Аутор Тема: Древна ДНК - научни радови  (Прочитано 227025 пута)

Ван мреже Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2511
  • I2-BY55783>BY79593
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #40 послато: Март 10, 2017, 12:19:48 пре подне »
Што се тиче E-V13, мислим да је неолитска бутмирска култура, раширена на простору БиХ, ЦГ и Хрватске, била један од главних "резервоара" ове хаплогрупе, али да су њени припадници остали на неки начин изоловани од главних неолитских миграторних токова (хаплогрупе G2a, H2 и остале); накнадна нагла експанзија E-V13 је вероватно последица асимилације њених носилаца са ИЕ. Тако да, сада када уопштено знамо генетску слику "неолићана" на подручју Паноније и централне Европе, требало би се позабавити унутрашњошћу ЈИ Европе.

Доњи ток Дунава, са неолитским културама Караново-Гумелница и Кукутени-Трипоље североисточније је припадао истом културном ареалу (балканско-анадолском) као и Старчево и Винча, па претпостављам да је и генетски састав неолитског становништва те области био сличан старчевачко-винчанском, дакле доминација G2a, H2 и евентуално неке варијанте I2a. Као што рече Синиша, бутмирска култура није део тог ареала већ је везана за Медитеран и Кардијум-Импресо културу која јој је претходила; северноафричка провенијенција хг E-V13 ми више нагиње ка њеној миграцији из Африке преко мора у Европу, а не преко Анадолије из области Плодног Полумесеца као G2a и H2.

И овај најновији рад је потврдио да Е-V13 скоро сигурно није била део оригиналних неолитских фармера са Блиског Истока, и слажем се са Николом да је најбољи кандидат за "извориште" ове хаплогрупе бутмирска култура. У новом раду је пронађен узорак из периода Ленђелске културе који је припадао грани предачкој V13: VEJ4a/I1900, 4796-4685 BC, E1b1b1a1b1-L618. Ево шта аутори рада кажу о овој и претходној Сопотској култури:

Цитат
The further cultural development of the eastern and western parts of the Carpathian Basin remained mostly distinct in the local Late Neolithic (ca. 5000-4500 BCE), with the transition of the Szakálhát and late ALPc to the Tisza culture in the East; and the spread of the Sopot culture of southern origin, followed by the Lengyel cultural orbit, surviving until 4300 BCE to the western part of today’s Hungary.

Дакле, Сопотска и наредна Ленђелска култура нису "природне" наследнице најранијих неолитских култура, већ им је порекло са југа, а то је управо подручје Бутмирске културе, и овај L618 узорак савршено иде у прилог пореклу L618/V13 из бутмирске културе.

Слажем се и по питању Трипољске културе, она је последица досељавања неолитских фармера из Старчево-Крис-Корош комплекса, па и ту треба без сумње очекивати пре свега хаплогрупе G2a2 и H2, мада је могуће и да је један део претходне Бушко-Дњестарске популације апсорбован, па нас не треба изненадити ако се у будућности међу Трипољцима открију и неке друге хаплогрупе, као што су R1a, R1b и I2a.

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #41 послато: Март 10, 2017, 12:31:58 поподне »
Штета :P :D
Ништа, чекамо онда то фамозно истраживање неолита Бугарске и БЈРМ које ће надам се бити објављено ускоро.

Исправка, постоји нешто мало скелета ископаних са две некрополе касноантичког беског хоризонта, колико се сећам, са локалитета Поповјане код Самокова у Бугарској (у подножју Витоше) и Стојкове њиве код Доње Љубате (Босилеград) у Србији. Они потичу из најкаснијег периода овог хоризонта, друге половине 4. века, када је христијанизација почела да буде видљива на основу промене гробног ритуса (инхумација уместо инцинерације). Додуше, када би узели генетски узорак са тих скелета, то би било равно светском чуду.
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Србин

  • Помоћник
  • ****
  • Поруке: 164
  • Y-DNA: I2a-Z17855>BY190177
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #42 послато: Март 14, 2017, 05:46:59 поподне »
Навалише, нема шта.

https://link.springer.com/article/10.1007/s00439-017-1770-2

^^^Балановски ет. ал."Genetic differentiation between upland and lowland populations shapes the Y-chromosomal landscape of West Asia".

Цитат
The ancient Yamnaya samples are located on the “eastern” R-GG400 branch of haplogroup R1b-L23, showing that the paternal descendants of the Yamnaya still live in the Pontic steppe and that the ancient Yamnaya population was not an important source of paternal lineages in present-day West Europeans.

Откривен је нови "источни" огранак GG400 "источне" R1b-L23. Стога аутори сматрају да потомци Јамнајаца по мушкој линији још увек живе у Понтијској степи као и да древна популација Јамна културе није била важан извор мушких линија код данашњих западних Европљана.

