 04, 2023, 02:30:26 пре подне
Са https://inantro.hr/projekti/medunarodni-projekti/
Цитат
MEĐUNARODNI ZNANSTVENI PROJEKTI
BIOLOŠKA ANTROPOLOGIJA I BIOMEDICINA:

Austrijska zaklada za znanost:
RECONSTRUCTION OF GENETIC DIVERSITY AND MIGRATORY PATTERNS OF LATE AVAR POPULATION USING ANCIENT DNA ANALYSIS / 2021.-2022., Austrijska zaklada za znanost, Joint Excellence in Science and Humanities (JESH), voditeljica projekta: dr. sc. Dubravka Havaš Auguštin

Naslov: Rekonstrukcija genetičke raznolikosti i migracijskih obrazaca kasne avarske populacije pomoću analize drevne DNA

Trajanje: 2021. – 2022.

Financiranje: program Joint Excellence in Science and Humanities (JESH)

Voditeljica: dr. sc. Dubravka Havaš Auguštin, Centar za primijenjenu bioantropologiju, Institut za antropologiju, Zagreb, Hrvatska

Suradnici:

sc. Jelena Šarac, Centar za primijenjenu bioantropologiju, Institut za antropologiju, Zagreb, Hrvatska
sc. Mario Novak, Centar za primijenjenu bioantropologiju, Institut za antropologiju, Zagreb, Hrvatska
prof. dr. sc. Ron Pinhasi, Odjel za evolucijsku antropologiju, Sveučilište u Beču, Beč, Austrija
Sažetak:

Prema povijesnim i arheološkim nalazima, Avari su u srednju Europu stigli iz srednjih euroazijskih stepa u 6. stoljeću. Tijekom 200 godina njihove vladavine sve do propasti Avarskog kaganata ostavili su značajan trag, kako u materijalnim dobrima, tako i u arheološkim nalazima koji se mogu vidjeti na mnogim mjestima iskopavanja u Panonskom bazenu. Ipak, vrlo je malo poznato o njihovim migracijskim obrascima, genetičkoj povijesti i utjecaju na genetičku strukturu suvremenih Europljana. Svega nekoliko nedavnih genetičkih studija različitih avarskih skupina iz srednje Europe potvrdilo je kako je njihovo podrijetlo najvjerojatnije azijsko, što je vidljivo iz veće zastupljenosti haplogrupa mtDNA i Y kromosoma specifičnih za azijske populacije. Međutim, stupanj miješanja s različitim avarskim i drugim populacijama ostao je uglavnom neriješen.  Nadalje, podaci o genetičkom podrijetlu Avara s područja Hrvatske u potpunosti nedostaju te je njihova povezanost s drugim avarskim ili slavenskim populacijama još uvijek nepoznata. Cilj ovog projekta je istražiti genetičku raznolikost populacije Avara s groblja Šarengrad iz kasnog avarskog razdoblja (8. stoljeće),  korištenjem tehnologije sekvenciranja sljedeće generacije (engl. next generation sequencing, NGS) koja je nedavno omogućila značajne iskorake u proučavanju drevne DNA. Kompletna obrada uzoraka i analiza podataka obavit će se u jednom od najboljih europskih laboratorija za drevnu DNA analizu na Odjelu za evolucijsku antropologiju Sveučilišta u Beču kod prof. Rona Pinhasija. Dobiveni rezultati drevnih genoma Avara pružit će uvid u njihovo matrilinealno i patrilinealno nasljeđe te će biti povezani s podacima (bio)arheologije (kontekstualna analiza grobnih dobara, spola, starenja, patologije). Rezultati ovog projekta dat će odgovore na složena pitanja o avarskom načinu života, društvenoj organizaciji i njihovim migracijskim putevima na širem europskom području koja su stoljećima bila nerazriješena.

TRACING THE SLAVIC ORIGINS OF CROATIANS USING ANCIENT GENOMES / 2021.-2022., Austrijska zaklada za znanost, Joint Excellence in Science and Humanities (JESH) voditeljica projekta: dr. sc. Jelena Šarac

NAZIV PROJEKTA: Tragajući za slavenskim korijenima hrvatske populacije pomoću analize drevnih genoma

TRAJANJE PROJEKTA: 2021. – 2022.

FINANCIRANJE PROJEKTA: Austrijska akademija znanosti, JESH program

VODITELJ PROJEKTA: dr. sc. Jelena Šarac

SURADNICI:

sc. Dubravka Havaš Auguštin, Centar za primijenjenu bioantropologiju, Institut za antropologiju, Zagreb, Hrvatska
sc. Mario Novak, Centar za primijenjenu bioantropologiju, Institut za antropologiju, Zagreb, Hrvatska
prof. dr. sc. Ron Pinhasi, Departmen of Evolutionary Anthropology, University of Vienna, Vienna, Austria
SAŽETAK:

