Evo danas na Srdjevdan dva WGS rezultata srdjevštaka.
Ljiljak(Srdjevdan),Gornji Žirovac/Dvor
Ljiljak je pozitivan na FT371439 ali je negativan na FT3457 i BY108084 i na sve Brekićeve novele.
Grunčić(Srdjevdan),Zrenjanin
Evo Milanovog komentara:
Grunčić ima mešovita pozitivna i negativna očitavanja tamo gde bi trebao imati samo pozitivna,doduše uglavnom ima više pozitivnih od negativnih.
Grunčić je BY149000+ i FT371439+,BY108084- i FT3457-.negativan je i na sve novele Brekića.
Ostaje da se uporede Grunčićeve novele sa Ljiljkovim kad im budu kompletirani rezultati na YFULLU,pošto YFULL to sigurno neće izdvojiti zbog malo lošijeg Grunčićevog BAM ili FASTQ fajla.
Ništa novo nismo dobili sa ova dva rezultata,i dalje imamo dosta njih pod FT371439*(Knežević,Berić,Jagodić,Milosavljević,LJiljak,Brekić,Grunčić).
U narednom periodu se očekuju rezultati za :Rebraču,Kovljenića,Šerbulu i Kuridžu,pa možda bude nekih novih grananja.
U poslednje vreme Dante je počeo malo da brlja sa sekvenciranjem,BAM fajlovi nisu dobrog kvaliteta.
-Vukićevića je YFULL stavio samo pod R1A*
-Blažića je YFull stavio pod R1a>M417
Poslali su mejlove Danteu, ali do sada bez odgovora.
Evo Milanovog komentara o njihovim Rezultatima
1.Nešto nije u redu sa Vukićevićevim Bam fajlom,pokazuje da je negativan na YP6098,Y2608,Y2613,Z280.Ili su pomešali njegov rezultat sa nekim drugim,ili nešto nije u redu sa fajlom,jer skoro C i $svaki SNP koji sam proverio pored većinski negativnih pokazuje i po koje pozitivno očitavanje.Ovo se u principu jako retko dešava,pa je možda u pitanju loš kvalitet fajla.U poslednjih nekoliko dana više ljudi je dobilo čudne rezultate od Dantea,diskutovalo se o tome dosta na fejsbuku,pa bi preporučio da i tamo postavite pitanje.
Vukićević ima po samo jedno pozitivno očitavanje za YP6098 i BY68536,uz 10+ negativnih.Kod Y190918,Y190923 i BY149000 ima samo negativna očitavanj kao i kod Y2608.
2.Blažićev BAM se čini malo boljim od Vukićevićevog ,ali i dalje ima puno mešovitih očitavanja(I pozitivnih i negativnih) kod većine SNP-ova koji bi trebali biti samo pozitivni.Npr. kod Y(A>G) ima 9A i 8G,kod Y2609(C>T) ima 6C i 4T,kod Y2608(T>C) ima 11T i 4C,ali možemo reći da je sigurno pozitivan na sve njih.Ispod Y2608 situacija je malo jasnija,na sve grane osim jedne ima samo negativna očitavanja,jedino kod YP3929(T>C) opet ima mešovita očitavanja,9T i 6C, pa bih sa dozom opreza rekao da je zaista YP3929+.Ispod ima samo negativna očitavanja kod M12335,dok kod FT62520(C>G,gde su Madjar i Belorus,opet ima mešovita očitavanja,9C i 4G.Na FTDNA ispod ovog imaju još dva SNP-a koja Madjar deli sa Italijanom koji nije na YFULL- stablu, i Blažić je čini se pozitivan na oba,opet sa mešovitim očitavanjima.Kod FTB12337(T>A) ima 4T i 5 A,dok kod FTB16629 (T>C) ima 11T i 3C.Iako definitivno BAM ima dosta loših očitavanja,rekao bi da je prilično sigurno da će Blažić formirati granu FTB12337/FTB16629 sa Madjarom koji se nalazi na stablu.