Ван мреже Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2511
  • I2-BY55783>BY79593
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #43 послато: Март 14, 2017, 08:03:57 поподне »
Навалише, нема шта.

https://link.springer.com/article/10.1007/s00439-017-1770-2

^^^Балановски ет. ал."Genetic differentiation between upland and lowland populations shapes the Y-chromosomal landscape of West Asia".

Откривен је нови "источни" огранак GG400 "источне" R1b-L23. Стога аутори сматрају да потомци Јамнајаца по мушкој линији још увек живе у Понтијској степи као и да древна популација Јамна културе није била важан извор мушких линија код данашњих западних Европљана.

Овај рад није о древној ДНК већ о модерним популацијама, а мислим да сам и раније помињао да ова GG400 не представља никакву нову грану источне R1b, већ је у питању добро нам позната Z2103. Ништа ново нисмо сазнали, одавно је познато да је Z2103 и данас заступљена код неких степских народа, пре свега код Башкира, док је прилично ретка у Западној Европи. Заиста неозбиљно од Балановског, не знам шта бих више рекао.

Ван мреже Србин

  • Помоћник
  • ****
  • Поруке: 164
  • Y-DNA: I2a-Z17855>BY190177
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #44 послато: Март 14, 2017, 08:52:19 поподне »
Овај рад није о древној ДНК већ о модерним популацијама, а мислим да сам и раније помињао да ова GG400 не представља никакву нову грану источне R1b, већ је у питању добро нам позната Z2103. Ништа ново нисмо сазнали, одавно је познато да је Z2103 и данас заступљена код неких степских народа, пре свега код Башкира, док је прилично ретка у Западној Европи. Заиста неозбиљно од Балановског, не знам шта бих више рекао.

У контексту је древне Јамна популације али можда је боље пребацити у неку другу прикладнију тему.  ;)

На Eurogenes-у је прокоментарисано као "epic fail".

Још мало па ће завршити као Кљосов.

Ван мреже Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2511
  • I2-BY55783>BY79593
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #45 послато: Март 14, 2017, 09:00:43 поподне »
У контексту је древне Јамна популације али можда је боље пребацити у неку другу прикладнију тему.  ;)

На Eurogenes-у је прокоментарисано као "epic fail".

Још мало па ће завршити као Кљосов.

Видео сам да се помињу узорци Јамне културе, али то су стари узорци објављени пре две године, који су већ изанализирани до детаља, и сад се појави Колумбо Балановски који "открије" наводно нову грану, и "открије" да носиоци те гране нису населили Западну Европу. Није само на Еурогенесу. ;)

Ван мреже Србин

  • Помоћник
  • ****
  • Поруке: 164
  • Y-DNA: I2a-Z17855>BY190177
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #46 послато: Март 15, 2017, 12:28:00 пре подне »
Видео сам да се помињу узорци Јамне културе, али то су стари узорци објављени пре две године, који су већ изанализирани до детаља, и сад се појави Колумбо Балановски који "открије" наводно нову грану, и "открије" да носиоци те гране нису населили Западну Европу. Није само на Еурогенесу. ;)

Haak et. al. 2015.?

У септембру 2016 је избацио за GG400 и то је искористио за ово сад али то је оно што ми је и промакло. Што је најгоре ја ко коза и поверовах да је стварно у питању нова грана.  ;D Чак би и са том хипотетичком новом граном било глупо да без нових узорака дДНК са тог подручја искључи L51 из приче тек тако.

Значи GG400=Z2103 (на неком месту у у тексту је чак погрешно укуцано Z2130) тако да пошто из старе студије имамо Z2103 а не L51 онда је закључио да Јамнајци тј. Курганци нису преци L51. Сјајно, нема шта.  ::)

Ван мреже Црна Гуја

  • Уредник СДНКП
  • Етнолог
  • *****
  • Поруке: 2511
  • I2-BY55783>BY79593
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #47 послато: Март 15, 2017, 01:06:45 пре подне »
Haak et. al. 2015.?

У септембру 2016 је избацио за GG400 и то је искористио за ово сад али то је оно што ми је и промакло. Што је најгоре ја ко коза и поверовах да је стварно у питању нова грана.  ;D Чак би и са том хипотетичком новом граном било глупо да без нових узорака дДНК са тог подручја искључи L51 из приче тек тако.