Razvoj tehnologije sekvenciranja sljedeće generacije i prepoznavanje koštanih ostataka kao bogatog izvora očuvane DNK, pretvorile su analize drevne DNK u revolucionarno novo oruđe za istraživanje prošlosti. Budući da se još uvijek malo zna o utjecaju različitih skupina stanovništva u srednjovjekovno doba (Slaveni, Avari, Huni, Mađari itd.) na genetički krajolik jugoistočne Europe i same Hrvatske, postalo je moguće analize drevne DNK iskoristiti za stjecanje novih spoznaja. Iako je fenomen „slavizacije“ Europe opisan u pisanim izvorima, pitanje materijalnih ostataka i dokaza o širenju Slavena u Hrvatsku i dalje je predmet rasprava i nejasno je u kojoj je mjeri ta srednjovjekovna kulturna transformacija utjecala na genetički krajolik Hrvatske. Stoga će ovaj projekt analizirati drevnu DNK jedinki s arheološkog nalazišta Jagodnjak-Krčevine u istočnoj Hrvatskoj koristeći tehnologiju sekvenciranja sljedeće generacije (NGS) kako bi se proširilo i produbilo znanje o 1000-godišnjem srednjovjekovnom razdoblju današnjeg hrvatskog teritorija. Obrada uzoraka i analiza podataka provest će se u specijaliziranom laboratoriju za analize drevne DNK na Sveučilištu u Beču, u suradnji s prof. dr. sc. Ronom Pinhasijem. Projektne aktivnosti uključivat će pripremu biblioteka drevne DNK, sekvenciranje uzoraka drevne DNK na Illumina platformi, bioinformatičku i biostatističku analizu podataka te izradu znanstvene publikacije na temelju rezultata projekta. Dobiveni rezultati pomoći će rasvijetliti utjecaj slavenskih migracija u ranom srednjem vijeku na hrvatski genetički krajolik, utvrditi stupanj miješanja između autohtone hrvatske populacije i pridošlica iz istočne/srednje Europe te omogućiti dublju karakterizaciju glavnih sastavnica genskog bazena srednjovjekovne Hrvatske na temelju sinteze podataka o drevnim autosomima, mitohondrijskoj DNK i kromosomima Y. Projekt će također omogućiti uvid u opće zdravstveno stanje istraživanje populacije i spolno uvjetovane migracijske događaje u testiranom ruralnom stanovništvu iz istočne Hrvatske.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: CosicZ Јануар 04, 2023, 02:39:12 пре подне
наставак
Цитат
BIOARHEOLGIJA I ARHEOLOGIJA:

HORIZON 2020:
SMART INTEGRATION OF GENETICS WITH SCIENCES OF THE PAST IN CORATIA: MINDING AND MENDING THE GAP (MendTheGap) (2016. – 2019., European Commission, HORIZON 2020, voditelj: prof. dr. sc. Stašo Forenbaher)

Horizon 2020 (H2020-TWINN-2015)
Web: http://mendthegap.agr.hr/
Smart Integration of Genetics with Sciences of the Past in Croatia: Minding and Mending the Gap (MendTheGap)
(692249 – MendTheGap)
Project duration: 1 February 2016 – 31 January 2019
Coordinator: CrEAMA (Croatian Eastern-Adriatic MIT disciplinary Archaeology Initiative)
(University of Zagreb Faculty of Agronomy, Croatian Academy of Sciences and Arts, Institute for Anthropological Research, University of Zagreb Faculty of Science, Croatian Natural History Museum, Cultural Centre Vela Luka)
Partners:
University of Cambridge (Cambridge, Great Britain)
University of Pisa (Pisa, Italy)

Summary of the project:


The first goal is to establish and integrate the existing MIT disciplinary scientific research community in Croatia. The second goal is to upgrade and intensify scientific research of CrEAMA Initiative by utilising recent methodological achievements in genetics (NGS) and other biological disciplines (GMM). The third goal is to foster integration of the CrEAMA Initiative into ERA. Our last goal is to commercialise and integrate the CrEAMA Initiative research with the needs of society (local community) at the local (Korčula Island), regional (Dalmatia), national, European (web) and global (web) level.

Bilateralni projekt Znanstveno –tehnološke suradnje s Mađarskom uz Ministarstvo znanosti i obrazovanja:
NAKON PROPASTI DREVNIH SVJETOVA – ŽIVOT I SMRT NA GRANICAMA GEPIDSKOG KRALJEVSTVA (2021. – 2023., Bilateralni projekt Znanstveno –tehnološke suradnje s Mađarskom, Ministarstvo znanosti i obrazovanja,voditelj projekta s Hrvatske strane: Dr. sc. Ivor Janković, Institut za antropologiju;voditelj projekta s Mađarske strane: Dr. sc. Tamás Szeczey, Hungarian Natural History Musem)
Projektni tim:
Dr. sc. Mario Novak,  Institut za antropologiju
Mario Carić, Instsitut za antropologiju
Dr. sc. Željka Bedić, Hrvatska akademija znanosti i umjetnosti
Anita Rapan Papeša, Gradski muzej Vinkovci
Dr. sc. Zsófia Rácz, Eötvös Loránd University, Institute for Archaeological Sciences
Dr. sc. Tamás Hajdu, Hungarian Natural History Musem
Krisztián Kiss, Hungarian Natural History Musem
Orsolya László,  Hungarian Natural History Musem

Opis projekta:
Prelazak iz kasne antike u rani srednji vijek u Karpatskoj kotlini je razdoblje brojnih političkih i društvenih promjena koje su rezultat propasti Zapadnog Rimskog Carstva i Hunske države. Stanovništvo ovog područja bilo je vrlo heterogeno što je posljedica uzastopnih migracijskih valova, a multietničku strukturu čine zajednice germanskih plemena iz stepskih područja i lokalni kasnoantički elementi. U borbama za vlast koje su uslijedile nakon propasti hunske hegemonije kao pobjednici izašli su Gepidi, germanska skupina nastanjena na istočnim i južnim dijelovima Karpatske kotline, koji su na tom području utemeljili svoje kraljevstvo (452.-568. god.). Gepidsko kraljevstvo je svoje političke temelje baziralo na zapadnoeuropskim tradicijama ranog srednjeg vijeka za razliku od države Huna koja se temeljila na nomadskim tradicijama iz Azije. Društvene i političke transformacije imale su za posljedicu značajne promjene u strukturi stanovništva, načinu života i općem zdravlju zajednica koje su tvorile novoustanovljeno kraljevstvo.

