Алгоритам YFulla ради у обе варијанте и HG38 и HG19, тако да не видим разлог да не прихвате Hg19. Иначе, мање више је свеједно да ли ће бити обрађено у Hg19 или Hg38, ту може бити ситних разлика, али не само у корист Hg38 већ и обрнуто.
На YFullu кажу да је Hg38 захватио и неке регионе близу центромере и да су услијед тога појављују додатни непоуздани SNP-ови, од којих нема пуно користи,а могу навести на пограшан траг.
Моји резултати су нпр и даље у Hg19 формату. Мислим да није неопходно пребацивати у Hg38.