Значи GG400=Z2103 (на неком месту у у тексту је чак погрешно укуцано Z2130) тако да пошто из старе студије имамо Z2103 а не L51 онда је закључио да Јамнајци тј. Курганци нису преци L51. Сјајно, нема шта.  ::)

Да, Haak, али Mathieson и Allentoft, исто из 2015. Проблем је што покушава одавно познате ствари да представи новим "открићима", и што порекло хаплогрупе R1b без икаквих доказа (и насупрот тренутно доступним) гура на Блиски Исток. Тврдње које се тичу L51 и нису толико спорне, сасвим је могуће да L51 не потиче директно из Јамне културе, чији се почетак датује око 3300. п.н.е, али је у сваком случају дошла из степа у неком периоду (можда са ранијим Суворово-Новоданиловка, Чернавода или Коцофени културама), што се јасно види по високом уделу "степске" компоненте у аутосомалној генетици свих до сада откривених Бел Бикер узорака из Немачке и Чешке. Што се тиче западног дела Јамне културе у црноморским степама, могуће да је у њему доминирала грана Z2103>>Z2110 која није до сада пронађена у источном делу Јамне културе, а управо та грана је данас заступљена на Балкану и у осталим деловима Европе.

На мрежи НиколаВук

  • Уредник
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 8478
  • I2-PH908>Y250780>A32852, род Никшића
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #48 послато: Мај 10, 2017, 02:12:25 поподне »
Један нови рад о "молекуларној археологији", како је у чланку називају, и њеној корелацији са индоевропском лингвистиком:

https://www.academia.edu/32927784/Molecular_archaeology_and_Indo-European_linguistics_Impressions_from_new_data
Чињеницама против самоувереног незнања.

Ван мреже Sergio

  • Памтиша
  • ********
  • Поруке: 1849
  • Y-DNA: I2-PH908>Y81557 | mtDNA: K1a-C150T
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #49 послато: Јул 06, 2017, 01:14:48 пре подне »

симо

  • Гост
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #50 послато: Јул 19, 2017, 03:25:16 поподне »
Не сјећам се да смо постављали сљедећи рад:

Extensive Farming in Estonia Started through a Sex-Biased Migration from the Steppe

Има неколико пронађених R1a

http://www.biorxiv.org/content/early/2017/03/02/112714

http://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2017/03/02/112714.full.pdf

симо

  • Гост
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #51 послато: Јул 19, 2017, 03:54:36 поподне »
Не сјећам се да смо постављали сљедећи рад:

Extensive Farming in Estonia Started through a Sex-Biased Migration from the Steppe

Има неколико пронађених R1a

http://www.biorxiv.org/content/early/2017/03/02/112714

http://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2017/03/02/112714.full.pdf

Има неких занимљивих детаља. Од Y-днк успјели су извући један из Комб Керамик културе и припада крајње ријеткој грани хаплогрупе R1a-YP1272, којој засад припадају један египатски Копт, један Тунижанин, Рус, Бјелорус и Чех. Аутосомално је утврђено да су тестирани из Комб Керамик културе повезани са Источним ловцима сакупљачима из Карелије и да се разликују од литванско-летонских скоро тестираних ловаца сакупљача који су ближи Западним ловцима сакупљачима (WHG)

Осталих 5 тестираних узорака су из Corded Ware културе и сви су R1a-Z645, при чему је код једног пронађена и R1a-Z283 што само потврђује да је главнина европске R1a па и практично сва словенска, проистекла из ове културе. Они су донијели  и нову неолитску културу као и нешто јужније степске генетике.

Занимљиво да 2500 г пне у Естонији још увијек нема N1c.

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 13139
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #52 послато: Јануар 10, 2018, 08:10:19 пре подне »
Добра вест што се тиче старе ДНК:

http://www.hurriyetdailynews.com/turkish-scientists-to-crack-neolithic-era-dna-code-european-funding-awarded-125398

У плану је тестирање 1500 узорака из Анадолије, период 10 до 8000 година пре н. е (неолит). Пројекат ће се звати: "Neogen".

"The European Research Council (ERC) has awarded Turkish scientists a €2.5 million ($2.9 million) grant to analyze the DNA of 1,500 people who used to live in the Anatolian region – the Asian part of present-day Turkey – during the Neolithic period."

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5481
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #53 послато: Јануар 10, 2018, 10:32:21 пре подне »

симо

  • Гост
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #54 послато: Јануар 10, 2018, 10:48:24 пре подне »
http://journals.plos.org/plosbiology/article?id=10.1371/journal.pbio.2003703

Хвала на линку, Милоше. Што се тиче Y-днк донекле очекивани резултати, од 4 мушка хаплотипа, двојица I2, један I2-M423 и један неутврђен. Ништа необично за скандинавски мезолит.

Ако сам добро упратио причу аутосомалној днк, говори се о одређеном мијешању западних и источних ловаца сакупљача на простору Скандинавије, гдје су источни дошли накнадно из сјевероисточног правца и спуштали се обалом Норвешке. Не знам да ли би овај утицај источних ловаца сакупљача могао бити извор за скандинавске гране R1a, које додуше још нису нађене у старој днк на простору Скандинавије (уколико нешто нисам пропустио).