Predloženi projekt će pokušati steći bolji uvid u: (i) populacijsku homogenost / heterogenost tijekom gepidskog razdoblja; (ii) obilježja strukture stanovništva gepidskog doba u svjetlu političkih i kulturnih promjena; (iii) zdravstveni status populacija gepidskog razdoblja i promjene u načinu života i prehrani. Transformacija društveno-političkih sustava tijekom 5. stoljeća utjecala je i na živote tadašnjih ljudi. Promjene u načinu života kao i promjene gustoće stanovništva i mobilnosti su čimbenici koji imali značajan utjecaj na zdravstveni status. Kako bi bolje razumjeli epidemiološku situaciju potrebno je istražiti starosnu i spolnu učestalost određenih bolesti, njihovo prostornu raširenost te moguće spolne i dobne razlike razlike u prehrani.

Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology:
THE NEANDERTAL GENOME PROJECT (2008. – 2011., Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology, Njemačka, voditelj: akademik Pavao Rudan)
Voditelj projekta: Prof. Svante Paabo, Max Planck Institut za evolucijsku antropologiju, Leipzig, Njemačka
Voditelj hrvatskog istraživačkog tima: Akademik Pavao Rudan
Partneri:
Institut za antropologiju, Zagreb
Hrvatska akademija znanosti i umjetnosti
Berlin-Brandenburška akademija

An international consortium of researchers has sequenced the genome of our closest relative, the Neandertal.
In a paper released in Science on May 7, 2010 the team reports the sequencing of an initial draft of the genome. The sequence was generated from several Neandertal fossils from Croatia, Germany, Spain and Russia using high-throughput sequencing technologies.
Results indicate that Neandertals are slightly more closely related to modern humans outside Africa. The team also identified several genomic regions that appear to have played an important role during human evolution.
http://pastlives.inantro.hr/
http://prehistria.inantro.hr/en/home_page/
https://www.eva.mpg.de/genetics/genome-projects/neandertal/draft-neandertal-genome
http://inealcost.inantro.hr/
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: CosicZ Јануар 06, 2023, 06:20:43 пре подне
2023-01-03 https://www.theytree.com/portal/index/ancientsamples
Хаплогрупе из рада "Paleogenomics of Upper Paleolithic to Neolithic European hunter-gatherers - Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology" ( Y, mtDNA)

https://www.eupedia.com/forum/threads/42841-The-Selection-Landscape-and-Genetic-Legacy-of-Ancient-Eurasians-Preprint?p=663563
Цитат
ENA abstract
Paleogenomics of Upper Paleolithic to Neolithic European hunter-gatherers
Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology
19.12.2022

Eurasia has been populated by modern humans for over 45,000 years and for the vast majority of their time they relied on a foraging lifestyle. Our knowledge of the genetic relatedness and structure of European hunter-gatherers is, however, still limited, because dedicated studies are challenged by the scarce availability and poor molecular preservation of human remains from that period. Here we analyze 356 ancient hunter-gatherer genomes including new genomic data of 116 individuals from 14 countries in western and central Eurasia, dating between 35,000 and 5,000 years ago (35-5 ka). We identify a new genetic ancestry profile in individuals associated with the Upper Paleolithic Gravettian from western Europe, which is distinct from contemporaneous groups related to this archeological culture in central and southern Europe. However, it resembles that of preceding individuals associated with the Aurignacian and survives during the Last Glacial Maximum (LGM, ~25-19 ka) in human populations from southwestern Europe, associated with the Solutrean and later Magdalenian, which re-expanded northward and northeastward after the LGM. Conversely, we reveal a genetic turnover in southern Europe suggesting a local replacement of human groups during the LGM, alongside a north-to-south expansion of Epigravettian-associated populations. From at least 14 ka, a lineage related to this culture expands from the south across the rest of Europe largely replacing the Magdalenian-associated gene pool. After a period of limited admixture across the beginning of the Mesolithic, we find genetic interactions between western and eastern European hunter-gatherers, also characterized by marked differences in inherited phenotypic traits.
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB51862
https://edmond.mpdl.mpg.de/dataset.xhtml?persistentId=doi:10.17617/3.Y1KJMF

https://www.theytree.com/sample/a7ffee6b7e824909ec9f352499c4ca4b.html
https://www.theytree.com/tree/I-A17060
https://www.yfull.com/tree/I-Y45825/
https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-BY37319/tree
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Кековац Мај 09, 2023, 12:50:52 поподне
Верујем да ће многим љубитељима археогенетска бити занимљив овај видео јер нуди краћи увид у процес истраживања и обраде резултата на једном заиста великом пројекту
https://youtube.com/v/myla0_cCEWU
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Симеон Волос Јун 07, 2023, 03:11:10 поподне
https://www.novosti.rs/reportaze/vesti/1246259/harvard-otkriva-proslost-sveta-viminacijumu-srpski-arheoloski-institut-vodeci-americki-univerzitet-pocinju-svetski-dnk-projekat
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Зрно Јун 07, 2023, 03:40:31 поподне
https://www.novosti.rs/reportaze/vesti/1246259/harvard-otkriva-proslost-sveta-viminacijumu-srpski-arheoloski-institut-vodeci-americki-univerzitet-pocinju-svetski-dnk-projekat


1.000 скелета!!!! То би било врх.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Кековац Јун 07, 2023, 03:50:51 поподне
https://www.novosti.rs/reportaze/vesti/1246259/harvard-otkriva-proslost-sveta-viminacijumu-srpski-arheoloski-institut-vodeci-americki-univerzitet-pocinju-svetski-dnk-projekat

Цитат
- Na ovaj način dobićemo jasniju sliku o stanovništvu Balkana tokom prvog milenijuma naše ere - kaže prof. dr Miomir Korać, dugogodišnji direktor Arheološkog instituta i rukovodilac projekta "Viminacijum - rimski grad i vojni logor". - Ovi rezultati se mogu dobiti samo istraživanjem velikog broja uzoraka, oko 1.000 skeleta, a tako veliku nekropolu ima samo Viminacijum.

Сјајна вест.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Јун 07, 2023, 04:04:33 поподне
https://www.novosti.rs/reportaze/vesti/1246259/harvard-otkriva-proslost-sveta-viminacijumu-srpski-arheoloski-institut-vodeci-americki-univerzitet-pocinju-svetski-dnk-projekat

О овоме ће професор Харпер да говори сутра у 18 часова у свечаној сали САНУ.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Ивица Јовановић Јун 07, 2023, 04:07:42 поподне
Necu se radovati dok rezultati ne budu na Yfull ili ftDNA. Tako sam se radovao i za proslo istrazivanje, eno ga jos u preprintu. Normalno ocekujem gomilu L70, i to je tako.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Кековац Јун 07, 2023, 04:43:21 поподне
О овоме ће професор Харпер да говори сутра у 18 часова у свечаној сали САНУ.

Да ли ће Порекло да сними ово предавање и постави на свој YT канал? Видим да ће бити директан пренос преко сајта САНУ али не ни било лоше и да буде на YT.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Драган Обреновић Јун 07, 2023, 05:10:26 поподне
О овоме ће професор Харпер да говори сутра у 18 часова у свечаној сали САНУ.

Надамо се да ћеш нам овде написати барем сажети извештај са предавања :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Јун 07, 2023, 07:16:10 поподне
Да ли ће Порекло да сними ово предавање и постави на свој YT канал? Видим да ће бити директан пренос преко сајта САНУ али не ни било лоше и да буде на YT.

Можда ће бити, видећемо.  ;)

Надамо се да ћеш нам овде написати барем сажети извештај са предавања :)

Наравно.  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Radul Јун 07, 2023, 10:43:58 поподне
Necu se radovati dok rezultati ne budu na Yfull ili ftDNA. Tako sam se radovao i za proslo istrazivanje, eno ga jos u preprintu. Normalno ocekujem gomilu L70, i to je tako.
Потписујем :D ; очекујем и Криче, М67 свих могућих грана, Ј1 и навијам за неког мог S8230.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Be like Bill Јун 08, 2023, 06:01:10 пре подне
Ako se neko nađe na samom predavanju, da li može postaviti pitanje oko uzorka I18719 iz Bezdanjače, da li bi bilo moguće uraditi njegovu dataciju uz pomoć C14 ili sličnog metoda?
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Јун 08, 2023, 04:15:44 поподне
Ako se neko nađe na samom predavanju, da li može postaviti pitanje oko uzorka I18719 iz Bezdanjače, da li bi bilo moguće uraditi njegovu dataciju uz pomoć C14 ili sličnog metoda?

Нисам сигуран да ли ће о Бездањачи бити речи јер је у питању предавање о генетском наслеђу римског подунавског лимеса.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: drajver Јун 08, 2023, 04:25:27 поподне
Нисам сигуран да ли ће о Бездањачи бити речи јер је у питању предавање о генетском наслеђу римског подунавског лимеса.

Не знам да ли сте примјетили, али у овом раду о Албанцима су споменули и узорке из Бездањаче. Ево њиховог коментара.

"We mention here naming differences based on a re-interpretation of the samples in question. Individuals I18723, I18721, I18719 from Bezdanjača Cave in Croatia, which were archaeologically dated to the Bronze Age (1500-800 BCE), were interpreted in previous studies as outliers compared to the contemporary population of Croatia (5, 6). We argue that based on insights from the PCA and their uniparental markers, these outlying individuals likely date to post- Medieval times. Individuals I18721 and I18719 are assigned to haplogroup I2-M423>I-Y3120 (Table S23), which is associated with the Slavic expansion toward southern Europe during the Migration Period, and has experienced major founder effects in the South Slavic population of the Balkans (48, 68, 82). This haplogroup is extremely unlikely to have entered the Western Balkans in the Bronze Age, as our extensive haplogroup dataset shows that subclades downstream of I2-M423 appear in the region primarily during the Migration Period (Fig. 8), as expected. Occasional migrants from the Balto-Slavic world to southern Europe are known in the Iron Age, such as two mercenaries from the Battle of Himera in Sicily (58). However, the Bezdanjača Cave outliers are unlikely to represent BA migrants from northern Europe, as the mitochondrial haplogroup of individual I18719 (HV0a1a1b), has a TMRCA of 225 years before present with a person from modern Germany (77). Furthermore, previous archaeological studies in Bezdanjača Cave radiocarbon-dated an ancient individual to the 17th century CE, and also reported the remains of two skeletons which date to World War II (86). Another sample that might be misdated is I13170 from Velika Gruda in Montenegro, attributed to the Iron Age (800-400 BCE) (6). This individual, which was not radiocarbon dated, clustered with modern South Slavs (6), and was therefore excluded from our analyses."
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Јун 08, 2023, 10:06:15 поподне
Не знам да ли сте примјетили, али у овом раду о Албанцима су споменули и узорке из Бездањаче. Ево њиховог коментара.