симо

  • Гост
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #55 послато: Јануар 10, 2018, 11:04:23 пре подне »
Овај дио из студије везан за физички изглед мезолитских Скандинаваца је интересантан:

"The genomic data further allowed us to study the physical appearance of SHGs ; for instance, they show a combination of eye color varying from blue to light brown and light skin pigmentation. This is strikingly different from the WHGs—who have been suggested to have the specific combination of blue eyes and dark skin  and EHGs—who have been suggested to be brown-eyed and light-skinned."

Ван мреже Сремац

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 536
  • Y-DNK: I2-PH908>Y81557 / mtDNK: H11a5
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #56 послато: Јануар 10, 2018, 11:58:41 пре подне »
Овај дио из студије везан за физички изглед мезолитских Скандинаваца је интересантан:

"The genomic data further allowed us to study the physical appearance of SHGs ; for instance, they show a combination of eye color varying from blue to light brown and light skin pigmentation. This is strikingly different from the WHGs—who have been suggested to have the specific combination of blue eyes and dark skin  and EHGs—who have been suggested to be brown-eyed and light-skinned."

Занимљиво је такође да су варијанте гена одговорне за депигментацију постале учесталије у популацији SHG у односу на предачке популације због прилагођавање животним условима Скандинавије:

In addition to performing this genome-wide scan, we studied the allele frequencies in three
pigmentation genes (SLC24A5, SLC45A2, which have a strong effect on skin pigmentation,
and OCA2/HERC2,which has a strong effect on eye pigmentation) in which the derived alleles
are virtually fixed in northern Europeans today...
All of the depigmentation variants at these three genes are in
high frequency in SHGs in contrast to both WHGs and EHGs
(Fig 4B)...
Therefore, the unique configuration of the SHGs is not fully explained by the fact that SHGs are a
mixture of EHGs and WHGs, but could rather be explained by a continued increase of the
allele frequencies after the admixture event, likely caused by adaptation to high-latitude environments

[50,52].

симо

  • Гост
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #57 послато: Јануар 10, 2018, 12:06:41 поподне »
Занимљиво је такође да су варијанте гена одговорне за депигментацију постале учесталије у популацији SHG у односу на предачке популације због прилагођавање животним условима Скандинавије:

In addition to performing this genome-wide scan, we studied the allele frequencies in three
pigmentation genes (SLC24A5, SLC45A2, which have a strong effect on skin pigmentation,
and OCA2/HERC2,which has a strong effect on eye pigmentation) in which the derived alleles
are virtually fixed in northern Europeans today...
All of the depigmentation variants at these three genes are in
high frequency in SHGs in contrast to both WHGs and EHGs
(Fig 4B)...
Therefore, the unique configuration of the SHGs is not fully explained by the fact that SHGs are a
mixture of EHGs and WHGs, but could rather be explained by a continued increase of the
allele frequencies after the admixture event, likely caused by adaptation to high-latitude environments

[50,52].

Да, у ствари они су имали у "понуди" плаве очи са WHG стране и свијетлу кожу са EHG стране, али је тек утицај средине након мијешања допринио да управо до изражаја дођу ову особине и да се даље генерацијски утврђују. Иначе, да је то само посљедица мијешања могло је доћи и до комбинације тамне очи-тамна кожа што је такође постојало у WHG/EHG "понуди".

Ван мреже Милош

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 5481
  • Y134591 Тарски Никшићи
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #58 послато: Јануар 10, 2018, 12:12:14 поподне »
Да, у ствари они су имали у "понуди" плаве очи са WHG стране и свијетлу кожу са EHG стране, али је тек утицај средине након мијешања допринио да управо до изражаја дођу ову особине и да се даље генерацијски утврђују. Иначе, да је то само посљедица мијешања могло је доћи и до комбинације тамне очи-тамна кожа што је такође постојало у WHG/EHG "понуди".

A мoждa и oвaкo


Ван мреже Сремац

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 536
  • Y-DNK: I2-PH908>Y81557 / mtDNK: H11a5
Одг: Древна ДНК - научни радови
« Одговор #59 послато: Јануар 10, 2018, 12:17:06 поподне »
Да, у ствари они су имали у "понуди" плаве очи са WHG стране и свијетлу кожу са EHG стране, али је тек утицај средине након мијешања допринио да управо до изражаја дођу ову особине и да се даље генерацијски утврђују. Иначе, да је то само посљедица мијешања могло је доћи и до комбинације тамне очи-тамна кожа што је такође постојало у WHG/EHG "понуди".

Да, управо то чини SHG "јединственом конфигурацијом", тј. одређене особине(светле очи и кожа) наслеђене из различитих извора су се фиксирале баш у тој популацији, док су, што се прилагодљивости тиче, мање пожељне комбинације ишчезле...