"We mention here naming differences based on a re-interpretation of the samples in question. Individuals I18723, I18721, I18719 from Bezdanjača Cave in Croatia, which were archaeologically dated to the Bronze Age (1500-800 BCE), were interpreted in previous studies as outliers compared to the contemporary population of Croatia (5, 6). We argue that based on insights from the PCA and their uniparental markers, these outlying individuals likely date to post- Medieval times. Individuals I18721 and I18719 are assigned to haplogroup I2-M423>I-Y3120 (Table S23), which is associated with the Slavic expansion toward southern Europe during the Migration Period, and has experienced major founder effects in the South Slavic population of the Balkans (48, 68, 82). This haplogroup is extremely unlikely to have entered the Western Balkans in the Bronze Age, as our extensive haplogroup dataset shows that subclades downstream of I2-M423 appear in the region primarily during the Migration Period (Fig. 8), as expected. Occasional migrants from the Balto-Slavic world to southern Europe are known in the Iron Age, such as two mercenaries from the Battle of Himera in Sicily (58). However, the Bezdanjača Cave outliers are unlikely to represent BA migrants from northern Europe, as the mitochondrial haplogroup of individual I18719 (HV0a1a1b), has a TMRCA of 225 years before present with a person from modern Germany (77). Furthermore, previous archaeological studies in Bezdanjača Cave radiocarbon-dated an ancient individual to the 17th century CE, and also reported the remains of two skeletons which date to World War II (86). Another sample that might be misdated is I13170 from Velika Gruda in Montenegro, attributed to the Iron Age (800-400 BCE) (6). This individual, which was not radiocarbon dated, clustered with modern South Slavs (6), and was therefore excluded from our analyses."

Добро је да је неко то поменуо у научном раду, било је крајње време да се каже оно што је нама мање-више од почетка било очигледно.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Јун 08, 2023, 10:14:12 поподне
Добро је да је неко то поменуо у научном раду, било је крајње време да се каже оно што је нама мање-више од почетка било очигледно.

Иначе, предавање је било помало "разочаравајуће", јер је археогенетика поменута само у контексту рада о коме је већ било речи у прошлогодишњем предавању Карлоса Лалуезе Фокса, а који се тренутно налази у процесу "прегледа" (review). Предавач је историчар и углавном је говорио мање-више познате ствари о кризи 3. века и њеним последицама по Римско Царство, о значају Доње Паноније и Горње Мезије због порекла римских царева који су Империју поново подигли на ноге, као и о климатским и епидемиолошким променама које су се догађале од 3. до 7. века. У том смислу је занимљиво да је готово цео 3. век био знатно хладнији од просека, а исто се може рећи и за 6. век, па је указао да би то могао бити један од узрока унутрашње кризе у Римском Царству као и појачаног притиска варвара који су желели да се преселе како би преживели неродне године. Такође су значајне три епидемије - Антонинска (160-их и 170-их), Кипријанова (251-266) и Јустинијанска (540-их до 720-их). Једино се за Јустинијанску сигурно зна узрочник (бубонска куга), за ове раније две нису сигурни да ли је то у питању или нека друга заразна болест.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Кековац Јун 09, 2023, 09:43:06 поподне
Добро је да је неко то поменуо у научном раду, било је крајње време да се каже оно што је нама мање-више од почетка било очигледно.

Ево и признања из рада на страни 38:

Цитат
The authors thank Ted Kandell (Open Genomes)and Milan Rajevac (Open Genomes, the Society of   Serbian   Genealogists   "Poreklo")for   providing   detailed   Y-chromosome   haplogroup determinations for part of the examined dataset.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Јун 10, 2023, 08:13:23 поподне
Ево и признања из рада на страни 38:

Ово је свакако велико признање.  :)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: CosicZ Август 02, 2023, 05:26:51 пре подне
Овде покушавају да доведу у везу ширење индоевропских језика са археогенетским налазима т.ј. са ширењем CHG генетике.
https://phys.org/news/2023-07-insights-indo-european-languages.html
Цитат
These analyses estimate the Indo-European family to be approximately 8,100 years old, with five main branches already split off by around 7,000 years ago.

These results are not entirely consistent with either the Steppe or the farming hypotheses. The first author of the study, Paul Heggarty, observed that, "Recent ancient DNA data suggest that the Anatolian branch of Indo-European did not emerge from the Steppe, but from further south, in or near the northern arc of the Fertile Crescent—as the earliest source of the Indo-European family. Our language family tree topology, and our lineage split dates, point to other early branches that may also have spread directly from there, not through the Steppe."

New insights from genetics and linguistics
The authors of the study therefore proposed a new hybrid hypothesis for the origin of the Indo-European languages, with an ultimate homeland south of the Caucasus and a subsequent branch northwards onto the Steppe, as a secondary homeland for some branches of Indo-European entering Europe with the later Yamnaya and Corded Ware-associated expansions.

"Ancient DNA and language phylogenetics thus combine to suggest that the resolution to the 200-year-old Indo-European enigma lies in a hybrid of the farming and Steppe hypotheses," said Gray.

Wolfgang Haak, a Group Leader in the Department of Archaeogenetics at the Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology, says, "Aside from a refined time estimate for the overall language tree, the tree topology and branching order are most critical for the alignment with key archaeological events and shifting ancestry patterns seen in the ancient human genome data. This is a huge step forward from the mutually exclusive, previous scenarios, towards a more plausible model that integrates archaeological, anthropological and genetic findings."
(https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800a/2023/new-insights-into-the-13.jpg)

https://www.science.org/doi/10.1126/science.abg0818
Цитат
It remains unclear, however, where this family’s common ancestral language (Proto-Indo-European) was initially spoken and when and why it spread through Eurasia. The “Steppe” hypothesis posits an expansion out of the Pontic-Caspian Steppe, no earlier than 6500 years before present (yr B.P.), and mostly with horse-based pastoralism from ~5000 yr B.P. An alternative “Anatolian” or “farming” hypothesis posits that Indo-European dispersed with agriculture out of parts of the Fertile Crescent, beginning as early as ~9500 to 8500 yr B.P.

Editor’s summary
Languages of the Indo-European family are spoken by almost half of the world’s population, but their origins and patterns of spread are disputed. Heggarty et al. present a database of 109 modern and 52 time-calibrated historical Indo-European languages, which they analyzed with models of Bayesian phylogenetic inference. Their results suggest an emergence of Indo-European languages around 8000 years before present. This is a deeper root date than previously thought, and it fits with an initial origin south of the Caucasus followed by a branch northward into the Steppe region. These findings lead to a “hybrid hypothesis” that reconciles current linguistic and ancient DNA evidence from both the eastern Fertile Crescent (as a primary source) and the steppe (as a secondary homeland). —Sacha Vignieri

Our results are not entirely consistent with either the Steppe hypothesis or the farming hypothesis. Recent aDNA evidence suggests that the Anatolian branch cannot be sourced to the steppe but rather to south of the Caucasus. For other branches, potential candidate expansion(s) out of the Yamnaya culture are detectable in aDNA, but some had only limited genetic impact. Our results reveal that these expansions from ~5000 yr B.P. onward also came too late for the language chronology of Indo-European divergence. They are consistent, however, with an ultimate homeland south of the Caucasus and a subsequent branch northward onto the steppe, as a secondary homeland for some branches of Indo-European entering Europe with the later Corded Ware–associated expansions.
(https://www.science.org/cms/10.1126/science.abg0818/asset/289d8006-e849-4201-b0f6-69174a873320/assets/images/large/science.abg0818-fa.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: CosicZ Август 02, 2023, 05:40:27 пре подне
https://www.science.org/doi/suppl/10.1126/science.abg0818/suppl_file/science.abg0818_sm.pdf
Цитат
2.1.4 LATEST ADNA RESULTS AND ALTERNATIVES TO THE STEPPE HYPOTHESIS
Recently published aDNA findings in Europe significantly update and refine the first major results (16). Notably,
populations of the Yamnaya culture on the Pontic-Caspian Steppe no longer appear as the whole or even main
source of the new ancestry component that spread into Central Europe from c. 5000 BP, from further to the east.
The ancestry predominant in aDNA samples from early Corded Ware contexts has recently been reported (39) to
have originated not on the Pontic-Caspian grassland steppe, but further to the north in the ‘forest steppe’ of the
Middle Dnepr region, and towards the Baltic (85). The ancestry predominant in Yamnaya samples entered Central
Europe via the Danubian corridor in a separate expansion further to the south. This conclusion has been challenged
in (23), arguing that the Yamnaya culture on the Pontic-Caspian cannot be excluded as a primary source for Corded
Ware samples, within the limits of the statistical resolution of their analysis. That inference, however, is a function
of the low resolution of their chosen analysis, and of the fact that both Yamnaya and Corded Ware ultimately derive
from a very similar Eneolithic ancestry background that formed c. 7000 BP once CHG ancestry spread north across
the Caucasus.
Recent aDNA results have also more clearly identified an additional, earlier east-to-west expansion, which brought
into the Eastern Mediterranean and the Balkans a quite different ancestry component, predominantly CHG/Iranian
(86, 44, 87). The homogenization of Anatolian and Iranian Neolithic ancestry is attested in Anatolia and the Near
East around 8500 BP (22), from where the mixed ancestry spread westward c. 7000 BP, which is best explained by
continued contacts with the eastern Mediterranean during the Chalcolithic and early Bronze Age (86, 44, 87).
Notably, the westward dissemination of CHG/Iranian, albeit in mixed form and not as a distinct migration event,
predated the expansions from the forest and grassland Steppe by approximately two millennia.
These updated aDNA findings open up potential correlations with processes of expansion and divergence attested
in the topology of the Indo-European language family. By the time that distinct forest vs. grassland steppe
ancestries were expanding westwards deeper into Europe (after c. 5000 BP, by the radiocarbon dating of the aDNA
samples), the linguistic chronology we report here has one already existing split, estimated around 6370 BP (4940-
7860 BP), between branches that make for at least a prima facie rough geographical and chronological fit: the BaltoSlavic clade as opposed to the joint clade of Germanic+Celtic+Italic. Further south, the expansion of CHG/Iranian
ancestry into the eastern Mediterranean and Balkans, without passing through the Steppe (48) and thus without
major admixture with EHG ancestry, presents a closer chronological and geographical match with the remaining,
deeper European branches in our topology, namely Albanian, Greek and Armenian. (To these might be added other
‘Paleo-Balkan’ branches, known of and identifiable as some form of Indo-European, but long since extinct and too
scantily documented to be placed reliably within the Indo-European topology.)
Ancient DNA evidence from the Fertile Crescent (46, 47) has already pointed to a scenario for the origins and
spread of agriculture that is more complex than the original farming hypothesis in which Indo-European languages
spread with the first farmers both westwards into Balkan Europe and eastwards to the Indus. The hybrid
hypothesis, in which some branches of Indo-European reach (Northern) Europe via the steppe as a secondary
homeland, fits with aDNA evidence that starting from c. 7000 BP, populations of the Pontic-Caspian steppe derived
approximately half of their ancestry from a source first found from the southern Caucasus to north-western Iran
(48). On the route by which this CHG/Iranian ancestry reached the Steppe, aDNA evidence is not yet sufficient to
exclude a route via Central Asia, i.e. first eastwards and then north and westwards, counter-clockwise around the
Caspian, as hypothesized in (54). Nonetheless, the more parsimonious explanation, also given the aDNA record for
time-transects through the Caucasus (48), would be a far shorter route directly northwards through the Caucasus,
in line with corresponding expansions in material culture in the archaeological record (48, 88).
Recent aDNA results from the Fertile Crescent and Western Asia more widely (21, 22, 23) find no intrusion of
Steppe ancestry into the region that spoke the Anatolian branch of Indo-European, as entailed by the Steppe
hypothesis. They do detect, however, “an admixture event that biologically connected” regions from Western
Anatolia to the Zagros in northern Iran, admixed into a common “Anatolian/Iranian ancestry cline” (22). Possible
scenarios include population movements westwards and eastwards out of the northern Fertile Crescent, which
could correlate with the early splits to the Anatolian and Indo-Iranic branches in a hybrid hypothesis for IndoEuropean origins.
This admixture event has been dated to c. 8500 BP (22).
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Август 02, 2023, 08:45:27 пре подне
Типично "померање лествице", где покушавају да нађу средину између нетачне хипотезе (Ренфруова о блискоисточним неолитским земљорадницима као носиоцима протоиндоевропског језика) и тачне хипотезе (бронзанодопски сточари из украјинско-руских степа као носиоци протоиндоевропског језика), која је самим тим у најбољем случају полутачна. Такође ми се чини да је у питању још једна појава, раширена у академским и научним круговима на Западу, а то је - осмишљавање нове "револуционарне" хипотезе која ће (тако се барем нада аутор) да у великој мери обесмисли све оне пре ње, а њему донесе признање и славу као "револуционару" (с обзиром да је број истраживача огроман, многи тај метод користе као "пречицу" како би се истакли и како би се за њих чуло, што последично може донети прилив новчаних средстава), без обзира да ли таква хипотеза заиста има смисла или је њен једини "смисао" стварање "шока" који ће друге научнике натерати или да се за њу изјасне (ретко) или да је жестоко оповргавају(много чешће), чиме је постигнут циљ аутора - за њега се чуло. И тако сваке године барем по једна "револуционарна" хипотеза...
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: CosicZ Август 03, 2023, 05:54:11 пре подне
Све указује на то да се R1a-Z93 из Источне Европе преко евроазијске степе ( дакле морали су бити у суседству језика којима је признат "степски" карактер) проширила до Блиског Истока и Индије и да су њени носиоци вероватно били говорници иранског или можда индоиранског језика. Треба одговорити на питање када су се везе између појединих индоевропских језика прекинуле, јер то указује на то да њихови говорници више нису живели у близини.

(https://th.bing.com/th/id/OIF.Q3gCiPxQvyuBFpyNUr8Egg?pid=ImgDet&rs=1)
Сличан прорачун из 2003, пре археогенетике.
https://www.science.org/content/article/earlier-birth-indo-european-languages
(https://www.science.org/do/10.1126/article.35664/full/2003112611-1644938338943.jpg)
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Август 03, 2023, 08:49:00 пре подне
Све указује на то да се R1a-Z93 из Источне Европе преко евроазијске степе ( дакле морали су бити у суседству језика којима је признат "степски" карактер) проширила до Блиског Истока и Индије и да су њени носиоци вероватно били говорници иранског или можда индоиранског језика. Треба одговорити на питање када су се везе између појединих индоевропских језика прекинуле, јер то указује на то да њихови говорници више нису живели у близини.

(https://th.bing.com/th/id/OIF.Q3gCiPxQvyuBFpyNUr8Egg?pid=ImgDet&rs=1)
Сличан прорачун из 2003, пре археогенетике.
https://www.science.org/content/article/earlier-birth-indo-european-languages
(https://www.science.org/do/10.1126/article.35664/full/2003112611-1644938338943.jpg)

Ако су за ову процену временског одвајања грана индоевропских језика користили глотохронологију или нешто слично томе, онда то уопште није поуздан метод за неко прецизније разврставање, јер колико год људи покушавали да лингвистику сведу на математичке функције, то је немогуће јер је језик "жива ствар" и у складу са тим може бити прилично "непредвидљив". Непоузданост глотохронологије је сликовито описао један лингвиста-јутјубер:

https://www.youtube.com/v/evJ_E7k1pvY

https://www.youtube.com/v/akVBtIPOnNI
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Никац Август 03, 2023, 11:12:20 пре подне
Све указује на то да се R1a-Z93 из Источне Европе преко евроазијске степе ( дакле морали су бити у суседству језика којима је признат "степски" карактер) проширила до Блиског Истока и Индије и да су њени носиоци вероватно били говорници иранског или можда индоиранског језика. Треба одговорити на питање када су се везе између појединих индоевропских језика прекинуле, јер то указује на то да њихови говорници више нису живели у близини.

(https://th.bing.com/th/id/OIF.Q3gCiPxQvyuBFpyNUr8Egg?pid=ImgDet&rs=1)
Сличан прорачун из 2003, пре археогенетике.
https://www.science.org/content/article/earlier-birth-indo-european-languages
(https://www.science.org/do/10.1126/article.35664/full/2003112611-1644938338943.jpg)

Postoji četvrti scenario za koji znamo već nekoliko godina pomoću drevne DNK, a ovdje ga nisu prikazali.

Populacija vrpčaste keramike (corded ware) migrira sa stepe u Njemačko-Poljsku niziju, i odavdje se šire  balto-slovenski , germanski i italo-keltski. R1a-Z93, tj. Indo-Iranci su takođe živjeli ovdje (npr. brojni uzorci Fatjanovo kulture iz današnje sjeverne Rusije) pa se krajem bronzanog doba opet vraćaju na stepu.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: сɣнце Август 03, 2023, 02:21:08 поподне
Postoji četvrti scenario za koji znamo već nekoliko godina pomoću drevne DNK, a ovdje ga nisu prikazali.

Populacija vrpčaste keramike (corded ware) migrira sa stepe u Njemačko-Poljsku niziju, i odavdje se šire  balto-slovenski , germanski i italo-keltski. R1a-Z93, tj. Indo-Iranci su takođe živjeli ovdje (npr. brojni uzorci Fatjanovo kulture iz današnje sjeverne Rusije) pa se krajem bronzanog doba opet vraćaju na stepu.

Реалан почетак издвајања прааријскога језика процјењујем грубо на добо 3000-2900 пређе Христа на подручију арх.култ. Фатјаново.
Једна одлика народа који дијеле мутацију R-Z645 је сатемизација, која се дакле могла десити за времена те мутације пређе раздвајања.
Што се тиче ПИЕ два основна носиоца су R1a и R1b. Води се голема расправа о том ко је кому предао ПИЕ језик.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Кековац Август 04, 2023, 08:18:01 пре подне
Postoji četvrti scenario za koji znamo već nekoliko godina pomoću drevne DNK, a ovdje ga nisu prikazali.

Populacija vrpčaste keramike (corded ware) migrira sa stepe u Njemačko-Poljsku niziju, i odavdje se šire  balto-slovenski , germanski i italo-keltski. R1a-Z93, tj. Indo-Iranci su takođe živjeli ovdje (npr. brojni uzorci Fatjanovo kulture iz današnje sjeverne Rusije) pa se krajem bronzanog doba opet vraćaju na stepu.

Хипотеза 3 (хибридни модел) предвиђа овај сценарио, само је слабије видљив на мапи јер се скоро иста боја користи за Јамнајце (светло зелена) и Кордидверце (тамно зелена). Ово је разрада идеје из рада који је публиковао Лазаридис са сарадницима прошле године у коме је анализирано преко 700 скелета, претежно из Анадолије, али и са Кавказа, јужне Русије и Балкана, па је постављена хипотеза да је прото-Индо-Анадолски настао у CHG популацији, која се изгледа помешала и са народима северно од Кавказа где је настао прото-Индоевропски и са народима Анадолије, где су настали анадолски језици. Дискутовали смо већ о овој хипотези на теми о Грцима. Видим да сад овде и Грчки и Албански смештају у групу која се из предложене прото-Индо-Анадолске прапостојбине јужно од Кавказа сели на Балкан јужном рутом преко Анадолије, а не северном, преко Кавказа, југа Русије и Украјине, па даље на Балкан. Врло смела хипотеза рекао бих. Биће доста полемике око ње између генетичара и лингвиста.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Август 04, 2023, 10:06:55 пре подне
Дискутовали смо већ о овој хипотези на теми о Грцима. Видим да сад овде и Грчки и Албански смештају у групу која се из предложене прото-Индо-Анадолске прапостојбине јужно од Кавказа сели на Балкан јужном рутом преко Анадолије, а не северном, преко Кавказа, југа Русије и Украјине, па даље на Балкан. Врло смела хипотеза рекао бих. Биће доста полемике око ње између генетичара и лингвиста.

Мислим да за ово немају буквално никаквих доказа. Анадолска грана индоевропских језика је подједнако удаљена од предака грчког и албанског као што је удаљена и од келтских, германских, индоиранских и осталих језика. Штавише, знам да сам на више места читао да претка грчког доводе у везу са индоиранским језицима, у смислу ареалног контакта у прадомовини. Такође не треба трошити речи на то да археолошки нису присутни никакви трагови некаквог анадолског досељавања на Балкан током енеолита и бронзаног доба, док насупрот томе има више доказа о утицају и досељавањима са подручја степе, и то у више таласа.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: Кековац Август 04, 2023, 11:33:52 пре подне
Мислим да за ово немају буквално никаквих доказа. Анадолска грана индоевропских језика је подједнако удаљена од предака грчког и албанског као што је удаљена и од келтских, германских, индоиранских и осталих језика. Штавише, знам да сам на више места читао да претка грчког доводе у везу са индоиранским језицима, у смислу ареалног контакта у прадомовини. Такође не треба трошити речи на то да археолошки нису присутни никакви трагови некаквог анадолског досељавања на Балкан током енеолита и бронзаног доба, док насупрот томе има више доказа о утицају и досељавањима са подручја степе, и то у више таласа.

И ја сам тренутно мишљења да је Грчки на Балкан дошао овим северним правцем. Само констатујем каква је хипотеза постављена.
Наслов: Одг: Древна ДНК
Порука од: НиколаВук Август 18, 2023, 10:42:11 пре подне
Занимљиво откриће у Француској - археогенетичари су успели да направе врло прецизно породично стабло користећи биолошки материјал 94 индивидуе са неолитског налазишта у околини Париза (датованог пре 6700 година, односно око 4700. год. п.н.е.):

https://archaeologymag.com/2023/08/largest-genetic-family-tree-for-neolithic-people-in-france/

Осим Y-ДНК и митохондријалних хаплогрупа, успели су да открију и друштвене одлике те неолитске заједнице, као што је патрилокалност и моногамност.